SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 7026544 FitnessBrowser__ANA3:7026544 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3p19A Improved NADPH-dependent blue fluorescent protein (see paper)
68% identity, 98% coverage: 6:243/243 of query aligns to 2:239/239 of 3p19A

query
sites
3p19A
Q
 
K
P
 
K
L
 
L
V
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
Q
 
R
F
 
F
S
 
S
A
 
E
A
 
E
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
|
A
R
|
R
R
|
R
V
 
V
E
 
E
P
 
R
M
 
L
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
N
L
 
L
P
 
P
N
 
N
S
 
T
L
 
L
A
 
C
I
 
A
G
 
Q
V
 
V
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
D
T
 
K
D
 
Y
A
 
T
I
 
F
K
 
D
A
 
T
A
 
A
I
 
I
N
 
T
Q
 
R
A
 
A
E
 
E
A
 
K
Q
 
I
F
 
Y
G
 
G
P
 
P
V
 
A
G
 
D
C
 
A
L
 
I
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
M
M
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
D
 
D
T
 
T
Q
 
Q
D
 
E
P
 
A
N
 
N
E
 
E
W
 
W
S
 
Q
R
 
R
M
 
M
L
 
F
N
 
D
I
 
V
N
 
N
V
 
V
M
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
L
N
 
N
G
 
G
I
 
M
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
P
M
 
M
K
 
K
A
 
A
R
 
R
K
 
N
T
 
C
G
 
G
T
 
T
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
K
K
 
K
T
 
T
F
 
F
P
 
P
N
 
D
H
 
H
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
C
A
 
G
T
 
T
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
I
T
 
S
E
 
E
N
 
N
I
 
V
R
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
M
 
A
D
 
S
D
 
N
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
M
T
 
T
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
 
S
A
|
A
V
|
V
E
 
K
T
|
T
E
|
E
L
|
L
L
 
L
S
 
S
H
 
H
T
 
T
T
 
T
D
 
S
D
 
Q
A
 
Q
I
 
I
K
 
K
A
 
D
G
 
G
Y
 
Y
Q
 
D
D
 
A
W
 
W
K
 
R
V
 
V
Q
 
D
M
 
M
G
 
G
G
 
G
V
 
V
I
 
L
A
 
A
P
 
A
E
 
D
N
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
R
A
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
A
 
A
W
 
Y
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
N
 
N
V
 
V
C
 
C
V
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
T
R
 
K
Q
 
Q
Q
 
Q
P
 
P

A0A1U8QWA2 Glycine betaine reductase ATRR; Nonribosomal peptide synthetase-like protein ATRR; EC 1.2.1.-; EC 1.1.1.- from Emericella nidulans (strain FGSC A4 / ATCC 38163 / CBS 112.46 / NRRL 194 / M139) (Aspergillus nidulans) (see paper)
37% identity, 99% coverage: 4:243/243 of query aligns to 1023:1269/1270 of A0A1U8QWA2

query
sites
A0A1U8QWA2
P
 
P
T
 
K
Q
 
G
P
|
P
L
|
L
-
x
S
-
x
G
-
x
K
-
x
V
V
x
A
V
|
V
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
S
|
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
|
G
A
|
A
A
|
A
I
x
V
A
|
A
K
x
T
Q
x
A
F
x
L
S
x
A
A
x
R
A
x
E
G
|
G
H
x
A
P
x
H
L
x
V
L
x
A
L
|
L
L
x
G
A
|
A
R
|
R
R
|
R
V
x
L
E
x
D
P
x
A
M
x
L
Q
x
E
A
x
S
L
|
L
E
x
K
L
x
E
P
x
K
N
x
L
S
|
S
L
 
-
A
|
A
I
x
S
G
|
G
V
|
V
-
x
K
-
x
V
-
x
V
-
x
T
-
x
C
-
x
K
-
x
T
D
|
D
V
|
V
T
|
T
D
|
D
T
x
R
D
x
K
A
x
Q
I
x
V
K
x
E
A
x
G
A
x
L
I
x
V
N
x
K
Q
x
A
A
|
A
E
x
T
A
x
E
Q
x
E
F
x
L
G
|
G
P
|
P
V
|
V
G
x
D
C
x
I
L
|
L
I
x
V
N
x
A
N
x
C
A
|
A
G
|
G
V
|
V
M
|
M
L
x
Y
L
x
F
G
x
T
Q
x
M
I
x
M
D
x
A
T
x
N
Q
x
T
D
x
Q
P
x
M
N
x
D
E
|
E
W
|
W
S
x
E
R
|
R
M
x
T
L
x
V
N
x
D
I
x
V
N
|
N
V
x
C
M
x
K
G
|
G
V
x
I
L
|
L
N
|
N
G
x
S
I
x
L
H
x
A
A
x
S
V
x
T
L
x
V
A
x
P
G
|
G
M
|
M
K
x
L
A
|
A
R
|
R
K
x
G
T
x
K
G
|
G
T
x
H
I
x
V
I
x
V
N
x
A
I
|
I
S
|
S
S
|
S
V
x
D
A
|
A
G
|
G
R
|
R
K
|
K
T
x
V
F
|
F
P
|
P
N
x
G
H
x
L
A
x
G
A
x
V
Y
|
Y
C
x
S
A
|
A
T
x
S
K
|
K
F
|
F
A
x
F
V
|
V
H
x
E
A
|
A
L
x
T
T
x
L
E
x
Q
N
x
A
I
x
L
R
|
R
E
x
L
E
|
E
V
x
T
A
|
A
M
x
G
D
x
Q
D
x
G
V
x
L
R
|
R
L
x
V
I
x
T
T
x
A
I
x
V
A
x
Q
P
|
P
G
|
G
A
x
N
V
x
T
E
x
A
T
|
T
E
x
D
L
|
L
L
|
L
S
x
G
H
x
M
T
x
S
T
|
T
D
|
D
-
x
A
D
x
E
A
|
A
I
|
I
K
|
K
A
x
K
G
x
Y
Y
x
G
Q
x
E
D
x
P
W
x
S
K
x
G
V
x
A
Q
|
Q
M
 
-
G
 
-
G
 
-
V
x
I
I
x
L
A
x
D
P
|
P
E
|
E
N
x
D
V
|
V
A
|
A
A
x
N
A
x
S
A
x
I
L
x
I
F
x
Y
A
|
A
W
x
L
Q
x
R
Q
|
Q
P
|
P
Q
x
E
N
x
H
V
|
V
C
 
A
V
 
M
R
 
N
E
 
E
I
 
I
V
 
L
L
 
I
A
 
E
P
 
P
T
 
-
R
 
R
Q
 
D
Q
 
E
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2japA Clavulanic acid dehydrogenase: structural and biochemical analysis of the final step in the biosynthesis of the beta- lactamase inhibitor clavulanic acid (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:241/243 of query aligns to 9:244/245 of 2japA

query
sites
2japA
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
E
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
R
Q
 
A
F
 
L
S
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
H
 
A
P
 
A
L
 
V
L
 
A
L
 
I
L
 
A
A
|
A
R
|
R
R
|
R
V
 
V
E
 
E
P
 
K
M
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
-
 
G
-
 
D
E
 
E
L
 
L
P
 
T
N
 
A
S
 
A
L
 
G
A
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
H
-
 
V
I
 
L
G
 
E
V
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
T
 
R
D
 
Q
A
 
G
I
 
V
K
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
V
N
 
A
Q
 
S
A
 
T
E
 
V
A
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
G
P
 
G
V
 
L
G
 
D
C
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
M
|
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
P
I
 
V
D
 
E
T
 
D
Q
 
A
D
 
D
P
 
T
N
 
T
E
 
D
W
 
W
S
 
T
R
 
R
M
 
M
L
 
I
N
 
D
I
x
T
N
 
N
V
 
L
M
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
M
N
 
Y
G
 
M
I
 
T
H
 
R
A
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
P
G
 
H
M
 
L
K
 
-
A
 
L
R
 
R
K
 
S
T
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
V
I
 
V
N
 
Q
I
x
M
S
|
S
S
|
S
V
 
I
A
|
A
G
 
G
R
 
R
K
 
V
T
 
N
F
 
V
P
 
R
N
 
N
H
 
A
A
 
A
A
 
V
Y
|
Y
C
 
Q
A
 
A
T
 
T
K
|
K
F
 
F
A
 
G
V
 
V
H
 
N
A
 
A
L
 
F
T
 
S
E
 
E
N
 
T
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
E
 
E
V
 
V
A
 
T
M
 
E
D
 
R
D
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
V
T
 
V
I
 
I
A
 
E
P
|
P
G
 
G
A
x
T
V
x
T
E
 
D
T
|
T
E
|
E
L
|
L
L
 
R
S
 
G
H
 
H
T
 
I
T
 
T
D
 
H
D
 
T
A
|
A
I
 
T
K
 
K
A
 
E
G
 
M
Y
|
Y
Q
 
E
D
 
Q
W
x
R
K
 
I
V
 
S
Q
 
Q
M
 
I
G
 
R
G
 
K
V
 
L
I
 
Q
A
 
A
P
 
-
E
 
Q
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
R
F
 
Y
A
 
A
W
 
V
Q
 
T
Q
 
A
P
 
P
Q
 
H
N
 
H
V
 
A
C
 
T
V
 
V
R
 
H
E
 
E
I
 
I
V
 
F
L
 
I
A
 
R
P
 
P
T
 
T
R
 
D
Q
 
Q

2jahC Biochemical and structural analysis of the clavulanic acid dehydeogenase (cad) from streptomyces clavuligerus (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:241/243 of query aligns to 10:245/246 of 2jahC

query
sites
2jahC
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
E
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
R
Q
 
A
F
 
L
S
 
A
A
 
A
A
 
E
G
 
G
H
 
A
P
 
A
L
 
V
L
 
A
L
 
I
L
 
A
A
|
A
R
|
R
R
|
R
V
 
V
E
 
E
P
 
K
M
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
-
 
G
-
 
D
E
 
E
L
 
L
P
 
T
N
 
A
S
 
A
L
 
G
A
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
H
-
 
V
I
 
L
G
 
E
V
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
D
T
 
R
D
 
Q
A
 
G
I
 
V
K
 
D
A
 
A
A
 
A
I
 
V
N
 
A
Q
 
S
A
 
T
E
 
V
A
 
E
Q
 
A
F
 
L
G
 
G
P
 
G
V
 
L
G
 
D
C
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
M
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
Q
 
P
I
 
V
D
 
E
T
 
D
Q
 
A
D
 
D
P
 
T
N
 
T
E
 
D
W
 
W
S
 
T
R
 
R
M
 
M
L
 
I
N
 
D
I
x
T
N
 
N
V
 
L
M
 
L
G
 
G
V
 
L
L
 
M
N
 
Y
G
 
M
I
 
T
H
 
R
A
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
P
G
 
H
M
 
L
K
 
-
A
 
L
R
 
R
K
 
S
T
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
V
I
 
V
N
 
Q
I
x
M
S
 
S
S
|
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
V
T
 
N
F
 
V
P
 
R
N
 
N
H
 
A
A
 
A
A
 
V
Y
|
Y
C
 
Q
A
 
A
T
 
T
K
|
K
F
 
F
A
 
G
V
 
V
H
 
N
A
 
A
L
 
F
T
 
S
E
 
E
N
 
T
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
E
 
E
V
 
V
A
 
T
M
 
E
D
 
R
D
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
V
T
 
V
I
 
I
A
 
E
P
|
P
G
|
G
A
x
T
V
x
T
E
 
D
T
|
T
E
|
E
L
|
L
L
 
R
S
 
G
H
 
H
T
 
I
T
 
T
D
 
H
D
 
T
A
|
A
I
 
T
K
 
K
A
 
E
G
 
M
Y
 
Y
Q
 
E
D
 
Q
W
 
R
K
 
I
V
 
S
Q
 
Q
M
 
I
G
 
R
G
 
K
V
 
L
I
 
Q
A
 
A
P
 
-
E
 
Q
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
R
F
 
Y
A
 
A
W
 
V
Q
 
T
Q
 
A
P
 
P
Q
 
H
N
 
H
V
 
A
C
 
T
V
 
V
R
 
H
E
 
E
I
 
I
V
 
F
L
 
I
A
 
R
P
 
P
T
 
T
R
 
D
Q
 
Q

Q05016 NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase; L-allo-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.-; EC 1.1.1.381 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast)
35% identity, 96% coverage: 9:241/243 of query aligns to 16:258/267 of Q05016

query
sites
Q05016
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
A
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
L
Q
 
E
F
 
Y
S
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
S
H
 
N
-
 
G
-
 
D
-
 
M
P
 
K
L
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
L
E
 
E
P
 
K
M
 
L
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
T
-
 
I
-
 
D
-
 
Q
E
 
E
L
 
F
P
 
P
N
 
N
S
 
A
L
 
K
A
 
V
-
 
H
-
 
V
I
 
A
G
 
Q
V
 
L
D
 
D
V
 
I
T
 
T
D
 
Q
T
 
A
D
 
E
A
 
K
I
 
I
K
 
K
A
 
P
A
 
F
I
 
I
N
 
E
Q
 
N
A
 
L
E
 
P
A
 
Q
Q
 
E
F
 
F
G
 
K
P
 
D
V
 
I
G
 
D
C
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
K
M
 
A
L
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
R
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
D
 
A
T
 
T
Q
 
E
D
 
D
P
 
I
N
 
Q
E
 
D
W
 
-
S
 
-
R
 
-
M
 
V
L
 
F
N
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
V
M
 
T
G
 
A
V
 
L
L
 
I
N
 
N
G
 
I
I
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
P
G
 
I
M
 
F
K
 
Q
A
 
A
R
 
K
K
 
N
T
 
S
G
 
G
T
 
D
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
L
S
 
G
S
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
D
T
 
A
F
 
Y
P
 
P
N
 
T
H
 
G
A
 
S
A
 
I
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
T
 
S
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
H
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
E
 
D
N
 
S
I
 
L
R
 
R
E
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
I
M
 
N
D
 
T
D
 
K
V
 
I
R
 
R
L
 
V
I
 
I
T
 
L
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
L
V
 
V
E
 
E
T
 
T
E
 
E
L
 
F
-
 
S
-
 
L
-
 
V
L
 
R
S
 
Y
H
 
R
T
 
G
T
 
N
D
 
E
D
 
E
A
 
Q
I
 
A
K
 
K
A
 
N
G
 
V
Y
 
Y
Q
 
K
D
 
D
W
 
T
K
 
T
V
 
P
Q
 
L
M
 
M
G
 
A
G
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
D
N
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
D
A
 
L
A
 
I
L
 
V
F
 
Y
A
 
A
W
 
T
Q
 
S
Q
 
R
P
 
K
Q
 
Q
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
I
R
 
A
E
 
D
I
 
T
V
 
L
L
 
I
A
 
F
P
 
P
T
 
T
R
 
N
Q
 
Q

3rkuA Substrate fingerprint and the structure of NADP+ dependent serine dehydrogenase from saccharomyces cerevisiae complexed with NADP+
35% identity, 96% coverage: 9:241/243 of query aligns to 17:259/268 of 3rkuA

query
sites
3rkuA
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
 
A
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
K
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
L
Q
 
E
F
 
Y
S
 
L
A
 
E
A
 
A
G
 
S
H
 
N
-
 
G
-
 
D
-
 
M
P
 
K
L
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
A
A
 
A
R
|
R
R
|
R
V
 
L
E
 
E
P
 
K
M
 
L
Q
 
E
A
 
E
L
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
T
-
 
I
-
 
D
-
 
Q
E
 
E
L
 
F
P
 
P
N
 
N
S
 
A
L
 
K
A
 
V
-
 
H
-
 
V
I
 
A
G
 
Q
V
 
L
D
|
D
V
x
I
T
 
T
D
 
Q
T
 
A
D
 
E
A
 
K
I
 
I
K
 
K
A
 
P
A
 
F
I
 
I
N
 
E
Q
 
N
A
 
L
E
 
P
A
 
Q
Q
 
E
F
 
F
G
 
K
P
 
D
V
 
I
G
 
D
C
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
K
M
x
A
L
 
L
-
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
R
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
D
 
A
T
 
T
Q
 
E
D
 
D
P
 
I
N
 
Q
E
 
D
W
 
-
S
 
-
R
 
-
M
 
V
L
 
F
N
 
D
I
 
T
N
|
N
V
 
V
M
 
T
G
 
A
V
 
L
L
 
I
N
 
N
G
 
I
I
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
P
G
 
I
M
 
F
K
 
Q
A
 
A
R
 
K
K
 
N
T
 
S
G
 
G
T
 
D
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
L
S
 
G
S
|
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
D
T
 
A
F
 
Y
P
 
P
N
 
T
H
 
G
A
 
S
A
 
I
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
T
 
S
K
|
K
F
 
F
A
 
A
V
 
V
H
 
G
A
 
A
L
 
F
T
 
T
E
 
D
N
 
S
I
 
L
R
 
R
E
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
I
M
 
N
D
 
T
D
 
K
V
 
I
R
 
R
L
 
V
I
 
I
T
 
L
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
L
V
|
V
E
 
E
T
|
T
E
|
E
L
x
F
-
 
S
-
 
L
-
 
V
L
 
R
S
 
Y
H
 
R
T
 
G
T
x
N
D
 
E
D
 
E
A
 
Q
I
 
A
K
 
K
A
 
N
G
 
V
Y
 
Y
Q
 
K
D
 
D
W
 
T
K
 
T
V
 
P
Q
 
L
M
 
M
G
 
A
G
 
-
V
 
-
I
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
D
N
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
D
A
 
L
A
 
I
L
 
V
F
 
Y
A
 
A
W
 
T
Q
 
S
Q
 
R
P
 
K
Q
 
Q
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
I
R
 
A
E
 
D
I
 
T
V
 
L
L
 
I
A
 
F
P
 
P
T
 
T
R
 
N
Q
 
Q

2ehdB Crystal structure analysis of oxidoreductase
33% identity, 95% coverage: 9:239/243 of query aligns to 7:213/213 of 2ehdB

query
sites
2ehdB
V
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
E
A
 
A
I
 
T
A
 
A
K
 
R
Q
 
L
F
 
L
S
 
H
A
 
A
A
 
K
G
 
G
H
 
Y
P
 
R
L
 
V
L
 
G
L
 
L
L
 
M
A
 
A
R
|
R
R
x
D
V
 
E
E
 
K
P
 
R
M
 
L
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
-
 
A
-
 
A
E
 
E
L
 
L
P
 
E
N
 
G
S
 
A
L
 
L
A
 
P
I
 
L
G
 
P
V
 
G
D
 
D
V
 
V
T
 
R
D
 
E
T
 
E
D
 
G
A
 
D
I
 
W
K
 
A
A
 
R
A
 
A
I
 
V
N
 
A
Q
 
A
A
 
M
E
 
E
A
 
E
Q
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
E
V
 
L
G
 
S
C
 
A
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
G
L
 
V
L
 
M
G
 
K
Q
 
P
I
 
V
D
 
H
T
 
E
Q
 
L
D
 
T
P
 
L
N
 
E
E
 
E
W
 
W
S
 
R
R
 
L
M
 
V
L
 
L
N
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
L
M
 
T
G
 
G
V
 
A
L
 
F
N
 
L
G
 
G
I
 
I
H
 
R
A
 
H
V
 
A
L
 
V
A
 
P
G
 
A
M
 
L
K
 
L
A
 
R
R
 
R
K
 
G
T
 
G
G
 
G
T
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
V
S
x
G
S
 
S
V
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
K
K
 
N
T
 
P
F
 
F
P
 
K
N
 
G
H
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
T
 
S
K
|
K
F
 
F
A
 
G
V
 
L
H
 
L
A
 
G
L
 
L
T
 
A
E
 
G
N
 
A
I
 
A
R
 
M
E
 
L
E
 
D
V
 
L
A
 
R
M
 
E
D
 
A
D
 
N
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
V
T
 
N
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
S
V
 
V
E
 
K
T
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
S
 
-
H
 
-
T
 
-
T
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
Y
 
-
Q
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
V
 
-
Q
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
-
V
 
-
I
 
L
A
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
A
 
A
W
 
L
Q
 
E
Q
 
M
P
 
P
Q
 
G
N
 
H
V
 
A
C
 
M
V
 
V
R
 
S
E
 
E
I
 
I
V
 
E
L
 
L
A
 
R
P
 
P
T
 
T

Q9P7B4 NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase; L-allo-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.381 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:241/243 of query aligns to 1:248/259 of Q9P7B4

query
sites
Q9P7B4
M
 
M
T
 
S
K
 
R
P
 
L
T
 
D
Q
 
G
P
 
K
L
 
T
V
 
I
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
G
 
G
A
 
K
A
 
S
I
 
T
A
 
A
K
 
F
Q
 
E
F
 
I
S
 
A
-
 
K
A
 
V
A
 
A
G
 
K
H
 
V
P
 
K
L
 
L
L
 
I
L
 
L
L
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
F
E
x
S
P
x
T
M
 
V
Q
 
E
-
 
E
-
 
I
A
 
A
L
 
K
E
 
E
L
 
L
P
 
E
N
 
S
S
 
K
L
 
Y
A
 
E
I
 
V
G
 
S
V
 
V
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
K
-
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
S
D
 
D
T
 
L
D
 
K
A
 
S
I
 
I
K
 
P
A
 
G
A
 
V
I
 
I
N
 
E
Q
 
S
A
 
L
E
 
P
A
 
K
Q
 
E
F
 
F
G
 
A
P
 
D
V
 
I
G
 
D
C
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
-
M
 
L
L
 
A
L
 
L
G
 
G
Q
 
T
I
 
D
D
 
K
T
 
V
Q
 
I
D
 
D
P
 
L
N
 
N
-
 
I
-
 
D
E
 
D
W
 
A
S
 
V
R
 
T
M
 
M
L
 
I
N
 
T
I
 
T
N
 
N
V
 
V
M
 
L
G
 
G
V
 
M
L
 
M
N
 
A
G
 
M
I
 
T
H
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
P
G
 
I
M
 
F
K
 
Y
A
 
S
R
 
K
K
 
N
T
 
K
G
 
G
T
 
D
I
 
I
I
 
L
N
 
N
I
 
V
S
 
G
S
 
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
R
K
 
E
T
 
S
F
 
Y
P
 
V
N
 
G
H
 
G
A
 
S
A
 
V
Y
 
Y
C
 
C
A
 
S
T
 
T
K
 
K
F
 
S
A
 
A
V
 
L
H
 
A
A
 
Q
L
 
F
T
 
T
E
 
S
N
 
A
I
 
L
R
 
R
E
 
K
E
 
E
V
 
T
A
 
I
M
 
D
D
 
T
D
 
R
V
 
I
R
 
R
L
 
I
I
 
M
T
 
E
I
 
V
A
 
D
P
 
P
G
 
G
A
 
L
V
 
V
E
 
E
T
 
T
E
 
E
L
 
F
-
 
S
L
 
V
S
 
V
H
 
R
T
 
F
T
 
H
D
 
G
D
 
D
A
 
K
I
 
Q
K
 
K
A
 
A
G
 
-
Y
 
-
Q
 
-
D
 
D
W
 
N
K
 
V
V
 
Y
Q
 
K
M
 
N
G
 
S
G
 
E
V
 
P
I
 
L
A
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
V
A
 
I
L
 
L
F
 
F
A
 
A
W
 
L
Q
 
T
Q
 
R
P
 
R
Q
 
E
N
 
N
V
 
V
C
 
V
V
 
I
R
 
A
E
 
D
I
 
T
V
 
L
L
 
V
A
 
F
P
 
P
T
 
S
R
 
H
Q
 
Q

Q8KES3 Sepiapterin reductase; SPR; cSR; EC 1.1.1.325 from Chlorobaculum tepidum (strain ATCC 49652 / DSM 12025 / NBRC 103806 / TLS) (Chlorobium tepidum) (see 2 papers)
30% identity, 96% coverage: 6:239/243 of query aligns to 2:237/244 of Q8KES3

query
sites
Q8KES3
Q
 
K
P
 
H
L
 
I
V
 
L
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
|
A
S
x
G
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
|
G
A
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
L
Q
 
E
F
 
F
S
 
A
A
 
R
A
 
A
G
 
A
-
 
R
-
 
H
H
 
H
P
 
P
-
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
P
-
 
V
L
 
L
L
 
V
L
 
L
L
 
S
A
x
S
R
|
R
R
x
T
V
 
A
E
 
A
P
 
D
M
 
L
Q
 
E
A
 
K
L
 
I
E
 
S
L
 
L
P
 
E
N
 
C
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
L
S
 
T
L
 
D
A
 
T
I
 
I
G
 
T
V
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
S
D
 
D
T
 
M
D
 
A
A
 
D
I
 
V
K
 
R
A
 
R
A
 
L
I
 
T
N
 
T
Q
 
H
A
 
I
E
 
V
A
 
E
Q
 
R
F
 
Y
G
 
G
P
 
H
V
 
I
G
 
D
C
 
C
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
M
 
G
L
 
R
L
x
F
G
 
G
Q
 
A
I
 
L
D
 
S
T
 
D
Q
 
L
D
 
T
P
 
E
N
 
E
E
 
D
W
 
F
S
 
D
R
 
Y
M
 
T
L
 
M
N
 
N
I
x
T
N
 
N
V
 
L
M
 
K
G
 
G
V
 
T
L
 
F
N
 
F
G
 
L
I
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
L
 
F
A
 
A
G
 
L
M
 
M
K
 
E
A
 
R
R
 
Q
K
 
H
T
 
S
G
 
G
T
 
H
I
 
I
I
 
F
N
 
F
I
 
I
S
 
T
S
|
S
V
 
V
A
 
A
G
 
A
R
 
T
K
 
K
T
 
A
F
 
F
P
 
R
N
 
H
H
 
S
A
 
S
A
 
I
Y
|
Y
C
 
C
A
 
M
T
 
S
K
|
K
F
 
F
A
 
G
V
 
Q
H
 
R
A
 
G
L
 
L
T
 
V
E
 
E
N
 
T
I
 
M
R
 
R
E
 
L
E
 
Y
V
 
A
A
 
R
M
 
K
D
 
C
D
 
N
V
 
V
R
 
R
L
 
I
I
 
T
T
 
D
I
 
V
A
 
Q
P
 
P
G
 
G
A
 
A
V
|
V
E
x
Y
T
|
T
E
x
P
L
x
M
L
x
W
S
 
G
H
 
-
T
 
K
T
 
V
D
 
D
D
 
D
A
 
E
I
 
M
K
 
Q
A
 
A
G
 
-
Y
 
-
Q
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
V
 
-
Q
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
L
V
 
M
I
 
M
A
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
P
A
 
V
L
 
V
F
 
Q
A
 
A
W
 
Y
Q
 
L
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
S
N
 
R
V
 
T
C
 
V
V
 
V
R
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
R
P
 
P
T
 
T

2bd0D Chlorobium tepidum sepiapterin reductase complexed with NADP and sepiapterin (see paper)
30% identity, 96% coverage: 6:239/243 of query aligns to 1:236/240 of 2bd0D

query
sites
2bd0D
Q
 
K
P
 
H
L
 
I
V
 
L
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
x
K
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
L
Q
 
E
F
 
F
S
 
A
A
 
R
A
 
A
G
 
A
-
 
R
-
 
H
H
 
H
P
 
P
-
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
P
-
 
V
L
 
L
L
 
V
L
 
L
L
 
S
A
x
S
R
|
R
R
x
T
V
 
A
E
 
A
P
 
D
M
 
L
Q
 
E
A
 
K
L
 
I
E
 
S
L
 
L
P
 
E
N
 
C
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
L
S
 
T
L
 
D
A
 
T
I
 
I
G
 
T
V
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
S
D
 
D
T
 
M
D
 
A
A
 
D
I
 
V
K
 
R
A
 
R
A
 
L
I
 
T
N
 
T
Q
 
H
A
 
I
E
 
V
A
 
E
Q
 
R
F
 
Y
G
 
G
P
 
H
V
 
I
G
 
D
C
 
C
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
|
V
M
 
G
L
 
R
L
x
F
G
 
G
Q
 
A
I
 
L
D
 
S
T
 
D
Q
 
L
D
 
T
P
 
E
N
 
E
E
 
D
W
 
F
S
 
D
R
 
Y
M
 
T
L
 
M
N
 
N
I
x
T
N
 
N
V
 
L
M
 
K
G
 
G
V
 
T
L
 
F
N
 
F
G
 
L
I
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
L
 
F
A
 
A
G
 
L
M
 
M
K
 
E
A
 
R
R
 
Q
K
 
H
T
 
S
G
 
G
T
 
H
I
 
I
I
 
F
N
 
F
I
 
I
S
 
T
S
|
S
V
 
V
A
 
A
G
 
A
R
 
T
K
 
K
T
 
A
F
 
F
P
 
R
N
 
H
H
 
S
A
 
S
A
 
I
Y
|
Y
C
 
C
A
 
M
T
 
S
K
|
K
F
 
F
A
 
G
V
 
Q
H
 
R
A
 
G
L
 
L
T
 
V
E
 
E
N
 
T
I
 
M
R
 
R
E
 
L
E
 
Y
V
 
A
A
 
R
M
 
K
D
 
C
D
 
N
V
 
V
R
 
R
L
 
I
I
 
T
T
 
D
I
 
V
A
 
Q
P
|
P
G
 
G
A
|
A
V
|
V
E
 
Y
T
|
T
E
x
P
L
x
M
L
x
W
S
 
G
H
 
-
T
 
K
T
 
V
D
 
D
D
 
D
A
 
E
I
 
M
K
 
Q
A
 
A
G
 
-
Y
 
-
Q
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
V
 
-
Q
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
L
V
 
M
I
 
M
A
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
P
A
 
V
L
 
V
F
 
Q
A
 
A
W
 
Y
Q
 
L
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
S
N
 
R
V
 
T
C
 
V
V
 
V
R
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
R
P
 
P
T
 
T

2bd0A Chlorobium tepidum sepiapterin reductase complexed with NADP and sepiapterin (see paper)
30% identity, 96% coverage: 6:239/243 of query aligns to 1:236/240 of 2bd0A

query
sites
2bd0A
Q
 
K
P
 
H
L
 
I
V
 
L
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
G
S
x
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
L
Q
 
E
F
 
F
S
 
A
A
 
R
A
 
A
G
 
A
-
 
R
-
 
H
H
 
H
P
 
P
-
 
D
-
 
F
-
 
E
-
 
P
-
 
V
L
 
L
L
 
V
L
 
L
L
 
S
A
 
S
R
|
R
R
x
T
V
 
A
E
 
A
P
 
D
M
 
L
Q
 
E
A
 
K
L
 
I
E
 
S
L
 
L
P
 
E
N
 
C
-
 
R
-
 
A
-
 
E
-
 
G
-
 
A
-
 
L
S
 
T
L
 
D
A
 
T
I
 
I
G
 
T
V
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
S
D
 
D
T
 
M
D
 
A
A
 
D
I
 
V
K
 
R
A
 
R
A
 
L
I
 
T
N
 
T
Q
 
H
A
 
I
E
 
V
A
 
E
Q
 
R
F
 
Y
G
 
G
P
 
H
V
 
I
G
 
D
C
 
C
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
|
V
M
 
G
L
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
A
I
 
L
D
 
S
T
 
D
Q
 
L
D
 
T
P
 
E
N
 
E
E
 
D
W
 
F
S
 
D
R
 
Y
M
 
T
L
 
M
N
 
N
I
x
T
N
 
N
V
 
L
M
 
K
G
 
G
V
 
T
L
 
F
N
 
F
G
 
L
I
 
T
H
 
Q
A
 
A
V
 
L
L
 
F
A
 
A
G
 
L
M
 
M
K
 
E
A
 
R
R
 
Q
K
 
H
T
 
S
G
 
G
T
 
H
I
 
I
I
 
F
N
 
F
I
|
I
S
 
T
S
|
S
V
 
V
A
 
A
G
 
A
R
 
T
K
 
K
T
 
A
F
 
F
P
 
R
N
 
H
H
 
S
A
 
S
A
 
I
Y
|
Y
C
 
C
A
 
M
T
 
S
K
|
K
F
 
F
A
 
G
V
 
Q
H
 
R
A
 
G
L
 
L
T
 
V
E
 
E
N
 
T
I
 
M
R
 
R
E
 
L
E
 
Y
V
 
A
A
 
R
M
 
K
D
 
C
D
 
N
V
 
V
R
 
R
L
 
I
I
 
T
T
 
D
I
 
V
A
 
Q
P
|
P
G
 
G
A
|
A
V
|
V
E
 
Y
T
|
T
E
x
P
L
x
M
L
x
W
S
 
G
H
 
-
T
 
K
T
 
V
D
 
D
D
 
D
A
 
E
I
 
M
K
 
Q
A
 
A
G
 
-
Y
 
-
Q
 
-
D
 
-
W
 
-
K
 
-
V
 
-
Q
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
L
V
 
M
I
 
M
A
 
M
P
 
P
E
 
E
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
P
A
 
V
L
 
V
F
 
Q
A
 
A
W
 
Y
Q
 
L
Q
 
Q
P
 
P
Q
 
S
N
 
R
V
 
T
C
 
V
V
 
V
R
 
E
E
 
E
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
R
P
 
P
T
 
T

3rkrA Crystal structure of a metagenomic short-chain oxidoreductase (sdr) in complex with NADP (see paper)
37% identity, 73% coverage: 8:185/243 of query aligns to 7:191/221 of 3rkrA

query
sites
3rkrA
L
 
V
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
 
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
R
Q
 
K
F
 
L
S
 
G
A
 
S
A
 
L
G
 
G
H
 
A
P
 
R
L
 
V
L
 
V
L
 
L
L
 
T
A
|
A
R
|
R
R
x
D
V
 
V
E
 
E
P
 
K
M
 
L
Q
 
R
A
 
A
L
 
V
E
 
E
L
 
R
P
 
E
N
 
I
S
 
V
L
 
A
A
 
A
I
 
G
G
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
H
-
 
A
V
x
C
D
|
D
V
x
L
T
 
S
D
 
H
T
 
S
D
 
D
A
 
A
I
 
I
K
 
A
A
 
A
A
 
F
I
 
A
N
 
T
Q
 
G
A
 
V
E
 
L
A
 
A
Q
 
A
F
 
H
G
 
G
P
 
R
V
 
C
G
 
D
C
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
V
|
V
M
x
G
L
 
W
L
 
F
G
 
G
Q
 
G
-
 
P
I
 
L
D
 
H
T
 
T
Q
 
M
D
 
K
P
 
P
N
 
A
E
 
E
W
 
W
S
 
D
R
 
A
M
 
L
L
 
I
N
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
L
M
 
K
G
 
A
V
 
P
L
 
Y
N
 
L
G
 
L
I
 
L
H
 
R
A
 
A
V
 
F
L
 
A
A
 
P
G
 
A
M
 
M
K
 
I
A
 
A
R
 
A
K
 
K
T
 
R
G
 
G
T
 
H
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
V
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
K
K
 
N
T
 
P
F
 
V
P
 
A
N
 
D
H
 
G
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
T
A
 
A
T
 
S
K
|
K
F
 
W
A
 
G
V
 
L
H
 
N
A
 
G
L
 
L
T
 
M
E
 
T
N
 
S
I
 
A
R
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
R
M
 
Q
D
 
H
D
 
Q
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
S
T
 
L
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
S
V
 
V
E
 
A
T
 
I
E
 
E

6wprA Crystal structure of a putative 3-oxoacyl-acp reductase (fabg) with NADP(h) from acinetobacter baumannii (see paper)
30% identity, 89% coverage: 6:221/243 of query aligns to 5:221/244 of 6wprA

query
sites
6wprA
Q
 
R
P
 
K
L
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
Q
Q
 
Q
F
 
L
S
 
I
A
 
Q
A
 
D
G
 
G
H
 
Y
P
 
-
L
 
-
L
 
F
L
 
V
L
 
V
A
 
G
R
 
T
R
 
A
V
x
T
E
 
S
P
 
E
M
 
S
Q
 
G
A
 
A
L
 
Q
E
 
K
L
 
L
P
 
T
N
 
D
S
 
S
L
 
F
A
 
G
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
G
I
 
L
G
 
A
V
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
R
D
 
N
T
 
L
D
 
D
A
 
E
I
 
I
K
 
E
A
 
A
A
 
V
I
 
V
N
 
S
Q
 
H
A
 
I
E
 
E
A
 
Q
Q
 
N
F
 
Y
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
L
C
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
M
 
T
L
 
K
L
 
D
G
 
N
Q
 
L
I
 
L
D
 
L
T
 
R
Q
 
M
D
 
S
P
 
E
N
 
D
E
 
D
W
 
W
S
 
D
R
 
D
M
 
I
L
 
L
N
 
N
I
 
I
N
 
H
V
 
L
M
 
K
G
 
A
V
 
V
L
 
Y
N
 
R
G
 
L
I
 
S
H
 
K
A
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
K
G
 
G
M
 
M
K
 
T
A
 
K
R
 
A
K
 
R
T
 
F
G
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
V
G
 
A
R
 
H
K
 
F
T
 
A
F
 
N
P
 
P
N
 
G
H
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
I
H
 
E
A
 
A
L
 
F
T
 
S
E
 
R
N
 
S
I
 
L
R
 
A
E
 
K
E
 
E
V
 
M
A
 
G
M
 
S
D
 
R
D
 
Q
V
 
I
R
 
T
L
 
V
I
 
N
T
 
S
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
A
 
F
V
 
I
E
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
M
L
 
T
S
 
D
H
 
A
T
 
L
T
 
S
D
 
E
D
 
D
A
 
-
I
 
I
K
 
R
A
 
K
G
 
K
Y
 
M
Q
 
S
D
 
D
W
 
-
K
 
Q
V
 
V
Q
 
A
M
 
L
G
 
N
G
 
R
V
 
L
I
 
G
A
 
E
P
 
P
E
 
Q
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
A
A
 
V
L
 
S
F
 
F

6t62A Crystal structure of acinetobacter baumannii fabg in complex with NADPH at 1.8 a resolution (see paper)
30% identity, 89% coverage: 6:221/243 of query aligns to 5:221/244 of 6t62A

query
sites
6t62A
Q
 
R
P
 
K
L
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
|
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
K
 
Q
Q
 
Q
F
 
L
S
 
I
A
 
Q
A
 
D
G
 
G
H
 
Y
P
 
-
L
 
-
L
 
F
L
 
V
L
 
V
A
 
G
R
 
T
R
x
A
V
x
T
E
 
S
P
 
E
M
 
S
Q
 
G
A
 
A
L
 
Q
E
 
K
L
 
L
P
 
T
N
 
D
S
 
S
L
 
F
A
 
G
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
G
I
 
L
G
 
A
V
x
L
D
|
D
V
|
V
T
 
R
D
 
N
T
 
L
D
 
D
A
 
E
I
 
I
K
 
E
A
 
A
A
 
V
I
 
V
N
 
S
Q
 
H
A
 
I
E
 
E
A
 
Q
Q
 
N
F
 
Y
G
 
G
P
 
P
V
 
V
G
 
L
C
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
M
 
T
L
 
K
L
 
D
G
 
N
Q
 
L
I
 
L
D
 
L
T
 
R
Q
 
M
D
 
S
P
 
E
N
 
D
E
 
D
W
 
W
S
 
D
R
 
D
M
 
I
L
 
L
N
 
N
I
 
I
N
 
H
V
 
L
M
 
K
G
 
A
V
 
V
L
 
Y
N
 
R
G
 
L
I
 
S
H
 
K
A
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
K
G
 
G
M
 
M
K
 
T
A
 
K
R
 
A
K
 
R
T
 
F
G
 
G
T
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
|
S
S
|
S
V
 
V
A
 
V
G
 
A
R
 
H
K
 
F
T
 
A
F
 
N
P
 
P
N
 
G
H
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
T
 
A
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
I
H
 
E
A
 
A
L
 
F
T
 
S
E
 
R
N
 
S
I
 
L
R
 
A
E
 
K
E
 
E
V
 
M
A
 
G
M
 
S
D
 
R
D
 
Q
V
 
I
R
 
T
L
 
V
I
 
N
T
 
S
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
F
V
x
I
E
 
A
T
 
T
E
 
E
L
x
M
L
 
T
S
 
D
H
 
A
T
 
L
T
 
S
D
 
E
D
 
D
A
 
-
I
 
I
K
 
R
A
 
K
G
 
K
Y
 
M
Q
 
S
D
 
D
W
 
-
K
 
Q
V
 
V
Q
 
A
M
 
L
G
 
N
G
 
R
V
 
L
I
 
G
A
 
E
P
 
P
E
 
Q
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
A
 
A
A
 
V
L
 
S
F
 
F

4ituA Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) bound to s-hpc and nadh (see paper)
35% identity, 77% coverage: 36:221/243 of query aligns to 41:230/253 of 4ituA

query
sites
4ituA
L
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
R
V
 
S
E
 
A
P
 
A
M
 
M
Q
 
L
A
 
S
L
 
T
E
 
G
L
 
G
P
 
A
N
 
V
S
 
A
L
 
K
A
 
G
I
 
F
G
 
G
V
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
T
 
A
D
 
A
A
 
D
I
 
I
K
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
N
 
T
Q
 
S
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
Q
 
T
F
 
I
G
 
G
P
 
S
V
 
L
G
 
T
C
 
G
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
M
 
A
L
 
G
L
 
F
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
D
 
H
T
 
D
Q
 
A
D
 
D
P
 
A
N
 
A
E
 
A
W
 
W
S
 
D
R
 
R
M
 
I
L
 
M
N
 
A
I
x
V
N
|
N
V
 
V
M
 
T
G
 
G
V
 
T
L
 
F
N
 
L
G
 
A
I
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
M
K
 
L
A
 
E
R
 
R
K
 
H
T
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
F
S
 
G
S
|
S
V
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
L
K
 
V
T
 
G
F
 
I
P
 
P
N
 
T
H
 
M
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
I
H
 
V
A
 
N
L
 
L
T
 
T
E
 
R
N
 
Q
I
 
M
R
 
A
E
 
A
E
 
D
V
 
Y
A
 
S
M
 
G
D
 
R
D
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
N
T
 
A
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
 
G
A
x
T
V
|
V
E
 
T
T
 
S
-
x
T
-
 
G
-
x
M
-
 
G
-
 
Q
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
S
T
 
D
T
 
T
D
 
S
D
 
P
A
 
E
I
 
V
K
 
Q
A
 
A
G
 
-
Y
 
R
Q
x
R
D
 
L
W
 
A
K
 
K
V
x
Y
Q
 
P
M
 
I
G
 
G
G
 
R
V
 
F
I
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
I
F
 
F

Sites not aligning to the query:

A7IQH5 2-(S)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase 3; S-HPCDH 3; 2-[(S)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase 3; Aliphatic epoxide carboxylation component IV; Epoxide carboxylase component IV; SHPCDH3; EC 1.1.1.269 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 2 papers)
35% identity, 77% coverage: 36:221/243 of query aligns to 43:232/255 of A7IQH5

query
sites
A7IQH5
L
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
R
V
 
S
E
 
A
P
 
A
M
 
M
Q
 
L
A
 
S
L
 
T
E
 
G
L
 
G
P
 
A
N
 
V
S
 
A
L
 
K
A
 
G
I
 
F
G
 
G
V
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
T
 
A
D
 
A
A
 
D
I
 
I
K
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
N
 
T
Q
 
S
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
Q
 
T
F
 
I
G
 
G
P
 
S
V
 
L
G
 
T
C
 
G
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
M
 
A
L
 
G
L
 
F
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
D
 
H
T
 
D
Q
 
A
D
 
D
P
 
A
N
 
A
E
 
A
W
 
W
S
 
D
R
 
R
M
 
I
L
 
M
N
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
M
 
T
G
 
G
V
 
T
L
 
F
N
 
L
G
 
A
I
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
M
K
 
L
A
 
E
R
 
R
K
 
H
T
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
 
F
S
 
G
S
|
S
V
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
L
K
 
V
T
 
G
F
 
I
P
 
P
N
 
T
H
 
M
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
I
H
 
V
A
 
N
L
 
L
T
 
T
E
 
R
N
 
Q
I
 
M
R
 
A
E
 
A
E
 
D
V
 
Y
A
 
S
M
 
G
D
 
R
D
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
N
T
 
A
I
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
G
A
x
T
V
|
V
E
x
T
T
x
S
-
x
T
-
x
G
-
 
M
-
 
G
-
 
Q
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
G
H
 
S
T
 
D
T
 
T
D
 
S
D
 
P
A
 
E
I
 
V
K
 
Q
A
 
A
G
 
-
Y
 
R
Q
x
R
D
 
L
W
 
A
K
|
K
V
x
Y
Q
 
P
M
 
I
G
 
G
G
 
R
V
 
F
I
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
I
F
 
F

Sites not aligning to the query:

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
33% identity, 79% coverage: 10:202/243 of query aligns to 20:215/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
S
 
G
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
A
 
T
I
 
L
A
 
A
K
 
R
Q
 
G
F
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
A
G
 
G
H
 
A
P
 
A
L
 
I
L
 
V
L
 
I
-
 
N
-
 
D
-
x
R
-
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
A
-
 
A
-
 
T
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
V
 
F
E
 
R
P
 
D
M
 
-
Q
 
E
A
 
G
L
 
F
E
 
A
L
 
A
P
 
D
N
 
H
S
 
A
L
 
V
A
 
-
I
 
-
G
 
-
V
 
F
D
|
D
V
|
V
T
 
A
D
 
E
T
 
H
D
 
A
A
 
Q
I
 
V
K
 
R
A
 
A
A
 
A
I
 
I
N
 
D
Q
 
E
A
 
F
E
 
E
A
 
A
Q
 
R
F
 
V
G
 
G
P
 
A
V
 
I
G
 
D
C
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
M
 
Q
L
 
R
L
 
R
G
 
A
Q
 
P
I
 
L
D
 
D
T
 
A
Q
 
F
D
 
E
P
 
P
N
 
D
E
 
D
W
 
W
S
 
H
R
 
A
M
 
L
L
 
M
N
 
R
I
 
V
N
 
N
V
 
L
M
 
D
G
 
G
V
 
V
L
 
F
N
 
N
G
 
V
I
 
A
H
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
A
A
 
R
G
 
H
M
 
M
K
 
I
A
 
A
R
 
R
K
 
G
T
 
H
G
 
G
T
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
C
S
|
S
V
 
V
A
 
Q
G
 
S
R
 
E
K
 
L
T
 
A
F
 
R
P
 
P
N
 
T
H
 
I
A
 
A
A
 
P
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
T
 
T
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
V
H
 
R
A
 
M
L
 
L
T
 
T
E
 
K
N
 
G
I
 
M
R
 
C
E
 
A
E
 
D
V
 
W
A
 
A
M
 
R
D
 
Y
D
 
G
V
 
I
R
 
Q
L
 
A
I
 
N
T
 
G
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
A
 
Y
V
x
F
E
 
E
T
|
T
E
 
E
L
|
L
L
x
N
S
 
R
H
 
A
T
 
L
T
 
V
D
 
D
D
 
D
A
 
-
I
 
-
K
 
-
A
 
A
G
 
A
Y
 
F
Q
 
S
D
 
D
W
 
W

6ixjA The crystal structure of sulfoacetaldehyde reductase from klebsiella oxytoca (see paper)
33% identity, 96% coverage: 8:241/243 of query aligns to 3:241/251 of 6ixjA

query
sites
6ixjA
L
 
V
V
 
V
V
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
S
x
T
S
|
S
G
|
G
I
x
F
G
 
G
A
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
K
 
Q
Q
 
V
F
 
F
S
 
A
A
 
D
A
 
A
G
 
G
H
 
W
P
 
S
L
 
L
L
 
V
L
 
L
L
 
S
A
 
G
R
|
R
R
|
R
V
 
F
E
 
E
P
 
R
M
 
L
Q
 
K
A
 
T
L
 
L
E
 
Q
L
 
-
P
 
-
N
 
D
S
 
K
L
 
L
A
 
A
-
 
S
-
 
Q
-
 
V
-
 
P
-
 
V
-
 
H
-
 
I
I
 
I
G
 
E
V
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
R
D
 
D
T
 
S
D
 
D
A
 
S
I
 
V
K
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
V
N
 
A
Q
 
A
A
 
L
E
 
P
A
 
A
Q
 
D
F
 
F
G
 
A
P
 
D
V
 
I
G
 
T
C
 
T
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
L
M
 
A
L
 
L
L
 
S
G
 
P
Q
 
Q
I
 
P
D
 
A
T
 
Q
Q
 
K
-
 
V
D
 
D
P
 
L
N
 
D
E
 
D
W
 
W
S
 
K
R
 
T
M
 
M
L
 
I
N
 
D
I
x
T
N
 
N
V
 
V
M
 
T
G
 
G
V
 
L
L
 
V
N
 
N
G
 
V
I
 
T
H
 
H
A
 
A
V
 
L
L
 
L
A
 
P
G
 
T
M
 
L
K
 
I
A
 
N
R
 
H
K
 
G
T
 
A
G
 
G
-
 
A
T
 
S
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
G
S
|
S
V
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
K
 
W
T
 
P
F
x
Y
P
 
P
N
 
G
H
 
S
A
 
H
A
 
V
Y
|
Y
C
 
G
A
 
A
T
 
S
K
|
K
F
 
A
A
 
F
V
 
V
H
 
K
A
 
Q
L
 
F
T
 
S
E
 
Y
N
 
N
I
 
L
R
 
R
E
 
C
E
 
D
V
 
L
A
 
L
M
 
G
D
 
T
D
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
T
T
 
D
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
I
V
x
A
E
 
E
T
|
T
E
|
E
L
x
F
-
 
T
L
 
L
S
 
V
H
 
R
T
 
T
T
 
K
D
 
G
D
 
D
A
 
Q
I
 
A
K
 
A
A
 
S
G
 
-
Y
 
-
Q
 
-
D
 
D
W
 
N
K
 
L
V
 
Y
Q
 
R
M
 
G
G
 
T
G
 
T
V
 
P
I
 
L
A
 
S
P
 
A
E
 
R
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
Q
A
 
M
L
 
F
F
 
Y
A
 
I
W
 
A
Q
 
T
Q
 
L
P
 
P
Q
 
D
N
 
H
V
 
M
C
 
N
V
 
I
R
 
N
E
 
R
I
 
V
V
 
E
L
 
V
A
 
M
P
 
P
T
 
V
R
 
R
Q
 
Q

4gh5A Crystal structure of s-2-hydroxypropyl coenzyme m dehydrogenase (s- hpcdh) (see paper)
34% identity, 77% coverage: 36:221/243 of query aligns to 41:225/248 of 4gh5A

query
sites
4gh5A
L
 
L
A
 
A
R
 
E
R
 
R
V
 
S
E
 
A
P
 
A
M
 
M
Q
 
L
A
 
S
L
 
T
E
 
G
L
 
G
P
 
A
N
 
V
S
 
A
L
 
K
A
 
G
I
 
F
G
 
G
V
x
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
D
 
K
T
 
A
D
 
A
A
 
D
I
 
I
K
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
N
 
T
Q
 
S
A
 
A
E
 
E
A
 
Q
Q
 
T
F
 
I
G
 
G
P
 
S
V
 
L
G
 
T
C
 
G
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
M
 
A
L
 
G
L
 
F
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
D
 
H
T
 
D
Q
 
A
D
 
D
P
 
A
N
 
A
E
 
A
W
 
W
S
 
D
R
 
R
M
 
I
L
 
M
N
 
A
I
x
V
N
|
N
V
 
V
M
 
T
G
 
G
V
 
T
L
 
F
N
 
L
G
 
A
I
 
S
H
 
K
A
 
A
V
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
M
 
M
K
 
L
A
 
E
R
 
R
K
 
H
T
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
I
I
 
V
N
 
N
I
x
F
S
 
G
S
|
S
V
 
V
A
 
A
G
 
G
R
 
L
K
 
V
T
 
G
F
 
I
P
 
P
N
 
T
H
 
M
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
T
 
A
K
|
K
F
 
G
A
 
A
V
 
I
H
 
V
A
 
N
L
 
L
T
 
T
E
 
R
N
 
Q
I
 
M
R
 
A
E
 
A
E
 
D
V
 
Y
A
 
S
M
 
G
D
 
R
D
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
N
T
 
A
I
 
V
A
 
C
P
|
P
G
 
G
A
 
T
V
|
V
E
 
T
T
 
S
E
x
T
L
x
G
L
x
M
S
 
G
H
 
Q
T
 
Q
T
 
L
D
 
L
D
 
P
A
 
E
I
 
V
K
 
Q
A
 
A
G
 
-
Y
 
R
Q
 
R
D
 
L
W
 
A
K
 
K
V
 
Y
Q
 
P
M
 
I
G
 
G
G
 
R
V
 
F
I
 
G
A
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
E
A
 
A
A
 
V
L
 
I
F
 
F

Sites not aligning to the query:

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
33% identity, 79% coverage: 1:193/243 of query aligns to 3:198/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
T
 
T
K
 
K
P
 
S
T
 
A
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
R
A
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
L
Q
 
Q
F
 
L
S
 
A
A
 
E
A
 
E
G
 
G
H
 
Y
P
 
N
L
 
V
L
 
A
L
 
V
-
 
N
L
 
Y
A
 
A
R
 
G
R
 
S
V
 
K
E
 
E
P
 
K
M
 
A
Q
 
E
A
 
A
L
 
V
-
 
V
-
 
E
E
 
E
L
 
I
P
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
V
N
 
D
S
 
S
L
 
F
A
 
A
I
 
I
G
 
Q
V
 
A
D
 
N
V
 
V
T
 
A
D
 
D
T
 
A
D
 
D
A
 
E
I
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
M
I
 
I
N
 
K
Q
 
E
A
 
V
E
 
V
A
 
S
Q
 
Q
F
 
F
G
 
G
P
 
S
V
 
L
G
 
D
C
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
M
 
T
L
 
R
L
 
D
G
 
N
Q
 
L
I
 
L
D
 
M
T
 
R
Q
 
M
D
 
K
P
 
E
N
 
Q
E
 
E
W
 
W
S
 
D
R
 
D
M
 
V
L
 
I
N
 
D
I
 
T
N
 
N
V
 
L
M
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
F
N
 
N
G
 
C
I
 
I
H
 
Q
A
 
K
V
 
A
L
 
T
A
 
P
G
 
Q
M
 
M
K
 
L
A
 
R
R
 
Q
K
 
R
T
 
S
G
 
G
T
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
V
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
A
K
 
V
T
 
G
F
 
N
P
 
P
N
 
G
H
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
T
 
T
K
|
K
F
 
A
A
 
G
V
 
V
H
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
K
N
 
S
I
 
A
R
 
A
E
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
A
M
 
S
D
 
R
D
 
G
V
 
I
R
 
T
L
 
V
I
 
N
T
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
F
V
 
I
E
 
V
T
 
S
E
 
D
L
 
M
L
 
T
S
 
D
H
 
A
T
 
L
T
 
S
D
 
D
D
 
E

Query Sequence

>7026544 FitnessBrowser__ANA3:7026544
MTKPTQPLVVITGASSGIGAAIAKQFSAAGHPLLLLARRVEPMQALELPNSLAIGVDVTD
TDAIKAAINQAEAQFGPVGCLINNAGVMLLGQIDTQDPNEWSRMLNINVMGVLNGIHAVL
AGMKARKTGTIINISSVAGRKTFPNHAAYCATKFAVHALTENIREEVAMDDVRLITIAPG
AVETELLSHTTDDAIKAGYQDWKVQMGGVIAPENVAAAALFAWQQPQNVCVREIVLAPTR
QQP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory