SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8499505 FitnessBrowser__Miya:8499505 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9FG67 Methylthioalkylmalate synthase 1, chloroplastic; 2-isopropylmalate synthase 3; EC 2.3.3.17 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
30% identity, 65% coverage: 5:357/540 of query aligns to 85:447/506 of Q9FG67

query
sites
Q9FG67
I
 
V
Q
 
R
L
 
V
Y
 
F
D
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
G
S
 
E
Q
 
Q
S
 
S
E
 
P
D
 
G
I
 
G
N
x
S
L
 
L
T
 
T
A
 
P
A
 
P
D
 
Q
K
 
K
L
 
L
K
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
R
K
 
Q
L
 
L
D
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
R
I
 
V
D
 
D
R
 
I
I
 
M
E
 
E
G
 
V
G
 
G
W
 
F
P
 
P
G
 
G
S
 
S
N
 
S
P
 
E
V
 
E
D
 
E
V
 
L
A
 
E
F
 
T
F
 
I
K
 
K
E
 
T
I
 
I
A
 
A
N
 
K
Y
 
T
H
 
V
L
 
G
K
 
N
H
 
E
A
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
V
-
 
P
V
 
V
I
 
I
S
 
C
A
 
A
F
 
I
G
 
A
S
 
R
T
 
C
H
 
K
H
 
H
P
 
-
N
 
-
F
 
-
T
 
-
A
 
R
D
 
D
S
 
I
D
 
E
P
 
A
N
 
T
L
 
W
R
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
K
E
 
Y
S
 
A
G
 
K
A
 
R
R
 
P
V
 
R
A
 
I
S
 
L
I
 
V
F
 
F
G
 
T
K
 
S
S
 
T
C
 
S
E
 
D
V
 
I
H
 
H
A
 
M
A
 
K
E
 
Y
A
 
K
L
 
L
R
 
K
L
 
K
D
 
T
A
 
Q
A
 
E
R
 
E
N
 
V
L
 
I
E
 
E
I
 
M
I
 
A
G
 
V
D
 
S
S
 
S
V
 
I
A
 
R
F
 
F
L
 
A
K
 
K
G
 
S
-
 
L
K
 
G
L
 
F
A
 
N
E
 
D
V
 
I
Y
 
Q
F
 
F
D
 
G
A
 
C
E
 
E
H
 
-
F
 
-
F
 
-
D
 
D
G
 
G
Y
 
G
R
 
R
H
 
S
N
 
D
A
 
K
A
 
D
Y
 
F
A
 
L
L
 
C
S
 
K
A
 
I
L
 
L
R
 
G
R
 
E
A
 
A
H
 
I
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
V
D
 
T
V
 
V
L
 
V
V
 
T
L
 
I
C
 
G
D
 
D
T
 
T
N
 
V
G
 
G
G
 
I
T
 
N
L
 
M
P
 
P
H
 
H
E
 
E
V
 
Y
A
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
V
T
 
T
E
 
Y
V
 
L
R
 
K
E
 
A
A
 
N
L
 
T
P
 
P
G
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
D
A
 
V
A
 
V
V
 
V
G
x
A
I
 
V
H
 
H
A
 
C
H
 
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
E
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
T
A
 
A
N
 
N
S
 
S
I
 
I
A
 
A
A
 
G
V
 
I
Q
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
R
Q
 
Q
I
 
V
Q
 
E
G
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
C
 
S
G
 
G
N
 
N
A
 
A
N
 
S
L
 
L
C
 
E
S
 
E
I
 
V
I
 
V
P
 
M
T
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
C
K
 
R
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
V
F
 
I
G
 
N
G
 
G
E
 
V
Y
 
Y
T
 
T
C
 
K
L
 
I
P
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
D
L
 
T
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
I
T
 
M
A
 
A
V
 
T
A
 
S
A
 
K
Y
 
M
V
 
V
S
 
Q
E
 
E
V
 
Y
A
 
T
N
 
G
I
 
L
P
 
Y
P
 
V
F
 
Q
S
 
A
R
 
H
Q
 
K
P
 
P
Y
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
A
S
 
N
A
 
C
F
 
F
A
 
V
H
 
H
K
 
E
G
 
S
G
 
G
V
 
I
H
 
H
V
 
Q
S
 
D
A
 
G
V
 
I
N
 
L
R
 
K
K
 
N
S
 
R
S
 
S
L
 
T
Y
 
Y
E
 
E
H
 
I
I
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
E
V
 
D
V
 
I
G
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
S
N
 
Q
R
 
N
Q
 
S
R
 
G
I
 
L
L
 
V
I
 
L
T
 
G
E
 
K
L
 
L
A
 
S
G
 
G
R
 
R
S
 
H
N
 
A
I
 
V
V
 
K
S
 
D
L
 
R
A
 
L
R
 
K
R
 
E
F
 
L
G
 
G
F
 
Y
H
 
E
L
 
L
D
 
D
K
 
D
D
 
E
E
 
K

6e1jA Crystal structure of methylthioalkylmalate synthase (bjumam1.1) from brassica juncea (see paper)
30% identity, 65% coverage: 5:357/540 of query aligns to 18:380/409 of 6e1jA

query
sites
6e1jA
I
 
V
Q
 
R
L
 
V
Y
 
F
D
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
L
R
|
R
D
|
D
G
 
G
S
 
E
Q
|
Q
S
 
S
E
 
P
D
 
G
I
 
A
N
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
P
A
 
P
D
 
Q
K
 
K
L
 
I
K
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
R
K
 
Q
L
 
L
D
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
R
I
 
V
D
 
D
R
 
I
I
 
M
E
 
E
G
 
V
G
 
G
W
x
F
P
 
P
G
 
V
S
|
S
N
 
S
P
 
E
V
 
E
D
 
E
V
 
F
A
 
E
F
 
T
F
 
I
K
 
Q
E
 
T
I
 
I
A
 
A
N
 
K
Y
 
-
H
 
T
L
 
V
K
 
G
H
 
N
A
 
E
V
|
V
I
 
D
S
x
E
A
 
E
F
 
T
G
 
G
S
 
Y
T
 
I
H
 
P
H
 
V
P
 
I
N
 
C
F
 
V
T
x
I
A
 
A
D
x
R
S
|
S
-
x
K
D
 
E
P
 
R
N
 
D
L
 
I
R
 
K
A
 
A
I
 
A
A
 
W
E
 
E
S
 
S
-
 
V
-
 
K
-
 
Y
-
 
A
-
 
K
G
 
R
A
 
P
R
 
R
V
 
I
A
 
V
S
 
-
I
 
I
F
|
F
G
x
T
K
 
S
S
 
T
C
 
S
E
 
D
V
 
I
H
 
H
A
 
L
A
 
K
E
 
Y
A
x
K
L
|
L
R
 
K
L
 
M
D
 
T
A
 
R
A
 
E
R
 
E
N
 
V
L
 
V
E
 
D
I
 
M
I
 
V
G
 
A
D
 
S
S
 
S
V
 
I
A
 
R
F
 
F
L
 
A
K
 
K
G
 
S
-
 
L
K
 
G
L
 
F
A
 
E
E
 
D
V
 
I
Y
 
E
F
 
F
D
x
G
A
 
C
E
|
E
H
 
-
F
 
-
F
 
-
D
 
D
G
 
G
Y
 
G
R
 
R
H
 
S
N
 
D
A
 
K
A
 
D
Y
 
Y
A
 
I
L
 
C
S
 
T
A
 
V
L
 
F
R
 
E
R
 
E
A
 
A
H
 
I
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
V
 
T
L
 
L
V
 
A
L
 
C
C
x
P
D
 
D
T
|
T
N
 
V
G
 
G
G
 
I
T
 
N
L
 
M
P
 
P
H
 
H
E
 
E
V
 
Y
A
 
G
R
 
K
I
 
L
V
 
V
T
 
R
E
 
Y
V
 
I
R
 
K
E
 
A
A
 
N
L
 
T
P
 
P
G
 
G
-
 
I
-
 
D
-
 
D
A
 
V
A
 
I
V
 
F
G
 
S
I
 
A
H
|
H
A
 
C
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
E
 
G
L
 
V
A
 
A
V
 
T
A
 
A
N
 
N
S
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
G
V
 
I
Q
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
R
Q
 
Q
I
 
V
Q
x
E
G
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
C
 
S
G
 
G
N
 
N
A
 
A
N
 
P
L
 
L
C
 
E
S
 
E
I
 
V
I
 
V
P
 
M
T
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
C
K
 
R
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
V
F
 
M
G
 
G
G
 
G
E
 
V
Y
 
Y
T
 
T
C
 
R
L
 
I
P
 
D
E
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
T
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
I
T
 
M
A
 
A
V
 
T
A
 
S
A
 
K
Y
 
M
V
 
V
S
 
Q
E
 
E
V
 
Y
A
 
T
N
 
G
I
 
L
P
 
Y
P
 
V
F
 
Q
S
 
P
R
 
H
Q
 
K
P
 
P
Y
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
A
S
 
N
A
 
C
F
 
F
A
 
V
H
 
H
K
 
E
G
x
S
G
|
G
V
x
I
H
 
H
V
 
Q
S
x
D
A
 
G
V
 
I
N
 
L
R
x
K
K
 
N
S
 
R
S
 
S
L
 
T
Y
 
Y
E
 
E
H
 
I
I
 
I
S
 
S
P
 
P
D
 
E
V
 
D
V
 
V
G
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
K
-
 
S
N
 
Q
R
 
N
Q
 
S
R
 
G
I
 
I
L
 
V
I
 
L
T
 
G
E
 
K
L
|
L
A
 
S
G
|
G
R
|
R
S
x
H
N
 
A
I
 
V
V
 
K
S
 
G
L
 
R
A
 
L
R
 
K
R
 
E
F
 
L
G
 
G
F
 
Y
H
 
E
L
 
I
D
 
S
K
 
D
D
 
E
E
 
K

Sites not aligning to the query:

Q9JZG1 2-isopropylmalate synthase; Alpha-IPM synthase; Alpha-isopropylmalate synthase; EC 2.3.3.13 from Neisseria meningitidis serogroup B (strain MC58) (see 2 papers)
27% identity, 84% coverage: 1:451/540 of query aligns to 3:439/517 of Q9JZG1

query
sites
Q9JZG1
M
 
Q
T
 
T
R
 
N
R
 
R
I
 
V
Q
 
I
L
 
I
Y
 
F
D
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
D
|
D
G
 
G
S
 
E
Q
 
Q
S
 
S
E
 
P
D
 
G
I
 
A
N
 
A
L
 
M
T
 
T
A
 
K
A
 
E
D
 
E
K
 
K
L
 
I
K
 
R
I
 
V
A
 
A
L
 
R
K
 
Q
L
 
L
D
 
E
E
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
D
R
 
I
I
 
I
E
 
E
G
 
A
G
 
G
W
 
F
P
 
A
G
 
A
S
 
A
N
 
S
P
 
P
V
 
G
D
 
D
V
 
F
A
 
E
F
 
A
F
 
V
K
 
N
E
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
K
Y
 
T
H
 
I
L
 
T
K
 
K
H
 
S
A
 
T
V
 
V
I
 
C
S
 
S
A
 
L
F
 
S
G
 
R
S
 
A
T
 
I
H
 
E
H
 
R
P
 
-
N
 
-
F
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
D
S
 
I
D
 
R
P
 
Q
N
 
A
L
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
A
E
 
P
S
 
A
G
 
P
A
 
K
R
 
K
V
 
R
A
 
I
S
 
H
I
 
T
F
 
F
G
 
I
K
 
A
S
 
T
C
 
S
E
 
P
V
 
I
H
 
H
A
 
M
A
 
E
E
 
Y
A
 
K
L
 
L
R
 
K
L
 
M
D
 
K
A
 
P
A
 
K
R
 
Q
N
 
V
L
 
I
E
 
E
I
 
A
I
 
A
G
 
V
D
 
K
S
 
A
V
 
V
A
 
K
F
 
I
L
 
A
K
 
R
G
 
E
K
 
Y
L
 
T
A
 
D
E
 
D
V
 
V
Y
 
E
F
 
F
D
 
S
A
 
C
E
 
E
H
 
-
F
 
-
F
 
-
D
 
D
G
 
A
Y
 
L
R
 
R
H
 
S
N
 
E
A
 
I
A
 
D
Y
 
F
A
 
L
L
 
A
S
 
E
A
 
I
L
 
C
R
 
G
R
 
A
A
 
V
H
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
V
 
T
L
 
I
V
 
N
L
 
I
C
 
P
D
 
D
T
 
T
N
 
V
G
 
G
G
 
Y
T
 
S
L
 
I
P
 
P
H
 
Y
E
 
K
V
 
T
A
 
E
R
 
E
I
 
F
V
 
F
T
 
R
E
 
E
V
 
L
R
 
I
E
 
A
A
 
K
L
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
A
 
G
V
 
K
G
 
V
I
 
V
-
 
W
-
 
S
-
 
A
H
|
H
A
 
C
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
E
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
L
Q
 
K
A
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
R
Q
 
Q
I
 
V
Q
 
E
G
 
C
T
 
T
I
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
C
 
A
G
 
G
N
|
N
A
 
A
N
 
S
L
 
V
C
 
E
S
 
E
I
 
I
I
 
V
P
 
M
T
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
V
K
 
R
-
 
H
-
 
D
-
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
L
E
 
E
Y
 
T
T
 
G
C
 
I
L
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
D
L
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
I
T
 
V
A
 
P
V
 
S
A
 
S
A
 
K
Y
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
T
V
 
I
A
 
T
N
 
G
I
 
Y
P
 
P
P
 
V
F
 
Q
S
 
P
R
 
N
Q
 
K
P
 
A
Y
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
A
S
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
S
H
 
H
K
 
E
G
 
S
G
 
G
V
 
I
H
 
H
V
 
Q
S
 
D
A
 
G
V
 
V
N
 
L
R
 
K
K
 
H
S
 
R
S
 
E
L
 
T
Y
 
Y
E
 
E
H
 
I
I
 
M
S
 
S
P
 
A
D
 
E
V
 
S
V
 
V
G
 
G
-
 
W
N
 
A
R
 
T
Q
 
N
R
 
R
I
 
L
L
 
S
I
 
L
T
 
G
E
 
K
L
 
L
A
 
S
G
 
G
R
 
R
S
 
N
N
 
A
I
 
F
V
 
K
S
 
T
L
 
K
A
 
L
R
 
A
R
 
D
F
 
L
G
 
G
F
 
I
H
 
E
L
 
L
D
 
E
K
 
S
D
 
E
E
 
E
P
 
A
V
 
L
V
 
N
K
 
A
G
 
A
L
 
F
-
 
A
-
 
R
L
 
F
T
 
K
E
 
E
L
|
L
K
x
A
K
x
D
K
|
K
A
x
K
S
x
R
L
x
E
G
x
I
Y
x
F
D
|
D
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
x
E
S
x
D
V
x
L
E
x
H
L
x
A
L
|
L
I
x
V
L
x
S
R
x
D
K
x
E
L
x
M
A
x
G
R
x
S
R
x
M
G
x
N
V
x
A
R
x
E
E
x
S
F
x
Y
F
x
K
R
x
F
L
x
I
L
x
S
Q
|
Q
F
x
K
R
x
I
V
x
S
L
x
T
E
|
E
T
|
T
K
x
G
H
x
E
D
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
E
|
E
P
|
P
V
x
R
S
x
A
E
x
D
V
 
-
S
 
-
V
x
I
M
x
V
V
x
F
D
x
S
V
x
I
E
x
K
G
|
G
V
x
E
T
x
E
E
x
K
H
x
R
T
x
A
A
x
S
A
|
A
T
|
T
G
|
G
R
x
S
G
|
G
P
|
P
V
|
V
N
x
D
A
|
A
L
x
I
D
x
F
N
x
K
A
|
A
L
x
I

Sites not aligning to the query:

6ktqA Crystal structure of catalytic domain of homocitrate synthase from sulfolobus acidocaldarius (sahcs(dram)) in complex with alpha- ketoglutarate/zn2+/coa (see paper)
28% identity, 69% coverage: 4:375/540 of query aligns to 21:377/399 of 6ktqA

query
sites
6ktqA
R
 
K
I
 
V
Q
 
G
L
 
I
Y
 
L
D
 
D
T
 
S
T
 
T
L
 
L
R
|
R
D
x
E
G
 
G
S
 
E
Q
 
Q
S
 
T
E
 
P
D
 
G
I
 
V
N
 
V
L
 
F
T
 
T
A
 
T
A
 
D
D
 
Q
K
 
R
L
 
V
K
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
K
K
 
A
L
 
L
D
 
S
E
 
D
I
 
I
G
 
G
I
 
V
D
 
Q
R
 
M
I
 
I
E
 
E
G
 
A
G
 
G
W
x
H
P
 
P
G
 
A
S
x
V
N
 
S
P
 
P
V
 
D
D
 
I
V
 
Y
A
 
E
F
 
G
F
 
I
K
 
R
E
 
R
I
 
I
A
 
I
N
 
K
Y
 
L
H
 
K
L
 
-
K
 
R
H
 
E
A
 
G
V
 
V
I
 
I
S
 
K
A
 
S
F
 
E
G
 
I
S
 
V
T
 
A
H
|
H
H
 
S
P
x
R
N
x
A
F
x
V
T
 
K
A
 
R
D
 
D
S
 
-
D
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
I
R
 
E
A
 
V
I
 
G
A
 
A
E
 
E
S
 
I
G
 
E
A
 
A
R
 
D
V
 
R
A
 
I
S
 
A
I
 
I
F
|
F
G
x
Y
K
 
G
S
 
I
C
 
S
E
 
D
V
 
T
H
 
H
A
 
L
A
 
K
E
 
A
A
x
K
L
x
H
R
 
H
L
 
T
D
 
T
A
 
R
A
 
D
R
 
E
N
 
A
L
 
L
E
 
R
I
 
S
I
 
I
G
 
A
D
 
E
S
 
T
V
 
V
A
 
S
F
 
Y
L
 
A
K
 
K
G
 
S
K
 
H
L
 
G
A
 
V
E
 
K
V
 
V
Y
x
R
F
 
F
D
x
T
A
 
A
E
|
E
H
 
-
F
 
-
F
 
-
D
 
D
G
 
A
Y
 
T
R
 
R
H
 
A
N
 
D
A
 
Y
A
 
Q
Y
 
Y
A
 
L
L
 
L
S
 
E
A
 
V
L
 
I
R
 
K
R
 
T
A
 
V
H
 
R
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
R
L
 
V
V
x
S
L
 
I
C
x
A
D
 
D
T
|
T
N
 
V
G
 
G
G
 
V
T
 
L
L
 
Y
P
 
P
H
 
S
E
 
R
V
 
T
A
 
R
R
 
E
I
 
L
V
 
F
T
 
K
E
 
D
V
 
L
R
 
T
E
 
S
A
 
R
L
 
F
P
 
P
G
 
D
A
 
I
A
 
E
V
 
F
G
 
D
I
 
I
H
|
H
A
 
A
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
E
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
V
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
A
Q
 
E
A
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
T
Q
 
I
I
 
I
Q
x
H
G
 
T
T
 
T
I
 
L
N
 
N
G
 
G
V
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
C
 
V
G
 
G
N
 
I
A
 
A
N
 
P
L
 
L
C
 
Q
S
 
V
I
 
V
I
 
A
P
 
A
T
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
Y
K
 
H
F
 
F
G
 
G
G
 
I
E
 
E
Y
 
V
T
 
V
C
 
D
L
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
L
Q
 
K
Q
 
K
L
 
L
T
 
S
A
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
S
Y
 
L
V
 
V
S
 
E
E
 
K
V
 
Y
A
 
S
N
 
G
I
 
I
P
 
A
P
 
L
F
 
P
S
 
P
R
 
N
Q
 
F
P
 
P
Y
 
I
V
 
T
G
 
G
R
 
D
S
 
Y
A
 
A
F
 
F
A
 
V
H
 
H
K
 
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
H
V
 
V
S
 
A
A
 
G
V
 
V
N
 
L
R
 
N
K
 
D
S
 
P
S
 
K
L
 
T
Y
 
Y
E
 
E
H
 
F
I
 
L
S
 
P
P
 
P
D
 
E
V
 
T
V
 
F
G
 
G
N
 
R
R
 
S
Q
 
R
R
 
D
I
 
Y
L
 
V
I
 
I
T
 
D
E
 
K
L
 
Y
A
 
T
G
 
G
R
 
K
S
 
H
N
 
A
I
 
V
V
 
K
S
 
D
L
 
R
A
 
F
R
 
D
R
 
R
F
 
L
G
 
G
F
 
V
H
 
K
L
 
L
D
 
T
K
 
D
D
 
S
E
 
E
P
 
-
V
 
-
V
 
I
K
 
D
G
 
Q
L
 
V
L
 
L
T
 
A
E
 
K
L
 
I
K
 
K
K
 
S
K
 
N
A
 
P
S
 
N
L
 
V
G
 
R
Y
 
F

Q9FN52 Methylthioalkylmalate synthase 3, chloroplastic; 2-isopropylmalate synthase 2; Methylthioalkylmalate synthase-like; EC 2.3.3.17 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
29% identity, 65% coverage: 5:357/540 of query aligns to 85:447/503 of Q9FN52

query
sites
Q9FN52
I
 
V
Q
 
R
L
 
V
Y
 
L
D
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
G
S
 
E
Q
 
Q
S
 
S
E
 
P
D
 
G
I
 
A
N
 
A
L
 
L
T
 
T
A
 
P
A
 
P
D
 
Q
K
 
K
L
 
L
K
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
R
K
 
Q
L
 
L
D
 
A
E
 
K
I
 
L
G
 
R
I
 
V
D
 
D
R
 
I
I
 
M
E
 
E
G
 
V
G
 
G
W
 
F
P
 
P
G
 
V
S
 
S
N
 
S
P
 
E
V
 
E
D
 
E
V
 
F
A
 
E
F
 
A
F
 
I
K
 
K
E
 
T
I
 
I
A
 
A
N
 
K
Y
 
T
H
 
-
L
 
V
K
 
G
H
 
N
A
 
E
V
 
V
I
 
D
S
 
E
A
 
E
F
 
T
G
 
G
S
 
-
T
 
-
H
 
Y
H
 
V
P
 
P
N
 
V
F
 
I
T
 
C
A
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
R
-
 
C
-
 
K
-
 
K
-
 
R
D
 
D
S
 
I
D
 
E
P
 
A
N
 
T
L
 
W
R
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
K
E
 
Y
S
 
A
G
 
K
A
 
R
R
 
P
V
 
R
A
 
V
S
 
M
I
 
L
F
 
F
G
 
T
K
 
S
S
 
T
C
 
S
E
 
E
V
 
I
H
 
H
A
 
M
A
 
K
E
 
Y
A
 
K
L
 
L
R
 
K
L
 
K
D
 
T
A
 
K
A
 
E
R
 
E
N
 
V
L
 
I
E
 
E
I
 
M
I
 
A
G
 
V
D
 
N
S
 
S
V
 
V
A
 
K
F
 
Y
L
 
A
K
 
K
G
 
S
-
 
L
K
 
G
L
 
F
A
 
K
E
 
D
V
 
I
Y
 
Q
F
 
F
D
 
G
A
 
C
E
 
E
H
 
-
F
 
-
F
 
-
D
 
D
G
 
G
Y
 
G
R
 
R
H
 
T
N
 
E
A
 
K
A
 
D
Y
 
F
A
 
I
L
 
C
S
 
K
A
 
I
L
 
L
R
 
G
R
 
E
A
 
S
H
 
I
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
V
 
T
L
 
V
V
 
G
L
 
F
C
 
A
D
 
D
T
 
T
N
 
V
G
|
G
G
 
I
T
 
N
L
 
M
P
 
P
H
 
Q
E
 
E
V
 
F
A
 
G
R
 
E
I
 
L
V
 
V
T
 
A
E
 
Y
V
 
V
R
 
I
E
 
E
A
 
N
L
 
T
P
 
P
G
 
G
A
 
A
-
 
D
-
 
D
-
 
I
A
 
V
V
 
F
G
 
A
I
 
I
H
 
H
A
 
C
H
 
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
E
 
G
L
 
V
A
 
A
V
 
T
A
 
A
N
 
N
S
 
T
I
 
I
A
 
S
A
 
G
V
 
I
Q
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
R
Q
 
Q
I
 
V
Q
 
E
G
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
G
V
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
C
 
S
G
 
G
N
 
N
A
 
A
N
 
P
L
 
L
C
 
E
S
 
E
I
 
V
I
 
V
P
 
M
T
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
C
K
 
R
-
 
G
-
 
E
-
 
S
-
 
L
F
 
M
G
 
D
G
 
G
E
 
V
Y
 
Y
T
 
T
C
 
K
L
 
I
P
 
D
E
 
S
G
 
-
R
 
-
L
 
-
Q
 
R
Q
 
Q
L
 
I
T
 
M
A
 
A
V
 
T
A
 
S
A
 
K
Y
 
M
V
 
V
S
 
Q
E
 
E
V
 
H
A
 
T
N
 
G
I
 
M
P
 
Y
P
 
V
F
 
Q
S
 
P
R
 
H
Q
 
K
P
 
P
Y
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
D
S
 
N
A
 
C
F
 
F
A
 
V
H
 
H
K
 
E
G
 
S
G
 
G
V
 
I
H
 
H
V
 
Q
S
 
D
A
 
G
V
 
I
N
 
L
R
 
K
K
 
N
S
 
R
S
 
S
L
 
T
Y
 
Y
E
 
E
H
 
I
I
 
L
S
 
S
P
 
P
D
 
E
V
 
D
V
 
V
G
 
G
-
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
S
N
 
E
R
 
N
Q
 
S
R
 
G
I
 
I
L
 
V
I
 
L
T
 
G
E
 
K
L
 
L
A
 
S
G
 
G
R
 
R
S
 
H
N
 
A
I
 
V
V
 
K
S
 
D
L
 
R
A
 
L
R
 
K
R
 
E
F
 
L
G
 
G
F
 
Y
H
 
E
L
 
I
D
 
S
K
 
D
D
 
E
E
 
K

O87198 Homocitrate synthase; HCS; EC 2.3.3.14 from Thermus thermophilus (strain ATCC BAA-163 / DSM 7039 / HB27) (see paper)
30% identity, 66% coverage: 3:357/540 of query aligns to 2:344/376 of O87198

query
sites
O87198
R
 
R
R
 
E
I
 
W
Q
 
K
L
 
I
Y
 
I
D
 
D
T
 
S
T
 
T
L
 
L
R
|
R
D
x
E
G
 
G
S
 
E
Q
 
Q
S
 
F
E
 
E
D
 
K
I
 
A
N
 
N
L
 
F
T
 
S
A
 
T
A
 
Q
D
 
D
K
 
K
L
 
V
K
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
K
K
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
F
G
 
G
I
 
I
D
 
E
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
G
 
V
G
 
T
W
 
T
P
 
P
G
 
V
S
 
A
N
 
S
P
 
P
V
 
Q
D
 
S
V
 
R
A
 
K
F
 
D
F
 
A
K
 
E
E
 
V
I
 
L
A
 
A
N
 
S
Y
 
L
H
 
G
L
 
L
K
 
K
H
 
A
A
 
K
V
 
V
I
 
V
S
 
T
A
 
-
F
 
-
G
 
-
S
 
-
T
 
-
H
 
-
H
|
H
P
 
I
N
 
Q
F
 
C
T
 
R
A
 
L
D
 
D
S
 
A
D
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
A
R
 
K
A
 
V
I
 
A
A
 
V
E
 
E
S
 
T
G
 
G
A
 
V
R
 
Q
-
 
G
V
 
I
A
x
D
S
 
L
I
 
L
F
 
F
G
 
G
K
 
T
S
 
S
C
 
K
E
 
Y
V
 
L
H
 
R
A
 
A
A
 
A
E
 
H
A
 
G
L
 
-
R
 
-
L
 
R
D
 
D
A
 
I
A
 
P
R
 
R
N
 
I
L
 
I
E
 
E
I
 
E
I
 
A
G
 
K
D
 
E
S
 
V
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
L
 
I
K
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
A
K
 
P
L
 
H
A
 
V
E
 
E
V
 
V
Y
x
R
F
 
F
D
x
S
A
 
A
E
 
E
H
 
D
F
 
T
F
 
F
D
 
R
G
 
S
Y
 
E
R
 
E
H
 
Q
N
 
D
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
L
S
 
L
A
 
A
L
 
V
R
 
Y
R
 
E
A
 
A
H
 
V
E
 
A
A
 
P
G
 
Y
A
 
V
D
 
D
V
 
R
L
 
V
V
 
G
L
 
L
C
 
A
D
 
D
T
|
T
N
 
V
G
 
G
G
 
V
T
 
A
L
 
T
P
 
P
H
 
R
E
 
Q
V
 
V
A
 
Y
R
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
R
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
R
A
 
V
L
 
V
-
 
G
P
 
P
G
 
R
A
 
V
A
 
D
V
 
I
G
 
E
I
 
F
H
|
H
A
 
G
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
T
E
 
G
L
 
C
A
 
A
V
 
I
A
 
A
N
 
N
S
 
A
I
 
Y
A
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
T
Q
 
H
I
 
V
Q
 
D
G
 
T
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
C
 
N
G
 
G
N
 
I
A
 
T
N
 
P
L
 
L
C
 
G
S
 
G
I
 
F
I
 
L
P
 
A
T
 
R
L
 
M
E
 
-
L
 
-
K
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
Y
 
Y
T
 
T
C
 
L
L
 
Q
P
 
P
E
 
E
-
 
Y
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
K
G
 
Y
R
 
K
L
 
L
Q
 
E
Q
 
M
L
 
L
T
 
P
A
 
E
V
 
L
A
 
D
A
 
R
Y
 
M
V
 
V
S
 
A
E
 
R
V
 
M
A
 
V
N
 
G
I
 
V
P
 
E
-
 
I
P
 
P
F
 
F
S
 
N
R
 
N
Q
 
-
P
 
-
Y
 
Y
V
 
I
-
 
T
G
 
G
R
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
A
 
S
H
 
H
K
 
K
G
 
A
G
 
G
V
 
M
H
 
H
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
I
N
 
Y
R
 
I
K
 
N
S
 
P
S
 
E
L
 
A
Y
 
Y
E
 
E
H
 
P
I
 
Y
S
 
P
P
 
P
D
 
E
V
 
V
V
 
F
G
 
G
N
 
V
R
 
K
Q
 
R
R
 
K
I
 
L
L
 
I
I
 
I
-
 
A
T
 
S
E
 
R
L
 
L
A
 
T
G
 
G
R
 
R
S
 
H
N
 
A
I
 
I
V
 
K
S
 
A
L
 
R
A
 
A
R
 
E
R
 
E
F
 
L
G
 
G
F
 
L
H
 
H
L
 
Y
D
 
G
K
 
E
D
 
E
E
 
E

4ov9A Structure of isopropylmalate synthase binding with alpha- isopropylmalate (see paper)
28% identity, 66% coverage: 3:356/540 of query aligns to 2:350/380 of 4ov9A

query
sites
4ov9A
R
 
K
R
 
T
I
 
I
Q
 
H
L
 
I
Y
 
Q
D
 
D
T
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
D
|
D
G
 
G
S
 
N
Q
|
Q
S
 
A
E
 
L
D
 
K
I
 
R
N
 
P
L
 
W
T
 
T
A
 
I
A
 
D
D
 
E
K
 
K
L
 
I
K
 
E
I
 
V
A
 
F
L
 
D
K
 
L
L
 
L
D
 
V
E
 
E
I
 
L
G
 
N
I
 
V
D
 
D
R
 
G
I
 
I
E
 
E
G
 
V
G
 
G
W
 
F
P
 
P
G
 
S
S
 
S
N
 
N
P
 
E
V
 
T
D
 
E
V
 
F
A
 
H
F
 
T
F
 
C
K
 
Q
E
 
V
I
 
L
A
 
S
N
 
K
Y
 
R
H
 
A
L
 
P
K
 
K
H
 
G
A
 
K
V
 
P
I
 
I
S
 
A
A
 
A
F
x
L
G
 
S
S
 
R
T
 
A
H
 
N
H
 
Q
P
 
N
N
 
E
F
 
I
T
 
A
A
 
V
D
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
-
N
 
T
L
 
W
R
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
Q
E
 
K
S
 
A
G
 
D
A
 
C
R
 
P
V
 
R
A
 
M
S
 
H
I
 
I
F
x
V
G
 
Y
K
 
P
S
 
V
C
 
S
E
 
D
V
 
F
H
 
S
A
 
I
A
 
K
E
 
H
A
 
V
L
 
L
R
 
K
L
 
I
D
 
S
A
 
E
A
 
K
R
 
E
N
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
K
I
 
I
G
 
R
D
 
N
S
 
S
V
 
I
A
 
S
F
 
F
L
 
A
K
 
R
-
 
S
-
 
I
-
 
V
G
 
G
K
 
P
L
 
G
A
 
I
E
 
E
V
 
I
Y
 
Q
F
 
F
D
x
S
A
 
G
E
|
E
H
 
H
F
 
F
F
 
G
D
 
D
G
 
A
Y
 
I
R
 
E
H
 
-
N
 
N
A
 
F
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
L
 
K
S
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
L
R
 
T
A
 
A
H
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
N
V
 
I
L
 
I
V
 
N
L
 
L
C
x
P
D
 
N
T
|
T
N
 
V
G
 
E
G
 
R
T
 
Y
L
 
R
P
 
P
H
 
M
E
 
V
V
 
F
A
 
V
R
 
N
I
 
M
V
 
V
T
 
K
E
 
E
V
 
I
R
 
K
E
 
D
A
 
V
L
 
V
P
 
K
G
 
D
A
 
K
A
 
A
V
 
I
-
 
I
G
 
S
I
 
I
H
|
H
A
 
T
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
E
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
T
A
 
A
N
 
T
S
 
S
I
 
V
A
 
E
A
 
S
V
 
V
Q
 
Y
A
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
E
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
E
G
 
V
T
 
A
I
 
L
N
 
N
G
 
G
V
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
C
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
T
N
 
N
L
 
L
C
 
Y
S
 
E
I
 
T
I
 
-
P
 
-
T
 
A
L
 
I
E
 
A
L
 
L
K
 
H
F
 
Q
G
 
N
G
 
G
E
 
E
Y
 
N
T
 
L
C
 
N
L
 
I
P
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
N
L
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
L
 
I
T
 
Y
A
 
P
V
 
T
A
 
A
A
 
K
Y
 
R
V
 
I
S
 
S
E
 
E
V
 
L
A
 
T
N
 
G
I
 
I
P
 
P
P
 
I
F
 
G
S
 
E
R
 
K
Q
 
T
P
 
P
Y
 
I
V
 
I
G
 
G
R
 
E
S
 
D
A
 
I
F
 
F
A
 
S
H
 
H
K
 
R
G
 
S
G
 
G
V
 
I
H
 
H
V
 
-
S
 
Q
A
 
T
V
 
L
N
 
H
R
 
Q
K
 
S
S
 
K
S
 
G
L
 
A
Y
 
Y
E
 
R
H
 
T
I
 
F
S
 
S
P
 
P
D
 
E
V
 
F
V
 
V
G
 
G
-
 
R
-
 
M
N
 
D
R
 
K
Q
 
E
R
 
T
I
 
I
L
 
S
I
 
F
T
 
T
E
 
N
L
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
H
S
 
K
N
 
A
I
 
I
V
 
E
S
 
F
L
 
L
A
 
L
R
 
H
R
 
Q
F
 
R
G
 
G
F
 
I
H
 
Q
L
 
V
D
 
S
K
 
K
D
 
E

4ov4A Isopropylmalate synthase binding with ketoisovalerate (see paper)
28% identity, 66% coverage: 3:356/540 of query aligns to 2:348/379 of 4ov4A

query
sites
4ov4A
R
 
K
R
 
T
I
 
I
Q
 
H
L
 
I
Y
 
Q
D
 
D
T
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
D
|
D
G
 
G
S
 
N
Q
|
Q
S
 
A
E
 
L
D
 
K
I
 
R
N
 
P
L
 
W
T
 
T
A
 
I
A
 
D
D
 
E
K
 
K
L
 
I
K
 
E
I
 
V
A
 
F
L
 
D
K
 
L
L
 
L
D
 
V
E
 
E
I
 
L
G
 
N
I
 
V
D
 
D
R
 
G
I
 
I
E
 
E
G
 
V
G
 
G
W
 
F
P
 
P
G
 
S
S
 
S
N
 
N
P
 
E
V
 
T
D
 
E
V
 
F
A
 
H
F
 
T
F
 
C
K
 
Q
E
 
V
I
 
L
A
 
S
N
 
K
Y
 
R
H
 
A
L
 
P
K
 
K
H
 
G
A
 
K
V
 
P
I
 
I
S
 
A
A
 
A
F
x
L
G
 
S
S
 
R
T
 
A
H
 
N
H
 
Q
P
 
N
N
 
E
F
 
I
T
 
A
A
 
V
D
 
-
S
 
-
D
 
-
P
 
-
N
 
T
L
 
W
R
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
Q
E
 
K
S
 
A
G
 
D
A
 
C
R
 
P
V
 
R
A
 
M
S
 
H
I
 
I
F
x
V
G
 
Y
K
 
P
S
 
V
C
 
S
E
 
D
V
 
F
H
 
S
A
 
I
A
 
K
E
 
H
A
 
V
L
 
L
R
 
K
L
 
I
D
 
S
A
 
E
A
 
K
R
 
E
N
 
V
L
 
L
E
 
Q
I
 
K
I
 
I
G
 
R
D
 
N
S
 
S
V
 
I
A
 
S
F
 
F
L
 
A
K
 
R
-
 
S
-
 
I
-
 
V
G
 
G
K
 
P
L
 
G
A
 
I
E
 
E
V
 
I
Y
 
Q
F
 
F
D
x
S
A
 
G
E
 
E
H
 
H
F
 
F
F
 
G
D
 
D
G
 
A
Y
 
I
R
 
E
H
 
-
N
 
N
A
 
F
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
L
 
K
S
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
L
R
 
T
A
 
A
H
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
N
V
 
I
L
 
I
V
 
N
L
 
L
C
x
P
D
 
N
T
|
T
N
 
V
G
 
E
G
 
R
T
 
Y
L
 
R
P
 
P
H
 
M
E
 
V
V
 
F
A
 
V
R
 
N
I
 
M
V
 
V
T
 
K
E
 
E
V
 
I
R
 
K
E
 
D
A
 
V
L
 
V
P
 
K
G
 
D
A
 
K
A
 
A
V
 
I
-
 
I
G
 
S
I
 
I
H
|
H
A
 
T
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
E
 
G
L
 
M
A
 
A
V
 
T
A
 
A
N
 
T
S
 
S
I
 
V
A
 
E
A
 
S
V
 
V
Q
 
Y
A
 
V
G
 
G
A
 
A
V
 
E
Q
 
Q
I
 
I
Q
 
E
G
 
V
T
 
A
I
 
L
N
 
N
G
 
G
V
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
C
 
A
G
 
G
N
 
N
A
 
T
N
 
N
L
 
L
C
 
Y
S
 
E
I
 
T
I
 
-
P
 
-
T
 
A
L
 
I
E
 
A
L
 
L
K
 
H
F
 
Q
G
 
N
G
 
G
E
 
E
Y
 
N
T
 
L
C
 
N
L
 
I
P
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
N
L
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
L
 
I
T
 
Y
A
 
P
V
 
T
A
 
A
A
 
K
Y
 
R
V
 
I
S
 
S
E
 
E
V
 
L
A
 
T
N
 
G
I
 
I
P
 
P
P
 
I
F
 
G
S
 
E
R
 
K
Q
 
T
P
 
P
Y
 
I
V
 
I
G
 
G
R
 
E
S
 
D
A
 
I
F
 
F
A
 
S
H
 
H
K
 
R
G
 
S
G
 
G
V
 
I
H
 
H
V
 
-
S
 
-
A
 
-
V
 
Q
N
 
H
R
 
Q
K
 
S
S
 
K
S
 
G
L
 
A
Y
 
Y
E
 
R
H
 
T
I
 
F
S
 
S
P
 
P
D
 
E
V
 
F
V
 
V
G
 
G
-
 
R
-
 
M
N
 
D
R
 
K
Q
 
E
R
 
T
I
 
I
L
 
S
I
 
F
T
 
T
E
 
N
L
 
Q
A
 
S
G
 
G
R
 
H
S
 
K
N
 
A
I
 
I
V
 
E
S
 
F
L
 
L
A
 
L
R
 
H
R
 
Q
F
 
R
G
 
G
F
 
I
H
 
Q
L
 
V
D
 
S
K
 
K
D
 
E

3rmjB Crystal structure of truncated alpha-isopropylmalate synthase from neisseria meningitidis (see paper)
29% identity, 56% coverage: 2:302/540 of query aligns to 1:295/308 of 3rmjB

query
sites
3rmjB
T
 
T
R
 
N
R
 
R
I
 
V
Q
 
I
L
 
I
Y
 
F
D
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
D
|
D
G
 
G
S
 
E
Q
|
Q
S
 
S
E
 
P
D
 
G
I
 
A
N
 
A
L
 
M
T
 
T
A
 
K
A
 
E
D
 
E
K
 
K
L
 
I
K
 
R
I
 
V
A
 
A
L
 
R
K
 
Q
L
 
L
D
 
E
E
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
D
R
 
I
I
 
I
E
 
E
G
 
A
G
 
G
W
 
F
P
 
A
G
 
A
S
 
A
N
 
S
P
 
P
V
 
G
D
 
D
V
 
F
A
 
E
F
 
A
F
 
V
K
 
N
E
 
A
I
 
I
A
 
A
N
 
K
Y
 
T
H
 
I
L
 
T
K
 
K
H
 
S
A
 
T
V
 
V
I
 
C
S
 
S
A
 
L
F
 
S
G
 
R
S
 
A
T
 
I
H
 
E
H
 
R
P
 
-
N
 
-
F
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
D
S
 
I
D
 
R
P
 
Q
N
 
A
L
 
G
R
 
E
A
 
A
I
 
V
A
 
A
E
 
P
S
 
A
G
 
P
A
 
K
R
 
K
V
 
R
A
 
I
S
 
H
I
 
T
F
 
F
G
 
I
K
 
A
S
 
T
C
 
S
E
 
P
V
 
I
H
 
H
A
 
M
A
 
E
E
 
Y
A
 
K
L
 
L
R
 
K
L
 
M
D
 
K
A
 
P
A
 
K
R
 
Q
N
 
V
L
 
I
E
 
E
I
 
A
I
 
A
G
 
V
D
 
K
S
 
A
V
 
V
A
 
K
F
 
I
L
 
A
K
 
R
G
 
E
K
 
Y
L
 
T
A
 
D
E
 
D
V
 
V
Y
 
E
F
 
F
D
 
S
A
 
C
E
 
E
H
 
-
F
 
-
F
 
-
D
 
D
G
 
A
Y
 
L
R
 
R
H
 
S
N
 
E
A
 
I
A
 
D
Y
 
F
A
 
L
L
 
A
S
 
E
A
 
I
L
 
C
R
 
G
R
 
A
A
 
V
H
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
V
 
T
L
 
I
V
 
N
L
 
I
C
 
P
D
 
D
T
 
T
N
 
V
G
 
G
G
 
Y
T
 
S
L
 
I
P
 
P
H
 
Y
E
 
K
V
 
T
A
 
E
R
 
E
I
 
F
V
 
F
T
 
R
E
 
E
V
 
L
R
 
I
E
 
A
A
 
K
L
 
T
P
 
P
G
 
N
A
 
G
A
 
G
V
 
K
G
 
V
I
 
V
-
 
W
-
 
S
-
 
A
H
|
H
A
 
C
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
E
 
G
L
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
A
N
 
N
S
 
S
I
 
L
A
 
A
A
 
A
V
 
L
Q
 
K
A
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
R
Q
 
Q
I
 
V
Q
 
E
G
 
C
T
 
T
I
 
V
N
 
N
G
 
G
V
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
C
 
A
G
 
G
N
|
N
A
 
A
N
 
S
L
 
V
C
 
E
S
 
E
I
 
I
I
 
V
P
 
M
T
 
A
L
 
L
E
 
K
L
 
V
K
 
R
-
 
H
-
 
D
-
 
L
F
 
F
G
 
G
G
 
L
E
 
E
Y
 
T
T
 
G
C
 
I
L
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
D
L
 
T
Q
 
T
Q
 
Q
L
 
I
T
 
V
A
 
P
V
 
S
A
 
S
A
 
K
Y
 
L
V
 
V
S
 
S
E
 
T
V
 
I
A
 
T
N
 
G
I
 
Y
P
 
P
P
 
V
F
 
Q
S
 
P
R
 
N
Q
 
K
P
 
A
Y
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
A
S
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
S
H
 
H
K
 
E

2zyfA Crystal structure of homocitrate synthase from thermus thermophilus complexed with magnesuim ion and alpha-ketoglutarate (see paper)
30% identity, 61% coverage: 3:333/540 of query aligns to 2:313/314 of 2zyfA

query
sites
2zyfA
R
 
R
R
 
E
I
 
W
Q
 
K
L
 
I
Y
 
I
D
 
D
T
 
S
T
 
T
L
 
L
R
|
R
D
x
E
G
 
G
S
 
E
Q
|
Q
S
 
F
E
 
E
D
 
K
I
 
A
N
 
N
L
 
F
T
 
S
A
 
T
A
 
Q
D
 
D
K
 
K
L
 
V
K
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
K
K
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
F
G
 
G
I
 
I
D
 
E
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
G
 
V
G
 
T
W
 
T
P
 
P
G
 
V
S
 
A
N
 
S
P
 
P
V
 
Q
D
 
S
V
 
R
A
 
K
F
 
D
F
 
A
K
 
E
E
 
V
I
 
L
A
 
A
N
 
S
Y
 
L
H
 
G
L
 
L
K
 
K
H
 
A
A
 
K
V
 
V
I
 
V
S
 
T
A
 
-
F
 
-
G
 
-
S
 
-
T
 
-
H
 
-
H
|
H
P
 
I
N
 
Q
F
 
C
T
 
R
A
 
L
D
 
D
S
 
A
D
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
A
R
 
K
A
 
V
I
 
A
A
 
V
E
 
E
S
 
T
G
 
G
A
 
V
R
 
Q
-
 
G
V
 
I
A
 
D
S
 
L
I
x
L
F
 
F
G
 
G
K
 
T
S
 
S
C
 
K
E
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
G
L
 
R
D
 
D
A
 
I
A
 
P
R
 
R
N
 
I
L
 
I
E
 
E
I
 
E
I
 
A
G
 
K
D
 
E
S
 
V
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
L
 
I
K
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
A
K
 
P
L
 
H
A
 
V
E
 
E
V
 
V
Y
x
R
F
 
F
D
x
S
A
 
A
E
 
E
H
 
D
F
 
T
F
 
F
D
 
R
G
 
S
Y
 
E
R
 
E
H
 
Q
N
 
D
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
L
S
 
L
A
 
A
L
 
V
R
 
Y
R
 
E
A
 
A
H
 
V
E
 
A
A
 
P
G
 
Y
A
 
V
D
 
D
V
 
R
L
 
V
V
 
G
L
 
L
C
x
A
D
 
D
T
|
T
N
 
V
G
 
G
G
 
V
T
 
A
L
 
T
P
 
P
H
 
R
E
 
Q
V
 
V
A
 
Y
R
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
R
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
R
A
 
V
L
 
V
-
 
G
P
 
P
G
 
R
A
 
V
A
 
D
V
 
I
G
 
E
I
 
F
H
|
H
A
 
G
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
T
E
 
G
L
 
C
A
 
A
V
 
I
A
 
A
N
 
N
S
 
A
I
 
Y
A
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
T
Q
 
H
I
 
V
Q
 
D
G
 
T
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
C
 
N
G
 
G
N
 
I
A
 
T
N
 
P
L
 
L
C
 
G
S
 
G
I
 
F
I
 
L
P
 
A
T
 
R
L
 
M
E
 
-
L
 
-
K
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
Y
 
Y
T
 
T
C
 
L
L
 
Q
P
 
P
E
 
E
-
 
Y
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
K
G
 
Y
R
 
K
L
 
L
Q
 
E
Q
 
M
L
 
L
T
 
P
A
 
E
V
 
L
A
 
D
A
 
R
Y
 
M
V
 
V
S
 
A
E
 
R
V
 
M
A
 
V
N
 
G
I
 
V
P
 
E
-
 
I
P
 
P
F
 
F
S
 
N
R
 
N
Q
 
-
P
 
-
Y
 
Y
V
 
I
-
 
T
G
 
G
R
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
A
 
S
H
 
H
K
 
K
G
 
A
G
 
G
V
 
M
H
 
H
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
I
N
 
Y
R
 
I
K
 
N
S
 
P
S
 
E
L
 
A
Y
 
Y
E
 
E
H
 
P
I
 
Y
S
 
P
P
 
P
D
 
E
V
 
V
V
 
F
G
 
G
N
 
V
R
 
K
Q
 
R
R
 
K
I
 
L
L
 
I
I
 
I

3a9iA Crystal structure of homocitrate synthase from thermus thermophilus complexed with lys (see paper)
30% identity, 60% coverage: 3:326/540 of query aligns to 1:305/347 of 3a9iA

query
sites
3a9iA
R
 
R
R
 
E
I
 
W
Q
 
K
L
 
I
Y
 
I
D
 
D
T
 
S
T
 
T
L
 
L
R
|
R
D
x
E
G
 
G
S
 
E
Q
 
Q
S
 
F
E
 
E
D
 
K
I
 
A
N
 
N
L
 
F
T
 
S
A
 
T
A
 
Q
D
 
D
K
 
K
L
 
V
K
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
K
K
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
F
G
 
G
I
 
I
D
 
E
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
G
 
V
G
 
T
W
 
T
P
 
P
G
 
V
S
 
A
N
 
S
P
 
P
V
 
Q
D
 
S
V
 
R
A
 
K
F
 
D
F
 
A
K
 
E
E
 
V
I
 
L
A
 
A
N
 
S
Y
 
L
H
 
G
L
 
L
K
 
K
H
 
A
A
 
K
V
 
V
I
 
V
S
 
T
A
 
-
F
 
-
G
 
-
S
 
-
T
 
-
H
 
-
H
 
H
P
 
I
N
 
Q
F
 
C
T
 
R
A
 
L
D
 
D
S
 
A
D
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
A
R
 
K
A
 
V
I
 
A
A
 
V
E
 
E
S
 
T
G
 
G
A
 
V
R
 
Q
-
 
G
V
 
I
A
x
D
S
 
L
I
x
L
F
 
F
G
 
G
K
 
T
S
 
S
C
 
K
E
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
Y
L
 
L
D
 
D
A
 
I
A
 
P
R
 
R
N
 
I
L
 
I
E
 
E
I
 
E
I
 
A
G
 
K
D
 
E
S
 
V
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
L
 
I
K
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
A
K
 
P
L
 
H
A
 
V
E
 
E
V
 
V
Y
 
R
F
 
F
D
x
S
A
 
A
E
 
E
H
 
D
F
 
T
F
 
F
D
 
R
G
 
S
Y
 
E
R
 
E
H
 
Q
N
 
D
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
L
S
 
L
A
 
A
L
 
V
R
 
Y
R
 
E
A
 
A
H
 
V
E
 
A
A
 
P
G
 
Y
A
 
V
D
 
D
V
 
R
L
 
V
V
 
G
L
 
L
C
x
A
D
 
D
T
|
T
N
 
V
G
 
G
G
 
V
T
 
A
L
 
T
P
 
P
H
 
R
E
 
Q
V
 
V
A
 
Y
R
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
R
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
R
A
 
V
L
 
V
-
 
G
P
 
P
G
 
R
A
 
V
A
 
D
V
 
I
G
 
E
I
 
F
H
|
H
A
 
G
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
T
E
 
G
L
 
C
A
 
A
V
 
I
A
 
A
N
 
N
S
 
A
I
 
Y
A
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
T
Q
 
H
I
 
V
Q
 
D
G
 
T
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
C
 
N
G
 
G
N
 
I
A
 
T
N
 
P
L
 
L
C
 
G
S
 
G
I
 
F
I
 
L
P
 
A
T
 
R
L
 
M
E
 
-
L
 
-
K
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
Y
 
Y
T
 
T
C
 
L
L
 
Q
P
 
P
E
 
E
-
 
Y
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
K
G
 
Y
R
 
K
L
 
L
Q
 
E
Q
 
M
L
 
L
T
 
P
A
 
E
V
 
L
A
 
D
A
 
R
Y
 
M
V
 
V
S
 
A
E
 
R
V
 
M
A
 
V
N
 
G
I
 
V
P
 
E
-
 
I
P
 
P
F
 
F
S
 
N
R
 
N
Q
 
-
P
 
-
Y
 
Y
V
 
I
-
 
T
G
 
G
R
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
A
 
S
H
 
H
K
 
K
G
 
A
G
 
G
V
 
M
H
 
H
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
I
N
 
Y
R
 
I
K
 
N
S
 
P
S
 
E
L
 
A
Y
 
Y
E
 
E
H
 
P
I
 
Y
S
 
P
P
 
P
D
 
E
V
 
V
V
 
F
G
 
G

2ztjA Crystal structure of homocitrate synthase from thermus thermophilus complexed with alpha-ketoglutarate (see paper)
29% identity, 61% coverage: 3:333/540 of query aligns to 2:311/312 of 2ztjA

query
sites
2ztjA
R
 
R
R
 
E
I
 
W
Q
 
K
L
 
I
Y
 
I
D
 
D
T
 
S
T
 
T
L
 
L
R
|
R
D
x
E
G
 
G
S
 
E
Q
|
Q
S
 
F
E
 
E
D
 
K
I
 
A
N
 
N
L
 
F
T
 
S
A
 
T
A
 
Q
D
 
D
K
 
K
L
 
V
K
 
E
I
 
I
A
 
A
L
 
K
K
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
E
I
 
F
G
 
G
I
 
I
D
 
E
R
 
Y
I
 
I
E
 
E
G
 
V
G
 
T
W
 
T
P
 
P
G
 
V
S
 
A
N
 
S
P
 
P
V
 
Q
D
 
S
V
 
R
A
 
K
F
 
D
F
 
A
K
 
E
E
 
V
I
 
L
A
 
A
N
 
S
Y
 
L
H
 
G
L
 
L
K
 
K
H
 
A
A
 
K
V
 
V
I
 
V
S
 
T
A
 
-
F
 
-
G
 
-
S
 
-
T
 
-
H
 
-
H
|
H
P
 
I
N
 
Q
F
 
C
T
 
R
A
 
L
D
 
D
S
 
A
D
 
-
P
 
-
N
 
-
L
 
A
R
 
K
A
 
V
I
 
A
A
 
V
E
 
E
S
 
T
G
 
G
A
 
V
R
 
Q
-
 
G
V
 
I
A
 
D
S
 
L
I
x
L
F
 
F
G
 
G
K
 
T
S
 
G
C
 
-
E
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
R
D
 
D
A
 
I
A
 
P
R
 
R
N
 
I
L
 
I
E
 
E
I
 
E
I
 
A
G
 
K
D
 
E
S
 
V
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
L
 
I
K
 
R
-
 
E
-
 
A
G
 
A
K
 
P
L
 
H
A
 
V
E
 
E
V
 
V
Y
x
R
F
 
F
D
x
S
A
 
A
E
 
E
H
 
D
F
 
T
F
 
F
D
 
R
G
 
S
Y
 
E
R
 
E
H
 
Q
N
 
D
A
 
-
A
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
L
S
 
L
A
 
A
L
 
V
R
 
Y
R
 
E
A
 
A
H
 
V
E
 
A
A
 
P
G
 
Y
A
 
V
D
 
D
V
 
R
L
 
V
V
 
G
L
 
L
C
x
A
D
 
D
T
|
T
N
 
V
G
 
G
G
 
V
T
 
A
L
 
T
P
 
P
H
 
R
E
 
Q
V
 
V
A
 
Y
R
 
A
I
 
L
V
 
V
T
 
R
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
R
A
 
V
L
 
V
-
 
G
P
 
P
G
 
R
A
 
V
A
 
D
V
 
I
G
 
E
I
 
F
H
|
H
A
 
G
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
T
E
 
G
L
 
C
A
 
A
V
 
I
A
 
A
N
 
N
S
 
A
I
 
Y
A
 
E
A
 
A
V
 
I
Q
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
V
 
T
Q
 
H
I
 
V
Q
 
D
G
 
T
T
 
T
I
 
I
N
 
L
G
 
G
V
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
C
 
N
G
 
G
N
 
I
A
 
T
N
 
P
L
 
L
C
 
G
S
 
G
I
 
F
I
 
L
P
 
A
T
 
R
L
 
M
E
 
-
L
 
-
K
 
-
F
 
-
G
 
-
G
 
-
E
 
-
Y
 
Y
T
 
T
C
 
L
L
 
Q
P
 
P
E
 
E
-
 
Y
-
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
K
G
 
Y
R
 
K
L
 
L
Q
 
E
Q
 
M
L
 
L
T
 
P
A
 
E
V
 
L
A
 
D
A
 
R
Y
 
M
V
 
V
S
 
A
E
 
R
V
 
M
A
 
V
N
 
G
I
 
V
P
 
E
-
 
I
P
 
P
F
 
F
S
 
N
R
 
N
Q
 
-
P
 
-
Y
 
Y
V
 
I
-
 
T
G
 
G
R
 
E
S
 
T
A
 
A
F
 
F
A
 
S
H
 
H
K
 
K
G
 
A
G
 
G
V
 
M
H
 
H
V
 
L
S
 
K
A
 
A
V
 
I
N
 
Y
R
 
I
K
 
N
S
 
P
S
 
E
L
 
A
Y
 
Y
E
 
E
H
 
P
I
 
Y
S
 
P
P
 
P
D
 
E
V
 
V
V
 
F
G
 
G
N
 
V
R
 
K
Q
 
R
R
 
K
I
 
L
L
 
I
I
 
I

Q8F3Q1 (R)-citramalate synthase CimA; LiCMS; EC 2.3.3.21 from Leptospira interrogans serogroup Icterohaemorrhagiae serovar Lai (strain 56601) (see 2 papers)
25% identity, 88% coverage: 4:480/540 of query aligns to 7:464/516 of Q8F3Q1

query
sites
Q8F3Q1
R
 
R
I
 
L
Q
 
E
L
 
I
Y
 
L
D
 
D
T
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
D
|
D
G
 
G
S
 
E
Q
 
Q
S
 
T
E
 
R
D
 
G
I
 
V
N
 
S
L
 
F
T
 
S
A
 
T
A
 
S
D
 
E
K
 
K
L
 
L
K
 
N
I
 
I
A
 
A
-
 
K
L
 
F
K
 
L
L
 
L
D
 
Q
E
 
K
I
 
L
G
 
N
I
 
V
D
 
D
R
 
R
I
 
V
E
 
E
G
 
I
G
 
A
W
 
S
P
 
A
G
 
R
S
 
V
N
 
S
P
 
K
V
 
G
D
 
E
V
 
L
A
 
E
F
 
T
F
 
V
K
 
Q
E
 
K
I
 
I
A
 
M
N
 
E
Y
 
W
H
 
A
L
 
A
K
 
T
H
 
E
A
 
Q
V
 
L
-
 
T
-
 
E
-
 
R
I
 
I
S
 
E
A
 
I
F
x
L
G
 
G
S
 
-
T
 
-
H
 
-
H