SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 408289 DVU0030 transcriptional regulator, GntR family to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3wx9A Crystal structure of pyrococcus horikoshii kynurenine aminotransferase in complex with pmp, gla, 4ad, 2og, glu and kya
29% identity, 75% coverage: 102:475/500 of query aligns to 18:396/404 of 3wx9A

query
sites
3wx9A
R
 
R
S
 
A
R
x
S
L
 
E
I
x
V
S
x
R
T
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
L
V
 
V
G
 
E
N
 
T
H
 
S
E
 
D
L
 
I
V
 
I
P
 
S
F
 
L
G
 
A
V
x
G
L
x
G
C
x
L
P
 
P
D
 
N
T
 
P
S
 
K
L
 
T
L
 
F
P
 
P
L
 
K
K
 
E
A
 
I
L
 
I
V
 
R
R
 
D
I
 
I
M
 
L
G
 
V
E
 
E
T
 
I
M
 
M
R
 
E
S
 
K
A
 
Y
P
 
A
Q
 
D
V
 
K
A
 
A
T
 
L
G
 
Q
Y
|
Y
E
 
G
T
 
T
V
 
T
Q
 
K
G
 
G
N
 
F
A
 
T
E
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
E
R
 
T
I
 
L
A
 
M
W
 
K
R
 
W
M
 
L
G
 
G
E
 
K
C
 
R
G
x
Y
M
 
G
D
 
I
V
 
S
S
 
Q
A
 
D
E
 
N
G
 
D
L
 
I
V
 
M
I
 
I
T
 
T
T
 
S
G
|
G
A
x
S
V
x
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Y
 
D
I
 
L
A
 
I
L
 
G
R
 
R
A
 
V
L
 
F
T
 
L
R
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
S
 
A
P
 
P
T
 
T
Y
|
Y
Y
x
L
C
x
A
F
 
A
L
 
L
Q
 
Q
L
 
A
L
 
F
E
 
N
T
 
F
L
 
Y
G
 
E
L
 
P
R
 
Q
A
 
Y
I
 
I
E
 
Q
A
 
I
P
 
P
S
 
L
S
 
D
P
 
D
E
 
E
K
 
G
-
 
M
-
 
K
-
 
V
G
 
E
I
 
I
D
 
L
P
 
E
E
 
E
A
 
K
V
 
L
R
 
K
H
 
E
I
 
L
V
 
K
D
 
S
R
 
Q
H
 
G
R
 
K
V
 
K
A
 
V
C
 
K
C
 
V
I
 
V
F
 
Y
S
 
T
-
x
V
P
 
P
N
 
T
F
 
F
N
 
Q
N
|
N
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
V
L
 
T
T
 
M
P
 
N
D
 
E
D
 
D
A
 
R
K
 
R
R
 
K
E
 
Y
I
 
L
L
 
L
D
 
E
I
 
L
L
 
A
A
 
S
P
 
E
R
 
Y
G
 
D
I
 
F
H
 
I
V
 
V
I
 
V
E
 
E
D
|
D
D
|
D
V
x
P
A
x
Y
A
x
G
D
x
E
L
|
L
H
 
R
Y
 
Y
G
 
S
P
 
G
V
 
N
R
 
P
P
 
E
S
 
K
T
 
K
F
 
I
S
 
K
Q
 
A
Y
 
L
D
 
D
R
 
N
H
 
E
G
 
G
L
 
R
V
 
V
T
 
I
L
 
Y
C
 
L
S
x
G
S
x
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
T
x
I
V
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
R
|
R
V
 
I
G
 
G
W
|
W
M
 
M
A
 
V
-
 
G
-
 
D
P
 
P
G
 
G
R
 
I
I
 
I
F
 
-
D
 
-
K
 
R
A
 
K
M
 
M
E
 
E
V
 
I
-
 
A
K
 
K
A
 
Q
T
 
S
T
 
T
N
 
D
V
x
L
C
 
C
C
 
T
P
 
N
T
 
V
P
 
F
T
 
G
Q
 
Q
M
 
V
A
 
V
L
 
A
A
 
W
R
 
R
Y
 
Y
L
 
V
E
 
D
Q
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
 
L
Q
 
E
R
 
K
H
 
H
L
 
I
R
 
P
R
 
E
L
 
I
R
 
R
T
 
K
A
 
F
L
 
Y
V
 
K
R
 
P
Q
 
R
M
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
R
 
L
Q
 
E
T
 
A
I
 
L
A
 
E
C
 
E
S
 
F
F
 
M
P
 
P
E
 
E
G
 
G
T
 
V
S
 
K
A
 
W
T
 
T
R
 
K
P
 
P
L
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
M
V
 
F
L
 
I
W
 
W
V
 
V
R
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
T
 
I
D
 
D
G
 
S
T
 
K
E
 
K
L
 
M
F
 
L
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
I
D
 
K
A
 
K
G
 
G
I
 
V
A
 
A
I
 
Y
A
x
V
P
 
P
G
 
G
S
 
E
I
x
A
F
 
F
S
 
Y
T
 
A
Q
 
H
D
x
R
S
 
D
Y
 
V
T
 
K
N
 
N
Y
 
T
V
 
M
R
|
R
L
 
L
G
 
N
C
 
F
N
 
T
G
 
Y
V
 
V
W
 
D
D
 
E
D
 
D
R
 
K
M
 
I
A
 
M
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
R
L
 
L
G
 
A
E
 
E

3av7A Crystal structure of pyrococcus horikoshii kynurenine aminotransferase in complex with pmp, kyn as substrates and kya as products
29% identity, 75% coverage: 102:475/500 of query aligns to 18:396/404 of 3av7A

query
sites
3av7A
R
 
R
S
 
A
R
x
S
L
 
E
I
x
V
S
x
R
T
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
L
V
 
V
G
 
E
N
 
T
H
 
S
E
 
D
L
 
I
V
 
I
P
 
S
F
 
L
G
 
A
V
 
G
L
x
G
C
 
L
P
 
P
D
 
N
T
 
P
S
 
K
L
 
T
L
 
F
P
 
P
L
 
K
K
 
E
A
 
I
L
 
I
V
 
R
R
 
D
I
 
I
M
 
L
G
 
V
E
 
E
T
 
I
M
 
M
R
 
E
S
 
K
A
 
Y
P
 
A
Q
 
D
V
 
K
A
 
A
T
 
L
G
 
Q
Y
|
Y
E
 
G
T
 
T
V
 
T
Q
 
K
G
 
G
N
 
F
A
 
T
E
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
E
R
 
T
I
 
L
A
 
M
W
 
K
R
 
W
M
 
L
G
 
G
E
 
K
C
 
R
G
 
Y
M
 
G
D
 
I
V
 
S
S
 
Q
A
 
D
E
 
N
G
 
D
L
 
I
V
 
M
I
 
I
T
 
T
T
 
S
G
|
G
A
x
S
V
x
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Y
 
D
I
 
L
A
 
I
L
 
G
R
 
R
A
 
V
L
 
F
T
 
L
R
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
S
 
A
P
 
P
T
 
T
Y
|
Y
Y
x
L
C
x
A
F
 
A
L
 
L
Q
|
Q
L
 
A
L
 
F
E
 
N
T
 
F
L
 
Y
G
 
E
L
 
P
R
 
Q
A
 
Y
I
 
I
E
 
Q
A
 
I
P
 
P
S
 
L
S
 
D
P
 
D
E
 
E
K
 
G
-
 
M
-
 
K
-
 
V
G
 
E
I
 
I
D
 
L
P
 
E
E
 
E
A
 
K
V
 
L
R
 
K
H
 
E
I
 
L
V
 
K
D
 
S
R
 
Q
H
 
G
R
 
K
V
 
K
A
 
V
C
 
K
C
 
V
I
 
V
F
 
Y
S
 
T
-
x
V
P
 
P
N
 
T
F
 
F
N
 
Q
N
|
N
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
V
L
 
T
T
 
M
P
 
N
D
 
E
D
 
D
A
 
R
K
 
R
R
 
K
E
 
Y
I
 
L
L
 
L
D
 
E
I
 
L
L
 
A
A
 
S
P
 
E
R
 
Y
G
 
D
I
 
F
H
 
I
V
 
V
I
 
V
E
 
E
D
|
D
D
 
D
V
x
P
A
x
Y
A
 
G
D
 
E
L
 
L
H
 
R
Y
 
Y
G
 
S
P
 
G
V
 
N
R
 
P
P
 
E
S
 
K
T
 
K
F
 
I
S
 
K
Q
 
A
Y
 
L
D
 
D
R
 
N
H
 
E
G
 
G
L
 
R
V
 
V
T
 
I
L
 
Y
C
 
L
S
 
G
S
x
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
I
V
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
R
|
R
V
 
I
G
 
G
W
 
W
M
 
M
A
 
V
-
 
G
-
 
D
P
 
P
G
 
G
R
 
I
I
 
I
F
 
-
D
 
-
K
 
R
A
 
K
M
 
M
E
 
E
V
 
I
-
 
A
K
 
K
A
 
Q
T
 
S
T
 
T
N
 
D
V
x
L
C
 
C
C
 
T
P
 
N
T
 
V
P
 
F
T
 
G
Q
 
Q
M
 
V
A
 
V
L
 
A
A
 
W
R
 
R
Y
 
Y
L
 
V
E
 
D
Q
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
 
L
Q
 
E
R
 
K
H
 
H
L
 
I
R
 
P
R
 
E
L
 
I
R
 
R
T
 
K
A
 
F
L
 
Y
V
 
K
R
 
P
Q
 
R
M
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
R
 
L
Q
 
E
T
 
A
I
 
L
A
 
E
C
 
E
S
 
F
F
 
M
P
 
P
E
 
E
G
 
G
T
 
V
S
 
K
A
 
W
T
 
T
R
 
K
P
 
P
L
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
M
V
 
F
L
 
I
W
 
W
V
 
V
R
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
T
 
I
D
 
D
G
 
S
T
x
K
E
 
K
L
 
M
F
 
L
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
I
D
 
K
A
 
K
G
 
G
I
 
V
A
 
A
I
 
Y
A
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
E
I
x
A
F
 
F
S
 
Y
T
 
A
Q
 
H
D
x
R
S
 
D
Y
 
V
T
 
K
N
 
N
Y
 
T
V
 
M
R
|
R
L
 
L
G
 
N
C
 
F
N
 
T
G
 
Y
V
 
V
W
 
D
D
 
E
D
 
D
R
 
K
M
 
I
A
 
M
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
R
L
 
L
G
 
A
E
 
E

3aowA Crystal structure of pyrococcus horikoshii kynurenine aminotransferase in complex with akg
29% identity, 75% coverage: 102:475/500 of query aligns to 18:396/404 of 3aowA

query
sites
3aowA
R
 
R
S
 
A
R
 
S
L
 
E
I
 
V
S
x
R
T
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
L
V
 
V
G
 
E
N
 
T
H
 
S
E
 
D
L
 
I
V
 
I
P
 
S
F
 
L
G
 
A
V
 
G
L
 
G
C
x
L
P
 
P
D
 
N
T
 
P
S
 
K
L
 
T
L
 
F
P
 
P
L
 
K
K
 
E
A
 
I
L
 
I
V
 
R
R
 
D
I
 
I
M
 
L
G
 
V
E
 
E
T
 
I
M
 
M
R
 
E
S
 
K
A
 
Y
P
 
A
Q
 
D
V
 
K
A
 
A
T
 
L
G
 
Q
Y
|
Y
E
 
G
T
 
T
V
 
T
Q
 
K
G
 
G
N
 
F
A
 
T
E
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
E
R
 
T
I
 
L
A
 
M
W
 
K
R
 
W
M
 
L
G
 
G
E
 
K
C
 
R
G
 
Y
M
 
G
D
 
I
V
 
S
S
 
Q
A
 
D
E
 
N
G
 
D
L
 
I
V
 
M
I
 
I
T
 
T
T
 
S
G
|
G
A
x
S
V
x
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Y
 
D
I
 
L
A
 
I
L
 
G
R
 
R
A
 
V
L
 
F
T
 
L
R
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
S
 
A
P
 
P
T
 
T
Y
|
Y
Y
 
L
C
x
A
F
 
A
L
 
L
Q
 
Q
L
 
A
L
 
F
E
 
N
T
 
F
L
 
Y
G
 
E
L
 
P
R
 
Q
A
 
Y
I
 
I
E
 
Q
A
 
I
P
 
P
S
 
L
S
 
D
P
 
D
E
 
E
K
 
G
-
 
M
-
 
K
-
 
V
G
 
E
I
 
I
D
 
L
P
 
E
E
 
E
A
 
K
V
 
L
R
 
K
H
 
E
I
 
L
V
 
K
D
 
S
R
 
Q
H
 
G
R
 
K
V
 
K
A
 
V
C
 
K
C
 
V
I
 
V
F
 
Y
S
 
T
-
x
V
P
 
P
N
 
T
F
 
F
N
 
Q
N
|
N
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
V
L
 
T
T
 
M
P
 
N
D
 
E
D
 
D
A
 
R
K
 
R
R
 
K
E
 
Y
I
 
L
L
 
L
D
 
E
I
 
L
L
 
A
A
 
S
P
 
E
R
 
Y
G
 
D
I
 
F
H
 
I
V
 
V
I
 
V
E
 
E
D
|
D
D
 
D
V
x
P
A
x
Y
A
 
G
D
 
E
L
 
L
H
 
R
Y
 
Y
G
 
S
P
 
G
V
 
N
R
 
P
P
 
E
S
 
K
T
 
K
F
 
I
S
 
K
Q
 
A
Y
 
L
D
 
D
R
 
N
H
 
E
G
 
G
L
 
R
V
 
V
T
 
I
L
 
Y
C
 
L
S
 
G
S
x
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
I
V
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
R
|
R
V
 
I
G
 
G
W
 
W
M
 
M
A
 
V
-
 
G
-
 
D
P
 
P
G
 
G
R
 
I
I
 
I
F
 
-
D
 
-
K
 
R
A
 
K
M
 
M
E
 
E
V
 
I
-
 
A
K
 
K
A
 
Q
T
 
S
T
 
T
N
 
D
V
x
L
C
 
C
C
 
T
P
 
N
T
 
V
P
 
F
T
 
G
Q
 
Q
M
 
V
A
 
V
L
 
A
A
 
W
R
 
R
Y
 
Y
L
 
V
E
 
D
Q
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
 
L
Q
 
E
R
 
K
H
 
H
L
 
I
R
 
P
R
 
E
L
 
I
R
 
R
T
 
K
A
 
F
L
 
Y
V
 
K
R
 
P
Q
 
R
M
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
R
 
L
Q
 
E
T
 
A
I
 
L
A
 
E
C
 
E
S
 
F
F
 
M
P
 
P
E
 
E
G
 
G
T
 
V
S
 
K
A
 
W
T
 
T
R
 
K
P
 
P
L
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
M
V
 
F
L
 
I
W
 
W
V
 
V
R
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
T
 
I
D
 
D
G
 
S
T
 
K
E
 
K
L
 
M
F
 
L
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
I
D
 
K
A
 
K
G
 
G
I
 
V
A
 
A
I
 
Y
A
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
E
I
 
A
F
 
F
S
 
Y
T
 
A
Q
 
H
D
 
R
S
 
D
Y
 
V
T
 
K
N
 
N
Y
 
T
V
 
M
R
 
R
L
 
L
G
 
N
C
 
F
N
 
T
G
 
Y
V
 
V
W
 
D
D
 
E
D
 
D
R
 
K
M
 
I
A
 
M
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
R
L
 
L
G
 
A
E
 
E

3aovA Crystal structure of pyrococcus horikoshii kynurenine aminotransferase in complex with plp
29% identity, 75% coverage: 102:475/500 of query aligns to 18:396/404 of 3aovA

query
sites
3aovA
R
 
R
S
 
A
R
 
S
L
 
E
I
 
V
S
 
R
T
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
L
V
 
V
G
 
E
N
 
T
H
 
S
E
 
D
L
 
I
V
 
I
P
 
S
F
 
L
G
 
A
V
 
G
L
 
G
C
 
L
P
 
P
D
 
N
T
 
P
S
 
K
L
 
T
L
 
F
P
 
P
L
 
K
K
 
E
A
 
I
L
 
I
V
 
R
R
 
D
I
 
I
M
 
L
G
 
V
E
 
E
T
 
I
M
 
M
R
 
E
S
 
K
A
 
Y
P
 
A
Q
 
D
V
 
K
A
 
A
T
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
E
 
G
T
 
T
V
 
T
Q
 
K
G
 
G
N
 
F
A
 
T
E
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
E
R
 
T
I
 
L
A
 
M
W
 
K
R
 
W
M
 
L
G
 
G
E
 
K
C
 
R
G
 
Y
M
 
G
D
 
I
V
 
S
S
 
Q
A
 
D
E
 
N
G
 
D
L
 
I
V
 
M
I
 
I
T
 
T
T
 
S
G
|
G
A
x
S
V
x
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Y
 
D
I
 
L
A
 
I
L
 
G
R
 
R
A
 
V
L
 
F
T
 
L
R
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
S
 
A
P
 
P
T
 
T
Y
|
Y
Y
 
L
C
 
A
F
 
A
L
 
L
Q
 
Q
L
 
A
L
 
F
E
 
N
T
 
F
L
 
Y
G
 
E
L
 
P
R
 
Q
A
 
Y
I
 
I
E
 
Q
A
 
I
P
 
P
S
 
L
S
 
D
P
 
D
E
 
E
K
 
G
-
 
M
-
 
K
-
 
V
G
 
E
I
 
I
D
 
L
P
 
E
E
 
E
A
 
K
V
 
L
R
 
K
H
 
E
I
 
L
V
 
K
D
 
S
R
 
Q
H
 
G
R
 
K
V
 
K
A
 
V
C
 
K
C
 
V
I
 
V
F
 
Y
S
 
T
-
x
V
P
 
P
N
 
T
F
 
F
N
 
Q
N
|
N
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
V
L
 
T
T
 
M
P
 
N
D
 
E
D
 
D
A
 
R
K
 
R
R
 
K
E
 
Y
I
 
L
L
 
L
D
 
E
I
 
L
L
 
A
A
 
S
P
 
E
R
 
Y
G
 
D
I
 
F
H
 
I
V
 
V
I
 
V
E
 
E
D
|
D
D
 
D
V
x
P
A
x
Y
A
 
G
D
 
E
L
 
L
H
 
R
Y
 
Y
G
 
S
P
 
G
V
 
N
R
 
P
P
 
E
S
 
K
T
 
K
F
 
I
S
 
K
Q
 
A
Y
 
L
D
 
D
R
 
N
H
 
E
G
 
G
L
 
R
V
 
V
T
 
I
L
 
Y
C
 
L
S
 
G
S
x
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
I
V
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
R
|
R
V
 
I
G
 
G
W
 
W
M
 
M
A
 
V
-
 
G
-
 
D
P
 
P
G
 
G
R
 
I
I
 
I
F
 
-
D
 
-
K
 
R
A
 
K
M
 
M
E
 
E
V
 
I
-
 
A
K
 
K
A
 
Q
T
 
S
T
 
T
N
 
D
V
 
L
C
 
C
C
 
T
P
 
N
T
 
V
P
 
F
T
 
G
Q
 
Q
M
 
V
A
 
V
L
 
A
A
 
W
R
 
R
Y
 
Y
L
 
V
E
 
D
Q
 
G
G
 
G
L
 
Y
L
 
L
Q
 
E
R
 
K
H
 
H
L
 
I
R
 
P
R
 
E
L
 
I
R
 
R
T
 
K
A
 
F
L
 
Y
V
 
K
R
 
P
Q
 
R
M
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
R
 
L
Q
 
E
T
 
A
I
 
L
A
 
E
C
 
E
S
 
F
F
 
M
P
 
P
E
 
E
G
 
G
T
 
V
S
 
K
A
 
W
T
 
T
R
 
K
P
 
P
L
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
M
V
 
F
L
 
I
W
 
W
V
 
V
R
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
T
 
I
D
 
D
G
 
S
T
 
K
E
 
K
L
 
M
F
 
L
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
I
D
 
K
A
 
K
G
 
G
I
 
V
A
 
A
I
 
Y
A
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
E
I
 
A
F
 
F
S
 
Y
T
 
A
Q
 
H
D
 
R
S
 
D
Y
 
V
T
 
K
N
 
N
Y
 
T
V
 
M
R
 
R
L
 
L
G
 
N
C
 
F
N
 
T
G
 
Y
V
 
V
W
 
D
D
 
E
D
 
D
R
 
K
M
 
I
A
 
M
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
R
L
 
L
G
 
A
E
 
E

2zyjA Crystal structure of lysn, alpha-aminoadipate aminotransferase (complexed with n-(5'-phosphopyridoxyl)-l-glutamate), from thermus thermophilus hb27 (see paper)
29% identity, 74% coverage: 106:474/500 of query aligns to 22:387/397 of 2zyjA

query
sites
2zyjA
I
|
I
S
x
R
T
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
L
V
 
T
G
 
Q
N
 
R
H
 
P
E
 
G
L
 
I
V
 
L
P
 
S
F
 
F
G
 
A
V
x
G
L
x
G
C
 
L
P
 
P
D
 
A
T
 
P
S
 
E
L
 
L
L
 
F
P
 
P
L
 
K
K
 
E
A
 
E
L
 
A
V
 
A
R
 
E
I
 
A
M
 
A
G
 
A
E
 
R
T
 
I
M
 
L
R
 
R
S
 
E
A
 
K
P
 
G
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
L
G
 
Q
Y
|
Y
E
 
S
T
 
P
V
 
T
Q
 
E
G
 
G
N
 
Y
A
 
A
E
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
A
R
 
F
I
 
V
A
 
A
W
 
E
R
 
W
M
 
I
G
 
G
E
 
-
C
 
-
G
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
V
S
 
R
A
 
P
E
 
E
G
 
E
L
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
x
S
V
x
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Y
 
D
I
 
L
A
 
V
L
 
G
R
 
K
A
 
V
L
 
F
T
 
L
R
 
D
P
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
L
Q
 
E
S
 
A
P
 
P
T
 
S
Y
|
Y
Y
 
M
C
 
G
F
 
A
L
 
I
Q
 
Q
L
 
A
L
 
F
E
 
R
T
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
P
R
 
R
A
 
F
I
 
L
E
 
T
A
 
V
P
 
P
S
 
A
S
 
G
P
 
-
E
 
E
K
 
E
G
 
G
I
 
P
D
 
D
P
 
L
E
 
D
A
 
A
V
 
L
R
 
E
H
 
E
I
 
V
V
 
L
D
 
K
R
 
R
H
 
E
R
 
R
V
 
P
A
 
R
C
 
F
C
 
L
I
 
Y
F
 
L
S
 
I
P
 
P
N
 
S
F
 
F
N
 
Q
N
|
N
P
 
P
D
 
T
G
 
G
S
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
L
D
 
P
A
 
A
K
 
R
R
 
K
E
 
R
I
 
L
L
 
L
D
 
Q
I
 
M
L
 
V
A
 
M
P
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
L
H
 
V
V
 
V
I
 
V
E
 
E
D
|
D
D
 
D
V
x
A
A
x
Y
A
 
R
D
 
E
L
 
L
H
 
Y
Y
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
A
R
 
R
-
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
L
F
 
F
S
 
E
Q
 
L
Y
 
A
D
 
R
R
 
E
H
 
A
G
 
G
L
 
Y
-
 
P
-
 
G
V
 
V
T
 
I
L
 
Y
C
 
L
S
 
G
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
V
V
 
L
A
 
S
P
 
P
G
 
G
F
 
L
R
|
R
V
 
V
G
 
A
W
 
F
-
 
A
M
 
V
A
 
A
P
 
H
G
 
P
R
 
E
I
 
A
F
 
L
D
 
Q
K
 
K
A
 
L
M
 
V
E
 
Q
V
 
A
K
 
K
A
 
Q
T
 
G
T
 
A
N
 
D
V
x
L
C
 
H
C
 
T
P
 
P
T
 
M
P
 
L
T
 
N
Q
 
Q
M
 
M
A
 
L
L
 
V
A
 
H
R
 
E
Y
 
L
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
L
 
F
L
 
S
Q
 
E
R
 
R
H
 
-
L
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
V
R
 
R
T
 
R
A
 
V
L
 
Y
V
 
R
R
 
E
Q
 
K
M
 
A
E
 
Q
A
 
A
M
 
M
R
 
L
Q
 
H
T
 
A
I
 
L
A
 
D
C
 
R
S
 
E
F
 
V
P
 
P
E
 
K
G
 
E
T
 
V
S
 
R
A
 
Y
T
 
T
R
 
R
P
 
P
L
 
K
G
 
G
G
 
G
G
 
M
V
x
F
L
 
V
W
 
W
V
 
M
R
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
K
G
 
G
T
 
L
D
 
S
G
 
A
T
 
E
E
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
R
R
 
R
A
 
A
R
 
L
D
 
E
A
 
E
G
 
N
I
 
V
A
 
A
I
 
F
A
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
G
I
 
P
F
 
F
S
 
F
T
 
A
Q
 
N
D
 
G
S
 
G
Y
 
G
T
 
E
N
 
N
Y
 
T
V
 
L
R
|
R
L
 
L
G
 
S
C
 
Y
N
 
A
G
 
T
V
 
L
W
 
D
D
 
R
D
 
E
R
 
G
M
 
I
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
R
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
G

Q72LL6 2-aminoadipate transaminase; 2-aminoadipate aminotransferase; Alpha-aminoadipate aminotransferase; AAA-AT; AadAT; EC 2.6.1.39 from Thermus thermophilus (strain ATCC BAA-163 / DSM 7039 / HB27) (see 2 papers)
29% identity, 74% coverage: 106:474/500 of query aligns to 22:387/397 of Q72LL6

query
sites
Q72LL6
I
 
I
S
x
R
T
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
L
V
 
T
G
 
Q
N
 
R
H
 
P
E
 
G
L
 
I
V
 
L
P
 
S
F
 
F
G
 
A
V
 
G
L
x
G
C
 
L
P
 
P
D
 
A
T
 
P
S
 
E
L
 
L
L
 
F
P
 
P
L
 
K
K
 
E
A
 
E
L
 
A
V
 
A
R
 
E
I
 
A
M
 
A
G
 
A
E
 
R
T
 
I
M
 
L
R
 
R
S
 
E
A
 
K
P
 
G
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
L
G
 
Q
Y
|
Y
E
 
S
T
 
P
V
 
T
Q
 
E
G
 
G
N
 
Y
A
 
A
E
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
A
R
 
F
I
 
V
A
 
A
W
 
E
R
 
W
M
 
I
G
 
G
E
 
-
C
 
-
G
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
V
S
 
R
A
 
P
E
 
E
G
 
E
L
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
S
V
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Y
 
D
I
 
L
A
 
V
L
 
G
R
 
K
A
 
V
L
 
F
T
 
L
R
 
D
P
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
L
Q
 
E
S
 
A
P
 
P
T
 
S
Y
 
Y
Y
 
M
C
 
G
F
 
A
L
 
I
Q
 
Q
L
 
A
L
 
F
E
 
R
T
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
P
R
 
R
A
 
F
I
 
L
E
 
T
A
 
V
P
 
P
S
 
A
S
 
G
P
 
-
E
 
E
K
 
E
G
 
G
I
 
P
D
 
D
P
 
L
E
 
D
A
 
A
V
 
L
R
 
E
H
 
E
I
 
V
V
 
L
D
 
K
R
 
R
H
 
E
R
 
R
V
 
P
A
 
R
C
 
F
C
 
L
I
 
Y
F
 
L
S
 
I
P
 
P
N
 
S
F
 
F
N
 
Q
N
|
N
P
 
P
D
 
T
G
 
G
S
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
L
D
 
P
A
 
A
K
 
R
R
 
K
E
 
R
I
 
L
L
 
L
D
 
Q
I
 
M
L
 
V
A
 
M
P
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
L
H
 
V
V
 
V
I
 
V
E
 
E
D
 
D
D
 
D
V
 
A
A
 
Y
A
 
R
D
 
E
L
 
L
H
 
Y
Y
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
A
R
 
R
-
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
L
F
 
F
S
 
E
Q
 
L
Y
 
A
D
 
R
R
 
E
H
 
A
G
 
G
L
 
Y
-
 
P
-
 
G
V
 
V
T
 
I
L
 
Y
C
 
L
S
 
G
S
 
S
F
 
F
S
 
S
K
 
K
T
 
V
V
 
L
A
 
S
P
 
P
G
 
G
F
 
L
R
|
R
V
 
V
G
 
A
W
 
F
-
 
A
M
 
V
A
 
A
P
 
H
G
 
P
R
 
E
I
 
A
F
 
L
D
 
Q
K
 
K
A
 
L
M
 
V
E
 
Q
V
 
A
K
 
K
A
 
Q
T
 
G
T
 
A
N
 
D
V
 
L
C
 
H
C
 
T
P
 
P
T
 
M
P
 
L
T
 
N
Q
 
Q
M
 
M
A
 
L
L
 
V
A
 
H
R
 
E
Y
 
L
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
L
 
F
L
 
S
Q
 
E
R
 
R
H
 
-
L
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
V
R
 
R
T
 
R
A
 
V
L
 
Y
V
 
R
R
 
E
Q
 
K
M
 
A
E
 
Q
A
 
A
M
 
M
R
 
L
Q
 
H
T
 
A
I
 
L
A
 
D
C
 
R
S
 
E
F
 
V
P
 
P
E
 
K
G
 
E
T
 
V
S
 
R
A
 
Y
T
 
T
R
 
R
P
 
P
L
 
K
G
 
G
G
 
G
G
 
M
V
 
F
L
 
V
W
 
W
V
 
M
R
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
K
G
 
G
T
 
L
D
 
S
G
 
A
T
 
E
E
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
R
R
 
R
A
 
A
R
 
L
D
 
E
A
 
E
G
 
N
I
 
V
A
 
A
I
 
F
A
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
G
I
 
P
F
 
F
S
 
F
T
 
A
Q
 
N
D
 
G
S
 
G
Y
 
G
T
 
E
N
 
N
Y
 
T
V
 
L
R
|
R
L
 
L
G
 
S
C
 
Y
N
 
A
G
 
T
V
 
L
W
 
D
D
 
R
D
 
E
R
 
G
M
 
I
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
R
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3cbfA Crystal structure of lysn, alpha-aminoadipate aminotransferase, from thermus thermophilus hb27 (see paper)
29% identity, 74% coverage: 106:474/500 of query aligns to 18:383/392 of 3cbfA

query
sites
3cbfA
I
|
I
S
x
R
T
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
L
V
 
T
G
 
Q
N
 
R
H
 
P
E
 
G
L
 
I
V
 
L
P
 
S
F
 
F
G
 
A
V
x
G
L
x
G
C
x
L
P
 
P
D
 
A
T
 
P
S
 
E
L
 
L
L
 
F
P
 
P
L
 
K
K
 
E
A
 
E
L
 
A
V
 
A
R
 
E
I
 
A
M
 
A
G
 
A
E
 
R
T
 
I
M
 
L
R
 
R
S
 
E
A
 
K
P
 
G
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
L
G
 
Q
Y
|
Y
E
 
S
T
 
P
V
 
T
Q
 
E
G
 
G
N
 
Y
A
 
A
E
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
A
R
 
F
I
 
V
A
 
A
W
 
E
R
 
W
M
 
I
G
 
G
E
 
-
C
 
-
G
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
V
S
 
R
A
 
P
E
 
E
G
 
E
L
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
x
S
V
x
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Y
 
D
I
 
L
A
 
V
L
 
G
R
 
K
A
 
V
L
 
F
T
 
L
R
 
D
P
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
L
Q
 
E
S
 
A
P
 
P
T
 
S
Y
|
Y
Y
 
M
C
 
G
F
 
A
L
 
I
Q
 
Q
L
 
A
L
 
F
E
 
R
T
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
P
R
 
R
A
 
F
I
 
L
E
 
T
A
 
V
P
 
P
S
 
A
S
 
G
P
 
-
E
 
E
K
 
E
G
 
G
I
 
P
D
 
D
P
 
L
E
 
D
A
 
A
V
 
L
R
 
E
H
 
E
I
 
V
V
 
L
D
 
K
R
 
R
H
 
E
R
 
R
V
 
P
A
 
R
C
 
F
C
 
L
I
x
Y
F
 
L
S
x
I
P
 
P
N
 
S
F
 
F
N
 
Q
N
|
N
P
 
P
D
 
T
G
 
G
S
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
L
D
 
P
A
 
A
K
 
R
R
 
K
E
 
R
I
 
L
L
 
L
D
 
Q
I
 
M
L
 
V
A
 
M
P
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
L
H
 
V
V
 
V
I
 
V
E
 
E
D
|
D
D
 
D
V
x
A
A
x
Y
A
 
R
D
 
E
L
 
L
H
 
Y
Y
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
A
R
 
R
-
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
L
F
 
F
S
 
E
Q
 
L
Y
 
A
D
 
R
R
 
E
H
 
A
G
 
G
L
 
Y
-
 
P
-
 
G
V
 
V
T
 
I
L
 
Y
C
 
L
S
 
G
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
V
V
 
L
A
 
S
P
 
P
G
 
G
F
 
L
R
|
R
V
 
V
G
 
A
W
 
F
-
 
A
M
 
V
A
 
A
P
 
H
G
 
P
R
 
E
I
 
A
F
 
L
D
 
Q
K
 
K
A
 
L
M
 
V
E
 
Q
V
 
A
K
 
K
A
 
Q
T
 
G
T
 
A
N
 
D
V
x
L
C
 
H
C
 
T
P
 
P
T
 
M
P
 
L
T
 
N
Q
 
Q
M
 
M
A
 
L
L
 
V
A
 
H
R
 
E
Y
 
L
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
L
 
F
L
 
S
Q
 
E
R
 
R
H
 
-
L
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
V
R
 
R
T
 
R
A
 
V
L
 
Y
V
 
R
R
 
E
Q
 
K
M
 
A
E
 
Q
A
 
A
M
 
M
R
 
L
Q
 
H
T
 
A
I
 
L
A
 
D
C
 
R
S
 
E
F
 
V
P
 
P
E
 
K
G
 
E
T
 
V
S
 
R
A
 
Y
T
 
T
R
 
R
P
 
P
L
 
K
G
 
G
G
 
G
G
 
M
V
x
F
L
 
V
W
 
W
V
 
M
R
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
K
G
 
G
T
 
L
D
 
S
G
 
A
T
 
E
E
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
R
R
 
R
A
 
A
R
 
L
D
 
E
A
 
E
G
 
N
I
 
V
A
 
A
I
 
F
A
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
G
I
 
P
F
 
F
S
 
F
T
 
A
Q
 
N
D
 
G
S
 
G
Y
 
G
T
 
E
N
 
N
Y
 
T
V
 
L
R
|
R
L
 
L
G
 
S
C
 
Y
N
 
A
G
 
T
V
 
L
W
 
D
D
 
R
D
 
E
R
 
G
M
 
I
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
R
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
G

2egyA Crystal structure of lysn, alpha-aminoadipate aminotransferase (substrate free form), from thermus thermophilus hb27
29% identity, 74% coverage: 106:474/500 of query aligns to 18:383/392 of 2egyA

query
sites
2egyA
I
 
I
S
 
R
T
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
L
V
 
T
G
 
Q
N
 
R
H
 
P
E
 
G
L
 
I
V
 
L
P
 
S
F
 
F
G
 
A
V
 
G
L
 
G
C
 
L
P
 
P
D
 
A
T
 
P
S
 
E
L
 
L
L
 
F
P
 
P
L
 
K
K
 
E
A
 
E
L
 
A
V
 
A
R
 
E
I
 
A
M
 
A
G
 
A
E
 
R
T
 
I
M
 
L
R
 
R
S
 
E
A
 
K
P
 
G
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
E
 
S
T
 
P
V
 
T
Q
 
E
G
 
G
N
 
Y
A
 
A
E
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
A
R
 
F
I
 
V
A
 
A
W
 
E
R
 
W
M
 
I
G
 
G
E
 
-
C
 
-
G
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
V
S
 
R
A
 
P
E
 
E
G
 
E
L
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
x
S
V
x
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Y
 
D
I
 
L
A
 
V
L
 
G
R
 
K
A
 
V
L
 
F
T
 
L
R
 
D
P
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
L
Q
 
E
S
 
A
P
 
P
T
 
S
Y
|
Y
Y
 
M
C
 
G
F
 
A
L
 
I
Q
 
Q
L
 
A
L
 
F
E
 
R
T
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
P
R
 
R
A
 
F
I
 
L
E
 
T
A
 
V
P
 
P
S
 
A
S
 
G
P
 
-
E
 
E
K
 
E
G
 
G
I
 
P
D
 
D
P
 
L
E
 
D
A
 
A
V
 
L
R
 
E
H
 
E
I
 
V
V
 
L
D
 
K
R
 
R
H
 
E
R
 
R
V
 
P
A
 
R
C
 
F
C
 
L
I
 
Y
F
 
L
S
 
I
P
 
P
N
 
S
F
 
F
N
 
Q
N
|
N
P
 
P
D
 
T
G
 
G
S
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
L
D
 
P
A
 
A
K
 
R
R
 
K
E
 
R
I
 
L
L
 
L
D
 
Q
I
 
M
L
 
V
A
 
M
P
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
L
H
 
V
V
 
V
I
 
V
E
 
E
D
|
D
D
 
D
V
x
A
A
x
Y
A
 
R
D
 
E
L
 
L
H
 
Y
Y
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
A
R
 
R
-
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
L
F
 
F
S
 
E
Q
 
L
Y
 
A
D
 
R
R
 
E
H
 
A
G
 
G
L
 
Y
-
 
P
-
 
G
V
 
V
T
 
I
L
 
Y
C
 
L
S
 
G
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
V
V
 
L
A
 
S
P
 
P
G
 
G
F
 
L
R
|
R
V
 
V
G
 
A
W
 
F
-
 
A
M
 
V
A
 
A
P
 
H
G
 
P
R
 
E
I
 
A
F
 
L
D
 
Q
K
 
K
A
 
L
M
 
V
E
 
Q
V
 
A
K
 
K
A
 
Q
T
 
G
T
 
A
N
 
D
V
 
L
C
 
H
C
 
T
P
 
P
T
 
M
P
 
L
T
 
N
Q
 
Q
M
 
M
A
 
L
L
 
V
A
 
H
R
 
E
Y
 
L
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
L
 
F
L
 
S
Q
 
E
R
 
R
H
 
-
L
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
V
R
 
R
T
 
R
A
 
V
L
 
Y
V
 
R
R
 
E
Q
 
K
M
 
A
E
 
Q
A
 
A
M
 
M
R
 
L
Q
 
H
T
 
A
I
 
L
A
 
D
C
 
R
S
 
E
F
 
V
P
 
P
E
 
K
G
 
E
T
 
V
S
 
R
A
 
Y
T
 
T
R
 
R
P
 
P
L
 
K
G
 
G
G
 
G
G
 
M
V
 
F
L
 
V
W
 
W
V
 
M
R
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
K
G
 
G
T
 
L
D
 
S
G
 
A
T
 
E
E
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
R
R
 
R
A
 
A
R
 
L
D
 
E
A
 
E
G
 
N
I
 
V
A
 
A
I
 
F
A
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
G
I
 
P
F
 
F
S
 
F
T
 
A
Q
 
N
D
 
G
S
 
G
Y
 
G
T
 
E
N
 
N
Y
 
T
V
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
S
C
 
Y
N
 
A
G
 
T
V
 
L
W
 
D
D
 
R
D
 
E
R
 
G
M
 
I
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
R
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
G

2z1yA Crystal structure of lysn, alpha-aminoadipate aminotransferase (complexed with n-(5'-phosphopyridoxyl)-l-leucine), from thermus thermophilus hb27
30% identity, 70% coverage: 125:474/500 of query aligns to 33:379/389 of 2z1yA

query
sites
2z1yA
C
 
L
P
 
P
D
 
A
T
 
P
S
 
E
L
 
L
L
 
F
P
 
P
L
 
K
K
 
E
A
 
E
L
 
A
V
 
A
R
 
E
I
 
A
M
 
A
G
 
A
E
 
R
T
 
I
M
 
L
R
 
R
S
 
E
A
 
K
P
 
G
Q
 
E
V
 
V
A
 
A
T
 
L
G
 
Q
Y
|
Y
E
 
S
T
 
P
V
 
T
Q
 
E
G
 
G
N
 
Y
A
 
A
E
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
A
R
 
F
I
 
V
A
 
A
W
 
E
R
 
W
M
 
I
G
 
G
E
 
-
C
 
-
G
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
V
S
 
R
A
 
P
E
 
E
G
 
E
L
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
T
 
T
G
|
G
A
x
S
V
x
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Y
 
D
I
 
L
A
 
V
L
 
G
R
 
K
A
 
V
L
 
F
T
 
L
R
 
D
P
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
P
V
 
V
V
 
L
I
 
L
Q
 
E
S
 
A
P
 
P
T
 
S
Y
|
Y
Y
x
M
C
 
G
F
 
A
L
 
I
Q
 
Q
L
 
A
L
 
F
E
 
R
T
 
L
L
 
Q
G
 
G
L
 
P
R
 
R
A
 
F
I
 
L
E
 
T
A
 
V
P
 
P
S
 
A
S
 
G
P
 
-
E
 
E
K
 
E
G
 
G
I
 
P
D
 
D
P
 
L
E
 
D
A
 
A
V
 
L
R
 
E
H
 
E
I
 
V
V
 
L
D
 
K
R
 
R
H
 
E
R
 
R
V
 
P
A
 
R
C
 
F
C
 
L
I
x
Y
F
 
L
S
 
I
P
 
P
N
 
S
F
 
F
N
 
Q
N
|
N
P
 
P
D
 
T
G
 
G
S
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
D
 
L
D
 
P
A
 
A
K
 
R
R
 
K
E
 
R
I
 
L
L
 
L
D
 
Q
I
 
M
L
 
V
A
 
M
P
 
E
R
 
R
G
 
G
I
 
L
H
 
V
V
 
V
I
 
V
E
 
E
D
|
D
D
 
D
V
x
A
A
x
Y
A
 
R
D
 
E
L
 
L
H
 
Y
Y
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
A
R
 
R
-
 
L
P
 
P
S
 
S
T
 
L
F
 
F
S
 
E
Q
 
L
Y
 
A
D
 
R
R
 
E
H
 
A
G
 
G
L
 
Y
-
 
P
-
 
G
V
 
V
T
 
I
L
 
Y
C
 
L
S
 
G
S
|
S
F
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
V
V
 
L
A
 
S
P
 
P
G
 
G
F
 
L
R
|
R
V
 
V
G
 
A
W
 
F
-
 
A
M
 
V
A
 
A
P
 
H
G
 
P
R
 
E
I
 
A
F
 
L
D
 
Q
K
 
K
A
 
L
M
 
V
E
 
Q
V
 
A
K
 
K
A
 
Q
T
 
G
T
 
A
N
 
D
V
x
L
C
 
H
C
 
T
P
 
P
T
 
M
P
 
L
T
 
N
Q
 
Q
M
 
M
A
 
L
L
 
V
A
 
H
R
 
E
Y
 
L
L
 
L
E
 
K
Q
 
E
G
 
G
L
 
F
L
 
S
Q
 
E
R
 
R
H
 
-
L
 
L
R
 
E
R
 
R
L
 
V
R
 
R
T
 
R
A
 
V
L
 
Y
V
 
R
R
 
E
Q
 
K
M
 
A
E
 
Q
A
 
A
M
 
M
R
 
L
Q
 
H
T
 
A
I
 
L
A
 
D
C
 
R
S
 
E
F
 
V
P
 
P
E
 
K
G
 
E
T
 
V
S
 
R
A
 
Y
T
 
T
R
 
R
P
 
P
L
 
K
G
 
G
G
 
G
G
 
M
V
 
F
L
 
V
W
 
W
V
 
M
R
 
E
L
 
L
P
 
P
E
 
K
G
 
G
T
 
L
D
 
S
G
 
A
T
 
E
E
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
R
R
 
R
A
 
A
R
 
L
D
 
E
A
 
E
G
 
N
I
 
V
A
 
A
I
 
F
A
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
G
I
 
P
F
 
F
S
 
F
T
 
A
Q
 
N
D
 
G
S
 
G
Y
 
G
T
 
E
N
 
N
Y
 
T
V
 
L
R
|
R
L
 
L
G
 
S
C
 
Y
N
 
A
G
 
T
V
 
L
W
 
D
D
 
R
D
 
E
R
 
G
M
 
I
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
R
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1wstA Crystal structure of multiple substrate aminotransferase (msat) from thermococcus profundus
27% identity, 74% coverage: 106:475/500 of query aligns to 19:394/403 of 1wstA

query
sites
1wstA
I
 
V
S
 
R
T
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
L
V
 
V
G
 
E
N
 
T
H
 
S
E
 
D
L
 
V
V
 
I
P
 
S
F
 
L
G
 
A
V
 
G
L
 
G
C
 
L
P
 
P
D
 
A
T
 
P
S
 
E
L
 
T
L
 
F
P
 
P
L
 
V
K
 
E
A
 
T
L
 
I
V
 
K
R
 
K
I
 
I
M
 
A
G
 
V
E
 
E
T
 
V
M
 
L
R
 
E
S
 
E
A
 
H
P
 
A
Q
 
D
V
 
K
A
 
A
T
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
E
 
G
T
 
T
V
 
T
Q
 
K
G
 
G
N
 
F
A
 
T
E
 
P
L
 
L
R
 
R
R
 
L
R
 
A
I
 
L
A
 
A
-
 
R
W
 
W
R
 
M
M
 
E
G
 
K
E
 
R
C
 
Y
G
 
D
M
 
I
D
 
P
V
 
M
S
 
S
A
 
K
E
 
V
G
 
E
L
 
I
V
 
M
I
 
T
T
 
V
T
 
A
G
|
G
A
x
S
V
x
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Y
 
D
I
 
L
A
 
I
L
 
G
R
 
R
A
 
V
L
 
F
T
 
L
R
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
P
V
 
I
V
 
V
I
 
V
Q
 
E
S
 
A
P
 
P
T
 
T
Y
|
Y
Y
 
L
C
 
A
F
 
A
L
 
I
Q
 
Q
L
 
A
L
 
F
E
 
K
T
 
Y
L
 
Y
G
 
D
L
 
P
R
 
E
A
 
F
I
 
I
E
 
S
A
 
I
P
 
P
S
 
L
S
 
D
P
 
-
E
 
D
K
 
K
G
 
G
-
 
M
-
 
R
I
 
V
D
 
D
P
 
L
E
 
L
A
 
E
V
 
E
R
 
K
H
 
L
I
 
E
V
 
E
D
 
L
R
 
R
H
 
K
-
 
Q
-
 
G
-
 
K
R
 
R
V
 
V
A
 
K
C
 
I
C
 
V
I
 
Y
F
 
T
S
x
V
P
 
S
N
 
T
F
 
F
N
 
Q
N
|
N
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
V
L
 
T
T
 
M
P
 
S
D
 
V
D
 
D
A
 
R
K
 
R
R
 
K
E
 
K
I
 
L
L
 
L
D
 
E
I
 
L
L
 
A
A
 
N
P
 
E
R
 
Y
G
 
D
I
 
F
H
 
L
V
 
I
I
 
V
E
 
E
D
|
D
D
 
G
V
x
P
A
x
Y
A
 
S
D
 
E
L
 
L
H
 
R
Y
 
Y
G
 
S
P
 
G
V
 
E
R
 
P
P
 
T
S
 
P
T
 
P
F
 
I
S
 
K
Q
 
H
Y
 
F
D
 
D
R
 
D
H
 
Y
G
 
G
L
 
R
V
 
V
T
 
I
L
 
Y
C
 
L
S
 
G
S
x
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
T
 
I
V
 
L
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
R
|
R
V
 
I
G
 
G
W
 
W
M
 
V
A
 
A
P
 
A
G
 
H
R
 
P
I
 
H
F
 
L
D
 
I
K
 
R
A
 
K
M
 
M
E
 
E
V
 
I
-
 
A
K
 
K
A
 
Q
T
 
S
T
 
I
N
 
D
V
 
L
C
 
C
C
 
T
P
 
N
T
 
T
P
 
F
T
 
G
Q
 
Q
M
 
A
A
 
I
L
 
A
A
 
W
R
 
K
Y
 
Y
L
 
V
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
L
 
Y
L
 
L
Q
 
D
R
 
E
H
 
H
L
 
I
R
 
P
R
 
K
L
 
I
R
 
I
T
 
E
A
 
F
L
 
Y
V
 
K
R
 
P
Q
 
R
M
 
R
E
 
D
A
 
A
M
 
M
R
 
L
Q
 
E
T
 
A
I
 
L
A
 
E
C
 
E
S
 
Y
F
 
M
P
 
P
E
 
E
G
 
G
T
 
V
S
 
E
A
 
W
T
 
T
R
 
K
P
 
P
L
 
E
G
 
G
G
 
G
G
 
M
V
 
F
L
 
V
W
 
R
V
 
V
R
 
T
L
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
G
T
 
I
D
 
D
G
 
T
T
 
K
E
 
L
L
 
M
F
 
M
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
V
D
 
A
A
 
K
G
 
G
I
 
V
A
 
A
I
 
Y
A
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
E
I
 
A
F
 
F
S
 
F
T
 
V
Q
 
H
D
 
R
S
 
D
Y
 
K
T
 
K
N
 
N
Y
 
T
V
 
M
R
 
R
L
 
L
G
 
N
C
 
F
N
 
T
G
 
Y
V
 
V
W
 
P
D
 
E
D
 
E
R
 
T
M
 
I
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
R
 
R
T
 
R
L
 
L
G
 
A
E
 
E

2zc0A Crystal structure of an archaeal alanine:glyoxylate aminotransferase (see paper)
28% identity, 71% coverage: 126:478/500 of query aligns to 44:402/405 of 2zc0A

query
sites
2zc0A
P
 
P
D
 
D
T
 
P
S
 
E
L
 
L
L
 
I
P
 
P
L
 
R
K
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
G
R
 
E
I
 
I
M
 
A
G
 
K
E
 
E
T
 
V
M
 
L
R
 
E
S
 
K
A
 
E
P
 
P
Q
 
K
V
 
-
A
 
S
T
 
V
G
 
M
Y
|
Y
E
 
T
T
 
P
V
 
A
Q
 
N
G
 
G
N
 
I
A
 
P
E
 
E
L
 
L
R
 
R
R
 
E
R
 
E
I
 
L
A
 
A
W
 
A
R
 
F
M
 
L
G
 
K
E
 
K
C
 
Y
G
 
D
-
 
H
M
 
L
D
 
E
V
 
V
S
 
S
A
 
P
E
 
E
G
 
N
L
 
I
V
 
V
I
 
I
T
 
T
T
 
I
G
|
G
A
x
G
V
x
T
E
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
D
I
 
L
A
 
L
L
 
G
R
 
R
A
 
V
L
 
L
T
 
I
R
 
D
P
 
P
G
 
G
D
 
D
I
 
V
V
 
V
V
 
I
I
 
T
Q
 
E
S
 
N
P
 
P
T
 
S
Y
|
Y
Y
 
I
C
 
N
F
 
T
L
 
L
Q
 
L
L
 
A
L
 
F
E
 
E
T
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
A
R
 
K
A
 
-
I
 
I
E
 
E
A
 
G
P
 
V
S
 
P
S
 
V
P
 
D
E
 
N
K
 
D
G
 
G
I
 
M
D
 
R
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
L
P
 
E
E
 
E
A
 
K
V
 
I
R
 
K
H
 
E
I
 
L
V
 
K
D
 
A
R
 
K
H
 
G
R
 
Q
V
 
K
A
 
V
C
 
K
C
 
L
I
 
I
F
 
Y
S
 
T
-
x
I
P
 
P
N
 
T
F
 
G
N
 
Q
N
|
N
P
 
P
D
 
M
G
 
G
S
 
V
L
 
T
T
 
M
P
 
S
D
 
M
D
 
E
A
 
R
K
 
R
R
 
K
E
 
A
I
 
L
L
 
L
D
 
E
I
 
I
L
 
A
A
 
S
P
 
K
R
 
Y
G
 
D
I
 
L
H
 
L
V
 
I
I
 
I
E
 
E
D
|
D
D
 
T
V
x
A
A
x
Y
A
 
N
D
 
F
L
 
M
H
 
R
Y
 
Y
-
 
E
-
 
G
G
 
G
P
 
D
V
 
I
R
 
V
P
 
P
S
 
-
T
 
-
F
 
L
S
 
K
Q
 
A
Y
 
L
D
 
D
R
 
N
H
 
E
G
 
G
L
 
R
V
 
V
T
 
I
L
 
V
C
 
A
S
 
G
S
x
T
F
 
L
S
|
S
K
|
K
T
 
V
V
 
L
A
 
G
P
x
T
G
 
G
F
 
F
R
|
R
V
 
I
G
 
G
W
 
W
-
 
I
M
 
I
A
 
A
P
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
I
F
 
L
D
 
K
K
 
K
A
 
V
M
 
L
E
 
M
V
 
Q
K
 
K
A
 
Q
T
 
P
T
 
I
N
 
D
V
x
F
C
 
C
C
 
A
P
 
P
T
 
A
P
 
I
T
 
S
Q
 
Q
M
 
Y
A
 
I
L
 
A
A
 
L
R
 
E
Y
 
Y
L
 
L
E
 
K
Q
 
R
G
 
G
L
 
Y
L
 
F
Q
 
E
R
 
K
-
 
Y
H
 
H
L
 
L
R
 
E
R
 
G
L
 
A
R
 
L
T
 
L
A
 
G
L
 
Y
V
 
K
R
 
E
Q
 
K
M
 
R
E
 
D
A
 
I
M
 
M
R
 
L
Q
 
K
T
 
A
I
 
L
A
 
E
C
 
N
S
 
H
F
 
L
P
 
P
E
 
-
G
 
N
T
 
A
S
 
E
A
 
F
T
 
T
R
 
K
P
 
P
L
 
I
G
 
A
G
 
G
G
 
M
V
 
F
L
 
V
W
 
M
V
 
F
R
 
F
L
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
G
T
 
A
D
 
D
G
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
F
-
 
A
T
 
N
E
 
E
L
 
L
F
 
M
Y
 
E
R
 
R
A
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
E
G
 
G
I
 
V
A
 
V
I
 
V
A
 
V
P
 
P
G
 
G
S
 
K
I
 
P
F
 
F
S
 
Y
T
 
T
Q
 
D
D
 
E
S
 
S
Y
 
G
T
 
K
N
 
N
Y
 
A
V
 
I
R
 
R
L
 
L
G
 
N
C
 
F
N
 
S
G
 
R
V
 
P
W
 
S
D
 
K
D
 
E
R
 
E
M
 
I
A
 
P
Q
 
I
G
 
G
L
 
I
R
 
K
T
 
K
L
 
L
G
 
A
E
 
K
L
 
L
A
 
Y
R
 
K

1vp4A Crystal structure of a putative aminotransferase (tm1131) from thermotoga maritima msb8 at 1.82 a resolution
25% identity, 75% coverage: 102:477/500 of query aligns to 24:410/420 of 1vp4A

query
sites
1vp4A
R
 
K
S
 
S
R
 
S
L
 
I
I
 
I
S
 
R
T
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
A
 
F
V
 
A
G
 
A
N
 
D
H
 
K
E
 
D
L
 
A
V
 
I
P
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
G
L
 
G
C
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
P
S
 
E
L
 
T
L
 
F
P
 
P
L
 
R
K
 
K
A
 
E
L
 
L
V
 
A
R
 
E
I
 
I
M
 
A
G
 
K
E
 
E
T
 
I
M
 
I
R
 
E
S
 
K
A
 
E
P
 
Y
Q
 
H
V
 
Y
A
 
T
T
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
E
 
S
T
 
T
V
 
T
Q
 
E
G
 
G
N
 
D
A
 
P
E
 
V
L
 
L
R
 
K
R
 
Q
R
 
Q
I
 
I
A
 
L
W
 
K
R
 
L
M
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
M
-
 
Y
G
 
G
E
 
I
C
 
T
G
 
G
M
 
L
D
 
D
V
 
-
S
 
-
A
 
E
E
 
D
G
 
N
L
 
L
V
 
I
I
 
F
T
 
T
T
 
V
G
|
G
A
x
S
V
x
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
Y
 
D
I
 
L
A
 
I
L
 
G
R
 
K
A
 
L
L
 
F
T
 
L
R
 
D
P
 
D
G
 
E
D
 
S
I
 
Y
V
 
C
V
 
V
I
 
L
Q
 
D
S
 
D
P
 
P
T
 
A
Y
|
Y
Y
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
I
-
 
N
C
 
A
F
 
F
L
 
R
Q
 
Q
L
 
Y
L
 
L
E
 
A
T
 
N
L
 
F
G
 
V
L
 
V
R
 
V
A
 
P
I
 
L
E
 
E
A
 
-
P
 
-
S
 
-
S
 
-
P
 
-
E
 
D
K
 
D
G
 
G
I
 
M
D
 
D
P
 
L
E
 
N
A
 
V
V
 
L
R
 
E
H
 
R
I
 
K
V
 
L
-
 
S
-
 
E
-
 
F
D
 
D
R
 
K
H
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
I
-
 
K
R
 
Q
V
 
V
A
 
K
C
 
F
C
 
I
I
 
Y
F
 
V
S
 
V
P
 
S
N
 
N
F
 
F
N