SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 5208717 Shew_1220 pyruvate carboxylase subunit B (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2nx9B Crystal structure of the carboxyltransferase domain of the oxaloacetate decarboxylase na+ pump from vibrio cholerae (see paper)
69% identity, 75% coverage: 3:451/601 of query aligns to 5:453/453 of 2nx9B

query
sites
2nx9B
K
 
K
P
 
R
L
 
V
A
 
G
L
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
|
D
A
 
A
H
 
H
Q
|
Q
S
 
S
I
 
L
L
 
F
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
I
D
 
D
D
 
D
M
 
M
L
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
A
P
 
Q
L
 
Q
L
 
L
D
 
D
K
 
Q
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
W
 
W
S
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
C
W
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
A
 
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
G
 
G
E
 
E
D
 
D
P
 
P
W
 
W
E
 
Q
R
 
R
I
 
L
R
 
R
E
 
L
L
 
L
K
 
K
K
 
Q
A
 
A
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
T
P
 
P
Q
 
L
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
L
 
L
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
H
 
H
Y
 
Y
G
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
V
V
 
V
H
 
D
R
 
T
F
 
F
V
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
H
 
V
Q
 
K
N
 
N
G
 
G
V
 
M
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
R
I
 
V
F
 
F
D
|
D
A
 
A
M
 
M
N
 
N
D
 
D
V
 
V
R
 
R
N
 
N
L
 
M
E
 
Q
T
 
Q
A
 
A
V
 
L
K
 
Q
S
 
A
V
 
V
V
 
K
E
 
K
V
 
M
G
 
G
G
 
A
H
 
H
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
I
 
L
S
 
C
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
S
 
S
P
 
P
V
 
V
H
 
H
T
 
N
L
 
L
D
 
Q
T
 
T
W
 
W
V
 
V
D
 
D
M
 
V
A
 
A
K
 
Q
R
 
Q
L
 
L
E
 
A
D
 
E
M
 
L
G
 
G
C
 
V
H
 
D
S
 
S
L
 
I
C
 
A
I
 
L
K
|
K
D
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
K
 
T
P
 
P
F
 
Y
D
 
A
A
 
A
F
 
E
D
 
E
L
 
L
I
 
V
S
 
S
Q
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
K
Q
 
Q
T
 
V
N
 
D
L
 
V
I
 
E
I
 
L
S
 
H
M
 
L
Q
x
H
C
 
C
H
|
H
A
 
S
T
 
T
T
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
A
T
 
D
A
 
M
T
 
T
Y
 
L
Q
 
L
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
R
L
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
S
 
S
M
 
M
S
 
S
Q
 
G
T
 
T
Y
 
Y
G
 
G
H
 
H
S
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
T
 
S
L
 
L
V
 
V
A
 
A
M
 
T
V
 
L
E
 
Q
D
 
G
T
 
T
D
 
G
R
 
Y
A
 
D
T
 
T
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
M
 
I
A
 
A
L
 
K
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
R
 
R
E
 
D
V
 
V
R
 
R
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
V
 
H
A
 
A
F
 
F
E
 
E
G
 
G
E
 
M
L
 
M
K
 
K
G
 
G
I
 
S
D
 
D
S
 
A
R
 
R
I
 
I
L
 
L
R
 
V
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
M
 
M
L
 
L
T
 
T
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
S
Q
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
Q
Q
 
Q
G
 
N
A
 
A
A
 
L
D
 
D
K
 
K
L
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
I
P
 
P
K
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
E
D
 
E
L
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
V
T
|
T
P
 
P
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
 
V
L
 
V
T
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Y
 
Y
K
 
K
S
 
T
L
 
I
T
 
T
K
 
K
E
 
E
T
 
T
E
 
S
G
 
G
V
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
A
 
K
T
 
T
P
 
P
A
 
A
P
 
P
V
 
V
N
 
N
R
 
T
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
G
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
I
C
 
T
C
 
C
R
 
R
P
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
P
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
M
D
 
P
S
 
T
L
 
L
R
 
Q
A
 
D
E
 
R
L
 
V
S
 
L
E
 
Q
K
 
Q
A
 
A
A
 
K
S
 
E
E
 
Q
Q
 
H
I
 
I
S
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
N
L
 
A
D
 
I
D
 
D
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Y
 
I
A
 
A
L
 
L
F
 
F
P
 
D
Q
 
Q
I
 
V
G
 
G
L
 
W
K
 
K
F
 
F
L
 
L
K
 
A
N
 
N
R
 
R

5ks8D Crystal structure of two-subunit pyruvate carboxylase from methylobacillus flagellatus (see paper)
51% identity, 99% coverage: 7:600/601 of query aligns to 5:578/580 of 5ks8D

query
sites
5ks8D
L
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
|
R
D
|
D
A
 
G
H
 
H
Q
|
Q
S
 
S
I
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
R
 
R
I
 
T
D
 
D
D
 
D
M
 
M
L
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
C
P
 
S
L
 
K
L
 
L
D
 
D
K
 
A
V
 
V
G
 
G
F
 
Y
W
 
W
S
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
A
W
 
W
G
 
G
G
|
G
A
|
A
T
 
T
F
 
F
D
|
D
A
 
A
C
 
C
I
 
V
R
|
R
Y
|
Y
L
 
L
G
 
R
E
 
E
D
 
D
P
 
P
W
 
W
E
 
E
R
 
R
I
 
L
R
 
K
E
 
K
L
 
L
K
 
R
K
 
K
A
 
A
M
 
L
P
 
P
N
 
N
T
 
S
P
 
R
Q
 
L
Q
 
Q
M
 
M
L
|
L
L
 
L
R
|
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
|
Y
R
 
R
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
D
 
D
D
 
D
L
 
V
V
 
V
H
 
R
R
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
Q
R
 
K
A
 
S
H
 
A
Q
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
R
I
 
I
F
|
F
D
|
D
A
 
A
M
 
M
N
 
N
D
 
D
V
 
L
R
 
R
N
 
N
L
 
L
E
 
K
T
 
V
A
 
S
V
 
I
K
 
E
S
 
S
V
 
V
V
 
K
E
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
K
H
 
H
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
T
 
T
I
 
I
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
S
 
S
P
 
P
V
 
V
H
 
H
T
 
D
L
 
I
D
 
P
T
 
Y
W
 
F
V
 
V
D
 
N
M
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
S
M
 
F
G
 
G
C
 
C
H
 
D
S
 
T
L
 
I
C
 
A
I
 
I
K
|
K
D
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
S
L
 
L
L
 
L
K
 
T
P
 
P
F
 
Q
D
 
V
A
 
T
F
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
V
S
 
K
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
E
Q
 
A
T
 
V
N
 
S
L
 
L
I
 
P
I
 
I
S
 
H
M
 
L
Q
x
H
C
 
A
H
|
H
A
 
A
T
 
T
T
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
A
T
 
S
A
 
M
T
 
S
Y
 
I
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
D
A
 
N
G
 
G
I
 
V
D
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
G
A
 
C
I
 
I
S
 
S
S
 
S
M
 
F
S
 
A
Q
 
E
T
 
G
Y
 
A
G
 
S
H
 
L
S
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
T
 
S
L
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
A
V
 
L
E
 
K
D
 
G
T
 
T
D
 
E
R
 
Y
A
 
D
T
 
T
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
R
 
R
E
 
E
V
 
V
R
 
R
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
V
 
W
A
 
Q
F
 
F
E
 
E
G
 
S
E
 
E
L
 
F
K
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
T
R
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
V
A
 
N
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
|
G
M
|
M
L
 
I
T
 
S
N
|
N
M
 
L
E
 
S
N
 
N
Q
|
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
L
D
 
D
K
 
R
L
 
M
D
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
D
E
 
E
I
 
I
P
 
P
K
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
I
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
T
|
T
P
 
P
T
 
T
S
|
S
Q
|
Q
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
M
T
 
T
G
 
G
E
 
A
R
 
R
Y
 
Y
K
 
K
S
 
S
L
 
V
T
 
T
K
 
N
E
 
E
T
 
V
E
 
K
G
 
N
V
 
Y
L
 
L
K
 
L
G
 
G
E
 
H
Y
 
Y
G
 
G
A
 
K
T
 
A
P
 
P
A
 
S
P
 
T
V
 
V
N
 
N
R
 
P
E
 
D
L
 
V
Q
 
R
A
 
N
R
 
L
V
 
A
L
 
V
A
 
G
G
 
N
A
 
A
E
 
Q
A
 
V
I
 
I
C
 
E
C
 
C
R
 
R
P
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
T
A
 
A
E
 
E
L
 
M
D
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
N
E
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
G
K
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
S
E
 
A
Q
 
A
I
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
M
F
 
F
P
 
P
Q
 
D
I
 
L
G
 
A
L
 
K
K
 
T
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
N
 
E
R
 
R
D
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
N
A
 
A
F
 
G
E
 
S
P
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
-
P
 
P
Q
 
L
A
 
L
T
 
D
T
 
K
Q
 
E
A
 
A
A
 
V
T
 
T
V
 
S
S
 
R
E
 
E
P
 
S
A
 
H
S
 
S
A
 
R
R
 
F
Q
 
A
P
 
P
Q
 
T
G
 
-
K
 
-
E
 
-
T
 
E
Y
 
F
T
 
N
V
 
V
N
 
T
V
 
L
Q
 
H
G
 
G
Q
 
E
S
 
T
F
 
F
V
 
H
V
 
I
E
 
K
V
 
L
S
 
T
P
 
P
G
 
F
G
 
Y
D
 
V
I
 
S
S
 
V
Q
 
D
I
 
G
V
 
V
P
 
T
S
 
E
E
 
E
N
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
E
-
 
I
F
 
L
A
 
N
A
 
R
P
 
P
E
 
R
P
 
P
V
 
T
A
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
E
 
H
G
 
A
S
 
G
P
 
C
M
 
V
N
 
T
A
 
T
P
 
A
L
 
M
S
 
P
G
 
G
N
 
T
I
 
I
F
 
V
K
 
D
V
 
V
N
 
K
V
 
V
Q
 
N
P
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
K
V
 
V
K
 
S
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
A
V
 
V
I
 
L
I
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
K
 
K
M
 
M
E
 
E
T
 
N
E
 
E
I
 
I
R
 
Q
A
 
A
E
 
S
S
 
K
D
 
S
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
V
K
 
A
V
 
I
W
 
N
V
 
V
K
 
K
E
 
K
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
P
G
 
D
N
 
E
Q
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
E
I
 
I

5ks8C Crystal structure of two-subunit pyruvate carboxylase from methylobacillus flagellatus (see paper)
50% identity, 99% coverage: 7:600/601 of query aligns to 4:600/603 of 5ks8C

query
sites
5ks8C
L
 
V
T
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
|
R
D
|
D
A
 
G
H
 
H
Q
|
Q
S
 
S
I
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
R
 
R
I
 
T
D
 
D
D
 
D
M
 
M
L
 
L
P
 
P
I
 
I
A
 
C
P
 
S
L
 
K
L
 
L
D
 
D
K
 
A
V
 
V
G
 
G
F
 
Y
W
 
W
S
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
A
W
 
W
G
 
G
G
|
G
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
A
 
A
C
 
C
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
G
 
R
E
 
E
D
 
D
P
 
P
W
 
W
E
 
E
R
 
R
I
 
L
R
 
K
E
 
K
L
 
L
K
 
R
K
 
K
A
 
A
M
 
L
P
 
P
N
 
N
T
 
S
P
 
R
Q
 
L
Q
 
Q
M
 
M
L
|
L
L
 
L
R
|
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
D
 
D
D
 
D
L
 
V
V
 
V
H
 
R
R
 
A
F
 
F
V
 
V
E
 
Q
R
 
K
A
 
S
H
 
A
Q
 
D
N
 
N
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
R
I
 
I
F
|
F
D
|
D
A
 
A
M
 
M
N
 
N
D
 
D
V
 
L
R
 
R
N
 
N
L
 
L
E
 
K
T
 
V
A
 
S
V
 
I
K
 
E
S
 
S
V
 
V
V
 
K
E
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
K
H
 
H
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
T
 
T
I
 
I
S
 
S
Y
 
Y
T
 
T
T
 
T
S
 
S
P
 
P
V
 
V
H
 
H
T
 
D
L
 
I
D
 
P
T
 
Y
W
 
F
V
 
V
D
 
N
M
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
S
M
 
F
G
 
G
C
 
C
H
 
D
S
 
T
L
 
I
C
 
A
I
 
I
K
|
K
D
 
D
M
|
M
A
 
A
G
 
S
L
 
L
L
 
L
K
 
T
P
 
P
F
 
Q
D
 
V
A
 
T
F
 
G
D
 
D
L
 
L
I
 
V
S
 
K
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
E
Q
 
A
T
 
V
N
 
S
L
 
L
I
 
P
I
 
I
S
 
H
M
 
L
Q
x
H
C
 
A
H
|
H
A
 
A
T
 
T
T
 
S
G
 
G
L
 
L
S
 
A
T
 
S
A
 
M
T
 
S
Y
 
I
Q
 
Q
K
 
R
A
 
A
I
 
V
E
 
D
A
 
N
G
 
G
I
 
V
D
 
A
V
 
I
L
 
V
D
 
D
T
 
G
A
 
C
I
 
I
S
 
S
S
 
S
M
 
F
S
 
A
Q
 
E
T
 
G
Y
 
A
G
 
S
H
 
L
S
 
P
A
 
A
T
 
T
E
 
E
T
 
S
L
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
A
V
 
L
E
 
K
D
 
G
T
 
T
D
 
E
R
 
Y
A
 
D
T
 
T
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
M
 
I
A
 
G
L
 
L
L
 
L
E
 
Q
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
R
 
R
E
 
E
V
 
V
R
 
R
K
 
K
K
 
K
Y
 
Y
V
 
W
A
 
Q
F
 
F
E
 
E
G
 
S
E
 
E
L
 
F
K
 
T
G
 
G
I
 
V
D
 
D
S
 
T
R
 
R
I
 
V
L
 
L
R
 
V
A
 
N
Q
 
Q
V
 
V
P
 
P
G
 
G
G
 
G
M
 
M
L
 
I
T
 
S
N
 
N
M
 
L
E
 
S
N
 
N
Q
 
Q
L
 
L
R
 
K
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
L
D
 
D
K
 
R
L
 
M
D
 
D
L
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
D
E
 
E
I
 
I
P
 
P
K
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
E
D
 
D
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
I
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
L
N
 
N
V
 
V
L
 
M
T
 
T
G
 
G
E
 
A
R
 
R
Y
 
Y
K
 
K
S
 
S
L
 
V
T
 
T
K
 
N
E
 
E
T
 
V
E
 
K
G
 
N
V
 
Y
L
 
L
K
 
L
G
 
G
E
 
H
Y
 
Y
G
 
G
A
 
K
T
 
A
P
 
P
A
 
S
P
 
T
V
 
V
N
 
N
R
 
P
E
 
D
L
 
V
Q
 
R
A
 
N
R
 
L
V
 
A
L
 
V
A
 
G
G
 
N
A
 
A
E
 
Q
A
 
V
I
 
I
C
 
E
C
 
C
R
 
R
P
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
T
A
 
A
E
 
E
L
 
M
D
 
E
S
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
N
E
 
E
L
 
V
S
 
E
E
 
G
K
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
S
E
 
A
Q
 
A
I
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
D
 
-
D
 
-
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
M
F
 
F
P
 
P
Q
 
D
I
 
L
G
 
A
L
 
K
K
 
T
F
 
F
L
 
L
K
 
Q
N
 
E
R
 
R
D
 
-
N
 
-
P
 
-
D
 
N
A
 
A
F
 
G
E
 
S
P
 
L
K
 
K
P
 
P
E
 
E
A
 
-
P
 
P
Q
 
L
A
 
L
T
 
D
T
 
K
Q
 
E
A
 
A
A
 
V
T
 
T
V
 
S
S
 
R
E
 
E
P
 
S
A
 
H
S
 
S
A
 
R
R
 
F
Q
 
A
P
 
P
Q
 
T
G
 
-
K
 
-
E
 
-
T
 
E
Y
 
F
T
 
N
V
 
V
N
 
T
V
 
L
Q
 
H
G
 
G
Q
 
E
S
 
T
F
 
F
V
 
H
V
 
I
E
 
K
V
 
L
S
 
T
P
 
G
G
 
S
G
 
G
D
 
H
I
 
H
S
 
G
Q
 
E
I
 
E
-
 
Q
-
 
R
-
 
P
-
 
F
-
 
Y
-
 
V
-
 
S
-
 
V
-
 
D
-
 
G
V
 
V
P
 
T
S
 
E
E
 
E
N
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
E
F
 
I
-
 
L
-
 
N
A
 
E
A
 
A
P
 
K
E
 
R
P
 
K
V
 
A
A
 
S
P
 
S
V
 
A
V
 
A
G
 
S
E
 
S
G
 
G
S
 
R
P
 
P
-
 
R
-
 
P
-
 
T
-
 
H
-
 
A
-
 
G
-
 
C
M
 
V
N
 
T
A
 
T
P
 
A
L
 
M
S
 
P
G
 
G
N
 
T
I
 
I
F
 
V
K
 
D
V
 
V
N
 
K
V
 
V
Q
 
N
P
 
V
G
 
G
D
 
D
A
 
K
V
 
V
K
 
S
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
A
V
 
V
I
 
L
I
 
V
L
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
K
 
K
M
 
M
E
 
E
T
 
N
E
 
E
I
 
I
R
 
Q
A
 
A
E
 
S
S
 
K
D
 
S
G
 
G
V
 
V
V
 
V
A
 
V
K
 
A
V
 
I
W
 
N
V
 
V
K
 
K
E
 
K
G
 
G
D
 
D
S
 
S
V
 
V
A
 
T
V
 
P
G
 
D
N
 
E
Q
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
E
I
 
I

Q70AC7 Methylmalonyl-CoA carboxyltransferase 5S subunit; Transcarboxylase 5S subunit; EC 2.1.3.1 from Propionibacterium freudenreichii subsp. shermanii (see paper)
49% identity, 82% coverage: 3:494/601 of query aligns to 12:495/505 of Q70AC7

query
sites
Q70AC7
K
 
R
P
 
E
L
 
V
A
 
G
L
 
I
T
 
T
D
 
E
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
I
 
L
L
 
M
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
R
 
A
I
 
M
D
 
E
D
 
D
M
 
M
L
 
V
P
 
G
I
 
A
A
 
C
P
 
A
L
 
D
L
 
I
D
 
D
K
 
A
V
 
A
G
 
G
F
 
Y
W
 
W
S
 
S
L
 
V
E
 
E
S
 
C
W
 
W
G
 
G
G
 
G
A
|
A
T
 
T
F
 
Y
D
 
D
A
 
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
G
 
N
E
 
E
D
 
D
P
 
P
W
 
W
E
 
E
R
 
R
I
 
L
R
 
R
E
 
T
L
 
F
K
 
R
K
 
K
A
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
S
P
 
R
Q
 
L
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
L
 
L
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
H
 
H
Y
 
Y
G
 
N
D
 
D
D
 
E
L
 
V
V
 
V
H
 
D
R
 
R
F
 
F
V
 
V
E
 
D
R
 
K
A
 
S
H
 
A
Q
 
E
N
 
N
G
 
G
V
 
M
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
R
I
 
V
F
 
F
D
 
D
A
 
A
M
 
M
N
 
N
D
 
D
V
 
P
R
 
R
N
 
N
L
 
M
E
 
A
T
 
H
A
 
A
V
 
M
K
 
A
S
 
A
V
 
V
V
 
K
E
 
K
V
 
A
G
 
G
G
 
K
H
 
H
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
I
 
I
S
 
C
Y
 
Y
T
 
T
T
 
I
S
 
S
P
 
P
V
 
V
H
 
H
T
 
T
L
 
V
D
 
E
T
 
G
W
 
Y
V
 
V
D
 
K
M
 
L
A
 
A
K
 
G
R
 
Q
L
 
L
E
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
C
 
A
H
 
D
S
 
S
L
 
I
C
 
A
I
 
L
K
|
K
D
 
D
M
|
M
A
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
Q
D
 
P
A
 
A
F
 
Y
D
 
D
L
 
I
I
 
I
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
D
Q
 
T
-
 
Y
-
 
G
T
 
Q
N
 
K
L
 
T
I
 
Q
I
 
I
S
 
N
M
 
L
Q
 
H
C
 
C
H
 
H
A
 
S
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
V
S
 
T
T
 
E
A
 
V
T
 
S
Y
 
L
Q
 
M
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
S
 
S
M
 
M
S
 
S
Q
 
L
T
 
G
Y
 
P
G
 
G
H
 
H
S
 
N
A
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
S
L
 
V
V
 
A
A
 
E
M
 
M
V
 
L
E
 
E
D
 
G
T
 
T
D
 
G
R
 
Y
A
 
T
T
 
T
G
 
N
Y
 
L
D
 
D
M
 
Y
A
 
D
L
 
R
L
 
L
E
 
H
Q
 
K
I
 
I
A
 
R
A
 
D
Y
 
H
F
 
F
R
 
K
E
 
A
V
 
I
R
 
R
K
 
P
K
 
K
Y
 
Y
V
 
K
A
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
S
E
 
K
L
 
T
K
 
L
G
 
-
I
 
V
D
 
D
S
 
T
R
 
S
I
 
I
L
 
F
R
 
K
A
 
S
Q
 
Q
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
M
 
M
L
 
L
T
 
S
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
S
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
E
D
 
D
K
 
K
L
 
M
D
 
D
L
 
E
V
 
V
L
 
M
E
 
A
E
 
E
I
 
V
P
 
P
K
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
K
D
 
A
L
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
T
 
S
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
F
N
 
N
V
 
V
L
 
M
T
 
M
G
 
G
E
 
E
R
 
-
Y
 
Y
K
 
K
S
 
R
L
 
M
T
 
T
K
 
G
E
 
E
T
 
F
E
 
A
G
 
D
V
 
I
L
 
M
K
 
L
G
 
G
E
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
S
P
 
P
A
 
A
P
 
-
V
 
-
N
 
D
R
 
R
E
 
D
L
 
P
Q
 
K
A
 
V
R
 
V
V
 
K
L
 
L
A
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
S
G
 
G
A
 
K
E
 
K
A
 
P
I
 
I
C
 
T
C
 
Q
R
 
R
P
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
P
E
 
E
L
 
W
D
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
E
K
 
K
A
 
Q
A
 
S
S
 
K
E
 
E
Q
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
G
-
 
F
-
 
N
E
 
G
L
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
I
 
V
G
 
A
L
 
-
K
 
-
F
 
-
L
 
-
K
 
-
N
 
-
R
 
-
D
 
-
N
 
-
P
 
P
D
 
V
A
 
F
F
 
F
E
 
E
P
 
H
K
 
R
P
 
A
E
 
E
A
 
G
P
 
P
Q
 
H
-
 
S
-
 
V
A
 
A
T
 
L
T
 
T
Q
 
D
A
 
A
A
 
Q
T
 
L
V
 
K
S
 
A
E
 
E
P
 
A
A
 
E
S
 
G
A
 
D
R
 
E
Q
 
K
P
 
S
-
 
L
-
 
A
-
 
V
Q
 
A
G
 
G
K
 
P
E
 
V
T
 
T
Y
 
Y
T
 
N
V
 
V
N
 
N
V
 
V
Q
 
G
G
 
G

1rr2A Propionibacterium shermanii transcarboxylase 5s subunit bound to 2- ketobutyric acid (see paper)
51% identity, 75% coverage: 3:451/601 of query aligns to 10:454/472 of 1rr2A

