SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 6937316 FitnessBrowser__SB2B:6937316 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5xu1B Structure of a non-canonical abc transporter from streptococcus pneumoniae r6 (see paper)
43% identity, 89% coverage: 7:227/249 of query aligns to 4:225/226 of 5xu1B

query
sites
5xu1B
I
 
I
K
 
S
V
 
L
V
 
K
H
 
N
L
 
I
K
 
F
K
 
R
K
 
S
V
 
Y
Q
 
R
T
 
N
Q
 
G
E
 
D
G
 
Q
E
 
E
L
 
L
T
 
Q
I
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
N
V
 
I
D
 
N
M
 
L
E
 
E
V
 
V
K
 
N
P
 
E
G
 
G
E
 
E
S
 
F
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
L
 
M
G
 
N
L
 
T
L
 
I
A
 
G
A
 
M
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
W
 
Y
L
 
L
D
 
E
G
 
G
S
 
Q
A
 
E
L
 
V
S
 
A
N
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
E
E
 
K
A
 
Q
K
 
L
A
 
A
A
 
K
L
 
V
R
 
R
K
 
N
K
 
Q
K
 
Q
I
 
I
S
 
G
F
 
F
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
Q
F
 
F
M
 
F
L
 
L
V
 
L
D
 
S
T
 
K
L
 
L
T
 
N
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
N
 
N
V
 
V
M
 
E
L
 
L
P
 
P
A
 
L
E
 
I
L
 
Y
A
 
A
G
 
G
M
 
V
K
 
S
D
 
S
A
 
S
K
 
K
A
 
R
K
 
R
-
 
K
-
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
E
M
 
Y
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
E
L
 
L
S
 
T
H
 
E
R
 
R
V
 
S
N
 
H
H
 
H
L
 
L
P
 
P
K
 
S
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
I
 
V
C
 
N
E
 
N
P
 
P
K
 
S
V
 
I
L
 
I
F
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
T
G
 
K
N
 
T
A
 
G
H
 
N
K
 
Q
V
 
I
A
 
M
D
 
Q
M
 
L
L
 
L
F
 
V
A
 
D
L
 
L
N
 
N
A
 
K
E
 
E
L
 
-
G
 
G
T
 
K
T
 
T
L
 
I
V
 
I
L
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
N
 
P
Q
 
E
L
 
I
A
 
A
L
 
A
R
 
Y
C
 
A
Q
 
K
R
 
R
Q
 
Q
F
 
I
T
 
V
M
 
I
T
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
V
L
 
I
A
 
S
E
 
S
T
 
D
T
 
S
A
 
A

7arlD Lolcde in complex with lipoprotein and adp (see paper)
48% identity, 85% coverage: 11:222/249 of query aligns to 7:220/222 of 7arlD

query
sites
7arlD
H
 
N
L
 
L
K
 
C
K
 
K
K
 
R
V
 
Y
Q
 
Q
T
 
E
Q
 
G
E
 
S
G
 
V
E
 
Q
L
 
T
T
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
H
G
 
N
V
 
V
D
 
S
M
 
F
E
 
S
V
 
V
K
 
G
P
 
E
G
 
G
E
 
E
S
 
M
V
 
M
A
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
S
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
D
I
 
V
W
 
I
L
 
F
D
 
N
G
 
G
S
 
Q
A
 
P
L
 
M
S
 
S
N
 
K
L
 
L
G
 
S
E
 
S
E
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
R
K
 
N
K
 
Q
K
 
K
I
 
L
S
 
G
F
 
F
I
 
I
F
 
Y
Q
 
Q
S
 
F
F
 
H
M
 
H
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
D
L
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
M
P
 
P
A
 
L
E
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
K
M
 
K
K
 
K
D
 
P
A
 
A
K
 
E
A
 
I
K
 
N
A
 
S
E
 
R
A
 
A
-
 
L
-
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
K
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
D
H
 
H
R
 
R
V
 
A
N
 
N
H
 
H
L
 
R
P
 
P
K
 
S
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
I
 
V
C
 
N
E
 
N
P
 
P
K
 
R
V
 
L
L
 
V
F
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
H
 
D
K
 
S
V
 
I
A
 
F
D
 
Q
M
 
L
L
 
L
F
 
G
A
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
R
E
 
L
L
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
A
L
 
F
V
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
N
 
L
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
K
R
 
R
C
 
M
Q
 
S
R
 
R
Q
 
Q
F
 
L
T
 
E
M
 
M
T
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
R
L
 
L

P75957 Lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
48% identity, 85% coverage: 11:222/249 of query aligns to 10:223/233 of P75957

query
sites
P75957
H
 
N
L
 
L
K
 
C
K
 
K
K
 
R
V
 
Y
Q
 
Q
T
 
E
Q
 
G
E
 
S
G
 
V
E
 
Q
L
 
T
T
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
H
G
 
N
V
 
V
D
 
S
M
 
F
E
 
S
V
 
V
K
 
G
P
 
E
G
 
G
E
 
E
S
 
M
V
 
M
A
 
A
I
 
I
I
 
V
G
|
G
P
 
S
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
D
I
 
V
W
 
I
L
 
F
D
 
N
G
 
G
S
 
Q
A
 
P
L
 
M
S
 
S
N
 
K
L
 
L
G
 
S
E
 
S
E
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
R
K
 
N
K
 
Q
K
 
K
I
 
L
S
 
G
F
 
F
I
 
I
F
 
Y
Q
 
Q
S
 
F
F
 
H
M
 
H
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
D
L
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
M
P
 
P
A
 
L
E
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
K
M
 
K
K
 
K
D
 
P
A
 
A
K
 
E
A
 
I
K
 
N
A
 
S
E
 
R
A
 
A
-
 
L
-
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
K
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
D
H
 
H
R
 
R
V
 
A
N
 
N
H
 
H
L
 
R
P
 
P
K
 
S
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
I
 
V
C
 
N
E
 
N
P
 
P
K
 
R
V
 
L
L
 
V
F
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
H
 
D
K
 
S
V
 
I
A
 
F
D
 
Q
M
 
L
L
 
L
F
 
G
A
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
R
E
 
L
L
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
A
L
 
F
V
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
N
 
L
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
K
R
 
R
C
 
M
Q
 
S
R
 
R
Q
 
Q
F
 
L
T
 
E
M
 
M
T
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
R
L
 
L

7mdyC Lolcde nucleotide-bound
48% identity, 85% coverage: 11:222/249 of query aligns to 7:220/226 of 7mdyC

query
sites
7mdyC
H
 
N
L
 
L
K
 
C
K
 
K
K
 
R
V
x
Y
Q
 
Q
T
 
E
Q
 
G
E
 
S
G
 
V
E
 
Q
L
 
T
T
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
H
G
 
N
V
 
V
D
 
S
M
 
F
E
 
S
V
 
V
K
 
G
P
 
E
G
 
G
E
 
E
S
 
M
V
 
M
A
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
S
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
G
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
D
I
 
V
W
 
I
L
 
F
D
 
N
G
 
G
S
 
Q
A
 
P
L
 
M
S
 
S
N
 
K
L
 
L
G
 
S
E
 
S
E
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
R
K
 
N
K
 
Q
K
 
K
I
 
L
S
 
G
F
 
F
I
 
I
F
 
Y
Q
|
Q
S
 
F
F
 
H
M
 
H
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
D
L
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
M
P
 
P
A
 
L
E
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
K
M
 
K
K
 
K
D
 
P
A
 
A
K
 
E
A
 
I
K
 
N
A
 
S
E
 
R
A
 
A
-
 
L
-
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
K
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
D
H
 
H
R
 
R
V
 
A
N
 
N
H
|
H
L
 
R
P
 
P
K
 
S
Q
x
E
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
I
 
V
C
 
N
E
 
N
P
 
P
K
 
R
V
 
L
L
 
V
F
 
L
A
 
A
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
|
N
L
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
H
 
D
K
 
S
V
 
I
A
 
F
D
 
Q
M
 
L
L
 
L
F
 
G
A
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
R
E
 
L
L
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
A
L
 
F
V
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
N
 
L
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
K
R
 
R
C
 
M
Q
 
S
R
 
R
Q
 
Q
F
 
L
T
 
E
M
 
M
T
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
R
L
 
L

7v8iD Lolcd(e171q)e with bound amppnp in nanodiscs (see paper)
48% identity, 85% coverage: 11:222/249 of query aligns to 9:222/229 of 7v8iD

query
sites
7v8iD
H
 
N
L
 
L
K
 
C
K
 
K
K
 
R
V
 
Y
Q
 
Q
T
 
E
Q
 
G
E
 
S
G
 
V
E
 
Q
L
 
T
T
 
D
I
x
V
L
 
L
K
 
H
G
 
N
V
 
V
D
 
S
M
 
F
E
 
S
V
 
V
K
 
G
P
 
E
G
 
G
E
 
E
S
 
M
V
 
M
A
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
S
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
G
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
G
A
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
D
I
 
V
W
 
I
L
 
F
D
 
N
G
 
G
S
 
Q
A
 
P
L
 
M
S
 
S
N
 
K
L
 
L
G
 
S
E
 
S
E
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
R
K
 
N
K
 
Q
K
 
K
I
 
L
S
 
G
F
 
F
I
 
I
F
 
Y
Q
|
Q
S
 
F
F
 
H
M
 
H
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
D
L
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
M
P
 
P
A
 
L
E
 
L
L
 
I
A
 
G
G
 
K
M
 
K
K
 
K
D
 
P
A
 
A
K
 
E
A
 
I
K
 
N
A
 
S
E
 
R
A
 
A
-
 
L
-
 
E
M
 
M
L
 
L
E
 
K
R
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
D
H
 
H
R
|
R
V
 
A
N
 
N
H
|
H
L
 
R
P
 
P
K
 
S
Q
x
E
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
|
E
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
I
 
V
C
 
N
E
 
N
P
 
P
K
 
R
V
 
L
L
 
V
F
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
R
N
 
N
A
 
A
H
 
D
K
 
S
V
 
I
A
 
F
D
 
Q
M
 
L
L
 
L
F
 
G
A
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
R
E
 
L
L
 
Q
G
 
G
T
 
T
T
 
A
L
 
F
V
 
L
L
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
N
 
L
Q
 
Q
L
 
L
A
 
A
L
 
K
R
 
R
C
 
M
Q
 
S
R
 
R
Q
 
Q
F
 
L
T
 
E
M
 
M
T
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
R
L
 
L

2pclA Crystal structure of abc transporter with complex (aq_297) from aquifex aeolicus vf5
47% identity, 86% coverage: 11:223/249 of query aligns to 8:217/223 of 2pclA

query
sites
2pclA
H
 
N
L
 
I
K
 
K
K
 
K
K
 
V
V
 
I
Q
 
R
T
 
G
Q
 
Y
E
 
E
G
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
I
 
I
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
S
M
 
L
E
 
S
V
 
V
K
 
K
P
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
F
V
 
V
A
 
S
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
Y
L
 
I
L
 
L
A
 
G
A
 
L
L
 
L
D
 
D
T
 
A
P
 
P
S
 
T
E
 
E
G
 
G
E
 
K
I
 
V
W
 
F
L
 
L
D
 
E
G
 
G
S
 
K
A
 
E
L
 
V
S
 
D
N
 
Y
L
 
T
G
 
N
E
 
E
E
 
K
A
 
E
K
 
L
A
 
S
A
 
L
L
 
L
R
 
R
K
 
N
K
 
R
K
 
K
I
 
L
S
 
G
F
 
F
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
F
F
 
H
M
 
Y
L
 
L
V
 
I
D
 
P
T
 
E
L
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
I
L
 
V
P
 
P
A
 
M
E
 
L
L
 
K
A
 
M
G
 
G
-
 
K
-
 
P
M
 
K
K
 
K
D
 
E
A
 
A
K
 
K
A
 
E
K
 
R
A
 
G
E
 
E
A
 
Y
M
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
G
H
 
D
R
 
K
V
 
L
N
 
S
H
 
R
L
 
K
P
 
P
K
 
Y
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
I
 
A
C
 
N
E
 
E
P
 
P
K
 
I
V
 
L
L
 
L
F
 
F
A
 
A
D
 
D
E
|
E
P
|
P
T
|
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
S
G
 
A
N
 
N
A
 
T
H
 
K
K
 
R
V
 
V
A
 
M
D
 
D
M
 
I
L
 
F
F
 
L
A
 
K
L
 
I
N
 
N
A
 
-
E
 
E
L
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
S
L
 
I
V
 
V
L
 
M
V
 
V
T
|
T
H
 
H
D
 
E
N
 
R
Q
 
E
L
 
L
A
 
A
L
 
E
R
 
L
C
 
T
Q
 
H
R
 
R
Q
 
T
F
 
L
T
 
E
M
 
M
T
 
K
E
 
D
G
 
G
E
 
K
L
 
V
A
 
V

1f3oA Crystal structure of mj0796 atp-binding cassette (see paper)
42% identity, 87% coverage: 7:222/249 of query aligns to 2:223/232 of 1f3oA

query
sites
1f3oA
I
 
I
K
 
K
V
 
L
V
 
K
H
 
N
L
 
V
K
 
T
K
 
K
K
 
T
V
x
Y
Q
 
K
T
 
M
Q
 
G
E
 
E
G
 
E
E
 
I
L
 
I
T
 
Y
I
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
N
V
 
V
D
 
N
M
 
L
E
 
N
V
 
I
K
 
K
P
 
E
G
 
G
E
 
E
S
 
F
V
 
V
A
 
S
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
M
L
 
L
G
 
N
L
 
I
L
 
I
A
 
G
A
 
C
L
 
L
D
 
D
T
 
K
P
 
P
S
 
T
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
W
 
Y
L
 
I
D
 
D
G
 
N
S
 
I
A
 
K
L
 
T
S
 
N
N
 
D
L
 
L
G
 
D
E
 
D
E
 
D
A
 
E
K
 
L
A
 
T
A
 
K
L
 
I
R
 
R
K
 
R
K
 
D
K
 
K
I
 
I
S
 
G
F
 
F
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
Q
F
 
F
M
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
P
T
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
E
L
 
L
P
 
P
-
 
L
-
 
I
-
 
F
-
 
K
-
 
Y
-
 
R
A
 
G
E
 
A
L
 
M
A
 
S
G
 
G
M
 
-
K
 
E
D
 
E
A
 
R
K
 
R
A
 
K
K
 
R
A
 
A
E
 
L
A
 
E
M
 
C
L
 
L
E
 
K
R
 
M
V
 
A
G
 
E
L
 
L
S
 
E
H
 
E
R
 
R
V
 
F
-
 
A
N
 
N
H
 
H
L
 
K
P
 
P
K
 
N
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
I
 
A
C
 
N
E
 
N
P
 
P
K
 
P
V
 
I
L
 
I
F
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
S
G
 
K
N
 
T
A
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
I
A
 
M
D
 
Q
M
 
L
L
 
L
F
 
K
A
 
K
L
 
L
N
 
N
A
 
E
E
 
E
L
 
D
G
 
G
T
 
K
T
 
T
L
 
V
V
 
V
L
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
N
 
I
Q
 
N
L
 
V
A
 
A
L
 
R
R
 
F
C
 
G
Q
 
E
R
 
R
Q
 
I
F
 
I
T
 
Y
M
 
L
T
 
K
E
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
V

1l2tA Dimeric structure of mj0796, a bacterial abc transporter cassette (see paper)
42% identity, 87% coverage: 7:222/249 of query aligns to 2:223/230 of 1l2tA

query
sites
1l2tA
I
 
I
K
 
K
V
 
L
V
 
K
H
 
N
L
 
V
K
 
T
K
 
K
K
 
T
V
x
Y
Q
 
K
T
 
M
Q
 
G
E
 
E
G
 
E
E
 
I
L
 
I
T
 
Y
I
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
N
V
 
V
D
 
N
M
 
L
E
 
N
V
 
I
K
 
K
P
 
E
G
 
G
E
 
E
S
 
F
V
 
V
A
 
S
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
M
L
 
L
G
 
N
L
 
I
L
 
I
A
 
G
A
 
C
L
 
L
D
 
D
T
 
K
P
 
P
S
 
T
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
W
 
Y
L
 
I
D
 
D
G
 
N
S
 
I
A
 
K
L
 
T
S
 
N
N
 
D
L
 
L
G
 
D
E
 
D
E
 
D
A
 
E
K
 
L
A
 
T
A
 
K
L
 
I
R
 
R
K
 
R
K
 
D
K
 
K
I
 
I
S
 
G
F
 
F
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
Q
F
 
F
M
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
P
T
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
E
L
 
L
P
 
P
-
 
L
-
 
I
-
 
F
-
 
K
-
 
Y
-
 
R
A
 
G
E
 
A
L
 
M
A
 
S
G
 
G
M
 
-
K
 
E
D
 
E
A
 
R
K
 
R
A
 
K
K
 
R
A
 
A
E
 
L
A
 
E
M
 
C
L
 
L
E
 
K
R
 
M
V
 
A
G
 
E
L
 
L
S
 
E
H
 
E
R
 
R
V
x
F
-
 
A
N
 
N
H
 
H
L
 
K
P
 
P
K
 
N
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
I
 
A
C
 
N
E
 
N
P
 
P
K
 
P
V
 
I
L
 
I
F
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
S
G
 
K
N
 
T
A
 
G
H
 
E
K
 
K
V
 
I
A
 
M
D
 
Q
M
 
L
L
 
L
F
 
K
A
 
K
L
 
L
N
 
N
A
 
E
E
 
E
L
 
D
G
 
G
T
 
K
T
 
T
L
 
V
V
 
V
L
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
D
 
D
N
 
I
Q
 
N
L
 
V
A
 
A
L
 
R
R
 
F
C
 
G
Q
 
E
R
 
R
Q
 
I
F
 
I
T
 
Y
M
 
L
T
 
K
E
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
V

5ws4A Crystal structure of tripartite-type abc transporter macb from acinetobacter baumannii (see paper)
42% identity, 88% coverage: 3:222/249 of query aligns to 1:221/650 of 5ws4A

query
sites
5ws4A
K
 
K
M
 
Q
H
 
A
A
 
L
I
 
L
K
 
E
V
 
V
V
 
S
H
 
N
L
 
L
K
 
V
K
 
R
K
 
E
V
 
F
Q
 
P
T
 
A
Q
 
G
E
 
E
G
 
S
E
 
T
L
 
I
T
 
Q
I
 
I
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
D
M
 
L
E
 
T
V
 
I
K
 
Y
P
 
E
G
 
G
E
 
E
S
 
L
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
Q
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
K
 
K
S
|
S
T
 
T
L
 
L
L
 
M
G
 
N
L
 
I
L
 
L
A
 
G
A
 
C
L
 
L
D
 
D
T
 
R
P
 
P
S
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
S
I
 
Y
W
 
K
L
 
V
D
 
N
G
 
G
S
 
Q
A
 
E
L
 
T
S
 
G
N
 
K
L
 
L
G
 
E
E
 
P
E
 
D
A
 
Q
K
 
L
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
R
 
R
K
 
R
K
 
E
K
 
Y
I
 
F
S
 
G
F
 
F
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
F
 
Y
M
 
H
L
 
L
V
 
L
D
 
G
T
 
D
L
 
L
T
 
S
A
 
A
L
 
E
E
 
G
N
 
N
V
 
V
M
 
E
L
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
V
L
 
Y
A
 
A
G
 
G
M
 
V
K
 
T
-
 
P
-
 
A
D
 
D
A
 
R
K
 
K
A
 
Q
K
 
R
A
 
A
E
 
T
A
 
A
M
 
L
L
 
L
E
 
T
R
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
G
H
 
T
R
 
K
V
 
T
N
 
Q
H
 
N
L
 
R
P
 
P
K
 
S
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
I
 
M
C
 
N
E
 
G
P
 
G
K
 
D
V
 
V
L
 
I
F
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
S
G
 
H
N
 
S
A
 
G
H
 
V
K
 
E
V
 
V
A
 
M
D
 
R
M
 
I
L
 
L
F
 
R
A
 
E
L
 
L
N
 
N
A
 
A
E
 
A
L
 
-
G
 
G
T
 
H
T
 
T
L
 
I
V
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
N
 
M
Q
 
Q
L
 
V
A
 
A
L
 
K
R
 
N
C
 
A
Q
 
T
R
 
R
Q
 
I
F
 
I
T
 
E
M
 
I
T
 
S
E
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
I

8g4cB Bceabs atpgs high res tm (see paper)
39% identity, 80% coverage: 25:222/249 of query aligns to 22:221/248 of 8g4cB

query
sites
8g4cB
I
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
D
M
 
I
E
 
H
V
 
I
K
 
E
P
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
F
V
 
V
A
 
S
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
 
G
S
|
S
G
 
G
K
 
K
S
x
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
N
L
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
S
L
 
I
D
 
D
T
 
Q
P
 
V
S
 
S
E
 
H
G
 
G
E
 
T
I
 
I
W
 
H
L
 
I
D
 
N
G
 
G
S
 
N
A
 
D
L
 
M
S
 
T
N
 
A
L
 
M
G
 
K
E
 
E
E
 
K
A
 
Q
K
 
L
A
 
A
A
 
E
L
 
F
R
 
R
K
 
K
K
 
Q
K
 
H
I
 
L
S
 
G
F
 
F
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
S
 
D
F
 
Y
M
 
N
L
 
L
V
 
L
D
 
D
T
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
V
L
 
K
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
L
E
 
S
L
 
I
A
 
T
G
 
K
M
 
L
-
 
S
-
 
K
K
 
K
D
 
E
A
 
A
K
 
N
A
 
R
K
 
K
A
 
F
E
 
E
A
 
E
M
 
V
L
 
A
E
 
K
R
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
Y
H
 
E
R
 
L
V
 
R
N
 
D
H
 
K
L
 
Y
P
 
P
K
 
N
Q
 
E
L
 
I
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
T
A
 
S
I
 
A
A
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
F
I
 
I
C
 
H
E
 
D
P
 
P
K
 
S
V
 
I
L
 
I
F
 
F
A
 
A
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
S
G
 
K
N
 
S
A
 
A
H
 
S
K
 
D
V
 
L
A
 
L
D
 
N
M
 
K
L
 
L
F
 
S
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
A
 
Q
E
 
K
L
 
R
G
 
N
T
 
A
T
 
T
L
 
I
V
 
I
L
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
N
 
P
Q
 
V
L
 
A
A
 
A
L
 
S
R
 
Y
C
 
C
Q
 
G
R
 
R
Q
 
V
F
 
I
T
 
F
M
 
I
T
 
K
E
 
D
G
 
G
E
 
Q
L
 
M

Sites not aligning to the query:

7tchB Bceab e169q variant atp-bound conformation (see paper)
39% identity, 80% coverage: 25:222/249 of query aligns to 21:220/245 of 7tchB

query
sites
7tchB
I
x
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
D
M
 
I
E
 
H
V
 
I
K
 
E
P
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
F
V
 
V
A
 
S
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
N
L
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
S
L
 
I
D
 
D
T
 
Q
P
 
V
S
 
S
E
 
H
G
 
G
E
 
T
I
 
I
W
 
H
L
 
I
D
 
N
G
 
G
S
 
N
A
 
D
L
 
M
S
 
T
N
 
A
L
 
M
G
 
K
E
 
E
E
 
K
A
 
Q
K
 
L
A
 
A
A
 
E
L
 
F
R
 
R
K
 
K
K
 
Q
K
 
H
I
 
L
S
 
G
F
 
F
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
S
 
D
F
 
Y
M
 
N
L
 
L
V
 
L
D
 
D
T
 
T
L
 
L
T
 
T
A
 
V
L
 
K
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
L
E
 
S
L
 
I
A
 
T
G
 
K
M
 
L
-
 
S
-
 
K
K
 
K
D
 
E
A
 
A
K
 
N
A
 
R
K
 
K
A
 
F
E
 
E
A
 
E
M
 
V
L
 
A
E
 
K
R
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
I
S
 
Y
H
 
E
R
 
L
V
 
R
N
 
D
H
 
K
L
 
Y
P
 
P
K
 
N
Q
x
E
L
 
I
S
 
S
G
|
G
G
|
G
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
T
A
 
S
I
 
A
A
 
G
R
 
R
A
 
A
F
 
F
I
 
I
C
 
H
E
 
D
P
 
P
K
 
S
V
 
I
L
 
I
F
 
F
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
S
G
 
K
N
 
S
A
 
A
H
 
S
K
 
D
V
 
L
A
 
L
D
 
N
M
 
K
L
 
L
F
 
S
A
 
Q
L
 
L
N
 
N
A
 
Q
E
 
K
L
 
R
G
 
N
T
 
A
T
 
T
L
 
I
V
 
I
L
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
N
 
P
Q
 
V
L
 
A
A
 
A
L
 
S
R
 
Y
C
 
C
Q
 
G
R
 
R
Q
 
V
F
 
I
T
 
F
M
 
I
T
 
K
E
 
D
G
 
G
E
 
Q
L
 
M

Sites not aligning to the query:

P75831 Macrolide export ATP-binding/permease protein MacB; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
39% identity, 88% coverage: 12:230/249 of query aligns to 10:229/648 of P75831

query
sites
P75831
L
 
I
K
 
R
K
 
R
K
 
S
V
 
Y
Q
 
P
T
 
A
Q
 
G
E
 
D
G
 
E
E
 
Q
L
 
V
T
 
E
I
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
S
M
 
L
E
 
D
V
 
I
K
 
Y
P
 
A
G
 
G
E
 
E
S
 
M
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
M
G
 
N
L
 
I
L
 
L
A
 
G
A
 
C
L
 
L
D
 
D
T
 
K
P
 
A
S
 
T
E
 
S
G
 
G
E
 
T
I
 
Y
W
 
R
L
 
V
D
 
A
G
 
G
S
 
Q
A
 
D
L
 
V
S
 
A
N
 
T
L
 
L
G
 
D
E
 
A
E
 
D
A
 
A
K
 
L
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
R
 
R
K
 
R
K
 
E
K
 
H
I
 
F
S
 
G
F
 
F
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
S
 
R
F
 
Y
M
 
H
L
 
L
V
 
L
D
 
S
T
 
H
L
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
E
E
 
Q
N
 
N
V
 
V
M
 
E
L
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
V
L
 
Y
A
 
A
G
 
G
M
 
L
-
 
E
-
 
R
K
 
K
D
 
Q
A
 
R
K
 
L
A
 
L
K
 
R
A
 
A
E
 
Q
A
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
Q
R
 
R
V
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
E
H
 
D
R
 
R
V
 
T
N
 
E
H
 
Y
L
 
Y
P
 
P
K
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
I
 
M
C
 
N
E
 
G
P
 
G
K
 
Q
V
 
V
L
 
I
F
 
L
A
 
A
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
S
G
 
H
N
 
S
A
 
G
H
 
E
K
 
E
V
 
V
A
 
M
D
 
A
M
 
I
L
 
L
F
 
H
A
 
Q
L
 
L
N
 
R
A
 
-
E
 
D
L
 
R
G
 
G
T
 
H
T
 
T
L
 
V
V
 
I
L
 
I
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
N
 
P
Q
 
Q
L
 
V
A
 
A
L
 
A
R
 
Q
C
 
A
Q
 
E
R
 
R
Q
 
V
F
 
I
T
 
E
M
 
I
T
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
I
A
 
V
E
 
R
T
 
N
T
 
P
A
 
P
A
 
A
Q
 
I
E
 
E

5lj7A Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atp (p21) (see paper)
38% identity, 92% coverage: 4:231/249 of query aligns to 1:229/592 of 5lj7A

query
sites
5lj7A
M
 
M
H
 
N
A
 
I
I
 
I
K
 
E
V
 
I
V
 
K
H
 
Q
L
 
L
K
 
N
K
 
R
K
 
Y
V
 
F
Q
 
G
T
 
E
Q
 
G
E
 
E
G
 
N
E
 
R
L
 
V
T
 
H
I
x
V
L
 
L
K
 
K
G
 
D
V
 
I
D
 
S
M
 
L
E
 
S
V
 
I
K
 
E
P
 
R
G
 
G
E
 
D
S
 
F
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
Q
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
M
G
 
N
L
 
I
L
 
I
A
 
G
A
 
C
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
A
S
 
T
E
 
G
G
 
G
E
 
S
I
 
S
W
 
K
L
 
I
D
 
D
G
 
G
S
 
K
A
 
E
L
 
T
S
 
I
N
 
E
L
 
L
G
 
T
E
 
N
E
 
D
A
 
Q
K
 
L
A
 
S
A
 
D
L
 
L
R
 
R
K
 
S
K
 
Q
K
 
K
I
 
F
S
 
G
F
 
F
I
 
I
F
 
F
Q
|
Q
S
 
R
F
 
Y
M
 
N
L
 
L
V
 
L
D
 
S
T
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
E
 
I
L
 
Y
A
 
A
G
 
G
M
 
M
K
 
P
D
 
Q
A
 
S
K
 
Q
A
 
R
-
 
L
-
 
E
K
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
Q
M
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
G
H
 
D
R
x
K
V
 
W
N
 
Q
H
 
N
L
 
K
P
 
P
K
 
N
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
I
 
M
C
 
N
E
 
G
P
 
G
K
 
E
V
 
I
L
 
I
F
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
S
G
 
H
N
 
S
A
 
G
H
 
E
K
 
N
V
 
V
A
 
M
D
 
E
M
 
I
L
 
L
F
 
R
A
 
Q
L
 
L
N
 
H
A
 
E
E
 
E
L
 
-
G
 
G
T
 
H
T
 
T
L
 
I
V
 
I
L
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
N
 
K
Q
 
H
L
 
I
A
 
A
L
 
A
R
 
S
C
 
A
Q
 
N
R
 
R
Q
 
I
F
 
I
T
 
E
M
 
I
T
 
K
E
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
I
A
 
I
E
 
S
T
 
D
T
 
T
A
 
Q
A
 
K
Q
 
R
E
 
Q
A
 
V

5lilA Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atpys (p21) (see paper)
38% identity, 92% coverage: 4:231/249 of query aligns to 1:229/615 of 5lilA

query
sites
5lilA
M
 
M
H
 
N
A
 
I
I
 
I
K
 
E
V
 
I
V
 
K
H
 
Q
L
 
L
K
 
N
K
 
R
K
 
Y
V
x
F
Q
 
G
T
 
E
Q
 
G
E
 
E
G
 
N
E
 
R
L
 
V
T
 
H
I
x
V
L
 
L
K
 
K
G
 
D
V
 
I
D
 
S
M
 
L
E
 
S
V
 
I
K
 
E
P
 
R
G
 
G
E
 
D
S
 
F
V
 
V
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
Q
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
M
G
 
N
L
 
I
L
 
I
A
 
G
A
 
C
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
A
S
 
T
E
 
G
G
 
G
E
 
S
I
 
S
W
 
K
L
 
I
D
 
D
G
 
G
S
 
K
A
 
E
L
 
T
S
 
I
N
 
E
L
 
L
G
 
T
E
 
N
E
 
D
A
 
Q
K
 
L
A
 
S
A
 
D
L
 
L
R
 
R
K
 
S
K
 
Q
K
 
K
I
 
F
S
 
G
F
 
F
I
 
I
F
 
F
Q
|
Q
S
 
R
F
 
Y
M
 
N
L
 
L
V
 
L
D
 
S
T
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
A
E
 
I
L
 
Y
A
 
A
G
 
G
M
 
M
K
 
P
D
 
Q
A
 
S
K
 
Q
A
 
R
-
 
L
-
 
E
K
 
R
A
 
A
E
 
K
A
 
Q
M
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
G
H
 
D
R
x
K
V
 
W
N
 
Q
H
 
N
L
 
K
P
 
P
K
 
N
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
I
 
M
C
 
N
E
 
G
P
 
G
K
 
E
V
 
I
L
 
I
F
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
S
G
 
H
N
 
S
A
 
G
H
 
E
K
 
N
V
 
V
A
 
M
D
 
E
M
 
I
L
 
L
F
 
R
A
 
Q
L
 
L
N
 
H
A
 
E
E
 
E
L
 
-
G
 
G
T
 
H
T
 
T
L
 
I
V
 
I
L
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
D
N
 
K
Q
 
H
L
 
I
A
 
A
L
 
A
R
 
S
C
 
A
Q
 
N
R
 
R
Q
 
I
F
 
I
T
 
E
M
 
I
T
 
K
E
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
I
A
 
I
E
 
S
T
 
D
T
 
T
A
 
Q
A
 
K
Q
 
R
E
 
Q
A
 
V

8w6iD Cryo-em structure of escherichia coli str k12 ftsex complex with atp- gamma-s in peptidisc
41% identity, 79% coverage: 26:222/249 of query aligns to 18:215/219 of 8w6iD

query
sites
8w6iD
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
T
M
 
F
E
 
H
V
 
M
K
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
S
 
M
V
 
A
A
 
F
I
 
L
I
 
T
G
 
G
P
 
H
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
G
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
C
A
 
G
L
 
I
D
 
E
T
 
R
P
 
P
S
 
S
E
 
A
G
 
G
E
 
K
I
 
I
W
 
W
L
 
F
D
 
S
G
 
G
S
 
H
A
 
D
L
 
I
S
 
T
N
 
R
L
 
L
G
 
K
E
 
N
E
 
R
A
 
E
K
 
V
A
 
P
A
 
F
L
 
L
R
 
R
K
 
R
K
 
Q
K
 
-
I
 
I
S
 
G
F
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
|
Q
S
 
D
F
 
H
M
 
H
L
 
L
V
 
L
D
 
M
T
 
D
L
 
R
T
 
T
A
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
I
P
 
P
A
 
L
E
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
A
K
 
S
-
 
G
-
 
D
D
 
D
A
 
I
K
 
R
A
 
R
K
 
R
A
 
V
E
 
S
A
 
A
M
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
L
H
 
D
R
x
K
V
 
A
N
 
K
H
 
N
L
 
F
P
 
P
K
 
I
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
I
 
V
C
 
N
E
 
K
P
 
P
K
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
D
G
 
A
N
 
L
A
 
S
H
 
E
K
 
G
V
 
I
A
 
L
D
 
R
M
 
L
L
 
F
F
 
E
A
 
E
L
 
F
N
 
N
A
 
-
E
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
V
T
 
T
L
 
V
V
 
L
L
 
M
V
 
A
T
 
T
H
|
H
D
 
D
-
 
I
N
 
N
Q
 
L
L
 
I
A
 
S
L
 
R
R
 
R
C
 
S
Q
 
Y
R
 
R
Q
 
M
F
 
L
T
 
T
M
 
L
T
 
S
E
 
D
G
 
G
E
 
H
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P0A9R7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
41% identity, 79% coverage: 26:222/249 of query aligns to 18:215/222 of P0A9R7

query
sites
P0A9R7
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
T
M
 
F
E
 
H
V
 
M
K
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
S
 
M
V
 
A
A
 
F
I
 
L
I
 
T
G
 
G
P
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
K
L
 
L
L
 
I
A
x
C
A
 
G
L
 
I
D
 
E
T
 
R
P
 
P
S
 
S
E
 
A
G
 
G
E
 
K
I
 
I
W
 
W
L
 
F
D
 
S
G
 
G
S
 
H
A
 
D
L
 
I
S
 
T
N
 
R
L
 
L
G
 
K
E
 
N
E
 
R
A
 
E
K
 
V
A
 
P
A
 
F
L
 
L
R
 
R
K
 
R
K
 
Q
K
 
-
I
 
I
S
 
G
F
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
S
 
D
F
 
H
M
 
H
L
 
L
V
 
L
D
 
M
T
 
D
L
 
R
T
 
T
A
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
I
P
 
P
A
 
L
E
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
A
K
 
S
-
 
G
-
 
D
D
 
D
A
 
I
K
 
R
A
 
R
K
 
R
A
 
V
E
 
S
A
 
A
M
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
L
H
 
D
R
 
K
V
 
A
N
 
K
H
 
N
L
 
F
P
 
P
K
 
I
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
I
 
V
C
 
N
E
 
K
P
 
P
K
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
D
G
 
A
N
 
L
A
 
S
H
 
E
K
 
G
V
 
I
A
 
L
D
 
R
M
 
L
L
 
F
F
 
E
A
 
E
L
 
F
N
 
N
A
 
-
E
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
V
T
 
T
L
 
V
V
 
L
L
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
D
-
 
I
N
 
N
Q
 
L
L
 
I
A
 
S
L
 
R
R
 
R
C
 
S
Q
 
Y
R
 
R
Q
 
M
F
 
L
T
 
T
M
 
L
T
 
S
E
 
D
G
 
G
E
 
H
L
 
L

8hd0A Cell divisome spg hydrolysis machinery ftsex-envc
40% identity, 79% coverage: 26:222/249 of query aligns to 18:215/218 of 8hd0A

query
sites
8hd0A
L
 
L
K
 
Q
G
 
G
V
 
V
D
 
T
M
 
F
E
 
H
V
 
M
K
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
S
 
M
V
 
A
A
 
F
I
 
L
I
 
T
G
 
G
P
 
H
S
 
S
G
 
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
G
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
C
A
 
G
L
 
I
D
 
E
T
 
R
P
 
P
S
 
S
E
 
A
G
 
G
E
 
K
I
 
I
W
 
W
L
 
F
D
 
S
G
 
G
S
 
H
A
 
D
L
 
I
S
 
T
N
 
R
L
 
L
G
 
K
E
 
N
E
 
R
A
 
E
K
 
V
A
 
P
A
 
F
L
 
L
R
 
R
K
 
R
K
 
Q
K
 
-
I
 
I
S
 
G
F
 
M
I
 
I
F
 
F
Q
 
Q
S
 
D
F
 
H
M
 
H
L
 
L
V
 
L
D
 
M
T
 
D
L
 
R
T
 
T
A
 
V
L
 
Y
E
 
D
N
 
N
V
 
V
M
 
A
L
 
I
P
 
P
A
 
L
E
 
I
L
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
A
K
 
S
-
 
G
-
 
D
D
 
D
A
 
I
K
 
R
A
 
R
K
 
R
A
 
V
E
 
S
A
 
A
M
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
L
H
 
D
R
 
K
V
 
A
N
 
K
H
 
N
L
 
F
P
 
P
K
 
I
Q
 
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
I
 
V
C
 
N
E
 
K
P
 
P
K
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
L
A
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
D
G
 
A
N
 
L
A
 
S
H
 
E
K
 
G
V
 
I
A
 
L
D
 
R
M
 
L
L
 
F
F
 
E
A
 
E
L
 
F
N
 
N
A
 
-
E
 
R
L
 
V
G
 
G
T
 
V
T
 
T
L
 
V
V
 
L
L
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
D
-
 
I
N
 
N
Q
 
L
L
 
I
A
 
S
L
 
R
R
 
R
C
 
S
Q
 
Y
R
 
R
Q
 
M
F
 
L
T
 
T
M
 
L
T
 
S
E
 
D
G
 
G
E
 
H
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
37% identity, 80% coverage: 9:208/249 of query aligns to 3:202/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
V
 
I
V
 
I
H
 
E
L
 
M
K
 
R
K
 
D
K
 
V
V
 
V
Q
 
K
T
 
K
Q
x
Y
E
 
D
G
 
N
E
 
G
L
x
T
T
 
T
I
x
A
L
 
L
K
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
S
M
 
V
E
 
S
V
 
V
K
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
S
 
F
V
 
A
A
 
Y
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
I
G
 
R
L
 
S
L
 
L
A
 
Y
A
 
R
L
 
E
D
 
V
T
 
K
P
 
I
S
 
D
E
 
K
G
 
G
E
 
S
I
 
L
W
 
S
L
 
V
D
 
A
G
 
G
S
 
F
A
 
N
L
 
L
S
 
V
N
 
K
L
 
I
G
 
K
E
 
K
E
 
K
A
 
D
K
 
V
A
 
P
A
 
L
L
 
L
R
 
R
K
 
R
K
 
S
K
 
-
I
 
V
S
 
G
F
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
D
F
 
Y
M
 
K
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
K
L
 
K
T
 
T
A
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
L
 
Y
P
 
A
A
 
M
E
 
E
L
 
V
A
 
I
G
 
G
-
 
E
-
 
N
M
 
R
K
 
R
D
 
N
A
 
I
K
 
K
A
 
R
K
 
R
A
 
V
E
 
M
A
 
E
M
 
V
L
 
L
E
 
D
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
H
 
H
R
 
K
V
 
V
N
 
R
H
 
S
L
 
F
P
 
P
K
 
N
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
I
I
 
V
C
 
N
E
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
F
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
P
G
 
D
N
 
N
A
 
S
H
 
W
K
 
E
V
 
I
A
 
M
D
 
N
M
 
L
L
 
L
F
 
E
A
 
R
L
 
I
N
 
N
A
 
L
E
 
Q
L
 
-
G
 
G
T
 
T
T
 
T
L
 
I
V
 
L
L
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
N
N
 
S
Q
 
Q
L
 
I
A
 
V

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
37% identity, 80% coverage: 9:208/249 of query aligns to 3:202/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
V
 
I
V
 
I
H
 
E
L
 
M
K
 
R
K
 
D
K
 
V
V
 
V
Q
 
K
T
 
K
Q
x
Y
E
 
D
G
 
N
E
x
G
L
 
T
T
 
T
I
x
A
L
 
L
K
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
S
M
 
V
E
 
S
V
 
V
K
 
Q
P
 
P
G
 
G
E
 
E
S
 
F
V
 
A
A
 
Y
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
I
G
 
R
L
 
S
L
 
L
A
 
Y
A
 
R
L
 
E
D
 
V
T
 
K
P
 
I
S
 
D
E
 
K
G
 
G
E
 
S
I
 
L
W
 
S
L
 
V
D
 
A
G
 
G
S
 
F
A
 
N
L
 
L
S
 
V
N
 
K
L
 
I
G
 
K
E
 
K
E
 
K
A
 
D
K
 
V
A
 
P
A
 
L
L
 
L
R
 
R
K
 
R
K
 
S
K
 
-
I
 
V
S
 
G
F
 
V
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
D
F
 
Y
M
 
K
L
 
L
V
 
L
D
 
P
T
 
K
L
 
K
T
 
T
A
 
V
L
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
I
M
 
A
L
 
Y
P
 
A
A
 
M
E
 
E
L
 
V
A
 
I
G
 
G
-
 
E
-
 
N
M
 
R
K
 
R
D
 
N
A
 
I
K
 
K
A
 
R
K
 
R
A
 
V
E
 
M
A
 
E
M
 
V
L
 
L
E
 
D
R
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
K
H
 
H
R
 
K
V
 
V
N
 
R
H
 
S
L
 
F
P
 
P
K
 
N
Q
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
I
I
 
V
C
 
N
E
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
L
 
L
F
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
D
 
D
G
 
P
G
 
D
N
 
N
A
 
S
H
 
W
K
 
E
V
 
I
A
 
M
D
 
N
M
 
L
L
 
L
F
 
E
A
 
R
L
 
I
N
 
N
A
 
L
E
 
Q
L
 
-
G
 
G
T
 
T
T
 
T
L
 
I
V
 
L
L
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
D
 
N
N
 
S
Q
 
Q
L
 
I
A
 
V

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
42% identity, 84% coverage: 21:230/249 of query aligns to 13:222/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
G
 
G
E
 
P
L
 
L
T
 
H
I
x
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
I
D
 
H
M
 
L
E
 
E
V
 
V
K
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
E
S
 
K
V
 
L
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
G
 
R
L
 
T
L
 
I
A
 
N
A
 
R
L
 
L
D
 
E
T
 
D
P
 
F
S
 
Q
E
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
V
W
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
G
S
 
L
A
 
S
L
 
V
S
 
K
N
 
D
L
 
-
G
 
-
E
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
D
A
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
R
-
 
E
-
 
I
K
 
R
K
 
R
K
 
E
I
 
V
S
 
G
F
 
M
I
 
V
F
 
F
Q
 
Q
S
 
Q
F
 
F
M
 
N
L
 
L
V
 
F
D
 
P
T
 
H
L
 
M
T
 
T
A
 
V
L
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
M
 
T
L
 
L
-
 
A
P
 
P
A
 
M
E
 
R
L
 
V
A
 
R
G
 
R
M
 
W
K
 
P
D
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
-
 
E
-
 
K
K
 
K
A
 
A
E
 
L
A
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
S
 
L
H
 
D
R
 
Q
V
 
A
N
 
R
H
 
K
L
 
Y
P
 
P
K
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
I
 
A
C
 
M
E
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
L
 
M
F
 
L
A
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
G
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
P
G
 
E
N
 
M
A
 
V
H
 
G
K
 
E
V
 
V
A
 
L
D
 
D
M
 
V
L
 
M
F
 
R
A
 
D
L
 
L
N
 
-
A
 
A
E
 
Q
L
 
G
G
 
G
T
 
M
T
 
T
L
 
M
V
 
V
L
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
D
 
E
N
 
M
Q
 
G
L
 
F
A
 
A
L
 
R
R
 
E
C
 
V
-
 
A
Q
 
D
R
 
R
Q
 
V
F
 
V
T
 
F
M
 
M
T
 
D
E
 
G
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
A
 
V
E
 
E
T
 
E
T
 
G
A
 
R
A
 
P
Q
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>6937316 FitnessBrowser__SB2B:6937316
MSKMHAIKVVHLKKKVQTQEGELTILKGVDMEVKPGESVAIIGPSGSGKSTLLGLLAALD
TPSEGEIWLDGSALSNLGEEAKAALRKKKISFIFQSFMLVDTLTALENVMLPAELAGMKD
AKAKAEAMLERVGLSHRVNHLPKQLSGGEQQRVAIARAFICEPKVLFADEPTGNLDGGNA
HKVADMLFALNAELGTTLVLVTHDNQLALRCQRQFTMTEGELAETTAAQEAPRQDAQAEV
ETNIKEAAC

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory