SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 6936373 FitnessBrowser__SB2B:6936373 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3lkiB Crystal structure of fructokinase with bound atp from xylella fastidiosa
41% identity, 91% coverage: 1:313/343 of query aligns to 1:312/322 of 3lkiB

query
sites
3lkiB
M
 
L
S
 
K
K
 
K
R
 
T
V
 
I
L
 
L
C
 
C
F
 
F
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
F
 
M
L
 
L
C
 
A
T
 
Q
G
 
P
S
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
L
P
 
P
-
 
R
C
 
A
Y
 
F
R
 
L
Q
 
Q
Y
 
C
P
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
A
A
 
V
R
 
Q
F
 
F
A
 
V
G
 
G
L
 
M
V
 
L
G
 
G
K
 
S
D
 
D
T
 
M
F
 
F
G
 
G
D
 
D
F
 
F
L
 
L
A
 
F
N
 
D
S
 
S
L
 
F
V
 
A
R
 
E
Y
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
V
I
 
T
S
 
D
L
 
G
L
 
I
G
 
V
R
 
R
H
 
T
S
 
S
S
 
T
A
 
A
P
 
K
T
 
T
S
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
F
V
 
V
H
 
A
L
 
L
N
 
-
D
 
-
D
 
D
G
 
G
D
 
E
R
 
R
S
 
S
F
 
F
S
 
S
F
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
P
G
 
P
G
 
A
A
 
A
D
 
D
T
 
L
L
 
L
F
 
F
D
 
R
A
 
V
S
 
E
V
 
H
A
 
F
E
 
Q
A
 
D
S
 
A
W
 
S
F
 
F
E
 
S
N
 
D
T
 
A
A
 
L
V
 
I
L
 
F
H
 
H
L
 
A
C
 
C
S
 
S
N
 
N
T
 
S
L
 
M
T
 
T
T
 
D
A
 
A
Q
 
D
S
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
V
T
 
T
L
 
F
T
 
E
M
 
G
A
 
M
D
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
A
A
 
I
V
 
V
S
 
S
V
 
F
D
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
F
R
 
R
H
 
P
N
 
M
L
 
L
W
 
W
Q
 
P
G
 
N
G
 
G
A
 
E
A
 
N
C
 
P
K
 
A
A
 
S
T
 
R
V
 
L
M
 
W
S
 
K
L
 
G
V
 
L
H
 
S
K
 
L
A
 
A
H
 
D
V
 
V
L
 
V
K
 
K
F
 
L
A
 
S
Q
 
S
E
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
D
Y
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
N
S
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
A
E
 
D
P
 
A
Q
 
N
G
 
A
F
 
V
I
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
L
 
L
L
 
W
D
 
Q
S
 
G
G
 
R
C
 
A
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
L
 
L
I
 
V
T
|
T
D
|
D
G
 
A
G
 
A
N
 
G
P
 
P
I
 
V
R
 
H
A
 
W
F
 
Y
T
 
T
G
 
R
K
 
T
Q
 
A
C
 
G
L
 
G
T
 
E
L
 
V
P
 
P
V
x
T
P
 
F
K
 
R
M
 
V
D
 
Q
V
 
V
V
 
Q
D
 
D
T
 
S
T
 
N
A
|
A
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
 
A
F
|
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
M
L
 
L
H
 
Y
R
 
T
I
 
F
A
 
A
R
 
Q
D
 
Q
-
 
F
-
 
D
-
 
D
-
 
A
-
 
A
G
 
A
L
 
L
D
 
I
T
 
D
L
 
F
L
 
C
E
 
H
S
 
D
E
 
P
T
 
E
T
 
S
F
 
I
K
 
V
D
 
S
A
 
T
L
 
L
G
 
R
F
 
F
A
 
A
I
x
A
G
 
A
C
 
V
G
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
R
P
 
Q
G
 
G
A
 
A
F
 
F
P
 
T
A
 
A
L
 
M
P
 
P
G
 
M
L
 
L
A
 
S
E
 
E

5eynA Crystal structure of fructokinase from vibrio cholerae o395 in fructose, adp, beryllium trifluoride and calcium ion bound form
35% identity, 92% coverage: 4:317/343 of query aligns to 3:304/306 of 5eynA

query
sites
5eynA
R
 
R
V
 
V
L
 
W
C
 
L
F
 
T
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
|
D
F
 
L
L
 
I
C
 
P
T
 
D
G
 
G
S
 
Q
D
 
Q
E
 
H
D
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
P
 
-
C
 
-
Y
 
Y
R
 
L
Q
 
K
Y
 
C
P
 
P
G
 
G
G
|
G
A
|
A
P
 
P
A
 
A
N
|
N
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
L
G
 
S
G
 
G
Q
 
R
A
 
S
R
 
A
F
 
F
A
 
F
G
 
G
L
 
R
V
 
V
G
 
G
K
 
N
D
 
D
T
 
P
F
 
F
G
 
G
D
 
R
F
 
F
L
 
M
A
 
Q
N
 
Q
S
 
T
L
 
L
V
 
T
R
 
D
Y
 
E
G
 
Q
V
 
V
D
 
D
I
 
C
S
 
Q
L
 
H
L
 
L
G
 
H
R
 
F
H
 
D
S
 
P
S
 
V
A
 
H
P
 
R
T
 
T
S
 
S
L
 
T
A
 
V
F
 
V
V
 
V
H
 
D
L
 
L
N
 
D
D
 
E
D
x
H
G
 
G
D
 
E
R
 
R
S
 
S
F
|
F
S
 
T
F
|
F
Y
 
M
R
 
V
D
 
K
G
 
P
G
 
S
A
 
A
D
 
D
T
 
Q
L
 
F
F
 
L
D
 
Q
A
 
L
S
 
S
V
 
-
A
 
-
E
 
D
A
 
I
S
 
P
W
 
S
F
 
F
E
 
Q
N
 
K
T
 
G
A
 
E
V
 
W
L
 
L
H
 
H
L
 
V
C
 
C
S
 
S
N
 
I
T
 
A
L
 
L
T
 
A
T
 
N
A
 
Q
Q
 
P
S
 
S
A
 
R
E
 
S
A
 
S
T
 
T
L
 
F
T
 
A
M
 
A
A
 
I
D
 
A
R
 
Q
A
 
M
V
 
K
A
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
G
A
 
Y
V
 
V
S
 
S
V
 
F
D
 
D
V
 
P
N
 
N
L
 
L
R
|
R
H
 
E
N
 
E
L
 
V
W
 
W
Q
 
S
G
 
E
G
 
P
A
 
Q
A
 
E
C
 
L
K
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
V
M
 
M
S
 
R
L
 
A
V
 
V
H
 
G
K
 
L
A
 
A
H
 
D
V
 
V
L
 
V
K
 
K
F
 
F
A
 
S
Q
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
Q
Y
 
F
L
 
L
A
 
T
G
 
G
S
 
T
E
 
Q
P
 
S
-
 
I
Q
 
E
G
 
E
F
 
G
I
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
I
L
 
A
D
 
D
S
 
F
G
 
Q
C
 
I
K
 
P
L
 
L
L
 
V
L
 
V
I
 
V
T
|
T
D
 
L
G
|
G
G
x
A
N
 
K
P
 
G
I
 
A
R
 
L
A
 
V
F
 
A
T
 
T
G
 
P
K
 
N
Q
 
S
C
 
Q
L
 
Q
T
 
I
L
 
V
P
 
S
V
 
G
P
 
K
K
x
A
M
x
V
D
 
K
V
 
P
V
 
I
D
 
D
T
|
T
T
 
T
A
x
G
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
 
A
F
|
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
Y
R
 
R
-
 
L
-
 
S
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
D
 
D
G
 
-
L
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
W
E
 
H
S
 
N
E
 
Q
T
 
A
T
 
T
F
 
I
K
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
G
 
K
F
 
W
A
 
A
I
x
N
G
 
G
C
 
C
G
|
G
A
|
A
L
 
L
A
 
A
V
 
T
S
 
T
R
 
Q
P
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
M
P
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
N
L
 
Q
A
 
A
E
 
A
A
 
L
E
 
Y
A
 
A
F
 
F

5yggA Crystal structure of fructokinase double-mutant (t261c-h108c) from vibrio cholerae o395 in fructose, adp and potassium ion bound form (see paper)
35% identity, 92% coverage: 4:317/343 of query aligns to 7:308/310 of 5yggA

query
sites
5yggA
R
 
R
V
 
V
L
 
W
C
 
L
F
 
T
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
|
D
F
 
L
L
 
I
C
 
P
T
 
D
G
 
G
S
 
Q
D
 
Q
E
 
H
D
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
P
 
-
C
 
-
Y
 
Y
R
 
L
Q
 
K
Y
 
C
P
 
P
G
 
G
G
|
G
A
|
A
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
L
G
 
S
G
 
G
Q
 
R
A
 
S
R
 
A
F
 
F
A
 
F
G
 
G
L
 
R
V
 
V
G
 
G
K
 
N
D
 
D
T
 
P
F
 
F
G
 
G
D
 
R
F
 
F
L
 
M
A
 
Q
N
 
Q
S
 
T
L
 
L
V
 
T
R
 
D
Y
 
E
G
 
Q
V
 
V
D
 
D
I
 
C
S
 
Q
L
 
H
L
 
L
G
 
H
R
 
F
H
 
D
S
 
P
S
 
V
A
 
H
P
 
R
T
 
T
S
 
S
L
 
T
A
 
V
F
 
V
V
 
V
H
 
D
L
 
L
N
 
D
D
 
E
D
 
C
G
 
G
D
 
E
R
 
R
S
 
S
F
|
F
S
 
T
F
|
F
Y
 
M
R
 
V
D
 
K
G
 
P
G
 
S
A
 
A
D
 
D
T
 
Q
L
 
F
F
 
L
D
 
Q
A
 
L
S
 
S
V
 
-
A
 
-
E
 
D
A
 
I
S
 
P
W
 
S
F
 
F
E
 
Q
N
 
K
T
 
G
A
 
E
V
 
W
L
 
L
H
 
H
L
 
V
C
 
C
S
 
S
N
 
I
T
 
A
L
 
L
T
 
A
T
 
N
A
 
Q
Q
 
P
S
 
S
A
 
R
E
 
S
A
 
S
T
 
T
L
 
F
T
 
A
M
 
A
A
 
I
D
 
A
R
 
Q
A
 
M
V
 
K
A
 
E
A
 
V
G
 
G
L
 
G
A
 
Y
V
 
V
S
 
S
V
 
F
D
 
D
V
 
P
N
 
N
L
 
L
R
|
R
H
 
E
N
 
E
L
 
V
W
 
W
Q
 
S
G
 
E
G
 
P
A
 
Q
A
 
E
C
 
L
K
 
Q
A
 
A
T
 
T
V
 
V
M
 
M
S
 
R
L
 
A
V
 
V
H
 
G
K
 
L
A
 
A
H
 
D
V
 
V
L
 
V
K
|
K
F
 
F
A
 
S
Q
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
Q
Y
 
F
L
 
L
A
 
T
G
 
G
S
 
T
E
 
Q
P
 
S
-
 
I
Q
 
E
G
 
E
F
 
G
I
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
L
 
I
L
 
A
D
 
D
S
 
F
G
 
Q
C
 
I
K
 
P
L
 
L
L
 
V
L
 
V
I
 
V
T
|
T
D
 
L
G
|
G
G
 
A
N
 
K
P
 
G
I
 
A
R
 
L
A
 
V
F
 
A
T
 
T
G
 
P
K
 
N
Q
 
S
C
 
Q
L
 
Q
T
 
I
L
 
V
P
 
S
V
 
G
P
 
K
K
x
A
M
x
V
D
 
K
V
 
P
V
 
I
D
 
D
T
 
C
T
 
T
A
 
G
G
 
A
G
 
G
D
|
D
G
 
A
F
|
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
Y
R
 
R
-
 
L
-
 
S
I
 
V
A
 
A
R
 
Q
D
 
D
G
 
-
L
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
W
E
 
H
S
 
N
E
 
Q
T
 
A
T
 
T
F
 
I
K
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
V
G
 
K
F
 
W
A
 
A
I
x
N
G
 
G
C
 
C
G
|
G
A
|
A
L
 
L
A
 
A
V
 
T
S
 
T
R
 
Q
P
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
M
P
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
N
L
 
Q
A
 
A
E
 
A
A
 
L
E
 
Y
A
 
A
F
 
F

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
33% identity, 93% coverage: 3:320/343 of query aligns to 5:309/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
K
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
W
C
 
V
F
 
I
G
 
G
E
 
D
A
 
A
L
 
S
I
 
V
D
|
D
F
 
L
L
 
V
C
 
P
T
 
E
G
 
K
S
 
Q
D
 
N
E
 
S
D
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
P
 
-
C
 
-
Y
 
Y
R
 
L
Q
 
K
Y
 
C
P
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
P
 
S
A
 
A
N
 
N
A
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
C
V
 
V
A
 
A
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
C
R
 
G
F
 
F
A
 
I
G
 
G
L
 
C
V
 
L
G
 
G
K
 
D
D
 
D
T
 
D
F
 
A
G
 
G
D
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
R
N
 
Q
S
 
V
L
 
F
V
 
Q
R
 
D
Y
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
S
 
T
L
 
F
L
 
L
G
 
R
R
 
L
H
 
D
S
 
A
S
 
D
A
 
L
P
 
T
T
 
S
S
 
A
L
 
V
A
 
L
F
 
I
V
 
V
H
 
N
L
 
L
N
 
T
D
 
A
D
 
D
G
 
G
D
 
E
R
 
R
S
 
S
F
 
F
S
 
T
F
x
Y
Y
 
L
R
 
V
D
 
H
G
 
P
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
Y
F
 
-
D
 
-
A
 
V
S
 
S
V
 
P
A
 
Q
E
 
D
A
 
L
S
 
P
W
 
P
F
 
F
E
 
R
N
 
Q
T
 
Y
A
 
E
V
 
W
L
 
F
H
 
Y
L
 
F
C
 
S
S
 
S
N
 
I
T
 
G
L
 
L
T
 
T
T
 
D
A
 
R
Q
 
P
S
 
A
A
 
R
E
 
E
A
 
A
T
 
C
L
 
L
T
 
E
M
 
G
A
 
A
D
 
R
R
 
R
A
 
M
V
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
G
A
 
Y
V
 
V
S
 
L
V
 
F
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
|
R
H
 
S
N
 
K
L
 
M
W
 
W
Q
 
G
G
 
N
G
 
T
A
 
D
A
 
E
C
 
I
K
 
P
A
 
E
T
 
L
V
 
I
M
 
A
S
 
R
L
 
S
V
x
A
H
x
A
K
 
L
A
|
A
H
 
S
V
 
I
L
 
C
K
 
K
F
 
V
A
 
S
Q
 
A
E
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
C
Y
 
Q
L
 
L
A
 
S
G
 
G
-
 
A
S
 
S
E
 
H
P
 
W
Q
 
Q
G
 
D
F
 
A
I
 
R
Q
 
Y
Q
 
Y
L
 
L
L
 
R
D
 
D
S
 
L
G
|
G
C
 
C
K
 
D
L
 
T
L
 
T
L
 
I
I
 
I
T
 
S
D
 
L
G
 
G
G
 
A
N
 
D
P
 
G
I
 
A
R
 
L
A
 
L
F
 
I
T
 
T
G
 
A
K
 
E
Q
 
G
C
 
E
L
 
F
T
 
H
L
 
F
P
 
P
V
 
A
P
 
P
K
 
R
M
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
D
|
D
T
 
T
T
|
T
A
 
G
G
 
A
G
 
G
D
|
D
G
 
A
F
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
F
R
 
T
I
 
L
A
 
S
R
 
R
-
 
A
D
 
N
G
 
C
L
 
W
D
 
D
T
 
H
L
 
A
L
 
L
E
 
L
S
 
A
E
 
E
T
 
-
T
 
-
F
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
I
G
 
S
F
 
N
A
 
A
I
 
N
G
 
A
C
 
C
G
 
G
A
 
A
L
 
M
A
|
A
V
 
V
S
 
T
R
x
A
P
 
K
G
|
G
A
 
A
F
 
M
P
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
F
L
 
P
A
 
D
E
 
Q
A
 
L
E
 
N
A
 
T
F
 
F
Q
 
L
A
 
S
S
 
S

1tz3A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase complexed with aminoimidazole riboside (see paper)
32% identity, 93% coverage: 3:320/343 of query aligns to 1:298/299 of 1tz3A

query
sites
1tz3A
K
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
W
C
 
V
F
 
I
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
x
S
I
 
V
D
|
D
F
 
L
L
 
V
C
 
P
T
 
E
G
 
K
S
 
Q
D
 
N
E
 
S
D
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
P
 
-
C
 
-
Y
 
Y
R
 
L
Q
 
K
Y
x
C
P
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
P
 
S
A
 
A
N
 
N
A
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
C
V
 
V
A
 
A
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
C
R
 
G
F
 
F
A
 
I
G
 
G
L
 
C
V
 
L
G
 
G
K
 
D
D
 
D
T
 
D
F
 
A
G
 
G
D
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
R
N
 
Q
S
 
V
L
 
F
V
 
Q
R
 
D
Y
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
S
 
T
L
 
F
L
 
L
G
 
R
R
 
L
H
 
D
S
 
A
S
 
D
A
 
L
P
 
T
T
 
S
S
 
A
L
 
V
A
x
L
F
 
I
V
 
V
H
 
N
L
 
-
N
 
-
D
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
S
F
|
F
S
 
T
F
x
Y
Y
 
L
R
 
V
D
 
H
G
 
P
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
Y
F
 
-
D
 
-
A
 
V
S
 
S
V
 
P
A
 
Q
E
 
D
A
 
L
S
 
P
W
 
P
F
 
F
E
 
R
N
 
Q
T
 
Y
A
 
E
V
 
W
L
 
F
H
 
Y
L
 
F
C
 
S
S
 
S
N
 
I
T
 
G
L
 
L
T
 
T
T
 
D
A
 
R
Q
 
P
S
 
A
A
 
R
E
 
E
A
 
A
T
 
C
L
 
L
T
 
E
M
 
G
A
 
A
D
 
R
R
 
R
A
 
M
V
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
G
A
 
Y
V
 
V
S
 
L
V
 
F
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
|
R
H
 
S
N
 
K
L
x
M
W
 
W
Q
 
G
G
 
N
G
 
T
A
 
D
A
 
E
C
 
I
K
 
P
A
 
E
T
 
L
V
 
I
M
 
A
S
 
R
L
 
S
V
 
A
H
 
A
K
 
L
A
 
A
H
 
S
V
 
I
L
 
C
K
 
K
F
 
V
A
 
S
Q
 
A
E
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
C
Y
 
Q
L
 
L
A
 
S
G
 
G
-
 
A
S
 
S
E
 
H
P
 
W
Q
 
Q
G
 
D
F
 
A
I
 
R
Q
 
Y
Q
 
Y
L
 
L
L
 
R
D
 
D
S
 
L
G
 
G
C
 
C
K
 
D
L
 
T
L
 
T
L
 
I
I
 
I
T
 
S
D
 
L
G
 
G
G
 
A
N
 
D
P
 
G
I
 
A
R
 
L
A
 
L
F
 
I
T
 
T
G
 
A
K
 
E
Q
 
G
C
 
E
L
 
F
T
 
H
L
 
F
P
 
P
V
 
A
P
 
P
K
 
R
M
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
A
x
G
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
 
A
F
 
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
F
R
 
T
I
 
L
A
 
S
R
 
R
-
 
A
D
 
N
G
 
C
L
 
W
D
 
D
T
 
H
L
 
A
L
 
L
E
 
L
S
 
A
E
 
E
T
 
-
T
 
-
F
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
I
G
 
S
F
 
N
A
 
A
I
 
N
G
 
A
C
 
C
G
 
G
A
 
A
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
A
P
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
M
P
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
F
L
 
P
A
 
D
E
 
Q
A
 
L
E
 
N
A
 
T
F
 
F
Q
 
L
A
 
S
S
 
S

1tz6A Crystal structure of aminoimidazole riboside kinase from salmonella enterica complexed with aminoimidazole riboside and atp analog (see paper)
32% identity, 90% coverage: 3:309/343 of query aligns to 1:287/297 of 1tz6A

query
sites
1tz6A
K
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
W
C
 
V
F
 
I
G
 
G
E
x
D
A
 
A
L
 
S
I
 
V
D
|
D
F
 
L
L
 
V
C
 
P
T
 
E
G
 
K
S
 
Q
D
 
N
E
 
S
D
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
P
 
-
C
 
-
Y
 
Y
R
 
L
Q
 
K
Y
x
C
P
 
P
G
 
G
G
|
G
A
 
A
P
 
S
A
 
A
N
 
N
A
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
C
V
 
V
A
 
A
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
A
 
C
R
 
G
F
 
F
A
 
I
G
 
G
L
 
C
V
 
L
G
 
G
K
 
D
D
 
D
T
 
D
F
 
A
G
 
G
D
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
R
N
 
Q
S
 
V
L
 
F
V
 
Q
R
 
D
Y
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
S
 
T
L
 
F
L
 
L
G
 
R
R
 
L
H
 
D
S
 
A
S
 
D
A
 
L
P
 
T
T
 
S
S
 
A
L
 
V
A
 
L
F
 
I
V
 
V
H
 
N
L
 
-
N
 
-
D
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
S
 
S
F
|
F
S
 
T
F
x
Y
Y
 
L
R
 
V
D
 
H
G
 
P
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
Y
F
 
-
D
 
-
A
 
V
S
 
S
V
 
P
A
 
Q
E
 
D
A
 
L
S
 
P
W
 
P
F
 
F
E
 
R
N
 
Q
T
 
Y
A
 
E
V
 
W
L
 
F
H
 
Y
L
 
F
C
 
S
S
 
S
N
 
I
T
 
G
L
 
L
T
 
T
T
 
D
A
 
R
Q
 
P
S
 
A
A
 
R
E
 
E
A
 
A
T
 
C
L
 
L
T
 
E
M
 
G
A
 
A
D
 
R
R
 
R
A
 
M
V
 
R
A
 
E
A
 
A
G
 
G
L
 
G
A
 
Y
V
 
V
S
 
L
V
 
F
D
 
D
V
 
V
N
|
N
L
 
L
R
|
R
H
 
S
N
 
K
L
x
M
W
 
W
Q
 
G
G
 
N
G
 
T
A
 
D
A
 
E
C
 
I
K
 
P
A
 
E
T
 
L
V
 
I
M
 
A
S
 
R
L
 
S
V
 
A
H
 
A
K
 
L
A
 
A
H
 
S
V
 
I
L
 
C
K
|
K
F
 
V
A
 
S
Q
 
A
E
 
D
E
|
E
L
 
L
E
 
C
Y
 
Q
L
 
L
A
 
S
G
 
G
-
 
A
S
 
S
E
 
H
P
 
W
Q
 
Q
G
 
D
F
 
A
I
 
R
Q
 
Y
Q
 
Y
L
 
L
L
 
R
D
 
D
S
 
L
G
 
G
C
 
C
K
 
D
L
 
T
L
 
T
L
 
I
I
 
I
T
x
S
D
 
L
G
|
G
G
x
A
N
 
D
P
x
G
I
 
A
R
 
L
A
 
L
F
 
I
T
 
T
G
 
A
K
 
E
Q
 
G
C
 
E
L
 
F
T
 
H
L
 
F
P
 
P
V
 
A
P
 
P
K
 
R
M
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
A
x
G
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
 
A
F
|
F
I
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
F
R
 
T
I
 
L
A
 
S
R
 
R
-
 
A
D
 
N
G
 
C
L
 
W
D
 
D
T
 
H
L
 
A
L
 
L
E
 
L
S
 
A
E
 
E
T
 
-
T
 
-
F
 
-
K
 
-
D
 
-
A
 
A
L
 
I
G
 
S
F
 
N
A
 
A
I
x
N
G
 
A
C
 
C
G
|
G
A
|
A
L
 
M
A
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
A
P
 
K
G
 
G
A
 
A
F
 
M
P
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P

3gbuA Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with atp
29% identity, 76% coverage: 5:266/343 of query aligns to 2:252/302 of 3gbuA

query
sites
3gbuA
V
 
I
L
 
A
C
 
S
F
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
I
 
I
D
 
D
F
 
L
L
 
I
C
 
S
T
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
E
E
 
E
D
 
G
D
 
D
G
 
L
L
 
K
M
 
D
L
 
V
P
 
R
C
 
L
Y
 
F
R
 
E
Q
 
K
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
S
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
V
Q
 
K
A
 
S
R
 
S
F
 
L
A
 
I
G
 
S
L
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
N
D
 
D
T
 
P
F
 
F
G
 
G
D
 
E
F
 
Y
L
 
L
A
 
I
N
 
E
S
 
E
L
 
L
V
 
S
R
 
K
Y
 
E
G
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
T
S
 
R
L
 
G
L
 
I
G
 
V
R
 
K
H
 
D
S
 
E
S
 
K
A
 
K
P
 
H
T
 
T
S
 
G
L
 
I
A
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
Q
L
 
L
N
 
K
D
 
-
D
 
G
G
 
A
D
 
S
R
 
P
S
 
S
F
 
F
S
 
L
F
 
L
Y
 
Y
R
 
D
D
 
D
G
 
V
G
 
A
A
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
Y
F
 
F
D
 
N
A
 
M
S
 
T
V
 
L
A
 
N
E
 
D
A
 
I
S
 
N
W
 
W
-
 
D
-
 
I
F
 
V
E
 
E
N
 
E
T
 
A
A
 
K
V
 
I
L
 
V
H
 
N
L
 
F
C
 
G
S
 
S
N
 
V
T
 
I
L
 
L
T
 
A
T
 
R
A
 
N
Q
 
P
S
 
S
A
 
R
E
 
E
A
 
T
T
 
V
L
 
M
T
 
K
M
 
V
A
 
I
D
 
K
R
 
K
A
 
I
V
 
K
A
 
G
A
 
S
G
 
S
L
 
L
A
 
-
V
 
I
S
 
A
V
 
F
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
H
 
L
N
 
D
L
 
L
W
 
W
Q
 
R
G
 
G
G
 
Q
A
 
E
A
 
E
C
 
E
K
 
M
A
 
I
T
 
K
V
 
V
M
 
L
S
 
E
L
 
E
-
 
S
V
 
I
H
 
K
K
 
L
A
 
A
H
 
D
V
 
I
L
 
V
K
|
K
F
 
A
A
 
S
Q
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
V
E
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
E
P
 
N
Q
 
Q
G
 
G
F
 
V
I
 
E
Q
 
V
Q
 
K
L
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
G
C
 
S
K
 
M
L
 
L
L
 
T
L
 
A
I
 
I
T
|
T
D
 
L
G
|
G
G
 
P
N
 
K
P
 
G
I
 
F
R
 
R
A
 
L
F
 
I
T
 
K
G
 
N
K
 
E
Q
 
T
C
 
V
L
 
V
T
 
D
L
 
V
P
 
P
V
 
S
P
 
Y
K
 
N
M
x
V
D
 
N
V
x
P
V
 
L
D
 
D
T
 
T
T
 
T
A
x
G
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
 
A
F
 
F
I
 
M
G
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3ih0A Crystal structure of an uncharacterized sugar kinase ph1459 from pyrococcus horikoshii in complex with amp-pnp
29% identity, 76% coverage: 5:266/343 of query aligns to 3:253/304 of 3ih0A

query
sites
3ih0A
V
 
I
L
 
A
C
 
S
F
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
L
L
 
L
I
 
I
D
 
D
F
 
L
L
 
I
C
 
S
T
 
V
G
 
-
S
 
-
D
 
E
E
 
E
D
 
G
D
 
D
G
 
L
L
 
K
M
 
D
L
 
V
P
 
R
C
 
L
Y
 
F
R
 
E
Q
 
K
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
N
 
N
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
S
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
V
Q
 
K
A
 
S
R
 
S
F
 
L
A
 
I
G
 
S
L
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
N
D
 
D
T
 
P
F
 
F
G
 
G
D
 
E
F
 
Y
L
 
L
A
 
I
N
 
E
S
 
E
L
 
L
V
 
S
R
 
K
Y
 
E
G
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
T
S
 
R
L
 
G
L
 
I
G
 
V
R
 
K
H
 
D
S
 
E
S
 
K
A
 
K
P
 
H
T
 
T
S
 
G
L
 
I
A
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
Q
L
 
L
N
 
K
D
 
-
D
 
G
G
 
A
D
 
S
R
 
P
S
 
S
F
 
F
S
 
L
F
 
L
Y
 
Y
R
 
D
D
 
D
G
 
V
G
 
A
A
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
Y
F
 
F
D
 
N
A
 
M
S
 
T
V
 
L
A
 
N
E
 
D
A
 
I
S
 
N
W
 
W
-
 
D
-
 
I
F
 
V
E
 
E
N
 
E
T
 
A
A
 
K
V
 
I
L
 
V
H
 
N
L
 
F
C
 
G
S
 
S
N
 
V
T
 
I
L
 
L
T
 
A
T
 
R
A
 
N
Q
 
P
S
 
S
A
 
R
E
 
E
A
 
T
T
 
V
L
 
M
T
 
K
M
 
V
A
 
I
D
 
K
R
 
K
A
 
I
V
 
K
A
 
G
A
 
S
G
 
S
L
 
L
A
 
-
V
 
I
S
 
A
V
 
F
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
R
 
R
H
 
L
N
 
D
L
 
L
W
 
W
Q
 
R
G
 
G
G
 
Q
A
 
E
A
 
E
C
 
E
K
 
M
A
 
I
T
 
K
V
 
V
M
 
L
S
 
E
L
 
E
-
 
S
V
 
I
H
 
K
K
 
L
A
 
A
H
 
D
V
 
I
L
 
V
K
 
K
F
 
A
A
 
S
Q
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
V
E
 
L
Y
 
Y
L
 
L
A
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
E
P
 
N
Q
 
Q
G
 
G
F
 
V
I
 
E
Q
 
V
Q
 
K
L
 
-
L
 
-
D
 
-
S
 
-
G
 
G
C
 
S
K
 
M
L
 
L
L
 
T
L
 
A
I
 
I
T
|
T
D
 
L
G
|
G
G
 
P
N
 
K
P
 
G
I
 
F
R
 
R
A
 
L
F
 
I
T
 
K
G
 
N
K
 
E
Q
 
T
C
 
V
L
 
V
T
 
D
L
 
V
P
 
P
V
 
S
P
 
Y
K
 
N
M
x
V
D
 
N
V
 
P
V
 
L
D
 
D
T
 
T
T
 
T
A
x
G
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
 
A
F
 
F
I
 
M
G
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

4wjmA Crystal structure of fructokinase from brucella abortus 2308 with bound amppnp
31% identity, 88% coverage: 5:306/343 of query aligns to 8:306/312 of 4wjmA

query
sites
4wjmA
V
 
I
L
 
L
C
 
C
F
 
C
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
F
 
M
L
 
L
-
 
P
-
 
R
-
 
E
C
 
T
T
 
T
G
 
G
S
 
G
D
 
E
E
 
T
D
 
-
D
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
-
P
 
-
C
 
A
Y
 
F
R
 
Q
Q
 
P
Y
 
F
P
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
S
P
 
V
A
 
F
N
 
N
A
 
T
A
 
A
V
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
G
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
V
Q
 
P
A
 
T
R
 
G
F
 
F
A
 
F
G
 
S
L
 
G
V
 
I
G
 
S
K
 
S
D
 
D
T
 
F
F
 
F
G
 
G
D
 
D
F
 
V
L
 
L
A
 
R
N
 
D
S
 
T
L
 
L
V
 
A
R
 
R
Y
 
S
G
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
Y
S
 
S
L
 
F
L
 
A
G
 
A
R
 
I
H
 
-
S
 
S
S
 
N
A
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
T
L
 
L
A
 
A
F
 
F
V
 
V
H
 
R
L
 
L
N
 
V
D
 
D
D
 
-
G
 
G
D
 
Q
R
 
A
S
 
R
F
 
Y
S
 
A
F
 
F
Y
 
Y
R
 
D
D
 
E
G
 
N
G
 
T
A
 
A
D
 
G
T
 
R
L
 
M
F
 
L
D
 
-
A
 
-
S
 
S
V
 
R
A
 
N
E
 
D
A
 
M
S
 
P
W
 
Y
F
 
V
E
 
D
N
 
E
T
 
T
-
 
I
-
 
S
A
 
A
V
 
M
L
 
L
H
 
F
L
 
G
C
 
C
S
 
I
N
 
-
T
 
S
L
 
L
T
 
I
T
 
S
A
 
E
Q
 
P
S
 
C
A
 
G
E
 
S
A
 
V
T
 
Y
L
 
E
T
 
T
M
 
L
A
 
L
D
 
A
R
 
R
A
 
E
V
 
-
A
 
A
A
 
P
G
 
N
L
 
R
A
 
V
V
 
M
S
 
F
V
 
L
D
 
D
V
 
P
N
 
N
L
 
I
R
 
R
H
 
A
N
 
N
L
 
L
W
 
I
Q
 
T
G
 
V
G
 
R
A
 
K
A
 
T
C
 
H
K
 
L
A
 
T
T
 
R
V
 
M
M
 
K
S
 
R
L
 
M
V
 
I
H
 
A
K
 
L
A
 
A
H
 
D
V
 
I
L
 
V
K
 
K
F
 
L
A
 
S
Q
 
D
E
 
E
E
 
D
L
 
L
E
 
D
Y
 
W
L
 
F
A
 
G
-
 
E
-
 
K
G
 
G
S
 
S
E
 
H
P
 
D
Q
 
E
G
 
-
F
 
I
I
 
A
Q
 
A
Q
 
E
L
 
W
L
 
L
D
 
K
S
 
L
G
 
G
C
 
P
K
 
K
L
 
L
L
 
V
L
 
V
I
 
I
T
|
T
D
 
K
G
|
G
G
x
A
N
 
H
P
x
G
I
 
A
R
 
V
A
 
A
F
 
Y
T
 
T
G
 
N
K
 
H
Q
 
A
C
 
T
L
 
V
T
 
P
L
 
V
P
 
P
V
 
G
P
 
V
K
 
K
M
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
V
A
x
G
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
 
T
F
x
V
I
 
N
G
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
L
H
 
A
R
 
S
I
 
L
A
 
H
R
 
S
D
 
Q
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
T
-
 
K
D
 
D
T
 
A
L
 
L
L
 
A
E
 
N
-
 
L
S
 
S
E
 
E
T
 
D
T
 
Q
F
 
I
K
 
H
D
 
S
A
 
A
L
 
V
G
 
A
F
 
L
A
 
G
I
x
V
G
 
R
C
 
A
G
x
A
A
 
A
L
 
V
A
 
T
V
 
V
S
 
S
R
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
N
P
 
P

Q9M394 Fructokinase-like 1, chloroplastic; PEP-associated protein 6; pfkB-type carbohydrate kinase family protein 2 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
23% identity, 89% coverage: 5:309/343 of query aligns to 104:453/471 of Q9M394

query
sites
Q9M394
V
 
V
L
x
C
C
|
C
F
 
F
G
 
G
E
 
A
A
 
V
L
 
Q
I
 
K
D
 
E
F
 
F
L
 
V
C
 
P
T
 
V
G
 
V
S
 
R
D
 
V
E
 
H
D
 
D
D
 
N
G
 
P
L
 
M
M
 
H
L
 
P
P
 
D
C
 
M
Y
 
Y
R
 
S
Q
 
Q
Y
 
W
-
 
K
-
 
M
-
 
L
-
 
Q
-
 
W
-
 
D
-
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
F
-
 
G
-
 
R
-
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
P
P
 
P
A
 
S
N
 
N
A
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
S
V
 
H
A
 
V
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
R
 
A
F
 
F
A
 
M
G
 
G
L
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
E
D
 
D
T
 
D
F
 
F
G
 
G
D
 
D
F
 
E
L
 
L
A
 
V
N
 
L
S
 
M
L
 
M
V
 
N
R
 
Q
Y
 
E
G
 
R
V
 
V
D
 
Q
I
 
T
S
 
R
L
 
A
L
 
V
G
 
K
R
 
F
H
 
D
S
 
E
S
 
N
A
 
S
P
 
K
T
 
T
S
 
A
L
 
C
A
 
T
F
 
R
V
 
V
H
 
K
L
 
I
N
 
K
-
 
F
D
 
K
D
 
D
G
 
G
D
 
K
R
 
M
S
 
M
F
 
A
S
 
E
F
 
T
Y
 
V
R
 
K
D
 
E
G
 
P
G
 
P
A
 
E
D
 
D
T
 
S
L
 
L
F
 
F
D
 
-
A
 
A
S
 
S
V
 
E
A
 
L
E
 
N
A
 
L
S
 
A
W
 
V
F
 
L
E
 
K
N
 
E
T
 
A
A
 
R
V
 
I
L
 
F
H
 
H
L
 
F
C
 
N
S
 
S
N
 
E
T
 
V
L
 
L
T
 
T
T
 
S
A
 
P
Q
 
T
S
 
M
A
 
Q
E
 
S
A
 
T
T
 
L
L
 
F
T
 
T
M
 
A
A
 
I
D
 
Q
R
 
W
A
 
S
V
 
K
A
 
K
A
 
F
G
 
G
L
 
G
A
 
L
V
 
I
S
 
F
V
 
F
D
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
R
 
P
H
 
L
N
 
P
L
 
L
W
 
W
Q
 
R
G
 
S
G
 
R
A
 
N
A
 
E
C
 
T
K
 
R
A
 
K
T
 
L
V
 
I
M
 
K
S
 
K
L
 
A
V
 
W
H
 
N
K
 
E
A
 
A
H
 
N
V
 
I
L
 
I
K
 
E
F
 
V
A
 
S
Q
 
Q
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
A
 
L
G
 
D
S
 
E
E
 
D
-
 
Y
-
 
Y
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
N
-
 
Y
-
 
T
P
 
P
Q
 
Q
G
 
Y
F
 
F
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
D
-
 
Q
-
 
T
-
 
K
-
 
N
-
 
R
-
 
R
-
 
D
-
 
Y
-
 
Y
-
 
H
-
 
Y
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
E
I
 
I
Q
 
K
Q
 
S
L
 
L
L
 
W
D
 
H
S
 
D
G
 
K
C
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
L
L
 
V
I
 
V
T
 
T
D
 
D
G
 
G
G
 
T
N
 
L
P
 
R
I
 
L
R
 
H
A
 
Y
F
 
Y
T
 
T
-
 
P
-
 
T
-
 
F
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
I
-
 
G
G
 
T
K
 
E
Q
 
D
C
 
V
L
 
L
T
 
I
L
 
T
P
 
P
V
 
F
P
 
-
K
 
-
M
 
-
D
 
-
V
 
T
V
 
C
D
 
D
T
 
R
T
 
T
A
 
G
G
 
S
G
 
G
D
 
D
G
 
A
F
 
V
I
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
I
L
 
M
H
 
R
R
 
K
I
 
L
A
 
T
R
 
-
D
 
-
G
 
T
L
 
C
D
 
P
T
 
E
L
 
M
L
 
F
E
 
E
S
 
D
E
 
Q
T
 
D
T
 
V
F
 
M
K
 
E
D
 
R
A
 
Q
L
 
L
G
 
R
F
 
F
A
 
A
I
 
V
G
 
A
C
 
A
G
 
G
A
 
I
L
 
I
A
 
A
V
 
Q
S
 
W
R
 
T
P
 
I
G
 
G
A
 
A
F
 
V
P
 
R
A
 
G
L
 
F
P
 
P

8cqxA Ribokinase from t.Sp mutant a92g
28% identity, 84% coverage: 31:317/343 of query aligns to 31:297/300 of 8cqxA

query
sites
8cqxA
Y
 
Y
R
 
Q
Q
 
T
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
K
P
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
R
 
R
F
 
M
A
 
L
G
 
G
L
 
R
V
 
V
G
 
G
K
 
E
D
 
D
T
 
P
F
 
F
G
 
G
D
 
Q
F
 
A
L
 
L
A
 
K
N
 
S
S
 
G
L
 
L
V
 
A
R
 
Q
Y
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
S
 
A
L
 
W
L
 
V
G
 
-
R
 
L
H
 
E
S
 
T
S
 
P
A
 
G
P
 
P
T
 
S
S
 
G
L
 
T
A
 
G
F
 
F
V
 
I
H
 
L
L
 
V
N
 
D
D
 
P
D
 
E
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
S
 
Q
F
 
I
S
 
A
F
 
V
Y
 
A
R
 
P
D
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
A
D
 
N
T
 
A
L
 
R
F
 
L
D
 
V
A
 
P
S
 
E
V
 
D
A
 
L
E
 
P
A
 
A
S
 
T
W
 
A
F
 
F
E
 
Q
N
 
G
T
 
V
A
 
G
V
 
V
L
 
V
H
 
L
L
 
L
C
 
-
S
 
-
N
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
Q
 
-
S
 
Q
A
 
L
E
 
E
A
 
I
T
 
P
L
 
L
T
 
E
M
 
T
A
 
V
D
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
R
A
 
K
V
 
A
S
 
G
V
 
A
D
 
R
V
 
I
N
 
L
L
 
L
R
 
N
H
 
-
N
 
-
L
 
-
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
A
A
 
A
A
 
P
C
 
A
K
 
H
A
 
A
T
 
L
V
 
P
M
 
S
S
 
E
L
 
I
V
 
L
H
 
Q
K
 
S
A
 
V
H
 
D
V
 
L
L
 
L
K
 
L
F
 
V
A
x
N
Q
 
E
E
 
V
E
 
E
L
 
A
E
 
A
Y
 
Q
L
 
L
A
 
T
G
 
E
S
 
A
E
 
S
P
 
P
Q
 
P
-
 
R
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
G
 
A
F
 
L
I
 
A
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
R
D
 
G
S
 
R
G
 
A
C
 
P
K
 
Q
L
 
A
L
 
Q
L
 
V
I
 
V
T
 
L
D
x
T
G
 
L
G
|
G
N
x
A
P
 
Q
I
x
G
R
 
A
A
 
V
F
 
W
T
 
S
G
 
G
K
 
T
Q
 
E
C
 
E
L
 
S
T
 
H
L
 
F
P
 
P
V
 
A
P
 
F
K
 
P
M
 
V
D
 
R
V
 
A
V
 
V
D
|
D
T
 
T
T
|
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
A
F
|
F
I
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
A
H
 
L
R
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
E
D
 
G
G
 
-
L
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
Q
T
 
N
F
 
M
K
 
R
D
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
R
F
 
F
A
 
A
I
x
N
G
 
A
C
 
A
G
|
G
A
|
A
L
 
L
A
|
A
V
x
T
S
 
T
R
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
A
F
 
Q
P
 
P
A
x
S
L
 
L
P
 
P
G
 
F
L
 
R
A
 
D
E
 
E
A
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
L

6znxC Ribokinase from thermus species
29% identity, 88% coverage: 15:317/343 of query aligns to 2:262/265 of 6znxC

query
sites
6znxC
F
 
I
L
 
L
C
 
V
T
 
V
G
 
G
S
 
S
D
 
L
E
 
N
D
 
M
D
 
D
G
 
L
L
 
V
M
 
L
L
 
R
P
 
E
C
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
Q
 
T
Y
 
H
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
K
P
 
G
A
 
A
N
 
N
A
 
Q
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
R
 
R
F
 
M
A
 
L
G
 
G
L
 
R
V
 
V
G
 
G
K
 
E
D
 
D
T
 
P
F
 
F
G
 
G
D
 
Q
F
 
A
L
 
L
A
 
K
N
 
S
S
 
G
L
 
L
V
 
A
R
 
Q
Y
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
S
 
A
L
 
W
L
 
V
G
 
-
R
 
L
H
 
E
S
 
T
S
 
P
A
 
G
P
 
P
T
 
S
S
 
G
L
 
T
A
 
A
F
 
F
V
 
V
H
 
-
L
 
-
N
 
D
D
 
P
D
 
E
G
 
G
D
 
Q
R
 
N
S
 
Q
F
 
I
S
 
A
F
 
V
Y
 
A
R
 
P
D
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
A
D
 
N
T
 
A
L
 
R
F
 
L
D
 
V
A
 
P
S
 
E
V
 
D
A
 
L
E
 
P
A
 
A
S
 
T
W
 
A
F
 
F
E
 
Q
N
 
G
T
 
V
A
 
G
V
 
V
L
 
V
H
 
L
L
 
L
C
 
-
S
 
-
N
 
-
T
 
-
L
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
Q
 
-
S
 
Q
A
 
L
E
 
E
A
 
I
T
 
P
L
 
L
T
 
E
M
 
T
A
 
V
D
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
R
A
 
K
V
 
A
S
 
G
V
 
A
D
 
R
V
 
I
N
 
L
L
 
L
R
 
N
H
 
-
N
 
-
L
 
-
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
A
A
 
A
A
 
P
C
 
A
K
 
H
A
 
A
T
 
L
V
 
P
M
 
S
S
 
E
L
 
I
V
 
L
H
 
Q
K
 
S
A
 
V
H
 
D
V
 
L
L
 
L
K
 
L
F
 
V
A
x
N
Q
 
E
E
 
V
E
 
E
L
 
A
E
 
A
Y
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
E
 
-
P
 
-
Q
 
Q
G
 
A
F
 
L
I
 
A
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
L
L
 
-
D
 
-
S
 
R
G
 
G
C
 
A
K
 
Q
L
 
V
L
 
V
L
 
L
I
x
L
T
x
G
D
 
A
G
 
Q
G
 
G
N
 
A
P
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
V
F
 
W
T
 
S
G
 
G
K
 
E
Q
 
E
C
 
S
L
 
-
T
 
H
L
 
F
P
 
P
V
 
A
P
 
F
K
 
P
M
 
V
D
 
R
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
A
 
A
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
A
F
|
F
I
 
A
G
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
A
H
 
L
R
 
G
I
 
L
A
 
A
R
 
E
D
 
G
G
 
-
L
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
Q
T
 
N
F
 
M
K
 
R
D
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
R
F
 
F
A
 
A
I
x
N
G
 
A
C
 
A
G
|
G
A
|
A
L
 
L
A
 
A
V
x
T
S
 
T
R
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
A
F
 
Q
P
 
P
A
 
S
L
 
L
P
 
P
G
 
F
L
 
R
A
 
D
E
 
E
A
 
V
E
 
E
A
 
A
F
 
L

F4I0K2 Fructokinase-like 2, chloroplastic; pfkB-type carbohydrate kinase family protein 1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
21% identity, 85% coverage: 5:297/343 of query aligns to 207:532/614 of F4I0K2

query
sites
F4I0K2
V
 
V
L
x
C
C
|
C
F
 
F
G
 
G
E
 
S
A
 
A
-
 
Q
-
 
H
-
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
P
-
 
S
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
N
-
 
R
L
 
L
I
 
L
D
 
D
F
 
Y
L
 
E
C
 
L
T
 
H
G
 
E
S
 
R
D
 
M
E
 
R
D
 
D
D
 
A
G
 
K
L
 
W
M
 
A
L
 
P
P
 
E
C
 
K
Y
 
Y
R
 
I
Q
 
R
Y
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
C
P
 
A
A
 
G
N
 
G
A
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
A
K
 
S
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
A
 
V
R
 
A
F
 
F
A
 
M
G
 
G
L
 
K
V
 
L
G
 
G
K
 
A
D
 
D
T
 
D
F
 
Y
G
 
G
D
 
Q
F
 
A
L
 
M
A
 
L
N
 
Y
S
 
Y
L
 
L
V
 
N
R
 
V
Y
 
C
G
 
K
V
 
V
D
 
Q
I
 
T
S
 
R
L
 
S
L
 
V
G
 
K
R
 
I
H
 
D
S
 
G
S
 
K
A
 
R
P
 
V
T
 
T
S
 
A
L
 
C
A
 
S
F
 
T
V
 
M
H
 
K
L
 
I
N
 
S
D
 
K
D
 
R
G
 
G
D
 
R
R
 
L
S
 
K
F
 
S
S
 
T
F
 
C
Y
 
I
R
 
K
D
 
P
G
 
C
G
 
A
A
 
E
D
 
D
T
 
S
L
 
L
F
 
S
D
 
K
A
 
S
S
 
E
V
 
I
A
 
-
E
 
N
A
 
V
S
 
D
W
 
V
F
 
L
E
 
K
N
 
E
T
 
A
A
 
K
V
 
M
L
 
F
H
 
Y
L
 
F
C
 
S
S
 
T
N
 
H
T
 
S
L
 
L
T
 
L
T
 
D
A
 
K
Q
 
K
S
 
M
A
 
M
E
 
S
A
 
T
T
 
T
L
 
I
T
 
Q
M
 
A
A
 
I
D
 
K
R
 
I
A
 
S
V
 
K
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
L
 
N
A
 
V
V
 
I
S
 
F
V
 
Y
D
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
R
 
P
H
 
L
N
 
P
L
 
L
W
 
W
Q
 
H
G
 
S
G
 
S
A
 
E
A
 
E
C
 
T
K
 
K
A
 
S
T
 
F
V
 
I
M
 
Q
S
 
E
L
 
V
V
 
W
H
 
N
K
 
L
A
 
A
H
 
D
V
 
V
L
 
I
K
 
E
F
 
I
A
 
T
Q
 
K
E
 
Q
E
 
E
L
 
L
E
 
E
Y
 
F
L
 
L
A
 
C
G
 
G
S
 
I
E
 
E
P
 
P
-
 
T
Q
 
E
G
 
E
F
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
S
-
 
K
-
 
F
-
 
V
-
 
H
-
 
Y
-
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
T
I
 
V
Q
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
W
D
 
H
S
 
E
G
 
N
C
 
L
K
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
F
I
 
V
T
 
T
D
 
N
G
 
G
G
 
T
N
 
S
P
 
K
I
 
I
R
 
H
A
 
Y
F
 
Y
T
 
T
G
 
K
K
 
E
Q
 
H
-
 
N
-
 
G
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
 
G
C
 
M
L
 
E
T
 
D
L
 
V
P
 
P
V
 
I
P
 
T
K
 
P
M
 
F
D
 
-
V
 
T
V
 
R
D
 
D
T
 
M
T
 
S
A
 
A
G
 
S
G
 
G
D
 
D
G
 
G
F
 
I
I
 
V
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
I
H
 
R
R
 
M
I
 
L
A
 
T
R
 
V
D
 
Q
G
 
P
L
 
-
D
 
-
T
 
D
L
 
L
L
 
M
E
 
N
S
 
N
E
 
K
T
 
G
T
 
Y
F
 
L
K
 
E
D
 
R
A
 
T
L
 
A
G
 
R
F
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
 
E
C
 
C
G
 
G
A
 
I
L
 
I

3iq0B Crystal structure of a putative ribokinase ii in complex with atp and mg+2 from e.Coli
25% identity, 92% coverage: 4:317/343 of query aligns to 3:304/308 of 3iq0B

query
sites
3iq0B
R
 
K
V
 
V
L
 
F
C
 
T
F
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
I
L
 
L
I
 
V
D
 
E
F
 
I
L
 
M
C
 
A
T
 
S
G
 
K
S
 
I
D
 
G
E
 
Q
D
 
P
D
 
F
G
 
D
L
 
Q
M
 
P
L
 
G
P
 
I
C
 
W
Y
 
N
R
 
G
Q
 
P
Y
 
Y
P
 
P
G
 
S
G
 
G
A
 
A
P
 
P
A
 
A
N
 
I
A
 
F
A
 
I
V
 
D
A
 
Q
V
 
V
A
 
T
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
V
Q
 
P
A
 
C
R
 
G
F
 
I
A
 
I
G
 
S
L
 
C
V
 
V
G
 
G
K
 
N
D
 
D
T
 
G
F
 
F
G
 
G
D
 
D
F
 
I
L
 
N
A
 
I
N
 
H
S
 
R
L
 
L
V
 
A
R
 
A
Y
 
D
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
S
 
R
L
 
G
L
 
I
G
 
S
R
 
V
H
 
L
S
 
P
S
 
L
A
 
E
P
 
A
T
 
T
S
 
G
L
 
S
A
 
A
F
 
F
V
 
V
H
 
T
L
 
Y
N
 
-
D
 
-
D
 
-
G
 
G
D
 
D
R
 
R
S
 
D
F
 
F
S
 
I
F
 
F
Y
 
N
R
 
I
D
 
K
G
 
N
G
 
A
A
 
A
D
 
C
T
 
G
L
 
K
F
 
L
D
 
S
A
 
A
S
 
Q
V
 
H
A
 
V
E
 
D
A
 
E
S
 
N
W
 
I
F
 
L
E
 
K
N
 
D
T
 
C
A
 
T
V
 
H
L
 
F
H
 
H
L
 
I
C
 
M
S
 
G
N
 
S
T
 
S
L
 
L
T
 
F
T
 
S
A
 
F
Q
 
H
S
 
M
A
 
V
E
 
D
A
 
A
T
 
V
L
 
K
T
 
K
M
 
A
A
 
V
D
 
T
R
 
I
A
 
V
V
 
K
A
 
A
A
 
N
G
 
G
L
 
G
A
 
V
V
 
I
S
 
S
V
 
F
D
 
D
V
 
P
N
 
N
L
 
I
R
 
R
H
 
K
N
 
E
L
 
M
W
 
L
Q
 
D
G
 
I
G
 
P
A
 
E
A
 
M
C
 
R
K
 
D
A
 
A
T
 
L
V
 
H
M
 
F
S
 
V
L
 
L
V
 
E
H
 
L
K
 
T
A
 
D
H
 
I
V
 
Y
L
 
M
K
 
P
F
x
S
A
 
E
Q
 
G
E
 
E
E
 
V
L
 
L
E
 
L
Y
 
L
L
 
S
A
 
P
G
 
H
S
 
S
E
 
T
P
 
P
Q
 
E
G
 
R
F
 
A
I
 
I
Q
 
A
Q
 
G
L
 
F
L
 
L
D
 
E
S
 
E
G
 
G
C
 
V
K
 
K
L
 
E
L
 
V
L
 
I
I
 
V
T
x
K
D
 
R
G
|
G
G
 
N
N
 
Q
P
 
G
I
 
A
R
 
S
A
 
Y
F
 
Y
T
 
S
G
 
A
K
 
N
Q
 
E
C
 
Q
L
 
F
T
 
H
L
 
V
P
 
E
V
 
S
P
 
Y
K
 
P
M
 
V
D
 
E
V
x
E
V
 
V
D
 
D
T
 
P
T
 
T
A
x
G
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
 
C
F
|
F
I
 
-
G
 
G
G
 
G
L
 
A
L
 
W
H
 
I
R
 
A
I
 
C
A
 
R
R
 
Q
D
 
L
G
 
G
L
 
F
D
 
D
T
 
A
L
 
-
L
 
-
E
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
F
 
-
K
 
H
D
 
R
A
 
A
L
 
L
G
 
Q
F
 
Y
A
 
A
I
x
N
G
 
A
C
 
C
G
|
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
S
 
T
R
 
R
P
 
R
G
 
G
A
 
P
F
 
M
P
 
E
A
 
G
L
 
T
P
 
S
G
 
R
L
 
L
A
 
M
E
 
E
A
 
I
E
 
E
A
 
T
F
 
F

1v1aA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound 2- keto-3-deoxygluconate and adp (see paper)
28% identity, 68% coverage: 34:266/343 of query aligns to 31:258/301 of 1v1aA

query
sites
1v1aA
Y
 
Y
P
 
V
G
 
G
G
|
G
A
|
A
P
 
E
A
 
V
N
|
N
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
A
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
V
Q
 
K
A
 
V
R
 
G
F
 
F
A
 
V
G
 
G
L
 
R
V
 
V
G
 
G
K
 
E
D
 
D
T
 
E
F
 
L
G
 
G
D
 
A
F
 
M
L
 
V
A
 
E
N
 
E
S
 
R
L
 
L
V
 
R
R
 
A
Y
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
S
 
T
L
 
H
L
 
F
G
 
-
R
 
R
H
 
R
S
 
A
S
 
P
A
 
G
P
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
A
x
Y
F
 
L
V
 
R
H
 
E
L
 
Y
N
 
L
D
 
P
D
 
L
G
 
G
D
 
Q
R
 
G
S
 
R
F
 
V
S
 
F
F
 
Y
Y
 
Y
R
|
R
D
 
K
G
 
G
G
 
S
A
 
A
D
 
G
T
 
S
L
 
A
F
 
L
D
 
A
A
 
P
S
 
G
V
 
A
A
 
F
E
 
D
A
 
P
S
 
D
W
 
Y
F
 
L
E
 
E
N
 
G
T
 
V
A
 
R
V
 
F
L
 
L
H
 
H
L
 
L
C
 
S
S
 
G
N
 
I
T
 
T
L
 
P
T
 
A
T
 
L
A
 
S
Q
 
P
S
 
E
A
 
A
E
 
R
A
 
A
-
 
F
T
 
S
L
 
L
T
 
W
M
 
A
A
 
M
D
 
E
R
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
V
A
 
R
V
 
V
S
 
S
V
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
Y
R
|
R
H
 
Q
N
 
T
L
 
L
W
 
W
Q
 
S
G
 
P
G
 
E
A
 
E
A
 
A
C
 
-
K
 
R
A
 
G
T
 
F
V
 
L
M
 
E
S
 
R
L
 
A
V
 
L
H
 
P
K
 
G
A
 
V
H
 
D
V
 
L
L
 
L
K
 
F
F
 
L
A
 
S
Q
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
A
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
A
 
F
G
 
G
S
 
R
E
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
F
 
-
I
 
V
Q
 
E
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
R
S
 
A
-
 
L
G
 
S
C
 
A
K
 
P
L
 
E
L
 
V
L
 
V
I
 
L
T
x
K
D
 
R
G
|
G
G
x
A
N
 
K
P
 
G
I
 
A
R
 
W
A
 
A
F
 
F
T
 
V
G
 
D
K
 
G
Q
 
R
C
 
R
L
 
V
T
 
E
L
 
G
P
 
S
V
 
A
P
 
F
K
 
A
M
 
V
D
 
E
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
T
 
V
A
x
G
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
 
A
F
 
F
I
 
A
G
 
A
G
 
G
L
 
Y
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1v1bA 2-keto-3-deoxygluconate kinase from thermus thermophilus with bound atp (see paper)
28% identity, 68% coverage: 34:266/343 of query aligns to 31:258/300 of 1v1bA

query
sites
1v1bA
Y
 
Y
P
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
E
A
 
V
N
 
N
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
A
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
V
Q
 
K
A
 
V
R
 
G
F
 
F
A
 
V
G
 
G
L
 
R
V
 
V
G
 
G
K
 
E
D
 
D
T
 
E
F
 
L
G
 
G
D
 
A
F
 
M
L
 
V
A
 
E
N
 
E
S
 
R
L
 
L
V
 
R
R
 
A
Y
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
S
 
T
L
 
H
L
 
F
G
 
-
R
 
R
H
 
R
S
 
A
S
 
P
A
 
G
P
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
A
 
Y
F
 
L
V
 
R
H
 
E
L
 
Y
N
 
L
D
 
P
D
 
L
G
 
G
D
 
Q
R
 
G
S
 
R
F
 
V
S
 
F
F
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
D
 
K
G
 
G
G
 
S
A
 
A
D
 
G
T
 
S
L
 
A
F
 
L
D
 
A
A
 
P
S
 
G
V
 
A
A
 
F
E
 
D
A
 
P
S
 
D
W
 
Y
F
 
L
E
 
E
N
 
G
T
 
V
A
 
R
V
 
F
L
 
L
H
 
H
L
 
L
C
 
S
S
 
G
N
 
I
T
 
T
L
 
P
T
 
A
T
 
L
A
 
S
Q
 
P
S
 
E
A
 
A
E
 
R
A
 
A
-
 
F
T
 
S
L
 
L
T
 
W
M
 
A
A
 
M
D
 
E
R
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
V
A
 
R
V
 
V
S
 
S
V
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
Y
R
 
R
H
 
Q
N
 
T
L
 
L
W
 
W
Q
 
S
G
 
P
G
 
E
A
 
E
A
 
A
C
 
-
K
 
R
A
 
G
T
 
F
V
 
L
M
 
E
S
 
R
L
 
A
V
 
L
H
 
P
K
 
G
A
 
V
H
 
D
V
 
L
L
 
L
K
 
F
F
 
L
A
 
S
Q
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
A
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
A
 
F
G
 
G
S
 
R
E
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
F
 
-
I
 
V
Q
 
E
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
R
S
 
A
-
 
L
G
 
S
C
 
A
K
 
P
L
 
E
L
 
V
L
 
V
I
 
L
T
x
K
D
 
R
G
|
G
G
 
A
N
 
K
P
 
G
I
 
A
R
 
W
A
 
A
F
 
F
T
 
V
G
 
D
K
 
G
Q
 
R
C
 
R
L
 
V
T
 
E
L
 
G
P
 
S
V
x
A
P
x
F
K
 
A
M
x
V
D
 
E
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
T
 
V
A
x
G
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
 
A
F
 
F
I
 
A
G
 
A
G
 
G
L
 
Y
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q53W83 2-dehydro-3-deoxygluconokinase; 2-keto-3-deoxygluconokinase; 3-deoxy-2-oxo-D-gluconate kinase; KDG kinase; EC 2.7.1.45 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
28% identity, 68% coverage: 34:266/343 of query aligns to 31:258/309 of Q53W83

query
sites
Q53W83
Y
 
Y
P
 
V
G
 
G
G
|
G
A
|
A
P
x
E
A
x
V
N
|
N
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
L
A
 
A
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
V
Q
 
K
A
 
V
R
 
G
F
 
F
A
 
V
G
 
G
L
 
R
V
 
V
G
 
G
K
 
E
D
 
D
T
 
E
F
 
L
G
 
G
D
 
A
F
 
M
L
 
V
A
 
E
N
 
E
S
 
R
L
 
L
V
 
R
R
 
A
Y
 
E
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
S
 
T
L
 
H
L
 
F
G
 
-
R
 
R
H
 
R
S
 
A
S
 
P
A
 
G
P
 
F
T
 
T
S
 
G
L
 
L
A
 
Y
F
 
L
V
 
R
H
 
E
L
 
Y
N
 
L
D
 
P
D
 
L
G
 
G
D
 
Q
R
 
G
S
 
R
F
 
V
S
 
F
F
x
Y
Y
|
Y
R
|
R
D
 
K
G
 
G
G
 
S
A
 
A
D
 
G
T
 
S
L
 
A
F
 
L
D
 
A
A
 
P
S
 
G
V
 
A
A
 
F
E
 
D
A
 
P
S
 
D
W
 
Y
F
 
L
E
 
E
N
 
G
T
 
V
A
 
R
V
 
F
L
 
L
H
 
H
L
 
L
C
 
S
S
 
G
N
 
I
T
 
T
L
 
P
T
 
A
T
 
L
A
 
S
Q
 
P
S
 
E
A
 
A
E
 
R
A
 
A
-
 
F
T
 
S
L
 
L
T
 
W
M
 
A
A
 
M
D
 
E
R
 
E
A
 
A
V
 
K
A
 
R
A
 
R
G
 
G
L
 
V
A
 
R
V
 
V
S
 
S
V
 
L
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
Y
R
|
R
H
 
Q
N
 
T
L
 
L
W
 
W
Q
 
S
G
 
P
G
 
E
A
 
E
A
 
A
C
 
-
K
 
R
A
 
G
T
 
F
V
 
L
M
 
E
S
 
R
L
 
A
V
 
L
H
 
P
K
 
G
A
 
V
H
 
D
V
 
L
L
 
L
K
 
F
F
 
L
A
x
S
Q
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
A
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
A
 
F
G
 
G
S
 
R
E
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
F
 
-
I
 
V
Q
 
E
Q
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
R
S
 
A
-
 
L
G
 
S
C
 
A
K
 
P
L
 
E
L
 
V
L
 
V
I
 
L
T
x
K
D
x
R
G
|
G
G
x
A
N
x
K
P
x
G
I
x
A
R
 
W
A
 
A
F
 
F
T
 
V
G
 
D
K
 
G
Q
 
R
C
 
R
L
 
V
T
 
E
L
 
G
P
 
S
V
 
A
P
 
F
K
 
A
M
 
V
D
 
E
V
 
A
V
 
V
D
 
D
T
 
P
T
 
V
A
x
G
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
 
A
F
 
F
I
 
A
G
 
A
G
 
G
L
 
Y
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7fcaD Pfkb(mycobacterium marinum) (see paper)
27% identity, 88% coverage: 4:304/343 of query aligns to 3:282/282 of 7fcaD

query
sites
7fcaD
R
 
R
V
 
G
L
 
L
C
 
V
F
 
I
G
 
G
E
 
E
A
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
F
 
I
L
 
V
C
 
-
T
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
D
 
D
G
 
G
L
 
-
M
 
-
L
 
-
P
 
P
C
 
D
Y
 
P
R
 
A
Q
 
E
Y
 
Y
P
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
S
P
 
P
A
 
L
N
 
N
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
G
V
 
L
A
 
A
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
R
Q
 
D
A
 
V
R
 
D
F
 
L
A
 
L
G
 
T
L
 
H
V
 
I
G
 
G
K
x
R
D
 
D
T
 
A
F
 
R
G
 
G
D
 
R
F
 
R
L
 
I
A
 
A
N
 
E
S
 
Y
L
 
I
V
 
E
R
 
S
Y
 
S
G
 
G
V
 
V
D
 
Q
I
 
L
S
 
-
L
 
V
L
x
S
G
|
G
R
 
S
H
 
Q
S
 
T
S
 
A
-
 
D
-
 
R
A
 
T
P
 
P
T
 
T
S
 
A
L
 
T
A
 
A
F
 
-
V
 
-
H
 
-
L
 
-
N
 
-
D
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
R
S
 
T
F
 
Y
S
 
A
F
 
F
Y
 
D
R
 
-
D
 
-
G
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
-
F
 
L
D
 
E
A
 
W
S
 
Q
V
 
I
A
 
P
E
 
D
A
 
T
S
 
P
W
 
P
F
 
V
E
 
A
N
 
P
T
 
P
A
 
L
V
 
L
L
 
V
H
 
H
L
 
T
C
 
G
S
 
S
N
 
I
T
 
A
L
 
A
T
 
A
T
 
R
A
 
E
Q
 
P
S
 
G
A
 
C
E
 
L
A
 
A
T
 
V
L
 
A
T
 
A
M
 
L
A
 
L
D
 
D
R
 
-
A
 
A
V
 
Y
A
 
R
A
 
A
G
 
A
L
 
A
A
 
T
V
 
V
S
 
S
V
 
F
D
 
D
V
 
P
N
 
N
L
 
V
R
 
R
H
 
P
N
 
S
L
 
L
W
 
S
Q
 
A
G
 
D
G
 
P
A
 
D
A
 
L
C
 
T
K
 
R
A
 
R
T
 
R
V
 
I
M
 
Q
S
 
R
L
 
L
V
 
V
H
 
E
K
 
R
A
 
S
H
 
D
V
 
I
L
 
I
K
 
K
F
 
A
A
 
S
Q
 
A
E
 
E
E
 
D
L
 
L
E
 
H
Y
 
W
L
 
I
A
 
D
G
 
P
S
 
T
E
 
Q
-
 
P
P
 
P
Q
 
E
G
 
Q
F
 
T
I
 
A
Q
 
R
Q
 
A
L
 
W
L
 
L
D
 
A
S
 
C
G
 
G
C
 
P
K
 
A
L
 
I
L
 
V
L
 
A
I
 
L
T
 
T
D
 
L
G
 
G
G
 
D
N
 
Q
P
 
G
I
 
A
R
 
V
A
 
A
F
 
F
T
 
-
G
 
-
K
 
-
Q
 
-
C
 
C
L
 
A
T
 
A
L
 
G
P
 
P
-
 
A
-
 
S
V
 
V
P
 
P
K
 
A
M
 
Q
D
 
P
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
V
A
 
G
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
A
F
 
F
I
 
M
G
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
L
H
 
D
R
 
T
I
 
L
A
 
W
R
 
E
D
 
Q
G
 
G
L
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
A
D
 
D
T
 
R
L
 
R
L
 
T
E
 
E
S
 
L
E
 
R
-
 
K
-
 
I
-
 
G
-
 
V
T
 
S
T
 
A
F
 
L
K
 
T
D
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
E
F
 
V
A
 
A
I
 
A
G
 
L
C
 
T
G
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
T
V
 
V
S
 
A
R
 
R
P
 
A
G
 
G
A
 
A

2dcnA Crystal structure of 2-keto-3-deoxygluconate kinase from sulfolobus tokodaii complexed with 2-keto-6-phosphogluconate (alpha-furanose form)
25% identity, 93% coverage: 4:321/343 of query aligns to 2:308/308 of 2dcnA

query
sites
2dcnA
R
 
K
V
 
L
L
 
I
C
 
T
F
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
I
L
 
L
I
 
I
D
 
E
F
 
F
-
 
N
-
 
A
L
 
L
C
 
S
T
 
P
G
 
G
S
 
P
D
 
L
E
 
R
D
 
H
D
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
-
L
 
V
P
 
S
C
 
Y
Y
 
F
R
 
E
Q
 
K
Y
 
H
P
 
V
G
 
A
G
|
G
A
 
S
P
 
E
A
 
A
N
 
N
A
 
Y
A
 
C
V
 
V
A
 
A
V
 
F
A
 
I
K
 
K
L
 
Q
G
 
G
G
 
N
Q
 
E
A
 
C
R
 
G
F
 
I
A
 
I
G
 
A
L
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
D
D
 
D
T
 
E
F
 
F
G
 
G
D
 
Y
F
 
N
L
 
A
A
 
I
N
 
E
S
 
W
L
 
L
V
 
R
R
 
G
Y
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
V
S
 
S
L
 
H
L
 
M
G
 
K
R
 
I
H
 
D
S
 
P
S
 
S
A
 
A
P
 
P
T
 
T
S
 
G
L
 
I
A
x
F
F
 
F
V
 
I
-
 
Q
-
 
R
H
 
H
L
 
Y
N
 
P
D
 
V
D
 
P
G
 
L
D
 
K
R
 
S
S
 
E
F
 
S
S
 
I
F
x
Y
Y
 
Y
R
|
R
D
 
K
G
 
G
G
 
S
A
 
A
D
 
G
T
 
S
L
 
K
F
 
L
D
 
S
A
 
P
S
 
E
V
 
D
A
 
V
E
 
D
A
 
E
S
 
E
W
 
Y
F
 
V
E
 
K
N
 
S
T
 
A
A
 
D
V
 
L
L
 
V
H
 
H
L
 
S
C
 
S
S
 
G
N
x
I
T
 
T
L
 
L
T
 
A
T
 
I
A
 
S
Q
 
S
S
 
T
A
 
A
E
 
K
A
 
E
T
 
A
L
 
V
T
 
Y
M
 
-
A
 
-
D
 
-
R
 
K
A
 
A
V
 
F
A
 
E
A
 
I
G
 
A
L
 
S
A
 
N
V
 
R
S
 
S
V
 
F
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
I
R
|
R
H
 
L
N
 
K
L
 
L
W
 
W
Q
 
S
G
 
A
G
 
E
A
 
E
A
 
A
C
 
-
K
 
K
A
 
R
T
 
E
V
 
I
M
 
L
S
 
K
L
 
L
V
 
L
H
 
S
K
 
K
A
 
F
H
 
H
V
 
-
L
 
L
K
 
K
F
 
F
A
 
L
Q
 
I
E
 
T
E
x
D
L
 
T
E
 
D
-
 
D
-
 
S
-
 
K
-
 
I
Y
 
I
L
 
L
A
 
G
G
 
E
S
 
S
E
 
D
P
 
P
Q
 
D
G
 
K
F
 
A
I
 
A
Q
 
K
Q
 
A
L
 
F
L
 
S
D
 
D
S
 
Y
G
 
A
C
 
E
K
 
I
L
 
I
L
 
V
L
 
M
I
x
K
T
 
L
D
x
G
G
x
P
G
 
K
N
x
G
P
 
A
I
 
I
R
 
V
A
 
Y
F
 
Y
T
 
D
G
 
G
K
 
K
Q
 
K
C
 
Y
L
 
Y
T
 
S
-
 
S
-
 
G
L
 
Y
P
 
Q
V
 
V
P
 
P
K
 
-
M
 
-
D
 
-
V
|
V
V
 
E
D
 
D
T
 
V
T
|
T
A
x
G
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
 
A
F
 
-
I
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
T
L
 
F
H
 
L
R
 
S
I
 
L
A
 
Y
R
 
Y
D
 
K
G
 
G
L
 
F
D
 
E
T
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
F
 
M
K
 
E
D
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
D
F
 
Y
A
 
A
I
|
I
G
 
V
C
 
A
G
x
S
A
 
T
L
 
L
A
 
N
V
|
V
S
 
M
R
 
I
P
 
R
G
 
G
A
x
D
F
 
Q
P
 
E
A
 
N
L
 
L
P
 
P
G
 
T
L
 
T
A
 
K
E
 
D
A
 
I
E
 
E
A
 
T
F
 
F
Q
 
L
A
 
R
S
 
E
M
 
M

7aghA Crystal structure of sf kinase yihv from e. Coli in complex with amppnp-mg (see paper)
27% identity, 92% coverage: 4:317/343 of query aligns to 3:291/295 of 7aghA

query
sites
7aghA
R
 
R
V
 
V
L
 
A
C
 
C
F
 
V
G
 
G
E
 
I
A
 
T
L
 
V
I
 
M
D
 
D
-
 
R
-
 
I
F
 
Y
L
 
Y
C
 
V
T
 
E
G
 
G
S
 
L
D
 
P
E
 
T
D
 
E
D
 
S
G
 
G
L
 
K
M
 
Y
L
 
V
P
 
A
-
 
R
C
 
N
Y
 
Y
R
 
T
Q
 
E
Y
 
V
P
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
P
P
 
A
A
 
A
N
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
V
 
A
A
 
A
K
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
A
 
V
R
 
D
F
 
F
A
 
I
G
 
G
L
 
R
V
 
V
G
 
G
K
 
D
D
 
D
T
 
D
F
 
T
G
 
G
D
 
N
F
 
S
L
 
L
A
 
L
N
 
A
S
 
E
L
 
L
V
 
E
R
 
S
Y
 
W
G
 
G
V
 
V
D
 
N
I
 
T
S
 
R
L
 
Y
L
 
T
G
 
K
R
 
R
H
 
Y
S
 
N
S
 
Q
A
 
A
P
 
K
T
 
S
S
 
S
L
 
Q
A
 
S
F
 
A
V
 
I
H
 
M
L
 
V
N
 
D
D
 
T
D
 
K
G
 
G
D
 
E
R
|
R
S
 
I
F
 
I
S
 
I
F
 
N
Y
 
Y
R
 
P
D
 
-
G
 
-
G
 
S
A
 
P
D
 
D
T
 
L
L
 
L
F
 
P
D
 
D
A
 
A
S
 
E
V
 
W
A
 
L
E
 
E
A
 
E
S
 
I
W
 
D
F
 
F
E
 
S
N
 
Q
T
 
W
A
 
D
V
 
V
L
 
V
H
 
L
L
 
A
C
 
-
S
 
-
N
 
-
T
 
D
L
 
V
T
 
R
T
 
W
A
 
H
Q
 
D
S
 
G
A
 
A
E
 
K
A
 
K
T
 
A
L
 
F
T
 
T
M
 
L
A
 
A
D
 
R
R
 
Q
A
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
G
 
G
L
 
V
A
 
M
V
 
T
S
 
V
V
 
L
D
 
D
V
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
-
N
 
-
L
 
-
W
 
-
Q
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
D
A
 
I
C
 
T
K
 
P
A
 
Q
T
 
D
V
 
I
M
 
S
S
 
E
L
 
L
V
 
V
H
 
A
K
 
L
A
 
S
H
 
D
V
 
H
L
 
A
K
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
E
E
 
P
E
 
G
L
 
L
E
 
A
Y
 
R
L
 
L
A
 
T
G
 
G
-
 
V
S
 
K
E
 
E
P
 
M
Q
 
A
G
 
S
F
 
A
I
 
L
Q
 
K
Q
 
Q
L
 
A
L
 
Q
D
 
T
S
 
L
G
 
T
C
 
N
K
 
G
L
 
H
L
 
V
L
 
Y
I
 
V
T
|
T
D
 
Q
G
|
G
G
 
S
N
 
A
P
x
G
I
 
C
R
 
D
A
 
W
F
 
L
T
 
E
G
 
G
K
 
R
Q
 
Q
C
 
-
L
 
-
T
 
H
L
 
Q
P
 
P
V
 
A
P
 
F
K
 
K
M
 
V
D
 
D
V
 
V
V
 
V
D
 
D
T
 
T
T
 
T
A
x
G
G
x
A
G
|
G
D
 
D
G
 
V
F
 
F
I
 
H
G
 
G
G
 
A
L
 
L
L
 
A
H
 
V
R
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
T
D
 
S
G
 
G
L
 
-
D
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
S
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
D
F
 
L
K
 
A
D
 
E
A
 
S
L
 
V
G
 
R
F
 
F
A
 
A
I
x
S
G
 
G
C
 
V
G
x
A
A
 
A
L
 
L
A
 
K
V
 
C
S
 
T
R
 
R
P
 
P
G
 
G
A
 
G
F
 
R
P
 
A
A
 
G
L
 
I
P
 
P
G
 
D
L
 
C
A
 
D
E
 
Q
A
 
T
E
 
R
A
 
S
F
 
F

Query Sequence

>6936373 FitnessBrowser__SB2B:6936373
MSKRVLCFGEALIDFLCTGSDEDDGLMLPCYRQYPGGAPANAAVAVAKLGGQARFAGLVG
KDTFGDFLANSLVRYGVDISLLGRHSSAPTSLAFVHLNDDGDRSFSFYRDGGADTLFDAS
VAEASWFENTAVLHLCSNTLTTAQSAEATLTMADRAVAAGLAVSVDVNLRHNLWQGGAAC
KATVMSLVHKAHVLKFAQEELEYLAGSEPQGFIQQLLDSGCKLLLITDGGNPIRAFTGKQ
CLTLPVPKMDVVDTTAGGDGFIGGLLHRIARDGLDTLLESETTFKDALGFAIGCGALAVS
RPGAFPALPGLAEAEAFQASMGDVLHTISVDDSRLPKPCQRSW

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory