SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 7025668 Shewana3_2818 2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-carboxylate N-succinyltransferase (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 7 hits to proteins with known functional sites (download)

3tdtA Complex of tetrahydrodipicolinate n-succinyltransferase with 2-amino- 6-oxopimelate and coenzyme a (see paper)
82% identity, 100% coverage: 1:274/274 of query aligns to 1:274/274 of 3tdtA

query
sites
3tdtA
M
 
M
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
R
 
Q
Q
 
N
R
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
F
E
 
E
A
 
R
R
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
T
S
 
V
V
 
T
R
 
R
N
 
E
D
 
A
V
 
V
Q
 
N
N
 
Q
V
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
L
L
 
L
D
 
D
K
 
S
G
 
G
E
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
W
 
W
H
 
V
V
 
T
H
 
H
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
S
 
S
F
 
F
R
 
R
I
 
I
F
 
N
D
 
D
N
 
N
A
 
K
V
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
T
 
T
K
 
R
Y
 
Y
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
V
 
V
P
 
P
L
 
M
K
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
R
F
 
F
K
 
Q
A
 
K
E
 
E
A
 
G
I
 
F
R
|
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
P
A
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
G
 
G
S
 
A
F
 
F
I
 
I
G
 
A
K
 
R
N
 
N
T
 
T
V
 
V
L
 
L
M
|
M
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
T
M
|
M
V
 
V
D
|
D
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
S
C
 
C
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
V
 
V
H
 
H
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
V
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
G
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
D
N
 
N
C
 
C
F
|
F
I
 
I
G
|
G
A
|
A
R
 
R
S
 
S
E
|
E
I
 
V
V
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
|
S
M
|
M
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
R
|
R
E
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
V
|
V
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
L
P
 
P
S
 
S
A
 
K
C
 
D
G
 
G
K
 
S
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
A
 
C
A
 
A
I
 
V
I
 
I
V
|
V
K
|
K
K
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
K
|
K
T
|
T
R
 
R
G
 
G
K
|
K
V
 
V
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
E
L
 
L
L
|
L
R
 
R
I
 
T
V
 
I
D
 
D

2tdtA Complex of tetrahydrodipicolinate n-succinyltransferase with 2- aminopimelate and coenzyme a (see paper)
82% identity, 100% coverage: 1:274/274 of query aligns to 1:274/274 of 2tdtA

query
sites
2tdtA
M
 
M
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
R
 
Q
Q
 
N
R
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
F
E
 
E
A
 
R
R
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
T
S
 
V
V
 
T
R
 
R
N
 
E
D
 
A
V
 
V
Q
 
N
N
 
Q
V
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
L
L
 
L
D
 
D
K
 
S
G
 
G
E
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
W
 
W
H
 
V
V
 
T
H
 
H
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
S
 
S
F
 
F
R
 
R
I
 
I
F
 
N
D
 
D
N
 
N
A
 
K
V
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
T
 
T
K
 
R
Y
 
Y
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
V
 
V
P
 
P
L
 
M
K
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
R
F
 
F
K
 
Q
A
 
K
E
 
E
A
 
G
I
 
F
R
|
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
P
A
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
G
 
G
S
 
A
F
 
F
I
 
I
G
 
A
K
 
R
N
 
N
T
 
T
V
 
V
L
 
L
M
|
M
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
T
M
|
M
V
 
V
D
|
D
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
S
C
 
C
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
V
 
V
H
 
H
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
V
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
G
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
D
N
 
N
C
 
C
F
|
F
I
 
I
G
|
G
A
|
A
R
 
R
S
 
S
E
|
E
I
 
V
V
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
|
S
M
|
M
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
R
|
R
E
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
V
V
 
V
V
|
V
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
L
P
 
P
S
 
S
A
 
K
C
 
D
G
 
G
K
 
S
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
A
 
C
A
 
A
I
 
V
I
 
I
V
|
V
K
|
K
K
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
K
|
K
T
|
T
R
 
R
G
 
G
K
|
K
V
 
V
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
E
L
 
L
L
|
L
R
 
R
I
 
T
V
 
I
D
 
D

1kgtA Crystal structure of tetrahydrodipicolinate n-succinyltransferase in complex with pimelate and succinyl-coa (see paper)
82% identity, 100% coverage: 1:274/274 of query aligns to 1:274/274 of 1kgtA

query
sites
1kgtA
M
 
M
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
R
 
Q
Q
 
N
R
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
F
E
 
E
A
 
R
R
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
T
S
 
V
V
 
T
R
 
R
N
 
E
D
 
A
V
 
V
Q
 
N
N
 
Q
V
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
L
L
 
L
D
 
D
K
 
S
G
 
G
E
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
W
 
W
H
 
V
V
 
T
H
 
H
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
S
 
S
F
 
F
R
 
R
I
 
I
F
 
N
D
 
D
N
 
N
A
 
K
V
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
T
 
T
K
 
R
Y
 
Y
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
V
 
V
P
 
P
L
 
M
K
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
R
F
 
F
K
 
Q
A
 
K
E
 
E
A
 
G
I
 
F
R
|
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
P
A
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
G
 
G
S
 
A
F
 
F
I
 
I
G
 
A
K
 
R
N
 
N
T
 
T
V
 
V
L
 
L
M
|
M
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
T
M
|
M
V
 
V
D
|
D
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
S
C
 
C
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
V
 
V
H
 
H
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
V
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
G
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
D
N
 
N
C
 
C
F
|
F
I
 
I
G
|
G
A
|
A
R
|
R
S
 
S
E
|
E
I
 
V
V
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
|
S
M
|
M
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
R
|
R
E
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
|
V
V
 
V
V
|
V
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
L
P
 
P
S
 
S
A
 
K
C
 
D
G
 
G
K
 
S
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
A
 
C
A
 
A
I
 
V
I
 
I
V
|
V
K
|
K
K
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
K
|
K
T
|
T
R
 
R
G
 
G
K
|
K
V
 
V
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
E
L
 
L
L
|
L
R
 
R
I
 
T
V
 
I
D
 
D

1kgqA Crystal structure of tetrahydrodipicolinate n-succinyltransferase in complex with l-2-aminopimelate and succinamide-coa (see paper)
82% identity, 100% coverage: 1:274/274 of query aligns to 1:274/274 of 1kgqA

query
sites
1kgqA
M
 
M
E
 
Q
A
 
Q
L
 
L
R
 
Q
Q
 
N
R
 
V
I
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
F
E
 
E
A
 
R
R
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
T
P
 
P
S
 
A
T
 
N
V
 
V
D
 
D
A
 
T
S
 
V
V
 
T
R
 
R
N
 
E
D
 
A
V
 
V
Q
 
N
N
 
Q
V
 
V
I
 
I
N
 
G
M
 
L
L
 
L
D
 
D
K
 
S
G
 
G
E
 
A
L
 
L
R
 
R
V
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
K
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
W
 
W
H
 
V
V
 
T
H
 
H
Q
 
Q
W
 
W
L
 
L
K
 
K
K
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
S
 
S
F
 
F
R
 
R
I
 
I
F
 
N
D
 
D
N
 
N
A
 
K
V
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
A
 
A
E
 
E
T
 
T
K
 
R
Y
 
Y
F
 
Y
D
 
D
K
 
K
V
 
V
P
 
P
L
 
M
K
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
D
Y
 
Y
D
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
R
F
 
F
K
 
Q
A
 
K
E
 
E
A
 
G
I
 
F
R
|
R
V
 
V
V
 
V
P
 
P
S
 
P
A
 
A
T
 
T
V
 
V
R
 
R
K
 
Q
G
 
G
S
 
A
F
 
F
I
 
I
G
 
A
K
 
R
N
 
N
T
 
T
V
 
V
L
 
L
M
|
M
P
 
P
S
 
S
Y
 
Y
V
 
V
N
 
N
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
D
E
 
E
G
 
G
T
 
T
M
|
M
V
 
V
D
|
D
T
 
T
W
 
W
A
 
A
T
 
T
V
 
V
G
 
G
S
 
S
C
 
C
A
 
A
Q
 
Q
I
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
V
 
V
H
 
H
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
I
G
 
G
G
|
G
V
 
V
L
 
L
E
 
E
P
 
P
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
G
 
N
P
 
P
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
D
 
D
N
 
N
C
 
C
F
|
F
I
 
I
G
|
G
A
|
A
R
 
R
S
 
S
E
|
E
I
 
V
V
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
V
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
I
 
I
S
|
S
M
|
M
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
D
 
D
R
|
R
E
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
V
P
 
P
A
 
A
G
 
G
S
 
S
V
|
V
V
 
V
V
|
V
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
L
P
 
P
S
 
S
A
 
K
C
 
D
G
 
G
K
 
S
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
A
 
C
A
 
A
I
 
V
I
 
I
V
|
V
K
|
K
K
 
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
K
|
K
T
|
T
R
 
R
G
 
G
K
|
K
V
 
V
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
E
L
 
L
L
|
L
R
 
R
I
 
T
V
 
I
D
 
D

3r8yA Structure of the bacillus anthracis tetrahydropicolinate succinyltransferase
42% identity, 33% coverage: 104:194/274 of query aligns to 77:168/203 of 3r8yA

query
sites
3r8yA
R
 
R
V
 
I
V
 
E
P
 
P
S
 
G
A
 
A
T
 
I
V
 
I
R
 
R
K
 
D
G
 
H
S
 
V
F
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
D
N
 
N
T
 
A
V
 
V
-
 
I
L
 
M
M
 
M
P
 
N
S
 
A
Y
 
T
V
 
I
N
|
N
L
 
I
G
 
G
A
 
A
Y
 
V
V
 
I
D
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
S
M
 
M
V
 
I
D
|
D
T
 
M
W
 
N
A
 
A
T
 
V
V
 
L
G
|
G
S
x
G
C
 
R
A
 
A
Q
 
T
I
 
V
G
 
G
K
 
K
N
 
N
V
 
C
H
 
H
L
 
V
S
 
G
G
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
V
I
 
L
G
 
A
G
|
G
V
 
V
L
x
I
E
 
E
P
 
P
L
 
P
Q
 
S
A
 
A
G
 
K
P
 
P
T
 
V
I
 
I
I
 
V
E
 
E
D
 
D
N
 
D
C
 
V
F
 
V
I
 
I
G
 
G
A
 
A
R
 
N
S
 
V
E
x
V
I
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
G
V
 
V

8befy Cryo-em structure of the arabidopsis thaliana i+iii2 supercomplex (ci membrane core) (see paper)
30% identity, 54% coverage: 83:229/274 of query aligns to 49:186/265 of 8befy

query
sites
8befy
F
 
F
D
 
D
K
 
K
V
 
S
P
 
P
L
 
L
K
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
Y
 
V
D
 
D
E
 
K
A
 
D
R
 
V
F
 
F
K
 
V
A
 
A
E
 
P
A
 
S
I
 
A
R
 
S
V
 
V
V
 
I
P
 
G
S
 
D
A
 
V
T
 
Q
V
 
I
R
 
G
K
 
K
G
 
G
S
 
S
F
 
S
I
 
I
G
 
W
K
 
Y
N
 
G
T
 
C
V
 
V
L
 
L
M
 
R
P
 
G
S
 
D
Y
 
V
V
 
N
N
 
N
L
 
I
-
 
S
-
 
V
-
 
G
-
 
S
G
 
G
A
 
T
Y
 
N
V
 
I
D
x
Q
E
 
D
G
 
N
T
 
T
M
 
L
V
 
V
D
x
H
T
 
V
W
 
A
A
 
K
T
 
T
V
 
N
G
 
I
S
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
L
C
 
P
A
 
T
Q
 
L
I
 
I
G
 
G
K
 
D
N
 
N
V
 
V
H
x
T
L
 
V
S
 
G
G
 
H
G
 
S
V
 
A
G
 
V
I
 
I
G
x
H
G
 
G
V
 
C
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
T
 
-
I
 
T
I
 
V
E
 
E
D
 
D
N
 
D
C
 
A
F
|
F
I
 
V
G
|
G
A
x
M
R
 
G
S
 
A
E
 
T
I
 
L
V
 
L
E
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
E
 
K
G
 
H
S
 
A
V
 
M
I
 
V
S
x
A
M
x
A
G
 
G
V
 
S
Y
 
L
I
 
V
G
 
K
Q
 
Q
S
 
N
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Y
 
-
D
 
-
R
 
-
E
 
P
T
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
-
Y
 
W
G
 
G
R
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7aqqy Cryo-em structure of arabidopsis thaliana complex-i (membrane core) (see paper)
30% identity, 54% coverage: 83:229/274 of query aligns to 48:185/268 of 7aqqy

query
sites
7aqqy
F
 
F
D
 
D
K
 
K
V
 
S
P
 
P
L
 
L
K
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
Y
 
V
D
 
D
E
 
K
A
 
D
R
 
V
F
 
F
K
 
V
A
 
A
E
 
P
A
 
S
I
 
A
R
 
S
V
 
V
V
 
I
P
 
G
S
 
D
A
 
V
T
 
Q
V
 
I
R
 
G
K
 
K
G
 
G
S
 
S
F
 
S
I
 
I
G
 
W
K
 
Y
N
 
G
T
 
C
V
 
V
L
 
L
M
 
R
P
 
G
S
 
D
Y
 
V
V
 
N
N
 
N
L
 
I
-
 
S
-
 
V
-
 
G
-
 
S
G
 
G
A
 
T
Y
 
N
V
 
I
D
 
Q
E
 
D
G
 
N
T
 
T
M
 
L
V
 
V
D
x
H
T
 
V
W
 
A
A
 
K
T
 
T
V
 
N
G
 
I
S
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
V
-
 
L
C
 
P
A
 
T
Q
 
L
I
 
I
G
 
G
K
 
D
N
 
N
V
 
V
H
 
T
L
 
V
S
 
G
G
 
H
G
 
S
V
 
A
G
 
V
I
 
I
G
x
H
G
 
G
V
 
C
L
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
-
T
 
-
I
 
T
I
 
V
E
 
E
D
 
D
N
 
D
C
 
A
F
 
F
I
 
V
G
 
G
A
 
M
R
 
G
S
 
A
E
 
T
I
 
L
V
 
L
E
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
V
V
 
V
E
 
E
E
 
K
G
 
H
S
 
A
V
 
M
I
 
V
S
 
A
M
 
A
G
 
G
V
 
S
Y
 
L
I
 
V
G
 
K
Q
 
Q
S
 
N
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Y
 
-
D
 
-
R
 
-
E
 
P
T
 
S
G
 
G
E
 
E
I
 
V
H
 
-
Y
 
W
G
 
G
R
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>7025668 Shewana3_2818 2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-carboxylate N-succinyltransferase (RefSeq)
MEALRQRIEAAFEARADITPSTVDASVRNDVQNVINMLDKGELRVAEKIDGQWHVHQWLK
KAVLLSFRIFDNAVIDGAETKYFDKVPLKFAEYDEARFKAEAIRVVPSATVRKGSFIGKN
TVLMPSYVNLGAYVDEGTMVDTWATVGSCAQIGKNVHLSGGVGIGGVLEPLQAGPTIIED
NCFIGARSEIVEGVVVEEGSVISMGVYIGQSTRIYDRETGEIHYGRVPAGSVVVSGNLPS
ACGKYSLYAAIIVKKVDAKTRGKVGINELLRIVD

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory