SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 6936792 FitnessBrowser__SB2B:6936792 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 17 hits to proteins with known functional sites (download)

5ey3A X-ray structure of the thymidine phosphorylase from salmonella typhimurium in complex with cytidine and sulphate
67% identity, 99% coverage: 1:438/443 of query aligns to 3:440/442 of 5ey3A

query
sites
5ey3A
M
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
I
 
I
R
 
R
K
 
K
K
 
K
R
 
R
N
 
D
A
 
G
E
 
H
A
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
R
F
 
F
F
 
F
V
 
I
K
 
N
G
 
G
I
 
I
T
 
R
D
 
D
N
 
N
S
 
T
V
 
I
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
M
 
M
A
 
T
V
 
I
Y
 
F
F
 
F
N
 
H
D
 
D
M
 
M
T
 
T
M
 
M
D
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
V
A
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
D
W
 
W
D
 
K
S
 
S
L
 
L
G
 
N
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
I
I
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
T
S
 
S
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
G
P
 
P
M
 
M
A
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
R
|
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
F
 
L
D
x
E
A
 
A
I
 
I
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
Q
 
D
T
 
I
E
 
F
P
 
P
S
 
D
S
 
D
E
 
N
L
 
R
F
 
F
R
 
R
K
 
E
V
 
I
V
 
I
K
 
Q
E
 
D
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
S
D
 
S
L
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
D
|
D
K
 
K
R
 
R
F
 
F
Y
 
Y
S
 
A
I
 
T
R
|
R
D
 
D
N
 
I
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
D
S
 
S
I
 
I
S
 
P
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
G
S
|
S
I
 
I
L
 
L
S
 
A
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
D
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
M
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
L
S
 
S
L
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
E
S
 
A
I
 
I
T
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
V
K
 
R
T
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
M
 
M
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
C
 
S
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
F
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
E
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
P
 
P
R
 
R
L
 
L
Y
 
F
E
 
D
V
 
V
T
 
T
M
 
M
G
 
A
L
 
L
C
 
C
A
 
V
E
 
E
M
 
M
L
 
L
V
 
I
L
 
S
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
A
K
 
K
L
 
L
N
 
Q
T
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
D
N
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
R
M
 
M
V
 
V
S
 
A
G
 
A
L
 
Q
G
 
K
G
 
G
P
 
P
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
E
 
E
S
 
N
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
T
A
 
A
S
 
M
I
 
L
I
 
S
R
 
K
P
 
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
R
 
T
D
 
E
G
 
G
F
 
F
A
 
I
Y
 
S
S
 
A
M
 
M
V
 
D
T
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
S
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
P
 
A
G
 
S
D
 
D
A
 
T
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
F
S
 
T
N
 
D
V
 
M
C
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
S
I
 
I
N
 
D
K
 
G
D
 
Q
T
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
I
 
I
H
 
H
A
 
A
Q
 
K
S
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
W
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
I
V
 
L
S
 
D
D
 
D
K
 
K
Q
 
A
P
 
P
E
 
A
K
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
S
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
R
Y
 
R
V
 
I

4yyyB X-ray structure of the thymidine phosphorylase from salmonella typhimurium in complex with uridine (see paper)
67% identity, 99% coverage: 1:438/443 of query aligns to 1:438/440 of 4yyyB

query
sites
4yyyB
M
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
I
 
I
R
 
R
K
 
K
K
 
K
R
 
R
N
 
D
A
 
G
E
 
H
A
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
R
F
 
F
F
 
F
V
 
I
K
 
N
G
 
G
I
 
I
T
 
R
D
 
D
N
 
N
S
 
T
V
 
I
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
M
 
M
A
 
T
V
 
I
Y
 
F
F
 
F
N
 
H
D
 
D
M
 
M
T
 
T
M
 
M
D
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
V
A
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
D
W
 
W
D
 
K
S
 
S
L
 
L
G
 
N
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
I
I
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
T
S
 
S
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
G
P
 
P
M
 
M
A
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
|
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
F
 
L
D
 
E
A
 
A
I
 
I
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
Q
 
D
T
 
I
E
 
F
P
 
P
S
 
D
S
 
D
E
 
N
L
 
R
F
 
F
R
 
R
K
 
E
V
 
I
V
 
I
K
 
Q
E
 
D
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
S
D
 
S
L
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
D
|
D
K
 
K
R
 
R
F
 
F
Y
|
Y
S
 
A
I
 
T
R
|
R
D
 
D
N
 
I
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
D
S
 
S
I
 
I
S
 
P
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
G
S
|
S
I
|
I
L
 
L
S
 
A
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
D
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
M
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
L
S
 
S
L
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
E
S
 
A
I
 
I
T
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
V
K
 
R
T
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
M
 
M
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
S
|
S
C
 
S
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
x
Q
F
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
E
Y
|
Y
R
 
R
N
 
N
P
 
P
R
 
R
L
 
L
Y
 
F
E
 
D
V
 
V
T
 
T
M
 
M
G
 
A
L
 
L
C
 
C
A
 
V
E
 
E
M
 
M
L
 
L
V
 
I
L
 
S
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
A
K
 
K
L
 
L
N
 
Q
T
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
D
N
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
R
M
 
M
V
 
V
S
 
A
G
 
A
L
 
Q
G
 
K
G
 
G
P
 
P
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
E
 
E
S
 
N
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
T
A
 
A
S
 
M
I
 
L
I
 
S
R
 
K
P
 
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
R
 
T
D
 
E
G
 
G
F
 
F
A
 
I
Y
 
S
S
 
A
M
 
M
V
 
D
T
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
S
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
P
 
A
G
 
S
D
 
D
A
 
T
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
F
S
 
T
N
 
D
V
 
M
C
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
S
I
 
I
N
 
D
K
 
G
D
 
Q
T
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
I
 
I
H
 
H
A
 
A
Q
 
K
S
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
W
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
I
V
 
L
S
 
D
D
 
D
K
 
K
Q
 
A
P
 
P
E
 
A
K
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
S
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
R
Y
 
R
V
 
I

4yekA X-ray structure of the thymidine phosphorylase from salmonella typhimurium in complex with thymidine (see paper)
67% identity, 99% coverage: 1:438/443 of query aligns to 1:438/440 of 4yekA

query
sites
4yekA
M
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
I
 
I
R
 
R
K
 
K
K
 
K
R
 
R
N
 
D
A
 
G
E
 
H
A
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
R
F
 
F
F
 
F
V
 
I
K
 
N
G
 
G
I
 
I
T
 
R
D
 
D
N
 
N
S
 
T
V
 
I
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
M
 
M
A
 
T
V
 
I
Y
 
F
F
 
F
N
 
H
D
 
D
M
 
M
T
 
T
M
 
M
D
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
V
A
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
D
W
 
W
D
 
K
S
 
S
L
 
L
G
 
N
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
I
I
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
T
S
 
S
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
G
P
 
P
M
 
M
A
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
V
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
F
 
L
D
 
E
A
 
A
I
 
I
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
Q
 
D
T
 
I
E
 
F
P
 
P
S
 
D
S
 
D
E
 
N
L
 
R
F
 
F
R
 
R
K
 
E
V
 
I
V
 
I
K
 
Q
E
 
D
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
S
D
 
S
L
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
D
|
D
K
 
K
R
 
R
F
 
F
Y
|
Y
S
 
A
I
 
T
R
|
R
D
 
D
N
 
I
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
D
S
 
S
I
 
I
S
 
P
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
G
S
|
S
I
 
I
L
 
L
S
 
A
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
D
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
|
F
M
 
M
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
L
S
 
S
L
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
E
S
 
A
I
 
I
T
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
V
K
 
R
T
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
M
 
M
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
S
|
S
C
 
S
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
x
Q
F
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
E
Y
|
Y
R
 
R
N
 
N
P
 
P
R
 
R
L
 
L
Y
 
F
E
 
D
V
 
V
T
 
T
M
 
M
G
 
A
L
 
L
C
 
C
A
 
V
E
 
E
M
 
M
L
 
L
V
 
I
L
 
S
G
 
G
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
A
K
 
K
L
 
L
N
 
Q
T
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
D
N
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
R
M
 
M
V
 
V
S
 
A
G
 
A
L
 
Q
G
 
K
G
 
G
P
 
P
A
 
S
D
 
D
F
 
F
V
 
V
E
 
E
S
 
N
Y
 
Y
D
 
D
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
T
A
 
A
S
 
M
I
 
L
I
 
S
R
 
K
P
 
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
R
 
T
D
 
E
G
 
G
F
 
F
A
 
I
Y
 
S
S
 
A
M
 
M
V
 
D
T
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
S
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
P
 
A
G
 
S
D
 
D
A
 
T
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
F
S
x
T
N
x
D
V
 
M
C
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
S
I
 
I
N
 
D
K
 
G
D
 
Q
T
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
I
 
I
H
 
H
A
 
A
Q
 
K
S
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
S
F
 
W
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
I
V
 
L
S
 
D
D
 
D
K
 
K
Q
 
A
P
 
P
E
 
A
K
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
S
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
R
Y
 
R
V
 
I

4lhmA Thymidine phosphorylase from e.Coli with 3'-azido-3'-deoxythymidine (see paper)
67% identity, 99% coverage: 1:438/443 of query aligns to 1:438/440 of 4lhmA

query
sites
4lhmA
M
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
I
 
I
R
 
R
K
 
K
K
 
K
R
 
R
N
 
D
A
 
G
E
 
H
A
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
R
F
 
F
F
 
F
V
 
I
K
 
N
G
 
G
I
 
I
T
 
R
D
 
D
N
 
N
S
 
T
V
 
I
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
M
 
M
A
 
T
V
 
I
Y
 
F
F
 
F
N
 
H
D
 
D
M
 
M
T
 
T
M
 
M
D
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
V
A
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
D
W
 
W
D
 
K
S
 
S
L
 
L
G
 
H
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
I
I
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
T
S
|
S
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
G
P
 
P
M
 
M
A
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
F
 
L
D
 
E
A
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
Q
 
D
T
 
I
E
 
F
P
 
P
S
 
D
S
 
D
E
 
N
L
 
R
F
 
F
R
 
R
K
 
E
V
 
I
V
 
I
K
 
K
E
 
D
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
S
D
 
S
L
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
D
|
D
K
 
K
R
 
R
F
 
F
Y
|
Y
S
 
A
I
 
T
R
|
R
D
 
D
N
 
I
T
 
T
A
|
A
T
 
T
V
|
V
E
x
D
S
 
S
I
 
I
S
 
P
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
S
|
S
I
 
I
L
 
L
S
 
A
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
D
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
|
F
M
 
M
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
L
S
 
S
L
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
E
S
 
A
I
 
I
T
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
V
K
x
R
T
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
M
 
M
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
C
 
S
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
V
K
x
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
F
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
E
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
P
 
P
R
 
R
L
 
L
Y
 
F
E
 
D
V
 
V
T
 
T
M
 
M
G
 
A
L
 
L
C
 
C
A
 
V
E
 
E
M
 
M
L
 
L
V
 
I
L
 
S
G
 
G
G
x
K
L
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
A
K
 
K
L
 
L
N
 
Q
T
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
D
N
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
R
M
 
M
V
 
V
S
 
A
G
 
A
L
 
Q
G
 
K
G
 
G
P
 
P
A
 
T
D
 
D
F
 
F
V
 
V
E
 
E
S
 
N
Y
 
Y
D
 
A
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
T
A
 
A
S
 
M
I
 
L
I
 
T
R
 
K
P
 
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
R
 
T
D
 
E
G
 
G
F
 
F
A
 
V
Y
 
S
S
 
E
M
 
M
V
 
D
T
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
P
 
A
G
 
S
D
 
D
A
 
T
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
F
S
 
T
N
 
D
V
 
M
C
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
Q
I
 
V
N
 
D
K
 
G
D
 
Q
T
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
I
 
I
H
|
H
A
 
A
Q
 
K
S
 
D
E
 
E
A
 
N
A
 
N
F
 
W
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
K
V
 
L
S
 
A
D
 
D
K
 
K
Q
 
A
P
 
P
E
 
E
K
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
T
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
R
Y
x
R
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4eadA Thymidine phosphorylase from e.Coli with 3'-azido-2'-fluoro- dideoxyuridine
67% identity, 99% coverage: 1:438/443 of query aligns to 1:438/440 of 4eadA

query
sites
4eadA
M
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
E
 
E
I
 
I
I
 
I
R
 
R
K
 
K
K
 
K
R
 
R
N
 
D
A
 
G
E
 
H
A
 
A
L
 
L
S
 
S
K
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
R
F
 
F
F
 
F
V
 
I
K
 
N
G
 
G
I
 
I
T
 
R
D
 
D
N
 
N
S
 
T
V
 
I
S
 
S
E
 
E
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
A
M
 
M
A
 
T
V
 
I
Y
 
F
F
 
F
N
 
H
D
 
D
M
 
M
T
 
T
M
 
M
D
 
P
E
 
E
R
 
R
I
 
V
A
 
S
L
 
L
T
 
T
T
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
R
D
 
D
S
 
S
G
 
G
T
 
T
V
 
V
L
 
L
N
 
D
W
 
W
D
 
K
S
 
S
L
 
L
G
 
H
L
 
L
N
 
N
G
 
G
P
 
P
V
 
I
I
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
T
S
 
S
L
 
L
M
 
M
L
 
L
G
 
G
P
 
P
M
 
M
A
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
G
Y
 
Y
V
 
I
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
F
 
L
D
 
E
A
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
Q
 
D
T
 
I
E
 
F
P
 
P
S
 
D
S
 
D
E
 
N
L
 
R
F
 
F
R
 
R
K
 
E
V
 
I
V
 
I
K
 
K
E
 
D
A
 
V
G
 
G
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
S
D
 
S
L
 
L
V
 
A
P
 
P
A
 
A
D
|
D
K
 
K
R
 
R
F
 
F
Y
|
Y
S
 
A
I
 
T
R
|
R
D
 
D
N
 
I
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
|
V
E
 
D
S
 
S
I
 
I
S
 
P
L
 
L
I
 
I
T
 
T
A
 
A
S
|
S
I
 
I
L
 
L
S
 
A
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
M
D
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
V
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
A
F
|
F
M
 
M
P
 
P
T
 
T
Y
 
Y
E
 
E
A
 
L
S
 
S
L
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
E
S
 
A
I
 
I
T
 
V
A
 
G
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
V
K
 
R
T
 
T
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
L
T
 
T
D
 
D
M
 
M
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
C
 
S
A
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
V
E
 
E
V
 
V
K
 
R
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
Q
F
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
G
K
 
E
Y
 
Y
R
 
R
N
 
N
P
 
P
R
 
R
L
 
L
Y
 
F
E
 
D
V
 
V
T
 
T
M
 
M
G
 
A
L
 
L
C
 
C
A
 
V
E
 
E
M
 
M
L
 
L
V
 
I
L
 
S
G
 
G
G
 
K
L
 
L
A
 
A
A
 
K
N
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
A
K
 
K
L
 
L
N
 
Q
T
 
A
V
 
V
L
 
L
D
 
D
N
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
R
M
 
M
V
 
V
S
 
A
G
 
A
L
 
Q
G
 
K
G
 
G
P
 
P
A
 
T
D
 
D
F
 
F
V
 
V
E
 
E
S
 
N
Y
 
Y
D
 
A
K
 
K
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
K
 
T
A
 
A
S
 
M
I
 
L
I
 
T
R
 
K
P
 
A
V
 
V
Y
 
Y
A
 
A
E
 
D
R
 
T
D
 
E
G
 
G
F
 
F
A
 
V
Y
 
S
S
 
E
M
 
M
V
 
D
T
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
R
 
R
K
 
Q
P
 
A
G
 
S
D
 
D
A
 
T
L
 
I
D
 
D
Y
 
Y
S
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
F
S
 
T
N
 
D
V
 
M
C
 
A
A
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
P
 
Q
I
 
V
N
 
D
K
 
G
D
 
Q
T
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
V
I
 
I
H
 
H
A
 
A
Q
 
K
S
 
D
E
 
E
A
 
N
A
 
N
F
 
W
E
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
V
R
 
K
G
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
K
V
 
L
S
 
A
D
 
D
K
 
K
Q
 
A
P
 
P
E
 
E
K
 
S
T
 
T
P
 
P
E
 
T
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
R
Y
 
R
V
 
I

1brwB The crystal structure of pyrimidine nucleoside phosphorylase in a closed conformation (see paper)
43% identity, 98% coverage: 6:438/443 of query aligns to 5:432/433 of 1brwB

query
sites
1brwB
E
 
D
I
 
L
I
 
I
R
 
A
K
 
K
K
 
K
R
 
R
N
 
D
A
 
G
E
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
T
K
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
E
F
 
W
F
 
I
V
 
V
K
 
R
G
 
G
I
 
Y
T
 
T
D
 
N
N
 
G
S
 
D
V
 
I
S
 
P
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
I
 
M
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
I
Y
 
Y
F
 
F
N
 
R
D
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
E
D
 
E
E
 
E
R
 
T
I
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
V
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
T
 
E
V
 
M
L
 
L
N
 
D
W
 
L
D
 
S
S
 
S
L
 
I
G
 
-
L
 
-
N
 
R
G
 
G
P
 
V
V
 
K
I
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
|
G
D
 
D
V
 
T
I
 
T
S
x
T
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
P
M
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
S
C
 
V
G
 
G
G
 
V
Y
 
P
V
 
V
P
 
A
M
x
K
I
 
M
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
I
D
 
D
K
 
K
F
 
L
D
 
E
A
 
S
I
 
V
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
Q
 
H
T
 
V
E
 
E
P
 
I
S
 
S
S
 
K
E
 
D
L
 
E
F
 
F
R
 
I
K
 
R
V
 
L
V
 
V
K
 
N
E
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
A
D
|
D
K
 
K
R
 
K
F
 
L
Y
|
Y
S
 
A
I
 
L
R
|
R
D
 
D
N
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
N
S
 
S
I
 
I
S
 
P
L
 
L
I
|
I
T
 
A
A
 
S
S
|
S
I
|
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
|
K
L
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
L
D
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
M
P
 
K
T
 
K
Y
 
L
E
 
D
A
 
E
S
 
A
L
 
R
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
V
I
 
M
T
 
V
A
 
D
V
 
I
A
 
G
N
 
K
G
 
R
A
 
V
G
 
G
T
 
R
K
 
R
T
 
T
T
 
M
A
 
A
L
 
V
L
 
I
T
 
S
D
 
D
M
 
M
N
 
S
Q
 
Q
V
 
P
L
|
L
A
 
G
S
 
Y
C
x
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
V
K
 
K
E
|
E
A
 
A
V
 
I
D
 
E
F
 
T
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
N
Y
 
-
R
 
-
N
 
G
P
 
P
R
 
H
-
 
D
L
 
L
Y
 
T
E
 
E
V
 
L
T
 
C
M
 
L
G
 
T
L
 
L
C
 
G
A
 
S
E
 
H
M
 
M
L
 
V
V
 
Y
L
 
L
G
 
A
G
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
P
N
 
S
D
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
R
K
 
L
L
 
L
N
 
E
T
 
E
V
 
A
L
 
I
D
 
R
N
 
S
G
 
G
R
 
A
A
 
A
A
 
I
E
 
A
I
 
A
F
 
F
G
 
K
K
 
T
M
 
F
V
 
L
S
 
A
G
 
A
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
D
A
 
A
D
 
S
F
 
V
V
 
V
E
 
D
S
 
D
Y
 
L
D
 
D
K
 
K
Y
 
-
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
S
 
A
I
 
Y
I
 
T
R
 
S
P
 
T
V
 
V
Y
 
T
A
 
A
E
 
A
R
 
A
D
 
D
G
 
G
F
 
Y
A
 
V
Y
 
A
S
 
E
M
 
M
V
 
A
T
 
A
R
 
D
E
 
D
L
 
I
G
 
G
L
 
T
A
 
A
V
 
A
V
 
M
T
 
W
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
A
K
 
K
P
 
K
G
 
E
D
 
D
A
 
V
L
 
I
D
 
D
Y
 
L
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
I
S
 
V
N
 
L
V
 
H
C
 
K
A
 
K
L
 
I
G
 
G
Q
 
D
P
 
R
I
 
V
N
 
Q
K
 
K
D
 
G
T
 
E
P
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
S
Q
 
N
S
 
R
E
 
P
A
 
D
A
 
V
F
 
L
E
 
D
E
 
V
A
 
K
A
 
E
R
 
K
A
 
-
V
 
I
R
 
E
G
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
R
V
 
L
S
 
S
D
 
P
K
 
Q
Q
 
P
P
 
V
E
 
A
K
 
R
T
 
P
P
 
P
E
 
L
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
E
Y
 
T
V
 
I

1brwA The crystal structure of pyrimidine nucleoside phosphorylase in a closed conformation (see paper)
43% identity, 98% coverage: 6:438/443 of query aligns to 5:432/433 of 1brwA

query
sites
1brwA
E
 
D
I
 
L
I
 
I
R
 
A
K
 
K
K
 
K
R
 
R
N
 
D
A
 
G
E
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
T
K
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
E
F
 
W
F
 
I
V
 
V
K
 
R
G
 
G
I
 
Y
T
 
T
D
 
N
N
 
G
S
 
D
V
 
I
S
 
P
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
I
 
M
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
I
Y
 
Y
F
 
F
N
 
R
D
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
E
D
 
E
E
 
E
R
 
T
I
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
V
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
T
 
E
V
 
M
L
 
L
N
 
D
W
 
L
D
 
S
S
 
S
L
 
I
G
 
-
L
 
-
N
 
R
G
 
G
P
 
V
V
 
K
I
 
V
D
 
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
|
G
D
 
D
V
x
T
I
 
T
S
x
T
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
P
M
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
S
C
 
V
G
 
G
G
 
V
Y
 
P
V
 
V
P
 
A
M
x
K
I
 
M
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
I
D
 
D
K
 
K
F
 
L
D
 
E
A
 
S
I
 
V
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
Q
 
H
T
 
V
E
 
E
P
 
I
S
 
S
S
 
K
E
 
D
L
 
E
F
 
F
R
 
I
K
 
R
V
 
L
V
 
V
K
 
N
E
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
A
D
|
D
K
 
K
R
 
K
F
 
L
Y
 
Y
S
 
A
I
 
L
R
|
R
D
 
D
N
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
N
S
 
S
I
 
I
S
 
P
L
 
L
I
 
I
T
 
A
A
 
S
S
|
S
I
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
L
D
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
M
P
 
K
T
 
K
Y
 
L
E
 
D
A
 
E
S
 
A
L
 
R
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
V
I
 
M
T
 
V
A
 
D
V
 
I
A
 
G
N
 
K
G
 
R
A
 
V
G
 
G
T
 
R
K
 
R
T
 
T
T
 
M
A
 
A
L
 
V
L
 
I
T
 
S
D
 
D
M
 
M
N
 
S
Q
 
Q
V
 
P
L
|
L
A
 
G
S
 
Y
C
x
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
V
K
 
K
E
|
E
A
 
A
V
 
I
D
 
E
F
 
T
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
N
Y
 
-
R
 
-
N
 
G
P
 
P
R
 
H
-
 
D
L
 
L
Y
 
T
E
 
E
V
 
L
T
 
C
M
 
L
G
 
T
L
 
L
C
 
G
A
 
S
E
 
H
M
 
M
L
 
V
V
 
Y
L
 
L
G
 
A
G
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
P
N
 
S
D
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
R
K
 
L
L
 
L
N
 
E
T
 
E
V
 
A
L
 
I
D
 
R
N
 
S
G
 
G
R
 
A
A
 
A
A
 
I
E
 
A
I
 
A
F
 
F
G
 
K
K
 
T
M
 
F
V
 
L
S
 
A
G
 
A
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
D
A
 
A
D
 
S
F
 
V
V
 
V
E
 
D
S
 
D
Y
 
L
D
 
D
K
 
K
Y
 
-
L
 
L
P
 
P
K
 
K
A
 
A
S
 
A
I
 
Y
I
 
T
R
 
S
P
 
T
V
 
V
Y
 
T
A
 
A
E
 
A
R
 
A
D
 
D
G
 
G
F
 
Y
A
 
V
Y
 
A
S
 
E
M
 
M
V
 
A
T
 
A
R
 
D
E
 
D
L
 
I
G
 
G
L
 
T
A
 
A
V
 
A
V
 
M
T
 
W
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
A
K
 
K
P
 
K
G
 
E
D
 
D
A
 
V
L
 
I
D
 
D
Y
 
L
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
I
S
 
V
N
 
L
V
 
H
C
 
K
A
 
K
L
 
I
G
 
G
Q
 
D
P
 
R
I
 
V
N
 
Q
K
 
K
D
 
G
T
 
E
P
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
T
I
 
I
H
 
H
A
 
S
Q
 
N
S
 
R
E
 
P
A
 
D
A
 
V
F
 
L
E
 
D
E
 
V
A
 
K
A
 
E
R
 
K
A
 
-
V
 
I
R
 
E
G
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
R
V
 
L
S
 
S
D
 
P
K
 
Q
Q
 
P
P
 
V
E
 
A
K
 
R
T
 
P
P
 
P
E
 
L
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
E
Y
 
T
V
 
I

5olnB X-ray structure of the complex pyrimidine-nucleoside phosphorylase from bacillus subtilis at 1.88 a (see paper)
44% identity, 93% coverage: 6:415/443 of query aligns to 6:411/434 of 5olnB

query
sites
5olnB
E
 
D
I
 
I
I
 
I
R
 
I
K
 
K
K
 
K
R
 
Q
N
 
N
A
 
G
E
 
K
A
 
E
L
 
L
S
 
T
K
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
F
 
F
F
 
F
V
 
V
K
 
N
G
 
G
I
 
Y
T
 
T
D
 
D
N
 
G
S
 
S
V
 
I
S
 
P
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
I
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
I
Y
 
F
F
 
F
N
 
Q
D
 
D
M
 
M
T
 
S
M
 
D
D
 
R
E
 
E
R
 
R
I
 
A
A
 
D
L
 
L
T
 
T
T
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
V
D
 
N
S
 
S
G
 
G
T
 
E
V
 
T
L
 
I
N
 
D
W
 
L
D
 
S
S
 
A
L
 
I
G
 
-
L
 
-
N
 
E
G
 
G
P
 
I
V
 
K
I
 
V
D
 
D
K
 
K
H
|
H
S
 
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
T
I
 
T
S
x
T
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
A
P
 
P
M
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
L
G
 
D
G
 
V
Y
 
P
V
 
V
P
 
A
M
 
K
I
 
M
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
I
D
 
D
K
 
K
F
 
L
D
 
E
A
 
A
I
 
I
P
 
M
G
 
G
Y
 
F
Q
 
H
T
 
V
E
 
E
P
 
L
S
 
T
S
 
K
E
 
D
L
 
E
F
 
F
R
 
I
K
 
K
V
 
L
V
 
V
K
 
N
E
 
R
A
 
D
G
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
D
 
N
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
A
D
|
D
K
 
K
R
 
K
F
 
L
Y
|
Y
S
 
A
I
 
L
R
|
R
D
 
D
N
 
V
T
 
T
A
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
N
S
 
S
I
 
I
S
 
P
L
 
L
I
|
I
T
 
A
A
 
S
S
|
S
I
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
L
D
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
M
P
 
K
T
 
T
Y
 
E
E
 
E
A
 
D
S
 
A
L
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
S
 
A
I
 
M
T
 
V
A
 
R
V
 
I
A
 
G
N
 
N
G
 
N
A
 
V
G
 
G
T
 
R
K
 
Q
T
 
T
T
 
M
A
 
A
L
 
V
L
 
I
T
 
S
D
 
D
M
 
M
N
 
S
Q
 
Q
V
 
P
L
 
L
A
 
G
S
 
F
C
 
A
A
 
I
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
V
K
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
I
D
 
D
F
 
T
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
E
Y
 
-
R
 
-
N
 
G
P
 
P
R
 
E
-
 
D
L
 
L
Y
 
H
E
 
E
V
 
L
T
 
V
M
 
L
G
 
T
L
 
L
C
 
G
A
 
S
E
 
Q
M
 
M
L
 
V
V
 
V
L
 
L
G
 
A
G
 
K
L
 
K
A
 
A
A
 
D
N
 
T
D
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
A
K
 
K
L
 
L
N
 
E
T
 
E
V
 
V
L
 
M
D
 
K
N
 
N
G
 
G
R
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
E
I
 
K
F
 
F
G
 
K
K
 
D
M
 
F
V
 
L
S
 
K
G
 
N
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
D
A
 
S
D
 
S
F
 
I
V
 
V
E
 
D
S
 
D
Y
 
P
D
 
S
K
 
K
Y
 
-
L
 
L
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
S
 
A
I
 
Y
I
 
Q
R
 
I
P
 
D
V
 
V
Y
 
P
A
 
A
E
 
K
R
 
E
D
 
A
G
 
G
F
 
V
A
 
V
Y
 
S
S
 
E
M
 
I
V
 
V
T
 
A
R
 
D
E
 
E
L
 
I
G
 
G
L
 
V
A
 
A
V
 
A
V
 
M
T
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
A
K
 
T
P
 
K
G
 
E
D
 
D
A
 
E
L
 
I
D
 
D
Y
 
L
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
I
S
 
M
N
 
L
V
 
R
C
 
K
A
 
K
L
 
V
G
 
G
Q
 
D
P
 
K
I
 
V
N
 
E
K
 
K
D
 
G
T
 
E
P
 
P
L
 
L
A
 
V
V
 
T
I
 
L
H
 
Y
A
 
A
Q
 
N
S
 
R
E
 
E
A
 
N
A
 
V
F
 
D
E
 
E
E
 
V
A
 
I
A
 
A
R
 
K

7m7kB Crystal structure of uridine bound to geobacillus thermoglucosidasius pyrimidine nucleoside phosphorylase pynp
42% identity, 98% coverage: 6:438/443 of query aligns to 4:431/432 of 7m7kB

query
sites
7m7kB
E
 
D
I
 
L
I
 
I
R
 
A
K
 
K
K
 
K
R
 
R
N
 
D
A
 
G
E
 
Y
A
 
E
L
 
L
S
 
S
K
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
D
F
 
F
F
 
I
V
 
I
K
 
R
G
 
G
I
 
Y
T
 
T
D
 
N
N
 
G
S
 
D
V
 
I
S
 
P
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
I
 
M
A
 
S
A
 
A
L
 
F
G
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
V
Y
 
F
F
 
F
N
 
R
D
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
E
D
 
E
E
 
E
R
 
T
I
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
T
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
V
D
 
R
S
 
S
G
 
G
T
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
D
W
 
L
D
 
S
S
 
K
L
 
I
G
 
-
L
 
-
N
 
E
G
 
G
P
 
M
V
 
K
I
 
V
D
 
D
K
 
K
H
 
H
S
 
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
T
I
 
T
S
 
T
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
P
M
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
S
C
 
V
G
 
G
G
 
V
Y
 
P
V
 
V
P
 
A
M
 
K
I
 
M
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
I
D
 
D
K
 
K
F
 
L
D
 
E
A
 
S
I
 
V
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
Q
 
H
T
 
V
E
 
E
P
 
I
S
 
D
S
 
N
E
 
E
L
 
Q
F
 
F
R
 
I
K
 
E
V
 
L
V
 
V
K
 
N
E
 
K
A
 
N
G
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
D
 
N
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
A
D
 
D
K
 
K
R
 
K
F
 
L
Y
|
Y
S
 
A
I
 
L
R
|
R
D
 
D
N
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
D
S
 
S
I
 
I
S
 
P
L
 
L
I
 
I
T
 
A
A
 
S
S
|
S
I
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
L
D
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
G
A
 
A
F
|
F
M
 
M
P
 
K
T
 
D
Y
 
F
E
 
A
A
 
G
S
 
A
L
 
K
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
T
S
 
A
I
 
M
T
 
V
A
 
E
V
 
I
A
 
G
N
 
K
G
 
R
A
 
V
G
 
G
T
 
R
K
 
K
T
 
T
T
 
M
A
 
A
L
 
V
L
 
I
T
 
S
D
 
D
M
 
M
N
 
S
Q
 
Q
V
 
P
L
 
L
A
 
G
S
 
Y
C
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
V
K
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
I
D
 
D
F
 
T
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
K
Y
 
-
R
 
-
N
 
G
P
 
P
R
 
E
-
 
D
L
 
L
Y
 
Q
E
 
E
V
 
L
T
 
C
M
 
L
G
 
T
L
 
L
C
 
G
A
 
S
E
 
Y
M
 
M
L
 
V
V
 
Y
L
 
L
G
 
A
G
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
S
N
 
S
D
 
L
A
 
E
D
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
A
K
 
L
L
 
L
N
 
E
T
 
A
V
 
S
L
 
I
D
 
R
N
 
E
G
 
G
R
 
K
A
 
A
A
 
L
E
 
E
I
 
T
F
 
F
G
 
K
K
 
V
M
 
F
V
 
L
S
 
S
G
 
A
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
D
A
 
A
D
 
S
F
 
V
V
 
V
E
 
D
S
 
D
Y
 
P
D
 
T
K
 
K
Y
 
-
L
 
L
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
S
 
K
I
 
Y
I
 
R
R
 
W
P
 
E
V
 
L
Y
 
E
A
 
A
E
 
P
R
 
E
D
 
D
G
 
G
F
 
Y
A
 
V
Y
 
A
S
 
E
M
 
I
V
 
V
T
 
A
R
 
D
E
 
E
L
 
V
G
 
G
L
 
T
A
 
A
V
 
A
V
 
M
T
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
A
K
 
T
P
 
K
G
 
E
D
 
A
A
 
T
L
 
I
D
 
D
Y
 
L
S
 
S
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
V
N
 
L
V
 
H
C
 
K
A
 
K
L
 
V
G
 
G
Q
 
D
P
 
A
I
 
V
N
 
K
K
 
K
D
 
G
T
 
E
P
 
S
L
 
L
A
 
V
V
 
T
I
 
I
H
 
Y
A
 
S
Q
 
N
S
 
T
E
 
E
A
 
-
A
 
N
F
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
V
A
 
K
R
 
Q
A
 
K
V
 
L
R
 
A
G
 
K
A
 
S
I
 
I
T
 
R
V
 
L
S
 
S
D
 
S
K
 
I
Q
 
P
P
 
V
E
 
A
K
 
K
T
 
P
P
 
T
E
 
L
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
E
Y
 
T
V
 
I

P77836 Pyrimidine-nucleoside phosphorylase; PYNP; Py-NPase; EC 2.4.2.2 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
41% identity, 91% coverage: 6:407/443 of query aligns to 5:402/433 of P77836

query
sites
P77836
E
 
D
I
 
L
I
 
I
R
 
E
K
 
K
K
 
K
R
 
R
N
 
D
A
 
G
E
 
H
A
 
A
L
 
L
S
 
T
K
 
K
E
 
E
E
 
E
I
 
I
Q
 
Q
F
 
F
F
 
I
V
 
I
K
 
E
G
 
G
I
 
Y
T
 
T
D
 
K
N
 
G
S
 
D
V
 
I
S
 
P
E
 
D
G
 
Y
Q
 
Q
I
 
M
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
A
M
 
M
A
 
A
V
 
I
Y
 
F
F
 
F
N
 
R
D
 
G
M
 
M
T
 
N
M
 
E
D
 
E
E
 
E
R
 
T
I
 
A
A
 
E
L
 
L
T
 
T
T
 
M
A
 
A
M
 
M
R
 
V
D
 
H
S
 
S
G
 
G
T
 
D
V
 
T
L
 
I
N
 
D
W
 
L
D
 
S
S
 
R
L
 
I
G
 
-
L
 
-
N
 
E
G
 
G
P
 
I
V
 
K
I
 
V
D
 
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
|
G
D
 
D
V
x
T
I
 
T
S
x
T
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
G
P
 
P
M
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
S
C
 
V
G
 
G
G
 
V
Y
 
P
V
 
V
P
 
A
M
x
K
I
x
M
S
|
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
 
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
I
D
 
D
K
 
K
F
 
L
D
 
E
A
 
S
I
 
V
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
Q
 
H
T
 
V
E
 
E
P
 
I
S
 
T
S
 
N
E
 
D
L
 
E
F
 
F
R
 
I
K
 
D
V
 
L
V
 
V
K
 
N
E
 
K
A
 
N
G
 
K
V
 
I
A
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
G
 
G
D
 
N
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
A
D
 
D
K
 
K
R
 
K
F
 
L
Y
 
Y
S
 
A
I
 
L
R
|
R
D
 
D
N
 
V
T
 
T
A
 
A
T
 
T
V
 
V
E
 
N
S
 
S
I
 
I
S
 
P
L
 
L
I
 
I
T
 
A
A
 
S
S
 
S
I
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
A
D
 
D
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
L
D
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
T
G
 
G
S
 
V
G
 
G
A
 
A
F
 
F
M
 
M
P
 
K
T
 
D
Y
 
L
E
 
N
A
 
D
S
 
A
L
 
K
E
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
K
S
 
A
I
 
M
T
 
V
A
 
D
V
 
I
A
 
G
N
 
N
G
 
R
A
 
V
G
 
G
T
 
R
K
 
K
T
 
T
T
 
M
A
 
A
L
 
I
L
 
I
T
 
S
D
 
D
M
 
M
N
 
S
Q
 
Q
V
 
P
L
|
L
A
 
G
S
 
Y
C
x
A
A
 
I
G
 
G
N
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
E
V
 
V
K
 
K
E
|
E
A
 
A
V
 
I
D
 
D
F
 
T
L
 
L
T
 
K
G
 
G
K
 
E
Y
 
-
R
 
-
N
 
G
P
 
P
R
 
E
L
 
D
Y
 
F
-
 
Q
E
 
E
V
 
L
T
 
C
M
 
L
G
 
V
L
 
L
C
 
G
A
 
S
E
 
H
M
 
M
L
 
V
V
 
Y
L
 
L
G
 
A
G
 
E
L
 
K
A
 
A
A
 
S
N
 
S
D
 
L
A
 
E
D
 
E
A
 
A
R
 
R
T
 
H
K
 
M
L
 
L
N
 
E
T
 
K
V
 
A
L
 
M
D
 
K
N
 
D
G
 
G
R
 
S
A
 
A
A
 
L
E
 
Q
I
 
T
F
 
F
G
 
K
K
 
T
M
 
F
V
 
L
S
 
A
G
 
A
L
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
D
A
 
A
D
 
S
F
 
V
V
 
V
E
 
D
S
 
D
Y
 
P
D
 
S
K
 
K
Y
 
-
L
 
L
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
S
 
K
I
 
Y
I
 
I
R
 
I
P
 
E
V
 
L
Y
 
E
A
 
A
E
 
K
R
 
E
D
 
D
G
 
G
F
 
Y
A
 
V
Y
 
S
S
 
E
M
 
I
V
 
V
T
 
A
R
 
D
E
 
A
L
 
V
G
 
G
L
 
T
A
 
A
V
 
A
V
 
M
T
 
W
L
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
A
K
 
T
P
 
K
G
 
E
D
 
S
A
 
T
L
 
I
D
 
D
Y
 
L
S
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
V
N
 
L
V
 
R
C
 
K
A
 
K
L
 
V
G
 
G
Q
 
D
P
 
A
I
 
V
N
 
K
K
 
K
D
 
G
T
 
E
P
 
S
L
 
L
A
 
V
V
 
T
I
 
I
H
 
Y
A
 
S
Q
 
N
S
 
R
E
 
E

2j0fA Structural basis for non-competitive product inhibition in human thymidine phosphorylase: implication for drug design (see paper)
40% identity, 96% coverage: 6:432/443 of query aligns to 5:437/446 of 2j0fA

query
sites
2j0fA
E
 
E
I
 
L
I
 
I
R
 
R
K
 
M
K
 
K
R
 
R
N
 
D
A
 
G
E
 
G
A
 
R
L
 
L
S
 
S
K
 
E
E
 
A
E
 
D
I
 
I
Q
 
R
F
 
G
F
 
F
V
 
V
K
 
A
G
 
A
I
 
V
T
 
V
D
 
N
N
 
G
S
 
S
V
 
A
S
 
Q
E
 
G
G
 
A
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
A
 
A
L
 
M
G
 
L
M
 
M
A
 
A
V
 
I
Y
 
R
F
 
L
N
 
R
D
 
G
M
 
M
T
 
D
M
 
L
D
 
E
E
 
E
R
 
T
I
 
S
A
 
V
L
 
L
T
 
T
T
 
Q
A
 
A
M
 
L
R
 
A
D
 
Q
S
 
S
G
 
G
T
 
Q
V
 
Q
L
 
L
N
 
E
W
 
W
D
 
P
S
 
E
L
 
-
G
 
A
L
 
W
N
 
R
G
 
Q
P
 
Q
V
 
L
I
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
S
|
S
T
|
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
D
 
D
V
 
K
I
 
V
S
 
S
L
 
L
M
 
V
L
 
L
G
 
A
P
 
P
M
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
C
G
 
G
G
 
C
Y
 
K
V
 
V
P
 
P
M
 
M
I
 
I
S
 
S
G
 
G
R
 
R
G
 
G
L
|
L
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
G
 
G
T
|
T
L
 
L
D
 
D
K
 
K
F
 
L
D
 
E
A
 
S
I
 
I
P
 
P
G
 
G
Y
 
F
Q
 
N
T
 
V
E
 
I
P
 
Q
S
 
S
S
 
P
E
 
E
L
 
Q