SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 5210426 Shew_2867 pyruvate carboxylase, propionyl-CoA carboxylase (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

A0A0H3JRU9 Pyruvate carboxylase; EC 6.4.1.1 from Staphylococcus aureus (strain Mu50 / ATCC 700699) (see 2 papers)
43% identity, 41% coverage: 7:451/1094 of query aligns to 6:451/1150 of A0A0H3JRU9

query
sites
A0A0H3JRU9
R
 
K
I
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
A
 
F
Q
x
R
T
 
A
C
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
G
 
D
I
 
I
D
 
S
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
E
 
N
D
 
E
D
 
D
S
 
K
Q
 
S
S
 
S
L
 
L
H
 
H
T
 
R
K
 
Y
K
 
K
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
S
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
K
 
V
G
 
G
R
 
S
G
 
D
V
 
L
-
 
G
-
 
P
-
 
A
K
 
E
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
I
 
I
E
 
E
Q
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
D
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
Q
H
 
A
G
 
N
C
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
S
 
E
S
 
Q
F
 
F
S
 
A
K
 
R
R
 
R
C
 
C
H
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
C
 
K
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
H
A
 
L
E
 
E
L
 
H
L
 
L
D
 
D
L
 
M
L
 
F
G
 
G
N
 
D
K
|
K
A
 
V
T
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
K
S
 
A
D
 
D
T
 
L
P
 
P
L
 
V
T
 
I
G
 
P
G
 
G
I
 
T
N
 
D
K
 
G
P
 
P
C
 
I
S
 
K
L
 
S
E
 
Y
E
 
E
V
 
L
Q
 
A
A
 
K
F
 
E
F
 
F
T
 
A
S
 
E
L
 
E
G
 
A
D
 
-
G
 
G
A
 
F
A
 
P
V
 
L
M
 
M
I
 
I
K
|
K
A
 
A
L
 
T
A
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
G
 
G
M
 
M
R
 
R
P
 
I
V
 
V
S
 
R
R
 
E
Y
 
E
E
 
S
D
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
D
A
 
A
Y
 
F
R
 
H
Q
 
R
C
 
A
R
 
K
E
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
E
I
 
K
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
N
G
 
S
E
 
E
L
 
V
Y
 
Y
V
 
I
E
 
E
Q
 
R
L
 
Y
V
 
I
Q
 
D
H
 
N
A
 
P
R
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
L
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
T
 
H
G
 
G
A
 
N
A
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
L
W
 
F
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
V
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
P
 
V
S
 
G
L
 
L
D
 
S
D
 
P
A
 
T
T
 
L
R
 
R
M
 
Q
P
 
R
I
 
I
I
 
C
E
 
D
S
 
A
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
L
 
L
A
 
M
S
 
E
D
 
N
V
 
I
K
 
K
Y
 
Y
Q
 
V
G
 
N
L
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
V
E
|
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
A
 
G
D
 
D
D
 
E
H
 
-
S
 
-
K
 
-
F
 
F
Y
 
F
F
 
F
M
 
I
E
 
E
I
 
V
N
 
N
P
 
P
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
I
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
N
 
D
L
 
I
V
 
V
K
 
K
L
 
T
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
L
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
A
T
 
D
L
 
L
-
 
F
-
 
G
A
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
N
L
 
M
T
 
P
E
 
Q
A
 
Q
P
 
K
-
 
D
-
 
I
I
 
T
K
 
T
R
 
L
G
 
G
C
 
Y
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
I
N
 
T
L
 
T
E
 
E
Q
 
D
M
 
P
L
 
L
P
 
N
D
 
D
G
 
-
S
 
-
T
 
F
K
 
M
P
 
P
A
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
T
I
 
I
K
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
V
 
S
P
 
S
N
 
G
G
 
G
H
 
F
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
L
D
 
D
-
 
A
D
 
G
Y
 
D
L
 
G
Y
 
F
A
 
Q
G
 
G
Y
 
A
K
 
E
V
 
I
S
 
S
P
 
P
S
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
V
K
 
K
I
 
L
I
 
S
A
 
T
K
 
H
G
 
A
E
 
I
D
 
S
F
 
F
S
 
K
A
 
Q
A
 
A
L
 
E
N
 
E
K
|
K
V
 
M
Y
 
V
L
 
R
S
 
S
L
 
L
K
 
R
A
 
E
L
 
M
N
 
R
I
 
I
D
 
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
I
A
 
P
L
 
F
L
 
L
M
 
I
N
 
N
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
R
 
N
E
 
K
E
 
K
V
 
F
Q
 
T
H
 
S
N
 
G
R
 
D
L
 
Y
S
 
T
T
 
T
R
 
K
F
 
F
V
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q05920 Pyruvate carboxylase, mitochondrial; Pyruvic carboxylase; PCB; EC 6.4.1.1 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
43% identity, 41% coverage: 6:451/1094 of query aligns to 38:482/1178 of Q05920

query
sites
Q05920
N
 
K
R
x
K
I
 
V
L
 
M
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
V
A
 
F
Q
 
R
T
 
A
C
 
C
A
 
T
D
 
E
M
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
R
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
S
E
 
E
D
 
Q
D
 
D
S
 
T
Q
 
G
S
 
Q
L
 
M
H
 
H
T
 
R
K
 
Q
K
|
K
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
A
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
K
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
P
V
 
V
K
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
H
I
 
I
E
 
P
Q
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
E
H
 
N
G
 
G
C
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
R
S
 
A
S
 
D
F
 
F
S
 
A
K
 
Q
R
 
A
C
 
C
H
 
Q
E
 
D
E
 
A
G
 
G
I
 
V
C
 
R
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
S
A
 
P
E
 
E
L
 
V
L
 
V
D
 
R
L
x
K
L
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
A
 
V
T
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
I
R
 
A
S
 
A
D
 
G
T
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
V
G
 
P
G
 
G
I
 
T
N
 
D
K
 
S
P
 
P
-
 
I
C
 
S
S
 
S
L
 
L
E
 
H
E
 
E
V
 
A
Q
 
H
A
 
E
F
 
F
F
 
S
T
 
N
S
 
T
L
 
F
G
 
G
D
 
-
G
 
-
A
 
F
A
 
P
V
 
I
M
 
I
I
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
R
P
 
V
V
 
V
S
 
H
R
 
S
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
N
Y
 
Y
R
 
T
Q
 
R
C
 
A
R
 
Y
E
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
L
I
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
N
G
 
G
E
 
A
L
 
L
Y
 
F
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
L
 
F
V
 
I
Q
 
E
H
x
K
A
 
P
R
 
R
H
 
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
Q
T
 
Y
G
 
G
A
 
N
A
 
I
V
 
L
H
 
H
A
 
L
W
 
Y
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
I
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
T
S
 
H
L
 
L
D
 
D
D
 
P
A
 
Q
T
 
L
R
 
R
M
 
S
P
 
R
I
 
L
I
 
T
E
 
S
S
 
D
A
 
S
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
K
D
 
Q
V
 
V
K
 
G
Y
 
Y
Q
 
E
G
 
N
L
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
-
A
 
-
D
 
D
D
 
K
H
 
H
S
 
G
K
 
K
F
 
H
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
 
E
I
 
V
N
 
N
P
 
S
R
 
R
I
 
L
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
D
L
 
V
N
 
D
L
 
L
V
 
V
K
 
H
L
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
H
L
 
V
G
 
S
A
 
E
G
 
G
K
 
R
T
 
S
L
 
L
A
 
P
E
 
D
L
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
R
E
 
Q
A
 
E
P
 
N
I
 
I
K
 
R
-
 
I
R
 
N
G
 
G
C
 
C
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
V
N
 
T
L
 
T
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
A
G
 
R
S
 
S
T
 
F
K
 
Q
P
 
P
A
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
R
I
 
I
K
 
E
A
 
V
Y
 
F
Q
 
R
V
 
S
P
 
G
N
 
E
G
 
G
H
 
M
N
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
D
 
N
-
 
A
Y
 
S
L
 
A
Y
 
F
A
 
Q
G
 
G
Y
 
A
K
 
V
V
 
I
S
 
S
P
 
P
S
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
I
A
 
A
K
 
H
G
 
G
E
x
K
D
 
D
F
 
H
S
 
P
A
 
T
A
 
A
L
 
A
N
 
T
K
 
K
V
 
M
Y
 
S
L
 
R
S
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
E
L
 
F
N
 
R
I
 
V
D
 
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
I
A
 
P
L
 
F
L
 
L
M
 
Q
N
 
N
L
 
V
L
 
L
Q
 
N
R
 
N
E
 
Q
E
 
Q
V
 
F
Q
 
L
H
 
A
N
 
G
R
 
T
L
 
V
S
 
D
T
 
T
R
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
D

Sites not aligning to the query:

P11498 Pyruvate carboxylase, mitochondrial; Pyruvic carboxylase; PCB; EC 6.4.1.1 from Homo sapiens (Human) (see 6 papers)
43% identity, 41% coverage: 6:451/1094 of query aligns to 38:482/1178 of P11498

query
sites
P11498
N
 
K
R
 
K
I
 
V
L
 
M
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
V
A
 
F
Q
 
R
T
 
A
C
 
C
A
 
T
D
 
E
M
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
R
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
E
 
E
D
 
Q
D
 
D
S
 
T
Q
 
G
S
 
Q
L
 
M
H
 
H
T
 
R
K
 
Q
K
 
K
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
A
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
K
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
P
V
 
V
K
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
H
I
 
I
E
 
P
Q
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
E
H
 
N
G
 
N
C
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
R
S
 
A
S
 
D
F
 
F
S
 
A
K
 
Q
R
 
A
C
 
C
H
 
Q
E
 
D
E
 
A
G
 
G
I
 
V
C
 
R
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
S
A
 
P
E
 
E
L
x
V
L
 
V
D
 
R
L
 
K
L
 
M
G
 
G
N
 
D
K
 
K
A
 
V
T
 
E
A
 
A
R
|
R
E
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
I
R
 
A
S
 
A
D
 
G
T
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
V
G
 
P
G
 
G
I
 
T
N
 
D
K
 
A
P
 
P
-
 
I
C
 
T
S
 
S
L
 
L
E
 
H
E
 
E
V
 
A
Q
 
H
A
 
E
F
 
F
F
 
S
T
 
N
S
 
T
L
 
Y
G
 
G
D
 
-
G
 
-
A
 
F
A
 
P
V
 
I
M
 
I
I
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
R
P
 
V
V
 
V
S
 
H
R
 
S
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
N
Y
 
Y
R
 
T
Q
 
R
C
 
A
R
 
Y
E
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
L
I
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
N
G
 
G
E
 
A
L
 
L
Y
 
F
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
L
 
F
V
 
I
Q
 
E
H
 
K
A
 
P
R
 
R
H
 
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
Q
T
 
Y
G
 
G
A
 
N
A
 
I
V
 
L
H
 
H
A
 
L
W
 
Y
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
I
Q
 
Q
R
 
R
R
|
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
A
S
 
H
L
 
L
D
 
D
D
 
P
A
 
Q
T
 
L
R
 
R
M
 
T
P
 
R
I
 
L
I
 
T
E
 
S
S
 
D
A
 
S
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
K
D
 
Q
V
 
V
K
 
G
Y
|
Y
Q
 
E
G
 
N
L
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
-
A
 
-
D
 
D
D
 
R
H
 
H
S
 
G
K
 
K
F
 
H
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
 
E
I
 
V
N
 
N
P
 
S
R
 
R
I
 
L
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
D
L
 
V
N
 
D
L
 
L
V
 
V
K
 
H
L
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
H
L
 
V
G
 
A
A
 
E
G
 
G
K
 
R
T
 
S
L
 
L
A
 
P
E
 
D
L
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
R
E
 
Q
A
 
E
P
 
N
I
 
I
K
 
R
-
 
I
R
 
N
G
 
G
C
 
C
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
V
N
 
T
L
 
T
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
A
G
 
R
S
 
S
T
 
F
K
 
Q
P
 
P
A
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
R
I
 
I
K
 
E
A
 
V
Y
 
F
Q
 
R
V
 
S
P
 
G
N
 
E
G
 
G
H
 
M
N
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
D
 
N
-
 
A
Y
 
S
L
 
A
Y
 
F
A
 
Q
G
 
G
Y
 
A
K
 
V
V
 
I
S
 
S
P
 
P
S
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
I
A
 
A
K
 
H
G
 
G
E
 
K
D
 
D
F
 
H
S
 
P
A
 
T
A
 
A
L
 
A
N
 
T
K
 
K
V
 
M
Y
 
S
L
 
R
S
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
E
L
 
F
N
x
R
I
 
V
D
 
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
I
A
 
A
L
 
F
L
 
L
M
 
Q
N
 
N
L
 
V
L
 
L
Q
 
N
R
 
N
E
 
Q
E
 
Q
V
 
F
Q
 
L
H
 
A
N
 
G
R
 
T
L
 
V
S
 
D
T
 
T
R
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
D

Sites not aligning to the query:

7wtdC Cryo-em structure of human pyruvate carboxylase with acetyl-coa in the intermediate state 1 (see paper)
43% identity, 41% coverage: 6:451/1094 of query aligns to 6:450/1146 of 7wtdC

query
sites
7wtdC
N
 
K
R
 
K
I
 
V
L
 
M
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
V
A
x
F
Q
x
R
T
 
A
C
 
C
A
x
T
D
 
E
M
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
R
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
E
 
E
D
 
Q
D
 
D
S
 
T
Q
 
G
S
 
Q
L
 
M
H
 
H
T
x
R
K
x
Q
K
|
K
A
|
A
D
|
D
Q
x
E
A
 
A
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
K
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
P
V
 
V
K
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
H
I
 
I
E
 
P
Q
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
E
H
 
N
G
 
N
C
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
R
S
 
A
S
 
D
F
 
F
S
 
A
K
 
Q
R
 
A
C
 
C
H
 
Q
E
 
D
E
 
A
G
 
G
I
 
V
C
 
R
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
S
A
 
P
E
 
E
L
 
V
L
 
V
D
 
R
L
 
K
L
 
M
G
 
G
N
 
D
K
 
K
A
 
V
T
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
I
R
 
A
S
 
A
D
 
G
T
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
V
G
 
P
G
 
G
I
 
T
N
 
D
K
 
A
P
 
P
-
 
I
C
 
T
S
 
S
L
 
L
E
 
H
E
 
E
V
 
A
Q
 
H
A
 
E
F
 
F
F
 
S
T
 
N
S
 
T
L
 
Y
G
 
G
D
 
-
G
 
-
A
 
F
A
 
P
V
 
I
M
 
I
I
 
F
K
|
K
A
 
A
L
 
A
A
 
Y
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
R
P
 
V
V
 
V
S
 
H
R
 
S
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
N
Y
 
Y
R
 
T
Q
 
R
C
 
A
R
 
Y
E
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
L
I
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
N
G
 
G
E
 
A
L
 
L
Y
 
F
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
L
x
F
V
 
I
Q
 
E
H
 
K
A
 
P
R
 
R
H
 
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
Q
T
 
Y
G
 
G
A
 
N
A
 
I
V
 
L
H
 
H
A
 
L
W
 
Y
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
I
Q
|
Q
R
 
R
R
 
R
N
x
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
A
S
 
H
L
 
L
D
 
D
D
 
P
A
 
Q
T
 
L
R
 
R
M
 
T
P
 
R
I
 
L
I
 
T
E
 
S
S
 
D
A
 
S
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
K
D
 
Q
V
 
V
K
 
G
Y
 
Y
Q
 
E
G
 
N
L
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
-
A
 
-
D
 
D
D
 
R
H
 
H
S
 
G
K
 
K
F
 
H
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
I
 
V
N
 
N
P
 
S
R
 
R
I
 
L
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
D
L
 
V
N
 
D
L
 
L
V
 
V
K
 
H
L
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
H
L
 
V
G
 
A
A
 
E
G
 
G
K
 
R
T
 
S
L
 
L
A
 
P
E
 
D
L
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
R
E
 
Q
A
 
E
P
 
N
I
 
I
K
 
R
-
 
I
R
 
N
G
 
G
C
 
C
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
V
N
 
T
L
 
T
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
A
G
 
R
S
 
S
T
 
F
K
 
Q
P
 
P
A
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
R
I
 
I
K
 
E
A
 
V
Y
 
F
Q
x
R
V
 
S
P
 
G
N
 
E
G
 
G
H
 
M
N
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
D
 
N
-
 
A
Y
 
S
L
 
A
Y
 
F
A
 
Q
G
 
G
Y
 
A
K
 
V
V
 
I
S
 
S
P
 
P
S
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
I
A
 
A
K
 
H
G
 
G
E
 
K
D
 
D
F
 
H
S
 
P
A
 
T
A
 
A
L
 
A
N
 
T
K
 
K
V
 
M
Y
 
S
L
x
R
S
 
A
L
 
L
K
x
A
A
 
E
L
 
F
N
x
R
I
 
V
D
 
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
I
A
 
A
L
 
F
L
 
L
M
 
Q
N
 
N
L
 
V
L
 
L
Q
 
N
R
 
N
E
 
Q
E
 
Q
V
 
F
Q
 
L
H
 
A
N
 
G
R
 
T
L
 
V
S
 
D
T
 
T
R
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
D

Sites not aligning to the query:

7wtbB Cryo-em structure of human pyruvate carboxylase with acetyl-coa (see paper)
43% identity, 41% coverage: 6:451/1094 of query aligns to 7:451/1147 of 7wtbB

query
sites
7wtbB
N
 
K
R
 
K
I
 
V
L
 
M
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
V
A
x
F
Q
 
R
T
 
A
C
 
C
A
x
T
D
 
E
M
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
R
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
E
 
E
D
 
Q
D
 
D
S
 
T
Q
 
G
S
 
Q
L
 
M
H
 
H
T
x
R
K
x
Q
K
|
K
A
|
A
D
|
D
Q
 
E
A
 
A
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
K
 
I
G
 
G
R
 
R
G
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
P
V
 
V
K
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
H
I
 
I
E
 
P
Q
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
K
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
E
H
 
N
G
 
N
C
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
V
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
R
S
 
A
S
 
D
F
 
F
S
 
A
K
 
Q
R
 
A
C
 
C
H
 
Q
E
 
D
E
 
A
G
 
G
I
 
V
C
 
R
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
S
A
 
P
E
 
E
L
 
V
L
 
V
D
 
R
L
 
K
L
 
M
G
 
G
N
 
D
K
 
K
A
 
V
T
 
E
A
 
A
R
 
R
E
 
A
T
 
I
A
 
A
L
 
I
R
 
A
S
 
A
D
 
G
T
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
V
G
 
P
G
 
G
I
 
T
N
 
D
K
 
A
P
 
P
-
 
I
C
 
T
S
 
S
L
 
L
E
 
H
E
 
E
V
 
A
Q
 
H
A
 
E
F
 
F
F
 
S
T
 
N
S
 
T
L
 
Y
G
 
G
D
 
-
G
 
-
A
 
F
A
 
P
V
 
I
M
 
I
I
 
F
K
|
K
A
 
A
L
 
A
A
 
Y
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
|
M
R
 
R
P
 
V
V
 
V
S
 
H
R
 
S
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
E
A
 
N
Y
 
Y
R
 
T
Q
 
R
C
 
A
R
 
Y
E
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
L
I
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
N
G
 
G
E
 
A
L
 
L
Y
 
F
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
L
x
F
V
x
I
Q
 
E
H
 
K
A
x
P
R
 
R
H
 
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
Q
T
 
Y
G
 
G
A
 
N
A
 
I
V
 
L
H
 
H
A
 
L
W
 
Y
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
I
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
N
x
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
A
S
 
H
L
 
L
D
 
D
D
 
P
A
 
Q
T
 
L
R
 
R
M
 
T
P
 
R
I
 
L
I
 
T
E
 
S
S
 
D
A
 
S
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
K
D
 
Q
V
 
V
K
 
G
Y
 
Y
Q
 
E
G
 
N
L
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
-
A
 
-
D
 
D
D
 
R
H
 
H
S
 
G
K
 
K
F
 
H
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
 
E
I
 
V
N
 
N
P
 
S
R
 
R
I
 
L
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
D
L
 
V
N
 
D
L
 
L
V
 
V
K
 
H
L
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
H
L
 
V
G
 
A
A
 
E
G
 
G
K
 
R
T
 
S
L
 
L
A
 
P
E
 
D
L
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
R
E
 
Q
A
 
E
P
 
N
I
 
I
K
 
R
-
 
I
R
 
N
G
 
G
C
 
C
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
V
N
 
T
L
 
T
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
A
G
 
R
S
 
S
T
 
F
K
 
Q
P
 
P
A
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
R
I
 
I
K
 
E
A
 
V
Y
 
F
Q
x
R
V
 
S
P
 
G
N
 
E
G
 
G
H
 
M
N
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
D
 
N
-
 
A
Y
 
S
L
 
A
Y
 
F
A
 
Q
G
 
G
Y
 
A
K
 
V
V
 
I
S
 
S
P
 
P
S
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
I
A
 
A
K
 
H
G
 
G
E
 
K
D
 
D
F
 
H
S
 
P
A
 
T
A
 
A
L
 
A
N
 
T
K
 
K
V
 
M
Y
 
S
L
x
R
S
 
A
L
 
L
K
 
A
A
x
E
L
 
F
N
x
R
I
 
V
D
x
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
I
A
 
A
L
 
F
L
 
L
M
 
Q
N
 
N
L
 
V
L
 
L
Q
 
N
R
 
N
E
 
Q
E
 
Q
V
 
F
Q
 
L
H
 
A
N
 
G
R
 
T
L
 
V
S
 
D
T
 
T
R
 
Q
F
 
F
V
 
I
E
 
D

Sites not aligning to the query:

7zz3A Cryo-em structure of "bc react" conformation of lactococcus lactis pyruvate carboxylase with acetyl-coa (see paper)
42% identity, 41% coverage: 7:451/1094 of query aligns to 4:447/1138 of 7zz3A

query
sites
7zz3A
R
 
K
I
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
F
Q
 
R
T
 
A
C
 
C
A
x
N
D
 
E
M
 
L
G
 
G
I
 
L
D
 
S
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
E
 
R
D
 
E
D
 
D
S
 
E
Q
 
Y
S
 
S
L
 
V
H
 
H
T
 
R
K
x
F
K
|
K
A
|
A
D
|
D
Q
 
E
A
x
S
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
K
 
I
G
 
G
R
 
Q
G
 
G
V
 
K
K
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
D
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
I
E
 
D
Q
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
R
V
 
V
A
 
A
K
 
L
A
 
E
H
 
S
G
 
G
C
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
|
G
F
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
S
 
L
S
 
E
F
 
F
S
 
A
K
 
T
R
 
K
C
 
V
H
 
R
E
 
A
E
 
A
G
 
G
I
 
L
C
 
V
F
 
F
I
 
V
G
 
G
S
 
P
S
 
E
A
 
L
E
 
H
L
 
H
L
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
F
G
 
G
N
 
D
K
|
K
A
 
I
T
 
K
A
 
A
R
 
K
E
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
D
R
 
E
S
 
A
D
 
K
T
 
V
P
 
P
L
 
G
T
 
I
G
 
P
G
 
G
I
 
T
N
 
N
K
 
G
P
 
A
C
 
V
S
 
D
L
 
I
E
 
D
E
 
G
V
 
A
Q
 
L
A
 
E
F
 
F
F
 
A
T
 
K
S
 
T
L
 
Y
G
 
G
D
 
-
G
 
-
A
 
Y
A
 
P
V
 
V
M
|
M
I
 
I
K
|
K
A
 
A
L
 
A
A
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
R
 
R
G
 
G
M
|
M
R
 
R
P
 
V
V
 
A
S
 
R
R
 
N
Y
 
D
E
 
A
D
 
E
L
 
M
A
 
H
E
 
D
A
 
G
Y
 
Y
R
 
A
Q
 
R
C
 
A
R
 
K
E
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
G
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
Y
 
Y
V
 
V
E
|
E
Q
 
K
L
x
Y
V
x
I
Q
 
E
H
 
N
A
 
P
R
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
R
T
 
H
G
 
G
A
 
N
A
 
I
V
 
I
H
 
H
A
 
L
W
 
H
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
 
R
N
|
N
Q
 
Q
K
|
K
L
 
V
L
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
V
S
 
G
L
 
L
D
 
S
D
 
P
A
 
D
T
 
F
R
 
R
M
 
N
P
 
E
I
 
I
I
 
C
E
 
E
S
 
A
A
 
A
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
A
 
C
S
 
K
D
 
N
V
 
V
K
 
G
Y
 
Y
Q
 
V
G
 
N
L
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
V
E
|
E
F
 
F
L
|
L
L
 
V
D
 
K
A
 
D
D
 
D
D
 
-
H
 
-
S
 
-
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
I
 
V
N
|
N
P
 
P
R
|
R
I
 
V
Q
|
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
I
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
V
N
 
D
L
 
I
V
 
V
K
 
Q
L
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
D
L
 
L
-
 
H
A
 
R
E
 
E
L
 
I
S
 
G
L
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
Q
T
 
S
E
 
E
A
 
I
P
 
P
I
 
L
K
 
-
R
 
L
G
 
G
C
 
S
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
T
L
 
T
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
Q
G
 
N
S
 
G
T
 
F
K
 
L
P
 
P
A
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
K
I
 
I
K
 
D
A
 
T
Y
 
Y
Q
x
R
V
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
H
 
F
N
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
-
 
V
D
 
G
Y
 
N
L
 
A
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
K
 
E
V
 
V
S
 
T
P
 
P
S
 
Y
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
C
A
 
T
K
 
F
G
 
A
E
 
N
D
 
E
F
 
F
S
 
S
A
 
D
A
 
S
L
 
V
N
 
R
K
 
K
V
 
M
Y
 
D
L
 
R
S
 
V
L
 
L
K
x
H
A
x
E
L
 
F
N
x
R
I
 
I
D
x
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
I
A
 
P
L
 
F
L
 
L
M
 
I
N
 
N
L
 
V
L
 
I
Q
 
A
R
 
N
E
 
E
E
 
N
V
 
F
Q
 
T
H
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
A
S
 
T
T
|
T
R
 
T
F
 
F
V
 
I
E
 
D

Sites not aligning to the query:

5vyzA Crystal structure of lactococcus lactis pyruvate carboxylase in complex with cyclic-di-amp (see paper)
42% identity, 41% coverage: 7:451/1094 of query aligns to 10:453/1144 of 5vyzA

query
sites
5vyzA
R
 
K
I
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
F
Q
 
R
T
 
A
C
 
C
A
 
N
D
 
E
M
 
L
G
 
G
I
 
L
D
 
S
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
E
 
R
D
 
E
D
 
D
S
 
E
Q
 
Y
S
 
S
L
 
V
H
 
H
T
 
R
K
 
F
K
 
K
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
S
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
K
 
I
G
 
G
R
 
Q
G
 
G
V
 
K
K
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
D
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
I
E
 
D
Q
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
R
V
 
V
A
 
A
K
 
L
A
 
E
H
 
S
G
 
G
C
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
S
 
L
S
 
E
F
 
F
S
 
A
K
 
T
R
 
K
C
 
V
H
 
R
E
 
A
E
 
A
G
 
G
I
 
L
C
 
V
F
 
F
I
 
V
G
 
G
S
 
P
S
 
E
A
 
L
E
 
H
L
 
H
L
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
F
G
 
G
N
 
D
K
|
K
A
 
I
T
 
K
A
 
A
R
 
K
E
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
D
R
 
E
S
 
A
D
 
K
T
 
V
P
 
P
L
 
G
T
 
I
G
 
P
G
 
G
I
 
T
N
 
N
K
 
G
P
 
A
C
 
V
S
 
D
L
 
I
E
 
D
E
 
G
V
 
A
Q
 
L
A
 
E
F
 
F
F
 
A
T
 
K
S
 
T
L
 
Y
G
 
G
D
 
-
G
 
-
A
 
Y
A
 
P
V
 
V
M
|
M
I
 
I
K
|
K
A
 
A
L
 
A
A
 
L
G
|
G
G
 
G
G
|
G
G
|
G
R
 
R
G
 
G
M
|
M
R
 
R
P
 
V
V
 
A
S
 
R
R
 
N
Y
 
D
E
 
A
D
 
E
L
 
M
A
 
H
E
 
D
A
 
G
Y
 
Y
R
 
A
Q
 
R
C
 
A
R
 
K
E
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
G
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
Y
 
Y
V
 
V
E
 
E
Q
 
K
L
x
Y
V
x
I
Q
 
E
H
 
N
A
 
P
R
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
R
T
 
H
G
 
G
A
 
N
A
 
I
V
 
I
H
 
H
A
 
L
W
 
H
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
 
R
N
|
N
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
V
S
 
G
L
 
L
D
 
S
D
 
P
A
 
D
T
 
F
R
 
R
M
 
N
P
 
E
I
 
I
I
 
C
E
 
E
S
 
A
A
 
A
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
A
 
C
S
 
K
D
 
N
V
 
V
K
 
G
Y
 
Y
Q
 
V
G
 
N
L
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
V
E
|
E
F
 
F
L
|
L
L
 
V
D
 
K
A
 
D
D
 
D
D
 
-
H
 
-
S
 
-
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
I
 
V
N
 
N
P
 
P
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
I
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
V
N
 
D
L
 
I
V
 
V
K
 
Q
L
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
D
L
 
L
-
 
H
A
 
R
E
 
E
L
 
I
S
 
G
L
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
Q
T
 
S
E
 
E
A
 
I
P
 
P
I
 
L
K
 
-
R
 
L
G
 
G
C
 
S
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
I
N
 
T
L
 
T
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
Q
G
 
N
S
 
G
T
 
F
K
 
L
P
 
P
A
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
K
I
 
I
K
 
D
A
 
T
Y
 
Y
Q
 
R
V
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
H
 
F
N
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
-
 
V
D
 
G
Y
 
N
L
 
A
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
K
 
E
V
 
V
S
 
T
P
 
P
S
 
Y
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
C
A
 
T
K
 
F
G
 
A
E
 
N
D
 
E
F
 
F
S
 
S
A
 
D
A
 
S
L
 
V
N
 
R
K
 
K
V
 
M
Y
 
D
L
 
R
S
 
V
L
 
L
K
 
H
A
 
E
L
 
F
N
 
R
I
 
I
D
 
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
I
A
 
P
L
 
F
L
 
L
M
 
I
N
 
N
L
 
V
L
 
I
Q
 
A
R
 
N
E
 
E
E
 
N
V
 
F
Q
 
T
H
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
A
S
 
T
T
|
T
R
 
T
F
 
F
V
 
I
E
 
D

Sites not aligning to the query:

7zyyA Cryo-em structure of lactococcus lactis pyruvate carboxylase with acetyl-coa (see paper)
42% identity, 41% coverage: 7:451/1094 of query aligns to 4:447/1056 of 7zyyA

query
sites
7zyyA
R
 
K
I
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
F
Q
x
R
T
 
A
C
 
C
A
x
N
D
 
E
M
 
L
G
 
G
I
 
L
D
 
S
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
A
E
 
R
D
 
E
D
 
D
S
 
E
Q
 
Y
S
 
S
L
 
V
H
 
H
T
 
R
K
x
F
K
|
K
A
|
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
S
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
K
 
I
G
 
G
R
 
Q
G
 
G
V
 
K
K
 
K
-
 
P
-
 
I
-
 
D
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
I
E
 
D
Q
 
D
L
 
I
I
 
I
A
 
R
V
 
V
A
 
A
K
 
L
A
 
E
H
 
S
G
 
G
C
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
S
 
L
S
 
E
F
 
F
S
 
A
K
 
T
R
 
K
C
 
V
H
 
R
E
 
A
E
 
A
G
 
G
I
 
L
C
 
V
F
 
F
I
 
V
G
 
G
S
 
P
S
 
E
A
 
L
E
 
H
L
 
H
L
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
F
G
 
G
N
 
D
K
 
K
A
 
I
T
 
K
A
 
A
R
 
K
E
 
A
T
 
A
A
 
A
L
 
D
R
 
E
S
 
A
D
 
K
T
 
V
P
 
P
L
 
G
T
 
I
G
 
P
G
 
G
I
 
T
N
 
N
K
 
G
P
 
A
C
 
V
S
 
D
L
 
I
E
 
D
E
 
G
V
 
A
Q
 
L
A
 
E
F
 
F
F
 
A
T
 
K
S
 
T
L
 
Y
G
 
G
D
 
-
G
 
-
A
 
Y
A
 
P
V
 
V
M
 
M
I
 
I
K
|
K
A
 
A
L
 
A
A
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
|
M
R
 
R
P
 
V
V
 
A
S
 
R
R
 
N
Y
 
D
E
 
A
D
 
E
L
 
M
A
 
H
E
 
D
A
 
G
Y
 
Y
R
 
A
Q
 
R
C
 
A
R
 
K
E
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
I
I
 
G
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
Y
 
Y
V
 
V
E
|
E
Q
x
K
L
x
Y
V
x
I
Q
 
E
H
 
N
A
 
P
R
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
R
T
 
H
G
 
G
A
 
N
A
 
I
V
 
I
H
 
H
A
 
L
W
 
H
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
 
R
N
|
N
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
I
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
V
S
 
G
L
 
L
D
 
S
D
 
P
A
 
D
T
 
F
R
 
R
M
 
N
P
 
E
I
 
I
I
 
C
E
 
E
S
 
A
A
 
A
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
A
 
C
S
 
K
D
 
N
V
 
V
K
 
G
Y
 
Y
Q
 
V
G
 
N
L
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
V
E
|
E
F
 
F
L
|
L
L
 
V
D
 
K
A
 
D
D
 
D
D
 
-
H
 
-
S
 
-
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
I
 
V
N
 
N
P
 
P
R
|
R
I
 
V
Q
|
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
I
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
V
N
 
D
L
 
I
V
 
V
K
 
Q
L
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
L
 
I
G
 
A
A
 
Q
G
 
G
K
 
K
T
 
D
L
 
L
-
 
H
A
 
R
E
 
E
L
 
I
S
 
G
L
 
L
-
 
P
-
 
A
-
 
Q
T
 
S
E
 
E
A
 
I
P
 
P
I
 
L
K
 
-
R
 
L
G
 
G
C
 
S
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
I
N
 
T
L
 
T
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
Q
G
 
N
S
 
G
T
 
F
K
 
L
P
 
P
A
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
K
I
 
I
K
 
D
A
 
T
Y
 
Y
Q
x
R
V
 
S
P
 
P
N
 
G
G
 
G
H
 
F
N
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
-
 
V
D
 
G
Y
 
N
L
 
A
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
K
 
E
V
 
V
S
 
T
P
 
P
S
 
Y
Y
 
F
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
C
A
 
T
K
 
F
G
 
A
E
 
N
D
 
E
F
 
F
S
 
S
A
 
D
A
 
S
L
 
V
N
 
R
K
 
K
V
 
M
Y
 
D
L
 
R
S
 
V
L
 
L
K
 
H
A
x
E
L
 
F
N
x
R
I
 
I
D
x
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
I
A
 
P
L
 
F
L
 
L
M
 
I
N
 
N
L
 
V
L
 
I
Q
 
A
R
 
N
E
 
E
E
 
N
V
 
F
Q
 
T
H
 
S
N
 
G
R
 
Q
L
 
A
S
 
T
T
|
T
R
 
T
F
 
F
V
 
I
E
 
D

Sites not aligning to the query:

3bg5A Crystal structure of staphylococcus aureus pyruvate carboxylase (see paper)
41% identity, 41% coverage: 7:451/1094 of query aligns to 4:442/1137 of 3bg5A

query
sites
3bg5A
R
 
K
I
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
A
 
F
Q
 
R
T
 
A
C
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
G
 
D
I
 
I
D
 
S
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
E
 
N
D
 
E
D
 
D
S
 
K
Q
 
S
S
 
S
L
 
L
H
 
H
T
 
R
K
 
Y
K
 
K
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
S
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
K
 
V
G
 
G
R
 
S
G
 
D
V
 
L
-
 
G
-
 
P
-
 
A
K
 
E
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
I
 
I
E
 
E
Q
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
D
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
Q
H
 
A
G
 
N
C
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
S
 
E
S
 
Q
F
 
F
S
 
A
K
 
R
R
 
R
C
 
C
H
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
C
 
K
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
H
A
 
L
E
 
E
L
 
H
L
 
L
D
 
D
L
 
M
L
 
F
G
 
G
N
 
D
K
|
K
A
 
V
T
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
K
S
 
A
D
 
D
T
 
L
P
 
P
L
 
V
T
 
I
G
 
P
G
 
G
I
 
T
N
 
D
K
 
G
P
 
P
C
 
I
S
 
K
L
 
S
E
 
Y
E
 
E
V
 
L
Q
 
A
A
 
K
F
 
E
F
 
F
T
 
A
S
 
E
L
 
E
G
 
A
D
 
-
G
 
G
A
 
F
A
 
P
V
 
L
M
|
M
I
 
I
K
|
K
A
 
A
L
 
T
A
 
S
G
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
R
 
R
P
 
I
V
 
V
S
 
R
R
 
E
Y
 
E
E
 
S
D
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
D
A
 
A
Y
 
F
R
 
H
Q
 
R
C
 
A
R
 
K
E
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
E
I
 
K
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
N
G
x
S
E
 
E
L
 
V
Y
 
Y
V
 
I
E
 
E
Q
 
R
L
x
Y
V
x
I
Q
 
D
H
 
N
A
 
P
R
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
L
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
T
 
H
G
 
G
A
 
N
A
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
L
W
 
F
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
P
 
V
S
 
G
L
 
L
D
 
S
D
 
P
A
 
T
T
 
L
R
 
R
M
 
Q
P
 
R
I
 
I
I
 
C
E
 
D
S
 
A
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
L
 
L
A
 
M
S
 
E
D
 
N
V
 
I
K
 
K
Y
 
Y
Q
 
V
G
 
N
L
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
V
E
|
E
F
 
F
L
|
L
L
 
V
D
 
S
A
 
G
D
 
D
D
 
E
H
 
-
S
 
-
K
 
-
F
 
F
Y
 
F
F
 
F
M
 
I
E
|
E
I
 
V
N
|
N
P
 
P
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
I
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
N
 
D
L
 
I
V
 
V
K
 
K
L
 
T
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
L
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
A
T
 
D
L
 
L
-
 
F
-
 
G
A
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
N
L
 
M
T
 
P
E
 
Q
A
 
Q
P
 
K
-
 
D
-
 
I
I
 
T
K
 
T
R
 
L
G
 
G
C
 
Y
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
T
L
 
T
E
 
E
Q
 
D
M
 
P
L
 
L
P
 
N
D
 
D
G
 
-
S
 
-
T
 
F
K
 
M
P
 
P
A
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
T
I
 
I
K
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
V
 
S
P
 
S
N
 
G
G
 
G
H
 
F
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
L
D
 
D
-
 
A
D
 
G
Y
 
D
L
 
G
Y
 
F
A
 
Q
G
 
G
Y
 
A
K
 
E
V
 
I
S
 
S
P
 
P
S
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
V
K
 
K
I
 
L
I
 
S
A
 
T
K
 
H
G
 
A
E
 
I
D
 
S
F
 
F
S
 
K
A
 
Q
A
 
A
L
 
E
N
 
E
K
 
K
V
 
M
Y
 
V
L
 
R
S
 
S
L
 
L
K
 
R
A
 
E
L
 
M
N
 
R
I
 
I
D
 
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
I
A
 
P
L
 
F
L
 
L
M
 
I
N
 
N
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
R
 
N
E
 
K
E
 
K
V
 
F
Q
 
T
H
 
S
N
 
G
R
 
D
L
 
Y
S
 
T
T
 
T
R
 
K
F
 
F
V
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3hb9A Crystal structure of s. Aureus pyruvate carboxylase a610t mutant (see paper)
41% identity, 41% coverage: 7:451/1094 of query aligns to 4:438/1133 of 3hb9A

query
sites
3hb9A
R
 
K
I
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
A
 
F
Q
 
R
T
 
A
C
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
G
 
D
I
 
I
D
 
S
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
E
 
N
D
 
E
D
 
D
S
 
K
Q
 
S
S
 
S
L
 
L
H
 
H
T
 
R
K
 
Y
K
 
K
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
S
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
K
 
V
G
 
G
R
 
S
G
 
D
V
 
L
-
 
G
-
 
P
-
 
A
K
 
E
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
I
 
I
E
 
E
Q
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
D
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
Q
H
 
A
G
 
N
C
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
S
 
E
S
 
Q
F
 
F
S
 
A
K
 
R
R
 
R
C
 
C
H
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
C
 
K
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
H
A
 
L
E
 
E
L
 
H
L
 
L
D
 
D
L
 
M
L
 
F
G
 
G
N
 
D
K
|
K
A
 
V
T
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
K
S
 
A
D
 
D
T
 
L
P
 
P
L
 
V
T
 
I
G
 
P
G
 
G
I
 
T
N
 
D
K
 
G
P
 
P
C
 
I
S
 
K
L
 
S
E
 
Y
E
 
E
V
 
L
Q
 
A
A
 
K
F
 
E
F
 
F
T
 
A
S
 
E
L
 
E
G
 
A
D
 
-
G
 
G
A
 
F
A
 
P
V
 
L
M
|
M
I
 
I
K
|
K
A
 
A
L
 
T
A
 
S
G
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
R
 
R
P
 
I
V
 
V
S
 
R
R
 
E
Y
 
E
E
 
S
D
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
D
A
 
A
Y
 
F
R
 
H
Q
 
R
C
 
A
R
 
K
E
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
-
I
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
E
S
 
K
G
 
S
E
 
E
L
 
V
Y
 
Y
V
 
I
E
 
E
Q
 
R
L
x
Y
V
x
I
Q
 
D
H
 
N
A
 
P
R
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
L
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
T
 
H
G
 
G
A
 
N
A
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
L
W
 
F
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
P
 
V
S
 
G
L
 
L
D
 
S
D
 
P
A
 
T
T
 
L
R
 
R
M
 
Q
P
 
R
I
 
I
I
 
C
E
 
D
S
 
A
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
L
 
L
A
 
M
S
 
E
D
 
N
V
 
I
K
 
K
Y
 
Y
Q
 
V
G
 
N
L
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
V
E
|
E
F
 
F
L
|
L
L
 
V
D
 
S
A
 
G
D
 
D
D
 
E
H
 
-
S
 
-
K
 
-
F
 
F
Y
 
F
F
 
F
M
x
I
E
|
E
I
 
V
N
|
N
P
 
P
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
I
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
N
 
D
L
 
I
V
 
V
K
 
K
L
 
T
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
L
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
A
T
 
D
L
 
L
-
 
F
-
 
G
A
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
N
L
 
M
T
 
P
E
 
Q
A
 
Q
P
 
K
-
 
D
-
 
I
I
 
T
K
 
T
R
 
L
G
 
G
C
 
Y
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
T
L
 
T
E
 
E
Q
 
D
M
 
P
L
 
L
P
 
N
D
 
D
G
 
-
S
 
-
T
 
F
K
 
M
P
 
P
A
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
T
I
 
I
K
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
V
 
S
P
 
S
N
 
G
G
 
G
H
 
F
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
L
D
 
D
-
 
A
D
 
G
Y
 
D
L
 
G
Y
 
F
A
 
Q
G
 
G
Y
 
A
K
 
E
V
 
I
S
 
S
P
 
P
S
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
V
K
 
K
I
 
L
I
 
S
A
 
T
K
 
H
G
 
A
E
 
I
D
 
S
F
 
F
S
 
K
A
 
Q
A
 
A
L
 
E
N
 
E
K
 
K
V
 
M
Y
 
V
L
 
R
S
 
S
L
 
L
K
 
R
A
 
E
L
 
M
N
 
R
I
 
I
D
 
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
I
A
 
P
L
 
F
L
 
L
M
 
I
N
 
N
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
R
 
N
E
 
K
E
 
K
V
 
F
Q
 
T
H
 
S
N
 
G
R
 
D
L
 
Y
S
 
T
T
 
T
R
 
K
F
 
F
V
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3tw6B Structure of rhizobium etli pyruvate carboxylase t882a with the allosteric activator, acetyl coenzyme-a (see paper)
40% identity, 41% coverage: 5:451/1094 of query aligns to 3:454/1129 of 3tw6B

query
sites
3tw6B
F
 
I
N
 
S
R
 
K
I
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
S
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
V
A
 
F
Q
 
R
T
 
A
C
 
A
A
 
N
D
 
E
M
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
W
A
 
A
E
 
E
D
 
E
D
 
D
S
 
K
Q
 
L
S
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
R
K
 
F
K
 
K
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
S
V
 
Y
A
 
Q
L
 
V
K
 
-
G
 
G
R
 
R
G
 
G
-
 
P
-
 
H
-
 
L
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
G
-
 
P
V
 
I
K
 
E
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
S
I
 
I
E
 
D
Q
 
E
L
 
V
I
 
I
A
 
R
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
L
H
 
S
G
 
G
C
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
S
S
 
P
S
 
E
F
 
F
S
 
V
K
 
D
R
 
A
C
 
C
H
 
N
E
 
K
E
 
A
G
 
G
I
 
I
C
 
I
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
K
A
 
A
E
 
D
L
 
T
L
 
M
D
 
R
L
 
Q
L
 
L
G
 
G
N
 
N
K
|
K
A
 
V
T
 
A
A
 
A
R
 
R
E
 
N
T
 
L
A
 
A
L
 
I
R
 
S
S
 
V
D
 
G
T
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
V
G
 
P
G
 
A
I
 
T
N
 
E
K
 
-
P
 
-
C
 
-
S
 
P
L
 
L
E
 
A
E
 
E
V
 
V
Q
 
A
A
 
K
F
 
M
F
 
A
T
 
A
S
 
A
L
 
I
G
 
G
D
 
-
G
 
-
A
 
Y
A
 
P
V
 
V
M
 
M
I
 
L
K
|
K
A
 
A
L
 
S
A
 
W
G
 
G
G
|
G
G
 
G
G
|
G
R
 
R
G
 
G
M
|
M
R
 
R
P
 
V
V
 
I
S
 
R
R
 
S
Y
 
E
E
 
A
D
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
E
Y
 
V
R
 
T
Q
 
E
C
 
A
R
 
K
E
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
M
I
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
K
G
 
D
E
 
E
L
 
V
Y
 
Y
V
 
L
E
|
E
Q
 
K
L
|
L
V
|
V
Q
 
E
H
 
R
A
 
A
R
 
R
H
|
H
I
 
V
E
 
E
V
 
S
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
T
T
 
H
G
 
G
A
 
N
A
 
V
V
 
V
H
 
H
A
 
L
W
 
F
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
V
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
|
N
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
E
I
 
R
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
S
 
Y
L
 
L
D
 
S
D
 
E
A
 
A
T
 
Q
R
 
R
M
 
Q
P
 
E
I
 
L
I
 
A
E
 
A
S
 
Y
A
 
S
L
 
L
Q
 
K
L
 
I
A
 
A
S
 
G
D
 
A
V
 
T
K
 
N
Y
 
Y
Q
 
I
G
 
G
L
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
V
E
|
E
F
 
Y
L
|
L
L
 
M
D
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
T
H
 
-
S
 
G
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
I
 
V
N
|
N
P
 
P
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
T
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
N
 
D
L
 
I
V
 
V
K
 
K
L
 
A
Q
 
Q
-
 
I
-
 
H
I
 
I
L
 
L
L
 
D
G
 
G
A
 
A
-
 
A
-
 
I
G
 
G
K
 
T
T
 
P
L
 
Q
A
 
S
E
 
G
L
 
V
S
 
P
L
 
N
T
 
Q
E
 
E
A
 
D
P
 
I
I
 
R
K
 
L
R
 
N
G
 
G
C
 
H
A
 
A
I
 
L
Q
 
Q
A
 
C
R
|
R
I
 
V
N
 
T
L
 
T
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
E
G
 
H
S
 
N
T
 
F
K
 
I
P
 
P
A
 
D
S
 
Y
G
 
G
V
 
R
I
 
I
K
 
T
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
V
 
S
P
 
A
N
 
S
G
 
G
H
 
F
N
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
L
D
 
D
-
 
G
D
 
G
Y
 
T
L
 
S
Y
 
Y
A
 
S
G
 
G
Y
 
A
K
 
I
V
 
I
S
 
T
P
 
R
S
 
Y
Y
 
Y
D
|
D
S
 
P
L
 
L
G
 
L
A
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
T
A
 
A
K
 
W
G
 
A
E
 
P
D
 
N
F
 
P
S
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
I
N
 
S
K
 
R
V
 
M
Y
 
D
L
 
R
S
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
E
L
 
F
N
 
R
I
 
I
D
 
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
A
S
 
T
N
 
N
K
 
L
A
 
T
L
 
F
L
 
L
M
 
E
N
 
A
L
 
I
L
 
I
Q
 
G
R
 
H
E
 
P
E
 
K
V
 
F
Q
 
R
H
 
D
N
 
N
R
 
S
L
 
Y
S
 
T
T
|
T
R
 
R
F
 
F
V
 
I
E
 
D

Sites not aligning to the query:

2vqdA Crystal structure of biotin carboxylase from pseudomonas aeruginosa complexed with ampcp (see paper)
38% identity, 40% coverage: 4:436/1094 of query aligns to 1:426/447 of 2vqdA

query
sites
2vqdA
V
 
M
F
 
L
N
 
E
R
 
K
I
 
V
L
 
L
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
L
Q
 
R
T
 
A
C
 
C
A
 
K
D
 
E
M
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
H
A
 
S
E
 
T
D
 
A
D
 
D
S
 
R
Q
 
E
S
 
L
L
 
M
H
 
H
T
 
L
K
 
S
K
 
L
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
S
V
 
V
A
 
C
L
 
I
-
 
G
K
 
P
G
 
A
R
 
P
G
 
A
V
 
T
K
 
Q
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
Q
I
 
I
E
 
P
Q
 
A
L
 
I
I
 
I
A
 
A
V
 
A
A
 
A
K
 
E
A
 
V
H
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
T
A
 
A
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
A
E
 
E
N
 
N
S
 
A
S
 
D
F
 
F
S
 
A
K
 
E
R
 
Q
C
 
I
H
 
E
E
 
R
E
 
S
G
 
G
I
 
F
C
 
T
F
 
F
I
 
V
G
 
G
S
 
P
S
 
T
A
 
A
E
 
E
L
 
V
L
 
I
D
 
R
L
 
L
L
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
A
 
V
T
 
S
A
 
A
R
 
K
E
 
D
T
 
A
A
 
M
L
 
K
R
 
R
S
 
A
D
 
G
T
 
V
P
 
P
L
 
T
T
 
V
G
 
P
G
 
G
I
 
S
N
 
D
K
 
G
P
 
P
C
 
L
S
 
P
L
 
E
E
 
D
E
 
E
V
 
E
Q
 
T
A
 
A
F
 
L
F
 
A
T
 
I
S
 
A
L
 
R
G
 
E
D
 
V
G
 
G
A
 
Y
A
 
P
V
 
V
M
x
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
L
 
A
A
 
G
G
 
G
G
|
G
G
 
G
G
|
G
R
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
R
P
 
V
V
 
V
S
 
Y
R
 
D
Y
 
E
E
 
S
D
 
E
L
 
L
A
 
I
E
 
K
A
 
S
Y
 
A
R
 
K
Q
 
L
C
 
T
R
 
R
E
 
T
E
 
E
A
 
A
I
 
G
I
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
N
G
x
P
E
 
M
L
 
V
Y
 
Y
V
 
L
E
 
E
Q
 
K
L
x
F
V
x
L
Q
 
T
H
 
N
A
 
P
R
 
R
H
|
H
I
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
G
 
S
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
G
 
G
A
 
N
A
 
A
V
 
I
H
 
H
A
 
L
W
 
G
E
 
D
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
L
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
I
E
 
E
I
 
E
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
S
 
G
L
 
I
D
 
D
D
 
E
A
 
K
T
 
A
R
 
R
M
 
Q
P
 
E
I
 
V
I
 
F
E
 
A
S
 
R
A
 
C
L
 
V
Q
 
Q
L
 
A
A
 
C
S
 
I
D
 
E
V
 
I
K
 
G
Y
 
Y
Q
 
R
G
 
G
L
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
L
 
Y
D
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
E
H
 
N
S
 
G
K
 
R
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
I
 
M
N
|
N
P
 
T
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
P
I
 
V
T
 
S
E
 
E
E
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
V
N
 
D
L
 
I
V
 
V
K
 
K
L
 
E
Q
 
M
I
 
L
L
 
R
L
 
I
G
 
A
A
 
S
G
 
G
K
 
E
T
 
K
L
 
L
A
 
S
E
 
-
L
 
-
S
 
I
L
 
R
T
 
Q
E
 
E
A
 
D
P
 
V
I
 
V
K
 
I
R
 
R
G
 
G
C
 
H
A
 
A
I
 
L
Q
 
E
A
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
L
 
A
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
P
G
 
K
S
 
T
T
 
F
K
 
M
P
 
P
A
 
S
S
 
P
G
 
G
V
 
K
I
 
V
K
 
K
A
 
H
Y
 
F
Q
 
H
V
 
A
P
 
P
N
 
G
G
 
G
H
 
N
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
D
 
D
D
 
S
Y
 
H
L
 
L
Y
 
Y
A
 
S
G
 
G
Y
 
Y
K
 
S
V
 
V
S
 
P
P
 
P
S
 
N
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
V
A
 
G
K
 
K
I
 
V
I
 
I
A
 
T
K
 
Y
G
 
G
E
 
A
D
 
D
F
 
R
S
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
A
K
 
R
V
 
M
Y
 
R
L
 
N
S
 
A
L
 
L
K
 
D
A
 
E
L
 
L
N
 
I
I
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
I
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
T
A
 
E
L
 
L
L
 
H
M
 
K
N
 
D
L
 
L
L
 
V
Q
 
R

Sites not aligning to the query:

P9WPQ3 Biotin-dependent 3-methylcrotonyl-coenzyme A carboxylase alpha1 subunit; EC 6.3.4.14 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
40% identity, 42% coverage: 4:459/1094 of query aligns to 1:452/654 of P9WPQ3

query
sites
P9WPQ3
V
 
M
F
 
F
N
 
D
R
 
T
I
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
V
R
 
R
I
 
V
A
 
I
Q
 
R
T
 
T
C
 
L
A
 
R
D
 
R
M
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
R
S
 
S
L
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
Y
A
 
S
E
 
D
D
 
P
D
 
D
S
 
V
Q
 
D
S
 
A
L
 
R
H
 
H
T
 
V
K
 
L
K
 
E
A
 
A
D
 
D
Q
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
R
L
 
L
-
 
G
K
 
P
G
 
A
R
 
P
G
 
A
V
 
R
K
 
E
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
I
 
I
E
 
G
Q
 
K
L
 
V
I
 
L
A
 
D
V
 
A
A
 
A
K
 
A
A
 
R
H
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
A
E
 
E
N
 
N
S
 
A
S
 
D
F
 
F
S
 
A
K
 
A
R
 
A
C
 
C
H
 
E
E
 
R
E
 
A
G
 
R
I
 
V
C
 
V
F
 
F
I
 
L
G
 
G
S
 
P
S
 
P
A
 
A
E
 
R
L
 
A
L
 
I
D
 
E
L
 
V
L
 
M
G
 
G
N
 
D
K
 
K
A
 
I
T
 
A
A
 
A
R
 
K
E
 
N
T
 
A
A
 
V
L
 
A
R
 
A
S
 
F
D
 
D
T
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
V
G
 
P
G
 
G
I
 
V
N
 
A
K
 
R
P
 
A
C
 
G
S
 
L
L
 
T
E
 
D
E
 
D
V
 
-
Q
 
-
A
 
A
F
 
L
F
 
V
T
 
T
S
 
A
L
 
A
G
 
A
D
 
E
-
 
V
G
 
G
A
 
Y
A
 
P
V
 
V
M
 
L
I
 
I
K
 
K
A
 
P
L
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
K
G
 
G
M
 
M
R
 
R
P
 
L
V
 
V
S
 
Q
R
 
D
Y
 
P
E
 
A
D
 
R
L
 
L
A
 
P
E
 
E
A
 
A
Y
 
L
R
 
V
Q
 
S
C
 
A
R
 
R
E
 
R
E
 
E
A
 
A
I
 
M
I
 
S
A
 
S
F
 
F
G
 
G
S
 
D
G
 
D
E
 
T
L
 
L
Y
 
F
V
 
L
E
 
E
Q
 
R
L
 
F
V
 
V
Q
 
L
H
 
R
A
 
P
R
 
R
H
 
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
G
 
A
D
 
D
G
 
A
T
 
H
G
 
G
A
 
N
A
 
V
V
 
V
H
 
H
A
 
L
W
 
G
E
 
E
R
 
R
E
 
E
C
 
C
T
 
S
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
I
E
 
E
I
 
E
A
 
A
P
 
P
S
 
S
P
 
P
S
 
L
L
 
L
D
 
D
D
 
P
A
 
Q
T
 
T
R
 
R
M
 
E
P
 
R
I
 
I
I
 
G
E
 
V
S
 
A
A
 
A
L
 
C
Q
 
N
L
 
T
A
 
A
S
 
R
D
 
C
V
 
V
K
 
D
Y
 
Y
Q
 
V
G
 
G
L
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
I
L
 
V
D
 
S
A
 
A
D
 
Q
D
 
R
H
 
P
S
 
D
K
 
E
F
 
F
Y
 
F
F
 
F
M
 
M
E
 
E
I
 
M
N
 
N
P
 
T
R
 
R
I
 
L
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
P
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
A
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
L
N
 
D
L
 
L
V
 
V
K
 
E
L
 
W
Q
 
Q
I
 
L
L
 
R
L
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
E
T
 
-
L
 
-
A
 
-
E
x
K
L
 
L
S
 
G
L
 
F
T
 
A
E
 
Q
A
 
N
P
 
D
I
 
I
K
 
E
-
 
L
R
 
R
G
 
G
C
 
H
A
 
A
I
 
I
Q
 
E
A
 
A
R
 
R
I
 
V
N
 
Y
L
 
A
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
A
G
 
R
S
 
E
T
 
F
K
 
L
P
 
P
A
 
T
S
 
G
G
 
G
V
 
R
I
 
V
K
 
L
A
 
A
Y
 
V
Q
 
F
V
 
E
P
 
P
N
 
A
G
 
G
H
 
P
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
V
D
 
D
D
 
S
Y
 
S
L
 
L
Y
 
L
A
 
G
G
 
G
Y
 
T
K
 
V
V
 
V
S
 
G
P
 
S
S
 
D
Y
 
Y
D
 
D
S
 
P
L
 
L
G
 
L
A
 
T
K
 
K
I
 
V
I
 
I
A
 
A
K
 
H
G
 
G
E
 
A
D
 
D
F
 
R
S
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
D
K
 
R
V
 
L
Y
 
D
L
 
Q
S
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
R
L
 
T
N
 
A
I
 
V
D
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
S
 
T
N
 
N
K
 
V
A
 
E
L
 
F
L
 
L
M
 
R
N
 
F
L
 
L
L
 
L
Q
 
A
R
 
D
E
 
E
E
 
R
V
 
V
Q
 
R
H
 
V
N
 
G
R
 
D
L
 
L
S
 
D
T
 
T
R
 
A
F
 
V
V
 
L
E
 
D
A
 
E
H
 
R
M
 
S
A
 
A
E
 
D
L
 
F
L
 
T
A
 
A

2vr1A Crystal structure of biotin carboxylase from e. Coli in complex with atp analog, adpcf2p. (see paper)
38% identity, 41% coverage: 4:454/1094 of query aligns to 1:442/444 of 2vr1A

query
sites
2vr1A
V
 
M
F
 
L
N
 
D
R
 
K
I
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
L
Q
 
R
T
 
A
C
 
C
A
 
K
D
 
E
M
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
H
A
 
S
E
 
S
D
 
A
D
 
D
S
 
R
Q
 
D
S
 
L
L
 
K
H
 
H
T
 
V
K
 
L
K
 
L
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
C
L
 
I
-
 
G
K
 
P
G
 
A
R
 
P
G
 
S
V
 
V
K
 
K
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
I
 
I
E
 
P
Q
 
A
L
 
I
I
 
I
A
 
S
V
 
A
A
 
A
K
 
E
A
 
I
H
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
V
A
 
A
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
S
 
A
S
 
N
F
 
F
S
 
A
K
 
E
R
 
Q
C
 
V
H
 
E
E
 
R
E
 
S
G
 
G
I
 
F
C
 
I
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
K
A
 
A
E
 
E
L
 
T
L
 
I
D
 
R
L
 
L
L
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
A
 
V
T
 
S
A
 
A
R
 
I
E
 
A
T
 
A
A
 
M
L
 
K
R
 
K
S
 
A
D
 
G
T
 
V
P
 
P
L
 
C
T
 
V
G
 
P
G
 
G
I
 
S
N
 
D
K
 
G
P
 
P
C
 
L
S
 
G
-
 
D
-
 
D
L
 
M
E
 
D
E
 
K
V
 
N
Q
 
R
A
 
A
F
 
I
F
 
A
T
 
K
S
 
R
L
 
I
G
 
G
D
 
-
G
 
-
A
 
Y
A
 
P
V
 
V
M
 
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
L
 
-
A
 
-
G
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
|
R
G
 
G
M
|
M
R
 
R
P
 
V
V
 
V
S
 
R
R
 
G
Y
 
D
E
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
S
Y
 
I
R
 
S
Q
 
M
C
 
T
R
 
R
E
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
K
I
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
S
 
N
G
x
D
E
 
M
L
 
V
Y
 
Y
V
 
M
E
 
E
Q
 
K
L
x
Y
V
x
L
Q
 
E
H
 
N
A
 
P
R
 
R
H
|
H
I
 
V
E
 
E
V
 
I
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
G
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
G
 
G
A
 
N
A
 
A
V
 
I
H
 
Y
A
 
L
W
 
A
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
M
Q
 
Q
R
 
R
R
|
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
E
I
 
E
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
S
 
G
L
 
I
D
 
T
D
 
P
A
 
E
T
 
L
R
 
R
M
 
R
P
 
Y
I
 
I
I
 
G
E
 
E
S
 
R
A
 
C
L
 
A
Q
 
K
L
 
A
A
 
C
S
 
V
D
 
D
V
 
I
K
 
G
Y
 
Y
Q
 
R
G
 
G
L
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
L
 
F
D
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
E
H
 
N
S
 
G
K
 
E
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
I
 
M
N
|
N
P
 
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
P
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
V
N
 
D
L
 
L
V
 
I
K
 
K
L
 
E
Q
 
Q
I
 
L
L
 
R
L
 
I
G
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
T
 
P
L
 
L
A
 
S
E
 
-
L
 
I
S
 
K
L
 
Q
T
 
E
E
 
E
A
 
V
P
 
H
I
 
V
K
 
-
R
 
R
G
 
G
C
 
H
A
 
A
I
 
V
Q
 
E
A
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
L
 
A
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
N
G
 
-
S
 
T
T
 
F
K
 
L
P
 
P
A
 
S
S
 
P
G
 
G
V
 
K
I
 
I
K
 
T
A
 
R
Y
 
F
Q
 
H
V
 
A
P
 
P
N
 
G
G
 
G
H
 
F
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
W
D
 
E
D
 
S
Y
 
H
L
 
I
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
K
 
T
V
 
V
S
 
P
P
 
P
S
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
M
G
 
I
A
 
G
K
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
C
K
 
Y
G
 
G
E
 
E
D
 
N
F
 
R
S
 
D
A
 
V
A
 
A
L
 
I
N
 
A
K
 
R
V
 
M
Y
 
K
L
 
N
S
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
E
L
 
L
N
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
I
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
V
A
 
D
L
 
L
L
 
Q
M
 
I
N
 
R
L
 
I
L
 
M
Q
 
N
R
 
D
E
 
E
E
 
N
V
 
F
Q
 
Q
H
 
H
N
 
G
R
 
G
L
 
T
S
 
N
T
x
I
R
 
H
F
 
Y
V
 
L
E
 
E
A
 
K
H
 
K
M
 
L

2vpqB Crystal structure of biotin carboxylase from s. Aureus complexed with amppnp (see paper)
40% identity, 41% coverage: 7:453/1094 of query aligns to 2:443/448 of 2vpqB

query
sites
2vpqB
R
 
K
I
 
V
L
 
L
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
V
R
 
R
I
 
I
A
 
I
Q
 
R
T
 
A
C
 
C
A
 
R
D
 
D
M
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
Q
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
E
 
E
D
 
G
D
 
D
S
 
K
Q
 
D
S
 
A
L
 
L
H
 
H
T
 
T
K
 
Q
K
 
I
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
A
V
 
Y
A
 
C
L
 
V
K
 
G
G
 
P
R
 
T
G
 
L
V
 
S
K
 
K
-
 
D
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
I
 
I
E
 
P
Q
 
N
L
 
I
I
 
L
A
 
S
V
 
I
A
 
A
K
 
T
A
 
S
H
 
T
G
 
G
C
 
C
D
 
D
A
 
G
V
 
V
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
A
E
 
E
N
 
N
S
 
A
S
 
D
F
 
F
S
 
A
K
 
E
R
 
L
C
 
C
H
 
E
E
 
A
E
 
C
G
 
Q
I
 
L
C
 
K
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
S
A
 
Y
E
 
Q
L
 
S
L
 
I
D
 
Q
L
 
K
L
 
M
G
 
G
N
 
I
K
|
K
A
 
D
T
x
V
A
 
A
R
 
K
E
 
A
T
 
E
A
 
M
L
 
I
R
 
K
S
 
A
D
 
N
T
 
V
P
 
P
L
 
V
-
 
V
-
 
P
-
 
G
T
 
S
G
 
D
G
 
G
I
 
L
N
 
M
K
 
K
P
 
D
C
 
V
S
 
S
L
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
Q
 
E
A
 
A
F
 
K
F
 
K
T
 
I
S
 
A
L
 
K
G
 
K
D
 
I
G
 
G
A
 
Y
A
 
P
V
 
V
M
x
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
L
 
T
A
 
A
G
 
G
G
|
G
G
 
G
G
|
G
R
 
K
G
 
G
M
x
I
R
 
R
P
 
V
V
 
A
S
 
R
R
 
D
Y
 
E
E
 
K
D
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
T
A
 
G
Y
 
F
R
 
R
Q
 
M
C
 
T
R
 
E
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
I
 
Q
I
 
T
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
N
G
 
G
E
 
G
L
 
L
Y
 
Y
V
 
M
E
 
E
Q
 
K
L
x
F
V
x
I
Q
 
E
H
 
N
A
 
F
R
 
R
H
|
H
I
 
I
E
 
E
V
 
I
Q
 
Q
I
 
I
L
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
S
T
 
Y
G
 
G
A
 
N
A
 
V
V
 
I
H
 
H
A
 
L
W
 
G
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
T
L
 
I
Q
 
Q
R
 
R
R
|
R
N
 
M
Q
 
Q
K
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
E
A
 
A
P
 
P
S
 
S
P
 
P
S
 
I
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
E
T
 
T
R
 
R
M
 
R
P
 
E
I
 
M
I
 
G
E
 
N
S
 
A
A
 
A
L
 
V
Q
 
R
L
 
A
A
 
A
S
 
K
D
 
A
V
 
V
K
 
N
Y
 
Y
Q
 
E
G
 
N
L
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
I
E
|
E
F
 
F
L
x
I
L
 
Y
D
 
D
A
 
L
D
 
N
D
 
D
H
 
-
S
 
N
K
 
K
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
|
M
E
|
E
I
 
M
N
|
N
P
 
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
|
E
H
 
H
T
 
P
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
N
 
D
L
 
L
V
 
V
K
 
K
L
 
L
Q
 
Q
I
 
L
L
 
Q
L
 
V
G
 
A
A
 
M
G
 
G
K
 
D
T
 
V
L
 
L
A
 
P
-
 
Y
-
 
K
-
 
Q
-
 
E
E
 
D
L
 
I
S
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
-
A
 
-
P
 
-
I
 
-
K
 
-
R
 
-
G
 
G
C
 
H
A
 
A
I
 
I
Q
 
E
A
 
F
R
|
R
I
 
I
N
 
N
L
 
A
E
 
E
Q
 
N
M
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
Y
G
 
K
S
 
N
T
 
F
K
 
M
P
 
P
A
 
S
S
 
P
G
 
G
V
 
K
I
 
I
K
 
E
A
 
Q
Y
 
Y
Q
 
L
V
 
A
P
 
P
N
 
G
G
 
G
H
 
Y
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
D
 
E
D
 
S
Y
 
A
L
 
C
Y
 
Y
A
 
T
G
 
N
Y
 
Y
K
 
T
V
 
I
S
 
P
P
 
P
S
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
M
G
 
V
A
 
A
K
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
I
K
 
H
G
 
E
E
 
P
D
 
T
F
 
R
S
 
D
A
 
E
A
 
A
L
 
I
N
 
M
K
 
A
V
 
G
Y
 
I
L
 
R
S
 
A
L
 
L
K
 
S
A
 
E
L
 
F
N
 
V
I
 
V
D
 
L
G
 
G
V
 
I
Q
 
D
S
 
T
N
 
T
K
 
I
A
 
P
L
 
F
L
 
H
M
 
I
N
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
N
R
 
N
E
 
D
E
 
I
V
 
F
Q
 
R
H
 
S
N
 
G
R
 
K
L
 
F
S
 
N
T
 
T
R
 
N
F
 
F
V
 
L
E
 
E
A
 
Q
H
 
N

7kctA Crystal structure of the hydrogenobacter thermophilus 2-oxoglutarate carboxylase (ogc) biotin carboxylase (bc) domain dimer in complex with adenosine 5'-diphosphate magnesium salt (mgadp), adenosine 5'- diphosphate (adp, and bicarbonate anion (hydrogen carbonate/hco3-) (see paper)
38% identity, 41% coverage: 3:453/1094 of query aligns to 2:445/453 of 7kctA

query
sites
7kctA
R
 
Q
V
 
M
F
 
F
N
 
K
R
 
K
I
 
V
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
C
R
 
R
I
 
V
A
 
I
Q
 
R
T
 
A
C
 
C
A
 
K
D
 
E
M
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
Q
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
N
E
 
E
D
 
I
D
 
E
S
 
S
Q
 
T
S
 
A
L
 
R
H
 
H
T
 
V
K
 
K
K
 
M
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
A
V
 
Y
A
 
M
L
 
I
K
 
G
G
 
V
R
 
N
G
 
P
V
 
L
K
 
D
A
 
T
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
I
 
A
E
 
E
Q
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
D
V
 
L
A
 
A
K
 
L
A
 
E
H
 
V
G
 
G
C
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
A
E
 
E
N
 
N
S
 
E
S
 
H
F
 
F
S
 
A
K
 
R
R
 
L
C
 
C
H
 
E
E
 
E
E
 
K
G
 
G
I
 
I
C
 
T
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
H
A
 
W
E
 
K
L
 
V
L
 
I
D
 
E
L
 
L
L
 
M
G
 
G
N
x
D
K
|
K
A
 
A
T
x
R
A
 
S
R
 
K
E
 
E
T
 
V
A
 
M
L
 
K
R
 
R
S
 
A
D
 
G
T
 
V
P
 
P
L
 
T
T
 
V
G
 
P
G
 
G
I
 
S
N
 
D
K
 
G
P
 
I
C
 
L
S
 
K
-
 
D
L
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
A
Q
 
K
A
 
R
F
 
I
F
 
A
T
 
K
S
 
E
L
 
I
G
 
-
D
 
-
G
 
G
A
 
Y
A
 
P
V
 
V
M
x
L
I
 
L
K
|
K
A
 
A
L
 
S
A
 
A
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
R
 
R
G
 
G
M
x
I
R
 
R
P
 
I
V
 
C
S
 
R
R
 
N
Y
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
R
A
 
N
Y
 
Y
R
 
E
Q
 
N
C
 
A
R
 
Y
E
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
V
I
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
R
G
 
G
E
 
D
L
 
L
Y
 
L
V
 
L
E
|
E
Q
 
K
L
x
Y
V
x
I
Q
 
E
H
 
N
A
 
P
R
 
K
H
|
H
I
 
I
E
 
E
V
 
F
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
K
T
 
Y
G
 
G
A
 
N
A
 
V
V
 
I
H
 
H
A
 
L
W
 
G
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
I
Q
|
Q
R
 
R
R
 
R
N
 
N
Q
|
Q
K
|
K
L
 
L
L
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
P
 
P
S
 
S
P
 
L
S
 
L
L
 
L
D
 
T
D
 
P
A
 
E
T
 
Q
R
 
R
M
 
E
P
 
Y
I
 
Y
I
 
G
E
 
S
S
 
L
A
 
V
L
 
V
Q
 
K
L
 
A
A
 
A
S
 
K
D
 
E
V
 
I
K
 
G
Y
 
Y
Q
 
Y
G
 
S
L
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
M
E
|
E
F
 
F
L
x
I
L
 
-
D
 
-
A
 
A
D
 
D
D
 
E
H
 
K
S
 
G
K
 
N
F
 
L
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
I
 
M
N
|
N
P
 
T
R
|
R
I
 
I
Q
|
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
T
 
P
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
V
N
 
D
L
 
I
V
 
V
K
 
K
L
 
W
Q
 
Q
I
 
I
L
 
R
L
 
I
G
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
E
T
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
R
L
 
L
S
 
R
L
 
Y
T
 
S
E
 
Q
A
 
E
P
 
D
I
 
I
K
 
R
-
 
F
R
 
N
G
 
G
C
 
Y
A
 
S
I
 
I
Q
 
E
A
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
L
 
A
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
K
G
 
K
S
 
G
T
 
F
K
 
A
P
 
P
A
 
S
S
 
I
G
 
G
V
 
T
I
 
I
K
 
E
A
 
R
Y
 
Y
Q
 
Y
V
 
V
P
 
P
N
 
G
G
 
G
H
 
F
N
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
D
 
E
D
 
H
Y
 
A
L
 
S
Y
 
S
A
 
K
G
 
G
Y
 
Y
K
 
E
V
 
I
S
 
T
P
 
P
S
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
I
A
 
A
K
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
V
K
 
W
G
 
A
E
 
P
D
 
L
F
 
W
S
 
E
A
 
V
A
 
A
L
 
V
N
 
D
K
 
R
V
 
M
Y
 
R
L
 
S
S
 
A
L
 
L
K
 
E
A
 
T
L
 
Y
N
 
E
I
 
I
D
 
S
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
S
 
T
N
 
T
K
 
I
A
 
P
L
 
L
L
 
L
M
 
I
N
 
N
L
 
I
L
 
M
Q
 
K
R
 
D
E
 
K
E
 
D
V
 
F
Q
 
R
H
 
D
N
 
G
R
 
K
L
 
F
S
 
T
T
 
T
R
 
R
F
 
Y
V
 
L
E
 
E
A
 
E
H
 
H

P11154 Pyruvate carboxylase 1; Pyruvic carboxylase 1; PCB 1; EC 6.4.1.1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
42% identity, 41% coverage: 6:451/1094 of query aligns to 20:466/1178 of P11154

query
sites
P11154
N
 
N
R
 
K
I
 
I
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
P
I
 
I
R
 
R
I
 
I
A
 
F
Q
 
R
T
 
T
C
 
A
A
 
H
D
 
E
M
 
L
G
 
S
I
 
M
D
 
Q
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
E
 
H
D
 
E
D
 
D
S
 
R
Q
 
L
S
 
S
L
 
T
H
 
H
T
 
K
K
 
Q
K
 
K
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
A
V
 
Y
A
 
V
L
 
I
K
 
G
G
 
E
R
 
V
G
 
G
-
 
Q
-
 
Y
-
 
T
-
 
P
V
 
V
K
 
G
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
D
 
A
I
 
I
E
 
D
Q
 
E
L
 
I
I
 
I
A
 
S
V
 
I
A
 
A
K
 
Q
A
 
K
H
 
H
G
 
Q
C
 
V
D
 
D
A
 
F
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
S
 
S
S
 
E
F
 
F
S
 
A
K
 
D
R
 
K
C
 
V
H
 
V
E
 
K
E
 
A
G
 
G
I
 
I
C
 
T
F
 
W
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
P
A
 
A
E
 
E
L
 
V
L
 
I
D
 
D
L
 
S
L
 
V
G
 
G
N
 
D
K
 
K
A
 
V
T
 
S
A
 
A
R
 
R
E
 
N
T
 
L
A
 
A
L
 
A
R
 
K
S
 
A
D
 
N
T
 
V
P
 
P
L
 
T
T
 
V
G
 
P
G
 
G
I
 
T
N
 
P
K
 
G
P
 
P
C
 
I
-
 
E
S
 
T
L
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
A
Q
 
L
A
 
D
F
 
F
F
 
V
T
 
N
S
 
E
L
 
Y
G
 
-
D
 
-
G
 
G
A
 
Y
A
 
P
V
 
V
M
 
I
I
 
I
K
 
K
A
 
A
L
 
A
A
 
F
G
 
G
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
 
M
R
 
R
P
 
V
V
 
V
S
 
R
R
 
E
Y
 
G
E
 
D
D
 
D
L
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
A
Y
 
F
R
 
Q
Q
 
R
C
 
A
R
 
T
E
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
R
I
 
T
A
 
A
F
 
F
G
 
G
S
 
N
G
 
G
E
 
T
L
 
C
Y
 
F
V
 
V
E
 
E
Q
 
R
L
 
F
V
 
L
Q
 
D
H
 
K
A
 
P
R
 
K
H
 
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
L
L
 
L
G
 
A
D
 
D
G
 
N
T
 
H
G
 
G
A
 
N
A
 
V
V
 
V
H
 
H
A
 
L
W
 
F
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
V
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
K
S
 
T
L
 
L
D
 
P
D
 
R
A
 
E
T
 
V
R
 
R
M
 
D
P
 
A
I
 
I
I
 
L
E
 
T
S
 
D
A
 
A
L
 
V
Q
 
K
L
 
L
A
 
A
S
 
K
D
 
E
V
 
C
K
 
G
Y
 
Y
Q
 
R
G
 
N
L
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
A
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
-
A
 
-
D
 
D
D
 
N
H
 
Q
S
 
N
K
 
R
F
 
H
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
 
E
I
 
I
N
 
N
P
 
P
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
I
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
I
N
 
D
L
 
I
V
 
V
K
 
A
L
 
A
Q
 
Q
I
 
I
L
 
Q
L
 
I
G
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
P
E
 
Q
L
 
L
S
 
G
L
 
L
T
 
F
E
 
Q
A
 
D
P
 
K
I
 
I
-
 
T
K
 
T
R
 
R
G
 
G
C
 
F
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
I
N
 
T
L
 
T
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
P
D
 
A
G
 
K
S
 
N
T
 
F
K
 
Q
P
 
P
A
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
R
I
 
I
K
 
E
A
 
V
Y
 
Y
Q
 
R
V
 
S
P
 
A
N
 
G
G
 
G
H
 
N
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
L
D
 
D
-
 
G
D
 
G
Y
 
N
L
 
A
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
Y
 
T
K
 
I
V
 
I
S
 
S
P
 
P
S
 
H
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
M
G
 
L
A
 
V
K
 
K
I
 
C
I
 
S
A
 
C
K
 
S
G
 
G
E
 
S
D
 
T
F
 
Y
S
 
E
A
 
I
A
 
V
L
 
R
N
 
R
K
 
K
V
 
M
Y
 
I
L
 
R
S
 
A
L
 
L
K
 
I
A
 
E
L
 
F
N
 
R
I
 
I
D
 
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
I
A
 
P
L
 
F
L
 
L
M
 
L
N
 
T
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
R
 
N
E
 
P
E
 
V
V
 
F
Q
 
I
H
 
E
N
 
G
R
 
T
L
 
Y
S
 
W
T
 
T
R
 
T
F
 
F
V
 
I
E
 
D

Sites not aligning to the query:

8gk8A R21a staphylococcus aureus pyruvate carboxylase
40% identity, 41% coverage: 7:451/1094 of query aligns to 4:433/1041 of 8gk8A

query
sites
8gk8A
R
 
K
I
 
L
L
 
L
I
 
V
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
R
I
 
I
A
 
F
Q
 
A
T
 
A
C
 
A
A
 
A
D
 
E
M
 
L
G
 
D
I
 
I
D
 
S
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
A
 
S
E
 
N
D
 
E
D
 
D
S
 
K
Q
 
S
S
 
S
L
 
L
H
 
H
T
x
R
K
x
Y
K
 
K
A
|
A
D
|
D
Q
x
E
A
x
S
V
 
Y
A
 
-
L
 
L
K
 
V
G
 
G
R
 
S
G
 
D
V
 
L
-
 
G
-
 
P
-
 
A
K
 
E
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
I
 
I
E
 
E
Q
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
D
V
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
Q
H
 
A
G
 
N
C
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
S
 
E
S
 
Q
F
 
F
S
 
A
K
 
R
R
 
R
C
 
C
H
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
I
 
I
C
 
K
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
H
A
 
L
E
 
E
L
 
H
L
 
L
D
 
D
L
 
M
L
 
F
G
 
G
N
 
D
K
 
K
A
 
V
T
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
I
R
 
K
S
 
A
D
 
D
T
 
L
P
 
P
L
 
V
T
 
I
G
 
P
G
 
G
I
 
T
N
 
D
K
 
G
P
 
P
C
 
I
S
 
K
L
 
S
E
 
Y
E
 
E
V
 
L
Q
 
A
A
 
K
F
 
E
F
 
F
T
 
A
S
 
E
L
 
E
G
 
A
D
 
-
G
 
G
A
 
F
A
 
P
V
 
L
M
 
M
I
 
I
K
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
M
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
V
S
 
R
R
 
E
Y
 
E
E
 
S
D
 
E
L
 
L
A
 
E
E
 
D
A
 
A
Y
 
F
R
 
H
Q
 
R
C
 
A
R
 
K
E
 
S
E
 
E
A
 
A
I
 
-
I
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
S
 
-
G
 
E
E
 
K
L
 
V
Y
 
Y
V
 
I
E
 
E
Q
 
R
L
 
Y
V
 
I
Q
 
D
H
 
N
A
 
P
R
 
K
H
 
H
I
 
I
E
 
E
V
 
V
Q
 
Q
I
 
V
L
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
E
T
 
H
G
 
G
A
 
N
A
 
I
V
 
V
H
 
H
A
 
L
W
 
F
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
V
Q
 
Q
R
 
R
R
 
R
N
 
H
Q
 
Q
K
 
K
L
 
V
L
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
A
P
 
P
S
 
S
P
 
V
S
 
G
L
 
L
D
 
S
D
 
P
A
 
T
T
 
L
R
 
R
M
 
Q
P
 
R
I
 
I
I
 
C
E
 
D
S
 
A
A
 
A
L
 
I
Q
 
Q
L
 
L
A
 
M
S
 
E
D
 
N
V
 
I
K
 
K
Y
 
Y
Q
 
V
G
 
N
L
 
A
G
 
G
T
 
T
F
 
V
E
 
E
F
 
F
L
 
L
L
 
V
D
 
S
A
 
G
D
 
D
D
 
E
H
 
-
S
 
-
K
 
-
F
 
F
Y
 
F
F
 
F
M
 
I
E
 
E
I
 
V
N
 
N
P
 
P
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
H
 
H
T
 
T
I
 
I
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
I
N
 
D
L
 
I
V
 
V
K
 
K
L
 
T
Q
 
Q
I
 
I
L
 
L
L
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
A
T
 
D
L
 
L
-
 
F
-
 
G
A
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
N
L
 
M
T
 
P
E
 
Q
A
 
Q
P
 
K
-
 
D
-
 
I
I
 
T
K
 
T
R
 
L
G
 
G
C
 
Y
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
A
 
C
R
 
R
I
 
I
N
 
T
L
 
T
E
 
E
Q
 
D
M
 
P
L
 
L
P
 
N
D
 
D
G
 
-
S
 
-
T
 
F
K
 
M
P
 
P
A
 
D
S
 
T
G
 
G
V
 
T
I
 
I
K
 
I
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
R
V
 
S
P
 
S
N
 
G
G
 
G
H
 
F
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
L
D
 
D
-
 
A
D
 
G
Y
 
D
L
 
G
Y
 
F
A
 
Q
G
 
G
Y
 
A
K
 
E
V
 
I
S
 
S
P
 
P
S
 
Y
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
V
K
 
K
I
 
L
I
 
S
A
 
T
K
 
H
G
 
A
E
 
I
D
 
S
F
 
F
S
 
K
A
 
Q
A
 
A
L
 
E
N
 
E
K
 
K
V
 
M
Y
 
V
L
 
R
S
 
S
L
 
L
K
 
R
A
x
E
L
 
M
N
x
R
I
 
I
D
x
R
G
 
G
V
 
V
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
I
A
 
P
L
 
F
L
 
L
M
 
I
N
 
N
L
 
V
L
 
M
Q
 
K
R
 
N
E
 
K
E
 
K
V
 
F
Q
 
T
H
 
S
N
 
G
R
 
D
L
 
Y
S
 
T
T
 
T
R
 
K
F
 
F
V
 
I
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3rupA Crystal structure of e.Coli biotin carboxylase in complex with two adp and two ca ions (see paper)
38% identity, 41% coverage: 4:454/1094 of query aligns to 1:444/444 of 3rupA

query
sites
3rupA
V
 
M
F
 
L
N
 
D
R
 
K
I
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
L
Q
 
R
T
 
A
C
 
C
A
 
K
D
 
E
M
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
H
A
 
S
E
 
S
D
 
A
D
 
D
S
 
R
Q
 
D
S
 
L
L
 
K
H
 
H
T
 
V
K
 
L
K
 
L
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
C
L
 
I
-
 
G
K
 
P
G
 
A
R
 
P
G
 
S
V
 
V
K
 
K
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
I
 
I
E
 
P
Q
 
A
L
 
I
I
 
I
A
 
S
V
 
A
A
 
A
K
 
E
A
 
I
H
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
V
A
 
A
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
|
Y
G
|
G
F
 
F
L
 
L
S
 
S
E
|
E
N
 
N
S
 
A
S
 
N
F
 
F
S
 
A
K
 
E
R
 
Q
C
 
V
H
 
E
E
 
R
E
 
S
G
 
G
I
 
F
C
 
I
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
K
A
 
A
E
 
E
L
 
T
L
 
I
D
 
R
L
 
L
L
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
A
 
V
T
 
S
A
 
A
R
 
I
E
 
A
T
 
A
A
 
M
L
 
K
R
 
K
S
 
A
D
 
G
T
 
V
P
 
P
L
 
C
T
 
V
G
 
P
G
 
G
I
 
S
N
 
D
K
 
G
P
 
P
C
 
L
-
 
G
-
 
D
S
 
D
L
 
M
E
 
D
E
 
K
V
 
N
Q
 
R
A
 
A
F
 
I
F
 
A
T
 
K
S
 
R
L
 
I
G
 
G
D
 
-
G
 
-
A
 
Y
A
 
P
V
 
V
M
 
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
L
 
S
A
 
G
G
 
G
G
|
G
G
|
G
G
|
G
R
|
R
G
 
G
M
|
M
R
 
R
P
 
V
V
 
V
S
 
R
R
 
G
Y
 
D
E
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
S
Y
 
I
R
 
S
Q
 
M
C
 
T
R
 
R
E
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
K
I
 
A
A
 
A
F
|
F
G
 
S
S
 
N
G
x
D
E
 
M
L
 
V
Y
 
Y
V
 
M
E
|
E
Q
x
K
L
x
Y
V
x
L
Q
 
E
H
 
N
A
 
P
R
 
R
H
|
H
I
 
V
E
 
E
V
 
I
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
G
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
G
 
G
A
 
N
A
 
A
V
 
I
H
 
Y
A
 
L
W
 
A
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
M
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
|
K
L
 
V
L
 
V
E
 
E
I
 
E
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
S
 
G
L
 
I
D
 
T
D
 
P
A
 
E
T
 
L
R
 
R
M
 
R
P
 
Y
I
 
I
I
 
G
E
 
E
S
 
R
A
 
C
L
 
A
Q
 
K
L
 
A
A
 
C
S
 
V
D
 
D
V
 
I
K
 
G
Y
 
Y
Q
 
R
G
 
G
L
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
L
 
F
D
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
E
H
 
N
S
 
G
K
 
E
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
I
 
M
N
|
N
P
 
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
T
 
P
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
V
N
 
D
L
 
L
V
 
I
K
 
K
L
 
E
Q
 
Q
I
 
L
L
 
R
L
 
I
G
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
T
 
P
L
 
L
A
 
S
E
 
-
L
 
I
S
 
K
L
 
Q
T
 
E
E
 
E
A
 
V
P
 
H
I
 
V
K
 
-
R
 
R
G
 
G
C
 
H
A
 
A
I
 
V
Q
 
E
A
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
L
 
A
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
P
G
 
N
S
 
T
T
 
F
K
 
L
P
 
P
A
 
S
S
 
P
G
 
G
V
 
K
I
 
I
K
 
T
A
 
R
Y
 
F
Q
 
H
V
 
A
P
 
P
N
 
G
G
 
G
H
 
F
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
W
D
 
E
D
 
S
Y
 
H
L
 
I
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
K
 
T
V
 
V
S
 
P
P
 
P
S
 
Y
Y
 
Y
D
|
D
S
 
S
L
 
M
G
 
I
A
 
G
K
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
C
K
 
Y
G
 
G
E
 
E
D
 
N
F
 
R
S
 
D
A
 
V
A
 
A
L
 
I
N
 
A
K
 
R
V
 
M
Y
 
K
L
 
N
S
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
E
L
 
L
N
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
I
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
V
A
 
D
L
 
L
L
 
Q
M
 
I
N
 
R
L
 
I
L
 
M
Q
 
N
R
 
D
E
 
E
E
 
N
V
 
F
Q
 
Q
H
 
H
N
 
G
R
 
G
L
 
T
S
 
N
T
x
I
R
 
H
F
 
Y
V
 
L
E
 
E
A
 
K
H
 
K
M
 
L

3g8cA Crystal structure of biotin carboxylase in complex with biotin, bicarbonate, adp and mg ion (see paper)
38% identity, 41% coverage: 4:454/1094 of query aligns to 1:444/444 of 3g8cA

query
sites
3g8cA
V
 
M
F
 
L
N
 
D
R
 
K
I
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
N
 
N
R
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
I
A
 
A
I
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
L
Q
 
R
T
 
A
C
 
C
A
 
K
D
 
E
M
 
L
G
 
G
I
 
I
D
 
K
S
 
T
L
 
V
A
 
A
I
 
V
Y
 
H
A
 
S
E
 
S
D
 
A
D
 
D
S
 
R
Q
 
D
S
 
L
L
 
K
H
 
H
T
 
V
K
 
L
K
 
L
A
 
A
D
 
D
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
C
L
 
I
-
 
G
K
 
P
G
 
A
R
 
P
G
 
S
V
 
V
K
 
K
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
D
 
N
I
 
I
E
 
P
Q
 
A
L
 
I
I
 
I
A
 
S
V
 
A
A
 
A
K
 
E
A
 
I
H
 
T
G
 
G
C
 
A
D
 
V
A
 
A
V
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
Y
|
Y
G
 
G
F
|
F
L
 
L
S
 
S
E
 
E
N
 
N
S
 
A
S
 
N
F
 
F
S
 
A
K
 
E
R
 
Q
C
 
V
H
 
E
E
 
R
E
 
S
G
 
G
I
 
F
C
 
I
F
 
F
I
 
I
G
 
G
S
 
P
S
 
K
A
 
A
E
 
E
L
 
T
L
 
I
D
 
R
L
 
L
L
 
M
G
 
G
N
 
D
K
|
K
A
 
V
T
 
S
A
 
A
R
 
I
E
 
A
T
 
A
A
 
M
L
 
K
R
 
K
S
 
A
D
 
G
T
 
V
P
 
P
L
 
C
T
 
V
G
 
P
G
 
G
I
 
S
N
 
D
K
 
G
P
 
P
C
 
L
-
 
G
-
 
D
S
 
D
L
 
M
E
 
D
E
 
K
V
 
N
Q
 
R
A
 
A
F
 
I
F
 
A
T
 
K
S
 
R
L
 
I
G
 
G
D
 
-
G
 
-
A
 
Y
A
 
P
V
 
V
M
x
I
I
 
I
K
|
K
A
 
A
L
 
S
A
 
G
G
 
G
G
|
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
G
 
G
M
|
M
R
 
R
P
 
V
V
 
V
S
 
R
R
 
G
Y
 
D
E
 
A
D
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
S
Y
 
I
R
 
S
Q
 
M
C
 
T
R
 
R
E
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
K
I
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
S
S
 
N
G
x
D
E
 
M
L
 
V
Y
 
Y
V
 
M
E
|
E
Q
x
K
L
x
Y
V
x
L
Q
 
E
H
 
N
A
 
P
R
 
R
H
|
H
I
 
V
E
 
E
V
 
I
Q
 
Q
I
 
V
L
 
L
G
 
A
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
G
 
G
A
 
N
A
 
A
V
 
I
H
 
Y
A
 
L
W
 
A
E
 
E
R
 
R
E
 
D
C
 
C
T
 
S
L
 
M
Q
|
Q
R
 
R
R
|
R
N
x
H
Q
 
Q
K
|
K
L
 
V
L
 
V
E
 
E
I
 
E
A
 
A
P
 
P
S
 
A
P
 
P
S
 
G
L
 
I
D
 
T
D
 
P
A
 
E
T
 
L
R
 
R
M
 
R
P
 
Y
I
 
I
I
 
G
E
 
E
S
 
R
A
 
C
L
 
A
Q
 
K
L
 
A
A
 
C
S
 
V
D
 
D
V
 
I
K
 
G
Y
 
Y
Q
 
R
G
 
G
L
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
F
E
|
E
F
 
F
L
|
L
L
 
F
D
 
-
A
 
-
D
 
-
D
 
E
H
 
N
S
 
G
K
 
E
F
 
F
Y
 
Y
F
 
F
M
 
I
E
|
E
I
 
M
N
|
N
P
 
T
R
|
R
I
 
I
Q
|
Q
V
|
V
E
|
E
H
 
H
T
 
P
I
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
M
I
 
I
T
 
T
G
 
G
L
 
V
N
 
D
L
 
L
V
 
I
K
 
K
L
 
E
Q
 
Q
I
 
L
L
 
R
L
 
I
G
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
Q
T
 
P
L
 
L
A
 
S
E
 
-
L
 
I
S
 
K
L
 
Q
T
 
E
E
 
E
A
 
V
P
 
H
I
 
V
K
 
-
R
 
R
G
 
G
C
 
H
A
 
A
I
 
V
Q
 
E
A
 
C
R
|
R
I
 
I
N
 
N
L
 
A
E
 
E
Q
 
D
M
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
P
G
 
N
S
 
T
T
 
F
K
 
L
P
 
P
A
 
S
S
 
P
G
 
G
V
 
K
I
 
I
K
 
T
A
 
R
Y
 
F
Q
 
H
V
 
A
P
 
P
N
 
G
G
 
G
H
 
F
N
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
W
D
 
E
D
 
S
Y
 
H
L
 
I
Y
 
Y
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
K
 
T
V
 
V
S
 
P
P
 
P
S
 
Y
Y
 
Y
D
|
D
S
 
S
L
 
M
G
 
I
A
 
G
K
 
K
I
 
L
I
 
I
A
 
C
K
 
Y
G
 
G
E
 
E
D
 
N
F
 
R
S
 
D
A
 
V
A
 
A
L
 
I
N
 
A
K
 
R
V
 
M
Y
 
K
L
 
N
S
 
A
L
 
L
K
 
Q
A
 
E
L
 
L
N
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
I
Q
 
K
S
 
T
N
 
N
K
 
V
A
 
D
L
 
L
L
 
Q
M
 
I
N
 
R
L
 
I
L
 
M
Q
 
N
R
 
D
E
 
E
E
 
N
V
 
F
Q
 
Q
H
 
H
N
 
G
R
 
G
L
 
T
S
 
N
T
x
I
R
 
H
F
 
Y
V
 
L
E
 
E
A
 
K
H
 
K
M
 
L

Query Sequence

>5210426 Shew_2867 pyruvate carboxylase, propionyl-CoA carboxylase (RefSeq)
MTRVFNRILIANRGEIAIRIAQTCADMGIDSLAIYAEDDSQSLHTKKADQAVALKGRGVK
AYLDIEQLIAVAKAHGCDAVHPGYGFLSENSSFSKRCHEEGICFIGSSAELLDLLGNKAT
ARETALRSDTPLTGGINKPCSLEEVQAFFTSLGDGAAVMIKALAGGGGRGMRPVSRYEDL
AEAYRQCREEAIIAFGSGELYVEQLVQHARHIEVQILGDGTGAAVHAWERECTLQRRNQK
LLEIAPSPSLDDATRMPIIESALQLASDVKYQGLGTFEFLLDADDHSKFYFMEINPRIQV
EHTITEEITGLNLVKLQILLGAGKTLAELSLTEAPIKRGCAIQARINLEQMLPDGSTKPA
SGVIKAYQVPNGHNVRVDDYLYAGYKVSPSYDSLGAKIIAKGEDFSAALNKVYLSLKALN
IDGVQSNKALLMNLLQREEVQHNRLSTRFVEAHMAELLADDDHHEHFFNIASDQQETVQA
VNIPAGCEGVKSPTAGVLVQVNIESGDEVFAGQEIAVIEAMKMEIPVKSEHAGIVTEVLT
GNIGEVIDEHQILAVIQPGEVSVTGGQTEMEIDLDYIRANLAEFFDRRDKTLDESRSEAV
AKRHSEGKRTARENLNDLLDEGSFNEYGQLAIAAQRQKHAIDKLVEISPADGKITGIGTV
NADSFGEEAARCAVMSYDYTVMAGSQGLVNHKKTDRLLELCKKWKLPLVIFAEGAGGRPS
DTDYPGVAFLNLHTFSSLGELSGLVPTVGIAAGNCFAGNAALYGVCDLTIATRQASIGMA
GPAMIEGGGLGVFKPEEVGPPSVLSPNGVIDILVEDEAEAVAVTKKYLSYFQGDLSEWQV
ADQRRLRHLIPENRMAIYDIREVIDTLCDKDSVLELRREFAKNMITAMVRIEGKAYGLYA
NDPRFLGGAIDADAGDKLARFIQLCDAHDIPMISLCDTPGFMVGPESEKRATVRHISRLF
VHGANSTVPLFALVLRKGYGLGVMGMTGGGFTAPVFTASWPSGEFGAMGIEGAVRIAAKR
QLEAIADPDEREATFKAMVDKLYSHGSAINTASYLELDAVIDPMESRDWIVRGLACLPKP
EKRSGKKRNCIDTW

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory