SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 6939205 FitnessBrowser__SB2B:6939205 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ht5A Crystal structure of ilve a branched chain amino acid transaminase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
41% identity, 91% coverage: 31:357/361 of query aligns to 3:334/335 of 3ht5A

query
sites
3ht5A
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
F
 
V
M
 
S
M
 
I
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
D
 
E
G
 
G
Q
 
R
-
 
G
W
 
W
Q
 
H
N
 
N
A
 
A
R
 
R
I
 
V
L
 
I
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
F
 
I
E
 
E
M
 
L
M
 
D
P
 
P
G
 
S
A
 
A
M
 
I
A
 
V
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
A
Q
 
Q
S
 
E
I
 
V
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
L
K
 
K
A
 
A
F
 
Y
M
 
R
H
 
W
D
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
S
I
 
I
Y
 
V
T
 
S
F
 
F
R
 
R
L
 
A
D
 
D
K
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
R
|
R
L
 
L
N
 
R
R
 
S
S
 
S
A
 
A
D
 
R
I
 
R
V
 
L
C
 
A
I
 
I
P
 
P
N
 
E
I
 
L
P
 
P
E
 
D
A
 
A
V
 
V
Q
 
F
L
 
I
E
 
E
A
 
S
I
 
L
N
 
R
A
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
A
W
 
W
F
 
V
P
 
P
R
 
G
Q
 
A
E
 
G
G
 
G
-
 
E
A
 
E
C
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
V
 
I
F
 
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
P
R
 
G
L
 
L
S
 
G
V
 
V
S
 
R
P
 
P
A
 
A
N
 
T
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
R
F
 
Y
C
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
K
K
 
G
N
 
G
L
 
I
N
 
A
A
 
P
I
 
V
R
 
S
L
 
V
L
 
W
I
 
V
T
 
S
T
 
T
Q
 
E
F
 
Y
H
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
C
S
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
F
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
L
A
 
A
G
 
Q
K
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
N
G
 
G
A
 
C
A
 
D
Q
 
Q
V
 
V
L
 
V
Y
 
W
L
 
L
D
 
D
S
 
A
T
 
V
N
 
E
-
 
R
Q
 
R
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
E
|
E
V
 
M
G
 
G
A
x
G
M
|
M
N
|
N
H
 
I
F
 
F
H
 
F
I
 
V
R
 
L
K
 
G
D
 
S
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
A
T
 
R
L
 
L
I
 
V
I
 
T
P
 
P
E
 
E
F
 
L
T
 
S
D
 
G
T
 
S
I
 
L
L
|
L
R
 
P
S
x
G
I
|
I
T
|
T
S
 
R
E
 
D
S
 
S
I
 
L
L
 
L
A
 
Q
L
 
L
G
 
A
E
 
I
E
 
D
L
 
A
G
 
G
C
 
F
E
 
A
V
 
V
R
 
E
Q
 
E
E
 
R
T
 
R
V
 
I
K
 
D
L
 
I
S
 
D
D
 
E
F
 
W
I
 
Q
A
 
K
D
 
K
I
 
A
E
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
T
E
 
E
A
 
V
G
 
F
G
 
A
F
 
C
G
 
G
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
-
S
 
A
Y
 
R
I
 
V
F
 
R
E
 
H
D
 
G
G
 
A
R
 
S
I
 
E
V
 
F
T
 
R
V
 
I
G
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
V
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
V
I
 
T
S
 
M
H
 
A
I
 
L
Y
 
R
K
 
D
V
 
T
Y
 
L
T
 
T
E
 
G
M
 
I
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
L
 
T
R
 
F
P
 
A
A
 
D
P
 
T
E
 
H
G
 
G
W
 
W
V
 
M
R
 
A
K
 
R
V
 
L

3dtgA Structural analysis of mycobacterial branched chain aminotransferase- implications for inhibitor design
40% identity, 98% coverage: 3:357/361 of query aligns to 5:362/363 of 3dtgA

query
sites
3dtgA
I
 
V
K
 
S
Y
 
A
N
 
N
L
 
T
K
 
N
P
 
P
A
 
A
S
 
T
E
 
D
R
 
A
R
 
V
T
 
R
E
 
E
P
 
S
F
 
I
E
 
-
P
 
-
Q
 
L
G
 
A
D
 
N
V
 
P
G
 
G
F
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
Y
R
 
Y
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
F
 
V
M
 
S
M
 
I
D
 
D
Y
 
Y
K
 
T
-
 
V
D
 
D
G
 
E
Q
 
G
W
 
W
Q
 
H
N
 
N
A
 
A
R
 
Q
I
 
V
L
 
I
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
F
 
I
E
 
Q
M
 
L
M
 
D
P
 
P
G
 
S
A
 
A
M
 
I
A
 
V
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
S
 
E
I
 
I
F
|
F
E
 
E
G
 
G
A
 
L
K
 
K
A
 
A
F
 
Y
M
 
R
H
 
W
D
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
S
I
 
I
Y
 
V
T
 
S
F
 
F
R
 
R
L
 
P
D
 
E
K
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
R
|
R
L
 
L
N
 
Q
R
 
S
S
 
S
A
 
A
D
 
R
I
 
R
V
 
L
C
 
A
I
 
I
P
 
P
N
 
E
I
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
E
V
 
V
Q
 
F
L
 
I
E
 
E
A
 
S
I
 
L
N
 
R
A
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
E
L
 
K
W
 
W
F
 
V
P
 
P
R
 
P
Q
 
A
E
 
G
G
 
G
-
 
E
A
 
E
C
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
V
 
V
F
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
P
R
 
G
L
 
L
S
 
G
V
 
V
S
 
R
P
 
P
A
 
S
N
 
N
Q
 
E
Y
 
Y
T
 
R
F
 
Y
C
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
Y
 
F
G
 
K
K
 
G
N
 
G
L
 
I
N
 
K
A
 
P
I
 
V
R
 
S
L
 
V
L
 
W
I
 
L
T
 
S
T
 
H
Q
 
E
F
 
Y
H
 
V
R
|
R
A
 
A
V
 
S
S
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
F
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
L
A
 
A
G
 
Q
K
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
M
G
 
G
A
 
C
A
 
D
Q
 
Q
V
 
V
L
 
V
Y
 
W
L
 
L
D
 
D
S
 
A
T
 
I
N
 
E
-
 
R
Q
 
R
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
E
|
E
V
 
M
G
 
G
A
x
G
M
 
M
N
 
N
H
 
L
F
 
F
H
 
F
I
 
V
R
 
F
K
 
G
D
 
S
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
A
T
 
R
L
 
L
I
 
V
I
 
T
P
 
P
E
 
E
F
 
L
T
 
S
D
 
G
T
 
S
I
 
L
L
|
L
R
 
P
S
 
G
I
|
I
T
|
T
S
 
R
E
 
D
S
 
S
I
 
L
L
 
L
A
 
Q
L
 
L
G
 
A
E
 
T
E
 
D
L
 
A
G
 
G
C
 
F
E
 
A
V
 
V
R
 
E
Q
 
E
E
 
R
T
 
K
V
 
I
K
 
D
L
 
V
S
 
D
D
 
E
F
 
W
I
 
Q
A
 
K
D
 
K
I
 
A
E
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
T
E
 
E
A
 
V
G
 
F
G
 
A
F
 
C
G
 
G
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
S
S
 
H
Y
 
V
I
 
K
F
 
H
E
 
H
D
 
D
G
 
G
R
 
E
I
 
F
V
 
-
T
 
T
V
 
I
G
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
V
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
I
I
 
T
S
 
M
H
 
A
I
 
L
Y
 
R
K
 
D
V
 
T
Y
 
L
T
 
T
E
 
G
M
 
I
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
L
 
T
R
 
F
P
 
A
A
 
D
P
 
T
E
 
H
G
 
G
W
 
W
V
 
M
R
 
A
K
 
R
V
 
L

3dtfA Structural analysis of mycobacterial branched chain aminotransferase- implications for inhibitor design (see paper)
40% identity, 98% coverage: 3:357/361 of query aligns to 5:362/363 of 3dtfA

query
sites
3dtfA
I
 
V
K
 
S
Y
 
A
N
 
N
L
 
T
K
 
N
P
 
P
A
 
A
S
 
T
E
 
D
R
 
A
R
 
V
T
 
R
E
 
E
P
 
S
F
 
I
E
 
-
P
 
-
Q
 
L
G
 
A
D
 
N
V
 
P
G
 
G
F
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
Y
R
 
Y
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
F
 
V
M
 
S
M
 
I
D
 
D
Y
 
Y
K
 
T
-
 
V
D
 
D
G
 
E
Q
 
G
W
 
W
Q
 
H
N
 
N
A
 
A
R
 
Q
I
 
V
L
 
I
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
F
 
I
E
 
Q
M
 
L
M
 
D
P
 
P
G
 
S
A
 
A
M
 
I
A
 
V
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
S
 
E
I
 
I
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
L
K
 
K
A
 
A
F
 
Y
M
 
R
H
 
W
D
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
S
I
 
I
Y
 
V
T
 
S
F
 
F
R
 
R
L
 
P
D
 
E
K
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
R
|
R
L
 
L
N
 
Q
R
 
S
S
 
S
A
 
A
D
 
R
I
 
R
V
 
L
C
 
A
I
 
I
P
 
P
N
 
E
I
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
E
V
 
V
Q
 
F
L
 
I
E
 
E
A
 
S
I
 
L
N
 
R
A
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
E
L
 
K
W
 
W
F
 
V
P
 
P
R
 
P
Q
 
A
E
 
G
G
 
G
-
 
E
A
 
E
C
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
V
 
V
F
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
P
R
 
G
L
 
L
S
 
G
V
 
V
S
 
R
P
 
P
A
 
S
N
 
N
Q
 
E
Y
 
Y
T
 
R
F
 
Y
C
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
K
K
 
G
N
 
G
L
 
I
N
 
K
A
 
P
I
 
V
R
 
S
L
 
V
L
 
W
I
 
L
T
 
S
T
 
H
Q
 
E
F
 
Y
H
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
S
S
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
F
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
L
A
 
A
G
 
Q
K
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
M
G
 
G
A
 
C
A
 
D
Q
 
Q
V
 
V
L
 
V
Y
 
W
L
 
L
D
 
D
S
 
A
T
 
I
N
 
E
-
 
R
Q
 
R
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
M
G
 
G
A
 
G
M
 
M
N
 
N
H
 
L
F
 
F
H
 
F
I
 
V
R
 
F
K
 
G
D
 
S
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
A
T
 
R
L
 
L
I
 
V
I
 
T
P
 
P
E
 
E
F
 
L
T
 
S
D
 
G
T
 
S
I
 
L
L
 
L
R
 
P
S
 
G
I
|
I
T
|
T
S
 
R
E
 
D
S
 
S
I
 
L
L
 
L
A
 
Q
L
 
L
G
 
A
E
 
T
E
 
D
L
 
A
G
 
G
C
 
F
E
 
A
V
 
V
R
 
E
Q
 
E
E
 
R
T
 
K
V
 
I
K
 
D
L
 
V
S
 
D
D
 
E
F
 
W
I
 
Q
A
 
K
D
 
K
I
 
A
E
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
T
E
 
E
A
 
V
G
 
F
G
 
A
F
 
C
G
 
G
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
S
S
 
H
Y
 
V
I
 
K
F
 
H
E
 
H
D
 
D
G
 
G
R
 
E
I
 
F
V
 
-
T
 
T
V
 
I
G
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
V
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
I
I
 
T
S
 
M
H
 
A
I
 
L
Y
 
R
K
 
D
V
 
T
Y
 
L
T
 
T
E
 
G
M
 
I
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
L
 
T
R
 
F
P
 
A
A
 
D
P
 
T
E
 
H
G
 
G
W
 
W
V
 
M
R
 
A
K
 
R
V
 
L

A0R066 Branched-chain-amino-acid aminotransferase; BCAT; EC 2.6.1.42 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see 2 papers)
40% identity, 98% coverage: 3:357/361 of query aligns to 10:367/368 of A0R066

query
sites
A0R066
I
 
V
K
 
S
Y
 
A
N
 
N
L
 
T
K
 
N
P
 
P
A
 
A
S
 
T
E
 
D
R
 
A
R
 
V
T
 
R
E
 
E
P
 
S
F
 
I
E
 
-
P
 
-
Q
 
L
G
 
A
D
 
N
V
 
P
G
 
G
F
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
Y
R
 
Y
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
F
 
V
M
 
S
M
 
I
D
 
D
Y
 
Y
K
 
T
-
 
V
D
 
D
G
 
E
Q
 
G
W
 
W
Q
 
H
N
 
N
A
 
A
R
 
Q
I
 
V
L
 
I
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
F
 
I
E
 
Q
M
 
L
M
 
D
P
 
P
G
 
S
A
 
A
M
 
I
A
 
V
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
S
 
E
I
 
I
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
L
K
 
K
A
 
A
F
 
Y
M
 
R
H
 
W
D
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
S
I
 
I
Y
 
V
T
 
S
F
 
F
R
 
R
L
 
P
D
 
E
K
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
R
|
R
L
 
L
N
 
Q
R
 
S
S
 
S
A
 
A
D
 
R
I
 
R
V
 
L
C
 
A
I
 
I
P
 
P
N
 
E
I
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
E
V
 
V
Q
 
F
L
 
I
E
 
E
A
 
S
I
 
L
N
 
R
A
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
E
L
 
K
W
 
W
F
 
V
P
 
P
R
 
P
Q
 
A
E
 
G
G
 
G
-
 
E
A
 
E
C
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
V
 
V
F
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
P
R
 
G
L
 
L
S
 
G
V
 
V
S
 
R
P
 
P
A
 
S
N
 
N
Q
 
E
Y
 
Y
T
 
R
F
 
Y
C
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
A
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
K
K
 
G
N
 
G
L
 
I
N
 
K
A
 
P
I
 
V
R
 
S
L
 
V
L
 
W
I
 
L
T
 
S
T
 
H
Q
 
E
F
 
Y
H
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
S
S
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
F
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
L
A
 
A
G
 
Q
K
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
M
G
 
G
A
 
C
A
 
D
Q
 
Q
V
 
V
L
 
V
Y
 
W
L
 
L
D
 
D
S
 
A
T
 
I
N
 
E
-
 
R
Q
 
R
Y
 
Y
I
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
M
G
 
G
A
 
G
M
 
M
N
 
N
H
 
L
F
 
F
H
 
F
I
 
V
R
 
F
K
 
G
D
 
S
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
A
T
 
R
L
 
L
I
 
V
I
 
T
P
 
P
E
 
E
F
 
L
T
 
S
D
 
G
T
 
S
I
 
L
L
 
L
R
 
P
S
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
R
E
 
D
S
 
S
I
 
L
L
 
L
A
 
Q
L
 
L
G
 
A
E
 
T
E
 
D
L
 
A
G
 
G
C
 
F
E
 
A
V
 
V
R
 
E
Q
 
E
E
 
R
T
 
K
V
 
I
K
 
D
L
 
V
S
 
D
D
 
E
F
 
W
I
 
Q
A
x
K
D
 
K
I
 
A
E
 
G
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
T
E
 
E
A
 
V
G
 
F
G
 
A
F
 
C
G
 
G
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
S
S
 
H
Y
 
V
I
 
K
F
 
H
E
 
H
D
 
D
G
 
G
R
 
E
I
 
F
V
 
-
T
 
T
V
 
I
G
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
V
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
I
I
 
T
S
 
M
H
 
A
I
 
L
Y
 
R
K
 
D
V
 
T
Y
 
L
T
 
T
E
 
G
M
 
I
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
L
 
T
R
 
F
P
 
A
A
 
D
P
 
T
E
 
H
G
 
G
W
 
W
V
 
M
R
 
A
K
 
R
V
 
L

5u3fA Structure of mycobacterium tuberculosis ilve, a branched-chain amino acid transaminase, in complex with d-cycloserine derivative (see paper)
41% identity, 91% coverage: 31:357/361 of query aligns to 2:325/326 of 5u3fA

query
sites
5u3fA
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
F
 
V
M
 
S
M
 
I
D
 
D
Y
 
Y
K
 
A
D
 
E
G
 
G
Q
 
R
-
 
G
W
 
W
Q
 
H
N
 
N
A
 
A
R
 
R
I
 
V
L
 
I
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
F
 
I
E
 
E
M
 
L
M
 
D
P
 
P
G
 
S
A
 
A
M
 
I
A
 
V
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
A
Q
 
Q
S
 
E
I
 
V
F
 
F
E
 
E
G
|
G
A
 
L
K
 
K
A
 
A
F
 
Y
M
 
R
H
 
W
D
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
S
I
 
I
Y
 
V
T
 
S
F
 
F
R
 
R
L
 
A
D
 
D
K
 
A
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
R
|
R
L
 
L
N
 
R
R
 
S
S
 
S
A
 
A
D
 
R
I
 
R
V
 
L
C
 
A
I
 
I
P
 
P
N
 
E
I
 
L
P
 
P
E
 
D
A
 
A
V
 
V
Q
 
F
L
 
I
E
 
E
A
 
S
I
 
L
N
 
R
A
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
A
W
 
W
F
 
V
P
 
P
R
 
G
Q
 
A
E
 
G
G
 
G
-
 
E
A
 
E
C
 
A
L
 
L
Y
|
Y
I
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
V
 
I
F
 
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
D
 
P
R
 
G
L
 
L
S
 
G
V
 
V
S
 
R
P
 
P
A
 
A
N
 
T
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
R
F
 
Y
C
 
L
V
 
L
V
 
I
L
 
A
S
 
S
P
 
P
S
 
A
G
 
A
A
 
-
Y
 
-
Y
 
-
G
 
-
K
 
-
N
 
-
L
 
-
N
 
-
A
 
P
I
 
V
R
 
S
L
 
V
L
 
W
I
 
V
T
 
S
T
 
T
Q
 
E
F
 
Y
H
 
V
R
 
R
A
 
A
V
 
C
S
 
P
G
 
G
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
F
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
L
A
 
A
G
 
Q
K
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
E
H
 
N
G
 
G
A
 
C
A
 
D
Q
 
Q
V
 
V
L
 
V
Y
 
W
L
 
L
D
 
D
S
 
A
T
 
V
N
 
E
-
 
R
Q
 
R
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
E
|
E
V
 
M
G
 
G
A
x
G
M
|
M
N
|
N
H
 
I
F
 
F
H
 
F
I
 
V
R
 
L
K
 
G
D
 
S
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
A
T
 
R
L
 
L
I
 
V
I
 
T
P
 
P
E
 
E
F
 
L
T
 
S
D
 
G
T
 
S
I
 
L
L
|
L
R
 
P
S
x
G
I
|
I
T
|
T
S
 
R
E
 
D
S
 
S
I
 
L
L
 
L
A
 
Q
L
 
L
G
 
A
E
 
I
E
 
D
L
 
A
G
 
G
C
 
F
E
 
A
V
 
V
R
 
E
Q
 
E
E
 
R
T
 
R
V
 
I
K
 
D
L
 
I
S
 
D
D
 
E
F
 
W
I
 
Q
A
 
K
D
 
K
I
 
A
E
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
I
 
I
V
 
T
E
 
E
A
 
V
G
 
F
G
 
A
F
 
C
G
 
G
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
-
S
 
A
Y
 
R
I
 
V
F
 
R
E
 
H
D
 
G
G
 
A
R
 
S
I
 
E
V
 
F
T
 
R
V
 
I
G
 
A
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
V
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
V
I
 
T
S
 
M
H
 
A
I
 
L
Y
 
R
K
 
D
V
 
T
Y
 
L
T
 
T
E
 
G
M
 
I
Q
 
Q
K
 
R
G
 
G
L
 
T
R
 
F
P
 
A
A
 
D
P
 
T
E
 
H
G
 
G
W
 
W
V
 
M
R
 
A
K
 
R
V
 
L

3uyyB Crystal structures of branched-chain aminotransferase from deinococcus radiodurans complexes with alpha-ketoisocaproate and l-glutamate suggest its radio-resistance for catalysis (see paper)
36% identity, 93% coverage: 24:357/361 of query aligns to 8:337/337 of 3uyyB

query
sites
3uyyB
V
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
S
K
 
Y
L
 
I
R
 
R
T
 
T
D
 
D
H
 
L
M
 
R
F
 
Y
M
 
L
M
 
A
D
 
H
Y
 
W
K
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
D
N
 
A
A
 
G
R
 
T
I
 
L
L
 
T
P
 
E
Y
 
D
G
 
N
P
 
Q
F
 
I
E
 
H
M
 
L
M
 
A
P
 
E
G
 
G
A
 
S
M
 
T
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
S
 
Q
I
 
C
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
L
K
 
K
A
 
A
F
 
Y
M
 
R
H
 
C
D
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
S
I
 
I
Y
 
N
T
 
L
F
 
F
R
 
R
L
 
P
D
 
D
K
 
Q
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
R
|
R
L
 
M
N
 
R
R
 
M
S
 
S
A
 
C
D
 
R
I
 
R
V
 
L
C
 
L
I
 
M
P
 
P
N
 
E
I
 
L
P
 
S
E
 
D
A
 
E
V
 
Q
Q
 
F
L
 
I
E
 
D
A
 
A
I
 
C
N
 
L
A
 
Q
L
 
V
I
 
V
D
 
R
V
 
A
D
 
N
R
 
E
L
 
H
W
 
F
F
 
L
P
 
P
R
 
P
Q
 
Y
-
 
G
E
 
T
G
 
G
A
 
G
C
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
V
 
V
F
 
I
A
 
G
T
 
V
E
 
G
D
 
D
R
 
N
L
 
I
S
 
G
V
 
V
S
 
R
P
 
T
A
 
A
N
 
P
Q
 
E
Y
 
F
T
 
I
F
 
F
C
 
S
V
 
V
V
 
F
L
 
C
S
 
V
P
 
P
S
 
V
G
 
G
A
 
P
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
K
K
 
G
N
 
G
L
 
L
N
 
T
A
 
P
I
 
T
R
 
N
L
 
-
L
 
F
I
 
I
T
 
T
T
 
S
Q
 
D
F
 
Y
H
 
D
R
|
R
A
 
A
V
 
A
S
 
P
G
 
H
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
L
A
 
P
G
 
G
K
 
Y
A
 
E
A
 
A
A
 
K
E
 
K
H
 
R
G
 
D
A
 
F
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
-
 
P
S
 
A
T
 
T
N
 
H
Q
 
T
Y
 
T
I
 
I
E
 
E
E
|
E
V
 
A
G
|
G
A
|
A
M
x
A
N
 
N
H
 
F
F
 
F
H
 
A
I
 
I
R
 
T
K
 
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
L
 
K
I
 
F
I
 
V
P
 
T
E
 
P
F
 
Q
T
 
S
D
 
P
T
 
S
I
 
I
L
 
L
R
 
P
S
|
S
I
|
I
T
|
T
S
 
K
E
 
Y
S
 
S
I
 
L
L
 
L
A
 
W
L
 
L
G
 
A
E
 
E
E
 
H
-
 
R
L
 
L
G
 
G
C
 
L
E
 
E
V
 
V
R
 
E
Q
 
E
E
 
G
T
 
D
V
 
I
K
 
R
L
 
I
S
 
D
D
 
-
F
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
E
A
 
L
G
 
G
E
 
K
I
 
F
V
 
S
E
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
A
F
 
C
G
|
G
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
I
G
 
G
S
 
G
Y
 
I
I
 
Q
F
 
H
E
 
G
D
 
D
G
 
D
R
 
F
I
 
H
V
 
V
T
 
F
V
 
Y
G
 
S
D
 
E
G
 
S
K
 
E
V
 
P
G
 
G
E
 
P
R
 
V
I
 
T
S
 
R
H
 
R
I
 
L
Y
 
Y
K
 
D
V
 
E
Y
 
L
T
 
V
E
 
G
M
 
I
Q
 
Q
K
 
Y
G
 
G
L
 
D
R
 
K
P
 
E
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
G
W
 
W
V
 
I
R
 
V
K
 
K
V
 
V

3uzoA Crystal structures of branched-chain aminotransferase from deinococcus radiodurans complexes with alpha-ketoisocaproate and l-glutamate suggest its radio-resistance for catalysis (see paper)
36% identity, 93% coverage: 24:357/361 of query aligns to 6:335/335 of 3uzoA

query
sites
3uzoA
V
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
S
K
 
Y
L
 
I
R
 
R
T
 
T
D
 
D
H
 
L
M
 
R
F
 
Y
M
 
L
M
 
A
D
 
H
Y
 
W
K
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
D
N
 
A
A
 
G
R
 
T
I
 
L
L
 
T
P
 
E
Y
 
D
G
 
N
P
 
Q
F
 
I
E
 
H
M
 
L
M
 
A
P
 
E
G
 
G
A
 
S
M
 
T
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
|
Y
G
 
G
Q
 
Q
S
 
Q
I
 
C
F
|
F
E
 
E
G
 
G
A
 
L
K
 
K
A
 
A
F
 
Y
M
 
R
H
 
C
D
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
S
I
 
I
Y
 
N
T
 
L
F
 
F
R
 
R
L
 
P
D
 
D
K
 
Q
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
R
|
R
L
 
M
N
 
R
R
 
M
S
 
S
A
 
C
D
 
R
I
 
R
V
 
L
C
 
L
I
 
M
P
 
P
N
 
E
I
 
L
P
 
S
E
 
D
A
 
E
V
 
Q
Q
 
F
L
 
I
E
 
D
A
 
A
I
 
C
N
 
L
A
 
Q
L
 
V
I
 
V
D
 
R
V
 
A
D
 
N
R
 
E
L
 
H
W
 
F
F
 
L
P
 
P
R
 
P
Q
 
Y
-
 
G
E
 
T
G
 
G
A
 
G
C
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
R
|
R
P
 
P
F
 
F
V
 
V
F
 
I
A
 
G
T
 
V
E
 
G
D
 
D
R
 
N
L
 
I
S
 
G
V
|
V
S
 
R
P
 
T
A
 
A
N
 
P
Q
 
E
Y
 
F
T
 
I
F
 
F
C
 
S
V
 
V
V
 
F
L
 
C
S
 
V
P
 
P
S
 
V
G
 
G
A
 
P
Y
|
Y
Y
 
F
G
 
K
K
 
G
N
 
G
L
 
L
N
 
T
A
 
P
I
 
T
R
 
N
L
 
-
L
 
F
I
 
I
T
 
T
T
 
S
Q
 
D
F
 
Y
H
 
D
R
 
R
A
 
A
V
 
A
S
 
P
G
 
H
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
L
A
 
P
G
 
G
K
 
Y
A
 
E
A
 
A
A
 
K
E
 
K
H
 
R
G
 
D
A
 
F
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
-
 
P
S
 
A
T
 
T
N
 
H
Q
 
T
Y
 
T
I
 
I
E
 
E
E
|
E
V
 
A
G
|
G
A
|
A
M
x
A
N
|
N
H
 
F
F
 
F
H
 
A
I
 
I
R
 
T
K
 
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
L
 
K
I
 
F
I
 
V
P
 
T
E
 
P
F
 
Q
T
 
S
D
 
P
T
 
S
I
 
I
L
|
L
R
 
P
S
|
S
I
|
I
T
|
T
S
 
K
E
 
Y
S
 
S
I
 
L
L
 
L
A
 
W
L
 
L
G
 
A
E
 
E
E
 
H
-
 
R
L
 
L
G
 
G
C
 
L
E
 
E
V
 
V
R
 
E
Q
 
E
E
 
G
T
 
D
V
 
I
K
 
R
L
 
I
S
 
D
D
 
-
F
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
E
A
 
L
G
 
G
E
 
K
I
 
F
V
 
S
E
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
A
F
 
C
G
|
G
T
|
T
A
|
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
I
G
 
G
S
 
G
Y
 
I
I
 
Q
F
 
H
E
 
G
D
 
D
G
 
D
R
 
F
I
 
H
V
 
V
T
 
F
V
 
Y
G
 
S
D
 
E
G
 
S
K
 
E
V
 
P
G
 
G
E
 
P
R
 
V
I
 
T
S
 
R
H
 
R
I
 
L
Y
 
Y
K
 
D
V
 
E
Y
 
L
T
 
V
E
 
G
M
 
I
Q
 
Q
K
 
Y
G
 
G
L
 
D
R
 
K
P
 
E
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
G
W
 
W
V
 
I
R
 
V
K
 
K
V
 
V

3uzbA Crystal structures of branched-chain aminotransferase from deinococcus radiodurans complexes with alpha-ketoisocaproate and l-glutamate suggest its radio-resistance for catalysis (see paper)
36% identity, 93% coverage: 24:357/361 of query aligns to 6:335/335 of 3uzbA

query
sites
3uzbA
V
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
S
K
 
Y
L
 
I
R
 
R
T
 
T
D
 
D
H
 
L
M
 
R
F
 
Y
M
 
L
M
 
A
D
 
H
Y
 
W
K
 
K
D
 
D
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
D
N
 
A
A
 
G
R
 
T
I
 
L
L
 
T
P
 
E
Y
 
D
G
 
N
P
 
Q
F
 
I
E
 
H
M
 
L
M
 
A
P
 
E
G
 
G
A
 
S
M
 
T
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
S
 
Q
I
 
C
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
L
K
 
K
A
 
A
F
 
Y
M
 
R
H
 
C
D
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
S
I
 
I
Y
 
N
T
 
L
F
 
F
R
 
R
L
 
P
D
 
D
K
 
Q
N
 
N
A
 
A
Q
 
A
R
|
R
L
 
M
N
 
R
R
 
M
S
 
S
A
 
C
D
 
R
I
 
R
V
 
L
C
 
L
I
 
M
P
 
P
N
 
E
I
 
L
P
 
S
E
 
D
A
 
E
V
 
Q
Q
 
F
L
 
I
E
 
D
A
 
A
I
 
C
N
 
L
A
 
Q
L
 
V
I
 
V
D
 
R
V
 
A
D
 
N
R
 
E
L
 
H
W
 
F
F
 
L
P
 
P
R
 
P
Q
 
Y
-
 
G
E
 
T
G
 
G
A
 
G
C
 
S
L
 
L
Y
|
Y
I
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
V
 
V
F
 
I
A
 
G
T
 
V
E
 
G
D
 
D
R
 
N
L
 
I
S
 
G
V
 
V
S
 
R
P
 
T
A
 
A
N
 
P
Q
 
E
Y
 
F
T
 
I
F
 
F
C
 
S
V
 
V
V
 
F
L
 
C
S
 
V
P
 
P
S
 
V
G
 
G
A
 
P
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
K
K
 
G
N
 
G
L
 
L
N
 
T
A
 
P
I
 
T
R
 
N
L
 
-
L
 
F
I
 
I
T
 
T
T
 
S
Q
 
D
F
 
Y
H
 
D
R
 
R
A
 
A
V
 
A
S
 
P
G
 
H
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
L
A
 
P
G
 
G
K
 
Y
A
 
E
A
 
A
A
 
K
E
 
K
H
 
R
G
 
D
A
 
F
A
 
A
Q
 
D
V
 
V
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
-
 
P
S
 
A
T
 
T
N
 
H
Q
 
T
Y
 
T
I
 
I
E
 
E
E
|
E
V
 
A
G
|
G
A
|
A
M
x
A
N
|
N
H
 
F
F
 
F
H
 
A
I
 
I
R
 
T
K
 
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
Q
L
 
K
I
 
F
I
 
V
P
 
T
E
 
P
F
 
Q
T
 
S
D
 
P
T
 
S
I
 
I
L
 
L
R
 
P
S
|
S
I
|
I
T
|
T
S
 
K
E
 
Y
S
 
S
I
 
L
L
 
L
A
 
W
L
 
L
G
 
A
E
 
E
E
 
H
-
 
R
L
 
L
G
 
G
C
 
L
E
 
E
V
 
V
R
 
E
Q
 
E
E
 
G
T
 
D
V
 
I
K
 
R
L
 
I
S
 
D
D
 
-
F
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
E
A
 
L
G
 
G
E
 
K
I
 
F
V
 
S
E
 
E
A
 
A
G
 
G
G
 
A
F
 
C
G
|
G
T
|
T
A
|
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
S
 
T
P
 
P
V
 
I
G
 
G
S
 
G
Y
 
I
I
 
Q
F
 
H
E
 
G
D
 
D
G
 
D
R
 
F
I
 
H
V
 
V
T
 
F
V
 
Y
G
 
S
D
 
E
G
 
S
K
 
E
V
 
P
G
 
G
E
 
P
R
 
V
I
 
T
S
 
R
H
 
R
I
 
L
Y
 
Y
K
 
D
V
 
E
Y
 
L
T
 
V
E
 
G
M
 
I
Q
 
Q
K
 
Y
G
 
G
L
 
D
R
 
K
P
 
E
A
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
G
W
 
W
V
 
I
R
 
V
K
 
K
V
 
V

2hdkB Crystal structure of cys315ala-cys318ala mutant of human mitochondrial branched chain aminotransferase (see paper)
34% identity, 96% coverage: 2:347/361 of query aligns to 7:355/363 of 2hdkB

query
sites
2hdkB
D
 
D
I
 
L
K
 
Q
Y
 
L
N
 
E
L
 
M
K
 
T
P
 
Q
A
 
K
S
 
P
E
 
H
R
 
K
R
 
K
T
 
P
E
 
G
P
 
P
F
 
G
E
 
E
P
 
P
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
L
G
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
T
R
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
F
 
L
M
 
M
M
 
V
D
 
E
Y
 
W
K
 
N
D
 
D
G
 
K
Q
 
G
W
 
W
Q
 
G
N
 
Q
A
 
P
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
P
 
P
Y
 
F
G
 
Q
P
 
N
F
 
L
E
 
T
M
 
L
M
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
S
M
 
S
A
 
S
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
S
 
Q
I
 
L
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
M
K
 
K
A
 
A
F
 
F
M
 
K
H
 
G
D
 
K
D
 
D
G
 
Q
E
 
Q
I
 
V
Y
 
R
T
 
L
F
 
F
R
 
R
L
 
P
D
 
W
K
 
L
N
 
N
A
 
M
Q
 
D
R
|
R
L
 
M
N
 
L
R
 
R
S
 
S
A
 
A
D
 
M
I
 
R
V
 
L
C
 
C
I
 
L
P
 
P
N
 
S
I
 
F
P
 
D
E
 
K
A
 
L
V
 
E
Q
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
C
I
 
I
N
 
R
A
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
E
V
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
D
W
 
W
F
 
V
P
 
P
R
 
D
Q
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
T
C
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
V
 
L
F
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
D
 
P
R
 
S
L
 
L
S
 
G
V
 
V
S
 
S
P
 
Q
A
 
P
N
 
R
Q
 
R
Y
 
A
T
 
L
F
 
L
C
 
F
V
 
V
V
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
S
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
-
 
P
G
 
G
K
 
G
N
 
S
L
 
V
N
 
T
A
 
P
I
 
V
R
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
A
T
 
D
T
 
P
Q
 
A
F
 
F
H
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
W
S
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
V
G
 
G
A
 
N
S
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
A
 
G
A
 
P
S
 
T
L
 
V
R
 
L
A
 
V
G
 
Q
K
 
Q
A
 
E
A
 
A
A
 
L
E
 
K
H
 
R
G
 
G
A
 
C
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
Y
 
W
L
 
L
D
 
Y
S
 
G
T
 
P
N
 
D
Q
 
H
Y
 
Q
I
 
L
E
 
T
E
|
E
V
 
V
G
 
G
A
x
T
M
 
M
N
 
N
H
 
I
F
 
F
-
 
V
-
 
Y
H
 
W
I
 
T
R
 
H
K
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
V
-
 
L
-
 
E
L
 
L
I
 
V
I
 
T
P
 
P
E
 
P
F
 
L
T
 
N
D
 
G
T
 
V
I
 
I
L
|
L
R
 
P
S
x
G
I
x
V
T
x
V
S
 
R
E
 
Q
S
 
S
I
 
L
L
 
L
A
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
E
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
C
 
F
E
 
R
V
 
V
R
 
V
Q
 
E
E
 
R
T
 
T
V
 
I
K
 
T
L
 
M
S
 
K
D
 
Q
F
 
L
I
 
L
A
 
R
D
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
E
G
 
G
E
 
R
I
 
V
V
 
R
E
 
E
A
 
V
G
 
F
G
 
G
F
 
S
G
|
G
T
|
T
A
|
A
A
 
A
V
 
Q
V
 
V
S
 
A
P
 
P
V
 
V
G
 
H
S
 
R
Y
 
I
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
D
 
D
G
 
R
-
 
N
-
 
L
R
 
H
I
 
I
V
 
P
T
 
T
V
 
M
G
 
E
D
 
N
G
 
G
K
 
P
V
 
-
G
 
-
E
 
E
R
 
L
I
 
I
S
 
L
H
 
R
I
 
F
Y
 
Q
K
 
K
V
 
E
Y
 
L
T
 
K
E
 
E
M
 
I
Q
 
Q
K
 
Y
G
 
G
L
 
I
R
 
R

5i5xA X-ray crystal structure at 1.65a resolution of human mitochondrial branched chain aminotransferase (bcatm) complexed with a thiazole compound and pmp cofactor. (see paper)
34% identity, 93% coverage: 12:347/361 of query aligns to 11:350/358 of 5i5xA

query
sites
5i5xA
E
 
E
R
 
M
R
 
T
T
 
Q
E
 
K
P
 
P
F
 
H
E
 
K
P
 
K
Q
 
P
G
 
G
D
 
P
V
 
L
G
 
V
F
|
F
G
 
G
K
 
K
L
 
T
R
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
F
 
L
M
 
M
M
 
V
D
 
E
Y
 
W
K
 
N
D
 
D
G
 
K
Q
 
G
W
 
W
Q
 
G
N
 
Q
A
 
P
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
P
 
P
Y
 
F
G
 
Q
P
 
N
F
 
L
E
 
T
M
 
L
M
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
S
M
 
S
A
 
S
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
S
 
Q
I
 
L
F
|
F
E
 
E
G
 
G
A
 
M
K
|
K
A
 
A
F
 
F
M
 
K
H
 
G
D
 
K
D
 
D
G
 
Q
E
 
Q
I
 
V
Y
 
R
T
 
L
F
 
F
R
 
R
L
 
P
D
 
W
K
 
L
N
 
N
A
 
M
Q
 
D
R
|
R
L
 
M
N
 
L
R
 
R
S
 
S
A
 
A
D
 
M
I
 
R
V
 
L
C
 
C
I
 
L
P
 
P
N
 
S
I
 
F
P
 
D
E
 
K
A
 
L
V
 
E
Q
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
C
I
 
I
N
 
R
A
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
E
V
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
D
W
 
W
F
 
V
P
 
P
R
 
D
Q
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
T
C
 
S
L
 
L
Y
|
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
V
 
L
F
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
D
 
P
R
 
S
L
 
L
S
 
G
V
 
V
S
 
S
P
 
Q
A
 
P
N
 
T
Q
 
R
Y
 
A
T
 
L
F
 
L
C
 
F
V
 
V
V
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
S
x
V
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
Y
 
F
G
 
G
K
 
-
N
 
S
L
 
V
N
 
T
A
 
P
I
 
V
R
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
A
T
 
D
T
 
P
Q
 
A
F
 
F
H
 
I
R
|
R
A
 
A
V
 
W
S
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
V
G
 
G
A
 
N
S
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
A
 
G
A
 
P
S
 
T
L
 
V
R
 
L
A
 
V
G
 
Q
K
 
Q
A
 
E
A
 
A
A
 
L
E
 
K
H
 
R
G
 
G
A
 
C
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
Y
 
W
L
 
L
D
 
Y
S
 
G
T
 
P
N
 
D
Q
 
H
Y
 
Q
I
 
L
E
 
T
E
|
E
V
 
V
G
 
G
A
x
T
M
|
M
N
|
N
H
 
I
F
 
F
-
 
V
-
 
Y
H
 
W
I
 
T
R
 
H
K
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
V
-
 
L
-
 
E
L
 
L
I
 
V
I
 
T
P
 
P
E
 
P
F
 
L
T
 
N
D
 
G
T
 
V
I
 
I
L
|
L
R
 
P
S
x
G
I
x
V
T
x
V
S
 
R
E
 
Q
S
 
S
I
 
L
L
 
L
A
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
E
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
C
 
F
E
 
R
V
 
V
R
 
V
Q
 
E
E
 
R
T
 
T
V
 
I
K
 
T
L
 
M
S
 
K
D
 
Q
F
 
L
I
 
L
A
 
R
D
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
E
G
 
G
E
 
R
I
 
V
V
 
R
E
 
E
A
 
V
G
 
F
G
 
G
F
 
S
G
 
G
T
|
T
A
|
A
A
 
C
V
 
Q
V
 
V
S
 
C
P
 
P
V
 
V
G
 
H
S
 
R
Y
 
I
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
D
 
D
G
 
R
-
 
N
-
 
L
R
 
H
I
 
I
V
 
P
T
 
T
V
 
M
G
 
E
D
 
N
G
 
G
K
 
P
V
 
-
G
 
-
E
 
E
R
 
L
I
 
I
S
 
L
H
 
R
I
 
F
Y
 
Q
K
 
K
V
 
E
Y
 
L
T
 
K
E
 
E
M
 
I
Q
 
Q
K
 
Y
G
 
G
L
 
I
R
 
R

5i5vA X-ray crystal structure at 1.94a resolution of human mitochondrial branched chain aminotransferase (bcatm) complexed with a thienopyrimidine compound and an internal aldimine linked plp cofactor. (see paper)
34% identity, 93% coverage: 12:347/361 of query aligns to 11:352/360 of 5i5vA

query
sites
5i5vA
E
 
E
R
 
M
R
 
T
T
 
Q
E
 
K
P
 
P
F
 
H
E
 
K
P
 
K
Q
 
P
G
 
G
D
 
P
V
 
L
G
 
V
F
|
F
G
 
G
K
 
K
L
 
T
R
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
F
 
L
M
 
M
M
 
V
D
 
E
Y
 
W
K
 
N
D
 
D
G
 
K
Q
 
G
W
 
W
Q
 
G
N
 
Q
A
 
P
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
P
 
P
Y
 
F
G
 
Q
P
 
N
F
 
L
E
 
T
M
 
L
M
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
S
M
 
S
A
 
S
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
S
 
Q
I
 
L
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
M
K
|
K
A
 
A
F
 
F
M
 
K
H
 
G
D
 
K
D
 
D
G
 
Q
E
 
Q
I
 
V
Y
 
R
T
 
L
F
 
F
R
 
R
L
 
P
D
 
W
K
 
L
N
 
N
A
 
M
Q
 
D
R
|
R
L
 
M
N
 
L
R
 
R
S
 
S
A
 
A
D
 
M
I
 
R
V
 
L
C
 
C
I
 
L
P
 
P
N
 
S
I
 
F
P
 
D
E
 
K
A
 
L
V
 
E
Q
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
C
I
 
I
N
 
R
A
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
E
V
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
D
W
 
W
F
 
V
P
 
P
R
 
D
Q
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
T
C
 
S
L
 
L
Y
|
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
V
 
L
F
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
D
 
P
R
 
S
L
 
L
S
 
G
V
 
V
S
 
S
P
 
Q
A
 
P
N
 
T
Q
 
R
Y
 
A
T
 
L
F
 
L
C
 
F
V
 
V
V
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
S
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
|
Y
Y
 
F
-
 
P
G
 
G
K
 
G
N
 
S
L
 
V
N
 
T
A
 
P
I
 
V
R
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
A
T
 
D
T
 
P
Q
 
A
F
 
F
H
 
I
R
|
R
A
 
A
V
 
W
S
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
V
G
 
G
A
 
N
S
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
A
 
G
A
 
P
S
 
T
L
 
V
R
 
L
A
 
V
G
 
Q
K
 
Q
A
 
E
A
 
A
A
 
L
E
 
K
H
 
R
G
 
G
A
 
C
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
Y
 
W
L
 
L
D
 
Y
S
 
G
T
 
P
N
 
D
Q
 
H
Y
 
Q
I
 
L
E
 
T
E
|
E
V
 
V
G
 
G
A
x
T
M
|
M
N
 
N
H
 
I
F
 
F
-
 
V
-
 
Y
H
 
W
I
 
T
R
 
H
K
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
V
-
 
L
-
 
E
L
 
L
I
 
V
I
 
T
P
 
P
E
 
P
F
 
L
T
 
N
D
 
G
T
 
V
I
 
I
L
|
L
R
 
P
S
x
G
I
x
V
T
x
V
S
 
R
E
 
Q
S
 
S
I
 
L
L
 
L
A
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
E
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
C
 
F
E
 
R
V
 
V
R
 
V
Q
 
E
E
 
R
T
 
T
V
 
I
K
 
T
L
 
M
S
 
K
D
 
Q
F
 
L
I
 
L
A
 
R
D
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
E
G
 
G
E
 
R
I
 
V
V
 
R
E
 
E
A
 
V
G
 
F
G
 
G
F
 
S
G
|
G
T
|
T
A
|
A
A
 
C
V
 
Q
V
 
V
S
 
C
P
 
P
V
 
V
G
 
H
S
 
R
Y
 
I
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
D
 
D
G
 
R
-
 
N
-
 
L
R
 
H
I
 
I
V
 
P
T
 
T
V
 
M
G
 
E
D
 
N
G
 
G
K
 
P
V
 
-
G
 
-
E
 
E
R
 
L
I
 
I
S
 
L
H
 
R
I
 
F
Y
 
Q
K
 
K
V
 
E
Y
 
L
T
 
K
E
 
E
M
 
I
Q
 
Q
K
 
Y
G
 
G
L
 
I
R
 
R

O15382 Branched-chain-amino-acid aminotransferase, mitochondrial; BCAT(m); Placental protein 18; PP18; EC 2.6.1.42 from Homo sapiens (Human) (see 6 papers)
33% identity, 96% coverage: 2:347/361 of query aligns to 36:384/392 of O15382

query
sites
O15382
D
 
D
I
 
L
K
 
Q
Y
 
L
N
 
E
L
 
M
K
 
T
P
 
Q
A
 
K
S
 
P
E
 
H
R
 
K
R
 
K
T
 
P
E
 
G
P
 
P
F
 
G
E
 
E
P
 
P
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
V
 
L
G
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
K
L
 
T
R
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
F
 
L
M
 
M
M
 
V
D
 
E
Y
 
W
K
 
N
D
 
D
G
 
K
Q
 
G
W
 
W
Q
 
G
N
 
Q
A
 
P
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
P
 
P
Y
 
F
G
 
Q
P
 
N
F
 
L
E
 
T
M
 
L
M
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
S
M
 
S
A
 
S
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
S
 
Q
I
 
L
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
M
K
 
K
A
 
A
F
 
F
M
 
K
H
 
G
D
 
K
D
 
D
G
 
Q
E
 
Q
I
 
V
Y
 
R
T
 
L
F
 
F
R
 
R
L
 
P
D
 
W
K
 
L
N
 
N
A
 
M
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
N
 
L
R
 
R
S
 
S
A
 
A
D
 
M
I
 
R
V
 
L
C
 
C
I
 
L
P
 
P
N
 
S
I
 
F
P
 
D
E
 
K
A
 
L
V
 
E
Q
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
C
I
 
I
N
 
R
A
 
R
L
 
L
I
 
I
D
 
E
V
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
D
W
 
W
F
 
V
P
 
P
R
 
D
Q
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
T
C
 
S
L
 
L
Y
|
Y
I
 
V
R
|
R
P
 
P
F
 
V
V
 
L
F
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
D
 
P
R
 
S
L
 
L
S
 
G
V
 
V
S
 
S
P
 
Q
A
 
P
N
x
T
Q
 
R
Y
 
A
T
 
L
F
 
L
C
 
F
V
 
V
V
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
S
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
-
 
P
G
 
G
K
 
G
N
 
S
L
 
V
N
 
T
A
 
P
I
 
V
R
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
A
T
 
D
T
 
P
Q
 
A
F
 
F
H
 
I
R
 
R
A
 
A
V
 
W
S
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
V
G
 
G
A
 
N
S
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
A
 
G
A
 
P
S
 
T
L
 
V
R
 
L
A
 
V
G
 
Q
K
 
Q
A
 
E
A
 
A
A
 
L
E
 
K
H
 
R
G
 
G
A
 
C
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
Y
 
W
L
 
L
D
 
Y
S
 
G
T
 
P
N
 
D
Q
 
H
Y
 
Q
I
 
L
E
 
T
E
|
E
V
 
V
G
 
G
A
 
T
M
 
M
N
 
N
H
 
I
F
 
F
-
 
V
-
 
Y
H
 
W
I
 
T
R
 
H
K
 
E
D
 
D
G
 
G
T
 
V
-
 
L
-
 
E
L
 
L
I
 
V
I
 
T
P
 
P
E
 
P
F
 
L
T
 
N
D
 
G
T
 
V
I
 
I
L
 
L
R
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
V
S
 
R
E
 
Q
S
 
S
I
 
L
L
 
L
A
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
E
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
C
 
F
E
 
R
V
 
V
R
 
V
Q
 
E
E
 
R
T
 
T
V
 
I
K
 
T
L
 
M
S
 
K
D
 
Q
F
 
L
I
 
L
A
 
R
D
 
A
I
 
L
E
 
E
A
 
E
G
 
G
E
 
R
I
 
V
V
 
R
E
 
E
A
 
V
G
 
F
G
 
G
F
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
x
C
V
 
Q
V
 
V
S
x
C
P
 
P
V
 
V
G
 
H
S
 
R
Y
 
I
I
 
L
F
 
Y
E
 
K
D
 
D
G
 
R
-
 
N
-
 
L
R
 
H
I
 
I
V
 
P
T
 
T
V
 
M
G
 
E
D
 
N
G
 
G
K
 
P
V
 
-
G
 
-
E
 
E
R
 
L
I
 
I
S
 
L
H
 
R
I
 
F
Y
 
Q
K
 
K
V
 
E
Y
 
L
T
 
K
E
 
E
M
 
I
Q
 
Q
K
 
Y
G
 
G
L
 
I
R
 
R

6jifB Crystal structures of branched-chain aminotransferase from pseudomonas sp. Uw4 (see paper)
36% identity, 93% coverage: 24:357/361 of query aligns to 6:334/334 of 6jifB

query
sites
6jifB
V
 
L
G
 
G
F
 
F
G
 
D
K
 
Y
L
 
I
R
 
K
T
 
T
D
 
D
H
 
K
M
 
R
F
 
Y
M
 
L
M
 
S
D
 
Y
Y
 
F
K
 
R
D
 
N
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
D
N
 
K
A
 
G
R
 
T
I
 
L
L
 
T
P
 
E
Y
 
D
G
 
N
P
 
V
F
 
L
E
 
H
M
 
I
M
 
S
P
 
E
G
 
G
A
 
S
M
 
T
A
 
A
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
S
 
Q
I
 
C
F
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
M
K
 
K
A
 
A
F
 
Y
M
 
R
H
 
C
D
 
K
D
 
D
G
 
G
E
 
S
I
 
I
Y
 
N
T
 
L
F
 
F
R
 
R
L
 
P
D
 
D
K
 
Q
N
 
N
A
 
A
Q
 
L
R
|
R
L
 
M
N
 
Q
R
 
R
S
 
S
A
 
C
D
 
A
I
 
R
V
 
L
C
 
L
I
 
M
P
 
P
N
 
Q
I
 
V
P
 
D
E
 
T
A
 
E
V
 
Q
Q
 
F
L
 
I
E
 
E
A
 
A
I
 
C
N
 
K
A
 
A
L
 
V
I
 
V
D
 
R
V
 
A
D
 
N
-
 
E
R
 
R
L
 
F
W
 
I
F
 
P
P
 
P
R
 
Y
Q
 
G
E
 
T
G
 
G
A
 
G
C
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
V
 
V
F
 
I
A
 
G
T
 
V
E
 
G
D
 
D
R
 
N
L
 
I
S
 
G
V
 
V
S
 
R
P
 
T
A
 
A
N
 
P
Q
 
E
Y
 
F
T
 
I
F
 
F
C
 
S
V
 
I
V
 
F
L
 
C
S
 
I
P
 
P
S
 
V
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
G
 
K
K
 
G
N
 
G
L
 
L
N
 
T
A
 
P
I
 
H
R
 
N
L
 
F
L
 
Q
I
 
I
T
 
S
T
 
S
Q
 
-
F
 
Y
H
 
D
R
|
R
A
 
A
V
 
A
S
 
P
G
 
Q
G
 
G
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
V
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
R
 
M
A
 
P
G
 
G
K
 
S
A
 
K
A
 
A
A
 
K
E
 
K
H
 
A
G
 
H
A
 
F
A
 
A
Q
 
D
V
 
A
L
 
I
Y
 
Y
L
 
L
D
 
D
S
 
P
-
 
M
T
 
T
N
 
H
Q
 
T
Y
 
K
I
 
I
E
 
E
E
|
E
V
 
V
G
 
G
A
x
S
M
x
A
N
|
N
H
 
F
F
 
F
H
 
G
I
 
I
R
 
T
K
 
H
D
 
D
G
 
N
T
 
K
L
 
F
I
 
V
I
 
T
P
 
P
E
 
N
F
 
-
T
 
S
D
 
P
T
 
S
I
 
V
L
|
L
R
 
P
S
x
G
I
|
I
T
|
T
S
 
R
E
 
L
S
 
S
I
 
L
L
 
I
A
 
E
L
 
L
G
 
A
E
 
K
-
 
T
E
 
R
L
 
L
G
 
G
C
 
M
E
 
E
V
 
V
R
 
V
Q
 
E
E
 
G
T
 
D
V
 
V
-
 
F
-
 
I
-
 
D
K
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
D
F
 
F
I
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
E
 
-
I
 
-
V
 
K
E
 
E
A
 
A
G