SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 6937211 FitnessBrowser__SB2B:6937211 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
43% identity, 99% coverage: 3:252/252 of query aligns to 5:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
E
M
 
A
A
 
A
K
 
R
D
 
V
L
 
F
A
 
M
A
 
K
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
V
L
 
I
I
 
A
D
|
D
V
x
F
D
 
N
Q
 
E
E
 
A
R
 
A
L
 
G
E
 
K
R
 
E
A
 
A
C
 
V
-
 
E
A
 
A
D
 
N
I
 
P
G
 
G
D
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
V
 
V
Q
 
V
G
 
F
Y
 
I
A
 
R
L
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
E
 
R
E
 
E
D
 
S
V
 
V
V
 
H
A
 
R
G
 
L
F
 
V
R
 
E
Y
 
N
I
 
V
L
 
A
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
V
 
K
I
 
I
H
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
|
D
G
 
S
L
 
M
L
 
L
I
 
-
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
S
R
x
K
M
 
M
S
 
T
L
 
V
D
 
D
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
Q
S
 
Q
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
H
C
 
C
G
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
V
A
 
L
A
 
P
A
 
Y
M
 
M
I
 
A
E
 
E
S
 
Q
G
 
G
Q
 
K
G
 
G
G
 
K
V
 
I
I
 
I
V
 
N
N
x
T
I
 
S
S
|
S
S
 
V
L
 
T
A
 
G
R
 
T
A
 
Y
G
 
G
N
|
N
M
x
V
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
T
 
G
M
 
M
A
 
T
V
 
K
G
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
F
 
K
N
 
G
I
 
I
R
 
N
A
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
x
F
I
x
T
A
 
E
T
|
T
E
 
A
M
|
M
T
 
V
A
 
A
A
 
E
M
 
V
K
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
V
L
 
I
E
 
E
R
x
K
L
 
M
E
 
K
K
 
A
M
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
K
A
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
T
 
A
V
 
Y
R
 
L
F
 
F
I
 
L
-
 
A
-
 
S
M
 
H
E
 
E
N
 
S
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
G
 
G
R
 
H
V
 
V
F
 
L
E
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
M
L
 
M

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
40% identity, 97% coverage: 6:250/252 of query aligns to 2:249/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
K
 
R
V
 
V
I
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
T
A
 
A
K
 
L
D
 
E
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
H
 
A
G
 
G
A
 
Y
K
 
H
L
 
V
A
 
V
L
 
A
I
 
W
D
|
D
V
x
L
D
 
A
Q
 
E
E
 
E
R
 
A
L
 
G
E
 
A
R
 
A
A
 
L
C
 
I
A
 
A
D
 
E
I
 
I
G
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
G
E
 
G
V
 
S
Q
 
A
G
 
D
Y
 
F
A
 
A
-
 
R
L
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
A
E
 
A
E
 
E
D
 
S
V
 
V
V
 
E
A
 
A
G
 
A
F
 
V
R
 
A
Y
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
A
D
 
E
F
 
H
G
 
G
V
 
R
I
 
V
H
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
L
R
 
H
D
 
D
G
 
G
L
 
Q
L
 
L
I
 
V
K
 
K
A
 
V
K
 
K
D
 
G
G
 
G
V
 
E
V
 
V
T
 
V
D
 
K
R
 
K
M
 
M
S
 
A
L
 
E
D
 
A
Q
 
Q
F
 
F
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
I
 
I
N
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
P
A
 
H
M
 
M
I
 
I
E
 
A
S
 
A
G
 
K
Q
 
Y
G
 
G
G
 
R
V
 
I
I
 
L
V
 
N
N
 
A
I
 
S
S
|
S
S
 
V
L
 
V
A
 
G
R
 
L
A
 
Y
G
 
G
N
 
N
M
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
I
T
 
G
M
 
M
A
 
T
V
 
K
G
 
V
W
 
W
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
F
 
Y
N
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
|
I
A
 
A
T
|
T
E
 
E
M
 
M
T
 
V
A
 
Q
A
 
Q
M
 
M
K
 
P
P
 
E
E
 
R
A
 
V
L
 
L
E
 
E
R
 
A
L
 
M
E
 
V
K
 
A
M
 
R
V
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
G
Q
 
D
A
 
P
E
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
R
T
 
A
V
 
Y
R
 
L
F
 
F
I
 
L
M
 
A
-
 
S
-
 
E
E
 
E
N
 
S
D
 
G
Y
 
F
V
 
I
N
 
S
G
 
G
R
 
T
V
 
T
F
 
L
E
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M

4cqmF Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
38% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 6:239/241 of 4cqmF

query
sites
4cqmF
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
C
V
 
A
I
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
A
 
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
V
A
 
A
K
 
Q
D
 
L
L
 
M
A
 
A
A
 
R
H
 
K
G
 
G
A
 
Y
K
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
I
D
x
A
V
x
R
D
x
N
Q
 
L
E
 
E
R
 
G
L
 
A
E
 
K
R
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
D
 
G
A
 
-
T
 
-
E
 
D
V
 
H
Q
 
L
G
 
A
Y
 
F
A
 
S
L
 
C
D
|
D
I
x
V
T
 
A
D
 
K
E
 
E
E
 
H
D
 
D
V
 
V
V
 
Q
A
 
N
G
 
T
F
 
F
R
 
E
Y
 
E
I
 
L
L
 
E
E
 
K
D
 
H
F
 
L
G
 
G
V
 
R
I
 
V
H
 
N
G
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
L
I
 
V
K
 
R
A
 
T
K
 
K
D
 
T
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
D
 
E
Q
 
D
F
 
M
Q
 
V
S
 
S
V
 
Q
I
 
L
N
 
H
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
L
G
 
G
T
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
G
 
C
R
 
K
E
 
A
A
 
A
A
 
M
A
 
R
A
 
T
M
 
M
I
 
I
E
 
Q
S
 
Q
G
 
-
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
L
 
I
-
 
V
A
 
G
R
 
L
A
 
K
G
 
G
N
 
N
M
 
S
G
 
G
Q
|
Q
T
 
S
N
 
V
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
V
T
 
G
M
 
F
A
 
S
V
 
R
G
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R
F
 
K
N
 
K
I
 
I
R
 
R
A
 
V
A
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
x
V
A
 
H
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
A
 
K
A
 
D
M
 
L
K
 
K
P
 
E
E
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
R
 
H
L
 
L
E
 
K
K
 
K
M
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
E
A
 
T
E
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
H
T
 
A
V
 
V
R
 
V
F
 
F
I
 
L
M
 
L
E
 
E
N
 
S
D
 
P
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
H
V
 
V
F
 
L
E
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
L
R
 
Q
L
 
L

Q8N4T8 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase beta subunit; KAR beta subunit; Carbonyl reductase family member 4; CBR4; Quinone reductase CBR4; Short chain dehydrogenase/reductase family 45C member 1; EC 1.1.1.100; EC 1.6.5.10 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
38% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 2:235/237 of Q8N4T8

query
sites
Q8N4T8
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
C
V
 
A
I
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
A
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
V
A
 
A
K
 
Q
D
 
L
L
 
M
A
 
A
A
 
R
H
 
K
G
 
G
A
 
Y
K
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
I
D
 
A
V
x
R
D
x
N
Q
 
L
E
 
E
R
 
G
L
 
A
E
 
K
R
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
G
D
 
D
I
 
L
G
 
G
D
 
G
A
 
-
T
 
-
E
 
D
V
 
H
Q
 
L
G
 
A
Y
 
F
A
 
S
L
 
C
D
|
D
I
 
V
T
 
A
D
 
K
E
 
E
E
 
H
D
 
D
V
 
V
V
 
Q
A
 
N
G
 
T
F
 
F
R
 
E
Y
 
E
I
x
L
L
 
E
E
 
K
D
 
H
F
 
L
G
 
G
V
 
R
I
 
V
H
 
N
G
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
L
I
 
V
K
 
R
A
 
T
K
 
K
D
 
T
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
D
 
E
Q
 
D
F
 
M
Q
 
V
S
 
S
V
 
Q
I
 
L
N
 
H
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
L
G
 
G
T
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
G
 
C
R
 
K
E
 
A
A
 
A
A
 
M
A
 
R
A
 
T
M
 
M
I
 
I
E
 
Q
S
 
Q
G
 
-
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
V
S
 
G
S
|
S
L
 
I
-
 
V
A
 
G
R
 
L
A
 
K
G
 
G
N
 
N
M
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
N
 
V
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
V
T
 
G
M
 
F
A
 
S
V
 
R
G
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
|
R
F
x
K
N
 
K
I
 
I
R
 
R
A
 
V
A
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
x
V
A
x
H
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
K
A
 
D
M
 
L
K
 
K
P
 
E
E
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
R
 
H
L
 
L
E
 
K
K
 
K
M
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
E
A
 
T
E
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
H
T
 
A
V
 
V
R
 
V
F
 
F
I
 
L
M
 
L
E
 
E
N
 
S
D
 
P
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
H
V
 
V
F
 
L
E
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
L
R
 
Q
L
 
L

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
38% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 2:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
E
 
K
L
 
L
K
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
x
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
L
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
A
K
 
L
D
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
E
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
-
I
 
-
D
 
-
V
 
-
D
 
-
Q
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
A
A
 
G
D
|
D
I
x
L
G
 
G
D
 
D
A
 
L
T
 
T
-
 
Y
-
 
S
-
 
H
-
 
P
E
 
N
V
 
V
Q
 
E
G
 
G
Y
 
M
A
 
Y
L
|
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
E
 
V
E
 
T
D
 
G
V
 
V
V
 
E
A
 
K
G
 
F
F
 
Y
R
 
Q
Y
 
S
I
 
V
L
 
I
E
 
D
D
 
K
F
 
Y
G
 
G
V
 
K
I
 
I
H
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
A
L
 
M
L
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
T
D
 
R
R
 
K
M
 
M
S
 
T
L
 
E
D
 
A
Q
 
Q
F
 
W
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
I
 
I
N
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
L
G
 
T
R
 
R
E
 
L
A
 
V
A
 
G
A
 
P
A
 
Q
M
 
M
I
 
Q
E
 
T
S
 
N
G
 
G
Q
 
Y
G
 
G
G
 
S
V
 
I
I
 
I
V
 
-
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
V
R
 
G
A
 
V
-
 
F
G
 
G
N
 
N
M
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
T
 
G
M
 
L
A
 
T
V
 
M
G
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
L
-
 
K
-
 
G
F
 
A
N
 
N
I
 
V
R
 
R
A
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
Y
I
|
I
A
 
M
T
|
T
E
 
D
M
 
I
T
 
L
A
 
K
A
 
T
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
D
A
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
L
 
F
E
 
A
K
 
A
M
 
L
V
 
T
P
 
M
V
 
L
G
 
N
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
A
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
K
T
 
V
V
 
A
R
 
L
F
 
F
I
 
L
M
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
S
Y
 
Y
V
 
V
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
T
F
 
I
E
 
N
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
R
 
R
L
 
L

P73826 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
39% identity, 98% coverage: 3:248/252 of query aligns to 6:236/240 of P73826

query
sites
P73826
L
 
L
K
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
N
G
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
A
A
 
A
M
 
I
A
 
V
K
 
K
D
 
L
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
H
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
F
I
 
T
D
 
D
V
 
L
D
 
A
Q
 
T
E
 
D
R
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
C
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
G
 
G
D
 
G
A
 
N
T
 
T
E
 
E
V
 
A
Q
 
L
G
 
G
Y
 
V
A
 
V
L
 
A
D
 
N
I
 
V
T
 
T
D
 
D
E
 
L
E
 
E
D
 
S
V
 
M
V
 
T
A
 
A
G
 
A
F
 
A
R
 
A
Y
 
E
I
 
I
L
 
T
E
 
D
D
 
K
F
 
L
G
 
G
V
 
P
I
 
V
H
 
Y
G
 
G
L
 
V
V
 
V
N
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
N
L
 
F
L
 
F
I
 
P
K
 
K
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
L
S
 
T
L
 
P
D
 
A
Q
 
D
F
 
W
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
I
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
V
F
 
A
L
 
Y
C
 
S
G
 
I
R
 
K
E
 
P
A
 
F
A
 
I
A
 
E
A
 
G
M
 
M
I
 
Y
E
 
E
S
 
R
G
 
-
Q
 
K
G
 
A
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
A
I
 
I
S
 
S
S
|
S
L
 
I
A
 
S
-
 
G
R
 
E
A
 
R
G
 
G
N
 
N
M
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
T
 
G
M
 
M
A
 
M
V
 
K
G
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
R
F
 
Y
N
 
G
I
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
 
I
A
 
D
T
 
T
E
 
E
M
 
M
T
 
T
A
 
L
A
 
A
M
 
I
K
 
R
P
 
E
E
 
D
A
 
I
L
 
R
E
 
E
R
 
K
L
 
I
E
 
T
K
 
K
M
 
E
V
 
I
P
 
P
V
 
F
G
 
R
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
K
A
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
W
T
 
A
V
 
V
R
 
A
F
 
F
I
 
L
M
 
L
E
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
N
 
S
D
 
S
Y
 
Y
V
 
V
N
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
L
E
 
R
I
 
V
D
 
N
G
 
G

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
40% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:237/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
M
 
L
E
 
P
L
 
L
K
 
T
D
 
D
K
 
R
V
 
I
I
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
A
K
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
N
D
 
Y
V
x
A
D
x
S
Q
x
S
-
 
A
-
 
G
E
 
A
R
 
A
L
 
D
E
 
E
R
 
V
A
 
V
C
 
A
A
 
A
D
 
I
I
 
A
G
 
A
D
 
A
A
 
G
T
 
G
E
 
E
V
 
A
Q
 
F
G
 
A
Y
 
V
A
 
K
L
x
A
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
Q
E
 
E
E
 
S
D
 
E
V
 
V
V
 
E
A
 
A
G
 
L
F
 
F
R
 
A
Y
 
A
I
 
V
L
 
I
E
 
E
D
 
R
F
 
W
G
 
G
V
 
R
I
 
L
H
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
L
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
R
M
 
M
S
 
K
L
 
R
D
 
D
Q
 
D
F
 
W
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
L
N
 
D
V
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
S
R
 
R
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
I
M
 
M
I
 
L
E
 
K
S
 
Q
G
 
-
Q
 
R
G
 
S
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
V
-
 
G
R
 
E
A
 
M
G
 
G
N
 
N
M
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
T
 
G
M
 
L
A
 
T
V
 
K
G
 
T
W
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
F
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
F
I
|
I
A
 
A
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
A
 
S
A
 
-
M
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
L
E
 
L
K
 
E
M
 
V
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
E
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
G
T
 
V
V
 
V
R
 
R
F
 
F
I
 
L
M
 
A
E
 
A
N
 
D
D
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
V
F
 
I
E
 
N
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
L

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
37% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
E
 
T
L
 
L
K
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
D
M
 
I
A
 
A
K
 
I
D
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
K
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
I
A
 
F
L
 
F
-
x
N
I
x
Y
D
x
N
V
x
G
D
x
S
Q
 
P
E
 
E
R
 
A
L
 
A
E
 
E
R
 
E
A
 
T
C
 
A
A
 
K
D
 
L
I
 
V
G
 
A
D
 
E
-
 
H
A
 
G
T
 
V
E
 
E
V
 
V
Q
 
E
G
 
A
Y
 
M
A
 
K
L
 
A
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
I
E
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
V
V
 
D
A
 
A
G
 
F
F
 
F
R
 
K
Y
 
Q
I
 
A
L
 
I
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
V
 
R
I
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
I
 
M
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
R
M
 
M
S
 
K
L
 
E
D
 
D
Q
 
E
F
 
W
Q
 
D
S
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
V
A
 
S
A
 
R
A
 
T
M
 
M
I
 
M
E
 
K
S
 
Q
G
 
R
Q
 
A
G
 
G
G
 
K
V
 
I
I
 
I
V
 
N
N
 
M
I
 
A
S
|
S
S
 
V
L
 
V
A
 
G
R
 
L
A
 
I
G
 
G
N
 
N
M
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
T
 
G
M
 
L
A
 
T
V
 
K
G
 
T
W
 
T
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
P
F
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
N
A
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
F
I
|
I
A
 
T
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
D
A
 
K
M
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
K
A
 
T
L
 
K
E
 
E
R
 
A
L
 
M
E
 
L
K
 
A
M
 
Q
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
Q
 
T
A
 
T
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
T
 
A
V
 
V
R
 
L
F
 
F
I
 
L
M
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
A
-
 
S
D
 
K
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
T
F
 
L
E
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M

1edoA The x-ray structure of beta-keto acyl carrier protein reductase from brassica napus complexed with NADP+ (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 1:244/244 of 1edoA

query
sites
1edoA
D
 
S
K
 
P
V
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
M
 
I
A
 
A
K
 
L
D
 
S
L
 
L
A
 
G
A
 
K
H
 
A
G
 
G
A
 
C
K
 
K
L
 
V
A
 
L
L
 
-
I
 
-
D
 
-
V
 
V
D
x
N
Q
x
Y
E
x
A
R
|
R
L
x
S
E
 
A
R
 
K
A
 
A
C
 
A
A
 
E
D
 
E
I
 
V
G
 
S
D
 
K
A
 
Q
T
 
I
E
 
E
V
 
A
Q
 
Y
G
 
G
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
I
-
 
T
Y
 
F
A
 
G
L
 
G
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
K
E
 
E
E
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
E
A
 
A
G
 
M
F
 
M
R
 
K
Y
 
T
I
 
A
L
 
I
E
 
D
D
 
A
F
 
W
G
 
G
V
 
T
I
 
I
H
 
D
G
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
I
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
R
M
 
M
S
 
K
L
 
K
D
 
S
Q
 
Q
F
 
W
Q
 
D
S
 
E
V
 
V
I
 
I
N
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
K
A
 
I
M
 
M
I
 
M
E
 
K
S
 
K
G
 
R
Q
 
K
G
 
G
G
 
R
V
 
I
I
 
I
V
 
N
N
 
I
I
 
A
S
|
S
S
 
V
L
 
V
A
 
G
R
 
L
A
 
I
G
 
G
N
 
N
M
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
T
 
G
M
 
F
A
 
S
V
 
K
G
 
T
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
S
F
 
R
N
 
N
I
 
I
R
 
N
A
 
V
A
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
 
F
I
|
I
A
 
A
T
x
S
E
 
D
M
|
M
T
 
T
A
 
A
A
 
K
M
 
L
K
 
G
P
 
E
E
 
D
A
 
M
L
 
E
E
 
K
R
 
K
L
 
I
E
 
L
K
 
G
M
 
T
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
P
E
 
E
E
 
N
I
 
V
A
 
A
S
 
G
T
 
L
V
 
V
R
 
E
F
 
F
I
 
L
M
 
A
E
 
L
N
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
A
D
 
S
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
A
F
 
F
E
 
T
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
A
L
 
I

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
36% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 4:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
M
 
M
E
 
K
L
 
L
K
 
A
D
 
S
K
 
K
V
 
T
I
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
F
A
 
G
M
 
I
A
 
A
K
 
Q
D
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
R
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
V
A
 
I
L
 
I
I
 
A
D
|
D
V
x
R
D
 
D
Q
 
A
E
 
H
R
 
G
L
 
-
E
 
E
R
 
A
A
 
A
C
 
A
A
 
A
D
 
S
I
 
L
G
 
R
D
 
E
A
 
S
-
 
G
T
 
A
E
 
Q
V
 
A
Q
 
L
G
 
F
Y
 
I
A
 
S
L
x
C
D
 
N
I
|
I
T
 
A
D
 
E
E
 
K
E
 
T
D
 
Q
V
 
V
V
 
E
A
 
A
G
 
L
F
 
F
R
 
S
Y
 
Q
I
 
A
L
 
E
E
 
E
D
 
A
F
 
F
G
 
G
V
 
P
I
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
A
L
 
M
L
 
L
I
 
H
K
 
K
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
L
S
 
T
L
 
E
D
 
A
Q
 
D
F
 
W
Q
 
D
S
 
T
V
 
V
I
 
I
N
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
M
R
 
Q
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
I
A
 
R
M
 
M
I
 
R
E
 
E
S
 
R
G
 
G
Q
 
-
G
 
A
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
 
S
L
 
A
A
 
S
R
 
W
A
 
L
G
 
G
N
 
N
M
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
T
 
G
M
 
M
A
 
T
V
 
K
G
 
T
W
 
A
A
 
C
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
F
 
K
N
 
G
I
 
V
R
 
T
A
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
|
I
A
 
D
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
|
T
A
 
R
A
 
G
M
 
V
K
 
P
P
 
E
E
 
N
A
 
V
L
 
W
E
 
Q
R
 
I
L
 
M
E
 
V
K
 
S
M
 
K
V
 
I
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
Y
L
 
A
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
E
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
S
 
E
T
 
C
V
 
V
R
 
A
F
 
F
I
 
L
M
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
G
-
 
A
D
 
R
Y
 
Y
V
 
I
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
N
I
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
I
 
M
R
 
V
L
 
L

1e3wD Rat brain 3-hydroxyacyl-coa dehydrogenase binary complex with nadh and 3-keto butyrate (see paper)
38% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 1:253/255 of 1e3wD

query
sites
1e3wD
E
 
S
L
 
V
K
 
K
D
 
G
K
 
L
V
 
V
I
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
x
S
G
|
G
L
|
L
G
 
G
L
 
L
A
 
S
M
 
T
A
 
A
K
 
K
D
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
G
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
A
A
 
V
L
 
L
I
 
L
D
|
D
V
|
V
D
 
P
Q
 
N
E
 
S
R
 
E
L
 
G
E
 
E
R
 
T
A
 
E
C
 
A
A
 
K
D
 
K
I
 
L
G
 
G
D
 
G
A
 
N
T
 
C
E
 
I
V
 
F
Q
 
A
G
 
-
Y
 
-
A
 
P
L
 
A
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
S
E
 
E
E
 
K
D
 
E
V
 
V
V
 
Q
A
 
A
G
 
A
F
 
L
R
 
T
Y
 
L
I
 
A
L
 
K
E
 
E
D
 
K
F
 
F
G
 
G
V
 
R
I
 
I
H
 
D
G
 
V
L
 
A
V
 
V
N
 
N
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
A
L
 
V
L
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
T
K
 
Y
D
 
H
G
 
E
V
 
K
V
 
K
T
 
N
D
 
Q
R
 
V
M
 
H
S
 
T
L
 
L
D
 
E
Q
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
|
V
N
|
N
L
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
N
C
 
V
G
 
I
R
 
R
E
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
V
M
 
M
I
 
G
E
 
Q
S
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
G
 
G
Q
 
Q
G
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
A
R
 
A
-
 
F
A
 
E
G
 
G
N
 
Q
M
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
I
A
 
V
T
 
G
M
 
M
A
 
T
V
 
L
G
 
P
W
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
P
F
 
I
N
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
V
A
 
V
A
 
T
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
x
L
I
x
F
A
 
A
T
|
T
E
 
P
M
x
L
T
 
L
A
 
T
A
x
T
M
 
L
K
 
P
P
 
D
E
 
K
A
 
V
L
 
R
E
 
N
R
 
F
L
 
L
E
 
A
K
 
S
M
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
F
-
 
P
G
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
A
 
P
E
 
A
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
S
 
H
T
 
L
V
 
V
R
 
Q
F
 
M
I
 
V
M
 
I
E
 
E
N
 
N
D
 
P
Y
 
F
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
R
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
M

O70351 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2; 17-beta-estradiol 17-dehydrogenase; 2-methyl-3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase; MHBD; 3-alpha-(17-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase (NAD(+)); 3-hydroxy-2-methylbutyryl-CoA dehydrogenase; 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II; 3alpha(or 20beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; 7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; Endoplasmic reticulum-associated amyloid beta-peptide-binding protein; Mitochondrial ribonuclease P protein 2; Mitochondrial RNase P protein 2; Short chain dehydrogenase/reductase family 5C member 1; Short-chain type dehydrogenase/reductase XH98G2; Type II HADH; EC 1.1.1.35; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.239; EC 1.1.1.178; EC 1.1.1.53; EC 1.1.1.159 from Rattus norvegicus (Rat) (see paper)
38% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 7:259/261 of O70351

query
sites
O70351
E
 
S
L
 
V
K
 
K
D
 
G
K
 
L
V
 
V
I
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
S
M
 
T
A
 
A
K
 
K
D
 
R
L
 
L
A
 
V
A
 
G
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
A
A
 
V
L
 
L
I
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
P
Q
 
N
E
 
S
R
 
E
L
 
G
E
 
E
R
 
T
A
 
E
C
 
A
A
 
K
D
 
K
I
 
L
G
 
G
D
 
G
A
 
N
T
 
C
E
 
I
V
 
F
Q
 
A
G
 
-
Y
 
-
A
 
P
L
 
A
D
 
N
I
 
V
T
 
T
D
 
S
E
 
E
E
 
K
D
 
E
V
 
V
V
 
Q
A
 
A
G
 
A
F
 
L
R
 
T
Y
 
L
I
 
A
L
 
K
E
 
E
D
 
K
F
 
F
G
 
G
V
 
R
I
 
I
H
 
D
G
 
V
L
 
A
V
 
V
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
A
L
 
V
L
 
A
I
 
I
K
 
K
A
 
T
K
 
Y
D
 
H
G
 
E
V
 
K
V
 
K
T
 
N
D
 
Q
R
 
V
M
 
H
S
 
T
L
 
L
D
 
E
Q
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
N
C
 
V
G
 
I
R
 
R
E
 
L
A
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
V
M
 
M
I
 
G
E
 
Q
S
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
G
 
G
Q
 
Q
G
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
T
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
A
R
 
A
-
 
F
A
 
E
G
 
G
N
 
Q
M
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
G
G
 
G
V
 
I
A
 
V
T
 
G
M
 
M
A
 
T
V
 
L
G
 
P
W
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
P
F
 
I
N
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
V
A
 
V
A
 
T
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
L
I
 
F
A
 
A
T
 
T
E
 
P
M
 
L
T
 
L
A
 
T
A
 
T
M
 
L
K
 
P
P
 
D
E
 
K
A
 
V
L
 
R
E
 
N
R
 
F
L
 
L
E
 
A
K
 
S
M
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
F
-
 
P
G
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
A
 
P
E
 
A
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
S
 
H
T
 
L
V
 
V
R
 
Q
F
 
M
I
 
V
M
 
I
E
 
E
N
 
N
D
 
P
Y
 
F
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
R
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
M

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
38% identity, 98% coverage: 3:250/252 of query aligns to 4:244/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
K
 
T
D
 
A
K
 
Q
V
 
V
I
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
x
A
A
 
S
G
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
M
 
T
A
 
A
K
 
L
D
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
H
 
T
G
 
G
A
 
M
K
 
K
L
 
V
A
 
-
L
 
V
I
 
V
D
 
N
V
 
Y
D
 
A
Q
 
Q
E
 
S
R
 
S
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
V
L
 
V
E
 
A
R
 
E
A
 
I
C
 
I
A
 
A
D
 
N
I
 
G
G
 
G
D
 
E
A
 
A
T
 
I
E
 
A
V
 
V
Q
 
Q
G
 
A
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
D
 
N
I
 
V
T
 
A
D
 
N
E
 
A
E
 
D
D
 
E
V
 
V
V
 
D
A
 
Q
G
 
L
F
 
I
R
 
K
Y
 
T
I
 
T
L
 
L
E
 
D
D
 
K
F
 
F
G
 
S
V
 
R
I
 
I
H
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
L
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
R
M
 
M
S
 
K
L
 
L
D
 
E
Q
 
D
F
 
W
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
I
 
I
N
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
V
A
 
S
A
 
K
A
 
L
M
 
M
I
 
L
E
 
K
S
 
Q
G
 
-
Q
 
K
G
 
S
G
 
G
V
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
T
S
 
S
L
 
V
A
 
A
-
 
G
R
 
M
A
 
M
G
 
G
N
 
N
M
x
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
T
 
G
M
 
F
A
 
T
V
 
K
G
 
T
W
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
F
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
T
A
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
x
F
I
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
E
A
 
N
M
 
L
K
x
N
P
 
A
E
 
E
A
 
P
L
 
I
E
 
L
R
 
Q
L
 
F
E
 
-
K
 
-
M
 
-
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
A
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
S
 
G
T
 
T
V
 
I
R
 
R
F
 
F
I
 
L
M
 
A
E
 
T
N
 
D
D
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
T
F
 
F
E
 
N
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
I
 
M

4cqmA Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
34% identity, 99% coverage: 2:250/252 of query aligns to 3:246/248 of 4cqmA

query
sites
4cqmA
E
 
R
L
 
L
K
 
R
D
 
S
K
 
A
V
 
L
I
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
G
G
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
V
A
 
S
K
 
V
D
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
G
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
I
 
C
D
|
D
V
x
L
D
 
D
Q
 
R
E
 
A
R
 
A
L
 
A
E
 
Q
R
 
E
A
 
T
C
 
V
A
 
R
D
 
L
I
 
L
G
 
P
D
 
P
A
 
R
T
 
G
E
 
N
V
 
H
Q
 
A
G
 
A
Y
 
F
A
 
Q
L
x
A
D
 
D
I
x
V
T
 
S
D
 
E
E
 
A
E
 
R
D
 
-
V
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
A
F
 
A
R
 
R
Y
 
C
I
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
F
 
V
G
 
Q
V
 
A
I
 
C
H
 
F
G
 
S
-
 
R
-
 
P
-
 
P
-
 
S
-
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
Q
D
 
D
G
 
E
L
 
F
L
 
L
I
 
L
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
H
M
 
M
S
 
S
L
 
E
D
 
D
Q
 
D
F
 
W
Q
 
D
S
 
K
V
 
V
I
 
I
N
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
V
G
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
V
E
 
S
S
 
N
G
 
G
Q
 
C
G
 
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
L
 
I
A
 
V
-
 
G
R
 
K
A
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
T
 
G
M
 
L
A
 
T
V
 
Q
G
 
T
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
F
 
H
N
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
A
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
F
I
|
I
A
 
A
T
|
T
E
x
P
M
|
M
T
|
T
A
 
Q
A
 
K
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
V
E
 
D
R
 
K
L
 
I
E
 
T
K
 
E
M
 
M
V
 
I
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
A
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
D
T
 
V
V
 
V
R
 
A
F
 
F
I
 
L
M
 
A
E
 
S
N
 
E
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
T
V
 
S
F
 
V
E
 
E
I
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
L

4cqlI Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD (see paper)
35% identity, 98% coverage: 3:250/252 of query aligns to 6:249/251 of 4cqlI

query
sites
4cqlI
L
 
L
K
 
R
D
 
S
K
 
A
V
 
L
I
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
G
G
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
V
A
 
S
K
 
V
D
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
G
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
I
 
C
D
|
D
V
x
L
D
 
D
Q
 
R
E
 
A
R
 
A
L
 
A
E
 
Q
R
 
E
A
 
T
C
 
V
A
 
R
D
 
L
I
 
L
G
 
G
-
 
G
D
 
P
A
 
G
T
 
S
E
 
N
V
 
H
Q
 
A
G
 
A
Y
 
F
A
 
Q
L
x
A
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
E
E
 
A
E
 
R
D
 
A
V
 
A
V
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
R
 
R
Y
 
C
I
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
F
 
V
G
 
Q
V
 
A
I
 
C
H
 
F
G
 
S
-
 
R
-
 
P
-
 
P
-
 
S
-
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
Q
D
 
D
G
 
E
L
 
F
L
 
L
I
 
L
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
H
M
 
M
S
 
S
L
 
E
D
 
D
Q
 
D
F
 
W
Q
 
D
S
 
K
V
 
V
I
 
I
N
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
V
G
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
V
E
 
S
S
 
N
G
 
G
Q
 
C
G
 
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
L
 
I
-
 
V
A
 
G
R
 
K
A
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
T
 
G
M
 
L
A
 
T
V
 
Q
G
 
T
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
F
 
H
N
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
A
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
F
I
|
I
A
 
A
T
|
T
E
 
P
M
|
M
T
 
T
A
 
Q
A
 
K
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
V
E
 
D
R
 
K
L
 
I
E
 
T
K
 
E
M
 
M
V
 
I
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
A
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
D
T
 
V
V
 
V
R
 
A
F
 
F
I
 
L
M
 
A
E
 
S
N
 
E
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
T
V
 
S
F
 
V
E
 
E
I
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
L

O18404 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 10; 17-beta-HSD 10; 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II; Hydroxysteroid dehydrogenase; Mitochondrial ribonuclease P protein 2; Mitochondrial RNase P protein 2; Scully protein; Type II HADH; EC 1.1.1.35; EC 1.1.1.51; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.53 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see paper)
37% identity, 99% coverage: 3:252/252 of query aligns to 2:253/255 of O18404

query
sites
O18404
L
 
I
K
 
K
D
 
N
K
 
A
V
 
V
I
 
S
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
T
A
 
A
K
 
E
D
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
K
H
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
S
L
 
V
A
 
I
L
|
L
I
 
A
D
 
D
V
 
L
D
 
P
Q
 
S
E
 
S
R
 
K
L
 
G
E
 
N
R
 
E
A
 
V
C
 
A
A
 
K
D
 
E
I
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
-
T
 
-
E
 
K
V
 
V
Q
 
V
G
 
F
Y
 
V
A
 
P
L
 
V
D
 
D
I
 
V
T
 
T
D
 
S
E
 
E
E
 
K
D
 
D
V
 
V
V
 
S
A
 
A
G
 
A
F
 
L
R
 
Q
Y
 
T
I
 
A
L
 
K
E
 
D
D
 
K
F
 
F
G
 
G
V
 
R
I
 
L
H
 
D
G
 
L
L
 
T
V
 
V
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
T
L
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
A
L
 
T
L
 
A
I
 
V
K
 
K
A
 
T
K
 
F
D
 
N
G
 
F
V
 
N
V
 
K
T
 
N
D
 
V
R
 
A
M
 
H
S
 
R
L
 
L
D
 
E
Q
 
D
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
V
 
V
I
 
I
N
 
N
V
 
I
N
 
N
L
 
T
T
 
V
G
 
G
T
 
T
F
|
F
L
 
N
C
 
V
G
 
I
R
 
R
E
 
L
A
 
S
A
 
A
A
 
G
A
 
L
M
 
M
-
 
G
-
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
P
I
 
N
E
 
Q
S
 
D
G
 
G
Q
 
Q
G
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
T
S
 
A
S
 
S
L
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
F
-
 
D
G
 
G
N
 
Q
M
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
A
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
G
 
A
V
 
V
A
 
V
T
 
G
M
 
M
A
 
T
V
 
L
G
 
P
W
 
I
A
 
A
K
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
S
R
 
T
F
 
Q
N
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
I
A
 
C
A
 
T
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
L
I
 
F
A
 
N
T
 
T
E
 
P
M
 
M
T
 
L
A
 
A
A
 
A
M
 
L
K
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
V
L
 
R
E
 
T
R
 
F
L
 
L
E
 
A
K
 
K
M
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
F
G
 
P
-
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
E
A
 
P
E
 
S
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
S
 
H
T
 
L
V
 
V
R
 
Q
F
 
A
I
 
I
M
 
Y
E
 
E
N
 
N
D
 
P
Y
 
L
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
A
I
 
L
R
 
R
L
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
36% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 4:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
E
 
N
L
 
L
K
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
G
x
R
G
 
G
L
x
I
G
 
G
L
 
K
A
 
A
M
 
I
A
 
A
K
 
E
D
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
-
L
 
I
I
 
G
D
 
T
V
 
A
D
x
T
Q
 
S
E
 
E
R
 
S
L
 
G
E
 
A
R
 
Q
A
 
A
C
 
I
A
 
S
D
 
D
-
 
Y
I
 
L
G
 
G
D
 
D
A
 
-
T
 
-
E
 
N
V
 
G
Q
 
K
G
 
G
Y
 
M
A
 
A
L
 
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
N
E
 
P
E
 
E
D
 
S
V
 
I
V
 
E
A
 
A
G
 
V
F
 
L
R
 
K
Y
 
A
I
 
I
L
 
T
E
 
D
D
 
E
F
 
F
G
 
G
V
 
G
I
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
I
 
M
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
R
M
 
M
S
 
K
L
 
E
D
 
E
Q
 
E
F
 
W
Q
 
S
S
 
D
V
 
I
I
 
M
N
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
T
 
I
F
 
F
L
 
R
C
 
L
G
 
S
R
 
K
E
 
A
A
 
V
A
 
L
A
 
R
A
 
G
M
 
M
I
 
M
E
 
K
S
 
K
G
 
R
Q
 
Q
G
 
G
G
 
R
V
 
I
I
 
I
V
 
N
N
x
V
I
 
G
S
|
S
S
 
V
L
 
V
A
 
G
R
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
M
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
T
 
G
M
 
F
A
 
T
V
 
K
G
 
S
W
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
F
 
R
N
 
G
I
 
V
R
 
T
A
 
V
A
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
F
I
|
I
A
 
E
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
A
 
K
A
 
A
M
 
L
K
 
N
P
 
D
E
 
E
A
 
Q
L
 
R
E
 
T
R
 
A
L
 
T
E
 
L
K
 
A
M
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
A
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
A
V
 
V
R
 
A
F
 
F
I
 
L
M
 
A
-
 
S
-
 
P
E
 
E
N
 
A
D
 
A
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
E
V
 
T
F
 
L
E
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
R
 
Y
L
 
M

Q92506 (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 8; 17-beta-HSD 8; HSD17B8; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase alpha subunit; KAR alpha subunit; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; Estradiol 17-beta-dehydrogenase 8; Protein Ke6; Ke6; Short chain dehydrogenase/reductase family 30C member 1; Testosterone 17-beta-dehydrogenase 8; EC 1.1.1.n12; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.239 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
34% identity, 98% coverage: 3:250/252 of query aligns to 9:259/261 of Q92506

query
sites
Q92506
L
 
L
K
 
R
D
 
S
K
 
A
V
 
L
I
 
A
V
x
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
G
x
A
A
x
G
G
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
V
A
 
S
K
 
V
D
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
G
H
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
I
 
C
D
|
D
V
x
L
D
 
D
Q
 
R
E
 
A
R
 
A
L
 
A
E
 
Q
R
 
E
A
 
T
C
 
V
A
 
R
D
 
L
I
 
L
G
 
G
D
 
G
A
 
P
T
 
G
E
 
S
V
 
K
Q
 
E
G
 
G
-
 
P
-
 
P
-
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
H
-
 
A
-
 
A
Y
 
F
A
 
Q
L
x
A
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
E
E
 
A
E
 
R
D
 
A
V
 
A
V
 
-
A
 
-
G
 
-
F
 
-
R
 
R
Y
 
C
I
 
L
L
 
L
E
 
E
D
 
Q
F
 
V
G
 
Q
V
 
A
I
 
C
H
 
F
G
 
S
-
 
R
-
 
P
-
 
P
-
 
S
-
 
V
L
 
V
V
 
V
N
 
S
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
Q
D
 
D
G
 
E
L
 
F
L
 
L
I
 
L
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
H
M
 
M
S
 
S
L
 
E
D
 
D
Q
 
D
F
 
W
Q
 
D
S
 
K
V
 
V
I
 
I
N
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
V
G
 
T
R
 
Q
E
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
M
 
L
I
 
V
E
 
S
S
 
N
G
 
G
Q
 
C
G
x
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
 
S
L
 
I
-
x
V
A
 
G
R
 
K
A
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
A
|
A
A
|
A
S
|
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
T
 
G
M
 
L
A
 
T
V
 
Q
G
 
T
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
|
R
F
 
H
N
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
C
A
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
|
I
A
|
A
T
|
T
E
 
P
M
 
M
T
 
T
A
 
Q
A
 
K
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
V
E
 
D
R
 
K
L
 
I
E
 
T
K
 
E
M
 
M
V
 
I
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
H
L
 
L
G
 
G
Q
 
D
A
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
S
 
D
T
 
V
V
 
V
R
 
A
F
 
F
I
 
L
M
 
A
E
 
S
N
 
E
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
T
V
 
S
F
 
V
E
 
E
I
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
I
 
L

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
35% identity, 98% coverage: 6:252/252 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
V
 
S
I
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
S
G
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
L
 
R
A
 
S
M
 
I
A
 
A
K
 
L
D
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
E
G
 
G
A
 
Y
K
 
N
L
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
N
D
 
Y
V
 
A
D
 
G
Q
 
S
E
 
K
R
 
E
L
 
K
E
 
A
R
 
E
A
 
A
C
 
V
A
 
V
D
 
E
I
 
E
G
 
I
D
 
K
A
 
A
T
 
K
E
 
G
V
 
V
Q
 
D
G
 
S
Y
 
F
A
 
A
L
 
I
-
 
Q
-
 
A
D
 
N
I
 
V
T
 
A
D
 
D
E
 
A
E
 
D
D
 
E
V
 
V
V
 
K
A
 
A
G
 
M
F
 
I
R
 
K
Y
 
E
I
 
V
L
 
V
E
 
S
D
 
Q
F
 
F
G
 
G
V
 
S
I
 
L
H
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
I
 
M
K
 
-
A
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
R
M
 
M
S
 
K
L
 
E
D
 
Q
Q
 
E
F
 
W
Q
 
D
S
 
D
V
 
V
I
 
I
N
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
T
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
G
 
I
R
 
Q
E
 
K
A
 
A
A
 
T
A
 
P
A
 
Q
M
 
M
I
 
L
E
 
R
S
 
Q
G
 
-
Q
 
R
G
 
S
G
 
G
V
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
L
 
V
A
 
V
R
 
G
A
 
A
-
 
V
G
 
G
N
 
N
M
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
T
 
G
M
 
L
A
 
T
V
 
K
G
 
S
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
F
 
R
N
 
G
I
 
I
R
 
T
A
 
V
A
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
F
I
 
I
A
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
T
 
T
A
 
D
A
 
A
M
 
L
K
 
S
P
 
D
E
 
E
A
 
L
L
 
K
E
 
E
R
 
Q
L
 
M
E
 
L
K
 
T
M
 
Q
V
 
I
P
 
P
V
 
L
G
 
A
R
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
Q
A
 
D
E
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
S
 
N
T
 
T
V
 
V
R
 
A
F
 
F
I
 
L
M
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
K
-
 
A
D
 
K
Y
 
Y
V
 
I
N
 
T
G
 
G
R
 
Q
V
 
T
F
 
I
E
 
H
I
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
I
 
M
R
 
Y
L
 
M

4o5oB X-ray crystal structure of a 3-hydroxyacyl-coa dehydrogenase from brucella suis
39% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 7:258/261 of 4o5oB

query
sites
4o5oB
M
 
M
E
 
Q
L
 
I
K
 
E
D
 
N
K
 
R
V
 
V
I
 
F
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
G
G
 
S
G
|
G
L
 
L
G
 
G
L
 
A
A
 
A
M
 
V
A
 
S
K
 
K
D
 
M
L
 
A
A
 
V
A
 
E
H
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
V
L
 
L
I
 
L
D
 
D
V
 
V
D
 
N
Q
 
A
E
 
E
R
 
A
L
 
G
E
 
E
R
 
A
A
 
G
C
 
A
A
 
K
D
 
A
I
 
L
G
 
G
D
 
A
A
 
S
T
 
A
E
 
R
V
 
F
Q
 
Q
G
 
-
Y
 
-
A
 
R
L
 
T
D
 
D
I
 
V
T
 
A
D
 
S
E
 
D
E
 
T
D
 
D
V
 
G
V
 
K
A
 
A
G
 
A
F
 
I
R
 
A
Y
 
A
I
 
A
L
 
I
E
 
E
D
 
A
F
 
F
G
 
G
V
 
R
I
 
I
H
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
V
L
 
A
R
 
-
D
 
P
G
 
G
L
 
E
L
 
K
I
 
V
K
 
L
A
 
G
K
 
R
D
 
E
G
 
G
V
 
A
V
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
-
M
 
H
S
 
K
L
 
L
D
 
E
Q
 
T
F
 
F
Q
 
T
S
 
R
V
 
T
I
 
I
N
 
S
V
 
I
N
|
N
L
 
L
T
 
I
G
 
G
T
 
T
F
 
F
L
 
N
C
 
M
G
 
L
R
 
R
E
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A
M
 
M
I
 
A
-
 
K
-
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
G
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
-
 
E
-
 
R
-
 
G
V
 
V
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
A
S
|
S
L
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
F
-
 
D
G
 
G
N
 
Q
M
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
A
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
A
T
 
A
M
 
M
A
 
T
V
 
L
G
 
P
W
 
V
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
F
 
H
N
 
G
I
 
I
R
 
R
A
 
V
A
 
M
A
 
T
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
I
I
 
F
A
x
K
T
 
T
E
 
P
M
 
M
T
 
M
A
 
A
A
 
G
M
 
M
K
 
P
P
 
Q
E
 
E
A
 
V
L
 
Q
E
 
D
R
 
A
L
 
L
E
 
G
K
 
A
M
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
F
-
 
P
G
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
E
A
 
P
E
 
A
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
S
 
A
T
 
L
V
 
V
R
 
H
F
 
H
I
 
I
M
 
V
E
 
E
N
 
N
D
 
Q
Y
 
M
V
 
L
N
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
V
F
 
I
E
 
R
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
I
 
L
R
 
R
L
 
M

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>6937211 FitnessBrowser__SB2B:6937211
MELKDKVIVITGGAGGLGLAMAKDLAAHGAKLALIDVDQERLERACADIGDATEVQGYAL
DITDEEDVVAGFRYILEDFGVIHGLVNNAGILRDGLLIKAKDGVVTDRMSLDQFQSVINV
NLTGTFLCGREAAAAMIESGQGGVIVNISSLARAGNMGQTNYAASKAGVATMAVGWAKEL
ARFNIRAAAVAPGVIATEMTAAMKPEALERLEKMVPVGRLGQAEEIASTVRFIMENDYVN
GRVFEIDGGIRL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory