SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 6936653 FitnessBrowser__SB2B:6936653 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1ml4A The pala-liganded aspartate transcarbamoylase catalytic subunit from pyrococcus abyssi (see paper)
44% identity, 93% coverage: 4:319/339 of query aligns to 2:306/307 of 1ml4A

query
sites
1ml4A
F
 
W
K
 
K
G
 
G
S
 
R
H
 
D
I
 
V
L
 
I
S
 
S
V
 
I
N
 
R
Q
 
D
F
 
F
N
 
S
L
 
K
D
 
E
S
 
D
I
 
I
H
 
E
T
 
T
I
 
V
F
 
L
N
 
A
V
 
T
A
 
A
E
 
E
R
 
R
M
 
L
A
 
E
P
 
R
Y
 
E
A
 
L
L
 
K
R
 
E
E
 
K
K
 
G
R
 
Q
T
 
L
R
 
E
V
 
Y
L
 
A
D
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
P
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
C
 
S
A
 
A
F
 
M
N
 
H
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
V
A
 
I
E
 
G
T
 
F
V
 
A
G
 
E
M
 
A
A
 
S
S
 
T
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
R
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
K
V
 
T
L
 
V
S
 
E
T
 
Q
Y
 
Y
S
 
C
D
 
D
V
 
V
I
 
I
A
 
V
M
 
I
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
K
A
 
E
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
R
 
R
E
 
L
F
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
V
S
 
A
R
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
S
N
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
K
K
 
K
E
 
E
L
 
F
S
 
G
H
 
R
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
-
I
 
I
D
 
D
G
 
G
M
 
L
H
 
K
I
 
I
A
 
G
M
 
L
V
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
E
L
 
A
L
 
L
C
 
T
L
 
F
Y
 
Y
K
 
-
N
 
D
V
 
V
S
 
E
F
 
L
T
 
Y
L
 
L
I
 
I
S
 
S
P
 
P
K
 
E
E
 
L
L
 
L
A
 
R
M
 
M
P
 
P
D
 
R
Y
 
H
V
 
I
I
 
V
A
 
E
D
 
E
I
 
L
E
 
R
N
 
E
A
 
K
G
 
G
H
 
M
K
 
K
V
 
V
T
 
V
I
 
E
T
 
T
D
 
T
Q
 
T
L
 
L
E
 
E
G
 
D
N
 
V
L
 
I
D
 
G
K
 
K
A
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
P
S
 
D
Q
 
E
D
 
Q
E
 
E
A
 
Y
N
 
L
K
 
K
Y
 
V
R
 
K
G
 
G
K
 
S
F
 
Y
R
 
Q
L
 
V
N
 
N
R
 
L
S
 
K
I
 
V
Y
 
L
T
 
-
Q
 
E
H
 
K
C
 
A
K
 
K
S
 
D
N
 
E
T
 
L
V
 
R
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
H
N
 
P
D
 
E
L
 
V
N
 
D
S
 
N
H
 
T
P
 
K
N
 
H
L
 
A
A
 
I
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
V
D
 
F
N
 
N
G
|
G
L
 
V
L
 
P
I
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
V

5g1nE Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to pala (see paper)
46% identity, 92% coverage: 6:318/339 of query aligns to 5:305/307 of 5g1nE

query
sites
5g1nE
G
 
G
S
 
Q
H
 
H
I
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
V
N
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
N
 
T
L
 
K
D
 
D
S
 
Q
I
 
M
H
 
S
T
 
H
I
 
L
F
 
F
N
 
N
V
 
V
A
 
A
E
 
H
R
 
T
M
 
L
A
 
R
P
 
M
Y
 
M
A
 
V
L
 
Q
R
 
K
E
 
E
K
 
R
R
 
S
T
 
L
R
 
D
V
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
V
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
A
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
A
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
V
A
 
L
E
 
-
T
 
S
V
 
F
G
 
S
M
 
E
A
 
A
S
 
T
S
 
S
S
|
S
L
 
V
S
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
A
 
V
R
 
Q
V
 
T
L
 
M
S
 
S
T
 
C
Y
 
Y
S
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
V
M
 
L
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
A
 
P
Y
 
G
S
 
A
V
 
V
R
 
E
E
 
L
F
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
H
S
 
C
R
 
R
V
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
G
H
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
T
I
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
M
H
 
T
I
 
I
A
 
T
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
C
L
 
L
L
 
L
C
 
T
L
 
Q
Y
 
Y
K
 
R
N
 
-
V
 
V
S
 
S
F
 
L
T
 
R
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
K
 
P
E
 
S
L
 
L
A
 
R
M
 
M
P
 
P
D
 
P
Y
 
T
V
 
V
I
 
R
A
 
A
D
 
F
I
 
V
E
 
A
N
 
S
A
 
R
G
 
G
H
 
T
K
 
K
V
 
Q
T
 
E
I
 
E
T
 
F
D
 
E
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
E
N
 
A
L
 
L
D
 
P
K
 
D
A
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
|
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
G
S
 
S
Q
 
T
D
 
Q
E
 
E
A
 
Y
N
 
E
K
 
A
Y
 
C
R
 
F
G
 
G
K
 
Q
F
 
F
R
 
I
L
 
L
N
 
T
R
 
P
S
 
H
I
 
I
Y
 
M
T
 
T
Q
 
R
H
 
-
C
 
A
K
 
K
S
 
K
N
 
K
T
 
M
V
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
x
M
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
S
N
 
V
D
 
E
L
 
V
N
 
D
S
 
S
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
E
N
 
N
G
|
G
L
 
M
L
 
Y
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
T
T
 
V
L
 
L
G
 
G

P27708 CAD protein; EC 6.3.5.5; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
46% identity, 92% coverage: 6:318/339 of query aligns to 1923:2223/2225 of P27708

query
sites
P27708
G
|
G
S
x
Q
H
|
H
I
|
I
L
|
L
S
|
S
V
|
V
N
x
Q
Q
|
Q
F
|
F
N
x
T
L
x
K
D
|
D
S
x
Q
I
x
M
H
x
S
T
x
H
I
x
L
F
|
F
N
|
N
V
|
V
A
|
A
E
x
H
R
x
T
M
x
L
A
x
R
P
x
M
Y
x
M
A
x
V
L
x
Q
R
x
K
E
|
E
K
x
R
R
x
S
T
x
L
R
x
D
V
x
I
L
|
L
D
x
K
G
|
G
A
x
K
I
x
V
L
x
M
G
x
A
N
x
S
L
x
M
F
|
F
F
x
Y
E
|
E
P
x
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
x
S
V
x
S
S
|
S
F
|
F
G
x
A
C
x
A
A
|
A
F
x
M
N
x
A
L
x
R
L
|
L
G
|
G
G
|
G
R
x
A
V
|
V
A
x
L
E
 
-
T
x
S
V
x
F
G
x
S
M
x
E
A
|
A
S
x
T
S
|
S
S
|
S
L
x
V
S
x
Q
K
|
K
G
|
G
E
|
E
S
|
S
L
|
L
Y
x
A
D
|
D
T
x
S
A
x
V
R
x
Q
V
x
T
L
x
M
S
|
S
T
x
C
Y
|
Y
S
x
A
D
|
D
V
|
V
I
x
V
A
x
V
M
x
L
R
|
R
H
|
H
P
|
P
D
x
Q
A
x
P
Y
x
G
S
x
A
V
|
V
R
x
E
E
x
L
F
x
A
A
|
A
E
x
K
G
x
H
S
x
C
R
|
R
V
x
R
P
|
P
V
|
V
I
|
I
N
|
N
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
P
x
V
N
x
G
E
|
E
H
|
H
P
|
P
T
|
T
Q
|
Q
A
|
A
L
|
L
L
|
L
D
|
D
L
x
I
F
|
F
T
|
T
I
|
I
Q
x
R
K
x
E
E
|
E
L
|
L
S
x
G
H
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
x
T
I
x
V
D
x
N
G
|
G
M
|
M
H
x
T
I
|
I
A
x
T
M
|
M
V
|
V
G
|
G
D
|
D
L
|
L
K
|
K
F
x
H
G
|
G
R
|
R
T
|
T
V
|
V
H
|
H
S
|
S
L
|
L
S
x
A
R
x
C
L
|
L
L
|
L
C
x
T
L
x
Q
Y
|
Y
K
x
R
N
 
-
V
|
V
S
|
S
F
x
L
T
x
R
L
x
Y
I
x
V
S
x
A
P
|
P
K
x
P
E
x
S
L
|
L
A
x
R
M
|
M
P
|
P
D
x
P
Y
x
T
V
|
V
I
x
R
A
|
A
D
x
F
I
x
V
E
x
A
N
x
S
A
x
R
G
|
G
H
x
T
K
|
K
V
x
Q
T
x
E
I
x
E
T
x
F
D
x
E
Q
x
S
L
x
I
E
|
E
G
x
E
N
x
A
L
|
L
D
x
P
K
x
D
A
x
T
D
|
D
I
x
V
L
|
L
Y
|
Y
L
x
M
T
|
T
R
|
R
I
|
I
Q
|
Q
E
x
K
E
|
E
R
|
R
F
|
F
P
x
G
S
|
S
Q
x
T
D
x
Q
E
|
E
A
x
Y
N
x
E
K
x
A
Y
x
C
R
x
F
G
|
G
K
x
Q
F
|
F
R
x
I
L
|
L
N
x
T
R
x
P
S
x
H
I
|
I
Y
x
M
T
|
T
Q
x
R
H
 
-
C
x
A
K
|
K
S
x
K
N
x
K
T
x
M
V
|
V
I
x
V
M
|
M
H
|
H
P
|
P
L
x
M
P
|
P
R
|
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
x
V
N
|
N
E
|
E
L
x
I
D
x
S
N
x
V
D
x
E
L
x
V
N
x
D
S
|
S
H
x
D
P
|
P
N
x
R
L
x
A
A
|
A
I
x
Y
F
|
F
R
|
R
Q
|
Q
A
|
A
D
x
E
N
|
N
G
|
G
L
x
M
L
x
Y
I
|
I
R
|
R
M
|
M
A
|
A
L
|
L
F
x
L
A
|
A
L
x
T
T
x
V
L
|
L
G
|
G

Sites not aligning to the query:

P20054 Protein PYR1-3; EC 6.3.5.5; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Dictyostelium discoideum (Social amoeba)
43% identity, 92% coverage: 6:318/339 of query aligns to 1922:2222/2225 of P20054

query
sites
P20054
G
 
G
S
 
K
H
 
H
I
 
I
L
 
F
S
 
S
V
 
V
N
 
K
Q
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
R
D
 
K
S
 
Q
I
 
L
H
 
H
T
 
A
I
 
L
F
 
F
N
 
G
V
 
I
A
 
A
E
 
H
R
 
E
M
 
M
A
 
R
P
 
I
Y
 
L
A
 
V
L
 
K
R
 
R
E
 
S
K
 
G
R
 
G
T
 
S
R
 
D
V
 
L
L
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
Q
V
 
C
S
 
S
F
 
F
G
 
T
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
Q
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
S
V
 
V
A
 
V
E
 
-
T
 
T
V
 
V
G
 
D
M
 
N
A
 
V
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
I
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
Q
V
 
T
L
 
L
S
 
E
T
 
S
Y
 
Y
S
 
C
D
 
D
V
 
A
I
 
V
A
 
C
M
 
M
R
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
A
A
 
V
Y
 
G
S
 
S
V
 
V
R
 
E
E
 
S
F
 
A
A
 
I
E
 
Q
G
 
V
S
 
A
R
 
K
V
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
N
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
G
H
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
T
I
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
L
H
 
T
I
 
I
A
 
T
M
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
V
R
 
R
L
 
L
L
 
L
C
 
A
L
 
N
Y
 
Y
K
 
Q
N
 
-
V
 
V
S
 
K
F
 
I
T
 
N
L
 
Y
I
 
V
S
 
S
P
 
P
K
 
S
E
 
S
L
 
L
A
 
S
M
 
M
P
 
P
D
 
T
Y
 
E
V
 
I
I
 
I
A
 
K
D
 
E
I
 
L
E
 
N
N
 
E
A
 
K
G
 
G
H
 
I
K
 
E
V
 
Q
T
 
K
I
 
E
T
 
Y
D
 
T
Q
 
N
L
 
I
E
 
E
G
 
S
N
 
I
L
 
L
D
 
P
K
 
T
A
 
T
D
 
N
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
Q
S
 
S
Q
 
I
D
 
E
E
 
E
A
 
Y
N
 
E
K
 
K
Y
 
V
R
 
K
G
 
D
K
 
S
F
 
F
R
 
I
L
 
I
N
 
T
R
 
P
S
 
H
I
 
T
Y
 
L
T
 
T
Q
 
K
H
 
-
C
 
A
K
 
S
S
 
D
N
 
N
T
 
M
V
 
I
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
I
N
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
S
N
 
P
D
 
E
L
 
V
N
 
D
S
 
S
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
M
D
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
I
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
S
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P08955 CAD protein; EC 6.3.5.5; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Mesocricetus auratus (Golden hamster) (see paper)
45% identity, 92% coverage: 6:318/339 of query aligns to 1923:2223/2225 of P08955

query
sites
P08955
G
 
G
S
 
Q
H
 
H
I
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
V
N
 
K
Q
 
Q
F
 
F
N
 
T
L
 
K
D
 
D
S
 
Q
I
 
M
H
 
S
T
 
H
I
 
L
F
 
F
N
 
N
V
 
V
A
 
A
E
 
H
R
 
T
M
 
L
A
 
R
P
 
M
Y
 
M
A
 
V
L
 
Q
R
 
K
E
 
E
K
 
R
R
 
S
T
 
L
R
 
D
V
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
V
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
A
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
A
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
V
A
 
L
E
 
-
T
 
S
V
 
F
G
 
S
M
 
E
A
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
A
 
V
R
 
Q
V
 
T
L
 
M
S
 
S
T
 
C
Y
 
Y
S
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
V
M
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
A
 
P
Y
 
G
S
 
A
V
 
V
R
 
E
E
 
L
F
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
H
S
 
C
R
 
R
V
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
N
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
G
H
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
T
I
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
M
H
 
T
I
 
I
A
 
T
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
C
L
 
L
L
 
L
C
 
T
L
 
Q
Y
 
Y
K
 
R
N
 
-
V
 
V
S
 
S
F
 
L
T
 
R
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
K
 
P
E
 
S
L
 
L
A
 
R
M
 
M
P
 
P
D
 
P
Y
 
S
V
 
V
I
 
W
A
 
D
D
 
F
I
 
V
E
 
A
N
 
S
A
 
R
G
 
G
H
 
T
K
 
K
V
 
Q
T
 
E
I
 
E
T
 
F
D
 
E
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
E
N
 
A
L
 
L
D
 
P
K
 
D
A
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
M
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
G
S
 
S
Q
 
T
D
 
Q
E
 
E
A
 
Y
N
 
E
K
 
A
Y
 
C
R
 
F
G
 
G
K
 
Q
F
 
F
R
 
I
L
 
L
N
 
T
R
 
P
S
 
H
I
 
I
Y
 
M
T
 
T
Q
 
R
H
 
-
C
 
A
K
 
K
S
 
K
N
 
K
T
 
M
V
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
M
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
S
N
 
V
D
 
E
L
 
V
N
 
D
S
 
S
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
E
N
 
N
G
 
G
L
 
M
L
 
Y
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
T
T
 
V
L
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P07259 Protein URA2; EC 6.3.5.5; EC 2.1.3.2 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
43% identity, 94% coverage: 4:320/339 of query aligns to 1908:2213/2214 of P07259

query
sites
P07259
F
 
F
K
 
R
G
 
G
S
 
R
H
 
H
I
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
I
N
 
K
Q
 
Q
F
 
F
N
 
K
L
 
R
D
 
S
S
 
D
I
 
F
H
 
H
T
 
V
I
 
L
F
 
F
N
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
Q
R
 
E
M
 
L
A
 
R
P
 
A
Y
 
A
A
 
V
L
 
A
R
 
R
E
 
E
K
 
G
R
 
V
T
 
L
R
 
D
V
 
L
L
 
M
D
 
K
G
 
G
A
 
H
I
 
V
L
 
I
G
 
T
N
 
T
L
 
I
F
 
F
F
 
F
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
C
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
I
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
E
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
V
 
I
A
 
V
E
 
-
T
 
N
V
 
V
G
 
N
M
 
P
A
 
L
S
 
V
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
Q
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
L
S
 
A
T
 
C
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
V
 
A
I
 
I
A
 
V
M
 
M
R
 
R
H
 
H
P
 
S
D
 
E
A
 
E
Y
 
M
S
 
S
V
 
V
R
 
H
E
 
I
F
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
Y
S
 
S
R
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
P
 
S
N
 
R
E
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
I
S
 
G
H
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
T
I
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
I
H
 
T
I
 
V
A
 
T
M
 
F
V
 
M
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
C
R
 
R
L
 
L
L
 
L
C
 
M
L
 
H
Y
 
Y
K
 
Q
N
 
-
V
 
V
S
 
R
F
 
I
T
 
N
L
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
P
K
 
P
E
 
E
L
 
L
A
 
R
M
 
L
P
 
P
D
 
E
Y
 
G
V
 
L
I
 
R
A
 
E
D
 
E
I
 
L
E
 
R
N
 
K
A
 
A
G
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
G
-
 
V
H
 
E
K
 
S
V
 
I
T
 
E
I
 
L
T
 
T
D
 
P
Q
 
H
L
 
I
E
 
-
G
 
-
N
 
-
L
 
I
D
 
S
K
 
K
A
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
C
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
E
 
E
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
N
S
 
S
Q
 
P
D
 
E
E
 
E
A
 
Y
N
 
A
K
 
R
Y
 
L
R
 
K
G
 
D
K
 
T
F
 
Y
R
 
I
L
 
V
N
 
D
R
 
N
S
 
K
I
 
I
Y
 
L
T
 
A
Q
 
-
H
 
H
C
 
A
K
 
K
S
 
E
N
 
N
T
 
M
V
 
A
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
K
N
 
E
D
 
E
L
 
V
N
 
D
S
 
Y
H
 
D
P
 
H
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
M
D
 
K
N
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
F
I
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
M
T
 
V
L
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
D

Sites not aligning to the query:

P05990 CAD protein; Protein rudimentary; EC 6.3.5.5; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see 2 papers)
44% identity, 92% coverage: 6:318/339 of query aligns to 1917:2218/2224 of P05990

query
sites
P05990
G
 
G
S
 
K
H
 
H
I
 
I
L
 
L
S
 
A
V
 
V
N
 
D
Q
 
M
F
 
F
N
 
N
L
 
K
D
 
D
S
 
H
I
 
L
H
 
N
T
 
D
I
 
I
F
 
F
N
 
N
V
 
L
A
 
A
E
 
Q
R
 
L
M
 
L
A
 
K
P
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
L
R
 
R
E
 
G
K
 
T
R
 
K
T
 
D
R
 
R
V
 
P
L
 
V
D
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
L
-
 
P
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
V
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
Q
V
 
C
S
 
S
F
 
F
G
 
A
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
L
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
V
 
V
A
 
I
E
 
-
T
 
S
V
 
M
G
 
D
M
 
N
A
 
I
S
 
T
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
S
A
 
I
R
 
K
V
 
V
L
 
V
S
 
S
T
 
S
Y
 
Y
S
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
V
M
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
S
A
 
P
Y
 
G
S
 
A
V
 
V
R
 
A
E
 
R
F
 
A
A
 
A
E
 
T
G
 
F
S
 
S
R
 
R
V
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
N
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
F
S
 
G
H
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
T
I
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
L
H
 
T
I
 
I
A
 
T
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
C
 
T
L
 
L
Y
 
Y
K
 
-
N
 
N
V
 
V
S
 
N
F
 
L
T
 
Q
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
K
 
N
E
 
S
L
 
L
A
 
Q
M
 
M
P
 
P
D
 
D
Y
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
Q
D
 
F
I
 
V
E
 
H
N
 
Q
A
 
R
G
 
G
H
 
V
K
 
K
V
 
Q
T
 
L
I
 
F
T
 
A
D
 
R
Q
 
D
L
 
L
E
 
K
G
 
N
N
 
V
L
 
L
D
 
P
K
 
D
A
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
M
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
D
S
 
N
Q
 
V
D
 
E
E
 
D
A
 
Y
N
 
E
K
 
K
Y
 
C
R
 
C
G
 
G
K
 
H
F
 
L
R
 
V
L
 
L
N
 
T
R
 
P
S
 
E
I
 
-
Y
 
H
T
 
M
Q
 
M
H
 
R
C
 
A
K
 
K
S
 
K
N
 
R
T
 
S
V
 
I
I
 
V
M
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
L
N
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
S
N
 
R
D
 
E
L
 
I
N
 
D
S
 
S
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
E
N
 
Y
G
 
G
L
 
M
L
 
Y
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
M
T
 
V
L
 
V
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4eknB Structure of the catalytic chain of methanococcus jannaschii aspartate transcarbamoylase in a hexagonal crystal form (see paper)
43% identity, 91% coverage: 7:313/339 of query aligns to 2:296/304 of 4eknB

query
sites
4eknB
S
 
K
H
 
H
I
 
L
L
 
I
S
 
S
V
 
M
N
 
K
Q
 
D
F
 
I
N
 
G
L
 
K
D
 
E
S
 
E
I
 
I
H
 
L
T
 
E
I
 
I
F
 
L
N
 
D
V
 
E
A
 
A
E
 
R
R
 
K
M
 
M
A
 
E
P
 
E
Y
 
L
A
 
L
L
 
N
R
 
T
E
 
K
K
 
R
R
 
P
T
 
L
R
 
K
V
 
L
L
 
L
D
 
E
G
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
A
N
 
T
L
 
V
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
C
 
T
A
 
A
F
 
M
N
 
K
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
V
A
 
I
E
 
T
T
 
M
V
 
T
G
 
D
M
 
L
A
 
K
S
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
I
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
R
V
 
V
L
 
I
S
 
S
T
 
G
Y
 
Y
S
 
A
D
 
D
V
 
I
I
 
I
A
 
V
M
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
S
A
 
E
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
R
 
R
E
 
L
F
 
A
A
 
S
E
 
E
G
 
Y
S
 
S
R
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
S
N
 
N
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
M
K
 
R
E
 
E
L
 
I
S
 
G
H
 
R
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
-
I
 
I
D
 
D
G
 
G
M
 
I
H
 
K
I
 
I
A
 
A
M
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
|
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
V
R
 
Y
L
 
A
L
 
L
C
 
S
L
 
L
Y
 
F
K
 
E
N
 
N
V
 
V
S
 
E
F
 
M
T
 
Y
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
P
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
R
M
 
L
P
 
P
D
 
K
Y
 
D
V
 
I
I
 
I
A
 
E
D
 
D
I
 
L
E
 
K
N
 
A
A
 
K
G
 
N
H
 
I
K
 
K
V
 
F
T
 
Y
I
 
E
T
 
K
D
 
E
Q
 
S
L
 
L
E
 
D
G
 
D
N
 
L
L
 
D
D
 
D
K
 
D
A
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
V
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
P
S
 
D
Q
 
P
D
 
N
E
 
E
A
 
Y
N
 
E
K
 
K
Y
 
V
R
 
K
G
 
G
K
 
S
F
 
Y
R
 
K
L
 
I
N
 
K
R
 
R
S
 
E
I
 
-
Y
 
Y
T
 
V
Q
 
E
H
 
G
C
 
K
K
 
K
S
 
-
N
 
-
T
 
F
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
D
N
 
Y
D
 
D
L
 
V
N
 
D
S
 
D
H
 
L
P
 
P
N
 
Q
L
 
A
A
 
K
I
 
Y
F
 
F
R
 
K
Q
 
Q
A
 
S
D
 
F
N
 
Y
G
|
G
L
 
I
L
 
P
I
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
I
F
 
L

5g1pA Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to carbamoyl phosphate (see paper)
45% identity, 92% coverage: 6:318/339 of query aligns to 2:290/292 of 5g1pA

query
sites
5g1pA
G
 
G
S
 
Q
H
 
H
I
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
V
N
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
N
 
T
L
 
K
D
 
D
S
 
Q
I
 
M
H
 
S
T
 
H
I
 
L
F
 
F
N
 
N
V
 
V
A
 
A
E
 
H
R
 
T
M
 
L
A
 
R
P
 
M
Y
 
M
A
 
V
L
 
Q
R
 
K
E
 
E
K
 
R
R
 
S
T
 
L
R
 
D
V
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
V
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
A
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
A
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
A
V
 
V
A
 
L
E
 
-
T
 
S
V
 
F
G
 
S
M
 
E
A
 
A
S
 
T
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
A
 
V
R
 
Q
V
 
T
L
 
M
S
 
S
T
 
C
Y
 
Y
S
 
A
D
 
D
V
 
V
I
 
V
A
 
V
M
 
L
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
A
 
P
Y
 
G
S
 
A
V
 
V
R
 
E
E
 
L
F
 
A
A
 
A
E
 
K
G
 
H
S
 
C
R
 
R
V
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
I
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
G
H
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
T
I
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
M
H
 
T
I
 
I
A
 
T
M
 
M
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
C
L
 
L
L
 
L
C
 
T
L
 
Q
Y
 
Y
K
 
R
N
 
-
V
 
V
S
 
S
F
 
L
T
 
R
L
 
Y
I
 
V
S
 
A
P
 
P
K
 
P
E
 
S
L
 
L
A
 
R
M
 
M
P
 
P
D
 
P
Y
 
T
V
 
V
I
 
R
A
 
A
D
 
F
I
 
V
E
 
A
N
 
S
A
 
-
G
 
G
H
 
T
K
 
K
V
 
Q
T
 
E
I
 
E
T
 
F
D
 
E
Q
 
S
L
 
I
E
 
E
G
 
E
N
 
A
L
 
L
D
 
P
K
 
D
A
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
M
T
|
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
-
S
 
-
Q
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
-
Y
 
-
R
 
-
G
 
-
K
 
Q
F
 
F
R
 
I
L
 
L
N
 
T
R
 
P
S
 
H
I
 
I
Y
 
M
T
 
T
Q
 
R
H
 
-
C
 
A
K
 
K
S
 
K
N
 
K
T
 
M
V
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
x
M
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
V
N
 
N
E
 
E
L
 
I
D
 
S
N
 
V
D
 
E
L
 
V
N
 
D
S
 
S
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
E
N
 
N
G
|
G
L
 
M
L
 
Y
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
T
T
 
V
L
 
L
G
 
G

Q09794 Protein ura1; EC 6.3.5.5; EC 2.1.3.2 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
44% identity, 94% coverage: 2:318/339 of query aligns to 1932:2238/2244 of Q09794

query
sites
Q09794
T
 
S
Q
 
P
F
 
F
K
 
Y
G
 
R
S
 
K
H
 
H
I
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
V
N
 
H
Q
 
Q
F
 
V
N
 
T
L
 
R
D
 
S
S
 
D
I
 
L
H
 
H
T
 
V
I
 
L
F
 
F
N
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
H
R
 
Q
M
 
M
A
 
R
P
 
I
Y
 
I
A
 
V
L
 
E
R
 
R
E
 
Q
K
 
G
R
 
V
T
 
I
R
 
D
V
 
L
L
 
C
D
 
Y
G
 
G
A
 
K
I
 
L
L
 
L
G
 
C
N
 
T
L
 
M
F
 
F
F
 
F
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
G
 
D
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
Q
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
V
E
 
-
T
 
A
V
 
V
G
 
T
M
 
A
A
 
S
S
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
L
S
 
G
T
 
C
Y
 
Y
S
 
G
D
 
D
V
 
A
I
 
I
A
 
V
M
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
S
A
 
I
Y
 
E
S
 
S
V
 
A
R
 
R
E
 
I
F
 
A
A
 
A
E
 
N
G
 
F
S
 
S
R
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
P
 
S
N
 
K
E
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
G
H
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
S
I
 
V
D
 
N
G
 
G
M
 
L
H
 
T
I
 
I
A
 
T
M
 
F
V
 
I
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
L
L
 
L
C
 
A
L
 
F
Y
 
W
K
 
-
N
 
H
V
 
V
S
 
E
F
 
L
T
 
H
L
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
P
K
 
E
E
 
Q
L
 
L
A
 
A
M
 
L
P
 
P
D
 
D
Y
 
D
V
 
V
I
 
K
A
 
D
D
 
D
I
 
I
E
 
R
N
 
A
A
 
N
G
 
G
H
 
L
K
 
N
V
 
F
T
 
I
I
 
E
T
 
H
D
 
R
Q
 
E
L
 
L
E
 
T
G
 
K
N
 
E
-
 
V
L
 
V
D
 
A
K
 
Q
A
 
S
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
C
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
A
S
 
S
Q
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
Y
N
 
E
K
 
K
Y
 
L
R
 
K
G
 
D
K
 
S
F
 
F
R
 
I
L
 
V
N
 
D
R
 
N
S
 
S
I
 
V
Y
 
L
T
 
A
Q
 
S
H
 
-
C
 
A
K
 
K
S
 
S
N
 
H
T
 
C
V
 
I
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
N
S
 
-
R
 
R
A
 
E
Q
 
I
A
 
S
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
F
D
 
D
L
 
-
N
 
-
S
 
-
H
 
Q
P
 
R
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
M
D
 
R
N
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
C
T
 
V
L
 
M
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8bplA Aspartate transcarbamoylase mutant (n2045c, r2238c) from chaetomium thermophilum cad-like bound to carbamoyl phosphate (see paper)
44% identity, 93% coverage: 2:317/339 of query aligns to 11:315/316 of 8bplA

query
sites
8bplA
T
 
S
Q
 
S
F
 
F
K
 
K
G
 
K
S
 
S
H
 
H
I
 
V
L
 
L
S
 
S
V
 
V
N
 
T
Q
 
Q
F
 
F
N
 
T
L
 
R
D
 
A
S
 
D
I
 
L
H
 
H
T
 
L
I
 
L
F
 
F
N
 
Q
V
 
I
A
 
A
E
 
Q
R
 
E
M
 
M
A
 
R
P
 
L
Y
 
G
A
 
V
L
 
Q
R
 
R
E
 
E
K
 
G
R
 
V
T
 
L
R
 
D
V
 
I
L
 
L
D
 
R
G
 
G
A
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
C
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
V
 
A
S
 
S
F
 
F
G
 
D
C
 
A
A
 
A
F
 
M
N
 
Q
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
I
E
 
P
T
 
-
V
 
I
G
 
Q
M
 
T
A
 
S
S
 
T
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
Q
D
 
D
T
 
T
A
 
L
R
 
R
V
 
T
L
 
L
S
 
A
T
 
C
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
V
 
A
I
 
I
A
 
V
M
 
L
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
D
A
 
E
Y
 
K
S
 
C
V
 
V
R
 
D
E
 
V
F
 
A
A
 
K
E
 
K
G
 
Y
S
 
C
R
 
P
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
P
 
S
N
 
K
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
L
 
L
F
 
F
T
 
T
I
 
I
Q
 
R
K
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
G
H
 
-
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
T
I
 
M
D
 
Q
G
 
G
M
 
L
H
 
T
I
 
I
A
 
T
M
 
F
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
L
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
P
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
S
 
V
R
 
Y
L
 
L
L
 
L
C
 
R
L
 
H
Y
 
Y
K
 
Q
N
 
-
V
 
V
S
 
K
F
 
V
T
 
Q
L
 
L
I
 
V
S
 
S
P
 
P
K
 
K
E
 
A
L
 
L
A
 
R
M
 
L
P
 
P
D
 
P
Y
 
A
V
 
V
I
 
R
A
 
Q
D
 
Q
I
 
L
E
 
V
N
 
D
A
 
A
G
 
G
H
 
Q
K
 
L
V
 
L
T
 
C
I
 
E
T
 
S
D
 
E
Q
 
A
L
 
L
E
 
T
G
 
P
N
 
E
-
 
I
L
 
L
D
 
G
K
 
R
A
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
Y
 
Y
L
 
C
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
E
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
P
S
 
S
Q
 
L
D
 
A
E
 
E
A
 
F
N
 
E
K
 
A
Y
 
V
R
 
K
G
 
D
K
 
S
F
 
Y
R
 
R
L
 
I
N
 
D
R
 
Y
S
 
S
I
 
T
Y
 
L
T
 
-
Q
 
K
H
 
Y
C
 
A
K
 
K
S
 
P
N
 
T
T
 
T
V
 
V
I
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
N
S
 
E
R
 
E
A
 
V
Q
 
-
A
 
A
N
 
E
E
 
E
L
 
V
D
 
D
N
 
F
D
 
D
L
 
Q
N
 
R
S
 
A
H
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
-
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
M
D
 
C
N
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
I
 
C
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
V
L
 
M

6ys6B Arabidopsis aspartate transcarbamoylase complex with pala (see paper)
41% identity, 93% coverage: 4:317/339 of query aligns to 4:309/312 of 6ys6B

query
sites
6ys6B
F
 
F
K
 
E
G
 
L
S
 
S
H
 
D
I
 
V
L
 
I
S
 
E
V
 
G
N
 
K
Q
 
Q
F
 
F
N
 
D
L
 
R
D
 
E
S
 
M
I
 
L
H
 
S
T
 
A
I
 
I
F
 
F
N
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
R
R
 
E
M
 
M
A
 
E
P
 
K
Y
 
I
A
 
E
L
 
K
R
 
S
E
 
S
K
 
S
R
 
Q
T
 
S
R
 
E
V
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
Y
I
 
L
L
 
M
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
C
 
S
A
 
A
F
 
M
N
 
K
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
V
A
 
L
E
 
T
T
 
T
V
 
E
G
 
N
M
 
A
A
 
R
S
 
E
-
 
F
S
 
S
S
|
S
L
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
V
S
 
E
T
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
V
 
I
I
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
F
D
 
E
A
 
S
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
R
 
R
E
 
K
F
 
A
A
 
A
E
 
A
G
 
T
S
 
A
R
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
P
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
K
 
S
E
 
E
L
 
I
S
 
G
H
 
K
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
-
I
 
L
D
 
D
G
 
G
M
 
I
H
 
S
I
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
A
F
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
R
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
Y
L
 
L
L
 
L
C
 
A
L
 
K
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
V
 
V
S
 
K
F
 
I
T
 
Y
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
P
K
 
E
E
 
I
L
 
V
A
 
K
M
 
M
P
 
K
D
 
D
Y
 
D
V
 
I
I
 
K
A
 
D
D
 
Y
I
 
L
E
 
T
N
 
S
A
 
S
G
 
G
H
 
V
K
 
E
V
 
W
T
 
E
I
 
E
T
 
S
D
 
S
Q
 
D
L
 
L
E
 
M
G
 
E
N
 
V
L
 
A
D
 
S
K
 
K
A
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
V
Y
 
Y
L
 
Q
T
|
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
G
S
 
E
Q
 
R
-
 
L
D
 
D
E
 
L
A
 
Y
N
 
E
K
 
A
Y
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
F
 
F
R
 
I
L
 
V
N
 
D
R
 
K
S
 
D
I
 
L
Y
 
L
T
 
G
Q
 
V
H
 
M
C
 
Q
K
 
K
S
 
-
N
 
K
T
 
A
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
T
N
 
A
D
 
D
L
 
V
N
 
D
S
 
A
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
K
N
 
N
G
|
G
L
 
L
L
 
F
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
K
L
 
L
T
 
L
L
 
L

6ypoA Arabidopsis aspartate transcarbamoylase bound to ump (see paper)
41% identity, 93% coverage: 4:317/339 of query aligns to 4:309/312 of 6ypoA

query
sites
6ypoA
F
 
F
K
 
E
G
 
L
S
 
S
H
 
D
I
 
V
L
 
I
S
 
E
V
 
G
N
 
K
Q
 
Q
F
 
F
N
 
D
L
 
R
D
 
E
S
 
M
I
 
L
H
 
S
T
 
A
I
 
I
F
 
F
N
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
R
R
 
E
M
 
M
A
 
E
P
 
K
Y
 
I
A
 
E
L
 
K
R
 
S
E
 
S
K
 
S
R
 
Q
T
 
S
R
 
E
V
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
Y
I
 
L
L
 
M
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
G
 
E
C
 
S
A
 
A
F
 
M
N
 
K
L
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
R
 
E
V
 
V
A
 
L
E
 
T
T
 
T
V
 
E
G
 
N
M
 
A
A
 
R
S
 
E
-
 
F
S
 
S
S
 
S
L
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
A
 
I
R
 
R
V
 
T
L
 
V
S
 
E
T
 
G
Y
 
Y
S
 
S
D
 
D
V
 
I
I
 
I
A
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
F
D
 
E
A
 
S
Y
 
G
S
 
A
V
 
A
R
 
R
E
 
K
F
 
A
A
 
A
E
 
A
G
 
T
S
 
A
R
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
P
N
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
L
 
V
F
 
Y
T
 
T
I
 
I
Q
 
Q
K
 
S
E
 
E
L
 
I
S
 
G
H
 
K
A
 
-
G
 
-
M
 
-
S
 
-
I
 
L
D
 
D
G
 
G
M
 
I
H
 
S
I
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
A
F
 
N
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
R
S
 
S
L
 
L
S
 
A
R
 
Y
L
 
L
L
 
L
C
 
A
L
 
K
Y
 
F
K
 
K
N
 
D
V
 
V
S
 
K
F
 
I
T
 
Y
L
 
F
I
 
V
S
 
S
P
 
P
K
 
E
E
 
I
L
 
V
A
 
K
M
 
M
P
 
K
D
 
D
Y
 
D
V
 
I
I
 
K
A
 
D
D
 
Y
I
 
L
E
 
T
N
 
S
A
 
S
G
 
G
H
 
V
K
 
E
V
 
W
T
 
E
I
 
E
T
 
S
D
 
S
Q
 
D
L
 
L
E
 
M
G
 
E
N
 
V
L
 
A
D
 
S
K
 
K
A
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
V
Y
 
Y
L
 
Q
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
E
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
P
 
G
S
 
E
Q
 
R
-
 
L
D
 
D
E
 
L
A
 
Y
N
 
E
K
 
A
Y
 
A
R
 
R
G
 
G
K
 
K
F
 
F
R
 
I
L
 
V
N
 
D
R
 
K
S
 
D
I
 
L
Y
 
L
T
 
G
Q
 
V
H
 
M
C
 
Q
K
 
K
S
 
-
N
 
K
T
 
A
V
 
I
I
 
I
M
 
M
H
|
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
L
N
 
D
E
 
E
L
 
I
D
 
T
N
 
A
D
 
D
L
 
V
N
 
D
S
 
A
H
 
D
P
 
P
N
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
D
 
K
N
 
N
G
|
G
L
 
L
L
 
F
I
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
K
L
 
L
T
 
L
L
 
L

6yvbC Arabidopsis aspartate transcarbamoylase complex with carbamoyl phosphate (see paper)
41% identity, 93% coverage: 4:317/339 of query aligns to 16:321/324 of 6yvbC

query
sites
6yvbC
F
 
F
K
 
E
G
 
L
S
 
S
H
 
D
I
 
V
L
 
I
S
 
E
V
 
G
N
 
K
Q
 
Q
F
 
F
N
 
D
L
 
R
D
 
E
S
 
M
I
 
L
H
 
S
T
 
A
I
 
I
F
 
F
N
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
R
R
 
E
M
 
M
A
 
E
P
 
K
Y
 
I
A
 
E
L
 
K
R
 
S
E
 
S
K
 
S
R
 
Q
T
 
S
R
 
E
V
 
I
L
 
L
D
 
K
G
 
G
A
 
Y
I
 
L
L
 
M
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T