SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 5208217 FitnessBrowser__PV4:5208217 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3nt6A Structure of the shewanella loihica pv-4 nadh-dependent persulfide reductase c43s/c531s double mutant (see paper)
100% identity, 100% coverage: 1:565/566 of query aligns to 1:565/565 of 3nt6A

query
sites
3nt6A
M
 
M
K
 
K
K
 
K
I
 
I
L
 
L
I
 
I
I
|
I
G
|
G
G
 
G
V
|
V
A
|
A
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
|
A
R
|
R
A
 
A
R
 
R
R
|
R
L
 
L
S
 
S
E
 
E
T
 
T
A
 
A
E
 
E
I
 
I
I
 
I
M
 
M
F
 
F
E
|
E
R
|
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
V
|
V
S
|
S
F
 
F
A
 
A
N
|
N
C
x
S
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
H
 
H
I
 
I
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
S
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
L
 
L
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
S
F
 
F
K
 
K
A
 
A
R
 
R
F
 
F
N
 
N
V
 
V
E
 
E
V
 
V
R
 
R
V
 
V
K
 
K
H
 
H
E
|
E
V
|
V
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
T
 
T
V
 
V
R
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
L
D
 
D
G
 
G
S
 
S
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
L
 
L
L
 
L
L
 
L
S
|
S
P
|
P
G
|
G
A
 
A
A
 
A
P
 
P
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
P
I
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
V
D
 
D
N
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
T
H
 
H
S
 
S
L
|
L
R
|
R
N
 
N
I
 
I
P
 
P
D
 
D
M
 
M
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Q
 
Q
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
M
 
M
N
 
N
N
 
N
V
 
V
E
 
E
H
 
H
A
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
|
F
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
M
M
 
M
E
 
E
S
 
S
L
 
L
H
 
H
H
 
H
L
 
L
G
 
G
I
 
I
K
 
K
T
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
D
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
V
D
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
M
A
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
R
 
R
D
 
D
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
S
E
 
E
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
Q
 
Q
V
 
V
Q
 
Q
T
 
T
H
 
H
V
 
V
A
 
A
S
 
S
D
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
D
 
D
T
 
T
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
H
 
H
I
 
I
K
 
K
G
 
G
H
 
H
L
 
L
S
 
S
L
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
N
 
N
G
 
G
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
T
D
 
D
L
 
L
L
 
L
I
 
I
M
 
M
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
R
 
R
P
 
P
E
 
E
T
 
T
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
R
D
 
D
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
I
K
 
K
V
 
V
N
 
N
A
 
A
M
 
M
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
S
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
G
|
G
D
|
D
A
 
A
V
 
V
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
C
 
C
L
 
L
V
 
V
P
|
P
L
|
L
A
|
A
G
 
G
P
 
P
A
 
A
N
|
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
M
 
M
A
 
A
A
 
A
D
 
D
N
 
N
M
 
M
F
 
F
G
 
G
R
 
R
E
 
E
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
I
C
 
C
K
 
K
V
 
V
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
K
 
K
N
 
N
E
 
E
K
 
K
Q
 
Q
L
 
L
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
A
F
 
F
E
 
E
K
 
K
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
A
S
 
S
H
 
H
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
V
V
 
V
S
 
S
F
 
F
K
 
K
L
 
L
L
 
L
F
 
F
D
 
D
P
 
P
V
 
V
K
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
I
F
 
F
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
D
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
D
K
 
K
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
M
 
M
A
 
A
V
 
V
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
T
V
 
V
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
H
 
H
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
A
 
A
K
 
K
D
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
N
Q
|
Q
A
 
A
A
 
A
F
|
F
V
|
V
A
 
A
S
 
S
N
|
N
I
 
I
I
 
I
K
 
K
G
 
G
D
|
D
A
|
A
T
 
T
P
 
P
I
 
I
H
 
H
F
 
F
D
 
D
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
S
E
 
E
D
 
D
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
R
N
 
N
P
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
A
V
 
V
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
D
R
 
R
M
 
M
H
 
H
E
 
E
L
 
L
P
 
P
K
 
K
D
 
D
K
 
K
E
 
E
I
 
I
I
 
I
I
 
I
F
 
F
C
 
S
Q
 
Q
V
 
V
G
|
G
L
|
L
R
 
R
G
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
R
 
R
N
 
N
L
 
L
I
 
I
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
K
 
K
F
 
F
A
 
A
S
 
S

3ictA Crystal structure of reduced bacillus anthracis coadr-rhd (see paper)
50% identity, 96% coverage: 19:561/566 of query aligns to 23:547/557 of 3ictA

query
sites
3ictA
R
|
R
A
 
L
R
 
R
R
|
R
L
 
L
S
 
S
E
 
E
T
 
E
A
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
I
M
 
M
F
 
V
E
|
E
R
|
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
V
x
I
S
|
S
F
 
F
A
 
A
N
|
N
C
|
C
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
H
 
Y
I
 
I
S
 
G
G
 
G
E
 
V
I
 
I
A
 
T
Q
 
E
R
 
R
S
 
Q
A
 
K
L
 
L
V
 
L
L
 
V
Q
 
Q
T
 
T
P
 
V
E
 
E
S
 
R
F
 
M
K
 
S
A
 
K
R
 
R
F
 
F
N
 
N
V
 
L
E
 
D
V
 
I
R
 
R
V
 
V
K
 
L
H
 
S
E
 
E
V
|
V
V
 
V
A
 
K
I
 
I
D
 
N
R
 
K
A
 
E
A
 
E
K
 
K
L
 
T
V
 
I
T
 
T
V
 
I
R
 
K
R
 
N
L
 
V
L
 
T
D
 
T
G
 
N
S
 
E
E
 
T
Y
 
Y
Q
 
N
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
T
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
L
S
|
S
P
|
P
G
|
G
A
 
A
A
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
I
D
 
E
N
 
E
-
 
A
P
 
K
L
 
A
T
 
L
H
 
F
S
 
T
L
|
L
R
 
R
N
 
N
I
 
V
P
 
P
D
 
D
M
 
T
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
K
Q
 
A
T
 
Y
I
 
I
Q
 
D
M
 
E
N
 
K
N
 
K
V
 
P
E
 
R
H
 
H
A
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
L
 
V
E
 
E
M
 
M
M
 
V
E
 
E
S
 
N
L
 
L
H
 
R
H
 
E
L
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
E
T
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
V
E
 
E
L
 
M
A
 
A
D
 
N
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
T
 
P
P
 
P
V
 
I
D
 
D
R
 
Y
E
 
E
M
 
M
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
A
 
V
H
 
H
Q
 
E
A
 
H
I
 
M
R
 
K
D
 
N
Q
 
H
G
 
D
V
 
V
D
 
E
L
 
L
R
 
V
L
 
F
G
 
E
T
 
D
A
 
G
L
 
V
S
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
-
Y
 
-
Q
 
-
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
H
 
-
V
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
D
A
 
A
A
 
L
G
 
E
E
 
E
D
 
N
T
 
G
A
 
A
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
V
L
 
V
T
 
R
L
 
L
S
 
K
N
 
S
G
 
G
E
 
S
L
 
V
L
 
I
E
 
Q
T
 
T
D
 
D
L
 
M
L
 
L
I
 
I
M
 
L
A
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
T
 
S
Q
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
K
D
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
L
G
 
G
E
 
V
L
 
R
G
 
G
G
 
T
I
 
I
K
 
K
V
 
V
N
 
N
A
 
E
M
 
K
M
 
F
Q
 
Q
T
 
T
S
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
H
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
G
|
G
D
|
D
A
 
A
V
 
I
E
 
E
E
 
V
Q
 
K
D
 
D
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
E
Q
 
T
A
 
E
C
 
T
L
 
M
V
 
I
P
|
P
L
|
L
A
|
A
G
 
W
P
 
P
A
 
A
N
|
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
M
 
M
A
 
L
A
 
A
D
 
D
N
 
I
M
 
I
F
 
H
G
 
G
R
 
H
E
 
T
E
 
D
R
 
S
-
 
L
Y
 
Y
Q
 
K
G
 
G
T
 
T
Q
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
S
I
 
V
C
 
A
K
 
K
V
 
V
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
T
V
 
V
G
 
A
A
 
T
T
 
T
G
 
G
K
 
L
N
 
N
E
 
E
K
 
K
Q
 
I
L
 
L
K
 
K
Q
 
R
A
 
L
G
 
N
I
 
I
A
 
P
F
 
Y
E
 
E
K
 
V
V
 
V
Y
 
H
V
 
V
H
 
Q
T
 
A
A
 
N
S
 
S
H
 
H
A
 
A
S
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
G
 
N
A
 
A
E
 
T
V
 
P
V
 
V
S
 
L
F
 
I
K
 
K
L
 
L
L
 
I
F
 
F
D
 
N
P
 
K
V
 
D
K
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
I
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
T
V
 
L
G
 
G
K
 
R
D
 
D
G
 
G
I
 
V
D
 
D
K
 
K
R
 
R
I
 
M
D
 
D
V
 
V
M
 
I
A
 
A
V
 
T
A
 
A
Q
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
V
E
 
L
Q
 
D
L
 
L
Q
 
P
H
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
|
S
Y
 
Y
A
 
A
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
G
 
S
S
 
S
A
 
A
K
|
K
D
 
D
V
 
P
I
 
V
N
 
N
Q
 
M
A
 
V
A
 
G
F
 
Y
V
 
A
A
 
A
S
 
S
N
|
N
I
 
I
I
 
V
K
 
D
G
 
G
D
x
F
A
x
V
T
 
D
P
 
T
I
 
V
H
 
Q
F
 
W
D
 
H
Q
 
E
I
 
I
D
 
D
N
 
R
L
 
I
S
 
V
E
 
E
D
 
N
-
 
G
Q
 
G
L
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
V
R
 
R
N
 
E
P
 
P
G
 
N
E
 
E
L
 
L
Q
 
K
N
 
Q
G
 
G
G
 
M
L
 
I
E
 
K
G
 
G
A
 
S
V
 
I
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
D
R
 
R
M
 
L
H
 
E
E
 
E
L
 
V
P
 
P
K
 
V
D
 
D
K
 
K
E
 
D
I
 
I
I
 
Y
I
 
I
F
 
T
C
 
C
Q
 
Q
V
 
L
G
|
G
L
x
M
R
 
R
G
 
G
N
x
Y
V
 
V
A
 
A
Y
 
A
R
 
R
Q
 
M
L
 
L
V
 
M
N
 
E
N
 
K
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
A
 
V
R
 
K
N
 
N
L
 
V
I
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

3icsB Crystal structure of partially reduced bacillus anthracis coadr-rhd (see paper)
50% identity, 96% coverage: 19:561/566 of query aligns to 20:544/554 of 3icsB

query
sites
3icsB
R
|
R
A
 
L
R
 
R
R
|
R
L
 
L
S
 
S
E
 
E
T
 
E
A
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
I
M
 
M
F
 
V
E
|
E
R
|
R
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
V
x
I
S
|
S
F
 
F
A
 
A
N
|
N
C
|
C
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
H
 
Y
I
 
I
S
 
G
G
 
G
E
 
V
I
 
I
A
 
T
Q
 
E
R
 
R
S
 
Q
A
 
K
L
 
L
V
 
L
L
 
V
Q
 
Q
T
 
T
P
 
V
E
 
E
S
 
R
F
 
M
K
 
S
A
 
K
R
 
R
F
 
F
N
 
N
V
 
L
E
 
D
V
 
I
R
 
R
V
 
V
K
 
L
H
 
S
E
 
E
V
|
V
V
 
V
A
 
K
I
 
I
D
 
N
R
 
K
A
 
E
A
 
E
K
 
K
L
 
T
V
 
I
T
 
T
V
 
I
R
 
K
R
 
N
L
 
V
L
 
T
D
 
T
G
 
N
S
 
E
E
 
T
Y
 
Y
Q
 
N
E
 
E
S
 
A
Y
 
Y
D
 
D
T
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
L
S
|
S
P
|
P
G
|
G
A
 
A
A
 
K
P
 
P
I
 
I
V
 
V
P
 
P
P
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
G
V
 
I
D
 
E
N
 
E
-
 
A
P
 
K
L
 
A
T
 
L
H
 
F
S
 
T
L
|
L
R
|
R
N
 
N
I
 
V
P
 
P
D
 
D
M
 
T
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
K
Q
 
A
T
 
Y
I
 
I
Q
 
D
M
 
E
N
 
K
N
 
K
V
 
P
E
 
R
H
 
H
A
 
A
T
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
|
G
F
 
F
I
|
I
G
 
G
L
 
V
E
 
E
M
 
M
M
 
V
E
 
E
S
 
N
L
 
L
H
 
R
H
 
E
L
 
R
G
 
G
I
 
I
K
 
E
T
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
V
E
|
E
L
x
M
A
 
A
D
 
N
Q
 
Q
V
 
V
M
 
M
T
x
P
P
 
P
V
 
I
D
 
D
R
 
Y
E
 
E
M
 
M
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
A
 
V
H
 
H
Q
 
E
A
 
H
I
 
M
R
 
K
D
 
N
Q
 
H
G
 
D
V
 
V
D
 
E
L
 
L
R
 
V
L
 
F
G
 
E
T
 
D
A
 
G
L
 
V
S
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
-
Y
 
-
Q
 
-
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
H
 
-
V
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
D
A
 
A
A
 
L
G
 
E
E
 
E
D
 
N
T
 
G
A
 
A
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
V
L
 
V
T
 
R
L
 
L
S
 
K
N
 
S
G
 
G
E
 
S
L
 
V
L
 
I
E
 
Q
T
 
T
D
 
D
L
 
M
L
 
L
I
 
I
M
 
L
A
 
A
I
|
I
G
|
G
V
 
V
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
T
 
S
Q
 
S
L
|
L
A
 
A
R
 
K
D
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
L
G
 
G
E
 
V
L
 
R
G
 
G
G
 
T
I
 
I
K
 
K
V
 
V
N
 
N
A
 
E
M
 
K
M
 
F
Q
 
Q
T
 
T
S
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
H
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
V
 
I
G
|
G
D
|
D
A
 
A
V
 
I
E
 
E
E
 
V
Q
 
K
D
 
D
F
 
F
V
 
V
T
 
T
G
 
E
Q
 
T
A
 
E
C
 
T
L
 
M
V
 
I
P
|
P
L
|
L
A
|
A
G
 
W
P
 
P
A
|
A
N
|
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
M
 
M
A
 
L
A
 
A
D
 
D
N
 
I
M
 
I
F
 
H
G
 
G
R
 
H
E
 
T
E
 
D
R
 
S
-
 
L
Y
 
Y
Q
 
K
G
 
G
T
 
T
Q
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
S
I
 
V
C
 
A
K
 
K
V
 
V
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
T
V
 
V
G
 
A
A
 
T
T
 
T
G
 
G
K
 
L
N
 
N
E
 
E
K
 
K
Q
 
I
L
 
L
K
 
K
Q
 
R
A
 
L
G
 
N
I
 
I
A
 
P
F
 
Y
E
 
E
K
 
V
V
 
V
Y
 
H
V
 
V
H
 
Q
T
 
A
A
 
N
S
 
S
H
 
H
A
 
A
S
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
G
 
N
A
 
A
E
 
T
V
 
P
V
 
V
S
 
L
F
 
I
K
 
K
L
 
L
L
 
I
F
 
F
D
 
N
P
 
K
V
 
D
K
 
S
G
 
G
T
 
K
I
 
I
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
T
V
 
L
G
 
G
K
 
R
D
 
D
G
 
G
I
 
V
D
 
D
K
 
K
R
 
R
I
 
M
D
 
D
V
 
V
M
 
I
A
 
A
V
 
T
A
 
A
Q
 
I
R
 
K
A
 
A
G
 
N
M
 
L
T
 
T
V
 
V
E
 
L
Q
 
D
L
 
L
Q
 
P
H
 
D
L
 
L
E
 
E
L
 
L
S
|
S
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
G
 
S
S
 
S
A
 
A
K
|
K
D
 
D
V
 
P
I
 
V
N
 
N
Q
x
M
A
 
V
A
 
G
F
x
Y
V
x
A
A
 
A
S
 
S
N
|
N
I
 
I
I
 
V
K
 
D
G
 
G
D
x
F
A
x
V
T
 
D
P
 
T
I
 
V
H
 
Q
F
 
W
D
 
H
Q
 
E
I
 
I
D
 
D
N
 
R
L
 
I
S
 
V
E
 
E
D
 
N
-
 
G
Q
 
G
L
 
Y
L
 
L
L
 
I
D
 
D
V
 
V
R
 
R
N
 
E
P
 
P
G
 
N
E
 
E
L
 
L
Q
 
K
N
 
Q
G
 
G
G
 
M
L
 
I
E
 
K
G
 
G
A
 
S
V
 
I
N
 
N
I
 
I
P
 
P
V
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
D
R
 
R
M
 
L
H
 
E
E
 
E
L
 
V
P
 
P
K
 
V
D
 
D
K
 
K
E
 
D
I
 
I
I
 
Y
I
 
I
F
 
T
C
 
C
Q
 
Q
V
 
L
G
|
G
L
x
M
R
 
R
G
 
G
N
x
Y
V
 
V
A
 
A
Y
 
A
R
 
R
Q
 
M
L
 
L
V
 
M
N
 
E
N
 
K
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
A
 
V
R
 
K
N
 
N
L
 
V
I
 
D
G
 
G
G
 
G
Y
 
F
R
 
K
T
 
L
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

8a56B Coenzyme a-persulfide reductase (coapr) from enterococcus faecalis (see paper)
45% identity, 99% coverage: 3:563/566 of query aligns to 2:534/539 of 8a56B

query
sites
8a56B
K
 
K
I
 
I
L
 
V
I
 
I
I
|
I
G
|
G
G
 
G
V
|
V
A
 
A
G
|
G
G
 
G
A
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
x
T
R
|
R
A
 
L
R
 
R
R
|
R
L
 
L
S
 
M
E
 
E
T
 
D
A
 
A
E
 
E
I
 
I
I
 
V
M
 
V
F
 
M
E
|
E
R
x
K
G
 
G
E
 
P
Y
 
F
V
 
V
S
 
S
F
 
F
A
 
A
N
 
N
C
|
C
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
H
 
Y
I
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
S
 
E
A
 
Q
L
 
L
V
 
L
L
 
V
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
A
F
 
L
K
 
K
A
 
A
R
 
R
F
|
F
N
 
N
V
 
L
E
 
D
V
 
V
R
 
R
V
 
P
K
 
H
H
 
H
E
 
E
V
|
V
V
 
V
A
 
A
I
 
I
D
 
D
R
 
P
A
 
I
A
 
E
K
 
K
L
 
V
V
 
I
T
 
T
V
 
V
R
 
K
R
 
H
L
 
-
L
 
-
D
 
E
G
 
T
S
 
E
E
 
I
Y
 
L
Q
 
T
E
 
E
S
 
H
Y
 
Y
D
 
D
T
 
K
L
 
L
L
 
I
L
 
L
S
|
S
P
|
P
G
|
G
A
 
A
A
 
K
P
 
P
I
 
F
V
 
V
P
 
P
P
 
P
I
 
I
P
 
T
G
 
G
V
 
L
-
 
A
D
 
E
N
 
A
P
 
K
L
 
N
T
 
V
H
 
F
S
 
S
L
 
L
R
 
R
N
 
N
I
 
V
P
 
P
D
 
D
M
 
L
D
 
D
R
 
Q
I
 
I
L
 
M
Q
 
-
T
 
T
I
 
A
Q
 
L
M
 
T
N
 
P
N
 
E
V
 
T
E
 
K
H
 
R
A
 
A
T
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
F
 
F
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
M
M
 
A
E
 
E
S
 
N
L
 
L
H
 
Q
H
 
K
L
 
R
G
 
G
I
 
L
K
 
E
T
 
V
T
 
T
L
 
L
L
 
V
E
 
E
L
 
K
A
 
A
D
 
P
Q
 
H
V
 
V
M
 
L
T
 
P
P
 
P
V
 
L
D
 
D
R
 
E
E
 
E
M
 
M
A
 
A
G
 
A
F
 
F
A
 
V
H
 
K
Q
 
A
A
 
E
I
 
L
R
 
S
D
 
K
Q
 
N
G
 
N
V
 
V
D
 
Q
L
 
V
R
 
I
L
 
T
G
 
G
T
 
-
A
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
-
Y
 
-
Q
 
-
V
 
-
Q
 
Q
T
 
S
H
 
A
V
 
V
A
 
A
S
 
F
D
 
E
A
 
E
A
 
E
G
 
G
E
 
Q
D
 
-
T
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
V
L
 
I
T
 
R
L
 
L
S
 
E
N
 
D
G
 
G
E
 
Q
L
 
T
L
 
L
E
 
A
T
 
S
D
 
D
L
 
L
L
 
T
I
 
I
M
 
L
A
 
S
I
 
V
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
T
 
N
Q
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
V
D
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
A
I
 
T
G
 
G
E
 
L
L
 
R
G
 
G
G
 
G
I
 
I
K
 
V
V
 
V
N
 
D
A
 
E
M
 
H
M
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
S
 
N
D
 
Q
P
 
P
A
 
D
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
V
 
V
G
|
G
D
|
D
A
 
A
V
 
I
E
 
V
E
 
V
Q
 
K
D
 
Q
F
 
Q
V
 
I
T
 
T
G
 
Q
Q
 
E
A
 
D
C
 
A
L
 
L
V
 
I
P
x
S
L
|
L
A
|
A
G
 
S
P
 
P
A
 
A
N
 
N
R
 
R
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
M
 
Q
A
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
V
M
 
I
F
 
A
G
 
G
R
 
L
E
 
E
E
 
R
R
 
K
Y
 
N
Q
 
Q
G
 
G
T
 
S
Q
 
I
G
 
G
T
 
T
A
 
A
I
 
I
C
 
V
K
 
R
V
 
V
F
 
F
D
 
D
L
 
L
A
 
T
V
 
A
G
 
A
A
 
S
T
 
T
G
 
G
K
 
L
N
 
S
E
 
E
K
 
R
Q
 
A
L
 
A
K
 
K
Q
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
T
F
 
T
E
 
A
K
 
V
V
 
V
Y
 
H
V
x
I
H
 
S
T
 
G
A
 
K
S
 
D
H
 
H
A
 
A
S
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
G
 
G
A
 
A
E
 
T
V
 
D
V
 
L
S
 
Q
F
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
V
F
 
F
D
 
H
P
 
P
V
 
T
K
 
T
G
 
G
T
 
E
I
 
I
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
G
V
 
I
G
 
G
K
 
A
D
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
D
K
 
K
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
I
M
 
L
A
 
A
V
 
T
A
 
A
Q
 
I
R
 
K
A
 
G
G
 
Q
M
 
L
T
 
T
V
 
I
E
 
F
Q
 
D
L
 
L
Q
 
P
H
 
E
L
 
L
E
 
E
L
 
F
S
 
T
Y
|
Y
A
|
A
P
 
P
P
 
P
Y
 
F
G
 
G
S
 
S
A
 
A
K
|
K
D
 
D
V
 
P
I
 
V
N
 
N
Q
x
M
A
 
L
A
 
G
F
x
Y
V
 
A
A
 
A
S
 
M
N
 
N
I
 
L
I
 
V
K
 
E
G
 
G
D
 
L
A
 
S
T
 
E
P
 
N
I
 
V
H
 
Q
F
 
W
D
 
Y
Q
 
E
I
 
L
D
 
S
N
 
N
-
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
K
D
 
G
Q
 
A
L
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
R
N
 
N
P
 
P
G
 
-
E
 
-
L
 
-
Q
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
A
L
 
F
E
 
K
G
 
N
A
 
A
V
 
V
N
 
S
I
 
I
P
 
P
V
 
L
D
 
N
E
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
E
R
 
R
M
 
L
H
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
D
K
 
K
D
 
S
K
 
T
E
 
E
I
 
Y
I
 
I
I
 
V
F
 
S
C
 
C
Q
 
H
V
 
S
G
|
G
L
|
L
R
 
R
G
 
S
N
x
Y
V
 
I
A
 
A
Y
 
E
R
 
R
Q
 
M
L
 
L
V
 
K
N
 
Q
N
 
A
G
 
G
Y
 
I
R
 
S
A
 
A
R
 
K
N
 
N
L
 
L
I
 
D
G
 
G
G
 
A
Y
 
F
R
 
A
T
 
L
Y
 
Y
K
 
R
F
 
M

6pfzA Structure of a NAD-dependent persulfide reductase from a. Fulgidus (see paper)
35% identity, 96% coverage: 18:563/566 of query aligns to 17:541/541 of 6pfzA

query
sites
6pfzA
A
 
S
R
|
R
A
 
I
R
 
R
R
|
R
L
 
K
S
 
D
E
 
G
T
 
D
A
 
A
E
 
S
I
 
I
I
 
T
M
 
V
F
 
V
E
|
E
R
x
A
G
 
G
E
 
K
Y
 
Y
V
|
V
S
|
S
F
 
L
A
x
G
N
x
R
C
|
C
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
H
 
Y
I
 
V
S
 
G
G
 
G
E
 
L
I
 
V
A
 
H
Q
 
E
R
 
V
S
 
D
A
 
N
L
 
L
-
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
T
-
 
Y
-
 
G
V
 
A
L
 
V
Q
 
R
T
 
D
P
 
E
E
 
A
S
 
Y
F
 
F
K
 
K
A
 
K
R
 
L
F
x
K
N
 
N
V
 
I
E
 
D
V
 
V
R
 
L
V
 
T
K
 
E
H
 
T
E
 
V
V
x
A
V
 
T
A
 
E
I
 
I
D
 
D
R
 
R
A
 
S
A
 
R
K
 
K
L
 
T
V
 
V
T
 
K
V
 
I
R
 
V
R
 
R
L
 
-
L
 
-
D
 
N
G
 
G
S
 
S
E
 
E
Y
 
D
Q
 
E
E
 
L
S
 
N
Y
 
Y
D
 
D
T
 
Y
L
 
L
L
 
V
L
 
I
S
x
A
P
x
T
G
|
G
A
 
A
A
 
R
P
 
P
I
 
A
V
 
K
P
 
P
P
 
P
I
 
I
P
 
E
G
 
G
V
 
I
D
 
E
N
 
A
P
 
E
L
 
G
T
 
V
H
 
V
S
 
T
L
|
L
R
 
T
N
 
S
I
 
A
P
 
E
D
 
E
M
 
A
D
 
E
R
 
K
I
 
I
L
 
I
Q
 
E
T
 
M
I
 
W
Q
 
E
M
 
-
N
 
E
N
 
G
V
 
A
E
 
E
H
 
K
A
 
A
T
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
S
M
 
A
E
 
E
S
 
A
L
 
L
H
 
K
H
 
N
L
 
L
G
 
D
I
 
M
K
 
E
T
 
V
T
 
T
L
 
V
L
 
I
E
 
E
L
 
M
A
 
M
D
 
D
Q
 
R
V
 
V
M
 
A
T
 
P
P
 
A
-
 
M
V
 
L
D
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
M
A
 
A
G
 
V
F
 
L
A
 
V
H
 
E
Q
 
N
A
 
H
I
 
L
R
 
R
D
 
E
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
N
L
 
V
R
 
V
L
 
T
G
 
S
T
 
T
A
 
R
L
 
V
S
 
E
E
 
K
V
 
I
S
 
V
Y
 
S
Q
 
Q
V
 
-
Q
 
-
T
 
-
H
 
-
V
 
-
A
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
I
 
-
K
 
D
G
 
D
H
 
K
L
 
V
S
 
R
L
 
A
T
 
V
L
 
I
S
 
A
N
 
N
G
 
G
E
 
K
L
 
E
L
 
Y
E
 
P
T
 
A
D
 
D
L
 
V
L
 
V
I
 
V
M
 
V
A
 
A
I
 
T
G
 
G
V
 
I
R
 
K
P
 
P
E
 
N
T
 
S
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
E
D
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
K
I
 
I
G
 
G
E
 
E
L
 
T
G
 
G
G
 
A
I
 
I
K
 
W
V
 
V
N
 
D
A
 
E
M
 
Y
M
 
M
Q
 
R
T
 
T
S
 
S
D
 
D
P
 
E
A
 
S
I
 
I
Y
 
Y
A
 
A
V
 
G
G
|
G
D
|
D
A
 
C
V
 
V
E
 
E
E
 
T
Q
 
T
D
 
C
F
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
A
 
K
C
 
I
L
 
I
V
 
A
P
|
P
L
x
F
A
x
G
G
x
D
P
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
K
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
M
 
V
A
 
I
A
 
G
D
 
E
N
 
N
M
 
I
F
 
T
G
 
G
R
 
G
E
 
R
E
 
A
R
 
V
Y
 
F
Q
 
P
G
 
G
T
 
V
Q
 
I
G
 
R
T
|
T
A
 
A
I
 
I
C
 
F
K
 
K
V
 
V
F
 
F
D
 
D
L
 
F
A
 
T
V
 
A
G
 
A
A
 
S
T
 
A
G
 
G
K
 
V
N
 
N
E
 
E
K
 
Q
Q
 
M
L
 
A
K
 
K
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
D
F
 
Y
E
 
F
K
 
T
V
 
V
Y
 
I
V
 
A
H
 
P
T
 
S
A
 
P
S
 
D
H
 
R
A
 
A
S
 
H
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
G
 
Q
A
 
A
E
 
N
V
 
Y
V
 
I
S
 
R
F
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
I
F
 
V
D
 
E
P
 
K
V
 
G
K
 
S
G
 
W
T
 
R
I
 
V
F
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
A
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
M
D
 
G
G
 
E
I
 
V
D
 
A
K
 
K
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
M
 
L
A
 
S
V
 
T
A
 
A
Q
 
I
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
M
 
M
T
 
T
V
 
I
E
 
D
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
A
H
 
N
L
 
L
E
x
D
L
|
L
S
 
A
Y
|
Y
A
 
A
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
G
 
S
S
 
P
A
 
A
K
 
L
D
 
D
V
 
P
I
 
V
N
 
I
Q
 
T
A
 
I
A
 
A
F
 
N
V
|
V
A
 
A
S
 
M
N
 
N
I
 
K
I
 
R
K
 
D
G
 
G
D
x
L
A
x
F
T
 
E
P
 
G
I
 
I
H
 
N
F
 
V
D
 
F
Q
 
E
I
 
L
D
 
-
N
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
K
D
 
D
Q
 
I
L
 
V
L
 
I
L
 
L
D
 
D
V
 
V
R
 
R
N
 
S
P
 
E
G
 
E
E
 
E
L
 
R
Q
 
I
N
 
E
G
 
-
G
 
-
L
 
S
E
 
E
G
 
K
A
 
V
V
 
I
N
 
H
I
 
I
P
 
P
V
 
I
D
 
L
E
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
E
R
 
R
M
 
L
H
 
D
E
 
E
L
 
I
P
 
P
K
 
R
D
 
D
K
 
K
E
 
E
I
 
I
I
 
V
I
 
V
F
 
V
C
 
C
Q
 
A
V
 
I
G
|
G
L
|
L
R
 
R
G
 
S
N
x
F
V
 
E
A
 
A
Y
 
S
R
 
R
Q
 
I
L
 
L
V
 
K
N
 
H
N
 
A
G
 
G
Y
 
F
R
 
E
A
 
K
R
 
V
N
 
K
L
 
I
I
 
L
G
 
E
G
 
G
Y
 
G
R
 
M
T
 
A
Y
 
F
K
 
W
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3cgeA Pyridine nucleotide complexes with bacillus anthracis coenzyme a- disulfide reductase: a structural analysis of dual NAD(p)h specificity (see paper)
34% identity, 81% coverage: 5:461/566 of query aligns to 4:440/444 of 3cgeA

query
sites
3cgeA
L
 
V
I
 
I
I
|
I
G
 
G
G
 
G
V
x
D
A
|
A
G
x
A
G
 
G
A
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
x
M
R
 
Q
A
 
I
R
 
V
R
|
R
L
 
N
S
 
D
E
 
E
T
 
N
A
 
A
E
 
N
I
 
V
I
 
V
M
 
T
F
x
L
E
|
E
R
x
K
G
 
G
E
 
E
Y
 
I
V
x
Y
S
|
S
F
 
Y
A
 
A
N
x
Q
C
|
C
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
H
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
G
E
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
S
R
 
T
S
 
E
A
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
A
Q
x
R
T
 
N
P
 
V
E
 
K
S
 
T
F
 
F
K
 
R
A
 
D
R
 
K
F
 
Y
N
 
G
V
 
I
E
 
D
V
 
A
R
 
K
V
 
V
K
 
R
H
 
H
E
 
E
V
|
V
V
 
T
A
 
K
I
 
V
D
 
D
R
 
T
A
 
E
A
 
K
K
 
K
L
 
I
V
 
V
T
 
Y
V
 
A
R
 
E
R
 
H
L
 
T
L
 
K
D
 
T
G
 
K
S
 
D
E
 
V
Y
 
F
Q
 
E
E
 
F
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
T
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
I
S
 
A
P
x
T
G
|
G
A
 
V
A
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
E
I
 
W
P
 
E
G
 
G
V
 
R
D
 
D
N
 
L
P
 
Q
L
 
G
T
 
V
H
 
H
S
 
L
L
 
L
R
 
K
N
 
T
I
 
I
P
 
P
D
 
D
M
 
A
D
 
E
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
T
 
T
I
 
L
Q
 
E
M
 
T
N
 
N
N
 
K
V
 
V
E
 
E
H
 
D
A
 
V
T
 
T
V
 
I
V
x
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
F
x
A
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
M
 
M
M
 
A
E
 
E
S
 
T
L
 
F
H
 
V
H
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
K
K
 
K
T
 
V
T
 
R
L
 
M
L
 
I
E
|
E
L
x
R
A
x
N
D
 
D
Q
 
H
V
 
I
M
 
G
T
|
T
P
 
I
V
 
Y
D
 
D
R
 
G
E
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
E
F
 
Y
A
 
I
H
 
Y
Q
 
K
A
 
E
I
 
A
R
 
D
D
 
K
Q
 
H
G
 
H
V
 
I
D
 
E
L
 
I
R
 
L
L
 
T
G
 
N
T
 
E
A
 
N
L
 
V
S
 
K
E
 
A
V
 
F
S
 
K
Y
 
G
Q
 
N
V
 
E
Q
 
R
T
 
V
H
 
E
V
 
A
A
 
V
S
 
E
D
 
T
A
 
D
A
 
K
G
 
G
E
 
T
D
 
Y
T
 
K
A
 
A
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
D
 
D
L
 
L
L
 
V
I
 
L
M
 
V
A
 
S
I
x
V
G
|
G
V
 
V
R
 
K
P
 
P
E
 
N
T
 
T
Q
 
D
L
 
F
A
 
L
R
 
E
D
 
G
A
 
T
G
 
N
L
 
I
A
 
R
I
 
T
G
 
N
E
 
H
L
 
K
G
 
G
G
 
A
I
 
I
K
 
E
V
 
V
N
 
N
A
 
A
M
 
Y
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
S
 
N
D
 
V
P
 
Q
A
 
D
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
C
V
 
A
E
 
T
E
 
H
Q
 
Y
D
 
H
F
 
V
V
 
I
T
 
K
G
 
E
Q
 
I
A
 
H
C
 
D
L
 
H
V
 
I
P
|
P
L
x
I
A
x
G
G
 
T
P
 
T
A
|
A
N
|
N
R
 
K
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
M
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
L
N
 
N
M
 
M
F
 
L
G
 
D
R
 
K
E
 
R
E
 
R
R
 
A
Y
 
F
Q
 
K
G
 
G
T
 
T
Q
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
G
I
 
I
C
 
I
K
 
K
V
 
F
F
 
M
D
 
N
L
 
L
A
 
T
V
 
L
G
 
A
A
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
L
N
 
N
E
 
E
K
 
K
Q
 
E
L
 
A
K
 
K
Q
 
G
A
 
L
G
 
H
I
 
I
A
 
P
F
 
Y
E
 
K
K
 
T
V
 
V
Y
 
K
V
 
V
H
 
D
T
 
S
A
 
T
S
 
N
H
 
M
A
 
A
S
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
G
 
N
A
 
A
E
 
K
V
 
P
V
 
L
S
 
Y
F
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
F
 
Y
D
 
R
P
 
S
V
 
D
K
 
T
G
 
K
T
 
Q
I
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
G
Q
 
Q
A
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
E
D
 
E
G
 
G
I
 
V
D
 
D
K
 
K
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
M
 
I
A
 
A
V
 
M
A
 
A
Q
 
L
R
 
F
A
 
N
G
 
K
M
 
M
T
 
S
V
 
I
E
 
H
Q
 
D
L
 
L
Q
 
E
H
 
D
L
 
V
E
 
D
L
 
L
S
 
S
Y
|
Y
A
|
A
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
G
 
N
S
 
S
A
 
V
K
 
W
D
 
D
V
 
P
I
 
I
N
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3cgdA Pyridine nucleotide complexes with bacillus anthracis coenzyme a- disulfide reductase: a structural analysis of dual NAD(p)h specificity (see paper)
34% identity, 81% coverage: 5:461/566 of query aligns to 4:440/444 of 3cgdA

query
sites
3cgdA
L
 
V
I
 
I
I
|
I
G
|
G
G
 
G
V
x
D
A
|
A
G
x
A
G
 
G
A
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
x
M
R
x
Q
A
 
I
R
 
V
R
|
R
L
 
N
S
 
D
E
 
E
T
 
N
A
 
A
E
 
N
I
 
V
I
 
V
M
 
T
F
x
L
E
|
E
R
x
K
G
 
G
E
 
E
Y
 
I
V
x
Y
S
|
S
F
x
Y
A
 
A
N
x
Q
C
|
C
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
H
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
G
E
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
S
R
 
T
S
 
E
A
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
A
Q
x
R
T
 
N
P
 
V
E
 
K
S
 
T
F
 
F
K
 
R
A
 
D
R
 
K
F
 
Y
N
 
G
V
 
I
E
 
D
V
 
A
R
 
K
V
 
V
K
 
R
H
 
H
E
 
E
V
|
V
V
 
T
A
 
K
I
 
V
D
 
D
R
 
T
A
 
E
A
 
K
K
 
K
L
 
I
V
 
V
T
 
Y
V
 
A
R
 
E
R
 
H
L
 
T
L
 
K
D
 
T
G
 
K
S
 
D
E
 
V
Y
 
F
Q
 
E
E
 
F
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
T
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
I
S
x
A
P
x
T
G
 
G
A
 
V
A
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
E
I
 
W
P
 
E
G
 
G
V
 
R
D
 
D
N
 
L
P
 
Q
L
 
G
T
 
V
H
 
H
S
 
L
L
 
L
R
 
K
N
 
T
I
 
I
P
 
P
D
 
D
M
 
A
D
 
E
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
T
 
T
I
 
L
Q
 
E
M
 
T
N
 
N
N
 
K
V
 
V
E
 
E
H
 
D
A
 
V
T
 
T
V
 
I
V
x
I
G
|
G
G
 
G
G
|
G
F
x
A
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
|
E
M
 
M
M
 
A
E
 
E
S
 
T
L
 
F
H
 
V
H
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
K
K
 
K
T
 
V
T
 
R
L
 
M
L
 
I
E
|
E
L
x
R
A
 
N
D
 
D
Q
 
H
V
 
I
M
 
G
T
 
T
P
 
I
V
 
Y
D
 
D
R
 
G
E
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
E
F
 
Y
A
 
I
H
 
Y
Q
 
K
A
 
E
I
 
A
R
 
D
D
 
K
Q
 
H
G
 
H
V
 
I
D
 
E
L
 
I
R
 
L
L
 
T
G
 
N
T
 
E
A
 
N
L
 
V
S
 
K
E
 
A
V
 
F
S
 
K
Y
 
G
Q
 
N
V
 
E
Q
 
R
T
 
V
H
 
E
V
 
A
A
 
V
S
 
E
D
 
T
A
 
D
A
 
K
G
 
G
E
 
T
D
 
Y
T
 
K
A
 
A
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
D
 
D
L
 
L
L
 
V
I
 
L
M
 
V
A
 
S
I
x
V
G
|
G
V
 
V
R
 
K
P
 
P
E
 
N
T
 
T
Q
 
D
L
 
F
A
 
L
R
 
E
D
 
G
A
 
T
G
 
N
L
 
I
A
 
R
I
 
T
G
 
N
E
 
H
L
 
K
G
 
G
G
 
A
I
 
I
K
 
E
V
 
V
N
 
N
A
 
A
M
 
Y
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
S
 
N
D
 
V
P
 
Q
A
 
D
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
C
V
 
A
E
 
T
E
 
H
Q
 
Y
D
 
H
F
 
V
V
 
I
T
 
K
G
 
E
Q
 
I
A
 
H
C
 
D
L
 
H
V
 
I
P
|
P
L
x
I
A
x
G
G
 
T
P
 
T
A
|
A
N
|
N
R
 
K
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
M
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
L
N
 
N
M
 
M
F
 
L
G
 
D
R
 
K
E
 
R
E
 
R
R
 
A
Y
 
F
Q
 
K
G
 
G
T
 
T
Q
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
G
I
 
I
C
 
I
K
 
K
V
 
F
F
 
M
D
 
N
L
 
L
A
 
T
V
 
L
G
 
A
A
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
L
N
 
N
E
 
E
K
 
K
Q
 
E
L
 
A
K
 
K
Q
 
G
A
 
L
G
 
H
I
 
I
A
 
P
F
 
Y
E
 
K
K
 
T
V
 
V
Y
 
K
V
 
V
H
 
D
T
 
S
A
 
T
S
 
N
H
 
M
A
 
A
S
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
G
 
N
A
 
A
E
 
K
V
 
P
V
 
L
S
 
Y
F
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
F
 
Y
D
 
R
P
 
S
V
 
D
K
 
T
G
 
K
T
 
Q
I
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
G
Q
 
Q
A
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
E
D
 
E
G
 
G
I
 
V
D
 
D
K
 
K
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
M
 
I
A
 
A
V
 
M
A
 
A
Q
 
L
R
 
F
A
 
N
G
 
K
M
 
M
T
 
S
V
 
I
E
 
H
Q
 
D
L
 
L
Q
 
E
H
 
D
L
 
V
E
 
D
L
 
L
S
 
S
Y
|
Y
A
|
A
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
G
 
N
S
 
S
A
 
V
K
 
W
D
 
D
V
 
P
I
 
I
N
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3cgbA Pyridine nucleotide complexes with bacillus anthracis coenzyme a- disulfide reductase: a structural analysis of dual NAD(p)h specificity (see paper)
34% identity, 81% coverage: 5:461/566 of query aligns to 4:440/444 of 3cgbA

query
sites
3cgbA
L
 
V
I
 
I
I
|
I
G
|
G
G
 
G
V
x
D
A
|
A
G
x
A
G
 
G
A
 
M
S
 
S
A
 
A
A
 
A
A
x
M
R
 
Q
A
 
I
R
 
V
R
|
R
L
 
N
S
 
D
E
 
E
T
 
N
A
 
A
E
 
N
I
 
V
I
 
V
M
 
T
F
 
L
E
|
E
R
x
K
G
 
G
E
 
E
Y
 
I
V
x
Y
S
|
S
F
x
Y
A
 
A
N
x
Q
C
|
C
G
 
G
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
H
 
V
I
 
I
S
 
S
G
 
G
E
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
S
R
 
T
S
 
E
A
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
A
Q
x
R
T
 
N
P
 
V
E
 
K
S
 
T
F
 
F
K
 
R
A
 
D
R
 
K
F
 
Y
N
 
G
V
 
I
E
 
D
V
 
A
R
 
K
V
 
V
K
 
R
H
 
H
E
 
E
V
|
V
V
 
T
A
 
K
I
 
V
D
 
D
R
 
T
A
 
E
A
 
K
K
 
K
L
 
I
V
 
V
T
 
Y
V
 
A
R
 
E
R
 
H
L
 
T
L
 
K
D
 
T
G
 
K
S
 
D
E
 
V
Y
 
F
Q
 
E
E
 
F
S
 
S
Y
 
Y
D
 
D
T
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
I
S
 
A
P
x
T
G
 
G
A
 
V
A
 
R
P
 
P
I
 
V
V
 
M
P
 
P
P
 
E
I
 
W
P
 
E
G
 
G
V
 
R
D
 
D
N
 
L
P
 
Q
L
 
G
T
 
V
H
 
H
S
 
L
L
|
L
R
 
K
N
 
T
I
 
I
P
 
P
D
 
D
M
 
A
D
 
E
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Q
 
K
T
 
T
I
 
L
Q
 
E
M
 
T
N
 
N
N
 
K
V
 
V
E
 
E
H
 
D
A
 
V
T
 
T
V
 
I
V
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
A
I
|
I
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
M
M
 
A
E
 
E
S
 
T
L
 
F
H
 
V
H
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
K
K
 
K
T
 
V
T
 
R
L
 
M
L
 
I
E
 
E
L
 
R
A
 
N
D
 
D
Q
 
H
V
 
I
M
 
G
T
 
T
P
 
I
V
 
Y
D
 
D
R
 
G
E
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
E
F
 
Y
A
 
I
H
 
Y
Q
 
K
A
 
E
I
 
A
R
 
D
D
 
K
Q
 
H
G
 
H
V
 
I
D
 
E
L
 
I
R
 
L
L
 
T
G
 
N
T
 
E
A
 
N
L
 
V
S
 
K
E
 
A
V
 
F
S
 
K
Y
 
G
Q
 
N
V
 
E
Q
 
R
T
 
V
H
 
E
V
 
A
A
 
V
S
 
E
D
 
T
A
 
D
A
 
K
G
 
G
E
 
T
D
 
Y
T
 
K
A
 
A
H
 
-
Q
 
-
H
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
S
 
-
N
 
-
G
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
T
 
-
D
 
D
L
 
L
L
 
V
I
 
L
M
 
V
A
 
S
I
 
V
G
 
G
V
 
V
R
 
K
P
 
P
E
 
N
T
 
T
Q
 
D
L
 
F
A
 
L
R
 
E
D
 
G
A
 
T
G
 
N
L
 
I
A
 
R
I
 
T
G
 
N
E
 
H
L
 
K
G
 
G
G
 
A
I
 
I
K
 
E
V
 
V
N
 
N
A
 
A
M
 
Y
M
 
M
Q
 
Q
T
 
T
S
 
N
D
 
V
P
 
Q
A
 
D
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
V
 
A
G
|
G
D
|
D
A
 
C
V
 
A
E
 
T
E
 
H
Q
 
Y
D
 
H
F
 
V
V
 
I
T
 
K
G
 
E
Q
 
I
A
 
H
C
 
D
L
 
H
V
 
I
P
 
P
L
x
I
A
x
G
G
 
T
P
 
T
A
|
A
N
|
N
R
 
K
Q
 
Q
G
 
G
R
|
R
M
 
L
A
 
A
A
 
G
D
 
L
N
 
N
M
 
M
F
 
L
G
 
D
R
 
K
E
 
R
E
 
R
R
 
A
Y
 
F
Q
 
K
G
 
G
T
 
T
Q
 
L
G
 
G
T
 
T
A
 
G
I
 
I
C
 
I
K
 
K
V
 
F
F
 
M
D
 
N
L
 
L
A
 
T
V
 
L
G
 
A
A
 
R
T
 
T
G
 
G
K
 
L
N
 
N
E
 
E
K
 
K
Q
 
E
L
 
A
K
 
K
Q
 
G
A
 
L
G
 
H
I
 
I
A
 
P
F
 
Y
E
 
K
K
 
T
V
 
V
Y
 
K
V
 
V
H
 
D
T
 
S
A
 
T
S
 
N
H
 
M
A
 
A
S
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
G
 
N
A
 
A
E
 
K
V
 
P
V
 
L
S
 
Y
F
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
F
 
Y
D
 
R
P
 
S
V
 
D
K
 
T
G
 
K
T
 
Q
I
 
L
F
 
L
G
 
G
A
 
G
Q
 
Q
A
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
E
D
 
E
G
 
G
I
 
V
D
 
D
K
 
K
R
 
R
I
 
I
D
 
D
V
 
V
M
 
I
A
 
A
V
 
M
A
 
A
Q
 
L
R
 
F
A
 
N
G
 
K
M
 
M
T
 
S
V
 
I
E
 
H
Q
 
D
L
 
L
Q
 
E
H
 
D
L
 
V
E
 
D
L
 
L
S
 
S
Y
|
Y
A
|
A
P
 
P
P
 
P
Y
 
Y
G
 
N
S
 
S
A
x
V
K
 
W
D
 
D
V
 
P
I
 
I
N
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A