SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 7023023 FitnessBrowser__ANA3:7023023 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q46856 Alcohol dehydrogenase YqhD; EC 1.1.1.2 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
57% identity, 100% coverage: 1:384/385 of query aligns to 1:386/387 of Q46856

query
sites
Q46856
M
 
M
F
 
N
N
 
N
F
 
F
A
 
N
Y
 
L
Y
 
H
N
 
T
P
 
P
T
 
T
R
 
R
I
 
I
H
 
L
F
 
F
G
 
G
K
 
K
N
 
G
T
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
G
I
 
L
D
 
R
T
 
E
L
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
H
N
 
D
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
L
V
 
I
L
 
T
F
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
x
G
S
|
S
A
 
V
R
 
K
R
 
K
T
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
L
A
 
D
E
 
Q
V
 
V
K
 
L
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
K
N
 
G
R
 
M
F
 
D
V
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
F
E
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
P
 
P
N
 
N
P
 
P
T
 
A
Y
 
Y
E
 
E
T
 
T
L
 
L
M
 
M
Q
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
K
Q
 
L
V
 
V
R
 
R
E
 
E
L
 
Q
N
 
K
I
 
V
D
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
|
V
I
x
L
D
|
D
G
 
G
T
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
N
F
 
Y
E
 
P
G
 
E
-
 
N
-
 
I
E
 
D
P
 
P
W
 
W
D
 
H
I
 
I
L
 
L
T
 
Q
S
 
T
W
 
G
G
 
G
A
 
K
N
 
E
V
 
I
T
 
K
Q
 
S
A
 
A
M
 
I
P
 
P
F
 
M
G
 
G
S
 
C
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
 
L
P
 
P
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
S
N
|
N
N
 
A
A
 
G
S
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
S
R
 
R
K
 
K
S
 
T
L
 
T
K
 
G
A
 
D
K
|
K
L
 
Q
P
 
A
F
 
F
R
 
H
N
 
S
D
 
A
L
 
H
V
 
V
Y
 
Q
P
 
P
Q
 
V
F
 
F
S
 
A
I
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
V
K
x
Y
T
|
T
F
x
Y
T
|
T
L
 
L
P
 
P
E
 
P
R
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
F
V
 
V
H
|
H
I
 
T
T
 
V
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
Y
 
K
P
 
P
V
 
V
N
 
D
A
 
A
A
 
K
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
L
Q
 
L
I
 
T
L
 
L
I
 
I
E
 
E
L
 
D
G
 
G
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
V
R
 
R
A
 
A
N
 
N
L
 
V
M
 
M
W
 
W
V
 
A
A
 
A
T
 
T
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
W
 
W
A
 
A
T
 
T
H
|
H
M
 
M
I
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
E
L
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
M
Y
 
H
D
 
G
I
 
L
D
 
D
H
|
H
A
 
A
R
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
W
R
 
N
C
 
E
T
 
K
K
 
R
A
 
D
A
 
T
K
 
K
R
 
R
E
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
A
 
A
D
 
E
R
 
R
V
 
V
W
 
W
H
 
N
I
 
I
N
 
T
T
 
E
G
 
G
S
 
S
E
 
D
D
 
D
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
A
T
 
T
Q
 
R
A
 
N
F
 
F
F
 
F
E
 
E
S
 
Q
M
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
P
T
 
T
H
 
H
L
 
L
S
 
S
A
 
D
Y
 
Y
D
 
G
L
 
L
G
 
D
K
 
G
E
 
S
A
 
S
V
 
I
D
 
P
A
 
A
V
 
L
V
 
L
N
 
K
Q
 
K
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
M
 
M
V
 
T
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
 
N
G
 
H
N
 
D
I
 
I
D
 
T
P
 
L
T
 
D
M
 
V
S
 
S
R
 
R
D
 
R
I
 
I
L
 
Y
T
 
E
L
 
A
A
 
A

1oj7B Structural genomics, unknown function crystal structure of e. Coli k-12 yqhd (see paper)
57% identity, 99% coverage: 3:384/385 of query aligns to 6:389/390 of 1oj7B

query
sites
1oj7B
N
 
N
F
 
F
A
 
N
Y
 
L
Y
 
H
N
 
T
P
 
P
T
 
T
R
 
R
I
 
I
H
 
L
F
 
F
G
 
G
K
 
K
N
 
G
T
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
G
I
 
L
D
 
R
T
 
E
L
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
H
N
 
D
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
L
V
 
I
L
 
T
F
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
 
G
S
|
S
A
 
V
R
 
K
R
 
K
T
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
L
A
 
D
E
 
Q
V
 
V
K
 
L
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
K
N
 
G
R
 
M
F
 
D
V
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
F
E
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
P
|
P
N
|
N
P
 
P
T
 
A
Y
 
Y
E
 
E
T
 
T
L
 
L
M
 
M
Q
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
K
Q
 
L
V
 
V
R
 
R
E
 
E
L
 
Q
N
 
K
I
 
V
D
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
I
 
L
D
|
D
G
 
G
T
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
N
F
 
Y
E
 
P
G
 
E
-
 
N
-
 
I
E
 
D
P
 
P
W
 
W
D
 
H
I
 
I
L
 
L
T
 
Q
S
 
T
W
 
G
G
 
G
A
 
K
N
 
E
V
 
I
T
 
K
Q
 
S
A
 
A
M
 
I
P
 
P
F
 
M
G
 
G
S
 
C
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
|
L
P
 
P
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
S
N
 
N
N
 
A
A
x
G
S
 
A
V
|
V
V
 
I
T
 
S
R
 
R
K
 
K
S
 
T
L
 
T
K
 
G
A
 
D
K
|
K
L
 
Q
P
 
A
F
 
F
R
 
H
N
 
S
D
 
A
L
 
H
V
 
V
Y
 
Q
P
 
P
Q
 
V
F
 
F
S
 
A
I
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
V
K
 
Y
T
 
T
F
 
Y
T
|
T
L
|
L
P
|
P
E
 
P
R
 
R
Q
|
Q
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
F
V
 
V
H
|
H
I
 
T
T
 
V
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
Y
 
K
P
 
P
V
 
V
N
 
D
A
 
A
A
 
K
V
 
I
Q
 
H
D
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
L
Q
 
L
I
 
T
L
 
L
I
 
I
E
 
E
L
 
D
G
 
G
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
V
R
 
R
A
 
A
N
 
N
L
 
V
M
 
M
W
 
W
V
 
A
A
 
A
T
 
T
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
W
 
W
A
 
A
T
 
T
H
|
H
M
 
M
I
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
E
L
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
M
Y
 
H
D
 
G
I
 
L
D
 
D
H
|
H
A
 
A
R
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
W
R
 
N
C
 
E
T
 
K
K
 
R
A
 
D
A
 
T
K
 
K
R
 
R
E
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
A
 
A
D
 
E
R
 
R
V
 
V
W
 
W
H
 
N
I
 
I
N
 
T
T
 
E
G
 
G
S
 
S
E
 
D
D
 
D
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
A
T
 
T
Q
 
R
A
 
N
F
 
F
F
 
F
E
 
E
S
 
Q
M
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
P
T
 
T
H
 
H
L
 
L
S
 
S
A
 
D
Y
 
Y
D
 
G
L
 
L
G
 
D
K
 
G
E
 
S
A
 
S
V
 
I
D
 
P
A
 
A
V
 
L
V
 
L
N
 
K
Q
 
K
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
M
 
M
V
 
T
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
 
N
G
 
H
N
 
D
I
 
I
D
 
T
P
 
L
T
 
D
M
 
V
S
 
S
R
 
R
D
 
R
I
 
I
L
 
Y
T
 
E
L
 
A
A
 
A

1oj7A Structural genomics, unknown function crystal structure of e. Coli k-12 yqhd (see paper)
57% identity, 99% coverage: 3:384/385 of query aligns to 6:389/390 of 1oj7A

query
sites
1oj7A
N
 
N
F
 
F
A
 
N
Y
 
L
Y
 
H
N
 
T
P
 
P
T
 
T
R
 
R
I
 
I
H
 
L
F
 
F
G
 
G
K
 
K
N
 
G
T
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
G
I
 
L
D
 
R
T
 
E
L
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
H
N
 
D
A
 
A
R
 
R
V
 
V
M
 
L
V
 
I
L
 
T
F
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
 
G
S
|
S
A
 
V
R
 
K
R
 
K
T
 
T
G
 
G
T
 
V
L
 
L
A
 
D
E
 
Q
V
 
V
K
 
L
Q
 
D
A
 
A
L
 
L
G
 
K
N
 
G
R
 
M
F
 
D
V
 
V
V
 
L
E
 
E
F
 
F
E
 
G
G
 
G
I
 
I
E
 
E
P
|
P
N
|
N
P
 
P
T
 
A
Y
 
Y
E
 
E
T
 
T
L
 
L
M
 
M
Q
 
N
A
 
A
V
 
V
E
 
K
Q
 
L
V
 
V
R
 
R
E
 
E
L
 
Q
N
 
K
I
 
V
D
 
T
F
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
I
 
L
D
|
D
G
 
G
T
 
T
K
 
K
F
 
F
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
N
F
 
Y
E
 
P
G
 
E
-
 
N
-
 
I
E
 
D
P
 
P
W
 
W
D
 
H
I
 
I
L
 
L
T
 
Q
S
 
T
W
 
G
G
 
G
A
 
K
N
 
E
V
 
I
T
 
K
Q
 
S
A
 
A
M
 
I
P
 
P
F
 
M
G
 
G
S
 
C
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
|
L
P
 
P
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
S
N
|
N
N
 
A
A
x
G
S
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
S
R
 
R
K
 
K
S
 
T
L
 
T
K
 
G
A
 
D
K
|
K
L
 
Q
P
 
A
F
 
F
R
 
H
N
 
S
D
 
A
L
 
H
V
 
V
Y
 
Q
P
 
P
Q
 
V
F
 
F
S
 
A
I
 
V
L
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
V
K
 
Y
T
 
T
F
 
Y
T
|
T
L
|
L
P
 
P
E
 
P
R
 
R
Q
|
Q
V
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
F
V
 
V
H
|
H
I
 
T
T
 
V
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
V
T
 
T
Y
 
K
P
 
P
V
 
V
N
 
D
A
 
A
A
 
K
V
 
I
Q
 
H
D
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
L
Q
 
L
I
 
T
L
 
L
I
 
I
E
 
E
L
 
D
G
 
G
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
N
Y
 
Y
D
 
D
I
 
V
R
 
R
A
 
A
N
 
N
L
 
V
M
 
M
W
 
W
V
 
A
A
 
A
T
 
T
M
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
H
 
Q
D
 
D
W
 
W
A
 
A
T
 
T
H
|
H
M
 
M
I
 
L
G
 
G
H
 
H
E
 
E
L
 
L
T
 
T
A
 
A
L
 
M
Y
 
H
D
 
G
I
 
L
D
 
D
H
|
H
A
 
A
R
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
W
R
 
N
C
 
E
T
 
K
K
 
R
A
 
D
A
 
T
K
 
K
R
 
R
E
 
A
K
 
K
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
F
 
Y
A
 
A
D
 
E
R
 
R
V
 
V
W
 
W
H
 
N
I
 
I
N
 
T
T
 
E
G
 
G
S
 
S
E
 
D
D
 
D
E
 
E
R
 
R
I
 
I
E
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
A
T
 
T
Q
 
R
A
 
N
F
 
F
F
 
F
E
 
E
S
 
Q
M
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
P
T
 
T
H
 
H
L
 
L
S
 
S
A
 
D
Y
 
Y
D
 
G
L
 
L
G
 
D
K
 
G
E
 
S
A
 
S
V
 
I
D
 
P
A
 
A
V
 
L
V
 
L
N
 
K
Q
 
K
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
H
 
H
G
 
G
M
 
M
V
 
T
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
E
H
 
N
G
 
H
N
 
D
I
 
I
D
 
T
P
 
L
T
 
D
M
 
V
S
 
S
R
 
R
D
 
R
I
 
I
L
 
Y
T
 
E
L
 
A
A
 
A

7w9yA Crystal structure of bacillus subtilis yugj in complex with NADP and nickel (see paper)
39% identity, 99% coverage: 1:383/385 of query aligns to 3:384/389 of 7w9yA

query
sites
7w9yA
M
 
M
F
 
H
N
 
N
F
 
F
A
 
T
Y
 
Y
Y
 
W
N
 
N
P
 
P
T
 
T
R
 
K
I
 
L
H
 
I
F
 
F
G
 
G
K
 
R
N
 
G
T
 
E
I
 
V
A
 
E
E
 
R
I
 
L
-
 
P
D
 
E
T
 
E
L
 
L
V
 
K
P
 
S
R
 
Y
N
 
G
A
 
K
R
 
N
V
 
V
M
 
L
V
 
L
L
 
V
F
 
Y
G
|
G
G
|
G
S
 
G
S
|
S
A
 
I
R
 
K
R
 
R
T
 
S
G
 
G
T
 
L
L
 
Y
A
 
D
E
 
Q
V
 
V
K
 
I
Q
 
E
A
 
Q
L
 
L
G
 
N
N
 
K
R
 
A
F
 
G
V
 
V
V
 
T
-
 
V
-
 
H
E
 
E
F
 
L
E
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
E
P
|
P
N
|
N
P
 
P
T
 
R
Y
 
V
E
 
S
T
 
T
L
 
V
M
 
N
Q
 
K
A
 
G
V
 
V
E
 
A
Q
 
L
V
 
C
R
 
K
E
 
E
L
 
H
N
 
H
I
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
C
T
 
T
K
 
K
F
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
A
V
 
K
F
 
Y
E
 
D
G
 
G
E
 
D
P
 
A
W
 
W
D
 
D
I
 
I
L
 
V
T
 
T
S
 
K
W
 
-
G
 
K
A
 
H
N
 
Q
V
 
P
T
 
K
Q
 
D
A
 
A
M
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
S
 
T
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
|
L
P
 
A
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
 
N
N
 
S
A
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
I
T
 
T
R
 
N
K
 
W
S
 
E
L
 
T
K
 
K
A
 
E
K
|
K
L
 
Y
P
 
G
F
 
W
R
 
G
N
 
S
D
 
P
L
 
L
V
 
V
Y
 
F
P
 
P
Q
 
K
F
 
F
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
V
K
 
N
T
 
T
F
 
F
T
|
T
L
x
V
P
|
P
E
 
K
R
 
N
Q
x
H
V
 
T
A
 
I
N
 
Y
G
 
G
V
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
M
F
 
M
V
 
S
H
 
H
I
 
V
T
 
F
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
F
T
 
H
Y
 
H
P
 
V
V
 
S
N
 
N
A
 
T
A
 
P
V
 
Y
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
F
 
M
A
 
C
E
 
E
G
 
S
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
I
 
T
L
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
T
G
 
A
P
 
P
Q
 
K
A
 
L
L
 
I
T
 
N
Q
 
D
P
 
L
E
 
E
D
 
N
Y
 
Y
D
 
E
I
 
L
R
 
R
A
 
E
N
 
T
L
 
I
M
 
L
W
 
Y
V
 
T
A
 
G
T
 
T
M
 
I
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
M
I
 
L
A
 
S
T
 
M
G
 
G
V
 
A
P
 
R
H
 
G
D
 
D
W
 
W
A
 
A
T
 
T
H
 
H
M
 
N
I
 
I
G
 
E
H
 
H
E
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
L
 
V
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
D
 
P
H
|
H
A
 
A
R
 
G
T
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
L
L
 
F
P
 
P
A
 
N
L
 
W
L
 
M
R
 
R
C
 
H
T
 
T
K
 
L
A
 
S
A
 
E
K
 
N
R
 
P
E
 
A
K
 
R
L
 
M
L
 
K
Q
 
Q
F
 
L
A
 
A
D
 
V
R
 
R
V
 
V
W
 
F
H
 
G
I
 
V
-
 
E
N
 
E
T
 
A
G
 
G
S
 
K
E
 
T
D
 
D
E
 
K
R
 
E
I
 
V
E
 
A
-
 
L
A
 
E
A
 
G
I
 
I
A
 
D
K
 
K
T
 
L
Q
 
S
A
 
A
F
 
F
F
 
W
E
 
T
S
 
S
M
 
L
G
 
G
I
 
A
A
 
P
T
 
N
H
 
R
L
 
L
S
 
A
A
 
D
Y
 
Y
D
 
D
L
 
I
G
 
N
K
 
D
E
 
E
A
 
Q
V
 
L
D
 
D
A
 
T
V
 
I
V
 
A
N
 
D
Q
 
K
L
 
-
E
 
-
Q
 
-
H
 
-
G
 
-
M
 
A
V
 
M
A
 
A
L
 
N
G
 
G
E
 
T
H
 
F
G
 
G
N
 
Q
I
 
F
D
 
K
P
 
S
T
 
L
M
 
N
S
 
K
R
 
E
D
 
D
I
 
V
L
 
L
T
 
A
L
 
I

7w9zA Crystal structure of bacillus subtilis yugj in complex with NADP and nitrate (see paper)
41% identity, 92% coverage: 3:357/385 of query aligns to 2:360/381 of 7w9zA

query
sites
7w9zA
N
 
N
F
 
F
A
 
T
Y
 
Y
Y
 
W
N
 
N
P
 
P
T
 
T
R
 
K
I
 
L
H
 
I
F
 
F
G
 
G
K
 
R
N
 
G
T
 
E
I
 
V
A
 
E
E
 
R
I
 
L
-
 
P
D
 
E
T
 
E
L
 
L
V
 
K
P
 
S
R
 
Y
N
 
G
A
 
K
R
 
N
V
 
V
M
 
L
V
 
L
L
 
V
F
 
Y
G
|
G
G
|
G
S
 
G
S
|
S
A
 
I
R
 
K
R
 
R
T
 
S
G
 
G
T
 
L
L
 
Y
A
 
D
E
 
Q
V
 
V
K
 
I
Q
 
E
A
 
Q
L
 
L
G
 
N
N
 
K
R
 
A
F
 
G
V
 
V
V
 
T
-
 
V
-
 
H
E
 
E
F
 
L
E
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
E
P
|
P
N
 
N
P
 
P
T
x
R
Y
x
V
E
x
S
T
 
T
L
 
V
M
 
N
Q
 
K
A
 
G
V
 
V
E
 
A
Q
 
L
V
 
C
R
 
K
E
 
E
L
 
H
N
 
H
I
 
I
D
 
D
F
 
F
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
I
 
I
D
|
D
G
 
C
T
 
T
K
 
K
F
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
A
V
 
K
F
 
Y
E
 
D
G
 
G
E
 
D
P
 
A
W
 
W
D
 
D
I
 
I
L
 
V
T
 
T
S
 
K
W
 
-
G
 
K
A
 
H
N
 
Q
V
 
P
T
 
K
Q
 
D
A
 
A
M
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
S
 
T
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
|
L
P
 
A
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
|
N
N
 
S
A
x
G
S
 
S
V
|
V
V
 
I
T
 
T
R
x
N
K
x
W
S
x
E
L
 
T
K
 
K
A
 
E
K
|
K
L
 
Y
P
 
G
F
 
W
R
 
G
N
 
S
D
 
P
L
 
L
V
 
V
Y
 
F
P
 
P
Q
 
K
F
 
F
S
 
S
I
 
I
L
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
V
K
 
N
T
 
T
F
 
F
T
|
T
L
x
V
P
|
P
E
 
K
R
 
N
Q
x
H
V
 
T
A
 
I
N
 
Y
G
 
G
V
 
M
V
 
V
D
 
D
A
 
M
F
 
M
V
 
S
H
 
H
I
 
V
T
 
F
E
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
F
T
 
H
Y
 
H
P
 
V
V
 
S
N
 
N
A
 
T
A
 
P
V
 
Y
Q
 
Q
D
 
D
R
 
R
F
 
M
A
 
C
E
 
E
G
 
S
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
I
 
T
L
 
V
I
 
I
E
 
E
L
 
T
G
 
A
P
 
P
Q
 
K
A
 
L
L
 
I
T
 
N
Q
 
D
P
 
L
E
 
E
D
 
N
Y
 
Y
D
 
E
I
 
L
R
 
R
A
 
E
N
 
T
L
 
I
M
 
L
W
 
Y
V
 
T
A
 
G
T
 
T
M
 
I
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
M
I
 
L
A
 
S
T
 
M
G
 
G
V
 
A
P
 
R
H
 
G
D
 
D
W
|
W
A
 
A
T
 
T
H
 
H
M
 
N
I
 
I
G
 
E
H
|
H
E
 
A
L
 
V
T
 
S
A
 
A
L
 
V
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
D
 
P
H
|
H
A
 
A
R
 
G
T
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
L
L
 
F
P
 
P
A
 
N
L
 
W
L
 
M
R
 
R
C
 
H
T
 
T
K
 
L
A
 
S
A
 
E
K
 
N
R
 
P
E
 
A
K
 
R
L
 
M
L
 
K
Q
 
Q
F
 
L
A
 
A
D
 
V
R
 
R
V
 
V
W
 
F
H
 
G
I
 
V
-
 
E
N
 
E
T
 
A
G
 
G
S
 
K
E
 
T
D
 
D
E
 
K
R
 
E
I
 
V
E
 
A
-
 
L
A
 
E
A
 
G
I
 
I
A
 
D
K
 
K
T
 
L
Q
 
S
A
 
A
F
 
F
F
 
W
E
 
T
S
 
S
M
 
L
G
 
G
I
 
A
A
 
P
T
 
N
H
 
R
L
 
L
S
 
A
A
 
D
Y
 
Y
D
 
D
L
 
I
G
 
N
K
 
D
E
 
E
A
 
Q
V
 
L
D
 
D
A
 
T
V
 
I
V
 
A
N
 
D
Q
 
K

8i29A Crystal structure of butanol dehydrogenase a (yqdh) in complex with nadh from fusobacterium nucleatum
35% identity, 90% coverage: 3:349/385 of query aligns to 2:349/384 of 8i29A

query
sites
8i29A
N
 
N
F
 
F
A
 
N
Y
 
Y
Y
 
K
N
 
N
P
 
D
T
 
T
R
 
K
I
 
I
H
 
I
F
 
F
G
 
G
K
 
K
N
 
D
T
 
N
I
 
Y
A
 
S
E
 
E
I
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
I
D
 
K
T
 
I
L
 
F
V
 
S
P
 
K
R
 
K
N
 
T
A
 
P
R
 
K
V
 
I
M
 
L
V
 
L
L
 
H
F
 
Y
-
 
E
-
 
A
G
 
D
G
 
G
S
 
E
S
 
L
A
 
I
R
 
K
R
 
K
T
 
L
G
 
G
T
 
I
L
 
Y
A
 
E
E
 
K
V
 
V
K
 
I
Q
 
S
A
 
S
L
 
L
G
 
-
N
 
K
R
 
E
F
 
F
V
 
D
V
 
I
E
 
E
F
 
F
-
 
I
-
 
E
-
 
L
E
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
V
P
 
P
N
 
N
P
 
P
T
 
R
Y
 
L
E
 
S
T
 
L
L
 
V
M
 
Y
Q
 
E
A
 
G
V
 
I
E
 
K
Q
 
I
V
 
C
R
 
K
E
 
E
L
 
E
N
 
N
I
 
I
D
 
T
F
 
F
L
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
x
A
S
 
S
V
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
S
T
 
A
K
 
K
F
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
L
A
 
G
A
 
A
V
 
V
F
 
D
E
 
N
G
 
G
E
 
D
P
 
V
W
 
W
D
 
D
I
 
F
L
 
F
T
 
T
S
 
A
W
 
-
G
 
-
A
 
K
N
 
R
V
 
I
T
 
P
Q
 
Q
-
 
D
A
 
T
M
 
L
P
 
G
F
 
I
G
 
G
S
 
V
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
x
I
P
 
P
A
 
G
T
x
A
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
M
N
x
S
N
 
E
A
x
S
S
 
S
V
x
I
V
 
I
T
 
T
R
 
D
K
 
E
S
 
N
L
 
K
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
L
 
A
P
 
V
F
 
C
R
 
D
N
 
T
D
 
E
L
 
V
V
 
N
Y
 
F
P
 
P
Q
 
K
F
 
F
S
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
N
P
 
P
T
 
E
K
 
V
T
 
C
F
 
Y
T
|
T
L
x
I
P
 
P
E
 
D
R
 
R
Q
x
L
V
 
M
A
 
A
N
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
I
F
 
L
V
 
S
H
 
H
I
 
L
T
 
M
E
|
E
Q
 
R
Y
 
Y
L
 
F
T
 
T
Y
 
K
P
 
S
V
 
I
N
 
D
A
 
T
A
 
A
V
 
L
Q
 
S
D
 
D
R
 
S
F
 
L
A
 
I
E
 
E
G
 
A
L
 
T
L
 
M
Q
 
K
I
 
I
L
 
V
I
 
I
E
 
K
L
 
Y
G
 
G
P
 
P
Q
 
L
A
 
L
L
 
M
T
 
K
Q
 
D
P
 
R
E
 
K
D
 
N
Y
 
Y
D
 
N
I
 
Y
R
 
C
A
 
S
N
 
Q
L
 
I
M
 
M
W
 
W
V
 
A
A
 
A
T
 
T
M
 
M
A
 
A
L
 
H
N
 
N
G
 
G
T
 
M
I
 
I
A
 
A
T
 
C
G
 
G
V
 
R
P
 
V
H
 
A
D
 
D
W
 
W
A
 
A
T
 
S
H
|
H
M
 
R
I
 
I
G
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
I
T
 
S
A
 
G
L
 
I
Y
 
Y
D
 
D
I
 
L
D
 
T
H
|
H
A
 
G
R
 
I
T
 
G
L
 
M
A
 
A
I
 
I
V
 
I
L
 
F
P
 
P
A
 
A
L
 
W
L
 
M
R
 
K
C
 
Y
T
 
T
K
 
K
A
 
N
A
 
I
K
 
R
R
 
P
E
 
Q
K
 
I
L
 
F
L
 
E
Q
 
K
F
 
F
A
 
F
D
 
K
R
 
E
V
 
V
W
 
F
H
 
-
I
 
-
N
 
N
T
 
T
G
 
V
S
 
N
E
 
I
D
 
D
E
 
E
R
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
G
I
 
I
A
 
N
K
 
K
T
 
L
Q
 
E
A
 
E
F
 
F
F
 
F
E
 
K
S
 
S
M
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
N
T
 
L
H
 
K
L
 
L
S
 
S
A
 
D
Y
 
Y
D
 
G
L
 
I
G
 
T
K
 
E
E
 
E

7fjgA Crystal structure of butanol dehydrogenase a (yqdh) in complex with partial nadh from fusobacterium nucleatum
35% identity, 90% coverage: 3:349/385 of query aligns to 2:349/384 of 7fjgA

query
sites
7fjgA
N
 
N
F
 
F
A
 
N
Y
 
Y
Y
 
K
N
 
N
P
 
D
T
 
T
R
 
K
I
 
I
H
 
I
F
 
F
G
 
G
K
 
K
N
 
D
T
 
N
I
 
Y
A
 
S
E
 
E
I
 
I
-
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
I
D
 
K
T
 
I
L
 
F
V
 
S
P
 
K
R
 
K
N
 
T
A
 
P
R
 
K
V
 
I
M
 
L
V
 
L
L
 
H
F
 
Y
-
 
E
-
 
A
G
 
D
G
 
G
S
 
E
S
 
L
A
 
I
R
 
K
R
 
K
T
 
L
G
 
G
T
 
I
L
 
Y
A
 
E
E
 
K
V
 
V
K
 
I
Q
 
S
A
 
S
L
 
L
G
 
-
N
 
K
R
 
E
F
 
F
V
 
D
V
 
I
E
 
E
F
 
F
-
 
I
-
 
E
-
 
L
E
 
G
G
 
G
I
 
V
E
 
V
P
 
P
N
 
N
P
 
P
T
 
R
Y
 
L
E
 
S
T
 
L
L
 
V
M
 
Y
Q
 
E
A
 
G
V
 
I
E
 
K
Q
 
I
V
 
C
R
 
K
E
 
E
L
 
E
N
 
N
I
 
I
D
 
T
F
 
F
L
 
I
L
 
L
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
x
A
S
 
S
V
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
S
T
 
A
K
 
K
F
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
L
A
 
G
A
 
A
V
 
V
F
 
D
E
 
N
G
 
G
E
 
D
P
 
V
W
 
W
D
 
D
I
 
F
L
 
F
T
 
T
S
 
A
W
 
-
G
 
-
A
 
K
N
 
R
V
 
I
T
 
P
Q
 
Q
-
 
D
A
 
T
M
 
L
P
 
G
F
 
I
G
 
G
S
 
V
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
x
I
P
 
P
A
 
G
T
 
A
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
 
S
N
 
E
A
 
S
S
 
S
V
 
I
V
 
I
T
 
T
R
 
D
K
 
E
S
 
N
L
 
K
K
 
K
A
 
Q
K
 
K
L
 
A
P
 
V
F
 
C
R
 
D
N
 
T
D
 
E
L
 
V
V
 
N
Y
 
F
P
 
P
Q
 
K
F
 
F
S
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
N
P
 
P
T
 
E
K
 
V
T
 
C
F
 
Y
T
|
T
L
x
I
P
 
P
E
 
D
R
 
R
Q
 
L
V
 
M
A
 
A
N
 
A
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
D
A
 
I
F
 
L
V
 
S
H
 
H
I
 
L
T
 
M
E
|
E
Q
 
R
Y
 
Y
L
 
F
T
 
T
Y
 
K
P
 
S
V
 
I
N
 
D
A
 
T
A
 
A
V
 
L
Q
 
S
D
 
D
R
 
S
F
 
L
A
 
I
E
 
E
G
 
A
L
 
T
L
 
M
Q
 
K
I
 
I
L
 
V
I
 
I
E
 
K
L
 
Y
G
 
G
P
 
P
Q
 
L
A
 
L
L
 
M
T
 
K
Q
 
D
P
 
R
E
 
K
D
 
N
Y
 
Y
D
 
N
I
 
Y
R
 
C
A
 
S
N
 
Q
L
 
I
M
 
M
W
 
W
V
 
A
A
 
A
T
 
T
M
 
M
A
 
A
L
 
H
N
 
N
G
 
G
T
 
M
I
 
I
A
 
A
T
 
C
G
 
G
V
 
R
P
 
V
H
 
A
D
 
D
W
 
W
A
 
A
T
 
S
H
|
H
M
 
R
I
 
I
G
 
E
H
 
H
E
 
E
L
 
I
T
 
S
A
 
G
L
 
I
Y
 
Y
D
 
D
I
 
L
D
 
T
H
|
H
A
 
G
R
 
I
T
 
G
L
 
M
A
 
A
I
 
I
V
 
I
L
 
F
P
 
P
A
 
A
L
 
W
L
 
M
R
 
K
C
 
Y
T
 
T
K
 
K
A
 
N
A
 
I
K
 
R
R
 
P
E
 
Q
K
 
I
L
 
F
L
 
E
Q
 
K
F
 
F
A
 
F
D
 
K
R
 
E
V
 
V
W
 
F
H
 
-
I
 
-
N
 
N
T
 
T
G
 
V
S
 
N
E
 
I
D
 
D
E
 
E
R
 
-
I
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
G
I
 
I
A
 
N
K
 
K
T
 
L
Q
 
E
A
 
E
F
 
F
F
 
F
E
 
K
S
 
S
M
 
L
G
 
G
I
 
I
A
 
N
T
 
L
H
 
K
L
 
L
S
 
S
A
 
D
Y
 
Y
D
 
G
L
 
I
G
 
T
K
 
E
E
 
E

1vljB Crystal structure of nadh-dependent butanol dehydrogenase a (tm0820) from thermotoga maritima at 1.78 a resolution
36% identity, 93% coverage: 1:358/385 of query aligns to 6:365/400 of 1vljB

query
sites
1vljB
M
 
M
F
 
E
N
 
N
F
 
F
A
 
V
Y
 
F
Y
 
H
N
 
N
P
 
P
T
 
T
R
 
K
I
 
I
H
 
V
F
 
F
G
 
G
K
 
R
N
 
G
T
 
T
I
 
I
A
 
P
E
 
K
I
 
I
D
 
G
T
 
E
L
 
E
V
 
I
P
 
-
R
 
K
N
 
N
A
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
R
R
 
K
V
 
V
M
 
L
V
 
F
L
 
L
F
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
 
G
S
|
S
A
 
I
R
 
K
R
 
K
T
 
N
G
 
G
T
 
V
L
 
Y
A
 
D
E
 
Q
V
 
V
K
 
V
Q
 
D
A
 
S
L
 
L
G
 
K
N
 
K
R
 
H
F
 
G
V
 
I
-
 
E
-
 
W
V
 
V
E
 
E
F
 
V
E
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
K
P
|
P
N
 
N
P
 
P
T
 
V
Y
 
L
E
 
S
T
 
K
L
 
V
M
 
H
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
V
V
 
A
R
 
K
E
 
K
L
 
E
N
 
K
I
 
V
D
 
E
F
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
G
V
 
V
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
I
 
V
D
|
D
G
 
S
T
 
A
K
 
K
F
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
A
V
 
L
F
 
Y
E
 
E
G
 
G
E
 
D
P
 
I
W
 
W
D
 
D
I
 
A
L
 
F
T
 
I
S
 
G
W
 
-
G
 
K
A
 
Y
N
 
Q
V
 
I
T
 
E
Q
 
K
A
 
A
M
 
L
P
 
P
F
 
I
G
 
F
S
 
D
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
x
I
P
 
S
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
x
T
E
 
E
M
 
M
N
|
N
N
 
G
A
x
N
S
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
R
 
N
K
 
E
S
 
K
L
 
T
K
 
K
A
 
E
K
|
K
L
 
Y
P
 
G
F
 
V
R
 
S
N
 
S
D
 
K
L
 
A
V
 
L
Y
 
Y
P
 
P
Q
 
K
F
 
V
S
 
S
I
 
I
L
 
I
D
 
D
P
 
P
T
 
S
K
 
V
T
 
Q
F
 
F
T
|
T
L
|
L
P
 
P
E
 
K
R
 
E
Q
|
Q
V
 
T
A
 
V
N
 
Y
G
 
G
V
 
A
V
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
I
V
 
S
H
|
H
I
 
I
T
 
L
E
 
E
Q
 
Y
Y
 
Y
L
 
F
T
 
D
Y
 
-
P
 
G
V
 
S
N
 
S
A
 
P
A
 
E
V
 
I
Q
 
S
D
 
N
R
 
E
F
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
L
 
T
L
 
I
Q
 
R
I
 
T
L
 
I
I
 
M
E
 
K
L
 
M
G
 
T
P
 
E
Q
 
R
A
 
L
L
 
I
T
 
E
Q
 
K
P
 
P
E
 
D
D
 
D
Y
 
Y
D
 
E
I
 
A
R
 
R
A
 
A
N
 
N
L
 
L
M
 
A
W
 
W
V
 
S
A
 
A
T
 
T
M
 
I
A
 
A
L
 
L
N
 
N
G
 
G
T
 
T
I
 
M
A
 
A
T
 
V
G
 
G
-
 
R
V
 
R
P
 
G
H
 
G
D
 
E
W
 
W
A
 
A
T
 
C
H
|
H
M
 
R
I
 
I
G
 
E
H
 
H
E
 
S
L
 
L
T
 
S
A
 
A
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
D
 
A
H
|
H
A
 
G
R
 
A
T
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
F
P
 
P
A
 
A
L
 
W
L
 
M
R
 
K
C
 
Y
T
 
V
K
 
Y
A
 
R
A
 
K
K
 
N
R
 
P
E
 
A
K
 
Q
L
 
F
L
 
E
Q
 
R
F
 
F
A
 
A
D
 
K
R
 
K
V
 
I
W
 
F
H
 
G
I
 
F
N
 
E
T
 
-
G
 
G
S
 
E
E
 
G
D
 
E
E
 
E
R
 
L
I
 
I
E
 
L
A
 
K
A
 
G
I
 
I
A
 
E
K
 
A
T
 
F
Q
 
K
A
 
N
F
 
W
F
 
L
E
 
K
S
 
K
M
 
V
G
 
G
I
 
A
A
 
P
T
 
V
H
 
S
L
 
L
S
 
K
A
 
D
Y
 
A
D
 
G
L
 
I
G
 
P
K
 
E
E
 
E
A
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
K
V
 
I
V
 
V
N
 
D
Q
 
N
L
 
V

1vhdA Crystal structure of an iron containing alcohol dehydrogenase (see paper)
27% identity, 81% coverage: 4:316/385 of query aligns to 3:304/361 of 1vhdA

query
sites
1vhdA
F
 
W
A
 
E
Y
 
F
Y
 
Y
N
 
M
P
 
P
T
 
T
R
 
D
I
 
V
H
 
F
F
 
F
G
 
G
K
 
E
N
 
K
T
 
I
I
 
L
A
 
E
E
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
I
I
 
I
D
 
D
T
 
L
L
 
L
V
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
G
A
 
K
R
 
R
V
 
A
M
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
T
G
 
G
G
 
K
S
|
S
S
|
S
A
 
S
R
 
K
R
 
K
T
 
N
G
 
G
T
 
S
L
 
L
A
 
D
E
 
D
V
 
L
K
 
K
Q
 
K
A
 
L
L
 
L
G
 
D
N
 
E
R
 
T
F
 
E
V
 
I
V
 
S
E
 
Y
-
 
E
-
 
I
F
 
F
E
 
D
G
 
E
I
 
V
E
 
E
P
x
E
N
|
N
P
 
P
T
 
S
Y
 
F
E
 
D
T
 
N
L
 
V
M
 
M
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
R
V
 
Y
R
 
R
E
 
N
L
 
D
N
 
S
I
 
F
D
 
D
F
 
F
L
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
I
 
M
D
|
D
G
 
F
T
 
A
K
 
K
F
 
-
V
 
-
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
V
V
 
L
F
 
L
E
 
K
G
 
E
E
 
K
P
 
D
W
 
L
D
 
S
I
 
V
L
 
E
T
 
D
S
 
L
W
 
Y
G
 
D
-
 
R
A
 
E
N
 
K
V
 
V
T
 
K
Q
 
H
A
 
W
M
 
L
P
 
P
F
 
V
G
 
V
S
 
E
V
 
I
L
 
P
T
|
T
L
x
T
P
 
A
A
 
G
T
|
T
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
V
N
x
T
N
 
P
A
x
Y
S
 
S
V
x
I
V
 
L
T
 
T
R
 
D
K
 
P
S
 
E
L
 
G
K
 
N
A
x
K
K
 
R
L
 
-
P
 
-
F
 
-
R
 
G
N
 
C
D
 
T
L
 
L
V
 
M
Y
 
F
P
 
P
Q
 
V
F
 
Y
S
 
A
I
 
F
L
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
R
K
 
Y
T
 
T
F
 
Y
T
x
S
L
x
M
P
 
S
E
 
D
R
 
E
Q
x
L
V
 
T
A
 
L
N
 
S
G
 
T
V
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
L
V
 
S
H
|
H
I
 
A
T
 
V
E
 
E
Q
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
Y
 
R
P
 
K
V
 
-
N
 
S
A
 
T
A
 
P
V
 
P
Q
 
S
D
 
D
R
 
A
F
 
L
A
 
A
E
 
I
G
 
E
L
 
A
L
 
M
Q
 
K
I
 
I
L
 
I
I
 
H
E
 
R
L
 
N
G
 
L
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
L
 
I
T
 
E
Q
 
G
P
 
N
E
 
R
D
 
E
Y
 
A
D
 
R
I
 
K
R
 
K
A
 
-
N
 
-
L
 
-
M
 
M
W
 
F
V
 
V
A
 
A
T
 
S
M
 
C
A
 
L
L
 
A
N
 
G
G
 
M
T
 
V
I
 
I
A
 
A
-
 
Q
T
 
T
G
 
G
V
 
T
P
 
T
H
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
L
T
 
A
H
|
H
M
 
A
I
 
L
G
 
G
H
 
Y
E
 
P
L
 
L
T
 
T
A
 
T
L
 
E
Y
 
K
D
 
G
I
 
I
D
 
K
H
|
H
A
 
G
R
 
K
T
 
A
L
 
T
A
 
G
I
 
M
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
F
L
 
V
L
 
M
R
 
E
C
 
V
T
 
M
K
 
K
A
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
E
K
 
E
L
 
I
L
 
P
Q
 
E
F
 
K
A
 
V
D
 
D
R
 
T
V
 
V
W
 
N
H
 
H
I
 
I
N
 
F
T
 
G
G
 
G
S
 
S

1o2dA Crystal structure of alcohol dehydrogenase, iron-containing (tm0920) from thermotoga maritima at 1.30 a resolution (see paper)
27% identity, 81% coverage: 4:316/385 of query aligns to 2:303/359 of 1o2dA

query
sites
1o2dA
F
 
W
A
 
E
Y
 
F
Y
 
Y
N
 
M
P
 
P
T
 
T
R
 
D
I
 
V
H
 
F
F
 
F
G
 
G
K
 
E
N
 
K
T
 
I
I
 
L
A
 
E
E
 
K
-
 
R
-
 
G
-
 
N
-
 
I
I
 
I
D
 
D
T
 
L
L
 
L
V
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
G
A
 
K
R
 
R
V
 
A
M
 
L
V
 
V
L
 
V
F
 
T
G
 
G
G
 
K
S
|
S
S
|
S
A
 
S
R
 
K
R
 
K
T
 
N
G
 
G
T
 
S
L
 
L
A
 
D
E
 
D
V
 
L
K
 
K
Q
 
K
A
 
L
L
 
L
G
 
D
N
 
E
R
 
T
F
 
E
V
 
I
V
 
S
E
 
Y
-
 
E
-
 
I
F
 
F
E
 
D
G
 
E
I
 
V
E
 
E
P
x
E
N
|
N
P
 
P
T
 
S
Y
 
F
E
 
D
T
 
N
L
 
V
M
 
M
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
Q
 
R
V
 
Y
R
 
R
E
 
N
L
 
D
N
 
S
I
 
F
D
 
D
F
 
F
L
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
I
 
M
D
|
D
G
 
F
T
 
A
K
 
K
F
 
-
V
 
-
A
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
V
V
 
L
F
 
L
E
 
K
G
 
E
E
 
K
P
 
D
W
 
L
D
 
S
I
 
V
L
 
E
T
 
D
S
 
L
W
 
Y
G
 
D
-
 
R
A
 
E
N
 
K
V
 
V
T
 
K
Q
 
H
A
 
W
M
 
L
P
 
P
F
 
V
G
 
V
S
 
E
V
 
I
L
 
P
T
|
T
L
x
T
P
 
A
A
 
G
T
|
T
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
V
N
 
T
N
 
P
A
x
Y
S
 
S
V
x
I
V
 
L
T
 
T
R
 
D
K
 
P
S
 
E
L
 
G
K
 
N
A
x
K
K
 
R
L
 
-
P
 
-
F
 
-
R
 
G
N
 
C
D
 
T
L
 
L
V
 
M
Y
 
F
P
 
P
Q
 
V
F
 
Y
S
 
A
I
 
F
L
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
R
K
 
Y
T
 
T
F
 
Y
T
x
S
L
x
M
P
 
S
E
 
D
R
 
E
Q
x
L
V
 
T
A
 
L
N
 
S
G
 
T
V
 
G
V
 
V
D
|
D
A
 
A
F
 
L
V
 
S
H
|
H
I
 
A
T
 
V
E
 
E
Q
 
G
Y
 
Y
L
 
L
T
 
S
Y
 
R
P
 
K
V
 
-
N
 
S
A
 
T
A
 
P
V
 
P
Q
 
S
D
 
D
R
 
A
F
 
L
A
 
A
E
 
I
G
 
E
L
 
A
L
 
M
Q
 
K
I
 
I
L
 
I
I
 
H
E
 
R
L
 
N
G
 
L
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
L
 
I
T
 
E
Q
 
G
P
 
N
E
 
R
D
 
E
Y
 
A
D
 
R
I
 
K
R
 
K
A
 
-
N
 
-
L
 
-
M
 
M
W
 
F
V
 
V
A
 
A
T
 
S
M
 
C
A
 
L
L
 
A
N
 
G
G
 
M
T
 
V
I
 
I
A
 
A
-
 
Q
T
 
T
G
 
G
V
 
T
P
 
T
H
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
L
T
 
A
H
|
H
M
 
A
I
 
L
G
 
G
H
 
Y
E
 
P
L
 
L
T
 
T
A
 
T
L
 
E
Y
 
K
D
 
G
I
 
I
D
 
K
H
|
H
A
 
G
R
 
K
T
 
A
L
 
T
A
 
G
I
 
M
V
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
F
L
 
V
L
 
M
R
 
E
C
 
V
T
 
M
K
 
K
A
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
E
 
E
K
 
E
L
 
I
L
 
P
Q
 
E
F
 
K
A
 
V
D
 
D
R
 
T
V
 
V
W
 
N
H
 
H
I
 
I
N
 
F
T
 
G
G
 
G
S
 
S

6jkpA Crystal structure of sulfoacetaldehyde reductase from bifidobacterium kashiwanohense in complex with NAD+ (see paper)
24% identity, 78% coverage: 6:306/385 of query aligns to 6:303/376 of 6jkpA

query
sites
6jkpA
Y
 
Y
Y
 
A
N
 
Q
P
 
P
T
 
V
R
 
T
I
 
I
H
 
R
F
 
F
G
 
G
K
 
K
N
 
G
T
 
R
I
 
A
A
 
M
E
 
E
I
 
I
D
 
K
T
 
D
L
 
I
V
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
A
R
 
E
V
 
A
M
 
M
V
 
G
L
 
L
F
 
H
G
 
D
G
 
G
S
 
I
S
 
M
A
 
V
R
 
T
-
 
P
-
 
K
-
 
F
-
x
F
-
 
V
R
 
D
T
 
S
G
 
G
T
 
E
L
 
A
A
 
Q
E
 
R
V
 
L
K
 
I
Q
 
D
A
 
A
L
 
S
G
 
D
N
 
G
R
 
A
F
 
V
V
 
S
V
 
T
E
 
V
F
 
F
E
 
T
G
 
D
I
 
F
E
 
S
P
 
P
N
 
N
P
 
P
T
 
D
Y
 
V
E
 
T
T
 
E
L
 
V
M
 
D
Q
 
A
A
 
C
V
 
A
E
 
E
Q
 
I
V
 
I
R
 
R
E
 
K
L
 
N
N
 
H
I
 
C
D
 
E
F
 
F
L
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
M
G
 
G
G
 
G
G
|
G
S
 
S
V
 
A
I
 
M
D
|
D
G
 
V
T
 
S
K
 
K
F
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
I
A
 
C
V
 
L
F
 
T
E
 
D
G
 
D
E
 
S
P
 
I
W
 
A
D
 
D
I
 
Y
L
 
H
T
 
G
S
 
T
W
 
G
G
 
K
A
 
A
N
 
M
V
 
P
T
 
Q
Q
 
K
A
 
H
M
 
L
P
 
P
F
 
I
G
 
I
S
 
A
V
 
L
L
 
P
T
|
T
L
x
T
P
 
A
A
 
G
T
|
T
G
 
G
S
|
S
E
 
E
M
 
V
N
x
T
N
 
C
A
 
V
S
 
S
V
 
V
V
 
L
T
 
T
R
 
N
K
 
R
S
 
K
L
 
L
K
 
G
A
 
K
K
 
K
L
 
A
P
 
P
F
 
I
R
 
V
N
 
S
D
 
D
L
 
G
V
 
F
Y
 
F
P
 
P
Q
 
S
F
 
V
S
 
A
I
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
P
T
 
E
K
 
L
T
 
T
F
 
Y
T
x
S
L
x
V
P
|
P
E
 
P
R
 
K
Q
 
I
V
 
T
A
 
A
N
 
S
G
 
T
V
 
G
V
 
M
D
 
D
A
 
V
F
 
L
V
 
S
H
 
Q
I
 
A
T
 
I
E
 
E
Q
 
G
Y
 
F
L
 
W
T
 
S
Y
 
K
P
 
G
V
 
-
N
 
H
A
 
Q
A
 
P
V
 
I
Q
 
C
D
 
D
R
 
S
F
 
C
A
 
A
E
 
A
G
 
H
L
 
A
L
 
A
Q
 
K
I
 
L
L
 
V
I
 
F
E
 
K
L
 
Y
G
 
L
P
 
P
Q
 
I
A
 
A
L
 
V
T
 
A
Q
 
E
P
 
P
E
 
H
D
 
N
Y
 
E
D
 
E
I
 
A
R
 
R
A
 
E
N
 
K
L
 
M
M
 
C
W
 
E
V
 
A
A
 
S
T
 
V
M
 
I
A
 
A
L
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
G
I
 
L
A
 
A
T
 
F
G
 
T
V
 
L
P
 
P
H
 
K
D
 
T
W
 
T
A
 
S
T
 
S
H
 
H
M
 
A
I
 
C
G
 
S
H
 
F
E
 
P
L
 
L
T
 
T
A
 
N
L
 
I
Y
 
H
D
 
G
I
 
I
D
 
P
H
 
H
A
 
G
R
 
E
T
 
A
L
 
C
A
 
G
I
 
L
V
 
T
L
 
L
P
 
D
A
 
Y
L
 
F
L
 
A
R
 
R
C
 
I
T
 
N
K
 
K
A
 
D
A
 
A
K
 
Q
R
 
H
E
 
G
K
 
R
L
 
V
L
 
Q
Q
 
E
F
 
F
A
 
A

6jkoA Crystal structure of sulfoacetaldehyde reductase from bifidobacterium kashiwanohense (see paper)
24% identity, 78% coverage: 6:306/385 of query aligns to 6:303/376 of 6jkoA

query
sites
6jkoA
Y
 
Y
Y
 
A
N
 
Q
P
 
P
T
 
V
R
 
T
I
 
I
H
 
R
F
 
F
G
 
G
K
 
K
N
 
G
T
 
R
I
 
A
A
 
M
E
 
E
I
 
I
D
 
K
T
 
D
L
 
I
V
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
A
R
 
E
V
 
A
M
 
M
V
 
G
L
 
L
F
 
H
G
 
D
G
 
G
S
 
I
S
 
M
A
 
V
R
 
T
-
 
P
-
 
K
-
 
F
-
 
F
-
 
V
R
 
D
T
 
S
G
 
G
T
 
E
L
 
A
A
 
Q
E
 
R
V
 
L
K
 
I
Q
 
D
A
 
A
L
 
S
G
 
D
N
 
G
R
 
A
F
 
V
V
 
S
V
 
T
E
 
V
F
 
F
E
 
T
G
 
D
I
 
F
E
 
S
P
 
P
N
 
N
P
 
P
T
 
D
Y
 
V
E
 
T
T
 
E
L
 
V
M
 
D
Q
 
A
A
 
C
V
 
A
E
 
E
Q
 
I
V
 
I
R
 
R
E
 
K
L
 
N
N
 
H
I
 
C
D
 
E
F
 
F
L
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
A
I
 
M
D
 
D
G
 
V
T
 
S
K
 
K
F
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
S
A
 
I
A
 
C
V
 
L
F
 
T
E
 
D
G
 
D
E
 
S
P
 
I
W
 
A
D
 
D
I
 
Y
L
 
H
T
 
G
S
 
T
W
 
G
G
 
K
A
 
A
N
 
M
V
 
P
T
 
Q
Q
 
K
A
 
H
M
 
L
P
 
P
F
 
I
G
 
I
S
 
A
V
 
L
L
 
P
T
 
T
L
 
T
P
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
V
N
 
T
N
 
C
A
 
V
S
 
S
V
 
V
V
 
L
T
 
T
R
 
N
K
 
R
S
 
K
L
 
L
K
 
G
A
 
K
K
 
K
L
 
A
P
 
P
F
 
I
R
 
V
N
 
S
D
 
D
L
 
G
V
 
F
Y
 
F
P
 
P
Q
 
S
F
 
V
S
 
A
I
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
P
T
 
E
K
 
L
T
 
T
F
 
Y
T
 
S
L
 
V
P
 
P
E
 
P
R
 
K
Q
 
I
V
 
T
A
 
A
N
 
S
G
 
T
V
 
G
V
 
M
D
|
D
A
 
V
F
 
L
V
 
S
H
 
Q
I
 
A
T
 
I
E
 
E
Q
 
G
Y
 
F
L
 
W
T
 
S
Y
 
K
P
 
G
V
 
-
N
 
H
A
 
Q
A
 
P
V
 
I
Q
 
C
D
 
D
R
 
S
F
 
C
A
 
A
E
 
A
G
 
H
L
 
A
L
 
A
Q
 
K
I
 
L
L
 
V
I
 
F
E
 
K
L
 
Y
G
 
L
P
 
P
Q
 
I
A
 
A
L
 
V
T
 
A
Q
 
E
P
 
P
E
 
H
D
 
N
Y
 
E
D
 
E
I
 
A
R
 
R
A
 
E
N
 
K
L
 
M
M
 
C
W
 
E
V
 
A
A
 
S
T
 
V
M
 
I
A
 
A
L
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
G
I
 
L
A
 
A
T
 
F
G
 
T
V
 
L
P
 
P
H
 
K
D
 
T
W
 
T
A
 
S
T
 
S
H
|
H
M
 
A
I
 
C
G
 
S
H
 
F
E
 
P
L
 
L
T
 
T
A
 
N
L
 
I
Y
 
H
D
 
G
I
 
I
D
 
P
H
|
H
A
 
G
R
 
E
T
 
A
L
 
C
A
 
G
I
 
L
V
 
T
L
 
L
P
 
D
A
 
Y
L
 
F
L
 
A
R
 
R
C
 
I
T
 
N
K
 
K
A
 
D
A
 
A
K
 
Q
R
 
H
E
 
G
K
 
R
L
 
V
L
 
Q
Q
 
E
F
 
F
A
 
A

3zdrA Structure of the alcohol dehydrogenase (adh) domain of a bifunctional adhe dehydrogenase from geobacillus thermoglucosidasius ncimb 11955 (see paper)
24% identity, 91% coverage: 9:360/385 of query aligns to 8:372/403 of 3zdrA

query
sites
3zdrA
P
 
P
T
 
P
R
 
K
I
 
I
H
 
Y
F
 
F
G
 
E
K
 
K
N
 
N
T
 
A
I
 
V
A
 
Q
E
 
Y
I
 
L
D
 
A
T
 
K
L
 
M
V
 
-
P
 
P
R
 
D
N
 
I
A
 
S
R
 
R
V
 
A
M
 
F
V
 
I
L
 
V
F
 
-
G
 
T
G
 
D
S
 
P
S
 
G
A
 
M
R
 
V
R
 
K
T
 
L
G
 
G
T
 
Y
L
 
V
A
 
D
E
 
K
V
 
V
K
 
L
Q
 
Y
A
 
Y
L
 
L
G
 
R
N
 
R
R
 
R
-
 
P
-
 
D
F
 
Y
V
 
V
V
 
H
E
 
S
-
 
E
-
 
I
F
 
F
E
 
S
G
 
E
I
 
V
E
 
E
P
 
P
N
 
D
P
 
P
T
 
S
Y
 
I
E
 
E
T
 
T
L
 
V
M
 
M
Q
 
K
A
 
G
V
 
V
E
 
D
Q
 
M
V
 
M
R
 
R
E
 
S
L
 
F
N
 
E
I
 
P
D
 
D
F
 
V
L
 
I
L
 
I
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
P
I
 
M
D
 
D
G
 
A
T
 
A
K
 
K
F
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
M
A
 
W
V
 
L
F
 
F
E
 
Y
G
 
E
E
 
H
P
 
P
-
 
T
-
 
A
-
 
D
W
 
F
D
 
N
I
 
A
L
 
L
T
 
K
S
 
Q
W
 
K
G
 
F
A
 
L
N
 
D
V
 
I
T
 
R
-
 
K
-
 
R
-
 
V
-
 
Y
-
 
K
-
 
Y
-
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
G
Q
 
Q
A
 
K
M
 
A
P
 
K
F
 
F
G
 
V
S
 
A
V
 
I
L
 
P
T
 
T
L
 
T
P
 
S
A
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
V
N
 
T
N
 
S
A
 
F
S
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
R
 
D
K
 
K
S
 
K
L
 
T
K
 
N
A
 
I
K
 
K
L
 
Y
P
 
P
F
 
L
R
 
A
N
 
D
D
 
Y
L
 
E
V
 
L
Y
 
T
P
 
P
Q
 
D
F
 
V
S
 
A
I
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
P
T
 
Q
K
 
F
T
 
V
F
 
M
T
 
T
L
 
V
P
 
P
E
 
K
R
 
H
Q
 
V
V
 
T
A
 
A
N
 
D
G
 
T
V
 
G
V
 
M
D
|
D
A
 
V
F
 
L
V
 
T
H
|
H
I
 
A
T
 
I
E
 
E
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
V
T
 
S
Y
 
N
P
 
M
V
 
A
N
 
N
A
 
-
A
 
D
V
 
Y
Q
 
T
D
 
D
R
 
G
F
 
L
A
 
A
E
 
M
G
 
K
L
 
A
L
 
I
Q
 
Q
I
 
L
L
 
V
I
 
F
E
 
E
L
 
Y
G
 
L
P
 
P
Q
 
R
A
 
A
L
 
Y
T
 
Q
Q
 
N
P
 
G
E
 
A
D
 
D
Y
 
E
D
 
L
I
 
A
R
 
R
A
 
E
N
 
K
L
 
M
M
 
H
W
 
N
V
 
A
A
 
S
T
 
T
M
 
I
A
 
A
L
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
G
I
 
M
A
 
A
T
 
F
G
 
A
V
 
N
P
 
A
H
 
F
D
 
L
W
 
G
A
 
I
T
 
N
H
|
H
M
 
S
I
 
L
G
 
A
H
 
H
E
 
K
L
 
L
T
 
G
A
 
A
L
 
E
Y
 
F
D
 
H
I
 
I
D
 
P
H
|
H
A
 
G
R
 
R
T
 
A
L
 
N
A
 
T
I
 
I
V
 
L
L
 
M
P
 
P
A
 
H
L
 
V
L
 
I
R
 
R
C
 
Y
T
 
N
K
 
-
A
 
A
A
 
A
K
 
K
R
 
P
E
 
K
K
 
K
L
 
Y
L
 
F
Q
 
K
-
 
A
-
 
D
-
 
Q
-
 
R
F
 
Y
A
 
A
D
 
E
-
 
I
-
 
A
R
 
R
V
 
M
W
 
L
H
 
G
I
 
L
N
 
P
T
 
A
G
 
R
S
 
T
E
 
T
D
 
E
E
 
E
R
 
G
I
 
V
E
 
E
A
 
S
A
 
L
I
 
V
A
 
Q
K
 
A
T
 
I
Q
 
I
A
 
K
F
 
L
F
 
A
E
 
K
S
 
Q
M
 
L
G
 
D
I
 
M
A
 
P
T
 
L
H
 
S
L
 
I
S
 
E
A
 
A
Y
 
C
D
 
G
L
 
V
G
 
S
K
 
K
E
 
Q
A
 
E
V
 
F
D
 
E
A
 
S
V
 
K
V
 
V
N
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
A
Q
 
E

Q59104 4-hydroxybutyrate dehydrogenase; 4HbD; Gamma-hydroxybutyrate dehydrogenase; GHBDH; EC 1.1.1.61 from Cupriavidus necator (Alcaligenes eutrophus) (Ralstonia eutropha) (see paper)
27% identity, 82% coverage: 4:317/385 of query aligns to 3:321/382 of Q59104

query
sites
Q59104
F
 
F
A
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
L
P
 
-
T
 
T
R
 
H
I
 
I
H
 
H
F
 
L
G
 
D
K
 
F
N
 
G
T
 
A
I
 
V
A
 
S
E
 
L
I
 
L
D
 
K
T
 
S
L
 
E
V
 
C
P
 
E
R
 
R
-
 
I
N
 
G
A
 
I
R
 
R
V
 
R
M
 
P
V
 
L
L
 
L
F
 
V
G
 
T
G
 
D
S
 
K
S
 
G
A
 
V
R
 
V
R
 
A
T
 
A
G
 
G
T
 
V
L
 
A
A
 
Q
E
 
R
V
 
A
K
 
I
Q
 
D
A
 
A
L
 
M
G
 
Q
N
 
G
R
 
L
F
 
Q
V
 
V
V
 
A
E
 
V
F
 
F
E
 
D
G
 
E
I
 
T
E
 
P
P
 
S
N
 
N
P
 
P
T
 
T
Y
 
E
E
 
A
T
 
M
L
 
V
M
 
R
Q
 
K
A
 
A
V
 
A
E
 
A
Q
 
Q
V
 
Y
R
 
R
E
 
E
L
 
A
N
 
G
I
 
C
D
 
D
F
 
G
L
 
L
L
 
V
A
 
A
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
S
I
 
I
D
 
D
G
 
L
T
 
A
K
 
K
F
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
I
A
 
L
A
 
A
V
 
T
F
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
E
-
 
L
-
 
T
P
 
T
W
 
Y
D
 
A
I
 
T
L
 
I
T
 
E
S
 
G
W
 
G
G
 
S
A
 
A
N
 
R
V
 
I
T
 
T
-
 
D
Q
 
K
A
 
A
M
 
A
P
 
P
F
 
L
G
 
I
S
 
A
V
 
V
L
 
P
T
 
T
L
 
T
P
 
S
A
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
V
N
 
A
N
 
R
A
 
G
S
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
I
R
 
L
K
 
D
S
 
D
L
 
G
K
 
R
A
 
-
K
 
K
L
 
L
P
 
G
F
 
F
R
 
H
N
 
S
D
 
W
L
 
H
V
 
L
Y
 
L
P
 
P
Q
 
K
F
 
S
S
 
A
I
 
V
L
 
C
D
 
D
P
 
P
T
 
E
K
 
L
T
 
T
F
 
L
T
 
G
L
 
L
P
 
P
E
 
A
R
 
G
Q
 
L
V
 
T
A
 
A
N
 
A
G
 
T
V
 
G
V
 
M
D
|
D
A
 
A
F
 
I
V
 
A
H
|
H
I
 
C
T
 
I
E
 
E
Q
 
T
Y
 
F
L
 
L
T
 
A
Y
 
P
P
 
A
V
 
F
N
 
N
A
 
P
A
 
P
V
 
-
Q
 
-
D
 
-
R
 
-
F
 
-
A
 
A
E
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
A
Q
 
L
I
 
D
L
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
R
G
 
G
-
 
W
-
 
G
-
 
H
-
 
I
P
 
E
Q
 
R
A
 
A
L
 
T
T
 
R
Q
 
D
P
 
G
E
 
Q
D
 
D
Y
 
R
D
 
D
I
 
A
R
 
R
A
 
L
N
 
N
L
 
M
M
 
M
W
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
S
M
 
A
A
 
S
L
 
M
N
 
Q
G
 
G
T
 
A
I
 
M
A
 
A
-
 
F
-
 
Q
-
 
K
-
 
G
T
 
L
G
 
G
V
 
C
P
 
V
H
|
H
D
 
S
W
 
L
A
 
S
T
x
H
H
 
P
M
 
L
I
 
G
G
 
G
H
 
L
E
 
K
L
 
I
T
 
D
A
 
G
L
 
R
Y
 
T
D
 
G
I
 
L
D
 
H
H
|
H
A
 
G
R
 
T
T
 
L
L
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
M
P
 
P
A
 
A
L
 
V
L
 
L
R
 
R
C
 
F
T
 
N
K
 
A
A
 
D
A
 
A
K
 
P
-
 
T
-
 
V
-
 
V
R
 
R
E
 
D
K
 
D
L
 
R
L
 
Y
Q
 
A
F
 
R
A
 
L
D
 
R
R
 
R
V
 
A
W
 
M
H
 
H
I
 
L
N
 
P
T
 
D
G
 
G
S
 
A
E
 
D

3bfjA Crystal structure analysis of 1,3-propanediol oxidoreductase (see paper)
28% identity, 91% coverage: 4:352/385 of query aligns to 3:348/382 of 3bfjA

query
sites
3bfjA
F
 
F
A
 
D
Y
 
Y
Y
 
L
N
 
V
P
 
P
T
 
N
R
 
V
I
 
N
H
 
F
F
 
F
G
 
G
K
 
P
N
 
N
T
 
A
I
 
I
A
 
S
E
 
V
I
 
V
D
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
A
 
G
R
 
E
V
 
R
M
 
C
V
 
Q
L
 
L
F
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
K
S
 
K
A
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
K
-
 
G
-
 
L
R
 
R
R
 
K
T
 
D
G
 
G
T
 
A
L
 
V
A
 
D
E
 
K
V
 
T
K
 
L
Q
 
H
A
 
Y
L
 
L
-
 
R
-
 
E
G
 
A
N
 
G
R
 
I
F
 
E
V
 
V
V
 
A
E
 
I
F
 
F
E
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
E
P
 
P
N
 
N
P
 
P
T
 
K
Y
 
D
E
 
T
T
 
N
L
 
V
M
 
R
Q
 
D
A
 
G
V
 
L
E
 
A
Q
 
V
V
 
F
R
 
R
E
 
R
L
 
E
N
 
Q
I
 
C
D
 
D
F
 
I
L
 
I
L
 
V
A
 
T
V
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
P
I
 
H
D
 
D
G
 
C
T
 
G
K
 
K
F
 
G
V
 
I
A
 
G
A
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
T
F
 
H
E
 
E
G
 
G
E
 
D
P
 
L
W
 
Y
D
 
Q
I
 
Y
L
 
-
T
 
-
S
 
A
W
 
G
G
 
I
A
 
E
N
 
T
V
 
L
T
 
T
Q
 
N
A
 
P
M
 
L
-
 
P
P
 
P
F
 
I
G
 
V
S
 
A
V
 
V
L
 
N
T
 
T
L
 
T
P
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
A
S
 
S
E
 
E
M
 
V
N
 
T
N
 
R
A
 
H
S
 
C
V
 
V
V
 
L
T
 
T
R
 
N
K
 
T
S
 
E
L
 
T
K
 
K
A
 
V
K
 
K
L
 
F
P
 
V
F
 
I
R
 
V
N
 
S
D
 
W
L
 
R
V
 
N
Y
 
L
P
 
P
Q
 
S
F
 
V
S
 
S
I
 
I
L
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
L
K
 
L
T
 
M
F
 
I
T
 
G
L
 
K
P
 
P
E
 
A
R
 
A
Q
 
L
V
 
T
A
 
A
N
 
A
G
 
T
V
 
G
V
 
M
D
|
D
A
 
A
F
 
L
V
 
T
H
|
H
I
 
A
T
 
V
E
 
E
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
I
T
 
S
Y
 
K
P
 
D
V
 
A
N
 
N
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
M
Q
 
Q
D
 
A
-
 
I
R
 
R
F
 
L
A
 
I
E
 
A
G
 
R
L
 
N
L
 
L
Q
 
R
I
 
Q
L
 
A
I
 
V
E
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
S
Q
 
N
A
 
-
L
 
-
T
 
L
Q
 
Q
P
 
A
E
 
R
D
 
E
Y
 
Y
D
 
M
I
 
A
R
 
Y
A
 
A
N
 
S
L
 
L
M
 
L
W
 
-
V
 
-
A
 
A
T
 
G
M
 
M
A
 
A
L
 
F
N
 
N
G
 
N
T
 
A
I
 
-
A
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
H
 
N
D
 
L
W
 
G
A
 
Y
T
 
V
H
|
H
M
 
A
I
 
M
G
 
A
H
 
H
E
 
Q
L
 
L
T
 
G
A
 
G
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
I
 
M
D
 
P
H
|
H
A
 
G
R
 
V
T
 
A
L
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
V
L
 
A
R
 
R
C
 
Y
T
 
N
K
 
L
A
 
I
A
 
A
K
 
N
R
 
P
E
 
E
K
 
K
L
 
F
L
 
A
Q
 
D
F
 
I
A
 
A
D
 
E
R
 
L
V
 
M
W
 
G
H
 
E
I
 
N
N
 
I
T
 
T
G
 
G
-
 
L
S
 
S
E
 
T
D
 
L
E
 
D
R
 
A
I
 
A
E
 
E
A
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
A
T
 
I
Q
 
T
A
 
R
F
 
L
F
 
S
E
 
M
S
 
D
M
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
P
T
 
Q
H
 
H
L
 
L
S
 
R
A
 
-
Y
 
-
D
 
D
L
 
L
G
 
G
K
 
V
E
 
K
A
 
E
V
 
T
D
 
D

A0A0S1X9S7 Alcohol dehydrogenase; EC 1.1.1.1 from Thermococcus barophilus (see paper)
29% identity, 75% coverage: 10:299/385 of query aligns to 8:298/378 of A0A0S1X9S7

query
sites
A0A0S1X9S7
T
 
T
R
 
R
I
 
I
H
 
V
F
 
L
G
 
G
K
 
E
N
 
G
T
 
S
I
 
L
A
 
S
E
 
Y
I
 
I
D
 
K
T
 
S
L
 
V
V
 
A
P
 
K
R
 
K
N
 
H
A
 
S
R
 
R
V
 
V
M
 
L
V
 
I
L
 
-
F
 
F
G
 
S
G
 
S
S
 
K
S
 
S
A
 
M
R
 
R
R
 
V
T
 
H
G
 
G
T
 
F
L
 
L
A
 
N
E
 
E
V
 
T
K
 
M
Q
 
N
A
 
Y
L
 
V
-
 
E
-
 
D
G
 
A
N
 
N
R
 
A
F
 
E
V
 
V
V
 
E
E
 
A
F
 
I
E
 
T
G
 
G
I
 
V
E
 
P
P
 
A
N
 
E
P
 
P
T
 
S
Y
 
Y
E
 
E
T
 
Y
L
 
V
M
 
E
Q
 
S
A
 
I
V
 
M
E
 
P
Q
 
K
V
 
V
R
 
R
E
 
E
L
 
F
N
 
Q
I
 
P
D
 
D
F
 
L
L
 
I
L
 
V
A
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
I
D
 
D
G
 
V
T
 
A
K
 
K
F
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
A
 
V
A
 
K
V
 
V
F
 
F
E
 
Y
G
 
D
E
 
A
P
 
P
W
 
E
D
 
L
I
 
K
L
 
F
-
 
E
-
 
E
T
 
V
S
 
A
W
 
F
G
 
I
A
 
S
N
 
R
V
 
F
T
 
E
Q
 
K
A
 
P
M
 
K
P
 
P
F
 
I
G
 
P
S
 
K
V
 
L
L
 
K
T
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
I
-
 
A
L
 
I
P
 
P
A
 
S
T
 
T
-
 
S
-
 
G
-
 
A
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
V
N
 
S
N
 
A
A
 
A
S
 
S
V
 
V
V
 
L
T
 
K
R
 
K
K
 
G
S
 
D
L
 
I
K
 
K
A
 
Y
K
 
N
L
 
L
-
 
V
P
 
S
F
 
F
R
 
E
N
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
I
Y
 
A
P
 
P
Q
 
E
F
 
F
S
 
A
I
 
I
L
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
R
K
 
L
T
 
P
F
 
R
T
 
T
L
 
M
P
 
P
E
 
K
R
 
E
Q
 
V
V
 
A
A
 
R
N
 
N
G
 
S
V
 
G
V
 
L
D
|
D
A
 
V
F
 
L
V
 
V
H
|
H
I
 
G
T
 
I
E
 
E
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
T
T
 
T
Y
 
T
P
 
A
V
 
A
N
 
T
A
 
-
A
 
P
V
 
F
Q
 
S
D
 
D
R
 
A
F
 
M
A
 
A
E
 
I
G
 
K
L
 
A
L
 
I
Q
 
K
I
 
L
L
 
V
I
 
Y
E
 
K
L
 
W
G
 
L
P
 
P
Q
 
-
A
 
-
L
 
L
T
 
S
Q
 
V
P
 
Q
E
 
G
D
 
D
Y
 
E
D
 
K
I
 
A
R
 
R
A
 
E
N
 
N
L
 
V
M
 
H
W
 
Y
V
 
A
A
 
A
T
 
T
M
 
M
A
 
A
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
F
L
 
L
N
 
N
G
 
A
T
 
R
I
 
L
A
 
G
T
 
L
G
 
-
V
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
T
 
C
H
|
H
M
 
S
I
 
L
G
 
S
H
|
H
E
 
K
L
 
-
T
 
-
A
 
A
L
 
A
Y
 
W
D
 
I
I
 
A
D
 
P
H
|
H
A
 
G
R
 
L
T
 
L
L
 
N
A
 
A
I
 
I
V
 
F
L
 
L
P
 
P
A
 
Y
L
 
V
-
 
M
-
 
E
-
 
F
-
 
N
L
 
M
R
 
R
C
 
S
T
 
E
K
 
Y
A
 
A
A
 
R
K
 
K
R
 
R

P31005 NAD-dependent methanol dehydrogenase; MDH; MEDH; Type 3 alcohol dehydrogenase; EC 1.1.1.244 from Bacillus methanolicus (see 3 papers)
24% identity, 80% coverage: 1:307/385 of query aligns to 1:303/381 of P31005

query
sites
P31005
M
|
M
F
 
T
N
 
N
F
 
F
A
 
-
Y
 
F
Y
 
I
N
 
P
P
 
P
T
 
A
R
 
S
I
 
V
H
 
-
F
 
I
G
|
G
K
 
R
N
x
G
T
 
A
I
 
V
A
 
K
E
 
E
I
 
V
D
 
G
T
 
T
L
 
R
V
 
L
P
 
K
R
 
Q
-
 
I
N
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
K
M
 
A
V
 
L
L
 
I
F
 
V
G
 
T
G
 
D
S
 
A
S
 
F
A
 
L
R
 
H
R
 
S
T
 
T
G
 
G
T
 
L
L
 
S
A
 
E
E
 
E
V
 
V
K
 
A
Q
 
K
A
 
N
L
 
I
-
 
R
-
 
E
G
 
A
N
 
G
R
 
L
F
 
D
V
 
V
V
 
A
E
 
I
F
 
F
E
 
P
G
 
K
I
 
A
E
 
Q
P
 
P
N
 
D
P
 
P
T
 
A
Y
 
D
E
 
T
T
 
Q
L
 
V
M
 
H
Q
 
E
A
 
G
V
 
V
E
 
D
Q
 
V
V
 
F
R
 
K
E
 
Q
L
 
E
N
 
N
I
 
C
D
|
D
F
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
S
V
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
S
|
S
V
 
S
I
 
H
D
|
D
G
 
T
T
 
A
K
|
K
F
 
A
V
 
I
A
 
G
A
 
L
A
 
V
A
 
A
V
 
A
F
 
N
E
 
G
G
 
G
E
 
R
P
 
I
W
 
N
D
 
D
I
 
Y
L
 
-
T
 
-
S
 
-
W
 
Q
G
 
G
A
 
V
N
 
N
V
 
S
T
 
V
Q
 
E
-
 
K
-
 
P
A
 
V
M
 
V
P
 
P
F
 
V
G
 
V
S
 
A
V
 
I
L
 
T
T
 
T
L
 
T
P
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
M
 
T
N
 
T
N
 
S
A
 
L
S
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
R
 
D
K
 
S
S
 
A
L
 
R
K
 
K
A
 
V
K
 
K
L
 
M
P
 
P
F
 
V
R
 
I
N
 
D
D
 
E
L
 
K
V
 
I
Y
 
T
P
 
P
Q
 
T
F
 
V
S
 
A
I
 
I
L
 
V
D
 
D
P
 
P
T
 
E
K
 
L
T
 
M
F
 
V
T
 
K
L
 
K
P
 
P
E
 
A
R
 
G
Q
 
L
V
 
T
A
 
I
N
 
A
G
 
T
V
 
G
V
 
M
D
 
D
A
 
A
F
 
L
V
 
S
H
 
H
I
 
A
T
 
I
E
 
E
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
V
T
 
A
Y
 
K
P
 
G
V
 
A
N
 
T
A
 
-
A
 
P
V
 
V
Q
 
T
D
 
D
R
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
I
G
 
Q
L
 
A
L
 
M
Q
 
K
I
 
L
L
 
I
I
 
N
E
 
E
L
 
Y
G
 
L
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
L
 
V
T
 
A
Q
 
N
P
 
G
E
 
E
D
 
D
Y
 
I
D
 
E
I
 
A
R
 
R
A
 
E
N
 
A
L
 
M
M
 
A
W
 
Y
V
 
A
A
 
Q
T
 
Y
M
 
M
A
 
A
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
F
L
 
N
N
 
N
G
 
G
T
 
G
I
 
L
A
 
G
T
 
L
G
 
-
V
 
-
P
 
-
H
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
T
 
V
H
 
H
M
 
S
I
 
I
G
 
S
H
 
H
E
 
Q
L
 
V
T
 
G
A
 
G
L
 
V
Y
 
Y
D
 
K
I
 
L
D
 
Q
H
 
H
A
 
G
R
 
I
T
 
C
L
 
N
A
 
S
I
 
V
V
 
N
L
 
M
P
 
P
A
 
H
L
 
V
L
 
C
R
 
A
C
 
F
T
 
N
K
 
L
A
 
I
A
 
A
K
 
K
R
 
T
E
 
E
K
 
R
L
 
F
L
 
A
Q
 
H
F
 
I
A
 
A
D
 
E

P0DJA2 Alcohol dehydrogenase 2; Alcohol dehydrogenase II; ADH II; EC 1.1.1.1 from Zymomonas mobilis subsp. mobilis (strain ATCC 31821 / ZM4 / CP4) (see 2 papers)
27% identity, 75% coverage: 62:351/385 of query aligns to 65:350/383 of P0DJA2

query
sites
P0DJA2
F
 
Y
E
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
M
P
 
P
N
|
N
P
 
P
T
 
T
Y
 
V
E
 
T
T
 
A
L
 
V
M
 
L
Q
 
E
A
 
G
V
 
L
E
 
K
Q
 
I
V
 
L
R
 
K
E
 
D
L
 
N
N
 
N
I
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
L
 
I
A
 
S
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
I
 
H
D
 
D
G
 
C
T
 
A
K
 
K
F
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
V
A
 
A
V
 
T
F
 
N
E
 
G
G
 
G
E
 
E
P
 
V
W
 
K
D
 
D
I
 
-
L
 
Y
T
 
E
S
 
G
W
 
I
G
 
D
A
 
K
N
 
S
V
 
K
T
 
K
Q
 
P
A
 
A
M
 
L
P
 
P
F
 
L
G
 
M
S
 
S
V
 
I
L
 
N
T
|
T
L
x
T
P
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
A
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
x
T
N
 
R
A
x
F
S
 
C
V
 
I
V
 
I
T
 
T
R
 
D
K
 
E
S
 
V
L
 
R
K
 
H
A
 
V
K
|
K
L
 
M
P
 
A
F
 
I
R
 
V
N
 
D
D
 
R
L
 
H
V
 
V
Y
 
T
P
 
P
Q
 
M
F
 
V
S
 
S
I
 
V
L
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
L
K
x
L
T
 
M
F
 
V
T
x
G
L
x
M
P
 
P
E
 
K
R
 
G
Q
 
L
V
 
T
A
 
A
N
 
A
G
 
T
V
 
G
V
 
M
D
|
D
A
 
A
F
 
L
V
 
T
H
|
H
I
 
A
T
 
F
E
 
E
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
S
T
 
S
-
 
T
-
 
A
-
 
A
Y
 
T
P
 
P
V
 
I
N
 
T
A
 
D
A
 
A
V
 
C
Q
 
A
D
 
L
R
 
K
F
 
A
A
 
A
E
 
S
G
 
M
L
 
I
L
 
A
Q
 
K
I
 
N
L
 
L
I
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
K
Q
 
T
A
 
A
L
 
C
T
 
D
Q
 
N
P
 
G
E
 
K
D
 
D
Y
 
M
D
 
P
I
 
A
R
 
R
A
 
E
N
 
A
L
 
M
M
 
A
W
 
Y
-
 
A
-
 
Q
-
 
F
V
 
L
A
 
A
T
 
G
M
 
M
A
 
A
L
 
F
N
 
N
G
 
N
T
 
A
I
 
S
A
 
L
T
 
G
G
 
Y
V
 
V
P
 
-
H
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
T
 
-
H
|
H
M
 
A
I
 
M
G
 
A
H
|
H
E
 
Q
L
 
L
T
 
G
A
 
G
L
 
Y
Y
 
Y
D
 
N
I
 
L
D
 
P
H
|
H
A
 
G
R
 
V
T
 
C
L
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
V
L
 
L
-
 
A
-
 
Y
R
 
N
C
 
A
T
 
S
K
 
V
A
 
V
A
 
A
K
 
G
R
 
R
E
 
L
K
 
K
L
 
D
L
 
V
Q
 
G
F
 
V
A
 
A
D
 
M
R
 
G
V
 
L
W
 
D
H
 
I
I
 
A
N
 
N
T
 
L
G
 
G
S
 
-
E
 
D
D
 
K
E
 
E
R
 
G
I
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
T
I
 
I
A
 
Q
K
 
A
T
 
V
Q
 
R
A
 
D
F
 
L
F
 
A
E
 
A
S
 
S
M
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
P
T
 
A
H
 
N
L
 
L
S
 
T
A
 
E
Y
 
L
D
 
G
L
 
A
G
 
K
K
 
K
E
 
E
A
 
D
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3ox4A Structures of iron-dependent alcohol dehydrogenase 2 from zymomonas mobilis zm4 complexed with NAD cofactor (see paper)
27% identity, 75% coverage: 62:351/385 of query aligns to 64:349/382 of 3ox4A

query
sites
3ox4A
F
 
Y
E
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
M
P
 
P
N
|
N
P
 
P
T
 
T
Y
 
V
E
 
T
T
 
A
L
 
V
M
 
L
Q
 
E
A
 
G
V
 
L
E
 
K
Q
 
I
V
 
L
R
 
K
E
 
D
L
 
N
N
 
N
I
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
L
 
I
A
 
S
V
 
L
G
 
G
G
|
G
G
|
G
S
|
S
V
 
P
I
 
H
D
 
D
G
 
C
T
 
A
K
 
K
F
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
V
A
 
A
V
 
T
F
 
N
E
 
G
G
 
G
E
 
E
P
 
V
W
 
K
D
 
D
I
 
-
L
 
Y
T
 
E
S
 
G
W
 
I
G
 
D
A
 
K
N
 
S
V
 
K
T
 
K
Q
 
P
A
 
A
M
 
L
P
 
P
F
 
L
G
 
M
S
 
S
V
 
I
L
 
N
T
|
T
L
x
T
P
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
A
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
 
T
N
 
R
A
x
F
S
 
C
V
x
I
V
 
I
T
 
T
R
 
D
K
 
E
S
 
V
L
 
R
K
 
H
A
 
V
K
 
K
L
 
M
P
 
A
F
 
I
R
 
V
N
 
D
D
 
R
L
 
H
V
 
V
Y
 
T
P
 
P
Q
 
M
F
 
V
S
 
S
I
 
V
L
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
L
K
 
L
T
 
M
F
 
V
T
x
G
L
x
M
P
 
P
E
 
K
R
 
G
Q
x
L
V
 
T
A
 
A
N
 
A
G
 
T
V
 
G
V
 
M
D
|
D
A
 
A
F
 
L
V
 
T
H
|
H
I
 
A
T
 
F
E
 
E
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
S
T
 
S
-
 
T
-
 
A
-
 
A
Y
 
T
P
 
P
V
 
I
N
 
T
A
 
D
A
 
A
V
 
C
Q
 
A
D
 
L
R
 
K
F
 
A
A
 
A
E
 
S
G
 
M
L
 
I
L
 
A
Q
 
K
I
 
N
L
 
L
I
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
K
Q
 
T
A
 
A
L
 
C
T
 
D
Q
 
N
P
 
G
E
 
K
D
 
D
Y
 
M
D
 
P
I
 
A
R
 
R
A
 
E
N
 
A
L
 
M
M
 
A
W
 
Y
-
 
A
-
 
Q
-
 
F
V
 
L
A
 
A
T
 
G
M
 
M
A
 
A
L
 
F
N
 
N
G
 
N
T
 
A
I
 
S
A
 
L
T
 
G
G
 
Y
V
 
V
P
 
-
H
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
T
 
-
H
|
H
M
 
A
I
 
M
G
 
A
H
 
H
E
 
Q
L
 
L
T
 
G
A
 
G
L
 
Y
Y
 
Y
D
 
N
I
 
L
D
 
P
H
|
H
A
 
G
R
 
V
T
 
C
L
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
V
L
 
L
-
 
A
-
 
Y
R
 
N
C
 
A
T
 
S
K
 
V
A
 
V
A
 
A
K
 
G
R
 
R
E
 
L
K
 
K
L
 
D
L
 
V
Q
 
G
F
 
V
A
 
A
D
 
M
R
 
G
V
 
L
W
 
D
H
 
I
I
 
A
N
 
N
T
 
L
G
 
G
S
 
-
E
 
D
D
 
K
E
 
E
R
 
G
I
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
T
I
 
I
A
 
Q
K
 
A
T
 
V
Q
 
R
A
 
D
F
 
L
F
 
A
E
 
A
S
 
S
M
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
P
T
 
A
H
 
N
L
 
L
S
 
T
A
 
E
Y
 
L
D
 
G
L
 
A
G
 
K
K
 
K
E
 
E
A
 
D
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3owoA Structures of iron-dependent alcohol dehydrogenase 2 from zymomonas mobilis zm4 with and without NAD cofactor (see paper)
27% identity, 75% coverage: 62:351/385 of query aligns to 64:349/382 of 3owoA

query
sites
3owoA
F
 
Y
E
 
D
G
 
G
I
 
V
E
 
M
P
 
P
N
 
N
P
 
P
T
 
T
Y
 
V
E
 
T
T
 
A
L
 
V
M
 
L
Q
 
E
A
 
G
V
 
L
E
 
K
Q
 
I
V
 
L
R
 
K
E
 
D
L
 
N
N
 
N
I
 
S
D
 
D
F
 
F
L
 
V
L
 
I
A
 
S
V
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
P
I
 
H
D
 
D
G
 
C
T
 
A
K
 
K
F
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
L
A
 
V
A
 
A
V
 
T
F
 
N
E
 
G
G
 
G
E
 
E
P
 
V
W
 
K
D
 
D
I
 
-
L
 
Y
T
 
E
S
 
G
W
 
I
G
 
D
A
 
K
N
 
S
V
 
K
T
 
K
Q
 
P
A
 
A
M
 
L
P
 
P
F
 
L
G
 
M
S
 
S
V
 
I
L
 
N
T
 
T
L
 
T
P
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
A
S
 
S
E
 
E
M
 
M
N
 
T
N
 
R
A
 
F
S
 
C
V
 
I
V
 
I
T
 
T
R
 
D
K
 
E
S
 
V
L
 
R
K
 
H
A
 
V
K
 
K
L
 
M
P
 
A
F
 
I
R
 
V
N
 
D
D
 
R
L
 
H
V
 
V
Y
 
T
P
 
P
Q
 
M
F
 
V
S
 
S
I
 
V
L
 
N
D
 
D
P
 
P
T
 
L
K
 
L
T
 
M
F
 
V
T
 
G
L
 
M
P
 
P
E
 
K
R
 
G
Q
 
L
V
 
T
A
 
A
N
 
A
G
 
T
V
 
G
V
 
M
D
|
D
A
 
A
F
 
L
V
 
T
H
|
H
I
 
A
T
 
F
E
 
E
Q
 
A
Y
 
Y
L
 
S
T
 
S
-
 
T
-
 
A
-
 
A
Y
 
T
P
 
P
V
 
I
N
 
T
A
 
D
A
 
A
V
 
C
Q
 
A
D
 
L
R
 
K
F
 
A
A
 
A
E
 
S
G
 
M
L
 
I
L
 
A
Q
 
K
I
 
N
L
 
L
I
 
-
E
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
K
Q
 
T
A
 
A
L
 
C
T
 
D
Q
 
N
P
 
G
E
 
K
D
 
D
Y
 
M
D
 
P
I
 
A
R
 
R
A
 
E
N
 
A
L
 
M
M
 
A
W
 
Y
-
 
A
-
 
Q
-
 
F
V
 
L
A
 
A
T
 
G
M
 
M
A
 
A
L
 
F
N
 
N
G
 
N
T
 
A
I
 
S
A
 
L
T
 
G
G
 
Y
V
 
V
P
 
-
H
 
-
D
 
-
W
 
-
A
 
-
T
 
-
H
|
H
M
 
A
I
 
M
G
 
A
H
 
H
E
 
Q
L
 
L
T
 
G
A
 
G
L
 
Y
Y
 
Y
D
 
N
I
 
L
D
 
P
H
|
H
A
 
G
R
 
V
T
 
C
L
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
V
L
 
L
-
 
A
-
 
Y
R
 
N
C
 
A
T
 
S
K
 
V
A
 
V
A
 
A
K
 
G
R
 
R
E
 
L
K
 
K
L
 
D
L
 
V
Q
 
G
F
 
V
A
 
A
D
 
M
R
 
G
V
 
L
W
 
D
H
 
I
I
 
A
N
 
N
T
 
L
G
 
G
S
 
-
E
 
D
D
 
K
E
 
E
R
 
G
I
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
T
I
 
I
A
 
Q
K
 
A
T
 
V
Q
 
R
A
 
D
F
 
L
F
 
A
E
 
A
S
 
S
M
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
P
T
 
A
H
 
N
L
 
L
S
 
T
A
 
E
Y
 
L
D
 
G
L
 
A
G
 
K
K
 
K
E
 
E
A
 
D
V
 
V

Query Sequence

>7023023 FitnessBrowser__ANA3:7023023
MFNFAYYNPTRIHFGKNTIAEIDTLVPRNARVMVLFGGSSARRTGTLAEVKQALGNRFVV
EFEGIEPNPTYETLMQAVEQVRELNIDFLLAVGGGSVIDGTKFVAAAAVFEGEPWDILTS
WGANVTQAMPFGSVLTLPATGSEMNNASVVTRKSLKAKLPFRNDLVYPQFSILDPTKTFT
LPERQVANGVVDAFVHITEQYLTYPVNAAVQDRFAEGLLQILIELGPQALTQPEDYDIRA
NLMWVATMALNGTIATGVPHDWATHMIGHELTALYDIDHARTLAIVLPALLRCTKAAKRE
KLLQFADRVWHINTGSEDERIEAAIAKTQAFFESMGIATHLSAYDLGKEAVDAVVNQLEQ
HGMVALGEHGNIDPTMSRDILTLAL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory