SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 5210422 FitnessBrowser__PV4:5210422 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7djsD Crystal structure of isopiperitenol dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa complexed with NAD
42% identity, 98% coverage: 5:248/248 of query aligns to 3:251/251 of 7djsD

query
sites
7djsD
F
 
L
E
 
S
G
 
G
K
 
Q
V
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
 
A
G
|
G
F
x
I
G
 
G
K
 
R
L
 
A
L
 
T
A
 
A
Q
 
Q
R
 
A
L
 
F
A
 
A
P
 
A
Q
 
A
G
 
G
A
 
V
K
 
K
L
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
A
D
|
D
I
x
L
N
 
D
-
 
S
-
 
A
-
 
G
-
 
G
D
 
E
T
 
G
A
 
T
L
 
V
D
 
E
A
 
A
L
 
I
C
 
R
S
 
Q
E
 
A
L
 
G
G
 
G
E
 
E
C
 
-
A
 
A
V
 
V
G
 
F
L
 
I
R
 
R
C
|
C
D
|
D
V
|
V
S
 
T
I
 
R
E
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
V
L
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
E
L
 
G
A
 
C
E
 
A
E
 
A
S
 
A
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
Y
A
 
A
I
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
S
 
E
A
 
I
P
 
E
M
 
Q
K
 
G
S
 
K
L
 
L
L
 
A
A
 
D
T
 
G
T
 
N
E
 
E
A
 
A
D
 
E
M
 
F
D
 
D
L
 
A
S
 
I
F
 
M
A
 
A
I
 
V
N
 
N
T
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
W
F
 
L
G
 
C
M
 
M
K
 
K
A
 
H
Q
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
M
 
M
Q
 
L
K
 
A
H
 
Q
K
 
G
C
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
x
T
A
 
A
S
|
S
M
 
V
A
 
A
G
 
G
I
 
L
N
 
G
G
 
A
A
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
M
T
 
S
P
 
I
Y
|
Y
V
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
H
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
I
E
 
E
F
 
Y
A
 
A
A
 
K
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
C
P
 
P
F
x
A
F
x
V
T
 
I
P
 
D
T
 
T
P
 
D
M
 
M
V
 
F
T
 
R
E
 
R
G
 
A
V
 
Y
-
 
E
-
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
R
L
 
K
I
 
A
E
 
E
Q
 
F
L
 
A
T
 
A
R
 
A
A
 
M
V
 
H
P
 
P
M
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
V
A
 
G
D
 
R
P
 
V
N
 
E
E
 
E
V
 
I
V
 
A
S
 
A
A
 
A
M
 
V
L
 
L
H
 
Y
M
 
L
V
 
C
N
 
S
P
 
D
D
 
N
N
 
A
G
 
G
F
 
F
M
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
I
A
 
A
I
 
L
A
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
A
S
 
T
A
 
A
I
 
I

4urfB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:244/248 of query aligns to 3:244/248 of 4urfB

query
sites
4urfB
F
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
S
x
N
G
|
G
F
x
I
G
 
G
K
 
R
L
 
T
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
T
L
 
Y
A
 
A
P
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
S
D
 
D
T
 
E
A
 
W
L
 
G
D
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
I
S
 
E
E
 
G
L
 
K
G
 
G
E
 
G
C
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
F
L
 
Q
R
 
H
C
 
A
D
|
D
V
x
T
S
 
A
I
 
H
E
 
P
A
 
E
E
 
D
Q
 
H
L
 
D
A
 
E
L
 
L
A
 
I
Q
 
A
L
 
A
A
 
A
E
 
K
E
 
R
S
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
S
 
S
A
x
G
P
 
E
M
 
F
K
 
T
S
 
P
L
 
T
L
 
A
A
 
E
T
 
T
T
 
T
E
 
D
A
 
A
D
 
Q
M
 
W
D
 
Q
L
x
R
S
 
V
F
 
I
A
 
G
I
 
I
N
 
N
T
 
L
K
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
G
 
G
M
 
V
K
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
P
 
R
L
 
A
M
 
M
Q
 
L
K
 
E
H
 
T
K
 
G
C
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
M
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
N
 
I
G
 
G
A
 
I
P
 
E
K
 
G
L
x
I
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
V
 
T
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
T
A
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
A
 
S
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
x
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
C
 
G
P
|
P
F
x
A
F
 
F
T
x
I
P
 
N
T
|
T
P
 
T
M
 
L
V
 
V
T
 
-
E
 
Q
G
 
N
V
 
V
D
 
P
P
 
L
A
 
E
L
 
T
I
 
R
E
 
R
Q
 
Q
L
 
L
T
 
E
R
 
Q
A
 
M
V
 
H
P
 
A
M
x
L
R
|
R
R
|
R
L
 
L
A
 
G
D
 
E
P
 
T
N
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
A
S
 
N
A
 
L
M
 
V
L
 
A
H
 
W
M
 
L
V
 
S
N
x
S
P
 
D
D
 
K
N
 
A
G
 
S
F
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
A
 
Y
I
 
Y
A
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4urfA Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:244/248 of query aligns to 3:244/248 of 4urfA

query
sites
4urfA
F
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
G
S
x
N
G
|
G
F
x
I
G
 
G
K
 
R
L
 
T
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
T
L
 
Y
A
 
A
P
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
S
D
 
D
T
 
E
A
x
W
L
 
G
D
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
I
S
 
E
E
 
G
L
 
K
G
 
G
E
 
G
C
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
F
L
 
Q
R
 
H
C
 
A
D
|
D
V
x
T
S
 
A
I
 
H
E
 
P
A
 
E
E
 
D
Q
 
H
L
 
D
A
 
E
L
 
L
A
 
I
Q
 
A
L
 
A
A
 
A
E
 
K
E
 
R
S
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
S
|
S
A
x
G
P
x
E
M
 
F
K
x
T
S
 
P
L
 
T
L
 
A
A
x
E
T
 
T
T
|
T
E
 
D
A
 
A
D
x
Q
M
 
W
D
 
Q
L
x
R
S
 
V
F
 
I
A
 
G
I
 
I
N
 
N
T
 
L
K
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
G
 
G
M
 
V
K
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
P
 
R
L
 
A
M
 
M
Q
 
L
K
 
E
H
 
T
K
 
G
C
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
M
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
N
 
I
G
 
G
A
 
I
P
 
E
K
 
G
L
x
I
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
V
 
T
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
T
A
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
A
x
S
Q
 
K
G
|
G
I
 
I
Q
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
C
 
G
P
|
P
F
 
A
F
 
F
T
x
I
P
 
N
T
|
T
P
 
T
M
 
L
V
 
V
T
 
-
E
 
Q
G
 
N
V
 
V
D
 
P
P
 
L
A
 
E
L
 
T
I
 
R
E
 
R
Q
 
Q
L
 
L
T
 
E
R
 
Q
A
 
M
V
 
H
P
 
A
M
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
E
P
 
T
N
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
A
S
 
N
A
 
L
M
 
V
L
 
A
H
 
W
M
 
L
V
 
S
N
 
S
P
 
D
D
 
K
N
 
A
G
 
S
F
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
x
S
A
x
Y
I
 
Y
A
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4ureB Molecular genetic and crystal structural analysis of 1-(4- hydroxyphenyl)-ethanol dehydrogenase from aromatoleum aromaticum ebn1 (see paper)
39% identity, 97% coverage: 5:244/248 of query aligns to 3:244/248 of 4ureB

query
sites
4ureB
F
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
S
x
N
G
|
G
F
x
I
G
 
G
K
 
R
L
 
T
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
T
L
 
Y
A
 
A
P
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
S
D
 
D
I
 
I
N
 
S
D
 
D
T
 
E
A
 
W
L
 
G
D
 
R
-
 
E
-
 
T
-
 
L
A
 
A
L
 
L
C
 
I
S
 
E
E
 
G
L
 
K
G
 
G
E
 
G
C
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
F
L
 
Q
R
 
H
C
 
A
D
 
D
V
 
T
S
 
A
I
 
H
E
 
P
A
 
E
E
 
D
Q
 
H
L
 
D
A
 
E
L
 
L
A
 
I
Q
 
A
L
 
A
A
 
A
E
 
K
E
 
R
S
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
S
 
S
A
 
G
P
 
E
M
 
F
K
 
T
S
 
P
L
 
T
L
 
A
A
 
E
T
 
T
T
 
T
E
 
D
A
 
A
D
 
Q
M
 
W
D
 
Q
L
 
R
S
 
V
F
 
I
A
 
G
I
 
I
N
 
N
T
 
L
K
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
G
 
G
M
 
V
K
 
R
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
P
 
R
L
 
A
M
 
M
Q
 
L
K
 
E
H
 
T
K
 
G
C
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
S
S
|
S
M
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
Q
N
 
I
G
 
G
A
 
I
P
 
E
K
 
G
L
x
I
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
V
 
T
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
T
A
 
V
A
 
A
L
 
W
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
A
 
S
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
C
 
G
P
|
P
F
x
A
F
 
F
T
 
I
P
 
N
T
 
T
P
 
T
M
 
L
V
 
V
T
 
-
E
 
Q
G
 
N
V
 
V
D
 
P
P
 
L
A
 
E
L
 
T
I
 
R
E
 
R
Q
 
Q
L
 
L
T
 
E
R
 
Q
A
 
M
V
 
H
P
 
A
M
 
L
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
E
P
 
T
N
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
A
S
 
N
A
 
L
M
 
V
L
 
A
H
 
W
M
 
L
V
 
S
N
 
S
P
 
D
D
 
K
N
 
A
G
 
S
F
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
A
 
Y
I
 
Y
A
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:248/248 of query aligns to 3:248/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
F
 
L
E
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
H
R
 
S
L
 
Y
A
 
A
P
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
V
 
I
L
 
V
G
 
S
D
|
D
I
|
I
N
 
N
D
 
E
-
 
D
-
 
H
-
 
G
-
 
N
T
 
K
A
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
D
L
 
I
C
 
K
S
 
A
E
 
Q
L
 
G
G
 
G
E
 
E
C
 
A
A
 
S
V
 
F
G
 
-
L
 
V
R
 
K
C
x
A
D
|
D
V
x
T
S
 
S
I
 
N
E
 
P
A
 
E
E
 
E
Q
 
V
L
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
L
 
R
A
 
T
E
 
V
E
 
E
S
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
S
 
G
A
 
G
P
 
E
M
 
-
K
 
Q
S
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
G
T
 
D
T
 
Y
E
 
G
A
 
L
D
 
D
-
 
S
M
 
W
D
 
R
L
 
K
S
 
V
F
 
L
A
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
L
K
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
F
 
Y
G
 
G
M
 
C
K
 
K
A
 
Y
Q
 
E
I
 
L
P
 
E
L
 
Q
M
 
M
Q
 
E
K
 
K
H
 
N
K
 
G
C
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
x
M
A
 
A
S
|
S
M
 
I
A
 
H
G
 
G
I
 
I
N
 
V
G
 
A
A
 
A
P
 
P
K
 
L
L
 
S
T
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
T
A
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
N
A
 
I
A
 
G
L
 
A
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
A
 
Q
Q
 
K
G
 
N
I
 
I
Q
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
G
P
|
P
F
x
A
F
x
Y
T
x
I
P
 
E
T
 
T
P
 
P
M
x
L
V
 
L
T
 
-
E
 
E
G
 
S
V
 
L
D
 
T
P
 
K
A
 
E
L
 
M
I
 
K
E
 
E
Q
 
A
L
 
L
T
 
I
R
 
S
A
 
K
V
 
H
P
 
P
M
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
K
P
 
P
N
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
A
S
 
E
A
 
L
M
 
V
L
 
L
H
 
F
M
 
L
V
 
S
N
 
S
P
 
E
D
 
K
N
 
S
G
 
S
F
 
F
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
G
A
 
Y
I
 
Y
A
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
S
 
T
A
 
A
I
 
V

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
36% identity, 99% coverage: 3:247/248 of query aligns to 9:265/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
S
 
T
N
 
R
F
 
F
E
 
T
G
 
D
K
 
R
V
 
V
V
 
V
L
|
L
I
|
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
A
x
G
S
|
S
G
|
G
F
x
L
G
|
G
K
x
R
L
x
A
L
x
T
A
|
A
Q
x
V
R
|
R
L
|
L
A
|
A
P
x
A
Q
x
E
G
|
G
A
|
A
K
|
K
L
|
L
V
x
S
L
|
L
G
 
V
D
 
D
I
 
V
N
 
S
D
 
S
T
 
E
A
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
S
C
 
K
S
 
A
E
 
A
L
 
V
G
 
L
E
 
E
C
 
T
A
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
V
V
 
L
G
 
T
L
 
T
R
 
V
C
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
S
I
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
Q
Q
 
V
L
 
E
A
 
A
L
 
Y
A
 
V
Q
 
T
L
 
A
A
 
T
E
 
T
E
 
E
S
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
G
A
 
F
I
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
x
E
A
 
G
P
 
K
M
 
Q
K
 
N
S
 
P
L
 
T
L
 
E
A
 
S
T
 
F
T
 
T
E
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
F
D
 
D
L
 
K
S
 
V
F
 
V
A
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
L
K
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
F
 
L
G
 
G
M
 
L
K
 
E
A
 
K
Q
 
V
I
 
L
P
 
K
L
 
I
M
 
M
Q
 
R
K
 
E
H
 
Q
K
 
G
C
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
L
 
V
N
 
N
V
 
T
A
 
A
S
 
S
M
 
V
A
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
R
G
 
G
A
 
I
P
 
G
K
 
N
L
 
Q
T
 
S
P
 
G
Y
 
Y
V
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
R
T
 
N
A
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
A
 
R
Q
 
Y
G
 
G
I
 
I
Q
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
A
P
 
P
F
 
G
F
 
A
T
 
I
P
 
W
T
 
T
P
 
P
M
 
M
V
 
V
T
 
E
E
 
N
G
 
S
-
 
M
-
 
K
-
 
Q
V
 
L
D
 
D
P
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
R
A
 
K
L
 
A
I
 
A
E
 
E
Q
 
E
L
 
F
T
 
I
R
 
Q
A
 
V
V
 
N
P
 
P
M
 
S
R
 
K
R
 
R
L
 
Y
A
 
G
D
 
E
P
 
A
N
 
P
E
 
E
V
 
I
V
 
A
S
 
A
A
 
V
M
 
V
L
 
A
H
 
F
M
 
L
V
 
L
N
 
S
P
 
D
D
 
D
N
 
A
G
 
S
F
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
A
Q
 
T
A
 
V
I
 
V
A
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Q
S
 
S
A
 
A

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:247/248 of query aligns to 2:256/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
F
 
F
E
 
T
G
 
D
K
 
R
V
 
V
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
G
S
|
S
G
|
G
F
x
L
G
 
G
K
 
R
L
 
A
L
 
T
A
 
A
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
P
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
S
L
 
L
G
 
V
D
|
D
I
x
V
N
 
S
D
 
S
T
 
E
A
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
S
C
 
K
S
 
A
E
 
A
L
 
V
G
 
L
E
 
E
C
 
T
A
 
A
-
 
P
-
 
D
-
 
A
-
 
E
-
 
V
V
 
L
G
 
T
L
 
T
R
 
V
C
x
A
D
|
D
V
|
V
S
 
S
I
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
Q
Q
 
V
L
 
E
A
 
A
L
 
Y
A
 
V
Q
 
T
L
 
A
A
 
T
E
 
T
E
 
E
S
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
G
A
 
F
I
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
S
 
E
A
 
G
P
 
K
M
 
Q
K
 
N
S
 
P
L
 
T
L
 
E
A
 
S
T
 
F
T
 
T
E
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
F
D
 
D
L
 
K
S
 
V
F
 
V
A
 
S
I
 
I
N
 
N
T
 
L
K
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
F
 
L
G
 
G
M
 
L
K
 
E
A
 
K
Q
 
V
I
 
L
P
 
K
L
 
I
M
 
M
Q
 
R
K
 
E
H
 
Q
K
 
G
C
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
L
 
V
N
 
N
V
x
T
A
 
A
S
|
S
M
 
V
A
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
R
G
 
G
A
 
I
P
 
G
K
 
N
L
x
Q
T
 
S
P
 
G
Y
|
Y
V
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
R
T
 
N
A
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
E
F
 
Y
A
 
G
A
 
R
Q
 
Y
G
 
G
I
 
I
Q
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
I
C
 
A
P
|
P
F
x
G
F
 
A
T
 
I
P
 
W
T
|
T
P
|
P
M
|
M
V
 
V
T
 
E
E
 
N
G
 
S
-
 
M
-
 
K
-
 
Q
V
 
L
D
 
D
P
 
P
-
 
E
-
 
N
-
 
P
-
 
R
A
 
K
L
 
A
I
 
A
E
 
E
Q
 
E
L
 
F
T
 
I
R
 
Q
A
 
V
V
 
N
P
 
P
M
 
S
R
 
K
R
 
R
L
 
Y
A
 
G
D
 
E
P
 
A
N
 
P
E
 
E
V
 
I
V
 
A
S
 
A
A
 
V
M
 
V
L
 
A
H
 
F
M
 
L
V
 
L
N
 
S
P
 
D
D
 
D
N
 
A
G
 
S
F
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
A
Q
 
T
A
 
V
I
 
V
A
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Q
S
 
S
A
 
A

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
36% identity, 96% coverage: 8:245/248 of query aligns to 3:253/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
x
Q
G
|
G
F
x
I
G
 
G
K
 
K
L
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
V
P
 
K
Q
 
D
G
 
G
A
 
F
K
 
A
L
 
V
V
 
A
L
 
I
G
 
A
D
|
D
I
x
Y
N
 
N
D
 
D
T
 
A
A
 
T
L
 
A
D
 
K
A
 
A
L
 
V
C
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
G
 
G
E
 
G
C
 
H
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
V
R
 
K
C
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
I
 
D
E
x
R
A
x
D
E
 
Q
Q
 
V
L
x
F
A
 
A
L
 
A
A
 
V
Q
 
E
L
 
Q
A
 
A
E
 
R
E
 
K
S
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
A
 
I
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
V
S
 
-
A
 
A
P
 
P
M
 
S
K
 
T
S
 
P
L
 
I
L
 
E
A
 
S
T
 
I
T
 
T
E
 
P
A
 
E
D
 
I
M
 
V
D
 
D
L
 
K
S
 
V
F
 
Y
A
 
N
I
|
I
N
 
N
T
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
I
F
 
W
G
 
G
M
 
I
K
 
Q
A
 
A
Q
 
A
I
 
V
P
x
E
L
 
A
M
 
F
Q
 
K
K
 
K
H
 
E
-
 
G
K
 
H
C
 
G
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
 
A
A
 
C
S
|
S
M
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
H
N
 
V
G
 
G
A
 
N
P
 
P
K
 
E
L
 
L
T
 
A
P
 
V
Y
|
Y
V
 
S
A
 
S
A
 
S
K
|
K
H
 
F
A
 
A
V
 
V
V
 
R
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
D
F
 
L
A
 
A
A
 
P
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
C
 
C
P
|
P
F
 
G
F
 
I
T
x
V
P
 
K
T
|
T
P
 
P
M
|
M
V
 
W
T
 
A
E
 
E
G
 
-
V
 
I
D
 
D
P
 
R
A
 
Q
L
x
V
I
 
S
E
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
T
-
 
A
Q
 
E
L
 
F
T
 
A
R
 
K
A
 
R
V
 
I
P
 
T
M
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
S
D
 
E
P
 
P
N
 
E
E
 
D
V
 
V
V
 
A
S
 
A
A
 
C
M
 
V
L
 
S
H
 
Y
M
 
L
V
 
A
N
 
S
P
 
P
D
 
D
N
 
S
G
 
D
F
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
S
I
 
L
A
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
M

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
35% identity, 96% coverage: 8:245/248 of query aligns to 3:253/256 of Q48436

query
sites
Q48436
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
A
x
G
S
x
Q
G
|
G
F
x
I
G
|
G
K
|
K
L
x
A
L
x
I
A
|
A
Q
x
L
R
|
R
L
|
L
A
x
V
P
x
K
Q
x
D
G
|
G
A
x
F
K
x
A
L
x
V
V
x
A
L
x
I
G
x
A
D
|
D
I
 
Y
N
 
N
D
 
D
T
 
A
A
 
T
L
 
A
D
 
K
A
 
A
L
 
V
C
 
A
S
 
S
E
 
E
L
 
I
G
 
N
E
 
Q
C
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
R
A
 
A
V
 
M
G
 
A
L
 
V
R
 
K
C
 
V
D
|
D
V
 
V
S
 
S
I
 
D
E
 
R
A
 
D
E
 
Q
Q
 
V
L
 
F
A
 
A
L
 
A
A
 
V
Q
 
E
L
 
Q
A
 
A
E
 
R
E
 
K
S
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
V
A
 
I
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
-
A
 
A
P
 
P
M
 
S
K
 
T
S
 
P
L
 
I
L
 
E
A
 
S
T
 
I
T
 
T
E
 
P
A
 
E
D
 
I
M
 
V
D
 
D
L
 
K
S
 
V
F
 
Y
A
 
N
I
 
I
N
 
N
T
 
V
K
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
I
F
 
W
G
 
G
M
 
I
K
 
Q
A
 
A
Q
 
A
I
 
V
P
 
E
L
 
A
M
 
F
Q
 
K
K
 
K
H
 
E
-
 
G
K
 
H
C
 
G
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
 
A
A
 
C
S
 
S
M
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
H
N
 
V
G
 
G
A
 
N
P
 
P
K
 
E
L
 
L
T
 
A
P
 
V
Y
 
Y
V
 
S
A
 
S
A
 
S
K
|
K
H
 
F
A
 
A
V
 
V
V
 
R
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
D
F
 
L
A
 
A
A
 
P
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
C
 
C
P
 
P
F
 
G
F
 
I
T
 
V
P
 
K
T
 
T
P
 
P
M
 
M
V
 
W
T
 
A
E
 
E
G
 
-
V
 
I
D
 
D
P
 
R
A
 
Q
L
 
V
I
 
S
E
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
-
 
G
-
 
T
-
 
A
Q
 
E
L
 
F
T
 
A
R
 
K
A
 
R
V
 
I
P
 
T
M
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
S
D
 
E
P
 
P
N
 
E
E
 
D
V
 
V
V
 
A
S
 
A
A
 
C
M
 
V
L
 
S
H
 
Y
M
 
L
V
 
A
N
 
S
P
 
P
D
 
D
N
 
S
G
 
D
F
 
Y
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
S
I
 
L
A
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
M

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
37% identity, 98% coverage: 3:245/248 of query aligns to 3:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
S
 
S
N
 
R
F
 
L
E
 
Q
G
 
D
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
F
x
I
G
 
G
K
 
L
L
 
E
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
R
 
V
L
 
F
A
 
M
P
 
K
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
A
D
|
D
I
x
F
N
 
N
D
 
E
T
 
A
A
 
A
L
 
-
D
 
G
A
 
K
L
 
E
C
 
A
S
 
V
E
 
E
L
 
A
G
 
N
E
 
P
C
 
G
A
 
V
V
 
V
G
 
F
L
 
I
R
 
R
C
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
I
 
D
E
 
R
A
 
E
E
 
S
Q
 
V
L
 
H
A
 
R
L
 
L
A
 
V
Q
 
E
L
 
N
A
 
V
E
 
A
E
 
E
S
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
S
 
T
A
 
R
P
x
D
M
 
-
K
 
-
S
 
S
L
 
M
L
 
L
A
 
S
T
x
K
T
 
M
E
 
T
A
 
V
D
 
D
-
 
Q
M
 
F
D
 
Q
L
 
Q
S
 
V
F
 
I
A
 
N
I
 
V
N
|
N
T
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
F
 
H
G
 
C
M
 
T
K
 
Q
A
 
A
Q
 
V
I
 
L
P
 
P
L
 
Y
M
 
M
Q
 
A
K
 
E
H
 
Q
K
 
G
C
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
x
T
A
 
S
S
|
S
M
 
V
A
 
T
G
 
G
I
 
T
N
 
Y
G
 
G
A
x
N
P
x
V
K
 
G
L
x
Q
T
 
T
P
 
N
Y
|
Y
V
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
I
 
M
T
 
T
R
 
K
T
 
T
A
 
W
A
 
A
L
 
K
E
 
E
F
 
L
A
 
A
A
 
R
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
F
 
G
F
|
F
T
|
T
P
 
E
T
|
T
P
 
A
M
|
M
V
 
V
T
 
A
E
 
E
G
 
-
V
 
V
D
 
P
P
 
E
A
 
K
L
 
V
I
 
I
E
 
E
Q
x
K
L
 
M
T
 
K
R
 
A
A
 
Q
V
 
V
P
 
P
M
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
K
P
 
P
N
 
E
E
 
D
V
 
I
V
 
A
S
 
N
A
 
A
M
 
Y
L
 
L
H
 
F
M
 
L
V
 
A
N
 
S
P
 
H
D
 
E
N
 
S
G
 
D
F
 
Y
M
 
V
T
 
N
G
 
G
Q
 
H
A
 
V
I
 
L
A
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
I

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
37% identity, 98% coverage: 5:246/248 of query aligns to 3:244/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
F
 
I
E
 
Q
G
 
N
K
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
S
|
S
G
 
G
F
 
M
G
 
G
K
 
K
L
 
Q
L
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
R
L
 
F
A
 
A
P
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
N
D
|
D
I
 
I
N
 
D
D
 
A
T
 
E
A
 
K
L
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
T
C
 
V
S
 
D
E
 
E
L
 
F
-
 
S
-
 
A
-
 
R
G
 
G
E
 
H
C
 
R
A
 
V
V
 
L
G
 
G
L
 
A
R
 
V
C
 
A
D
|
D
V
x
I
S
 
G
I
 
N
E
 
K
A
 
A
E
 
A
Q
 
V
L
 
D
A
 
G
L
 
M
A
 
V
Q
 
K
L
 
Q
A
 
T
E
 
I
E
 
D
S
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
S
 
E
A
 
R
P
 
A
M
 
-
K
 
G
S
 
A
L
 
L
L
 
R
A
 
K
T
 
L
T
 
S
E
 
E
A
 
A
D
 
D
M
 
W
D
 
D
L
 
V
S
 
T
F
 
I
A
 
N
I
 
V
N
 
N
T
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
F
 
L
G
 
C
M
 
T
K
 
Q
A
 
A
Q
 
V
I
 
H
P
 
G
L
 
H
M
 
M
Q
 
V
K
 
E
H
 
N
K
 
K
C
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
 
S
M
 
R
A
 
A
G
 
W
I
 
L
N
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
G
K
 
Q
L
 
-
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
V
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
M
T
 
T
R
 
R
T
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
F
 
L
A
 
G
A
 
R
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
A
P
 
P
F
 
G
F
 
L
T
 
I
P
 
H
T
 
T
P
 
P
M
 
M
V
 
W
T
 
D
E
 
E
G
 
L
V
 
P
D
 
E
P
 
K
A
 
D
L
 
Q
I
 
Q
E
 
F
Q
 
L
L
 
L
T
 
S
R
 
R
A
 
Q
V
 
-
P
 
P
M
 
T
R
 
G
R
 
K
L
 
L
A
 
G
D
 
E
P
 
P
N
 
D
E
 
D
V
 
I
V
 
A
S
 
N
A
 
T
M
 
L
L
 
L
H
 
F
M
 
L
V
 
A
N
 
D
P
 
D
D
 
D
N
 
S
G
 
G
F
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
V
I
 
L
A
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
V
 
R
S
 
S

Sites not aligning to the query:

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:246/248 of query aligns to 2:243/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
F
 
I
E
 
Q
G
 
N
K
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
S
 
S
G
 
G
F
x
M
G
 
G
K
 
K
L
 
Q
L
 
T
A
 
A
Q
 
L
R
 
R
L
 
F
A
 
A
P
 
E
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
N
D
|
D
I
|
I
N
 
D
D
 
A
T
 
E
A
 
K
L
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
T
C
 
V
S
 
D
E
 
E
L
 
F
-
 
S
-
 
A
-
 
R
G
 
G
E
 
H
C
 
R
A
 
V
V
 
L
G
 
G
L
 
A
R
 
V
C
 
A
D
 
D
V
x
I
S
 
G
I
 
N
E
 
K
A
 
A
E
 
A
Q
 
V
L
 
D
A
 
G
L
 
M
A
 
V
Q
 
K
L
 
Q
A
 
T
E
 
I
E
 
D
S
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
S
 
E
A
 
R
P
 
A
M
 
-
K
 
G
S
 
A
L
 
L
L
 
R
A
 
K
T
 
L
T
 
S
E
 
E
A
 
A
D
 
D
M
 
W
D
 
D
L
 
V
S
 
T
F
 
I
A
 
N
I
 
V
N
 
N
T
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
F
 
L
G
 
C
M
 
T
K
 
Q
A
 
A
Q
 
V
I
 
H
P
 
G
L
 
H
M
 
M
Q
 
V
K
 
E
H
 
N
K
 
K
C
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
M
 
R
A
 
A
G
 
W
I
 
L
N
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
G
K
 
Q
L
 
-
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
V
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
A
A
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
I
 
M
T
 
T
R
 
R
T
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
I
E
 
E
F
 
L
A
 
G
A
 
R
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
I
 
V
C
 
A
P
 
P
F
 
G
F
 
L
T
x
I
P
 
H
T
 
T
P
 
P
M
 
M
V
 
W
T
 
D
E
 
E
G
 
L
V
 
P
D
 
E
P
 
K
A
 
D
L
 
Q
I
 
Q
E
 
F
Q
 
L
L
 
L
T
 
S
R
 
R
A
 
Q
V
 
-
P
 
P
M
 
T
R
 
G
R
 
K
L
 
L
A
 
G
D
 
E
P
 
P
N
 
D
E
 
D
V
 
I
V
 
A
S
 
N
A
 
T
M
 
L
L
 
L
H
 
F
M
 
L
V
 
A
N
 
D
P
 
D
D
 
D
N
 
S
G
 
G
F
 
F
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
V
I
 
L
A
 
Y
I
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G
V
 
R
S
 
S

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
35% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 1:260/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
M
 
M
Q
 
T
S
 
K
N
 
L
F
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
K
 
L
L
 
E
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
K
L
 
F
A
 
A
P
 
Q
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
S
D
|
D
I
x
M
N
 
N
D
 
A
T
 
E
A
 
K
L
 
C
D
 
Q
A
 
E
L
 
T
C
 
A
S
 
N
E
 
S
L
 
L
G
 
K
E
 
E
C
 
Q
-
 
G
-
 
F
-
 
D
A
 
A
V
 
L
G
 
S
L
 
A
R
 
P
C
 
C
D
|
D
V
|
V
S
 
T
I
 
D
E
 
E
A
 
D
E
 
A
Q
 
Y
L
 
K
A
 
Q
L
 
A
A
 
I
Q
 
E
L
 
L
A
 
T
E
 
Q
E
 
K
S
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
S
x
Q
-
 
H
-
 
V
A
 
A
P
 
P
M
 
I
K
 
E
S
 
E
L
 
F
L
 
P
A
 
T
T
 
A
T
 
V
E
 
F
A
 
Q
D
 
K
M
 
L
D
 
-
L
 
-
S
 
-
F
 
V
A
 
Q
I
 
V
N
 
M
T
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
K
 
K
A
 
H
Q
 
V
I
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
M
Q
 
K
K
 
A
H
 
Q
K
 
K
C
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
M
 
I
A
x
N
G
 
G
I
 
L
N
 
I
G
 
G
A
 
F
P
 
A
K
 
G
L
x
K
T
 
A
P
 
G
Y
|
Y
V
 
N
A
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
C
A
 
A
A
 
R
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
|
P
F
x
G
F
 
Y
T
x
V
P
 
D
T
|
T
P
 
P
M
x
L
V
 
V
-
 
R
-
 
G
-
x
Q
-
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
K
T
 
T
E
 
R
G
 
N
V
 
V
-
 
S
-
 
L
D
 
D
P
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
E
E
 
D
Q
 
V
L
 
I
T
 
L
R
 
A
A
 
M
V
 
V
P
 
P
M
 
Q
R
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
L
D
 
S
P
 
V
N
 
E
E
 
E
V
 
I
V
 
A
S
 
D
A
 
Y
M
 
A
L
 
I
H
 
F
M
 
L
V
 
A
N
 
S
P
 
S
D
 
K
N
 
A
G
 
G
F
 
G
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
S
 
T
A
 
A

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:247/248 of query aligns to 4:259/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
F
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
K
 
L
L
 
E
L
 
I
A
 
A
Q
 
K
R
 
K
L
 
F
A
 
A
P
 
Q
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
S
D
|
D
I
x
M
N
 
N
D
 
A
T
 
E
A
 
K
L
 
C
D
 
Q
A
 
E
L
 
T
C
 
A
S
 
N
E
 
S
L
 
L
G
 
K
E
 
E
C
 
Q
-
 
G
-
 
F
-
 
D
A
 
A
V
 
L
G
 
S
L
 
A
R
 
P
C
 
C
D
|
D
V
|
V
S
 
T
I
 
D
E
 
E
A
 
D
E
 
A
Q
 
Y
L
 
K
A
 
Q
L
 
A
A
 
I
Q
 
E
L
 
L
A
 
T
E
 
Q
E
 
K
S
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
S
x
Q
-
 
H
-
 
V
A
 
A
P
 
P
M
 
I
K
 
E
S
 
E
L
 
F
L
 
P
A
 
T
T
 
A
T
 
V
E
 
F
A
 
Q
D
 
K
M
 
L
D
 
-
L
 
-
S
 
-
F
 
V
A
 
Q
I
 
V
N
 
M
T
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
I
K
 
K
A
 
H
Q
 
V
I
 
L
P
 
P
L
 
I
M
 
M
Q
 
K
K
 
A
H
 
Q
K
 
K
C
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
M
 
I
A
 
N
G
 
G
I
 
L
N
 
I
G
 
G
A
 
F
P
 
A
K
 
G
L
x
K
T
 
A
P
 
G
Y
|
Y
V
 
N
A
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
F
 
C
A
 
A
A
 
R
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
 
P
F
 
G
F
x
Y
T
x
V
P
 
D
T
|
T
P
 
P
M
 
L
V
 
V
-
 
R
-
 
G
-
x
Q
-
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
K
T
 
T
E
 
R
G
 
N
V
 
V
-
 
S
-
 
L
D
 
D
P
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
E
E
 
D
Q
 
V
L
 
I
T
 
L
R
 
A
A
 
M
V
 
V
P
 
P
M
 
Q
R
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
L
D
 
S
P
 
V
N
 
E
E
 
E
V
 
I
V
 
A
S
 
D
A
 
Y
M
 
A
L
 
I
H
 
F
M
 
L
V
 
A
N
 
S
P
 
S
D
 
K
N
 
A
G
 
G
F
 
G
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
Y
S
 
T
A
 
A

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
35% identity, 96% coverage: 8:245/248 of query aligns to 6:248/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
K
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
S
x
Q
G
|
G
F
x
I
G
 
G
K
 
R
L
 
I
L
 
Y
A
 
A
Q
 
E
R
 
R
L
 
F
A
 
A
P
 
E
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
A
D
|
D
I
 
I
N
 
N
D
 
E
-
 
P
-
 
K
-
 
A
T
 
T
A
 
E
L
 
V
D
 
A
A
 
S
L
 
S
C
 
I
S
 
T
E
 
S
L
 
L
G
 
G
E
 
G
C
 
R
A
 
A
V
 
I
G
 
A
L
 
A
R
 
A
C
 
V
D
 
D
V
|
V
S
 
S
I
 
D
E
 
V
A
 
E
E
 
S
Q
 
V
L
 
N
A
 
R
L
 
M
A
 
V
Q
 
D
L
 
S
A
 
A
E
 
V
E
 
E
S
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
x
A
I
 
I
-
 
F
-
x
S
S
 
T
A
 
L
P
 
K
M
 
M
K
 
K
S
 
P
L
 
F
L
 
E
A
 
E
T
 
I
T
 
S
E
 
G
A
 
D
D
 
E
M
 
W
D
 
D
L
 
K
S
 
L
F
 
F
A
 
A
I
 
V
N
 
N
T
 
A
K
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
F
 
L
G
 
C
M
 
C
K
 
Q
A
 
A
Q
 
V
I
 
S
P
 
P
L
 
V
M
 
M
Q
 
R
K
 
K
H
 
N
K
 
Q
C
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
x
I
A
x
S
S
|
S
M
 
S
A
 
V
G
 
V
I
 
V
N
 
T
G
 
G
A
 
R
P
 
P
K
 
N
L
 
Y
T
 
A
P
 
H
Y
|
Y
V
 
I
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
W
G
 
A
I
 
L
T
 
T
R
 
H
T
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
T
E
 
E
F
 
M
A
 
G
A
 
T
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
C
 
S
P
|
P
-
x
H
-
 
G
F
x
I
F
 
I
T
 
T
P
 
E
T
x
I
P
 
P
M
 
R
V
 
E
T
 
T
-
 
I
-
 
S
-
 
E
E
 
E
G
 
G
V
 
W
D
 
R
P
 
R
A
 
N
L
 
L
I
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
-
T
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
A
M
 
L
R
 
K
R
 
R
L
 
K
A
 
G
D
 
D
P
 
A
N
 
S
E
 
D
V
 
L
V
 
V
S
 
G
A
 
I
M
 
L
L
 
L
H
 
Y
M
 
L
V
 
A
N
 
S
P
 
D
D
 
E
N
 
S
G
 
K
F
 
F
M
 
M
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
I
 
V
A
 
A
I
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G
V
 
L

4qecA Elxo with NADP bound (see paper)
33% identity, 96% coverage: 8:244/248 of query aligns to 3:244/248 of 4qecA

query
sites
4qecA
K
 
K
V
 
N
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
F
S
x
K
G
|
G
F
x
I
G
 
G
K
 
K
L
 
Q
L
 
V
A
 
A
Q
 
L
R
 
E
L
 
F
A
 
L
P
 
K
Q
 
N
G
 
D
A
 
Y
K
 
H
L
 
V
V
 
C
L
 
I
G
 
T
D
x
S
I
x
R
-
 
Y
-
 
F
-
 
E
N
x
K
D
 
E
T
 
K
A
 
R
L
 
I
D
 
P
A
 
H
L
 
L
C
 
F
S
 
S
E
 
S
L
 
Y
G
 
E
E
 
E
C
 
N
A
 
I
V
 
S
G
 
F
L
 
Y
R
 
Q
C
 
L
D
|
D
V
|
V
S
 
T
I
 
D
E
 
E
A
 
E
E
 
Q
Q
 
V
L
 
N
A
 
E
L
 
I
A
 
I
Q
 
N
L
 
K
A
 
I
E
 
V
E
 
K
S
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
V
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
S
 
S
A
 
L
P
 
S
M
 
D
K
 
G
S
 
L
L
 
L
L
 
T
A
 
E
T
 
T
T
 
K
E
 
T
A
 
T
D
 
D
M
 
F
D
 
N
L
 
K
S
 
M
F
 
I
A
 
N
I
 
T
N
|
N
T
 
I
K
 
L
G
 
G
V
 
T
F
 
Y
F
 
F
G
 
C
M
 
M
K
 
K
A
 
Y
Q
 
A
I
 
L
P
 
K
L
 
H
M
 
M
Q
 
Q
K
 
K
H
 
V
K
 
S
C
 
C
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
x
I
A
 
S
S
|
S
M
 
I
A
 
T
G
 
G
I
 
L
N
 
S
G
 
G
A
 
F
P
 
P
K
 
Y
L
 
S
T
 
I
P
 
L
Y
|
Y
V
 
G
A
 
S
A
 
T
K
|
K
H
 
H
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
 
G
I
 
L
T
 
T
R
 
K
T
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
E
F
 
F
A
 
A
A
 
D
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
Q
 
K
V
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
V
C
 
A
P
|
P
F
 
G
F
 
I
T
x
I
P
 
K
T
 
T
P
 
E
M
 
T
V
 
L
T
 
Q
E
 
K
G
 
E
V
 
I
D
 
D
P
 
S
A
 
G
L
 
E
I
 
F
E
 
S
Q
 
E
-
 
D
-
 
S
L
 
I
T
 
S
R
 
S
A
 
I
V
 
H
P
 
P
M
 
M
R
 
Q
R
 
K
L
 
L
A
 
G
D
 
T
P
 
T
N
 
L
E
 
D
V
 
V
V
 
A
S
 
K
A
 
G
M
 
I
L
 
Y
H
 
F
M
 
L
V
 
A
N
 
N
P
 
E
D
 
D
N
 
N
G
 
N
F
 
F
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
H
A
 
V
I
 
L
A
 
S
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2hsdA The refined three-dimensional structure of 3alpha,20beta- hydroxysteroid dehydrogenase and possible roles of the residues conserved in short-chain dehydrogenases (see paper)
36% identity, 98% coverage: 3:246/248 of query aligns to 1:242/253 of 2hsdA

query
sites
2hsdA
S
 
N
N
 
D
F
 
L
E
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
V
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
S
x
R
G
|
G
F
x
L
G
 
G
K
 
A
L
 
E
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
R
 
Q
L
 
A
A
 
V
P
 
A
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
A
D
|
D
I
x
V
N
 
L
D
 
D
T
 
E
A
 
E
L
 
G
D
 
A
A
 
A
L
 
T
C
 
A
S
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
E
 
D
C
 
A
A
 
A
V
 
R
G
 
Y
L
 
Q
R
 
H
C
x
L
D
 
D
V
|
V
S
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
E
E
 
D
Q
 
W
L
 
Q
A
 
R
L
 
V
A
 
V
Q
 
A
L
 
Y
A
 
A
E
 
R
E
 
E
S
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
G
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
S
 
S
A
 
T
P
 
G
M
 
M
K
 
-
S
 
-
L
 
F
L
 
L
A
 
E
T
 
T
T
 
E
E
 
S
A
 
V
D
 
E
-
 
R
M
 
F
D
 
R
L
 
K
S
 
V
F
 
V
A
 
E
I
 
I
N
 
N
T
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
T
Q
 
V
I
 
I
P
 
P
L
 
A
M
 
M
Q
 
K
K
 
D
H
 
A
K
 
G
C
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
S
S
|
S
M
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
N
 
M
G
 
G
A
 
L
P
 
A
K
 
L
L
 
T
T
 
S
P
 
S
Y
|
Y
V
 
G
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
W
A
 
G
V
 
V
V
 
R
G
 
G
I
 
L
T
 
S
R
 
K
T
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
E
F
 
L
A
 
G
A
 
T
Q
 
D
G
 
R
I
 
I
Q
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
V
C
 
H
P
|
P
F
x
G
F
 
M
T
|
T
P
 
Y
T
 
T
P
 
P
M
 
M
V
 
T
T
 
A
E
 
E
-
 
T
G
 
G
V
 
I
D
 
R
P
 
Q
A
 
G
L
 
-
I
 
-
E
 
E
Q
 
G
L
 
N
T
 
Y
R
 
P
A
 
N
V
 
T
P
 
P
M
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
V
A
 
G
D
 
E
P
 
P
N
 
G
E
 
E
V
 
I
V
 
A
S
 
G
A
 
A
M
 
V
L
 
V
H
 
K
M
 
L
V
 
L
N
 
S
P
 
D
D
 
T
N
 
S
G
 
S
F
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
A
 
E
I
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
W
S
 
T

1hdcA Mechanism of inhibition of 3alpha,20beta-hydroxysteroid dehydrogenase by a licorice-derived steroidal inhibitor (see paper)
36% identity, 98% coverage: 3:246/248 of query aligns to 1:242/253 of 1hdcA

query
sites
1hdcA
S
 
N
N
 
D
F
 
L
E
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
T
V
 
V
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
S
 
R
G
|
G
F
 
L
G
 
G
K
 
A
L
 
E
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
R
 
Q
L
 
A
A
 
V
P
 
A
Q
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
A
D
 
D
I
 
V
N
 
L
D
 
D
T
 
E
A
 
E
L
 
G
D
 
A
A
 
A
L
 
T
C
 
A
S
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
G
E
 
D
C
 
A
A
 
A
V
 
R
G
 
Y
L
 
Q
R
 
H
C
 
L
D
 
D
V
 
V
S
 
T
I
 
I
E
 
E
A
 
E
E
 
D
Q
 
W
L
 
Q
A
 
R
L
 
V
A
 
V
Q
 
A
L
 
Y
A
 
A
E
 
R
E
 
E
S
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
S
L
 
V
D
 
D
I
 
G
A
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
|
S
A
x
T
P
x
G
M
 
M
K
 
-
S
 
-
L
 
F
L
 
L
A
 
E
T
 
T
T
 
E
E
 
S
A
 
V
D
 
E
-
 
R
M
 
F
D
 
R
L
 
K
S
 
V
F
 
V
A
 
E
I
 
I
N
 
N
T
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
F
 
I
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
T
Q
 
V
I
 
I
P
 
P
L
 
A
M
 
M
Q
 
K
K
 
D
H
 
A
K
 
G
C
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
 
I
A
 
S
S
|
S
M
 
A
A
 
A
G
 
G
I
 
L
N
 
M
G
 
G
A
 
L
P
 
A
K
x
L
L
 
T
T
 
S
P
 
S
Y
|
Y
V
 
G
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
W
A
 
G
V
 
V
V
 
R
G
 
G
I
 
L
T
 
S
R
 
K
T
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
V
E
 
E
F
 
L
A
 
G
A
 
T
Q
 
D
G
 
R
I
 
I
Q
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
V
C
 
H
P
 
P
F
 
G
F
x
M
T
 
T
P
 
Y
T
 
T
P
 
P
M
|
M
V
x
T
T
 
A
E
 
E
-
x
T
G
 
G
V
 
I
D
 
R
P
 
Q
A
 
G
L
 
-
I
 
-
E
 
E
Q
 
G
L
 
N
T
 
Y
R
 
P
A
 
N
V
 
T
P
 
P
M
 
M
R
 
G
R
 
R
L
 
V
A
 
G
D
 
E
P
 
P
N
 
G
E
 
E
V
 
I
V
 
A
S
 
G
A
 
A
M
 
V
L
 
V
H
 
K
M
 
L
V
 
L
N
 
S
P
 
D
D
 
T
N
 
S
G
 
S
F
 
Y
M
 
V
T
 
T
G
 
G
Q
 
A
A
 
E
I
 
L
A
 
A
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
W
S
 
T

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
34% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 1:245/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
M
 
F
Q
 
Q
S
 
G
N
 
R
F
 
F
E
 
D
G
 
N
K
 
K
V
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
S
x
N
G
|
G
F
 
M
G
 
G
K
 
E
L
 
A
L
 
A
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
L
 
F
A
 
S
P
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
A
D
|
D
I
x
W
N
 
A
D
 
K
T
 
E
A
 
A
L
 
V
D
 
D
A
 
K
L
 
V
C
 
A
S
 
A
E
 
S
L
 
L
G
 
P
E
 
K
C
 
G
-
 
R
A
 
A
V
 
M
G
 
A
L
 
V
R
 
H
C
x
I
D
|
D
V
|
V
S
 
S
I
 
D
E
 
H
A
 
V
E
 
A
Q
 
V
L
 
E
A
 
K
L
 
M
A
 
M
Q
 
N
L
 
E
A
 
V
E
 
A
E
 
E
S
 
K
F
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
A
 
L
I
 
L
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
 
V
S
 
H
A
 
V
P
 
A
M
 
-
K
 
G
S
 
S
L
 
V
L
 
L
A
 
E
T
 
T
T
 
S
E
 
I
A
 
D
D
 
D
M
 
W
D
 
R
L
 
R
S
 
I
F
 
A
A
 
G
I
 
V
N
 
D
T
 
I
K
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
V
F
 
F
G
 
C
M
 
S
K
 
K
A
 
F
Q
 
A
I
 
L
P
 
P
L
 
H
M
 
L
Q
 
L
K
 
K
H
 
T
K
 
K
C
 
-
G
 
G
A
 
C
I
 
I
L
 
V
N
 
N
V
 
T
A
 
A
S
|
S
M
 
V
A
 
S
G
 
G
I
 
L
N
 
G
G
 
G
A
 
D
P
 
W
K
 
G
L
 
A
T
 
A
P
 
Y
Y
|
Y
V
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
H
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
N
I
 
L
T
 
T
R
 
R
T
 
A
A
 
M
A
 
A
L
 
L
E
 
D
F
 
H
A
 
G
A
 
G
Q
 
D
G
 
G
I
 
V
Q
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
I
 
V
C
 
C
P
 
P
F
 
S
F
 
L
T
 
V
P
 
K
T
 
T
P
 
N
M
 
M
V
 
-
T
 
T
E
 
N
G
 
G
V
 
W
D
 
P
P
 
Q
A
 
E
L
 
I
I
 
R
E
 
D
Q
 
K
L
 
F
T
 
N
R
 
E
A
 
R
V
 
I
P
 
A
M
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
A
A
 
A
D
 
E
P
 
P
N
 
E
E
 
E
V
 
V
V
 
A
S
 
A
A
 
V
M
 
M
L
 
A
H
 
F
M
 
L
V
 
A
N
 
S
P
 
D
D
 
D
N
 
A
G
 
S
F
 
F
M
 
I
T
 
N
G
 
G
Q
 
A
A
 
N
I
 
I
A
 
P
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
A
S
 
T
A
 
A

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
36% identity, 100% coverage: 1:247/248 of query aligns to 4:252/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
M
 
L
Q
 
T
S
 
Q
N
 
R
F
 
L
E
 
A
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
|
A
S
|
S
G
|
G
F
x
I
G
 
G
K
 
L
L
 
A
L
 
T
A
 
G
Q
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
R
P
 
A
Q
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
V
V
 
V
L
 
V
G
 
G
D
|
D
I
|
I
N
 
D
D
 
P
T
 
T
A
 
T
L
 
G
D
 
K
A
 
A
L
 
A
C
 
A
S
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
-
E
 
-
C
 
-
A
 
-
V
 
E
G
 
G
L
 
L
R
 
F
C
 
V
D
 
P
V
|
V
S
x
D
I
x
V
E
 
-
A
 
S
E
 
E
Q
 
Q
L
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
D
Q
 
N
L
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
T
A
 
A
E
 
A
E
 
S
S
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
I
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
S
 
S
A
 
P
P
 
P
M
 
E
K
 
D
S
 
D
L
 
L
L
 
I
A
 
E
T
 
N
T
 
T
E
 
D
-
 
L
A
 
P
D
 
A
M
 
W
D
 
Q
L
 
R
S
 
V
F
 
Q
A
 
D
I
 
I
N
 
N
T
 
L
K
 
K
G
 
S
V
 
V
F
 
Y
F
 
L
G
 
S
M
 
C
K
 
R
A
 
A
Q
 
A
I
 
L
P
 
R
L
 
H
M
 
M
Q
 
V
K
 
P
H
 
A
K
 
G
C
 
K
G
 
G
A
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
V
x
T
A
 
A
S
|
S
M
 
F
A
 
V
G
 
A
I
 
V
N
 
M
G
 
G
-
 
S
A
 
A
P
 
T
K
 
S
L
x
Q
T
 
I
P
 
S
Y
|
Y
V
 
T
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
G
A
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
A
I
 
M
T
 
S
R
 
R
T
 
E
A
 
L
A
 
G
L
 
V
E
 
Q
F
 
Y
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
Q
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
C
 
C
P
|
P
F
 
G
F
x
P
T
x
V
P
 
N
T
 
T
P
 
P
M
 
L
V
 
L
T
 
Q
E
 
E
-
 
L
-
 
F
G
 
A
V
 
K
D
 
D
P
 
P
A
 
E
L
 
R
I
 
A
E
 
A
Q
 
R
L
 
R
T
 
L
R
 
V
A
 
H
V
 
I
P
 
P
M
 
L
R
 
G
R
 
R
L
 
F
A
 
A
D
 
E
P
 
P
N
 
E
E
 
E
V
 
L
V
 
A
S
 
A
A
 
A
M
 
V
L
 
A
H
 
F
M
 
L
V
 
A
N
 
S
P
 
D
D
 
D
N
 
A
G
 
S
F
 
F
M
 
I
T
 
T
G
 
G
Q
 
S
A
 
T
I
 
F
A
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
V
 
I
S
 
S
A
 
S

Query Sequence

>5210422 FitnessBrowser__PV4:5210422
MQSNFEGKVVLITGAASGFGKLLAQRLAPQGAKLVLGDINDTALDALCSELGECAVGLRC
DVSIEAEQLALAQLAEESFGRLDIAINNAGISAPMKSLLATTEADMDLSFAINTKGVFFG
MKAQIPLMQKHKCGAILNVASMAGINGAPKLTPYVAAKHAVVGITRTAALEFAAQGIQVN
AICPFFTPTPMVTEGVDPALIEQLTRAVPMRRLADPNEVVSAMLHMVNPDNGFMTGQAIA
IDGGVSAI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory