SitesBLAST

R31 (= R33) mutation R->A,K: Decreased affinity for glutamine and catalytic activity.
EPN 35:37 (= EPN 37:39) binding
41:47 (vs. 43:49, 100% identical) binding
D67 (= D69) binding
Y212 (= Y214) binding
C230 (= C232) mutation to R: Decreases catalytic activity 1000-fold, but has no effect on affinity for glutamine. Loss of catalytic activity; when associated with I-256.
T231 (= T233) binding
Q256 (= Q261) mutation to I: Loss of catalytic activity; when associated with R-230.
RL 261:262 (= RL 266:267) binding
MSK 269:271 (= MSK 274:276) binding
317:324 (vs. 322:329, 63% identical) Interaction with tRNA

Sites not aligning to the query:

1 modified: Initiator methionine, Removed

4jyzA Crystal structure of e. Coli glutaminyl-tRNA synthetase bound to atp and native tRNA(gln) containing the cmnm5s2u34 anticodon wobble base (see paper)
73% identity, 98% coverage: 10:554/556 of query aligns to 1:541/542 of 4jyzA

query
sites
4jyzA

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active site: E28 (= E37), R254 (= R266), K264 (= K276)
binding adenosine-5'-triphosphate: F25 (= F34), P26 (= P35), P27 (= P36), E28 (= E37), H34 (= H43), G36 (= G45), H37 (= H46), K39 (= K48), S40 (= S49), T224 (= T233), F252 (= F264), R254 (= R266), L255 (= L267), M262 (= M274), S263 (= S275), K264 (= K276)
binding : Q7 (≠ N16), E28 (= E37), D60 (= D69), T62 (= T71), N63 (= N72), L118 (= L127), T119 (≠ N128), P120 (≠ G129), I123 (≠ T132), R124 (= R133), R127 (= R136), G128 (= G137), T129 (= T138), L130 (= L139), G162 (= G171), C165 (≠ A174), P175 (= P184), F176 (= F185), I177 (≠ M186), V183 (= V192), R186 (= R195), K188 (≠ R197), M204 (= M213), Y205 (= Y214), E226 (= E235), F227 (= F236), Q228 (= Q237), D229 (= D238), R232 (= R241), R306 (= R318), I307 (= I319), T310 (= T322), K311 (= K323), Q312 (= Q324), D313 (≠ E325), N314 (= N326), T315 (≠ M327), I316 (≠ V328), E317 (= E329), A319 (≠ S331), S320 (≠ M332), S323 (≠ A335), N330 (= N342), R335 (= R347), P363 (= P376), N364 (≠ T377), Q393 (≠ K406), Y394 (= Y407), K395 (= K408), R396 (= R409), R404 (= R417), R406 (= R419), L436 (= L449), S437 (≠ G450), K438 (= K451), V449 (= V462), Q511 (= Q524), E513 (= E526), R514 (= R527), L538 (= L551), R539 (= R552), T541 (≠ S554)

Sites not aligning to the query:

binding : 542

1o0cA Crystal structure of l-glutamate and ampcpp bound to glutamine aminoacyl tRNA synthetase (see paper)
71% identity, 98% coverage: 11:554/556 of query aligns to 1:529/529 of 1o0cA

query
sites
1o0cA

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1o0bA Crystal structure of l-glutamine and ampcpp bound to glutamine aminoacyl tRNA synthetase (see paper)
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1gtsA Structural basis for transfer RNA aminoaceylation by escherichia coli glutaminyl-tRNA synthetase (see paper)
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binding adenosine monophosphate: F24 (= F34), P25 (= P35), P26 (= P36), E27 (= E37), H33 (= H43), G35 (= G45), H36 (= H46), K38 (= K48), S39 (= S49), C222 (= C232), T223 (= T233), F251 (= F264), R253 (= R266), L254 (= L267), K263 (= K276)
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1exdA Crystal structure of a tight-binding glutamine tRNA bound to glutamine aminoacyl tRNA synthetase (see paper)
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1exdA

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1euqA Crystal structure of glutaminyl-tRNA synthetase complexed with a tRNA- gln mutant and an active-site inhibitor (see paper)
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1euqA

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