query
sites
1rr2A
K
 
R
P
 
E
L
 
V
A
 
G
L
 
I
T
 
T
D
 
E
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
|
R
D
|
D
A
 
A
H
 
H
Q
|
Q
S
 
S
I
 
L
L
 
M
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
R
 
A
I
 
M
D
 
E
D
 
D
M
 
M
L
 
V
P
 
G
I
 
A
A
 
C
P
 
A
L
 
D
L
 
I
D
 
D
K
 
A
V
 
A
G
 
G
F
 
Y
W
 
W
S
 
S
L
 
V
E
 
E
S
 
C
W
 
W
G
 
G
G
|
G
A
|
A
T
 
T
F
 
Y
D
 
D
A
 
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
G
 
N
E
 
E
D
 
D
P
 
P
W
 
W
E
 
E
R
 
R
I
 
L
R
 
R
E
 
T
L
 
F
K
 
R
K
 
K
A
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
S
P
 
R
Q
 
L
Q
 
Q
M
 
M
L
|
L
L
 
L
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
H
 
H
Y
 
Y
G
 
N
D
 
D
D
 
E
L
 
V
V
 
V
H
 
D
R
 
R
F
 
F
V
 
V
E
 
D
R
 
K
A
 
S
H
 
A
Q
 
E
N
 
N
G
 
G
V
 
M
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
R
I
 
V
F
|
F
D
|
D
A
 
A
M
 
M
N
 
N
D
 
D
V
 
P
R
 
R
N
 
N
L
 
M
E
 
A
T
 
H
A
 
A
V
 
M
K
 
A
S
 
A
V
 
V
V
 
K
E
 
K
V
 
A
G
 
G
G
 
K
H
 
H
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
I
 
I
S
 
C
Y
 
Y
T
 
T
T
 
I
S
 
S
P
 
P
V
 
V
H
 
H
T
 
T
L
 
V
D
 
E
T
 
G
W
 
Y
V
 
V
D
 
K
M
 
L
A
 
A
K
 
G
R
 
Q
L
 
L
E
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
C
 
A
H
 
D
S
 
S
L
 
I
C
 
A
I
 
L
K
|
K
D
 
D
M
|
M
A
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
Q
D
 
P
A
 
A
F
 
Y
D
 
D
L
 
I
I
 
I
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
D
Q
 
T
-
 
Y
-
 
G
T
 
Q
N
 
K
L
 
T
I
 
Q
I
 
I
S
 
N
M
 
L
Q
x
H
C
 
C
H
|
H
A
 
S
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
V
S
 
T
T
 
E
A
 
V
T
 
S
Y
 
L
Q
 
M
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
S
 
S
M
 
M
S
 
S
Q
 
L
T
 
G
Y
 
P
G
 
G
H
 
H
S
 
N
A
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
S
L
 
V
V
 
A
A
 
E
M
 
M
V
 
L
E
 
E
D
 
G
T
 
T
D
 
G
R
 
Y
A
 
T
T
 
T
G
 
N
Y
 
L
D
 
D
M
 
Y
A
 
D
L
 
R
L
 
L
E
 
H
Q
 
K
I
 
I
A
 
R
A
 
D
Y
 
H
F
 
F
R
 
K
E
 
A
V
 
I
R
 
R
K
 
P
K
 
K
Y
 
Y
V
 
K
A
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
S
E
 
K
L
 
T
K
 
L
G
 
-
I
 
V
D
 
D
S
 
T
R
 
S
I
 
I
L
 
F
R
 
K
A
 
S
Q
 
Q
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
M
 
M
L
 
L
T
 
S
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
S
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
E
D
 
D
K
 
K
L
 
M
D
 
D
L
 
E
V
 
V
L
 
M
E
 
A
E
 
E
I
 
V
P
 
P
K
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
K
D
 
A
L
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
T
|
T
P
 
P
T
 
S
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
F
N
 
N
V
 
V
L
 
M
T
 
M
G
 
G
E
 
E
R
 
-
Y
 
Y
K
 
K
S
 
R
L
 
M
T
 
T
K
 
G
E
 
E
T
 
F
E
 
A
G
 
D
V
 
I
L
 
M
K
 
L
G
 
G
E
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
S
P
 
P
A
 
A
P
 
-
V
 
-
N
 
D
R
 
R
E
 
D
L
 
P
Q
 
K
A
 
V
R
 
V
V
 
K
L
 
L
A
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
S
G
 
G
A
 
K
E
 
K
A
 
P
I
 
I
C
 
T
C
 
Q
R
 
R
P
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
P
E
 
E
L
 
W
D
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
E
K
 
K
A
 
Q
A
 
S
S
 
K
E
 
E
Q
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
G
-
 
F
-
 
N
E
 
G
L
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
I
 
V
G
 
A
L
 
P
K
 
V
F
 
F
L
 
F
K
 
E
N
 
H
R
 
R

1rqeA Propionibacterium shermanii transcarboxylase 5s subunit bound to oxaloacetate (see paper)
51% identity, 75% coverage: 3:451/601 of query aligns to 10:454/472 of 1rqeA

query
sites
1rqeA
K
 
R
P
 
E
L
 
V
A
 
G
L
 
I
T
 
T
D
 
E
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
|
R
D
|
D
A
 
A
H
 
H
Q
|
Q
S
 
S
I
 
L
L
 
M
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
R
 
A
I
 
M
D
 
E
D
 
D
M
 
M
L
 
V
P
 
G
I
 
A
A
 
C
P
 
A
L
 
D
L
 
I
D
 
D
K
 
A
V
 
A
G
 
G
F
 
Y
W
 
W
S
 
S
L
 
V
E
 
E
S
 
C
W
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
A
T
 
T
F
 
Y
D
 
D
A
 
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
G
 
N
E
 
E
D
 
D
P
 
P
W
 
W
E
 
E
R
 
R
I
 
L
R
 
R
E
 
T
L
 
F
K
 
R
K
 
K
A
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
S
P
 
R
Q
 
L
Q
 
Q
M
 
M
L
|
L
L
 
L
R
|
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
H
 
H
Y
 
Y
G
 
N
D
 
D
D
 
E
L
 
V
V
 
V
H
 
D
R
 
R
F
 
F
V
 
V
E
 
D
R
 
K
A
 
S
H
 
A
Q
 
E
N
 
N
G
 
G
V
 
M
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
R
I
 
V
F
 
F
D
|
D
A
 
A
M
 
M
N
 
N
D
 
D
V
 
P
R
 
R
N
 
N
L
 
M
E
 
A
T
 
H
A
 
A
V
 
M
K
 
A
S
 
A
V
 
V
V
 
K
E
 
K
V
 
A
G
 
G
G
 
K
H
 
H
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
I
 
I
S
 
C
Y
 
Y
T
 
T
T
 
I
S
 
S
P
 
P
V
 
V
H
 
H
T
 
T
L
 
V
D
 
E
T
 
G
W
 
Y
V
 
V
D
 
K
M
 
L
A
 
A
K
 
G
R
 
Q
L
 
L
E
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
C
 
A
H
 
D
S
 
S
L
 
I
C
 
A
I
 
L
K
|
K
D
 
D
M
|
M
A
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
Q
D
 
P
A
 
A
F
 
Y
D
 
D
L
 
I
I
 
I
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
D
Q
 
T
-
 
Y
-
 
G
T
 
Q
N
 
K
L
 
T
I
 
Q
I
 
I
S
 
N
M
 
L
Q
x
H
C
 
C
H
|
H
A
 
S
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
V
S
 
T
T
 
E
A
 
V
T
 
S
Y
 
L
Q
 
M
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
S
 
S
M
 
M
S
 
S
Q
 
L
T
 
G
Y
 
P
G
 
G
H
 
H
S
 
N
A
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
S
L
 
V
V
 
A
A
 
E
M
 
M
V
 
L
E
 
E
D
 
G
T
 
T
D
 
G
R
 
Y
A
 
T
T
 
T
G
 
N
Y
 
L
D
 
D
M
 
Y
A
 
D
L
 
R
L
 
L
E
 
H
Q
 
K
I
 
I
A
 
R
A
 
D
Y
 
H
F
 
F
R
 
K
E
 
A
V
 
I
R
 
R
K
 
P
K
 
K
Y
 
Y
V
 
K
A
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
S
E
 
K
L
 
T
K
 
L
G
 
-
I
 
V
D
 
D
S
 
T
R
 
S
I
 
I
L
 
F
R
 
K
A
 
S
Q
 
Q
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
M
 
M
L
 
L
T
 
S
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
S
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
E
D
 
D
K
 
K
L
 
M
D
 
D
L
 
E
V
 
V
L
 
M
E
 
A
E
 
E
I
 
V
P
 
P
K
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
K
D
 
A
L
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
T
|
T
P
 
P
T
 
S
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
F
N
 
N
V
 
V
L
 
M
T
 
M
G
 
G
E
 
E
R
 
-
Y
 
Y
K
 
K
S
 
R
L
 
M
T
 
T
K
 
G
E
 
E
T
 
F
E
 
A
G
 
D
V
 
I
L
 
M
K
 
L
G
 
G
E
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
S
P
 
P
A
 
A
P
 
-
V
 
-
N
 
D
R
 
R
E
 
D
L
 
P
Q
 
K
A
 
V
R
 
V
V
 
K
L
 
L
A
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
S
G
 
G
A
 
K
E
 
K
A
 
P
I
 
I
C
 
T
C
 
Q
R
 
R
P
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
P
E
 
E
L
 
W
D
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
E
K
 
K
A
 
Q
A
 
S
S
 
K
E
 
E
Q
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
G
-
 
F
-
 
N
E
 
G
L
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
I
 
V
G
 
A
L
 
P
K
 
V
F
 
F
L
 
F
K
 
E
N
 
H
R
 
R

1rqbA Propionibacterium shermanii transcarboxylase 5s subunit (see paper)
51% identity, 75% coverage: 3:451/601 of query aligns to 10:454/472 of 1rqbA

query
sites
1rqbA
K
 
R
P
 
E
L
 
V
A
 
G
L
 
I
T
 
T
D
 
E
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
 
R
D
|
D
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
I
 
L
L
 
M
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
R
 
A
I
 
M
D
 
E
D
 
D
M
 
M
L
 
V
P
 
G
I
 
A
A
 
C
P
 
A
L
 
D
L
 
I
D
 
D
K
 
A
V
 
A
G
 
G
F
 
Y
W
 
W
S
 
S
L
 
V
E
 
E
S
 
C
W
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
A
T
 
T
F
 
Y
D
 
D
A
 
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
G
 
N
E
 
E
D
 
D
P
 
P
W
 
W
E
 
E
R
 
R
I
 
L
R
 
R
E
 
T
L
 
F
K
 
R
K
 
K
A
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
S
P
 
R
Q
 
L
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
L
 
L
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
H
 
H
Y
 
Y
G
 
N
D
 
D
D
 
E
L
 
V
V
 
V
H
 
D
R
 
R
F
 
F
V
 
V
E
 
D
R
 
K
A
 
S
H
 
A
Q
 
E
N
 
N
G
 
G
V
 
M
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
R
I
 
V
F
 
F
D
|
D
A
 
A
M
 
M
N
 
N
D
 
D
V
 
P
R
 
R
N
 
N
L
 
M
E
 
A
T
 
H
A
 
A
V
 
M
K
 
A
S
 
A
V
 
V
V
 
K
E
 
K
V
 
A
G
 
G
G
 
K
H
 
H
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
I
 
I
S
 
C
Y
 
Y
T
 
T
T
 
I
S
 
S
P
 
P
V
 
V
H
 
H
T
 
T
L
 
V
D
 
E
T
 
G
W
 
Y
V
 
V
D
 
K
M
 
L
A
 
A
K
 
G
R
 
Q
L
 
L
E
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
C
 
A
H
 
D
S
 
S
L
 
I
C
 
A
I
 
L
K
|
K
D
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
Q
D
 
P
A
 
A
F
 
Y
D
 
D
L
 
I
I
 
I
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
D
Q
 
T
-
 
Y
-
 
G
T
 
Q
N
 
K
L
 
T
I
 
Q
I
 
I
S
 
N
M
 
L
Q
x
H
C
 
C
H
|
H
A
 
S
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
V
S
 
T
T
 
E
A
 
V
T
 
S
Y
 
L
Q
 
M
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
S
 
S
M
 
M
S
 
S
Q
 
L
T
 
G
Y
 
P
G
 
G
H
 
H
S
 
N
A
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
S
L
 
V
V
 
A
A
 
E
M
 
M
V
 
L
E
 
E
D
 
G
T
 
T
D
 
G
R
 
Y
A
 
T
T
 
T
G
 
N
Y
 
L
D
 
D
M
 
Y
A
 
D
L
 
R
L
 
L
E
 
H
Q
 
K
I
 
I
A
 
R
A
 
D
Y
 
H
F
 
F
R
 
K
E
 
A
V
 
I
R
 
R
K
 
P
K
 
K
Y
 
Y
V
 
K
A
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
S
E
 
K
L
 
T
K
 
L
G
 
-
I
 
V
D
 
D
S
 
T
R
 
S
I
 
I
L
 
F
R
 
K
A
 
S
Q
 
Q
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
M
 
M
L
 
L
T
 
S
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
S
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
E
D
 
D
K
 
K
L
 
M
D
 
D
L
 
E
V
 
V
L
 
M
E
 
A
E
 
E
I
 
V
P
 
P
K
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
K
D
 
A
L
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
T
|
T
P
 
P
T
 
S
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
F
N
 
N
V
 
V
L
 
M
T
 
M
G
 
G
E
 
E
R
 
-
Y
 
Y
K
 
K
S
 
R
L
 
M
T
 
T
K
 
G
E
 
E
T
 
F
E
 
A
G
 
D
V
 
I
L
 
M
K
 
L
G
 
G
E
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
S
P
 
P
A
 
A
P
 
-
V
 
-
N
 
D
R
 
R
E
 
D
L
 
P
Q
 
K
A
 
V
R
 
V
V
 
K
L
 
L
A
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
S
G
 
G
A
 
K
E
 
K
A
 
P
I
 
I
C
 
T
C
 
Q
R
 
R
P
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
P
E
 
E
L
 
W
D
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
E
K
 
K
A
 
Q
A
 
S
S
 
K
E
 
E
Q
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
G
-
 
F
-
 
N
E
 
G
L
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
I
 
V
G
 
A
L
 
P
K
 
V
F
 
F
L
 
F
K
 
E
N
 
H
R
 
R

1rqhA Propionibacterium shermanii transcarboxylase 5s subunit bound to pyruvic acid (see paper)
51% identity, 75% coverage: 3:451/601 of query aligns to 9:453/471 of 1rqhA

query
sites
1rqhA
K
 
R
P
 
E
L
 
V
A
 
G
L
 
I
T
 
T
D
 
E
V
 
L
V
 
V
L
 
L
R
|
R
D
|
D
A
 
A
H
 
H
Q
|
Q
S
 
S
I
 
L
L
 
M
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
M
R
 
A
I
 
M
D
 
E
D
 
D
M
 
M
L
 
V
P
 
G
I
 
A
A
 
C
P
 
A
L
 
D
L
 
I
D
 
D
K
 
A
V
 
A
G
 
G
F
 
Y
W
 
W
S
 
S
L
 
V
E
 
E
S
 
C
W
 
W
G
 
G
G
|
G
A
|
A
T
 
T
F
 
Y
D
 
D
A
 
S
C
 
C
I
 
I
R
 
R
Y
 
F
L
 
L
G
 
N
E
 
E
D
 
D
P
 
P
W
 
W
E
 
E
R
 
R
I
 
L
R
 
R
E
 
T
L
 
F
K
 
R
K
 
K
A
 
L
M
 
M
P
 
P
N
 
N
T
 
S
P
 
R
Q
 
L
Q
 
Q
M
 
M
L
|
L
L
 
L
R
 
R
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
R
 
R
H
 
H
Y
 
Y
G
 
N
D
 
D
D
 
E
L
 
V
V
 
V
H
 
D
R
 
R
F
 
F
V
 
V
E
 
D
R
 
K
A
 
S
H
 
A
Q
 
E
N
 
N
G
 
G
V
 
M
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
R
I
 
V
F
|
F
D
|
D
A
 
A
M
 
M
N
 
N
D
 
D
V
 
P
R
 
R
N
 
N
L
 
M
E
 
A
T
 
H
A
 
A
V
 
M
K
 
A
S
 
A
V
 
V
V
 
K
E
 
K
V
 
A
G
 
G
G
 
K
H
 
H
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
T
I
 
I
S
 
C
Y
 
Y
T
 
T
T
 
I
S
 
S
P
 
P
V
 
V
H
 
H
T
 
T
L
 
V
D
 
E
T
 
G
W
 
Y
V
 
V
D
 
K
M
 
L
A
 
A
K
 
G
R
 
Q
L
 
L
E
 
L
D
 
D
M
 
M
G
 
G
C
 
A
H
 
D
S
 
S
L
 
I
C
 
A
I
 
L
K
|
K
D
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
Q
D
 
P
A
 
A
F
 
Y
D
 
D
L
 
I
I
 
I
S
 
K
Q
 
A
L
 
I
K
 
K
A
 
D
Q
 
T
-
 
Y
-
 
G
T
 
Q
N
 
K
L
 
T
I
 
Q
I
 
I
S
 
N
M
 
L
Q
x
H
C
 
C
H
|
H
A
 
S
T
 
T
T
 
T
G
 
G
L
 
V
S
 
T
T
 
E
A
 
V
T
 
S
Y
 
L
Q
 
M
K
 
K
A
 
A
I
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
V
D
 
D
T
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
S
 
S
M
 
M
S
 
S
Q
 
L
T
 
G
Y
 
P
G
 
G
H
 
H
S
 
N
A
 
P
T
 
T
E
 
E
T
 
S
L
 
V
V
 
A
A
 
E
M
 
M
V
 
L
E
 
E
D
 
G
T
 
T
D
 
G
R
 
Y
A
 
T
T
 
T
G
 
N
Y
 
L
D
 
D
M
 
Y
A
 
D
L
 
R
L
 
L
E
 
H
Q
 
K
I
 
I
A
 
R
A
 
D
Y
 
H
F
 
F
R
 
K
E
 
A
V
 
I
R
 
R
K
 
P
K
 
K
Y
 
Y
V
 
K
A
 
K
F
 
F
E
 
E
G
 
S
E
 
K
L
 
T
K
 
L
G
 
-
I
 
V
D
 
D
S
 
T
R
 
S
I
 
I
L
 
F
R
 
K
A
 
S
Q
 
Q
V
 
I
P
 
P
G
 
G
G
 
G
M
 
M
L
 
L
T
 
S
N
 
N
M
 
M
E
 
E
N
 
S
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
A
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
E
D
 
D
K
 
K
L
 
M
D
 
D
L
 
E
V
 
V
L
 
M
E
 
A
E
 
E
I
 
V
P
 
P
K
 
R
V
 
V
R
 
R
E
 
K
D
 
A
L
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
V
T
|
T
P
 
P
T
 
S
S
 
S
Q
 
Q
I
 
I
V
 
V
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
F
N
 
N
V
 
V
L
 
M
T
 
M
G
 
G
E
 
E
R
 
-
Y
 
Y
K
 
K
S
 
R
L
 
M
T
 
T
K
 
G
E
 
E
T
 
F
E
 
A
G
 
D
V
 
I
L
 
M
K
 
L
G
 
G
E
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
T
 
S
P
 
P
A
 
A
P
 
-
V
 
-
N
 
D
R
 
R
E
 
D
L
 
P
Q
 
K
A
 
V
R
 
V
V
 
K
L
 
L
A
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
Q
-
 
S
G
 
G
A
 
K
E
 
K
A
 
P
I
 
I
C
 
T
C
 
Q
R
 
R
P
 
P
A
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
P
E
 
E
L
 
W
D
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
-
E
 
E
K
 
K
A
 
Q
A
 
S
S
 
K
E
 
E
Q
 
A
I
 
A
S
 
T
L
 
L
A
 
K
A
 
G
-
 
F
-
 
N
E
 
G
L
 
T
D
 
D
D
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
Q
I
 
V
G
 
A
L
 
P
K
 
V
F
 
F
L
 
F
K
 
E
N
 
H
R
 
R

4hnvB Crystal structure of r54e mutant of s. Aureus pyruvate carboxylase (see paper)
35% identity, 99% coverage: 7:600/601 of query aligns to 422:1032/1033 of 4hnvB

query
sites
4hnvB
L
 
L
T
 
T
D
 
D
V
 
T
V
 
T
L
 
F
R
 
R
D
|
D
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
S
 
S
I
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
T
R
 
R
L
 
V
R
 
R
I
 
T
D
 
K
D
 
D
M
 
M
L
 
I
P
 
N
I
 
I
A
 
A
P
 
S
L
 
K
L
 
T
D
 
A
K
 
D
V
 
V
-
 
F
-
 
K
-
 
D
G
 
G
F
 
F
W
 
-
S
 
S
L
 
L
E
 
E
S
 
M
W
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
A
 
V
C
 
A
I
 
Y
R
 
N
Y
x
F
L
 
L
G
x
K
E
 
E
D
 
N
P
 
P
W
 
W
E
 
E
R
 
R
I
 
L
R
 
E
E
 
R
L
 
L
K
 
R
K
 
K
A
 
A
M
 
I
P
 
P
N
 
N
T
 
V
P
 
L
Q
 
F
Q
 
Q
M
 
M
L
 
L
L
 
L
R
 
R
G
 
A
Q
 
S
N
 
N
L
 
A
L
 
V
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
H
 
N
Y
 
Y
G
 
P
D
 
D
D
 
N
L
 
V
V
 
I
H
 
H
R
 
K
F
 
F
V
 
V
E
 
Q
R
 
E
A
 
S
H
 
A
Q
 
K
N
 
A
G
 
G
V
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
R
 
R
I
 
I
F
 
F
D
|
D
A
 
S
M
 
L
N
 
N
D
 
W
V
 
V
R
 
D
N
 
Q
L
 
M
E
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
N
K
 
E
S
 
A
V
 
V
V
 
Q
E
 
E
V
 
A
G
 
G
G
 
K
H
 
I
A
 
S
Q
 
E
G
 
G
T
 
T
I
 
I
S
 
C
Y
 
Y
T
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
L
-
 
N
-
 
P
-
 
E
T
 
R
S
 
S
P
 
N
V
 
I
H
 
Y
T
 
T
L
 
L
D
 
E
T
 
Y
W
 
Y
V
 
V
D
 
K
M
 
L
A
 
A
K
 
K
R
 
E
L
 
L
E
 
E
D
 
R
M
 
E
G
 
G
C
 
F
H
 
H
S
 
I
L
 
L
C
 
A
I
 
I
K
|
K
D
 
D
M
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
K
 
K
P
 
P
F
 
K
D
 
A
A
 
A
F
 
Y
D
 
E
L
 
L
I
 
I
S
 
G
Q
 
E
L
 
L
K
 
K
A
 
S
Q
 
A
T
 
V
N
 
D
L
 
L
I
 
P
I
 
I
S
 
H
M
 
L
Q
x
H
C
 
T
H
|
H
A
 
D
T
 
T
T
 
S
G
 
G
L
 
N
S
 
G
T
 
L
A
 
L
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
K
K
 
Q
A
 
A
I
 
I
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
V
 
I
L
x
I
D
 
D
T
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
A
S
|
S
M
|
M
S
 
S
Q
 
G
T
 
L
Y
 
T
G
 
S
H
 
Q
S
 
P
A
 
S
T
 
A
E
 
N
T
 
S
L
 
L
V
 
Y
A
 
Y
M
 
A
V
 
L
E
 
N
D
 
G
T
 
F
D
 
P
R
 
R
A
 
H
T
 
L
G
 
R
Y
 
T
D
 
D
M
 
I
A
 
E
L
 
G
L
 
M
E
 
E
Q
 
S
I
 
L
A
 
S
A
 
H
Y
 
Y
F
 
W
R
 
S
E
x
T
V
 
V
R
 
R
K
 
T
K
 
Y
Y
 
Y
V
 
S
A
 
D
F
 
F
E
 
E
G
 
S
E
 
D
L
 
I
K
 
K
G
 
S
I
 
P
D
 
N
S
 
T
R
 
E
I
 
I
L
 
Y
R
 
Q
A
 
H
Q
 
E
V
 
M
P
 
P
G
 
G
G
 
G
M
 
Q
L
 
Y
T
 
S
N
 
N
M
 
L
E
 
S
N
 
Q
Q
 
Q
L
 
A
R
 
K
E
 
S
Q
 
L
G
 
G
A
 
L
A
 
G
D
 
E
K
 
R
L
 
F
D
 
D
L
 
E
V
 
V
L
 
K
E
 
D
E
 
M
I
 
Y
P
 
R
K
 
R
V
 
V
R
 
N
E
 
F
D
 
L
L
 
F
G
 
G
F
 
D
I
 
I
P
 
V
L
 
K
V
 
V
T
|
T
P
 
P
T
x
S
S
 
S
Q
 
K
I
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
D
Q
 
M
A
 
A
V
 
L
I
 
Y
-
 
M
-
x
V
-
 
Q
-
x
N
-
 
D
-
 
L
-
 
D
-
 
E
-
x
Q
N
 
S
V
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
D
E
 
G
R
 
Y
Y
 
K
K
 
L
S
 
D
L
 
F
T
 
P
K
 
E
E
 
S
T
 
V
E
 
V
G
 
S
V
 
F
L
 
F
K
 
K
G
 
G
E
 
E
Y
 
I
G
 
G
A
 
Q
T
 
P
P
 
V
A
 
N
P
 
G
V
 
F
N
 
N
R
 
K
E
 
D
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
 
V
V
 
I
L
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
L
C
 
T
C
 
A
R
 
R
P
 
P
A
 
G
D
 
E
L
 
Y
L
 
L
-
 
E
P
 
P
A
 
V
E
 
D
L
 
F
D
 
E
S
 
K
L
 
V
R
 
R
A
 
E
E
 
L
L
 
L
S
 
E
E
 
E
K
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
E
 
E
Q
 
Q
I
 
Q
S
 
G
L
 
P
A
 
V
A
 
T
E
 
E
L
 
-
D
 
-
D
 
Q
D
 
D
V
 
I
L
 
I
T
 
S
Y
 
Y
A
 
V
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
Q
 
K
I
 
V
G
 
Y
L
 
E
K
 
Q
F
 
Y
L
 
I
K
 
Q
N
 
T
R
 
R
-
 
N
-
 
Q
-
 
Y
-
 
G
-
 
N
-
 
L
-
 
S
-
 
L
-
 
L
D
 
D
N
 
T
P
 
P
D
 
T
A
 
F
F
 
F
E
 
F
P
 
G
K
 
M
-
 
R
-
 
N
-
 
G
-
 
E
-
 
T
-
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
E
-
 
I
P
 
D
E
 
K
A
 
G
P
 
K
Q
 
R
A
 
L
T
 
I
T
 
I
Q
 
K
A
 
L
A
 
E
T
 
T
V
 
I
S
 
S
E
 
E
P
 
P
A
 
-
S
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
D
P
 
E
Q
 
N
G
 
G
K
 
N
E
 
R
T
 
T
Y
 
I
T
 
Y
V
 
Y
N
 
A
V
 
M
Q
 
N
G
 
G
Q
 
Q
S
 
A
F
 
R
V
 
R
V
 
I
E
 
-
V
 
-
S
 
-
P
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
-
Q
 
-
I
 
Y
V
 
I
P
 
K
S
 
D
E
 
E
N
 
N
V
 
V
V
 
H
P
 
T
F
 
N
A
 
A
A
 
N
P
 
V
E
 
K
P
 
P
V
 
K
A
 
A
P
 
D
V
 
-
V
 
K
G
 
S
E
 
N
G
 
P
S
 
S
P
 
H
M
 
I
N
 
G
A
 
A
P
 
Q
L
 
M
S
 
P
G
 
G
N
 
S
I
 
V
F
 
T
K
 
E
V
 
V
N
 
K
V
 
V
Q
 
S
P
 
V
G
 
G
D
 
E
A
 
T
V
 
V
K
 
K
A
 
A
G
 
N
D
 
Q
V
 
P
V
 
L
I
 
L
I
 
I
L
 
T
E
 
E<