SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8499437 FitnessBrowser__Miya:8499437 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
36% identity, 89% coverage: 34:318/322 of query aligns to 35:323/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
P
 
P
R
 
R
E
 
E
A
 
K
I
 
L
R
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
V
A
 
K
G
 
D
A
 
V
H
 
D
M
 
A
V
 
L
L
 
V
T
 
T
N
x
M
K
x
L
T
 
S
P
 
E
-
 
R
L
 
I
D
 
D
A
 
Q
D
 
E
T
 
V
I
 
F
A
 
E
A
 
N
L
 
A
P
 
P
D
 
R
L
 
L
A
 
R
Y
 
I
I
 
V
G
 
A
V
 
N
L
x
Y
A
|
A
T
x
V
G
|
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
V
R
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
T
A
 
R
R
 
R
S
 
G
I
 
I
P
 
Y
V
 
V
C
 
T
N
 
N
V
 
T
P
 
P
G
 
D
Y
 
V
G
x
L
T
 
T
E
 
N
A
 
A
V
x
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
H
V
 
A
F
 
F
A
 
A
F
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
A
L
 
T
C
 
A
R
 
R
R
 
H
I
 
V
A
 
V
R
 
K
H
 
G
D
 
D
A
 
K
S
 
F
V
 
V
K
 
R
V
 
S
G
 
G
N
 
E
W
 
W
S
 
K
A
 
-
N
 
-
K
 
R
D
 
K
W
 
G
C
 
I
F
 
A
W
 
W
E
 
H
T
 
P
T
 
K
Q
 
W
I
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
E
 
E
L
 
L
T
 
Y
G
 
G
K
 
K
A
 
T
M
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
F
|
F
G
|
G
N
x
R
M
x
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
A
V
 
I
G
 
A
Q
 
R
I
 
R
A
 
A
N
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
K
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
Y
Y
 
Y
S
|
S
P
x
R
N
 
T
T
 
R
R
 
K
T
 
S
M
 
Q
P
 
A
G
 
E
Y
 
K
E
 
E
P
 
L
F
 
G
A
 
A
-
 
E
Y
 
Y
V
 
R
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
L
A
 
K
R
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
F
V
 
V
T
 
I
L
 
L
H
x
A
C
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
K
A
 
E
T
|
T
R
 
M
G
 
Y
M
 
M
V
 
I
N
 
N
R
 
E
V
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
K
S
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
P
G
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
L
 
V
L
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
I
A
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
E
N
 
G
H
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
F
A
 
E
V
 
E
E
|
E
P
 
P
I
 
Y
R
 
Y
P
 
-
D
 
N
N
 
E
P
 
E
L
 
L
L
 
F
T
 
S
A
 
L
K
 
D
N
 
N
C
 
V
L
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
x
G
W
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
F
T
 
E
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
T
 
A
L
 
M
M
 
A
R
 
E
V
 
L
T
 
V
A
 
A
G
 
R
N
 
N
I
 
L
R
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
K
A
 
R
G
 
G
A
 
E
-
 
I
-
 
P
P
 
P
T
 
T
N
 
L
V
 
V
V
 
N
K
 
K

3kb6B Crystal structure of d-lactate dehydrogenase from aquifex aeolicus complexed with NAD and lactic acid (see paper)
33% identity, 80% coverage: 54:311/322 of query aligns to 53:320/334 of 3kb6B

query
sites
3kb6B
P
 
K
L
 
L
D
 
T
A
 
E
D
 
E
T
 
L
I
 
L
A
 
S
A
 
K
L
 
M
P
 
P
D
 
R
L
 
L
A
 
K
Y
 
L
I
 
I
G
 
H
V
 
T
L
 
R
A
x
S
T
x
V
G
|
G
Y
 
F
D
 
D
V
 
H
V
 
I
D
 
D
I
 
L
R
 
D
A
 
Y
A
 
C
A
 
K
A
 
K
R
 
K
S
 
G
I
 
I
P
 
L
V
 
V
C
 
T
N
 
H
V
 
I
P
 
P
G
 
A
Y
|
Y
G
x
S
T
 
P
E
 
E
A
 
S
V
|
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
V
 
T
F
 
F
A
 
A
F
 
M
L
 
I
L
 
L
E
 
T
L
 
L
C
 
V
R
 
K
R
 
R
I
 
L
A
 
K
R
 
R
H
 
I
D
 
E
A
 
D
S
 
R
V
 
V
K
 
K
V
 
K
G
 
L
N
 
N
W
 
F
S
 
S
A
 
Q
N
 
D
K
 
S
D
 
E
W
 
I
C
 
L
F
 
A
W
 
R
E
 
E
T
 
L
T
 
N
Q
 
R
I
 
L
E
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
-
A
 
T
M
 
L
G
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
T
G
|
G
N
x
R
M
x
I
G
 
G
K
 
S
R
 
R
V
 
V
G
 
A
Q
 
M
I
 
Y
A
 
G
N
 
L
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
C
Y
 
Y
S
x
D
P
x
V
N
 
V
T
 
K
R
 
R
T
 
E
M
 
D
P
 
L
G
 
K
Y
 
E
E
 
K
P
 
G
F
 
C
A
 
V
Y
 
Y
V
 
T
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
F
 
L
A
 
K
R
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
T
 
S
L
 
L
H
 
H
C
 
V
P
|
P
L
 
Y
T
 
T
D
 
K
A
 
E
T
 
T
R
 
H
G
 
H
M
 
M
V
 
I
N
 
N
R
 
E
V
 
E
R
 
R
L
 
I
A
 
S
S
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
D
G
 
G
A
 
V
I
 
Y
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
L
 
V
L
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
D
A
 
A
V
 
L
A
 
Y
A
 
R
A
 
A
L
 
Y
N
 
Q
D
 
R
N
 
G
H
 
K
L
 
F
G
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
F
A
 
E
V
 
D
E
|
E
P
 
E
I
 
I
R
 
L
P
 
I
D
 
L
N
 
K
P
 
K
L
 
Y
L
 
T
T
 
E
A
 
G
K
 
K
-
 
A
-
 
T
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
C
-
 
K
-
 
D
N
 
N
C
 
V
L
 
I
I
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
|
A
W
x
Y
A
 
Y
T
 
T
L
 
D
T
 
K
A
 
S
R
 
L
Q
 
E
T
 
R
L
 
I
M
 
R
R
 
E
V
 
E
T
 
T
A
 
V
G
 
K
N
 
V
I
 
V
R
 
K
A
 
A
F
 
F
L
 
V
A
 
K
G
 
G

Sites not aligning to the query:

5z20F The ternary structure of d-lactate dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa with nadh and oxamate (see paper)
38% identity, 78% coverage: 69:319/322 of query aligns to 79:336/336 of 5z20F

query
sites
5z20F
I
 
V
G
 
A
V
 
L
L
 
R
A
 
S
T
 
A
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
V
 
H
V
 
V
D
 
D
I
 
L
R
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
A
R
 
L
S
 
G
I
 
L
P
 
P
V
 
V
C
 
V
N
 
H
V
 
V
P
 
P
G
 
A
Y
|
Y
G
x
S
T
 
P
E
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
V
 
A
F
 
V
A
 
G
F
 
L
L
 
I
L
 
L
E
 
T
L
 
L
C
 
N
R
 
R
R
 
R
I
 
L
A
 
H
R
 
R
H
 
-
D
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
K
 
-
V
 
A
G
 
Y
N
 
N
W
 
R
S
 
T
A
 
R
N
 
E
K
 
G
D
 
D
W
 
F
C
 
S
F
 
L
W
 
H
E
 
G
T
 
L
T
 
T
Q
 
G
I
 
F
E
 
D
L
 
L
T
 
H
G
 
G
K
 
K
A
 
R
M
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
T
G
|
G
N
x
Q
M
x
I
G
 
G
K
 
E
R
 
T
V
 
F
G
 
A
Q
 
R
I
 
I
A
 
M
N
 
A
A
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
C
K
 
E
V
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
|
Y
S
x
D
P
|
P
N
 
Y
T
 
P
R
 
N
T
 
P
M
 
R
P
 
I
G
 
Q
Y
 
A
E
 
L
P
 
G
F
 
G
A
 
R
Y
 
Y
V
 
L
S
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
A
L
 
L
F
 
L
A
 
A
R
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
S
L
 
L
H
 
H
C
|
C
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
A
A
 
D
T
|
T
R
 
R
G
 
H
M
 
L
V
 
I
N
 
D
R
 
A
V
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
T
M
 
M
K
 
K
Q
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
G
R
|
R
G
 
G
P
 
A
L
 
L
L
 
V
D
 
N
E
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
I
A
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
S
N
 
G
H
 
Q
L
 
L
G
 
G
G
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
Y
A
 
E
V
 
E
E
|
E
-
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
F
-
 
F
P
 
E
I
 
D
R
 
R
P
 
S
D
 
D
N
 
Q
P
 
P
-
 
L
-
 
Q
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
S
A
 
F
K
 
P
N
 
N
C
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
A
H
|
H
L
 
Q
A
|
A
W
 
F
A
 
L
T
 
T
L
 
R
T
 
E
A
 
A
R
 
L
Q
 
A
T
 
A
L
 
I
M
 
A
R
 
D
V
 
T
T
 
T
A
 
L
G
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
A
A
 
A
F
 
W
L
 
Q
A
 
D
G
 
G
A
 
T
P
 
P
T
 
R
N
 
N
V
 
R
V
 
V
K
 
R
A
 
A

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
35% identity, 82% coverage: 47:311/322 of query aligns to 45:304/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
M
 
I
V
 
I
L
 
V
T
 
R
N
 
S
K
 
K
T
 
P
P
 
K
L
 
V
D
 
T
A
 
R
D
 
R
T
 
V
I
 
I
A
 
E
A
 
S
L
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
L
A
 
K
Y
 
V
I
 
I
G
 
A
V
 
R
L
 
A
A
 
G
T
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
V
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
V
R
 
E
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
E
R
 
K
S
 
G
I
 
I
P
 
E
V
 
V
C
 
V
N
 
N
V
 
A
P
 
P
G
 
A
Y
 
A
G
x
S
T
 
S
E
 
R
A
 
S
V
|
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
L
V
 
A
F
 
V
A
 
G
F
 
L
L
 
M
L
 
F
E
 
S
L
 
V
C
 
A
R
 
R
R
 
K
I
 
I
A
 
A
R
 
F
H
 
A
D
 
D
A
 
R
S
 
K
V
 
M
K
 
R
V
 
E
G
 
G
N
 
V
W
 
W
S
 
A
A
 
K
N
 
K
K
 
-
D
 
-
W
 
-
C
 
-
F
 
-
W
 
-
E
 
E
T
 
A
T
 
M
Q
 
G
I
 
I
E
 
E
L
 
L
T
 
E
G
 
G
K
 
K
A
 
T
M
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
F
|
F
G
|
G
N
x
R
M
x
I
G
 
G
K
 
Y
R
 
Q
V
 
V
G
 
A
Q
 
K
I
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
F
 
L
G
 
G
M
 
M
K
 
N
V
 
I
L
 
L
A
 
L
Y
|
Y
S
x
D
P
|
P
N
 
Y
T
 
P
R
 
N
T
 
E
M
 
E
P
 
R
G
 
A
Y
 
K
E
 
E
P
 
V
F
 
N
A
 
G
-
 
K
Y
 
F
V
 
V
S
 
D
L
 
L
D
 
E
E
 
T
L
 
L
F
 
L
A
 
K
R
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
T
L
 
I
H
 
H
C
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
V
D
 
E
A
 
S
T
|
T
R
 
Y
G
 
H
M
 
L
V
 
I
N
 
N
R
 
E
V
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
K
S
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
K
G
 
T
A
 
A
I
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
N
A
 
A
V
 
L
A
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
E
N
 
G
H
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
G
L
 
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
F
A
 
E
V
 
E
E
|
E
P
 
P
I
 
L
R
 
P
P
 
K
D
 
D
N
 
H
P
 
P
L
 
L
L
 
T
T
 
K
A
 
F
K
 
D
N
 
N
C
 
V
L
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
x
G
W
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
V
T
 
E
A
 
A
R
 
Q
Q
 
E
T
 
R
L
 
A
M
 
G
R
 
V
V
 
E
T
 
V
A
 
A
G
 
E
N
 
K
I
 
V
R
 
V
A
 
K
F
 
I
L
 
L
A
 
K
G
 
G

6p2iA Acyclic imino acid reductase (bsp5) in complex with NADPH and d-arg (see paper)
31% identity, 98% coverage: 1:317/322 of query aligns to 1:306/307 of 6p2iA

query
sites
6p2iA
M
 
M
R
 
K
I
 
I
V
 
T
V
 
Y
L
 
I
D
 
D
G
 
K
Y
 
P
T
 
T
L
 
Y
N
 
L
P
 
P
G
 
S
D
 
-
N
 
-
P
 
-
W
 
W
-
 
V
-
 
I
D
 
N
A
 
K
V
 
I
A
 
N
A
 
E
L
 
Y
G
 
G
E
 
D
L
 
F
T
 
E
V
 
V
-
 
F
H
 
Y
D
 
D
R
 
F
T
 
P
P
 
N
R
 
E
E
 
E
A
 
E
I
 
A
R
 
I
E
 
N
R
 
R
A
 
L
A
 
S
G
 
S
A
 
T
H
 
D
M
 
I
V
 
A
L
 
I
T
 
V
N
x
E
K
 
W
T
 
T
P
 
S
L
 
I
D
 
T
A
 
K
D
 
E
T
 
M
I
 
I
A
 
E
A
 
K
L
 
I
P
 
S
D
 
R
L
 
L
A
 
K
Y
 
Y
I
 
L
G
 
I
V
 
T
L
 
I
A
x
T
T
|
T
G
x
S
Y
 
Y
D
 
D
V
 
Y
V
 
I
D
 
D
I
 
V
R
 
N
A
 
S
A
 
L
A
 
K
A
 
D
R
 
N
S
 
E
I
 
I
P
 
M
V
 
V
C
 
S
N
 
N
V
 
C
P
 
P
G
 
Q
Y
|
Y
G
x
S
T
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
|
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
V
 
V
F
 
F
A
 
A
F
 
L
L
 
L
L
 
F
E
 
A
L
 
V
C
 
N
R
 
R
R
 
K
I
 
I
A
 
L
R
 
Q
H
 
A
D
 
D
A
 
E
S
 
T
V
 
C
K
 
R
V
 
K
G
 
G
N
 
-
W
 
-
S
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
L
D
 
S
W
 
H
C
 
I
F
 
Y
W
 
P
E
 
P
T
 
F
T
 
L
Q
 
C
I
 
S
E
 
E
L
 
I
T
 
R
G
 
D
K
 
K
A
 
T
M
 
I
G
 
G
I
 
L
V
 
I
G
|
G
F
x
I
G
|
G
N
x
Q
M
x
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
T
V
 
V
G
 
A
Q
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
F
 
F
G
 
Q
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
G
Y
 
L
S
x
N
P
x
K
N
x
S
T
 
K
R
|
R
T
 
N
M
 
V
P
 
K
G
 
G
Y
 
I
E
 
Q
P
 
Q
F
 
-
A
 
-
Y
 
-
V
 
V
S
 
D
L
 
I
D
 
T
E
 
E
L
 
L
F
 
M
A
 
K
R
 
K
S
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
I
T
 
S
L
 
L
H
|
H
C
x
I
P
|
P
L
 
R
T
 
N
D
 
A
A
 
D
T
|
T
R
 
E
G
 
I
M
 
I
V
 
L
N
 
T
R
 
E
V
 
K
R
 
L
L
 
L
A
 
S
S
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
P
G
 
D
A
 
A
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
x
C
R
 
R
G
 
G
P
 
N
L
 
L
L
 
I
D
 
D
E
 
E
A
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
Y
A
 
S
A
 
V
L
 
L
N
 
K
D
 
Q
N
 
N
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
L
 
A
G
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
D
V
 
L
A
 
T
V
 
Y
E
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
Y
P
 
K
D
 
D
N
 
N
P
 
P
L
 
I
L
 
I
T
 
G
A
 
L
K
 
N
N
 
N
C
 
V
L
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
 
G
L
 
S
A
 
A
W
|
W
A
 
Y
T
 
S
L
 
Y
T
 
E
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
T
 
K
L
 
N
M
 
M
R
 
Y
V
 
E
T
 
L
A
 
I
G
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
E
A
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
Q
A
 
K
P
 
P
T
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
I

4zgsA Identification of the pyruvate reductase of chlamydomonas reinhardtii (see paper)
34% identity, 82% coverage: 56:319/322 of query aligns to 67:346/346 of 4zgsA

query
sites
4zgsA
D
 
D
A
 
A
D
 
S
T
 
V
I
 
I
A
 
K
A
 
E
L
 
L
P
 
A
D
 
K
-
 
A
-
 
G
L
 
V
A
 
K
Y
 
L
I
 
I
G
 
A
V
 
L
L
 
R
A
 
C
T
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
D
V
 
R
V
 
V
D
 
D
I
 
L
R
 
H
A
 
A
A
 
C
A
 
A
A
 
E
R
 
H
S
 
G
I
 
V
P
 
R
V
 
V
C
 
V
N
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
T
Y
|
Y
G
x
S
T
 
P
E
 
E
A
 
S
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
V
 
A
F
 
V
A
 
A
F
 
L
L
 
I
L
 
F
E
 
A
L
 
L
C
 
N
R
 
R
R
 
H
I
 
L
A
 
T
R
 
D
H
 
A
D
 
Y
A
 
I
S
 
R
V
 
V
K
 
R
V
 
M
G
 
G
N
 
N
W
 
Y
S
 
S
A
 
L
N
 
S
K
 
G
D
 
-
W
 
-
C
 
-
F
 
-
W
 
-
E
 
-
T
 
L
T
 
V
Q
 
G
I
 
V
E
 
E
L
 
M
T
 
R
G
 
H
K
 
K
A
 
V
M
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
T
G
|
G
N
x
A
M
x
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
Q
V
 
A
G
 
A
Q
 
R
I
 
I
A
 
L
N
 
K
A
 
G
F
 
I
G
 
G
M
 
C
K
 
K
V
 
V
L
 
F
A
 
A
Y
 
Y
S
 
-
P
 
-
N
x
D
T
 
I
R
 
K
T
 
P
M
 
N
P
 
P
G
 
A
Y
 
V
E
 
E
P
 
A
F
 
M
A
 
G
-
 
I
-
 
P
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
F
 
L
A
 
A
R
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
V
T
 
T
L
 
L
H
 
H
C
|
C
P
|
P
L
 
L
T
x
L
D
 
P
A
x
S
T
|
T
R
 
R
G
 
Q
M
 
L
V
 
I
N
 
N
R
 
K
V
 
E
R
 
S
L
 
I
A
 
Q
S
 
K
M
 
M
K
 
K
Q
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
M
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
 
V
A
x
S
R
|
R
G
 
G
P
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
E
 
S
A
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
F
A
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
E
D
 
S
N
 
G
H
 
Q
L
 
I
G
 
G
G
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
Y
A
 
E
V
 
N
E
|
E
P
 
G
-
 
G
-
 
L
-
 
F
-
 
F
-
 
V
-
 
D
-
 
H
-
 
T
-
 
K
-
 
F
-
 
D
-
 
P
-
 
S
-
 
V
-
 
R
-
 
M
-
 
Q
-
 
K
-
 
W
I
 
D
R
 
R
P
 
Q
D
 
F
N
 
R
P
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
S
A
 
Y
K
 
P
N
 
Q
C
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
T
A
 
A
W
x
F
A
 
L
T
 
T
L
 
E
T
 
E
A
 
A
R
 
L
Q
 
N
T
 
N
L
 
I
M
 
C
R
 
T
V
 
T
T
 
T
A
 
I
G
 
Q
N
 
N
I
 
I
R
 
A
A
 
D
F
 
Y
L
 
V
A
 
L
G
 
D
A
 
R
P
 
P
T
 
L
-
 
G
N
 
N
V
 
E
V
 
V
K
 
K
A
 
A

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
38% identity, 82% coverage: 47:311/322 of query aligns to 45:303/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
M
 
L
V
 
L
L
 
V
T
 
R
N
 
S
K
 
A
T
 
T
P
 
T
L
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
E
T
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
L
A
 
K
Y
 
I
I
 
V
G
 
A
V
 
R
L
 
A
A
 
G
T
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
V
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
V
R
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
R
S
 
G
I
 
V
P
 
L
V
 
V
C
 
V
N
 
N
V
 
A
P
 
P
G
 
T
Y
 
S
G
x
N
T
 
I
E
 
H
A
 
S
V
 
A
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
V
 
A
F
 
L
A
 
A
F
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
A
L
 
A
C
 
S
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
A
H
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
S
V
 
L
K
 
R
V
 
E
G
 
H
N
 
T
W
 
W
S
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
K
D
 
R
W
 
S
C
 
S
F
 
F
W
 
S
E
 
G
T
 
T
T
 
-
Q
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
I
T
 
F
G
 
G
K
 
K
A
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
G
 
G
N
 
R
M
 
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
L
V
 
V
G
 
A
Q
 
Q
I
 
R
A
 
I
N
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
A
K
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
Y
-
 
V
S
 
S
P
 
P
N
 
A
T
 
R
R
 
A
T
 
A
M
 
Q
P
 
L
G
 
G
Y
 
I
E
 
E
P
 
-
F
 
-
A
 
-
Y
 
L
V
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
D
 
D
V
 
F
V
 
I
T
 
S
L
 
V
H
 
H
C
 
L
P
 
P
L
 
K
T
 
T
D
 
P
A
 
E
T
 
T
R
 
A
G
 
G
M
 
L
V
 
I
N
 
D
R
 
K
V
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
K
M
 
T
K
 
K
Q
 
P
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
L
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
N
 
T
D
 
G
N
 
G
H
 
H
L
 
V
G
 
R
G
 
A
L
 
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
F
A
 
A
V
 
T
E
|
E
P
 
P
I
 
C
R
 
T
P
 
-
D
 
D
N
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
F
T
 
E
A
 
L
K
 
A
N
 
Q
C
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
L
A
 
G
W
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
A
T
 
E
A
 
A
R
 
Q
Q
 
D
T
 
R
L
 
A
M
 
G
R
 
T
V
 
D
T
 
V
A
 
A
G
 
E
N
 
S
I
 
V
R
 
R
A
 
L
F
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
38% identity, 82% coverage: 47:311/322 of query aligns to 46:304/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
M
 
L
V
 
L
L
 
V
T
 
R
N
 
S
K
 
A
T
 
T
P
 
T
L
 
V
D
 
D
A
 
A
D
 
E
T
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
A
P
 
P
D
 
K
L
 
L
A
 
K
Y
 
I
I
 
V
G
 
A
V
x
R
L
 
A
A
 
G
T
x
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
V
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
V
R
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
R
S
 
G
I
 
V
P
 
L
V
 
V
C
 
V
N
 
N
V
 
A
P
 
P
G
 
T
Y
 
S
G
x
N
T
 
I
E
 
H
A
 
S
V
 
A
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
V
 
A
F
 
L
A
 
A
F
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
A
L
 
A
C
 
S
R
 
R
R
 
Q
I
 
I
A
 
P
R
 
A
H
 
A
D
 
D
A
 
A
S
 
S
V
 
L
K
 
R
V
 
E
G
 
H
N
 
T
W
 
W
S
 
-
A
 
-
N
 
-
K
 
K
D
 
R
W
 
S
C
 
S
F
 
F
W
 
S
E
 
G
T
 
T
T
 
-
Q
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
I
T
 
F
G
 
G
K
 
K
A
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
G
 
G
F
 
L
G
 
G
N
 
R
M
 
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
L
V
 
V
G
 
A
Q
 
Q
I
 
R
A
 
I
N
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
A
K
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
Y
 
Y
-
 
D
-
 
P
-
 
Y
-
 
V
S
 
S
P
 
P
N
 
A
T
 
R
R
 
A
T
 
A
M
 
Q
P
 
L
G
 
G
Y
 
I
E
 
E
P
 
-
F
 
-
A
 
-
Y
 
L
V
 
L
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
A
R
 
R
S
 
A
D
 
D
V
 
F
V
 
I
T
 
S
L
 
V
H
 
H
C
 
L
P
 
P
L
 
K
T
 
T
D
 
P
A
 
E
T
 
T
R
 
A
G
 
G
M
 
L
V
 
I
N
 
D
R
 
K
V
 
E
R
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
K
M
 
T
K
 
K
Q
 
P
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
I
I
 
V
N
 
N
T
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
L
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
I
N
 
T
D
 
G
N
 
G
H
 
H
L
 
V
G
 
R
G
 
A
L
 
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
F
A
 
A
V
 
T
E
|
E
P
 
P
I
 
C
R
 
T
P
 
-
D
 
D
N
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
F
T
 
E
A
 
L
K
 
A
N
 
Q
C
 
V
L
 
V
I
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
L
A
 
G
W
x
A
A
 
S
T
 
T
L
 
A
T
 
E
A
 
A
R
x
Q
Q
 
D
T
 
R
L
 
A
M
 
G
R
 
T
V
 
D
T
 
V
A
 
A
G
 
E
N
 
S
I
 
V
R
 
R
A
 
L
F
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G

5z21B The ternary structure of d-lactate dehydrogenase from fusobacterium nucleatum with nadh and oxamate (see paper)
34% identity, 82% coverage: 51:313/322 of query aligns to 58:324/331 of 5z21B

query
sites
5z21B
N
 
N
K
 
K
T
 
E
P
 
T
L
 
I
D
 
D
A
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
I
A
 
M
A
 
A
L
 
E
P
 
N
D
 
G
L
 
I
A
 
K
Y
 
L
I
 
L
G
 
A
V
 
M
L
 
R
A
 
C
T
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
N
V
 
N
V
 
V
D
 
S
I
 
L
R
 
K
A
 
D
A
 
V
A
 
N
A
 
E
R
 
R
S
 
-
I
 
F
P
 
K
V
 
V
C
 
V
N
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
A
Y
|
Y
G
x
S
T
 
P
E
 
H
A
 
A
V
x
I
A
 
A
Q
 
E
H
 
Y
V
 
T
F
 
V
A
 
G
F
 
L
L
 
I
L
 
L
E
 
A
L
 
V
C
 
N
R
 
R
R
 
K
I
 
I
A
 
N
R
 
K
H
 
A
D
 
Y
A
 
V
S
 
R
V
 
T
K
 
R
V
 
E
G
 
G
N
 
N
W
 
F
S
 
S
A
 
I
N
 
N
K
 
G
D
 
-
W
 
-
C
 
-
F
 
-
W
 
-
E
 
-
T
 
L
T
 
M
Q
 
G
I
 
I
E
 
D
L
 
L
T
 
Y
G
 
E
K
 
K
A
 
T
M
 
A
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
T
G
|
G
N
x
K
M
x
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
I
V
 
L
G
 
I
Q
 
K
I
 
I
A
 
L
N
 
R
A
 
G
F
 
F
G
 
D
M
 
M
K
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
A
Y
 
Y
S
x
D
-
x
L
-
 
F
P
 
P
N
 
N
T
 
Q
R
 
K
T
 
V
M
 
A
P
 
D
G
 
E
Y
 
L
E
 
-
P
 
G
F
 
F
A
 
E
Y
 
Y
V
 
V
S
 
S
L
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
L
F
 
Y
A
 
A
R
 
N
S
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
I
T
 
S
L
 
L
H
 
N
C
 
C
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
K
A
 
D
T
|
T
R
 
K
G
 
Y
M
 
M
V
 
I
N
 
N
R
 
R
V
 
R
R
 
S
L
 
M
A
 
L
S
 
K
M
 
M
K
 
K
Q
 
D
G
 
G
A
 
V
I
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
|
T
A
x
G
R
|
R
G
 
G
P
 
M
L
 
L
L
 
I
D
 
D
E
 
S
A
 
A
A
 
D
V
 
L
A
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
D
N
 
K
H
 
K
L
 
I
G
 
G
G
 
A
L
 
V
G
 
A
V
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
Y
-
 
E
-
 
E
-
x
E
-
 
E
-
 
N
-
 
Y
-
 
F
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
K
A
 
S
V
 
T
E
 
Q
P
 
V
I
 
I
R
 
E
P
 
D
D
 
D
-
 
I
-
 
L
N
 
G
P
 
R
L
 
L
L
 
L
T
 
S
A
 
F
K
 
Y
N
 
N
C
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
P
 
S
H
|
H
L
 
Q
A
 
A
W
x
Y
A
 
F
T
 
T
L
 
K
T
 
E
A
 
A
R
 
V
Q
 
G
T
 
A
L
 
I
M
 
T
R
 
V
V
 
T
T
 
T
A
 
L
G
 
N
N
 
N
I
 
I
R
 
K
A
 
D
F
 
F
L
 
V
A
 
E
G
 
G
A
 
R
P
 
P

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
34% identity, 86% coverage: 34:311/322 of query aligns to 34:313/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
P
 
P
R
 
R
E
 
E
A
 
V
I
 
L
R
 
L
E
 
E
R
 
K
A
 
V
A
 
K
G
 
D
A
 
V
H
 
D
M
 
A
V
 
L
L
 
V
T
 
T
N
 
M
-
 
L
K
 
S
T
 
E
P
 
K
L
 
I
D
 
D
A
 
R
D
 
E
T
 
V
I
 
F
A
 
D
A
 
A
L
 
A
P
 
P
D
 
R
L
 
L
A
 
R
Y
 
I
I
 
V
G
 
A
V
 
N
L
 
Y
A
 
A
T
x
V
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
N
V
 
I
D
 
D
I
 
I
R
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
T
A
 
K
R
 
R
S
 
G
I
 
I
P
 
Y
V
 
V
C
 
T
N
 
N
V
 
T
P
 
P
G
 
D
Y
 
V
G
x
L
T
 
T
E
 
D
A
 
A
V
x
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
L
V
 
A
F
 
W
A
 
A
F
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
A
L
 
A
C
 
A
R
 
R
R
 
H
I
 
V
A
 
V
R
 
K
H
 
G
D
 
D
A
 
K
S
 
F
V
 
V
K
 
R
V
 
S
G
 
G
N
 
E
W
 
W
S
 
K
A
 
-
N
 
-
K
 
R
D
 
R
W
 
G
C
 
I
F
 
A
W
 
W
E
 
H
T
 
P
T
 
K
Q
 
M
I
 
F
-
 
L
-
 
G
-
 
Y
E
 
D
L
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
K
A
 
T
M
 
I
G
 
G
I
 
I
V
 
V
G
|
G
F
|
F
G
|
G
N
x
R
M
x
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
A
V
 
I
G
 
A
Q
 
K
I
 
R
A
 
A
N
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
-
Y
 
Y
S
 
T
P
x
A
N
x
R
T
x
S
R
 
R
T
x
K
M
 
P
P
 
E
G
 
A
Y
 
E
E
 
K
P
 
E
F
 
L
A
 
G
-
 
A
-
 
E
Y
 
F
V
 
K
S
 
P
L
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
L
F
 
L
A
 
R
R
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
F
V
 
V
T
 
V
L
 
L
H
 
A
C
x
V
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
K
A
x
E
T
|
T
R
 
Y
G
 
H
M
 
M
V
 
I
N
 
N
R
 
E
V
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
R
S
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
P
G
 
T
A
 
A
I
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
x
V
A
|
A
R
|
R
G
 
G
P
 
K
L
 
V
L
 
V
D
 
D
E
 
T
A
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
I
A
 
R
A
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
E
N
 
G
H
 
W
L
 
I
G
 
A
G
 
A
L
 
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
F
A
 
E
V
 
E
E
|
E
P
 
P
I
 
Y
R
 
Y
P
 
-
D
 
D
N
 
E
P
 
E
L
 
L
L
 
F
T
 
A
A
 
L
K
 
D
N
 
N
C
 
V
L
 
V
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
x
G
W
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
F
T
 
G
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
T
 
G
L
 
M
M
 
A
R
 
E
V
 
L
T
 
V
A
 
A
G
 
K
N
 
N
I
 
L
R
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
K
A
 
N
G
 
G

2p9eA Crystal structure of g336v mutant of e.Coli phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
34% identity, 91% coverage: 31:322/322 of query aligns to 40:326/406 of 2p9eA

query
sites
2p9eA
D
 
D
R
 
E
T
 
Q
P
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
D
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
H
 
H
M
 
F
V
 
I
-
 
G
L
 
L
T
 
R
N
 
S
K
 
R
T
 
T
P
 
H
L
 
L
D
 
T
A
 
E
D
 
D
T
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
A
 
V
Y
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
A
L
 
F
A
 
A
T
 
I
G
 
G
Y
 
T
D
 
N
V
 
Q
V
 
V
D
 
D
I
 
L
R
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
R
S
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
C
 
F
N
 
N
V
 
A
P
 
P
G
 
F
Y
 
S
G
x
N
T
 
T
E
 
R
A
 
S
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
L
V
 
V
F
 
I
A
 
G
F
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
L
L
 
L
C
 
L
R
 
R
R
 
G
I
 
V
A
 
P
R
 
E
H
 
A
D
 
N
A
 
A
S
 
K
V
 
A
K
 
H
V
 
R
G
 
G
N
 
V
W
 
W
S
 
N
A
 
K
N
 
L
K
 
A
D
 
A
W
 
G
C
 
S
F
 
F
W
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
Q
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
A
T
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
K
M
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
|
G
N
x
H
M
x
I
G
 
G
K
 
T
R
 
Q
V
 
L
G
 
G
Q
 
I
I
 
L
A
 
A
N
 
E
A
 
S
F
 
L
G
 
G
M
 
M
K
 
Y
V
 
V
L
 
Y
A
 
F
Y
|
Y
S
x
D
P
x
I
N
 
E
T
 
N
R
 
K
T
 
-
M
 
L
P
 
P
G
 
L
Y
 
G
E
 
N
P
 
A
F
 
T
A
 
Q
Y
 
V
V
 
Q
S
 
H
L
 
L
D
 
S
E
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
N
R
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
S
L
 
L
H
|
H
C
x
V
P
|
P
L
 
E
T
 
N
D
 
P
A
x
S
T
 
T
R
 
K
G
 
N
M
 
M
V
 
M
N
 
G
R
 
A
V
 
K
R
 
E
L
 
I
A
 
S
S
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
P
G
 
G
A
 
S
I
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
P
 
T
L
 
V
L
 
V
D
 
D
E
 
I
A
 
P
A
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
A
D
 
S
N
 
K
H
 
H
L
 
L
G
 
A
G
 
G
L
 
A
G
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
V
 
F
A
 
P
V
 
T
E
|
E
P
 
P
I
 
A
R
 
T
P
 
N
D
 
S
N
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
T
-
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
A
T
 
E
A
 
F
K
 
D
N
 
N
C
 
V
L
 
L
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
x
G
W
 
G
A
 
S
T
 
T
L
 
Q
T
 
E
A
 
A
R
 
Q
Q
 
E
T
 
N
L
 
I
M
 
G
R
 
L
V
 
E
T
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
K
-
 
L
I
 
I
R
 
K
A
 
Y
F
 
S
L
 
D
A
 
N
G
 
G
A
 
S
P
 
T
T
 
L
N
 
S
V
 
A
V
 
V
K
 
N
A
 
F
P
 
P
T
 
E
V
 
V

Q65CJ7 Hydroxyphenylpyruvate reductase; HPPR; EC 1.1.1.237 from Plectranthus scutellarioides (Coleus) (Solenostemon scutellarioides) (see paper)
33% identity, 80% coverage: 56:313/322 of query aligns to 58:307/313 of Q65CJ7

query
sites
Q65CJ7
D
 
D
A
 
A
D
 
E
T
 
L
I
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
K
L
 
L
A
 
E
Y
 
I
I
 
V
G
 
S
V
 
S
L
 
F
A
 
S
T
 
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
V
 
K
V
 
V
D
 
D
I
 
L
R
 
I
A
 
K
A
 
C
A
 
E
A
 
E
R
 
K
S
 
G
I
 
V
P
 
R
V
 
V
C
 
T
N
 
N
V
 
T
P
 
P
G
 
D
Y
 
V
G
 
L
T
 
T
E
 
D
A
 
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
D
H
 
L
V
 
A
F
 
I
A
 
G
F
 
L
L
 
I
L
 
L
E
 
A
L
 
V
C
 
L
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
C
R
 
E
H
 
C
D
 
D
A
 
K
S
 
Y
V
 
V
K
 
R
V
 
R
G
 
G
N
 
A
W
 
W
S
 
K
A
 
F
N
 
G
K
 
D
D
 
-
W
 
-
C
 
-
F
 
F
W
 
K
E
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
K
I
 
-
E
 
-
L
 
F
T
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
R
M
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
x
L
G
|
G
N
x
R
M
x
I
G
 
G
K
 
L
R
 
A
V
 
V
G
 
A
Q
 
E
I
 
R
A
 
A
N
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
K
 
P
V
 
I
L
 
S
A
 
Y
Y
 
F
S
|
S
P
x
R
N
x
S
T
 
K
R
 
K
T
 
P
M
 
N
P
 
T
G
 
N
Y
 
Y
E
 
T
P
 
-
F
 
-
A
 
Y
Y
 
Y
V
 
G
S
 
S
L
 
V
D
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
S
R
 
N
S
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
L
T
 
V
L
 
V
H
 
A
C
 
C
P
 
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
A
 
E
T
 
T
R
 
T
G
 
H
M
 
I
V
 
I
N
 
N
R
 
R
V
 
E
R
 
V
L
 
I
A
 
D
S
 
A
M
 
L
K
 
G
Q
 
P
G
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
x
I
A
 
G
R
 
R
G
 
G
P
 
P
L
 
H
L
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
P
A
 
E
V
 
L
A
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
V
D
 
E
N
 
G
H
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
F
A
 
E
V
 
R
E
 
E
P
 
P
I
 
E
R
 
V
P
 
P
D
 
E
N
 
K
P
 
-
L
 
L
L
 
F
T
 
G
A
 
L
K
 
E
N
 
N
C
 
V
L
 
V
I
 
L
T
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
V
A
 
G
W
 
S
A
 
G
T
 
T
L
 
V
T
 
E
A
 
T
R
 
R
Q
 
K
T
 
V
L
 
M
M
 
A
R
 
D
V
 
L
T
 
V
A
 
V
G
 
G
N
 
N
I
 
L
R
 
E
A
 
A
F
 
H
L
 
F
A
 
S
G
 
G
A
 
K
P
 
P

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
33% identity, 80% coverage: 56:313/322 of query aligns to 56:305/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
D
 
D
A
 
A
D
 
E
T
 
L
I
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
D
 
K
L
 
L
A
 
E
Y
 
I
I
 
V
G
 
S
V
 
S
L
 
F
A
 
S
T
x
V
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
V
 
K
V
 
V
D
 
D
I
 
L
R
 
I
A
 
K
A
 
C
A
 
E
A
 
E
R
 
K
S
 
G
I
 
V
P
 
R
V
 
V
C
 
T
N
 
N
V
 
T
P
 
P
G
 
D
Y
 
V
G
x
L
T
 
T
E
 
D
A
 
D
V
 
V
A
 
A
Q
 
D
H
 
L
V
 
A
F
 
I
A
 
G
F
 
L
L
 
I
L
 
L
E
 
A
L
 
V
C
 
L
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
C
R
 
E
H
 
C
D
 
D
A
 
K
S
 
Y
V
 
V
K
 
R
V
 
R
G
 
G
N
 
A
W
 
W
S
 
K
A
 
F
N
 
G
K
 
D
D
 
-
W
 
-
C
 
-
F
 
F
W
 
K
E
 
L
T
 
T
T
 
T
Q
 
K
I
 
-
E
 
-
L
 
F
T
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
R
M
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
F
x
L
G
|
G
N
x
R
M
x
I
G
 
G
K
 
L
R
 
A
V
 
V
G
 
A
Q
 
E
I
 
R
A
 
A
N
 
E
A
 
A
F
 
F
G
 
D
M
 
C
K
 
P
V
 
I
L
 
S
A
 
Y
Y
 
F
S
|
S
P
x
R
N
x
S
T
 
K
R
 
K
T
 
P
M
 
N
P
 
T
G
 
N
Y
 
Y
E
 
T
P
 
-
F
 
-
A
 
Y
Y
 
Y
V
 
G
S
 
S
L
 
V
D
 
V
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
S
R
 
N
S
 
S
D
 
D
V
 
I
V
 
L
T
 
V
L
 
V
H
 
A
C
|
C
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
A
 
E
T
|
T
R
 
T
G
 
H
M
 
I
V
 
I
N
 
N
R
 
R
V
 
E
R
 
V
L
 
I
A
 
D
S
 
A
M
 
L
K
 
G
Q
 
P
G
 
K
A
 
G
I
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
x
I
A
x
G
R
|
R
G
 
G
P
 
P
L
 
H
L
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
P
A
 
E
V
 
L
A
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
N
 
V
D
 
E
N
 
G
H
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
x
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
F
A
 
E
V
 
R
E
|
E
P
 
P
I
 
E
R
 
V
P
 
P
D
 
E
N
 
K
P
 
-
L
 
L
L
 
F
T
 
G
A
 
L
K
 
E
N
 
N
C
 
V
L
 
V
I
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
L
 
V
A
x
G
W
 
S
A
 
G
T
 
T
L
 
V
T
 
E
A
 
T
R
 
R
Q
 
K
T
 
V
L
 
M
M
 
A
R
 
D
V
 
L
T
 
V
A
 
V
G
 
G
N
 
N
I
 
L
R
 
E
A
 
A
F
 
H
L
 
F
A
 
S
G
 
G
A
 
K
P
 
P

P0A9T0 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; PGDH; 2-oxoglutarate reductase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
34% identity, 91% coverage: 31:322/322 of query aligns to 44:330/410 of P0A9T0

query
sites
P0A9T0
D
 
D
R
 
E
T
 
Q
P
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
D
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
H
 
H
M
 
F
V
 
I
-
 
G
L
 
L
T
 
R
N
 
S
K
 
R
T
 
T
P
 
H
L
 
L
D
 
T
A
 
E
D
 
D
T
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
A
 
V
Y
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
C
L
 
F
A
 
C
T
 
I
G
 
G
Y
 
T
D
 
N
V
 
Q
V
 
V
D
 
D
I
 
L
R
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
R
S
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
C
 
F
N
 
N
V
 
A
P
 
P
G
 
F
Y
 
S
G
 
N
T
 
T
E
 
R
A
 
S
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
L
V
 
V
F
 
I
A
 
G
F
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
L
L
 
L
C
 
L
R
 
R
R
 
G
I
 
V
A
 
P
R
 
E
H
 
A
D
 
N
A
 
A
S
 
K
V
 
A
K
 
H
V
 
R
G
 
G
N
 
V
W
 
W
S
 
N
A
 
K
N
 
L
K
 
A
D
 
A
W
 
G
C
 
S
F
 
F
W
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
Q
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
A
T
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
K
M
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
N
x
H
M
x
I
G
 
G
K
 
T
R
 
Q
V
 
L
G
 
G
Q
 
I
I
 
L
A
 
A
N
 
E
A
 
S
F
 
L
G
 
G
M
 
M
K
 
Y
V
 
V
L
 
Y
A
 
F
Y
 
Y
S
x
D
P
 
I
N
 
E
T
 
N
R
 
K
T
 
-
M
 
L
P
 
P
G
 
L
Y
 
G
E
 
N
P
 
A
F
 
T
A
 
Q
Y
 
V
V
 
Q
S
 
H
L
 
L
D
 
S
E
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
N
R
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
S
L
 
L
H
 
H
C
 
V
P
 
P
L
 
E
T
 
N
D
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
K
G
 
N
M
 
M
V
 
M
N
 
G
R
 
A
V
 
K
R
 
E
L
 
I
A
 
S
S
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
P
G
 
G
A
 
S
I
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
P
 
T
L
 
V
L
 
V
D
 
D
E
 
I
A
 
P
A
 
A
V
 
L
A
 
C
A
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
A
D
 
S
N
 
K
H
 
H
L
 
L
G
 
A
G
 
G
L
 
A
G
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
V
 
F
A
 
P
V
 
T
E
 
E
P
 
P
I
 
A
R
 
T
P
 
N
D
 
S
N
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
T
-
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
C
T
 
E
A
 
F
K
 
D
N
 
N
C
 
V
L
 
L
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
x
I
A
x
G
W
x
G
A
 
S
T
 
T
L
 
Q
T
 
E
A
 
A
R
 
Q
Q
 
E
T
 
N
L
 
I
M
 
G
R
 
L
V
 
E
T
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
K
-
 
L
I
 
I
R
 
K
A
 
Y
F
 
S
L
 
D
A
 
N
G
 
G
A
 
S
P
 
T
T
 
L
N
 
S
V
 
A
V
 
V
K
 
N
A
 
F
P
 
P
T
 
E
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1psdA The allosteric ligand site in the vmax-type cooperative enzyme phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
34% identity, 91% coverage: 31:322/322 of query aligns to 38:324/404 of 1psdA

query
sites
1psdA
D
 
D
R
 
E
T
 
Q
P
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
D
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
H
 
H
M
 
F
V
 
I
-
 
G
L
 
L
T
 
R
N
 
S
K
 
R
T
 
T
P
 
H
L
 
L
D
 
T
A
 
E
D
 
D
T
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
A
 
V
Y
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
C
L
 
F
A
 
C
T
 
I
G
 
G
Y
 
T
D
 
N
V
 
Q
V
 
V
D
 
D
I
 
L
R
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
R
S
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
C
 
F
N
 
N
V
 
A
P
 
P
G
 
F
Y
 
S
G
x
N
T
 
T
E
 
R
A
 
S
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
L
V
 
V
F
 
I
A
 
G
F
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
L
L
 
L
C
 
L
R
 
R
R
 
G
I
 
V
A
 
P
R
 
E
H
 
A
D
 
N
A
 
A
S
 
K
V
 
A
K
 
H
V
 
R
G
 
G
N
 
V
W
 
W
S
 
N
A
 
K
N
 
L
K
 
A
D
 
A
W
 
G
C
 
S
F
 
F
W
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
Q
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
A
T
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
K
M
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
Y
G
 
G
N
x
H
M
x
I
G
 
G
K
 
T
R
 
Q
V
 
L
G
 
G
Q
 
I
I
 
L
A
 
A
N
 
E
A
 
S
F
 
L
G
 
G
M
 
M
K
 
Y
V
 
V
L
 
Y
A
 
F
Y
 
Y
S
x
D
P
x
I
N
 
E
T
 
N
R
x
K
T
 
-
M
 
L
P
 
P
G
 
L
Y
 
G
E
 
N
P
 
A
F
 
T
A
 
Q
Y
 
V
V
 
Q
S
 
H
L
 
L
D
 
S
E
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
N
R
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
S
L
 
L
H
|
H
C
x
V
P
|
P
L
 
E
T
 
N
D
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
K
G
 
N
M
 
M
V
 
M
N
 
G
R
 
A
V
 
K
R
 
E
L
 
I
A
 
S
S
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
P
G
 
G
A
 
S
I
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
P
 
T
L
 
V
L
 
V
D
 
D
E
 
I
A
 
P
A
 
A
V
 
L
A
 
C
A
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
A
D
 
S
N
 
K
H
 
H
L
 
L
G
 
A
G
 
G
L
 
A
G
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
V
 
F
A
 
P
V
 
T
E
|
E
P
 
P
I
 
A
R
 
T
P
 
N
D
 
S
N
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
T
-
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
C
T
 
E
A
 
F
K
 
D
N
 
N
C
 
V
L
 
L
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
 
G
W
 
G
A
 
S
T
 
T
L
 
Q
T
 
E
A
 
A
R
 
Q
Q
 
E
T
 
N
L
 
I
M
 
G
R
 
L
V
 
E
T
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
K
-
 
L
I
 
I
R
 
K
A
 
Y
F
 
S
L
 
D
A
 
N
G
 
G
A
 
S
P
 
T
T
 
L
N
 
S
V
 
A
V
 
V
K
 
N
A
 
F
P
 
P
T
 
E
V
 
V

Sites not aligning to the query:

1ybaA The active form of phosphoglycerate dehydrogenase (see paper)
34% identity, 91% coverage: 31:322/322 of query aligns to 40:326/406 of 1ybaA

query
sites
1ybaA
D
 
D
R
 
E
T
 
Q
P
 
L
R
 
K
E
 
E
A
 
S
I
 
I
R
 
R
E
 
D
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
A
H
 
H
M
 
F
V
 
I
-
 
G
L
 
L
T
x
R
N
x
S
K
 
R
T
 
T
P
 
H
L
 
L
D
 
T
A
 
E
D
 
D
T
 
V
I
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
A
P
 
E
D
 
K
L
 
L
A
 
V
Y
 
A
I
 
I
G
 
G
V
 
C
L
 
F
A
x
C
T
x
I
G
|
G
Y
 
T
D
x
N
V
 
Q
V
 
V
D
 
D
I
 
L
R
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
R
S
 
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
C
 
F
N
 
N
V
 
A
P
 
P
G
x
F
Y
 
S
G
x
N
T
 
T
E
 
R
A
 
S
V
|
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
L
V
 
V
F
 
I
A
 
G
F
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
L
L
 
L
C
 
L
R
 
R
R
 
G
I
 
V
A
 
P
R
 
E
H
 
A
D
 
N
A
 
A
S
 
K
V
 
A
K
 
H
V
 
R
G
 
G
N
 
V
W
 
W
S
 
N
A
 
K
N
 
L
K
 
A
D
 
A
W
 
G
C
 
S
F
 
F
W
 
-
E
 
-
T
 
-
T
 
-
Q
 
-
I
 
-
E
 
E
L
 
A
T
 
R
G
 
G
K
 
K
A
 
K
M
 
L
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
F
 
Y
G
|
G
N
x
H
M
x
I
G
 
G
K
 
T
R
 
Q
V
 
L
G
 
G
Q
 
I
I
 
L
A
 
A
N
 
E
A
 
S
F
 
L
G
 
G
M
 
M
K
 
Y
V
 
V
L
 
Y
A
 
F
Y
|
Y
S
x
D
P
x
I
N
 
E
T
 
N
R
x
K
T
 
-
M
 
L
P
 
P
G
 
L
Y
 
G
E
 
N
P
 
A
F
 
T
A
 
Q
Y
 
V
V
 
Q
S
 
H
L
 
L
D
 
S
E
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
N
R
 
M
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
V
T
 
S
L
 
L
H
|
H
C
x
V
P
|
P
L
 
E
T
 
N
D
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
K
G
 
N
M
 
M
V
 
M
N
 
G
R
 
A
V
 
K
R
 
E
L
 
I
A
 
S
S
 
L
M
 
M
K
 
K
Q
 
P
G
 
G
A
 
S
I
 
L
L
 
L
I
 
I
N
 
N
T
x
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
P
 
T
L
 
V
L
 
V
D
 
D
E
 
I
A
 
P
A
 
A
V
 
L
A
 
C
A
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
A
D
 
S
N
 
K
H
 
H
L
 
L
G
 
A
G
 
G
L
 
A
G
 
A
V
 
I
D
|
D
V
 
V
V
 
F
A
 
P
V
 
T
E
|
E
P
 
P
I
 
A
R
 
T
P
 
N
D
 
S
N
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
T
-
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
C
T
 
E
A
 
F
K
 
D
N
 
N
C
 
V
L
 
L
I
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
x
G
W
 
G
A
 
S
T
 
T
L
 
Q
T
 
E
A
 
A
R
 
Q
Q
 
E
T
 
N
L
 
I
M
 
G
R
 
L
V
 
E
T
 
V
A
 
A
G
 
G
N
 
K
-
 
L
I
 
I
R
 
K
A
 
Y
F
 
S
L
 
D
A
 
N
G
 
G
A
 
S
P
 
T
T
 
L
N
 
S
V
 
A
V
 
V
K
 
N
A
 
F
P
 
P
T
 
E
V
 
V

4cukA Structure of salmonella d-lactate dehydrogenase in complex with nadh
33% identity, 76% coverage: 68:311/322 of query aligns to 71:321/330 of 4cukA

query
sites
4cukA
Y
 
Y
I
 
I
G
 
A
V
 
L
L
 
R
A
 
C
T
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
N
V
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
L
R
 
D
A
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
E
R
 
L
S
 
G
I
 
L
P
 
Q
V
 
V
C
 
V
N
 
R
V
 
V
P
 
P
G
 
A
Y
|
Y
G
x
S
T
 
P
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
H
 
H
V
 
A
F
 
I
A
 
G
F
 
M
L
 
M
L
 
M
E
 
T
L
 
L
C
 
N
R
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
H
R
 
R
H
 
A
D
 
Y
A
 
Q
S
 
R
V
 
T
K
 
R
V
 
D
G
 
A
N
 
N
W
 
F
S
 
S
A
 
L
N
 
E
K
 
G
D
 
-
W
 
-
C
 
-
F
 
-
W
 
-
E
 
-
T
 
L
T
 
T
Q
 
G
I
 
F
E
 
T
L
 
M
T
 
H
G
 
G
K
 
K
A
 
T
M
 
A
G
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
G
F
 
T
G
|
G
N
x
K
M
x
I
G
 
G
K
 
V
R
 
A
V
 
A
G
 
L
Q
 
R
I
 
I
A
 
L
N
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
G
M
 
M
K
 
R
V
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
x
F
S
x
D
P
|
P
N
 
Y
T
 
P
R
 
S
T
 
T
M
 
A
P
 
A
G
 
L
Y
 
D
E
 
L
P
 
G
F
 
V
A
 
E
Y
 
Y
V
 
V
S
 
D
L
 
L
D
 
Q
E
 
T
L
 
L
F
 
F
A
 
A
R
 
E
S
 
S
D
 
D
V
 
V
V
 
I
T
 
S
L
 
L
H
|
H
C
|
C
P
|
P
L
 
L
T
 
T
D
 
P
A
 
E
T
x
N
R
 
Y
G
 
H
M
 
L
V
 
L
N
 
N
R
 
H
V
 
A
R
 
A
L
 
F
A
 
D
S
 
Q
M
 
M
K
 
K
Q
 
N
G
 
G
A
 
V
I
 
M
L
 
I
I
 
I
N
 
N
T
|
T
A
 
S
R
|
R
G
 
G
P
 
A
L
 
L
L
 
I
D
 
D
E
 
S
A
 
Q
A
 
A
V
 
A
A
 
I
A
 
E
A
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
N
N
 
Q
H
 
K
L
 
I
G
 
G
G
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
M
D
|
D
V
 
V
V
x
Y
-
 
E
-
 
N
-
x
E
-
 
R
-
 
D
-
 
L
-
 
F
-
 
F
-
 
E
-
 
D
-
 
K
A
 
S
V
 
V
E
 
D
P
 
V
I
 
I
R
 
Q
P
 
D
D
 
D
-
 
V
-
 
F
N
 
R
P
 
R
L
 
L
L
 
S
T
 
A
A
 
C
K
 
H
N
 
N
C
 
V
L
 
L
I
 
F
T
 
T
P
 
G
H
|
H
L
 
Q
A
|
A
W
 
F
A
 
L
T
 
T
L
 
A
T
 
E
A
 
A
R
 
L
Q
 
I
T
 
S
L
 
I
M
 
S
R
 
E
V
 
T
T
 
T
A
 
L
G
 
Q
N
 
N
I
 
L
R
 
S
A
 
Q
F
 
L
L
 
E
A
 
K
G
 
G

2gcgA Ternary crystal structure of human glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (see paper)
32% identity, 87% coverage: 34:313/322 of query aligns to 37:317/324 of 2gcgA

query
sites
2gcgA
P
 
P
R
 
A
E
 
K
A
 
E
I
 
L
R
 
E
E
 
R
R
 
G
A
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
H
M
 
G
V
 
L
L
 
L
-
 
C
-
 
L
-
x
L
-
 
S
-
 
D
-
 
H
T
 
V
N
 
D
K
 
K
T
 
R
P
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
A
L
 
G
P
 
A
D
 
N
L
 
L
A
 
K
Y
 
V
I
 
I
G
 
S
V
 
T
L
 
M
A
x
S
T
x
V
G
|
G
Y
 
I
D
 
D
V
 
H
V
 
L
D
 
A
I
 
L
R
 
D
A
 
E
A
 
I
A
 
K
A
 
K
R
 
R
S
 
G
I
 
I
P
 
R
V
 
V
C
 
G
N
 
Y
V
 
T
P
 
P
G
 
D
Y
 
V
G
x
L
T
 
T
E
 
D
A
 
T
V
x
T
A
 
A
Q
 
E
H
 
L
V
 
A
F
 
V
A
 
S
F
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
T
L
 
T
C
 
C
R
 
R
R
 
R
I
 
L
A
 
P
R
 
E
H
 
A
D
 
I
A
 
E
S
 
E
V
 
V
K
 
K
V
 
N
G
 
G
N
 
G
W
 
W
S
 
T
A
 
S
N
 
W
K
 
K
D
 
P
-
 
L
W
 
W
-
 
L
C
 
C
F
 
G
W
 
Y
E
 
G
T
 
L
T
 
T
Q
 
Q
I
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
S
A
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
|
G
F
 
L
G
|
G
N
 
R
M
x
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
A
V
 
I
G
 
A
Q
 
R
I
 
R
A
 
L
N
 
K
A
 
P
F
 
F
G
 
G
M
 
V
K
 
Q
V
 
R
L
 
F
A
 
L
Y
 
Y
S
 
T
-
x
G
-
x
R
-
 
Q
P
 
P
N
x
R
T
 
P
R
 
E
T
 
E
M
 
A
P
 
A
G
 
E
Y
 
F
E
 
Q
P
 
A
F
 
-
A
 
E
Y
 
F
V
 
V
S
 
S
L
 
T
D
 
P
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
A
R
 
Q
S
 
S
D
 
D
V
 
F
V
 
I
T
 
V
L
 
V
H
 
A
C
|
C
P
x
S
L
 
L
T
 
T
D
 
P
A
 
A
T
|
T
R
 
E
G
 
G
M
 
L
V
 
C
N
 
N
R
 
K
V
 
D
R
 
F
L
 
F
A
 
Q
S
 
K
M
 
M
K
 
K
Q
 
E
G
 
T
A
 
A
I
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
T
x
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
P
 
D
L
 
V
L
 
V
D
 
N
E
 
Q
A
 
D
A
 
D
V
 
L
A
 
Y
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
A
D
 
S
N
 
G
H
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
A
L
 
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
T
A
 
S
V
 
P
E
|
E
P
 
P
I
 
L
R
 
P
P
 
T
D
 
N
N
 
H
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
L
K
 
K
N
 
N
C
 
C
L
 
V
I
 
I
T
 
L
P
 
P
H
|
H
L
 
I
A
x
G
W
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
H
T
 
R
A
 
T
R
 
R
Q
 
N
T
 
T
L
 
M
M
 
S
R
 
L
V
 
L
T
 
A
A
 
A
G
 
N
N
 
N
I
 
L
R
 
L
A
 
A
F
 
G
L
 
L
A
 
R
G
 
G
A
 
E
P
 
P

Q9UBQ7 Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase; EC 1.1.1.79; EC 1.1.1.81 from Homo sapiens (Human) (see paper)
32% identity, 87% coverage: 34:313/322 of query aligns to 41:321/328 of Q9UBQ7

query
sites
Q9UBQ7
P
 
P
R
 
A
E
 
K
A
 
E
I
 
L
R
 
E
E
 
R
R
 
G
A
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
H
M
 
G
V
 
L
L
 
L
-
 
C
-
 
L
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
H
T
 
V
N
 
D
K
 
K
T
 
R
P
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
A
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
A
 
A
L
 
G
P
 
A
D
 
N
L
 
L
A
 
K
Y
 
V
I
 
I
G
 
S
V
 
T
L
 
M
A
 
S
T
x
V
G
|
G
Y
 
I
D
 
D
V
 
H
V
 
L
D
 
A
I
 
L
R
 
D
A
 
E
A
 
I
A
 
K
A
 
K
R
 
R
S
 
G
I
 
I
P
 
R
V
 
V
C
 
G
N
 
Y
V
 
T
P
 
P
G
 
D
Y
 
V
G
 
L
T
 
T
E
 
D
A
 
T
V
 
T
A
 
A
Q
 
E
H
 
L
V
 
A
F
 
V
A
 
S
F
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
T
L
 
T
C
 
C
R
 
R
R
 
R
I
 
L
A
 
P
R
 
E
H
 
A
D
 
I
A
 
E
S
 
E
V
 
V
K
 
K
V
 
N
G
 
G
N
 
G
W
 
W
S
 
T
A
 
S
N
 
W
K
 
K
D
 
P
-
 
L
W
 
W
-
 
L
C
 
C
F
 
G
W
 
Y
E
 
G
T
 
L
T
 
T
Q
 
Q
I
 
-
E
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
-
K
 
S
A
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
G
F
 
L
G
|
G
N
x
R
M
x
I
G
 
G
K
 
Q
R
 
A
V
 
I
G
 
A
Q
 
R
I
 
R
A
 
L
N
 
K
A
 
P
F
 
F
G
 
G
M
 
V
K
 
Q
V
 
R
L
 
F
A
 
L
Y
 
Y
S
 
T
-
 
G
-
x
R
-
x
Q
P
|
P
N
x
R
T
 
P
R
 
E
T
 
E
M
 
A
P
 
A
G
 
E
Y
 
F
E
 
Q
P
 
A
F
 
-
A
 
E
Y
 
F
V
 
V
S
 
S
L
 
T
D
 
P
E
 
E
L
 
L
F
 
A
A
 
A
R
 
Q
S
 
S
D
 
D
V
 
F
V
 
I
T
 
V
L
 
V
H
 
A
C
 
C
P
x
S
L
 
L
T
 
T
D
 
P
A
 
A
T
 
T
R
 
E
G
 
G
M
 
L
V
 
C
N
 
N
R
 
K
V
 
D
R
 
F
L
 
F
A
 
Q
S
 
K
M
 
M
K
 
K
Q
 
E
G
 
T
A
 
A
I
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
T
x
I
A
 
S
R
|
R
G
 
G
P
 
D
L
 
V
L
 
V
D
 
N
E
 
Q
A
 
D
A
 
D
V
 
L
A
 
Y
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
A
D
 
S
N
 
G
H
 
K
L
 
I
G
 
A
G
 
A
L
 
A
G
 
G
V
 
L
D
|
D
V
 
V
V
 
T
A
 
S
V
 
P
E
 
E
P
 
P
I
 
L
R
 
P
P
 
T
D
 
N
N
 
H
P
 
P
L
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
L
K
 
K
N
 
N
C
 
C
L
 
V
I
 
I
T
 
L
P
 
P
H
|
H
L
x
I
A
x
G
W
x
S
A
 
A
T
 
T
L
 
H
T
 
R
A
 
T
R
 
R
Q
 
N
T
 
T
L
 
M
M
 
S
R
 
L
V
 
L
T
 
A
A
 
A
G
 
N
N
 
N
I
 
L
R
 
L
A
 
A
F
 
G
L
 
L
A
 
R
G
 
G
A
 
E
P
 
P

8atiA Human ctbp2(31-364) in complex with rai2 peptide(315-322)
33% identity, 88% coverage: 29:311/322 of query aligns to 36:315/330 of 8atiA

query
sites
8atiA
V
 
I
H
|
H
D
 
E
R
 
K
T
 
V
P
 
L
R
 
N
E
 
E
A
 
A
I
 
V
R
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
M
M
 
M
V
 
Y
L
 
H
T
 
T
-
 
I
N
 
T
K
 
L
T
 
T
P
 
R
L
 
E
D
 
D
A
 
L
D
 
E
T
 
K
I
 
F
A
 
K
A
 
A
L
 
L
P
 
R
D
 
V
L
 
I
A
 
V
Y
 
R
I
 
I
G
 
G
V
 
-
L
 
-
A
 
-
T
x
S
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
V
 
N
V
 
V
D
 
D
I
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
G
A
 
E
R
 
L
S
 
G
I
 
I
P
 
A
V
 
V
C
 
C
N
 
N
V
 
I
P
 
P
G
 
S
Y
 
A
G
 
A
T
 
V
E
 
E
A
 
E
V
x
T
A
 
A
Q
 
D
H
 
S
V
 
T
F
 
I
A
 
C
F
 
H
L
 
I
L
 
L
E
 
N
L
 
L
C
 
Y
R
 
R
R
 
R
I
 
N
A
 
T
R
 
W
H
 
L
D
 
Y
A
 
Q
S
 
A
V
 
L
K
 
R
V
 
E
G
 
G
N
 
T
W
 
R
S
 
V
A
 
Q
N
 
S
K
 
V
D
 
E
W
 
Q
C
 
I
F
 
R
W
 
E
-
 
V
E
 
A
T
 
S
T
 
G
Q
 
A
I
 
A
E
 
R
L
 
I
T
 
R
G
 
G
K
 
E
A
 
T
M
 
L
G
 
G
I
 
L
V
 
I
G
|
G
F
 
F
G
|
G
N
x
R
M
x
T
G
 
G
K
 
Q
R
 
A
V
 
V
G
 
A
Q
 
V
I
 
R
A
 
A
N
 
K
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
F
K
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
F
Y
 
Y
S
x
D
P
|
P
N
x
Y
T
 
L
R
 
Q
T
 
-
M
 
-
P
 
D
G
 
G
Y
 
I
E
 
E
P
 
R
F
 
S
A
 
L
Y
 
G
V
 
V
-
 
Q
-
 
R
-
 
V
-
 
Y
S
 
T
L
 
L
D
 
Q
E
 
D
L
 
L
F
 
L
A
 
Y
R
 
Q
S
 
S
D
 
D
V
 
C
V
 
V
T
 
S
L
 
L
H
|
H
C
|
C
P
x
N
L
 
L
T
 
N
D
 
E
A
 
H
T
 
N
R
 
H
G
 
H
M
 
L
V
 
I
N
 
N
R
 
D
V
 
F
R
 
T
L
 
I
A
 
K
S
 
Q
M
 
M
K
 
R
Q
 
Q
G
 
G
A
 
A
I
 
F
L
 
L
I
 
V
N
 
N
T
x
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
P
 
G
L
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
K
A
 
A
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
K
D
 
E
N
 
G
H
 
R
L
 
I
G
 
R
G
 
G
L
 
A
G
 
A
V
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
H
A
 
E
V
 
S
E
 
E
P
 
P
I
 
F
R
 
S
-
 
F
P
 
A
D
 
Q
N
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
K
T
 
D
A
 
A
K
 
P
N
 
N
C
 
L
L
 
I
I
 
C
T
 
T
P
 
P
H
|
H
L
 
T
A
|
A
W
|
W
A
 
Y
T
 
S
L
 
E
T
 
Q
A
 
A
R
 
S
Q
 
L
T
 
E
L
 
M
M
 
R
R
 
E
V
 
A
T
 
A
A
 
A
G
 
T
N
 
E
I
 
I
R
 
R
A
 
R
F
 
A
L
 
I
A
 
T
G
 
G

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>8499437 FitnessBrowser__Miya:8499437
MRIVVLDGYTLNPGDNPWDAVAALGELTVHDRTPREAIRERAAGAHMVLTNKTPLDADTI
AALPDLAYIGVLATGYDVVDIRAAAARSIPVCNVPGYGTEAVAQHVFAFLLELCRRIARH
DASVKVGNWSANKDWCFWETTQIELTGKAMGIVGFGNMGKRVGQIANAFGMKVLAYSPNT
RTMPGYEPFAYVSLDELFARSDVVTLHCPLTDATRGMVNRVRLASMKQGAILINTARGPL
LDEAAVAAALNDNHLGGLGVDVVAVEPIRPDNPLLTAKNCLITPHLAWATLTARQTLMRV
TAGNIRAFLAGAPTNVVKAPTV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory