SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 6936634 FitnessBrowser__SB2B:6936634 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P08417 Fumarate hydratase, mitochondrial; Fumarase; EC 4.2.1.2 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 2 papers)
43% identity, 99% coverage: 4:455/457 of query aligns to 29:486/488 of P08417

query
sites
P08417
R
|
R
I
x
T
E
|
E
T
|
T
D
|
D
S
x
A
M
x
F
G
|
G
E
|
E
V
x
I
L
x
H
V
|
V
P
|
P
A
|
A
E
x
D
A
x
K
L
 
Y
Y
 
W
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
L
 
F
N
 
Q
N
 
N
F
 
F
A
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
-
 
A
-
 
R
Q
 
E
P
 
R
M
 
M
P
 
P
R
 
L
A
 
P
F
 
L
I
 
V
E
 
H
T
 
A
L
 
F
L
 
G
L
 
V
I
 
L
K
 
K
A
 
K
A
 
S
A
 
A
A
 
A
R
 
I
A
 
V
N
 
N
S
 
E
Q
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
G
L
 
L
A
 
D
S
 
P
D
 
K
C
 
I
G
 
S
Q
 
K
A
 
A
I
 
I
T
 
Q
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
D
S
 
E
L
 
V
R
 
A
Q
 
S
D
 
G
K
 
K
A
 
-
L
 
L
M
 
D
Q
 
D
H
 
H
F
 
F
P
 
P
V
 
L
D
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
Q
S
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
A
 
A
N
 
N
E
 
E
V
 
V
L
 
I
A
 
S
R
 
N
L
 
R
T
 
A
S
 
I
E
 
E
S
 
I
L
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
I
-
 
G
-
 
S
R
 
K
A
 
Q
V
 
V
S
x
H
A
 
P
N
 
N
D
 
N
E
 
H
V
 
C
N
 
N
L
 
Q
G
 
S
Q
 
Q
S
 
S
S
 
S
N
 
N
D
 
D
V
 
T
I
 
F
P
 
P
S
 
T
C
 
V
I
 
M
Q
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
S
G
 
L
V
 
Q
L
 
I
T
 
Q
K
 
N
T
 
E
L
 
L
L
 
I
P
 
P
A
 
E
L
 
L
T
 
T
H
 
N
L
 
L
K
 
K
S
 
N
C
 
A
I
 
L
R
 
E
T
 
A
K
 
K
A
 
S
A
 
K
S
 
E
V
 
F
K
 
D
G
 
H
V
 
I
V
 
V
K
 
K
T
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
H
 
H
L
 
L
M
 
Q
D
 
D
A
 
A
M
 
T
P
 
P
V
 
L
R
 
T
L
 
L
S
 
G
Q
 
Q
S
 
E
L
 
F
E
 
S
T
 
G
W
 
Y
A
 
V
S
 
Q
Q
 
Q
L
 
V
D
 
E
A
 
N
R
 
G
E
 
I
L
 
Q
Q
 
R
L
 
V
Q
 
A
S
 
H
Q
 
S
L
 
L
I
 
K
S
 
T
L
 
L
W
 
S
Q
 
F
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
T
A
 
K
P
 
P
G
 
G
F
 
F
P
 
D
Q
 
V
A
 
K
F
 
I
C
 
A
H
 
E
E
 
Q
L
 
I
N
 
S
L
 
K
L
 
E
T
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
K
F
 
F
Q
 
Q
P
 
T
A
 
A
P
 
P
H
 
N
L
 
K
F
 
F
T
 
E
G
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
A
Q
 
H
D
 
D
T
 
A
A
 
I
V
 
V
A
 
E
L
 
C
S
 
S
G
 
G
E
 
A
L
 
L
K
 
N
A
 
T
L
 
L
A
 
A
V
 
C
T
 
S
L
 
L
M
 
F
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
Q
D
 
D
L
 
I
R
 
R
W
 
Y
M
 
L
N
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
R
A
 
C
G
 
G
L
 
Y
G
 
H
E
 
E
I
 
L
R
 
M
L
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
N
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
T
I
 
Q
P
 
N
E
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
T
M
 
Q
A
 
V
C
 
C
A
 
V
Q
 
Q
V
 
V
I
 
M
G
 
G
N
 
N
D
 
N
A
 
A
C
 
A
I
 
I
T
 
T
V
 
F
A
 
A
G
 
G
Q
 
S
S
 
Q
G
 
G
N
 
Q
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
V
M
 
F
L
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
M
A
 
I
D
 
A
N
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
N
S
 
S
L
 
I
R
 
R
L
 
L
L
 
I
T
 
T
N
 
D
A
 
A
M
 
A
M
 
Y
A
 
S
L
 
F
A
 
R
D
 
V
K
 
H
A
 
C
I
 
V
D
 
E
G
 
G
F
 
I
E
 
K
V
 
A
C
 
N
E
 
E
G
 
P
R
 
R
M
 
I
A
 
H
K
 
E
E
 
L
L
 
L
S
 
T
R
 
K
N
 
S
P
 
L
I
 
M
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
N
P
 
P
I
 
K
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
K
 
A
A
 
A
A
 
S
D
 
K
I
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
N
A
 
A
Y
 
H
A
 
K
E
 
K
G
 
G
R
 
I
P
 
T
V
 
L
L
 
K
E
 
E
V
 
S
A
 
A
L
 
L
E
 
E
M
 
L
T
 
G
D
 
V
I
 
L
D
 
T
A
 
E
E
 
K
E
 
E
L
 
F
A
 
D
R
 
E
L
 
W
L
 
V
D
 
V
P
 
P
V
 
E
R
 
H
L
 
M
T
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P05042 Fumarate hydratase class II; Fumarase C; Aerobic fumarase; Iron-independent fumarase; EC 4.2.1.2 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
46% identity, 93% coverage: 4:426/457 of query aligns to 5:432/467 of P05042

query
sites
P05042
R
 
R
I
 
S
E
 
E
T
 
K
D
 
D
S
 
S
M
 
M
G
 
G
E
 
A
V
 
I
L
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
D
A
 
K
L
 
L
Y
 
W
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
L
 
L
N
 
E
N
 
H
F
 
F
A
 
R
I
 
I
G
 
S
G
 
T
Q
 
E
P
 
K
M
 
M
P
 
P
R
 
T
A
 
S
F
 
L
I
 
I
E
 
H
T
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
L
I
 
T
K
 
K
A
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
V
N
 
N
S
 
E
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
A
 
S
S
 
E
D
 
E
C
 
K
G
 
A
Q
 
S
A
 
A
I
 
I
T
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
D
K
 
E
A
 
V
L
 
L
M
 
A
-
 
G
Q
 
Q
H
 
H
-
 
D
-
 
D
-
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
L
D
 
A
V
 
I
F
 
W
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
Q
S
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
A
 
M
N
 
N
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
N
L
 
R
T
 
A
S
 
S
E
 
E
S
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
G
-
 
M
-
 
E
R
|
R
A
x
K
V
 
V
S
x
H
A
x
P
N
|
N
D
|
D
E
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
K
G
 
S
Q
 
Q
S
|
S
S
|
S
N
|
N
D
 
D
V
 
V
I
 
F
P
 
P
S
 
T
C
 
A
I
 
M
Q
 
H
I
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
L
G
 
L
V
 
A
L
 
L
T
 
R
K
 
K
T
 
Q
L
 
L
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
L
 
L
T
 
K
H
 
T
L
 
L
K
 
T
S
 
Q
C
 
T
I
 
L
R
 
N
T
 
E
K
 
K
A
 
S
A
 
R
S
 
A
V
 
F
K
 
A
G
 
D
V
 
I
V
 
V
K
 
K
T
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
H
|
H
L
 
L
M
 
Q
D
 
D
A
 
A
M
 
T
P
 
P
V
 
L
R
 
T
L
 
L
S
 
G
Q
 
Q
S
 
E
L
 
I
E
 
S
T
 
G
W
 
W
A
 
V
S
 
A
Q
 
M
L
 
L
D
 
E
A
 
H
R
 
N
E
 
L
L
 
K
Q
 
H
L
 
I
Q
 
E
S
 
Y
Q
 
S
L
 
L
I
 
P
S
 
H
L
 
V
W
 
A
Q
 
E
L
 
L
P
 
A
Q
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
T
A
 
H
P
 
P
G
 
E
F
 
Y
P
 
A
Q
 
R
A
 
R
F
 
V
C
 
A
H
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
A
L
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
C
L
 
A
A
 
P
F
 
F
Q
 
V
P
 
T
A
 
A
P
 
P
H
 
N
L
 
K
F
 
F
T
 
E
G
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
C
D
 
D
T
 
A
A
 
L
V
 
V
A
 
Q
L
 
A
S
 
H
G
 
G
E
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
T
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
V
R
 
R
W
 
W
M
 
L
N
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
R
A
 
C
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
S
L
 
I
P
 
P
A
 
E
L
 
N
Q
x
E
P
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
T
I
 
Q
P
 
C
E
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
T
M
 
M
A
 
L
C
 
C
A
 
C
Q
 
Q
V
 
V
I
 
M
G
 
G
N
 
N
D
 
D
A
 
V
C
 
A
I
 
I
T
 
N
V
 
M
A
 
G
G
 
G
Q
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
V
M
 
F
L
 
R
P
 
P
V
 
M
I
 
V
A
 
I
D
 
H
N
 
N
L
 
F
L
 
L
S
 
Q
S
 
S
L
 
V
R
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
D
A
 
G
M
 
M
M
 
E
A
 
S
L
 
F
A
 
N
D
 
K
K
 
H
A
 
C
I
 
A
D
 
V
G
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
P
C
 
N
E
 
R
G
 
E
R
 
R
M
 
I
A
 
N
K
 
Q
E
 
L
L
 
L
S
 
N
R
 
E
N
 
S
P
 
L
I
 
M
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
N
P
 
T
I
 
H
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
K
A
 
A
Y
 
H
A
 
K
E
 
E
G
 
G

1fuqA Fumarase with bound 3-trimethylsilylsuccinic acid (see paper)
46% identity, 93% coverage: 4:426/457 of query aligns to 2:429/456 of 1fuqA

query
sites
1fuqA
R
 
R
I
 
S
E
 
E
T
 
K
D
 
D
S
 
S
M
 
M
G
 
G
E
 
A
V
 
I
L
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
D
A
 
K
L
 
L
Y
 
W
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
L
 
L
N
 
E
N
 
H
F
 
F
A
 
R
I
 
I
G
 
S
G
 
T
Q
 
E
P
 
K
M
 
M
P
 
P
R
 
T
A
 
S
F
 
L
I
 
I
E
 
H
T
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
L
I
 
T
K
 
K
A
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
V
N
 
N
S
 
E
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
A
 
S
S
 
E
D
 
E
C
 
K
G
 
A
Q
 
S
A
 
A
I
 
I
T
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
D
K
 
E
A
 
V
L
 
L
M
 
A
-
 
G
Q
 
Q
H
 
H
-
 
D
-
 
D
-
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
L
D
 
A
V
 
I
F
 
W
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
|
T
S
 
Q
S
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
A
 
M
N
|
N
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
N
L
 
R
T
 
A
S
 
S
E
 
E
S
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
G
-
 
M
-
 
E
R
|
R
A
 
K
V
 
V
S
x
H
A
x
P
N
|
N
D
|
D
E
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
K
G
 
S
Q
 
Q
S
|
S
S
|
S
N
|
N
D
 
D
V
 
V
I
 
F
P
 
P
S
 
T
C
 
A
I
 
M
Q
 
H
I
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
L
G
 
L
V
 
A
L
 
L
T
 
R
K
 
K
T
 
Q
L
 
L
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
L
 
L
T
 
K
H
 
T
L
 
L
K
 
T
S
 
Q
C
 
T
I
 
L
R
 
N
T
 
E
K
 
K
A
 
S
A
 
R
S
 
A
V
 
F
K
 
A
G
 
D
V
 
I
V
 
V
K
 
K
T
 
I
G
 
G
R
 
R
T
|
T
H
|
H
L
 
L
M
 
Q
D
 
D
A
 
A
M
 
T
P
 
P
V
 
L
R
 
T
L
 
L
S
 
G
Q
 
Q
S
 
E
L
 
I
E
 
S
T
 
G
W
 
W
A
 
V
S
 
A
Q
 
M
L
 
L
D
 
E
A
 
H
R
 
N
E
 
L
L
 
K
Q
 
H
L
 
I
Q
 
E
S
 
Y
Q
 
S
L
 
L
I
 
P
S
 
H
L
 
V
W
 
A
Q
 
E
L
 
L
P
 
A
Q
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
T
A
 
H
P
 
P
G
 
E
F
 
Y
P
 
A
Q
 
R
A
 
R
F
 
V
C
 
A
H
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
A
L
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
C
L
 
A
A
 
P
F
 
F
Q
 
V
P
 
T
A
 
A
P
 
P
H
 
N
L
 
K
F
 
F
T
 
E
G
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
C
D
 
D
T
 
A
A
 
L
V
 
V
A
 
Q
L
 
A
S
 
H
G
 
G
E
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
T
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
V
R
 
R
W
 
W
M
 
L
N
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
R
A
 
C
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
S
L
 
I
P
 
P
A
 
E
L
 
N
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
T
I
 
Q
P
 
C
E
|
E
A
 
A
V
 
L
A
 
T
M
 
M
A
 
L
C
 
C
A
 
C
Q
 
Q
V
 
V
I
 
M
G
 
G
N
 
N
D
 
D
A
 
V
C
 
A
I
 
I
T
 
N
V
 
M
A
 
G
G
 
G
Q
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
V
M
 
F
L
 
R
P
 
P
V
 
M
I
 
V
A
 
I
D
 
H
N
 
N
L
 
F
L
 
L
S
 
Q
S
 
S
L
 
V
R
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
D
A
 
G
M
 
M
M
 
E
A
 
S
L
 
F
A
 
N
D
 
K
K
 
H
A
 
C
I
 
A
D
 
V
G
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
P
C
 
N
E
 
R
G
 
E
R
 
R
M
 
I
A
 
N
K
 
Q
E
 
L
L
 
L
S
 
N
R
 
E
N
 
S
P
 
L
I
 
M
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
N
P
 
T
I
 
H
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
K
A
 
A
Y
 
H
A
 
K
E
 
E
G
 
G

1fuoA FumarasE C with bound citrate (see paper)
46% identity, 93% coverage: 4:426/457 of query aligns to 2:429/456 of 1fuoA

query
sites
1fuoA
R
 
R
I
 
S
E
 
E
T
 
K
D
 
D
S
 
S
M
 
M
G
 
G
E
 
A
V
 
I
L
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
D
A
 
K
L
 
L
Y
 
W
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
L
 
L
N
 
E
N
 
H
F
 
F
A
 
R
I
 
I
G
 
S
G
 
T
Q
 
E
P
 
K
M
 
M
P
 
P
R
 
T
A
 
S
F
 
L
I
 
I
E
 
H
T
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
L
I
 
T
K
 
K
A
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
V
N
 
N
S
 
E
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
A
 
S
S
 
E
D
 
E
C
 
K
G
 
A
Q
 
S
A
 
A
I
 
I
T
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
D
K
 
E
A
 
V
L
 
L
M
 
A
-
 
G
Q
 
Q
H
 
H
-
 
D
-
 
D
-
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
L
D
 
A
V
 
I
F
 
W
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
|
T
S
 
Q
S
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
A
 
M
N
|
N
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
N
L
 
R
T
 
A
S
 
S
E
 
E
S
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
G
-
 
M
-
 
E
R
 
R
A
 
K
V
 
V
S
 
H
A
 
P
N
 
N
D
 
D
E
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
K
G
 
S
Q
 
Q
S
|
S
S
|
S
N
|
N
D
 
D
V
 
V
I
 
F
P
 
P
S
 
T
C
 
A
I
 
M
Q
 
H
I
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
L
G
 
L
V
 
A
L
 
L
T
 
R
K
 
K
T
 
Q
L
 
L
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
L
 
L
T
 
K
H
 
T
L
 
L
K
 
T
S
 
Q
C
 
T
I
 
L
R
 
N
T
 
E
K
 
K
A
 
S
A
 
R
S
 
A
V
 
F
K
 
A
G
 
D
V
 
I
V
 
V
K
 
K
T
 
I
G
 
G
R
 
R
T
|
T
H
|
H
L
 
L
M
 
Q
D
 
D
A
 
A
M
 
T
P
 
P
V
 
L
R
 
T
L
 
L
S
 
G
Q
 
Q
S
 
E
L
 
I
E
 
S
T
 
G
W
 
W
A
 
V
S
 
A
Q
 
M
L
 
L
D
 
E
A
 
H
R
 
N
E
 
L
L
 
K
Q
 
H
L
 
I
Q
 
E
S
 
Y
Q
 
S
L
 
L
I
 
P
S
 
H
L
 
V
W
 
A
Q
 
E
L
 
L
P
 
A
Q
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
T
A
 
H
P
 
P
G
 
E
F
 
Y
P
 
A
Q
 
R
A
 
R
F
 
V
C
 
A
H
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
A
L
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
C
L
 
A
A
 
P
F
 
F
Q
 
V
P
 
T
A
 
A
P
 
P
H
 
N
L
 
K
F
 
F
T
 
E
G
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
C
D
 
D
T
 
A
A
 
L
V
 
V
A
 
Q
L
 
A
S
 
H
G
 
G
E
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
T
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
V
R
 
R
W
 
W
M
 
L
N
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
R
A
 
C
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
S
L
 
I
P
 
P
A
 
E
L
 
N
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
T
I
 
Q
P
 
C
E
|
E
A
 
A
V
 
L
A
 
T
M
 
M
A
 
L
C
 
C
A
 
C
Q
 
Q
V
 
V
I
 
M
G
 
G
N
 
N
D
 
D
A
 
V
C
 
A
I
 
I
T
 
N
V
 
M
A
 
G
G
 
G
Q
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
V
M
 
F
L
 
R
P
 
P
V
 
M
I
 
V
A
 
I
D
 
H
N
 
N
L
 
F
L
 
L
S
 
Q
S
 
S
L
 
V
R
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
D
A
 
G
M
 
M
M
 
E
A
 
S
L
 
F
A
 
N
D
 
K
K
 
H
A
 
C
I
 
A
D
 
V
G
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
P
C
 
N
E
 
R
G
 
E
R
 
R
M
 
I
A
 
N
K
 
Q
E
 
L
L
 
L
S
 
N
R
 
E
N
 
S
P
 
L
I
 
M
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
N
P
 
T
I
 
H
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
K
A
 
A
Y
 
H
A
 
K
E
 
E
G
 
G

1fupA Fumarase with bound pyromellitic acid (see paper)
46% identity, 93% coverage: 4:426/457 of query aligns to 1:428/455 of 1fupA

query
sites
1fupA
R
 
R
I
 
S
E
 
E
T
 
K
D
 
D
S
 
S
M
 
M
G
 
G
E
 
A
V
 
I
L
 
D
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
D
A
 
K
L
 
L
Y
 
W
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
L
 
L
N
 
E
N
 
H
F
 
F
A
 
R
I
 
I
G
 
S
G
 
T
Q
 
E
P
 
K
M
 
M
P
 
P
R
 
T
A
 
S
F
 
L
I
 
I
E
 
H
T
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
L
I
 
T
K
 
K
A
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
V
N
 
N
S
 
E
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
A
 
S
S
 
E
D
 
E
C
 
K
G
 
A
Q
 
S
A
 
A
I
 
I
T
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
L
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
D
K
 
E
A
 
V
L
 
L
M
 
A
-
 
G
Q
 
Q
H
 
H
-
 
D
-
 
D
-
 
E
F
 
F
P
 
P
V
 
L
D
 
A
V
 
I
F
 
W
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
|
T
S
 
Q
S
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
A
 
M
N
|
N
E
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
N
L
 
R
T
 
A
S
 
S
E
 
E
S
 
L
L
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
R
-
 
G
-
 
M
-
 
E
R
 
R
A
 
K
V
 
V
S
 
H
A
 
P
N
 
N
D
 
D
E
 
D
V
 
V
N
|
N
L
 
K
G
 
S
Q
 
Q
S
|
S
S
|
S
N
|
N
D
 
D
V
 
V
I
 
F
P
 
P
S
 
T
C
 
A
I
 
M
Q
 
H
I
 
V
A
 
A
S
 
A
A
 
L
G
 
L
V
 
A
L
 
L
T
 
R
K
 
K
T
 
Q
L
 
L
L
 
I
P
 
P
A
 
Q
L
 
L
T
 
K
H
 
T
L
 
L
K
 
T
S
 
Q
C
 
T
I
 
L
R
 
N
T
 
E
K
 
K
A
 
S
A
 
R
S
 
A
V
 
F
K
 
A
G
 
D
V
 
I
V
 
V
K
 
K
T
 
I
G
 
G
R
 
R
T
|
T
H
|
H
L
 
L
M
 
Q
D
 
D
A
 
A
M
 
T
P
 
P
V
 
L
R
 
T
L
 
L
S
 
G
Q
 
Q
S
 
E
L
 
I
E
 
S
T
 
G
W
 
W
A
 
V
S
 
A
Q
 
M
L
 
L
D
 
E
A
 
H
R
 
N
E
 
L
L
 
K
Q
 
H
L
 
I
Q
 
E
S
 
Y
Q
 
S
L
 
L
I
 
P
S
 
H
L
 
V
W
 
A
Q
 
E
L
 
L
P
 
A
Q
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
|
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
T
A
 
H
P
 
P
G
 
E
F
 
Y
P
 
A
Q
 
R
A
 
R
F
 
V
C
 
A
H
 
D
E
 
E
L
 
L
N
 
A
L
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
C
L
 
A
A
 
P
F
 
F
Q
 
V
P
 
T
A
 
A
P
 
P
H
 
N
L
 
K
F
 
F
T
 
E
G
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
T
Q
 
C
D
 
D
T
 
A
A
 
L
V
 
V
A
 
Q
L
 
A
S
 
H
G
 
G
E
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
A
T
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
V
R
 
R
W
 
W
M
 
L
N
 
A
S
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
R
A
 
C
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
I
 
I
R
 
S
L
 
I
P
 
P
A
 
E
L
 
N
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
T
I
 
Q
P
 
C
E
|
E
A
 
A
V
 
L
A
 
T
M
 
M
A
 
L
C
 
C
A
 
C
Q
 
Q
V
 
V
I
 
M
G
 
G
N
 
N
D
 
D
A
 
V
C
 
A
I
 
I
T
 
N
V
 
M
A
 
G
G
 
G
Q
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
V
M
 
F
L
 
R
P
 
P
V
 
M
I
 
V
A
 
I
D
 
H
N
 
N
L
 
F
L
 
L
S
 
Q
S
 
S
L
 
V
R
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
A
N
 
D
A
 
G
M
 
M
M
 
E
A
 
S
L
 
F
A
 
N
D
 
K
K
 
H
A
 
C
I
 
A
D
 
V
G
 
G
F
 
I
E
 
E
V
 
P
C
 
N
E
 
R
G
 
E
R
 
R
M
 
I
A
 
N
K
 
Q
E
 
L
L
 
L
S
 
N
R
 
E
N
 
S
P
 
L
I
 
M
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
N
P
 
T
I
 
H
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
E
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
K
A
 
A
Y
 
H
A
 
K
E
 
E
G
 
G

4adlA Crystal structures of rv1098c in complex with malate (see paper)
47% identity, 98% coverage: 2:449/457 of query aligns to 1:451/459 of 4adlA

query
sites
4adlA
D
 
N
S
 
Y
R
 
R
I
 
I
E
 
E
T
 
H
D
 
D
S
 
T
M
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Y
 
W
G
 
R
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
V
N
 
E
N
 
N
F
 
F
A
 
P
I
 
I
G
 
S
G
 
G
Q
 
R
P
 
G
M
 
L
P
 
E
R
 
R
A
 
T
F
 
Q
I
 
I
E
 
R
T
 
A
L
 
L
L
 
G
L
 
L
I
 
L
K
 
K
A
 
G
A
 
A
A
 
C
A
 
A
R
 
Q
A
 
V
N
 
N
S
 
S
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
P
D
 
E
C
 
K
G
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
T
 
I
E
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
A
S
 
E
L
 
I
R
 
A
Q
 
D
D
 
G
K
 
Q
A
 
H
L
 
D
M
 
D
Q
 
Q
H
 
-
F
 
F
P
 
P
V
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
|
S
G
 
G
T
|
T
S
 
S
S
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
A
 
T
N
 
N
E
 
E
V
 
V
L
 
I
A
 
A
R
 
S
L
 
I
T
 
A
S
 
A
E
 
K
S
 
G
L
 
-
G
 
G
R
 
V
A
 
T
V
 
L
S
 
H
A
 
P
N
 
N
D
 
D
E
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
M
G
 
S
Q
 
Q
S
|
S
S
|
S
N
|
N
D
 
D
V
 
T
I
 
F
P
 
P
S
 
T
C
 
A
I
 
T
Q
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
T
G
 
E
V
 
A
L
 
A
T
 
V
K
 
A
T
 
H
L
 
L
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
H
 
Q
L
 
L
K
 
H
S
 
D
C
 
A
I
 
L
R
 
A
T
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
L
S
 
D
V
 
W
K
 
H
G
 
T
V
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
T
|
T
H
|
H
L
 
L
M
 
M
D
 
D
A
 
A
M
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
T
L
 
L
S
 
G
Q
 
Q
S
 
E
L
 
F
E
 
S
T
 
G
W
 
Y
A
 
A
S
 
R
Q
 
Q
L
 
I
D
 
E
A
 
A
R
 
G
E
 
I
L
 
E
Q
 
R
L
 
V
Q
 
R
S
 
A
Q
 
C
L
 
L
I
 
P
S
 
R
L
 
L
W
 
G
Q
 
E
L
 
L
P
 
A
Q
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
P
P
 
D
G
 
D
F
 
F
P
 
G
Q
 
V
A
 
R
F
 
V
C
 
V
H
 
A
E
 
V
L
 
L
N
 
V
L
 
A
L
 
Q
T
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
S
-
 
E
F
 
L
Q
 
R
P
 
T
A
 
A
P
 
A
H
 
N
L
 
S
F
 
F
T
 
E
G
 
A
I
 
Q
A
 
A
S
 
A
Q
 
R
D
 
D
T
 
G
A
 
L
V
 
V
A
 
E
L
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
V
T
 
S
L
 
L
M
 
T
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
R
 
R
W
 
W
M
 
M
N
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
D
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
V
I
 
L
P
 
P
E
|
E
A
 
A
V
 
V
A
 
T
M
 
Q
A
 
V
C
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
D
A
 
A
C
 
A
I
 
I
T
 
A
V
 
W
A
 
G
G
 
G
Q
 
A
S
 
N
G
 
G
N
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
V
M
 
Y
L
 
I
P
 
P
V
 
M
I
 
M
A
 
A
D
 
R
N
 
N
L
 
I
L
 
L
S
 
E
S
 
S
L
 
F
R
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
N
 
N
A
 
V
M
 
S
M
 
R
A
 
L
L
 
F
A
 
A
D
 
Q
K
 
R
A
 
C
I
 
I
D
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
T
V
 
A
C
 
N
E
 
V
G
 
E
R
 
H
M
 
L
A
 
R
K
 
R
E
 
L
L
 
A
S
 
E
R
 
S
N
 
S
P
 
P
I
 
S
L
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
P
L
 
L
N
 
N
P
 
S
I
 
A
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
E
K
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
Q
A
 
A
Y
 
L
A
 
K
E
 
E
G
 
R
R
 
K
P
 
T
V
 
I
L
 
R
E
 
Q
V
 
T
A
 
V
L
 
I
E
 
D
M
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
I
-
 
G
T
 
D
D
 
R
I
 
L
D
 
S
A
 
I
E
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
D
R
 
R
L
 
R
L
 
L
D
 
D

P9WN93 Fumarate hydratase class II; Fumarase C; Aerobic fumarase; Iron-independent fumarase; EC 4.2.1.2 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
47% identity, 98% coverage: 2:449/457 of query aligns to 9:459/474 of P9WN93

query
sites
P9WN93
D
 
N
S
 
Y
R
 
R
I
 
I
E
 
E
T
 
H
D
 
D
S
 
T
M
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Y
 
W
G
 
R
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
V
N
 
E
N
 
N
F
 
F
A
 
P
I
 
I
G
 
S
G
 
G
Q
 
R
P
 
G
M
 
L
P
 
E
R
 
R
A
 
T
F
 
Q
I
 
I
E
 
R
T
 
A
L
 
L
L
 
G
L
 
L
I
 
L
K
 
K
A
 
G
A
 
A
A
 
C
A
 
A
R
 
Q
A
 
V
N
 
N
S
 
S
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
P
D
 
E
C
 
K
G
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
T
 
I
E
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
A
S
 
E
L
 
I
R
 
A
Q
 
D
D
 
G
K
 
Q
A
 
H
L
 
D
M
 
D
Q
 
Q
H
 
-
F
 
F
P
 
P
V
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
|
S
G
|
G
T
|
T
S
 
S
S
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
A
 
T
N
 
N
E
 
E
V
 
V
L
 
I
A
 
A
R
 
S
L
 
I
T
 
A
S
 
A
E
 
K
S
 
G
L
 
-
G
 
G
R
 
V
A
 
T
V
 
L
S
 
H
A
 
P
N
 
N
D
 
D
E
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
M
G
 
S
Q
 
Q
S
|
S
S
|
S
N
|
N
D
 
D
V
 
T
I
 
F
P
 
P
S
 
T
C
 
A
I
 
T
Q
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
T
G
 
E
V
 
A
L
 
A
T
 
V
K
 
A
T
 
H
L
 
L
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
H
 
Q
L
 
L
K
 
H
S
 
D
C
 
A
I
 
L
R
 
A
T
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
L
S
 
D
V
 
W
K
 
H
G
 
T
V
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
T
|
T
H
 
H
L
 
L
M
 
M
D
 
D
A
 
A
M
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
T
L
 
L
S
 
G
Q
 
Q
S
 
E
L
 
F
E
 
S
T
 
G
W
 
Y
A
 
A
S
 
R
Q
 
Q
L
 
I
D
 
E
A
 
A
R
 
G
E
 
I
L
 
E
Q
 
R
L
 
V
Q
 
R
S
 
A
Q
 
C
L
 
L
I
 
P
S
 
R
L
 
L
W
 
G
Q
 
E
L
 
L
P
 
A
Q
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
P
P
 
D
G
 
D
F
 
F
P
 
G
Q
 
V
A
 
R
F
 
V
C
 
V
H
 
A
E
 
V
L
 
L
N
 
V
L
 
A
L
 
Q
T
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
S
-
 
E
F
 
L
Q
 
R
P
 
T
A
 
A
P
 
A
H
 
N
L
 
S
F
 
F
T
 
E
G
 
A
I
 
Q
A
 
A
S
 
A
Q
 
R
D
 
D
T
 
G
A
 
L
V
 
V
A
 
E
L
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
V
T
 
S
L
 
L
M
 
T
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
R
 
R
W
 
W
M
 
M
N
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
D
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
G
 
G
S
|
S
S
|
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
|
V
N
|
N
P
 
P
V
 
V
I
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
T
M
 
Q
A
 
V
C
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
D
A
 
A
C
 
A
I
 
I
T
 
A
V
 
W
A
 
G
G
 
G
Q
 
A
S
 
N
G
 
G
N
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
V
M
 
Y
L
 
I
P
 
P
V
 
M
I
 
M
A
 
A
D
 
R
N
 
N
L
 
I
L
 
L
S
 
E
S
 
S
L
 
F
R
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
N
 
N
A
 
V
M
 
S
M
 
R
A
 
L
L
 
F
A
 
A
D
 
Q
K
 
R
A
 
C
I
 
I
D
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
T
V
 
A
C
 
N
E
 
V
G
 
E
R
 
H
M
 
L
A
 
R
K
 
R
E
 
L
L
 
A
S
 
E
R
 
S
N
 
S
P
 
P
I
 
S
L
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
P
L
 
L
N
 
N
P
 
S
I
 
A
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
E
K
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
Q
A
 
A
Y
 
L
A
 
K
E
 
E
G
 
R
R
 
K
P
 
T
V
 
I
L
 
R
E
 
Q
V
 
T
A
 
V
L
 
I
E
 
D
M
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
I
-
 
G
T
 
D
D
 
R
I
 
L
D
 
S
A
 
I
E
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
D
R
 
R
L
 
R
L
 
L
D
 
D

4apbD Crystal structure of mycobacterium tuberculosis fumarase ( rv1098c) s318c in complex with fumarate (see paper)
46% identity, 98% coverage: 2:449/457 of query aligns to 1:451/462 of 4apbD

query
sites
4apbD
D
 
N
S
 
Y
R
 
R
I
 
I
E
 
E
T
 
H
D
 
D
S
 
T
M
 
M
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
K
A
 
A
L
 
L
Y
 
W
G
 
R
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
A
L
 
V
N
 
E
N
 
N
F
 
F
A
 
P
I
 
I
G
 
S
G
 
G
Q
 
R
P
 
G
M
 
L
P
 
E
R
 
R
A
 
T
F
 
Q
I
 
I
E
 
R
T
 
A
L
 
L
L
 
G
L
 
L
I
 
L
K
 
K
A
 
G
A
 
A
A
 
C
A
 
A
R
 
Q
A
 
V
N
 
N
S
 
S
Q
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
P
D
 
E
C
 
K
G
 
A
Q
 
D
A
 
A
I
 
I
T
 
I
E
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
A
S
 
E
L
 
I
R
 
A
Q
 
D
D
 
G
K
 
Q
A
 
H
L
 
D
M
 
D
Q
 
Q
H
 
-
F
 
F
P
 
P
V
 
I
D
 
D
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
|
T
S
 
S
S
 
S
N
 
N
M
 
M
N
 
N
A
 
T
N
 
N
E
 
E
V
 
V
L
 
I
A
 
A
R
 
S
L
 
I
T
 
A
S
 
A
E
 
K
S
 
G
L
 
-
G
 
G
R
 
V
A
 
T
V
 
L
S
 
H
A
 
P
N
 
N
D
 
D
E
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
M
G
 
S
Q
 
Q
S
|
S
S
|
S
N
|
N
D
 
D
V
 
T
I
 
F
P
 
P
S
 
T
C
 
A
I
 
T
Q
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
T
G
 
E
V
 
A
L
 
A
T
 
V
K
 
A
T
 
H
L
 
L
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
Q
H
 
Q
L
 
L
K
 
H
S
 
D
C
 
A
I
 
L
R
 
A
T
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
L
S
 
D
V
 
W
K
 
H
G
 
T
V
 
V
V
 
V
K
 
K
T
 
S
G
 
G
R
 
R
T
|
T
H
|
H
L
 
L
M
 
M
D
 
D
A
 
A
M
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
T
L
 
L
S
 
G
Q
 
Q
S
 
E
L
 
F
E
 
S
T
 
G
W
 
Y
A
 
A
S
 
R
Q
 
Q
L
 
I
D
 
E
A
 
A
R
 
G
E
 
I
L
 
E
Q
 
R
L
 
V
Q
 
R
S
 
A
Q
 
C
L
 
L
I
 
P
S
 
R
L
 
L
W
 
G
Q
 
E
L
 
L
P
 
A
Q
 
I
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
P
P
 
D
G
 
D
F
 
F
P
 
G
Q
 
V
A
 
R
F
 
V
C
 
V
H
 
A
E
 
V
L
 
L
N
 
V
L
 
A
L
 
Q
T
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
S
-
 
E
F
 
L
Q
 
R
P
 
T
A
 
A
P
 
A
H
 
N
L
 
S
F
 
F
T
 
E
G
 
A
I
 
Q
A
 
A
S
 
A
Q
 
R
D
 
D
T
 
G
A
 
L
V
 
V
A
 
E
L
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
A
L
 
L
K
 
R
A
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
V
T
 
S
L
 
L
M
 
T
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
R
 
R
W
 
W
M
 
M
N
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
T
G
 
G
L
 
L
G
 
A
E
 
E
I
 
I
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
A
 
D
L
 
L
Q
 
Q
P
 
P
G
|
G
S
x
C
S
|
S
I
|
I
M
|
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
|
N
P
 
P
V
 
V
I
 
L
P
 
P
E
|
E
A
 
A
V
 
V
A
 
T
M
 
Q
A
 
V
C
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
G
 
G
N
 
N
D
 
D
A
 
A
C
 
A
I
 
I
T
 
A
V
 
W
A
 
G
G
 
G
Q
 
A
S
 
N
G
 
G
N
 
A
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
V
M
 
Y
L
 
I
P
 
P
V
 
M
I
 
M
A
 
A
D
 
R
N
 
N
L
 
I
L
 
L
S
 
E
S
 
S
L
 
F
R
 
K
L
 
L
L
 
L
T
 
T
N
 
N
A
 
V
M
 
S
M
 
R
A
 
L
L
 
F
A
 
A
D
 
Q
K
 
R
A
 
C
I
 
I
D
 
A
G
 
G
F
 
L
E
 
T
V
 
A
C
 
N
E
 
V
G
 
E
R
 
H
M
 
L
A
 
R
K
 
R
E
 
L
L
 
A
S
 
E
R
 
S
N
 
S
P
 
P
I
 
S
L
 
I
V
 
V
T
 
T
A
 
P
L
 
L
N
 
N
P
 
S
I
 
A
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
E
K
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
K
R
 
Q
A
 
A
Y
 
L
A
 
K
E
 
E
G
 
R
R
 
K
P
 
T
V
 
I
L
 
R
E
 
Q
V
 
T
A
 
V
L
 
I
E
 
D
M
 
R
-
 
G
-
 
L
-
 
I
-
 
G
T
 
D
D
 
R
I
 
L
D
 
S
A
 
I
E
 
E
E
 
D
L
 
L
A
 
D
R
 
R
L
 
R
L
 
L
D
 
D

Q9ZCQ4 Fumarate hydratase class II; Fumarase C; Aerobic fumarase; Iron-independent fumarase; EC 4.2.1.2 from Rickettsia prowazekii (strain Madrid E) (see paper)
41% identity, 99% coverage: 2:453/457 of query aligns to 3:459/461 of Q9ZCQ4

query
sites
Q9ZCQ4
D
 
N
S
 
Y
R
 
R
I
 
I
E
 
E
T
 
S
D
 
D
S
 
S
M
 
F
G
 
G
E
 
E
V
 
I
L
 
Q
V
 
I
P
 
E
A
 
E
E
 
K
A
 
F
L
 
Y
Y
 
W
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
A
 
S
L
 
L
N
 
N
N
 
N
F
 
F
A
 
K
I
 
I
G
 
S
G
 
K
Q
 
Q
P
 
K
M
 
M
P
 
P
R
 
K
A
 
I
F
 
L
I
 
I
E
 
R
T
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
I
I
 
L
K
 
K
A
 
K
A
 
C
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
A
 
V
N
 
N
S
 
Y
Q
 
E
L
 
F
G
 
G
V
 
D
L
 
L
A
 
E
S
 
Y
D
 
K
C
 
I
G
 
A
Q
 
T
A
 
S
I
 
I
T
 
D
E
 
K
A
 
A
A
 
I
L
 
D
S
 
R
L
 
I
R
 
L
Q
 
A
D
 
G
K
 
E
A
 
-
L
 
F
M
 
E
Q
 
D
H
 
N
F
 
F
P
 
P
V
 
L
D
 
V
V
 
V
F
 
W
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
|
S
G
|
G
T
|
T
S
 
Q
S
 
T
N
 
N
M
 
M
N
 
N
A
 
M
N
 
N
E
 
E
V
 
V
L
 
I
A
 
A
R
 
S
L
 
I
T
 
A
S
 
N
E
 
E
S
 
E
L
 
L
-
 
T
G
 
G
R
 
K
A
 
K
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
F
-
 
P
V
 
V
S
 
H
A
 
P
N
 
N
D
 
D
E
 
H
V
 
V
N
 
N
L
 
K
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
S
 
S
N
 
N
D
 
D
V
 
S
I
 
F
P
 
P
S
 
T
C
 
A
I
 
M
Q
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
T
A
 
V
G
 
L
V
 
A
L
 
T
T
 
K
K
 
Q
T
 
Q
L
 
L
L
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
T
 
N
H
 
N
L
 
L
K
 
L
S
 
T
C
 
Y
I
 
L
R
 
Q
T
 
D
K
 
K
A
 
S
A
 
K
S
 
D
V
 
W
K
 
D
G
 
K
V
 
I
V
 
I
K
 
K
T
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
H
 
H
L
 
L
M
 
Q
D
 
D
A
 
A
M
 
T
P
 
P
V
 
L
R
 
T
L
 
L
S
 
K
Q
 
Q
S
 
E
L
 
F
E
 
S
T
 
G
W
 
Y
A
 
I
S
 
T
Q
 
Q
L
 
I
D
 
E
A
 
Y
R
 
A
E
 
L
L
 
E
Q
 
R
L
 
I
Q
 
E
S
 
D
Q
 
A
L
 
L
I
 
K
S
 
K
L
 
V
W
 
Y
Q
 
L
L
 
L
P
 
A
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
I
N
 
N
A
 
S
A
 
K
P
 
I
G
 
G
F
 
F
P
 
D
Q
 
I
A
 
K
F
 
F
C
 
A
H
 
Q
E
 
K
L
 
V
N
 
A
L
 
E
L
 
F
T
 
T
G
 
Q
L
 
Q
A
 
P
F
 
F
Q
 
K
P
 
T
A
 
A
P
 
P
H
 
N
L
 
K
F
 
F
T
 
E
G
 
S
I
 
L
A
 
A
S
 
A
Q
 
H
D
 
D
T
 
A
A
 
L
V
 
V
A
 
E
L
 
F
S
 
S
G
 
G
E
 
T
L
 
L
K
 
N
A
 
T
L
 
I
A
 
A
V
 
V
T
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
R
 
R
W
 
L
M
 
L
N
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
R
A
 
C
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
E
I
 
L
R
 
H
L
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
N
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
S
 
S
S
 
S
I
 
I
M
 
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
|
V
N
|
N
P
 
P
V
 
T
I
 
Q
P
 
V
E
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
T
M
 
M
A
 
V
C
 
C
A
 
T
Q
 
Q
V
 
V
I
 
M
G
 
G
N
 
N
D
 
H
A
 
V
C
 
T
I
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
A
G
 
G
Q
 
S
S
 
N
G
 
G
N
 
H
F
 
L
E
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
V
M
 
F
L
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
I
D
 
Y
N
 
N
L
 
I
L
 
L
S
 
Q
S
 
S
L
 
I
R
 
E
L
 
L
L
 
L
T
 
S
N
 
D
A
 
S
M
 
V
M
 
N
A
 
S
L
 
F
A
 
V
D
 
T
K
 
H
A
 
C
I
 
V
D
 
K
G
 
G
F
 
L
E
 
E
V
 
P
C
 
N
E
 
I
G
 
A
R
 
R
M
 
I
A
 
N
K
 
T
E
 
L
L
 
R
S
 
D
R
 
K
N
 
S
P
 
L
I
 
M
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
V
L
 
L
N
 
N
P
 
P
I
 
H
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
K
 
N
A
 
A
A
 
A
D
 
K
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
E
A
 
A
Y
 
H
A
 
K
E
 
Y
G
 
G
R
 
I
P
 
T
V
 
L
L
 
K
E
 
E
V
 
A
A
 
A
L
 
K
E
 
K
M
 
L
T
 
N
D
 
F
I
 
L
D
 
S
A
 
E
E
 
E
E
 
E
L
 
F
A
 
D
R
 
K
L
 
I
L
 
V
D
 
V
P
 
P
V
 
E
R
 
K
L
 
M

7lubB Crystal structure of recombinant human fumarase in complex with d-2- amino-3-phosphono-propionic acid (see paper)
42% identity, 99% coverage: 4:455/457 of query aligns to 3:460/462 of 7lubB

query
sites
7lubB
R
 
R
I
 
I
E
 
E
T
 
Y
D
 
D
S
 
T
M
 
F
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
N
E
 
D
A
 
K
L
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
V
R
 
R
A
 
S
L
 
T
N
 
M
N
 
N
F
 
F
A
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
-
 
V
-
 
T
Q
 
E
P
 
R
M
 
M
P
 
P
R
 
T
A
 
P
F
 
V
I
 
I
E
 
K
T
 
A
L
 
F
L
 
G
L
 
I
I
 
L
K
 
K
A
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
V
N
 
N
S
 
Q
Q
 
D
L
 
Y
G
 
G
V
 
-
L
 
L
A
 
D
S
 
P
D
 
K
C
 
I
G
 
A
Q
 
N
A
 
A
I
 
I
T
 
M
E
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
D
S
 
E
L
 
V
R
 
A
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
A
 
-
L
 
L
M
 
N
Q
 
D
H
 
H
F
 
F
P
 
P
V
 
L
D
 
V
V
 
V
F
 
W
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
Q
S
 
T
N
 
N
M
 
M
N
 
N
A
 
V
N
 
N
E
 
E
V
 
V
L
 
I
A
 
S
R
 
N
L
 
R
T
 
A
S
 
I
E
 
E
S
 
M
L
 
L
G
 
G
R
 
G
A
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
I
-
 
P
V
 
V
S
 
H
A
 
P
N
 
N
D
 
D
E
 
H
V
 
V
N
 
N
L
 
K
G
 
S
Q
 
Q
S
 
S
S
 
S
N
 
N
D
 
D
V
 
T
I
 
F
P
 
P
S
 
T
C
 
A
I
 
M
Q
 
H
I
 
I
A
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
I
V
 
E
L
 
V
T
 
H
K
 
E
T
 
V
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
G
L
 
L
T
 
Q
H
 
K
L
 
L
K
 
H
S
 
D
C
 
A
I
 
L
R
 
D
T
 
A
K
 
K
A
 
S
A
 
K
S
 
E
V
 
F
K
 
A
G
 
Q
V
 
I
V
 
I
K
 
K
T
 
I
G
 
G
R
 
R
T
|
T
H
|
H
L
 
T
M
 
Q
D
 
D
A
 
A
M
 
V
P
 
P
V
 
L
R
 
T
L
 
L
S
 
G
Q
 
Q
S
 
E
L
 
F
E
 
S
T
 
G
W
 
Y
A
 
V
S
 
Q
Q
 
Q
L
 
V
D
 
K
A
 
Y
R
 
A
E
 
M
L
 
T
Q
 
R
L
 
I
Q
 
K
S
 
A
Q
 
A
L
 
M
I
 
P
S
 
R
L
 
I
W
 
Y
Q
 
E
L
 
L
P
 
A
Q
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
V
 
L
N
 
N
A
 
T
A
 
R
P
 
I
G
 
G
F
 
F
P
 
A
Q
 
E
A
 
K
F
 
V
C
 
A
H
 
A
E
 
K
L
 
V
N
 
A
L
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
L
A
 
P
F
 
F
Q
 
V
P
 
T
A
 
A
P
 
P
H
 
N
L
 
K
F
 
F
T
 
E
G
 
A
I
 
L
A
 
A
S
 
A
Q
 
H
D
 
D
T
 
A
A
 
L
V
 
V
A
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
E
 
A
L
 
M
K
 
N
A
 
T
L
 
T
A
 
A
V
 
C
T
 
S
L
 
L
M
 
M
K
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
D
 
D
L
 
I
R
 
R
W
 
F
M
 
L
N
 
G
S
 
S
G
 
G
P
 
P
L
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
E
I
 
L
R
 
I
L
 
L
P
 
P
A
 
E
L
 
N
Q
 
E
P
 
P
G
 
G
S
|
S
S
 
S
I
|
I
M
|
M
P
 
P
G
 
G
K
|
K
V
 
V
N
|
N
P
 
P
V
 
T
I
 
Q
P
 
C
E
 
E
A
 
A
V
 
M
A
 
T
M
 
M
A
 
V
C
 
A
A
 
A
Q
 
Q
V
 
V
I
 
M
G
 
G
N
 
N
D
 
H
A
 
V
C
 
A
I
 
V
T
 
T
V
 
V
A
 
G
G
 
G
Q
 
S
S
 
N
G
 
G
N
 
H
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
V
 
V
M
 
F
L
 
K
P
 
P
V
 
M
I
 
M
A
 
I
D
 
K
N
 
N
L
 
V
L
 
L
S
 
H
S
 
S
L
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
G
N
 
D
A
 
A
M
 
S
M
 
V
A
 
S
L
 
F
A
 
T
D
 
E
K
 
N
A
 
C
I
 
V
D
 
V
G
 
G
F
 
I
E
 
Q
V
 
A
C
 
N
E
 
T
G
 
E
R
 
R
M
 
I
A
 
N
K
 
K
E
 
L
L
 
M
S
 
N
R
 
E
N
 
S
P
 
L
I
 
M
L
 
L
V
 
V
T
 
T
A
 
A
L
 
L
N
 
N
P
 
P
I
 
H
V
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
D
K
 
K
A
 
A
A
 
A
D
 
K
I
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
T
A
 
A
Y
 
H
A
 
K
E
 
N
G
 
G
R
 
S
P
 
T
V
 
L
L
 
K
E
 
E
V
 
T
A
 
A
L
 
I
E
 
E
M
 
L
T
 
G
D
 
Y
I
 
L
D
 
T
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
L
 
F
A
 
D
R
 
E
L
 
W
L
 
V
D
 
K
P
 
P
V
 
K
R
 
D
L
 
M
T
 
L
G
 
G

5uppA Crystal structure of human fumarate hydratase (see paper)
42% identity, 99% coverage: 4:455/457 of query aligns to 3:460/462 of 5uppA

query
sites
5uppA
R
 
R
I
 
I
E
 
E
T
 
Y
D
 
D
S
 
T
M
 
F
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
K
V
 
V
P
 
P
A
 
N
E
 
D
A
 
K
L
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
Q
 
V
R
 
R
A
 
S
L
 
T
N
 
M
N
 
N
F
 
F
A
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
G
-
 
V
-
 
T
Q
 
E
P
 
R
M
 
M
P
 
P
R
 
T
A
 
P
F
 
V
I
 
I
E
 
K
T
 
A
L
 
F
L
 
G
L
 
I
I
 
L
K
 
K
A
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
V
N
 
N
S
 
Q
Q
 
D
L
 
Y
G
 
G
V
 
-
L
 
L
A
 
D
S
 
P
D
 
K
C
 
I
G
 
A
Q
 
N
A
 
A
I
 
I
T
 
M
E
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
D
S
 
E
L
 
V
R
 
A
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
A
 
-
L
 
L
M
 
N
Q
 
D
H
 
H
F
 
F
P
 
P
V
 
L
D
 
V
V
 
V
F
 
W
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
S
 
S
G
 
G
T
 
T
S
 
Q
S
 
T
N
 
N
M
 
M
N
 
N
A
 
V
N
 
N
E
 
E
V
 
V
L
 
I
A
 
S
R
 
N
L
 
R
T
 
A
S
 
I
E
 
E
S
 
M
L
 
L
G
 
G
R
 
G
A
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
S
-