SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 5210146 FitnessBrowser__PV4:5210146 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3igjC Crystal structure of maltose o-acetyltransferase complexed with acetyl coenzyme a from bacillus anthracis
44% identity, 43% coverage: 114:202/209 of query aligns to 96:183/188 of 3igjC

query
sites
3igjC
K
 
E
I
 
V
V
 
R
I
 
I
G
 
G
D
 
D
Q
 
H
T
 
C
R
 
M
I
 
F
A
|
A
N
 
P
N
 
G
V
 
V
T
 
H
I
 
I
Y
|
Y
A
 
T
F
x
A
N
 
T
H
|
H
G
 
P
M
 
L
H
 
H
P
 
P
D
 
-
T
 
-
P
 
-
I
 
V
Y
 
E
Q
 
R
Q
 
N
S
 
S
S
 
G
Q
 
K
S
 
E
K
 
Y
G
 
G
-
 
K
-
 
P
I
 
V
V
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
V
G
|
G
A
 
G
Q
 
G
A
 
A
G
 
I
I
 
I
V
x
N
D
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
S
I
 
I
G
 
G
D
 
D
C
 
N
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
x
A
M
x
S
G
 
G
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
|
T
K
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
N
Y
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
P
 
P
A
 
A
R
 
K
I
 
V
I
 
I

Sites not aligning to the query:

1krrA Galactoside acetyltransferase in complex with acetyl-coenzyme a (see paper)
44% identity, 45% coverage: 115:208/209 of query aligns to 95:187/200 of 1krrA

query
sites
1krrA
I
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
Q
 
N
T
 
V
R
 
L
I
|
I
A
|
A
N
x
P
N
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
L
Y
 
S
A
 
V
F
x
T
N
 
G
H
|
H
G
 
P
M
 
V
H
 
H
P
 
H
D
 
E
T
 
L
P
 
R
I
 
-
Y
 
K
Q
 
N
Q
 
G
S
 
E
S
 
M
Q
 
Y
S
 
S
K
 
F
G
 
P
I
 
I
V
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
|
G
A
x
S
Q
 
H
A
 
V
G
 
V
I
 
I
V
x
N
D
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
C
 
N
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
|
G
M
x
A
G
 
G
C
 
S
I
 
I
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
Y
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
A
A
|
A
G
 
G
N
 
V
P
|
P
A
 
C
R
 
R
I
 
V
I
 
I
G
x
R
D
 
E
R
 
I
R
 
N
D
 
D
K
 
R

Sites not aligning to the query:

P07464 Galactoside O-acetyltransferase; GAT; Acetyl-CoA:galactoside 6-O-acetyltransferase; Thiogalactoside acetyltransferase; Thiogalactoside transacetylase; EC 2.3.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
44% identity, 45% coverage: 115:208/209 of query aligns to 96:188/203 of P07464

query
sites
P07464
I
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
Q
 
N
T
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
A
N
 
P
N
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
L
Y
 
S
A
 
V
F
 
T
N
 
G
H
|
H
G
 
P
M
 
V
H
 
H
P
 
H
D
 
E
T
 
L
P
 
R
I
 
-
Y
 
K
Q
 
N
Q
 
G
S
 
E
S
 
M
Q
 
Y
S
 
S
K
 
F
G
 
P
I
 
I
V
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
A
x
S
Q
 
H
A
 
V
G
 
V
I
 
I
V
 
N
D
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
C
 
N
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
x
A
G
 
G
C
 
S
I
 
I
V
 
V
T
|
T
K
|
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
Y
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
V
P
 
P
A
 
C
R
|
R
I
 
V
I
 
I
G
x
R
D
 
E
R
 
I
R
 
N
D
 
D
K
 
R

Sites not aligning to the query:

1krvA Galactoside acetyltransferase in complex with coa and pnp-beta-gal (see paper)
44% identity, 45% coverage: 115:208/209 of query aligns to 95:187/201 of 1krvA

query
sites
1krvA
I
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
Q
 
N
T
 
V
R
 
L
I
 
I
A
|
A
N
 
P
N
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
L
Y
x
S
A
 
V
F
x
T
N
 
G
H
 
H
G
 
P
M
 
V
H
 
H
P
 
H
D
 
E
T
 
L
P
 
R
I
 
-
Y
 
K
Q
 
N
Q
 
G
S
 
E
S
x
M
Q
 
Y
S
 
S
K
 
F
G
 
P
I
 
I
V
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
x
S
Q
 
H
A
 
V
G
 
V
I
 
I
V
x
N
D
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
C
 
N
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
x
A
G
 
G
C
 
S
I
 
I
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
Y
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
V
P
|
P
A
 
C
R
|
R
I
 
V
I
 
I
G
x
R
D
 
E
R
 
I
R
 
N
D
 
D
K
 
R

Sites not aligning to the query:

1kruA Galactoside acetyltransferase in complex with iptg and coenzyme a (see paper)
44% identity, 45% coverage: 115:208/209 of query aligns to 95:187/201 of 1kruA

query
sites
1kruA
I
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
Q
 
N
T
 
V
R
x
L
I
 
I
A
 
A
N
 
P
N
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
L
Y
 
S
A
 
V
F
 
T
N
 
G
H
|
H
G
 
P
M
 
V
H
 
H
P
 
H
D
 
E
T
 
L
P
 
R
I
 
-
Y
 
K
Q
 
N
Q
 
G
S
 
E
S
x
M
Q
 
Y
S
 
S
K
 
F
G
 
P
I
 
I
V
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
x
S
Q
 
H
A
 
V
G
 
V
I
 
I
V
 
N
D
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
C
 
N
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
|
G
M
x
A
G
 
G
C
 
S
I
 
I
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
Y
 
N
A
 
V
I
 
V
V
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
V
P
|
P
A
 
C
R
 
R
I
 
V
I
 
I
G
x
R
D
 
E
R
 
I
R
 
N
D
 
D
K
 
R

Sites not aligning to the query:

4mzuF Crystal structure of fdtd, a bifunctional ketoisomerase/n- acetyltransferase from shewanella denitrificans (see paper)
36% identity, 61% coverage: 77:203/209 of query aligns to 30:142/294 of 4mzuF

query
sites
4mzuF
L
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
R
R
 
N
C
 
C
M
 
N
I
 
I
A
x
C
A
 
A
D
 
N
S
 
S
F
 
L
L
 
I
H
 
E
G
 
N
P
 
D
I
 
V
V
 
V
M
 
I
G
 
G
N
 
D
E
 
N
V
 
V
A
 
T
I
 
I
N
 
K
H
 
S
G
 
G
C
 
V
S
 
Q
L
 
I
D
 
W
G
 
D
G
 
G
R
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
I
V
 
H
I
 
I
G
 
Q
D
 
D
Q
 
D
T
 
V
R
 
F
I
 
I
A
 
G
N
 
P
N
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
-
Y
 
-
A
 
-
F
 
F
N
 
T
H
x
N
G
x
D
M
x
K
H
 
Q
P
 
P
D
 
R
T
 
S
P
 
K
I
 
I
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
S
 
-
Q
 
-
S
 
-
K
 
-
G
 
K
I
 
T
V
 
I
I
 
V
G
 
K
R
 
K
D
 
G
V
 
A
W
 
S
I
 
I
G
|
G
A
|
A
Q
 
N
A
 
S
G
 
T
I
 
I
V
x
L
D
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
L
I
 
I
G
 
G
D
 
E
C
 
N
A
 
A
V
 
M
I
 
V
G
|
G
M
x
A
G
 
G
C
 
A
I
 
V
V
 
I
T
|
T
K
|
K
D
 
N
V
 
V
P
 
P
D
 
D
Y
 
N
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
x
I
G
 
G
N
|
N
P
 
P
A
 
G
R
|
R
I
 
I
I
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4mzuB Crystal structure of fdtd, a bifunctional ketoisomerase/n- acetyltransferase from shewanella denitrificans (see paper)
36% identity, 61% coverage: 77:203/209 of query aligns to 30:141/290 of 4mzuB

query
sites
4mzuB
L
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
R
R
 
N
C
 
C
M
 
N
I
 
I
A
x
C
A
|
A
D
 
N
S
 
S
F
 
L
L
 
I
H
 
E
G
 
N
P
 
D
I
 
V
V
 
V
M
 
I
G
 
G
N
 
D
E
 
N
V
 
V
A
 
T
I
 
I
N
 
K
H
 
S
G
|
G
C
 
V
S
 
Q
L
 
I
D
 
W
G
 
D
G
 
G
R
 
-
G
 
-
K
 
-
I
 
I
V
 
H
I
 
I
G
 
Q
D
 
D
Q
 
D
T
 
V
R
x
F
I
 
I
A
 
G
N
 
P
N
|
N
V
 
V
T
 
T
I
 
-
Y
 
-
A
 
-
F
 
F
N
x
T
H
x
N
G
x
D
M
x
K
H
 
Q
P
|
P
D
 
-
T
 
-
P
 
-
I
 
-
Y
 
-
Q
 
-
Q
 
-
S
 
-
S
 
-
Q
 
R
S
 
S
K
 
L
G
 
K
I
 
T
V
 
I
I
 
V
G
 
K
R
 
K
D
 
G
V
 
A
W
 
S
I
 
I
G
|
G
A
|
A
Q
 
N
A
 
S
G
 
T
I
 
I
V
 
L
D
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
L
I
 
I
G
 
G
D
 
E
C
 
N
A
 
A
V
 
M
I
 
V
G
|
G
M
x
A
G
 
G
C
 
A
I
 
V
V
 
I
T
|
T
K
|
K
D
 
N
V
 
V
P
 
P
D
 
D
Y
 
N
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
x
I
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
G
R
|
R
I
 
I
I
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5u2kA Crystal structure of galactoside o-acetyltransferase complex with coa (h3 space group)
27% identity, 83% coverage: 29:202/209 of query aligns to 1:181/190 of 5u2kA

query
sites
5u2kA
L
 
M
K
 
T
P
 
E
K
 
K
H
 
E
L
 
K
V
 
M
W
 
L
A
 
A
K
 
E
P
 
K
W
 
W
Q
 
Y
D
 
D
E
 
A
V
 
N
Q
 
F
Q
 
D
A
 
Q
L
 
Y
M
 
L
S
 
I
V
 
N
E
 
E
T
 
R
V
 
A
S
 
R
I
 
A
G
 
K
K
 
D
E
 
I
C
 
C
F
 
F
I
 
E
A
 
L
P
 
N
Q
 
H
A
 
T
K
 
R
L
 
P
F
 
S
A
 
A
E
 
T
P
 
N
G
 
K
R
 
R
D
 
K
I
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
D
D
 
Q
R
 
L
C
 
F
M
 
Q
I
 
T
A
 
T
A
 
T
D
 
D
S
 
N
F
 
V
-
 
S
L
 
I
H
 
S
G
 
I
P
 
P
-
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
D
-
 
Y
-
 
G
-
 
W
-
 
N
I
 
V
V
 
K
M
 
L
G
 
G
N
 
K
E
 
N
V
 
V
A
 
Y
I
 
V
N
 
N
H
 
T
G
 
N
C
 
C
S
 
Y
L
 
F
D
x
M
G
 
D
G
 
G
R
 
-
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
V
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
Q
 
N
T
 
V
R
 
F
I
 
I
A
 
G
N
 
P
N
 
N
V
 
C
T
 
G
I
 
F
Y
|
Y
A
 
T
F
x
A
N
 
T
H
|
H
-
 
P
-
 
L
G
 
N
M
 
F
H
 
H
P
 
H
D
 
R
T
 
N
P
 
E
I
 
G
Y
 
F
Q
 
E
Q
 
K
S
 
A
S
 
G
Q
 
P
S
 
-
K
 
-
G
 
-
I
 
I
V
 
H
I
 
I
G
 
G
R
 
S
D
 
N
V
 
T
W
 
W
I
 
F
G
 
G
A
 
G
Q
 
H
A
 
V
G
 
A
I
 
V
V
x
L
D
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
E
C
 
G
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
A
G
 
G
C
 
S
I
 
V
V
 
V
T
|
T
K
|
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
Y
 
H
A
 
S
I
 
L
V
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
C
R
 
K
I
 
V
I
 
V

2xatA Complex of the hexapeptide xenobiotic acetyltransferase with chloramphenicol and desulfo-coenzyme a (see paper)
37% identity, 52% coverage: 98:205/209 of query aligns to 53:162/208 of 2xatA

query
sites
2xatA
N
 
D
E
 
K
V
 
L
A
 
V
I
 
I
N
 
G
H
 
S
G
 
F
C
 
C
S
 
S
L
 
I
D
 
G
G
 
S
G
 
G
R
 
A
G
 
A
K
 
F
I
 
I
V
 
M
I
 
A
G
 
G
D
 
N
Q
 
Q
T
 
G
R
 
H
I
 
R
A
 
A
N
 
E
N
 
W
V
 
A
T
 
S
I
 
T
Y
 
F
A
 
P
F
 
F
N
 
-
H
 
H
G
 
F
M
 
M
H
 
H
P
 
E
D
 
E
T
 
P
P
 
A
I
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
N
-
 
G
Y
 
Y
Q
 
Q
Q
 
P
S
 
A
S
 
G
Q
 
D
S
 
T
K
 
-
G
 
-
I
 
-
V
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
H
D
 
E
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
|
G
A
x
T
Q
 
E
A
 
A
G
 
M
I
 
F
V
 
M
D
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
H
C
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
G
|
G
M
x
S
G
 
R
C
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
T
K
 
G
D
 
D
V
 
V
P
 
E
D
 
P
Y
 
Y
A
 
A
I
 
I
V
 
V
A
x
G
G
|
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
I
 
T
I
|
I
G
 
R
D
 
K
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4isxA The crystal structure of maltose o-acetyltransferase from clostridium difficile 630 in complex with acetyl-coa
44% identity, 43% coverage: 114:202/209 of query aligns to 94:181/186 of 4isxA

query
sites
4isxA
K
 
K
I
 
I
V
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
D
Q
 
N
T
 
V
R
 
M
I
 
L
A
|
A
N
 
P
N
 
N
V
 
V
T
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
A
 
T
F
 
-
N
 
-
H
 
-
G
 
A
M
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
I
T
 
D
P
 
A
I
 
Q
Y
 
L
Q
 
R
Q
 
N
S
 
S
S
 
G
Q
 
I
S
 
E
K
 
Y
G
 
G
-
 
S
-
 
P
I
 
V
V
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
D
D
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
x
G
Q
 
G
A
 
V
G
 
I
I
 
I
V
 
T
D
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
C
 
N
A
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
x
A
G
 
G
C
 
S
I
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
D
 
P
Y
 
N
A
 
T
I
 
V
V
 
A
A
x
V
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
C
R
 
R
I
 
V
I
 
I

Sites not aligning to the query:

4hurA Crystal structure of streptogramin group a antibiotic acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with acetyl coenzyme a (see paper)
35% identity, 57% coverage: 87:205/209 of query aligns to 47:166/211 of 4hurA

query
sites
4hurA
D
 
D
S
 
Q
F
 
V
L
 
L
H
x
Y
G
 
H
P
 
Y
I
 
E
V
 
V
M
 
I
G
 
G
N
 
D
E
 
K
V
 
L
A
 
I
I
 
I
N
 
G
H
 
R
G
 
F
C
 
C
S
|
S
L
x
I
D
x
G
G
 
P
G
 
G
R
 
T
G
 
T
K
 
F
I
 
I
V
 
M
I
 
N
G
 
G
D
x
A
Q
x
N
T
 
H
R
 
R
I
 
M
-
 
D
A
 
G
N
 
S
N
 
T
V
 
Y
T
 
P
I
 
F
Y
 
H
A
 
L
F
 
F
N
 
R
H
 
M
G
 
G
M
 
W
H
 
E
P
 
K
D
 
Y
T
 
M
P
 
P
I
 
S
Y
 
L
Q
 
K
Q
 
D
S
 
L
S
 
P
Q
 
L
S
x
K
K
 
G
G
 
D
I
 
I
V
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
|
I
G
|
G
A
x
R
Q
 
D
A
 
V
G
 
T
I
 
I
V
x
M
D
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
C
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
G
x
A
M
x
A
G
 
E
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
|
T
K
 
K
D
 
N
V
 
V
P
 
A
D
 
P
Y
 
Y
A
 
S
I
 
I
V
 
V
A
x
G
G
 
G
N
 
N
P
|
P
A
 
L
R
 
K
I
 
F
I
|
I
G
x
R
D
 
K
R
 
R

4husA Crystal structure of streptogramin group a antibiotic acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with virginiamycin m1 (see paper)
35% identity, 57% coverage: 87:205/209 of query aligns to 47:166/212 of 4husA

