SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 7025861 FitnessBrowser__ANA3:7025861 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ozwA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with ketoconazole (see paper)
28% identity, 65% coverage: 24:270/380 of query aligns to 148:397/403 of 3ozwA

query
sites
3ozwA
P
 
P
A
 
G
S
 
G
V
 
W
V
 
K
G
 
G
F
 
W
S
 
R
Q
 
T
L
 
F
V
 
V
C
 
I
V
 
R
E
 
E
R
 
K
W
 
R
N
 
P
E
 
E
T
 
S
A
 
D
D
 
V
V
 
I
V
 
T
S
 
S
F
 
F
R
 
I
F
 
L
Q
 
E
A
 
P
-
 
A
-
 
D
G
 
G
E
 
G
P
 
P
M
 
V
K
 
-
F
 
V
D
 
N
Y
 
F
K
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
M
 
T
T
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
I
E
 
D
I
 
V
N
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
Q
 
Q
A
 
Q
C
 
I
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
S
S
 
D
T
 
M
P
 
P
S
 
N
R
 
G
P
 
-
Y
 
R
S
 
S
L
 
Y
M
 
R
L
 
I
T
x
S
I
x
V
K
|
K
R
 
R
V
x
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
L
x
Y
V
|
V
S
|
S
N
 
N
Y
 
L
L
 
L
I
 
H
D
 
D
H
 
H
L
 
V
Q
 
N
P
 
V
G
 
G
Q
 
D
T
 
Q
V
 
V
R
 
K
V
 
L
L
 
A
P
 
A
P
 
P
T
 
Y
G
 
G
Q
 
S
F
 
F
N
 
H
L
 
I
F
 
-
D
 
D
I
 
V
P
 
D
A
 
A
K
 
K
-
 
T
K
 
P
Y
 
I
L
 
V
F
 
L
L
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
C
x
V
G
 
G
I
 
L
T
|
T
P
 
P
M
 
M
Y
 
V
S
 
S
M
 
M
S
 
L
R
 
K
Y
 
V
L
 
A
T
 
L
D
 
Q
S
 
A
Q
 
P
M
 
P
N
 
R
A
 
-
D
 
Q
I
 
V
A
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
S
 
G
A
 
A
R
 
R
T
 
N
Q
 
S
A
 
A
D
 
V
I
 
H
I
 
A
F
 
M
K
 
R
T
 
D
S
 
R
L
 
L
E
 
R
T
 
E
M
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
T
H
 
Y
R
 
E
D
 
N
F
 
L
K
 
D
L
 
L
-
 
F
-
 
V
-
 
F
-
 
Y
-
 
D
R
 
Q
Y
 
P
I
 
L
V
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
T
 
Q
A
 
G
D
 
R
T
 
D
A
 
Y
W
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
G
A
 
L
V
 
V
L
 
-
H
 
-
N
 
D
V
 
V
G
 
K
R
 
Q
L
 
I
R
 
E
P
 
K
D
 
S
N
 
I
L
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
D
F
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
A
T
 
D
V
 
Y
F
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
I
P
 
P
Y
 
F
M
 
M
Q
 
R
A
 
M
V
 
Q
K
 
H
T
 
D
I
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
N
L
 
L
N
 
G
F
 
I
D
 
H
M
 
E
T
 
A
Q
 
R
L
 
I
Y
 
H
H
 
Y
E
 
E
S
x
V
F
|
F
A
 
G

Sites not aligning to the query:

3ozvA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with econazole (see paper)
28% identity, 65% coverage: 24:270/380 of query aligns to 148:397/403 of 3ozvA

query
sites
3ozvA
P
 
P
A
 
G
S
 
G
V
 
W
V
 
K
G
 
G
F
 
W
S
 
R
Q
 
T
L
 
F
V
 
V
C
 
I
V
 
R
E
 
E
R
 
K
W
 
R
N
 
P
E
 
E
T
 
S
A
 
D
D
 
V
V
 
I
V
 
T
S
 
S
F
 
F
R
 
I
F
 
L
Q
 
E
A
 
P
-
 
A
-
 
D
G
 
G
E
 
G
P
 
P
M
 
V
K
 
-
F
 
V
D
 
N
Y
 
F
K
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
M
 
T
T
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
I
E
 
D
I
 
V
N
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
Q
 
Q
A
 
Q
C
 
I
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
S
S
 
D
T
 
M
P
 
P
S
 
N
R
 
G
P
 
-
Y
 
R
S
 
S
L
 
Y
M
 
R
L
 
I
T
x
S
I
x
V
K
|
K
R
 
R
V
x
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
L
x
Y
V
|
V
S
|
S
N
 
N
Y
 
L
L
 
L
I
 
H
D
 
D
H
 
H
L
 
V
Q
 
N
P
 
V
G
 
G
Q
 
D
T
 
Q
V
 
V
R
 
K
V
 
L
L
 
A
P
 
A
P
 
P
T
 
Y
G
 
G
Q
 
S
F
 
F
N
 
H
L
 
I
F
 
-
D
 
D
I
 
V
P
 
D
A
 
A
K
 
K
-
 
T
K
 
P
Y
 
I
L
 
V
F
 
L
L
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
C
x
V
G
 
G
I
 
L
T
|
T
P
 
P
M
 
M
Y
 
V
S
 
S
M
 
M
S
 
L
R
 
K
Y
 
V
L
 
A
T
 
L
D
 
Q
S
 
A
Q
 
P
M
 
P
N
 
R
A
 
-
D
 
Q
I
 
V
A
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
S
 
G
A
 
A
R
 
R
T
 
N
Q
 
S
A
 
A
D
 
V
I
 
H
I
 
A
F
 
M
K
 
R
T
 
D
S
 
R
L
 
L
E
 
R
T
 
E
M
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
T
H
 
Y
R
 
E
D
 
N
F
 
L
K
 
D
L
 
L
-
 
F
-
 
V
-
 
F
-
 
Y
-
 
D
R
 
Q
Y
 
P
I
 
L
V
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
T
 
Q
A
 
G
D
 
R
T
 
D
A
 
Y
W
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
G
A
 
L
V
 
V
L
 
-
H
 
-
N
 
D
V
 
V
G
 
K
R
 
Q
L
 
I
R
 
E
P
 
K
D
 
S
N
 
I
L
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
D
F
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
A
T
 
D
V
 
Y
F
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
I
P
 
P
Y
 
F
M
 
M
Q
 
R
A
 
M
V
 
Q
K
 
H
T
 
D
I
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
N
L
 
L
N
 
G
F
 
I
D
 
H
M
 
E
T
 
A
Q
 
R
L
 
I
Y
 
H
H
 
Y
E
 
E
S
 
V
F
|
F
A
 
G

Sites not aligning to the query:

3ozuA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with miconazole (see paper)
28% identity, 65% coverage: 24:270/380 of query aligns to 148:397/403 of 3ozuA

query
sites
3ozuA
P
 
P
A
 
G
S
 
G
V
 
W
V
 
K
G
 
G
F
 
W
S
 
R
Q
 
T
L
 
F
V
 
V
C
 
I
V
 
R
E
 
E
R
 
K
W
 
R
N
 
P
E
 
E
T
 
S
A
 
D
D
 
V
V
 
I
V
 
T
S
 
S
F
 
F
R
 
I
F
 
L
Q
 
E
A
 
P
-
 
A
-
 
D
G
 
G
E
 
G
P
 
P
M
 
V
K
 
-
F
 
V
D
 
N
Y
 
F
K
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
M
 
T
T
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
I
E
 
D
I
 
V
N
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
Q
 
Q
A
 
Q
C
 
I
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
S
S
 
D
T
 
M
P
 
P
S
 
N
R
 
G
P
 
-
Y
 
R
S
 
S
L
 
Y
M
 
R
L
 
I
T
x
S
I
x
V
K
|
K
R
 
R
V
x
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
L
x
Y
V
|
V
S
|
S
N
 
N
Y
 
L
L
 
L
I
 
H
D
 
D
H
 
H
L
 
V
Q
 
N
P
 
V
G
 
G
Q
 
D
T
 
Q
V
 
V
R
 
K
V
 
L
L
 
A
P
 
A
P
 
P
T
 
Y
G
 
G
Q
 
S
F
 
F
N
 
H
L
 
I
F
 
-
D
 
D
I
 
V
P
 
D
A
 
A
K
 
K
-
 
T
K
 
P
Y
 
I
L
 
V
F
 
L
L
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
C
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
Y
 
V
S
 
S
M
 
M
S
 
L
R
 
K
Y
 
V
L
 
A
T
 
L
D
 
Q
S
 
A
Q
 
P
M
 
P
N
 
R
A
 
-
D
 
Q
I
 
V
A
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
S
 
G
A
 
A
R
 
R
T
 
N
Q
 
S
A
 
A
D
 
V
I
 
H
I
 
A
F
 
M
K
 
R
T
 
D
S
 
R
L
 
L
E
 
R
T
 
E
M
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
T
H
 
Y
R
 
E
D
 
N
F
 
L
K
 
D
L
 
L
-
 
F
-
 
V
-
 
F
-
 
Y
-
 
D
R
 
Q
Y
 
P
I
 
L
V
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
T
 
Q
A
 
G
D
 
R
T
 
D
A
 
Y
W
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
G
A
 
L
V
 
V
L
 
-
H
 
-
N
 
D
V
 
V
G
 
K
R
 
Q
L
 
I
R
 
E
P
 
K
D
 
S
N
 
I
L
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
D
F
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
A
T
 
D
V
 
Y
F
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
I
P
 
P
Y
 
F
M
 
M
Q
 
R
A
 
M
V
 
Q
K
 
H
T
 
D
I
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
N
L
 
L
N
 
G
F
 
I
D
 
H
M
 
E
T
 
A
Q
 
R
L
 
I
Y
 
H
H
 
Y
E
|
E
S
x
V
F
 
F
A
x
G

Sites not aligning to the query:

P39662 Flavohemoprotein; FHP; Flavohemoglobin; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see paper)
28% identity, 65% coverage: 24:270/380 of query aligns to 148:397/403 of P39662

query
sites
P39662
P
 
P
A
 
G
S
 
G
V
 
W
V
 
K
G
 
G
F
 
W
S
 
R
Q
 
T
L
 
F
V
 
V
C
 
I
V
 
R
E
 
E
R
 
K
W
 
R
N
 
P
E
 
E
T
 
S
A
 
D
D
 
V
V
 
I
V
 
T
S
 
S
F
 
F
R
 
I
F
 
L
Q
 
E
A
 
P
-
 
A
-
 
D
G
 
G
E
 
G
P
 
P
M
 
V
K
 
-
F
 
V
D
 
N
Y
 
F
K
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
M
 
T
T
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
I
E
 
D
I
 
V
N
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
Q
 
Q
A
 
Q
C
 
I
R
 
R
S
 
Q
Y
 
Y
T
 
S
L
 
L
S
 
S
S
 
D
T
 
M
P
 
P
S
 
N
R
 
G
P
 
-
Y
 
R
S
 
S
L
 
Y
M
 
R
L
 
I
T
 
S
I
 
V
K
 
K
R
 
R
V
 
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
 
Q
-
 
P
-
 
P
-
 
G
L
 
Y
V
 
V
S
 
S
N
 
N
Y
 
L
L
 
L
I
 
H
D
 
D
H
 
H
L
 
V
Q
 
N
P
 
V
G
 
G
Q
 
D
T
 
Q
V
 
V
R
 
K
V
 
L
L
 
A
P
 
A
P
 
P
T
 
Y
G
 
G
Q
 
S
F
 
F
N
 
H
L
 
I
F
 
-
D
 
D
I
 
V
P
 
D
A
 
A
K
 
K
-
 
T
K
 
P
Y
 
I
L
 
V
F
 
L
L
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
C
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
Y
 
V
S
 
S
M
 
M
S
 
L
R
 
K
Y
 
V
L
 
A
T
 
L
D
 
Q
S
 
A
Q
 
P
M
 
P
N
 
R
A
 
-
D
 
Q
I
 
V
A
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
S
 
G
A
 
A
R
 
R
T
 
N
Q
 
S
A
 
A
D
 
V
I
 
H
I
 
A
F
 
M
K
 
R
T
 
D
S
 
R
L
 
L
E
 
R
T
 
E
M
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
T
H
 
Y
R
 
E
D
 
N
F
 
L
K
 
D
L
 
L
-
 
F
-
 
V
-
 
F
-
 
Y
-
 
D
R
 
Q
Y
 
P
I
 
L
V
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
T
 
Q
A
 
G
D
 
R
T
 
D
A
 
Y
W
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
G
A
 
L
V
 
V
L
 
-
H
 
-
N
 
D
V
 
V
G
 
K
R
 
Q
L
 
I
R
 
E
P
 
K
D
 
S
N
 
I
L
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
D
F
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
A
T
 
D
V
 
Y
F
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
I
P
 
P
Y
 
F
M
 
M
Q
 
R
A
 
M
V
 
Q
K
 
H
T
 
D
I
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
N
L
 
L
N
 
G
F
 
I
D
 
H
M
 
E
T
 
A
Q
 
R
L
 
I
Y
 
H
H
 
Y
E
 
E
S
 
V
F
 
F
A
 
G

Sites not aligning to the query:

1cqxA Crystal structure of the flavohemoglobin from alcaligenes eutrophus at 1.75 a resolution (see paper)
28% identity, 65% coverage: 24:270/380 of query aligns to 148:397/403 of 1cqxA

query
sites
1cqxA
P
 
P
A
 
G
S
 
G
V
 
W
V
 
K
G
 
G
F
 
W
S
 
R
Q
 
T
L
 
F
V
 
V
C
 
I
V
 
R
E
 
E
R
 
K
W
 
R
N
 
P
E
 
E
T
 
S
A
 
D
D
 
V
V
 
I
V
 
T
S
 
S
F
 
F
R
 
I
F
 
L
Q
 
E
A
 
P
-
 
A
-
 
D
G
 
G
E
 
G
P
 
P
M
 
V
K
 
-
F
 
V
D
 
N
Y
 
F
K
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
M
 
T
T
 
S
L
 
V
V
 
A
L
 
I
E
 
D
I
 
V
N
 
P
-
 
A
-
 
L
G
 
G
E
 
L
Q
 
Q
A
 
Q
C
 
I
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
S
S
 
D
T
 
M
P
 
P
S
 
N
-
 
G
R
 
R
P
 
T
Y
 
Y
S
 
R
L
 
I
M
 
-
L
 
-
T
x
S
I
 
V
K
 
K
R
 
R
V
x
E
D
 
G
G
 
G
G
 
G
-
 
P
-
x
Q
-
x
P
-
 
P
-
x
G
L
x
Y
V
|
V
S
|
S
N
 
N
Y
 
L
L
 
L
I
 
H
D
 
D
H
 
H
L
 
V
Q
 
N
P
 
V
G
 
G
Q
 
D
T
 
Q
V
 
V
R
 
K
V
 
L
L
 
A
P
 
A
P
 
P
T
 
Y
G
 
G
Q
 
S
F
 
F
N
 
H
L
 
I
F
 
-
D
 
D
I
 
V
P
 
D
A
 
A
K
 
K
-
 
T
K
 
P
Y
 
I
L
 
V
F
 
L
L
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
C
 
V
G
 
G
I
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
Y
 
V
S
 
S
M
 
M
S
 
L
R
 
K
Y
 
V
L
 
A
T
 
L
D
 
Q
S
 
A
Q
 
P
M
 
P
N
 
R
A
 
-
D
 
Q
I
 
V
A
 
V
F
 
F
V
 
V
H
 
H
S
 
G
A
 
A
R
 
R
T
 
N
Q
 
S
A
 
A
D
 
V
I
 
H
I
 
A
F
 
M
K
 
R
T
 
D
S
 
R
L
 
L
E
 
R
T
 
E
M
 
A
A
 
A
T
 
K
R
 
T
H
 
Y
R
 
E
D
 
N
F
 
L
K
 
D
L
 
L
-
 
F
-
 
V
-
 
F
-
 
Y
-
 
D
R
 
Q
Y
 
P
I
 
L
V
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
V
T
 
Q
A
 
G
D
 
R
T
 
D
A
 
Y
W
 
D
H
 
Y
P
 
P
E
 
G
A
 
L
V
 
V
L
 
-
H
 
-
N
 
D
V
 
V
G
 
K
R
 
Q
L
 
I
R
 
E
P
 
K
D
 
S
N
 
I
L
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
L
V
 
L
P
 
P
D
 
D
F
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
A
T
 
D
V
 
Y
F
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
I
P
 
P
Y
 
F
M
 
M
Q
 
R
A
 
M
V
 
Q
K
 
H
T
 
D
I
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
N
L
 
L
N
 
G
F
 
I
D
 
H
M
 
E
T
 
A
Q
 
R
L
 
I
Y
 
H
H
 
Y
E
 
E
S
x
V
F
 
F
A
x
G

Sites not aligning to the query:

2eixA The structure of physarum polycephalum cytochrome b5 reductase (see paper)
28% identity, 57% coverage: 48:265/380 of query aligns to 29:241/243 of 2eixA

query
sites
2eixA
F
 
F
R
 
R
F
 
F
Q
 
N
A
 
L
G
 
H
E
 
H
P
 
P
M
 
E
K
 
D
F
 
V
D
 
V
Y
 
G
K
 
L
P
 
P
-
 
I
G
 
G
Q
 
Q
F
x
H
M
 
M
T
 
S
L
 
V
V
 
K
L
 
A
E
 
T
I
 
V
N
 
D
G
 
G
E
 
K
Q
 
E
A
 
I
C
 
Y
R
|
R
S
x
P
Y
|
Y
T
|
T
L
 
P
S
 
V
S
 
S
T
 
S
P
 
D
S
 
D
R
 
E
P
 
K
Y
 
G
S
 
Y
L
 
F
M
 
D
L
 
L
T
x
I
I
 
I
K
 
K
R
 
V
V
x
Y
D
 
E
G
x
K
G
|
G
L
 
Q
V
x
M
S
|
S
N
 
Q
Y
 
Y
L
 
-
I
 
I
D
 
D
H
 
H
L
 
L
Q
 
N
P
 
P
G
 
G
Q
 
D
T
 
F
V
 
L
R
 
Q
V
 
V
L
 
R
P
 
G
P
 
P
T
 
K
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
N
 
D
L
 
Y
F
 
K
D
 
P
I
 
N
P
 
M
A
 
V
K
 
K
K
 
E
Y
 
M
L
 
G
F
 
M
L
 
I
S
 
A
A
 
G
G
 
G
C
x
T
G
 
G
I
 
I
T
|
T
P
 
P
M
 
M
Y
 
L
S
 
Q
M
 
V
S
 
A
R
 
R
-
 
A
Y
 
I
L
 
I
T
 
K
D
 
N
S
 
P
Q
 
K
M
 
E
N
 
K
A
 
T
D
 
I
I
 
I
A
 
N
F
 
L
V
 
I
H
 
F
S
 
A
A
 
N
R
 
V
T
 
N
Q
 
E
A
 
D
D
 
D
I
 
I
I
 
L
F
 
L
K
 
R
T
 
T
S
 
E
L
 
L
E
 
D
T
 
D
M
 
M
A
 
A
T
 
K
R
 
K
H
 
Y
R
 
S
D
 
N
F
 
F
K
 
K
L
 
V
R
 
Y
Y
 
Y
I
 
V
V
 
L
E
 
N
D
 
N
V
 
P
T
 
P
A
 
A
D
 
-
T
 
-
A
 
G
W
 
W
H
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
T
H
 
G
N
 
G
V
 
V
G
 
G
R
x
F
L
 
V
R
 
S
P
 
A
D
 
D
N
 
M
L
 
I
R
 
K
D
 
Q
-
 
H
L
 
F
V
 
S
P
 
P
D
 
P
F
 
S
A
 
S
E
 
D
R
 
I
T
 
K
V
 
V
F
 
M
L
 
M
C
|
C
G
 
G
P
 
P
E
 
P
P
x
M
Y
 
M
M
 
N
Q
 
K
A
|
A
V
 
M
K
 
Q
T
 
G
I
 
H
L
 
L
A
 
E
E
 
T
L
 
L
N
 
G
F
 
Y
D
 
T
M
 
P
T
 
E
Q
 
Q
L
 
W
Y
 
F

6laaA Crystal structure of full-length cyp116b46 from tepidiphilus thermophilus (see paper)
23% identity, 92% coverage: 26:374/380 of query aligns to 437:747/753 of 6laaA

query
sites
6laaA
S
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
R
F
 
T
S
 
M
Q
 
E
L
 
V
V
 
A
C
 
A
V
 
V
E
 
E
R
 
R
W
 
P
N
 
S
E
 
E
T
 
D
A
 
I
D
 
V
V
 
V
V
 
L
S
 
H
F
 
L
R
 
T
F
 
R
Q
 
P
A
 
D
G
 
R
E
 
R
P
 
P
M
 
L
K
 
P
F
 
-
D
 
R
Y
 
W
K
 
S
P
 
P
G
 
G
Q
 
A
F
 
H
M
 
I
T
 
D
L
 
I
V
 
-
L
 
-
E
 
E
I
 
C
N
 
G
G
 
E
E
 
P
Q
 
D
A
 
R
C
 
S
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
C
S
 
S
T
 
D
P
 
P
S
 
E
R
 
N
P
 
R
Y
 
D
S
 
A
L
 
W
M
 
R
L
 
V
T
 
A
I
 
V
K
x
Q
R
 
R
-
 
D
-
 
P
-
 
A
V
x
S
D
x
R
G
 
G
G
|
G
L
 
-
V
 
-
S
|
S
N
 
R
Y
 
W
L
 
I
I
 
H
D
 
E
H
 
E
L
 
V
Q
 
R
P
 
P
G
 
G
Q
 
M
T
 
L
V
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
R
P
 
G
P
 
P
T
 
R
G
 
N
Q
 
S
F
 
F
N
 
R
L
 
L
F
 
-
D
 
D
I
 
E
P
 
H
A
 
A
K
 
P
K
 
R
Y
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
S
 
A
A
 
G
G
 
G
C
x
I
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
I
Y
 
M
S
 
T
M
 
M
S
 
A
R
 
-
Y
 
-
L
 
A
T
 
R
D
 
A
S
 
K
Q
 
E
M
 
L
N
 
G
A
 
T
D
 
D
I
 
Y
A
 
E
F
 
L
V
 
H
H
 
Y
S
 
S
A
 
V
R
 
R
T
 
S
Q
 
R
A
 
T
D
 
S
I
 
L
I
 
I
F
 
F
K
 
V
T
 
D
S
 
E
L
 
L
E
 
R
T
 
Q
M
 
I
A
 
-
T
 
-
R
 
-
H
 
H
R
 
G
D
 
D
F
 
R
K
 
L
L
 
H
R
 
V
Y
 
Y
I
 
V
V
 
S
E
 
E
D
 
E
-
 
G
V
 
V
T
 
R
A
 
N
D
 
D
T
 
L
A
 
A
W
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
A
V
 
L
L
 
I
H
 
R
N
 
R
V
 
A
G
 
S
R
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
N
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
A
E
 
G
R
 
T
T
 
Q
V
 
I
F
 
Y
L
 
A
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
Q
P
 
R
Y
 
M
M
 
L
Q
 
D
A
 
T
V
 
L
K
 
E
T
 
R
I
 
L
L
 
I
A
 
E
-
 
N
-
 
R
-
 
P
E
 
E
L
 
V
N
 
T
F
 
L
D
 
R
M
 
V
T
x
E
Q
 
H
L
x
F
Y
 
F
H
 
G
E
 
E
-
 
P
S
 
S
F
 
H
A
 
L
T
 
D
A
 
P
V
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
R
-
 
P
-
 
F
Q
 
Q
S
 
V
R
 
V
V
 
L
K
 
R
Q
 
N
A
 
S
E
 
G
M
 
L
Q
 
T
T
 
V
E
 
E
A
 
V
P
 
P
E
 
-
S
 
-
G
 
-
S
 
-
N
 
-
S
 
-
F
 
-
M
 
-
L
 
-
S
 
-
I
 
-
G
 
-
D
 
-
K
 
-
K
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
V
I
 
L
E
 
R
A
 
A
E
 
Y
G
 
N
L
 
I
P
 
E
I
 
V
I
 
Q
A
x
S
A
 
D
C
|
C
R
x
E
S
 
E
G
|
G
V
 
L
C
|
C
G
|
G
A
 
T
C
|
C
K
 
E
C
 
V
Q
 
S
V
 
V
L
 
V
E
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
V
E
 
D
S
 
H
T
 
R
S
 
D
S
 
S
M
 
V
T
 
L
L
 
T
T
 
R
P
 
A
S
 
E
E
 
R
I
 
R
E
 
E
A
 
N
G
 
R
Y
 
R
V
 
M
L
 
M
A
 
C
C
|
C
S
 
C
T
 
S
K
 
R
L
 
A
K
 
K
S
 
T
D
 
E

Sites not aligning to the query:

1gvhA The x-ray structure of ferric escherichia coli flavohemoglobin reveals an unespected geometry of the distal heme pocket (see paper)
27% identity, 56% coverage: 59:270/380 of query aligns to 182:391/396 of 1gvhA

query
sites
1gvhA
D
 
E
Y
 
Y
K
 
R
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
M
 
L
T
 
G
L
 
V
V
 
W
L
 
L
E
 
K
I
 
P
N
 
E
G
 
G
-
 
F
-
 
P
E
 
H
Q
 
Q
A
 
E
C
 
I
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
T
S
 
R
T
 
K
P
 
P
S
 
D
R
 
G
P
 
K
Y
 
-
S
 
G
L
 
Y
M
 
R
L
 
I
T
x
A
I
x
V
K
 
K
R
 
R
V
x
E
D
 
E
G
 
G
G
|
G
L
x
Q
V
|
V
S
|
S
N
 
N
Y
 
W
L
 
L
I
 
H
D
 
N
H
 
H
L
 
A
Q
 
N
P
 
V
G
 
G
Q
 
D
T
 
V
V
 
V
R
 
K
V
 
L
L
 
V
P
 
A
P
 
P
T
 
A
G
 
G
Q
 
D
F
 
F
N
 
F
L
 
M
F
 
A
D
 
V
I
 
A
P
 
D
A
 
D
K
 
T
K
 
P
Y
 
V
L
 
T
F
 
L
L
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
C
x
V
G
 
G
I
 
Q
T
|
T
P
 
P
M
 
M
Y
 
L
S
 
A
M
 
M
S
 
L
R
 
D
Y
 
T
L
 
L
T
 
A
D
 
K
S
 
A
Q
 
G
M
 
H
N
 
T
A
 
A
D
 
Q
I
 
V
A
 
N
F
 
W
V
 
F
H
 
H
S
 
A
A
 
A
R
 
E
T
 
N
Q
 
G
A
 
D
D
 
V
I
 
H
I
 
A
F
 
F
K
 
A
T
 
D
S
 
E
L
 
V
E
 
K
T
 
E
M
 
L
A
 
G
T
 
Q
R
 
S
H
 
L
R
 
P
D
 
R
F
 
F
K
 
-
L
 
-
R
 
-
Y
 
-
I
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
V
 
-
T
 
T
A
 
A
D
 
H
T
 
T
A
 
-
W
 
W
H
 
Y
-
 
R
-
 
Q
P
 
P
E
 
S
A
 
E
V
 
A
L
 
D
H
 
R
N
 
A
V
 
K
G
 
G
R
 
Q
L
 
F
R
 
D
P
 
S
D
 
E
N
 
G
L
 
L
R
 
M
D
 
D
L
 
L
V
 
S
P
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
G
D
 
A
F
 
F
A
 
S
E
 
D
R
 
P
T
 
T
V
 
M
-
 
Q
-
 
F
F
 
Y
L
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
V
P
 
G
Y
 
F
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
V
 
T
K
 
A
T
 
K
I
 
Q
L
 
L
A
 
V
E
 
D
L
 
L
N
 
G
F
 
V
D
 
K
M
 
Q
T
 
E
Q
 
N
L
 
I
Y
 
H
H
 
Y
E
|
E
S
 
C
F
|
F
A
 
G

Sites not aligning to the query:

P24232 Flavohemoprotein; Flavohemoglobin; HMP; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
27% identity, 56% coverage: 59:270/380 of query aligns to 182:391/396 of P24232

query
sites
P24232
D
 
E
Y
 
Y
K
 
R
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
M
 
L
T
 
G
L
 
V
V
 
W
L
 
L
E
 
K
I
 
P
N
 
E
G
 
G
-
 
F
-
 
P
E
 
H
Q
 
Q
A
 
E
C
 
I
R
 
R
S
 
Q
Y
 
Y
T
 
S
L
 
L
S
 
T
S
 
R
T
 
K
P
 
P
S
 
D
R
 
G
P
 
K
Y
 
-
S
 
G
L
 
Y
M
 
R
L
 
I
T
 
A
I
 
V
K
 
K
R
 
R
V
 
E
D
 
E
G
 
G
G
 
G
L
 
Q
V
 
V
S
 
S
N
 
N
Y
 
W
L
 
L
I
 
H
D
 
N
H
 
H
L
 
A
Q
 
N
P
 
V
G
 
G
Q
 
D
T
 
V
V
 
V
R
 
K
V
 
L
L
 
V
P
 
A
P
 
P
T
 
A
G
 
G
Q
 
D
F
 
F
N
 
F
L
 
M
F
 
A
D
 
V
I
 
A
P
 
D
A
 
D
K
 
T
K
 
P
Y
 
V
L
 
T
F
 
L
L
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
C
 
V
G
 
G
I
 
Q
T
 
T
P
 
P
M
 
M
Y
 
L
S
 
A
M
 
M
S
 
L
R
 
D
Y
 
T
L
 
L
T
 
A
D
 
K
S
 
A
Q
 
G
M
 
H
N
 
T
A
 
A
D
 
Q
I
 
V
A
 
N
F
 
W
V
 
F
H
 
H
S
 
A
A
 
A
R
 
E
T
 
N
Q
 
G
A
 
D
D
 
V
I
 
H
I
 
A
F
 
F
K
 
A
T
 
D
S
 
E
L
 
V
E
 
K
T
 
E
M
 
L
A
 
G
T
 
Q
R
 
S
H
 
L
R
 
P
D
 
R
F
 
F
K
 
-
L
 
-
R
 
-
Y
 
-
I
 
-
V
 
-
E
 
-
D
 
-
V
 
-
T
 
T
A
 
A
D
 
H
T
 
T
A
 
-
W
 
W
H
 
Y
-
 
R
-
 
Q
P
 
P
E
 
S
A
 
E
V
 
A
L
 
D
H
 
R
N
 
A
V
 
K
G
 
G
R
 
Q
L
 
F
R
 
D
P
 
S
D
 
E
N
 
G
L
 
L
R
 
M
D
 
D
L
 
L
V
 
S
P
 
K
-
 
L
-
 
E
-
 
G
D
 
A
F
 
F
A
 
S
E
 
D
R
 
P
T
 
T
V
 
M
-
 
Q
-
 
F
F
 
Y
L
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
V
P
 
G
Y
 
F
M
 
M
Q
 
Q
A
 
F
V
 
T
K
 
A
T
 
K
I
 
Q
L
 
L
A
 
V
E
 
D
L
 
L
N
 
G
F
 
V
D
 
K
M
 
Q
T
 
E
Q
 
N
L
 
I
Y
 
H
H
 
Y
E
 
E
S
 
C
F
 
F
A
 
G

Sites not aligning to the query:

6kbhA Crystal structure of an intact type iv self-sufficient cytochrome p450 monooxygenase
24% identity, 88% coverage: 45:379/380 of query aligns to 470:765/765 of 6kbhA

query
sites
6kbhA
V
 
L
V
 
I
S
 
T
F
 
L
R
 
R
F
 
D
Q
 
T
A
 
S
G
 
G
E
 
R
P
 
P
M
 
L
K
 
-
F
 
-
D
 
-
Y
 
-
K
 
-
P
 
P
G
 
K
Q
 
W
F
 
S
M
 
A
T
 
G
L
 
S
V
 
H
L
 
I
E
 
D
I
 
V
N
 
D
G
 
C
E
 
G
Q
 
A
A
 
V
C
 
S
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
C
S
 
G
T
 
D
P
 
P
S
 
H
R
 
D
P
 
R
Y
 
T
S
 
T
L
 
F
M
 
Q
L
 
V
T
x
A
I
 
V
-
x
L
-
 
H
-
 
D
K
 
R
R
 
E
V
x
S
D
x
R
G
 
G
G
|
G
L
 
-
V
 
-
S
|
S
N
 
R
Y
 
W
L
 
I
I
 
H
D
 
T
H
 
E
L
 
L
Q
 
A
P
 
V
G
 
G
Q
 
A
T
 
T
V
 
L
R
 
R
V
 
V
L
 
R
P
 
G
P
 
P
T
 
R
G
 
N
Q
 
H
F
 
F
N
 
K
L
 
L
F
 
-
D
 
D
I
 
P
P
 
D
A
 
A
K
 
K
K
 
R
Y
 
Y
L
 
V
F
 
F
L
 
V
S
 
A
A
 
G
G
 
G
C
x
I
G
 
G
I
 
I
T
|
T
P
 
P
M
 
V
Y
 
I
S
 
A
M
 
M
S
 
A
R
 
D
Y
 
Q
L
 
V
T
 
K
D
 
A
S
 
A
Q
 
G
M
 
G
N
 
D
A
 
Y
D
 
E
I
 
I
A
 
H
F
 
Y
V
 
A
H
 
G
S
 
R
A
 
S
R
 
R
T
 
T
Q
 
S
A
 
M
-
 
A
-
 
F
-
 
L
D
 
D
I
 
R
I
 
L
F
 
A
K
 
R
T
 
D
S
 
H
L
 
G
E
 
E
T
 
S
M
 
V
A
 
R
T
 
V
R
 
Y
H
 
P
R
 
G
D
 
D
F
 
E
K
 
G
L
 
V
R
 
R
Y
 
M
I
 
D
V
 
L
E
 
P
D
 
S
V
 
L
T
 
F
A
 
A
D
 
D
T
 
-
A
 
-
W
 
-
H
 
-
P
 
P
E
 
E
A
 
-
V
 
-
L
 
-
H
 
-
N
 
-
V
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
D
N
 
G
L
 
T
R
 
Q
D
 
-
L
 
-
V
 
-
P
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
V
F
 
Y
L
 
S
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
E
P
 
R
Y
 
L
M
 
L
Q
 
S
A
 
A
V
 
L
K
 
S
T
 
E
I
 
A
L
 
T
A
 
A
E
 
H
L
 
W
N
 
P
F
 
D
D
 
D
M
 
T
T
 
-
Q
 
-
L
 
L
Y
 
H
H
 
V
E
|
E
S
 
H
F
|
F
A
 
S
T
 
S
A
 
T
V
 
L
K
 
E
E
 
E
A
 
L
Q
 
D
S
 
P
R
 
-
V
 
-
K
 
-
Q
 
-
A
 
-
E
 
-
M
 
-
Q
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
S
G
 
K
S
 
E
N
 
H
S
 
G
F
 
F
M
 
D
L
 
V
S
 
V
I
 
L
G
 
K
D
 
D
K
 
S
-
 
G
-
 
I
K
 
T
R
 
V
A
 
P
L
 
V
T
 
A
A
 
A
E
 
D
Q
 
Q
T
 
T
L
 
V
L
 
L
E
 
Q
G
 
A
I
 
L
E
 
R
A
 
A
E
 
A
G
 
N
L
 
I
P
 
D
I
 
A
I
 
Q
A
 
S
A
 
D
C
|
C
R
x
E
S
 
E
G
|
G
V
x
I
C
|
C
G
|
G
A
 
A
C
|
C
K
 
E
C
 
V
Q
 
P
V
 
V
L
 
L
E
 
D
G
 
G
E
 
E
T
 
V
E
 
D
S
 
H
T
 
-
S
 
R
S
 
D
M
 
L
T
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
K
S
 
T
E
 
E
I
 
R
E
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
 
K
V
 
T
L
 
M
-
 
M
-
 
T
A
x
C
C
 
C
S
 
S
T
 
R
K
 
A
L
 
C
K
 
G
S
 
D
D
 
K
V
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
Q
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1tvcA Fad and nadh binding domain of methane monooxygenase reductase from methylococcus capsulatus (bath) (see paper)
25% identity, 55% coverage: 60:269/380 of query aligns to 44:244/250 of 1tvcA

query
sites
1tvcA
Y
 
F
K
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
F
|
F
M
 
M
T
 
D
L
 
L
V
 
T
L
 
-
E
 
-
I
 
I
N
 
P
G
 
G
E
 
T
Q
 
D
A
 
V
C
 
S
R
|
R
S
|
S
Y
|
Y
T
x
S
L
 
P
S
 
A
S
 
N
T
 
L
P
 
P
S
 
N
R
 
P
P
 
E
Y
 
G
S
 
R
L
 
L
M
 
E
L
 
F
T
x
L
I
|
I
K
x
R
R
 
V
V
x
L
D
 
P
G
 
E
G
 
G
L
 
R
V
x
F
S
 
S
N
 
D
Y
 
Y
L
 
L
I
 
R
D
 
N
H
 
D
L
 
A
Q
 
R
P
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
V
V
 
L
R
 
S
V
 
V
L
 
K
P
 
G
P
 
P
T
 
L
G
 
G
Q
 
V
F
 
F
N
 
G
L
 
L
F
 
K
D
 
E
I
 
R
P
 
G
A
 
M
K
 
A
K
 
P
Y
 
R
L
 
Y
F
 
F
L
 
V
S
 
A
A
 
G
G
 
G
C
 
T
G
|
G
I
 
L
T
 
A
P
 
P
M
 
V
Y
 
V
S
 
S
M
 
M
S
 
V
R
 
R
Y
 
Q
L
 
M
T
 
Q
D
 
E
S
 
W
Q
 
T
M
 
A
N
 
P
A
 
N
D
 
E
I
 
T
A
 
R
F
 
I
V
 
Y
H
 
F
S
 
G
A
 
V
R
x
N
T
 
T
Q
 
E
A
 
P
D
x
E
I
 
L
I
 
F
F
 
Y
K
 
I
T
 
D
S
 
E
L
 
L
E
 
K
T
 
S
M
 
L
A
 
E
T
 
R
R
 
S
H
 
M
R
 
R
D
 
N
F
 
L
K
 
T
L
 
V
R
 
K
Y
 
A
I
 
C
V
 
V
E
 
-
D
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
W
 
W
H
 
H
P
 
P
E
x
S
A
x
G
V
 
D
L
 
W
H
 
E
N
 
G
V
 
E
G
 
Q
R
 
G
L
 
S
R
 
P
P
 
I
D
 
D
N
 
A
L
 
L
R
 
R
-
 
E
D
 
D
L
 
L
V
 
E
P
 
S
D
 
S
F
 
D
A
 
A
E
 
N
R
 
P
T
 
D
V
 
I
F
 
Y
L
|
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
P
P
 
G
Y
 
M
M
 
I
Q
 
D
A
 
A
V
 
A
K
 
C
T
 
E
I
 
L
L
 
V
A
 
R
E
 
S
L
 
R
N
 
G
F
 
I
D
 
P
M
 
G
T
 
E
Q
 
Q
L
 
V
Y
 
F
H
 
F
E
|
E
S
 
K
F
|
F

Sites not aligning to the query:

P17571 Nitrate reductase [NADH] 1; NR; EC 1.7.1.1 from Zea mays (Maize) (see 3 papers)
26% identity, 69% coverage: 2:265/380 of query aligns to 333:618/621 of P17571

query
sites
P17571
D
 
D
T
 
N
K
 
S
T
 
V
M
 
H
N
 
G
I
 
G
S
 
S
T
 
V
M
 
L
Q
 
S
N
 
H
I
 
L
M
 
A
P
 
P
S
 
I
P
 
R
A
 
R
L
 
A
S
 
V
S
 
R
A
 
A
P
 
P
A
 
A
S
 
L
V
 
S
V
 
N
G
 
P
F
 
R
S
 
E
Q
 
K
L
 
I
V
 
H
C
 
C
-
 
R
-
 
L
V
 
V
E
 
G
R
 
K
W
 
K
N
 
E
E
 
L
T
 
S
A
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
R
S
 
L
F
 
F
R
 
R
F
 
F
Q
 
S
A
 
L
G
 
P
E
 
S
P
 
P
M
 
D
K
 
Q
F
 
V
D
 
L
Y
 
G
K
 
L
P
 
P
-
 
I
G
 
G
Q
 
K
F
 
H
M
 
I
T
 
F
L
 
V
V
 
C
L
 
A
E
 
S
I
 
I
N
 
E
G
 
G
E
 
K
Q
 
L
A
 
C
C
 
M
R
|
R
S
x
A
Y
|
Y
T
|
T
L
 
P
S
 
T
S
 
S
T
 
M
P
 
V
S
 
D
R
 
E
-
 
I
-
 
G
P
 
H
Y
 
F
S
 
D
L
 
L
M
x
L
L
x
V
T
x
K
I
 
V
-
 
Y
-
x
F
-
 
K
-
 
N
-
 
E
-
 
H
-
 
P
K
 
K
R
 
F
V
 
P
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
|
L
V
x
M
S
x
T
N
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
I
 
-
D
 
D
H
 
S
L
 
L
Q
 
P
P
 
V
G
 
G
Q
 
S
T
 
Y
V
 
I
R
 
D
V
 
V
L
 
K
P
 
G
P
 
P
T
 
L
G
 
G
Q
 
H
F
 
V
N
 
E
L
 
Y
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
S
F
 
F
D
 
V
I
 
I
P
 
N
A
 
G
K
 
K
-
 
Q
-
 
R
-
 
H
-
 
A
-
 
S
K
 
R
Y
 
L
L
 
A
F
 
M
L
 
I
S
 
C
A
 
G
G
 
G
C
x
S
G
 
G
I
 
I
T
|
T
P
 
P
M
 
M
Y
 
Y
S
 
Q
M
 
I
S
 
I
R
 
Q
Y
 
A
L
 
V
T
 
L
D
 
R
S
 
D
Q
 
Q
M
 
P
-
 
E
-
 
D
N
 
H
A
 
T
D
 
E
I
 
M
A
 
H
F
 
L
V
 
V
H
 
Y
S
 
A
A
 
N
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
A
 
D
D
 
D
I
 
I
I
 
L
F
 
L
K
 
R
T
 
D
S
 
E
L
 
L
E
 
D
T
 
R
M
 
W
A
 
A
T
 
A
R
 
E
H
 
Y
R
 
P
D
 
D
-
 
R
F
 
L
K
 
K
L
 
V
R
 
W
Y
 
Y
I
 
V
V
 
I
E
 
D
D
 
Q
V
 
V
T
 
K
A
 
R
D
 
P
T
 
E
A
 
-
W
 
-
H
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
G
V
 
W
L
 
K
H
 
Y
N
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
L
 
V
R
 
T
P
 
E
D
 
A
N
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
E
L
 
H
V
 
V
P
 
P
D
 
E
F
 
G
A
 
G
E
 
D
R
 
D
T
 
T
V
 
L
F
 
A
L
 
L
-
 
A
C
|
C
G
 
G
P
 
P
E
 
P
P
 
P
Y
 
M
M
 
I
Q
 
Q
-
 
F
A
 
A
V
 
I
K
 
S
T
 
P
I
 
N
L
 
L
A
 
E
E
 
K
L
 
M
N
 
K
F
 
Y
D
 
D
M
 
M
T
 
A
Q
 
N
L
 
S
Y
 
F

5ogxA Crystal structure of amycolatopsis cytochrome p450 reductase gcob. (see paper)
24% identity, 58% coverage: 54:272/380 of query aligns to 123:332/333 of 5ogxA

query
sites
5ogxA
E
 
E
P
 
P
M
 
L
K
 
A
F
 
F
D
 
E
Y
 
A
K
 
-
P
 
-
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
M
 
V
T
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
-
E
 
-
I
 
V
N
 
P
G
 
G
E
 
S
Q
 
G
A
 
A
C
 
R
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
A
S
 
N
T
 
T
P
 
A
S
 
D
R
 
E
P
 
D
Y
 
K
S
 
V
L
 
L
M
 
E
L
 
L
T
x
H
I
x
V
K
 
R
R
 
R
V
|
V
D
 
P
G
 
G
G
|
G
L
x
V
V
x
A
S
x
T
N
 
D
-
 
G
Y
 
W
L
 
L
I
 
F
D
 
D
H
 
G
L
 
L
Q
 
A
P
 
A
G
 
G
Q
 
D
T
 
R
V
 
V
R
 
E
V
 
A
L
 
T
P
 
G
P
 
P
T
 
L
G
 
G
Q
 
D
F
 
F
N
 
H
L
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
P
F
 
D
D
 
E
I
 
D
P
 
D
A
 
G
K
 
G
K
 
P
Y
 
M
L
 
V
F
 
L
L
 
I
S
 
G
A
 
G
G
 
G
C
x
T
G
 
G
I
 
L
T
 
A
P
 
P
M
 
L
Y
 
V
S
 
G
M
 
I
S
 
A
R
 
R
Y
 
T
L
 
A
T
 
L
D
 
A
S
 
R
Q
 
H
M
 
P
N
 
S
A
 
R
D
 
E
I
 
V
A
 
L
F
 
L
V
 
Y
H
 
H
S
 
G
A
 
V
R
 
R
T
 
G
Q
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
L
I
 
Y
F
 
D
K
 
L
T
 
G
S
 
R
L
 
F
E
 
A
T
 
E
M
 
I
A
 
A
T
 
E
R
 
E
H
 
H
R
 
P
D
 
G
F
 
F
K
 
R
L
 
F
R
 
V
Y
 
P
I
 
V
V
 
L
E
 
S
D
 
D
V
 
-
T
 
E
A
 
P
D
 
D
T
 
P
A
 
A
W
 
Y
H
 
R
P
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
H
 
-
N
 
-
V
 
-
G
 
G
R
 
G
L
 
F
R
 
P
P
 
T
D
 
D
N
 
A
L
 
F
R
 
V
D
 
E
L
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
S
F
 
G
A
 
R
E
 
G
R
 
W
T
 
S
V
 
G
F
 
W
L
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
P
P
 
A
Y
 
M
M
 
V
Q
 
E
A
 
A
V
 
G
K
 
V
T
 
K
I
 
A
L
 
F
A
 
K
E
 
R
L
 
R
N
 
R
F
 
M
D
 
S
M
 
P
T
 
R
Q
 
R
L
 
I
Y
 
H
H
 
R
E
 
E
S
 
K
F
|
F
A
 
T
T
x
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P0DPQ8 Aromatic O-demethylase, reductase subunit; NADH--hemoprotein reductase; EC 1.6.2.- from Amycolatopsis sp. (strain ATCC 39116 / 75iv2) (see paper)
24% identity, 58% coverage: 54:272/380 of query aligns to 124:333/334 of P0DPQ8

query
sites
P0DPQ8
E
 
E
P
 
P
M
 
L
K
 
A
F
 
F
D
 
E
Y
 
A
K
 
-
P
 
-
G
 
G
Q
 
Q
F
 
Y
M
 
V
T
 
E
L
 
L
V
 
V
L
 
-
E
 
-
I
 
V
N
 
P
G
 
G
E
 
S
Q
 
G
A
 
A
C
 
R
R
|
R
S
x
Q
Y
|
Y
T
x
S
L
 
L
S
 
A
S
 
N
T
 
T
P
 
A
S
 
D
R
 
E
P
 
D
Y
 
K
S
 
V
L
 
L
M
 
E
L
 
L
T
x
H
I
x
V
K
x
R
R
 
R
V
 
V
D
 
P
G
 
G
G
 
G
L
x
V
V
x
A
S
x
T
N
 
D
-
 
G
Y
 
W
L
 
L
I
 
F
D
 
D
H
 
G
L
 
L
Q
 
A
P
 
A
G
 
G
Q
 
D
T
 
R
V
 
V
R
 
E
V
 
A
L
 
T
P
 
G
P
 
P
T
 
L
G
 
G
Q
 
D
F
 
F
N
 
H
L
 
L
-
 
P
-
 
P
-
 
P
F
 
D
D
 
E
I
 
D
P
 
D
A
 
G
K
 
G
K
 
P
Y
 
M
L
 
V
F
 
L
L
 
I
S
 
G
A
 
G
G
 
G
C
x
T
G
 
G
I
 
L
T
 
A
P
 
P
M
 
L
Y
 
V
S
 
G
M
 
I
S
 
A
R
 
R
Y
 
T
L
 
A
T
 
L
D
 
A
S
 
R
Q
 
H
M
 
P
N
 
S
A
 
R
D
 
E
I
 
V
A
 
L
F
 
L
V
 
Y
H
 
H
S
 
G
A
 
V
R
 
R
T
 
G
Q
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
L
I
 
Y
F
 
D
K
 
L
T
 
G
S
 
R
L
 
F
E
 
A
T
 
E
M
 
I
A
 
A
T
 
E
R
 
E
H
 
H
R
 
P
D
 
G
F
 
F
K
 
R
L
 
F
R
 
V
Y
 
P
I
 
V
V
 
L
E
 
S
D
 
D
V
 
-
T
 
E
A
 
P
D
 
D
T
 
P
A
 
A
W
 
Y
H
 
R
P
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
H
 
-
N
 
-
V
 
-
G
 
G
R
 
G
L
 
F
R
 
P
P
 
T
D
 
D
N
 
A
L
 
F
R
 
V
D
 
E
L
 
D
V
 
V
P
 
P
D
 
S
F
 
G
A
 
R
E
 
G
R
 
W
T
 
S
V
 
G
F
 
W
L
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
E
 
P
P
 
A
Y
 
M
M
 
V
Q
 
E
A
 
A
V
 
G
K
 
V
T
 
K
I
 
A
L
 
F
A
 
K
E
 
R
L
 
R
N
 
R
F
 
M
D
 
S
M
 
P
T
 
R
Q
 
R
L
 
I
Y
 
H
H
 
R
E
 
E
S
 
K
F
|
F
A
 
T
T
 
P
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1cnfA Structural studies on corn nitrate reductase: refined structure of the cytochrome b reductase fragment at 2.5 angstroms, its adp complex and an active site mutant and modeling of the cytochrome b domain (see paper)
27% identity, 58% coverage: 42:263/380 of query aligns to 14:255/260 of 1cnfA

query
sites
1cnfA
T
 
S
A
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
R
S
 
L
F
 
F
R
 
R
F
 
F
Q
 
S
A
 
L
G
 
P
E
 
S
P
 
P
M
 
D
K
 
Q
F
 
V
D
 
L
Y
 
G
K
 
L
P
 
P
-
 
I
G
 
G
Q
 
K
F
x
H
M
 
I
T
 
F
L
 
V
V
 
C
L
 
A
E
 
T
I
 
I
N
 
E
G
 
G
E
 
K
Q
 
L
A
 
C
C
 
M
R
|
R
S
x
A
Y
|
Y
T
|
T
L
 
P
S
 
T
S
 
S
T
 
M
P
 
V
S
 
D
R
 
E
-
 
I
-
 
G
P
 
H
Y
 
F
S
 
D
L
 
L
M
x
L
L
 
V
T
x
K
I
 
V
-
x
Y
-
 
F
-
 
K
-
 
N
-
 
E
-
 
H
-
 
P
K
 
K
R
x
F
V
 
P
D
 
N
G
|
G
G
|
G
L
|
L
V
x
M
S
x
T
N
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
I
 
-
D
 
D
H
 
S
L
 
L
Q
 
P
P
 
V
G
 
G
Q
 
S
T
 
Y
V
 
I
R
 
D
V
 
V
L
 
K
P
 
G
P
 
P
T
 
L
G
 
G
Q
 
H
-
 
V
-
 
E
-
 
Y
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
V
F
 
I
N
 
N
L
 
G
F
 
K
D
 
Q
I
 
R
P
 
N
A
 
A
K
 
R
K
 
R
Y
 
L
L
 
A
F
 
M
L
 
I
S
 
C
A
 
G
G
 
G
C
x
S
G
 
G
I
 
I
T
|
T
P
|
P
M
 
M
Y
 
Y
S
 
Q
M
 
I
S
 
I
R
 
Q
Y
 
A
L
 
V
T
 
L
D
 
R
S
 
D
Q
 
Q
M
 
P
-
 
E
-
 
D
N
 
H
A
 
T
D
 
E
I
 
M
A
 
H
F
 
L
V
 
V
H
 
Y
S
 
A
A
x
N
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
A
 
D
D
 
D
I
 
I
I
 
L
F
 
L
K
 
R
T
 
D
S
 
E
L
 
L
E
 
D
T
 
R
M
 
W
A
 
A
T
 
A
R
 
E
H
 
Y
R
 
P
D
 
D
-
 
R
F
 
L
K
 
K
L
 
V
R
 
W
Y
 
Y
I
 
V
V
 
I
E
 
D
D
 
Q
V
 
V
T
 
K
-
 
R
A
 
P
D
 
E
T
 
E
A
 
G
W
 
W
H
 
K
P
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
H
 
Y
N
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
L
 
V
R
 
T
P
 
E
D
 
A
N
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
E
L
 
H
V
 
V
P
 
P
D
 
E
F
 
G
A
 
G
E
 
D
R
 
D
T
 
T
V
 
L
F
 
A
L
 
L
-
 
A
C
|
C
G
 
G
P
|
P
E
 
P
P
|
P
Y
x
M
M
 
I
Q
 
Q
-
x
F
A
|
A
V
 
I
K
 
S
T
 
P
I
 
N
L
 
L
A
 
E
E
 
K
L
 
M
N
 
K
F
 
Y
D
 
D
M
 
M
T
 
A
Q
 
N

1cneA Structural studies on corn nitrate reductase: refined structure of the cytochrome b reductase fragment at 2.5 angstroms, its adp complex and an active site mutant and modeling of the cytochrome b domain (see paper)
26% identity, 58% coverage: 42:263/380 of query aligns to 14:255/260 of 1cneA

query
sites
1cneA
T
 
S
A
 
R
D
 
D
V
 
V
V
 
R
S
 
L
F
 
F
R
 
R
F
 
F
Q
 
S
A
 
L
G
 
P
E
 
S
P
 
P
M
 
D
K
 
Q
F
 
V
D
 
L
Y
 
G
K
 
L
P
 
P
-
 
I
G
 
G
Q
 
K
F
x
H
M
 
I
T
 
F
L
 
V
V
 
C
L
 
A
E
 
T
I
 
I
N
 
E
G
 
G
E
 
K
Q
 
L
A
 
C
C
 
M
R
|
R
S
x
A
Y
|
Y
T
|
T
L
 
P
S
 
T
S
 
S
T
 
M
P
 
V
S
 
D
R
 
E
-
 
I
-
 
G
P
 
H
Y
 
F
S
 
D
L
 
L
M
x
L
L
x
V
T
 
K
I
 
V
-
x
Y
-
 
F
-
 
K
-
 
N
-
 
E
-
x
H
-
 
P
K
 
K
R
 
F
V
 
P
D
 
N
G
|
G
G
 
G
L
 
L
V
x
M
S
x
T
N
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
I
 
-
D
 
D
H
 
S
L
 
L
Q
 
P
P
 
V
G
 
G
Q
 
S
T
 
Y
V
 
I
R
 
D
V
 
V
L
 
K
P
 
G
P
 
P
T
 
L
G
 
G
Q
 
H
-
 
V
-
 
E
-
 
Y
-
 
T
-
 
G
-
 
R
-
 
G
-
 
S
-
 
F
-
 
V
F
 
I
N
 
N
L
 
G
F
 
K
D
 
Q
I
 
R
P
 
N
A
 
A
K
 
R
K
 
R
Y
 
L
L
 
A
F
 
M
L
 
I
S
 
C
A
 
G
G
 
G
C
 
S
G
 
G
I
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
M
Y
 
Y
S
 
Q
M
 
I
S
 
I
R
 
Q
Y
 
A
L
 
V
T
 
L
D
 
R
S
 
D
Q
 
Q
M
 
P
-
 
E
-
 
D
N
 
H
A
 
T
D
 
E
I
 
M
A
 
H
F
 
L
V
 
V
H
 
Y
S
 
A
A
 
N
R
 
R
T
 
T
Q
 
E
A
 
D
D
 
D
I
 
I
I
 
L
F
 
L
K
 
R
T
 
D
S
 
E
L
 
L
E
 
D
T
 
R
M
 
W
A
 
A
T
 
A
R
 
E
H
 
Y
R
 
P
D
 
D
-
 
R
F
 
L
K
 
K
L
 
V
R
 
W
Y
 
Y
I
 
V
V
 
I
E
 
D
D
 
Q
V
 
V
T
 
K
-
 
R
A
 
P
D
 
E
T
 
E
A
 
G
W
 
W
H
 
K
P
 
-
E
 
-
A
 
-
V
 
-
L
 
-
H
 
Y
N
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
F
L
 
V
R
 
T
P
 
E
D
 
A
N
 
V
L
 
L
R
 
R
D
 
E
L
 
H
V
 
V
P
 
P
D
 
E
F
 
G
A
 
G
E
 
D
R
 
D
T
 
T
V
 
L
F
 
A
L
 
L
C
 
A
-
x
S
G
 
G
P
 
P
E
 
P
P
 
P
Y
 
M
M
 
I
Q
 
Q
-
 
F
A
 
A
V
 
I
K
 
S
T
 
P
I
 
N
L
 
L
A
 
E
E
 
K
L
 
M
N
 
K
F
 
Y
D
 
D
M
 
M
T
 
A
Q
 
N

Sites not aligning to the query:

1krhA X-ray structure of benzoate dioxygenase reductase (see paper)
24% identity, 63% coverage: 33:270/380 of query aligns to 112:335/337 of 1krhA

query
sites
1krhA
L
 
L
V
 
A
C
 
R
V
 
V
E
 
E
R
 
N
W
 
L
N
 
S
E
 
D
T
 
S
A
 
T
D
 
I
V
 
T
V
 
F
S
 
D
F
 
I
R
 
Q
F
 
L
Q
 
D
A
 
D
G
 
G
E
 
Q
P
 
P
M
 
-
K
 
D
F
 
I
D
 
H
Y
 
F
K
 
L
P
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
x
Y
M
 
V
T
 
N
L
 
V
V
 
T
L
 
L
E
 
P
I
 
-
N
 
-
G
 
G
E
 
T
Q
 
T
A
 
E
C
 
T
R
|
R
S
|
S
Y
|
Y
T
x
S
L
 
F
S
 
S
S
 
S
T
 
Q
P
 
P
S
 
G
R
 
N
P
 
R
Y
 
L
S
 
T
L
 
-
M
 
G
L
 
F
T
x
V
I
x
V
K
 
R
R
 
N
V
 
V
D
 
P
G
 
Q
G
|
G
L
x
K
V
x
M
S
|
S
N
 
E
Y
 
Y
L
 
L
I
 
S
D
 
V
H
 
Q
L
 
A
Q
 
K
P
 
A
G
 
G
Q
 
D
T
 
K
V
 
M
R
 
S
V
 
F
L
 
T
P
 
G
P
 
P
T
 
F
G
 
G
Q
 
S
F
 
F
N
 
Y
L
 
L
F
 
R
D
 
D
I
 
V
P
 
-
A
 
K
K
 
R
K
 
P
Y
 
V
L
 
L
F
 
M
L
 
L
S
 
A
A
 
G
G
 
G
C
x
T
G
 
G
I
 
I
T
 
A
P
 
P
M
 
F
Y
 
L
S
 
S
M
 
M
S
 
L
R
 
Q
Y
 
V
L
 
L
T
 
E
D
 
Q
S
 
K
Q
 
G
M
 
S
N
 
E
A
 
H
D
 
P
I
 
V
A
 
R
F
 
L
V
 
V
H
 
F
S
 
G
A
 
V
R
 
T