SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 7025111 FitnessBrowser__ANA3:7025111 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7qyrD Crystal structure of rimk from pseudomonas aeruginosa pao1 (see paper)
76% identity, 97% coverage: 1:289/299 of query aligns to 1:289/293 of 7qyrD

query
sites
7qyrD
M
 
M
R
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
V
L
 
L
S
|
S
Q
 
R
G
 
N
P
 
P
E
 
R
L
|
L
Y
 
Y
S
|
S
T
 
T
K
 
R
R
 
R
L
 
L
V
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
G
T
 
R
L
 
E
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
 
E
V
 
M
K
 
V
V
 
V
I
 
I
N
 
D
P
 
T
L
 
L
E
 
R
C
 
A
Y
 
Y
M
 
M
N
 
N
I
 
I
N
 
A
M
 
S
R
 
H
Q
 
K
S
 
P
S
 
Q
I
 
I
H
 
H
I
 
Y
G
 
R
G
 
G
E
 
Q
E
 
P
L
 
L
P
 
E
P
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
R
|
R
I
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
S
I
 
V
T
 
T
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
S
 
C
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
M
 
M
M
 
M
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
A
 
P
L
 
L
N
 
N
D
 
E
S
 
S
V
 
V
G
 
A
I
 
I
S
 
A
R
 
R
S
 
S
R
 
R
D
 
D
K
 
K
L
 
L
R
 
R
S
 
S
M
 
L
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
S
 
S
R
 
R
R
 
K
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
T
 
T
G
 
G
F
 
F
A
 
A
N
 
H
K
 
S
P
 
P
S
 
D
D
 
D
I
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
E
M
 
M
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
|
V
I
 
I
K
 
K
L
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
C
E
 
E
T
 
T
R
 
E
K
 
K
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
S
V
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
A
F
 
F
M
 
M
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
H
N
 
N
I
 
I
M
 
M
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
Y
|
Y
I
|
I
K
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
G
G
 
G
A
 
A
D
|
D
I
 
I
R
|
R
C
 
C
F
 
F
V
 
V
L
 
V
G
 
G
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
S
M
 
M
K
 
K
R
 
R
Q
 
Q
A
 
A
M
 
A
P
 
P
G
 
G
E
 
E
F
 
F
R
|
R
S
|
S
N
 
N
L
 
L
H
 
H
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
V
 
I
K
 
K
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
R
 
R
S
 
M
V
 
T
A
 
A
I
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
R
T
 
V
M
 
M
G
 
G
L
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
|
L
R
 
R
S
 
S
N
 
N
H
 
H
G
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
V
M
|
M
E
 
E
V
 
V
N
|
N
S
 
S
S
|
S
P
 
P
G
|
G
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
E
G
 
S
A
 
T
T
 
T
A
 
G
K
 
K
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
I
I
 
I
I
 
I
E
 
Q
F
 
Y
V
 
L
E
 
E
K
 
K
N
 
N

5zctH The crystal structure of the poly-alpha-l-glutamate peptides synthetase rimk at 2.05 angstrom resolution. (see paper)
68% identity, 97% coverage: 1:290/299 of query aligns to 1:290/292 of 5zctH

query
sites
5zctH
M
 
M
R
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
L
S
 
S
Q
 
R
G
 
D
P
 
G
E
 
T
L
 
L
Y
 
Y
S
 
S
T
 
C
K
 
K
R
 
R
L
 
L
V
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
 
L
V
 
V
K
 
E
V
 
I
I
 
L
N
 
D
P
 
P
L
 
L
E
 
S
C
 
C
Y
 
Y
M
 
M
N
 
N
I
 
I
N
 
N
M
 
P
R
 
A
Q
 
A
S
 
S
S
 
S
I
 
I
H
 
H
I
 
Y
G
 
K
G
 
G
E
 
R
E
 
K
L
 
L
P
 
P
P
 
H
F
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
T
S
 
A
I
 
I
T
 
T
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
A
V
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
M
 
M
M
 
L
G
 
G
V
 
S
Y
 
Y
A
 
P
L
 
L
N
 
N
D
 
E
S
 
S
V
 
V
G
 
A
I
 
I
S
 
A
R
 
R
S
 
A
R
 
R
D
 
D
K
 
K
L
 
L
R
 
R
S
 
S
M
 
M
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
S
 
A
R
 
R
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
V
T
 
T
G
 
G
F
 
I
A
 
A
N
 
H
K
 
S
P
 
P
S
 
D
D
 
D
I
 
T
P
 
S
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
|
V
I
 
V
K
|
K
L
 
L
L
 
V
E
 
E
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
T
R
 
R
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
S
V
 
V
I
 
I
E
 
D
A
 
A
F
 
F
M
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
N
A
 
A
N
 
H
I
 
I
M
 
L
V
 
V
Q
|
Q
E
 
E
Y
|
Y
I
|
I
K
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
|
D
I
 
I
R
 
R
C
 
C
F
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
G
D
 
D
K
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
I
K
 
E
R
 
R
Q
 
R
A
 
A
M
 
K
P
 
E
G
 
G
E
 
D
F
|
F
R
|
R
S
|
S
N
|
N
L
 
L
H
 
H
R
|
R
G
 
G
G
 
G
T
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
V
V
 
A
K
 
S
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
R
 
R
S
 
E
V
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
R
T
 
T
M
 
M
G
 
A
L
 
L
N
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
|
D
L
 
I
L
|
L
R
 
R
S
 
A
N
 
N
H
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
V
M
|
M
E
|
E
V
 
V
N
 
N
S
 
A
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
E
G
 
K
A
 
T
T
 
T
A
 
G
K
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
M
I
 
I
E
 
R
F
 
W
V
 
I
E
 
E
K
 
R
N
 
H
A
 
A

5zctA The crystal structure of the poly-alpha-l-glutamate peptides synthetase rimk at 2.05 angstrom resolution. (see paper)
68% identity, 97% coverage: 1:290/299 of query aligns to 1:290/292 of 5zctA

query
sites
5zctA
M
 
M
R
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
L
S
 
S
Q
 
R
G
 
D
P
 
G
E
 
T
L
 
L
Y
 
Y
S
 
S
T
 
C
K
 
K
R
 
R
L
 
L
V
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
 
L
V
 
V
K
 
E
V
 
I
I
 
L
N
 
D
P
 
P
L
 
L
E
 
S
C
 
C
Y
 
Y
M
 
M
N
 
N
I
 
I
N
 
N
M
 
P
R
 
A
Q
 
A
S
 
S
S
 
S
I
 
I
H
 
H
I
 
Y
G
 
K
G
 
G
E
 
R
E
 
K
L
 
L
P
 
P
P
 
H
F
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
T
S
 
A
I
 
I
T
 
T
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
A
V
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
M
 
M
M
 
L
G
 
G
V
 
S
Y
 
Y
A
 
P
L
 
L
N
 
N
D
 
E
S
 
S
V
 
V
G
 
A
I
 
I
S
 
A
R
 
R
S
 
A
R
 
R
D
 
D
K
|
K
L
 
L
R
 
R
S
 
S
M
 
M
Q
 
Q
L
 
L
M
 
L
S
 
A
R
 
R
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
V
T
 
T
G
 
G
F
 
I
A
 
A
N
 
H
K
 
S
P
 
P
S
 
D
D
 
D
I
 
T
P
 
S
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
 
V
I
 
V
K
|
K
L
 
L
L
 
V
E
 
E
G
 
G
T
|
T
Q
|
Q
G
|
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
T
R
 
R
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
S
V
 
V
I
 
I
E
 
D
A
 
A
F
 
F
M
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
N
A
 
A
N
 
H
I
 
I
M
 
L
V
 
V
Q
|
Q
E
 
E
Y
|
Y
I
|
I
K
 
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
 
D
I
 
I
R
 
R
C
 
C
F
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
G
D
 
D
K
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
I
K
 
E
R
 
R
Q
 
R
A
 
A
M
 
K
P
 
E
G
 
G
E
 
D
F
 
F
R
|
R
S
|
S
N
|
N
L
 
L
H
 
H
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
V
V
 
A
K
 
S
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
R
 
R
S
 
E
V
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
R
T
 
T
M
 
M
G
 
A
L
 
L
N
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
|
L
R
 
R
S
 
A
N
 
N
H
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
V
M
|
M
E
 
E
V
 
V
N
 
N
S
 
A
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
E
G
 
K
A
 
T
T
 
T
A
 
G
K
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
M
I
 
I
E
 
R
F
 
W
V
 
I
E
 
E
K
 
R
N
 
H
A
 
A

4iwxA Rimk structure at 2.85a (see paper)
68% identity, 97% coverage: 1:290/299 of query aligns to 3:292/294 of 4iwxA

query
sites
4iwxA
M
 
M
R
 
K
I
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
L
S
 
S
Q
 
R
G
 
D
P
 
G
E
 
T
L
 
L
Y
 
Y
S
 
S
T
 
C
K
 
K
R
 
R
L
 
L
V
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
A
T
 
I
L
 
Q
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
 
L
V
 
V
K
 
E
V
 
I
I
 
L
N
 
D
P
 
P
L
 
L
E
 
S
C
 
C
Y
 
Y
M
 
M
N
 
N
I
 
I
N
 
N
M
 
P
R
 
A
Q
 
A
S
 
S
S
 
S
I
 
I
H
 
H
I
 
Y
G
 
K
G
 
G
E
 
R
E
 
K
L
 
L
P
 
P
P
 
H
F
 
F
D
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
R
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
T
S
 
A
I
 
I
T
 
T
F
 
F
Y
 
Y
G
 
G
S
 
T
A
 
A
V
 
A
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
F
 
F
E
 
E
M
 
M
M
 
L
G
 
G
V
 
S
Y
 
Y
A
 
P
L
 
L
N
 
N
D
 
E
S
 
S
V
 
V
G
 
A
I
 
I
S
 
A
R
|
R
S
 
A
R
 
R
D
 
D
K
 
K
L
 
L
R
|
R
S
 
S
M
 
M
Q
|
Q
L
|
L
M
 
L
S
 
A
R
|
R
R
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
D
L
 
L
P
 
P
I
 
V
T
 
T
G
 
G
F
 
I
A
 
A
N
 
H
K
 
S
P
 
P
S
 
D
D
 
D
I
 
T
P
 
S
D
 
D
L
 
L
I
 
I
D
 
D
M
 
M
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
V
|
V
I
 
V
K
|
K
L
 
L
L
 
V
E
 
E
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
T
R
 
R
K
 
Q
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
S
V
 
V
I
 
I
E
 
D
A
 
A
F
 
F
M
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
N
A
 
A
N
 
H
I
 
I
M
 
L
V
 
V
Q
 
Q
E
|
E
Y
|
Y
I
|
I
K
|
K
E
 
E
A
 
A
N
 
Q
G
 
G
A
 
C
D
|
D
I
 
I
R
 
R
C
 
C
F
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
G
D
 
D
K
 
E
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
A
M
 
I
K
 
E
R
 
R
Q
 
R
A
 
A
M
 
K
P
 
E
G
 
G
E
 
D
F
 
F
R
|
R
S
|
S
N
|
N
L
 
L
H
 
H
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
V
V
 
A
K
 
S
L
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
R
 
R
S
 
E
V
 
I
A
 
A
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
R
T
 
T
M
 
M
G
 
A
L
 
L
N
 
D
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
L
 
I
L
 
L
R
 
R
S
 
A
N
 
N
H
 
R
G
 
G
P
 
P
V
 
L
V
 
V
M
|
M
E
|
E
V
 
V
N
 
N
S
 
A
S
 
S
P
 
P
G
 
G
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
I
E
 
E
G
 
K
A
 
T
T
 
T
A
 
G
K
 
I
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
M
I
 
I
E
 
R
F
 
W
V
 
I
E
 
E
K
 
R
N
 
H
A
 
A

3vpbB Argx from sulfolobus tokodaii complexed with lysw/glu/adp/mg/zn/sulfate (see paper)
31% identity, 82% coverage: 48:292/299 of query aligns to 31:282/282 of 3vpbB

query
sites
3vpbB
I
 
I
H
 
N
I
 
V
G
 
A
G
 
Q
E
 
E
E
 
P
L
 
L
P
 
P
P
 
-
F
 
F
D
 
N
A
 
K
V
 
A
I
 
L
P
 
G
R
 
R
I
 
Y
G
 
D
A
 
V
S
 
A
I
 
I
-
 
I
-
 
R
-
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
M
-
 
Y
-
 
R
T
 
A
F
 
L
Y
 
Y
G
 
S
S
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
-
Q
 
-
F
 
-
E
 
E
M
 
A
M
 
A
G
 
G
V
 
V
Y
 
H
A
 
T
L
 
I
N
 
N
D
 
S
S
 
S
V
 
D
G
 
V
I
 
I
S
 
N
R
 
V
S
 
C
R
 
G
D
 
D
K
|
K
L
 
I
R
 
L
S
 
T
M
 
Y
Q
 
S
L
 
K
M
 
L
S
 
Y
R
 
R
R
 
E
G
 
G
I
 
I
G
 
P
L
 
I
P
 
P
I
 
D
T
 
S
G
 
I
F
 
I
A
 
A
N
 
L
K
 
S
P
 
A
S
 
E
D
 
A
I
 
A
P
 
L
D
 
K
L
 
A
I
 
Y
D
 
E
M
 
Q
V
 
-
G
 
R
G
 
G
A
 
F
P
 
P
L
 
L
V
x
I
I
 
D
K
|
K
L
 
P
L
 
P
E
 
I
G
 
G
T
x
S
Q
 
W
G
|
G
I
 
R
G
 
L
V
|
V
V
 
S
L
 
L
A
 
I
E
 
R
T
 
D
R
 
V
K
 
F
A
 
E
A
 
G
E
 
K
S
 
T
V
 
I
I
 
I
E
 
E
-
 
H
-
 
R
A
 
E
F
 
L
M
 
M
G
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
N
 
H
I
 
I
M
 
-
V
 
V
Q
|
Q
E
 
E
Y
|
Y
I
|
I
K
 
-
E
 
Q
A
 
Y
N
 
K
G
 
G
A
 
R
D
|
D
I
 
I
R
 
R
C
 
C
F
 
I
V
 
A
L
 
I
G
 
G
D
 
E
K
 
E
V
 
L
I
 
L
A
 
G
A
 
C
M
x
Y
K
 
A
R
|
R
Q
 
N
A
 
I
M
 
P
P
 
P
G
 
N
E
 
E
F
 
W
R
|
R
S
x
A
N
|
N
L
x
V
H
x
A
R
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
P
S
 
S
L
 
N
V
 
I
K
 
E
L
 
V
T
 
D
P
 
E
E
 
K
E
 
L
R
 
K
S
 
E
V
 
T
A
 
V
I
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
V
K
 
S
T
 
I
M
 
V
G
 
H
L
 
G
N
 
E
V
 
F
A
 
V
G
 
S
V
 
I
D
|
D
L
 
I
L
 
L
R
 
E
S
 
H
-
 
P
N
 
N
H
 
K
G
 
G
P
 
Y
V
 
V
V
 
V
M
x
N
E
|
E
V
 
L
N
|
N
S
 
D
S
 
V
P
 
P
G
x
E
L
 
F
E
 
K
G
|
G
I
 
F
E
 
M
G
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
N
K
 
I
D
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
Q
A
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
E
F
 
Y
V
 
I
E
 
K
K
 
E
N
 
N
A
 
Y
L
 
S
K
 
K

Q970U6 Glutamate--LysW ligase ArgX; EC 6.3.2.- from Sulfurisphaera tokodaii (strain DSM 16993 / JCM 10545 / NBRC 100140 / 7) (Sulfolobus tokodaii) (see paper)
31% identity, 82% coverage: 48:292/299 of query aligns to 31:282/282 of Q970U6

query
sites
Q970U6
I
 
I
H
 
N
I
 
V
G
 
A
G
 
Q
E
 
E
E
 
P
L
 
L
P
 
P
P
 
-
F
 
F
D
 
N
A
 
K
V
 
A
I
 
L
P
 
G
R
 
R
I
 
Y
G
 
D
A
 
V
S
 
A
I
 
I
-
 
I
-
 
R
-
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
M
-
 
Y
-
 
R
T
 
A
F
 
L
Y
 
Y
G
 
S
S
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
-
Q
 
-
F
 
-
E
 
E
M
 
A
M
 
A
G
 
G
V
 
V
Y
 
H
A
 
T
L
 
I
N
 
N
D
 
S
S
 
S
V
 
D
G
 
V
I
 
I
S
 
N
R
 
V
S
 
C
R
 
G
D
 
D
K
 
K
L
 
I
R
 
L
S
 
T
M
 
Y
Q
 
S
L
 
K
M
 
L
S
 
Y
R
 
R
R
 
E
G
 
G
I
 
I
G
 
P
L
 
I
P
 
P
I
 
D
T
 
S
G
 
I
F
 
I
A
 
A
N
 
L
K
 
S
P
 
A
S
 
E
D
 
A
I
 
A
P
 
L
D
 
K
L
 
A
I
 
Y
D
 
E
M
 
Q
V
 
-
G
 
R
G
 
G
A
 
F
P
 
P
L
 
L
V
 
I
I
 
D
K
 
K
L
 
P
L
 
P
E
 
I
G
 
G
T
 
S
Q
 
W
G
 
G
I
 
R
G
 
L
V
 
V
V
 
S
L
 
L
A
 
I
E
 
R
T
 
D
R
 
V
K
 
F
A
 
E
A
 
G
E
 
K
S
 
T
V
 
I
I
 
I
E
 
E
-
 
H
-
 
R
A
 
E
F
 
L
M
 
M
G
 
G
-
 
N
-
 
S
-
 
A
L
 
L
K
 
K
A
 
A
N
 
H
I
 
I
M
 
-
V
 
V
Q
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
K
 
-
E
 
Q
A
 
Y
N
 
K
G
 
G
A
 
R
D
 
D
I
 
I
R
 
R
C
 
C
F
 
I
V
 
A
L
 
I
G
 
G
D
 
E
K
 
E
V
 
L
I
 
L
A
 
G
A
 
C
M
 
Y
K
 
A
R
 
R
Q
 
N
A
 
I
M
 
P
P
 
P
G
 
N
E
 
E
F
 
W
R
 
R
S
 
A
N
 
N
L
 
V
H
 
A
R
 
L
G
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
P
S
 
S
L
 
N
V
 
I
K
 
E
L
 
V
T
 
D
P
 
E
E
 
K
E
 
L
R
 
K
S
 
E
V
 
T
A
 
V
I
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
V
K
 
S
T
 
I
M
 
V
G
 
H
L
 
G
N
 
E
V
 
F
A
 
V
G
 
S
V
 
I
D
|
D
L
 
I
L
 
L
R
 
E
S
 
H
-
 
P
N
 
N
H
 
K
G
 
G
P
 
Y
V
 
V
V
 
V
M
 
N
E
|
E
V
 
L
N
|
N
S
 
D
S
 
V
P
 
P
G
 
E
L
 
F
E
 
K
G
 
G
I
 
F
E
 
M
G
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
N
K
 
I
D
 
N
V
 
V
A
 
A
G
 
Q
A
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
E
F
 
Y
V
 
I
E
 
K
K
 
E
N
 
N
A
 
Y
L
 
S
K
 
K

3vpdA Lysx from thermus thermophilus complexed with amp-pnp (see paper)
30% identity, 73% coverage: 73:290/299 of query aligns to 62:279/281 of 3vpdA

query
sites
3vpdA
G
 
G
S
 
L
A
 
A
V
 
A
L
 
A
R
 
R
Q
 
Y
F
 
L
E
 
T
M
 
A
M
 
L
G
 
G
V
 
I
Y
 
P
A
 
V
L
 
V
N
 
N
D
 
R
S
 
P
V
 
E
G
 
V
I
 
I
S
 
E
R
 
A
S
 
C
R
 
G
D
 
D
K
 
K
L
 
W
R
 
A
S
 
T
M
 
S
Q
 
V
L
 
A
M
 
L
S
 
A
R
 
K
R
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
P
L
 
Q
P
 
P
I
 
K
T
 
T
G
 
A
F
 
L
A
 
A
N
 
T
K
 
D
P
 
R
S
 
E
D
 
E
I
 
A
P
 
L
D
 
R
L
 
L
I
 
M
D
 
E
M
 
A
V
 
F
G
 
G
G
 
-
A
 
Y
P
 
P
L
 
V
V
|
V
I
 
L
K
|
K
L
 
P
L
 
V
E
 
I
G
 
G
T
 
S
Q
x
W
G
|
G
I
 
R
G
 
L
V
x
L
V
 
A
L
 
K
A
 
V
E
 
T
T
 
D
R
 
R
K
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
S
 
A
V
 
L
I
 
L
E
 
E
-
 
H
-
 
K
-
 
E
A
 
V
F
 
L
M
 
G
G
 
G
L
 
F
K
 
Q
A
 
H
N
 
Q
I
 
L
M
 
F
-
 
Y
V
 
I
Q
|
Q
E
 
E
Y
 
Y
I
x
V
K
 
-
E
 
E
A
x
K
N
 
P
G
 
G
A
 
R
D
|
D
I
 
I
R
 
R
C
 
V
F
 
F
V
 
V
L
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
R
V
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
M
 
I
K
 
Y
R
|
R
Q
 
R
A
 
S
M
 
-
P
 
-
G
 
A
E
 
H
F
x
W
R
 
I
S
x
T
N
 
N
L
 
T
H
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
Q
A
 
A
S
 
E
L
 
N
V
 
C
K
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
E
E
 
E
E
 
I
R
 
A
S
 
R
V
 
L
A
 
S
I
 
V
R
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
E
T
 
A
M
 
V
G
 
G
L
 
G
N
 
G
V
 
V
A
 
V
G
 
A
V
 
V
D
 
D
L
 
L
L
x
F
R
 
E
S
 
S
N
 
E
H
 
R
G
 
G
P
 
L
V
 
L
V
 
V
M
 
N
E
|
E
V
 
V
N
 
N
S
 
H
S
 
T
P
 
M
G
 
E
L
x
F
E
x
K
G
x
N
I
x
S
E
 
V
G
 
H
A
 
T
T
 
T
A
 
G
K
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
P
G
 
G
A
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
R
F
 
Y
V
 
A
E
 
W
K
 
E
N
 
V
A
 
A

5k2mI Bifunctional lysx/argx from thermococcus kodakarensis with lysw-gamma- aaa (see paper)
27% identity, 70% coverage: 78:285/299 of query aligns to 61:266/273 of 5k2mI

query
sites
5k2mI
R
 
R
Q
 
L
F
 
F
E
 
E
M
 
S
M
 
E
G
 
G
V
 
I
Y
 
P
A
 
T
L
 
V
N
 
N
D
 
S
S
 
S
V
 
R
G
 
L
I
 
I
S
 
F
R
 
E
S
 
A
R
 
G
D
 
D
K
|
K
L
 
L
R
 
F
S
 
A
M
 
T
Q
 
L
L
 
R
M
 
L
S
 
A
R
 
G
R
 
K
G
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
V
P
 
P
I
 
V
T
 
P
G
 
E
F
 
W
A
 
K
N
 
A
K
 
A
P
 
L
S
 
S
D
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
R
I
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
S
I
 
L
D
 
-
M
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
Y
P
 
P
L
 
L
V
|
V
I
 
S
K
|
K
L
 
P
L
 
V
E
x
F
G
 
G
T
x
S
Q
x
W
G
 
G
I
x
R
G
 
L
V
x
L
V
 
A
L
 
K
A
 
V
E
 
N
T
 
D
R
 
R
K
 
D
A
 
S
A
 
L
E
 
E
S
 
A
V
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
H
F
 
R
M
 
K
G
 
W
L
 
M
K
 
K
A
x
N
N
 
P
I
 
L
M
x
Y
-
 
G
-
 
I
-
 
H
-
 
Y
V
 
F
Q
|
Q
E
 
E
Y
 
F
I
x
V
K
 
-
E
 
E
A
x
K
N
 
P
G
 
G
A
 
R
D
|
D
I
 
I
R
|
R
C
 
S
F
 
Y
V
 
V
L
 
I
G
 
G
D
 
G
K
 
E
V
 
F
I
 
V
A
 
G
A
 
A
M
 
I
K
 
Y
R
 
R
Q
 
Y
A
 
S
M
 
-
P
 
-
G
 
N
E
 
H
F
x
W
R
x
I
S
x
T
N
|
N
L
x
T
H
x
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
S
 
E
L
 
P
V
 
C
K
 
S
L
 
-
T
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
V
R
 
E
S
 
E
V
 
L
A
 
S
I
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
W
K
 
E
T
 
A
M
 
F
G
 
G
L
 
E
N
 
G
V
 
A
A
 
L
G
 
A
V
 
I
D
 
D
L
 
I
L
x
F
R
 
E
S
 
S
N
 
E
H
 
K
G
 
G
P
 
L
V
 
L
V
 
V
M
x
N
E
|
E
V
 
V
N
 
N
S
 
P
S
x
N
P
 
M
G
x
E
L
x
F
E
 
K
G
x
N
I
 
A
E
 
A
G
 
R
A
 
V
T
 
T
A
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
E
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

5k2mG Bifunctional lysx/argx from thermococcus kodakarensis with lysw-gamma- aaa (see paper)
27% identity, 70% coverage: 78:285/299 of query aligns to 61:266/273 of 5k2mG

query
sites
5k2mG
R
 
R
Q
 
L
F
 
F
E
 
E
M
 
S
M
 
E
G
 
G
V
 
I
Y
 
P
A
 
T
L
 
V
N
 
N
D
 
S
S
 
S
V
 
R
G
 
L
I
 
I
S
 
F
R
 
E
S
 
A
R
 
G
D
 
D
K
|
K
L
 
L
R
 
F
S
 
A
M
 
T
Q
 
L
L
 
R
M
 
L
S
 
A
R
 
G
R
 
K
G
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
V
P
 
P
I
 
V
T
 
P
G
 
E
F
 
W
A
 
K
N
 
A
K
 
A
P
 
L
S
 
S
D
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
L
-
 
R
I
 
V
P
 
P
D
 
D
L
 
S
I
 
L
D
 
-
M
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
G
A
 
Y
P
 
P
L
 
L
V
|
V
I
 
S
K
|
K
L
 
P
L
 
V
E
x
F
G
 
G
T
x
S
Q
x
W
G
|
G
I
x
R
G
 
L
V
 
L
V
 
A
L
 
K
A
 
V
E
 
N
T
 
D
R
 
R
K
 
D
A
 
S
A
 
L
E
 
E
S
 
A
V
 
V
I
 
L
E
 
E
A
 
H
F
 
R
M
 
K
G
 
W
L
 
M
K
 
K
A
 
N
N
 
P
I
 
L
M
x
Y
-
 
G
-
 
I
-
 
H
-
 
Y
V
 
F
Q
|
Q
E
 
E
Y
 
F
I
x
V
K
 
-
E
 
E
A
x
K
N
 
P
G
 
G
A
 
R
D
|
D
I
 
I
R
|
R
C
 
S
F
 
Y
V
 
V
L
 
I
G
 
G
D
 
G
K
 
E
V
 
F
I
 
V
A
 
G
A
 
A
M
 
I
K
 
Y
R
|
R
Q
 
Y
A
 
S
M
 
-
P
 
-
G
 
N
E
 
H
F
x
W
R
 
I
S
x
T
N
|
N
L
x
T
H
x
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
T
 
K
A
 
A
S
 
E
L
 
P
V
 
C
K
 
S
L
 
-
T
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
V
R
 
E
S
 
E
V
 
L
A
 
S
I
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
W
K
 
E
T
 
A
M
 
F
G
 
G
L
 
E
N
 
G
V
 
A
A
 
L
G
 
A
V
 
I
D
|
D
L
 
I
L
x
F
R
 
E
S
 
S
N
 
E
H
 
K
G
 
G
P
 
L
V
 
L
V
 
V
M
x
N
E
|
E
V
 
V
N
|
N
S
x
P
S
x
N
P
 
M
G
x
E
L
x
F
E
 
K
G
x
N
I
x
A
E
 
A
G
 
R
A
 
V
T
 
T
A
 
G
K
 
A
D
 
D
V
 
M
A
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
E
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

1uc9A Crystal structure of a lysine biosynthesis enzyme, lysx, from thermus thermophilus hb8 (see paper)
28% identity, 71% coverage: 73:285/299 of query aligns to 62:250/256 of 1uc9A

query
sites
1uc9A
G
 
G
S
 
L
A
 
A
V
 
A
L
 
A
R
 
R
Q
 
Y
F
 
L
E
 
T
M
 
A
M
 
L
G
 
G
V
 
I
Y
 
P
A
 
V
L
 
V
N
 
N
D
 
R
S
 
P
V
 
E
G
 
V
I
 
I
S
 
E
R
 
A
S
 
C
R
 
G
D
 
D
K
 
K
L
 
W
R
 
A
S
 
T
M
 
S
Q
 
V
L
 
A
M
 
L
S
 
A
R
 
K
R
 
A
G
 
G
I
 
L
G
 
P
L
 
Q
P
 
P
I
 
K
T
 
T
G
 
A
F
 
L
A
 
A
N
 
T
K
 
D
P
 
R
S
 
E
D
 
E
I
 
A
P
 
L
D
 
R
L
 
L
I
 
M
D
 
E
M
 
A
V
 
F
G
 
G
G
 
-
A
 
Y
P
 
P
L
 
V
V
 
V
I
 
L
K
|
K
L
 
P
L
 
V
E
 
I
G
 
G
T
 
A
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
A
E
 
A
T
 
A
R
 
A
K
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
A
S
 
A
V
 
A
I
 
A
E
 
A
A
 
A
F
 
A
M
 
A
G
 
G
L
 
F
K
 
Q
A
 
H
N
 
Q
I
 
L
M
 
F
-
 
Y
V
 
I
Q
 
Q
E
 
E
Y
|
Y
I
x
V
K
 
-
E
 
E
A
 
K
N
 
P
G
 
G
A
 
R
D
|
D
I
 
I
R
 
R
C
 
V
F
 
F
V
 
V
L
 
V
G
 
G
D
 
E
K
 
R
V
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
A
M
 
I
K
 
Y
R
|
R
Q
 
-
A
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
F
 
-
R
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
-
H
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
A
S
 
E
L
 
N
V
 
C
K
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
E
E
 
E
E
 
V
R
 
A
S
 
R
V
 
L
A
 
S
I
 
V
R
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
E
T
 
A
M
 
V
G
 
G
L
 
G
N
 
G
V
 
V
A
 
V
G
 
A
V
 
V
D
 
D
L
 
L
L
x
F
R
 
E
S
 
S
N
 
E
H
 
R
G
 
G
P
 
L
V
 
L
V
 
V
M
x
N
E
 
E
V
 
V
N
 
N
S
 
H
S
 
T
P
 
M
G
 
E
L
 
F
E
 
K
G
 
N
I
 
S
E
 
V
G
 
H
A
 
T
T
 
T
A
 
G
K
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
P
G
 
G
A
 
E
I
 
I
I
 
L
E
 
K
F
 
Y

7drpA Structure of atp-grasp ligase psnb complexed with phosphomimetic variant of minimal precursor, mg, and adp (see paper)
25% identity, 92% coverage: 10:284/299 of query aligns to 12:304/312 of 7drpA

query
sites
7drpA
P
 
P
E
 
D
L
 
D
Y
 
L
S
 
H
T
 
V
K
 
Q
R
 
S
L
 
V
V
 
T
E
 
E
A
 
G
A
 
L
T
 
R
L
 
A
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
 
E
V
 
P
K
 
Y
V
 
V
I
 
F
N
 
D
-
 
T
-
 
Q
-
 
R
-
 
F
P
 
P
L
 
E
E
 
E
C
 
M
Y
 
T
M
 
V
N
 
S
I
 
L
N
 
G
M
 
E
R
 
Q
Q
 
G
S
 
A
S
 
S
I
 
I
H
 
F
I
 
V
G
 
D
G
 
G
E
 
Q
E
 
Q
L
 
I
P
 
A
P
 
R
F
 
P
D
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
Y
P
 
L
R
|
R
-
 
S
I
 
L
G
 
Y
A
 
Q
S
 
S
I
 
P
T
x
G
F
 
A
Y
|
Y
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
Q
-
 
D
-
 
N
-
 
W
-
 
R
-
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
M
S
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
L
Q
 
R
F
 
W
E
 
E
M
 
E
M
 
A
G
 
G
V
 
T
Y
 
A
A
 
V
L
 
Y
N
 
N
D
 
S
S
 
P
V
 
R
G
 
A
I
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
S
R
 
A
D
 
N
K
 
I
L
 
T
R
 
K
S
 
P
M
 
F
Q
 
Q
L
 
L
M
 
A
S
 
L
R
 
L
R
 
R
G
 
D
I
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
-
 
P
-
 
R
T
 
S
G
 
L
F
 
W
A
 
T
N
 
N
K
 
D
P
 
P
S
 
E
D
 
A
I
 
V
P
 
R
D
 
R
L
 
F
I
 
H
D
 
A
M
 
E
V
 
V
G
 
G
G
 
D
A
 
C
P
 
-
L
 
-
V
 
I
I
x
Y
K
|
K
L
 
P
L
 
V
E
 
A
G
 
G
T
x
G
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
-
A
|
A
E
 
R
T
|
T
R
|
R
K
 
K
A
 
L
A
 
E
E
 
A
S
 
K
V
 
D
I
 
L
E
 
E
A
 
A
F
 
D
M
x
R
G
 
I
L
 
E
K
x
R
-
x
L
-
 
S
-
 
A
A
 
A
N
 
P
I
x
V
M
 
C
V
 
F
Q
|
Q
E
|
E
Y
 
L
I
x
L
K
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
T
G
 
G
A
 
D
D
|
D
I
 
V
R
|
R
C
 
V
F
 
Y
V
 
V
L
 
I
G
 
D
D
 
D
K
 
Q
V
 
V
I
 
I
A
 
C
A
 
A
M
 
L
K
 
R
R
 
I
Q
 
V
A
 
T
M
 
D
P
 
E
G
 
I
E
 
D
F
 
F
R
 
R
S
 
Q
N
 
A
L
 
E
H
 
E
R
 
R
G
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
I
S
 
E
L
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
I
T
 
S
P
 
D
E
 
E
E
 
V
R
 
K
S
 
D
V
 
Q
A
 
C
I
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
L
M
 
V
G
 
G
L
 
L
N
 
R
V
 
Y
A
 
T
G
 
G
V
 
M
D
|
D
L
 
I
L
x
K
R
 
A
S
 
G
N
 
A
H
 
D
G
 
G
P
 
N
V
 
Y
-
 
R
V
 
V
M
x
L
E
|
E
V
 
L
N
|
N
S
 
A
S
|
S
P
x
A
G
x
M
L
 
F
E
 
R
G
 
G
I
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
R
T
 
A
A
 
N
K
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
C
G
 
G
A
 
P
I
 
L
I
 
C
E
 
D

7drnA Structure of atp-grasp ligase psnb complexed with precursor peptide psna2 and amppnp (see paper)
25% identity, 92% coverage: 10:284/299 of query aligns to 12:304/311 of 7drnA

query
sites
7drnA
P
 
P
E
 
D
L
 
D
Y
 
L
S
 
H
T
 
V
K
 
Q
R
 
S
L
 
V
V
 
T
E
 
E
A
 
G
A
 
L
T
 
R
L
 
A
R
 
R
G
 
G
H
 
H
E
 
E
V
 
P
K
 
Y
V
 
V
I
 
F
N
 
D
-
 
T
-
 
Q
-
 
R
-
 
F
P
 
P
L
 
E
E
 
E
C
 
M
Y
 
T
M
 
V
N
 
S
I
 
L
N
 
G
M
 
E
R
 
Q
Q
 
G
S
 
A
S
 
S
I
 
I
H
 
F
I
 
V
G
 
D
G
 
G
E
 
Q
E
 
Q
L
 
I
P
 
A
P
 
R
F
 
P
D
 
A
A
 
A
V
 
V
I
 
Y
P
 
L
R
|
R
-
 
S
I
 
L
G
 
Y
A
 
Q
S
 
S
I
 
P
T
 
G
F
 
A
Y
|
Y
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
A
-
 
M
-
 
Q
-
 
D
-
 
N
-
 
W
-
 
R
-
 
R
-
 
T
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
F
-
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
T
-
 
L
-
 
M
S
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
L
Q
 
R
F
 
W
E
 
E
M
 
E
M
 
A
G
 
G
V
 
T
Y
 
A
A
 
V
L
 
Y
N
 
N
D
 
S
S
 
P
V
 
R
G
 
A
I
 
-
S
 
-
R
 
-
S
 
S
R
 
A
D
 
N
K
 
I
L
 
T
R
 
K
S
 
P
M
 
F
Q
 
Q
L
 
L
M
 
A
S
 
L
R
 
L
R
 
R
G
 
D
I
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
P
I
 
V
-
 
P
-
 
R
T
 
S
G
 
L
F
 
W
A
 
T
N
 
N
K
 
D
P
 
P
S
 
E
D
 
A
I
 
V
P
 
R
D
 
R
L
 
F
I
 
H
D
 
A
M
 
E
V
 
V
G
 
G
G
 
D
A
 
C
P
 
-
L
 
-
V
 
I
I
x
Y
K
|
K
L
x
P
L
 
V
E
 
A
G
 
G
T
x
G
Q
 
-
G
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
L
 
-
A
|
A
E
 
R
T
|
T
R
|
R
K
 
K
A
 
L
A
 
E
E
 
A
S
 
K
V
 
D
I
 
L
E
 
E
A
 
A
F
 
D
M
x
R
G
 
I
L
 
E
K
 
R
-
 
L
-
 
S
-
 
A
A
 
A
N
 
P
I
 
V
M
 
C
V
 
F
Q
|
Q
E
|
E
Y
 
L
I
x
L
K
 
-
E
 
-
A
 
-
N
 
T
G
 
G
A
 
D
D
|
D
I
 
V
R
|
R
C
 
V
F
 
Y
V
 
V
L
 
I
G
 
D
D
 
D
K
 
Q
V
 
V
I
 
I
A
 
C
A
 
A
M
 
L
K
 
R
R
 
I
Q
 
V
A
 
T
M
 
D
P
 
E
G
 
I
E
 
D
F
 
F
R
 
R
S
 
Q
N
 
A
L
 
E
H
 
E
R
 
R
G
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
I
S
 
E
L
 
A
V
 
I
K
 
E
L
 
I
T
 
S
P
 
D
E
 
E
E
 
V
R
 
K
S
 
D
V
 
Q
A
 
C
I
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
K
T
 
L
M
 
V
G
 
G
L
 
L
N
 
R
V
 
Y
A
 
T
G
 
G
V
 
M
D
 
D
L
 
I
L
x
K
R
 
A
S
 
G
N
 
A
H
 
D
G
 
G
P
 
N
V
 
Y
-
 
R
V
 
V
M
x
L
E
|
E
V
 
L
N
 
N
S
 
A
S
|
S
P
 
A
G
x
M
L
 
F
E
 
R
G
 
G
I
 
F
E
 
E
G
 
G
A
 
R
T
 
A
A
 
N
K
 
V
D
 
D
V
 
I
A
 
C
G
 
G
A
 
P
I
 
L
I
 
C
E
 
D

3r5xD Crystal structure of d-alanine--d-alanine ligase from bacillus anthracis complexed with atp
26% identity, 57% coverage: 99:267/299 of query aligns to 96:269/306 of 3r5xD

query
sites
3r5xD
D
 
D
K
 
K
L
 
N
R
 
I
S
 
S
M
 
K
Q
 
K
L
 
I
M
 
L
S
 
R
R
 
Y
R
 
E
G
 
G
I
 
I
G
 
E
L
 
T
P
 
P
I
 
D
T
 
W
G
 
I
F
 
E
A
 
L
N
 
T
K
 
K
P
 
M
S
 
E
D
 
D
I
 
L
P
 
N
-
 
F
D
 
D
L
 
E
I
 
L
D
 
D
M
 
K
V
 
L
G
 
G
G
 
-
A
 
F
P
 
P
L
 
L
V
|
V
I
 
V
K
|
K
L
 
P
L
 
N
E
 
S
G
 
G
T
 
G
Q
x
S
G
 
S
I
 
V
G
 
G
V
|
V
V
 
K
L
 
I
A
 
V
E
 
Y
T
 
D
R
 
K
K
 
D
A
 
E
A
 
L
E
 
I
S
 
S
V
 
M
I
 
L
E
 
E
A
 
T
F
 
V
M
 
F
G
 
E
L
 
W
K
 
D
A
 
S
N
 
E
I
 
V
M
 
V
V
 
I
Q
x
E
E
 
K
Y
|
Y
I
|
I
K
 
K
E
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
G
A
 
E
D
x
E
I
 
I
R
 
T
C
 
C
F
 
S
V
 
I
L
 
F
G
 
D
D
 
G
K
 
K
V
 
Q
-
 
L
-
 
P
I
 
I
A
 
I
A
 
S
M
 
I
K
 
R
R
 
H
Q
 
A
A
 
A
M
x
E
P
 
F
G
 
F
E
x
D
F
 
Y
R
x
N
S
 
A
N
 
K
L
x
Y
H
 
D
R
 
D
G
 
A
G
 
S
T
 
T
A
 
I
S
 
E
L
 
E
V
 
V
K
 
I
L
 
E
T
 
L
P
 
P
E
 
A
E
 
E
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
R
-
 
V
R
 
N
S
 
K
V
 
A
A
 
S
I
 
L
R
 
A
A
 
C
A
 
Y
K
 
K
T
 
A
M
 
L
G
 
K
L
 
C
N
 
S
V
 
V
-
 
Y
A
 
A
G
x
R
V
 
V
D
|
D
L
 
M
L
x
M
R
 
V
S
 
K
N
 
D
H
 
G
G
 
I
P
 
P
V
 
Y
V
 
V
M
|
M
E
|
E
V
 
V
N
|
N
S
 
T
S
 
L
P
 
P
G
|
G
L
 
M

Sites not aligning to the query:

7lg5A Synechocystis sp. Utex2470 cyanophycin synthetase 1 with atp (see paper)
28% identity, 37% coverage: 92:203/299 of query aligns to 212:319/871 of 7lg5A

query
sites
7lg5A
V
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
E
R
 
L
S
 
A
R
 
C
D
 
D
K
 
K
L
 
E
R
 
G
S
 
T
M
 
K
Q
 
T
L
 
I
M
 
L
S
 
Q
R
 
D
R
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
P
L
 
V
P
 
P
I
 
R
T
 
G
G
 
T
F
 
T
A
 
I
N
 
Q
K
 
Y
P
 
F
S
 
D
D
 
D
I
 
L
P
 
E
D
 
E
L
 
A
I
 
I
D
 
N
M
 
D
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
P
 
P
L
 
V
V
|
V
I
 
I
K
 
K
L
 
P
L
 
L
E
 
D
G
 
G
T
 
N
Q
 
H
G
 
G
I
 
R
G
 
G
V
 
I
V
 
T
L
 
I
A
 
-
E
 
N
T
 
V
R
 
R
K
 
H
A
 
W
A
 
Q
E
 
E
S
 
A
V
 
I
I
 
A
E
 
A
A
 
Y
F
 
D
M
 
L
G
 
A
L
 
A
K
 
E
A
 
E
N
 
S
I
 
I
M
 
I
V
 
V
Q
 
E
E
 
R
Y
 
Y
I
x
Y
K
 
E
E
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
G
A
 
S
D
|
D
I
 
H
R
 
R
C
 
V
F
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
N
D
 
G
K
 
K
V
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
V
M
 
A
K
 
E
R
 
R

Sites not aligning to the query:

7waeB Trichodesmium erythraeum cyanophycin synthetase 1 (tecpha1) with atpgammas, 4x(beta-asp-arg), and aspartate (see paper)
28% identity, 37% coverage: 92:203/299 of query aligns to 212:323/877 of 7waeB

query
sites
7waeB
V
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
E
R
 
L
S
 
A
R
 
C
D
 
D
K
 
K
L
 
E
R
 
G
S
 
T
M
 
K
Q
 
R
L
 
I
M
 
L
S
 
K
R
 
D
R
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
P
L
 
V
P
 
P
I
 
R
T
 
G
G
 
T
F
 
V
A
 
A
N
 
R
K
 
Y
P
 
F
S
 
D
D
 
E
I
 
L
P
 
Q
D
 
D
L
 
A
I
 
I
D
 
E
M
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
P
 
P
L
 
I
V
 
V
I
 
I
K
|
K
L
 
P
L
 
L
E
 
D
G
 
G
T
 
N
Q
 
H
G
 
G
I
 
R
G
 
G
V
x
I
V
 
T
L
 
I
-
 
D
-
 
V
A
 
K
E
 
N
T
 
W
R
 
Q
K
 
E
A
 
A
A
 
E
E
 
E
S
 
A
V
 
Y
I
 
D
E
 
L
A
 
A
F
 
R
M
 
K
G
 
A
L
 
S
K
 
K
A
 
T
N
 
K
I
 
T
M
 
V
V
 
I
Q
 
V
E
|
E
Y
 
-
I
 
-
K
 
R
E
 
Y
A
x
Y
N
 
T
G
 
G
A
 
K
D
|
D
I
 
H
R
|
R
C
 
V
F
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
N
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
V
M
 
A
K
 
E
R
 
R

Sites not aligning to the query:

A0A482PU20 Glutathione synthetase; GSH synthetase; GSH-S; GSHase; Glutathione synthase; EC 6.3.2.3 from Citrobacter rodentium (see paper)
27% identity, 78% coverage: 56:287/299 of query aligns to 89:310/315 of A0A482PU20

query
sites
A0A482PU20
P
 
P
P
 
P
F
 
F
D
 
D
A
 
T
V
 
E
I
 
F
P
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
T
 
-
F
 
I
Y
 
Y
G
 
A
S
 
T
A
 
Y
V
 
I
L
 
L
R
 
E
Q
 
R
F
 
A
E
 
E
M
 
E
M
 
K
G
 
G
V
 
T
Y
 
L
A
 
I
L
 
V
N
 
N
D
 
K
S
 
P
V
 
Q
G
 
S
I
 
L
S
 
R
R
 
D
S
 
C
R
 
N
D
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
F
S
 
T
M
 
A
Q
 
W
-
 
F
-
 
S
-
 
D
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
T
L
 
L
M
 
V
S
 
T
R
 
R
R
 
N
G
 
K
I
 
A
G
 
Q
L
 
L
P
 
-
I
 
-
T
 
K
G
 
A
F
 
F
A
 
W
N
 
Q
K
 
K
P
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
I
-
 
I
-
 
L
-
 
K
P
 
P
D
 
-
L
 
-
I
 
L
D
 
D
M
 
G
V
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
S
L
 
-
V
 
I
I
 
F
K
 
R
L
 
V
L
 
K
E
 
E
G
 
G
T
 
D
Q
 
P
G
 
N
I
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
A
E
 
E
S
 
T
V
 
L
I
 
T
E
 
E
A
 
H
F
 
-
M
 
-
G
 
G
L
 
T
K
 
R
A
 
Y
N
 
-
I
 
C
M
 
M
V
 
A
Q
 
Q
E
 
N
Y
 
Y
I
 
L
K
 
P
E
 
A
A
 
I
N
 
V
G
 
D
A
 
G
D
 
D
I
 
K
R
 
R
C
 
V
F
 
L
V
 
V
L
 
V
-
 
D
G
 
G
D
 
E
K
 
P
V
 
V
I
 
P
A
 
Y
A
 
C
M
 
L
K
 
A
R
 
R
Q
 
I
A
 
P
M
 
Q
P
 
G
G
 
G
E
 
E
F
 
T
R
 
R
S
 
G
N
 
N
L
 
L
H
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
R
A
 
G
S
 
E
L
 
P
V
 
R
K
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
D
E
 
S
E
 
D
R
 
W
S
 
A
V
 
I
A
 
A
I
x
R
R
 
R
A
 
I
A
 
G
K
 
P
T
 
T
M
 
L
-
 
K
-
 
A
-
 
K
G
 
G
L
 
L
N
 
I
V
 
F
A
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
I
R
 
-
S
 
-
N
 
-
H
 
-
G
 
G
P
 
D
V
 
R
V
 
L
M
 
T
E
 
E
V
 
I
N
 
N
-
 
V
S
 
T
S
 
S
P
 
P
G
 
T
-
 
C
L
 
I
E
 
R
G
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
A
A
 
E
T
 
F
A
 
P
K
 
I
D
 
S
V
 
I
A
 
T
G
 
G
A
 
M
I
 
L
I
 
M
E
 
D
F
 
A
V
 
I
E
 
E

7waeD Trichodesmium erythraeum cyanophycin synthetase 1 (tecpha1) with atpgammas, 4x(beta-asp-arg), and aspartate (see paper)
28% identity, 37% coverage: 92:203/299 of query aligns to 212:323/724 of 7waeD

query
sites
7waeD
V
 
L
G
 
G
I
 
V
S
 
E
R
 
L
S
 
A
R
 
C
D
 
D
K
|
K
L
 
E
R
 
G
S
 
T
M
 
K
Q
 
R
L
 
I
M
 
L
S
 
K
R
 
D
R
 
A
G
 
G
I
 
V
G
 
P
L
 
V
P
 
P
I
 
R
T
 
G
G
 
T
F
 
V
A
 
A
N
 
R
K
 
Y
P
 
F
S
 
D
D
 
E
I
 
L
P
 
Q
D
 
D
L
 
A
I
 
I
D
 
E
M
 
Y
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
Y
P
 
P
L
 
I
V
|
V
I
 
I
K
|
K
L
 
P
L
 
L
E
 
D
G
|
G
T
x
N
Q
x
H
G
|
G
I
 
R
G
 
G
V
x
I
V
 
T
L
x
I
-
 
D
-
 
V
A
 
K
E
 
N
T
 
W
R
 
Q
K
 
E
A
 
A
A
 
E
E
 
E
S
 
A
V
 
Y
I
 
D
E
 
L
A
 
A
F
 
R
M
 
K
G
 
A
L
 
S
K
 
K
A
 
T
N
 
K
I
 
T
M
 
V
V
 
I
Q
 
V
E
|
E
Y
 
-
I
 
-
K
 
R
E
 
Y
A
x
Y
N
 
T
G
 
G
A
 
K
D
|
D
I
 
H
R
|
R
C
 
V
F
 
L
V
 
V
L
 
V
G
 
N
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
V
M
 
A
K
 
E
R
 
R

Sites not aligning to the query:

B7UHZ4 Glutathione synthetase; GSH synthetase; GSH-S; GSHase; Glutathione synthase; EC 6.3.2.3 from Escherichia coli O127:H6 (strain E2348/69 / EPEC) (see paper)
26% identity, 78% coverage: 56:287/299 of query aligns to 89:310/316 of B7UHZ4

query
sites
B7UHZ4
P
 
P
P
 
P
F
 
F
D
 
D
A
 
T
V
 
E
I
 
F
P
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
T
 
-
F
 
I
Y
 
Y
G
 
A
S
 
T
A
 
Y
V
 
I
L
 
L
R
 
E
Q
 
R
F
 
A
E
 
E
M
 
E
M
 
K
G
 
G
V
 
T
Y
 
L
A
 
I
L
 
V
N
 
N
D
 
K
S
 
P
V
 
Q
G
 
S
I
 
L
S
 
R
R
 
D
S
 
C
R
 
N
D
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
F
S
 
T
M
 
A
Q
 
W
-
 
F
-
 
S
-
 
D
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
T
L
 
L
M
 
V
S
 
T
R
 
R
R
 
N
G
 
K
I
 
A
G
 
Q
L
 
L
P
 
-
I
 
-
T
 
K
G
 
A
F
 
F
A
 
W
N
 
E
K
 
K
P
 
H
S
 
S
D
 
D
I
 
I
-
 
I
-
 
L
-
 
K
P
 
P
D
 
-
L
 
-
I
 
L
D
 
D
M
 
G
V
 
M
G
 
G
G
 
G
A
 
A
P
 
S
L
 
-
V
 
I
I
 
F
K
 
R
L
 
V
L
 
K
E
 
E
G
 
G
T
 
D
Q
 
P
G
 
N
I
 
L
G
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
-
A
 
-
E
 
-
T
 
-
R
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
A
E
 
E
S
 
T
V
 
L
I
 
T
E
 
E
A
 
H
F
 
-
M
 
-
G
 
G
L
 
T
K
 
R
A
 
Y
N
 
-
I
 
C
M
 
M
V
 
A
Q
 
Q
E
 
N
Y
 
Y
I
 
L
K
 
P
E
 
A
A
 
I
N
 
K
G
 
D
A
 
G
D
 
D
I
 
K
R
 
R
C
 
V
F
 
L
V
 
V
L
 
V
-
 
D
G
 
G
D
 
E
K
 
P
V
 
V
I
 
P
A
 
Y
A
 
C
M
 
L
K
 
A
R
 
R
Q
 
I
A
 
P
M
 
Q
P
 
G
G
 
G
E
 
E
F
 
T
R
 
R
S
 
G
N
 
N
L
 
L
H
 
A
R
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
R
A
 
G
S
 
E
L
 
P
V
 
R
K
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
E
E
 
S
E
 
D
R
 
W
S
 
K
V
 
I
A
 
A
I
x
R
R
 
Q
A
 
I
A
 
G
K
 
P
T
 
T
M
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
K
G
 
G
L
 
L
N
 
I
V
 
F
A
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
I
R
 
-
S
 
-
N
 
-
H
 
-
G
 
G
P
 
D
V
 
R
V
 
L
M
 
T
E
 
E
V
 
I
N
 
N
-
 
V
S
 
T
S
 
S
P
 
P
G
 
T
-
 
C
L
 
I
E
 
R
G
 
E
I
 
I
E
 
E
G
 
A
A
 
E
T
 
F
A
 
P
K
 
V
D
 
S
V
 
I
A
 
T
G
 
G
A
 
M
I
 
L
I
 
M
E
 
D
F
 
A
V
 
I
E
 
E

P04425 Glutathione synthetase; GSH synthetase; GSH-S; GSHase; Glutathione synthase; EC 6.3.2.3 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
26%