SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 6937022 FitnessBrowser__SB2B:6937022 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

2df8A Crystal structure of the ph0510 protein from pyrococcus horikoshii ot3 in complex with beta-d-fructopyranose-1-phosphate
24% identity, 77% coverage: 63:369/397 of query aligns to 28:316/325 of 2df8A

query
sites
2df8A
L
 
I
A
 
S
L
 
L
P
 
P
D
 
N
L
 
-
R
 
R
V
 
I
I
 
L
L
 
Y
T
 
L
G
 
G
A
 
C
G
 
G
T
 
S
S
|
S
A
 
H
Y
 
F
I
 
L
G
 
S
E
 
K
A
 
L
L
 
L
A
 
A
P
 
-
F
 
-
L
 
M
A
 
V
T
 
T
Q
 
N
M
 
M
P
 
H
L
 
-
V
 
-
G
 
G
Q
 
G
T
 
L
V
 
G
E
 
I
A
 
A
I
 
L
A
 
P
T
 
C
T
 
S
D
 
E
L
 
F
V
 
L
S
 
Y
H
 
S
P
 
K
H
 
E
L
 
T
Y
 
Y
L
 
-
H
 
P
P
 
I
A
 
G
R
 
E
P
 
V
T
 
E
L
 
L
V
 
A
I
 
V
S
 
G
F
 
I
G
x
S
R
|
R
S
|
S
G
 
G
S
 
E
S
x
T
P
 
T
E
 
E
S
 
I
M
 
L
A
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
K
C
 
I
D
 
N
A
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
C
 
-
Y
 
-
H
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
T
 
-
C
 
V
N
 
K
P
 
K
Q
 
L
G
 
G
S
 
I
M
 
T
A
 
T
R
 
R
Y
 
-
G
 
-
E
 
E
Q
 
S
Q
 
S
A
 
L
Q
 
T
R
 
R
A
 
M
C
 
C
L
 
D
W
 
Y
L
 
S
M
 
L
P
 
V
E
 
V
G
 
P
S
 
A
H
 
I
D
 
E
R
 
E
S
 
S
F
x
V
A
 
V
M
 
M
T
 
T
S
 
H
S
 
S
F
 
F
S
 
T
C
 
S
M
 
F
Y
 
Y
L
 
F
G
 
A
V
 
Y
L
 
L
L
 
Q
L
 
L
F
 
L
A
 
R
A
 
Y
N
 
S
Y
 
Y
S
 
G
-
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
G
A
 
E
L
 
I
A
 
S
R
 
K
A
 
A
V
 
T
T
 
E
L
 
K
A
 
S
-
 
L
-
 
E
-
 
Y
E
 
E
R
 
R
M
 
Y
L
 
I
C
 
R
D
 
E
R
 
I
V
 
V
D
 
E
E
 
-
I
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
S
L
 
F
P
 
D
L
 
F
S
 
Q
R
 
N
V
 
I
V
 
I
F
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
S
G
 
G
T
 
L
L
 
L
Q
 
Y
G
 
P
I
 
V
A
 
A
R
 
L
E
|
E
A
 
A
A
 
S
L
 
L
K
|
K
L
 
M
L
 
K
E
|
E
L
 
M
S
 
S
A
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
I
M
 
F
G
 
W
V
 
S
H
 
E
E
 
A
S
 
Y
P
 
P
-
 
T
L
 
F
G
 
E
F
 
V
R
 
R
H
|
H
G
 
G
P
 
F
K
 
K
S
 
A
L
 
I
I
 
A
D
 
D
K
 
E
D
 
K
S
 
T
L
 
L
V
 
V
V
 
V
V
 
L
L
 
M
C
 
V
S
 
E
S
 
-
E
 
E
P
 
P
Y
 
F
A
 
E
R
 
-
A
 
-
Y
 
W
D
 
H
M
 
E
D
 
K
M
 
L
A
 
V
A
 
K
E
 
E
L
 
F
E
 
K
R
 
N
D
 
Q
G
 
G
A
 
A
A
 
K
S
 
V
A
 
L
L
 
V
V
 
I
R
 
S
L
 
N
C
 
S
E
 
P
E
 
Q
N
 
D
V
 
L
G
 
G
A
 
Q
D
 
D
A
 
Y
Q
 
S
T
 
I
L
 
E
L
 
L
E
 
P
D
 
R
V
 
L
W
 
S
L
 
K
T
 
D
-
 
A
-
 
N
-
 
P
F
 
I
P
 
P
Y
 
Y
I
 
L
L
 
P
Y
 
I
C
 
V
Q
 
Q
L
 
L
F
 
L
A
 
S
Y
 
Y
F
 
Y
K
 
K
A
 
A
L
 
V
N
 
S
L
 
R
G
 
G
I
 
L
S
 
N
A
 
P
D
 
D
N
 
N
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4amvA E.Coli glucosamine-6p synthase in complex with fructose-6p (see paper)
25% identity, 63% coverage: 120:369/397 of query aligns to 339:598/608 of 4amvA

query
sites
4amvA
R
 
R
P
 
N
T
 
S
L
 
L
V
 
M
I
 
I
S
 
T
F
 
L
G
x
S
R
x
Q
S
|
S
G
 
G
S
 
E
S
x
T
P
 
A
E
 
D
S
 
T
M
 
L
A
 
A
A
 
G
I
 
L
E
 
R
L
 
L
C
 
S
D
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
-
P
 
-
R
 
G
C
 
Y
Y
 
L
H
 
G
L
 
S
L
 
L
L
 
A
T
 
I
C
 
C
N
 
N
-
 
V
P
 
P
Q
 
G
G
 
S
S
 
S
M
 
L
A
 
V
R
 
R
Y
 
E
G
 
S
E
 
D
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
L
 
L
W
 
A
L
 
L
M
 
M
P
 
T
E
 
N
G
 
A
S
 
G
H
 
T
D
 
E
R
 
I
S
 
G
F
 
V
A
 
A
M
x
S
T
 
T
S
 
K
S
 
A
F
 
F
S
 
T
C
 
T
M
 
Q
Y
 
-
L
 
L
G
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
M
F
 
L
A
 
V
A
 
A
N
 
K
Y
 
L
S
 
S
A
 
K
L
 
L
A
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
E
R
 
H
A
 
D
V
 
I
T
 
V
L
 
H
A
 
G
E
 
L
R
 
Q
M
 
A
L
 
L
C
 
P
D
 
S
R
 
R
V
 
I
D
 
E
E
 
Q
I
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
Q
-
 
D
A
 
K
K
 
R
L
 
I
A
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
S
P
 
D
L
 
K
S
 
H
R
 
H
V
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
R
G
 
G
T
 
D
L
 
Q
Q
 
Y
G
 
P
I
 
I
A
 
A
R
 
L
E
|
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
K
|
K
L
 
L
L
 
K
E
|
E
L
 
I
S
 
S
A
 
Y
G
 
-
A
 
-
V
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
I
H
 
H
E
 
A
S
 
E
P
 
A
L
 
Y
G
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
E
F
 
L
R
 
K
H
|
H
G
 
G
P
 
P
K
 
L
S
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
K
 
A
D
 
D
S
 
M
L
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
V
C
 
A
S
 
P
S
 
N
E
 
N
P
 
E
Y
 
L
A
 
L
R
 
E
A
 
K
Y
 
L
D
 
K
M
 
S
D
 
N
M
 
I
A
 
E
A
 
E
E
 
V
L
 
R
E
 
A
R
 
R
D
 
G
G
 
G
A
 
Q
A
 
L
S
 
Y
A
 
V
L
 
F
V
 
A
R
 
D
L
 
Q
C
 
D
E
 
A
E
 
G
N
 
F
V
 
V
G
 
S
A
 
S
D
 
D
A
 
N
Q
 
M
T
 
H
L
 
I
L
 
I
-
 
E
-
 
M
-
 
P
-
 
H
-
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
V
W
 
I
L
 
A
T
 
P
F
 
I
P
 
F
Y
 
Y
I
 
T
L
 
V
Y
 
P
C
 
L
Q
 
Q
L
 
L
F
 
L
A
 
A
Y
 
Y
F
 
H
K
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
K
G
 
G
I
 
T
S
 
D
A
 
V
D
 
D
N
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1jxaA Glucosamine 6-phosphate synthase with glucose 6-phosphate (see paper)
25% identity, 63% coverage: 120:369/397 of query aligns to 339:598/608 of 1jxaA

query
sites
1jxaA
R
 
R
P
 
N
T
 
S
L
 
L
V
 
M
I
 
I
S
 
T
F
 
L
G
x
S
R
x
Q
S
|
S
G
 
G
S
 
E
S
x
T
P
 
A
E
 
D
S
 
T
M
 
L
A
 
A
A
 
G
I
 
L
E
 
R
L
 
L
C
 
S
D
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
-
P
 
-
R
 
G
C
 
Y
Y
 
L
H
 
G
L
 
S
L
 
L
L
 
A
T
 
I
C
 
C
N
 
N
-
 
V
P
 
P
Q
 
G
G
 
S
S
 
S
M
 
L
A
 
V
R
 
R
Y
 
E
G
 
S
E
 
D
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
L
 
L
W
 
A
L
 
L
M
 
M
P
 
T
E
 
N
G
 
A
S
 
G
H
 
T
D
 
E
R
 
I
S
 
G
F
 
V
A
 
A
M
x
S
T
 
T
S
 
K
S
 
A
F
 
F
S
 
T
C
 
T
M
 
Q
Y
 
-
L
 
L
G
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
M
F
 
L
A
 
V
A
 
A
N
 
K
Y
 
L
S
 
S
A
 
K
L
 
L
A
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
I
-
 
E
R
 
H
A
 
D
V
 
I
T
 
V
L
 
H
A
 
G
E
 
L
R
 
Q
M
 
A
L
 
L
C
 
P
D
 
S
R
 
R
V
 
I
D
 
E
E
 
Q
I
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
Q
-
 
D
A
 
K
K
 
R
L
 
I
A
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
S
P
 
D
L
 
K
S
 
H
R
 
H
V
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
R
G
 
G
T
 
D
L
 
Q
Q
 
Y
G
 
P
I
 
I
A
 
A
R
 
L
E
|
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
K
|
K
L
 
L
L
 
K
E
|
E
L
 
I
S
 
S
A
 
Y
G
 
-
A
 
-
V
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
I
H
 
H
E
 
A
S
 
E
P
 
A
L
 
Y
G
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
E
F
 
L
R
 
K
H
|
H
G
 
G
P
 
P
K
 
L
S
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
K
 
A
D
 
D
S
 
M
L
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
V
C
 
A
S
 
P
S
 
N
E
 
N
P
 
E
Y
 
L
A
 
L
R
 
E
A
 
K
Y
 
L
D
 
K
M
 
S
D
 
N
M
 
I
A
 
E
A
 
E
E
 
V
L
 
R
E
 
A
R
 
R
D
 
G
G
 
G
A
 
Q
A
 
L
S
 
Y
A
 
V
L
 
F
V
 
A
R
 
D
L
 
Q
C
 
D
E
 
A
E
 
G
N
 
F
V
 
V
G
 
S
A
 
S
D
 
D
A
 
N
Q
 
M
T
 
H
L
 
I
L
 
I
-
 
E
-
 
M
-
 
P
-
 
H
-
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
V
W
 
I
L
 
A
T
 
P
F
 
I
P
 
F
Y
 
Y
I
 
T
L
 
V
Y
 
P
C
 
L
Q
 
Q
L
 
L
F
 
L
A
 
A
Y
 
Y
F
 
H
K
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
K
G
 
G
I
 
T
S
 
D
A
 
V
D
 
D
N
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2j6hA E. Coli glucosamine-6-p synthase in complex with glucose-6p and 5-oxo- l-norleucine (see paper)
25% identity, 63% coverage: 120:369/397 of query aligns to 339:598/608 of 2j6hA

query
sites
2j6hA
R
 
R
P
 
N
T
 
S
L
 
L
V
 
M
I
 
I
S
 
T
F
 
L
G
x
S
R
x
Q
S
|
S
G
 
G
S
 
E
S
x
T
P
 
A
E
 
D
S
 
T
M
 
L
A
 
A
A
 
G
I
 
L
E
 
R
L
 
L
C
 
S
D
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
-
P
 
-
R
 
G
C
 
Y
Y
 
L
H
 
G
L
 
S
L
 
L
L
 
A
T
 
I
C
 
C
N
 
N
-
 
V
P
 
P
Q
 
G
G
 
S
S
 
S
M
 
L
A
 
V
R
 
R
Y
 
E
G
 
S
E
 
D
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
L
 
L
W
 
A
L
 
L
M
 
M
P
 
T
E
 
N
G
 
A
S
 
G
H
 
T
D
 
E
R
 
I
S
 
G
F
x
V
A
 
A
M
x
S
T
 
T
S
 
K
S
 
A
F
 
F
S
 
T
C
 
T
M
 
Q
Y
 
-
L
 
L
G
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
M
F
 
L
A
 
V
A
 
A
N
 
K
Y
 
L
S
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
A
A
 
S
L
 
I
A
 
E
R
 
H
A
 
D
V
 
I
T
 
V
L
 
H
A
 
G
E
 
L
R
 
Q
M
 
A
L
 
L
C
 
P
D
 
S
R
 
R
V
 
I
D
 
E
E
 
Q
I
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
Q
-
 
D
A
 
K
K
 
R
L
 
I
A
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
S
P
 
D
L
 
K
S
 
H
R
 
H
V
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
R
G
 
G
T
 
D
L
 
Q
Q
 
Y
G
 
P
I
 
I
A
 
A
R
 
L
E
|
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
K
|
K
L
 
L
L
 
K
E
|
E
L
 
I
S
 
S
A
 
Y
G
 
-
A
 
-
V
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
I
H
 
H
E
 
A
S
 
E
P
 
A
L
 
Y
G
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
E
F
 
L
R
 
K
H
|
H
G
 
G
P
 
P
K
 
L
S
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
K
 
A
D
 
D
S
 
M
L
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
V
C
 
A
S
 
P
S
 
N
E
 
N
P
 
E
Y
 
L
A
 
L
R
 
E
A
 
K
Y
 
L
D
 
K
M
 
S
D
 
N
M
 
I
A
 
E
A
 
E
E
 
V
L
 
R
E
 
A
R
 
R
D
 
G
G
 
G
A
 
Q
A
 
L
S
 
Y
A
 
V
L
 
F
V
 
A
R
 
D
L
 
Q
C
 
D
E
 
A
E
 
G
N
 
F
V
 
V
G
 
S
A
 
S
D
 
D
A
 
N
Q
 
M
T
 
H
L
 
I
L
 
I
-
 
E
-
 
M
-
 
P
-
 
H
-
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
V
W
 
I
L
 
A
T
 
P
F
 
I
P
 
F
Y
 
Y
I
 
T
L
 
V
Y
 
P
C
 
L
Q
 
Q
L
 
L
F
 
L
A
 
A
Y
 
Y
F
 
H
K
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
K
G
 
G
I
 
T
S
 
D
A
 
V
D
 
D
N
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1morA Isomerase domain of glucosamine 6-phosphate synthase complexed with glucose 6-phosphate (see paper)
25% identity, 63% coverage: 120:369/397 of query aligns to 97:356/366 of 1morA

query
sites
1morA
R
 
R
P
 
N
T
 
S
L
 
L
V
 
M
I
 
I
S
 
T
F
 
L
G
x
S
R
x
Q
S
|
S
G
 
G
S
 
E
S
x
T
P
 
A
E
 
D
S
 
T
M
 
L
A
 
A
A
 
G
I
 
L
E
 
R
L
 
L
C
 
S
D
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
-
P
 
-
R
 
G
C
 
Y
Y
 
L
H
 
G
L
 
S
L
 
L
L
 
A
T
 
I
C
 
C
N
 
N
-
 
V
P
 
P
Q
 
G
G
 
S
S
 
S
M
 
L
A
 
V
R
 
R
Y
 
E
G
 
S
E
 
D
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
L
 
L
W
 
A
L
 
L
M
 
M
P
 
T
E
 
N
G
 
A
S
 
G
H
 
T
D
 
E
R
 
I
S
 
G
F
x
V
A
 
A
M
 
S
T
 
T
S
 
K
S
 
A
F
 
F
S
 
T
C
 
T
M
 
Q
Y
 
-
L
 
L
G
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
M
F
 
L
A
 
V
A
 
A
N
 
K
Y
 
L
S
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
A
A
 
S
L
 
I
A
 
E
R
 
H
A
 
D
V
 
I
T
 
V
L
 
H
A
 
G
E
 
L
R
 
Q
M
 
A
L
 
L
C
 
P
D
 
S
R
 
R
V
 
I
D
 
E
E
 
Q
I
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
Q
-
 
D
A
 
K
K
 
R
L
 
I
A
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
S
P
 
D
L
 
K
S
 
H
R
 
H
V
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
R
G
 
G
T
 
D
L
 
Q
Q
 
Y
G
 
P
I
 
I
A
 
A
R
 
L
E
|
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
K
|
K
L
 
L
L
 
K
E
|
E
L
 
I
S
 
S
A
 
Y
G
 
-
A
 
-
V
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
I
H
 
H
E
 
A
S
 
E
P
 
A
L
 
Y
G
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
E
F
 
L
R
 
K
H
|
H
G
 
G
P
 
P
K
 
L
S
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
K
 
A
D
 
D
S
 
M
L
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
V
C
 
A
S
 
P
S
 
N
E
 
N
P
 
E
Y
 
L
A
 
L
R
 
E
A
 
K
Y
 
L
D
 
K
M
 
S
D
 
N
M
 
I
A
 
E
A
 
E
E
 
V
L
 
R
E
 
A
R
 
R
D
 
G
G
 
G
A
 
Q
A
 
L
S
 
Y
A
 
V
L
 
F
V
 
A
R
 
D
L
 
Q
C
 
D
E
 
A
E
 
G
N
 
F
V
 
V
G
 
S
A
 
S
D
 
D
A
 
N
Q
 
M
T
 
H
L
 
I
L
 
I
-
 
E
-
 
M
-
 
P
-
 
H
-
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
V
W
 
I
L
 
A
T
 
P
F
 
I
P
 
F
Y
 
Y
I
 
T
L
 
V
Y
 
P
C
 
L
Q
 
Q
L
 
L
F
 
L
A
 
A
Y
 
Y
F
 
H
K
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
K
G
 
G
I
 
T
S
 
D
A
 
V
D
 
D
N
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1moqA Isomerase domain of glucosamine 6-phosphate synthase complexed with glucosamine 6-phosphate (see paper)
25% identity, 63% coverage: 120:369/397 of query aligns to 97:356/366 of 1moqA

query
sites
1moqA
R
 
R
P
 
N
T
 
S
L
 
L
V
 
M
I
 
I
S
 
T
F
 
L
G
x
S
R
x
Q
S
|
S
G
 
G
S
 
E
S
x
T
P
 
A
E
 
D
S
 
T
M
 
L
A
 
A
A
 
G
I
 
L
E
 
R
L
 
L
C
 
S
D
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
-
P
 
-
R
 
G
C
 
Y
Y
 
L
H
 
G
L
 
S
L
 
L
L
 
A
T
 
I
C
 
C
N
 
N
-
 
V
P
 
P
Q
 
G
G
 
S
S
 
S
M
 
L
A
 
V
R
 
R
Y
 
E
G
 
S
E
 
D
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
L
 
L
W
 
A
L
 
L
M
 
M
P
 
T
E
 
N
G
 
A
S
 
G
H
 
T
D
 
E
R
 
I
S
 
G
F
x
V
A
 
A
M
 
S
T
 
T
S
 
K
S
 
A
F
 
F
S
 
T
C
 
T
M
 
Q
Y
 
-
L
 
L
G
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
M
F
 
L
A
 
V
A
 
A
N
 
K
Y
 
L
S
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
A
A
 
S
L
 
I
A
 
E
R
 
H
A
 
D
V
 
I
T
 
V
L
 
H
A
 
G
E
 
L
R
 
Q
M
 
A
L
 
L
C
 
P
D
 
S
R
 
R
V
 
I
D
 
E
E
 
Q
I
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
Q
-
 
D
A
 
K
K
 
R
L
 
I
A
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
S
P
 
D
L
 
K
S
 
H
R
 
H
V
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
R
G
 
G
T
 
D
L
 
Q
Q
 
Y
G
 
P
I
 
I
A
 
A
R
 
L
E
|
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
K
|
K
L
 
L
L
 
K
E
|
E
L
 
I
S
 
S
A
 
Y
G
 
-
A
 
-
V
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
I
H
 
H
E
 
A
S
 
E
P
 
A
L
 
Y
G
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
E
F
 
L
R
 
K
H
|
H
G
 
G
P
 
P
K
 
L
S
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
K
 
A
D
 
D
S
 
M
L
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
V
C
 
A
S
 
P
S
 
N
E
 
N
P
 
E
Y
 
L
A
 
L
R
 
E
A
 
K
Y
 
L
D
 
K
M
 
S
D
 
N
M
 
I
A
 
E
A
 
E
E
 
V
L
 
R
E
 
A
R
 
R
D
 
G
G
 
G
A
 
Q
A
 
L
S
 
Y
A
 
V
L
 
F
V
 
A
R
 
D
L
 
Q
C
 
D
E
 
A
E
 
G
N
 
F
V
 
V
G
 
S
A
 
S
D
 
D
A
 
N
Q
 
M
T
 
H
L
 
I
L
 
I
-
 
E
-
 
M
-
 
P
-
 
H
-
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
V
W
 
I
L
 
A
T
 
P
F
 
I
P
 
F
Y
 
Y
I
 
T
L
 
V
Y
 
P
C
 
L
Q
 
Q
L
 
L
F
 
L
A
 
A
Y
 
Y
F
 
H
K
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
K
G
 
G
I
 
T
S
 
D
A
 
V
D
 
D
N
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7dnrA Crystal structure of zn-bound sis domain of glucosamine-6-p synthase from e. Coli
25% identity, 63% coverage: 120:369/397 of query aligns to 97:356/357 of 7dnrA

query
sites
7dnrA
R
 
R
P
 
N
T
 
S
L
 
L
V
 
M
I
 
I
S
 
T
F
 
L
G
 
S
R
 
Q
S
 
S
G
 
G
S
 
E
S
 
T
P
 
A
E
 
D
S
 
T
M
 
L
A
 
A
A
 
G
I
 
L
E
 
R
L
 
L
C
 
S
D
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
-
P
 
-
R
 
G
C
 
Y
Y
 
L
H
 
G
L
 
S
L
 
L
L
 
A
T
 
I
C
 
C
N
 
N
-
 
V
P
 
P
Q
 
G
G
 
S
S
 
S
M
 
L
A
 
V
R
 
R
Y
 
E
G
 
S
E
 
D
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
L
 
L
W
 
A
L
 
L
M
 
M
P
 
T
E
 
N
G
 
A
S
 
G
H
 
T
D
 
E
R
 
I
S
 
G
F
 
V
A
 
A
M
 
S
T
 
T
S
 
K
S
 
A
F
 
F
S
 
T
C
 
T
M
 
Q
Y
 
-
L
 
L
G
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
M
F
 
L
A
 
V
A
 
A
N
 
K
Y
 
L
S
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
A
A
 
S
L
 
I
A
 
E
R
 
H
A
 
D
V
 
I
T
 
V
L
 
H
A
 
G
E
 
L
R
 
Q
M
 
A
L
 
L
C
 
P
D
 
S
R
 
R
V
 
I
D
 
E
E
 
Q
I
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
Q
-
 
D
A
 
K
K
 
R
L
 
I
A
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
S
P
 
D
L
 
K
S
x
H
R
x
H
V
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
R
G
 
G
T
 
D
L
 
Q
Q
 
Y
G
 
P
I
 
I
A
 
A
R
 
L
E
 
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
K
 
K
L
 
L
L
 
K
E
 
E
L
 
I
S
 
S
A
 
Y
G
 
-
A
 
-
V
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
I
H
 
H
E
 
A
S
 
E
P
 
A
L
 
Y
G
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
E
F
 
L
R
 
K
H
 
H
G
 
G
P
 
P
K
 
L
S
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
K
 
A
D
 
D
S
 
M
L
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
V
C
 
A
S
 
P
S
 
N
E
 
N
P
 
E
Y
 
L
A
 
L
R
 
E
A
 
K
Y
 
L
D
 
K
M
 
S
D
 
N
M
 
I
A
 
E
A
 
E
E
 
V
L
 
R
E
 
A
R
 
R
D
 
G
G
 
G
A
 
Q
A
 
L
S
 
Y
A
 
V
L
 
F
V
 
A
R
 
D
L
 
Q
C
 
D
E
 
A
E
 
G
N
 
F
V
 
V
G
 
S
A
 
S
D
 
D
A
 
N
Q
 
M
T
 
H
L
 
I
L
 
I
-
 
E
-
 
M
-
 
P
-
 
H
-
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
V
W
 
I
L
 
A
T
 
P
F
 
I
P
 
F
Y
 
Y
I
 
T
L
 
V
Y
 
P
C
 
L
Q
 
Q
L
 
L
F
 
L
A
 
A
Y
 
Y
F
 
H
K
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
K
G
 
G
I
 
T
S
 
D
A
 
V
D
 
D
N
 
Q
P
 
P

1mosA Isomerase domain of glucosamine 6-phosphate synthase complexed with 2- amino-2-deoxyglucitol 6-phosphate (see paper)
25% identity, 63% coverage: 120:369/397 of query aligns to 98:357/367 of 1mosA

query
sites
1mosA
R
 
R
P
 
N
T
 
S
L
 
L
V
 
M
I
 
I
S
 
T
F
 
L
G
x
S
R
x
Q
S
|
S
G
 
G
S
 
E
S
x
T
P
 
A
E
 
D
S
 
T
M
 
L
A
 
A
A
 
G
I
 
L
E
 
R
L
 
L
C
 
S
D
 
K
A
 
E
L
 
L
L
 
-
P
 
-
R
 
G
C
 
Y
Y
 
L
H
 
G
L
 
S
L
 
L
L
 
A
T
 
I
C
 
C
N
 
N
-
 
V
P
 
P
Q
 
G
G
 
S
S
 
S
M
 
L
A
 
V
R
 
R
Y
 
E
G
 
S
E
 
D
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
L
 
L
W
 
A
L
 
L
M
 
M
P
 
T
E
 
N
G
 
A
S
 
G
H
 
T
D
 
E
R
 
I
S
 
G
F
 
V
A
 
A
M
 
S
T
 
T
S
 
K
S
 
A
F
 
F
S
 
T
C
 
T
M
 
Q
Y
 
-
L
 
L
G
 
T
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
M
F
 
L
A
 
V
A
 
A
N
 
K
Y
 
L
S
 
S
-
 
R
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
D
-
 
A
A
 
S
L
 
I
A
 
E
R
 
H
A
 
D
V
 
I
T
 
V
L
 
H
A
 
G
E
 
L
R
 
Q
M
 
A
L
 
L
C
 
P
D
 
S
R
 
R
V
 
I
D
 
E
E
 
Q
I
 
M
-
 
L
-
 
S
-
 
Q
-
 
D
A
 
K
K
 
R
L
 
I
A
 
E
A
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
S
P
 
D
L
 
K
S
 
H
R
 
H
V
 
A
V
 
L
F
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
R
G
 
G
T
 
D
L
 
Q
Q
 
Y
G
 
P
I
 
I
A
 
A
R
 
L
E
|
E
A
 
G
A
 
A
L
 
L
K
|
K
L
 
L
L
 
K
E
|
E
L
 
I
S
 
S
A
 
Y
G
 
-
A
 
-
V
 
-
M
 
-
G
 
-
V
 
I
H
 
H
E
 
A
S
 
E
P
 
A
L
 
Y
G
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
E
F
 
L
R
 
K
H
|
H
G
 
G
P
 
P
K
 
L
S
 
A
L
 
L
I
 
I
D
 
D
K
 
A
D
 
D
S
 
M
L
 
P
V
 
V
V
 
I
V
 
V
L
 
V
C
 
A
S
 
P
S
 
N
E
 
N
P
 
E
Y
 
L
A
 
L
R
 
E
A
 
K
Y
 
L
D
 
K
M
 
S
D
 
N
M
 
I
A
 
E
A
 
E
E
 
V
L
 
R
E
 
A
R
 
R
D
 
G
G
 
G
A
 
Q
A
 
L
S
 
Y
A
 
V
L
 
F
V
 
A
R
 
D
L
 
Q
C
 
D
E
 
A
E
 
G
N
 
F
V
 
V
G
 
S
A
 
S
D
 
D
A
 
N
Q
 
M
T
 
H
L
 
I
L
 
I
-
 
E
-
 
M
-
 
P
-
 
H
-
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
V
W
 
I
L
 
A
T
 
P
F
 
I
P
 
F
Y
 
Y
I
 
T
L
 
V
Y
 
P
C
 
L
Q
 
Q
L
 
L
F
 
L
A
 
A
Y
 
Y
F
 
H
K
 
V
A
 
A
L
 
L
N
 
I
L
 
K
G
 
G
I
 
T
S
 
D
A
 
V
D
 
D
N
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>6937022 FitnessBrowser__SB2B:6937022
MQVNDLSKTKICLEFGEDALRQPPKGSQWTAEEICQQPRLWREMAEQFVQEKSRLQDFAA
PLLALPDLRVILTGAGTSAYIGEALAPFLATQMPLVGQTVEAIATTDLVSHPHLYLHPAR
PTLVISFGRSGSSPESMAAIELCDALLPRCYHLLLTCNPQGSMARYGEQQAQRACLWLMP
EGSHDRSFAMTSSFSCMYLGVLLLFAANYSALARAVTLAERMLCDRVDEIAKLAALPLSR
VVFLGGGTLQGIAREAALKLLELSAGAVMGVHESPLGFRHGPKSLIDKDSLVVVLCSSEP
YARAYDMDMAAELERDGAASALVRLCEENVGADAQTLLEDVWLTFPYILYCQLFAYFKAL
NLGISADNPCPGGQVNRVVQGVKIYPLNQYRLPGVGV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory