SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8499452 FitnessBrowser__Miya:8499452 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 10 hits to proteins with known functional sites (download)

1wyvA Crystal structure of glycine decarboxylase (p-protein) of the glycine cleavage system, in inhibitor-bound form (see paper)
46% identity, 100% coverage: 1:443/443 of query aligns to 1:437/437 of 1wyvA

query
sites
1wyvA
M
 
M
P
 
D
F
 
Y
I
 
T
P
 
P
H
 
H
S
 
T
P
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
R
E
 
E
M
 
M
L
 
L
S
 
R
V
 
R
I
 
V
G
 
G
V
 
A
Q
 
A
S
 
S
I
 
L
E
 
E
D
 
D
L
 
L
F
 
F
V
 
A
D
 
H
I
 
L
P
 
P
A
 
K
E
 
E
M
 
I
R
 
L
P
 
S
R
 
P
S
 
P
F
 
I
E
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
E
G
 
P
L
 
L
S
 
P
E
 
E
M
 
W
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
E
K
 
E
M
 
L
E
 
R
E
 
R
M
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
N
 
N
R
 
L
T
 
P
D
 
A
V
 
H
V
 
K
S
 
A
F
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
V
Y
 
R
S
 
S
H
 
H
H
 
H
I
 
V
P
 
P
A
 
P
A
 
V
V
 
V
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
A
S
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
L
T
 
T
A
 
A
Y
|
Y
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
A
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
I
 
T
F
 
F
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
A
 
M
V
 
I
C
 
A
R
 
E
L
 
L
L
 
A
D
 
G
M
 
L
D
 
E
C
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
S
 
S
V
 
M
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
G
 
A
S
 
T
A
 
A
I
 
L
F
 
A
E
 
E
A
 
G
M
 
V
M
 
L
M
 
L
A
 
A
V
 
L
R
 
R
A
 
E
T
 
T
K
 
G
R
 
R
R
 
M
K
 
G
L
 
V
V
 
L
I
 
V
D
 
S
E
 
Q
A
 
G
V
 
V
S
 
H
P
 
P
I
 
E
W
 
Y
R
 
R
T
 
A
M
 
V
L
 
L
A
 
R
S
 
A
Y
 
Y
T
 
L
S
 
E
N
 
A
L
 
V
S
 
G
L
 
A
D
 
K
L
 
L
V
 
L
T
 
T
V
 
L
P
 
P
Q
 
L
V
 
E
D
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
T
D
 
P
M
 
L
A
 
P
A
 
E
M
 
V
K
 
G
A
 
E
A
 
E
V
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
V
A
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
N
 
N
P
 
P
N
 
N
F
 
F
F
 
L
G
 
G
V
 
A
V
 
L
E
 
E
D
 
D
F
 
L
T
 
G
D
 
P
L
 
-
F
 
F
A
 
A
H
 
E
A
 
A
K
 
A
S
 
H
Q
 
G
K
 
A
A
 
G
A
 
A
S
 
L
V
 
F
I
 
V
S
 
A
V
 
V
Y
 
A
-
 
D
P
 
P
V
 
L
M
 
S
Q
 
L
S
 
G
V
 
V
L
 
L
K
 
K
T
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
A
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
G
E
 
D
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
L
 
M
S
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
Y
 
H
L
 
F
G
 
G
I
 
F
M
 
L
T
 
A
C
 
T
T
 
K
K
 
K
D
 
A
M
 
F
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
M
 
L
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
L
V
 
V
G
 
S
R
 
E
T
 
T
N
 
V
D
 
D
T
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
R
T
 
R
G
 
G
Y
 
F
V
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
Y
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
K
S
 
S
N
 
N
I
 
I
C
x
T
S
x
T
N
 
N
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
C
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
M
T
 
G
L
 
A
V
 
M
H
 
Y
L
 
L
C
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
R
R
 
E
T
 
V
A
 
A
E
 
L
L
 
K
S
 
S
M
 
V
E
 
E
R
 
M
A
 
A
R
 
H
Y
 
K
A
 
L
M
 
H
E
 
A
R
 
L
L
 
L
T
 
L
A
 
E
I
 
V
A
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
R
P
 
P
L
 
F
N
 
T
T
 
P
A
 
K
P
 
P
F
 
F
G
 
F
N
 
N
E
 
E
F
 
F
A
 
A
V
 
L
R
 
A
L
 
L
P
 
P
I
 
K
P
 
D
A
 
P
F
 
-
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
R
R
 
R
-
 
A
L
 
L
T
 
A
A
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
V
 
H
P
 
G
G
 
A
F
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
P
R
 
R
Y
 
E
Y
 
Y
A
 
G
G
 
-
M
 
-
D
 
E
D
 
N
V
 
L
L
 
A
L
 
L
V
 
F
A
 
A
C
 
A
T
 
T
E
 
E
K
 
L
N
 
H
S
 
E
F
 
E
E
 
E
Q
 
D
V
 
L
G
 
L
I
 
A
L
 
L
A
 
R
E
 
E
M
 
A
L
 
L
G
 
K
G
 
E
I
 
V
L
 
L

1wyuA Crystal structure of glycine decarboxylase (p-protein) of the glycine cleavage system, in holo form (see paper)
46% identity, 100% coverage: 1:443/443 of query aligns to 1:437/437 of 1wyuA

query
sites
1wyuA
M
 
M
P
 
D
F
 
Y
I
 
T
P
 
P
H
 
H
S
 
T
P
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
I
R
 
R
E
 
E
M
 
M
L
 
L
S
 
R
V
 
R
I
 
V
G
 
G
V
 
A
Q
 
A
S
 
S
I
 
L
E
 
E
D
 
D
L
 
L
F
 
F
V
 
A
D
 
H
I
 
L
P
 
P
A
 
K
E
 
E
M
 
I
R
 
L
P
 
S
R
 
P
S
 
P
F
 
I
E
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
E
G
 
P
L
 
L
S
 
P
E
 
E
M
 
W
Q
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
E
K
 
E
M
 
L
E
 
R
E
 
R
M
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
N
 
N
R
 
L
T
 
P
D
 
A
V
 
H
V
 
K
S
 
A
F
 
F
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
F
 
V
Y
 
R
S
 
S
H
 
H
H
 
H
I
 
V
P
 
P
A
 
P
A
 
V
V
 
V
D
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
A
S
 
A
R
 
R
G
 
G
E
 
E
F
 
F
Y
 
L
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
A
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
V
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
I
 
T
F
 
F
E
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
A
 
M
V
 
I
C
 
A
R
 
E
L
 
L
L
 
A
D
 
G
M
 
L
D
 
E
C
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
S
 
S
V
 
M
Y
 
Y
D
 
D
G
 
G
G
 
A
S
 
T
A
 
A
I
 
L
F
 
A
E
 
E
A
 
G
M
 
V
M
 
L
M
 
L
A
 
A
V
 
L
R
 
R
A
 
E
T
 
T
K
 
G
R
 
R
R
 
M
K
 
G
L
 
V
V
 
L
I
 
V
D
 
S
E
 
Q
A
 
G
V
 
V
S
 
H
P
 
P
I
 
E
W
 
Y
R
 
R
T
 
A
M
 
V
L
 
L
A
 
R
S
 
A
Y
 
Y
T
 
L
S
 
E
N
 
A
L
 
V
S
 
G
L
 
A
D
 
K
L
 
L
V
 
L
T
 
T
V
 
L
P
 
P
Q
 
L
V
 
E
D
 
G
G
 
G
R
 
R
S
 
T
D
 
P
M
 
L
A
 
P
A
 
E
M
 
V
K
 
G
A
 
E
A
 
E
V
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
V
A
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
V
 
V
Q
 
Q
N
 
N
P
 
P
N
 
N
F
 
F
F
 
L
G
 
G
V
 
A
V
 
L
E
 
E
D
 
D
F
 
L
T
 
G
D
 
P
L
 
-
F
 
F
A
 
A
H
 
E
A
 
A
K
 
A
S
 
H
Q
 
G
K
 
A
A
 
G
A
 
A
S
 
L
V
 
F
I
 
V
S
 
A
V
 
V
Y
 
A
-
 
D
P
 
P
V
 
L
M
 
S
Q
 
L
S
 
G
V
 
V
L
 
L
K
 
K
T
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
A
M
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
G
E
 
D
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
L
 
M
S
 
G
F
 
F
G
 
G
G
 
G
P
 
P
Y
 
H
L
 
F
G
 
G
I
 
F
M
 
L
T
 
A
C
 
T
T
 
K
K
 
K
D
 
A
M
 
F
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
M
 
L
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
L
V
 
V
G
 
S
R
 
E
T
 
T
N
 
V
D
 
D
T
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
R
T
 
R
G
 
G
Y
 
F
V
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
Y
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
A
T
 
K
S
 
S
N
 
N
I
 
I
C
x
T
S
x
T
N
 
N
Q
 
A
A
 
Q
L
 
L
C
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
M
T
 
G
L
 
A
V
 
M
H
 
Y
L
 
L
C
 
A
L
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
R
R
 
E
T
 
V
A
 
A
E
 
L
L
 
K
S
 
S
M
 
V
E
 
E
R
 
M
A
 
A
R
 
H
Y
 
K
A
 
L
M
 
H
E
 
A
R
 
L
L
 
L
T
 
L
A
 
E
I
 
V
A
 
P
G
 
G
V
 
V
R
 
R
P
 
P
L
 
F
N
 
T
T
 
P
A
 
K
P
 
P
F
 
F
G
 
F
N
 
N
E
 
E
F
 
F
A
 
A
V
 
L
R
 
A
L
 
L
P
 
P
I
 
K
P
 
D
A
 
P
F
 
-
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
R
R
 
R
-
 
A
L
 
L
T
 
A
A
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
 
F
V
 
H
P
 
G
G
 
A
F
 
T
P
 
P
V
 
V
G
 
P
R
 
R
Y
 
E
Y
 
Y
A
 
G
G
 
-
M
 
-
D
 
E
D
 
N
V
 
L
L
 
A
L
 
L
V
 
F
A
 
A
C
 
A
T
 
T
E
 
E
K
 
L
N
 
H
S
 
E
F
 
E
E
 
E
Q
 
D
V
 
L
G
 
L
I
 
A
L
 
L
A
 
R
E
 
E
M
 
A
L
 
L
G
 
K
G
 
E
I
 
V
L
 
L

P15505 Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial; Glycine cleavage system P protein; Glycine decarboxylase; Glycine dehydrogenase (aminomethyl-transferring); EC 1.4.4.2 from Gallus gallus (Chicken) (see paper)
38% identity, 76% coverage: 10:346/443 of query aligns to 64:388/1004 of P15505

query
sites
P15505
E
 
E
V
 
K
R
 
R
E
 
E
M
 
M
L
 
L
S
 
S
V
 
A
I
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
S
 
S
I
 
V
E
 
E
D
 
E
L
 
L
F
 
M
-
 
D
V
 
K
D
 
T
I
 
I
P
 
P
A
 
A
E
 
S
M
 
I
R
 
R
-
 
L
P
 
R
R
 
R
S
 
P
F
 
L
E
 
R
L
 
M
P
 
D
L
 
D
G
 
H
L
 
V
S
 
V
E
 
E
M
 
N
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
A
 
E
K
 
T
M
 
L
E
 
Y
E
 
N
M
 
I
A
 
A
A
 
S
R
 
K
N
 
N
R
 
K
T
 
I
D
 
-
V
 
W
V
 
R
S
 
S
F
 
Y
L
 
I
G
 
G
G
 
M
G
 
G
F
 
Y
Y
 
Y
S
 
N
H
 
C
H
 
S
I
 
V
P
 
P
A
 
Q
A
 
P
V
 
I
-
 
A
D
 
R
A
 
N
L
 
L
V
 
L
S
 
E
R
 
N
G
 
A
E
 
G
F
 
W
Y
 
V
T
 
T
A
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
A
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
I
 
L
F
 
L
E
 
N
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
A
 
M
V
 
V
C
 
C
R
 
D
L
 
I
L
 
T
D
 
G
M
 
M
D
 
D
C
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
A
S
 
S
V
 
L
Y
 
L
D
 
D
G
 
E
G
 
G
S
 
T
A
 
A
I
 
A
F
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
M
 
Q
M
 
L
A
 
C
V
 
H
R
 
R
A
 
Q
T
 
N
K
 
K
R
 
R
R
 
R
K
 
K
L
 
F
V
 
Y
I
 
I
D
 
D
E
 
A
A
 
R
V
 
C
S
 
H
P
 
P
I
 
-
W
 
-
R
 
-
T
 
Q
M
 
T
L
 
I
A
 
A
S
 
N
Y
 
Y
T
 
T
S
 
G
N
 
-
L
 
-
S
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
V
V
 
I
T
 
T
V
 
E
P
 
L
Q
 
K
V
 
L
D
 
P
G
 
H
R
 
E
S
 
M
D
 
D
M
 
F
A
 
S
A
 
G
M
 
K
K
 
D
A
 
V
A
 
S
V
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
F
Q
 
Q
N
 
Y
P
 
P
N
 
D
F
 
T
F
 
E
G
 
G
V
 
K
V
 
V
E
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
S
D
 
E
L
 
L
F
 
I
A
 
E
H
 
R
A
 
A
K
 
H
S
 
Q
Q
 
N
K
 
G
A
 
T
A
 
L
S
 
A
V
 
C
I
 
C
S
 
A
V
 
T
Y
 
D
P
 
L
V
 
L
M
 
A
Q
 
L
S
 
C
V
 
I
L
 
L
K
 
K
T
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
F
G
 
G
A
 
V
D
 
D
I
 
V
A
 
V
V
 
L
A
 
G
E
 
S
G
 
S
Q
 
Q
S
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
L
 
L
S
 
C
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
P
 
P
Y
 
H
L
 
A
G
 
A
I
 
F
M
 
F
T
 
A
C
 
V
T
 
K
K
 
E
D
 
N
M
 
L
V
 
V
R
 
R
Q
 
M
M
 
M
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
M
V
 
V
G
 
G
R
 
V
T
 
T
N
 
R
D
 
D
T
 
A
E
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
E
G
 
V
Y
 
Y
V
 
R
L
 
L
T
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
D
K
 
K
A
 
A
T
 
T
S
 
S
N
 
N
I
 
I
C
 
C
S
 
T
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
C
 
L
A
 
A
L
 
N
R
 
M
T
 
A
L
 
A
V
 
M
H
 
Y
L
 
G
C
 
V
L
 
Y
L
 
H
G
 
G
P
 
S
E
 
D
G
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6i33B Crystal structure of human glycine decarboxylase (p-protein)
36% identity, 77% coverage: 9:350/443 of query aligns to 23:358/925 of 6i33B

query
sites
6i33B
E
 
K
E
 
D
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
M
 
M
L
 
L
S
 
Q
V
 
T
I
 
L
G
 
G
V
 
L
Q
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
D
D
 
E
L
 
L
F
 
I
V
 
E
D
 
K
-
 
T
I
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
N
M
 
I
R
 
R
-
 
L
P
 
K
R
 
R
S
 
P
F
 
L
E
 
K
L
 
M
P
 
E
L
 
D
G
 
P
L
 
V
S
 
C
E
 
E
M
 
N
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
T
M
 
L
E
 
H
E
 
A
M
 
I
A
 
S
A
 
S
R
 
K
N
 
N
R
 
Q
T
 
I
D
 
-
V
 
W
V
 
R
S
 
S
F
 
Y
L
 
I
G
 
G
G
 
M
G
 
G
F
 
Y
Y
 
Y
S
 
N
H
 
C
H
 
S
I
 
V
P
 
P
A
 
Q
A
 
T
V
 
I
-
 
L
D
 
R
A
 
N
L
 
L
V
 
L
S
 
E
R
 
N
G
 
S
E
 
G
F
 
W
Y
 
I
T
 
T
A
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
A
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
I
 
L
F
 
L
E
 
N
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
A
 
M
V
 
V
C
 
C
R
 
D
L
 
I
L
 
T
D
 
G
M
 
L
D
 
D
C
 
M
A
 
A
N
 
N
A
 
A
S
 
S
V
 
L
Y
 
L
D
 
D
G
 
E
G
 
G
S
 
T
A
 
A
I
 
A
F
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
L
M
 
Q
M
 
L
A
 
C
V
 
Y
R
 
R
A
 
H
T
 
N
K
 
K
R
 
R
R
 
R
K
 
K
L
 
F
V
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
P
A
 
R
V
 
C
S
 
H
P
 
P
I
 
-
W
 
-
R
 
Q
T
 
T
M
 
I
L
 
A
A
 
V
S
 
V
Y
 
Q
T
 
T
S
 
R
N
 
A
L
 
K
S
 
Y
L
 
T
D
 
G
L
 
V
V
 
L
T
 
T
V
 
E
P
 
L
Q
 
K
V
 
L
D
 
P
G
 
C
R
 
E
S
 
M
D
 
D
M
 
F
A
 
S
A
 
G
M
 
K
K
 
D
A
 
V
A
 
S
V
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
F
Q
 
Q
N
 
Y
P
 
P
N
 
D
F
 
T
F
 
E
G
 
G
V
 
K
V
 
V
E
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
T
D
 
E
L
 
L
F
 
V
A
 
E
H
 
R
A
 
A
K
 
H
S
 
Q
Q
 
S
K
 
G
A
 
S
A
 
L
S
 
A
V
 
C
I
 
C
S
 
A
V
 
T
Y
 
D
P
 
L
V
 
L
M
 
A
Q
 
L
S
 
C
V
 
I
L
 
L
K
 
R
T
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
F
G
 
G
A
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
S
G
 
S
Q
 
Q
S
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
L
 
L
S
 
G
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
P
 
P
Y
 
H
L
 
A
G
 
A
I
 
F
M
 
F
T
 
A
C
 
V
T
 
R
K
 
E
D
 
S
M
 
L
V
 
V
R
 
R
Q
 
M
M
 
M
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
M
V
 
V
G
 
G
R
 
V
T
 
T
N
 
R
D
 
D
T
 
A
E
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
E
G
 
V
Y
 
Y
V
 
R
L
 
L
T
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
D
K
 
K
A
 
A
T
 
T
S
 
S
N
 
N
I
 
I
C
|
C
S
x
T
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
C
 
L
A
 
A
L
 
N
R
 
M
T
 
A
L
 
A
V
 
M
H
 
F
L
 
A
C
 
I
L
 
Y
L
 
H
G
 
G
P
 
S
E
 
H
G
 
G
L
 
L
I
 
E
R
 
H
T
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6i35A Crystal structure of human glycine decarboxylase (p-protein) bound with pyridoxyl-glycine-5'-monophosphate
36% identity, 77% coverage: 9:350/443 of query aligns to 25:360/953 of 6i35A

query
sites
6i35A
E
 
K
E
 
D
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
M
 
M
L
 
L
S
 
Q
V
 
T
I
 
L
G
 
G
V
 
L
Q
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
D
D
 
E
L
 
L
F
 
I
V
 
E
D
 
K
-
 
T
I
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
N
M
 
I
R
 
R
-
 
L
P
 
K
R
 
R
S
 
P
F
 
L
E
 
K
L
 
M
P
 
E
L
 
D
G
 
P
L
 
V
S
 
C
E
 
E
M
 
N
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
T
M
 
L
E
 
H
E
 
A
M
 
I
A
 
S
A
 
S
R
 
K
N
 
N
R
 
Q
T
 
I
D
 
-
V
 
W
V
 
R
S
 
S
F
 
Y
L
 
I
G
 
G
G
 
M
G
 
G
F
 
Y
Y
 
Y
S
 
N
H
 
C
H
 
S
I
 
V
P
 
P
A
 
Q
A
 
T
V
 
I
-
 
L
D
 
R
A
 
N
L
 
L
V
 
L
S
 
E
R
 
N
G
 
S
E
 
G
F
 
W
Y
 
I
T
 
T
A
 
Q
Y
|
Y
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
A
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
I
 
L
F
 
L
E
 
N
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
A
 
M
V
 
V
C
 
C
R
 
D
L
 
I
L
 
T
D
 
G
M
 
L
D
 
D
C
 
M
A
 
A
N
 
N
A
 
A
S
 
S
V
 
L
Y
 
L
D
 
D
G
 
E
G
 
G
S
 
T
A
 
A
I
 
A
F
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
L
M
 
Q
M
 
L
A
 
C
V
 
Y
R
 
R
A
 
H
T
 
N
K
 
K
R
 
R
R
 
R
K
 
K
L
 
F
V
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
P
A
 
R
V
 
C
S
 
H
P
 
P
I
 
-
W
 
-
R
 
Q
T
 
T
M
 
I
L
 
A
A
 
V
S
 
V
Y
 
Q
T
 
T
S
 
R
N
 
A
L
 
K
S
 
Y
L
 
T
D
 
G
L
 
V
V
 
L
T
 
T
V
 
E
P
 
L
Q
 
K
V
 
L
D
 
P
G
 
C
R
 
E
S
 
M
D
 
D
M
 
F
A
 
S
A
 
G
M
 
K
K
 
D
A
 
V
A
 
S
V
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
F
Q
 
Q
N
 
Y
P
 
P
N
 
D
F
 
T
F
 
E
G
 
G
V
 
K
V
 
V
E
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
T
D
 
E
L
 
L
F
 
V
A
 
E
H
 
R
A
 
A
K
 
H
S
 
Q
Q
 
S
K
 
G
A
 
S
A
 
L
S
 
A
V
 
C
I
 
C
S
 
A
V
 
T
Y
 
D
P
 
L
V
 
L
M
 
A
Q
 
L
S
 
C
V
 
I
L
 
L
K
 
R
T
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
F
G
 
G
A
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
S
G
 
S
Q
 
Q
S
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
L
 
L
S
 
G
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
P
 
P
Y
 
H
L
 
A
G
 
A
I
 
F
M
 
F
T
 
A
C
 
V
T
 
R
K
 
E
D
 
S
M
 
L
V
 
V
R
 
R
Q
 
M
M
 
M
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
M
V
 
V
G
 
G
R
 
V
T
 
T
N
 
R
D
 
D
T
 
A
E
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
E
G
 
V
Y
 
Y
V
 
R
L
 
L
T
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
D
K
 
K
A
 
A
T
 
T
S
 
S
N
 
N
I
 
I
C
|
C
S
x
T
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
C
 
L
A
 
A
L
 
N
R
 
M
T
 
A
L
 
A
V
 
M
H
 
F
L
 
A
C
 
I
L
 
Y
L
 
H
G
 
G
P
 
S
E
 
H
G
 
G
L
 
L
I
 
E
R
 
H
T
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6i33A Crystal structure of human glycine decarboxylase (p-protein)
36% identity, 77% coverage: 9:350/443 of query aligns to 25:360/950 of 6i33A

query
sites
6i33A
E
 
K
E
 
D
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
M
 
M
L
 
L
S
 
Q
V
 
T
I
 
L
G
 
G
V
 
L
Q
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
D
D
 
E
L
 
L
F
 
I
V
 
E
D
 
K
-
 
T
I
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
N
M
 
I
R
 
R
-
 
L
P
 
K
R
 
R
S
 
P
F
 
L
E
 
K
L
 
M
P
 
E
L
 
D
G
 
P
L
 
V
S
 
C
E
 
E
M
 
N
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
T
M
 
L
E
 
H
E
 
A
M
 
I
A
 
S
A
 
S
R
 
K
N
 
N
R
 
Q
T
 
I
D
 
-
V
 
W
V
 
R
S
 
S
F
 
Y
L
 
I
G
 
G
G
 
M
G
 
G
F
 
Y
Y
 
Y
S
 
N
H
 
C
H
 
S
I
 
V
P
 
P
A
 
Q
A
 
T
V
 
I
-
 
L
D
 
R
A
 
N
L
 
L
V
 
L
S
 
E
R
 
N
G
 
S
E
 
G
F
 
W
Y
 
I
T
 
T
A
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
A
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
I
 
L
F
 
L
E
 
N
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
A
 
M
V
 
V
C
 
C
R
 
D
L
 
I
L
 
T
D
 
G
M
 
L
D
 
D
C
 
M
A
 
A
N
 
N
A
 
A
S
 
S
V
 
L
Y
 
L
D
 
D
G
 
E
G
 
G
S
 
T
A
 
A
I
 
A
F
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
L
M
 
Q
M
 
L
A
 
C
V
 
Y
R
 
R
A
 
H
T
 
N
K
 
K
R
 
R
R
 
R
K
 
K
L
 
F
V
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
P
A
 
R
V
 
C
S
 
H
P
 
P
I
 
-
W
 
-
R
 
Q
T
 
T
M
 
I
L
 
A
A
 
V
S
 
V
Y
 
Q
T
 
T
S
 
R
N
 
A
L
 
K
S
 
Y
L
 
T
D
 
G
L
 
V
V
 
L
T
 
T
V
 
E
P
 
L
Q
 
K
V
 
L
D
 
P
G
 
C
R
 
E
S
 
M
D
 
D
M
 
F
A
 
S
A
 
G
M
 
K
K
 
D
A
 
V
A
 
S
V
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
F
Q
 
Q
N
 
Y
P
 
P
N
 
D
F
 
T
F
 
E
G
 
G
V
 
K
V
 
V
E
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
T
D
 
E
L
 
L
F
 
V
A
 
E
H
 
R
A
 
A
K
 
H
S
 
Q
Q
 
S
K
 
G
A
 
S
A
 
L
S
 
A
V
 
C
I
 
C
S
 
A
V
 
T
Y
 
D
P
 
L
V
 
L
M
 
A
Q
 
L
S
 
C
V
 
I
L
 
L
K
 
R
T
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
F
G
 
G
A
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
S
G
 
S
Q
 
Q
S
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
L
 
L
S
 
G
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
P
 
P
Y
 
H
L
 
A
G
 
A
I
 
F
M
 
F
T
 
A
C
 
V
T
 
R
K
 
E
D
 
S
M
 
L
V
 
V
R
 
R
Q
 
M
M
 
M
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
M
V
 
V
G
 
G
R
 
V
T
 
T
N
 
R
D
 
D
T
 
A
E
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
E
G
 
V
Y
 
Y
V
 
R
L
 
L
T
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
D
K
 
K
A
 
A
T
 
T
S
 
S
N
 
N
I
 
I
C
|
C
S
x
T
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
C
 
L
A
 
A
L
 
N
R
 
M
T
 
A
L
 
A
V
 
M
H
 
F
L
 
A
C
 
I
L
 
Y
L
 
H
G
 
G
P
 
S
E
 
H
G
 
G
L
 
L
I
 
E
R
 
H
T
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6i34B Crystal structure of neanderthal glycine decarboxylase (p-protein)
36% identity, 77% coverage: 9:350/443 of query aligns to 23:358/954 of 6i34B

query
sites
6i34B
E
 
K
E
 
D
V
 
Q
R
 
R
E
 
E
M
 
M
L
 
L
S
 
Q
V
 
T
I
 
L
G
 
G
V
 
L
Q
 
A
S
 
S
I
 
I
E
 
D
D
 
E
L
 
L
F
 
I
V
 
E
D
 
K
-
 
T
I
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
N
M
 
I
R
 
R
-
 
L
P
 
K
R
 
R
S
 
P
F
 
L
E
 
K
L
 
M
P
 
E
L
 
D
G
 
P
L
 
V
S
 
C
E
 
E
M
 
N
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
A
 
A
K
 
T
M
 
L
E
 
H
E
 
A
M
 
I
A
 
S
A
 
S
R
 
K
N
 
N
R
 
Q
T
 
I
D
 
-
V
 
W
V
 
R
S
 
S
F
 
Y
L
 
I
G
 
G
G
 
M
G
 
G
F
 
Y
Y
 
Y
S
 
N
H
 
C
H
 
S
I
 
V
P
 
P
A
 
Q
A
 
T
V
 
I
-
 
L
D
 
R
A
 
N
L
 
L
V
 
L
S
 
E
R
 
N
G
 
S
E
 
G
F
 
W
Y
 
I
T
 
T
A
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
E
 
E
A
 
V
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
I
 
L
F
 
L
E
 
N
Y
 
Y
Q
 
Q
T
 
T
A
 
M
V
 
V
C
 
C
R
 
D
L
 
I
L
 
T
D
 
G
M
 
L
D
 
D
C
 
M
A
 
A
N
 
N
A
 
A
S
 
S
V
 
L
Y
 
L
D
 
D
G
 
E
G
 
G
S
 
T
A
 
A
I
 
A
F
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
L
M
 
Q
M
 
L
A
 
C
V
 
Y
R
 
R
A
 
H
T
 
N
K
 
K
R
 
R
R
 
R
K
 
K
L
 
F
V
 
F
I
 
V
D
 
D
E
 
P
A
 
R
V
 
C
S
 
H
P
 
P
I
 
-
W
 
-
R
 
Q
T
 
T
M
 
I
L
 
A
A
 
V
S
 
V
Y
 
Q
T
 
T
S
 
R
N
 
A
L
 
K
S
 
Y
L
 
T
D
 
G
L
 
V
V
 
L
T
 
T
V
 
E
P
 
L
Q
 
K
V
 
L
D
 
P
G
 
C
R
 
E
S
 
M
D
 
D
M
 
F
A
 
S
A
 
G
M
 
K
K
 
D
A
 
V
A
 
S
V
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
C
 
-
A
 
-
A
 
G
V
 
V
V
 
L
V
 
F
Q
 
Q
N
 
Y
P
 
P
N
 
D
F
 
T
F
 
E
G
 
G
V
 
K
V
 
V
E
 
E
D
 
D
F
 
F
T
 
T
D
 
E
L
 
L
F
 
V
A
 
E
H
 
R
A
 
A
K
 
H
S
 
Q
Q
 
S
K
 
G
A
 
S
A
 
L
S
 
A
V
 
C
I
 
C
S
 
A
V
 
T
Y
 
D
P
 
L
V
 
L
M
 
A
Q
 
L
S
 
C
V
 
I
L
 
L
K
 
R
T
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
F
G
 
G
A
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
L
A
 
G
E
 
S
G
 
S
Q
 
Q
S
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
L
 
L
S
 
G
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
P
 
P
Y
 
H
L
 
A
G
 
A
I
 
F
M
 
F
T
 
A
C
 
V
T
 
R
K
 
E
D
 
S
M
 
L
V
 
V
R
 
R
Q
 
M
M
 
M
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
M
V
 
V
G
 
G
R
 
V
T
 
T
N
 
R
D
 
D
T
 
A
E
 
T
G
 
G
R
 
K
T
 
E
G
 
V
Y
 
Y
V
 
R
L
 
L
T
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
D
K
 
K
A
 
A
T
 
T
S
 
S
N
 
N
I
 
I
C
|
C
S
x
T
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
C
 
L
A
 
A
L
 
N
R
 
M
T
 
A
L
 
A
V
 
M
H
 
F
L
 
A
C
 
I
L
 
Y
L
 
H
G
 
G
P
 
S
E
 
H
G
 
G
L
 
L
I
 
E
R
 
H
T
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q94B78 Glycine dehydrogenase (decarboxylating) 1, mitochondrial; Glycine cleavage system P protein 1; Glycine decarboxylase 1; Glycine decarboxylase P-protein 1; AtGLDP1; Glycine dehydrogenase (aminomethyl-transferring) 1; EC 1.4.4.2 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
32% identity, 86% coverage: 7:388/443 of query aligns to 87:455/1037 of Q94B78

query
sites
Q94B78
S
 
T
P
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
Q
R
 
T
E
 
H
M
 
M
L
 
A
S
 
K
V
 
F
I
x
C
G
 
G
V
 
F
Q
 
D
S
 
H
I
 
I
E
 
D
D
 
S
L
 
L
F
 
I
-
 
D
V
 
A
D
 
T
I
 
V
P
 
P
A
 
K
E
 
S
M
 
I
R
 
R
P
 
L
R
 
D
S
 
S
F
 
M
E
 
K
L
 
F
P
 
S
-
 
K
-
 
F
-
 
D
L
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
E
M
 
S
Q
 
Q
V
 
M
L
 
I
A
 
Q
K
 
H
M
 
M
E
 
V
E
 
D
M
 
L
A
 
A
A
 
S
R
 
K
N
 
N
R
 
K
T
 
V
D
 
-
V
 
F
V
 
K
S
 
S
F
 
F
L
 
I
G
 
G
G
 
M
G
 
G
F
 
Y
Y
 
Y
S
 
N
H
 
T
H
 
H
I
 
V
P
 
P
A
 
T
A
 
V
V
 
I
-
 
L
D
 
R
A
 
N
L
 
I
V
 
M
S
 
E
R
 
N
G
 
P
E
 
A
F
 
W
Y
 
Y
T
 
T
A
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
P
 
A
E
 
E
A
 
I
S
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
I
 
L
F
 
L
E
 
N
Y
 
F
Q
 
Q
T
 
T
A
 
V
V
 
I
C
 
T
R
 
D
L
 
L
L
 
T
D
 
G
M
 
L
D
 
P
C
 
M
A
 
S
N
 
N
A
 
A
S
 
S
V
 
L
Y
 
L
D
 
D
G
 
E
G
 
G
S
 
T
A
 
A
I
 
A
F
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
M
 
A
M
 
M
A
 
C
-
 
N
-
 
N
V
 
I
R
 
L
A
 
K
T
 
G
K
 
K
R
 
K
R
 
K
K
 
T
L
 
F
V
 
V
I
 
I
D
 
A
E
 
S
A
 
N
V
 
C
S
 
H
P
 
P
I
 
Q
W
 
T
R
 
I
T
 
D
M
 
V
L
 
C
A
 
K
S
 
T
Y
 
R
T
 
A
S
 
D
N
 
G
L
 
F
S
 
D
L
 
L
D
 
K
L
 
V
V
 
V
T
 
T
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
S
D
 
D
M
 
L
A
 
K
A
 
D
M
 
I
K
 
D
A
 
Y
A
 
S
V
 
S
D
 
G
T
 
D
G
 
V
C
 
C
A
 
G
A
 
-
V
 
V
V
 
L
V
 
V
Q
 
Q
N
 
Y
P
 
P
N
 
G
F
 
T
F
 
E
G
 
G
V
 
E
V
 
V
E
 
L
D
 
D
F
 
Y
T
 
A
D
 
E
L
 
F
F
 
V
A
 
K
H
 
N
A
 
A
K
 
H
S
 
A
Q
 
N
K
 
G
A
 
V
A
 
K
S
 
V
V
 
V
I
 
M
S
 
A
V
 
T
Y
 
D
P
 
L
V
 
L
M
 
A
Q
 
L
S
 
T
V
 
V
L
 
L
K
 
K
T
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
F
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
V
V
 
V
A
 
G
E
 
S
G
 
A
Q
 
Q
S
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
L
 
M
S
 
G
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
P
 
P
Y
 
H
L
 
A
G
 
A
I
 
F
M
 
L
T
 
A
C
 
T
T
 
S
K
 
Q
D
 
E
M
 
Y
V
 
K
R
 
R
Q
 
M
M
 
M
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
G
 
G
R
 
I
T
 
S
N
 
V
D
 
D
T
 
S
E
 
S
G
 
G
R
 
K
T
 
Q
G
 
A
Y
 
L
V
 
R
L
 
M
T
 
A
L
 
M
Q
 
Q
A
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
D
K
 
K
A
 
A
T
 
T
S
 
S
N
 
N
I
 
I
C
|
C
S
 
T
N
 
A
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
C
 
L
A
 
A
L
 
N
R
 
M
T
 
A
L
 
A
V
 
M
H
 
Y
L
 
A
C
 
V
L
 
Y
L
 
H
G
 
G
P
 
P
E
 
A
G
 
G
L
 
L
I
 
K
R
 
S
T
 
I
A
 
A
E
 
-
L
 
-
S
 
-
M
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
Y
 
-
A
 
-
M
 
-
E
 
Q
R
 
R
L
 
V
T
 
H
A
 
G
I
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
F
P
 
S
L
 
L
N
 
G
T
 
L
A
 
N
P
 
K
F
 
L
G
 
G
N
 
V
E
 
A
F
 
E
A
 
V
V
 
Q
R
 
E
L
 
L
P
 
P
I
 
F

Sites not aligning to the query:

4lhdA Crystal structure of synechocystis sp. Pcc 6803 glycine decarboxylase (p-protein), holo form with pyridoxal-5'-phosphate and glycine, closed flexible loop (see paper)
34% identity, 77% coverage: 10:350/443 of query aligns to 30:365/952 of 4lhdA

query
sites
4lhdA
E
 
E
V
 
Q
R
 
R
E
 
Q
M
 
M
L
 
L
S
 
Q
V
 
T
I
 
L
G
 
G
V
 
F
Q
 
D
S
 
T
I
 
L
E
 
G
D
 
D
L
 
L
F
 
I
V
 
D
D
 
Q
-
 
A
I
 
V
P
 
P
A
 
P
E
 
A
M
 
I
R
 
R
-
 
F
P
 
P
R
 
R
S
 
S
F
 
L
E
x
Q
L
|
L
P
|
P
L
 
A
G
 
S
L
 
Q
S
|
S
E
 
E
M
x
Y
Q
 
G
V
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
Q
M
 
L
E
 
K
E
 
S
M
 
I
A
 
A
A
 
S
R
 
K
N
 
N
R
 
Q
T
 
V
D
 
-
V
 
F
V
 
R
S
 
S
F
 
Y
L
 
I
G
 
G
G
 
M
G
 
G
F
 
Y
Y
 
Y
S
 
D
H
 
T
H
 
I
I
 
T
P
 
P
A
 
P
A
 
V
V
 
I
D
 
Q
-
 
R
A
 
N
L
 
I
V
 
L
S
 
E
R
 
N
G
 
P
E
 
G
F
 
W
Y
 
Y
T
 
T
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Q
 
Q
P
 
A
E
 
E
A
 
I
S
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
I
 
L
F
 
L
E
 
N
Y
 
F
Q
 
Q
T
 
T
A
 
M
V
 
V
C
 
M
R
x
D
L
 
L
L
 
T
D
 
G
M
 
L
D
 
E
C
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
S
 
S
V
 
L
Y
 
L
D
 
D
G
 
E
G
 
G
S
 
T
A
 
A
I
 
A
F
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
M
 
A
M
 
L
A
 
S
-
 
Y
-
 
G
V
 
V
R
 
S
A
 
K
T
 
S
K
 
K
R
 
A
R
 
N
K
 
A
L
 
F
V
 
F
I
 
V
D
 
A
E
 
Q
A
 
D
V
 
C
S
 
H
P
 
P
I
 
Q
W
 
T
R
 
I
T
 
E
M
 
V
L
 
I
A
 
K
S
 
T
Y
 
R
T
 
A
S
 
N
N
 
P
L
 
L
S
 
G
L
 
I
D
 
E
L
 
V
V
 
I
T
 
V
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
V
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
G
D
 
D
M
 
H
A
 
H
A
 
T
M
 
F
K
 
-
A
 
-
A
 
S
V
 
F
D
 
S
T
 
T
G
 
S
C
 
I
A
 
F
A
 
G
V
 
A
V
 
L
V
 
L
Q
 
Q
N
 
Y
P
 
P
N
 
A
F
 
T
F
 
D
G
 
G
V
 
A
V
 
V
E
 
Y
D
 
D
F
 
Y
T
 
R
D
 
S
L
 
F
F
 
I
A
 
D
H
 
K
A
 
A
K
 
H
S
 
Q
Q
 
H
K
 
Q
A
 
A
A
 
L
S
 
V
V
 
T
I
 
L
S
 
A
V
 
A
Y
 
D
P
 
P
V
 
L
M
 
S
Q
 
L
S
 
T
V
 
L
L
 
L
K
 
T
T
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
E
M
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
G
E
 
S
G
 
T
Q
 
Q
S
 
R
L
 
F
G
 
G
Q
 
I
P
 
P
L
 
L
S
 
G
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
P
 
P
Y
 
H
L
 
A
G
 
A
I
 
Y
M
 
F
T
 
A
C
 
T
T
 
K
K
 
A
D
 
E
M
 
Y
V
 
Q
R
 
R
Q
 
K
M
 
M
P
 
P
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
V
T
 
S
N
 
K
D
 
D
T
 
A
E
 
H
G
 
G
R
 
N
T
 
P
G
 
A
Y
 
L
V
 
R
L
 
L
T
 
A
L
 
L
Q
 
Q
A
 
T
R
 
R
E
 
E
Q
 
Q
H
 
H
I
 
I
R
 
R
R
 
R
A
 
D
K
 
K
A
 
A
T
 
T
S
 
S
N
 
N
I
 
I
C
 
C
S
 
T
N
 
A
Q
 
Q
A
 
V
L
 
L
C
 
L
A
 
A
L
 
V
R
 
M
T
 
A
L
 
S
V
 
M
H
 
Y
L
 
G
C
 
V
L
 
Y
L
 
H
G
 
G
P
 
S
E
 
T
G
 
G
L
 
L
I
 
K
R
 
N
T
 
I
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1wyuB Crystal structure of glycine decarboxylase (p-protein) of the glycine cleavage system, in holo form (see paper)
26% identity, 78% coverage: 97:443/443 of query aligns to 94:437/473 of 1wyuB

query
sites
1wyuB
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
-
 
D
P
 
P
E
 
R
A
 
T
S
 
A
Q
 
Q
G
 
G
T
 
A
L
 
L
Q
 
R
A
 
L
I
 
M
F
 
W
E
 
E
Y
 
L
Q
 
G
T
 
E
A
 
Y
V
 
L
C
 
K
R
 
A
L
 
L
L
 
T
D
 
G
M
 
M
D
 
D
C
 
A
A
 
I
N
 
T
A
 
L
S
 
E
V
 
P
Y
 
A
D
x
A
G
|
G
G
x
A
S
 
H
A
 
G
I
 
E
F
 
L
E
 
T
A
 
G
M
 
I
M
 
L
M
 
I
A
 
-
V
 
I
R
 
R
A
 
A
-
 
Y
-
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
G
-
 
R
T
 
T
K
 
R
R
 
R
R
 
V
K
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
P
D
 
D
E
 
S
A
 
A
-
x
H
-
 
G
V
 
S
S
 
N
P
 
P
I
 
A
W
 
T
R
 
A
T
 
S
M
 
M
L
 
-
A
 
A
S
 
G
Y
 
Y
T
 
Q
S
 
V
N
 
R
L
 
-
S
 
-
L
 
-
D
 
E
L
 
I
V
 
P
T
 
S
V
 
G
P
 
P
Q
 
E
V
 
-
D
 
-
G
 
G
R
 
E
S
 
V
D
 
D
M
 
L
A
 
E
A
 
A
M
 
L
K
 
K
A
 
R
A
 
E
V
 
L
D
 
G
T
 
P
G
 
H
C
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
L
V
 
M
V
 
L
Q
 
T
N
 
N
P
 
P
N
 
N
F
 
T
F
 
L
G
 
G
V
 
L
V
 
F
E
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
I
-
 
L
D
 
E
F
 
I
T
 
S
D
 
R
L
 
L
F
 
C
A
 
K
H
 
E
A
 
A
K
 
G
S
 
V
Q
 
Q
K
 
L
A
 
Y
A
 
Y
S
x
D
V
 
G
I
x
A
S
 
N
V
 
L
Y
 
N
P
 
A
V
 
I
M
 
M
Q
 
G
S
 
W
V
 
A
L
 
-
K
 
-
T
 
R
P
 
P
G
 
G
E
 
D
M
 
M
G
 
G
A
 
F
D
 
D
I
 
V
A
 
V
-
 
H
V
 
L
A
x
N
E
 
L
G
x
H
Q
x
K
S
 
T
L
 
F
G
 
T
Q
 
V
P
 
P
L
 
H
S
 
G
F
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
P
Y
 
G
L
 
S
G
 
G
I
 
P
M
 
V
T
 
G
C
 
V
T
 
K
K
 
A
D
 
H
M
 
L
V
 
A
R
 
P
Q
 
Y
M
 
L
P
 
P
G
 
V
R
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
E
R
 
R
T
 
-
N
 
-
D
 
-
T
 
-
E
 
-
G
 
G
R
 
E
T
 
E
G
 
G
Y
 
F
V
 
Y
L
 
L
T
 
D
L
 
F
Q
 
D
A
 
-
R
 
R
E
 
P
Q
 
K
H
 
S
I
 
I
R
 
G
R
 
R
A
 
V
K
 
R
A
 
S
T
 
-
S
 
-
N
 
-
I
 
-
C
 
F
S
 
Y
N
 
G
Q
 
N
A
 
F
L
 
L
C
 
A
A
 
L
L
 
V
R
 
R
T
 
A
L
 
W
V
 
A
H
 
Y
L
 
I
C
 
R
L
 
T
L
 
L
G
 
G
P
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
K
R
 
K
T
 
A
A
 
A
E
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
V
E
 
L
R
 
N
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
A
 
L
M
 
K
E
 
E
R
 
L
L
 
L
T
 
K
A
 
E
I
 
-
A
 
K
G
 
G
V
 
Y
R
 
R
P
 
V
L
 
P
N
 
Y
T
 
D
A
 
G
P
 
P
F
 
S
G
 
M
N
 
H
E
 
E
F
 
F
A
 
V
V
 
A
R
 
Q
L
 
-
P
 
P
I
 
P
P
 
E
A
 
G
F
 
F
E
 
R
A
 
A
V
 
L
D
 
D
R
 
-
L
 
-
T
 
L
A
 
A
R
 
K
G
 
G
Y
 
L
V
 
L
P
 
E
-
 
L
G
 
G
F
 
F
-
 
H
-
 
P
P
 
P
V
 
T
G
 
V
R
 
Y
Y
 
F
Y
 
P
A
 
L
G
 
I
M
 
V
D
 
K
D
 
E
V
 
A
L
 
L
L
 
M
V
 
V
A
 
E
C
 
P
T
 
T
E
 
E
K
 
T
N
 
E
S
 
A
F
 
K
E
 
E
Q
 
T
V
 
L
G
 
E
I
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
E
M
 
A
L
 
M
G
 
G
G
 
A
I
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>8499452 FitnessBrowser__Miya:8499452
MPFIPHSPEEVREMLSVIGVQSIEDLFVDIPAEMRPRSFELPLGLSEMQVLAKMEEMAAR
NRTDVVSFLGGGFYSHHIPAAVDALVSRGEFYTAYTPYQPEASQGTLQAIFEYQTAVCRL
LDMDCANASVYDGGSAIFEAMMMAVRATKRRKLVIDEAVSPIWRTMLASYTSNLSLDLVT
VPQVDGRSDMAAMKAAVDTGCAAVVVQNPNFFGVVEDFTDLFAHAKSQKAASVISVYPVM
QSVLKTPGEMGADIAVAEGQSLGQPLSFGGPYLGIMTCTKDMVRQMPGRIVGRTNDTEGR
TGYVLTLQAREQHIRRAKATSNICSNQALCALRTLVHLCLLGPEGLIRTAELSMERARYA
MERLTAIAGVRPLNTAPFGNEFAVRLPIPAFEAVDRLTARGYVPGFPVGRYYAGMDDVLL
VACTEKNSFEQVGILAEMLGGIL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory