SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 5210390 FitnessBrowser__PV4:5210390 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4mvaA 1.43 angstrom resolution crystal structure of triosephosphate isomerase (tpia) from escherichia coli in complex with acetyl phosphate. (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:260/260 of query aligns to 1:252/255 of 4mvaA

query
sites
4mvaA
L
 
M
R
 
R
R
 
H
P
 
P
M
 
L
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
S
A
 
R
Q
 
H
L
 
M
A
 
V
Q
 
H
E
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
S
K
 
N
F
 
L
A
 
R
T
 
K
K
 
E
L
 
L
Q
 
A
N
 
G
D
 
V
S
 
A
A
 
G
-
 
C
E
 
A
V
 
V
V
 
A
L
 
I
C
 
A
P
 
P
P
 
P
S
 
E
I
 
M
F
 
Y
L
 
I
E
 
D
S
 
M
V
 
A
R
 
K
Q
 
R
Q
 
E
L
 
A
D
 
E
A
 
-
N
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
G
C
 
S
L
 
H
V
 
I
R
 
M
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
V
S
 
D
Q
 
L
H
 
N
D
 
L
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
S
 
S
G
 
A
Q
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
D
S
 
I
G
 
G
C
 
A
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
I
 
I
I
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
T
M
 
Y
Y
 
H
G
 
K
E
 
E
T
 
S
S
 
D
D
 
E
I
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
V
A
 
L
Q
 
K
K
 
E
H
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
T
G
 
E
P
 
A
A
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
R
 
G
R
 
K
T
 
T
F
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
C
A
 
A
E
 
R
E
 
Q
L
 
I
D
 
D
V
 
A
V
 
V
I
 
L
E
 
K
K
 
T
N
 
Q
G
 
G
T
 
A
M
 
A
A
 
A
F
 
F
D
 
E
N
 
G
A
 
A
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
K
F
 
F
I
 
I
R
 
R
K
 
D
R
 
H
L
 
I
S
 
A
E
 
K
V
 
V
S
 
D
P
 
A
Y
 
N
I
 
I
G
 
A
E
 
E
N
 
Q
I
 
V
R
 
I
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
T
 
N
P
 
A
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
S
 
A
T
 
D
E
 
A
F
 
F
L
 
A
S
 
V
L
 
I
C
 
V
S
 
K
I
 
A
A
 
A
M
 
E
S
 
A
A
 
A

B1XB85 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Escherichia coli (strain K12 / DH10B) (see paper)
46% identity, 99% coverage: 3:260/260 of query aligns to 1:252/255 of B1XB85

query
sites
B1XB85
L
 
M
R
 
R
R
 
H
P
 
P
M
 
L
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
S
A
 
R
Q
 
H
L
 
M
A
 
V
Q
 
H
E
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
S
K
 
N
F
 
L
A
 
R
T
 
K
K
 
E
L
 
L
Q
 
A
N
 
G
D
 
V
S
 
A
A
 
G
-
 
C
E
 
A
V
 
V
V
 
A
L
 
I
C
 
A
P
 
P
P
 
P
S
 
E
I
 
M
F
 
Y
L
 
I
E
 
D
S
 
M
V
 
A
R
 
K
Q
 
R
Q
 
E
L
 
A
D
 
E
A
 
-
N
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
G
C
 
S
L
 
H
V
 
I
R
 
M
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
V
S
 
D
Q
 
L
H
 
N
D
 
L
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
S
 
S
G
 
A
Q
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
D
S
 
I
G
 
G
C
 
A
R
 
Q
Y
 
Y
V
 
I
I
 
I
I
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
T
M
 
Y
Y
 
H
G
 
K
E
 
E
T
 
S
S
 
D
D
 
E
I
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
V
A
 
L
Q
 
K
K
 
E
H
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
T
G
 
E
P
 
A
A
 
E
R
 
N
E
 
E
A
 
A
R
 
G
R
 
K
T
 
T
F
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
C
A
 
A
E
 
R
E
 
Q
L
 
I
D
 
D
V
 
A
V
 
V
I
 
L
E
 
K
K
 
T
N
 
Q
G
 
G
T
 
A
M
 
A
A
 
A
F
 
F
D
 
E
N
 
G
A
 
A
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
A
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
K
F
 
F
I
 
I
R
 
R
K
 
D
R
 
H
L
 
I
S
 
A
E
 
K
V
 
V
S
 
D
P
 
A
Y
 
N
I
 
I
G
 
A
E
 
E
N
 
Q
I
 
V
R
 
I
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
T
 
N
P
 
A
S
 
S
N
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
E
L
 
L
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
S
 
A
T
 
D
E
 
A
F
 
F
L
 
A
S
 
V
L
 
I
C
 
V
S
 
K
I
 
A
A
 
A
M
 
E
S
 
A
A
 
A

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
46% identity, 98% coverage: 1:255/260 of query aligns to 1:249/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
M
 
M
A
 
A
L
 
S
R
 
R
R
 
K
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
T
 
T
A
 
L
Q
 
E
L
 
S
A
 
I
Q
 
K
E
 
A
L
 
L
F
 
V
T
 
E
K
 
T
F
 
L
A
 
N
T
 
S
K
 
A
L
 
Q
Q
 
L
N
 
D
D
 
P
S
 
N
A
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
V
C
 
A
P
 
P
P
 
P
S
 
A
I
 
I
F
 
Y
L
 
L
E
 
P
S
 
F
V
 
A
R
 
R
Q
 
S
Q
 
K
L
 
L
D
 
K
A
 
K
N
 
P
K
 
K
E
 
E
A
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
-
C
 
-
L
 
-
V
 
I
R
 
Q
M
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
C
S
 
Y
Q
 
T
H
 
K
D
 
P
F
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
G
 
A
Q
 
E
M
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
D
S
 
L
G
 
G
C
 
V
R
 
P
Y
 
W
V
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
T
M
 
I
Y
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
S
 
D
D
 
E
I
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
E
K
 
K
F
 
V
A
 
K
A
 
Y
A
 
A
Q
 
L
K
 
D
H
 
Q
G
 
G
L
 
L
T
 
K
P
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
T
G
 
L
P
 
E
A
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
G
R
 
K
T
 
T
F
 
M
E
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
A
E
 
R
E
 
Q
L
 
I
D
 
L
V
 
K
V
 
A
I
 
I
E
 
-
K
 
A
N
 
D
G
 
K
T
 
I
M
 
K
A
 
D
F
 
W
D
 
S
N
 
N
A
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
V
x
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
A
I
 
L
R
 
R
K
 
K
R
 
W
L
 
L
S
 
K
E
 
E
-
 
N
V
 
V
S
 
S
P
 
P
Y
 
E
I
 
V
G
 
A
E
 
E
N
 
S
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
T
 
N
P
 
A
S
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
K
D
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
K
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
S
 
A
T
 
P
E
 
E
F
 
F
L
 
V
S
 
D
L
 
I
C
 
I
S
 
N

P50921 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Moritella marina (Vibrio marinus) (see paper)
46% identity, 94% coverage: 3:246/260 of query aligns to 1:240/256 of P50921

query
sites
P50921
L
 
M
R
 
R
R
 
H
P
 
P
M
 
V
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
S
A
 
K
Q
 
E
L
 
M
A
 
V
Q
 
V
E
 
D
L
 
L
F
 
L
T
 
N
K
 
G
F
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
E
L
 
L
Q
 
E
N
 
G
-
 
V
D
 
T
S
 
G
A
 
V
E
 
D
V
 
V
V
 
A
L
 
V
C
 
A
P
 
P
P
 
P
S
 
A
I
 
L
F
 
F
L
 
V
E
 
D
S
 
L
V
 
A
R
 
E
Q
 
R
Q
 
T
L
 
L
D
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
-
N
 
-
G
 
G
C
 
S
L
 
A
V
 
I
R
 
I
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
T
S
 
D
Q
 
L
H
 
N
D
 
N
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
S
 
S
G
 
P
Q
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
E
S
 
F
G
 
G
C
 
A
R
 
T
Y
 
H
V
 
I
I
 
I
I
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
E
M
 
Y
Y
 
H
G
 
A
E
 
E
T
 
S
S
 
D
D
 
E
I
 
F
V
 
V
A
 
A
E
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
F
A
 
L
Q
 
K
K
 
E
H
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
S
G
 
D
P
 
A
A
 
Q
R
 
N
E
 
E
A
 
A
R
 
G
R
 
E
T
 
T
F
 
M
E
 
A
V
 
V
I
 
C
A
 
A
E
 
R
E
 
Q
L
 
L
D
 
D
V
 
A
V
 
V
I
 
I
E
 
N
K
 
T
N
 
Q
G
 
G
T
 
V
M
 
E
A
 
A
F
 
L
D
 
E
N
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
V
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
E
 
R
V
 
I
H
 
H
A
 
A
F
 
Q
I
 
I
R
 
R
K
 
A
R
 
H
L
 
I
S
 
A
E
 
E
V
 
K
S
 
S
P
 
E
Y
 
A
I
 
V
G
 
A
E
 
K
N
 
N
I
 
V
R
 
V
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
T
 
K
P
 
P
S
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
A
L
 
Y
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
x
A
L
 
L
N
 
D

1aw1A Triosephosphate isomerase of vibrio marinus complexed with 2- phosphoglycolate (see paper)
46% identity, 93% coverage: 4:246/260 of query aligns to 1:239/255 of 1aw1A

query
sites
1aw1A
R
 
R
R
 
H
P
 
P
M
 
V
V
 
V
A
 
M
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
S
A
 
K
Q
 
E
L
 
M
A
 
V
Q
 
V
E
 
D
L
 
L
F
 
L
T
 
N
K
 
G
F
 
L
A
 
N
T
 
A
K
 
E
L
 
L
Q
 
E
N
 
G
-
 
V
D
 
T
S
 
G
A
 
V
E
 
D
V
 
V
V
 
A
L
 
V
C
 
A
P
 
P
P
 
P
S
 
A
I
 
L
F
 
F
L
 
V
E
 
D
S
 
L
V
 
A
R
 
E
Q
 
R
Q
 
T
L
 
L
D
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
T
E
 
E
A
 
A
L
 
-
N
 
-
G
 
G
C
 
S
L
 
A
V
 
I
R
 
I
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
T
S
 
D
Q
 
L
H
 
N
D
 
N
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
M
S
 
S
G
 
P
Q
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
E
S
 
F
G
 
G
C
 
A
R
 
T
Y
 
H
V
 
I
I
 
I
I
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
R
 
E
M
 
Y
Y
 
H
G
 
A
E
 
E
T
 
S
S
 
D
D
 
E
I
 
F
V
 
V
A
 
A
E
 
K
K
 
K
F
 
F
A
 
A
A
 
F
A
 
L
Q
 
K
K
 
E
H
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
S
G
 
D
P
 
A
A
 
Q
R
 
N
E
 
E
A
 
A
R
 
G
R
 
E
T
 
T
F
 
M
E
 
A
V
 
V
I
 
C
A
 
A
E
 
R
E
 
Q
L
 
L
D
 
D
V
 
A
V
 
V
I
 
I
E
 
N
K
 
T
N
 
Q
G
 
G
T
 
V
M
 
E
A
 
A
F
 
L
D
 
E
N
 
G
A
 
A
I
 
I
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
V
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
A
A
 
A
T
 
T
P
 
A
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
E
 
R
V
 
I
H
 
H
A
 
A
F
 
Q
I
 
I
R
 
R
K
 
A
R
 
H
L
 
I
S
 
A
E
 
E
V
 
K
S
 
S
P
 
E
Y
 
A
I
 
V
G
 
A
E
 
K
N
 
N
I
 
V
R
 
V
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
T
 
K
P
 
P
S
 
E
N
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
A
L
 
Y
F
 
F
A
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
A
L
 
L
N
 
D

6ooiC Crystal structure of triosephosphate isomerase from schistosoma mansoni in complex with 2pg (see paper)
44% identity, 97% coverage: 4:254/260 of query aligns to 8:251/255 of 6ooiC

query
sites
6ooiC
R
 
R
R
 
K
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
T
 
S
A
 
R
Q
 
D
L
 
D
A
 
N
Q
 
D
E
 
K
L
 
L
F
 
L
T
 
K
K
 
L
F
 
L
A
 
S
T
 
E
K
 
A
L
 
H
Q
 
F
N
 
D
D
 
D
S
 
N
A
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
L
L
 
I
C
 
A
P
 
P
P
 
P
S
 
S
I
 
V
F
 
F
L
 
L
E
 
H
S
 
E
V
 
I
R
 
R
Q
 
K
Q
 
S
L
 
L
D
 
-
A
 
-
N
 
K
K
 
K
E
 
E
A
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
-
C
 
-
L
 
-
V
 
I
R
 
H
M
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
C
S
 
Y
Q
 
K
H
 
V
D
 
S
F
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
G
 
P
Q
 
A
M
 
M
L
 
I
K
 
R
D
 
D
S
 
I
G
 
G
C
 
C
R
 
D
Y
 
W
V
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
R
 
N
M
 
I
Y
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
S
 
D
D
 
E
I
 
L
V
 
I
A
 
A
E
 
E
K
 
K
F
 
V
A
 
Q
A
 
H
A
 
A
Q
 
L
K
 
A
H
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
T
G
 
L
P
 
S
A
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
R
 
N
R
 
K
T
 
T
F
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
C
A
 
V
E
 
R
E
 
Q
L
 
L
D
 
K
V
 
A
V
 
I
I
 
A
E
 
N
K
 
K
-
 
I
N
 
K
G
 
S
T
 
A
M
 
D
A
 
E
F
 
W
D
 
K
N
 
R
A
 
V
I
 
V
I
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
V
x
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
N
F
 
F
I
 
L
R
 
R
K
 
K
R
 
W
L
 
F
S
 
K
E
 
T
V
 
N
S
 
A
P
 
P
Y
 
N
-
 
G
I
 
V
G
 
D
E
 
E
N
 
K
I
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
T
 
T
P
 
A
S
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
K
D
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
Q
Q
 
Q
P
 
H
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
-
S
 
K
T
 
P
E
 
E
F
 
F
L
 
T
S
 
E
L
 
I
C
 
C

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
44% identity, 97% coverage: 4:256/260 of query aligns to 402:648/654 of P36204

query
sites
P36204
R
 
R
R
 
K
P
 
L
M
 
I
V
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
H
G
 
K
T
 
T
A
 
I
Q
 
S
L
 
E
A
 
A
Q
 
K
E
 
K
L
 
F
F
 
V
T
 
S
K
 
L
F
 
L
A
 
V
T
 
N
K
 
E
L
 
L
Q
 
H
N
 
D
-
 
V
D
 
K
S
 
E
A
 
F
E
 
E
V
 
I
V
 
V
L
 
V
C
 
C
P
 
P
P
 
P
S
 
F
I
 
T
F
 
A
L
 
L
E
 
S
S
 
E
V
 
V
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
G
E
 
E
A
 
I
L
 
L
N
 
S
G
 
G
C
 
R
L
 
N
V
 
I
R
 
K
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
V
S
 
F
Q
 
Y
H
 
E
D
 
D
F
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
G
 
P
Q
 
L
M
 
M
L
 
L
K
 
Q
D
 
E
S
 
I
G
 
G
C
 
V
R
 
E
Y
 
Y
V
 
V
I
 
I
I
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
R
M
 
I
Y
 
F
G
 
K
E
 
E
T
 
D
S
 
D
D
 
E
I
 
F
V
 
I
A
 
N
E
 
R
K
 
K
F
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
V
Q
 
L
K
 
E
H
 
K
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
L
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
G
 
L
P
 
E
A
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
K
R
 
G
R
 
L
T
 
T
F
 
F
E
 
C
V
 
V
I
 
V
A
 
E
E
 
K
E
 
Q
L
 
V
D
 
-
V
 
-
V
 
-
I
 
-
E
 
-
K
 
R
N
 
E
G
 
G
T
 
F
M
 
Y
A
 
G
F
 
L
D
 
D
N
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
R
A
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
S
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
F
I
 
I
R
 
R
K
 
K
R
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
V
 
M
-
 
Y
S
 
D
P
 
E
Y
 
E
I
 
T
G
 
A
E
 
G
N
 
S
I
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
T
 
K
P
 
P
S
 
D
N
 
N
A
 
F
A
 
L
D
 
G
L
 
L
F
 
I
A
 
V
Q
 
Q
P
 
K
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
S
 
E
T
 
S
E
 
-
F
 
F
L
 
I
S
 
E
L
 
L
C
 
A
S
 
R
I
 
I

Sites not aligning to the query:

5zfxB Crystal structure of triosephosphate isomerase from opisthorchis viverrini (see paper)
45% identity, 97% coverage: 4:255/260 of query aligns to 1:245/248 of 5zfxB

query
sites
5zfxB
R
 
R
R
 
K
P
 
F
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
T
 
S
A
 
K
Q
 
K
L
 
E
A
 
N
Q
 
D
E
 
K
L
 
L
F
 
I
T
x
E
K
 
M
F
 
L
A
 
T
T
x
H
K
 
A
L
 
K
Q
 
I
N
 
D
D
 
P
S
 
N
A
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
L
L
 
V
C
 
A
P
 
P
P
 
P
S
 
A
I
 
L
F
 
Y
L
 
L
E
 
P
S
 
S
V
 
V
R
 
R
Q
 
E
Q
 
K
L
 
L
D
 
D
A
 
K
N
 
R
K
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
-
C
 
-
L
 
-
V
 
F
R
 
H
M
 
V
G
 
A
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
C
S
 
Y
Q
 
K
H
 
V
D
 
P
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
S
 
S
G
 
P
Q
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
K
D
 
D
S
 
V
G
 
G
C
 
C
R
 
D
Y
 
W
V
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
R
 
H
M
 
I
Y
 
L
G
 
L
E
 
E
T
 
T
S
 
D
D
 
Q
I
 
L
V
 
V
A
 
G
E
 
E
K
 
K
F
 
T
A
 
N
A
 
H
A
 
A
Q
 
I
K
 
S
H
 
A
G
 
G
L
 
V
T
 
N
P
 
V
I
 
I
L
 
A
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
K
G
 
L
P
 
E
A
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
G
R
 
K
T
 
T
F
 
E
E
 
E
V
 
V
I
 
C
A
 
F
E
 
R
E
 
Q
L
 
M
D
 
E
V
 
-
V
 
A
I
 
I
E
 
R
K
 
K
N
 
N
G
 
L
T
 
S
M
 
S
A
 
A
-
 
D
-
 
M
F
 
W
D
 
N
N
 
H
A
 
I
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
|
A
V
 
I
G
|
G
T
|
T
G
 
G
K
|
K
S
 
T
A
 
A
T
 
T
P
 
E
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
H
A
 
L
F
 
A
I
 
V
R
 
R
K
 
R
R
 
W
L
 
M
S
 
E
E
 
E
-
 
K
V
 
V
S
 
S
P
 
P
Y
 
A
I
 
V
G
 
A
E
 
K
N
 
S
I
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
T
 
T
P
 
A
S
 
A
N
 
N
A
 
C
A
 
R
D
 
T
L
 
L
F
 
A
A
 
K
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
F
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
S
 
P
T
 
-
E
 
D
F
 
F
L
 
I
S
 
E
L
 
I
C
 
C
S
 
N

3uwzA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
41% identity, 97% coverage: 2:253/260 of query aligns to 1:249/254 of 3uwzA

query
sites
3uwzA
A
 
S
L
 
M
R
 
R
R
 
T
P
 
P
M
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
T
 
T
A
 
V
Q
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
K
E
 
D
L
 
F
F
 
V
T
 
N
K
 
A
F
 
L
A
 
P
T
 
T
K
 
L
L
 
P
Q
 
D
N
 
S
D
 
K
S
 
E
A
 
V
E
 
E
V
 
S
V
 
V
L
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
S
 
A
I
 
I
F
 
Q
L
 
L
E
 
D
S
 
A
V
 
L
R
 
T
Q
 
T
Q
 
A
L
 
V
D
 
K
A
 
E
N
 
G
K
 
K
E
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
A
C
 
Q
L
 
G
V
 
L
R
 
E
M
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
T
S
 
Y
Q
 
F
H
 
E
D
 
D
F
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
S
 
S
G
 
P
Q
 
V
M
 
A
L
 
L
K
 
A
D
 
D
S
 
L
G
 
G
C
 
V
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
R
 
E
M
 
L
Y
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
D
 
E
I
 
E
V
 
I
A
 
N
E
 
K
K
 
K
F
 
A
A
 
H
A
 
A
A
 
I
Q
 
F
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
G
 
D
P
 
E
A
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
R
 
G
R
 
K
T
 
A
F
 
N
E
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
G
E
 
E
E
 
Q
L
 
V
D
 
K
V
 
K
V
 
A
I
 
V
E
 
A
K
 
G
N
 
L
G
 
S
T
 
E
M
 
D
A
 
Q
F
 
L
D
 
K
N
 
S
A
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
K
 
Q
R
 
T
L
 
I
S
 
A
E
 
D
V
 
L
S
 
S
P
 
S
Y
 
K
-
 
E
I
 
V
G
 
S
E
 
E
N
 
A
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
T
 
K
P
 
P
S
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
D
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
S
 
V
T
 
E
E
 
D
F
 
F
L
 
V
S
 
Q
L
 
L

3uwwA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglyceric acid (see paper)
41% identity, 97% coverage: 2:253/260 of query aligns to 1:249/254 of 3uwwA

query
sites
3uwwA
A
 
S
L
 
M
R
 
R
R
 
T
P
 
P
M
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
T
 
T
A
 
V
Q
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
K
E
 
D
L
 
F
F
 
V
T
 
N
K
 
A
F
 
L
A
 
P
T
 
T
K
 
L
L
 
P
Q
 
D
N
 
S
D
 
K
S
 
E
A
 
V
E
 
E
V
 
S
V
 
V
L
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
S
 
A
I
 
I
F
 
Q
L
 
L
E
 
D
S
 
A
V
 
L
R
 
T
Q
 
T
Q
 
A
L
 
V
D
 
K
A
 
E
N
 
G
K
 
K
E
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
A
C
 
Q
L
 
G
V
 
L
R
 
E
M
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
T
S
 
Y
Q
 
F
H
 
E
D
 
D
F
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
S
 
S
G
 
P
Q
 
V
M
 
A
L
 
L
K
 
A
D
 
D
S
 
L
G
 
G
C
 
V
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
R
 
E
M
 
L
Y
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
D
 
E
I
 
E
V
 
I
A
 
N
E
 
K
K
 
K
F
 
A
A
 
H
A
 
A
A
 
I
Q
 
F
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
G
 
D
P
 
E
A
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
R
 
G
R
 
K
T
 
A
F
 
N
E
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
G
E
 
E
E
 
Q
L
 
V
D
 
K
V
 
K
V
 
A
I
 
V
E
 
A
K
 
G
N
 
L
G
 
S
T
 
E
M
 
D
A
 
Q
F
 
L
D
 
K
N
 
S
A
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
V
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
K
 
Q
R
 
T
L
 
I
S
 
A
E
 
D
V
 
L
S
 
S
P
 
S
Y
 
K
-
 
E
I
 
V
G
 
S
E
 
E
N
 
A
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
T
 
K
P
 
P
S
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
D
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
S
 
V
T
 
E
E
 
D
F
 
F
L
 
V
S
 
Q
L
 
L

3uwvA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglyceric acid (see paper)
41% identity, 97% coverage: 2:253/260 of query aligns to 2:250/255 of 3uwvA

query
sites
3uwvA
A
 
S
L
 
M
R
 
R
R
 
T
P
 
P
M
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
T
 
T
A
 
V
Q
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
K
E
 
D
L
 
F
F
 
V
T
 
N
K
 
A
F
 
L
A
 
P
T
 
T
K
 
L
L
 
P
Q
 
D
N
 
S
D
 
K
S
 
E
A
 
V
E
 
E
V
 
S
V
 
V
L
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
S
 
A
I
 
I
F
 
Q
L
 
L
E
 
D
S
 
A
V
 
L
R
 
T
Q
 
T
Q
 
A
L
 
V
D
 
K
A
 
E
N
 
G
K
 
K
E
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
A
C
 
Q
L
 
G
V
 
L
R
 
E
M
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
T
S
 
Y
Q
 
F
H
 
E
D
 
D
F
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
S
 
S
G
 
P
Q
 
V
M
 
A
L
 
L
K
 
A
D
 
D
S
 
L
G
 
G
C
 
V
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
R
 
E
M
 
L
Y
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
D
 
E
I
 
E
V
 
I
A
 
N
E
 
K
K
 
K
F
 
A
A
 
H
A
 
A
A
 
I
Q
 
F
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
G
 
D
P
 
E
A
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
R
 
G
R
 
K
T
 
A
F
 
N
E
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
G
E
 
E
E
 
Q
L
 
V
D
 
K
V
 
K
V
 
A
I
 
V
E
 
A
K
 
G
N
 
L
G
 
S
T
 
E
M
 
D
A
 
Q
F
 
L
D
 
K
N
 
S
A
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
V
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
K
 
Q
R
 
T
L
 
I
S
 
A
E
 
D
V
 
L
S
 
S
P
 
S
Y
 
K
-
 
E
I
 
V
G
 
S
E
 
E
N
 
A
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
T
x
K
P
 
P
S
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
D
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
S
 
V
T
 
E
E
 
D
F
 
F
L
 
V
S
 
Q
L
 
L

3uwuA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-3-phosphate (see paper)
41% identity, 97% coverage: 3:253/260 of query aligns to 1:248/253 of 3uwuA

query
sites
3uwuA
L
 
M
R
 
R
R
 
T
P
 
P
M
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
T
 
T
A
 
V
Q
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
K
E
 
D
L
 
F
F
 
V
T
 
N
K
 
A
F
 
L
A
 
P
T
 
T
K
 
L
L
 
P
Q
 
D
N
 
S
D
 
K
S
 
E
A
 
V
E
 
E
V
 
S
V
 
V
L
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
S
 
A
I
 
I
F
 
Q
L
 
L
E
 
D
S
 
A
V
 
L
R
 
T
Q
 
T
Q
 
A
L
 
V
D
 
K
A
 
E
N
 
G
K
 
K
E
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
A
C
 
Q
L
 
G
V
 
L
R
 
E
M
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
T
S
 
Y
Q
 
F
H
 
E
D
 
D
F
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
S
 
S
G
 
P
Q
 
V
M
 
A
L
 
L
K
 
A
D
 
D
S
 
L
G
 
G
C
 
V
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
R
 
E
M
 
L
Y
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
D
 
E
I
 
E
V
 
I
A
 
N
E
 
K
K
 
K
F
 
A
A
 
H
A
 
A
A
 
I
Q
 
F
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
G
 
D
P
 
E
A
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
R
 
G
R
 
K
T
 
A
F
 
N
E
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
G
E
 
E
E
 
Q
L
 
V
D
 
K
V
 
K
V
 
A
I
 
V
E
 
A
K
 
G
N
 
L
G
 
S
T
 
E
M
 
D
A
 
Q
F
 
L
D
 
K
N
 
S
A
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
V
x
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
K
 
Q
R
 
T
L
 
I
S
 
A
E
 
D
V
 
L
S
 
S
P
 
S
Y
 
K
-
 
E
I
 
V
G
 
S
E
 
E
N
 
A
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
T
 
K
P
 
P
S
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
D
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
S
 
V
T
 
E
E
 
D
F
 
F
L
 
V
S
 
Q
L
 
L

Q6GIL6 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Staphylococcus aureus (strain MRSA252) (see paper)
41% identity, 97% coverage: 3:253/260 of query aligns to 1:248/253 of Q6GIL6

query
sites
Q6GIL6
L
 
M
R
 
R
R
 
T
P
 
P
M
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
T
 
T
A
 
V
Q
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
K
E
 
D
L
 
F
F
 
V
T
 
N
K
 
A
F
 
L
A
 
P
T
 
T
K
 
L
L
 
P
Q
 
D
N
 
S
D
 
K
S
 
E
A
 
V
E
 
E
V
 
S
V
 
V
L
 
I
C
 
C
P
 
A
P
 
P
S
 
A
I
 
I
F
 
Q
L
 
L
E
 
D
S
 
A
V
 
L
R
 
T
Q
 
T
Q
 
A
L
 
V
D
 
K
A
 
E
N
 
G
K
 
K
E
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
G
 
A
C
 
Q
L
 
G
V
 
L
R
 
E
M
 
I
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
T
S
 
Y
Q
 
F
H
 
E
D
 
D
F
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
T
S
 
S
G
 
P
Q
 
V
M
 
A
L
 
L
K
 
A
D
 
D
S
 
L
G
 
G
C
 
V
R
 
K
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
I
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
E
M
 
L
Y
 
F
G
 
H
E
 
E
T
 
T
S
 
D
D
 
E
I
 
E
V
 
I
A
 
N
E
 
K
K
 
K
F
 
A
A
 
H
A
 
A
A
 
I
Q
 
F
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
M
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
G
 
D
P
 
E
A
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
R
 
G
R
 
K
T
 
A
F
 
N
E
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
G
E
 
E
E
 
Q
L
 
V
D
 
K
V
 
K
V
 
A
I
 
V
E
 
A
K
 
G
N
 
L
G
 
S
T
 
E
M
 
D
A
 
Q
F
 
L
D
 
K
N
 
S
A
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
V
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
S
E
 
E
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
E
V
 
M
H
 
C
A
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
K
 
Q
R
 
T
L
 
I
S
 
A
E
 
D
V
 
L
S
 
S
P
 
S
Y
 
K
-
 
E
I
 
V
G
 
S
E
 
E
N
 
A
I
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
T
 
K
P
 
P
S
 
N
N
 
N
A
 
I
A
 
K
D
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
Q
 
Q
P
 
T
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
S
 
V
T
 
E
E
 
D
F
 
F
L
 
V
S
 
Q
L
 
L

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
42% identity, 97% coverage: 3:253/260 of query aligns to 1:246/253 of P27876

query
sites
P27876
L
 
M
R
 
R
R
 
K
P
 
P
M
 
I
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
N
 
N
G
 
K
T
 
T
A
 
L
Q
 
G
L
 
E
A
 
A
Q
 
V
E
 
S
L
 
F
F
 
V
T
 
E
K
 
E
F
 
V
A
 
K
T
 
S
K
 
S
L
 
I
-
 
P
Q
 
A
N
 
A
D
 
D
S
 
K
A
 
A
E
 
E
V
 
A
V
 
V
L
 
V
C
 
C
P
 
A
P
 
P
S
 
A
I
 
L
F
 
F
L
 
L
E
 
E
S
 
K
V
 
L
R
 
A
Q
 
S
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
-
E
 
-
A
 
A
L
 
V
N
 
K
G
 
G
C
 
T
L
 
D
V
 
L
R
 
K
M
 
V
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
N
L
 
M
S
 
H
Q
 
F
H
 
E
D
 
E
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
G
 
P
Q
 
V
M
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
D
S
 
L
G
 
G
C
 
V
R
 
D
Y
 
Y
V
 
C
I
 
V
I
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
E
M
 
M
Y
 
F
G
 
A
E
 
E
T
 
T
S
 
D
D
 
E
I
 
T
V
 
V
A
 
N
E
 
K
K
 
K
F
 
A
A
 
H
A
 
A
A
 
A
Q
 
F
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
I
T
 
V
P
 
P
I
 
I
L
 
I
C
 
C
V
 
V
G
 
G
E
 
E
S
 
T
G
 
L
P
 
E
A
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
G
R
 
K
T
 
T
F
 
N
E
 
D
V
 
L
I
 
V
A
 
A
E
 
D
E
 
Q
L
 
V
D
 
K
V
 
K
V
 
G
I
 
L
E
 
A
K
 
G
N
 
L
G
 
S
T
 
E
M
 
E
A
 
Q
F
 
V
D
 
A
N
 
A
A
 
S
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
L
 
I
W
 
W
A
 
A
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
S
A
 
S
T
 
T
P
 
A
E
 
K
Q
 
D
A
 
A
Q
 
N
E
 
D
V
 
V
H
 
C
A
 
A
F
 
H
I
 
I
R
 
R
K
 
K
R
 
T
L
 
V
S
 
A
E
 
E
-
 
S
V
 
F
S
 
S
P
 
Q
Y
 
E
I
 
A
G
 
A
E
 
D
N
 
K
I
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
T
 
K
P
 
P
S
 
A
N
 
N
A
 
I
A
 
K
D
 
E
L
 
Y
F
 
M
A
 
A
Q
 
E
P
 
S
D
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
E
S
 
P
T
 
Q
E
 
S
F
 
F
L
 
V
S
 
Q
L
 
L

P9WG43 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
47% identity, 98% coverage: 4:257/260 of query aligns to 3:255/261 of P9WG43

query
sites
P9WG43
R
 
R
R
 
K
P
 
P
M
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
L
T
 
N
A
 
H
Q
 
Y
L
 
E
A
 
A
Q
 
I
E
 
A
L
 
L
F
 
V
T
 
Q
K
 
K
F
 
I
A
 
A
T
 
F
K
 
S
L
 
L
Q
 
P
N
 
D
-
 
K
-
 
Y
-
 
Y
D
 
D
S
 
R
A
 
V
E
 
D
V
 
V
V
 
A
L
 
V
C
 
I
P
 
P
P
 
P
S
 
F
I
 
T
F
 
D
L
 
L
E
 
R
S
 
S
V
 
V
R
 
Q
Q
 
T
Q
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
G
N
 
D
K
 
K
E
 
L
A
 
R
L
 
L
N
 
T
G
 
-
C
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
L
 
L
S
 
S
Q
 
P
H
 
H
D
 
D
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
A
M
 
F
L
 
L
K
 
A
D
 
K
S
 
L
G
 
G
C
 
C
R
 
S
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
I
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
R
 
T
M
 
Y
Y
 
H
G
 
N
E
 
E
T
 
D
S
 
D
D
 
A
I
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
A
K
 
K
F
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
A
Q
 
L
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
V
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
H
G
 
L
P
 
D
A
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
G
R
 
N
T
 
H
F
 
V
E
 
A
V
 
H
I
 
N
A
 
I
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
D
 
R
V
 
G
V
 
S
I
 
L
E
 
A
K
 
G
N
 
L
G
 
L
T
 
A
M
 
E
A
 
Q
F
 
I
D
 
G
N
 
S
A
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
V
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
S
 
V
A
 
A
T
 
S
P
 
A
E
 
A
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
C
A
 
A
F
 
A
I
 
I
R
 
R
K
 
K
R
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
S
V
 
L
-
 
A
S
 
S
P
 
P
Y
 
R
I
 
I
G
 
A
E
 
D
N
 
T
I
 
V
R
 
R
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
T
 
N
P
 
A
S
 
K
N
 
N
A
 
V
A
 
G
D
 
D
L
 
I
F
 
V
A
 
A
Q
 
Q
P
 
D
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
D
S
 
G
T
 
E
E
 
H
F
 
F
L
 
A
S
 
T
L
 
L
C
 
A
S
 
A
I
 
I
A
 
A

3taoA Structure of mycobacterium tuberculosis triosephosphate isomerase bound to phosphoglycolohydroxamate (see paper)
47% identity, 98% coverage: 4:257/260 of query aligns to 2:254/256 of 3taoA

query
sites
3taoA
R
 
R
R
 
K
P
 
P
M
 
L
V
 
I
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
L
T
 
N
A
 
H
Q
 
Y
L
 
E
A
 
A
Q
 
I
E
 
A
L
 
L
F
 
V
T
 
Q
K
 
K
F
 
I
A
 
A
T
 
F
K
 
S
L
 
L
Q
 
P
N
 
D
-
 
K
-
 
Y
-
 
Y
D
 
D
S
 
R
A
 
V
E
 
D
V
 
V
V
 
A
L
 
V
C
 
I
P
 
P
P
 
P
S
 
F
I
 
T
F
 
D
L
 
L
E
x
R
S
|
S
V
 
V
R
 
Q
Q
x
T
Q
 
L
L
 
V
D
 
D
A
 
G
N
 
D
K
 
K
E
 
L
A
 
R
L
 
L
N
 
T
G
 
-
C
 
-
L
 
-
V
 
-
R
 
-
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
L
 
L
S
 
S
Q
 
P
H
 
H
D
 
D
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
D
V
 
V
S
 
S
G
 
G
Q
 
A
M
 
F
L
 
L
K
 
A
D
 
K
S
 
L
G
 
G
C
 
C
R
 
S
Y
 
Y
V
 
V
I
 
V
I
 
V
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
R
 
T
M
 
Y
Y
 
H
G
 
N
E
 
E
T
 
D
S
 
D
D
 
A
I
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
A
K
 
K
F
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
A
Q
 
L
K
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
L
T
 
T
P
 
P
I
 
I
L
 
V
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
H
G
 
L
P
 
D
A
 
V
R
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
G
R
 
N
T
 
H
F
 
V
E
 
A
V
 
H
I
 
N
A
 
I
E
 
E
E
 
Q
L
 
L
D
 
R
V
 
G
V
 
S
I
 
L
E
 
A
K
 
G
N
 
L
G
 
L
T
 
A
M
 
E
A
 
Q
F
 
I
D
 
G
N
 
S
A
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
V
x
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
S
 
V
A
 
A
T
 
S
P
 
A
E
 
A
Q
 
D
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
H
 
C
A
 
A
F
 
A
I
 
I
R
 
R
K
 
K
R
 
E
L
 
L
S
 
A
E
 
S
V
 
L
-
 
A
S
 
S
P
 
P
Y
 
R
I
 
I
G
 
A
E
 
D
N
 
T
I
 
V
R
 
R
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
T
 
N
P
 
A
S
 
K
N
 
N
A
 
V
A
 
G
D
 
D
L
 
I
F
 
V
A
 
A
Q
 
Q
P
 
D
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
|
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
D
S
 
G
T
 
E
E
 
H
F
 
F
L
 
A
S
 
T
L
 
L
C
 
A
S
 
A
I
 
I
A
 
A

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
43% identity, 98% coverage: 4:257/260 of query aligns to 2:249/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
R
 
R
R
 
K
P
 
K
M
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
T
T
 
T
A
 
L
Q
 
A
L
 
E
A
 
A
Q
 
K
E
 
A
L
 
L
F
 
G
T
 
A
K
 
A
F
 
V
A
 
A
T
 
K
K
 
G
L
 
V
Q
 
T
N
 
D
D
 
D
S
 
R
A
 
V
E
 
T
V
 
V
V
 
A
L
 
V
C
 
F
P
 
P
P
 
P
S
 
Y
I
 
P
F
 
W
L
 
L
E
 
T
S
 
A
V
 
V
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
G
E
 
E
A
 
V
L
 
L
N
 
K
G
 
G
C
 
S
L
 
P
V
 
V
R
 
A
M
 
L
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
N
 
D
L
 
V
S
 
S
Q
 
S
H
 
E
D
 
K
F
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
V
S
 
S
G
 
P
Q
 
A
M
 
M
L
 
L
K
 
L
D
 
E
S
 
T
G
 
G
C
 
C
R
 
K
Y
 
Y
V
 
A
I
 
L
I
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
R
 
H
M
 
I
Y
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
S
S
 
E
D
 
T
I
 
F
V
 
I
A
 
N
E
 
H
K
 
K
F
 
V
A
 
H
A
 
T
A
 
A
Q
 
L
K
 
E
H
 
E
G
 
G
L
 
L
T
 
S
P
 
V
I
 
V
L
 
L
C
 
C
V
 
M
G
 
G
E
 
E
S
 
T
G
 
L
P
 
A
A
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
R
R
 
G
R
 
L
T
 
Q
F
 
E
E
 
R
V
 
V
I
 
F
A
 
Q
E
 
R
E
 
Q
L
 
V
D
 
Y
V
 
A
V
 
A
I
 
C
E
 
A
K
 
G
N
 
L
G
 
T
T
 
D
M
 
E
A
 
Q
F
 
F
D
 
G
N
 
R
A
 
I
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
L
 
V
W
 
W
A
 
A
V
x
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
V
A
 
A
T
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
V
 
A
H
 
H
A
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
R
K
 
S
R
 
K
L
 
L
S
 
R
E
 
L
V
 
L
-
 
Y
S
 
G
P
 
D
Y
 
K
I
 
I
G
 
A
E
 
D
N
 
S
I
 
T
R
 
P
I
 
I
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
T
 
T
P
 
P
S
 
D
N
 
N
A
 
T
A
 
V
D
 
G
L
 
L
F
 
M
A
 
S
Q
 
Q
P
 
P
D
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
A
L
 
L
I
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
K
S
 
A
T
 
D
E
 
S
F
 
F
L
 
L
S
 
A
L
 
I
C
 
V
S
 
K
I
 
A
A
 
A

6oogA Crystal structure of triosephosphate isomerase from taenia solium in complex with 2pg (see paper)
43% identity, 96% coverage: 4:253/260 of query aligns to 5:247/252 of 6oogA

query
sites
6oogA
R
 
R
R
 
K
P
 
L
M
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
N
 
N
G
 
G
T
 
S
A
 
Y
Q
 
S
L
 
H
A
 
I
Q
 
N
E
 
T
L
 
F
F
 
F
T
 
D
K
 
T
F
 
L
A
 
Q
T
 
K
K
 
A
L
 
D
Q
 
T
N
 
D
D
 
P
S
 
N
A
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
V
L
 
I
C
 
G
P
 
V
P
 
P
S
 
A
I
 
C
F
 
Y
L
 
L
E
 
K
S
 
Y
V
 
-
R
 
-
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
D
 
-
A
 
A
N
 
Q
K
 
D
E
 
K
A
 
A
L
 
P
N
 
K
G
 
G
C
 
-
L
 
-
V
 
I
R
 
K
M
 
I
G
 
A
A
 
A
Q
 
E
N
 
N
L
 
C
S
 
Y
Q
 
K
H
 
V
D
 
G
F
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
V
 
I
S
 
S
G
 
T
Q
 
E
M
 
M
L
 
I
K
 
K
D
 
D
S
 
C
G
 
G
C
 
C
R
 
E
Y
 
W
V
 
V
I
 
I
I
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
R
 
H
M
 
I
Y
 
F
G
 
G
E
 
E
T
 
S
S
 
N
D
 
E
I
 
L
V
 
I
A
 
G
E
 
E
K
 
K
F
 
V
A
 
K
A
 
H
A
 
A
Q
 
L
K
 
D
H
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
N
P
 
V
I
 
I
L
 
P
C
 
C
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
L
G
 
L
P
 
S
A
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
R
 
G
R
 
K
T
 
T
F
 
N
E
 
D
V
 
V
I
 
C
A
 
F
E
 
A
E
 
Q
L
 
M
D
 
D
V
 
-
V
 
A
I
 
I
E
 
A
K
 
K
N
 
N
-
 
V
-
 
P
G
 
S
T
 
K
M
 
E
A
 
A
F
 
W
D
 
D
N
 
K
A
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
A
Y
 
Y