query
sites
4husA
D
 
D
S
 
Q
F
 
V
L
 
L
H
 
Y
G
 
H
P
 
Y
I
 
E
V
 
V
M
 
I
G
 
G
N
 
D
E
 
K
V
 
L
A
 
I
I
 
I
N
 
G
H
 
R
G
 
F
C
 
C
S
 
S
L
 
I
D
 
G
G
 
P
G
 
G
R
 
T
G
 
T
K
 
F
I
 
I
V
 
M
I
 
N
G
 
G
D
 
A
Q
 
N
T
 
H
R
 
R
I
 
M
-
 
D
A
 
G
N
 
S
N
 
T
V
 
Y
T
 
P
I
 
F
Y
 
H
A
 
L
F
 
F
N
 
R
H
 
M
G
 
G
M
 
W
H
 
E
P
 
K
D
 
Y
T
 
M
P
 
P
I
 
S
Y
 
L
Q
 
K
Q
 
D
S
 
L
S
 
P
Q
 
L
S
 
K
K
 
G
G
 
D
I
 
I
V
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
A
 
R
Q
 
D
A
 
V
G
 
T
I
 
I
V
 
M
D
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
C
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
A
M
 
A
G
 
E
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
N
V
 
V
P
 
A
D
 
P
Y
 
Y
A
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
L
R
 
K
I
 
F
I
 
I
G
 
R
D
 
K
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6x3jA Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with streptogramin analog f0224 (46) (see paper)
33% identity, 63% coverage: 74:205/209 of query aligns to 27:166/206 of 6x3jA

query
sites
6x3jA
R
 
E
D
 
N
I
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
G
D
 
E
-
 
Y
-
 
S
-
 
Y
-
 
Y
-
 
D
-
 
S
-
 
K
R
 
R
C
 
G
M
 
E
I
 
S
A
 
F
A
 
E
D
 
D
S
 
Q
F
 
V
L
 
L
H
x
Y
G
 
H
P
x
Y
I
 
E
V
|
V
M
 
I
G
 
G
N
 
D
E
 
K
V
 
L
A
 
I
I
 
I
N
 
G
H
 
R
G
 
F
C
 
C
S
 
S
L
 
I
D
x
G
G
 
P
G
 
G
R
 
T
G
 
T
K
 
F
I
 
I
V
 
M
I
 
N
G
 
G
D
x
A
Q
 
N
T
x
H
R
 
R
I
 
M
-
 
D
A
 
G
N
 
S
N
 
T
V
 
Y
T
 
P
I
 
F
Y
x
H
A
x
L
F
 
F
N
 
R
H
 
M
G
 
G
M
 
W
H
 
E
P
 
K
D
 
Y
T
x
M
P
|
P
I
 
S
Y
 
L
Q
 
K
Q
 
D
S
x
L
S
 
P
Q
 
L
S
 
K
K
 
G
G
 
D
I
 
I
V
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
 
R
Q
 
D
A
 
V
G
 
T
I
 
I
V
 
M
D
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
C
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
G
 
A
M
 
A
G
 
E
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
N
V
 
V
P
 
A
D
 
P
Y
 
Y
A
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
L
R
 
K
I
 
F
I
 
I
G
 
R
D
 
K
R
 
R

6x3cA Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with streptogramin analog f1037 (47) (see paper)
35% identity, 57% coverage: 87:205/209 of query aligns to 47:166/207 of 6x3cA

query
sites
6x3cA
D
 
D
S
 
Q
F
 
V
L
 
L
H
x
Y
G
 
H
P
x
Y
I
 
E
V
 
V
M
 
I
G
 
G
N
 
D
E
 
K
V
 
L
A
 
I
I
 
I
N
 
G
H
 
R
G
 
F
C
 
C
S
 
S
L
 
I
D
x
G
G
 
P
G
 
G
R
 
T
G
 
T
K
 
F
I
 
I
V
 
M
I
 
N
G
|
G
D
 
A
Q
x
N
T
x
H
R
 
R
I
 
M
-
 
D
A
 
G
N
 
S
N
 
T
V
 
Y
T
 
P
I
 
F
Y
x
H
A
x
L
F
 
F
N
 
R
H
 
M
G
 
G
M
 
W
H
 
E
P
 
K
D
 
Y
T
x
M
P
|
P
I
 
S
Y
x
L
Q
 
K
Q
 
D
S
 
L
S
 
P
Q
 
L
S
 
K
K
 
G
G
 
D
I
 
I
V
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
x
R
Q
 
D
A
 
V
G
 
T
I
 
I
V
x
M
D
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
C
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
G
x
A
M
x
A
G
 
E
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
N
V
 
V
P
 
A
D
 
P
Y
 
Y
A
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
L
R
 
K
I
 
F
I
 
I
G
 
R
D
 
K
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6x3cE Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with streptogramin analog f1037 (47) (see paper)
33% identity, 63% coverage: 74:205/209 of query aligns to 27:166/203 of 6x3cE

query
sites
6x3cE
R
 
E
D
 
N
I
 
I
L
 
L
I
 
V
G
 
G
D
 
E
-
 
Y
-
 
S
-
 
Y
-
 
Y
-
 
D
-
 
S
-
 
K
R
 
R
C
 
G
M
 
E
I
 
S
A
 
F
A
 
E
D
 
D
S
 
Q
F
 
V
L
 
L
H
x
Y
G
 
H
P
x
Y
I
 
E
V
 
V
M
 
I
G
 
G
N
 
D
E
 
K
V
 
L
A
 
I
I
 
I
N
 
G
H
 
R
G
 
F
C
 
C
S
 
S
L
 
I
D
x
G
G
 
P
G
 
G
R
 
T
G
 
T
K
 
F
I
 
I
V
 
M
I
 
N
G
|
G
D
 
A
Q
x
N
T
x
H
R
 
R
I
x
M
-
 
D
A
 
G
N
 
S
N
 
T
V
 
Y
T
 
P
I
 
F
Y
x
H
A
x
L
F
 
F
N
 
R
H
 
M
G
 
G
M
 
W
H
 
E
P
 
K
D
 
Y
T
x
M
P
|
P
I
 
S
Y
 
L
Q
 
K
Q
 
D
S
 
L
S
 
P
Q
 
L
S
 
K
K
 
G
G
 
D
I
 
I
V
 
E
I
 
I
G
 
G
R
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
 
R
Q
 
D
A
 
V
G
 
T
I
 
I
V
 
M
D
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
C
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
I
G
x
A
M
x
A
G
 
E
C
 
A
I
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
N
V
 
V
P
 
A
D
 
P
Y
 
Y
A
 
S
I
 
I
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
P
|
P
A
 
L
R
 
K
I
 
F
I
 
I
G
 
R
D
 
K
R
 
R

A1ADJ6 Polysialic acid O-acetyltransferase; Capsule O-acetyl transferase; EC 2.3.1.136 from Escherichia coli O1:K1 / APEC (see paper)
35% identity, 53% coverage: 92:202/209 of query aligns to 167:277/307 of A1ADJ6

query
sites
A1ADJ6
G
 
S
P
 
K
I
 
V
V
 
I
M
 
I
G
 
G
N
 
R
E
 
R
V
 
T
A
 
T
I
 
I
N
 
G
H
 
A
G
 
G
C
 
F
S
 
E
L
 
V
D
 
V
G
 
T
G
 
D
R
 
K
G
 
C
K
 
N
I
 
V
V
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
H
Q
 
D
T
 
C
R
 
M
I
 
I
A
 
A
N
 
R
N
 
D
V
 
V
T
 
I
I
 
L
Y
 
R
A
 
A
F
 
S
N
 
D
H
 
G
G
 
-
M
 
-
H
|
H
P
 
P
D
 
I
T
 
F
P
 
D
I
 
I
Y
 
H
Q
 
S
Q
 
K
S
 
K
-
 
R
-
 
I
S
 
N
Q
 
W
S
 
A
K
 
K
G
 
D
I
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
S
R
 
S
D
 
Y
V
 
V
W
|
W
I
 
V
G
 
G
A
 
R
Q
 
N
A
 
V
G
 
S
I
 
I
V
 
M
D
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
S
I
 
V
G
 
G
D
 
S
C
 
G
A
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
G
M
 
Y
G
 
G
C
 
S
I
 
I
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
S
Y
 
M
A
 
C
I
 
A
V
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
K
I
 
I
I
 
I

G3XD01 UDP-2-acetamido-3-amino-2,3-dideoxy-D-glucuronate N-acetyltransferase; UDP-D-GlcNAc3NA N-acetyltransferase; UDP-2-acetamido-3-amino-2,3-dideoxy-alpha-D-glucuronic acid 3-N-acetyltransferase; EC 2.3.1.201 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
35% identity, 43% coverage: 114:203/209 of query aligns to 50:153/191 of G3XD01

query
sites
G3XD01
K
 
K
I
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
D
 
D
Q
 
R
T
 
C
R
 
K
I
 
I
A
 
Q
N
 
N
N
 
N
V
 
V
T
 
S
I
 
V
Y
 
Y
-
 
D
-
 
N
-
 
V
-
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
F
-
 
C
-
 
G
-
 
P
-
 
S
-
 
M
A
 
V
F
 
F
N
 
T
H
 
N
G
 
V
M
 
Y
H
 
N
P
 
P
D
 
R
T
 
S
P
 
L
I
 
I
Y
 
-
Q
 
E
Q
 
R
S
 
K
S
 
D
Q
 
Q
S
 
Y
K
 
R
G
 
N
I
 
T
V
 
L
I
 
V
G
 
K
R
 
K
D
 
G
V
 
A
W
 
T
I
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
N
A
 
C
G
 
T
I
 
I
V
 
V
D
 
C
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
E
C
 
Y
A
 
A
V
 
F
I
 
V
G
 
G
M
 
A
G
 
G
C
 
A
I
 
V
V
 
I
T
 
N
K
|
K
D
 
N
V
 
V
P
 
P
D
 
S
Y
 
Y
A
 
A
I
 
L
V
 
M
A
 
V
G
 
G
N
 
V
P
 
P
A
 
A
R
 
R
I
 
Q
I
 
I
G
 
G

3ectA Crystal structure of the hexapeptide-repeat containing- acetyltransferase vca0836 from vibrio cholerae
31% identity, 79% coverage: 43:207/209 of query aligns to 26:176/176 of 3ectA

query
sites
3ectA
E
 
E
V
 
I
Q
 
N
Q
 
Q
A
 
S
L
 
L
M
 
D
S
 
E
V
 
A
E
 
E
T
 
R
V
 
Y
S
 
A
I
 
L
G
 
Q
K
 
R
E
 
E
C
 
L
F
 
F
I
 
G
A
 
H
P
 
L
Q
 
G
A
 
H
K
 
K
L
 
S
F
 
C
A
 
V
E
 
Q
P
 
P
G
 
P
R
 
F
D
 
H
I
 
C
L
 
E
I
 
F
G
 
G
D
 
K
R
 
T
C
 
I
M
 
R
I
 
I
A
 
G
A
 
D
D
 
H
S
 
T
F
 
F
L
 
I
H
 
N
G
 
M
P
 
N
I
 
V
V
 
V
M
 
M
G
 
-
N
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
H
 
-
G
 
-
C
 
-
S
 
-
L
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
R
 
-
G
 
-
K
 
P
I
 
I
V
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
Q
 
H
T
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
G
N
 
P
N
 
S
V
 
T
T
 
Q
I
 
F
Y
 
Y
A
 
T
F
 
A
N
 
S
H
 
H
G
 
S
M
 
L
H
 
-
P
 
-
D
 
D
T
 
Y
P
 
R
I
 
R
Y
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
-
 
W
S
 
E
S
 
T
Q
 
I
S
 
C
K
 
K
G
 
P
I
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
D
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
 
G
A
 
G
Q
 
N
A
 
V
G
 
V
I
 
I
V
 
N
D
 
Q
G
|
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
A
C
 
R
A
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
A
M
 
A
G
 
N
C
 
S
I
 
V
V
 
V
T
 
N
K
 
Q
D
|
D
V
 
V
P
 
P
D
 
P
Y
 
D
A
 
T
I
 
L
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
T
P
 
P
A
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
L
G
 
R
D
 
S
R
 
L
R
 
K
D
 
D

3nz2C Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
31% identity, 79% coverage: 43:207/209 of query aligns to 33:183/183 of 3nz2C

query
sites
3nz2C
E
 
E
V
 
I
Q
 
N
Q
 
Q
A
 
S
L
 
L
M
 
D
S
 
E
V
 
A
E
 
E
T
 
R
V
 
Y
S
 
A
I
 
L
G
 
Q
K
 
R
E
 
E
C
 
L
F
 
F
I
 
G
A
 
H
P
 
L
Q
 
G
A
 
H
K
 
K
L
 
S
F
 
C
A
 
V
E
 
Q
P
 
P
G
 
P
R
 
F
D
 
H
I
 
C
L
 
E
I
 
F
G
 
G
D
 
K
R
 
T
C
 
I
M
 
R
I
 
I
A
 
G
A
 
D
D
 
H
S
 
T
F
 
F
L
 
I
H
 
N
G
 
M
P
 
N
I
 
V
V
 
V
M
 
M
G
 
-
N
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
H
 
-
G
 
-
C
 
-
S
 
-
L
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
R
 
-
G
 
-
K
 
P
I
 
I
V
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
Q
 
H
T
 
V
R
 
L
I
 
I
A
 
G
N
 
P
N
 
S
V
 
T
T
 
Q
I
 
F
Y
|
Y
A
 
T
F
 
A
N
 
S
H
|
H
G
 
S
M
 
L
H
 
-
P
 
-
D
 
D
T
 
Y
P
 
R
I
 
R
Y
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
-
 
W
S
 
E
S
 
T
Q
 
I
S
 
C
K
 
K
G
 
P
I
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
D
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
G
|
G
A
 
G
Q
 
N
A
 
V
G
 
V
I
 
I
V
 
N
D
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
A
C
 
R
A
 
S
V
 
V
I
 
V
G
x
A
M
x
A
G
x
N
C
 
S
I
 
V
V
 
V
T
x
N
K
 
Q
D
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
P
Y
 
D
A
 
T
I
 
L
V
 
V
A
x
G
G
 
G
N
x
T
P
|
P
A
 
A
R
 
R
I
 
I
I
x
L
G
x
R
D
 
S
R
 
L
R
 
K
D
 
D

3nz2J Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
32% identity, 77% coverage: 43:202/209 of query aligns to 36:181/185 of 3nz2J

query
sites
3nz2J
E
 
E
V
 
I
Q
 
N
Q
 
Q
A
 
S
L
 
L
M
 
D
S
 
E
V
 
A
E
 
E
T
 
R
V
 
Y
S
 
A
I
 
L
G
 
Q
K
 
R
E
 
E
C
 
L
F
 
F
I
 
G
A
 
H
P
 
L
Q
 
G
A
 
H
K
 
K
L
 
S
F
 
C
A
 
V
E
 
Q
P
 
P
G
 
P
R
 
F
D
 
H
I
 
C
L
 
E
I
 
F
G
 
G
D
 
K
R
 
T
C
 
I
M
 
R
I
 
I
A
 
G
A
 
D
D
 
H
S
 
T
F
 
F
L
 
I
H
 
N
G
 
M
P
 
N
I
 
V
V
 
V
M
 
M
G
 
-
N
 
-
E
 
-
V
 
-
A
 
-
I
 
-
N
 
-
H
 
-
G
 
-
C
 
-
S
 
-
L
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
R
 
-
G
 
-
K
 
P
I
 
I
V
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
Q
 
H
T
 
V
R
 
L
I
 
I
A
x
G
N
 
P
N
 
S
V
 
T
T
 
Q
I
 
F
Y
|
Y
A
 
T
F
 
A
N
 
S
H
|
H
G
 
S
M
 
L
H
 
-
P
 
-
D
 
D
T
 
Y
P
 
R
I
 
R
Y
 
R
Q
 
Q
Q
 
A
-
 
W
S
 
E
S
 
T
Q
 
I
S
 
C
K
 
K
G
 
P
I
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
D
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
G
|
G
A
 
G
Q
 
N
A
 
V
G
 
V
I
 
I
V
 
N
D
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
A
C
 
R
A
 
S
V
 
V
I
 
V
G
x
A
M
x
A
G
 
N
C
 
S
I
 
V
V
 
V
T
x
N
K
 
Q
D
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
P
Y
 
D
A
 
T
I
 
L
V
 
V
A
x
G
G
 
G
N
x
T
P
|
P
A
 
A
R
 
R
I
 
I
I
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>5210146 FitnessBrowser__PV4:5210146
MQTPLANQVDYREQHKQRLAYMPWLYFSLKPKHLVWAKPWQDEVQQALMSVETVSIGKEC
FIAPQAKLFAEPGRDILIGDRCMIAADSFLHGPIVMGNEVAINHGCSLDGGRGKIVIGDQ
TRIANNVTIYAFNHGMHPDTPIYQQSSQSKGIVIGRDVWIGAQAGIVDGVTIGDCAVIGM
GCIVTKDVPDYAIVAGNPARIIGDRRDKK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory