SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 7024497 Shewana3_1675 AMP-dependent synthetase and ligase (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5gxdA Structure of acryloyl-coa lyase prpe from dinoroseobacter shibae dfl 12
62% identity, 96% coverage: 20:634/640 of query aligns to 12:626/627 of 5gxdA

query
sites
5gxdA
N
 
D
K
 
P
Q
 
E
A
 
G
F
 
F
W
 
W
Q
 
M
Q
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
Q
A
 
A
L
 
I
D
 
D
W
 
W
V
 
V
T
 
T
P
 
P
S
 
P
K
 
G
Q
 
A
I
 
A
L
 
L
D
 
N
E
 
S
S
 
D
E
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
L
Y
 
Y
H
 
E
W
 
W
F
 
F
S
 
T
D
 
D
G
 
A
E
 
E
L
 
V
N
 
N
T
 
T
C
 
C
Y
 
F
N
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
D
R
 
R
H
 
H
V
 
V
L
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
N
G
 
G
E
 
D
Q
 
R
I
 
V
A
 
A
I
 
I
H
 
I
Y
 
H
V
 
D
S
 
S
P
 
P
V
 
V
T
 
T
E
 
H
T
 
T
E
 
K
Y
 
Q
S
 
E
I
 
I
T
 
T
Y
 
Y
R
 
A
E
 
E
L
 
L
Q
 
Q
A
 
E
Q
 
R
V
 
V
A
 
S
R
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
Y
 
A
L
 
L
Q
 
R
S
 
A
V
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
E
K
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
I
 
I
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
M
 
M
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
T
 
A
A
 
L
Y
 
E
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
R
 
R
I
 
L
G
 
G
A
 
A
I
 
I
H
 
H
S
 
S
V
 
V
V
 
V
F
|
F
G
|
G
G
|
G
F
 
F
A
 
A
A
 
A
N
 
N
E
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
V
R
 
R
I
 
I
N
 
D
D
 
D
A
 
A
K
 
T
P
 
P
K
 
K
L
 
A
V
 
I
M
 
I
S
 
A
A
 
A
S
 
S
C
 
C
G
 
G
I
 
I
E
|
E
P
 
P
S
 
G
G
x
R
V
 
V
V
 
V
P
 
H
Y
 
Y
K
 
K
P
 
P
L
 
L
L
 
L
D
 
D
K
 
G
A
 
A
L
 
I
N
 
D
E
 
L
A
 
A
V
 
T
H
 
H
K
 
K
V
 
P
E
 
D
H
 
F
C
 
C
L
 
L
I
 
I
L
 
F
N
 
Q
R
 
R
P
 
E
Q
 
Q
Y
 
E
E
 
V
A
 
A
Q
 
H
M
 
L
Q
 
E
A
 
P
G
 
G
R
 
R
D
 
D
K
 
F
D
 
D
W
 
W
Q
 
H
T
 
E
A
 
A
L
 
Q
C
 
Y
T
 
G
S
 
V
D
 
D
S
 
P
A
 
A
D
 
E
C
 
C
V
 
V
T
 
P
V
 
V
K
 
A
A
 
G
T
 
N
D
 
H
P
 
P
L
 
A
Y
 
Y
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
L
R
 
R
D
 
P
N
 
T
G
 
A
G
 
G
H
 
H
A
 
L
V
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
N
W
 
W
S
 
T
M
 
M
A
 
K
N
 
N
I
 
I
Y
 
Y
D
 
N
I
 
V
A
 
D
Q
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
V
F
 
F
W
 
W
A
 
A
A
|
A
S
|
S
D
|
D
V
 
V
G
 
G
W
|
W
V
 
V
V
|
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
V
 
C
Y
 
Y
G
 
A
P
 
P
L
 
L
L
 
I
V
 
H
G
 
G
A
 
N
T
 
T
T
 
T
L
 
I
L
 
V
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
K
|
K
P
|
P
V
 
V
G
 
G
T
 
T
P
 
P
D
 
D
P
 
A
G
 
G
A
 
T
F
 
F
W
 
W
R
 
R
T
 
V
I
 
I
A
 
S
K
 
E
Y
 
H
R
 
K
V
 
V
K
 
K
S
 
S
F
 
F
F
 
F
T
 
T
A
|
A
P
 
P
T
|
T
A
|
A
I
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
V
K
 
K
R
 
R
E
 
E
D
 
D
P
 
P
D
 
N
G
 
G
E
 
E
F
 
F
I
 
I
L
 
G
G
 
K
V
 
Y
D
 
D
L
 
L
S
 
S
C
 
H
L
 
L
K
 
K
N
 
T
V
 
V
F
 
Y
L
 
L
A
|
A
G
|
G
E
|
E
R
|
R
C
 
A
D
 
D
P
 
P
D
 
D
T
 
T
L
 
I
H
 
Q
W
 
W
A
 
T
E
 
M
A
 
D
K
 
K
L
 
L
H
 
G
K
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
D
|
D
H
|
H
W
|
W
W
|
W
Q
|
Q
T
|
T
E
|
E
T
 
T
G
 
G
W
 
W
P
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
A
N
 
N
L
 
P
M
 
M
G
 
G
V
 
I
A
 
E
P
 
H
I
 
L
A
 
P
V
 
V
K
 
K
A
 
I
G
 
G
S
 
S
P
 
P
G
 
S
R
 
V
P
 
A
V
 
M
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
E
 
D
V
 
V
D
 
Q
V
 
V
V
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
G
G
 
G
A
 
H
K
 
P
V
 
V
A
 
A
A
 
P
N
 
G
V
 
T
S
 
L
G
 
G
N
 
A
V
 
I
V
 
A
I
 
V
K
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
L
P
 
A
P
 
P
G
 
G
T
 
T
L
 
L
T
 
P
T
 
N
L
 
L
W
 
W
Q
 
Q
N
 
A
N
 
E
K
 
E
R
 
R
Y
 
F
Q
 
V
D
 
K
S
 
S
Y
 
Y
L
 
L
S
 
T
M
 
T
Y
 
F
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
Y
L
 
E
T
 
T
G
 
G
D
|
D
A
 
A
G
 
G
Y
 
Y
M
 
I
D
 
D
E
 
E
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
L
Y
 
Y
I
|
I
M
 
M
S
 
A
R
|
R
I
 
T
D
 
D
D
 
D
I
 
V
I
 
I
N
|
N
V
 
V
A
|
A
G
 
G
H
|
H
R
|
R
L
 
L
S
 
S
T
 
T
G
 
G
R
 
A
F
 
M
E
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
L
C
 
A
Q
 
S
H
 
H
P
 
P
D
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
C
A
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
V
D
 
S
D
 
D
K
 
T
L
 
L
K
|
K
G
 
G
Q
 
Q
V
 
M
P
 
P
L
 
L
G
 
G
L
 
F
V
 
L
V
 
C
L
 
L
K
 
S
K
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
N
I
 
R
T
 
P
D
 
H
E
 
D
E
 
E
L
 
I
H
 
A
K
 
K
Q
 
E
L
 
C
I
 
V
A
 
K
L
 
L
V
 
V
R
|
R
Q
 
E
E
 
K
I
 
I
G
 
G
P
|
P
V
|
V
A
 
A
S
 
A
F
 
F
R
x
K
L
 
L
V
 
A
S
 
C
A
 
V
I
 
V
Q
 
D
K
 
R
L
 
L
P
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
|
K
I
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
G
T
 
T
M
 
M
R
 
V
K
 
N
I
 
I
A
 
A
D
 
D
N
 
G
Q
 
T
Q
 
P
Y
 
W
T
 
K
A
 
M
P
 
P
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
D
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
T
 
I
L
 
L
D
 
D
L
 
E
V
 
I
R
 
T
T
 
E
T
 
A
L
 
L
T
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
Y
 
Y

Q8ZKF6 Acetyl-coenzyme A synthetase; AcCoA synthetase; Acs; Acetate--CoA ligase; Acyl-activating enzyme; EC 6.2.1.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see 4 papers)
41% identity, 95% coverage: 14:623/640 of query aligns to 28:639/652 of Q8ZKF6

query
sites
Q8ZKF6
H
 
Y
Q
 
K
T
 
Q
S
 
S
I
 
I
A
 
N
N
 
D
K
 
P
Q
 
D
A
 
T
F
 
F
W
 
W
Q
 
G
Q
 
E
A
 
Q
A
 
G
K
 
K
A
 
I
L
 
L
D
 
D
W
 
W
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
Y
K
 
Q
Q
 
K
I
 
V
L
 
K
D
 
N
E
 
T
S
 
S
E
 
F
A
 
A
P
 
P
-
 
G
-
 
N
-
 
V
F
 
S
Y
 
I
H
 
K
W
 
W
F
 
Y
S
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
L
N
 
N
T
 
L
C
 
A
Y
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
L
D
 
D
R
 
R
H
 
H
V
 
-
L
 
L
A
 
Q
G
 
E
R
 
N
G
 
G
E
 
D
Q
 
R
I
 
T
A
 
A
I
 
I
H
 
I
Y
 
W
V
 
E
S
 
G
P
 
D
V
 
D
T
 
T
E
 
S
T
 
Q
E
 
S
Y
 
K
S
 
H
I
 
I
T
 
S
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
L
 
L
Q
 
H
A
 
R
Q
 
D
V
 
V
A
 
C
R
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
N
Y
 
T
L
 
L
Q
 
L
S
 
D
V
 
L
G
 
G
V
 
I
A
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
A
I
 
I
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
M
 
M
V
 
V
P
 
P
E
 
E
T
 
A
A
 
A
Y
 
V
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
H
 
H
S
 
S
V
 
V
V
 
I
F
 
F
G
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
S
A
 
P
N
 
E
E
 
A
L
 
V
A
 
A
T
 
G
R
 
R
I
 
I
N
 
I
D
 
D
A
 
S
K
 
S
P
 
S
K
 
R
L
 
L
V
 
V
M
 
I
S
 
T
A
 
A
S
 
D
C
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
R
P
 
A
S
 
G
G
x
R
V
 
S
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
K
 
K
P
 
K
L
 
N
L
 
V
D
 
D
K
 
D
A
 
A
L
 
L
-
 
K
N
 
N
E
 
P
A
 
N
V
 
V
H
 
T
K
 
S
V
 
V
E
 
E
H
 
H
C
 
V
L
 
I
I
 
V
L
 
L
N
 
K
R
 
R
P
 
T
Q
 
G
Y
 
S
E
 
D
A
 
I
Q
 
D
M
 
W
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
R
 
R
D
 
D
K
 
L
D
 
W
W
 
W
Q
 
R
T
 
D
A
 
L
L
 
I
-
 
E
C
 
K
T
 
A
S
 
S
D
 
P
S
 
E
A
 
H
D
 
Q
C
 
P
V
 
E
T
 
A
V
 
M
K
 
N
A
 
A
T
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
L
R
 
H
D
 
T
N
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
A
 
L
V
 
V
A
 
Y
L
 
A
A
 
A
W
 
T
S
 
T
M
 
F
A
 
K
N
 
Y
I
 
V
Y
 
F
D
 
D
I
 
Y
A
 
H
Q
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
Y
W
 
W
A
 
C
A
 
T
S
 
A
D
 
D
V
 
V
G
 
G
W
 
W
V
 
V
V
x
T
G
 
G
H
 
H
S
 
S
Y
 
Y
I
 
L
V
 
L
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
A
V
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
V
P
 
P
V
 
-
G
x
N
T
 
W
P
 
P
D
 
T
P
 
P
G
 
A
A
 
R
F
 
M
W
 
C
R
 
Q
T
 
V
I
 
V
A
 
D
K
 
K
Y
 
H
R
 
Q
V
 
V
K
 
N
S
 
I
F
 
L
F
 
Y
T
 
T
A
|
A
P
 
P
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
M
R
 
A
E
 
E
D
 
-
P
 
-
D
 
G
G
 
D
E
 
K
F
 
A
I
 
I
L
 
E
G
 
G
V
 
T
D
 
D
L
 
R
S
 
S
C
 
S
L
 
L
K
 
R
N
 
I
V
 
L
F
 
G
L
 
S
A
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
P
C
 
I
D
 
N
P
 
P
D
 
E
T
 
A
L
 
W
H
 
E
W
 
W
A
 
Y
E
 
W
A
 
K
K
 
K
L
 
I
H
 
G
K
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
C
P
 
P
V
 
V
I
 
V
D
 
D
H
 
T
W
 
W
W
 
W
Q
 
Q
T
 
T
E
 
E
T
 
T
G
 
G
W
 
G
P
 
F
V
 
M
A
 
I
A
 
T
N
 
P
L
 
L
M
 
P
G
 
G
V
 
A
A
 
-
P
 
-
I
 
I
A
 
E
V
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
G
S
 
S
P
 
A
G
 
T
R
 
R
P
 
P
V
 
F
P
 
F
G
 
G
Y
 
V
E
 
Q
V
 
P
D
 
A
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
N
L
 
E
G
 
G
A
 
H
K
 
P
V
 
Q
A
 
E
A
 
G
N
 
A
V
 
T
S
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
L
V
 
V
I
 
I
K
 
T
L
 
D
P
 
S
L
 
W
P
 
-
P
 
P
G
 
G
T
 
Q
L
 
A
T
 
R
T
 
T
L
 
L
W
 
F
Q
 
G
N
 
D
N
 
H
K
 
E
R
 
R
Y
 
F
Q
 
E
D
 
Q
S
 
T
Y
 
Y
L
 
F
S
 
S
M
 
T
Y
 
F
P
 
K
G
 
N
Y
 
M
Y
 
Y
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
 
D
A
 
G
G
 
A
Y
 
R
M
 
R
D
 
D
E
 
E
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
Y
Y
 
W
I
 
I
M
 
T
S
 
G
R
 
R
I
 
V
D
|
D
D
 
D
I
 
V
I
 
L
N
 
N
V
 
V
A
x
S
G
|
G
H
 
H
R
|
R
L
 
L
S
 
G
T
 
T
G
 
A
R
 
E
F
 
I
E
 
E
E
 
S
V
 
A
L
 
L
C
 
V
Q
 
A
H
 
H
P
 
P
D
 
K
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
P
D
 
H
K
 
A
L
 
I
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
P
 
I
L
 
Y
G
 
A
L
 
Y
V
 
V
V
 
T
L
 
L
K
 
N
K
 
H
G
 
G
V
 
E
T
 
E
I
 
P
T
 
S
D
 
-
E
 
P
E
 
E
L
 
L
H
 
Y
K
 
A
Q
 
E
L
 
V
I
 
R
A
 
N
L
 
W
V
 
V
R
|
R
Q
 
K
E
 
E
I
 
I
G
 
G
P
 
P
V
 
L
A
 
A
S
 
T
F
 
P
R
 
D
L
 
V
V
 
L
S
 
H
A
 
W
I
 
T
Q
 
D
K
 
S
L
 
L
P
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
|
K
I
 
I
L
 
M
R
 
R
G
 
R
T
 
I
M
 
L
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
A
-
 
A
-
 
G
D
 
D
N
 
T
Q
 
S
Q
 
N
Y
 
L
T
 
G
A
 
D
P
 
T
A
 
S
T
 
T
I
 
L
E
 
A
D
 
D
P
 
P
Q
 
G
T
 
V
L
 
V
D
 
E

2p20A Acetyl-coa synthetase, r584a mutation (see paper)
41% identity, 95% coverage: 14:623/640 of query aligns to 24:633/641 of 2p20A

query
sites
2p20A
H
 
Y
Q
 
K
T
 
Q
S
 
S
I
 
I
A
 
N
N
 
D
K
 
P
Q
 
D
A
 
T
F
 
F
W
 
W
Q
 
G
Q
 
E
A
 
Q
A
 
G
K
 
K
A
 
I
L
 
L
D
 
D
W
 
W
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
Y
K
 
Q
Q
 
K
I
 
V
L
 
K
D
 
N
E
 
T
S
 
S
E
 
F
A
 
A
P
 
P
-
 
G
-
 
N
-
 
V
F
 
S
Y
 
I
H
 
K
W
 
W
F
 
Y
S
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
L
N
 
N
T
 
L
C
 
A
Y
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
L
D
 
D
R
 
R
H
 
H
V
 
-
L
 
L
A
 
Q
G
 
E
R
 
N
G
 
G
E
 
D
Q
 
R
I
 
T
A
 
A
I
 
I
H
 
I
Y
 
W
V
 
E
S
 
G
P
 
D
V
 
D
T
 
T
E
 
S
T
 
Q
E
 
S
Y
 
K
S
 
H
I
 
I
T
 
S
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
L
 
L
Q
 
H
A
 
R
Q
 
D
V
 
V
A
 
C
R
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
N
Y
 
T
L
 
L
Q
 
L
S
 
D
V
 
L
G
 
G
V
 
I
A
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
A
I
 
I
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
M
 
M
V
 
V
P
 
P
E
 
E
T
 
A
A
 
A
Y
 
V
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
H
 
H
S
 
S
V
 
V
V
 
I
F
 
F
G
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
S
A
 
P
N
 
E
E
 
A
L
 
V
A
 
A
T
 
G
R
 
R
I
 
I
N
 
I
D
 
D
A
 
S
K
 
S
P
 
S
K
 
R
L
 
L
V
 
V
M
 
I
S
 
T
A
 
A
S
 
D
C
 
E
G
 
G
I
 
V
E
 
R
P
 
A
S
 
G
G
 
R
V
 
S
V
 
I
P
 
P
Y
 
L
K
 
K
P
 
K
L
 
N
L
 
V
D
 
D
K
 
D
A
 
A
L
 
L
-
 
K
N
 
N
E
 
P
A
 
N
V
 
V
H
 
T
K
 
S
V
 
V
E
 
E
H
 
H
C
 
V
L
 
I
I
 
V
L
 
L
N
 
K
R
 
R
P
 
T
Q
 
G
Y
 
S
E
 
D
A
 
I
Q
 
D
M
 
W
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
R
 
R
D
 
D
K
 
L
D
 
W
W
 
W
Q
 
R
T
 
D
A
 
L
L
 
I
-
 
E
C
 
K
T
 
A
S
 
S
D
 
P
S
 
E
A
 
H
D
 
Q
C
 
P
V
 
E
T
 
A
V
 
M
K
 
N
A
 
A
T
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
L
R
 
H
D
 
T
N
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
A
 
L
V
 
V
A
 
Y
L
 
A
A
 
A
W
 
T
S
 
T
M
 
F
A
 
K
N
 
Y
I
 
V
Y
 
F
D
 
D
I
 
Y
A
 
H
Q
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
Y
W
 
W
A
 
C
A
 
T
S
 
A
D
 
D
V
 
V
G
 
G
W
 
W
V
|
V
V
x
T
G
 
G
H
 
H
S
 
S
Y
 
Y
I
 
L
V
 
L
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
A
V
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
V
P
 
P
V
 
-
G
 
N
T
 
W
P
 
P
D
 
T
P
 
P
G
 
A
A
 
R
F
 
M
W
 
C
R
 
Q
T
 
V
I
 
V
A
 
D
K
 
K
Y
 
H
R
 
Q
V
 
V
K
 
N
S
 
I
F
 
L
F
 
Y
T
 
T
A
 
A
P
 
P
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
M
R
 
A
E
 
E
D
 
-
P
 
-
D
 
G
G
 
D
E
 
K
F
 
A
I
 
I
L
 
E
G
 
G
V
 
T
D
 
D
L
 
R
S
 
S
C
 
S
L
 
L
K
 
R
N
 
I
V
 
L
F
 
G
L
 
S
A
 
V
G
|
G
E
|
E
R
x
P
C
 
I
D
 
N
P
 
P
D
 
E
T
 
A
L
 
W
H
 
E
W
 
W
A
 
Y
E
 
W
A
 
K
K
 
K
L
 
I
H
 
G
K
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
C
P
 
P
V
 
V
I
 
V
D
|
D
H
x
T
W
|
W
W
|
W
Q
|
Q
T
|
T
E
|
E
T
 
T
G
 
G
W
 
G
P
 
F
V
 
M
A
 
I
A
 
T
N
 
P
L
 
L
M
 
P
G
 
G
V
 
A
A
 
-
P
 
-
I
 
I
A
 
E
V
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
G
S
 
S
P
 
A
G
 
T
R
 
R
P
 
P
V
 
F
P
 
F
G
 
G
Y
 
V
E
 
Q
V
 
P
D
 
A
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
N
L
 
E
G
 
G
A
 
H
K
 
P
V
 
Q
A
 
E
A
 
G
N
 
A
V
 
T
S
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
L
V
 
V
I
 
I
K
 
T
L
 
D
P
 
S
L
 
W
P
 
-
P
 
P
G
 
G
T
 
Q
L
 
A
T
 
R
T
 
T
L
 
L
W
 
F
Q
 
G
N
 
D
N
 
H
K
 
E
R
 
R
Y
 
F
Q
 
E
D
 
Q
S
 
T
Y
 
Y
L
 
F
S
 
S
M
 
T
Y
 
F
P
 
K
G
 
N
Y
 
M
Y
 
Y
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
|
D
A
 
G
G
 
A
Y
 
R
M
 
R
D
 
D
E
 
E
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
Y
Y
 
W
I
|
I
M
 
T
S
 
G
R
|
R
I
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
V
I
 
L
N
|
N
V
 
V
A
 
S
G
 
G
H
 
H
R
|
R
L
 
L
S
 
G
T
 
T
G
 
A
R
 
E
F
 
I
E
 
E
E
 
S
V
 
A
L
 
L
C
 
V
Q
 
A
H
 
H
P
 
P
D
 
K
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
P
D
 
H
K
 
A
L
 
I
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
P
 
I
L
 
Y
G
 
A
L
 
Y
V
 
V
V
 
T
L
 
L
K
 
N
K
 
H
G
 
G
V
 
E
T
 
E
I
 
P
T
 
S
D
 
-
E
 
P
E
 
E
L
 
L
H
 
Y
K
 
A
Q
 
E
L
 
V
I
 
R
A
 
N
L
 
W
V
 
V
R
 
A
Q
 
K
E
 
E
I
 
I
G
 
G
P
 
P
V
 
L
A
 
A
S
 
T
F
 
P
R
 
D
L
 
V
V
 
L
S
 
H
A
 
W
I
 
T
Q
 
D
K
 
S
L
 
L
P
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
|
K
I
 
I
L
 
M
R
 
R
G
 
R
T
 
I
M
 
L
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
N
 
G
Q
 
D
Q
 
T
Y
 
S
T
 
N
A
 
D
P
 
T
A
 
S
T
 
T
I
 
L
E
 
A
D
 
D
P
 
P
Q
 
G
T
 
V
L
 
V
D
 
E

5jrhA Crystal structure of salmonella enterica acetyl-coa synthetase (acs) in complex with camp and coenzyme a (see paper)
41% identity, 94% coverage: 14:617/640 of query aligns to 24:632/640 of 5jrhA

query
sites
5jrhA
H
 
Y
Q
 
K
T
 
Q
S
 
S
I
 
I
A
 
N
N
 
D
K
 
P
Q
 
D
A
 
T
F
 
F
W
 
W
Q
 
G
Q
 
E
A
 
Q
A
 
G
K
 
K
A
 
I
L
 
L
D
 
D
W
 
W
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
Y
K
 
Q
Q
 
K
I
 
V
L
 
K
D
 
N
E
 
T
S
 
S
E
 
F
A
 
A
P
 
P
-
 
G
-
 
N
-
 
V
F
 
S
Y
 
I
H
 
K
W
 
W
F
 
Y
S
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
L
N
 
N
T
 
L
C
 
A
Y
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
L
D
 
D
R
 
R
H
 
H
V
 
-
L
 
L
A
 
Q
G
 
E
R
 
N
G
 
G
E
 
D
Q
 
R
I
 
T
A
 
A
I
 
I
H
 
I
Y
x
W
V
 
E
S
 
G
P
 
D
V
 
D
T
 
T
E
 
S
T
 
Q
E
 
S
Y
x
K
S
 
H
I
 
I
T
 
S
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
L
 
L
Q
 
H
A
 
R
Q
 
D
V
 
V
A
 
C
R
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
N
Y
 
T
L
 
L
Q
 
L
S
 
D
V
 
L
G
 
G
V
 
I
A
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
A
I
 
I
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
M
 
M
V
|
V
P
 
P
E
|
E
T
 
A
A
 
A
Y
 
V
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
H
 
H
S
 
S
V
 
V
V
 
I
F
|
F
G
|
G
G
|
G
F
 
F
A
 
S
A
 
P
N
 
E
E
 
A
L
 
V
A
 
A
T
x
G
R
|
R
I
 
I
N
 
I
D
 
D
A
 
S
K
 
S
P
 
S
K
 
R
L
 
L
V
 
V
M
 
I
S
 
T
A
 
A
S
 
D
C
 
E
G
 
G
I
 
V
E
x
R
P
 
A
S
 
G
G
 
R
V
 
S
V
x
I
P
 
P
Y
 
L
K
 
K
P
 
K
L
 
N
L
 
V
D
 
D
K
 
D
A
 
A
L
 
L
-
 
K
N
 
N
E
 
P
A
 
N
V
 
V
H
 
T
K
 
S
V
 
V
E
 
E
H
 
H
C
 
V
L
 
I
I
 
V
L
|
L
N
 
K
R
|
R
P
 
T
Q
 
G
Y
 
S
E
 
D
A
 
I
Q
 
D
M
 
W
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
R
 
R
D
 
D
K
 
L
D
 
W
W
 
W
Q
 
R
T
 
D
A
 
L
L
 
I
-
 
E
C
 
K
T
 
A
S
 
S
D
 
P
S
 
E
A
 
H
D
 
Q
C
 
P
V
 
E
T
 
A
V
 
M
K
 
N
A
 
A
T
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
V
 
I
L
 
L
Y
|
Y
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
x
K
P
|
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
L
R
 
H
D
 
T
N
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
A
 
L
V
 
V
A
 
Y
L
 
A
A
 
A
W
 
T
S
 
T
M
 
F
A
 
K
N
 
Y
I
 
V
Y
 
F
D
 
D
I
 
Y
A
 
H
Q
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
Y
W
 
W
A
 
C
A
 
T
S
 
A
D
|
D
V
 
V
G
 
G
W
 
W
V
 
V
V
 
T
G
 
G
H
 
H
S
 
S
Y
 
Y
I
 
L
V
 
L
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
A
V
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
V
P
 
P
V
 
-
G
 
N
T
 
W
P
 
P
D
 
T
P
 
P
G
 
A
A
 
R
F
 
M
W
 
C
R
 
Q
T
 
V
I
 
V
A
 
D
K
 
K
Y
 
H
R
 
Q
V
 
V
K
 
N
S
 
I
F
 
L
F
 
Y
T
 
T
A
 
A
P
 
P
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
M
R
 
A
E
 
E
D
 
-
P
 
-
D
 
G
G
 
D
E
 
K
F
 
A
I
 
I
L
 
E
G
 
G
V
 
T
D
 
D
L
 
R
S
 
S
C
 
S
L
 
L
K
 
R
N
 
I
V
 
L
F
 
G
L
 
S
A
 
V
G
|
G
E
|
E
R
x
P
C
 
I
D
 
N
P
 
P
D
 
E
T
 
A
L
 
W
H
 
E
W
 
W
A
 
Y
E
 
W
A
 
K
K
 
K
L
 
I
H
 
G
K
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
C
P
 
P
V
 
V
I
 
V
D
|
D
H
x
T
W
|
W
W
|
W
Q
|
Q
T
|
T
E
|
E
T
 
T
G
 
G
W
 
G
P
 
F
V
 
M
A
 
I
A
 
T
N
 
P
L
 
L
M
 
P
G
 
G
V
 
A
A
 
-
P
 
-
I
 
I
A
 
E
V
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
G
S
 
S
P
 
A
G
 
T
R
 
R
P
 
P
V
 
F
P
 
F
G
 
G
Y
 
V
E
 
Q
V
 
P
D
 
A
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
N
L
 
E
G
 
G
A
 
H
K
 
P
V
 
Q
A
 
E
A
 
G
N
 
A
V
 
T
S
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
L
V
 
V
I
 
I
K
 
T
L
 
D
P
 
S
L
 
W
P
 
-
P
 
P
G
 
G
T
 
Q
L
 
A
T
 
R
T
 
T
L
 
L
W
 
F
Q
 
G
N
 
D
N
 
H
K
 
E
R
 
R
Y
 
F
Q
 
E
D
 
Q
S
 
T
Y
 
Y
L
 
F
S
 
S
M
 
T
Y
 
F
P
 
K
G
 
N
Y
 
M
Y
 
Y
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
|
D
A
 
G
G
 
A
Y
 
R
M
 
R
D
 
D
E
 
E
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
Y
Y
 
W
I
|
I
M
 
T
S
 
G
R
|
R
I
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
V
I
 
L
N
|
N
V
 
V
A
x
S
G
 
G
H
|
H
R
|
R
L
 
L
S
 
G
T
 
T
G
 
A
R
 
E
F
 
I
E
 
E
E
 
S
V
 
A
L
 
L
C
x
V
Q
 
A
H
|
H
P
 
P
D
 
K
V
x
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
P
D
 
H
K
 
A
L
 
I
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
P
 
I
L
 
Y
G
 
A
L
 
Y
V
 
V
V
 
T
L
 
L
K
 
N
K
 
H
G
 
G
V
 
E
T
 
E
I
 
P
T
 
S
D
 
-
E
 
P
E
 
E
L
 
L
H
 
Y
K
 
A
Q
 
E
L
 
V
I
 
R
A
 
N
L
 
W
V
 
V
R
|
R
Q
 
K
E
 
E
I
 
I
G
 
G
P
|
P
V
 
L
A
 
A
S
 
T
F
 
P
R
 
D
L
 
V
V
 
L
S
 
H
A
 
W
I
 
T
Q
 
D
K
 
S
L
 
L
P
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
|
K
I
 
I
L
 
M
R
 
R
G
 
R
T
 
I
M
 
L
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
G
D
 
D
N
 
T
Q
 
S
Q
 
T
Y
 
L
T
 
A
A
 
D
P
 
P
A
 
G
T
 
V
I
 
V
E
 
E

2p2fA Acetyl-coa synthetase, wild-type with acetate, amp, and coa bound (see paper)
41% identity, 95% coverage: 14:623/640 of query aligns to 23:629/637 of 2p2fA

query
sites
2p2fA
H
 
Y
Q
 
K
T
 
Q
S
 
S
I
 
I
A
 
N
N
 
D
K
 
P
Q
 
D
A
 
T
F
 
F
W
 
W
Q
 
G
Q
 
E
A
 
Q
A
 
G
K
 
K
A
 
I
L
 
L
D
 
D
W
 
W
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
Y
K
 
Q
Q
 
K
I
 
V
L
 
K
D
 
N
E
 
T
S
 
S
E
 
F
A
 
A
P
 
P
-
 
G
-
 
N
-
 
V
F
 
S
Y
 
I
H
 
K
W
 
W
F
 
Y
S
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
L
N
 
N
T
 
L
C
 
A
Y
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
L
D
 
D
R
 
R
H
 
H
V
 
-
L
 
L
A
 
Q
G
 
E
R
 
N
G
 
G
E
 
D
Q
 
R
I
 
T
A
 
A
I
 
I
H
 
I
Y
 
W
V
 
E
S
 
G
P
 
D
V
 
D
T
 
T
E
 
S
T
 
Q
E
 
S
Y
 
K
S
 
H
I
 
I
T
 
S
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
L
 
L
Q
 
H
A
 
R
Q
 
D
V
 
V
A
 
C
R
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
N
Y
 
T
L
 
L
Q
 
L
S
 
D
V
 
L
G
 
G
V
 
I
A
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
A
I
 
I
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
M
 
M
V
 
V
P
 
P
E
 
E
T
 
A
A
 
A
Y
 
V
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
H
 
H
S
 
S
V
 
V
V
 
I
F
|
F
G
|
G
G
|
G
F
 
F
A
 
S
A
 
P
N
 
E
E
 
A
L
 
V
A
 
A
T
 
G
R
 
R
I
 
I
N
 
I
D
 
D
A
 
S
K
 
S
P
 
S
K
 
R
L
 
L
V
 
V
M
 
I
S
 
T
A
 
A
S
 
D
C
 
E
G
 
G
I
 
V
E
x
R
P
 
A
S
 
G
G
 
R
V
 
S
V
x
I
P
 
P
Y
 
L
K
 
K
P
 
K
L
 
N
L
 
V
D
 
D
K
 
D
A
 
A
L
 
L
-
 
K
N
 
N
E
 
P
A
 
N
V
 
V
H
 
T
K
 
S
V
 
V
E
 
E
H
 
H
C
 
V
L
 
I
I
 
V
L
 
L
N
 
K
R
 
R
P
 
T
Q
 
G
Y
 
S
E
 
D
A
 
I
Q
 
D
M
 
W
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
R
 
R
D
 
D
K
 
L
D
 
W
W
 
W
Q
 
R
T
 
D
A
 
L
L
 
I
-
 
E
C
 
K
T
 
A
S
 
S
D
 
P
S
 
E
A
 
H
D
 
Q
C
 
P
V
 
E
T
 
A
V
 
M
K
 
N
A
 
A
T
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
L
R
 
H
D
 
T
N
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
A
 
L
V
 
V
A
 
Y
L
 
A
A
 
A
W
 
T
S
 
T
M
 
F
A
 
K
N
 
Y
I
 
V
Y
 
F
D
 
D
I
 
Y
A
 
H
Q
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
Y
W
 
W
A
 
C
A
 
T
S
x
A
D
 
D
V
 
V
G
 
G
W
|
W
V
 
V
V
x
T
G
 
G
H
 
H
S
 
S
Y
 
Y
I
 
L
V
 
L
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
A
V
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
K
x
V
P
|
P
V
 
-
G
 
N
T
 
W
P
 
P
D
 
T
P
 
P
G
 
A
A
 
R
F
 
M
W
 
C
R
 
Q
T
 
V
I
 
V
A
 
D
K
 
K
Y
 
H
R
 
Q
V
 
V
K
 
N
S
 
I
F
 
L
F
 
Y
T
 
T
A
|
A
P
 
P
T
|
T
A
|
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
M
R
 
A
E
 
E
D
 
-
P
 
-
D
 
G
G
 
D
E
 
K
F
 
A
I
 
I
L
 
E
G
 
G
V
 
T
D
 
D
L
 
R
S
 
S
C
 
S
L
 
L
K
 
R
N
 
I
V
 
L
F
 
G
L
 
S
A
 
V
G
|
G
E
|
E
R
x
P
C
 
I
D
 
N
P
 
P
D
 
E
T
 
A
L
 
W
H
 
E
W
 
W
A
 
Y
E
 
W
A
 
K
K
 
K
L
 
I
H
 
G
K
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
C
P
 
P
V
 
V
I
 
V
D
|
D
H
x
T
W
|
W
W
|
W
Q
|
Q
T
|
T
E
|
E
T
 
T
G
 
G
W
 
G
P
 
F
V
 
M
A
 
I
A
 
T
N
 
P
L
 
L
M
 
P
G
 
G
V
 
A
A
 
-
P
 
-
I
 
I
A
 
E
V
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
G
S
 
S
P
 
A
G
 
T
R
 
R
P
 
P
V
 
F
P
 
F
G
 
G
Y
 
V
E
 
Q
V
 
P
D
 
A
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
N
L
 
E
G
 
G
A
 
H
K
 
P
V
 
Q
A
 
E
A
 
G
N
 
A
V
 
T
S
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
L
V
 
V
I
 
I
K
 
T
L
 
D
P
 
S
L
 
W
P
 
-
P
 
P
G
 
G
T
 
Q
L
 
A
T
 
R
T
 
T
L
 
L
W
 
F
Q
 
G
N
 
D
N
 
H
K
 
E
R
 
R
Y
 
F
Q
 
E
D
 
Q
S
 
T
Y
 
Y
L
 
F
S
 
S
M
 
T
Y
 
F
P
 
K
G
 
N
Y
 
M
Y
 
Y
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
|
D
A
 
G
G
 
A
Y
 
R
M
 
R
D
 
D
E
 
E
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
Y
Y
 
W
I
|
I
M
 
T
S
 
G
R
|
R
I
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
V
I
 
L
N
|
N
V
 
V
A
x
S
G
|
G
H
 
H
R
|
R
L
 
L
S
 
G
T
 
T
G
 
A
R
 
E
F
 
I
E
 
E
E
 
S
V
 
A
L
 
L
C
 
V
Q
 
A
H
 
H
P
 
P
D
 
K
V
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
P
D
 
H
K
 
A
L
 
I
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
P
 
I
L
 
Y
G
 
A
L
 
Y
V
 
V
V
 
T
L
 
L
K
 
N
K
 
H
G
 
G
V
 
E
T
 
E
I
 
P
T
 
S
D
 
-
E
 
P
E
 
E
L
 
L
H
 
Y
K
 
A
Q
 
E
L
 
V
I
 
R
A
 
N
L
 
W
V
 
V
R
|
R
Q
 
K
E
 
E
I
 
I
G
 
G
P
|
P
V
 
L
A
 
A
S
 
T
F
 
P
R
 
D
L
 
V
V
 
L
S
 
H
A
 
W
I
 
T
Q
 
D
K
 
S
L
 
L
P
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
|
K
I
 
I
L
 
M
R
 
R
G
 
R
T
 
I
M
 
L
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
A
N
 
G
Q
 
D
Q
 
-
Y
 
-
T
 
-
A
 
T
P
 
S
A
 
S
T
 
T
I
 
L
E
 
A
D
 
D
P
 
P
Q
 
G
T
 
V
L
 
V
D
 
E

Q89WV5 Acetyl-coenzyme A synthetase; AcCoA synthetase; Acs; Acetate--CoA ligase; Acyl-activating enzyme; EC 6.2.1.1 from Bradyrhizobium diazoefficiens (strain JCM 10833 / BCRC 13528 / IAM 13628 / NBRC 14792 / USDA 110) (see paper)
41% identity, 96% coverage: 11:622/640 of query aligns to 24:629/648 of Q89WV5

query
sites
Q89WV5
Q
 
K
Q
 
E
L
 
M
H
 
Y
Q
 
A
T
 
R
S
 
S
I
 
I
A
 
S
N
 
D
K
 
P
Q
 
N
A
 
G
F
 
F
W
 
W
Q
 
A
Q
 
E
A
 
Q
A
 
A
K
 
K
A
 
R
L
 
I
D
 
D
W
 
W
V
 
M
T
 
K
P
 
A
S
 
P
K
 
T
Q
 
K
I
 
I
L
 
E
D
 
N
E
 
V
S
 
S
E
 
F
A
 
A
P
 
P
-
 
G
-
 
N
-
 
V
F
 
S
Y
 
I
H
 
K
W
 
W
F
 
F
S
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
V
L
 
L
N
 
N
T
 
V
C
 
A
Y
 
H
N
 
N
A
 
C
V
 
I
D
 
D
R
 
R
H
 
H
V
 
-
L
 
L
A
 
H
G
 
K
R
 
R
G
 
A
E
 
N
Q
 
Q
I
 
T
A
 
A
I
 
I
H
 
I
Y
 
W
V
 
E
S
 
G
P
 
D
V
 
D
T
 
P
E
 
S
T
 
Q
E
 
S
Y
 
R
S
 
H
I
 
I
T
 
T
Y
 
Y
R
 
K
E
 
E
L
 
L
Q
 
H
A
 
D
Q
 
E
V
 
V
A
 
C
R
 
R
L
 
M
A
 
A
G
 
N
Y
 
I
L
 
L
Q
 
R
S
 
T
V
 
R
G
 
N
V
 
V
A
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
T
I
 
I
Y
 
Y
M
 
L
P
 
P
M
 
M
V
 
I
P
 
P
E
 
E
T
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
I
H
 
H
S
 
S
V
 
V
V
 
V
F
 
F
G
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
S
A
 
P
N
 
D
E
 
S
L
 
L
A
 
A
T
 
Q
R
 
R
I
 
I
N
 
N
D
 
D
A
 
C
K
 
Q
P
 
S
K
 
K
L
 
V
V
 
I
M
 
I
S
 
T
A
 
A
S
 
D
C
 
E
G
 
G
I
 
L
E
 
R
P
 
G
S
 
G
G
 
K
V
 
K
V
 
V
P
 
P
Y
 
L
K
 
K
P
 
A
L
 
N
L
 
V
D
 
D
K
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
-
H
 
D
K
 
G
V
 
V
E
 
D
H
 
W
C
 
V
L
 
V
I
 
V
L
 
V
N
 
K
R
 
R
P
 
T
Q
 
G
Y
 
G
E
 
K
A
 
I
Q
 
D
M
 
M
Q
 
N
A
 
P
G
 
T
R
 
R
D
 
D
K
 
L
D
 
-
W
 
W
Q
 
Y
T
 
H
A
 
E
L
 
A
C
 
A
T
 
A
S
 
M
D
 
V
S
 
T
A
 
T
D
 
E
C
 
C
V
 
P
T
 
V
-
 
E
-
 
H
V
 
M
K
 
H
A
 
A
T
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
G
|
G
T
 
S
T
 
T
G
|
G
Q
 
Q
P
 
P
K
|
K
G
 
G
V
 
V
V
 
L
R
 
H
D
 
T
N
 
S
G
 
A
G
 
G
H
 
Y
A
 
L
V
 
V
A
 
Y
L
 
A
A
 
A
W
 
M
S
 
T
M
 
H
A
 
Q
N
 
Y
I
 
V
Y
 
F
D
 
D
I
 
Y
A
 
H
Q
 
D
G
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
Y
W
 
W
A
 
C
A
 
T
S
 
A
D
 
D
V
 
V
G
 
G
W
 
W
V
 
V
V
 
T
G
 
G
H
 
H
S
 
S
Y
 
Y
I
 
I
V
 
L
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
A
V
 
N
G
 
G
A
 
A
T
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
K
 
V
P
 
P
V
 
-
G
 
N
T
 
Y
P
 
P
D
 
D
P
 
N
G
 
S
A
 
R
F
 
F
W
 
W
R
 
N
T
 
V
I
 
I
A
 
D
K
 
K
Y
 
H
R
 
K
V
 
V
K
 
N
S
 
T
F
 
F
F
 
Y
T
 
T
A
 
A
P
 
P
T
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
M
R
 
Q
E
 
G
D
 
-
P
 
-
D
 
G
G
 
D
E
 
E
F
 
P
I
 
V
L
 
K
G
 
K
V
 
T
D
 
S
L
 
R
S
 
A
C
 
S
L
 
L
K
 
R
N
 
L
V
 
L
F
 
G
L
 
S
A
 
V
G
 
G
E
 
E
R
 
P
C
 
I
D
 
N
P
 
P
D
 
E
T
 
A
L
 
W
H
 
E
W
 
W
A
 
Y
E
 
H
A
 
R
K
 
V
L
 
V
H
 
G
K
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
C
P
 
P
V
 
I
I
 
V
D
 
D
H
 
T
W
 
W
W
 
W
Q
 
Q
T
 
T
E
|
E
T
 
T
G
 
G
W
 
G
P
 
I
V
 
L
A
 
I
A
 
T
N
 
P
L
 
L
M
 
P
G
 
G
V
 
A
A
 
T
P
 
K
I
 
L
A
 
-
V
 
-
K
 
K
A
 
P
G
 
G
S
 
S
P
 
A
G
 
T
R
 
Q
P
 
P
V
 
F
P
 
F
G
 
G
Y
 
V
E
 
V
V
 
P
D
 
E
V
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
A
L
 
D
G
 
G
A
 
K
K
 
V
V
 
L
A
 
E
A
 
G
N
 
E
V
 
T
S
 
T
G
 
G
N
 
N
V
 
L
V
 
C
I
 
L
K
 
T
L
 
R
P
 
A
L
 
W
P
 
-
P
 
P
G
 
G
T
 
M
L
 
M
T
 
R
T
 
T
L
 
V
W
 
Y
Q
 
G
N
 
D
N
 
H
K
 
A
R
 
R
Y
 
F
Q
 
E
D
 
Q
S
 
T
Y
 
Y
L
 
F
S
 
S
M
 
T
Y
 
Y
P
 
K
G
 
G
Y
 
K
Y
 
Y
L
 
F
T
 
T
G
 
G
D
 
D
A
 
G
G
 
C
Y
 
R
M
 
R
D
 
D
E
 
A
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
Y
Y
 
W
I
 
I
M
 
T
S
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
V
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
S
G
 
G
H
 
H
R
 
R
L
 
M
S
 
G
T
 
T
G
 
A
R
 
E
F
 
V
E
 
E
E
 
S
V
 
A
L
 
L
C
 
V
Q
 
A
H
 
H
P
 
E
D
 
K
V
 
V
A
 
S
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
F
D
 
P
D
 
H
K
 
D
L
 
I
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
V
 
G
P
 
I
L
 
Y
G
 
A
L
 
Y
V
 
V
V
 
T
L
 
L
K
 
M
K
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
I
 
P
T
 
T
D
 
-
E
 
E
E
 
D
L
 
L
H
 
R
K
 
K
Q
 
E
L
 
L
I
 
V
A
 
T
L
 
W
V
 
V
R
 
R
Q
 
K
E
 
E
I
 
I
G
 
G
P
 
P
V
 
I
A
 
A
S
 
S
F
 
P
R
 
D
L
 
Q
V
 
I
S
 
Q
A
 
F
I
 
A
Q
 
P
K
 
G
L
 
L
P
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
K
I
 
I
L
 
M
R
 
R
G
 
R
T
 
I
M
 
L
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
A
D
 
E
N
 
D
Q
 
E
Q
 
-
Y
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
P
A
 
G
T
 
S
I
 
L
E
 
G
D
 
D
P
 
T
Q
 
S
T
 
T
L
 
L

1pg3A Acetyl coa synthetase, acetylated on lys609 (see paper)
42% identity, 93% coverage: 14:605/640 of query aligns to 24:615/634 of 1pg3A

query
sites
1pg3A
H
 
Y
Q
 
K
T
 
Q
S
 
S
I
 
I
A
 
N
N
 
D
K
 
P
Q
 
D
A
 
T
F
 
F
W
 
W
Q
 
G
Q
 
E
A
 
Q
A
 
G
K
 
K
A
 
I
L
 
L
D
 
D
W
 
W
V
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
Y
K
 
Q
Q
 
K
I
 
V
L
 
K
D
 
N
E
 
T
S
 
S
E
 
F
A
 
A
P
 
P
-
 
G
-
 
N
-
 
V
F
 
S
Y
 
I
H
 
K
W
 
W
F
 
Y
S
 
E
D
 
D
G
 
G
E
 
T
L
 
L
N
 
N
T
 
L
C
 
A
Y
 
A
N
 
N
A
 
C
V
 
L
D
 
D
R
 
R
H
 
H
V
 
-
L
 
L
A
 
Q
G
 
E
R
 
N
G
 
G
E
 
D
Q
 
R
I
 
T
A
 
A
I
 
I
H
 
I
Y
 
W
V
 
E
S
 
G
P
 
D
V
 
D
T
 
T
E
 
S
T
 
Q
E
 
S
Y
 
K
S
 
H
I
 
I
T
 
S
Y
 
Y
R
 
R
E
 
E
L
 
L
Q
 
H
A
 
R
Q
 
D
V
 
V
A
 
C
R
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
N
Y
 
T
L
 
L
Q
 
L
S
 
D
V
 
L
G
 
G
V
 
I
A
 
K
K
 
K
G
 
G
D
 
D
R
 
V
V
 
V
V
 
A
I
 
I
Y
 
Y
M
 
M
P
 
P
M
 
M
V
 
V
P
 
P
E
 
E
T
 
A
A
 
A
Y
 
V
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
A
C
 
C
A
 
A
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
I
 
V
H
 
H
S
 
S
V
 
V
V
 
I
F
|
F
G
|
G
G
|
G
F
 
F
A
 
S
A
 
P
N
 
E
E
 
A
L
 
V
A
 
A
T
 
G
R
 
C
I
 
I
N
 
I
D
 
D
A
 
S
K
 
S
P
 
S
K
 
R
L
 
L
V
 
V
M
 
I
S
 
T
A
 
A
S
 
D
C
 
E
G
 
G
I
 
V
E
x
R
P
 
A
S
 
G
G
x
R
V
 
S
V
x
I
P
 
P
Y
 
L
K
 
K
P
 
K
L
 
N
L
 
V
D
 
D
K
 
D
A
 
A
L
 
L
-
 
K
N
 
N
E
 
P
A
 
N
V
 
V
H
 
T
K
 
S
V
 
V
E
 
E
H
 
H
C
 
V
L
 
I
I
 
V
L
 
L
N
 
K
R
 
R
P
 
T
Q
 
G
Y
 
S
E
 
D
A
 
I
Q
 
D
M
 
W
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
R
 
R
D
 
D
K
 
L
D
 
W
W
 
W
Q
 
R
T
 
D
A
 
L
L
 
I
-
 
E
C
 
K
T
 
A
S
 
S
D
 
P
S
 
E
A
 
H
D
 
Q
C
 
P
V
 
E
T
 
A
V
 
M
K
 
N
A
 
A
T
 
E
D
 
D
P
 
P
L
 
L
Y
 
F
V
 
I
L
 
L
Y
 
Y
T
|
T
S
 
S
G
 
G
T
 
S
T
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
K
 
K
G
 
G
V
 
V
V
 
L
R
 
H
D
 
T
N
 
T
G
 
G
G
 
G
H
 
Y
A
 
L
V
 
V
A
 
Y
L
 
A
A
 
A
W
 
T
S
 
T
M
 
F
A
 
K
N
 
Y
I
 
V
Y
 
F
D
 
D
I
 
Y
A
 
H
Q
 
P
G
 
G
D
 
D
V
 
I
F
 
Y
W
 
W
A
 
C
A
 
T
S
x
A
D
 
D
V
 
V
G
 
G
W
 
W
V
|
V
V
x
T
G
 
G
H
 
H
S
 
S
Y
 
Y
I
 
L
V
 
L
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
A
V
 
C
G
 
G
A
 
A
T
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
M
Y
 
F
E
 
E
G
 
G
K
x
V
P
|
P
V
 
-
G
x
N
T
 
W
P
 
P
D
 
T
P
 
P
G
 
A
A
 
R
F
 
M
W
 
C
R
 
Q
T
 
V
I
 
V
A
 
D
K
 
K
Y
 
H
R
 
Q
V
 
V
K
 
N
S
 
I
F
 
L
F
 
Y
T
 
T
A
|
A
P
 
P
T
|
T
A
|
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
I
 
L
K
 
M
R
 
A
E
 
E
D
 
-
P
 
-
D
 
G
G
 
D
E
 
K
F
 
A
I
 
I
L
 
E
G
 
G
V
 
T
D
 
D
L
 
R
S
 
S
C
 
S
L
 
L
K
 
R
N
 
I
V
 
L
F
 
G
L
 
S
A
x
V
G
|
G
E
|
E
R
x
P
C
 
I
D
 
N
P
 
P
D
 
E
T
 
A
L
 
W
H
 
E
W
 
W
A
 
Y
E
 
W
A
 
K
K
 
K
L
 
I
H
 
G
K
 
K
-
 
E
-
 
K
-
 
C
P
 
P
V
 
V
I
 
V
D
|
D
H
x
T
W
|
W
W
|
W
Q
|
Q
T
|
T
E
|
E
T
 
T
G
 
G
W
 
G
P
 
F
V
 
M
A
 
I
A
 
T
N
 
P
L
 
L
M
 
P
G
 
G
V
 
A
A
 
-
P
 
-
I
 
I
A
 
E
V
 
L
K
 
K
A
 
A
G
 
G
S
 
S
P
 
A
G
 
T
R
 
R
P
 
P
V
 
F
P
 
F
G
 
G
Y
 
V
E
 
Q
V
 
P
D
 
A
V
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
N
L
 
E
G
 
G
A
 
H
K
 
P
V
 
Q
A
 
E
A
 
G
N
 
A
V
 
T
S
 
E
G
 
G
N
 
N
V
 
L
V
 
V
I
 
I
K
 
T
L
 
D
P
 
S
L
 
W
P
 
-
P
 
P
G
 
G
T
 
Q
L
 
A
T
 
R
T
 
T
L
 
L
W
 
F
Q
 
G
N
 
D
N
 
H
K
 
E
R
 
R
Y
 
F
Q
 
E
D
 
Q
S
 
T
Y
 
Y
L
 
F
S
 
S
M
 
T
Y
 
F
P
 
K
G
 
N
Y
 
M
Y
 
Y
L
 
F
T
 
S
G
 
G
D
|
D
A
 
G
G
 
A
Y
 
R
M
 
R
D
 
D
E
 
E
D
 
D
G
 
G
Y
 
Y
L
 
Y
Y
 
W
I
|
I
M
 
T
S
 
G
R
|
R
I
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
V
I
 
L
N
|
N
V
 
V
A
x
S
G
|
G
H
|
H
R
|
R
L
 
L
S
 
G
T
 
T
G
 
A
R
 
E
F
 
I
E
 
E
E
 
S
V
 
A
L
 
L
C
x
V
Q
 
A
H
|
H
P
 
P
D
 
K
V
x
I
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
V
G
 
G
V
 
I
D
 
P
D
 
H
K
 
A
L
 
I
K
 
K
G
 
G
Q
 
Q
V
 
A
P
 
I
L
 
Y
G
 
A
L
 
Y
V
 
V
V
 
T
L
 
L
K
 
N
K
 
H
G
 
G
V
 
E
T
 
E
I
 
P
T
 
S
D
 
-
E
 
P
E
 
E
L
 
L
H
 
Y
K
 
A
Q
 
E
L
 
V
I
 
R
A
 
N
L
 
W
V
 
V
R
|
R
Q
 
K
E
 
E
I
 
I
G
 
G
P
|
P
V
 
L
A
 
A
S
 
T
F
 
P
R
 
D
L
 
V
V
 
L
S
 
H
A
 
W
I
 
T
Q
 
D
K
 
S
L
 
L
P
 
P
K
 
K
T
 
T
R
 
R
S
 
S
G
 
G
K
|
K
I
 
I
L
 
M
R
 
R
G
 
R
T
 
I
M
 
L
R
 
R
K
 
K
I
 
I
A
 
A

P27550 Acetyl-coenzyme A synthetase; AcCoA synthetase; Acs; Acetate--CoA ligase; Acyl-activating enzyme; EC 6.2.1.1 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
40% identity, 96% coverage: 11:623/640 of query aligns to 25:639/652 of P27550

query
sites
P27550
Q
 
E
Q
 
A
L
 
M
H
 
Y
Q
 
Q
T
 
Q
S
 
S
I
 
I
A
 
N
N
 
V
K
 
P
Q
 
D
A
 
T
F
 
F
W
 
W
Q
 
G
Q
 
E
A
 
Q
A
 
G
K
 
K
A
 
I
L
 
L
D
 
D
W
 
W
V
 
I
T
 
K
P
 
P
S
 
Y
K
 
Q
Q
 
K
I
 
V
L
 
K
D
 
N
E
 
T
S
 
S
E
 
F
A
 
A
P
 
P
-
 
G
-
 
N
-
 
V
F
 
S
Y
 
I
H
 
K
W
 
W
F
 
Y
S
 
E
D
 
D
G
 
G
E