SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 7025598 FitnessBrowser__ANA3:7025598 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4yerA Crystal structure of an abc transporter atp-binding protein (tm_1403) from thermotoga maritima msb8 at 2.35 a resolution
34% identity, 86% coverage: 26:324/346 of query aligns to 2:275/285 of 4yerA

query
sites
4yerA
E
 
E
F
 
D
A
 
I
I
 
I
E
 
V
T
 
V
R
 
E
G
 
N
M
 
L
T
 
V
R
 
K
A
 
K
F
|
F
G
 
G
G
 
D
I
x
F
N
 
E
A
 
A
V
 
V
E
 
K
D
 
G
L
 
V
D
 
S
L
 
F
A
 
S
I
 
V
P
 
K
K
 
K
G
 
G
T
 
E
I
 
I
Y
 
F
G
 
A
F
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
C
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
S
 
T
I
 
I
R
 
H
M
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
T
L
 
L
L
 
L
S
 
K
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
D
 
K
I
 
A
R
 
W
V
 
V
L
 
A
G
 
G
E
 
H
T
 
D
L
 
V
P
 
L
G
 
K
A
 
E
E
 
P
E
 
R
K
 
E
L
 
V
R
 
R
R
 
R
R
 
K
I
 
I
G
 
G
Y
 
I
M
 
V
T
 
F
Q
 
Q
K
 
D
F
 
Q
S
 
S
L
 
L
Y
 
D
D
 
R
N
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
A
R
 
Y
E
 
E
N
 
N
L
 
M
E
 
Y
F
 
I
V
 
H
A
 
G
Q
 
K
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
L
 
Y
N
 
G
R
 
G
R
 
E
Q
 
K
T
 
L
K
 
K
A
 
K
R
 
R
L
 
I
A
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
E
L
 
F
Y
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
L
G
 
E
R
 
F
E
 
K
K
 
D
Q
 
K
M
 
P
A
 
V
G
 
K
S
x
T
M
x
F
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
A
Q
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
E
L
 
I
A
 
A
A
 
R
A
 
S
T
 
L
L
 
I
H
 
H
H
 
E
P
 
P
E
 
E
L
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
I
A
 
G
V
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
H
N
 
T
R
 
R
R
 
A
E
 
H
F
 
M
W
 
W
E
 
E
R
 
Y
L
 
I
F
 
S
D
 
K
L
 
M
C
 
K
A
 
K
Q
 
E
-
 
H
G
 
N
T
 
M
T
 
T
I
 
I
L
 
F
V
 
L
S
 
T
T
 
T
H
 
H
Y
 
Y
M
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
Q
-
 
L
C
 
A
H
 
D
G
 
R
L
 
V
A
 
A
I
 
I
L
 
I
E
 
D
R
 
H
G
 
G
I
 
K
K
 
I
R
 
I
A
 
A
D
 
L
G
 
G
S
 
T
P
 
P
Q
 
T
Q
 
E
L
 
L
M
 
K
A
 
R
A
 
M
M
 
V
G
 
G
A
 
K
R
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
Y
V
 
V
S
 
R
G
 
D
-
 
F
-
 
I
E
 
E
D
 
S
L
 
C
R
 
R
K
 
K
L
 
L
K
 
P
Q
 
D
S
 
-
L
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
I
 
-
G
 
-
S
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
E
V
 
L
L
 
N
V
 
V
Q
 
E
S
 
D
S
 
I
I
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
W
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
R
 
E
A
 
E
L
 
I
T
 
T
E
 
Y
V
 
H
R
 
K
P
 
P
S
 
T
L
 
L
E
 
N
D
 
D
V
 
V
F
 
F
V
 
L
T
 
H
C
 
L
T
 
T
G
 
G

Q9BZC7 ATP-binding cassette sub-family A member 2; ATP-binding cassette transporter 2; ATP-binding cassette 2; EC 7.6.2.- from Homo sapiens (Human) (see paper)
35% identity, 62% coverage: 35:250/346 of query aligns to 2061:2277/2435 of Q9BZC7

query
sites
Q9BZC7
T
 
S
R
 
R
A
 
K
F
 
I
G
 
G
G
 
R
I
 
I
N
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
D
D
 
R
L
 
L
D
 
C
L
 
L
A
 
G
I
 
V
P
 
R
K
 
P
G
 
G
T
 
E
I
 
C
Y
 
F
G
 
G
F
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
V
N
 
N
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
S
S
 
T
I
 
F
R
 
K
M
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
D
L
 
E
S
 
S
P
 
T
T
 
T
S
 
G
G
 
G
D
 
E
I
 
A
R
 
F
V
 
V
L
 
N
G
 
G
E
 
H
T
 
S
L
 
V
P
 
L
G
 
K
A
 
E
E
 
L
E
 
L
K
 
Q
L
 
V
R
 
Q
R
 
Q
R
 
S
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
M
 
C
T
 
P
Q
 
Q
K
 
C
F
 
D
S
 
A
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
N
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
A
R
 
R
E
 
E
N
 
H
L
 
L
E
 
Q
F
 
L
V
 
Y
A
 
T
Q
 
R
I
 
L
Y
 
R
G
 
G
L
 
I
N
 
S
R
 
W
R
 
K
Q
 
D
T
 
E
K
 
A
A
 
R
R
 
V
L
 
V
A
 
K
E
 
W
L
 
A
L
 
L
S
 
E
L
 
K
Y
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
T
G
 
K
R
 
Y
E
 
A
K
 
D
Q
 
K
M
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
T
M
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
N
K
 
K
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
S
L
 
T
A
 
A
A
 
I
A
 
A
T
 
L
L
 
I
H
 
G
H
 
Y
P
 
P
E
 
A
L
 
F
L
 
I
F
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
T
A
 
G
V
 
M
D
 
D
P
 
P
E
 
K
N
 
A
R
 
R
R
 
R
E
 
F
F
 
L
W
 
W
E
 
N
R
 
L
L
 
I
F
 
L
D
 
D
L
 
L
C
 
I
A
 
K
Q
 
T
G
 
G
T
 
R
T
 
S
I
 
V
L
 
V
V
 
L
S
 
T
T
 
S
H
 
H
Y
 
S
M
 
M
D
 
E
E
 
E
A
 
C
E
 
E
R
 
A
-
 
L
C
 
C
H
 
T
G
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
L
 
M
E
 
V
R
 
N
G
 
G
I
 
R
K
 
L
R
 
R
A
 
C
D
 
L
G
 
G
S
 
S
P
 
I
Q
 
Q
Q
 
H
L
 
L
M
 
K
A
 
N
A
 
R
M
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Q99758 Phospholipid-transporting ATPase ABCA3; ABC-C transporter; ATP-binding cassette sub-family A member 3; ATP-binding cassette transporter 3; ATP-binding cassette 3; Xenobiotic-transporting ATPase ABCA3; EC 7.6.2.1; EC 7.6.2.2 from Homo sapiens (Human) (see 15 papers)
37% identity, 65% coverage: 43:267/346 of query aligns to 1398:1617/1704 of Q99758

query
sites
Q99758
A
 
A
V
 
V
E
 
D
D
 
R
L
 
L
D
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
V
P
 
Q
K
 
K
G
 
G
T
 
E
I
 
C
Y
 
F
G
 
G
F
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
F
N
 
N
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
S
 
T
I
 
F
R
 
K
M
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
E
L
 
E
S
 
S
P
 
L
T
 
T
S
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
A
R
 
F
V
 
V
L
 
G
G
 
G
E
 
H
T
 
R
L
 
I
P
 
S
G
 
S
A
 
D
E
 
V
E
 
G
K
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
R
 
R
I
 
I
G
 
G
Y
 
Y
M
 
C
T
 
P
Q
 
Q
K
 
F
F
 
D
S
 
A
L
 
L
Y
 
L
D
 
D
N
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
G
R
 
R
E
 
E
N
 
M
L
 
L
E
 
V
F
 
M
V
 
Y
A
 
A
Q
 
R
I
 
L
Y
 
R
G
 
G
L
 
I
N
 
P
R
 
E
R
 
R
Q
 
H
T
 
I
K
 
G
A
 
A
R
 
C
L
 
V
A
 
E
E
 
N
L
 
T
L
 
L
S
 
R
L
 
G
Y
 
L
D
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
P
R
 
H
E
 
A
K
 
N
Q
 
K
M
 
L
A
 
V
G
 
R
S
 
T
M
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
N
K
 
K
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
S
L
 
T
A
 
G
A
 
I
A
 
A
T
 
L
L
 
I
H
 
G
H
 
E
P
 
P
E
 
A
L
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
S
S
 
T
A
 
G
V
 
M
D
 
D
P
 
P
E
 
V
N
 
A
R
 
R
R
 
R
E
 
L
F
x
L
W
 
W
E
 
D
R
 
T
L
 
V
F
 
A
D
 
R
L
 
A
C
 
R
A
 
E
Q
 
S
G
 
G
T
 
K
T
 
A
I
 
I
L
 
I
V
 
I
S
 
T
T
 
S
H
 
H
Y
 
S
M
 
M
D
 
E
E
 
E
A
 
C
E
 
E
R
 
A
-
x
L
C
 
C
H
 
T
G
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
L
 
M
E
 
V
R
 
Q
G
 
G
I
x
Q
K
 
F
R
 
K
A
 
C
D
 
L
G
 
G
S
 
S
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
H
L
 
L
M
 
K
A
 
S
A
 
K
M
 
F
G
 
G
A
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
S
G
 
G
E
 
Y
D
 
S
L
 
L
R
 
R
K
 
A
L
 
K
K
 
V
Q
 
Q
S
 
S

Sites not aligning to the query:

Q5SSE9 ATP-binding cassette sub-family A member 13; EC 7.6.2.- from Mus musculus (Mouse) (see paper)
32% identity, 84% coverage: 43:333/346 of query aligns to 3825:4103/5034 of Q5SSE9

query
sites
Q5SSE9
A
 
A
V
 
V
E
 
Q
D
 
E
L
 
L
D
 
T
L
 
L
A
 
T
I
 
F
P
 
H
K
 
R
G
 
D
T
 
Q
I
 
I
Y
 
T
G
 
A
F
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
T
N
 
N
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
T
T
 
T
S
 
I
I
 
I
R
 
S
M
 
M
L
 
L
T
 
M
G
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
D
 
T
I
 
I
R
 
T
V
 
I
L
 
N
G
 
G
E
 
K
T
 
N
L
 
L
P
 
Q
G
 
T
A
 
D
E
 
L
E
 
S
K
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
R
 
E
I
 
L
G
 
G
Y
 
V
M
 
C
T
 
P
Q
 
Q
K
 
Q
F
 
D
S
 
V
L
 
L
Y
 
L
D
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
R
E
 
E
N
 
H
L
 
L
E
 
M
F
 
L
V
 
F
A
 
A
Q
 
S
I
 
I
Y
 
K
G
 
A
-
 
P
-
 
W
L
 
W
N
 
T
R
 
T
R
 
K
Q
 
E
T
 
L
K
 
Q
A
 
Q
R
 
Q
L
 
V
A
 
N
E
 
K
L
 
T
L
 
L
S
 
D
L
 
E
Y
 
V
D
 
E
L
 
L
A
 
T
G
 
Q
R
 
H
E
 
Q
K
 
H
Q
 
K
M
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
V
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
K
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
I
A
 
A
T
 
F
L
 
M
H
 
G
H
 
M
P
 
S
E
 
K
L
 
T
L
 
V
F
 
V
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
S
S
 
S
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
C
N
 
S
R
 
R
R
 
R
E
 
S
F
 
L
W
 
W
E
 
D
R
 
I
L
 
L
F
 
L
D
 
K
L
 
Y
C
 
-
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
I
L
 
I
V
 
F
S
 
T
T
|
T
H
 
H
Y
 
H
M
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
M
C
 
L
H
 
S
G
 
D
-
 
H
L
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
L
E
 
Q
R
 
Q
G
 
G
I
 
R
K
 
L
R
 
R
A
 
C
D
 
Y
G
 
A
S
 
P
P
 
P
Q
 
A
Q
 
D
L
 
L
M
 
K
A
 
E
A
 
T
M
 
Y
G
 
G
A
 
-
R
 
-
V
 
-
V
 
-
E
 
-
V
 
-
S
 
-
G
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
Q
K
 
G
L
 
L
K
 
T
Q
 
L
S
 
T
L
 
L
I
 
S
S
 
K
D
 
Q
A
 
P
N
 
S
V
 
I
L
 
L
S
 
E
A
 
T
A
 
Q
Q
 
E
I
 
P
G
 
K
S
 
D
R
 
V
L
 
A
R
 
R
V
 
V
L
 
T
V
 
S
Q
 
L
S
 
I
S
 
Q
I
 
I
A
 
Y
D
 
I
P
 
P
L
 
Q
A
 
A
W
 
F
L
 
L
S
 
K
P
 
D
R
 
S
V
 
C
A
 
G
G
 
G
R
 
E
A
 
-
L
 
L
T
 
T
E
 
Y
V
 
T
R
 
I
P
 
P
S
 
-
L
 
-
E
 
K
D
 
D
V
 
A
F
 
D
V
 
R
T
 
T
C
 
C
T
 
F
G
 
K
G
 
G
R
 
L
A
 
C
Q
 
Q
L
 
A
T
 
L
P
 
D
P
 
Q
N
 
N

Sites not aligning to the query:

7lkzA Structure of atp-bound human abca4 (see paper)
34% identity, 67% coverage: 43:275/346 of query aligns to 725:954/1920 of 7lkzA

query
sites
7lkzA
A
|
A
V
 
V
E
 
D
D
 
R
L
 
L
D
 
N
L
 
I
A
 
T
I
 
F
P
 
Y
K
 
E
G
 
N
T
 
Q
I
 
I
Y
 
T
G
 
A
F
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
C
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
 
T
S
 
T
I
 
L
R
 
S
M
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
D
 
T
I
 
V
R
 
L
V
 
V
L
 
G
G
 
G
E
 
R
T
 
D
L
 
I
P
 
E
G
 
T
A
 
S
E
 
L
E
 
D
K
 
A
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
R
 
S
I
 
L
G
 
G
Y
 
M
M
 
C
T
 
P
Q
|
Q
K
 
H
F
 
N
S
 
I
L
 
L
Y
 
F
D
 
H
N
 
H
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
H
L
 
M
E
 
L
F
 
F
V
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
I
 
L
Y
 
K
G
 
G
L
 
K
N
 
S
R
 
Q
R
 
E
Q
 
E
T
 
A
K
 
Q
A
 
L
R
 
E
L
 
M
A
 
E
E
 
A
L
 
M
L
 
L
S
 
E
L
 
D
Y
 
T
D
 
G
L
 
L
A
 
H
G
 
H
R
x
K
E
 
R
K
 
N
Q
 
E
M
 
E
A
 
A
G
 
Q
S
x
D
M
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
I
A
 
A
T
 
F
L
 
V
H
 
G
H
 
D
P
 
A
E
 
K
L
 
V
L
 
V
F
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
Y
N
 
S
R
 
R
R
 
R
E
 
S
F
 
I
W
 
W
E
 
D
R
 
L
L
 
L
F
 
L
D
 
K
L
 
Y
C
 
-
A
 
R
Q
 
S
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
I
L
 
I
V
 
M
S
 
S
T
 
T
H
 
H
Y
 
H
M
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
D
R
 
L
C
 
L
-
 
G
H
 
D
G
 
R
L
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
I
E
 
A
R
 
Q
G
 
G
I
 
R
K
 
L
R
 
Y
A
 
C
D
 
S
G
 
G
S
 
T
P
 
P
Q
 
L
Q
 
F
L
 
L
M
 
K
A
 
N
A
 
C
M
 
F
G
 
G
A
 
T
R
 
G
V
 
L
V
 
Y
E
 
L
V
 
T
S
 
L
G
 
-
E
 
-
D
 
-
L
 
V
R
 
R
K
 
K
L
 
M
K
 
K
Q
 
Q
S
 
V
L
 
L
I
 
D
S
 
G
D
 
D
A
 
V
N
 
N
V
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7roqA Alternative structure of human abca1
37% identity, 60% coverage: 44:250/346 of query aligns to 787:993/1831 of 7roqA

query
sites
7roqA
V
 
V
E
 
D
D
 
G
L
 
L
D
 
A
L
 
L
A
 
N
I
 
F
P
 
Y
K
 
E
G
 
G
T
 
Q
I
 
I
Y
 
T
G
 
S
F
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
S
 
T
I
 
M
R
 
S
M
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
D
 
T
I
 
A
R
 
Y
V
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
K
T
 
D
L
 
I
P
 
R
G
 
S
A
 
E
E
 
M
E
 
S
K
 
T
L
 
I
R
 
R
R
 
Q
R
 
N
I
 
L
G
 
G
Y
 
V
M
 
C
T
 
P
Q
 
Q
K
 
H
F
 
N
S
 
V
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
N
 
M
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
H
L
 
I
E
 
W
F
 
F
V
 
Y
A
 
A
Q
 
R
I
 
L
Y
 
K
G
 
G
L
 
L
N
 
S
R
 
E
R
 
K
Q
 
H
T
 
V
K
 
K
A
 
A
R
 
E
L
 
M
A
 
E
E
 
Q
L
 
M
L
 
A
S
 
L
L
 
D
Y
 
V
D
 
G
L
 
L
A
 
S
G
 
S
R
 
K
E
 
L
K
 
K
Q
 
S
M
 
K
A
 
T
G
 
S
S
 
Q
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
A
T
 
F
L
 
V
H
 
G
H
 
G
P
 
S
E
 
K
L
 
V
L
 
V
F
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
Y
N
 
S
R
 
R
R
 
R
E
 
G
F
 
I
W
 
W
E
 
E
R
 
L
L
 
L
F
 
L
D
 
K
L
 
Y
C
 
-
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
I
L
 
I
V
 
L
S
 
S
T
 
T
H
 
H
Y
 
H
M
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
D
R
 
V
C
 
L
-
 
G
H
 
D
G
 
R
L
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
I
E
 
S
R
 
H
G
 
G
I
 
K
K
 
L
R
 
C
A
 
C
D
 
V
G
 
G
S
 
S
P
 
S
Q
 
L
Q
 
F
L
 
L
M
 
K
A
 
N
A
 
Q
M
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8ee6A Cryo-em structure of human abca7 in pe/ch nanodiscs (see paper)
34% identity, 64% coverage: 32:251/346 of query aligns to 1501:1723/1808 of 8ee6A

query
sites
8ee6A
R
 
R
G
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
V
F
x
Y
G
 
R
G
 
G
-
 
Q
-
 
R
I
 
M
N
 
P
A
|
A
V
 
V
E
 
D
D
 
R
L
 
L
D
 
C
L
 
L
A
 
G
I
 
I
P
 
P
K
 
P
G
 
G
T
 
E
I
 
C
Y
 
F
G
 
G
F
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
V
N
 
N
G
|
G
C
x
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
 
S
S
 
T
I
 
F
R
 
R
M
 
M
L
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
D
L
 
T
S
 
L
P
 
A
T
 
S
S
 
R
G
 
G
D
 
E
I
 
A
R
 
V
V
 
L
L
 
A
G
 
G
E
 
H
T
 
S
L
 
V
P
 
A
G
 
R
A
 
E
E
 
P
E
 
S
K
 
A
L
 
A
R
 
H
R
 
L
R
 
S
I
 
M
G
 
G
Y
 
Y
M
 
C
T
 
P
Q
 
Q
K
 
S
F
 
D
S
 
A
L
 
I
Y
 
F
D
 
E
N
 
L
L
 
L
S
 
T
V
 
G
R
 
R
E
 
E
N
 
H
L
 
L
E
 
E
F
 
L
V
 
L
A
 
A
Q
 
R
I
 
L
Y
 
R
G
 
G
L
 
V
N
 
P
R
 
E
R
 
A
Q
 
Q
T
 
V
K
 
A
A
 
Q
R
 
T
L
 
A
A
 
G
E
 
S
L
 
G
L
 
L
S
 
A
L
 
R
Y
 
L
D
 
G
L
 
L
A
 
S
G
 
W
R
 
Y
E
 
A
K
 
D
Q
 
R
M
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
T
M
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
N
K
 
K
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
T
A
 
A
A
 
L
A
 
A
T
 
L
L
 
V
H
 
G
H
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
V
L
 
V
F
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
T
A
 
G
V
 
M
D
 
D
P
 
P
E
 
S
N
 
A
R
 
R
R
 
R
E
 
F
F
 
L
W
 
W
E
 
N
R
 
S
L
 
L
F
 
L
D
 
A
L
 
V
C
 
V
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
T
 
R
T
 
S
I
 
V
L
 
M
V
 
L
S
 
T
T
 
S
H
 
H
Y
 
S
M
 
M
D
 
E
E
 
E
A
 
C
E
 
E
R
 
A
-
 
L
C
 
C
H
 
S
G
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
L
 
M
E
 
V
R
 
N
G
 
G
I
 
R
K
 
F
R
 
R
A
 
C
D
 
L
G
 
G
S
 
S
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
H
L
 
L
M
 
K
A
 
G
A
 
R
M
 
F
G
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

E9Q876 Glucosylceramide transporter ABCA12; ATP-binding cassette sub-family A member 12; EC 7.6.2.1 from Mus musculus (Mouse) (see 2 papers)
30% identity, 89% coverage: 4:312/346 of query aligns to 1316:1636/2595 of E9Q876

query
sites
E9Q876
Q
 
Q
Q
 
N
A
 
T
T
 
N
A
 
P
G
 
S
I
 
A
S
 
S
V
 
K
A
 
T
G
 
S
T
 
P
S
 
D
A
 
C
A
 
A
E
 
F
T
 
P
S
 
S
S
 
N
A
 
I
T
 
E
P
 
P
E
 
E
-
 
P
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
Q
F
 
V
A
 
G
I
 
V
E
 
A
T
 
L
R
 
H
G
 
G
M
 
V
T
 
T
R
 
K
A
 
I
F
 
Y
G
 
G
G
 
S
I
 
K
N
 
T
A
 
A
V
 
V
E
 
E
D
 
N
L
 
L
D
 
N
L
 
L
A
 
N
I
 
F
P
 
Y
K
 
E
G
 
G
T
 
H
I
 
I
Y
 
T
G
 
S
F
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
S
 
T
I
|
I
R
x
S
M
|
M
L
|
L
T
|
T
G
|
G
L
|
L
L
x
F
S
x
G
P
x
A
T
|
T
S
x
A
G
|
G
D
x
T
I
|
I
R
x
F
V
|
V
L
x
Y
G
|
G
E
x
K
T
x
D
L
x
I
P
x
K
G
x
T
A
x
D
E
x
L
E
x
N
K
x
T
L
x
V
R
|
R
R
x
K
R
x
N
I
x
M
G
|
G
Y
x
V
M
x
C
T
x
M
Q
|
Q
K
x
H
F
x
D
S
x
V
L
|
L
Y
x
F
D
x
S
N
x
Y
L
|
L
S
x
T
V
x
T
R
x
K
E
|
E
N
x
H
L
|
L
E
x
L
F
x
L
V
x
Y
A
x
G
Q
x
S
I
|
I
Y
x
K
-
x
V
-
x
P
G
x
H
L
x
W
N
x
T
R
x
K
R
x
T
Q
|
Q
T
x
L
K
x
H
A
x
E
R
x
E
L
x
V
A
x
K
E
x
R
L
 
T
L
 
L
S
 
K
L
 
D
Y
 
T
D
 
G
L
 
L
A
 
Y
G
 
S
R
 
H
E
 
R
K
 
H
Q
 
K
M
 
R
A
 
V
G
 
G
S
 
T
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
K
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
S
L
 
I
A
 
S
A
 
I
A
 
A
T
 
L
L
 
I
H
 
G
H
 
G
P
 
S
E
 
R
L
 
V
L
 
V
F
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
S
S
 
T
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
C
N
 
S
R
 
R
R
 
R
E
 
S
F
 
I
W
 
W
E
 
D
R
 
-
L
 
V
F
 
I
D
 
S
L
 
K
C
 
N
A
 
K
Q
 
T
G
 
A
T
 
R
T
 
T
I
 
I
L
 
I
V
 
L
S
 
S
T
 
T
H
 
H
Y
 
H
M
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
E
R
 
V
C
 
L
H
 
S
G
 
D
-
 
R
L
 
I
A
 
A
I
 
F
L
 
L
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
I
 
G
K
 
L
R
 
R
A
 
C
D
 
C
G
 
G
S
 
S
P
 
P
Q
 
F
Q
 
Y
L
 
L
M
 
K
A
 
E
A
 
A
M
 
F
G
 
G
-
 
D
A
 
G
R
 
Y
V
 
H
V
 
L
E
 
T
V
 
L
S
 
T
G
 
K
E
 
K
D
 
K
L
 
S
R
 
P
K
 
N
L
 
L
K
 
D
Q
 
T
S
 
N
L
 
A
I
 
I
S
 
C
D
 
D
A
 
-
N
 
T
V
 
V
L
 
A
S
 
V
A
 
T
A
 
A
Q
 
M
I
 
I
G
 
Q
S
 
S
R
 
H
L
 
L
-
 
P
R
 
E
V
 
A
L
 
Y
V
 
L
Q
 
K
S
 
E
S
 
D
I
 
I
A
 
G
D
 
G
P
 
E
L
 
L
A
 
V
W
 
Y
L
 
V
S
 
L
P
 
P
-
 
P
-
 
F
-
 
S
-
 
T
R
 
K
V
 
V
A
 
S
G
 
G
R
 
A
A
 
Y
L
 
L
T
 
S
E
 
L
V
 
L
R
 
R

Sites not aligning to the query:

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
37% identity, 60% coverage: 29:234/346 of query aligns to 2:217/343 of P30750

query
sites
P30750
I
 
I
E
 
K
T
 
L
R
 
S
G
 
N
M
 
I
T
 
T
R
 
K
A
 
V
F
 
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
I
 
I
N
 
Q
A
 
A
V
 
L
E
 
N
D
 
N
L
 
V
D
 
S
L
 
L
A
 
H
I
 
V
P
 
P
K
 
A
G
 
G
T
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
F
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
C
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
S
 
L
I
 
I
R
 
R
M
 
C
L
 
V
T
 
N
G
 
L
L
 
L
L
 
E
S
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
V
R
 
L
V
 
V
L
 
D
G
 
G
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
P
 
T
G
 
T
A
 
L
E
 
S
E
 
E
-
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
T
K
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
Y
 
M
M
 
I
T
 
F
Q
 
Q
K
 
H
F
 
F
S
 
N
L
 
L
Y
 
L
D
 
S
N
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
E
 
A
F
 
L
V
 
P
A
 
L
Q
 
E
I
 
L
Y
 
D
G
 
N
L
 
T
N
 
P
R
 
K
R
 
D
Q
 
E
T
 
V
K
 
K
A
 
R
R
 
R
L
 
V
A
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
S
L
 
L
Y
 
V
D
 
G
L
 
L
A
 
G
G
 
D
R
 
K
E
 
H
K
 
D
Q
 
S
M
 
Y
A
 
P
G
 
S
S
 
N
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
R
A
 
A
T
 
L
L
 
A
H
 
S
H
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
L
 
L
F
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
V
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
N
 
T
R
 
T
R
 
R
E
 
S
F
 
I
W
 
L
E
 
E
R
 
L
L
 
L
F
 
K
D
 
D
L
 
I
C
 
N
A
 
R
Q
 
R
-
 
L
G
 
G
T
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
V
 
L
S
 
I
T
 
T
H
 
H
Y
 
E
M
 
M
D
 
D
E
 
V
A
 
V
E
 
K
R
 
R
-
 
I
C
 
C
H
 
D
G
 
C
L
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
I
E
 
S
R
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

8eopA Cryo-em structure of nanodisc reconstituted human abca7 eq mutant in atp bound closed state (see paper)
34% identity, 62% coverage: 32:245/346 of query aligns to 1455:1671/1687 of 8eopA

query
sites
8eopA
R
 
R
G
 
N
M
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
V
F
x
Y
G
 
R
G
 
G
-
 
Q
-
 
R
I
 
M
N
 
P
A
 
A
V
 
V
E
 
D
D
 
R
L
 
L
D
 
C
L
 
L
A
 
G
I
 
I
P
 
P
K
 
P
G
 
G
T
 
E
I
 
C
Y
 
F
G
 
G
F
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
V
N
|
N
G
|
G
C
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
x
S
S
 
T
I
 
F
R
 
R
M
 
M
L
 
V
T
 
T
G
 
G
L
 
D
L
 
T
S
 
L
P
 
A
T
 
S
S
 
R
G
 
G
D
 
E
I
 
A
R
 
V
V
 
L
L
 
A
G
 
G
E
 
H
T
 
S
L
 
V
P
 
A
G
 
R
A
 
E
E
 
P
E
 
S
K
 
A
L
 
A
R
 
H
R
 
L
R
 
S
I
 
M
G
 
G
Y
 
Y
M
 
C
T
 
P
Q
|
Q
K
 
S
F
 
D
S
 
A
L
 
I
Y
 
F
D
 
E
N
 
L
L
 
L
S
 
T
V
 
G
R
 
R
E
 
E
N
 
H
L
 
L
E
 
E
F
 
L
V
 
L
A
 
A
Q
 
R
I
 
L
Y
 
R
G
 
G
L
 
V
N
 
P
R
 
E
R
 
A
Q
 
Q
T
 
V
K
 
A
A
 
Q
R
 
T
L
 
A
A
 
G
E
 
S
L
 
G
L
 
L
S
 
A
L
 
R
Y
 
L
D
 
G
L
 
L
A
 
S
G
 
W
R
 
Y
E
 
A
K
 
D
Q
 
R
M
 
P
A
 
A
G
 
G
S
x
T
M
 
Y
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
N
K
 
K
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
A
L
 
T
A
 
A
A
 
L
A
 
A
T
 
L
L
 
V
H
 
G
H
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
V
L
 
V
F
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
T
A
 
G
V
 
M
D
 
D
P
 
P
E
 
S
N
 
A
R
 
R
R
 
R
E
 
F
F
 
L
W
 
W
E
 
N
R
 
S
L
 
L
F
 
L
D
 
A
L
 
V
C
 
V
A
 
R
Q
 
E
G
 
G
T
 
R
T
 
S
I
 
V
L
 
M
V
 
L
S
 
T
T
 
S
H
 
H
Y
 
S
M
 
M
D
 
E
E
 
E
A
 
C
E
 
E
R
 
A
-
 
L
C
 
C
H
 
S
G
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
L
 
M
E
 
V
R
 
N
G
 
G
I
 
R
K
 
F
R
 
R
A
 
C
D
 
L
G
 
G
S
 
S
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
H
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Q8R420 Phospholipid-transporting ATPase ABCA3; ATP-binding cassette sub-family A member 3; Xenobiotic-transporting ATPase ABCA3; EC 7.6.2.1; EC 7.6.2.2 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
36% identity, 60% coverage: 43:251/346 of query aligns to 1398:1607/1704 of Q8R420

query
sites
Q8R420
A
 
A
V
 
V
E
 
D
D
 
R
L
 
I
D
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
V
P
 
Q
K
 
K
G
 
G
T
 
E
I
 
C
Y
 
F
G
 
G
F
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
F
N
 
N
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
S
 
T
I
 
F
R
 
K
M
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
E
L
 
E
S
 
T
P
 
I
T
 
T
S
 
S
G
 
G
D
 
D
I
 
A
R
 
F
V
 
V
L
 
G
G
 
G
E
 
Y
T
 
S
L
 
I
P
 
S
G
 
S
A
 
D
E
 
I
E
 
G
K
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
R
 
R
I
 
M
G
 
G
Y
 
Y
M
 
C
T
 
P
Q
 
Q
K
 
F
F
 
D
S
 
A
L
 
L
Y
 
L
D
 
D
N
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
G
R
 
R
E
 
E
N
 
M
L
 
L
E
 
V
F
 
M
V
 
Y
A
 
A
Q
 
R
I
 
L
Y
 
R
G
 
G
L
 
I
N
 
P
R
 
E
R
 
R
Q
 
L
T
 
I
K
 
N
A
 
A
R
 
C
L
 
V
A
 
E
E
 
N
L
 
T
L
 
L
S
 
R
L
 
G
Y
 
L
D
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
P
R
 
H
E
 
A
K
 
N
Q
 
K
M
 
L
A
 
V
G
 
K
S
 
T
M
 
Y
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
N
K
 
K
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
S
L
 
T
A
 
G
A
 
I
A
 
A
T
 
L
L
 
I
H
 
G
H
 
E
P
 
P
E
 
A
L
 
V
L
 
I
F
 
F
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
S
S
 
T
A
 
G
V
 
M
D
 
D
P
 
P
E
 
V
N
 
A
R
 
R
R
 
R
E
 
L
F
 
L
W
 
W
E
 
D
R
 
T
L
 
V
F
 
A
D
 
R
L
 
A
C
 
R
A
 
E
Q
 
S
G
 
G
T
 
K
T
 
A
I
 
I
L
 
V
V
 
I
S
 
T
T
 
S
H
 
H
Y
 
S
M
 
M
D
 
E
E
 
E
A
 
C
E
 
E
R
 
A
-
 
L
C
 
C
H
 
T
G
 
R
L
 
L
A
 
A
I
 
I
L
 
M
E
 
V
R
 
Q
G
 
G
I
 
Q
K
 
F
R
 
K
A
 
C
D
 
L
G
 
G
S
 
S
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
H
L
 
L
M
 
K
A
 
S
A
 
K
M
 
F
G
 
G
A
 
S

Sites not aligning to the query:

O95477 Phospholipid-transporting ATPase ABCA1; ATP-binding cassette sub-family A member 1; ATP-binding cassette transporter 1; ABC-1; ATP-binding cassette 1; Cholesterol efflux regulatory protein; EC 7.6.2.1 from Homo sapiens (Human) (see 35 papers)
37% identity, 60% coverage: 43:250/346 of query aligns to 915:1123/2261 of O95477

query
sites
O95477
A
 
A
V
 
V
E
x
D
D
 
G
L
 
L
D
 
A
L
 
L
A
 
N
I
 
F
P
 
Y
K
 
E
G
 
G
T
 
Q
I
 
I
Y
x
T
G
 
S
F
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
T
T
 
T
S
 
T
I
 
M
R
 
S
M
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
D
 
T
I
 
A
R
 
Y
V
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
K
T
 
D
L
 
I
P
 
R
G
 
S
A
 
E
E
 
M
E
 
S
K
 
T
L
 
I
R
 
R
R
 
Q
R
 
N
I
 
L
G
 
G
Y
 
V
M
 
C
T
 
P
Q
 
Q
K
 
H
F
 
N
S
 
V
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
N
 
M
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
H
L
 
I
E
 
W
F
 
F
V
 
Y
A
 
A
Q
 
R
I
 
L
Y
 
K
G
 
G
L
 
L
N
 
S
R
 
E
R
 
K
Q
 
H
T
 
V
K
 
K
A
 
A
R
 
E
L
 
M
A
 
E
E
 
Q
L
 
M
-
 
A
L
 
L
S
 
D
L
 
V
Y
 
G
D
 
L
L
 
P
A
 
S
G
 
S
R
 
K
E
 
L
K
 
K
Q
 
S
M
 
K
A
 
T
G
 
S
S
 
Q
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
A
x
S
L
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
A
T
 
F
L
 
V
H
 
G
H
 
G
P
 
S
E
 
K
L
 
V
L
 
V
F
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
|
P
E
 
Y
N
 
S
R
 
R
R
 
R
E
 
G
F
 
I
W
 
W
E
 
E
R
 
L
L
 
L
F
 
L
D
 
K
L
 
Y
C
 
-
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
I
L
 
I
V
 
L
S
 
S
T
 
T
H
 
H
Y
 
H
M
|
M
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
D
R
 
V
C
 
L
-
 
G
H
 
D
G
 
R
L
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
I
E
 
S
R
 
H
G
 
G
I
 
K
K
 
L
R
x
C
A
x
C
D
 
V
G
 
G
S
 
S
P
 
S
Q
 
L
Q
 
F
L
 
L
M
 
K
A
 
N
A
 
Q
M
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

7tbwA The structure of atp-bound abca1 (see paper)
31% identity, 80% coverage: 43:320/346 of query aligns to 770:1044/1928 of 7tbwA

query
sites
7tbwA
A
 
A
V
 
V
E
 
D
D
 
G
L
 
L
D
 
A
L
 
L
A
 
N
I
 
F
P
 
Y
K
 
E
G
 
G
T
 
Q
I
 
I
Y
 
T
G
 
S
F
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
C
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
 
T
S
 
T
I
 
M
R
 
S
M
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
D
 
T
I
 
A
R
 
Y
V
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
K
T
 
D
L
 
I
P
 
R
G
 
S
A
 
E
E
 
M
E
 
S
K
 
T
L
 
I
R
 
R
R
 
Q
R
 
N
I
 
L
G
 
G
Y
 
V
M
 
C
T
 
P
Q
|
Q
K
 
H
F
 
N
S
 
V
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
N
 
M
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
H
L
 
I
E
 
W
F
 
F
V
 
Y
A
 
A
Q
 
R
I
 
L
Y
 
K
G
 
G
L
 
L
N
 
S
R
 
E
R
 
K
Q
 
H
T
 
V
K
 
K
A
 
A
R
 
E
L
 
M
A
 
E
E
 
Q
L
 
M
-
 
A
L
 
L
S
 
D
L
 
V
Y
 
G
D
 
L
L
 
P
A
 
S
G
 
S
R
 
K
E
 
L
K
 
K
Q
 
S
M
 
K
A
 
T
G
 
S
S
x
Q
M
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
A
T
 
F
L
 
V
H
 
G
H
 
G
P
 
S
E
 
K
L
 
V
L
 
V
F
 
I
L
 
L
D
|
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
Y
N
 
S
R
 
R
R
 
R
E
 
G
F
 
I
W
 
W
E
 
E
R
 
L
L
 
L
F
 
L
D
 
K
L
 
Y
C
 
-
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
I
L
 
I
V
 
L
S
 
S
T
 
T
H
|
H
Y
 
H
M
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
D
R
 
V
C
 
L
-
 
G
H
 
D
G
 
R
L
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
I
E
 
S
R
 
H
G
 
G
I
 
K
K
 
L
R
 
C
A
 
C
D
 
V
G
 
G
S
 
S
P
 
S
Q
 
L
Q
 
F
L
 
L
M
 
K
A
 
N
A
 
Q
M
 
L
G
 
G
A
 
T
-
 
G
R
 
Y
V
 
Y
V
 
L
E
 
T
V
 
L
S
 
V
G
 
K
E
 
S
D
 
A
L
 
I
R
 
S
K
 
N
L
 
L
K
 
I
Q
 
R
S
 
K
L
 
H
I
 
V
S
 
S
D
 
E
A
 
A
N
 
R
V
 
L
L
 
V
S
 
E
A
 
-
A
 
-
Q
 
D
I
 
I
G
 
G
S
 
H
R
 
E
L
 
L
R
 
-
V
 
T
L
 
Y
V
 
V
Q
 
L
S
 
P
S
 
A
I
 
F
A
 
V
D
 
E
P
 
L
L
 
F
A
 
H
W
 
E
L
 
I
S
 
D
P
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
S
G
 
S
R
 
Y
A
 
G
L
 
I
T
 
S
E
 
E
V
 
T
R
 
-
P
 
-
S
 
T
L
 
L
E
 
E
D
 
E
V
 
I
F
 
F
V
 
L

Sites not aligning to the query:

P41233 Phospholipid-transporting ATPase ABCA1; ATP-binding cassette sub-family A member 1; ATP-binding cassette transporter 1; ABC-1; ATP-binding cassette 1; EC 7.6.2.1 from Mus musculus (Mouse) (see paper)
38% identity, 52% coverage: 43:223/346 of query aligns to 915:1095/2261 of P41233

query
sites
P41233
A
 
A
V
 
V
E
 
D
D
 
G
L
 
L
D
 
A
L
 
L
A
 
N
I
 
F
P
 
Y
K
 
E
G
 
G
T
 
Q
I
 
I
Y
 
T
G
 
S
F
 
F
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
C
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
S
 
T
I
 
M
R
 
S
M
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
D
 
T
I
 
A
R
 
Y
V
 
I
L
 
L
G
 
G
E
 
K
T
 
D
L
 
I
P
 
R
G
 
S
A
 
E
E
 
M
E
 
S
K
 
S
L
 
I
R
 
R
R
 
Q
R
 
N
I
 
L
G
 
G
Y
 
V
M
 
C
T
 
P
Q
 
Q
K
 
H
F
 
N
S
 
V
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
N
 
M
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
E
E
 
E
N
 
H
L
 
I
E
 
W
F
 
F
V
 
Y
A
 
A
Q
 
R
I
 
L
Y
 
K
G
 
G
L
 
L
N
 
S
R
 
E
R
 
K
Q
 
H
T
 
V
K
 
K
A
 
A
R
 
E
L
 
M
A
 
E
E
 
Q
L
 
M
-
 
A
L
 
L
S
 
D
L
 
V
Y
 
G
D
 
L
L
 
P
A
 
P
G
 
S
R
 
K
E
 
L
K
 
K
Q
 
S
M
 
K
A
 
T
G
 
S
S
 
Q
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
Q
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
S
L
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
A
T
 
F
L
 
V
H
 
G
H
 
G
P
 
S
E
 
K
L
 
V
L
 
V
F
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
A
A
 
G
V
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
Y
N
 
S
R
 
R
R
 
R
E
 
G
F
 
I
W
 
W
E
 
E
R
 
L
L
 
L
F
 
L
D
 
K
L
 
Y
C
 
-
A
 
R
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
T
 
T
I
 
I
L
 
I
V
 
L
S
 
S
T
 
T
H
 
H
Y
 
H
M
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
D

Sites not aligning to the query:

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
37% identity, 60% coverage: 29:234/346 of query aligns to 3:218/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
I
 
I
E
 
K
T
 
L
R
 
S
G
 
N
M
 
I
T
 
T
R
 
K
A
 
V
F
|
F
G
 
H
-
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
I
|
I
N
 
Q
A
 
A
V
 
L
E
 
N
D
 
N
L
 
V
D
 
S
L
 
L
A
 
H
I
 
V
P
 
P
K
 
A
G
 
G
T
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
F
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
C
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
S
 
L
I
 
I
R
 
R
M
 
C
L
 
V
T
 
N
G
 
L
L
 
L
L
 
E
S
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
V
R
 
L
V
 
V
L
 
D
G
 
G
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
P
 
T
G
 
T
A
 
L
E
 
S
E
 
E
-
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
T
K
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
Y
 
M
M
 
I
T
 
F
Q
 
Q
K
 
H
F
 
F
S
 
N
L
 
L
Y
 
L
D
 
S
N
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
E
 
A
F
 
L
V
 
P
A
 
L
Q
 
E
I
 
L
Y
 
D
G
 
N
L
 
T
N
 
P
R
 
K
R
 
D
Q
 
E
T
 
V
K
 
K
A
 
R
R
 
R
L
 
V
A
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
S
L
 
L
Y
 
V
D
 
G
L
 
L
A
 
G
G
 
D
R
 
K
E
 
H
K
 
D
Q
 
S
M
 
Y
A
 
P
G
 
S
S
x
N
M
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
R
A
 
A
T
 
L
L
 
A
H
 
S
H
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
L
 
L
F
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
V
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
N
 
T
R
 
T
R
 
R
E
 
S
F
 
I
W
 
L
E
 
E
R
 
L
L
 
L
F
 
K
D
 
D
L
 
I
C
 
N
A
 
R
Q
 
R
-
 
L
G
 
G
T
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
V
 
L
S
 
I
T
 
T
H
|
H
Y
 
E
M
 
M
D
 
D
E
 
V
A
 
V
E
 
K
R
 
R
-
 
I
C
 
C
H
 
D
G
 
C
L
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
I
E
 
S
R
 
N
G
 
G

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
37% identity, 60% coverage: 29:234/346 of query aligns to 3:218/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
I
 
I
E
 
K
T
 
L
R
 
S
G
 
N
M
 
I
T
 
T
R
 
K
A
 
V
F
|
F
G
 
H
-
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
I
 
I
N
 
Q
A
 
A
V
 
L
E
 
N
D
 
N
L
 
V
D
 
S
L
 
L
A
 
H
I
 
V
P
 
P
K
 
A
G
 
G
T
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
F
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
C
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
S
 
L
I
 
I
R
 
R
M
 
C
L
 
V
T
 
N
G
 
L
L
 
L
L
 
E
S
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
V
R
 
L
V
 
V
L
 
D
G
 
G
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
P
 
T
G
 
T
A
 
L
E
 
S
E
 
E
-
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
T
K
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
Y
 
M
M
 
I
T
 
F
Q
 
Q
K
 
H
F
 
F
S
 
N
L
 
L
Y
 
L
D
 
S
N
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
E
 
A
F
 
L
V
 
P
A
 
L
Q
 
E
I
 
L
Y
 
D
G
 
N
L
 
T
N
 
P
R
 
K
R
 
D
Q
 
E
T
 
V
K
 
K
A
 
R
R
 
R
L
 
V
A
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
S
L
 
L
Y
 
V
D
 
G
L
 
L
A
 
G
G
 
D
R
 
K
E
 
H
K
 
D
Q
 
S
M
 
Y
A
 
P
G
 
S
S
 
N
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
R
A
 
A
T
 
L
L
 
A
H
 
S
H
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
L
 
L
F
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
V
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
N
 
T
R
 
T
R
 
R
E
 
S
F
 
I
W
 
L
E
 
E
R
 
L
L
 
L
F
 
K
D
 
D
L
 
I
C
 
N
A
 
R
Q
 
R
-
 
L
G
 
G
T
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
V
 
L
S
 
I
T
 
T
H
 
H
Y
 
E
M
 
M
D
 
D
E
 
V
A
 
V
E
 
K
R
 
R
-
 
I
C
 
C
H
 
D
G
 
C
L
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
I
E
 
S
R
 
N
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
37% identity, 60% coverage: 29:234/346 of query aligns to 3:218/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
I
 
I
E
 
K
T
 
L
R
 
S
G
 
N
M
 
I
T
 
T
R
 
K
A
 
V
F
|
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
I
 
I
N
 
Q
A
 
A
V
 
L
E
 
N
D
 
N
L
 
V
D
 
S
L
 
L
A
 
H
I
 
V
P
 
P
K
 
A
G
 
G
T
 
Q
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
F
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
C
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
S
 
L
I
 
I
R
 
R
M
 
C
L
 
V
T
 
N
G
 
L
L
 
L
L
 
E
S
 
R
P
 
P
T
 
T
S
 
E
G
 
G
D
 
S
I
 
V
R
 
L
V
 
V
L
 
D
G
 
G
E
 
Q
T
 
E
L
 
L
P
 
T
G
 
T
A
 
L
E
 
S
E
 
E
-
 
S
-
 
E
-
 
L
-
 
T
K
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
G
 
G
Y
 
M
M
 
I
T
 
F
Q
 
Q
K
 
H
F
 
F
S
 
N
L
 
L
Y
 
L
D
 
S
N
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
R
 
F
E
 
G
N
 
N
L
 
V
E
 
A
F
 
L
V
 
P
A
 
L
Q
 
E
I
 
L
Y
 
D
G
 
N
L
 
T
N
 
P
R
 
K
R
 
D
Q
 
E
T
 
V
K
 
K
A
 
R
R
 
R
L
 
V
A
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
L
S
 
S
L
 
L
Y
 
V
D
 
G
L
 
L
A
 
G
G
 
D
R
 
K
E
 
H
K
 
D
Q
 
S
M
 
Y
A
 
P
G
 
S
S
 
N
M
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
R
A
 
A
T
 
L
L
 
A
H
 
S
H
 
N
P
 
P
E
 
K
L
 
V
L
 
L
F
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
V
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
N
 
T
R
 
T
R
 
R
E
 
S
F
 
I
W
 
L
E
 
E
R
 
L
L
 
L
F
 
K
D
 
D
L
 
I
C
 
N
A
 
R
Q
 
R
-
 
L
G
 
G
T
 
L
T
 
T
I
 
I
L
 
L
V
 
L
S
 
I
T
 
T
H
 
H
Y
 
E
M
 
M
D
 
D
E
 
V
A
 
V
E
 
K
R
 
R
-
 
I
C
 
C
H
 
D
G
 
C
L
 
V
A
 
A
I
 
V
L
 
I
E
 
S
R
 
N
G
 
G

7w02A Cryo-em structure of atp-bound abca3 (see paper)
32% identity, 72% coverage: 29:278/346 of query aligns to 495:755/1566 of 7w02A

query
sites
7w02A
I
 
I
E
 
K
T
 
I
R
 
K
G
 
H
M
 
L
T
 
S
R
 
K
A
 
V
F
|
F
G
 
R
G
 
V
I
 
G
N
 
N
-
 
K
-
 
D
-
 
R
-
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
R
D
 
D
L
 
L
D
 
N
L
 
L
A
 
N
I
 
L
P
 
Y
K
 
E
G
 
G
T
 
Q
I
 
I
Y
 
T
G
 
V
F
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
H
N
|
N
G
|
G
C
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
S
 
T
I
 
L
R
 
S
M
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
P
P
 
P
T
 
T
S
 
S
G
 
G
D
 
R
I
 
A
R
 
Y
V
 
I
L
 
S
G
 
G
E
 
Y
T
 
E
L
 
I
P
 
S
G
 
Q
A
 
D
E
 
M
E
 
V
K
 
Q
L
 
I
R
 
R
R
 
K
R
 
S
I
 
L
G
 
G
Y
 
L
M
 
C
T
 
P
Q
|
Q
K
 
H
F
 
D
S
 
I
L
 
L
Y
 
F
D
 
D
N
 
N
L
 
L
S
 
T
V
 
V
R
 
A
E
 
E
N
 
H
L
 
L
E
 
Y
F
 
F
V
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
I
 
L
Y
 
K
G
 
G
L
 
L
N
 
S
R
 
R
R
 
Q
Q
 
K
T
 
C
K
 
P
A
 
E
R
 
E
L
 
V
A
 
K
E
 
Q
L
 
M
L
 
L
S
 
H
L
 
I
Y
 
I
D
 
G
L
 
L
A
 
E
G
 
D
R
 
K
E
 
W
K
 
N
Q
 
S
M
 
R
A
 
S
G
 
R
S
 
F
M
x
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
M
K
 
R
Q
 
R
R
 
K
L
 
L
A
 
S
L
 
I
A
 
G
A
 
I
A
 
A
T
 
L
L
 
I
H
 
A
H
 
G
P
 
S
E
 
K
L
 
V
L
 
L
F
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
G
V
 
M
D
 
D
P
 
A
E
 
I
N
 
S
R
 
R
R
 
R
E
 
A
F
 
I
W
 
W
E
 
D
R
 
-
L
 
L
F
 
L
D
 
Q
L
 
R
C
 
Q
A
 
K
Q
 
S
G
 
D
T
 
R
T
 
T
I
 
I
L
 
V
V
 
L
S
 
T
T
 
T
H
 
H
Y
 
F
M
 
M
D
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
D
R
 
L
C
 
L
-
 
G
H
 
D
G
 
R
L
 
I
A
 
A
I
 
I
L
 
M
E
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
E
K
 
L
R
 
Q
A
 
C
D
 
C
G
 
G
S
 
S
P
 
S
Q
 
L
Q
 
F
L
 
L
M
 
K
A
 
Q
A
 
K
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
H
-
 
M
-
 
T
-
 
L
-
 
V
R
 
K
V
 
E
V
 
P
E
 
H
V
 
C
S
 
N
G
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
I
R
 
S
K
 
Q
L
 
L
K
 
V
Q
 
H
S
 
H
L
 
H
I
 
V
S
 
P
D
 
N
A
 
A
N
 
T
V
 
L
L
 
E
S
 
S
A
 
S
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P78363 Retinal-specific phospholipid-transporting ATPase ABCA4; ATP-binding cassette sub-family A member 4; RIM ABC transporter; RIM proteinv; RmP; Retinal-specific ATP-binding cassette transporter; Stargardt disease protein; EC 7.6.2.1 from Homo sapiens (Human) (see 43 papers)
35% identity, 60% coverage: 43:250/346 of query aligns to 945:1152/2273 of P78363

query
sites
P78363
A
|
A