SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8499697 FitnessBrowser__Miya:8499697 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 14 hits to proteins with known functional sites (download)

2j8mA Structure of p. Aeruginosa acetyltransferase pa4866 (see paper)
58% identity, 97% coverage: 3:174/178 of query aligns to 4:171/171 of 2j8mA

query
sites
2j8mA
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
E
 
G
S
 
V
G
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
P
G
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
G
N
 
N
T
 
T
T
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
N
 
N
E
 
E
S
 
T
V
 
P
T
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
A
G
 
N
R
 
R
A
 
Q
A
 
A
W
 
W
L
 
F
A
 
D
D
 
A
R
 
R
R
 
A
A
 
R
A
 
Q
G
 
G
H
 
Y
P
 
P
V
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
S
E
 
D
A
 
A
G
 
A
R
 
G
N
 
E
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
T
 
S
F
 
Y
G
 
G
D
 
D
W
|
W
R
|
R
A
 
P
W
 
F
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
H
 
G
T
 
T
V
 
V
E
 
E
H
 
H
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
H
 
R
K
 
D
D
 
D
T
 
Q
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
R
D
 
A
M
 
Q
G
 
G
K
 
L
H
 
H
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
A
V
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
G
N
 
N
E
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
I
A
 
G
L
 
L
H
 
H
R
 
R
K
 
R
M
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
E
E
 
I
V
 
S
G
 
G
M
 
Q
L
 
M
R
 
P
E
 
Q
V
 
V
G
 
G
C
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
T
F
 
F
L
 
M
Q
 
Q
L
 
L
T
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
P
R
 
T
E
 
R
T
 
S
P
 
A
P
 
P

2j8rA Structure of p. Aeruginosa acetyltransferase pa4866 solved in complex with l-methionine sulfoximine (see paper)
58% identity, 97% coverage: 3:174/178 of query aligns to 3:170/170 of 2j8rA

query
sites
2j8rA
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
E
 
G
S
 
V
G
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
P
G
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
G
N
 
N
T
 
T
T
 
T
A
|
A
I
|
I
W
|
W
N
 
N
E
 
E
S
 
T
V
 
P
T
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
A
G
 
N
R
 
R
A
 
Q
A
 
A
W
|
W
L
 
F
A
 
D
D
 
A
R
 
R
R
 
A
A
 
R
A
 
Q
G
 
G
H
 
Y
P
 
P
V
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
S
E
 
D
A
 
A
G
 
A
R
 
G
N
 
E
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
|
Y
A
 
A
T
 
S
F
 
Y
G
 
G
D
 
D
W
 
W
R
|
R
A
 
P
W
x
F
D
 
E
G
 
G
Y
x
F
R
 
R
H
 
G
T
 
T
V
 
V
E
|
E
H
 
H
S
|
S
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
H
 
R
K
 
D
D
 
D
T
 
Q
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
R
D
 
A
M
 
Q
G
 
G
K
 
L
H
 
H
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
A
V
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
G
N
 
N
E
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
I
A
 
G
L
 
L
H
 
H
R
 
R
K
 
R
M
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
E
E
 
I
V
 
S
G
 
G
M
 
Q
L
 
M
R
 
P
E
 
Q
V
 
V
G
 
G
C
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
T
F
 
F
L
 
M
Q
 
Q
L
 
L
T
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
P
R
 
T
E
 
R
T
 
S
P
 
A
P
 
P

A6VCX3 L-methionine sulfoximine/L-methionine sulfone acetyltransferase; Methionine derivative detoxifier A; MDDA; EC 2.3.1.- from Pseudomonas aeruginosa (strain PA7) (see paper)
58% identity, 97% coverage: 3:174/178 of query aligns to 5:172/172 of A6VCX3

query
sites
A6VCX3
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
A
E
 
G
S
 
V
G
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
P
G
 
G
I
 
I
V
 
L
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
G
N
 
N
T
 
T
T
 
T
A
 
A
I
 
I
W
 
W
N
 
N
E
 
E
S
 
T
V
 
P
T
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
A
G
 
N
R
 
R
A
 
Q
A
 
A
W
 
W
L
 
F
A
 
D
D
 
A
R
 
R
R
 
A
A
 
R
A
 
Q
G
 
G
H
 
Y
P
 
P
V
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
S
E
 
D
A
 
A
G
 
A
R
 
G
N
 
E
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
T
 
S
F
 
Y
G
 
G
D
 
D
W
 
W
R
|
R
A
x
P
W
x
F
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
H
 
G
T
 
T
V
 
V
E
|
E
H
|
H
S
|
S
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
H
 
R
K
 
D
D
 
D
T
 
Q
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
L
G
 
G
A
 
V
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
A
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
E
R
 
R
A
 
A
R
 
R
D
 
A
M
 
Q
G
 
G
K
 
L
H
 
H
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
A
V
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
G
N
 
N
E
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
I
A
 
G
L
 
L
H
 
H
R
 
R
K
 
R
M
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
E
E
 
I
V
 
S
G
 
G
M
 
Q
L
 
M
R
 
P
E
 
Q
V
 
V
G
 
G
C
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
T
F
 
F
L
 
M
Q
 
Q
L
 
L
T
 
N
L
 
L
D
 
D
A
 
P
R
 
T
E
 
R
T
 
S
P
 
A
P
 
P

3dr8A Structure of ynca, a putative acetyltransferase from salmonella typhimurium with its cofactor acetyl-coa
54% identity, 98% coverage: 1:175/178 of query aligns to 3:172/173 of 3dr8A

query
sites
3dr8A
M
 
M
L
 
T
I
 
I
R
 
R
D
 
F
A
 
A
E
 
D
S
 
K
G
 
A
D
 
D
I
 
C
E
 
A
G
 
A
I
 
I
V
 
T
A
 
E
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
D
 
H
A
 
A
V
 
V
C
 
L
N
 
H
T
 
T
T
 
A
A
|
A
I
 
I
W
 
W
N
 
N
E
 
D
S
 
R
V
 
T
T
 
V
D
 
D
A
 
T
A
 
D
G
 
N
R
 
R
A
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
Y
A
 
E
D
 
A
R
 
R
R
 
Q
A
 
L
A
 
L
G
 
G
H
 
Y
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
S
V
 
E
E
 
E
A
 
N
G
 
G
R
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
V
V
 
V
L
 
T
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
T
 
S
F
 
F
G
 
G
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
S
W
 
F
D
 
D
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
H
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
 
E
H
|
H
S
|
S
V
|
V
Y
|
Y
V
|
V
H
 
H
K
 
P
D
 
A
T
 
H
R
x
Q
G
|
G
R
 
K
G
|
G
L
 
L
G
|
G
A
x
R
A
 
K
L
 
L
L
 
L
H
 
S
A
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
D
R
 
E
A
 
A
R
 
R
D
 
R
M
 
C
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
Q
N
 
N
E
x
A
A
|
A
S
 
S
M
 
I
A
x
R
L
 
L
H
|
H
R
 
H
K
x
S
M
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
T
E
 
V
V
 
T
G
 
A
M
 
Q
L
 
M
R
 
P
E
 
Q
V
 
V
G
 
G
C
 
V
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
T
F
 
F
L
 
M
Q
 
Q
L
 
L
T
 
Q
L
 
L
D
 
D
A
 
E
R
 
H
E
 
A
T
 
A
P
 
P
P
 
D
A
 
A

Q8ZPD3 L-methionine sulfoximine/L-methionine sulfone acetyltransferase; L-amino acid N-acyltransferase; Methionine derivative detoxifier A; MDDA; EC 2.3.1.-; EC 2.3.1.- from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
54% identity, 98% coverage: 1:175/178 of query aligns to 1:170/171 of Q8ZPD3

query
sites
Q8ZPD3
M
 
M
L
 
T
I
 
I
R
 
R
D
 
F
A
 
A
E
 
D
S
 
K
G
 
A
D
 
D
I
 
C
E
 
A
G
 
A
I
 
I
V
 
T
A
 
E
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
D
 
H
A
 
A
V
 
V
C
 
L
N
 
H
T
 
T
T
 
A
A
 
A
I
 
I
W
 
W
N
 
N
E
 
D
S
 
R
V
 
T
T
 
V
D
 
D
A
 
T
A
 
D
G
 
N
R
 
R
A
 
L
A
 
A
W
 
W
L
 
Y
A
 
E
D
 
A
R
 
R
R
 
Q
A
 
L
A
 
L
G
 
G
H
 
Y
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
S
V
 
E
E
 
E
A
 
N
G
 
G
R
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
V
V
 
V
L
 
T
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
T
 
S
F
 
F
G
 
G
D
 
D
W
 
W
R
 
R
A
 
S
W
 
F
D
 
D
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
H
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
|
E
H
 
H
S
 
S
V
|
V
Y
|
Y
V
|
V
H
 
H
K
 
P
D
 
A
T
 
H
R
 
Q
G
|
G
R
x
K
G
|
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
A
 
K
L
 
L
L
 
L
H
 
S
A
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
D
R
 
E
A
 
A
R
 
R
D
 
R
M
 
C
G
 
G
K
 
K
H
 
H
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
E
A
 
S
G
 
Q
N
|
N
E
 
A
A
 
A
S
 
S
M
 
I
A
 
R
L
 
L
H
 
H
R
 
H
K
x
S
M
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
T
E
 
V
V
 
T
G
 
A
M
 
Q
L
 
M
R
 
P
E
 
Q
V
 
V
G
 
G
C
 
V
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
T
F
 
F
L
 
M
Q
 
Q
L
 
L
T
 
Q
L
 
L
D
 
D
A
 
E
R
 
H
E
 
A
T
 
A
P
 
P
P
 
D
A
 
A

4jwpA Crystal structure of ribosomal-protein-alanine n-acetyltransferase from brucella melitensis in complex with acetyl coa
52% identity, 94% coverage: 1:167/178 of query aligns to 4:165/165 of 4jwpA

query
sites
4jwpA
M
 
L
L
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
H
A
 
A
E
 
T
S
 
E
G
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
P
G
 
A
I
 
L
V
 
L
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
A
 
A
V
 
V
C
 
E
N
 
N
T
 
T
T
 
L
A
|
A
I
 
I
W
 
W
N
 
N
E
 
E
S
 
T
V
 
L
T
 
V
D
 
D
A
 
L
A
 
E
G
 
N
R
 
R
A
 
H
A
 
Q
W
 
W
L
 
L
A
 
E
D
 
N
R
 
R
R
 
N
A
 
R
A
 
D
G
 
G
H
 
F
P
 
P
V
 
V
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
E
E
 
R
A
 
E
G
 
G
R
 
Q
N
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
V
L
 
V
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
T
 
S
F
 
Y
G
 
G
D
 
P
W
 
F
R
 
R
A
 
P
W
 
F
D
 
E
G
 
G
Y
 
F
R
 
R
H
 
H
T
 
S
V
 
S
E
 
E
H
 
L
S
 
S
V
|
V
Y
|
Y
V
|
V
H
 
A
K
 
S
D
 
N
T
 
A
R
|
R
G
|
G
R
 
G
G
|
G
L
 
I
G
|
G
A
x
R
A
 
T
L
 
L
L
 
L
H
 
A
A
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
E
R
x
E
A
 
A
R
 
R
D
x
E
M
 
R
G
 
K
K
 
V
H
 
H
V
 
V
M
 
L
V
 
I
A
 
A
G
|
G
V
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
N
 
N
E
 
A
A
|
A
S
|
S
M
 
I
A
|
A
L
 
L
H
 
H
R
 
R
K
 
S
M
 
Q
G
 
G
F
 
F
T
 
E
E
 
E
V
 
C
G
 
G
M
 
T
L
 
L
R
 
K
E
 
Q
V
 
V
G
 
G
C
 
Q
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
L
F
 
F
L
 
M
Q
 
Q
L
 
K
T
 
I
L
 
L

4mbuA Crystal structure of n-acetyltransferase from staphylococcus aureus mu50 (see paper)
44% identity, 93% coverage: 2:167/178 of query aligns to 4:164/165 of 4mbuA

query
sites
4mbuA
L
 
M
I
 
I
R
 
R
D
 
C
A
 
A
E
 
K
S
 
K
G
 
E
D
 
D
I
 
L
E
 
N
G
 
A
I
 
I
V
 
L
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
N
 
N
D
 
D
A
 
A
V
 
I
C
 
I
N
 
N
T
 
T
T
 
T
A
 
A
I
 
V
W
 
Y
N
 
T
E
 
Y
S
 
K
V
 
P
T
 
Q
D
 
T
A
 
I
A
 
D
G
 
E
R
 
R
A
 
I
A
 
A
W
 
W
L
 
F
A
 
E
D
 
T
R
 
K
R
 
Q
A
 
R
A
 
N
G
 
H
H
 
E
P
 
P
V
 
I
L
 
F
V
 
V
A
 
F
V
 
E
E
 
E
A
 
N
G
 
G
R
 
S
N
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
A
T
 
T
F
 
F
G
 
G
D
 
S
W
 
F
R
 
R
A
 
P
W
 
W
D
 
P
G
 
A
Y
 
Y
R
 
Q
H
 
Y
T
 
T
V
 
I
E
 
E
H
 
H
S
 
S
V
 
I
Y
 
Y
V
 
V
H
 
D
K
 
A
D
 
S
T
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
G
L
 
I
G
 
A
A
 
S
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
H
 
Q
A
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
V
R
 
E
A
 
A
R
 
K
D
 
A
M
 
K
G
 
G
K
 
Y
H
 
R
V
 
T
M
 
L
V
 
V
A
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
D
A
 
A
G
 
S
N
 
N
E
 
E
A
 
A
S
 
S
M
 
I
A
 
K
L
 
L
H
 
H
R
x
Q
K
 
K
M
 
F
G
 
N
F
 
F
T
x
K
E
x
H
V
 
A
G
 
G
M
 
T
L
 
L
R
 
T
E
 
N
V
 
V
G
 
G
C
 
Y
K
 
K
F
 
F
G
 
D
R
 
Y
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
A
F
 
F
L
 
Y
Q
 
E
L
 
L
T
 
D
L
 
L

2jlmF Structure of a putative acetyltransferase (aciad1637) from acinetobacter baylyi adp1 (see paper)
45% identity, 93% coverage: 14:178/178 of query aligns to 22:178/180 of 2jlmF

query
sites
2jlmF
I
 
I
V
 
L
A
 
E
I
 
I
Y
 
L
N
 
N
D
 
D
A
 
A
V
 
I
C
 
I
N
 
N
T
 
S
T
|
T
A
|
A
I
 
L
W
 
Y
N
 
D
E
 
Y
S
 
K
V
 
P
T
 
R
D
 
S
A
 
K
A
 
E
G
 
S
R
 
M
A
 
A
A
 
A
W
 
W
L
 
F
A
 
A
D
 
T
R
 
K
R
 
R
A
 
Q
A
 
N
G
 
N
H
 
F
P
 
P
V
 
I
L
 
I
V
 
G
A
 
A
V
 
V
-
 
N
E
 
E
A
 
V
G
 
G
R
 
Q
N
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
F
A
 
A
T
 
S
F
 
W
G
 
G
D
 
S
W
 
F
R
 
R
A
 
A
W
 
F
D
 
P
G
 
A
Y
 
Y
R
 
K
H
 
Y
T
 
T
V
 
V
E
 
E
H
 
H
S
 
S
V
 
V
Y
|
Y
V
x
I
H
 
H
K
 
K
D
 
D
T
 
Y
R
 
R
G
 
G
R
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
S
A
 
K
A
 
H
L
 
L
L
 
M
H
 
N
A
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
K
R
 
R
A
 
A
R
 
V
D
 
E
M
 
S
G
 
E
K
 
V
H
 
H
V
 
V
M
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
C
V
 
I
E
x
D
A
 
A
G
 
T
N
|
N
E
 
V
A
 
A
S
 
S
M
 
I
A
 
Q
L
 
L
H
 
H
R
 
Q
K
 
K
M
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
I
E
 
H
V
 
S
G
 
G
M
 
T
L
 
I
R
 
Q
E
 
Q
V
 
A
G
 
G
C
 
F
K
 
K
F
 
F
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
A
A
 
A
F
 
F
L
 
Y
Q
 
Q
L
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
T
R
 
-
E
 
-
T
 
-
P
 
-
P
 
P
A
 
L
R
 
H
P
 
P
R
 
Q

4jxrB Crystal structure of a gnat superfamily phosphinothricin acetyltransferase (pat) from sinorhizobium meliloti in complex with accoa
37% identity, 93% coverage: 3:167/178 of query aligns to 5:165/185 of 4jxrB

query
sites
4jxrB
I
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
A
E
 
V
S
 
A
G
 
A
D
 
D
I
 
L
E
 
R
G
 
S
I
 
I
V
 
T
A
 
E
I
 
I
Y
 
Y
N
 
R
D
 
E
A
 
S
V
 
V
C
 
L
N
 
N
T
 
G
T
 
V
A
|
A
I
 
T
W
 
Y
N
 
E
E
 
E
S
 
T
V
 
P
T
 
P
D
 
S
A
 
E
A
 
A
G
 
E
R
 
M
A
 
A
A
 
L
W
 
R
L
 
F
A
 
S
D
 
T
R
 
I
R
 
T
A
 
G
A
 
N
G
 
G
H
 
Y
P
 
P
V
 
Y
L
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
L
-
 
D
E
 
E
A
 
R
G
 
G
R
 
-
N
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
A
V
 
V
L
 
I
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
T
 
Y
F
 
A
G
 
S
D
 
A
W
 
F
R
 
R
A
 
N
W
 
R
D
 
T
G
 
A
Y
 
Y
R
 
R
H
 
F
T
 
L
V
 
V
E
 
E
H
x
D
S
|
S
V
x
I
Y
|
Y
V
x
L
H
 
S
K
x
P
D
 
E
T
 
A
R
|
R
G
|
G
R
 
K
G
 
G
L
 
I
G
|
G
A
 
K
A
 
A
L
 
L
L
 
L
H
 
S
A
 
E
L
 
L
I
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
C
R
 
T
D
 
A
M
 
L
G
 
G
K
 
F
H
 
R
V
 
Q
M
 
M
V
 
I
A
 
A
G
 
V
V
 
I
E
 
G
A
 
G
G
 
A
N
x
H
E
 
P
A
x
S
S
|
S
M
 
I
A
 
A
L
 
L
H
|
H
R
 
R
K
 
A
M
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
E
E
 
L
V
 
Q
G
 
G
M
 
L
L
 
M
R
 
K
E
 
A
V
 
T
G
 
G
C
 
F
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
T
A
 
A
F
 
F
L
 
M
Q
 
Q
L
 
R
T
 
P
L
 
L

5dwnA Crystal structure of phosphinothricin n-acetyltransferase from brucella ovis in complex with acetylcoa
39% identity, 97% coverage: 2:174/178 of query aligns to 5:175/181 of 5dwnA

query
sites
5dwnA
L
 
V
I
 
I
R
 
R
D
 
D
A
 
F
E
 
Q
S
 
P
G
 
A
D
 
D
I
 
I
E
 
E
G
 
T
I
 
I
V
 
T
A
 
A
I
 
I
Y
 
Y
N
 
T
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
C
 
L
N
 
T
T
 
G
T
 
T
A
 
G
-
 
S
-
 
Y
-
 
E
I
 
I
W
 
E
N
 
P
E
 
P
S
 
T
V
 
M
T
 
D
D
 
E
A
 
M
A
 
A
G
 
K
R
 
R
A
 
F
A
 
A
W
 
A
L
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
Q
R
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
H
 
F
P
 
P
V
 
I
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
E
E
 
A
A
 
D
G
 
G
R
 
R
N
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
T
 
Y
F
 
A
G
 
S
D
 
Y
W
 
F
R
 
R
A
 
V
W
 
R
D
 
P
G
 
A
Y
 
Y
R
 
R
H
 
W
T
 
L
V
 
A
E
 
E
H
 
D
S
|
S
V
x
I
Y
|
Y
V
x
I
H
 
A
K
 
P
D
 
D
T
 
A
R
x
K
G
|
G
R
 
Q
G
|
G
L
 
I
G
|
G
A
x
K
A
 
L
L
 
L
L
 
L
H
 
R
A
 
E
L
 
L
I
 
I
G
 
A
R
 
R
A
 
I
R
 
S
D
 
A
M
 
L
G
 
G
K
 
F
H
 
R
V
 
Q
M
 
L
V
 
L
A
 
A
G
 
V
V
 
I
E
 
G
A
 
D
G
 
G
-
 
E
-
 
H
N
 
N
E
 
I
A
x
G
S
|
S
M
 
V
A
x
K
L
|
L
H
|
H
R
 
E
K
 
S
M
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
T
E
 
H
V
 
C
G
 
G
M
 
R
L
 
I
R
 
E
E
 
G
V
 
S
G
 
G
C
 
F
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
D
L
 
T
A
 
V
F
 
L
L
 
M
Q
 
Q
L
 
L
T
 
P
L
 
L
D
 
N
-
 
G
A
 
G
R
 
R
E
 
S
T
 
T
P
 
E
P
 
P

5wphA Crystal structure of arsn, n-acetyltransferase with substrate ast from pseudomonas putida kt2440 (see paper)
31% identity, 98% coverage: 3:177/178 of query aligns to 4:172/179 of 5wphA

query
sites
5wphA
I
 
I
R
 
R
D
 
V
A
 
A
E
 
R
S
 
P
G
 
E
D
 
D
I
 
A
E
 
E
G
 
E
I
 
I
V
 
Q
A
 
I
I
 
I
Y
 
Y
N
 
A
D
 
P
A
 
I
V
 
V
C
 
L
N
 
N
T
 
T
T
 
A
A
 
I
I
x
S
W
x
F
N
 
E
E
 
E
S
 
A
V
 
V
T
 
P
D
 
S
A
 
V
A
 
E
G
 
Q
R
 
M
A
 
R
A
 
E
W
 
R
L
 
I
A
 
S
D
 
T
R
 
T
R
 
L
A
 
Q
A
 
T
G
 
-
H
 
Y
P
 
P
V
 
Y
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
R
A
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
V
L
 
V
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
T
 
Y
F
 
A
G
 
S
D
 
Q
W
 
H
R
|
R
A
 
A
W
x
R
D
 
A
G
 
A
Y
|
Y
R
 
R
H
 
W
T
 
A
V
 
V
E
 
D
H
 
V
S
 
T
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
H
 
A
K
 
E
D
 
G
T
 
Q
R
 
R
G
 
R
R
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
A
A
 
R
A
 
Q
L
 
L
L
 
Y
H
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
L
G
 
P
R
 
V
A
 
L
R
 
K
D
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
Y
H
 
R
V
 
S
M
 
A
V
 
Y
A
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
A
A
 
L
G
 
P
N
 
N
E
 
E
A
 
G
S
 
S
M
 
V
A
 
G
L
 
L
H
 
H
R
 
E
K
 
R
M
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
Q
E
 
H
V
 
I
G
 
G
M
 
T
L
 
F
R
 
P
E
 
Q
V
 
V
G
 
G
C
 
F
K
 
K
F
 
L
G
 
D
R
 
A
W
 
W
L
 
H
D
 
D
L
 
V
A
 
G
F
 
Y
L
 
W
Q
 
R
L
 
F
T
 
D
L
 
F
D
 
G
A
 
D
R
 
E
E
 
G
T
 
L
P
 
H
P
 
P
A
 
E
R
 
A
P
 
P

6m7gA Crystal structure of arsn, n-acetyltransferase with substrate phosphinothricin from pseudomonas putida kt2440 (see paper)
31% identity, 98% coverage: 3:177/178 of query aligns to 4:172/176 of 6m7gA

query
sites
6m7gA
I
 
I
R
 
R
D
 
V
A
 
A
E
 
R
S
 
P
G
 
E
D
 
D
I
 
A
E
 
E
G
 
E
I
 
I
V
 
Q
A
 
I
I
 
I
Y
 
Y
N
 
A
D
 
P
A
 
I
V
 
V
C
 
L
N
 
N
T
 
T
T
 
A
A
 
I
I
 
S
W
 
F
N
 
E
E
 
E
S
 
A
V
 
V
T
 
P
D
 
S
A
 
V
A
 
E
G
 
Q
R
 
M
A
 
R
A
 
E
W
 
R
L
 
I
A
 
S
D
 
T
R
 
T
R
 
L
A
 
Q
A
 
T
G
 
-
H
 
Y
P
 
P
V
 
Y
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
R
A
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
V
L
 
V
G
 
G
Y
 
Y
A
 
A
T
 
Y
F
 
A
G
 
S
D
 
Q
W
 
H
R
 
R
A
 
A
W
x
R
D
 
A
G
 
A
Y
|
Y
R
 
R
H
 
W
T
 
A
V
 
V
E
 
D
H
 
V
S
 
T
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
H
 
A
K
 
E
D
 
G
T
 
Q
R
 
R
G
 
R
R
 
S
G
 
G
L
 
I
G
 
A
A
 
R
A
 
Q
L
 
L
L
 
Y
H
 
D
A
 
V
L
 
L
I
 
L
G
 
P
R
 
V
A
 
L
R
 
K
D
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
Y
H
 
R
V
 
S
M
 
A
V
 
Y
A
 
A
G
 
G
V
 
I
E
 
A
A
 
L
G
 
P
N
 
N
E
 
E
A
 
G
S
 
S
M
 
V
A
 
G
L
 
L
H
 
H
R
 
E
K
 
R
M
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
Q
E
 
H
V
 
I
G
 
G
M
 
T
L
 
F
R
 
P
E
 
Q
V
 
V
G
 
G
C
 
F
K
 
K
F
 
L
G
 
D
R
 
A
W
 
W
L
 
H
D
 
D
L
 
V
A
 
G
F
 
Y
L
 
W
Q
 
R
L
 
F
T
 
D
L
 
F
D
 
G
A
 
D
R
 
E
E
 
G
T
 
L
P
 
H
P
 
P
A
 
E
R
 
A
P
 
P

5t7eD Crystal structure of streptomyces hygroscopicus bialaphos resistance (bar) protein in complex with coenzyme a and l-phosphinothricin (see paper)
31% identity, 93% coverage: 3:167/178 of query aligns to 4:162/175 of 5t7eD

query
sites
5t7eD
I
 
I
R
 
R
D
 
R
A
 
A
E
 
T
S
 
E
G
 
A
D
 
D
I
 
M
E
 
P
G
 
A
I
 
V
V
 
C
A
 
T
I
 
I
Y
 
V
N
 
N
D
 
H
A
x
Y
V
 
I
C
 
E
N
 
T
T
 
S
T
 
T
A
x
V
I
 
N
W
x
F
N
 
R
E
 
-
S
 
-
V
 
-
T
 
T
D
 
E
A
 
P
A
 
Q
G
 
E
R
 
P
A
 
Q
A
 
E
W
 
W
L
 
T
A
 
D
D
 
D
-
 
L
-
 
V
R
 
R
R
 
L
A
 
R
A
 
E
G
 
R
H
 
Y
P
 
P
V
 
W
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
E
E
 
V
A
 
D
G
 
G
R
 
E
N
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
V
L
 
A
G
 
G
Y
 
I
A
 
A
T
 
Y
F
 
A
G
 
G
D
 
P
W
 
W
R
x
K
A
 
A
W
x
R
D
 
N
G
 
A
Y
|
Y
R
 
D
H
 
W
T
 
T
V
 
A
E
 
E
H
 
S
S
x
T
V
|
V
Y
|
Y
V
|
V
H
 
S
K
 
P
D
 
R
T
 
H
R
x
Q
G
x
R
R
x
T
G
|
G
L
 
L
G
|
G
A
x
S
A
 
T
L
 
L
L
 
Y
H
 
T
A
 
H
L
 
L
I
 
L
G
 
K
R
 
S
A
 
L
R
 
E
D
 
A
M
 
Q
G
 
G
K
 
F
H
 
K
V
 
S
M
 
V
V
 
V
A
 
A
G
x
V
V
 
I
E
x
G
A
 
L
G
 
P
N
 
N
E
 
D
A
x
P
S
|
S
M
 
V
A
 
R
L
x
M
H
 
H
R
 
E
K
 
A
M
 
L
G
 
G
F
 
Y
T
 
A
E
 
P
V
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
L
R
 
R
E
 
A
V
 
A
G
 
G
C
 
F
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
N
W
 
W
L
 
H
D
 
D
L
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
W
Q
 
Q
L
 
L
T
 
D
L
 
F

5t7dA Crystal structure of streptomyces hygroscopicus bialaphos resistance (bar) protein in complex with acetyl coenzyme a (see paper)
31% identity, 93% coverage: 3:167/178 of query aligns to 3:161/173 of 5t7dA

query
sites
5t7dA
I
 
I
R
 
R
D
 
R
A
 
A
E
 
T
S
 
E
G
 
A
D
 
D
I
 
M
E
 
P
G
 
A
I
 
V
V
 
C
A
 
T
I
 
I
Y
 
V
N
 
N
D
 
H
A
x
Y
V
 
I
C
 
E
N
 
T
T
 
S
T
 
T
A
x
V
I
 
N
W
 
F
N
 
R
E
 
-
S
 
-
V
 
-
T
 
T
D
 
E
A
 
P
A
 
Q
G
 
E
R
 
P
A
 
Q
A
 
E
W
 
W
L
 
T
A
 
D
D
 
D
-
 
L
-
 
V
R
 
R
R
 
L
A
 
R
A
 
E
G
 
R
H
 
Y
P
 
P
V
 
W
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
E
E
 
V
A
 
D
G
 
G
R
 
E
N
 
-
G
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
V
 
V
L
 
A
G
 
G
Y
 
I
A
 
A
T
 
Y
F
 
A
G
 
G
D
 
P
W
 
W
R
 
K
A
 
A
W
 
R
D
 
N
G
 
A
Y
 
Y
R
 
D
H
 
W
T
 
T
V
 
A
E
 
E
H
 
S
S
x
T
V
|
V
Y
|
Y
V
|
V
H
 
S
K
 
P
D
 
R
T
 
H
R
x
Q
G
x
R
R
 
T
G
|
G
L
 
L
G
|
G
A
x
S
A
 
T
L
 
L
L
 
Y
H
 
T
A
 
H
L
 
L
I
 
L
G
 
K
R
 
S
A
 
L
R
 
E
D
 
A
M
 
Q
G
 
G
K
 
F
H
 
K
V
 
S
M
 
V
V
 
V
A
 
A
G
x
V
V
 
I
E
 
G
A
 
L
G
 
P
N
 
N
E
 
D
A
x
P
S
|
S
M
 
V
A
x
R
L
x
M
H
 
H
R
 
E
K
 
A
M
 
L
G
 
G
F
 
Y
T
 
A
E
 
P
V
 
R
G
 
G
M
 
M
L
 
L
R
 
R
E
 
A
V
 
A
G
 
G
C
 
F
K
 
K
F
 
H
G
 
G
R
 
N
W
 
W
L
 
H
D
 
D
L
 
V
A
 
G
F
 
F
L
 
W
Q
 
Q
L
 
L
T
 
D
L
 
F

Query Sequence

>8499697 FitnessBrowser__Miya:8499697
MLIRDAESGDIEGIVAIYNDAVCNTTAIWNESVTDAAGRAAWLADRRAAGHPVLVAVEAG
RNGGPVVLGYATFGDWRAWDGYRHTVEHSVYVHKDTRGRGLGAALLHALIGRARDMGKHV
MVAGVEAGNEASMALHRKMGFTEVGMLREVGCKFGRWLDLAFLQLTLDARETPPARPR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory