SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 7023065 FitnessBrowser__ANA3:7023065 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
37% identity, 96% coverage: 2:244/253 of query aligns to 4:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
L
 
Q
N
 
D
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
E
I
 
A
I
 
A
R
 
R
K
 
V
L
 
F
L
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
I
A
 
A
D
|
D
L
x
F
S
 
N
A
 
E
D
 
A
A
 
A
L
 
G
K
 
K
V
 
-
F
 
-
N
 
E
D
 
A
F
 
V
P
 
E
A
 
A
D
 
N
K
 
P
L
 
G
V
 
V
T
 
V
F
 
F
-
 
I
S
 
R
V
|
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Y
 
R
K
 
E
Q
 
S
V
 
V
E
 
H
A
 
R
M
 
L
V
 
V
K
 
E
H
 
N
A
 
V
A
 
A
D
 
E
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
K
L
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
G
 
-
L
 
T
A
 
R
K
x
D
P
 
S
L
 
M
L
 
L
Q
 
S
H
x
K
D
 
M
P
 
T
I
 
V
N
 
D
D
 
Q
F
 
F
E
 
Q
P
 
Q
V
 
V
T
 
I
N
 
N
V
 
V
N
|
N
Q
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
H
 
H
G
 
C
I
 
T
L
 
Q
A
 
A
G
 
V
G
 
-
R
 
L
Q
 
P
F
 
Y
Q
 
M
A
 
A
Q
 
E
G
 
Q
S
 
G
R
 
K
G
 
G
V
 
K
I
 
I
L
 
I
N
 
N
T
|
T
S
 
S
S
|
S
V
 
V
Y
 
T
A
 
G
Q
 
T
I
 
Y
A
 
G
S
x
N
E
x
V
M
 
G
T
x
Q
F
 
T
T
 
N
Y
|
Y
N
 
A
V
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
I
M
 
G
M
 
M
T
 
T
K
 
K
C
 
T
A
 
W
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
R
L
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
V
C
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
R
x
F
V
x
T
D
 
E
T
|
T
P
 
A
M
|
M
L
 
V
R
 
A
Q
 
E
Y
 
V
E
 
P
A
 
E
L
 
-
G
 
K
L
 
V
W
 
I
E
 
E
H
x
K
I
 
M
R
 
K
K
 
A
E
 
Q
Q
 
V
M
 
P
R
 
M
Q
 
G
E
 
R
F
 
L
T
 
G
Q
 
K
P
 
P
N
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
N
V
 
A
V
 
Y
A
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
H
E
 
E
A
 
S
N
 
D
C
 
Y
I
 
V
N
 
N
G
 
G
C
 
H
T
 
V
V
 
L
N
 
H
A
 
V
S
 
D
D
 
G
G
 
G
F
 
I

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)-hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
35% identity, 92% coverage: 4:235/253 of query aligns to 1:238/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
L
 
M
N
 
S
K
 
R
T
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
S
G
x
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
I
 
A
R
 
T
K
 
R
L
 
F
L
 
L
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
L
D
|
D
L
|
L
S
 
S
A
 
A
D
 
E
A
 
T
L
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
A
K
 
R
V
 
T
F
 
H
N
 
W
D
 
H
F
 
A
P
 
Y
A
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
V
V
 
L
T
 
R
F
 
V
S
 
R
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
Y
 
E
K
 
G
Q
 
D
V
 
V
E
 
N
A
 
A
M
 
A
V
 
I
K
 
A
H
 
A
A
 
T
A
 
M
D
 
E
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
-
 
T
-
 
G
G
 
N
L
 
S
A
 
E
K
 
A
P
 
G
L
 
V
L
 
L
Q
 
H
H
 
T
D
 
T
P
 
P
I
 
V
N
 
E
D
 
Q
F
 
F
E
 
D
P
 
K
V
 
V
T
 
M
N
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
V
K
 
R
G
 
G
V
 
I
Y
 
F
H
 
L
G
 
G
I
 
C
L
 
R
A
 
A
G
 
V
G
 
L
R
 
P
Q
 
H
F
 
M
Q
 
L
A
 
L
Q
 
Q
G
 
G
S
 
A
R
 
-
G
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
T
x
I
S
 
A
S
|
S
V
 
V
Y
 
A
A
 
S
Q
 
L
I
 
V
A
 
A
S
x
F
E
 
P
M
 
G
T
x
R
F
 
S
T
 
A
Y
|
Y
N
 
T
V
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
D
 
L
M
 
Q
M
 
L
T
 
T
K
 
K
C
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
V
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
G
L
 
S
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
C
C
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
R
x
M
V
x
I
D
 
E
T
|
T
P
|
P
M
|
M
L
x
T
R
 
Q
-
x
W
Q
x
R
Y
 
L
E
 
D
A
 
Q
L
 
P
G
 
E
L
 
L
W
 
R
E
 
D
H
 
Q
I
 
V
R
 
L
K
 
A
E
 
R
Q
 
I
M
 
P
R
 
Q
Q
 
K
E
 
E
F
 
I
T
 
G
Q
 
T
P
 
A
N
 
A
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
A
V
 
V
A
 
M
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
G
D
 
E
E
 
D
A
 
A
N
 
T
C
 
Y
I
 
V
N
 
N
G
 
G

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
35% identity, 92% coverage: 4:235/253 of query aligns to 1:238/250 of Q56840

query
sites
Q56840
L
x
M
N
 
S
K
 
R
T
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
G
x
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
I
I
 
A
R
 
T
K
 
R
L
 
F
L
 
L
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
A
A
 
A
A
 
L
D
|
D
L
 
L
S
 
S
A
 
A
D
 
E
A
 
T
L
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
A
K
 
R
V
 
T
F
 
H
N
 
W
D
 
H
F
 
A
P
 
Y
A
 
A
D
 
D
K
 
K
L
 
V
V
 
L
T
 
R
F
 
V
S
 
R
V
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
Y
 
E
K
 
G
Q
 
D
V
 
V
E
 
N
A
 
A
M
 
A
V
 
I
K
 
A
H
 
A
A
 
T
A
 
M
D
 
E
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
-
 
T
-
 
G
G
 
N
L
 
S
A
 
E
K
 
A
P
 
G
L
 
V
L
 
L
Q
 
H
H
 
T
D
 
T
P
 
P
I
 
V
N
 
E
D
 
Q
F
 
F
E
 
D
P
 
K
V
 
V
T
 
M
N
 
A
V
 
V
N
 
N
Q
 
V
K
 
R
G
 
G
V
 
I
Y
 
F
H
 
L
G
 
G
I
 
C
L
 
R
A
 
A
G
 
V
G
 
L
R
 
P
Q
 
H
F
 
M
Q
 
L
A
 
L
Q
 
Q
G
 
G
S
 
A
R
 
-
G
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
T
 
I
S
 
A
S
|
S
V
 
V
Y
 
A
A
 
S
Q
 
L
I
 
V
A
 
A
S
 
F
E
 
P
M
 
G
T
x
R
F
 
S
T
 
A
Y
|
Y
N
 
T
V
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
D
 
L
M
 
Q
M
 
L
T
 
T
K
 
K
C
 
S
A
 
V
A
 
A
L
 
V
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
G
L
 
S
G
 
G
V
 
I
R
|
R
V
 
C
C
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
G
R
 
M
V
x
I
D
x
E
T
|
T
P
|
P
M
|
M
L
 
T
R
 
Q
-
x
W
Q
x
R
Y
 
L
E
 
D
A
 
Q
L
 
P
G
 
E
L
 
L
W
x
R
E
 
D
H
 
Q
I
 
V
R
 
L
K
 
A
E
x
R
Q
 
I
M
 
P
R
 
Q
Q
 
K
E
 
E
F
 
I
T
 
G
Q
 
T
P
 
A
N
 
A
E
 
Q
I
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
A
V
 
V
A
 
M
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
G
D
 
E
E
 
D
A
 
A
N
 
T
C
 
Y
I
 
V
N
 
N
G
 
G

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
34% identity, 96% coverage: 1:244/253 of query aligns to 3:252/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
R
 
N
L
 
L
L
 
T
N
 
D
K
 
K
T
 
T
A
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
Y
A
 
A
I
 
A
I
 
V
R
 
Q
K
 
A
L
 
F
L
 
L
A
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
R
 
N
V
 
V
V
 
V
A
 
V
A
 
A
D
|
D
L
x
I
-
 
D
S
 
E
A
 
A
D
 
Q
A
 
G
L
 
E
K
 
A
V
 
M
F
 
V
N
 
R
D
 
K
F
 
E
P
 
N
A
 
N
D
 
D
K
 
R
L
 
L
V
 
H
T
 
F
F
 
V
S
 
Q
V
x
T
D
 
D
V
x
I
T
 
T
D
 
D
Y
 
E
K
 
A
Q
 
A
V
 
C
E
 
Q
A
 
H
M
 
A
V
 
V
K
 
E
H
 
S
A
 
A
A
 
V
D
 
H
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
Q
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
G
 
E
L
 
I
A
 
V
K
 
A
P
 
P
L
 
I
L
 
H
Q
 
E
H
 
M
D
 
E
P
 
-
I
 
L
N
 
S
D
 
D
F
 
W
E
 
N
P
 
K
V
 
V
T
 
L
N
 
Q
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
M
Y
 
F
H
 
L
G
 
M
I
 
S
L
 
K
A
 
H
G
 
A
G
 
L
R
 
K
Q
 
H
F
 
M
Q
 
L
A
 
A
Q
 
A
G
 
G
S
 
-
R
 
K
G
 
G
V
 
N
I
 
I
L
 
I
N
 
N
T
|
T
S
 
C
S
|
S
V
 
V
Y
 
G
A
 
G
Q
 
L
I
 
V
A
 
A
S
 
W
E
 
P
M
 
D
T
 
I
F
 
P
T
 
A
Y
|
Y
N
 
N
V
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
L
M
 
Q
M
 
L
T
 
T
K
 
K
C
 
S
A
 
M
A
 
A
L
 
V
E
 
D
L
 
Y
A
 
A
P
 
K
L
 
H
G
 
Q
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
R
x
I
V
x
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
M
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
K
-
 
S
-
 
F
L
 
L
R
 
E
Q
 
N
Y
 
N
E
 
E
A
 
-
L
 
-
G
 
G
L
 
T
W
 
L
E
 
E
H
 
E
I
 
I
R
 
K
K
 
K
E
 
E
Q
 
K
M
 
A
R
 
K
-
 
V
-
 
N
-
 
P
-
 
L
Q
 
L
E
 
R
F
 
L
T
 
G
Q
 
K
P
 
P
N
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
N
V
 
V
V
 
M
A
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
L
A
 
S
N
 
S
C
 
Y
I
 
M
N
 
T
G
 
G
C
 
S
T
 
A
V
 
I
N
 
T
A
 
A
S
 
D
D
 
G
G
 
G
F
 
Y

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
35% identity, 95% coverage: 4:244/253 of query aligns to 3:244/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
L
 
M
N
 
T
K
 
K
T
 
S
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
S
G
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
S
I
 
I
I
 
A
R
 
L
K
 
Q
L
 
L
L
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
V
-
 
N
-
 
Y
A
 
A
D
 
G
L
 
S
S
 
K
A
 
E
D
 
K
A
 
A
L
 
E
K
 
A
V
 
V
F
 
V
N
 
E
D
 
E
F
 
I
P
 
K
A
 
A
D
 
K
K
 
G
L
 
V
V
 
D
T
 
S
F
 
F
S
 
A
V
 
I
-
 
Q
-
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
D
 
D
Y
 
A
K
 
D
Q
 
E
V
 
V
E
 
K
A
 
A
M
 
M
V
 
I
K
 
K
H
 
E
A
 
V
A
 
V
D
 
S
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
T
L
 
R
A
 
D
K
 
N
P
 
L
L
 
L
L
 
M
Q
 
R
H
 
M
D
 
K
P
 
E
I
 
-
N
 
Q
D
 
E
F
 
W
E
 
D
P
 
D
V
 
V
T
 
I
N
 
D
V
 
T
N
 
N
Q
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
H
 
N
G
 
C
I
 
I
L
 
Q
A
 
K
G
 
A
G
 
T
R
 
P
Q
 
Q
F
 
M
Q
 
L
A
 
R
Q
 
Q
G
 
R
S
 
S
R
 
-
G
 
G
V
 
A
I
 
I
L
 
I
N
 
N
T
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
Y
 
V
A
 
G
Q
 
A
I
 
V
A
 
G
S
 
N
E
 
P
M
 
G
T
x
Q
F
 
A
T
 
N
Y
|
Y
N
 
V
V
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
I
M
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
S
L
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
R
 
F
V
 
I
D
 
V
T
 
S
P
 
D
M
 
M
L
 
T
R
 
D
Q
 
-
Y
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
A
L
 
L
W
 
S
E
 
D
H
 
E
I
 
L
R
 
K
K
 
E
E
 
Q
Q
 
M
M
 
L
R
 
T
Q
 
Q
-
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
A
E
 
R
F
 
F
T
 
G
Q
 
Q
P
 
D
N
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
N
V
 
T
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
N
 
K
C
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
C
 
Q
T
 
T
V
 
I
N
 
H
A
 
V
S
 
N
D
 
G
G
 
G
F
 
M

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
33% identity, 96% coverage: 1:243/253 of query aligns to 1:246/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
M
 
M
R
 
R
L
 
F
L
 
D
N
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
G
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
I
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
F
L
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
L
A
 
A
D
|
D
L
 
W
S
 
A
A
 
K
D
 
E
A
 
A
L
 
V
-
 
D
K
 
K
V
 
V
F
 
A
N
 
A
D
 
S
F
 
L
P
 
P
A
 
K
D
 
G
K
 
R
L
 
A
V
 
M
T
 
A
F
 
V
S
 
H
V
 
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Y
 
H
K
 
V
Q
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
K
M
 
M
V
 
M
K
 
N
H
 
E
A
 
V
A
 
A
D
 
E
Q
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
L
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
H
L
 
V
A
 
A
K
 
G
P
 
S
L
 
V
L
 
L
Q
 
E
H
 
-
D
 
T
P
 
S
I
 
I
N
 
D
D
 
D
F
 
W
E
 
R
P
 
R
V
 
I
T
 
A
N
 
G
V
 
V
N
 
D
Q
 
I
K
 
D
G
 
G
-
 
V
V
 
V
Y
 
F
H
 
C
G
 
S
I
 
K
L
 
F
A
 
A
G
 
L
G
 
P
R
 
H
Q
 
L
F
 
L
Q
 
K
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
S
 
T
R
 
K
G
 
G
V
 
C
I
 
I
L
 
V
N
 
N
T
 
T
S
 
A
S
|
S
V
|
V
Y
x
S
A
 
G
Q
 
L
I
 
G
A
 
G
S
 
D
E
 
W
M
 
G
T
 
A
F
 
A
T
 
Y
Y
|
Y
N
 
C
V
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
D
 
V
M
 
N
M
 
L
T
 
T
K
 
R
C
 
A
A
 
M
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
H
A
 
G
P
 
G
L
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
C
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
S
R
 
L
V
|
V
D
 
K
T
|
T
P
 
N
M
 
M
L
 
T
R
 
N
Q
 
G
Y
 
W
E
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
E
 
-
H
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
P
E
 
Q
Q
 
E
M
 
I
R
|
R
Q
x
D
E
x
K
F
 
F
T
 
N
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
A
Q
 
E
P
 
P
N
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
N
 
S
C
 
F
I
 
I
N
 
N
G
 
G
C
 
A
T
 
N
V
 
I
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
A
N
 
T
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4wecA Crystal structure of a short chain dehydrogenase from mycobacterium smegmatis
35% identity, 99% coverage: 2:251/253 of query aligns to 7:258/258 of 4wecA

query
sites
4wecA
R
 
R
L
 
L
L
 
A
N
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
|
A
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
T
I
 
G
R
 
R
K
 
R
L
 
L
L
 
R
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
V
 
V
A
 
V
A
 
G
D
|
D
L
x
I
S
 
D
A
 
P
D
 
T
A
 
T
L
 
G
K
 
K
V
 
A
F
 
-
N
 
-
D
 
-
F
 
-
P
 
A
A
 
A
D
 
D
K
 
E
L
 
L
-
 
E
-
 
G
V
 
L
T
 
F
F
 
V
S
 
P
V
|
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
E
Y
 
Q
K
 
E
Q
 
A
V
 
V
E
 
D
A
 
N
M
 
L
V
 
F
K
 
D
H
 
T
A
 
A
A
 
A
D
 
S
Q
 
T
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
A
I
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
S
L
 
P
A
 
P
K
 
E
P
 
D
-
 
D
L
 
L
L
 
I
Q
 
E
H
 
N
D
 
T
P
 
D
I
 
L
N
 
P
D
 
A
F
 
W
E
 
Q
P
 
R
V
 
V
T
 
Q
N
 
D
V
 
I
N
 
N
Q
 
L
K
 
K
G
 
S
V
 
V
Y
 
Y
H
 
L
G
 
S
I
 
C
L
 
R
A
 
A
G
 
A
G
 
L
R
 
R
Q
 
H
F
 
M
Q
 
V
A
 
P
Q
 
A
G
 
G
S
 
-
R
 
K
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
T
|
T
S
 
A
S
|
S
V
 
F
Y
 
V
A
 
A
Q
 
V
I
 
M
A
 
G
S
 
S
E
 
A
M
 
T
T
 
S
-
x
Q
F
 
I
T
 
S
Y
|
Y
N
 
T
V
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
G
V
 
V
D
 
L
M
 
A
M
 
M
T
 
S
K
 
R
C
 
E
A
 
L
A
 
G
L
 
V
E
 
Q
L
 
Y
A
 
A
P
 
R
L
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
C
P
|
P
G
 
G
R
x
P
V
|
V
D
 
N
T
 
T
P
 
P
M
 
L
L
 
L
R
 
Q
Q
 
E
Y
 
L
E
 
F
A
 
A
L
 
K
G
 
D
L
 
P
W
 
E
E
 
R
H
 
A
I
 
A
R
 
R
K
 
R
-
 
L
-
 
V
E
 
H
Q
 
I
M
 
P
R
 
L
Q
 
G
E
 
R
F
 
F
T
 
A
Q
 
E
P
 
P
N
 
E
E
 
E
I
 
L
A
 
A
D
 
A
V
 
A
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
N
 
S
C
 
F
I
 
I
N
 
T
G
 
G
C
 
S
T
 
T
V
 
F
N
 
L
A
 
V
S
 
D
D
 
G
G
 
G
F
 
I
E
 
S
N
 
S
-
 
A
F
 
Y
K
 
V
Y
 
T
P
 
P
L
 
L

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
36% identity, 94% coverage: 6:244/253 of query aligns to 2:237/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
T
 
S
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
S
I
 
I
I
 
A
R
 
L
K
 
Q
L
 
L
L
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
V
-
x
N
-
x
Y
A
|
A
D
x
G
L
x
S
S
 
K
A
 
E
D
 
K
A
 
A
L
 
E
K
 
A
V
 
V
F
 
V
N
 
E
D
 
E
F
 
I
P
 
K
A
 
A
D
 
K
K
 
G
L
 
V
V
 
D
T
 
S
F
 
F
S
 
A
V
 
I
-
 
Q
-
x
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
D
 
D
Y
 
A
K
 
D
Q
 
E
V
 
V
E
 
K
A
 
A
M
 
M
V
 
I
K
 
K
H
 
E
A
 
V
A
 
V
D
 
S
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
G
 
T
L
 
R
A
 
D
K
 
N
P
 
L
L
 
L
L
 
M
Q
 
R
H
 
M
D
 
K
P
 
E
I
 
-
N
 
Q
D
 
E
F
 
W
E
 
D
P
 
D
V
 
V
T
 
I
N
 
D
V
x
T
N
 
N
Q
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
H
 
N
G
 
C
I
 
I
L
 
Q
A
 
K
G
 
A
G
 
T
R
 
P
Q
 
Q
F
 
M
Q
 
L
A
 
R
Q
 
Q
G
 
R
S
 
S
R
 
-
G
 
G
V
 
A
I
 
I
L
 
I
N
 
N
T
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
Y
 
V
A
 
G
Q
 
A
I
 
V
A
 
G
S
 
N
E
 
P
M
 
G
T
x
Q
F
 
A
T
 
N
Y
|
Y
N
 
V
V
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
I
M
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
C
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
S
L
 
R
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
V
C
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
R
 
F
V
 
I
D
 
V
T
 
S
P
 
D
M
 
M
L
 
T
R
 
D
Q
 
E
Y
 
L
E
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
E
 
-
H
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
K
E
 
E
Q
 
Q
M
 
M
R
 
L
Q
 
T
E
 
Q
-
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
R
F
 
F
T
 
G
Q
 
Q
P
 
D
N
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
D
 
N
V
 
T
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
A
N
 
K
C
 
Y
I
 
I
N
 
T
G
 
G
C
 
Q
T
 
T
V
 
I
N
 
H
A
 
V
S
 
N
D
 
G
G
 
G
F
 
M

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
33% identity, 98% coverage: 2:249/253 of query aligns to 1:258/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
R
 
R
L
 
F
L
 
T
N
 
D
K
 
R
T
 
V
A
 
V
V
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
G
G
x
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
I
 
T
I
 
A
R
 
V
K
 
R
L
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
L
V
 
S
A
 
L
A
 
V
D
|
D
L
x
V
S
 
S
A
 
S
D
 
E
A
 
G
L
 
L
K
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
A
V
 
V
F
 
L
N
 
E
D
 
T
F
 
A
P
 
P
A
 
D
D
 
A
K
 
E
L
 
V
V
 
L
T
 
T
F
 
T
S
 
V
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Y
 
E
K
 
A
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
A
 
A
M
 
Y
V
 
V
K
 
T
H
 
A
A
 
T
A
 
T
D
 
E
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
G
L
 
F
I
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
E
L
 
G
A
 
K
K
 
Q
P
 
N
L
 
P
L
 
T
Q
 
E
H
 
S
D
 
F
P
 
T
I
 
A
N
 
A
D
 
E
F
 
F
E
 
D
P
 
K
V
 
V
T
 
V
N
 
S
V
 
I
N
 
N
Q
 
L
K
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
H
 
L
G
 
G
I
 
L
L
 
E
A
 
K
G
 
V
G
 
L
R
 
K
Q
 
I
F
 
M
Q
 
R
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
R
 
-
G
 
G
V
 
M
I
 
V
L
 
V
N
 
N
T
|
T
S
 
A
S
|
S
V
 
V
Y
 
G
A
 
G
Q
 
I
I
 
R
A
 
G
S
 
I
E
 
G
M
 
N
T
x
Q
F
 
S
T
 
G
Y
|
Y
N
 
A
V
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
D
 
V
M
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
R
C
 
N
A
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
P
 
R
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
C
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
R
 
A
V
 
I
D
 
W
T
|
T
P
|
P
M
|
M
L
 
V
R
 
E
Q
 
N
Y
 
S
E
 
M
A
 
K
L
 
Q
G
 
L
L
 
D
W
 
P
E
 
E
H
 
N
I
 
P
R
 
R
K
 
K
E
 
A
Q
 
A
M
 
-
R
 
-
Q
 
E
E
 
E
F
 
F
T
 
I
Q
 
Q
P
 
V
N
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
K
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
N
 
S
C
 
Y
I
 
V
N
 
N
G
 
-
C
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
V
A
 
P
S
 
I
D
 
D
G
 
G
F
 
G
E
 
Q
N
 
S
F
 
A
K
 
A
Y
 
Y

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
33% identity, 98% coverage: 2:249/253 of query aligns to 10:267/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
R
 
R
L
 
F
L
 
T
N
 
D
K
 
R
T
 
V
A
 
V
V
x
L
V
x
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
A
x
G
G
x
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
Q
x
R
A
|
A
I
x
T
I
x
A
R
x
V
K
x
R
L
|
L
L
x
A
A
|
A
E
|
E
G
|
G
A
|
A
R
x
K
V
x
L
V
x
S
A
x
L
A
 
V
D
 
D
L
 
V
S
 
S
A
 
S
D
 
E
A
 
G
L
 
L
K
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
K
-
 
A
-
 
A
V
 
V
F
 
L
N
 
E
D
 
T
F
 
A
P
 
P
A
 
D
D
 
A
K
 
E
L
 
V
V
 
L
T
 
T
F
 
T
S
 
V
V
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
Y
 
E
K
 
A
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
A
 
A
M
 
Y
V
 
V
K
 
T
H
 
A
A
 
T
A
 
T
D
 
E
Q
 
R
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
G
L
 
F
I
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
x
E
L
 
G
A
 
K
K
 
Q
P
 
N
L
 
P
L
 
T
Q
 
E
H
 
S
D
 
F
P
 
T
I
 
A
N
 
A
D
 
E
F
 
F
E
 
D
P
 
K
V
 
V
T
 
V
N
 
S
V
 
I
N
 
N
Q
 
L
K
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
H
 
L
G
 
G
I
 
L
L
 
E
A
 
K
G
 
V
G
 
L
R
 
K
Q
 
I
F
 
M
Q
 
R
A
 
E
Q
 
Q
G
 
G
S
 
S
R
 
-
G
 
G
V
 
M
I
 
V
L
 
V
N
 
N
T
 
T
S
 
A
S
 
S
V
 
V
Y
 
G
A
 
G
Q
 
I
I
 
R
A
 
G
S
 
I
E
 
G
M
 
N
T
 
Q
F
 
S
T
 
G
Y
 
Y
N
 
A
V
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
H
A
 
G
V
 
V
D
 
V
M
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
R
C
 
N
A
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
P
 
R
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
C
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
R
 
A
V
 
I
D
 
W
T
 
T
P
 
P
M
 
M
L
 
V
R
 
E
Q
 
N
Y
 
S
E
 
M
A
 
K
L
 
Q
G
 
L
L
 
D
W
 
P
E
 
E
H
 
N
I
 
P
R
 
R
K
 
K
E
 
A
Q
 
A
M
 
-
R
 
-
Q
 
E
E
 
E
F
 
F
T
 
I
Q
 
Q
P
 
V
N
 
N
-
 
P
-
 
S
-
 
K
-
 
R
-
 
Y
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
P
E
 
E
I
 
I
A
 
A
D
 
A
V
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
L
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
N
 
S
C
 
Y
I
 
V
N
 
N
G
 
-
C
 
A
T
 
T
V
 
V
N
 
V
A
 
P
S
 
I
D
 
D
G
 
G
F
 
G
E
 
Q
N
 
S
F
 
A
K
 
A
Y
 
Y

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
33% identity, 96% coverage: 2:243/253 of query aligns to 2:246/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
R
 
R
L
 
F
L
 
D
N
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
I
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
F
L
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
L
A
 
A
D
|
D
L
x
W
S
x
A
A
 
K
D
 
E
A
 
A
L
 
V
-
 
D
K
 
K
V
 
V
F
 
A
N
 
A
D
 
S
F
 
L
P
 
P
A
 
K
D
 
G
K
 
R
L
 
A
V
 
M
T
 
A
F
 
V
S
 
H
V
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Y
 
H
K
 
V
Q
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
K
M
 
M
V
 
M
K
 
N
H
 
E
A
 
V
A
 
A
D
 
E
Q
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
G
 
H
L
 
V
A
 
A
K
 
G
P
 
S
L
 
V
L
 
L
Q
 
E
H
 
-
D
 
T
P
 
S
I
 
I
N
 
D
D
 
D
F
 
W
E
 
R
P
 
R
V
 
I
T
 
A
N
 
G
V
|
V
N
 
D
Q
 
I
K
 
D
G
 
G
-
 
V
V
 
V
Y
 
F
H
 
C
G
 
S
I
 
K
L
 
F
A
 
A
G
 
L
G
 
P
R
 
H
Q
 
L
F
 
L
Q
 
K
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
S
 
T
R
 
K
G
 
G
V
 
C
I
 
I
L
 
V
N
 
N
T
|
T
S
 
A
S
|
S
V
 
V
Y
x
S
A
 
G
Q
 
L
I
 
G
A
 
G
S
 
D
E
 
W
M
 
G
T
 
A
F
 
A
T
 
Y
Y
|
Y
N
 
C
V
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
D
 
V
M
 
N
M
 
L
T
 
T
K
 
R
C
 
A
A
 
M
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
H
A
 
G
P
 
G
L
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
C
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
x
S
R
x
L
V
|
V
D
 
K
T
|
T
P
x
N
M
|
M
L
x
T
R
 
N
Q
 
G
Y
 
W
E
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
E
 
-
H
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
P
E
 
Q
Q
 
E
M
 
I
R
 
R
Q
 
D
E
 
K
F
 
F
T
 
N
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
A
Q
 
E
P
 
P
N
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
N
 
S
C
 
F
I
 
I
N
 
N
G
 
G
C
 
A
T
 
N
V
 
I
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
A
N
 
T
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
G

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
33% identity, 96% coverage: 2:243/253 of query aligns to 2:246/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
R
 
R
L
 
F
L
 
D
N
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
I
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
F
L
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
L
A
 
A
D
|
D
L
x
W
S
x
A
A
 
K
D
 
E
A
 
A
L
 
V
-
 
D
K
 
K
V
 
V
F
 
A
N
 
A
D
 
S
F
 
L
P
 
P
A
 
K
D
 
G
K
 
R
L
 
A
V
 
M
T
 
A
F
 
V
S
 
H
V
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Y
 
H
K
 
V
Q
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
K
M
 
M
V
 
M
K
 
N
H
 
E
A
 
V
A
 
A
D
 
E
Q
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
x
V
G
 
H
L
 
V
A
 
A
K
 
G
P
 
S
L
 
V
L
 
L
Q
 
E
H
 
-
D
 
T
P
 
S
I
 
I
N
 
D
D
 
D
F
 
W
E
 
R
P
 
R
V
 
I
T
 
A
N
 
G
V
|
V
N
 
D
Q
 
I
K
 
D
G
 
G
-
 
V
V
 
V
Y
 
F
H
 
C
G
 
S
I
 
K
L
 
F
A
 
A
G
 
L
G
 
P
R
 
H
Q
 
L
F
 
L
Q
 
K
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
S
 
T
R
 
K
G
 
G
V
 
C
I
 
I
L
 
V
N
 
N
T
|
T
S
 
A
S
|
S
V
 
V
Y
 
S
A
 
G
Q
 
L
I
 
G
A
 
G
S
 
D
E
 
W
M
 
G
T
 
A
F
 
A
T
 
Y
Y
|
Y
N
 
C
V
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
D
 
V
M
 
N
M
 
L
T
 
T
K
 
R
C
 
A
A
 
M
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
H
A
 
G
P
 
G
L
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
C
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
x
S
R
x
L
V
|
V
D
 
K
T
|
T
P
x
N
M
|
M
L
x
T
R
 
N
Q
 
G
Y
 
W
E
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
E
 
-
H
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
P
E
 
Q
Q
 
E
M
 
I
R
 
R
Q
 
D
E
 
K
F
 
F
T
 
N
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
A
Q
 
E
P
 
P
N
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
N
 
S
C
 
F
I
 
I
N
 
N
G
 
G
C
 
A
T
 
N
V
 
I
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
A
N
 
T
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
G

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
33% identity, 96% coverage: 2:243/253 of query aligns to 4:248/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
R
 
R
L
 
F
L
 
D
N
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
V
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
x
N
G
|
G
I
 
M
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
I
 
A
R
 
R
K
 
R
L
 
F
L
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
L
A
 
A
D
|
D
L
x
W
S
 
A
A
 
K
D
 
E
A
 
A
L
 
V
-
 
D
K
 
K
V
 
V
F
 
A
N
 
A
D
 
S
F
 
L
P
 
P
A
 
K
D
 
G
K
 
R
L
 
A
V
 
M
T
 
A
F
 
V
S
 
H
V
x
I
D
|
D
V
|
V
T
 
S
D
 
D
Y
 
H
K
 
V
Q
 
A
V
 
V
E
 
E
A
 
K
M
 
M
V
 
M
K
 
N
H
 
E
A
 
V
A
 
A
D
 
E
Q
 
K
F
 
L
G
 
G
Q
 
R
L
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
L
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
I
 
V
G
 
H
L
 
V
A
 
A
K
 
G
P
 
S
L
 
V
L
 
L
Q
 
E
H
 
-
D
 
T
P
 
S
I
 
I
N
 
D
D
 
D
F
 
W
E
 
R
P
 
R
V
 
I
T
 
A
N
 
G
V
 
V
N
 
D
Q
 
I
K
 
D
G
 
G
-
 
V
V
 
V
Y
 
F
H
 
C
G
 
S
I
 
K
L
 
F
A
 
A
G
 
L
G
 
P
R
 
H
Q
 
L
F
 
L
Q
 
K
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
S
 
T
R
 
K
G
 
G
V
 
C
I
 
I
L
 
V
N
 
N
T
 
T
S
 
A
S
|
S
V
 
V
Y
 
S
A
 
G
Q
 
L
I
 
G
A
 
G
S
 
D
E
 
W
M
 
G
T
 
A
F
 
A
T
 
Y
Y
|
Y
N
 
C
V
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
G
A
 
A
V
 
V
D
 
V
M
 
N
M
 
L
T
 
T
K
 
R
C
 
A
A
 
M
A
 
A
L
 
L
E
 
D
L
 
H
A
 
G
P
 
G
L
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
R
V
 
I
C
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
S
R
 
L
V
 
V
D
 
K
T
 
T
P
 
N
M
 
M
L
 
T
R
 
N
Q
 
G
Y
 
W
E
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
E
 
-
H
 
-
I
 
-
R
 
-
K
 
P
E
 
Q
Q
 
E
M
 
I
R
 
R
Q
 
D
E
 
K
F
 
F
T
 
N
-
 
E
-
 
R
-
 
I
-
 
A
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
A
Q
 
E
P
 
P
N
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
A
V
 
V
V
 
M
A
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
D
A
 
A
N
 
S
C
 
F
I
 
I
N
 
N
G
 
G
C
 
A
T
 
N
V
 
I
-
 
P
-
 
V
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
A
N
 
T
A
 
A
S
 
S
D
 
D
G
 
G

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
36% identity, 96% coverage: 1:244/253 of query aligns to 4:245/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
M
 
M
R
 
K
L
 
L
L
 
A
N
 
S
K
 
K
T
 
T
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
A
R
 
Q
K
 
V
L
 
L
L
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
V
 
V
V
 
I
A
 
I
A
 
A
D
|
D
L
x
R
S
 
D
A
 
A
D
 
H
-
 
G
-
 
E
-
 
A
A
 
A
L
 
A
K
 
A
V
 
S
F
 
L
N
 
R
D
 
E
F
 
S
P
 
G
A
 
A
D
 
Q
K
 
A
L
 
L
V
 
F
T
 
-
F
 
I
S
 
S
V
x
C
D
 
N
V
x
I
T
 
A
D
 
E
Y
 
K
K
 
T
Q
 
Q
V
 
V
E
 
E
A
 
A
M
 
L
V
 
F
K
 
S
H
 
Q
A
 
A
A
 
E
D
 
E
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
Q
 
P
L
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
N
L
 
R
A
 
-
K
 
D
P
 
A
L
 
M
L
 
L
Q
 
H
H
 
K
D
 
L
P
 
T
I
 
E
N
 
A
D
 
D
F
 
W
E
 
D
P
 
T
V
 
V
T
 
I
N
 
D
V
|
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
K
G
 
G
V
 
T
Y
 
F
H
 
L
G
 
C
I
 
M
L
 
Q
A
 
Q
G
 
A
G
 
A
R
 
I
Q
 
R
F
 
M
Q
 
R
A
 
E
Q
 
R
G
 
G
S
 
A
R
 
-
G
 
G
V
 
R
I
 
I
L
 
I
N
 
N
T
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
A
Y
 
-
A
 
S
Q
 
W
I
 
L
A
 
G
S
 
N
E
 
V
M
 
G
T
 
Q
F
 
T
T
 
N
Y
|
Y
N
 
S
V
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
V
M
 
G
M
 
M
T
 
T
K
 
K
C
 
T
A
 
A
A
 
C
L
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
P
 
K
L
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
T
V
 
V
C
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
R
 
F
V
x
I
D
 
D
T
|
T
P
 
D
M
 
M
L
x
T
R
 
R
Q
 
G
Y
 
V
E
 
P
A
 
E
L
 
-
G
 
N
L
 
V
W
 
W
E
 
Q
H
 
I
I
 
M
R
 
V
K
 
S
E
 
K
Q
 
I
M
 
P
R
 
A
Q
 
G
E
 
Y
F
 
A
T
 
G
Q
 
E
P
 
A
N
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
D
 
E
V
 
C
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
G
A
 
A
N
 
R
C
 
Y
I
 
I
N
 
N
G
 
G
C
 
E
T
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
V
S
 
G
D
 
G
G
 
G
F
 
M

3ak4A Crystal structure of nadh-dependent quinuclidinone reductase from agrobacterium tumefaciens
35% identity, 95% coverage: 3:243/253 of query aligns to 5:254/258 of 3ak4A

query
sites
3ak4A
L
 
L
L
 
S
N
 
G
K
 
R
T
 
K
A
 
A
V
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
S
G
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
I
 
I
I
 
A
R
 
R
K
 
A
L
 
L
L
 
D
A
 
K
E
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
V
V
 
A
A
 
I
A
 
A
D
|
D
L
|
L
S
 
D
A
 
V
D
 
M
A
 
A
L
 
A
K
 
Q
V
 
A
F
 
V
N
 
V
D
 
A
F
 
G
P
 
L
A
 
E
D
 
N
K
 
G
L
 
G
V
 
F
T
 
A
F
 
V
S
 
E
V
|
V
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
Y
 
R
K
 
A
Q
 
S
V
 
V
E
 
D
A
 
A
M
 
A
V
 
M
K
 
Q
H
 
K
A
 
A
A
 
I
D
 
D
Q
 
A
F
 
L
G
 
G
Q
 
G
L
 
F
D
 
D
I
 
L
L
 
L
I
 
C
N
 
A
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
V
G
 
S
L
 
T
A
 
M
K
 
R
P
 
P
L
 
A
L
 
V
Q
 
D
-
 
I
H
 
T
D
 
D
P
 
E
I
 
E
N
 
W
D
 
D
F
 
F
E
 
N
P
 
-
V
 
-
T
 
F
N
 
D
V
 
V
N
 
N
Q
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
H
 
L
G
 
A
I
 
N
L
 
Q
A
 
I
G
 
A
G
 
C
R
 
R
Q
 
H
F
 
F
Q
 
L
A
 
A
Q
 
S
G
 
N
S
 
T
R
 
K
G
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
T
|
T
S
 
A
S
|
S
V
 
L
Y
 
A
A
 
A
Q
 
K
I
 
V
A
 
G
S
 
A
E
 
P
M
 
L
T
x
L
F
 
A
T
 
H
Y
|
Y
N
 
S
V
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
D
 
F
M
 
G
M
 
W
T
 
T
K
 
Q
C
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
R
E
 
E
L
 
M
A
 
A
P
 
P
L
 
K
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
|
G
R
 
F
V
|
V
D
 
K
T
|
T
P
 
A
M
|
M
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
Y
 
Q
E
 
E
A
 
R
L
 
E
G
 
I
L
 
I
W
 
W
E
|
E
H
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
G
I
 
M
R
 
T
K
 
P
E
 
E
Q
 
A
M
 
V
R
 
R
Q
 
A
E
 
E
F
 
Y
T
 
V
-
 
S
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
I
-
 
E
Q
 
E
P
 
P
N
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
V
F
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
A
A
 
A
N
 
R
C
 
F
I
 
M
N
 
T
G
 
G
C
 
Q
T
 
G
V
 
I
N
 
N
A
 
V
S
 
T
D
 
G
G
 
G

O18404 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2; 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase 10; 17-beta-HSD 10; 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type II; Hydroxysteroid dehydrogenase; Mitochondrial ribonuclease P protein 2; Mitochondrial RNase P protein 2; Scully protein; Type II HADH; EC 1.1.1.35; EC 1.1.1.51; EC 1.1.1.62; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.53 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see 3 papers)
35% identity, 86% coverage: 5:222/253 of query aligns to 4:231/255 of O18404

query
sites
O18404
N
 
N
K
 
A
T
 
V
A
 
S
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
G
 
S
G
 
G
I
 
L
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
I
 
T
I
 
A
R
 
E
K
 
R
L
 
L
L
 
A
A
 
K
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
S
V
 
V
V
 
I
A
x
L
A
 
A
D
 
D
L
 
L
S
 
P
A
 
S
D
 
S
A
 
K
L
 
G
K
 
N
V
 
E
F
 
V
N
 
A
D
 
K
F
 
E
P
 
L
A
 
G
D
 
D
K
 
K
L
 
V
V
 
V
T
 
F
F
 
V
S
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
V
T
 
T
D
 
S
Y
 
E
K
 
K
Q
 
D
V
 
V
E
 
S
A
 
A
M
 
A
V
 
L
K
 
Q
H
 
T
A
 
A
A
 
K
D
 
D
Q
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
L
L
 
T
I
 
V
N
 
N
N
 
C
A
 
A
G
 
G
I
 
T
G
 
A
L
 
T
A
 
A
K
 
V
P
 
K
L
 
T
L
 
F
Q
 
N
H
 
F
D
 
N
P
 
K
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
H
-
 
R
I
 
L
N
 
E
D
 
D
F
 
F
E
 
Q
P
 
R
V
 
V
T
 
I
N
 
N
V
 
I
N
 
N
Q
 
T
K
 
V
G
 
G
V
 
T
Y
x
F
H
 
N
G
 
V
I
 
I
-
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
G
L
 
L
A
 
M
G
 
G
G
 
A
R
 
N
Q
 
E
F
 
P
Q
 
N
A
 
Q
Q
 
D
G
 
G
S
 
Q
R
 
R
G
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
T
 
T
S
 
A
S
 
S
V
 
V
Y
 
A
A
 
A
Q
 
F
I
 
D
A
 
G
S
 
Q
E
 
I
M
 
G
T
x
Q
F
 
A
T
 
A
Y
 
Y
N
x
S
V
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
V
M
 
G
M
 
M
T
 
T
K
 
L
C
 
P
A
 
I
A
 
A
L
 
R
E
 
D
L
 
L
A
 
S
P
 
T
L
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
C
 
C
A
 
T
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
R
 
L
V
 
F
D
 
N
T
 
T
P
 
P
M
 
M
L
 
L
R
 
-
Q
 
-
Y
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
A
G
 
A
L
 
L
W
 
P
E
 
E
H
 
K
I
 
V
R
 
R
K
 
T
E
 
F
Q
 
L
M
 
A
R
 
K
-
 
S
-
 
I
-
 
P
-
 
F
-
 
P
Q
 
Q
E
 
R
F
 
L
T
 
G
Q
 
E
P
 
P
N
 
S
E
 
E
I
 
Y
A
 
A
D
 
H
V
 
L
V
 
V

P9WGT1 3-alpha-(or 20-beta)-hydroxysteroid dehydrogenase; NADH-dependent 3alpha, 20beta-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.53 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
34% identity, 93% coverage: 2:236/253 of query aligns to 4:230/260 of P9WGT1

query
sites
P9WGT1
R
 
R
L
 
L
L
x
I
N
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
A
 
G
A
 
A
G
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
Q
 
A
A
 
S
I
 
H
I
 
V
R
 
R
K
 
A
L
 
M
L
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
F
A
 
G
D
|
D
L
 
I
S
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
E
L
 
G
K
 
K
V
 
A
F
x
V
N
 
A
D
 
A
F
 
E
P
 
L
A
 
A
D
 
D
K
 
A
L
 
A
V
 
R
T
 
Y
F
 
V
S
 
H
V
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
Q
Y
 
P
K
 
A
Q
 
Q
V
 
W
E
x
T
A
 
A
M
 
A
V
 
V
K
 
D
H
 
T
A
 
A
A
 
V
D
 
T
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
Q
 
G
L
 
L
D
 
H
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
-
L
 
L
A
 
N
K
 
I
P
 
G
L
 
T
L
 
I
Q
 
E
H
 
D
D
 
Y
P
 
A
I
 
L
N
 
T
D
 
E
F
 
W
E
 
Q
P
 
R
V
 
I
T
 
L
N
 
D
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
H
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
R
A
 
A
G
 
V
G
 
V
R
 
K
Q
 
P
F
 
M
Q
 
K
A
 
E
Q
 
A
G
 
G
S
 
-
R
 
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
T
 
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
Y
 
E
A
 
G
Q
 
L
I
 
A
A
 
G
S
 
T
E
 
V
M
 
A
T
 
C
F
 
H
T
 
G
Y
|
Y
N
 
T
V
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
D
 
R
M
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
C
 
S
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
S
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
A
 
S
V
 
I
A
 
H
P
|
P
G
|
G
R
x
L
V
|
V
D
x
K
T
|
T
P
|
P
M
|
M
L
x
T
R
 
D
Q
 
W
Y
 
V
E
 
P
A
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
E
 
E
H
 
D
I
 
I
R
 
F
K
 
Q
E
 
T
Q
 
A
M
 
L
R
 
G
Q
 
R
E
 
A
F
 
-
T
 
A
Q
 
E
P
 
P
N
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
S
D
 
N
V
 
L
V
 
V
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
N
 
S
C
 
Y
I
 
S
N
 
T
G
 
G
C
 
A

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
32% identity, 92% coverage: 3:235/253 of query aligns to 3:236/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
L
 
L
L
 
D
N
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
V
I
 
A
R
 
H
K
 
S
L
 
Y
L
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
I
A
 
V
A
 
S
D
|
D
L
x
I
S
 
N
A
 
E
D
 
D
-
 
H
A
 
G
L
 
N
K
 
K
V
 
A
F
 
V
N
 
E
D
 
D
F
 
I
P
 
K
A
 
A
D
 
Q
-
 
G
-
 
G
K
 
E
L
 
A
V
 
S
T
 
F
F
 
V
S
 
K
V
x
A
D
|
D
V
x
T
T
 
S
D
 
N
Y
 
P
K
 
E
Q
 
E
V
 
V
E
 
E
A
 
A
M
 
L
V
 
V
K
 
K
H
 
R
A
 
T
A
 
V
D
 
E
Q
 
I
F
 
Y
G
 
G
Q
 
R
L
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
A
I
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
G
A
 
E
K
 
Q
P
 
A
L
 
L
L
 
A
Q
 
G
H
 
D
D
 
Y
P
 
G
I
 
L
N
 
D
D
 
S
F
 
W
E
 
R
P
 
K
V
 
V
T
 
L
N
 
S
V
 
I
N
 
N
Q
 
L
K
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
H
 
Y
G
 
G
I
 
C
L
 
K
A
 
Y
G
 
E
G
 
L
R
 
E
Q
 
Q
F
 
M
Q
 
E
A
 
K
Q
 
N
G
 
G
S
 
G
R
 
-
G
 
G
V
 
V
I
 
I
L
 
V
N
 
N
T
x
M
S
 
A
S
|
S
V
 
I
Y
 
H
A
 
G
Q
 
I
I
 
V
A
 
A
S
 
A
E
 
P
M
 
L
T
 
S
F
 
S
T
 
A
Y
|
Y
N
 
T
V
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
D
 
V
M
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
C
 
N
A
 
I
A
 
G
L
 
A
E
 
E
L
 
Y
A
 
G
P
 
Q
L
 
K
G
 
N
V
 
I
R
 
R
V
 
C
C
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
R
x
Y
V
x
I
D
 
E
T
 
T
P
 
P
M
x
L
L
 
L
R
 
E
Q
 
S
Y
 
L
E
 
T
A
 
K
L
 
E
G
 
M
L
 
K
W
 
E
E
 
A
H
 
L
I
 
I
R
 
S
K
 
K
E
 
H
Q
 
P
M
 
M
R
 
G
Q
 
R
E
 
-
F
 
L
T
 
G
Q
 
K
P
 
P
N
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
E
V
 
L
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
V
 
S
S
 
S
D
 
E
E
 
K
A
 
S
N
 
S
C
 
F
I
 
M
N
 
T
G
 
G

1nfqA Rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
34% identity, 93% coverage: 2:236/253 of query aligns to 3:229/244 of 1nfqA

query
sites
1nfqA
R
 
R
L
 
L
L
 
T
N
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
S
G
 
G
A
 
G
A
 
A
G
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
Q
 
A
A
 
S
I
 
H
I
 
V
R
 
R
K
 
A
L
 
M
L
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
F
A
 
G
D
|
D
L
 
I
S
x
L
A
 
D
D
 
E
A
 
E
L
 
G
K
 
K
V
 
A
F
 
M
N
 
A
D
 
A
F
 
E
P
 
L
A
 
A
D
 
D
K
 
A
L
 
A
V
 
R
T
 
Y
F
 
V
S
 
H
V
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
Q
Y
 
P
K
 
A
Q
 
Q
V
 
W
E
 
K
A
 
A
M
 
A
V
 
V
K
 
D
H
 
T
A
 
A
A
 
V
D
 
T
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
Q
 
G
L
 
L
D
 
H
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
G
 
-
L
|
L
A
 
N
K
 
I
P
 
G
L
 
T
L
 
I
Q
 
E
H
 
D
D
 
Y
P
 
A
I
 
L
N
 
T
D
 
E
F
 
W
E
 
Q
P
 
R
V
 
I
T
 
L
N
 
D
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
H
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
R
A
 
A
G
 
V
G
 
V
R
 
K
Q
 
P
F
 
M
Q
 
K
A
 
E
Q
 
A
G
 
G
S
 
-
R
 
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
T
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
Y
x
E
A
 
G
Q
 
L
I
 
A
A
 
G
S
 
T
E
 
V
M
 
A
T
x
C
F
 
H
T
 
G
Y
|
Y
N
 
T
V
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
D
 
R
M
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
C
 
S
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
S
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
A
 
S
V
 
I
A
 
H
P
|
P
G
 
G
R
 
L
V
|
V
D
 
K
T
|
T
P
|
P
M
|
M
L
x
T
R
 
D
Q
 
W
Y
x
V
E
 
P
A
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
E
 
E
H
 
D
I
|
I
R
x
F
K
 
Q
E
 
T
Q
 
A
M
 
L
R
 
G
Q
 
R
E
 
A
F
 
-
T
 
A
Q
 
E
P
 
P
N
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
S
D
 
N
V
 
L
V
 
V
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
N
 
S
C
 
Y
I
 
S
N
 
T
G
 
G
C
 
A

1nffA Crystal structure of rv2002 gene product from mycobacterium tuberculosis (see paper)
34% identity, 93% coverage: 2:236/253 of query aligns to 3:229/244 of 1nffA

query
sites
1nffA
R
 
R
L
 
L
L
 
T
N
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
S
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
x
R
G
|
G
I
x
M
G
 
G
Q
 
A
A
 
S
I
 
H
I
 
V
R
 
R
K
 
A
L
 
M
L
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
V
A
 
F
A
 
G
D
|
D
L
x
I
S
x
L
A
 
D
D
 
E
A
 
E
L
 
G
K
 
K
V
 
A
F
 
M
N
 
A
D
 
A
F
 
E
P
 
L
A
 
A
D
 
D
K
 
A
L
 
A
V
 
R
T
 
Y
F
 
V
S
 
H
V
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
Q
Y
 
P
K
 
A
Q
 
Q
V
 
W
E
 
K
A
 
A
M
 
A
V
 
V
K
 
D
H
 
T
A
 
A
A
 
V
D
 
T
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
Q
 
G
L
 
L
D
 
H
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
G
 
-
L
 
L
A
 
N
K
 
I
P
 
G
L
 
T
L
 
I
Q
 
E
H
 
D
D
 
Y
P
 
A
I
 
L
N
 
T
D
 
E
F
 
W
E
 
Q
P
 
R
V
 
I
T
 
L
N
 
D
V
 
V
N
 
N
Q
 
L
K
 
T
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
H
 
L
G
 
G
I
 
I
L
 
R
A
 
A
G
 
V
G
 
V
R
 
K
Q
 
P
F
 
M
Q
 
K
A
 
E
Q
 
A
G
 
G
S
 
-
R
 
R
G
 
G
V
 
S
I
 
I
L
 
I
N
 
N
T
x
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
Y
 
E
A
 
G
Q
 
L
I
 
A
A
 
G
S
 
T
E
 
V
M
 
A
T
 
C
F
 
H
T
 
G
Y
|
Y
N
 
T
V
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
V
 
V
D
 
R
M
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
C
 
S
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
P
L
 
S
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
C
 
N
A
 
S
V
 
I
A
 
H
P
|
P
G
 
G
R
 
L
V
|
V
D
 
K
T
|
T
P
|
P
M
|
M
L
x
T
R
 
D
Q
 
W
Y
 
V
E
 
P
A
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
W
 
-
E
 
E
H
 
D
I
 
I
R
 
F
K
 
Q
E
 
T
Q
 
A
M
 
L
R
 
G
Q
 
R
E
 
A
F
 
-
T
 
A
Q
 
E
P
 
P
N
 
V
E
 
E
I
 
V
A
 
S
D
 
N
V
 
L
V
 
V
A
 
V
F
 
Y
L
 
L
V
 
A
S
 
S
D
 
D
E
 
E
A
 
S
N
 
S
C
 
Y
I
 
S
N
 
T
G
 
G
C
 
A

Query Sequence

>7023065 FitnessBrowser__ANA3:7023065
MRLLNKTAVVTGAAGGIGQAIIRKLLAEGARVVAADLSADALKVFNDFPADKLVTFSVDV
TDYKQVEAMVKHAADQFGQLDILINNAGIGLAKPLLQHDPINDFEPVTNVNQKGVYHGIL
AGGRQFQAQGSRGVILNTSSVYAQIASEMTFTYNVSKAAVDMMTKCAALELAPLGVRVCA
VAPGRVDTPMLRQYEALGLWEHIRKEQMRQEFTQPNEIADVVAFLVSDEANCINGCTVNA
SDGFENFKYPLLG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory