SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 6936101 FitnessBrowser__SB2B:6936101 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 3 hits to proteins with known functional sites (download)

2e2oA Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in complex with glucose (see paper)
28% identity, 85% coverage: 40:316/327 of query aligns to 5:287/299 of 2e2oA

query
sites
2e2oA
V
 
V
G
 
G
I
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
H
 
K
C
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
A
T
 
Y
D
 
D
D
 
C
S
 
E
G
 
G
Q
 
N
V
 
F
L
 
I
G
 
G
H
 
E
G
 
G
V
 
S
A
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
G
N
 
N
P
 
Y
V
 
H
N
 
N
G
 
-
V
 
-
S
 
-
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
A
 
V
A
 
G
I
 
L
M
 
T
S
 
R
A
 
A
I
 
I
D
 
E
K
 
N
A
 
I
L
 
K
G
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
K
L
 
I
D
 
A
K
 
A
Q
 
K
Y
 
G
H
 
E
R
 
A
L
 
D
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
M
G
 
G
L
 
V
A
 
A
G
|
G
L
 
L
H
x
D
L
 
S
P
 
K
K
 
F
M
 
D
Q
 
W
Q
 
E
V
 
N
M
 
F
N
 
T
E
 
P
W
 
L
A
 
A
H
 
S
P
 
L
F
 
I
A
 
A
A
 
P
W
 
K
H
 
V
T
 
I
T
 
I
T
 
Q
D
x
H
L
x
D
H
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
F
A
 
A
H
 
E
Q
 
T
-
 
L
G
 
G
A
 
E
D
 
P
G
 
G
G
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
A
G
 
G
T
 
T
G
|
G
F
 
-
S
|
S
S
x
V
L
 
V
A
 
E
N
 
G
V
 
Y
K
 
N
G
 
G
Q
 
K
Q
 
E
I
 
F
L
 
L
-
 
R
I
 
V
G
 
G
G
|
G
H
 
R
G
 
G
F
 
W
P
 
L
I
 
L
N
 
S
A
x
D
T
 
D
C
 
G
S
 
S
G
 
A
S
 
Y
W
 
W
F
 
V
G
 
G
L
 
R
E
 
K
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
K
D
 
M
A
 
M
D
 
D
G
 
G
I
 
L
G
 
E
P
 
N
G
 
K
T
 
T
S
 
I
L
 
L
T
 
Y
G
 
N
K
 
K
L
 
V
L
 
L
Q
 
K
G
 
T
T
 
I
N
 
N
A
 
V
M
 
K
A
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
E
Q
 
L
L
 
V
M
 
M
H
 
W
A
 
S
N
 
Y
A
 
T
T
 
S
D
 
S
-
 
C
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
L
F
 
V
A
 
A
R
 
S
F
 
I
A
 
A
P
 
K
Q
 
A
V
 
V
F
 
D
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
G
 
N
A
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
T
V
 
V
S
 
A
L
 
M
S
 
D
L
 
I
I
 
L
E
 
K
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
E
F
 
L
I
 
L
-
 
A
N
 
S
G
 
Q
V
 
A
I
 
V
R
 
Y
R
 
L
L
 
A
L
 
R
A
 
K
T
 
I
G
 
G
I
 
T
D
 
N
S
 
K
L
 
V
S
 
Y
L
 
L
V
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
M
-
 
F
-
 
R
-
 
S
-
 
N
-
 
I
-
 
Y
-
 
H
-
 
K
-
 
F
-
 
F
-
 
T
A
 
L
P
 
Y
L
 
L
M
 
E
Q
 
K
P
 
E
W
 
G
L
 
I
A
 
I
P
 
S
D
 
D
L
 
L
S
 
G
T
 
K
R
 
R
I
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
S
P
 
P
E
 
E
E
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
L
 
I
F
 
L
A
 
A
R
 
Y
Q
 
K

2e2pA Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in complex with adp (see paper)
28% identity, 85% coverage: 40:316/327 of query aligns to 5:287/298 of 2e2pA

query
sites
2e2pA
V
 
V
G
 
G
I
 
V
D
 
D
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
T
H
 
K
C
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
V
L
 
A
T
 
Y
D
 
D
D
 
C
S
 
E
G
 
G
Q
 
N
V
 
F
L
 
I
G
 
G
H
 
E
G
 
G
V
 
S
A
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
G
N
 
N
P
 
Y
V
 
H
N
 
N
G
 
-
V
 
-
S
 
-
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
A
 
V
A
 
G
I
 
L
M
 
T
S
 
R
A
 
A
I
 
I
D
 
E
K
 
N
A
 
I
L
 
K
G
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
K
L
 
I
D
 
A
K
 
A
Q
 
K
Y
 
G
H
 
E
R
 
A
L
 
D
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
M
G
 
G
L
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
H
 
D
L
 
S
P
 
K
K
 
F
M
 
D
Q
 
W
Q
 
E
V
 
N
M
 
F
N
 
T
E
 
P
W
 
L
A
 
A
H
 
S
P
 
L
F
 
I
A
 
A
A
 
P
W
 
K
H
 
V
T
 
I
T
 
I
T
 
Q
D
 
H
L
 
D
H
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
F
A
 
A
H
 
E
Q
 
T
-
 
L
G
 
G
A
 
E
D
 
P
G
 
G
G
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
A
G
|
G
T
|
T
G
 
G
F
 
-
S
 
S
S
 
V
L
 
V
A
 
E
N
 
G
V
 
Y
K
 
N
G
 
G
Q
 
K
Q
 
E
I
 
F
L
 
L
-
 
R
I
 
V
G
 
G
G
 
G
H
 
R
G
 
G
F
 
W
P
 
L
I
 
L
N
 
S
A
 
D
T
 
D
C
 
G
S
 
S
G
 
A
S
 
Y
W
 
W
F
 
V
G
 
G
L
 
R
E
 
K
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
K
D
 
M
A
 
M
D
 
D
G
 
G
I
 
L
G
 
E
P
 
N
G
 
K
T
 
T
S
 
I
L
 
L
T
 
Y
G
 
N
K
 
K
L
 
V
L
 
L
Q
 
K
G
 
T
T
 
I
N
 
N
A
 
V
M
 
K
A
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
E
Q
 
L
L
 
V
M
 
M
H
 
W
A
 
S
N
 
Y
A
 
T
T
 
S
D
 
S
-
 
C
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
L
F
 
V
A
|
A
R
 
S
F
 
I
A
|
A
P
x
K
Q
 
A
V
 
V
F
x
D
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
G
 
N
A
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
T
V
 
V
S
 
A
L
 
M
S
 
D
L
 
I
I
 
L
E
 
K
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
E
F
 
L
I
 
L
-
 
A
N
 
S
G
 
Q
V
 
A
I
 
V
R
 
Y
R
 
L
L
 
A
L
 
R
A
 
K
T
 
I
G
 
G
I
 
T
D
 
N
S
 
K
L
 
V
S
 
Y
L
 
L
V
 
K
G
 
G
G
|
G
I
 
M
-
 
F
-
x
R
-
 
S
-
 
N
-
 
I
-
 
Y
-
 
H
-
 
K
-
 
F
-
 
F
-
 
T
A
 
L
P
 
Y
L
 
L
M
 
E
Q
 
K
P
 
E
W
 
G
L
 
I
A
 
I
P
 
S
D
 
D
L
 
L
S
 
G
T
 
K
R
 
R
I
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
S
P
 
P
E
 
E
E
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
L
 
I
F
 
L
A
 
A
R
 
Y
Q
 
K

2e2qA Crystal structure of sulfolobus tokodaii hexokinase in complex with xylose, mg2+, and adp (see paper)
28% identity, 85% coverage: 40:316/327 of query aligns to 5:287/297 of 2e2qA

query
sites
2e2qA
V
 
V
G
 
G
I
 
V
D
 
D
A
 
A
G
|
G
G
|
G
S
x
T
H
x
K
C
 
T
R
x
K
A
 
A
L
 
V
L
 
A
T
 
Y
D
 
D
D
 
C
S
 
E
G
 
G
Q
 
N
V
 
F
L
 
I
G
 
G
H
 
E
G
 
G
V
 
S
A
 
S
G
 
G
P
 
P
A
 
G
N
 
N
P
 
Y
V
 
H
N
 
N
G
 
-
V
 
-
S
 
-
Q
 
-
S
 
-
Q
 
-
A
 
V
A
 
G
I
 
L
M
 
T
S
 
R
A
 
A
I
 
I
D
 
E
K
 
N
A
 
I
L
 
K
G
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
K
L
 
I
D
 
A
K
 
A
Q
 
K
Y
 
G
H
 
E
R
 
A
L
 
D
I
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
M
G
 
G
L
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
H
x
D
L
 
S
P
 
K
K
 
F
M
 
D
Q
 
W
Q
 
E
V
 
N
M
 
F
N
 
T
E
 
P
W
 
L
A
 
A
H
 
S
P
 
L
F
 
I
A
 
A
A
 
P
W
 
K
H
 
V
T
 
I
T
 
I
T
 
Q
D
x
H
L
x
D
H
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
F
A
 
A
H
 
E
Q
 
T
-
 
L
G
 
G
A
 
E
D
 
P
G
 
G
G
 
V
V
 
V
I
 
V
I
 
I
L
 
A
G
|
G
T
|
T
G
|
G
F
 
-
S
|
S
S
 
V
L
 
V
A
 
E
N
 
G
V
 
Y
K
 
N
G
 
G
Q
 
K
Q
 
E
I
 
F
L
 
L
-
 
R
I
 
V
G
 
G
G
|
G
H
 
R
G
 
G
F
 
W
P
 
L
I
 
L
N
 
S
A
x
D
T
 
D
C
 
G
S
 
S
G
 
A
S
 
Y
W
 
W
F
 
V
G
 
G
L
 
R
E
 
K
A
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
K
D
 
M
A
 
M
D
 
D
G
 
G
I
 
L
G
 
E
P
 
N
G
 
K
T
 
T
S
 
I
L
 
L
T
 
Y
G
 
N
K
 
K
L
 
V
L
 
L
Q
 
K
G
 
T
T
 
I
N
 
N
A
 
V
M
 
K
A
 
D
L
 
L
A
 
D
E
 
E
Q
 
L
L
 
V
M
 
M
H
 
W
A
 
S
N
 
Y
A
 
T
T
 
S
D
 
S
-
 
C
-
 
Q
-
 
I
-
 
D
-
 
L
F
 
V
A
|
A
R
x
S
F
 
I
A
|
A
P
x
K
Q
 
A
V
 
V
F
x
D
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
G
 
N
A
 
E
G
 
G
D
 
D
A
 
T
V
 
V
S
 
A
L
 
M
S
 
D
L
 
I
I
 
L
E
 
K
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
T
 
E
F
 
L
I
 
L
-
 
A
N
 
S
G
 
Q
V
 
A
I
 
V
R
 
Y
R
 
L
L
 
A
L
 
R
A
 
K
T
 
I
G
 
G
I
 
T
D
 
N
S
 
K
L
 
V
S
 
Y
L
 
L
V
 
K
G
|
G
G
|
G
I
 
M
-
 
F
-
x
R
-
x
S
-
 
N
-
 
I
-
 
Y
-
 
H
-
 
K
-
 
F
-
 
F
-
 
T
A
 
L
P
 
Y
L
 
L
M
 
E
Q
 
K
P
 
E
W
 
G
L
 
I
A
 
I
P
 
S
D
 
D
L
 
L
S
 
G
T
 
K
R
 
R
I
 
-
R
 
-
T
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
S
 
S
P
 
P
E
 
E
E
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
L
 
I
F
 
L
A
 
A
R
 
Y
Q
 
K

Query Sequence

>6936101 FitnessBrowser__SB2B:6936101
MAACAAVHHDTQATQTGAAYAPAEQGGEPRESSASAYFWVGIDAGGSHCRALLTDDSGQV
LGHGVAGPANPVNGVSQSQAAIMSAIDKALGAARLDKQYHRLIVGAGLAGLHLPKMQQVM
NEWAHPFAAWHTTTDLHVAALGAHQGADGGVIILGTGFSSLANVKGQQILIGGHGFPINA
TCSGSWFGLEAVKAVLLDADGIGPGTSLTGKLLQGTNAMALAEQLMHANATDFARFAPQV
FEQAGAGDAVSLSLIEQGATFINGVIRRLLATGIDSLSLVGGIAPLMQPWLAPDLSTRIR
TAKASPEEGAILFARQCHVGNSRIQER

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory