SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 3609989 Dshi_3370 Enoyl-CoA hydratase/isomerase (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
59% identity, 99% coverage: 1:255/258 of query aligns to 1:254/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
M
 
M
A
 
T
Y
 
Y
N
 
E
T
 
T
L
 
I
I
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
R
E
 
D
D
 
Q
H
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
Q
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
N
T
 
S
E
 
Q
L
 
V
L
 
M
G
 
N
E
 
E
L
 
V
A
 
T
K
 
S
A
 
A
L
 
A
R
 
T
S
 
E
A
 
L
E
 
D
E
 
D
N
 
D
E
 
P
K
 
D
V
 
I
R
 
G
C
 
A
I
 
I
I
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
|
K
E
 
E
M
|
M
S
 
A
E
 
D
K
 
L
T
 
T
F
 
F
V
 
A
E
 
D
V
 
A
F
 
F
S
x
T
S
 
A
D
 
D
L
 
F
F
|
F
G
 
A
P
 
-
E
 
T
V
 
W
E
 
G
R
 
K
L
 
L
L
 
A
N
 
A
C
 
V
R
 
R
K
 
T
P
 
P
I
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
V
I
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
K
L
 
L
G
 
G
V
|
V
V
 
L
A
x
P
G
|
G
I
x
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
F
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
M
D
 
D
M
 
L
H
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
F
 
T
M
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
T
 
A
K
 
D
K
 
D
L
 
L
M
 
L
E
 
T
E
 
E
A
 
A
M
 
R
G
 
A
A
 
T
A
 
A
Q
 
T
K
 
T
I
 
I
A
 
S
E
 
Q
K
 
M
S
 
S
V
 
A
L
 
S
T
 
A
S
 
A
M
 
R
A
 
M
V
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
R
 
R
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
S
T
 
S
L
 
L
R
 
S
E
 
E
G
 
G
L
 
L
L
|
L
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
L
F
 
F
H
 
H
A
 
S
M
 
A
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
T
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
M
G
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
A
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
59% identity, 99% coverage: 1:255/258 of query aligns to 1:254/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
M
 
M
A
 
T
Y
 
Y
N
 
E
T
 
T
L
 
I
I
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
R
E
 
D
D
 
Q
H
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
A
 
A
L
|
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
S
E
 
Q
L
 
V
L
 
M
G
 
N
E
 
E
L
 
V
A
 
T
K
 
S
A
 
A
L
 
A
R
 
T
S
 
E
A
 
L
E
 
D
E
 
D
N
 
D
E
 
P
K
 
D
V
 
I
R
 
G
C
 
A
I
 
I
I
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
|
I
K
|
K
E
 
E
M
|
M
S
 
A
E
 
D
K
 
L
T
 
T
F
 
F
V
 
A
E
 
D
V
 
A
F
 
F
S
x
T
S
 
A
D
 
D
L
 
F
F
|
F
G
 
A
P
 
-
E
 
T
V
 
W
E
 
G
R
 
K
L
 
L
L
 
A
N
 
A
C
 
V
R
 
R
K
 
T
P
 
P
I
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
G
Y
|
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
V
I
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
K
L
|
L
G
 
G
V
|
V
V
 
L
A
x
P
G
|
G
I
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
F
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
M
D
 
D
M
 
L
H
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
F
 
T
M
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
T
 
A
K
 
D
K
 
D
L
 
L
M
 
L
E
 
T
E
 
E
A
 
A
M
 
R
G
 
A
A
 
T
A
 
A
Q
 
T
K
 
T
I
 
I
A
 
S
E
 
Q
K
 
M
S
 
S
V
 
A
L
 
S
T
 
A
S
 
A
M
 
R
A
 
M
V
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
R
 
R
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
S
T
 
S
L
 
L
R
 
S
E
 
E
G
 
G
L
 
L
L
|
L
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
L
F
 
F
H
 
H
A
 
S
M
 
A
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
T
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
M
G
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
A
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
59% identity, 98% coverage: 3:255/258 of query aligns to 2:253/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
Y
 
Y
N
 
E
T
 
T
L
 
I
I
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
R
E
 
D
D
 
Q
H
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
S
E
 
Q
L
 
V
L
 
M
G
 
N
E
 
E
L
 
V
A
 
T
K
 
S
A
 
A
L
 
A
R
 
T
S
 
E
A
 
L
E
 
D
E
 
D
N
 
D
E
 
P
K
 
D
V
 
I
R
 
G
C
 
A
I
 
I
I
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
S
 
A
E
 
D
K
 
L
T
 
T
F
 
F
V
 
A
E
 
D
V
 
A
F
 
F
S
x
T
S
 
A
D
 
D
L
 
F
F
|
F
G
 
A
P
 
-
E
 
T
V
 
W
E
 
G
R
 
K
L
 
L
L
 
A
N
 
A
C
 
V
R
 
R
K
 
T
P
 
P
I
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
V
I
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
K
L
 
L
G
 
G
V
|
V
V
 
L
A
x
P
G
|
G
I
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
F
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
M
D
 
D
M
 
L
H
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
F
 
T
M
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
T
 
A
K
 
D
K
 
D
L
 
L
M
 
L
E
 
T
E
 
E
A
 
A
M
 
R
G
 
A
A
 
T
A
 
A
Q
 
T
K
 
T
I
 
I
A
 
S
E
 
Q
K
 
M
S
 
S
V
 
A
L
 
S
T
 
A
S
 
A
M
 
R
A
 
M
V
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
R
 
R
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
S
T
 
S
L
 
L
R
 
S
E
 
E
G
 
G
L
 
L
L
|
L
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
L
F
 
F
H
 
H
A
 
S
M
 
A
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Q
|
Q
T
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
M
G
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
A
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
59% identity, 98% coverage: 3:255/258 of query aligns to 2:249/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
Y
 
Y
N
 
E
T
 
T
L
 
I
I
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
R
E
 
D
D
 
Q
H
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
I
I
 
I
R
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
S
E
 
Q
L
 
V
L
 
M
G
 
N
E
 
E
L
 
V
A
 
T
K
 
S
A
 
A
L
 
A
R
 
T
S
 
E
A
 
L
E
 
D
E
 
D
N
 
D
E
 
P
K
 
D
V
 
I
R
 
G
C
 
A
I
 
I
I
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
S
 
-
E
 
-
K
 
-
T
 
-
F
 
F
V
 
A
E
 
D
V
 
A
F
 
F
S
x
T
S
 
A
D
 
D
L
 
F
F
|
F
G
 
A
P
 
-
E
 
T
V
 
W
E
 
G
R
 
K
L
 
L
L
 
A
N
 
A
C
 
V
R
 
R
K
 
T
P
 
P
I
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
V
I
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
A
K
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
K
L
 
L
G
 
G
V
|
V
V
 
L
A
x
P
G
|
G
I
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
F
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
M
D
 
D
M
 
L
H
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
F
 
T
M
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
S
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
T
 
A
K
 
D
K
 
D
L
 
L
M
 
L
E
 
T
E
 
E
A
 
A
M
 
R
G
 
A
A
 
T
A
 
A
Q
 
T
K
 
T
I
 
I
A
 
S
E
 
Q
K
 
M
S
 
S
V
 
A
L
 
S
T
 
A
S
 
A
M
 
R
A
 
M
V
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
R
 
R
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
S
T
 
S
L
 
L
R
 
S
E
 
E
G
 
G
L
 
L
L
|
L
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
L
F
|
F
H
 
H
A
 
S
M
 
A
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
T
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
M
G
 
A
A
 
A
F
|
F
L
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
A
P
 
P
Q
 
Q
F
 
F

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
55% identity, 95% coverage: 14:257/258 of query aligns to 17:259/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
V
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
T
 
N
E
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
N
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
E
S
 
T
A
 
F
E
 
E
E
 
E
N
 
D
E
 
P
K
 
A
V
 
V
R
 
G
C
 
A
I
 
I
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
S
 
Q
E
 
N
K
 
R
T
 
T
F
 
F
V
 
Q
E
 
D
V
 
C
F
 
Y
S
|
S
S
 
G
D
 
K
L
 
-
F
 
F
G
x
L
P
 
S
E
 
H
V
 
W
E
 
D
R
 
H
L
 
I
L
 
T
N
 
R
C
 
I
R
 
K
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
N
G
 
G
Y
|
Y
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
I
I
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
K
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
L
|
L
G
 
G
V
x
T
V
 
I
A
x
P
G
|
G
I
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
F
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
K
 
L
A
 
A
M
 
M
D
 
E
M
 
M
H
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
F
 
R
M
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
S
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
T
 
V
K
 
E
K
 
T
L
 
L
M
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
I
G
 
Q
A
 
C
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
N
K
 
N
S
 
S
V
 
K
L
 
I
T
 
I
S
 
V
M
 
A
A
 
M
V
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
V
 
V
N
 
N
R
 
A
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
M
T
 
T
L
 
L
R
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
N
L
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
K
L
 
L
F
|
F
H
 
Y
A
 
S
M
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
Q
 
R
T
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
K
P
 
A
Q
 
N
F
 
F
R
 
K
D
 
D

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
55% identity, 95% coverage: 14:257/258 of query aligns to 15:257/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
V
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
K
A
 
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
T
 
N
E
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
N
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
E
S
 
T
A
 
F
E
 
E
E
 
E
N
 
D
E
 
P
K
 
A
V
 
V
R
 
G
C
 
A
I
 
I
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
S
 
Q
E
 
N
K
 
R
T
 
T
F
 
F
V
 
Q
E
 
D
V
 
C
F
 
Y
S
|
S
S
 
G
D
 
K
L
 
-
F
 
F
G
x
L
P
 
S
E
 
H
V
x
W
E
 
D
R
 
H
L
 
I
L
 
T
N
 
R
C
 
I
R
 
K
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
I
I
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
K
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
L
|
L
G
 
G
V
x
T
V
 
I
A
x
P
G
|
G
I
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
F
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
K
 
L
A
 
A
M
 
M
D
 
E
M
 
M
H
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
F
 
R
M
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
S
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
T
 
V
K
 
E
K
 
T
L
 
L
M
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
I
G
 
Q
A
 
C
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
N
K
 
N
S
 
S
V
 
K
L
 
I
T
 
I
S
 
V
M
 
A
A
 
M
V
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
V
 
V
N
 
N
R
 
A
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
M
T
 
T
L
 
L
R
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
N
L
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
K
L
 
L
F
 
F
H
 
Y
A
 
S
M
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
Q
 
R
T
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
K
P
 
A
Q
 
N
F
 
F
R
 
K
D
 
D

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
55% identity, 95% coverage: 14:257/258 of query aligns to 17:257/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
V
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
T
 
N
E
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
N
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
E
S
 
T
A
 
F
E
 
E
E
 
E
N
 
D
E
 
P
K
 
A
V
 
V
R
 
G
C
 
A
I
 
I
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
S
 
Q
E
 
N
K
 
R
T
 
T
F
 
F
V
 
Q
E
 
D
V
 
C
F
 
Y
S
|
S
S
 
G
D
x
L
L
 
S
F
 
H
G
 
W
P
 
D
E
 
H
V
 
I
E
 
T
R
 
R
L
 
I
L
 
-
N
 
-
C
 
-
R
 
K
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
I
I
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
K
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
L
|
L
G
 
G
V
x
T
V
 
I
A
x
P
G
|
G
I
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
F
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
K
 
L
A
 
A
M
 
M
D
 
E
M
 
M
H
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
F
 
R
M
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
S
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
T
 
V
K
 
E
K
 
T
L
 
L
M
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
I
G
 
Q
A
 
C
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
N
K
 
N
S
 
S
V
 
K
L
 
I
T
 
I
S
 
V
M
 
A
A
 
M
V
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
V
 
V
N
 
N
R
 
A
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
M
T
 
T
L
 
L
R
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
N
L
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
K
L
 
L
F
 
F
H
 
Y
A
 
S
M
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
Q
 
R
T
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
K
P
 
A
Q
 
N
F
 
F
R
 
K
D
 
D

P14604 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial; mECH; mECH1; Enoyl-CoA hydratase 1; ECHS1; Short-chain enoyl-CoA hydratase; SCEH; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8 from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
55% identity, 95% coverage: 14:257/258 of query aligns to 47:289/290 of P14604

query
sites
P14604
V
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
C
T
 
N
E
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
N
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
E
S
 
T
A
 
F
E
 
E
E
 
E
N
 
D
E
 
P
K
 
A
V
 
V
R
 
G
C
 
A
I
 
I
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
K
 
K
E
 
E
M
 
M
S
 
Q
E
 
N
K
 
R
T
 
T
F
 
F
V
 
Q
E
 
D
V
 
C
F
 
Y
S
 
S
S
 
G
D
 
K
L
 
-
F
 
F
G
 
L
P
 
S
E
 
H
V
 
W
E
 
D
R
 
H
L
 
I
L
 
T
N
 
R
C
 
I
R
 
K
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
I
I
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
K
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
T
V
 
I
A
 
P
G
 
G
I
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
F
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
K
 
L
A
 
A
M
 
M
D
 
E
M
 
M
H
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
F
 
R
M
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
S
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
T
 
V
K
 
E
K
 
T
L
 
L
M
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
I
G
 
Q
A
 
C
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
N
K
 
N
S
 
S
V
 
K
L
 
I
T
 
I
S
 
V
M
 
A
A
 
M
V
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
V
 
V
N
 
N
R
 
A
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
M
T
 
T
L
 
L
R
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
N
L
 
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
K
L
 
L
F
 
F
H
 
Y
A
 
S
M
 
T
F
 
F
A
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
Q
 
R
T
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
K
P
 
A
Q
 
N
F
 
F
R
 
K
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
55% identity, 95% coverage: 14:257/258 of query aligns to 16:253/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
V
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
T
 
N
E
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
N
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
E
S
 
T
A
 
F
E
 
E
E
 
E
N
 
D
E
 
P
K
 
A
V
 
V
R
 
G
C
 
A
I
 
I
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
|
K
E
 
E
M
|
M
S
 
Q
E
 
N
K
 
R
T
 
T
F
 
F
V
 
Q
E
 
D
V
 
C
F
 
Y
S
|
S
S
 
-
D
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
H
V
 
W
E
 
D
R
 
H
L
 
I
L
 
T
N
 
R
C
 
I
R
 
K
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
I
I
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
K
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
L
 
L
G
 
G
V
x
T
V
 
I
A
x
P
G
|
G
I
x
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
F
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
K
 
L
A
 
A
M
 
M
D
 
E
M
 
M
H
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
F
 
R
M
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
S
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
F
P
 
P
T
 
V
K
 
E
K
 
T
L
 
L
M
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
I
G
 
Q
A
 
C
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
N
K
 
N
S
 
S
V
 
K
L
 
I
T
 
I
S
 
V
M
 
A
A
 
M
V
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
V
 
V
N
 
N
R
 
A
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
M
T
 
T
L
 
L
R
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
N
L
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
K
L
 
L
F
 
F
H
 
Y
A
 
S
M
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
Q
 
R
T
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
G
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
K
P
 
A
Q
 
N
F
 
F
R
 
K
D
 
D

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
53% identity, 96% coverage: 12:258/258 of query aligns to 15:260/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
D
 
N
H
 
T
V
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
I
R
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
N
 
C
T
 
D
E
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
D
E
 
E
L
 
L
A
 
N
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
S
 
I
A
 
F
E
 
E
E
 
E
N
 
D
E
 
P
K
 
A
V
 
V
R
 
G
C
 
A
I
 
I
I
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
E
 
D
K
|
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
S
 
Q
E
 
N
K
 
L
T
 
S
F
 
F
V
 
Q
E
 
D
V
 
C
F
 
Y
S
|
S
S
 
S
D
 
K
L
 
-
F
 
F
G
x
L
P
 
K
E
 
H
V
 
W
E
 
D
R
 
H
L
 
L
L
 
T
N
 
Q
C
 
V
R
 
K
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
x
F
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
I
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
I
I
 
I
I
 
Y
A
 
A
S
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
K
 
Q
F
 
F
G
 
A
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
L
L
 
I
G
 
G
V
x
T
V
 
I
A
x
P
G
|
G
I
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
F
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
K
 
L
A
 
A
M
 
M
D
 
E
M
 
M
H
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
D
F
 
R
M
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
D
A
 
A
E
 
K
R
 
Q
S
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
S
R
 
K
V
 
I
V
 
C
P
 
P
T
 
V
K
 
E
K
 
T
L
 
L
M
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
I
G
 
Q
A
 
C
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
S
K
 
N
S
 
S
V
 
K
L
 
I
T
 
V
S
 
V
M
 
A
A
 
M
V
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
V
 
V
N
 
N
R
 
A
S
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
M
T
 
T
L
 
L
R
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
S
L
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
K
L
 
L
F
 
F
H
 
Y
A
 
S
M
 
T
F
|
F
A
 
A
T
 
T
E
 
D
D
 
D
Q
 
R
T
 
K
E
 
E
G
 
G
M
 
M
G
 
T
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
K
P
 
A
Q
 
N
F
 
F
R
 
K
D
 
D
K
 
Q

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
47% identity, 100% coverage: 1:258/258 of query aligns to 1:259/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
M
 
M
A
 
E
Y
 
F
N
 
E
T
 
T
L
 
I
I
 
E
V
 
T
E
 
K
I
 
K
E
 
E
D
 
G
H
 
N
V
 
L
A
 
F
L
 
W
I
 
I
R
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
D
A
x
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
N
T
 
A
E
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
D
K
 
R
A
 
A
L
 
V
R
 
S
S
 
Q
A
 
A
E
 
E
E
 
S
N
 
D
E
 
P
K
 
E
V
 
I
R
 
R
C
 
V
I
 
I
I
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
K
E
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
T
E
 
Q
M
x
F
S
 
N
E
 
Q
K
 
L
T
 
T
F
 
P
V
 
A
E
 
E
V
 
A
F
 
W
S
 
K
S
 
F
D
x
S
L
 
K
F
 
K
G
 
G
P
x
R
E
 
E
V
 
I
-
 
M
E
 
D
R
 
K
L
 
I
L
 
E
N
 
A
C
 
L
R
 
S
K
 
K
P
 
P
I
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
V
 
I
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
L
E
|
E
I
 
L
A
 
A
M
 
L
M
 
A
C
 
C
D
 
D
F
 
I
I
 
R
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
E
T
 
E
A
 
A
K
 
Q
F
 
L
G
 
G
Q
 
L
P
|
P
E
|
E
I
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
V
x
I
V
 
Y
A
x
P
G
|
G
I
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
F
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
G
K
 
R
A
 
A
M
 
L
D
 
E
M
 
M
H
 
M
L
 
M
T
 
T
G
 
G
R
 
D
F
x
R
M
 
I
D
 
P
A
 
G
E
 
K
E
 
D
A
 
A
E
 
E
R
 
K
S
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
T
 
L
K
 
A
K
 
N
L
 
L
M
 
E
E
 
Q
E
 
E
A
 
T
M
 
R
G
 
K
A
 
L
A
 
A
Q
 
E
K
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
K
K
 
K
S
 
S
V
 
P
L
 
I
T
 
S
S
 
L
M
 
A
A
 
L
V
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
V
V
 
V
N
 
N
R
 
R
S
 
G
Y
 
L
E
 
D
T
 
S
T
 
P
L
 
L
R
 
L
E
 
S
G
 
G
L
 
L
L
x
A
F
 
L
E
 
E
R
 
S
R
 
V
L
 
G
F
 
W
H
 
G
A
 
V
M
 
V
F
|
F
A
 
S
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Q
 
K
T
 
K
E
 
E
G
 
G
M
 
V
G
 
S
A
 
A
F
|
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
E
 
E
P
 
P
Q
 
T
F
 
F
R
 
K
D
 
G
K
 
K

6slaAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
37% identity, 98% coverage: 6:258/258 of query aligns to 2:245/245 of 6slaAAA

query
sites
6slaAAA
L
 
I
I
 
L
V
 
K
E
 
E
I
 
R
E
 
Q
D
 
D
H
 
G
V
 
V
A
 
L
L
 
V
I
 
L
R
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
E
A
 
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
L
 
I
N
 
T
T
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
Y
K
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
K
S
 
E
A
 
G
E
 
E
E
 
E
N
 
D
E
 
R
K
 
E
V
 
V
R
 
R
C
 
A
I
 
L
I
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
G
K
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
Q
D
|
D
I
x
L
K
 
T
E
 
E
M
 
A
S
 
H
E
x
L
K
 
R
T
 
R
F
x
Y
V
x
N
E
 
R
V
 
V
F
 
-
S
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
V
E
 
E
R
 
A
L
 
L
L
 
S
N
 
G
C
 
L
R
 
E
K
 
K
P
 
P
I
 
L
I
 
V
A
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
N
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
L
x
A
G
|
G
G
x
A
G
 
G
C
 
M
E
x
S
I
 
L
A
 
A
M
 
L
M
 
W
C
 
G
D
 
D
F
 
L
I
 
R
I
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
V
T
 
G
A
 
A
K
 
S
F
 
F
G
 
T
Q
 
T
P
x
A
E
x
F
I
 
V
N
 
R
L
x
I
G
 
G
V
x
L
V
 
V
A
x
P
G
x
N
I
 
S
G
 
G
G
 
L
T
 
S
Q
 
F
R
 
L
L
 
L
T
 
P
R
 
R
F
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
L
S
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
Q
D
 
E
M
 
L
H
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
S
R
 
P
F
 
R
M
 
L
D
 
S
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
L
R
 
A
S
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
T
 
A
K
 
E
K
 
K
L
 
L
M
 
M
E
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
L
G
 
S
A
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
Q
K
 
G
S
 
P
V
 
T
L
 
R
T
 
A
S
 
Y
M
 
A
A
 
L
V
 
T
K
 
K
E
 
K
A
 
L
V
 
L
N
 
L
R
 
E
S
 
T
Y
 
Y
E
 
R
T
 
L
T
 
S
L
 
L
R
 
T
E
 
E
G
 
A
L
 
L
L
x
A
F
 
L
E
 
E
R
 
A
R
 
V
L
 
L
F
 
Q
H
 
G
A
 
Q
M
 
A
F
x
G
A
 
Q
T
 
T
E
 
Q
D
 
D
Q
 
H
T
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
V
G
 
R
A
 
A
F
|
F
L
 
R
E
 
E
K
|
K
R
 
R
E
 
P
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
R
 
Q
D
 
G
K
 
R

6slbAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
36% identity, 98% coverage: 6:258/258 of query aligns to 5:257/257 of 6slbAAA

query
sites
6slbAAA
L
 
I
I
 
L
V
 
K
E
 
E
I
 
R
E
 
Q
D
 
D
H
 
G
V
 
V
A
 
L
L
 
V
I
 
L
R
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
E
A
 
K
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
I
N
 
T
T
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
D
E
 
A
L
 
L
A
 
Y
K
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
K
S
 
E
A
 
G
E
 
E
E
 
E
N
 
D
E
 
R
K
 
E
V
 
V
R
 
R
C
 
A
I
 
L
I
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
G
K
x
R
A
 
A
F
 
F
A
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
Q
D
|
D
I
x
L
K
 
T
E
 
E
M
x
F
S
 
G
E
 
D
K
 
R
T
 
K
F
 
P
V
 
D
E
x
Y
V
 
E
F
 
A
S
 
H
S
x
L
D
 
R
L
 
R
F
 
Y
G
x
N
P
 
R
E
 
V
V
 
V
E
 
E
R
 
A
L
 
L
L
 
S
N
 
G
C
 
L
R
 
E
K
 
K
P
 
P
I
 
L
I
 
V
A
 
V
A
 
A
V
 
V
S
 
N
G
 
G
Y
 
V
A
 
A
L
 
A
G
 
G
G
x
A
G
 
G
C
 
M
E
x
S
I
 
L
A
 
A
M
 
L
M
 
W
C
 
G
D
 
D
F
 
L
I
 
R
I
 
L
A
 
A
S
 
A
E
 
V
T
 
G
A
 
A
K
 
S
F
 
F
G
 
T
Q
 
T
P
x
A
E
x
F
I
 
V
N
 
R
L
 
I
G
 
G
V
x
L
V
 
V
A
x
P
G
x
D
I
 
S
G
 
G
G
 
L
T
 
S
Q
 
F
R
 
L
L
 
L
T
 
P
R
 
R
F
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
L
S
 
A
K
 
K
A
 
A
M
 
Q
D
 
E
M
 
L
H
 
L
L
 
L
T
 
L
G
 
S
R
 
P
F
 
R
M
 
L
D
 
S
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
E
 
L
R
 
A
S
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
T
 
A
K
 
E
K
 
K
L
 
L
M
 
M
E
 
E
E
 
E
A
 
A
M
 
L
G
 
S
A
 
L
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
Q
K
 
G
S
 
P
V
 
T
L
 
R
T
 
A
S
 
Y
M
 
A
A
 
L
V
 
T
K
 
K
E
 
K
A
 
L
V
 
L
N
 
L
R
 
E
S
 
T
Y
 
Y
E
 
R
T
 
L
T
 
S
L
 
L
R
 
T
E
 
E
G
 
A
L
 
L
L
x
A
F
 
L
E
 
E
R
 
A
R
 
V
L
 
L
F
 
Q
H
 
G
A
 
Q
M
 
A
F
x
G
A
 
Q
T
 
T
E
 
Q
D
 
D
Q
 
H
T
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
V
G
 
R
A
 
A
F
 
F
L
 
R
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
P
P
 
P
Q
 
R
F
 
F
R
 
Q
D
 
G
K
 
R

5jbxB Crystal structure of liuc in complex with coenzyme a and malonic acid (see paper)
35% identity, 90% coverage: 26:258/258 of query aligns to 27:261/261 of 5jbxB

query
sites
5jbxB
N
 
N
A
|
A
L
 
I
N
 
S
T
 
R
E
 
A
L
 
M
L
 
L
G
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
G
K
 
E
A
 
L
L
 
V
R
 
T
S
 
R
A
 
V
E
 
S
E
 
S
N
 
S
E
 
R
K
 
D
V
 
V
R
 
R
C
 
A
I
 
V
I
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
A
-
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
C
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
x
L
K
|
K
E
 
E
-
x
R
-
 
A
-
 
T
M
 
M
S
 
A
E
 
E
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
F
-
x
L
-
 
D
-
 
G
-
 
L
-
x
R
K
 
R
T
 
T
F
 
F
V
 
R
E
 
A
V
 
I
F
 
E
S
 
K
S
 
S
D
 
D
L
 
C
F
 
V
G
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
N
 
-
C
 
-
R
 
-
K
 
-
P
 
-
I
 
F
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
S
 
N
G
 
G
Y
 
A
A
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
T
E
|
E
I
 
L
A
 
A
M
 
L
M
 
A
C
 
C
D
 
D
F
 
L
I
 
R
I
 
V
A
 
A
S
 
A
E
 
P
T
 
A
A
 
A
K
 
E
F
 
L
G
 
G
Q
 
L
P
x
T
E
|
E
I
 
V
N
 
K
L
|
L
G
 
G
V
x
I
V
 
I
A
x
P
G
|
G
I
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
R
F
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
P
S
 
G
K
 
R
A
 
A
M
 
K
D
 
D
M
 
L
H
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
A
R
 
R
F
x
R
M
 
I
D
 
N
A
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
F
R
 
S
S
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
A
S
 
N
R
 
R
V
 
L
V
 
A
P
 
P
T
 
E
K
 
G
K
 
H
L
 
L
M
 
L
E
 
A
E
 
V
A
 
A
M
 
Y
G
 
G
A
 
L
A
 
A
Q
 
E
K
 
S
I
 
V
A
 
V
E
 
E
K
 
N
S
 
A
V
 
P
L
 
I
T
 
A
S
 
V
M
 
A
A
 
T
V
 
A
K
 
K
E
 
H
A
 
A
V
 
I
N
 
D
R
 
E
S
 
G
Y
 
T
E
 
G
T
 
L
T
 
E
L
 
L
R
 
D
E
 
D
G
 
A
L
 
L
L
x
A
F
 
L
E
 
E
R
 
L
R
 
R
L
 
K
F
 
Y
H
 
E
A
 
E
M
 
I
F
x
L
A
 
K
T
 
T
E
 
E
D
 
D
Q
 
R
T
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
L
G
 
R
A
 
A
F
 
F
L
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
A
P
 
P
Q
 
V
F
 
Y
R
 
K
D
 
G
K
 
R

Sites not aligning to the query:

O53561 Enoyl-CoA hydratase EchA19; EC 4.2.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
34% identity, 98% coverage: 7:258/258 of query aligns to 11:266/266 of O53561

query
sites
O53561
I
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
R
E
 
R
D
 
G
H
 
H
V
 
T
A
 
L
L
 
I
I
 
V
R
 
T
L
 
M
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
A
A
 
A
L
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
N
 
S
T
 
T
E
 
E
L
 
M
L
 
M
G
 
R
E
 
I
L
 
M
A
 
V
K
 
Q
A
 
A
L
 
W
R
 
D
S
 
R
A
 
V
E
 
D
E
 
N
N
 
D
E
 
P
K
 
D
V
 
I
R
 
R
C
 
C
I
 
C
I
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
G
K
 
G
A
 
Y
F
 
F
A
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
M
D
 
D
I
 
L
K
 
K
E
 
A
M
 
A
S
 
T
E
 
Q
K
 
K
T
 
P
F
 
P
V
 
G
E
 
D
V
 
S
F
 
F
S
 
K
S
 
D
D
 
G
L
 
S
F
 
Y
G
 
G
P
 
P
E
 
S
-
 
R
V
 
I
E
 
D
R
 
A
L
 
L
L
 
L
N
 
K
C
 
G
R
 
R
-
 
R
-
 
L
-
 
T
K
 
K
P
 
P
I
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
E
G
 
G
Y
 
P
A
 
A
L
 
I
G
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
T
E
 
E
I
 
I
A
 
L
M
 
Q
M
 
G
C
 
T
D
 
D
F
 
I
I
 
R
I
 
V
A
 
A
S
 
G
E
 
E
T
 
S
A
 
A
K
|
K
F
|
F
G
|
G
Q
x
I
P
x
S
E
|
E
I
x
A
N
x
K
L
 
W
G
 
S
V
 
L
V
 
Y
A
 
P
G
 
M
I
 
G
G
 
G
G
 
S
T
 
A
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
V
R
 
R
F
 
Q
V
 
I
G
 
P
K
 
Y
S
 
T
K
 
L
A
 
A
M
 
C
D
 
D
M
 
L
H
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
R
 
R
F
 
H
M
 
I
D
 
T
A
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
A
E
 
K
R
 
E
S
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
I
S
 
G
R
 
H
V
 
V
V
 
V
P
 
P
T
 
D
K
 
G
K
 
Q
L
 
A
M
 
L
E
 
T
E
 
K
A
 
A
M
 
L
G
 
E
A
 
L
A
 
A
Q
 
D
K
 
A
I
 
I
A
 
S
E
 
A
K
 
N
S
 
G
V
 
P
L
 
L
T
 
A
S
 
V
M
 
Q
A
 
A
V
 
I
K
 
L
E
 
R
A
 
S
V
 
I
N
 
R
R
 
E
S
 
T
Y
 
E
E
 
C
T
 
M
T
 
P
L
 
E
R
 
N
E
 
E
G
 
A
L
 
F
L
 
K
F
 
I
E
 
D
R
 
T
R
 
Q
L
 
I
F
 
G
H
 
I
A
 
K
M
 
V
F
 
F
A
 
L
T
 
S
E
 
D
D
 
D
Q
 
A
T
 
K
E
 
E
G
 
G
M
 
P
G
 
R
A
 
A
F
 
F
L
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
A
P
 
P
Q
 
N
F
 
F
R
 
Q
D
 
N
K
 
R

Q4WF54 Mevalonyl-coenzyme A hydratase sidH; Siderophore biosynthesis protein H; EC 4.2.1.- from Aspergillus fumigatus (strain ATCC MYA-4609 / CBS 101355 / FGSC A1100 / Af293) (Neosartorya fumigata) (see paper)
34% identity, 95% coverage: 13:256/258 of query aligns to 20:266/270 of Q4WF54

query
sites
Q4WF54
H
 
H
V
 
I
A
 
L
L
 
L
I
 
L
R
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
E
A
 
K
L
 
R
N
 
N
A
 
C
L
 
I
N
 
S
T
 
L
E
 
A
L
 
T
L
 
S
G
 
A
E
 
E
L
 
I
A
 
Q
K
 
R
A
 
L
L
 
W
R
 
T
S
 
W
A
 
F
E
 
D
E
 
T
N
 
Q
E
 
P
K
 
A
V
 
L
R
 
Y
C
 
V
I
 
A
I
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
T
E
 
G
K
 
E
A
 
S
F
 
F
A
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
L
K
 
K
E
 
E
M
 
W
S
 
N
E
 
D
K
 
L
T
 
N
F
 
-
V
 
A
E
 
R
V
 
G
F
 
I
S
 
T
S
 
N
D
 
E
L
 
M
F
 
T
G
 
A
P
 
P
E
 
G
V
 
L
E
 
A
R
 
G
L
 
L
L
 
P
N
 
R
C
 
R
R
 
R
-
 
G
-
 
S
K
 
K
P
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
N
G
 
G
Y
 
Y
A
 
C
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
F
E
 
E
I
 
M
A
 
V
M
 
A
M
 
N
C
 
C
D
 
D
F
 
I
I
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
S
E
 
E
T
 
N
A
 
A
K
 
T
F
 
F
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
V
N
 
Q
L
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
A
A
 
A
G
 
V
I
 
A
G
 
G
G
 
S
T
 
L
Q
 
P
R
 
R
L
 
L
T
 
V
R
 
R
F
 
V
V
 
L
G
 
G
K
 
K
S
 
Q
K
 
R
A
 
A
M
 
A
D
 
E
M
 
I
H
 
A
L
 
L
T
 
S
G
 
G
R
 
L
F
 
S
M
 
F
D
 
S
A
 
A
E
 
S
E
 
Q
A
 
L
E
 
E
R
 
R
S
 
W
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
N
R
 
R
V
 
V
V
 
V
P
 
E
T
 
H
K
 
D
K
 
Q
L
 
L
M
 
L
E
 
A
E
 
T
A
 
A
M
 
V
G
 
E
A
 
I
A
 
A
Q
 
T
K
 
A
I
 
I
A
 
S
E
 
R
K
 
N
S
 
S
V
 
P
L
 
D
T
 
S
S
 
V
M
 
R
A
 
V
V
 
T
K
 
M
E
 
E
A
 
G
V
 
L
N
 
H
R
 
Y
S
 
G
Y
 
W
E
 
E
T
 
M
T
 
A
L
 
S
R
 
V
E
 
E
-
 
E
-
 
A
G
 
S
L
 
S
L
 
A
F
 
L
E
 
V
R
 
D
R
 
Q
L
 
W
F
 
Y
H
 
A
A
 
K
M
 
L
F
 
M
A
 
A
T
 
G
E
 
E
D
 
N
Q
 
F
T
 
H
E
 
E
G
 
G
M
 
V
G
 
R
A
 
A
F
 
F
L
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
K
P
 
P
Q
 
Q
F
 
W
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4i52A Scmenb im complex with 1-hydroxy-2-naphthoyl-coa (see paper)
34% identity, 98% coverage: 3:255/258 of query aligns to 9:268/275 of 4i52A

query
sites
4i52A
Y
 
Y
N
 
D
T
 
D
L
 
I
I
 
L
V
 
Y
E
 
Y
I
 
K
E
 
A
D
 
G
H
 
G
V
 
I
A
 
A
L
 
K
I
 
I
R
 
V
L
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
H
A
x
K
L
x
R
N
 
N
A
|
A
L
 
F
N
 
R
T
 
P
E
 
Q
L
 
T
L
 
V
G
 
F
E
 
E
L
 
L
A
 
Y
K
 
D
A
 
A
L
 
F
R
 
C
S
 
N
A
 
A
E
 
R
E
 
E
N
 
D
E
 
N
K
 
R
V
 
I
R
 
G
C
 
V
I
 
V
I
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
S
-
 
D
-
 
G
E
 
K
K
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
C
A
x
S
G
|
G
A
x
G
D
|
D
I
x
Q
K
 
S
E
 
V
M
x
R
S
 
G
E
 
E
K
 
G
T
 
G
F
x
Y
V
 
I
E
 
D
V
 
-
F
 
-
S
 
-
S
 
-
D
 
D
L
 
Q
F
 
G
G
 
T
P
 
P
-
x
R
-
x
L
-
 
N
-
x
V
-
x
L
E
 
D
V
 
L
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
I
-
 
R
N
 
S
C
 
M
R
 
P
K
 
K
P
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
L
V
 
V
S
 
A
G
 
G
Y
|
Y
A
 
A
L
x
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
H
E
x
V
I
 
L
A
 
H
M
 
L
M
 
V
C
 
C
D
 
D
F
 
L
I
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
T
 
N
A
 
A
K
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
x
T
E
x
G
I
 
P
N
 
K
L
x
V
G
 
G
V
x
S
V
x
F
A
x
D
G
|
G
I
 
G
G
 
F
G
 
G
T
 
S
Q
 
S
R
 
Y
L
 
L
T
 
A
R
 
R
F
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
S
 
K
K
 
K
A
 
A
M
 
R
D
 
E
M
 
I
H
 
W
L
 
Y
T
 
L
G
 
C
R
 
R
F
 
Q
M
 
Y
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
S
 
M
G
 
G
L
 
M
V
 
V
S
 
N
R
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
T
 
V
K
 
D
K
 
R
L
 
L
M
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
G
M
 
I
G
 
Q
A
 
W
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
I
 
I
A
 
L
E
 
S
K
 
K
S
 
S
V
 
P
L
 
L
T
 
A
S
 
I
M
 
R
A
 
C
V
 
L
K
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
F
N
 
N
R
 
A
S
 
D
Y
 
C
-
 
D
-
 
G
E
 
Q
T
 
A
T
 
G
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
G
 
-
L
 
L
L
x
A
F
 
G
E
 
N
R
 
A
R
 
T
L
 
L
F
 
L
H
 
Y
A
x
Y
M
 
M
F
 
-
A
 
-
T
 
T
E
 
E
D
 
E
Q
 
G
T
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
K
G
 
Q
A
 
A
F
 
F
L
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
E
 
P
P
 
P
Q
 
D
F
 
F

4i4zA Synechocystis sp. Pcc 6803 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-coenzyme a synthase (menb) in complex with salicylyl-coa (see paper)
34% identity, 98% coverage: 3:255/258 of query aligns to 9:268/275 of 4i4zA

query
sites
4i4zA
Y
 
Y
N
 
D
T
 
D
L
 
I
I
 
L
V
 
Y
E
 
Y
I
 
K
E
 
A
D
 
G
H
 
G
V
 
I
A
 
A
L
 
K
I
 
I
R
 
V
L
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
x
H
A
x
K
L
x
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
N
 
R
T
 
P
E
 
Q
L
 
T
L
 
V
G
 
F
E
 
E
L
 
L
A
 
Y
K
 
D
A
 
A
L
 
F
R
 
C
S
 
N
A
 
A
E
 
R
E
 
E
N
 
D
E
 
N
K
 
R
V
 
I
R
 
G
C
 
V
I
 
V
I
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
-
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
S
-
 
D
-
 
G
E
 
K
K
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
C
A
x
S
G
|
G
A
x
G
D
|
D
I
x
Q
K
 
S
E
 
V
M
x
R
S
 
G
E
 
E
K
 
G
T
 
G
F
x
Y
V
 
I
E
 
D
V
 
-
F
 
-
S
 
-
S
 
-
D
 
D
L
 
Q
F
 
G
G
 
T
P
 
P
-
x
R
-
 
L
-
 
N
-
x
V
-
x
L
E
 
D
V
 
L
E
 
Q
R
 
R
L
 
L
L
 
I
-
 
R
N
 
S
C
 
M
R
 
P
K
 
K
P
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
L
V
 
V
S
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
L
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
H
E
x
V
I
 
L
A
 
H
M
 
L
M
 
V
C
 
C
D
 
D
F
 
L
I
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
T
 
N
A
 
A
K
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
P
x
T
E
x
G
I
 
P
N
 
K
L
x
V
G
 
G
V
x
S
V
 
F
A
x
D
G
|
G
I
 
G
G
 
F
G
 
G
T
 
S
Q
 
S
R
 
Y
L
 
L
T
 
A
R
 
R
F
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
S
 
K
K
 
K
A
 
A
M
 
R
D
 
E
M
 
I
H
x
W
L
 
Y
T
 
L
G
 
C
R
 
R
F
 
Q
M
 
Y
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
R
S
 
M
G
 
G
L
 
M
V
 
V
S
 
N
R
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
T
 
V
K
 
D
K
 
R
L
 
L
M
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
G
M
 
I
G
 
Q
A
 
W
A
 
A
Q
 
K
K
 
E
I
 
I
A
 
L
E
 
S
K
 
K
S
 
S
V
 
P
L
 
L
T
 
A
S
 
I
M
 
R
A
 
C
V
 
L
K
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
F
N
 
N
R
 
A
S
 
D
Y
 
C
-
 
D
-
 
G
E
 
Q
T
 
A
T
 
G
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
G
 
-
L
 
L
L
x
A
F
 
G
E
 
N
R
 
A
R
 
T
L
 
L
F
 
L
H
 
Y
A
x
Y
M
 
M
F
 
-
A
 
-
T
 
T
E
 
E
D
 
E
Q
 
G
T
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
K
G
 
Q
A
 
A
F
|
F
L
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
E
 
P
P
 
P
Q
 
D
F
 
F

3h02A 2.15 angstrom resolution crystal structure of naphthoate synthase from salmonella typhimurium.
34% identity, 95% coverage: 12:255/258 of query aligns to 28:259/266 of 3h02A

query
sites
3h02A
D
 
D
H
 
G
V
 
I
A
 
A
L
 
K
I
 
I
R
 
T
L
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
A
 
V
L
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
N
 
R
T
 
P
E
 
L
L
 
T
L
 
V
G
 
K
E
 
E
L
 
M
A
 
I
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
A
S
 
D
A
 
A
E
 
R
E
 
Y
N
 
D
E
 
D
K
 
N
V
 
V
R
 
G
C
 
V
I
 
I
I
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
E
S
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
C
A
 
A
G
 
G
A
x
G
D
 
D
I
 
Q
K
 
H
E
x
H
M
 
L
S
 
N
E
 
V
K
x
L
T
 
D
F
 
F
V
 
Q
E
 
R
V
 
-
F
 
-
S
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
Q
L
 
I
L
 
R
N
 
T
C
 
C
R
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
M
V
 
V
S
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
L
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
H
E
x
V
I
 
L
A
 
H
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
L
I
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
E
T
 
N
A
 
A
K
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
P
 
T
E
x
G
I
 
P
N
 
K
L
 
V
G
 
G
V
x
S
V
 
F
A
x
D
G
|
G
I
 
G
G
 
W
G
 
G
T
 
A
Q
 
S
R
 
Y
L
 
M
T
 
A
R
 
R
F
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
S
 
K
K
 
K
A
 
A
M
 
R
D
 
E
M
 
I
H
x
W
L
 
F
T
 
L
G
 
C
R
 
R
F
 
Q
M
 
Y
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
E
 
Q
A
 
A
E
 
L
R
 
D
S
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
N
R
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
T
 
L
K
 
A
K
 
D
L
 
L
M
 
E
E
 
K
E
 
E
A
 
T
M
 
V
G
 
R
A
 
W
A
 
C
Q
 
R
K
 
E
I
 
M
A
 
L
E
 
Q
K
 
N
S
 
S
V
 
P
L
 
M
T
 
A
S
 
L
M
 
R
A
 
C
V
 
L
K
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
L
N
 
N
R
 
A
S
 
D
Y
 
C
-
 
D
-
 
G
E
 
Q
T
 
A
T
 
G
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
G
 
L
L
x
A
L
 
G
F
 
N
E
 
A
R
 
T
R
 
M
L
 
L
F
 
F
H
 
-
A
 
-
M
 
-
F
x
Y
A
 
M
T
 
T
E
 
E
D
 
E
Q
 
G
T
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
R
G
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
E
 
Q
P
 
P
Q
 
D
F
 
F

4elwA Structure of e. Coli. 1,4-dihydroxy-2- naphthoyl coenzyme a synthases (menb) in complex with nitrate (see paper)
33% identity, 95% coverage: 12:255/258 of query aligns to 29:260/267 of 4elwA

query
sites
4elwA
D
 
D
H
 
G
V
 
I
A
 
A
L
 
K
I
 
I
R
 
T
L
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
A
 
V
L
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
N
 
R
T
 
P
E
 
L
L
 
T
L
 
V
G
 
K
E
 
E
L
 
M
A
 
I
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
A
S
 
D
A
 
A
E
 
R
E
 
Y
N
 
D
E
 
D
K
 
N
V
 
I
R
 
G
C
 
V
I
 
I
I
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
-
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
C
A
 
S
G
 
G
A
x
G
D
 
D
I
 
Q
K
 
K
E
 
H
M
 
L
S
 
N
E
 
V
K
x
L
T
 
D
F
 
F
V
 
Q
E
 
R
V
 
-
F
 
-
S
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
-
R
 
Q
L
 
I
L
 
R
N
 
T
C
 
C
R
 
P
K
 
K
P
 
P
I
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
M
V
 
V
S
 
A
G
 
G
Y
 
Y
A
 
S
L
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
H
E
x
V
I
 
L
A
 
H
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
F
 
L
I
 
T
I
 
I
A
 
A
S
 
A
E
 
D
T
 
N
A
 
A
K
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
x
T
E
x
G
I
 
P
N
 
K
L
 
V
G
 
G
V
x
S
V
x
F
A
x
D
G
|
G
I
 
G
G
 
W
G
 
G
T
 
A
Q
 
S
R
 
Y
L
 
M
T
 
A
R
 
R
F
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
S
 
K
K
 
K
A
 
A
M
 
R
D
 
E
M
 
I
H
x
W
L
 
F
T
 
L
G
 
C
R
 
R
F
 
Q
M
 
Y
D
 
D
A
 
A
E
 
K
E
 
Q
A
 
A
E
 
L
R
 
D
S
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
S
 
N
R
 
T
V
 
V
V
 
V
P
 
P
T
 
L
K
 
A
K
 
D
L
 
L
M
 
E
E
 
K
E
 
E
A
 
T
M
 
V
G
 
R
A
 
W
A
 
C
Q
 
R
K
 
E
I
 
M
A
 
L
E
 
Q
K
 
N
S
 
S
V
 
P
L
 
M
T
 
A
S
 
L
M
 
R
A
 
C
V
 
L
K
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
L
N
 
N
R
 
A
S
 
D
Y
 
C
-
 
D
-
 
G
E
 
Q
T
 
A
T
 
G
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
G
 
L
L
x
A
L
 
G
F
 
N
E
 
A
R
 
T
R
 
M
L
 
L
F
 
F
H
 
-
A
 
-
M
 
-
F
x
Y
A
 
M
T
 
T
E
 
E
D
 
E
Q
 
G
T
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
R
G
 
N
A
 
A
F
 
F
L
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
E
 
Q
P
 
P
Q
 
D
F
 
F

Query Sequence

>3609989 Dshi_3370 Enoyl-CoA hydratase/isomerase (RefSeq)
MAYNTLIVEIEDHVALIRLNRPDALNALNTELLGELAKALRSAEENEKVRCIILTGSEKA
FAAGADIKEMSEKTFVEVFSSDLFGPEVERLLNCRKPIIAAVSGYALGGGCEIAMMCDFI
IASETAKFGQPEINLGVVAGIGGTQRLTRFVGKSKAMDMHLTGRFMDAEEAERSGLVSRV
VPTKKLMEEAMGAAQKIAEKSVLTSMAVKEAVNRSYETTLREGLLFERRLFHAMFATEDQ
TEGMGAFLEKREPQFRDK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory