SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 5209195 Shew_1673 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
43% identity, 98% coverage: 3:250/252 of query aligns to 5:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
|
A
G
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
F
 
L
A
 
E
M
 
A
A
 
A
Q
 
R
E
 
V
L
 
F
A
 
M
A
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
V
L
 
I
I
 
A
D
|
D
V
x
F
D
x
N
Q
 
E
E
 
A
K
 
A
L
 
G
E
 
K
R
 
E
A
 
A
C
 
V
-
 
E
A
 
A
D
 
N
I
 
P
G
 
G
D
 
-
T
 
-
T
 
-
E
 
-
V
 
V
Q
 
V
G
 
F
Y
 
I
A
 
R
F
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
E
 
R
E
 
E
D
 
S
V
 
V
V
 
H
A
 
R
G
 
L
F
 
V
G
 
E
Y
 
N
I
 
V
L
 
A
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
N
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
x
T
L
 
R
D
|
D
G
 
S
M
 
M
L
 
L
V
 
S
K
|
K
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
M
S
 
T
L
 
V
A
 
D
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
|
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
V
F
 
F
L
 
H
C
 
C
G
 
-
R
 
T
E
 
Q
A
 
A
A
 
V
A
 
L
A
 
P
M
 
Y
I
 
M
T
 
A
S
 
E
K
 
Q
Q
 
G
Q
 
K
G
 
G
V
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
|
S
S
|
S
L
 
V
A
x
T
-
 
G
K
 
T
A
 
Y
G
 
G
N
|
N
I
x
V
G
|
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
K
G
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
N
S
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
x
F
I
x
T
E
 
E
T
|
T
E
x
A
M
|
M
T
x
V
A
 
A
A
 
E
M
 
V
K
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
V
L
 
I
E
 
E
R
x
K
L
 
M
E
 
K
K
 
A
M
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
K
A
 
P
S
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
T
 
A
V
 
Y
K
 
L
F
 
F
I
 
L
I
 
A
-
 
S
-
 
H
E
 
E
N
 
S
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
H
V
 
V
F
 
L
E
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
I

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
44% identity, 97% coverage: 6:250/252 of query aligns to 2:249/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
K
 
R
V
 
V
V
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
|
A
G
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
M
 
T
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
Y
K
 
H
L
 
V
A
 
V
L
 
A
I
 
W
D
|
D
V
x
L
D
 
A
Q
 
E
E
 
E
K
 
A
L
 
G
E
 
A
R
 
A
A
 
L
C
 
I
A
 
A
D
 
E
I
 
I
G
 
A
D
 
D
T
 
A
T
 
G
E
 
G
V
 
S
Q
 
A
G
 
D
Y
 
F
A
 
A
-
 
R
F
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
A
E
 
A
E
 
E
D
 
S
V
 
V
V
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
V
G
 
A
Y
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
A
D
 
E
F
 
H
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
N
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
L
L
 
H
D
 
D
G
 
G
M
 
Q
L
 
L
V
 
V
K
 
K
A
 
V
K
 
K
E
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
V
T
 
V
D
 
K
R
 
K
M
 
M
S
 
A
L
 
E
A
 
A
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
N
 
S
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
P
A
 
H
M
 
M
I
 
I
T
 
A
S
 
A
K
 
K
Q
 
-
Q
 
Y
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
L
N
 
N
I
x
A
S
|
S
S
|
S
L
 
V
A
 
V
K
 
G
-
 
L
A
 
Y
G
 
G
N
 
N
I
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
K
G
 
V
W
 
W
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
T
S
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
E
 
E
M
 
M
T
 
V
A
 
Q
A
 
Q
M
 
M
K
 
P
P
 
E
E
 
R
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
A
L
 
M
E
 
V
K
 
A
M
 
R
V
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
G
Q
 
D
A
 
P
S
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
R
T
 
A
V
 
Y
K
 
L
F
 
F
I
 
L
I
 
A
-
 
S
-
 
E
E
 
E
N
 
S
D
 
G
Y
 
F
V
 
I
N
 
S
G
 
G
R
 
T
V
 
T
F
 
L
E
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M

4cqmF Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
38% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 6:239/241 of 4cqmF

query
sites
4cqmF
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
C
V
 
A
I
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
A
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
M
 
V
A
 
A
Q
 
Q
E
 
L
L
 
M
A
 
A
A
 
R
A
 
K
G
 
G
A
 
Y
K
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
I
D
x
A
V
x
R
D
x
N
Q
 
L
E
 
E
K
 
G
L
 
A
E
 
K
R
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
D
 
G
T
 
-
T
 
-
E
 
D
V
 
H
Q
 
L
G
 
A
Y
 
F
A
 
S
F
x
C
D
|
D
I
x
V
T
 
A
D
 
K
E
 
E
E
 
H
D
 
D
V
 
V
V
 
Q
A
 
N
G
 
T
F
 
F
G
 
E
Y
 
E
I
 
L
L
 
E
E
 
K
D
 
H
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
N
L
 
R
D
 
D
G
 
G
M
 
L
L
 
L
V
 
V
K
 
R
A
 
T
K
 
K
E
 
T
G
 
E
E
 
D
V
 
M
T
 
V
D
 
S
R
 
Q
M
 
L
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
H
V
x
T
N
 
N
L
 
L
T
 
L
G
 
G
S
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
G
 
C
R
 
K
E
 
A
A
 
A
A
 
M
A
 
R
A
 
T
M
 
M
I
 
I
T
 
-
S
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
Q
 
G
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
S
x
G
S
|
S
L
 
I
A
 
V
K
 
G
-
 
L
A
 
K
G
 
G
N
 
N
I
 
S
G
 
G
Q
|
Q
T
 
S
N
 
V
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
V
A
 
G
M
 
F
S
 
S
V
 
R
G
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R
Y
 
K
N
 
K
I
 
I
R
 
R
S
 
V
A
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
|
G
V
 
F
I
x
V
E
 
H
T
|
T
E
x
D
M
|
M
T
|
T
A
 
K
A
 
D
M
 
L
K
 
K
P
 
E
E
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
R
 
H
L
 
L
E
 
K
K
 
K
M
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
E
A
 
T
S
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
H
T
 
A
V
 
V
K
 
V
F
 
F
I
 
L
I
 
L
E
 
E
N
 
S
D
 
P
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
H
V
 
V
F
 
L
E
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
L
R
 
Q
I
 
L

Q8N4T8 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase beta subunit; KAR beta subunit; Carbonyl reductase family member 4; CBR4; Quinone reductase CBR4; Short chain dehydrogenase/reductase family 45C member 1; EC 1.1.1.100; EC 1.6.5.10 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
38% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 2:235/237 of Q8N4T8

query
sites
Q8N4T8
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
C
V
 
A
I
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
A
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
M
 
V
A
 
A
Q
 
Q
E
 
L
L
 
M
A
 
A
A
 
R
A
 
K
G
 
G
A
 
Y
K
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
I
D
 
A
V
x
R
D
x
N
Q
 
L
E
 
E
K
 
G
L
 
A
E
 
K
R
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
D
 
G
T
 
-
T
 
-
E
 
D
V
 
H
Q
 
L
G
 
A
Y
 
F
A
 
S
F
 
C
D
|
D
I
 
V
T
 
A
D
 
K
E
 
E
E
 
H
D
 
D
V
 
V
V
 
Q
A
 
N
G
 
T
F
 
F
G
 
E
Y
 
E
I
x
L
L
 
E
E
 
K
D
 
H
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
N
 
N
V
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
L
 
R
D
 
D
G
 
G
M
 
L
L
 
L
V
 
V
K
 
R
A
 
T
K
 
K
E
 
T
G
 
E
E
 
D
V
 
M
T
 
V
D
 
S
R
 
Q
M
 
L
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
-
N
 
H
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
L
G
 
G
S
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
G
 
C
R
 
K
E
 
A
A
 
A
A
 
M
A
 
R
A
 
T
M
 
M
I
 
I
T
 
-
S
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
Q
 
G
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
V
S
 
G
S
|
S
L
 
I
A
 
V
K
 
G
-
 
L
A
 
K
G
 
G
N
 
N
I
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
N
 
V
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
V
A
 
G
M
 
F
S
 
S
V
 
R
G
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
|
R
Y
x
K
N
 
K
I
 
I
R
 
R
S
 
V
A
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
x
V
E
x
H
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
K
A
 
D
M
 
L
K
 
K
P
 
E
E
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
R
 
H
L
 
L
E
 
K
K
 
K
M
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
E
A
 
T
S
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
H
T
 
A
V
 
V
K
 
V
F
 
F
I
 
L
I
 
L
E
 
E
N
 
S
D
 
P
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
H
V
 
V
F
 
L
E
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
L
R
 
Q
I
 
L

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
39% identity, 99% coverage: 3:252/252 of query aligns to 3:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
L
 
L
K
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
x
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
F
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
A
Q
 
L
E
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
E
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
-
I
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
A
A
 
G
D
|
D
I
x
L
G
 
G
D
 
D
T
 
L
T
 
T
-
 
Y
-
 
S
-
 
H
-
 
P
E
 
N
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
Y
 
M
A
 
Y
F
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
E
 
V
E
 
T
D
 
G
V
 
V
V
 
E
A
 
K
G
 
F
F
 
Y
G
 
Q
Y
 
S
I
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
K
F
 
Y
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
N
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
L
 
K
D
 
D
G
 
A
M
 
M
L
 
-
V
 
-
K
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
T
D
 
R
R
 
K
M
 
M
S
 
T
L
 
E
A
 
A
Q
 
Q
F
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
N
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
L
G
 
T
R
 
R
E
 
L
A
 
V
A
 
G
A
 
P
A
 
Q
M
 
M
I
 
Q
T
 
T
S
 
N
K
 
G
Q
 
Y
Q
 
-
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
|
S
S
|
S
L
 
V
A
 
V
K
 
G
A
 
V
-
 
F
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
L
S
 
T
V
 
M
G
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
L
Y
 
K
-
 
G
-
 
A
N
 
N
I
 
V
R
 
R
S
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
x
Y
I
|
I
E
 
M
T
|
T
E
 
D
M
 
I
T
 
L
A
 
K
A
 
T
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
D
A
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
F
E
 
A
K
 
A
M
 
L
V
 
T
P
 
M
V
 
L
G
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
A
 
P
S
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
K
T
 
V
V
 
A
K
 
L
F
 
F
I
 
L
I
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
S
Y
 
Y
V
 
V
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
T
F
 
I
E
 
N
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
R
 
R
I
 
L

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
38% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:237/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
M
 
L
D
 
P
L
 
L
K
 
T
D
 
D
K
 
R
V
 
I
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
F
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
V
I
x
N
D
x
Y
V
x
A
D
x
S
Q
x
S
E
 
A
K
 
G
L
 
A
E
 
A
R
 
D
A
 
E
C
 
V
A
 
V
D
 
A
I
 
A
G
 
I
D
 
A
T
 
A
T
 
A
E
 
G
V
 
G
Q
 
E
G
 
A
Y
 
F
A
 
A
F
 
V
-
 
K
-
x
A
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
Q
E
 
E
E
 
S
D
 
E
V
 
V
V
 
E
A
 
A
G
 
L
F
 
F
G
 
A
Y
 
A
I
 
V
L
 
I
E
 
E
D
 
R
F
 
W
G
 
G
Q
 
R
V
 
L
N
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
L
 
R
D
 
D
G
 
T
M
 
L
L
 
L
V
 
L
K
 
R
A
 
M
K
 
K
E
 
R
G
 
D
E
 
D
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
F
 
W
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
I
 
L
N
 
D
V
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
G
S
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
S
R
 
R
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
I
M
 
M
I
 
L
T
 
-
S
 
K
K
 
Q
Q
 
R
Q
 
S
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
x
A
S
|
S
L
 
V
-
 
V
A
 
G
K
 
E
A
 
M
G
 
G
N
 
N
I
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
L
S
 
T
V
 
K
G
 
T
W
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
T
S
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
x
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
E
x
D
M
|
M
T
|
T
A
 
S
A
 
-
M
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
L
K
 
E
M
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
S
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
G
T
 
V
V
 
V
K
 
R
F
 
F
I
 
L
I
 
A
E
 
A
N
 
D
D
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
V
F
 
I
E
 
N
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
L

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh
37% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 4:245/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
M
 
M
D
 
K
L
 
L
K
 
A
D
 
S
K
 
K
V
 
T
V
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
|
A
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
F
 
F
A
 
G
M
 
I
A
 
A
Q
 
Q
E
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
R
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
V
A
 
I
L
 
I
I
 
A
D
|
D
V
x
R
D
 
D
Q
 
A
E
 
H
K
 
G
L
 
-
E
 
E
R
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
A
D
 
S
I
 
L
G
 
R
D
 
E
T
 
S
-
 
G
T
 
A
E
 
Q
V
 
A
Q
 
L
G
 
F
Y
 
I
A
 
S
F
x
C
D
x
N
I
|
I
T
 
A
D
 
E
E
 
K
E
 
T
D
 
Q
V
 
V
V
 
E
A
 
A
G
 
L
F
 
F
G
 
S
Y
 
Q
I
 
A
L
 
E
E
 
E
D
 
A
F
 
F
G
 
G
Q
 
P
V
 
V
N
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
N
L
 
R
D
 
D
G
 
A
M
 
M
L
 
L
V
 
H
K
 
K
A
 
L
K
 
T
E
 
E
G
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
A
Q
 
D
F
 
W
Q
 
D
A
 
T
V
 
V
I
 
I
N
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
S
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
M
R
 
Q
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
I
A
 
R
M
 
M
I
 
-
T
 
R
S
 
E
K
 
R
Q
 
G
Q
 
A
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
L
 
A
A
 
S
K
 
W
A
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
K
G
 
T
W
 
A
A
 
C
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
K
N
 
G
I
 
V
R
 
T
S
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
x
F
I
|
I
E
 
D
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
|
T
A
 
R
A
 
G
M
 
V
K
 
P
P
 
E
E
 
N
A
 
V
L
 
W
E
 
Q
R
 
I
L
 
M
E
 
V
K
 
S
M
 
K
V
 
I
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
S
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
S
 
E
T
 
C
V
 
V
K
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
G
-
 
A
D
 
R
Y
 
Y
V
 
I
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
N
I
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
M

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
37% identity, 98% coverage: 7:252/252 of query aligns to 3:244/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
V
 
V
V
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
F
 
K
A
 
A
M
 
I
A
 
A
Q
 
L
E
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
C
K
 
K
L
 
V
A
 
L
L
 
-
I
 
-
D
 
-
V
 
V
D
x
N
Q
x
Y
E
x
A
K
x
R
L
x
S
E
 
A
R
 
K
A
 
A
C
 
A
A
 
E
D
 
E
I
 
V
G
 
S
D
 
K
T
 
Q
T
 
I
E
 
E
V
 
A
Q
 
Y
G
 
G
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
I
-
 
T
Y
 
F
A
 
G
F
x
G
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
K
E
 
E
E
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
E
A
 
A
G
 
M
F
 
M
G
 
K
Y
 
T
I
 
A
L
 
I
E
 
D
D
 
A
F
 
W
G
 
G
Q
 
T
V
 
I
N
 
D
V
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
L
 
R
D
 
D
G
 
T
M
 
L
L
 
L
V
 
I
K
 
-
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
R
M
 
M
S
 
K
L
 
K
A
 
S
Q
 
Q
F
 
W
Q
 
D
A
 
E
V
 
V
I
 
I
N
 
D
V
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
-
R
 
T
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
K
M
 
I
I
 
M
T
 
M
S
 
K
K
 
K
Q
 
R
Q
 
K
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
x
A
S
|
S
L
 
V
A
 
V
K
 
G
A
 
L
-
 
I
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
F
S
 
S
V
 
K
G
 
T
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
N
 
N
I
 
I
R
 
N
S
 
V
A
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
x
F
I
|
I
E
 
A
T
x
S
E
x
D
M
|
M
T
 
T
A
 
A
A
 
K
M
 
L
K
 
G
P
 
E
E
 
D
A
 
M
L
 
E
E
 
K
R
 
K
L
 
I
E
 
L
K
 
G
M
 
T
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
P
S
 
E
E
 
N
I
 
V
A
 
A
S
 
G
T
 
L
V
 
V
K
 
E
F
 
F
I
 
L
I
 
A
E
 
L
N
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
A
D
 
S
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
A
F
 
F
E
 
T
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
A
I
 
I

P73826 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
38% identity, 98% coverage: 1:248/252 of query aligns to 4:236/240 of P73826

query
sites
P73826
M
 
L
D
 
G
L
 
L
K
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
I
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
N
G
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
F
 
A
A
 
A
M
 
I
A
 
V
Q
 
K
E
 
L
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
A
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
F
I
 
T
D
 
D
V
 
L
D
 
A
Q
 
T
E
 
D
K
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
G
D
 
G
T
 
N
T
 
T
E
 
E
V
 
A
Q
 
L
G
 
G
Y
 
V
A
 
V
F
 
A
D
 
N
I
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
L
E
 
E
D
 
S
V
 
M
V
 
T
A
 
A
G
 
A
F
 
A
G
 
A
Y
 
E
I
 
I
L
 
T
E
 
D
D
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
P
V
 
V
N
 
Y
V
 
G
L
 
V
V
 
V
N
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
L
 
K
D
 
D
G
 
N
M
 
F
L
 
F
V
 
P
K
 
K
A
 
-
K
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
L
S
 
T
L
 
P
A
 
A
Q
 
D
F
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
S
 
V
F
 
A
L
 
Y
C
 
S
G
 
I
R
 
K
E
 
P
A
 
F
A
 
I
A
 
E
A
 
G
M
 
M
I
 
Y
T
 
-
S
 
E
K
 
R
Q
 
K
Q
 
A
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
A
I
 
I
S
 
S
S
|
S
L
 
I
A
 
S
-
 
G
K
 
E
A
 
R
G
 
G
N
 
N
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
M
S
 
M
V
 
K
G
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
N
 
G
I
 
V
R
 
R
S
 
A
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
E
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
L
A
 
A
M
 
I
K
 
R
P
 
E
E
 
D
A
 
I
L
 
R
E
 
E
R
 
K
L
 
I
E
 
T
K
 
K
M
 
E
V
 
I
P
 
P
V
 
F
G
 
R
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
K
A
 
P
S
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
W
T
 
A
V
 
V
K
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
L
E
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
N
 
S
D
 
S
Y
 
Y
V
 
V
N
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
L
E
 
R
I
 
V
D
 
N
G
 
G

4o5oB X-ray crystal structure of a 3-hydroxyacyl-coa dehydrogenase from brucella suis
39% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 7:258/261 of 4o5oB

query
sites
4o5oB
M
 
M
D
 
Q
L
 
I
K
 
E
D
 
N
K
 
R
V
 
V
V
 
F
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
G
G
 
S
G
|
G
L
 
L
G
 
G
F
 
A
A
 
A
M
 
V
A
 
S
Q
 
K
E
 
M
L
 
A
A
 
V
A
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
V
L
 
L
I
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
N
Q
 
A
E
 
E
K
 
A
L
 
G
E
 
E
R
 
A
A
 
G
C
 
A
A
 
K
D
 
A
I
 
L
G
 
G
D
 
A
T
 
S
T
 
A
E
 
R
V
 
F
Q
 
Q
G
 
-
Y
 
-
A
 
R
F
 
T
D
 
D
I
 
V
T
 
A
D
 
S
E
 
D
E
 
T
D
 
D
V
 
G
V
 
K
A
 
A
G
 
A
F
 
I
G
 
A
Y
 
A
I
 
A
L
 
I
E
 
E
D
 
A
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
V
 
I
N
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
V
L
 
A
L
 
-
D
 
P
G
 
G
M
 
E
L
 
K
V
 
V
K
 
L
A
 
G
K
 
R
E
 
E
G
 
G
E
 
A
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
H
S
 
K
L
 
L
A
 
E
Q
 
T
F
 
F
Q
 
T
A
 
R
V
 
T
I
 
I
N
 
S
V
 
I
N
|
N
L
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
T
F
 
F
L
 
N
C
 
M
G
 
L
R
 
R
E
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A
M
 
M
I
 
A
T
 
K
S
 
N
K
 
E
-
 
P
-
 
G
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
Q
 
E
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
A
K
 
A
A
 
F
-
 
D
G
 
G
N
 
Q
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
P
W
 
V
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
H
N
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
V
A
 
M
A
 
T
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
I
I
 
F
E
x
K
T
 
T
E
 
P
M
 
M
T
 
M
A
 
A
A
 
G
M
 
M
K
 
P
P
 
Q
E
 
E
A
 
V
L
 
Q
E
 
D
R
 
A
L
 
L
E
 
G
K
 
A
M
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
F
-
 
P
G
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
E
A
 
P
S
 
A
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
S
 
A
T
 
L
V
 
V
K
 
H
F
 
H
I
 
I
I
 
V
E
 
E
N
 
N
D
 
Q
Y
 
M
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
R
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
I
 
L
R
 
R
I
 
M

Sites not aligning to the query:

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
38% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 4:244/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
D
 
N
L
 
L
K
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
F
 
K
A
 
A
M
 
I
A
 
A
Q
 
E
E
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
-
L
 
I
I
 
G
D
 
T
V
x
A
D
x
T
Q
 
S
E
 
E
K
 
S
L
 
G
E
 
A
R
 
Q
A
 
A
C
 
I
A
 
S
D
 
D
-
 
Y
I
 
L
G
 
G
D
 
D
T
 
N
T
 
G
E
 
-
V
 
-
Q
 
K
G
 
G
Y
 
M
A
 
A
F
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
N
E
 
P
E
 
E
D
 
S
V
 
I
V
 
E
A
 
A
G
 
V
F
 
L
G
 
K
Y
 
A
I
 
I
L
 
T
E
 
D
D
 
E
F
 
F
G
 
G
Q
 
G
V
 
V
N
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
L
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
V
 
M
K
 
R
A
 
M
K
 
K
E
 
E
G
 
E
E
 
E
V
 
W
T
 
S
D
 
D
R
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
I
I
 
M
N
 
E
V
x
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
S
 
I
F
 
F
L
 
R
C
 
L
G
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
A
 
L
A
 
R
A
 
G
M
 
M
I
 
M
T
 
-
S
 
K
K
 
K
Q
 
R
Q
 
Q
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
S
x
G
S
|
S
L
 
V
-
 
V
A
 
G
K
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
F
S
 
T
V
 
K
G
 
S
W
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
T
S
 
V
A
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
x
F
I
|
I
E
 
E
T
|
T
E
x
D
M
|
M
T
 
T
A
 
K
A
 
A
M
 
L
K
 
N
P
 
D
E
 
E
A
 
Q
L
 
R
E
 
T
R
 
A
L
 
T
E
 
L
K
 
A
M
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
A
 
P
S
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
A
V
 
V
K
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
A
-
 
S
-
 
P
E
 
E
N
 
A
D
 
A
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
T
F
 
L
E
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
37% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
D
 
T
L
 
L
K
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
F
 
R
A
 
D
M
 
I
A
 
A
Q
 
I
E
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
I
A
 
F
L
 
F
-
x
N
I
x
Y
D
x
N
V
x
G
D
x
S
Q
 
P
E
 
E
K
 
A
L
 
A
E
 
E
R
 
E
A
 
T
C
 
A
A
 
K
D
 
L
I
 
V
G
 
A
D
 
E
T
 
H
-
 
G
T
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
E
G
 
A
Y
 
M
A
 
K
F
x
A
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
I
E
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
D
A
 
A
G
 
F
F
 
F
G
 
K
Y
 
Q
I
 
A
L
 
I
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
N
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
L
 
R
D
 
D
G
 
N
M
 
L
L
 
L
V
 
M
K
 
R
A
 
M
K
 
K
E
 
E
G
 
D
E
 
E
V
 
W
T
 
D
D
 
D
R
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
S
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
V
A
 
S
A
 
R
A
 
T
M
 
M
I
 
M
T
 
-
S
 
K
K
 
Q
Q
 
R
Q
 
A
G
 
G
V
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
S
x
A
S
|
S
L
 
V
A
 
V
K
 
G
A
 
L
-
 
I
G
 
G
N
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
M
 
L
S
 
T
V
 
K
G
 
T
W
 
T
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
N
S
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
F
I
|
I
E
 
T
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
D
A
 
K
M
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
K
A
 
T
L
 
K
E
 
E
R
 
A
L
 
M
E
 
L
K
 
A
M
 
Q
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
Q
 
T
A
 
T
S
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
T
 
A
V
 
V
K
 
L
F
 
F
I
 
L
I
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
A
-
 
S
D
 
K
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
T
F
 
L
E
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M

O18404 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 10; 17-beta-HSD 10; 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II; Hydroxysteroid dehydrogenase; Mitochondrial ribonuclease P protein 2; Mitochondrial RNase P protein 2; Scully protein; Type II HADH; EC 1.1.1.35; EC 1.1.1.51; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.53 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see paper)
38% identity, 99% coverage: 3:252/252 of query aligns to 2:253/255 of O18404

query
sites
O18404
L
 
I
K
 
K
D
 
N
K
 
A
V
 
V
V
 
S
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
R
A
 
A
M
 
T
A
 
A
Q
 
E
E
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
S
L
 
V
A
 
I
L
|
L
I
 
A
D
 
D
V
 
L
D
 
P
Q
 
S
E
 
S
K
 
K
L
 
G
E
 
N
R
 
E
A
 
V
C
 
A
A
 
K
D
 
E
I
 
L
G
 
G
D
 
D
T
 
-
T
 
-
E
 
K
V
 
V
Q
 
V
G
 
F
Y
 
V
A
 
P
F
 
V
D
 
D
I
 
V
T
 
T
D
 
S
E
 
E
E
 
K
D
 
D
V
 
V
V
 
S
A
 
A
G
 
A
F
 
L
G
 
Q
Y
 
T
I
 
A
L
 
K
E
 
D
D
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
V
 
L
N
 
D
V
 
L
L
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
T
L
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
A
M
 
T
L
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
T
K
 
F
E
 
N
G
 
F
E
 
N
V
 
K
T
 
N
D
 
V
R
 
A
M
 
H
S
 
R
L
 
L
A
 
E
Q
 
D
F
 
F
Q
 
Q
A
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
 
I
N
 
N
L
 
T
T
 
V
G
 
G
S
 
T
F
|
F
L
 
N
C
 
V
G
 
I
R
 
R
E
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
G
A
 
L
M
 
M
I
 
G
T
 
A
S
 
N
K
 
E
-
 
P
-
 
N
-
 
Q
-
 
D
-
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
T
S
 
A
S
 
S
L
 
V
A
 
A
K
 
A
A
 
F
-
 
D
G
 
G
N
 
Q
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
A
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
G
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
P
W
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
S
R
 
T
Y
 
Q
N
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
I
A
 
C
A
 
T
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
L
I
 
F
E
 
N
T
 
T
E
 
P
M
 
M
T
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
L
K
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
V
L
 
R
E
 
T
R
 
F
L
 
L
E
 
A
K
 
K
M
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
F
G
 
P
-
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
E
A
 
P
S
 
S
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
S
 
H
T
 
L
V
 
V
K
 
Q
F
 
A
I
 
I
I
 
Y
E
 
E
N
 
N
D
 
P
Y
 
L
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
I
 
L
R
 
R
I
 
M

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
40% identity, 98% coverage: 3:249/252 of query aligns to 11:262/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
L
 
F
K
 
T
D
 
D
K
 
R
V
 
V
V
 
V
V
x
L
I
|
I
T
|
T
G
|
G
G
|
G
A
x
G
G
x
S
G
|
G
L
|
L
G
|
G
F
x
R
A
|
A
M
x
T
A
|
A
Q
x
V
E
x
R
L
|
L
A
|
A
A
|
A
A
x
E
G
|
G
A
|
A
K
|
K
L
|
L
A
x
S
L
|
L
I
 
V
D
 
D
V
 
V
D
 
S
Q
 
S
E
 
E
K
 
G
L
 
L
E
 
E
R
 
A
A
 
S
C
 
K
A
 
A
D
 
A
I
 
V
G
 
L
D
 
E
T
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
D
T
 
A
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
G
 
T
Y
 
T
A
 
V
F
 
A
D
 
D
I
 
V
T
 
S
D
 
D
E
 
E
E
 
A
D
 
Q
V
 
V
V
 
E
A
 
A
G
 
Y
F
 
V
G
 
T
Y
 
A
I
 
T
L
 
T
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
V
 
I
N
 
D
V
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
V
 
-
K
x
E
A
 
G
K
 
K
E
 
Q
G
 
N
E
 
P
V
 
-
T
 
T
D
 
E
R
 
S
M
 
F
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Q
 
E
F
 
F
Q
 
D
A
 
K
V
 
V
I
 
V
N
 
S
V
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
R
G
 
G
S
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
-
G
 
G
R
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
V
A
 
L
A
 
K
M
 
I
I
 
M
T
 
R
S
 
E
K
 
Q
Q
 
G
Q
 
S
G
 
G
V
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
 
T
S
 
A
S
 
S
L
 
V
A
 
G
K
 
G
A
 
I
G
 
R
N
 
G
I
 
I
G
 
G
-
 
N
Q
 
Q
T
 
S
N
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
M
 
L
S
 
T
V
 
R
G
 
N
W
 
S
A
 
A
K
 
V
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
R
 
R
Y
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
A
I
 
I
E
 
W
T
 
T
E
 
P
M
 
M
T
 
V
A
 
E
-
 
N
A
 
S
M
 
M
K
 
K
-
 
Q
-
 
L
-
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
R
-
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
E
R
 
E
L
 
F
E
 
I
K
 
Q
M
 
V
V
 
N
P
 
P
V
 
S
G
 
K
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
S
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
A
T
 
V
V
 
V
K
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
L
E
 
S
N
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
S
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
A
R
 
T
V
 
V
F
 
V
E
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
40% identity, 98% coverage: 3:249/252 of query aligns to 2:253/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
L
 
F
K
 
T
D
 
D
K
 
R
V
 
V
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
G
G
x
S
G
|
G
L
|
L
G
 
G
F
 
R
A
 
A
M
 
T
A
 
A
Q
 
V
E
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
A
 
S
L
 
L
I
 
V
D
|
D
V
|
V
D
 
S
Q
 
S
E
 
E
K
 
G
L
 
L
E
 
E
R
 
A
A
 
S
C
 
K
A
 
A
D
 
A
I
 
V
G
 
L
D
 
E
T
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
D
T
 
A
E
 
E
V
 
V
Q
 
L
G
 
T
Y
 
T
A
 
V
F
x
A
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
E
 
E
E
 
A
D
 
Q
V
 
V
V
 
E
A
 
A
G
 
Y
F
 
V
G
 
T
Y
 
A
I
 
T
L
 
T
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
V
 
I
N
 
D
V
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
M
 
-
L
 
-
V
 
-
K
 
E
A
 
G
K
 
K
E
 
Q
G
 
N
E
 
P
V
 
-
T
 
T
D
 
E
R
 
S
M
 
F
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Q
 
E
F
 
F
Q
 
D
A
 
K
V
 
V
I
 
V
N
 
S
V
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
R
G
 
G
S
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
-
G
 
G
R
 
L
E
 
E
A
 
K
A
 
V
A
 
L
A
 
K
M
 
I
I
 
M
T
 
R
S
 
E
K
 
Q
Q
 
G
Q
 
S
G
 
G
V
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
I
x
T
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
G
K
 
G
A
 
I
G
 
R
N
 
G
I
 
I
G
 
G
-
 
N
Q
|
Q
T
 
S
N
 
G
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
M
 
L
S
 
T
V
 
R
G
 
N
W
 
S
A
 
A
K
 
V
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
R
 
R
Y
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
I
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
A
I
 
I
E
 
W
T
|
T
E
x
P
M
|
M
T
x
V
A
 
E
-
 
N
A
 
S
M
 
M
K
 
K
-
 
Q
-
 
L
-
 
D
P
 
P
E
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
R
-
 
K
A
 
A
L
 
A
E
 
E
R
 
E
L
 
F
E
 
I
K
 
Q
M
 
V
V
 
N
P
 
P
V
 
S
G
 
K
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
S
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
A
T
 
V
V
 
V
K
 
A
F
 
F
I
 
L
I
 
L
E
 
S
N
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
S
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
A
R
 
T
V
 
V
F
 
V
E
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

O70351 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2; 17-beta-estradiol 17-dehydrogenase; 2-methyl-3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase; MHBD; 3-alpha-(17-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase (NAD(+)); 3-hydroxy-2-methylbutyryl-CoA dehydrogenase; 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II; 3alpha(or 20beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; 7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; Endoplasmic reticulum-associated amyloid beta-peptide-binding protein; Mitochondrial ribonuclease P protein 2; Mitochondrial RNase P protein 2; Short chain dehydrogenase/reductase family 5C member 1; Short-chain type dehydrogenase/reductase XH98G2; Type II HADH; EC 1.1.1.35; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.239; EC 1.1.1.178; EC 1.1.1.53; EC 1.1.1.159 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
36% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 7:259/261 of O70351

query
sites
O70351
D
 
S
L
 
V
K
 
K
D
 
G
K
 
L
V
 
V
V
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
F
 
L
A
 
S
M
 
T
A
 
A
Q
 
K
E
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
G
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
A
A
 
V
L
 
L
I
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
P
Q
 
N
E
 
S
K
 
E
L
 
G
E
 
E
R
 
T
A
 
E
C
 
A
A
 
K
D
 
K
I
 
L
G
 
G
D
 
G
T
 
N
T
 
C
E
 
I
V
 
F
Q
 
A
G
 
-
Y
 
-
A
 
P
F
 
A
D
 
N
I
 
V
T
 
T
D
 
S
E
 
E
E
 
K
D
 
E
V
 
V
V
 
Q
A
 
A
G
 
A
F
 
L
G
 
T
Y
 
L
I
 
A
L
 
K
E
 
E
D
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
V
 
I
N
 
D
V
 
V
L
 
A
V
 
V
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
A
L
 
V
D
 
A
G
 
I
M
 
K
L
 
T
V
 
Y
K
 
H
A
 
E
K
 
K
E
 
K
G
 
N
E
 
Q
V
 
V
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
H
S
 
T
L
 
L
A
 
E
Q
 
D
F
 
F
Q
 
Q
A
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
I
G
 
G
S
 
T
F
 
F
L
 
N
C
 
V
G
 
I
R
 
R
E
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
V
M
 
M
I
 
G
T
 
Q
S
 
N
K
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
T
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
A
K
 
A
-
 
F
A
 
E
G
 
G
N
 
Q
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
G
G
 
G
V
 
I
A
 
V
A
 
G
M
 
M
S
 
T
V
 
L
G
 
P
W
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
I
N