SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8499579 FitnessBrowser__Miya:8499579 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4y96A Crystal structure of triosephosphate isomerase from gemmata obscuriglobus (see paper)
46% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 3:248/250 of 4y96A

query
sites
4y96A
K
 
K
K
 
K
L
 
F
M
 
V
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
T
T
 
T
A
 
L
G
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
K
T
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
A
L
 
A
T
 
V
A
 
A
D
 
K
T
 
G
L
 
V
P
 
T
D
 
D
D
 
D
R
 
R
-
 
V
E
 
T
V
 
V
V
 
A
I
 
V
F
 
F
P
 
P
Q
 
P
F
 
Y
T
 
P
A
 
W
L
 
L
S
 
T
P
 
A
V
 
V
A
 
G
D
 
E
A
 
V
L
 
L
R
 
K
H
 
-
A
 
G
T
 
S
G
 
P
Y
 
V
S
 
A
V
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
Y
 
S
P
 
S
A
 
E
A
 
K
E
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
P
 
P
G
 
A
M
 
M
L
 
L
M
 
L
D
 
E
C
 
T
G
 
G
C
 
C
A
 
K
W
 
Y
V
 
A
L
 
L
T
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
H
V
 
I
I
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
E
E
 
T
L
 
F
V
 
I
G
 
N
A
 
H
K
 
K
T
 
V
A
 
H
F
 
T
S
 
A
I
 
L
N
 
E
A
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
C
 
C
I
 
M
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
L
E
 
A
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
R
G
 
G
R
 
L
L
 
Q
G
 
E
E
 
R
V
 
V
L
 
F
E
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
L
 
V
E
 
Y
T
 
A
G
 
A
L
 
C
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
T
G
 
-
D
 
D
A
 
E
V
 
Q
P
 
F
A
 
G
A
 
R
I
 
I
A
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
T
P
 
P
P
 
E
E
 
Q
I
 
A
V
 
Q
E
 
E
A
 
A
H
 
H
A
 
A
L
 
F
V
 
V
R
 
R
Q
 
S
L
 
K
L
 
L
V
 
R
A
 
L
R
 
L
F
 
Y
G
 
G
E
 
D
G
 
K
-
 
I
G
 
A
V
 
D
A
 
S
V
 
T
R
 
P
I
 
I
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
T
R
 
V
E
 
G
I
 
L
I
 
M
A
 
S
L
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
D
 
D
S
 
S
F
 
F
S
 
L
R
 
A
I
 
I
I
 
V
L
 
K
A
 
A

P36204 Bifunctional PGK/TIM; EC 2.7.2.3; EC 5.3.1.1 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
43% identity, 97% coverage: 2:245/251 of query aligns to 403:642/654 of P36204

query
sites
P36204
K
 
K
K
 
L
L
 
I
M
 
L
A
 
A
A
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
Y
 
H
K
 
K
T
 
T
A
 
I
G
 
S
E
 
E
A
 
A
R
 
K
T
 
K
T
 
F
A
 
V
A
 
S
S
 
L
L
 
L
A
 
V
A
 
N
L
 
E
T
 
L
A
 
H
D
 
D
T
 
V
L
 
-
P
 
-
D
 
K
D
 
E
R
 
F
E
 
E
V
 
I
V
 
V
I
 
V
F
 
C
P
 
P
Q
 
P
F
 
F
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
S
P
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
E
A
 
I
L
 
L
R
 
-
H
 
S
A
 
G
T
 
R
G
 
N
Y
 
I
S
 
K
V
 
L
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
V
Y
 
F
P
 
Y
A
 
E
A
 
D
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
L
M
 
M
L
 
L
M
 
Q
D
 
E
C
 
I
G
 
G
C
 
V
A
 
E
W
 
Y
V
 
V
L
 
I
T
 
V
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
R
V
 
I
I
 
F
G
 
K
E
 
E
S
 
D
D
 
D
E
 
E
L
 
F
V
 
I
G
 
N
A
 
R
K
 
K
T
 
V
A
 
K
F
 
A
S
 
V
I
 
L
N
 
E
A
 
K
G
 
G
L
 
M
K
 
T
V
 
P
V
 
I
L
 
L
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
K
G
 
G
R
 
L
L
 
T
G
 
F
E
 
C
V
 
V
L
 
V
E
 
E
R
 
K
Q
 
Q
L
 
V
E
 
R
T
 
E
G
 
G
L
 
F
A
 
Y
G
 
G
V
 
L
K
 
D
G
 
K
D
 
E
A
 
E
V
 
A
P
 
-
A
 
K
A
 
R
I
 
V
A
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
A
G
 
T
P
 
P
P
 
Q
E
 
Q
I
 
A
V
 
Q
E
 
E
A
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
F
V
 
I
R
 
R
Q
 
K
L
 
L
L
 
L
V
 
S
A
 
E
R
 
M
F
 
Y
G
 
D
E
 
E
G
 
E
G
 
T
V
 
A
-
 
G
A
 
S
V
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
I
K
 
K
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
F
R
 
L
E
 
G
I
 
L
I
 
I
A
 
V
L
 
Q
D
 
K
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
-
D
 
E
S
 
S
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6neeB Crystal structure of a reconstructed ancestor of triosephosphate isomerase from eukaryotes (see paper)
43% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 5:250/252 of 6neeB

query
sites
6neeB
K
 
K
K
 
F
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
 
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
-
K
 
-
T
 
-
A
 
N
G
 
G
E
 
T
A
 
L
R
 
E
T
 
S
T
 
I
A
 
K
A
 
A
S
 
L
L
 
V
A
 
E
A
 
T
L
 
L
T
 
N
A
 
S
D
 
A
T
 
Q
L
 
L
P
 
D
D
 
P
D
 
N
R
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
V
I
 
V
F
 
A
P
 
P
Q
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
Y
L
 
L
S
 
P
P
 
F
V
 
A
A
 
R
D
 
S
A
 
K
L
 
L
R
 
K
H
 
K
A
 
P
T
 
K
G
 
E
Y
 
I
S
 
Q
V
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
Y
 
Y
P
 
T
A
 
K
A
 
P
E
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
A
G
 
E
M
 
M
L
 
L
M
 
K
D
 
D
C
 
L
G
 
G
C
 
V
A
 
P
W
 
W
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
T
V
 
I
I
 
F
G
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
G
 
A
A
 
E
K
 
K
T
 
V
A
 
K
F
 
Y
S
 
A
I
 
L
N
 
D
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
K
L
 
T
G
 
M
E
 
E
V
 
V
L
 
V
E
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
I
E
 
L
T
 
K
G
 
A
L
 
I
A
 
A
G
 
D
V
 
K
K
 
I
G
 
K
D
 
D
A
 
W
V
 
-
P
 
-
A
 
S
A
 
N
I
 
V
A
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
T
P
 
P
P
 
E
E
 
Q
I
 
A
V
 
Q
E
 
E
A
 
V
H
 
H
A
 
A
L
 
A
V
 
L
R
 
R
Q
 
K
L
 
W
L
 
L
V
 
K
A
 
E
R
 
N
F
 
V
G
 
S
-
 
P
E
 
E
G
 
V
G
 
A
V
 
E
A
 
S
V
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
N
P
 
A
E
 
A
N
 
N
A
 
C
R
 
K
E
 
E
I
 
L
I
 
A
A
 
K
L
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
A
D
 
P
S
 
E
F
 
F
S
 
V
R
 
D
I
 
I
I
 
I
L
 
N
A
 
A

5zfxB Crystal structure of triosephosphate isomerase from opisthorchis viverrini (see paper)
42% identity, 96% coverage: 2:243/251 of query aligns to 2:239/248 of 5zfxB

query
sites
5zfxB
K
 
K
K
 
F
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
-
K
 
-
T
 
-
A
 
N
G
 
G
E
 
S
A
 
K
R
 
K
T
 
E
T
 
N
A
 
D
A
 
K
S
 
L
L
 
I
A
x
E
A
 
M
L
 
L
T
 
T
A
x
H
D
 
A
T
 
K
L
 
I
P
 
D
D
 
P
D
 
N
R
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
L
I
 
V
F
 
A
P
 
P
Q
 
P
F
 
A
T
 
L
A
 
Y
L
 
L
S
 
P
P
 
S
V
 
V
A
 
R
D
 
E
A
 
K
L
 
L
R
 
D
H
 
K
A
 
R
T
 
-
G
 
-
Y
 
F
S
 
H
V
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
Y
 
Y
P
 
K
A
 
V
A
 
P
E
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
P
 
P
G
 
A
M
 
M
L
 
L
M
 
K
D
 
D
C
 
V
G
 
G
C
 
C
A
 
D
W
 
W
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
H
V
 
I
I
 
L
G
 
L
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
Q
L
 
L
V
 
V
G
 
G
A
 
E
K
 
K
T
 
T
A
 
N
F
 
H
S
 
A
I
 
I
N
 
S
A
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
K
L
 
T
G
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
C
E
 
F
R
 
R
Q
 
Q
L
 
M
E
 
E
T
 
A
G
 
I
L
 
R
A
 
K
G
 
N
V
 
L
K
 
S
G
 
S
D
 
A
A
 
D
V
 
M
P
 
W
A
 
N
A
 
H
I
 
I
A
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
|
A
I
 
I
G
|
G
T
|
T
G
 
G
K
|
K
V
 
T
A
 
A
G
 
T
P
 
E
P
 
Q
E
 
Q
I
 
A
V
 
Q
E
 
E
A
 
V
H
 
H
A
 
L
L
 
A
V
 
V
R
 
R
Q
 
R
L
 
W
L
 
M
V
 
E
A
 
E
R
 
K
F
 
V
G
 
S
E
 
P
G
 
A
-
 
V
G
 
A
V
 
K
A
 
S
V
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
A
E
 
A
N
 
N
A
 
C
R
 
R
E
 
T
I
 
L
I
 
A
A
 
K
L
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
P
D
 
D

6ooiC Crystal structure of triosephosphate isomerase from schistosoma mansoni in complex with 2pg (see paper)
41% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 9:253/255 of 6ooiC

query
sites
6ooiC
K
 
K
K
 
F
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
-
K
 
-
T
 
-
A
 
N
G
 
G
E
 
S
A
 
R
R
 
D
T
 
D
T
 
N
A
 
D
A
 
K
S
 
L
L
 
L
A
 
K
A
 
L
L
 
L
T
 
S
A
 
E
D
 
A
T
 
H
L
 
F
P
 
D
D
 
D
D
 
N
R
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
L
I
 
I
F
 
A
P
 
P
Q
 
P
F
 
S
T
 
V
A
 
F
L
 
L
S
 
H
P
 
E
V
 
I
A
 
R
D
 
K
A
 
S
L
 
L
R
 
K
H
 
K
A
 
E
T
 
I
G
 
-
Y
 
-
S
 
H
V
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
Y
 
Y
P
 
K
A
 
V
A
 
S
E
 
K
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
A
M
 
M
L
 
I
M
 
R
D
 
D
C
 
I
G
 
G
C
 
C
A
 
D
W
 
W
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
N
V
 
I
I
 
F
G
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
G
 
A
A
 
E
K
 
K
T
 
V
A
 
Q
F
 
H
S
 
A
I
 
L
N
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
S
V
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
N
R
 
K
L
 
T
G
 
E
E
 
E
V
 
V
L
 
C
E
 
V
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
E
 
K
T
 
A
G
 
I
L
 
A
A
 
N
G
 
K
V
 
I
K
 
K
G
 
S
D
 
A
A
 
D
V
 
E
P
 
W
A
 
K
A
 
R
I
 
V
A
 
V
V
 
V
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
G
 
T
P
 
P
P
 
Q
E
 
Q
I
 
A
V
 
Q
E
 
E
A
 
V
H
 
H
A
 
N
L
 
F
V
 
L
R
 
R
Q
 
K
L
 
W
L
 
F
V
 
K
A
 
T
R
 
N
F
 
A
G
 
P
E
 
N
G
 
G
-
 
V
G
 
D
V
 
E
A
 
K
V
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
A
E
 
A
N
 
N
A
 
C
R
 
K
E
 
E
I
 
L
I
 
A
A
 
Q
L
 
Q
D
 
H
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
P
D
 
E
S
 
-
F
 
F
S
 
T
R
 
E
I
 
I
I
 
C
L
 
K
A
 
A

6oogA Crystal structure of triosephosphate isomerase from taenia solium in complex with 2pg (see paper)
42% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 6:250/252 of 6oogA

query
sites
6oogA
K
 
K
K
 
L
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
G
T
 
S
A
 
Y
G
 
S
E
 
H
A
 
I
R
 
N
T
 
T
T
 
F
A
 
F
A
 
D
S
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
-
L
 
-
T
 
K
A
 
A
D
 
D
T
 
T
L
 
D
P
 
P
D
 
N
D
 
-
R
 
A
E
 
D
V
 
I
V
 
V
I
 
I
F
 
G
P
 
V
Q
 
P
F
 
A
T
 
C
A
 
Y
L
 
L
S
 
K
P
 
Y
V
 
A
A
 
Q
D
 
D
A
 
-
L
 
-
R
 
K
H
 
A
A
 
P
T
 
K
G
 
G
Y
 
I
S
 
K
V
 
I
G
 
A
G
 
A
Q
 
E
D
 
N
V
 
C
Y
 
Y
P
 
K
A
 
V
A
 
G
E
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
T
G
 
E
M
 
M
L
 
I
M
 
K
D
 
D
C
 
C
G
 
G
C
 
C
A
 
E
W
 
W
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
H
V
 
I
I
 
F
G
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
N
E
 
E
L
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
E
K
 
K
T
 
V
A
 
K
F
 
H
S
 
A
I
 
L
N
 
D
A
 
S
G
 
G
L
 
L
K
 
N
V
 
V
V
 
I
L
 
P
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
L
I
 
L
E
 
S
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
K
L
 
T
G
 
N
E
 
D
V
 
V
L
 
C
E
 
F
R
 
A
Q
 
Q
L
 
M
E
 
D
T
 
A
G
 
I
L
 
A
A
 
K
G
 
N
V
 
V
K
 
P
G
 
S
D
 
K
A
 
E
V
 
A
P
 
W
A
 
D
A
 
K
I
 
V
A
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
G
 
T
P
 
P
P
 
A
E
 
Q
I
 
A
V
 
Q
E
 
E
A
 
V
H
 
H
A
 
K
L
 
V
V
 
V
R
 
R
Q
 
D
L
 
-
L
 
W
V
 
I
A
 
R
R
 
K
F
 
H
G
 
V
E
 
D
G
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
A
-
 
D
-
 
K
V
 
V
R
 
R
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
A
E
 
S
N
 
N
A
 
A
R
 
K
E
 
D
I
 
L
I
 
G
A
 
T
L
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
P
D
 
D
S
 
-
F
 
F
S
 
I
R
 
T
I
 
I
I
 
I
L
 
N
A
 
A

P00943 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see 2 papers)
41% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 3:249/253 of P00943

query
sites
P00943
K
 
K
K
 
P
L
 
I
M
 
I
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
Y
x
H
K
|
K
T
 
T
A
 
L
G
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
V
A
 
Q
S
 
F
L
 
V
A
 
E
A
 
D
L
 
V
T
 
K
A
 
G
D
 
H
T
 
V
L
 
P
P
 
P
D
 
A
D
 
D
R
 
E
E
 
V
V
 
I
-
 
S
V
 
V
I
 
V
F
 
C
P
 
A
Q
 
P
F
 
F
T
 
L
A
 
F
L
 
L
S
 
D
P
 
R
V
 
L
A
 
V
D
 
Q
A
 
A
L
 
A
R
 
-
H
 
D
A
 
G
T
 
T
G
 
D
Y
 
L
S
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
T
V
 
M
Y
 
H
P
 
F
A
 
A
A
 
D
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
P
 
P
G
 
V
M
 
M
L
 
L
M
 
K
D
 
D
C
 
L
G
 
G
C
 
V
A
 
T
W
 
Y
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
Q
V
 
M
I
 
F
G
 
A
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
T
V
 
V
G
 
N
A
 
K
K
 
K
T
 
V
A
 
L
F
 
A
S
 
A
I
 
F
N
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
I
V
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
L
 
T
G
 
N
E
 
A
V
 
V
L
 
V
E
 
A
R
 
S
Q
 
Q
L
 
V
E
 
E
T
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
T
G
 
P
D
 
E
A
 
Q
V
 
V
P
 
K
A
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
-
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
P
P
 
E
E
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
S
A
 
V
H
 
C
A
 
G
L
 
H
V
 
I
R
 
R
Q
 
S
L
 
V
L
 
V
V
 
S
A
 
R
R
 
L
F
 
F
G
 
G
-
 
P
E
 
E
G
 
A
G
 
A
V
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
I
R
 
R
E
 
D
I
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
Q
D
 
Q
N
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
 
P
D
 
A
S
 
S
F
 
F
S
 
L
R
 
Q
I
 
L
I
 
V
L
 
E
A
 
A

1btmA Triosephosphate isomerase (tim) complexed with 2-phosphoglycolic acid (see paper)
41% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 2:248/251 of 1btmA

query
sites
1btmA
K
 
K
K
 
P
L
 
I
M
 
I
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
H
K
 
K
T
 
T
A
 
L
G
 
A
E
 
E
A
 
A
R
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
V
A
 
Q
S
 
F
L
 
V
A
 
E
A
 
D
L
 
V
T
 
K
A
 
G
D
 
H
T
 
V
L
 
P
P
 
P
D
 
A
D
 
D
R
 
E
E
 
V
V
 
I
-
 
S
V
 
V
I
 
V
F
 
C
P
 
A
Q
 
P
F
 
F
T
 
L
A
 
F
L
 
L
S
 
D
P
 
R
V
 
L
A
 
V
D
 
Q
A
 
A
L
 
A
R
 
-
H
 
D
A
 
G
T
 
T
G
 
D
Y
 
L
S
 
K
V
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
T
V
 
M
Y
 
H
P
 
F
A
 
A
A
 
D
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
Y
 
Y
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
V
S
 
S
P
 
P
G
 
V
M
 
M
L
 
L
M
 
K
D
 
D
C
 
L
G
 
G
C
 
V
A
 
T
W
 
Y
V
 
V
L
 
I
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
Q
V
 
M
I
 
F
G
 
A
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
T
V
 
V
G
 
N
A
 
K
K
 
K
T
 
V
A
 
L
F
 
A
S
 
A
I
 
F
N
 
T
A
 
R
G
 
G
L
 
L
K
 
I
V
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
C
G
 
G
E
 
E
T
 
S
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
L
 
T
G
 
N
E
 
A
V
 
V
L
 
V
E
 
A
R
 
S
Q
 
Q
L
 
V
E
 
E
T
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
T
G
 
P
D
 
E
A
 
Q
V
 
V
P
 
K
A
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
-
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
P
P
 
E
E
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
S
A
 
V
H
 
C
A
 
G
L
 
H
V
 
I
R
 
R
Q
 
S
L
 
V
L
 
V
V
 
S
A
 
R
R
 
L
F
 
F
G
 
G
-
 
P
E
 
E
G
 
A
G
 
A
V
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
D
N
 
N
A
 
I
R
 
R
E
 
D
I
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
Q
D
 
Q
N
 
Q
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
P
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
 
P
D
 
A
S
 
S
F
 
F
S
 
L
R
 
Q
I
 
L
I
 
V
L
 
E
A
 
A

P27876 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
40% identity, 99% coverage: 2:249/251 of query aligns to 3:247/253 of P27876

query
sites
P27876
K
 
K
K
 
P
L
 
I
M
 
I
A
 
A
A
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
K
T
 
T
A
 
L
G
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
A
 
V
S
 
S
L
 
F
A
 
V
A
 
E
L
 
E
T
 
V
A
 
K
D
 
S
T
 
S
L
 
I
P
 
P
-
 
A
-
 
A
D
 
D
D
 
K
R
 
A
E
 
E
V
 
A
V
 
V
I
 
V
F
 
C
P
 
A
Q
 
P
F
 
A
T
 
L
A
 
F
L
 
L
S
 
E
P
 
K
V
 
L
A
 
A
D
 
S
A
 
A
L
 
V
R
 
K
H
 
-
A
 
G
T
 
T
G
 
D
Y
 
L
S
 
K
V
 
V
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
M
Y
 
H
P
 
F
A
 
E
A
 
E
E
 
S
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
V
M
 
A
L
 
L
M
 
K
D
 
D
C
 
L
G
 
G
C
 
V
A
 
D
W
 
Y
V
 
C
L
 
V
T
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
E
V
 
M
I
 
F
G
 
A
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
T
V
 
V
G
 
N
A
 
K
K
 
K
T
 
A
A
 
H
F
 
A
S
 
A
I
 
F
N
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
I
K
 
V
V
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
L
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
K
L
 
T
G
 
N
E
 
D
V
 
L
L
 
V
E
 
A
R
 
D
Q
 
Q
L
 
V
E
 
K
T
 
K
G
 
G
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
S
G
 
E
D
 
E
A
 
Q
V
 
V
P
 
A
A
 
A
A
 
S
I
 
V
A
 
-
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
A
P
 
K
E
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
D
A
 
V
H
 
C
A
 
A
L
 
H
V
 
I
R
 
R
Q
 
K
L
 
T
L
 
V
V
 
A
A
 
E
R
 
S
F
 
F
G
 
S
-
 
Q
E
 
E
G
 
A
G
 
A
V
 
D
A
 
K
V
 
L
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
A
N
 
N
A
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
Y
I
 
M
A
 
A
L
 
E
D
 
S
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
 
P
D
 
Q
S
 
S
F
 
F
S
 
V
R
 
Q
I
 
L
I
 
L

P00939 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Oryctolagus cuniculus (Rabbit) (see 2 papers)
42% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 6:247/249 of P00939

query
sites
P00939
K
 
K
K
 
F
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
 
N
W
 
W
K
 
K
M
 
M
Y
x
N
K
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
G
E
 
R
A
 
K
R
 
K
T
 
N
T
 
L
A
 
G
A
 
E
S
 
L
L
 
I
A
 
T
A
 
T
L
 
L
T
 
N
A
 
A
D
 
A
T
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
A
D
 
D
R
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
V
I
 
C
F
 
A
P
 
P
Q
 
P
F
 
T
T
 
A
A
 
Y
L
 
I
S
 
D
P
 
F
V
 
A
A
 
R
D
 
Q
A
 
K
L
 
L
R
 
D
H
 
P
A
 
K
T
 
I
G
 
-
Y
 
-
S
 
A
V
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
Y
 
Y
P
 
K
A
 
V
A
 
T
E
x
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
I
M
 
K
D
 
D
C
 
C
G
 
G
C
 
A
A
 
T
W
 
W
V
 
V
L
 
V
T
 
L
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
H
V
 
V
I
 
F
G
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
Q
K
 
K
T
 
V
A
 
A
F
 
H
S
 
A
I
 
L
N
 
S
A
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
I
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
I
L
 
T
G
 
E
E
 
K
V
 
V
L
 
V
E
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
T
E
 
K
T
 
V
G
 
I
L
 
A
A
 
D
G
 
N
V
 
V
K
 
K
G
 
D
D
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
W
A
 
S
A
 
K
I
 
V
A
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
G
 
T
P
 
P
P
 
Q
E
 
Q
I
 
A
V
 
Q
E
 
E
A
 
V
H
 
H
A
 
E
L
 
K
V
 
L
R
 
R
Q
 
G
L
 
W
L
 
L
V
 
K
A
 
S
R
 
N
F
 
V
G
 
S
E
 
D
G
 
A
-
 
V
G
 
A
V
 
Q
A
 
S
V
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
E
 
A
N
 
T
A
 
C
R
 
K
E
 
E
I
 
L
I
 
A
A
 
S
L
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
P
D
 
E
S
 
-
F
 
F
S
 
V
R
 
D
I
 
I
I
 
I
L
 
N
A
 
A

4owgA Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase-pep complex
42% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 3:244/246 of 4owgA

query
sites
4owgA
K
 
K
K
 
F
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
-
K
 
-
T
 
-
A
 
N
G
 
G
E
 
R
A
 
K
R
 
K
T
 
N
T
 
L
A
 
G
A
 
E
S
 
L
L
 
I
A
 
T
A
 
T
L
 
L
T
 
N
A
 
A
D
 
A
T
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
A
D
 
D
R
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
V
I
 
C
F
 
A
P
 
P
Q
 
P
F
 
T
T
 
A
A
 
Y
L
 
I
S
 
D
P
 
F
V
 
A
A
 
R
D
 
Q
A
 
K
L
 
L
R
 
D
H
 
P
A
 
K
T
 
I
G
 
-
Y
 
-
S
 
A
V
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
Y
 
Y
P
 
K
A
 
V
A
 
T
E
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
I
M
 
K
D
 
D
C
 
C
G
 
G
C
 
A
A
 
T
W
 
W
V
 
V
L
 
V
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
H
V
 
V
I
 
F
G
 
G
E
 
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
Q
K
 
K
T
 
V
A
 
A
F
 
H
S
 
A
I
 
L
N
 
S
A
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
I
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
I
L
 
T
G
 
E
E
 
K
V
 
V
L
 
V
E
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
T
E
 
K
T
 
V
G
 
I
L
 
A
A
 
D
G
 
N
V
 
V
K
 
K
G
 
D
D
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
W
A
 
S
A
 
K
I
 
V
A
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
G
 
T
P
 
P
P
 
Q
E
 
Q
I
 
A
V
 
Q
E
 
E
A
 
V
H
 
H
A
 
E
L
 
K
V
 
L
R
 
R
Q
 
G
L
 
W
L
 
L
V
 
K
A
 
S
R
 
N
F
 
V
G
 
S
E
 
D
G
 
A
-
 
V
G
 
A
V
 
Q
A
 
S
V
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
|
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
E
 
A
N
 
T
A
 
C
R
 
K
E
 
E
I
 
L
I
 
A
A
 
S
L
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
P
D
 
E
S
 
-
F
 
F
S
 
V
R
 
D
I
 
I
I
 
I
L
 
N
A
 
A

1r2rB Crystal structure of rabbit muscle triosephosphate isomerase (see paper)
42% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 4:245/247 of 1r2rB

query
sites
1r2rB
K
 
K
K
 
F
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
-
K
 
-
T
 
-
A
 
N
G
 
G
E
 
R
A
 
K
R
 
K
T
 
N
T
 
L
A
 
G
A
 
E
S
 
L
L
 
I
A
 
T
A
 
T
L
 
L
T
 
N
A
 
A
D
 
A
T
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
A
D
 
D
R
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
V
I
 
C
F
 
A
P
 
P
Q
 
P
F
 
T
T
 
A
A
 
Y
L
 
I
S
 
D
P
 
F
V
 
A
A
 
R
D
 
Q
A
 
K
L
 
L
R
 
D
H
 
P
A
 
K
T
 
I
G
 
-
Y
 
-
S
 
A
V
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
Y
 
Y
P
 
K
A
 
V
A
 
T
E
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
I
M
 
K
D
 
D
C
 
C
G
 
G
C
 
A
A
 
T
W
 
W
V
 
V
L
 
V
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
H
V
 
V
I
 
F
G
 
G
E
 
E
S
 
S
D
|
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
Q
K
 
K
T
 
V
A
 
A
F
 
H
S
 
A
I
 
L
N
 
S
A
 
E
G
 
G
L
 
L
K
 
G
V
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
I
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
I
L
 
T
G
 
E
E
 
K
V
 
V
L
 
V
E
 
F
R
 
E
Q
|
Q
L
 
T
E
 
K
T
 
V
G
 
I
L
 
A
A
 
D
G
 
N
V
 
V
K
 
K
G
 
D
D
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
W
A
 
S
A
 
K
I
 
V
A
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
G
 
T
P
 
P
P
 
Q
E
 
Q
I
 
A
V
 
Q
E
 
E
A
 
V
H
 
H
A
 
E
L
 
K
V
 
L
R
 
R
Q
 
G
L
 
W
L
 
L
V
 
K
A
 
S
R
 
N
F
 
V
G
 
S
E
 
D
G
 
A
-
 
V
G
 
A
V
 
Q
A
 
S
V
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
T
P
 
G
E
 
A
N
 
T
A
 
C
R
 
K
E
 
E
I
 
L
I
 
A
A
 
S
L
 
Q
D
 
P
N
 
D
V
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
F
L
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
P
D
 
E
S
 
-
F
 
F
S
 
V
R
 
D
I
 
I
I
 
I
L
 
N
A
 
A

3uwzA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate (see paper)
40% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 6:250/254 of 3uwzA

query
sites
3uwzA
L
 
I
M
 
I
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
K
T
 
T
A
 
V
G
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
K
T
 
D
T
 
F
A
 
V
A
 
N
S
 
A
L
 
L
A
 
P
A
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
V
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
Q
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
L
S
 
D
P
 
A
V
 
L
A
 
T
D
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
K
H
 
E
-
 
G
-
 
K
A
 
A
T
 
Q
G
 
G
Y
 
L
S
 
E
V
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
Y
 
Y
P
 
F
A
 
E
A
 
D
E
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
P
 
P
G
 
V
M
 
A
L
 
L
M
 
A
D
 
D
C
 
L
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
Y
V
 
V
L
 
V
T
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
E
V
 
L
I
 
F
G
 
H
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
V
 
I
G
 
N
A
 
K
K
 
K
T
 
A
A
 
H
F
 
A
S
 
I
I
 
F
N
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
K
 
T
V
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
A
G
 
N
E
 
D
V
 
V
L
 
V
E
 
G
R
 
E
Q
 
Q
L
 
V
E
 
K
T
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
S
G
 
E
D
 
D
A
 
Q
V
 
L
P
 
K
A
 
-
A
 
S
I
 
V
A
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
S
P
 
E
E
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
E
A
 
M
H
 
C
A
 
A
L
 
F
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
L
 
T
L
 
I
V
 
A
A
 
D
-
 
L
R
 
S
F
 
S
G
 
K
E
 
E
G
 
V
G
 
S
V
 
E
A
 
A
V
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
|
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
Y
I
 
M
A
 
A
L
 
Q
D
 
T
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
V
D
 
E
S
 
D
F
 
F
S
 
V
R
 
Q
I
 
L
I
 
L

3uwwA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglyceric acid (see paper)
40% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 6:250/254 of 3uwwA

query
sites
3uwwA
L
 
I
M
 
I
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
K
T
 
T
A
 
V
G
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
K
T
 
D
T
 
F
A
 
V
A
 
N
S
 
A
L
 
L
A
 
P
A
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
V
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
Q
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
L
S
 
D
P
 
A
V
 
L
A
 
T
D
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
K
H
 
E
-
 
G
-
 
K
A
 
A
T
 
Q
G
 
G
Y
 
L
S
 
E
V
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
Y
 
Y
P
 
F
A
 
E
A
 
D
E
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
P
 
P
G
 
V
M
 
A
L
 
L
M
 
A
D
 
D
C
 
L
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
Y
V
 
V
L
 
V
T
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
E
V
 
L
I
 
F
G
 
H
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
V
 
I
G
 
N
A
 
K
K
 
K
T
 
A
A
 
H
F
 
A
S
 
I
I
 
F
N
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
K
 
T
V
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
A
G
 
N
E
 
D
V
 
V
L
 
V
E
 
G
R
 
E
Q
 
Q
L
 
V
E
 
K
T
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
S
G
 
E
D
 
D
A
 
Q
V
 
L
P
 
K
A
 
-
A
 
S
I
 
V
A
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
S
P
 
E
E
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
E
A
 
M
H
 
C
A
 
A
L
 
F
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
L
 
T
L
 
I
V
 
A
A
 
D
-
 
L
R
 
S
F
 
S
G
 
K
E
 
E
G
 
V
G
 
S
V
 
E
A
 
A
V
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
Y
I
 
M
A
 
A
L
 
Q
D
 
T
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
V
D
 
E
S
 
D
F
 
F
S
 
V
R
 
Q
I
 
L
I
 
L

3uwuA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-3-phosphate (see paper)
40% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 5:249/253 of 3uwuA

query
sites
3uwuA
L
 
I
M
 
I
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
K
T
 
T
A
 
V
G
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
K
T
 
D
T
 
F
A
 
V
A
 
N
S
 
A
L
 
L
A
 
P
A
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
V
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
Q
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
L
S
 
D
P
 
A
V
 
L
A
 
T
D
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
K
H
 
E
-
 
G
-
 
K
A
 
A
T
 
Q
G
 
G
Y
 
L
S
 
E
V
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
Y
 
Y
P
 
F
A
 
E
A
 
D
E
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
P
 
P
G
 
V
M
 
A
L
 
L
M
 
A
D
 
D
C
 
L
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
Y
V
 
V
L
 
V
T
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
E
V
 
L
I
 
F
G
 
H
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
V
 
I
G
 
N
A
 
K
K
 
K
T
 
A
A
 
H
F
 
A
S
 
I
I
 
F
N
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
K
 
T
V
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
A
G
 
N
E
 
D
V
 
V
L
 
V
E
 
G
R
 
E
Q
 
Q
L
 
V
E
 
K
T
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
S
G
 
E
D
 
D
A
 
Q
V
 
L
P
 
K
A
 
-
A
 
S
I
 
V
A
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
|
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
S
P
 
E
E
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
E
A
 
M
H
 
C
A
 
A
L
 
F
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
L
 
T
L
 
I
V
 
A
A
 
D
-
 
L
R
 
S
F
 
S
G
 
K
E
 
E
G
 
V
G
 
S
V
 
E
A
 
A
V
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
Y
I
 
M
A
 
A
L
 
Q
D
 
T
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
|
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
V
D
 
E
S
 
D
F
 
F
S
 
V
R
 
Q
I
 
L
I
 
L

Q6GIL6 Triosephosphate isomerase; TIM; TPI; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1 from Staphylococcus aureus (strain MRSA252) (see paper)
40% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 5:249/253 of Q6GIL6

query
sites
Q6GIL6
L
 
I
M
 
I
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
|
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
K
T
 
T
A
 
V
G
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
K
T
 
D
T
 
F
A
 
V
A
 
N
S
 
A
L
 
L
A
 
P
A
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
V
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
Q
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
L
S
 
D
P
 
A
V
 
L
A
 
T
D
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
K
H
 
E
-
 
G
-
 
K
A
 
A
T
 
Q
G
 
G
Y
 
L
S
 
E
V
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
Y
 
Y
P
 
F
A
 
E
A
 
D
E
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
P
 
P
G
 
V
M
 
A
L
 
L
M
 
A
D
 
D
C
 
L
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
Y
V
 
V
L
 
V
T
 
I
G
 
G
H
 
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
E
V
 
L
I
 
F
G
 
H
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
V
 
I
G
 
N
A
 
K
K
 
K
T
 
A
A
 
H
F
 
A
S
 
I
I
 
F
N
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
K
 
T
V
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
A
G
 
N
E
 
D
V
 
V
L
 
V
E
 
G
R
 
E
Q
 
Q
L
 
V
E
 
K
T
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
S
G
 
E
D
 
D
A
 
Q
V
 
L
P
 
K
A
 
-
A
 
S
I
 
V
A
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
S
P
 
E
E
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
E
A
 
M
H
 
C
A
 
A
L
 
F
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
L
 
T
L
 
I
V
 
A
A
 
D
-
 
L
R
 
S
F
 
S
G
 
K
E
 
E
G
 
V
G
 
S
V
 
E
A
 
A
V
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
 
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
Y
I
 
M
A
 
A
L
 
Q
D
 
T
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
V
D
 
E
S
 
D
F
 
F
S
 
V
R
 
Q
I
 
L
I
 
L

3uwvA Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 2-phosphoglyceric acid (see paper)
40% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 7:251/255 of 3uwvA

query
sites
3uwvA
L
 
I
M
 
I
A
 
A
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
K
T
 
T
A
 
V
G
 
Q
E
 
E
A
 
A
R
 
K
T
 
D
T
 
F
A
 
V
A
 
N
S
 
A
L
 
L
A
 
P
A
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
-
D
 
-
T
 
T
L
 
L
P
 
P
D
 
D
D
 
S
R
 
K
E
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
S
V
 
V
I
 
I
F
 
C
P
 
A
Q
 
P
F
 
A
T
 
I
A
 
Q
L
 
L
S
 
D
P
 
A
V
 
L
A
 
T
D
 
T
A
 
A
L
 
V
R
 
K
H
 
E
-
 
G
-
 
K
A
 
A
T
 
Q
G
 
G
Y
 
L
S
 
E
V
 
I
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
T
Y
 
Y
P
 
F
A
 
E
A
 
D
E
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
T
S
 
S
P
 
P
G
 
V
M
 
A
L
 
L
M
 
A
D
 
D
C
 
L
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
Y
V
 
V
L
 
V
T
 
I
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
|
E
R
 
R
R
 
R
H
 
E
V
 
L
I
 
F
G
 
H
E
 
E
S
 
T
D
 
D
E
 
E
L
 
E
V
 
I
G
 
N
A
 
K
K
 
K
T
 
A
A
 
H
F
 
A
S
 
I
I
 
F
N
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
K
 
T
V
 
P
V
 
I
L
 
I
C
 
C
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
I
 
D
E
 
E
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
A
G
 
N
E
 
D
V
 
V
L
 
V
E
 
G
R
 
E
Q
 
Q
L
 
V
E
 
K
T
 
K
G
 
A
L
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
L
K
 
S
G
 
E
D
 
D
A
 
Q
V
 
L
P
 
K
A
 
-
A
 
S
I
 
V
A
 
V
V
 
I
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
I
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
|
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
S
A
 
S
G
 
T
P
 
S
P
 
E
E
 
D
I
 
A
V
 
N
E
 
E
A
 
M
H
 
C
A
 
A
L
 
F
V
 
V
R
 
R
Q
 
Q
L
 
T
L
 
I
V
 
A
A
 
D
-
 
L
R
 
S
F
 
S
G
 
K
E
 
E
G
 
V
G
 
S
V
 
E
A
 
A
V
 
T
R
 
R
I
 
I
L
 
Q
Y
 
Y
G
 
G
G
 
G
S
|
S
V
 
V
K
|
K
P
 
P
E
 
N
N
 
N
A
 
I
R
 
K
E
 
E
I
 
Y
I
 
M
A
 
A
L
 
Q
D
 
T
N
 
D
V
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
A
L
 
L
V
 
V
G
|
G
G
|
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
K
A
 
V
D
 
E
S
 
D
F
 
F
S
 
V
R
 
Q
I
 
L
I
 
L

P60174 Triosephosphate isomerase; TIM; Methylglyoxal synthase; Triose-phosphate isomerase; EC 5.3.1.1; EC 4.2.3.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
42% identity, 100% coverage: 2:251/251 of query aligns to 6:247/249 of P60174

query
sites
P60174
K
 
K
K
 
F
L
 
F
M
 
V
A
 
G
A
 
G
N
|
N
W
 
W
K
|
K
M
 
M
Y
 
N
K
 
-
T
 
-
A
 
-
G
 
G
E
 
R
A
 
K
R
 
Q
T
 
S
T
 
L
A
 
G
A
 
E
S
 
L
L
 
I
A
 
G
A
 
T
L
 
L
T
 
N
A
 
A
D
 
A
T
 
K
L
 
V
P
 
P
D
 
A
D
 
D
R
 
T
E
 
E
V
 
V
V
 
V
I
 
C
F
 
A
P
 
P
Q
 
P
F
 
T
T
 
A
A
 
Y
L
 
I
S
 
D
P
 
F
V
 
A
A
 
R
D
 
Q
A
 
K
L
 
L
R
 
D
H
 
P
A
 
K
T
 
I
G
 
-
Y
 
-
S
 
A
V
 
V
G
 
A
G
 
A
Q
 
Q
D
 
N
V
 
C
Y
 
Y
P
 
K
A
 
V
A
 
T
E
 
N
G
 
G
A
 
A
Y
 
F
T
 
T
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
S
P
 
P
G
 
G
M
 
M
L
 
I
M
 
K
D
 
D
C
 
C
G
 
G
C
 
A
A
 
T
W
 
W
V
 
V
L
 
V
T
 
L
G
 
G
H
|
H
S
 
S
E
 
E
R
 
R
R
 
R
H
 
H
V
 
V
I
 
F
G
 
G
E
|
E
S
 
S
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
I
G
 
G
A
 
Q
K
 
K
T
 
V
A
 
A
F
 
H
S
 
A
I
 
L
N
 
A
A
 
E
G
 
G
L
 
L
K
x
G
V
 
V
V
 
I
L
 
A
C
 
C
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
K
I
 
L
E
 
D
E
 
E
R
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
G
R
 
I
L
 
T
G
 
E
E
 
K
V
 
V
L
 
V
E
 
F
R
 
E
Q
 
Q
L
 
T
E
 
K
T
 
V
G
 
I
L
 
A
A
 
D
G
 
N
V
 
V
K
 
K
G
 
D
D
 
-
A
 
-
V
 
-
P
 
W
A
 
S
A
 
K
I
 
V
A
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
E
|
E
P
 
P
V
 
V
W
 
W
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
T
A
 
A
G
 
T
P
 
P
P
 
Q
E
 
Q
I
 
A
V
 
Q
E
 
E
A
 
V
H
 
H
A
 
E
L
 
K
V
 
L
R
 
R
Q
 
G
L
 
W
L
 
L
V
 
K
A
 
S
R
 
N
F
 
V
G
 
S
E
 
D
G
 
A
-
 
V
G