SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8500135 FitnessBrowser__Miya:8500135 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P16171 Mercuric reductase; Hg(II) reductase; EC 1.16.1.1 from Bacillus cereus (see paper)
32% identity, 93% coverage: 6:477/508 of query aligns to 167:610/631 of P16171

query
sites
P16171
R
 
N
H
 
Y
D
 
D
A
 
Y
D
 
D
L
 
Y
L
 
I
V
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
S
G
 
G
A
 
G
A
 
A
G
 
A
L
 
F
T
 
S
A
 
S
A
 
A
A
 
I
G
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
A
F
 
L
G
 
N
A
 
A
R
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
M
A
 
I
E
 
E
R
 
R
E
 
-
P
 
G
A
 
T
L
 
V
G
 
G
G
 
G
D
 
T
C
 
C
L
 
V
H
 
N
H
 
V
G
 
G
C
 
C
V
 
V
P
 
P
S
 
S
K
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
R
T
 
A
A
 
G
R
 
E
A
 
I
R
 
N
H
 
H
V
 
L
M
 
A
R
 
K
R
 
N
A
 
N
A
 
P
L
 
F
F
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
H
A
 
T
P
 
S
E
 
-
L
 
A
E
 
S
P
 
N
V
 
V
D
 
D
F
 
L
A
 
A
A
 
P
V
 
L
A
 
V
R
 
K
R
 
Q
I
 
K
R
 
N
E
 
D
V
 
L
Q
 
V
A
 
T
V
 
E
I
 
M
Q
 
R
R
 
N
H
 
E
D
 
K
S
x
Y
P
 
V
Q
 
N
R
 
L
F
 
I
T
 
D
G
 
D
L
 
Y
G
 
G
V
 
F
D
 
E
V
 
L
R
 
I
F
 
K
G
 
G
P
 
E
A
 
S
R
 
K
F
 
F
C
 
V
D
 
N
E
 
E
H
 
N
T
 
T
V
 
V
E
 
E
I
 
V
G
 
N
G
 
G
R
 
N
R
 
Q
V
 
I
S
 
T
A
 
A
A
 
K
R
 
R
I
 
F
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
A
S
 
S
P
 
S
Q
 
T
L
 
A
P
 
P
P
 
N
L
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
E
V
 
V
P
 
D
F
 
Y
L
 
L
T
 
T
N
 
S
R
 
T
D
 
S
I
 
L
F
 
L
S
 
E
L
 
L
D
 
K
A
 
K
L
 
V
P
 
P
A
 
N
S
 
R
L
 
L
L
 
T
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
S
G
 
G
P
 
Y
M
 
I
A
 
G
C
 
M
E
 
E
M
 
L
A
 
G
Q
 
Q
A
 
L
F
 
F
A
 
H
R
 
N
L
 
L
G
 
G
S
 
S
R
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
L
V
 
I
L
 
Q
R
 
R
G
 
S
P
 
E
R
 
R
I
 
L
L
 
L
P
 
K
R
 
E
D
 
Y
D
 
D
A
 
P
D
 
E
M
 
I
A
 
S
G
 
E
V
 
A
V
 
I
H
 
T
A
 
K
S
 
A
L
 
L
A
 
T
A
 
E
D
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
N
V
 
L
L
 
V
A
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
T
V
 
Y
K
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
E
P
 
R
V
 
V
G
 
E
A
 
Q
D
 
D
G
 
G
N
 
-
D
 
D
A
 
I
A
 
K
G
 
K
T
 
V
G
 
H
V
 
V
E
 
E
A
 
I
E
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
N
G
 
G
E
 
K
G
 
K
R
 
R
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
I
V
 
I
R
 
E
A
 
A
D
 
E
R
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
I
A
 
A
L
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
K
P
 
P
E
 
I
T
 
Q
A
 
T
G
 
S
L
 
L
D
 
N
L
 
L
A
 
H
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
E
T
 
V
G
 
G
R
 
S
H
 
R
G
 
G
G
 
E
I
 
I
T
 
V
V
 
I
D
 
D
G
 
D
R
 
Y
M
 
L
R
 
K
T
 
T
S
 
T
Q
 
N
P
 
S
H
 
R
V
 
I
F
 
Y
A
 
S
A
 
A
G
 
G
D
 
D
V
 
V
T
 
T
G
 
P
D
 
G
W
 
P
Q
 
Q
F
 
F
T
 
V
H
 
Y
A
 
V
A
 
A
G
 
A
H
 
Y
E
 
E
A
 
G
G
 
G
V
 
L
V
 
A
V
 
A
A
 
R
N
 
N
A
 
A
V
 
I
L
 
G
R
 
G
L
 
L
P
 
N
R
 
Q
R
 
K
A
 
V
D
 
N
H
 
L
A
 
E
R
 
V
M
 
V
P
 
P
W
 
G
C
 
V
T
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
S
L
 
I
A
 
A
S
 
T
V
 
V
G
 
G
C
 
L
N
 
T
E
 
E
R
 
Q
M
 
Q
A
 
A
A
 
K
E
 
E
R
 
K
G
 
G
L
 
Y
P
 
E
V
 
V
D
 
K
V
 
T
H
 
S
V
 
V
E
 
L
P
 
P
F
 
L
A
 
D
A
 
A
N
 
V
D
 
P
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
N
G
 
R
T
 
E
P
 
T
E
 
T
G
 
G
R
 
V
L
 
F
K
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
A
R
 
D
K
 
A
G
 
K
G
 
T
N
 
L
R
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
V
 
A
Q
 
H
A
 
V
V
 
V
G
 
A
P
 
E
H
 
N
A
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
L
 
I
N
 
Y
E
 
A
W
 
A
V
 
T
A
 
L
V
 
A
L
 
V
G
 
K
G
 
F
G
 
G
V
 
L
R
 
T
L
 
V
S
 
G
A
 
D
L
 
L
A
 
R
G
 
E
A
 
T
V
 
M
H
 
A
P
 
P
Y
|
Y
P
 
L
T
 
T
L
 
M
G
 
A
E
 
E

2eq7A Crystal structure of lipoamide dehydrogenase from thermus thermophilus hb8 with psbdo
35% identity, 93% coverage: 10:483/508 of query aligns to 3:445/452 of 2eq7A

query
sites
2eq7A
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
A
G
|
G
A
x
P
A
x
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
A
 
M
R
 
K
V
 
V
V
 
G
L
 
V
A
 
V
E
|
E
R
x
K
E
 
E
P
 
K
A
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
D
x
T
C
|
C
L
 
L
H
x
R
H
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
T
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
E
T
 
T
A
 
T
R
 
E
A
 
-
R
 
R
H
 
I
V
 
Y
M
 
E
R
 
A
R
 
K
A
 
K
A
 
G
L
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
A
P
 
K
A
 
V
P
 
K
E
x
G
L
x
V
E
 
E
P
 
L
V
 
D
D
 
L
F
 
P
A
 
A
A
 
L
V
 
M
A
 
A
R
 
H
R
 
K
I
 
D
R
 
K
E
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
N
I
 
T
Q
 
Q
R
 
G
H
 
V
D
 
E
S
 
F
P
 
-
Q
 
-
R
 
L
F
 
F
T
 
K
G
 
K
L
 
N
G
 
G
V
 
I
D
 
A
V
 
R
R
 
H
F
 
Q
G
 
G
P
x
T
A
|
A
R
 
R
F
 
F
C
 
L
D
 
S
E
 
E
H
 
R
T
 
K
V
 
V
-
 
L
-
 
V
E
 
E
I
 
E
G
 
T
G
 
G
R
 
E
R
 
E
V
 
L
S
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
Y
I
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
A
P
 
P
Q
 
L
L
 
I
P
 
P
P
 
P
L
x
W
P
 
A
G
 
Q
L
 
V
D
 
D
T
 
Y
V
 
E
P
 
R
F
 
V
L
 
V
T
 
T
N
x
S
R
 
T
D
 
E
I
 
A
F
 
L
S
 
S
L
 
F
D
 
P
A
 
E
L
 
V
P
 
P
A
 
K
S
 
R
L
 
L
L
 
I
V
 
V
L
 
V
G
|
G
G
 
G
G
|
G
P
x
V
M
x
I
A
 
G
C
 
L
E
|
E
M
 
L
A
 
G
Q
 
V
A
 
V
F
 
W
A
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
E
V
 
V
T
 
I
M
 
V
V
 
L
L
x
E
R
x
Y
G
 
M
P
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
T
D
 
M
D
 
D
A
 
L
D
 
E
M
 
V
A
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
S
 
S
L
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
E
G
 
R
V
 
V
R
 
F
V
 
K
L
 
K
A
 
Q
G
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
I
K
 
R
M
 
T
L
 
G
R
 
V
A
 
R
V
|
V
S
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
V
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
P
D
 
E
A
 
A
A
 
K
G
 
G
T
 
A
G
 
R
V
 
V
E
 
E
A
 
L
E
 
E
L
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
P
 
G
L
 
E
V
 
V
V
 
L
R
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
L
 
L
A
 
V
A
 
A
L
x
V
G
|
G
R
|
R
T
 
R
P
 
P
E
x
Y
T
 
T
A
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
S
T
 
T
G
 
D
R
 
E
H
 
R
G
 
G
G
 
R
I
 
I
T
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
E
R
 
H
M
 
L
R
 
R
T
 
T
S
 
R
Q
 
V
P
 
P
H
 
H
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
V
G
 
R
D
 
G
W
 
P
Q
x
M
F
x
L
T
x
A
H
|
H
A
 
K
A
 
A
G
x
S
H
 
E
E
 
E
A
 
-
G
 
G
V
 
I
V
 
A
V
 
A
A
 
V
N
 
E
A
 
H
V
 
M
L
 
V
R
 
R
L
 
G
P
 
F
R
 
G
R
 
H
A
 
V
D
 
D
H
 
Y
A
 
Q
R
 
A
M
 
I
P
 
P
W
 
S
C
x
V
T
 
V
F
x
Y
T
 
T
D
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
V
G
 
G
C
 
Y
N
 
T
E
 
E
R
 
E
M
 
E
A
 
L
A
 
K
E
 
A
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
D
 
K
V
 
V
H
 
G
V
 
K
E
 
F
P
 
P
F
 
Y
A
 
S
A
 
A
N
 
S
D
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
R
A
 
A
E
 
M
G
 
G
T
 
E
P
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
F
L
 
I
K
 
K
L
 
V
V
 
L
L
 
A
R
 
H
K
 
A
G
 
K
G
 
T
N
 
D
R
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
H
A
 
G
V
 
I
G
 
G
P
 
A
H
 
R
A
 
V
G
 
G
E
 
D
V
 
V
L
 
L
N
 
A
E
 
E
W
 
A
V
 
A
A
 
L
V
 
A
L
 
L
G
 
F
G
 
F
G
 
K
V
 
A
R
 
S
L
 
A
S
 
E
A
 
D
L
 
L
A
 
G
G
 
R
A
 
A
V
 
P
H
|
H
P
 
A
Y
x
H
P
 
P
T
 
S
L
 
L
G
 
S
E
|
E
I
 
I
S
 
L
A
 
K
R
 
E
A
 
A
A
 
A

2yquB Crystal structures and evolutionary relationship of two different lipoamide dehydrogenase(e3s) from thermus thermophilus
35% identity, 93% coverage: 10:483/508 of query aligns to 3:445/455 of 2yquB

query
sites
2yquB
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
A
x
P
A
x
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
A
 
M
R
 
K
V
 
V
V
 
G
L
 
V
A
 
V
E
|
E
R
x
K
E
 
E
P
 
K
A
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
D
x
T
C
|
C
L
 
L
H
x
R
H
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
T
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
E
T
 
T
A
 
T
R
 
E
A
 
-
R
 
R
H
 
I
V
 
Y
M
 
E
R
 
A
R
 
K
A
 
K
A
 
G
L
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
A
P
 
K
A
 
V
P
 
K
E
x
G
L
x
V
E
 
E
P
 
L
V
 
D
D
 
L
F
 
P
A
 
A
A
 
L
V
 
M
A
 
A
R
 
H
R
 
K
I
 
D
R
 
K
E
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
N
I
 
T
Q
 
Q
R
 
G
H
 
V
D
 
E
S
 
F
P
 
-
Q
 
-
R
 
L
F
 
F
T
 
K
G
 
K
L
 
N
G
 
G
V
 
I
D
 
A
V
 
R
R
 
H
F
 
Q
G
 
G
P
x
T
A
|
A
R
 
R
F
 
F
C
 
L
D
 
S
E
 
E
H
 
R
T
 
K
V
 
V
-
 
L
-
 
V
E
 
E
I
 
E
G
 
T
G
 
G
R
 
E
R
 
E
V
 
L
S
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
Y
I
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
A
P
 
P
Q
 
L
L
 
I
P
 
P
P
 
P
L
 
W
P
 
A
G
 
Q
L
 
V
D
 
D
T
 
Y
V
 
E
P
 
R
F
 
V
L
 
V
T
 
T
N
 
S
R
 
T
D
 
E
I
 
A
F
 
L
S
 
S
L
 
F
D
 
P
A
 
E
L
 
V
P
 
P
A
 
K
S
 
R
L
 
L
L
 
I
V
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
x
V
M
x
I
A
 
G
C
 
L
E
|
E
M
 
L
A
 
G
Q
 
V
A
 
V
F
 
W
A
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
E
V
 
V
T
 
I
M
 
V
V
 
L
L
 
E
R
 
Y
G
 
M
P
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
T
D
 
M
D
 
D
A
 
L
D
 
E
M
 
V
A
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
S
 
S
L
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
E
G
 
R
V
 
V
R
 
F
V
 
K
L
 
K
A
 
Q
G
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
I
K
 
R
M
 
T
L
 
G
R
 
V
A
 
R
V
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
V
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
P
D
 
E
A
 
A
A
 
K
G
 
G
T
 
A
G
 
R
V
 
V
E
 
E
A
 
L
E
 
E
L
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
P
 
G
L
 
E
V
 
V
V
 
L
R
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
L
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
R
P
 
P
E
x
Y
T
 
T
A
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
S
T
 
T
G
 
D
R
 
E
H
 
R
G
 
G
G
 
R
I
 
I
T
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
E
R
 
H
M
 
L
R
 
R
T
 
T
S
 
R
Q
 
V
P
 
P
H
 
H
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
T
 
V
G
 
R
D
 
G
W
 
P
Q
x
M
F
x
L
T
x
A
H
|
H
A
 
K
A
 
A
G
x
S
H
 
E
E
 
E
A
 
-
G
 
G
V
 
I
V
 
A
V
 
A
A
 
V
N
 
E
A
 
H
V
 
M
L
 
V
R
 
R
L
 
G
P
 
F
R
 
G
R
 
H
A
 
V
D
 
D
H
 
Y
A
 
Q
R
 
A
M
 
I
P
 
P
W
 
S
C
 
V
T
 
V
F
 
Y
T
 
T
D
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
V
G
 
G
C
 
Y
N
 
T
E
 
E
R
 
E
M
 
E
A
 
L
A
 
K
E
 
A
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
D
 
K
V
 
V
H
 
G
V
 
K
E
 
F
P
 
P
F
 
Y
A
 
S
A
 
A
N
 
S
D
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
R
A
 
A
E
 
M
G
 
G
T
 
E
P
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
F
L
 
I
K
 
K
L
 
V
V
 
L
L
 
A
R
 
H
K
 
A
G
 
K
G
 
T
N
 
D
R
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
H
A
 
G
V
 
I
G
 
G
P
 
A
H
 
R
A
 
V
G
 
G
E
 
D
V
 
V
L
 
L
N
 
A
E
 
E
W
 
A
V
 
A
A
 
L
V
 
A
L
 
L
G
 
F
G
 
F
G
 
K
V
 
A
R
x
S
L
 
A
S
 
E
A
x
D
L
 
L
A
 
G
G
 
R
A
 
A
V
 
P
H
|
H
P
 
A
Y
x
H
P
 
P
T
 
S
L
 
L
G
 
S
E
|
E
I
 
I
S
 
L
A
 
K
R
 
E
A
 
A
A
 
A

2yquA Crystal structures and evolutionary relationship of two different lipoamide dehydrogenase(e3s) from thermus thermophilus
35% identity, 93% coverage: 10:483/508 of query aligns to 3:445/455 of 2yquA

query
sites
2yquA
D
 
D
L
 
L
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
|
G
G
 
A
G
|
G
A
x
P
A
x
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
A
 
M
R
 
K
V
 
V
V
 
G
L
 
V
A
 
V
E
|
E
R
x
K
E
 
E
P
 
K
A
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
D
x
T
C
|
C
L
 
L
H
x
R
H
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
T
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
E
T
 
T
A
 
T
R
 
E
A
 
-
R
 
R
H
 
I
V
 
Y
M
 
E
R
 
A
R
 
K
A
 
K
A
 
G
L
 
L
F
 
L
G
 
G
L
 
A
P
 
K
A
 
V
P
 
K
E
x
G
L
x
V
E
 
E
P
 
L
V
 
D
D
 
L
F
 
P
A
 
A
A
 
L
V
 
M
A
 
A
R
 
H
R
 
K
I
 
D
R
 
K
E
 
V
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
N
I
 
T
Q
 
Q
R
 
G
H
 
V
D
 
E
S
 
F
P
 
-
Q
 
-
R
 
L
F
 
F
T
 
K
G
 
K
L
 
N
G
 
G
V
 
I
D
 
A
V
 
R
R
 
H
F
 
Q
G
 
G
P
x
T
A
|
A
R
 
R
F
 
F
C
 
L
D
 
S
E
 
E
H
 
R
T
 
K
V
 
V
-
 
L
-
 
V
E
 
E
I
 
E
G
 
T
G
 
G
R
 
E
R
 
E
V
 
L
S
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
Y
I
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
A
P
 
P
Q
 
L
L
 
I
P
 
P
P
 
P
L
 
W
P
 
A
G
 
Q
L
 
V
D
 
D
T
 
Y
V
 
E
P
 
R
F
 
V
L
 
V
T
 
T
N
x
S
R
 
T
D
 
E
I
 
A
F
 
L
S
 
S
L
 
F
D
 
P
A
 
E
L
 
V
P
 
P
A
 
K
S
 
R
L
 
L
L
 
I
V
 
V
L
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
x
V
M
x
I
A
 
G
C
 
L
E
|
E
M
 
L
A
 
G
Q
 
V
A
 
V
F
 
W
A
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
E
V
 
V
T
 
I
M
 
V
V
 
L
L
 
E
R
 
Y
G
 
M
P
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
T
D
 
M
D
 
D
A
 
L
D
 
E
M
 
V
A
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
H
 
-
A
 
-
S
 
S
L
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
E
G
 
R
V
 
V
R
 
F
V
 
K
L
 
K
A
 
Q
G
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
I
K
 
R
M
 
T
L
 
G
R
 
V
A
 
R
V
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
V
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
P
D
 
E
A
 
A
A
 
K
G
 
G
T
 
A
G
 
R
V
 
V
E
 
E
A
 
L
E
 
E
L
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
P
 
G
L
 
E
V
 
V
V
 
L
R
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
L
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
R
P
 
P
E
x
Y
T
 
T
A
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
S
T
 
T
G
 
D
R
 
E
H
 
R
G
 
G
G
 
R
I
 
I
T
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
E
R
 
H
M
 
L
R
 
R
T
 
T
S
 
R
Q
 
V
P
 
P
H
 
H
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
V
T
 
V
G
 
R
D
 
G
W
 
P
Q
x
M
F
x
L
T
x
A
H
 
H
A
 
K
A
 
A
G
x
S
H
 
E
E
 
E
A
 
-
G
 
G
V
 
I
V
 
A
V
 
A
A
 
V
N
 
E
A
 
H
V
 
M
L
 
V
R
 
R
L
 
G
P
 
F
R
 
G
R
 
H
A
 
V
D
 
D
H
 
Y
A
 
Q
R
 
A
M
 
I
P
 
P
W
 
S
C
 
V
T
 
V
F
 
Y
T
 
T
D
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
A
S
 
A
V
 
V
G
 
G
C
 
Y
N
 
T
E
 
E
R
 
E
M
 
E
A
 
L
A
 
K
E
 
A
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
P
 
P
V
 
Y
D
 
K
V
 
V
H
 
G
V
 
K
E
 
F
P
 
P
F
 
Y
A
 
S
A
 
A
N
 
S
D
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
R
A
 
A
E
 
M
G
 
G
T
 
E
P
 
T
E
 
E
G
 
G
R
 
F
L
 
I
K
 
K
L
 
V
V
 
L
L
 
A
R
 
H
K
 
A
G
 
K
G
 
T
N
 
D
R
 
R
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
H
A
 
G
V
 
I
G
 
G
P
 
A
H
 
R
A
 
V
G
 
G
E
 
D
V
 
V
L
 
L
N
 
A
E
 
E
W
 
A
V
 
A
A
 
L
V
 
A
L
 
L
G
 
F
G
 
F
G
 
K
V
 
A
R
 
S
L
 
A
S
 
E
A
 
D
L
 
L
A
 
G
G
 
R
A
 
A
V
 
P
H
|
H
P
 
A
Y
x
H
P
 
P
T
 
S
L
 
L
G
 
S
E
|
E
I
 
I
S
 
L
A
 
K
R
 
E
A
 
A
A
 
A

4k8dA Crystal structure of the c558(464)a/c559(465)a double mutant of tn501 mera in complex with NADPH and hg2+
34% identity, 92% coverage: 13:477/508 of query aligns to 8:445/466 of 4k8dA

query
sites
4k8dA
V
 
V
I
|
I
G
|
G
G
 
S
G
|
G
A
x
G
A
|
A
G
 
A
L
 
M
T
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
K
A
 
A
A
 
V
R
 
E
F
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
V
 
V
V
 
T
L
 
L
A
 
I
E
|
E
R
|
R
E
 
-
P
 
G
A
 
T
L
x
I
G
 
G
G
|
G
D
x
T
C
|
C
L
 
V
H
 
N
H
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
V
P
 
P
S
|
S
K
|
K
T
 
I
L
 
M
L
 
I
A
 
R
T
 
A
A
 
A
R
 
H
A
 
I
R
 
A
H
 
H
V
 
L
M
 
R
R
 
R
R
 
E
A
 
S
A
 
P
L
 
F
F
 
D
G
 
G
L
 
G
P
 
I
A
 
A
P
 
A
E
 
T
L
x
V
E
x
P
P
 
T
V
 
I
D
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
V
 
Q
A
 
Q
R
 
A
R
 
R
I
 
V
R
 
D
E
 
E
V
 
L
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
-
Q
 
-
R
 
R
H
 
H
D
 
-
S
 
-
P
 
-
Q
 
A
R
 
K
F
 
Y
T
 
E
G
 
G
L
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
P
G
 
A
V
 
I
D
 
T
V
 
V
R
 
V
F
 
H
G
 
G
P
x
E
A
|
A
R
 
R
F
 
F
C
 
K
D
 
D
E
 
D
H
 
Q
T
 
S
V
 
L
E
 
T
I
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
G
G
 
G
G
 
E
R
 
R
R
 
V
V
 
V
S
 
M
A
 
F
A
 
D
R
 
R
I
 
C
L
 
L
I
 
V
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
A
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
L
 
V
P
 
P
P
 
P
L
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
K
T
 
E
V
 
S
P
 
P
F
 
Y
L
 
W
T
 
T
N
 
S
R
 
T
D
 
E
I
 
A
F
 
L
S
 
A
L
 
S
D
 
D
A
 
T
L
 
I
P
 
P
A
 
E
S
 
R
L
 
L
L
 
A
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
x
S
G
x
S
P
x
V
M
x
V
A
 
A
C
 
L
E
|
E
M
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
S
R
 
K
V
 
V
T
 
T
M
 
V
V
 
L
L
 
A
R
|
R
G
x
N
P
 
-
R
 
T
I
 
L
L
 
F
P
 
F
R
|
R
D
 
E
D
 
D
A
 
P
D
 
A
M
 
I
A
 
G
G
 
E
V
 
A
V
 
V
H
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
F
A
 
R
A
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
E
G
 
H
A
 
T
T
 
Q
V
 
A
K
 
S
M
 
Q
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
V
S
 
A
A
 
H
I
 
M
S
 
D
G
 
G
R
 
E
F
 
F
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
V
L
 
L
E
 
T
V
 
T
P
 
T
Q
 
H
G
 
G
E
 
E
G
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
L
R
 
R
A
 
A
D
 
D
R
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
V
A
 
A
L
x
T
G
|
G
R
|
R
T
 
T
P
 
P
E
 
N
T
 
T
A
 
R
G
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
T
T
 
V
G
 
N
R
 
A
H
 
Q
G
 
G
G
 
A
I
 
I
T
 
V
V
 
I
D
 
D
G
 
Q
R
 
G
M
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
S
Q
 
N
P
 
P
H
 
N
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
C
T
 
T
G
 
D
D
 
Q
W
 
P
Q
|
Q
F
|
F
T
x
V
H
x
Y
A
 
V
A
 
A
G
x
A
H
 
A
E
 
A
A
 
G
G
 
T
V
 
R
V
 
A
V
 
A
A
 
I
N
 
N
-
 
M
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
D
A
 
A
V
 
A
L
 
L
R
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
D
H
 
L
A
 
T
R
 
A
M
 
M
P
 
P
W
 
A
C
x
V
T
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
A
 
A
S
 
T
V
 
V
G
 
G
C
 
Y
N
 
S
E
 
E
R
 
A
M
 
E
A
 
A
A
 
H
E
 
H
R
 
D
G
 
G
L
 
I
P
 
E
V
 
T
D
 
D
V
 
S
H
 
R
V
 
T
E
 
L
P
 
T
F
 
L
A
 
D
A
 
N
N
 
V
D
 
P
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
N
G
 
F
T
 
D
P
 
T
E
 
R
G
 
G
R
 
F
L
 
I
K
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
I
R
 
E
K
 
E
G
 
G
G
 
S
N
 
H
R
 
R
V
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
A
P
 
P
H
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
Q
E
 
T
W
 
A
V
 
A
A
 
L
V
 
A
L
 
I
G
 
R
G
 
N
G
 
R
V
 
M
R
 
T
L
 
V
S
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
D
A
 
Q
V
 
L
H
x
F
P
 
P
Y
|
Y
P
 
L
T
 
T
L
 
M
G
 
V
E
|
E

Sites not aligning to the query:

P00392 Mercuric reductase; Hg(II) reductase; EC 1.16.1.1 from Pseudomonas aeruginosa (see 2 papers)
34% identity, 94% coverage: 1:477/508 of query aligns to 86:540/561 of P00392

query
sites
P00392
M
 
M
A
 
A
R
 
A
T
 
A
P
 
E
R
 
K
H
 
H
D
 
S
A
 
G
D
 
N
-
 
E
-
 
P
-
 
P
-
 
V
-
 
Q
L
 
V
L
 
A
V
 
V
I
 
I
G
 
G
G
 
S
G
 
G
A
 
G
A
 
A
G
x
A
L
 
M
T
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
K
A
 
A
A
 
V
R
 
E
F
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
V
 
V
V
 
T
L
 
L
A
 
I
E
 
E
R
 
R
E
 
-
P
x
G
A
 
T
L
 
I
G
 
G
G
 
G
D
x
T
C
|
C
L
 
V
H
 
N
H
 
V
G
 
G
C
|
C
V
 
V
P
 
P
S
 
S
K
|
K
T
 
I
L
 
M
L
 
I
A
 
R
T
 
A
A
 
A
R
 
H
A
 
I
R
 
A
H
 
H
V
 
L
M
 
R
R
 
R
R
 
E
A
 
S
A
 
P
L
 
F
F
 
D
G
 
G
L
 
G
P
 
I
A
 
A
P
 
A
E
 
T
L
 
V
E
 
P
P
 
T
V
 
I
D
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
V
 
Q
A
 
Q
R
 
A
R
 
R
I
 
V
R
 
D
E
 
E
V
 
L
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
-
Q
 
-
R
 
R
H
 
H
D
 
-
S
 
-
P
 
-
Q
 
A
R
 
K
F
 
Y
T
 
E
G
 
G
L
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
P
G
 
A
V
 
I
D
 
T
V
 
V
R
 
V
F
 
H
G
 
G
P
 
E
A
|
A
R
 
R
F
 
F
C
 
K
D
 
D
E
 
D
H
 
Q
T
 
S
V
 
L
E
 
T
I
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
G
G
 
G
G
 
E
R
 
R
R
 
V
V
 
V
S
 
M
A
 
F
A
 
D
R
 
R
I
 
C
L
 
L
I
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
A
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
L
 
V
P
 
P
P
 
P
L
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
K
T
 
E
V
 
S
P
 
P
F
 
Y
L
 
W
T
 
T
N
 
S
R
 
T
D
 
E
I
 
A
F
 
L
S
 
A
L
 
S
D
 
D
A
 
T
L
 
I
P
 
P
A
 
E
S
 
R
L
 
L
L
 
A
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
S
G
 
S
P
 
V
M
 
V
A
 
A
C
 
L
E
 
E
M
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
S
R
 
K
V
 
V
T
 
T
M
 
V
V
 
L
L
 
A
R
 
R
G
 
N
P
 
-
R
 
T
I
 
L
L
 
F
P
 
F
R
 
R
D
 
E
D
 
D
A
 
P
D
 
A
M
 
I
A
 
G
G
 
E
V
 
A
V
 
V
H
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
F
A
 
R
A
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
E
G
 
H
A
 
T
T
 
Q
V
 
A
K
 
S
M
 
Q
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
V
S
 
A
A
 
H
I
 
M
S
 
D
G
 
G
R
 
E
F
 
F
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
V
L
 
L
E
 
T
V
 
T
P
 
T
Q
 
H
G
 
G
E
 
E
G
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
L
R
 
R
A
 
A
D
 
D
R
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
T
P
 
P
E
 
N
T
 
T
A
 
R
G
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
T
T
 
V
G
 
N
R
 
A
H
 
Q
G
 
G
G
 
A
I
 
I
T
 
V
V
 
I
D
 
D
G
 
Q
R
 
G
M
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
S
Q
 
N
P
 
P
H
 
N
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
 
G
D
|
D
V
 
C
T
 
T
G
 
D
D
 
Q
W
 
P
Q
 
Q
F
 
F
T
x
V
H
 
Y
A
 
V
A
 
A
G
 
A
H
 
A
E
 
A
A
 
G
G
 
T
V
 
R
V
 
A
V
 
A
A
 
I
N
 
N
-
 
M
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
D
A
 
A
V
 
A
L
 
L
R
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
D
H
 
L
A
 
T
R
 
A
M
 
M
P
 
P
W
 
A
C
 
V
T
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
A
 
A
S
 
T
V
 
V
G
 
G
C
 
Y
N
 
S
E
 
E
R
 
A
M
 
E
A
 
A
A
 
H
E
 
H
R
 
D
G
 
G
L
 
I
P
 
E
V
 
T
D
 
D
V
 
S
H
 
R
V
 
T
E
 
L
P
 
T
F
 
L
A
 
D
A
 
N
N
 
V
D
 
P
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
N
G
 
F
T
 
D
P
 
T
E
 
R
G
 
G
R
 
F
L
 
I
K
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
I
R
 
E
K
 
E
G
 
G
G
 
S
N
 
H
R
 
R
V
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
A
P
 
P
H
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
Q
E
 
T
W
 
A
V
 
A
A
 
L
V
 
A
L
 
I
G
 
R
G
 
N
G
 
R
V
 
M
R
 
T
L
 
V
S
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
D
A
 
Q
V
 
L
H
 
F
P
 
P
Y
 
Y
P
 
L
T
 
T
L
 
M
G
 
V
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P11959 Dihydrolipoyl dehydrogenase; Dihydrolipoamide dehydrogenase; E3 component of pyruvate complex; EC 1.8.1.4 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
32% identity, 94% coverage: 8:483/508 of query aligns to 9:457/470 of P11959

query
sites
P11959
D
 
E
A
 
T
D
 
E
L
 
T
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
G
 
A
G
 
G
A
 
P
A
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
A
 
Q
R
 
K
V
 
V
V
 
T
L
 
I
A
 
V
E
|
E
R
x
K
E
 
-
P
x
G
A
x
N
L
|
L
G
|
G
G
|
G
D
x
V
C
|
C
L
 
L
H
 
N
H
 
V
G
 
G
C
 
C
V
 
I
P
 
P
S
 
S
K
|
K
T
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
S
T
 
A
A
 
S
R
 
H
A
 
R
R
 
Y
H
 
E
V
 
Q
M
 
A
R
 
K
R
 
H
A
 
S
A
 
E
L
 
E
F
 
M
G
 
G
L
 
I
P
 
K
A
 
A
P
 
E
E
 
N
L
 
V
E
 
-
P
 
T
V
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
A
A
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
K
I
 
V
R
 
Q
E
 
E
V
 
W
Q
 
K
A
 
A
V
 
S
I
 
V
Q
 
V
R
 
K
H
 
K
D
 
L
S
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
V
P
 
E
Q
 
G
R
 
L
F
 
L
T
 
K
G
 
G
L
 
N
G
 
K
V
 
V
D
 
E
V
 
I
R
 
V
F
 
K
G
 
G
P
 
E
A
 
A
R
 
Y
F
 
F
C
 
V
D
 
D
E
 
A
H
 
N
T
 
T
V
 
V
E
 
R
I
 
V
-
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
D
G
 
S
G
 
A
R
 
Q
R
 
T
V
 
Y
S
 
T
A
 
F
A
 
K
R
 
N
I
 
A
L
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
R
P
 
P
-
 
I
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
P
 
N
L
 
F
P
 
K
G
 
F
L
 
S
D
 
N
T
 
R
V
 
I
P
 
-
F
 
-
L
 
L
T
 
D
N
 
S
R
 
T
D
 
G
I
 
A
F
 
L
S
 
N
L
 
L
D
 
G
A
 
E
L
 
V
P
 
P
A
 
K
S
 
S
L
 
L
L
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
Y
M
 
I
A
 
G
C
 
I
E
 
E
M
 
L
A
 
G
Q
 
T
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
R
 
N
L
 
F
G
 
G
S
 
T
R
 
K
V
 
V
T
 
T
M
 
I
V
 
L
L
 
E
R
 
G
G
 
A
P
 
G
R
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
S
R
 
G
D
 
F
D
 
E
A
 
K
D
 
Q
M
 
M
A
 
A
G
 
A
V
 
I
V
 
I
H
 
K
A
 
K
S
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
K
D
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
E
V
 
V
L
 
V
A
 
T
G
 
N
A
 
A
T
 
L
V
 
A
K
 
K
M
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
G
N
 
A
D
 
E
A
 
E
A
 
R
G
 
E
T
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
T
A
 
V
E
 
T
L
 
Y
E
 
E
V
 
-
P
 
A
Q
 
N
G
 
G
E
 
E
G
 
T
R
 
K
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
T
V
 
I
R
 
D
A
 
A
D
 
D
R
 
Y
L
 
V
L
 
L
A
 
V
A
 
T
L
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
R
P
 
P
E
 
N
T
 
T
A
 
D
G
 
E
L
 
L
D
 
G
L
 
L
A
 
E
A
 
Q
A
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
K
T
 
M
G
 
T
R
 
N
H
 
R
G
 
G
G
 
L
I
 
I
T
 
E
V
 
V
D
 
D
G
 
Q
R
 
Q
M
 
C
R
 
R
T
 
T
S
 
S
Q
 
V
P
 
P
H
 
N
V
 
I
F
 
F
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
I
T
 
V
G
 
P
D
 
G
W
 
P
Q
 
A
F
 
L
T
x
A
H
 
H
A
 
K
A
 
A
G
 
S
H
 
Y
E
 
E
A
 
-
G
 
G
V
 
K
V
 
V
V
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
A
V
 
I
L
 
A
R
 
G
L
 
H
P
 
P
R
 
S
R
 
A
A
 
V
D
 
D
H
 
Y
A
 
V
R
 
A
M
 
I
P
 
P
W
 
A
C
 
V
T
 
V
F
 
F
T
 
S
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
G
C
 
Y
N
 
F
E
 
E
R
 
Q
M
 
Q
A
 
A
A
 
K
E
 
D
R
 
E
G
 
G
L
 
I
P
 
D
V
 
V
D
 
I
V
 
A
H
 
A
V
 
K
E
 
F
P
 
P
F
 
F
A
 
A
A
 
A
N
 
N
D
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
L
G
 
N
T
 
D
P
 
T
E
 
D
G
 
G
R
 
F
L
 
L
K
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
E
G
 
D
N
 
G
R
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
A
 
I
V
 
I
G
 
G
P
 
P
H
 
N
A
 
A
G
 
S
E
 
D
V
 
M
L
 
I
N
 
A
E
 
E
W
 
L
V
 
G
A
 
L
V
 
A
L
 
I
G
 
E
G
 
A
G
 
G
V
 
M
R
 
T
L
 
A
S
 
E
A
 
D
L
 
I
A
 
A
G
 
L
A
 
T
V
 
I
H
 
H
P
 
A
Y
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
L
G
 
G
E
 
E
I
 
I
S
 
A
A
 
M
R
 
E
A
 
A
A
 
A

1ebdA Dihydrolipoamide dehydrogenase complexed with the binding domain of the dihydrolipoamide acetylase (see paper)
32% identity, 94% coverage: 8:483/508 of query aligns to 3:451/455 of 1ebdA

query
sites
1ebdA
D
 
E
A
 
T
D
 
E
L
 
T
L
 
L
V
 
V
I
 
V
G
|
G
G
 
A
G
|
G
A
x
P
A
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
A
 
Q
R
 
K
V
 
V
V
 
T
L
 
I
A
x
V
E
|
E
R
x
K
E
 
-
P
 
G
A
 
N
L
|
L
G
 
G
G
|
G
D
x
V
C
|
C
L
 
L
H
 
N
H
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
T
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
S
T
 
A
A
 
S
R
 
H
A
 
R
R
 
Y
H
 
E
V
 
Q
M
 
A
R
 
K
R
 
H
A
 
S
A
 
E
L
 
E
F
 
M
G
 
G
L
 
I
P
 
K
A
 
A
P
 
E
E
x
N
L
x
V
E
 
-
P
 
T
V
 
I
D
 
D
F
 
F
A
 
A
A
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
K
I
 
V
R
 
Q
E
 
E
V
 
W
Q
 
K
A
 
A
V
 
S
I
 
V
Q
 
V
R
 
K
H
 
K
D
 
L
S
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
V
P
 
E
Q
 
G
R
 
L
F
 
L
T
 
K
G
 
G
L
 
N
G
 
K
V
 
V
D
 
E
V
 
I
R
 
V
F
 
K
G
 
G
P
x
E
A
|
A
R
 
Y
F
 
F
C
 
V
D
 
D
E
 
A
H
 
N
T
 
T
V
 
V
E
 
R
I
 
V
-
 
V
-
 
N
-
 
G
-
 
D
G
 
S
G
 
A
R
 
Q
R
 
T
V
 
Y
S
 
T
A
 
F
A
 
K
R
 
N
I
 
A
L
 
I
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
R
P
 
P
-
 
I
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
P
 
N
L
 
F
P
 
K
G
 
F
L
 
S
D
 
N
T
 
R
V
 
I
P
 
-
F
 
-
L
 
L
T
 
D
N
 
S
R
 
T
D
 
G
I
 
A
F
 
L
S
 
N
L
 
L
D
 
G
A
 
E
L
 
V
P
 
P
A
 
K
S
 
S
L
 
L
L
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
x
Y
M
x
I
A
 
G
C
 
I
E
|
E
M
 
L
A
 
G
Q
 
T
A
 
A
F
 
Y
A
 
A
R
 
N
L
 
F
G
 
G
S
 
T
R
 
K
V
 
V
T
 
T
M
 
I
V
 
L
L
 
E
R
 
G
G
 
A
P
 
G
R
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
S
R
 
G
D
 
F
D
 
E
A
 
K
D
 
Q
M
 
M
A
 
A
G
 
A
V
 
I
V
 
I
H
 
K
A
 
K
S
 
R
L
 
L
A
 
K
A
 
K
D
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
E
V
 
V
L
 
V
A
 
T
G
 
N
A
 
A
T
 
L
V
 
A
K
 
K
M
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
G
N
 
A
D
 
E
A
 
E
A
 
R
G
 
E
T
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
T
A
 
V
E
 
T
L
 
Y
E
 
E
V
 
-
P
 
A
Q
 
N
G
 
G
E
 
E
G
 
T
R
 
K
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
T
V
 
I
R
 
D
A
 
A
D
 
D
R
 
Y
L
 
V
L
 
L
A
 
V
A
 
T
L
 
V
G
 
G
R
|
R
T
 
R
P
 
P
E
 
N
T
 
T
A
 
D
G
 
E
L
 
L
D
 
G
L
 
L
A
 
E
A
 
Q
A
 
I
G
 
G
V
 
I
A
 
K
T
 
M
G
 
T
R
 
N
H
 
R
G
 
G
G
 
L
I
 
I
T
 
E
V
 
V
D
 
D
G
 
Q
R
 
Q
M
 
C
R
 
R
T
 
T
S
 
S
Q
 
V
P
 
P
H
 
N
V
 
I
F
 
F
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
I
T
 
V
G
 
P
D
 
G
W
 
P
Q
x
A
F
x
L
T
x
A
H
 
H
A
 
K
A
 
A
G
x
S
H
 
Y
E
 
E
A
 
-
G
 
G
V
 
K
V
 
V
V
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
A
V
 
I
L
 
A
R
 
G
L
 
H
P
 
P
R
 
S
R
 
A
A
 
V
D
 
D
H
 
Y
A
 
V
R
 
A
M
 
I
P
 
P
W
 
A
C
 
V
T
 
V
F
 
F
T
 
S
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
C
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
G
C
 
Y
N
 
F
E
 
E
R
 
Q
M
 
Q
A
 
A
A
 
K
E
 
D
R
 
E
G
 
G
L
 
I
P
 
D
V
 
V
D
 
I
V
 
A
H
 
A
V
 
K
E
 
F
P
 
P
F
 
F
A
 
A
A
 
A
N
 
N
D
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
L
G
 
N
T
 
D
P
 
T
E
 
D
G
 
G
R
 
F
L
 
L
K
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
V
R
 
R
K
 
K
G
 
E
G
 
D
N
 
G
R
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
V
 
A
Q
 
Q
A
 
I
V
 
I
G
 
G
P
 
P
H
 
N
A
 
A
G
 
S
E
 
D
V
 
M
L
 
I
N
 
A
E
 
E
W
 
L
V
 
G
A
 
L
V
 
A
L
 
I
G
 
E
G
 
A
G
 
G
V
 
M
R
 
T
L
 
A
S
 
E
A
 
D
L
 
I
A
 
A
G
 
L
A
 
T
V
 
I
H
|
H
P
 
A
Y
x
H
P
 
P
T
 
T
L
 
L
G
 
G
E
|
E
I
 
I
S
 
A
A
 
M
R
 
E
A
 
A
A
 
A

4k7zA Crystal structure of the c136(42)a/c141(47)a double mutant of tn501 mera in complex with NADP and hg2+
34% identity, 92% coverage: 13:477/508 of query aligns to 9:446/467 of 4k7zA

query
sites
4k7zA
V
 
V
I
|
I
G
|
G
G
 
S
G
|
G
A
x
G
A
|
A
G
 
A
L
 
M
T
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
K
A
 
A
A
 
V
R
 
E
F
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
Q
V
 
V
V
 
T
L
 
L
A
 
I
E
|
E
R
|
R
E
 
-
P
 
G
A
 
T
L
x
I
G
 
G
G
|
G
D
x
T
C
x
A
L
 
V
H
 
N
H
 
V
G
|
G
C
x
A
V
 
V
P
 
P
S
|
S
K
|
K
T
 
I
L
 
M
L
 
I
A
 
R
T
 
A
A
 
A
R
 
H
A
 
I
R
 
A
H
 
H
V
 
L
M
 
R
R
 
R
R
 
E
A
 
S
A
 
P
L
 
F
F
 
D
G
 
G
L
 
G
P
 
I
A
 
A
P
 
A
E
 
T
L
x
V
E
x
P
P
 
T
V
 
I
D
 
D
-
 
R
-
 
S
-
 
K
-
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
Q
V
 
Q
A
 
Q
R
 
A
R
 
R
I
 
V
R
 
D
E
 
E
V
 
L
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
-
Q
 
-
R
 
R
H
 
H
D
 
-
S
 
-
P
 
-
Q
 
A
R
 
K
F
 
Y
T
 
E
G
 
G
L
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
P
G
 
A
V
 
I
D
 
T
V
 
V
R
 
V
F
 
H
G
 
G
P
x
E
A
|
A
R
 
R
F
 
F
C
 
K
D
 
D
E
 
D
H
 
Q
T
 
S
V
 
L
E
 
T
I
 
V
-
 
R
-
 
L
-
 
N
-
 
E
-
 
G
G
 
G
G
 
E
R
 
R
R
 
V
V
 
V
S
 
M
A
 
F
A
 
D
R
 
R
I
 
C
L
 
L
I
 
V
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
A
S
 
S
P
 
P
Q
 
A
L
 
V
P
 
P
P
 
P
L
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
K
T
 
E
V
 
S
P
 
P
F
 
Y
L
 
W
T
 
T
N
 
S
R
 
T
D
 
E
I
 
A
F
 
L
S
 
A
L
 
S
D
 
D
A
 
T
L
 
I
P
 
P
A
 
E
S
 
R
L
 
L
L
 
A
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
x
S
G
x
S
P
x
V
M
x
V
A
 
A
C
 
L
E
|
E
M
 
L
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
S
R
 
K
V
 
V
T
 
T
M
 
V
V
 
L
L
 
A
R
|
R
G
x
N
P
 
-
R
 
T
I
 
L
L
 
F
P
 
F
R
|
R
D
 
E
D
 
D
A
 
P
D
 
A
M
 
I
A
 
G
G
 
E
V
 
A
V
 
V
H
 
T
A
 
A
S
 
A
L
 
F
A
 
R
A
 
A
D
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
E
G
 
H
A
 
T
T
 
Q
V
 
A
K
 
S
M
 
Q
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
V
S
 
A
A
 
H
I
 
M
S
 
D
G
 
G
R
 
E
F
 
F
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
V
L
 
L
E
 
T
V
 
T
P
 
T
Q
 
H
G
 
G
E
 
E
G
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
L
R
 
R
A
 
A
D
 
D
R
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
V
A
 
A
L
x
T
G
|
G
R
|
R
T
 
T
P
 
P
E
 
N
T
 
T
A
 
R
G
 
S
L
 
L
D
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
T
T
 
V
G
 
N
R
 
A
H
 
Q
G
 
G
G
 
A
I
 
I
T
 
V
V
 
I
D
 
D
G
 
Q
R
 
G
M
 
M
R
 
R
T
 
T
S
 
S
Q
 
N
P
 
P
H
 
N
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
C
T
 
T
G
 
D
D
 
Q
W
 
P
Q
|
Q
F
|
F
T
x
V
H
x
Y
A
 
V
A
 
A
G
x
A
H
 
A
E
 
A
A
 
G
G
 
T
V
 
R
V
 
A
V
 
A
A
 
I
N
 
N
-
 
M
-
 
T
-
 
G
-
 
G
-
 
D
A
 
A
V
 
A
L
 
L
R
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
D
H
 
L
A
 
T
R
 
A
M
 
M
P
 
P
W
 
A
C
x
V
T
 
V
F
 
F
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
V
A
 
A
S
 
T
V
 
V
G
 
G
C
 
Y
N
 
S
E
 
E
R
 
A
M
 
E
A
 
A
A
 
H
E
 
H
R
 
D
G
 
G
L
 
I
P
 
E
V
 
T
D
 
D
V
 
S
H
 
R
V
 
T
E
 
L
P
 
T
F
 
L
A
 
D
A
 
N
N
 
V
D
 
P
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
N
G
 
F
T
 
D
P
 
T
E
 
R
G
 
G
R
 
F
L
 
I
K
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
I
R
 
E
K
 
E
G
 
G
G
 
S
N
 
H
R
 
R
V
 
L
L
 
I
G
 
G
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
A
P
 
P
H
 
E
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
Q
E
 
T
W
 
A
V
 
A
A
 
L
V
 
A
L
 
I
G
 
R
G
 
N
G
 
R
V
 
M
R
 
T
L
 
V
S
 
Q
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
D
A
 
Q
V
 
L
H
x
F
P
 
P
Y
|
Y
P
 
L
T
 
T
L
 
M
G
 
V
E
|
E

Sites not aligning to the query:

4ywoA Mercuric reductase from metallosphaera sedula (see paper)
32% identity, 94% coverage: 2:477/508 of query aligns to 1:432/444 of 4ywoA

query
sites
4ywoA
A
 
S
R
 
Q
T
 
D
P
 
P
R
 
M
H
 
H
D
 
K
A
 
-
D
 
-
L
 
L
L
 
A
V
 
I
I
 
I
G
|
G
G
 
Y
G
|
G
A
|
A
A
 
A
G
 
G
L
 
F
T
 
A
A
 
A
A
 
M
A
 
I
G
 
K
A
 
A
A
 
N
R
 
E
F
 
L
G
 
G
A
 
V
R
 
K
V
 
P
V
 
V
L
 
L
A
 
I
E
 
G
R
x
K
E
 
-
P
 
G
A
 
E
L
x
I
G
 
G
G
|
G
D
x
T
C
|
C
L
 
V
H
 
N
H
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
V
P
 
P
S
|
S
K
|
K
T
 
R
L
 
M
L
 
L
A
 
Y
T
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
I
R
 
Y
H
 
K
V
 
K
M
 
A
R
 
R
R
 
E
A
 
-
A
 
-
L
 
-
F
 
-
G
 
-
L
 
V
P
 
T
A
 
G
P
 
S
E
 
E
L
 
V
E
 
Y
P
 
P
V
 
-
D
 
P
F
 
F
A
 
S
A
 
S
V
 
F
A
 
Q
R
 
E
R
 
K
I
 
D
R
 
G
E
 
L
V
 
V
Q
 
Q
A
 
E
V
 
-
I
 
M
Q
 
R
R
 
K
H
 
T
D
 
K
S
 
Y
P
 
E
Q
 
D
R
 
L
F
 
L
T
 
S
G
 
Y
L
 
Y
G
 
D
V
 
V
D
 
E
V
 
L
R
 
I
F
 
Q
G
 
G
P
 
E
A
|
A
R
 
R
F
 
F
C
 
I
D
 
S
E
 
P
H
 
H
T
 
A
V
 
V
E
 
K
I
 
V
G
 
N
G
 
G
R
 
Q
R
 
V
V
 
I
S
 
E
A
 
A
A
 
E
R
 
K
I
 
F
L
 
V
I
 
I
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
S
P
 
P
Q
 
L
L
 
I
P
 
P
P
 
R
L
 
I
P
 
P
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
K
V
 
V
P
 
G
F
 
F
L
 
W
T
 
T
N
|
N
R
 
R
D
 
E
I
 
A
F
 
L
S
 
S
L
 
P
D
 
D
A
 
R
L
 
R
P
 
I
A
 
D
S
 
S
L
 
L
L
 
A
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
R
P
x
A
M
x
L
A
 
A
C
 
L
E
|
E
M
 
F
A
 
A
Q
 
Q
A
 
M
F
 
Y
A
 
S
R
 
R
L
 
M
G
 
K
S
 
V
R
 
E
V
 
V
T
 
A
M
 
I
V
 
L
L
 
Q
R
 
R
G
 
S
P
 
P
R
 
V
I
 
L
L
 
I
P
 
P
R
 
D
D
 
W
D
 
E
A
 
P
D
 
E
M
 
A
A
 
S
G
 
V
V
 
E
V
 
A
H
 
R
A
 
R
S
 
I
L
 
M
A
 
E
A
 
N
D
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
T
G
 
G
A
 
V
T
 
N
V
 
V
K
 
K
M
 
E
L
 
V
R
 
R
A
 
K
V
 
-
S
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
G
P
 
A
G
 
G
E
 
K
P
 
I
V
 
V
G
 
I
A
 
T
D
 
D
G
 
-
N
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
G
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
V
R
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
E
L
 
I
L
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
T
G
 
G
R
 
R
T
 
K
P
 
P
E
 
-
T
 
N
A
 
V
G
 
D
L
|
L
D
 
G
L
 
L
A
 
E
A
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
R
T
 
L
G
 
N
R
 
E
H
 
R
G
 
G
G
 
G
I
 
I
T
 
K
V
 
V
D
 
D
G
 
D
R
 
E
M
 
L
R
 
R
T
 
T
S
 
D
Q
 
N
P
 
P
H
 
H
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
G
|
G
D
|
D
V
 
V
T
 
L
G
 
G
D
 
G
W
 
K
Q
x
M
F
x
L
T
x
E
H
 
A
A
 
L
A
|
A
G
|
G
H
 
R
E
 
Q
A
 
G
G
 
S
V
 
I
V
 
A
V
 
T
A
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
L
L
 
T
R
 
G
L
 
S
P
 
H
R
 
K
R
 
R
A
 
V
D
 
D
H
 
E
A
 
N
R
 
A
M
 
V
P
 
P
W
 
Q
C
 
V
T
 
I
F
 
F
T
 
T
D
 
Q
P
 
P
E
 
N
L
 
L
A
 
A
S
 
R
V
 
V
G
 
G
C
 
L
N
 
T
E
 
E
R
 
A
M
 
E
A
 
A
A
 
R
E
 
A
R
 
K
G
 
E
L
 
G
P
 
E
V
 
V
D
 
E
V
 
A
H
 
R
V
 
V
E
 
L
P
 
P
F
 
M
A
 
S
A
 
S
N
 
V
D
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
E
A
 
I
E
 
I
G
 
N
T
 
S
P
 
R
E
 
L
G
 
G
R
 
F
L
 
V
K
 
K
L
 
M
V
 
V
L
 
T
R
 
M
K
 
N
G
 
G
G
 
-
N
 
-
R
 
R
V
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
H
A
 
A
V
 
V
G
 
G
P
 
E
H
 
N
A
 
V
G
 
A
E
 
E
V
 
M
L
 
I
N
 
G
E
 
E
W
 
A
V
 
A
A
 
L
V
 
A
L
 
I
G
 
R
G
 
F
G
 
G
V
 
A
R
 
T
L
 
V
S
 
H
A
 
D
L
 
L
A
 
I
G
 
D
A
 
T
V
 
V
H
|
H
P
 
M
Y
x
F
P
 
P
T
 
T
L
 
I
G
 
A
E
|
E

3o0hB Crystal structure of glutathione reductase from bartonella henselae
30% identity, 93% coverage: 8:477/508 of query aligns to 3:440/459 of 3o0hB

query
sites
3o0hB
D
 
D
A
 
F
D
 
D
L
 
L
L
 
F
V
 
V
I
|
I
G
|
G
G
 
S
G
|
G
A
x
S
A
x
G
G
 
G
L
 
V
T
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
L
A
 
A
A
 
G
R
 
A
F
 
L
G
 
G
A
 
K
R
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
I
A
|
A
E
|
E
R
 
-
E
|
E
P
 
Y
A
 
R
L
x
I
G
 
G
G
 
G
D
x
T
C
|
C
L
 
V
H
 
I
H
 
R
G
|
G
C
|
C
V
 
V
P
 
P
S
x
K
K
 
K
T
 
L
L
 
Y
L
 
F
A
 
Y
T
 
A
A
 
S
R
 
Q
A
 
Y
R
 
A
H
 
Q
V
 
E
M
 
F
R
 
S
R
 
K
A
 
S
A
 
I
L
 
G
F
 
F
G
 
G
L
 
W
-
 
K
-
 
Y
-
 
A
-
x
D
P
|
P
A
 
I
P
 
F
E
 
N
L
 
W
E
 
E
P
 
K
V
 
L
D
 
-
F
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
K
A
 
N
R
 
K
R
 
E
I
 
I
R
 
S
E
 
R
V
 
L
Q
 
E
A
 
G
V
 
L
I
 
Y
Q
 
R
R
 
-
H
 
-
D
 
-
S
 
-
P
 
-
Q
 
E
R
 
G
F
 
L
T
 
Q
G
 
N
L
 
S
G
 
N
V
 
V
D
 
H
V
 
I
R
 
Y
F
 
E
G
 
S
P
x
R
A
|
A
R
 
V
F
 
F
C
 
V
D
 
D
E
 
E
H
 
H
T
 
T
V
 
L
E
 
E
I
 
L
G
 
S
-
 
V
-
 
T
G
 
G
R
 
E
R
 
R
V
 
I
S
 
S
A
 
A
A
 
E
R
 
K
I
 
I
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
A
S
 
K
P
 
I
Q
 
V
L
 
S
P
 
N
P
 
S
L
 
I
P
 
K
G
 
G
L
 
S
D
 
D
T
 
L
V
 
C
P
 
-
F
 
-
L
 
L
T
 
T
N
 
S
R
 
N
D
 
E
I
 
I
F
 
F
S
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
P
A
 
K
S
 
S
L
 
I
L
 
V
V
 
I
L
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
x
Y
M
 
I
A
 
G
C
 
V
E
|
E
M
 
F
A
 
A
Q
 
N
A
 
I
F
 
F
A
 
H
R
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
V
R
 
K
V
 
T
T
 
T
M
 
L
V
 
L
L
 
H
R
 
R
G
 
G
P
 
D
R
 
L
I
 
I
L
 
L
P
 
R
R
 
N
D
 
F
D
 
D
A
 
Y
D
 
D
M
 
L
A
 
R
G
 
Q
V
 
L
V
 
L
H
 
N
A
 
D
S
 
A
L
 
M
A
 
V
A
 
A
D
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
S
V
 
I
L
 
I
A
 
Y
G
 
E
A
 
A
T
 
T
V
 
V
K
 
S
M
 
Q
L
 
V
R
 
Q
A
 
S
V
 
T
S
 
E
A
 
N
I
 
C
S
 
Y
G
 
N
R
 
V
F
 
V
G
 
L
K
 
T
P
 
N
G
 
G
E
 
Q
P
 
T
V
 
I
G
 
C
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
L
 
M
A
 
L
A
 
A
L
 
T
G
 
G
R
|
R
T
 
V
P
 
P
E
x
N
T
 
T
A
 
T
G
 
G
L
 
L
D
 
G
L
 
L
A
 
E
A
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
K
T
 
V
G
 
N
R
 
E
H
 
F
G
 
G
G
 
A
I
 
V
T
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
E
R
 
K
M
 
M
R
 
T
T
 
T
S
 
N
Q
 
V
P
 
S
H
 
H
V
 
I
F
 
W
A
 
A
A
 
V
G
|
G
D
|
D
V
 
V
T
 
T
G
 
G
D
 
H
W
 
I
Q
|
Q
F
x
L
T
|
T
H
 
P
A
 
V
A
 
A
G
x
I
H
 
H
E
 
D
A
 
A
G
 
M
V
 
C
V
 
F
V
 
V
A
 
K
N
 
N
A
 
A
V
 
F
L
 
E
R
 
N
L
 
T
P
 
S
R
 
T
R
 
T
A
 
P
D
 
D
H
 
Y
A
 
D
R
 
L
M
 
I
P
 
T
W
 
T
C
 
A
T
 
V
F
 
F
T
 
S
D
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
G
S
 
T
V
 
V
G
 
G
C
 
L
N
 
S
E
 
E
R
 
E
M
 
D
A
 
A
A
 
L
E
 
H
R
 
R
G
 
Y
L
 
K
P
 
R
V
 
V
D
 
E
V
 
I
H
 
Y
V
 
R
E
 
T
P
 
V
F
 
F
A
 
R
A
 
P
N
 
M
D
 
-
R
 
R
A
 
N
L
 
V
A
 
L
E
 
S
G
 
G
T
 
S
P
 
P
E
 
E
G
 
K
R
 
M
-
 
F
L
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
V
R
 
D
K
 
G
G
 
E
G
 
S
N
 
R
R
 
I
V
 
V
L
 
V
G
 
G
V
 
A
Q
 
H
A
 
V
V
 
L
G
 
G
P
 
E
H
 
N
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
I
L
 
A
N
 
Q
E
 
L
W
 
I
V
 
G
A
 
I
V
 
S
L
 
L
G
 
K
G
 
G
G
 
K
V
 
L
R
 
T
L
 
K
S
 
D
A
 
I
L
 
F
A
 
D
G
 
K
A
 
T
V
 
M
H
x
A
P
 
V
Y
x
H
P
 
P
T
 
T
L
 
M
G
 
S
E
|
E

Sites not aligning to the query:

2eq6A Crystal structure of lipoamide dehydrogenase from thermus thermophilus hb8
36% identity, 93% coverage: 10:483/508 of query aligns to 5:448/460 of 2eq6A

query
sites
2eq6A
D
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
V
I
|
I
G
|
G
G
 
T
G
|
G
A
x
P
A
x
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
H
A
 
A
A
 
A
A
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
A
 
L
R
 
K
V
 
V
V
 
-
L
 
L
A
 
A
E
 
V
R
x
E
E
x
A
P
 
G
A
 
E
L
x
V
G
 
G
G
|
G
D
x
V
C
|
C
L
 
L
H
 
N
H
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
x
T
K
|
K
T
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
H
T
 
A
A
 
A
R
 
E
A
 
T
R
 
L
H
 
H
V
 
H
M
 
L
R
 
K
R
 
V
A
 
A
A
 
E
L
 
G
F
 
F
G
 
G
L
 
L
P
 
K
A
 
A
-
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
L
E
 
D
P
 
L
V
 
K
D
 
K
F
 
L
A
 
G
A
 
G
V
 
-
A
 
-
R
 
W
R
 
R
I
 
D
R
 
Q
E
 
V
V
 
V
Q
 
K
A
 
K
V
 
L
I
 
T
Q
 
G
R
 
G
H
 
V
D
 
G
S
 
T
P
 
-
Q
 
-
R
 
L
F
 
L
T
 
K
G
 
G
L
 
N
G
 
G
V
 
V
D
 
E
V
 
L
R
 
L
F
 
R
G
 
G
P
x
F
A
|
A
R
 
R
F
 
L
C
 
V
D
 
G
E
 
P
H
 
K
T
 
E
V
 
V
E
 
E
I
 
V
G
 
G
G
 
G
R
 
E
R
 
R
V
 
Y
S
 
G
A
 
A
A
 
K
R
 
S
I
 
L
L
 
I
I
 
L
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
E
P
 
P
-
 
L
Q
 
E
L
 
L
P
 
K
P
 
G
L
 
F
P
 
P
G
 
F
L
 
G
D
 
E
T
 
D
V
 
V
P
 
-
F
 
W
L
 
D
T
x
S
N
 
T
R
 
R
D
 
A
I
 
L
F
 
K
S
 
V
L
 
E
D
 
E
A
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
K
S
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
x
A
M
 
V
A
 
G
C
 
L
E
|
E
M
 
L
A
 
G
Q
 
Q
A
 
V
F
 
Y
A
 
R
R
 
R
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
L
V
 
I
L
 
E
R
 
Y
G
 
M
P
 
P
R
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
Q
D
 
G
D
 
D
A
 
P
D
 
E
M
 
T
A
 
A
G
 
A
V
 
L
V
 
L
H
 
R
A
 
R
S
 
A
L
 
L
A
 
E
A
 
K
D
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
V
L
 
R
A
 
T
G
 
K
A
 
T
T
 
K
V
 
-
K
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
A
D
 
V
G
 
G
N
 
Y
D
 
E
A
 
K
A
 
K
G
 
K
T
 
D
G
 
G
V
 
L
E
 
H
A
 
V
E
 
R
L
 
L
E
 
E
V
 
-
P
 
-
Q
 
P
G
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
G
G
 
E
P
 
G
L
 
E
V
 
E
V
 
V
R
 
V
A
 
V
D
 
D
R
 
K
L
 
V
L
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
K
P
 
P
E
x
R
T
 
T
A
 
E
G
 
G
L
 
L
D
 
G
L
 
L
A
 
E
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
K
T
 
V
G
 
D
R
 
E
H
 
R
G
 
G
G
 
F
I
 
I
T
 
R
V
 
V
D
 
N
G
 
A
R
 
R
M
 
M
R
 
E
T
 
T
S
 
S
Q
 
V
P
 
P
H
 
G
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
A
T
 
A
G
 
R
D
 
P
W
 
P
Q
x
L
F
x
L
T
x
A
H
|
H
A
 
K
A
 
A
G
 
M
H
 
R
E
 
E
A
 
G
G
 
L
V
 
I
V
 
A
V
 
A
A
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
A
L
 
G
R
 
K
L
 
-
P
 
-
R
 
D
R
 
S
A
 
A
D
 
F
H
 
D
A
 
Y
R
 
Q
M
 
V
P
 
P
W
 
S
C
 
V
T
 
V
F
x
Y
T
 
T
D
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
W
A
 
A
S
 
G
V
 
V
G
 
G
C
 
L
N
 
T
E
 
E
R
 
E
M
 
E
A
 
A
A
 
K
E
 
R
R
 
A
G
 
G
L
 
Y
P
 
K
V
 
V
D
 
K
V
 
V
H
 
G
V
 
K
E
 
F
P
 
P
F
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
S
D
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
T
E
 
L
G
 
G
T
 
G
P
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
M
L
 
V
K
 
K
L
 
V
V
 
V
L
 
G
R
 
D
K
 
E
G
 
E
G
 
T
N
 
D
R
 
L
V
 
L
L
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
F
A
 
I
V
 
V
G
 
G
P
 
P
H
 
Q
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
A
E
 
E
W
 
A
V
 
A
A
 
L
V
 
A
L
 
L
G
 
E
G
 
M
G
 
G
V
 
A
R
 
T
L
 
L
S
 
T
A
 
D
L
 
L
A
 
A
G
 
L
A
 
T
V
 
V
H
|
H
P
 
P
Y
x
H
P
 
P
T
 
T
L
 
L
G
 
S
E
|
E
I
 
S
S
 
L
A
 
M
R
 
E
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1dxlA Dihydrolipoamide dehydrogenase of glycine decarboxylase from pisum sativum (see paper)
31% identity, 94% coverage: 8:483/508 of query aligns to 3:457/467 of 1dxlA

query
sites
1dxlA
D
 
E
A
 
N
D
 
D
L
 
V
L
 
V
V
 
I
I
|
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
x
P
A
x
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
I
G
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
A
 
F
R
 
K
V
 
T
V
 
T
L
 
C
A
 
I
E
|
E
R
x
K
E
x
R
P
 
G
A
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
D
x
T
C
|
C
L
 
L
H
 
N
H
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
T
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
H
T
 
S
A
 
S
R
 
H
A
 
M
R
 
Y
H
 
H
V
 
E
M
 
A
R
 
K
R
 
H
A
 
S
-
 
F
A
 
A
L
 
N
F
 
H
G
 
G
L
 
V
P
 
K
A
 
V
P
 
S
E
 
N
L
 
V
E
 
E
P
 
-
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
A
A
 
A
-
 
M
-
 
M
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
A
V
 
V
A
 
S
R
 
N
R
 
L
I
 
T
R
 
R
E
 
G
V
 
I
Q
 
E
A
 
G
V
 
L
I
 
F
Q
 
K
R
 
K
H
 
-
D
 
N
S
 
K
P
 
V
Q
 
T
R
 
Y
F
 
V
T
 
K
G
 
G
L
x
Y
G
|
G
V
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
K
F
 
F
G
 
V
P
 
S
A
 
P
R
 
S
F
 
E
C
 
I
D
 
S
E
 
V
H
 
D
T
 
T
V
 
I
E
 
E
I
 
G
G
 
E
G
 
N
R
 
T
R
 
V
V
 
V
S
 
K
A
 
G
A
 
K
R
 
H
I
 
I
L
 
I
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
D
P
 
V
Q
 
K
L
 
S
P
 
L
P
 
P
L
 
G
P
 
V
G
 
T
L
 
I
D
 
D
T
 
E
V
 
K
P
 
K
F
 
I
L
 
V
T
 
S
N
 
S
R
 
T
D
 
G
I
 
A
F
 
L
S
 
A
L
 
L
D
 
S
A
 
E
L
 
I
P
 
P
A
 
K
S
 
K
L
 
L
L
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
P
x
Y
M
x
I
A
 
G
C
 
L
E
|
E
M
 
M
A
 
G
Q
 
S
A
 
V
F
 
W
A
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
G
S
 
S
R
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
V
V
 
V
L
 
E
R
 
F
G
 
A
P
 
S
R
 
E
I
 
I
L
 
V
P
 
P
R
 
T
D
 
M
D
 
D
A
 
A
D
 
E
M
 
I
A
 
R
G
 
K
V
 
Q
V
 
F
H
 
Q
A
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
K
D
 
Q
G
 
G
V
 
M
R
 
K
V
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
-
K
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
F
G
 
K
K
 
L
P
 
K
G
 
T
E
 
K
P
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
V
D
 
D
G
 
-
N
 
-
D
 
-
A
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
K
A
 
-
E
 
-
L
 
L
E
 
T
V
 
V
P
 
E
Q
 
P
G
 
S
E
 
A
G
 
G
R
 
G
G
 
E
P
 
Q
L
 
T
V
 
I
V
 
I
R
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
V
L
 
V
L
 
L
A
 
V
A
 
S
L
 
A
G
 
G
R
|
R
T
 
T
P
 
P
E
 
F
T
 
T
A
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
N
L
 
L
A
 
D
A
 
K
A
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
E
T
 
T
G
 
D
R
 
K
H
 
L
G
 
G
G
 
R
I
 
I
T
 
L
V
 
V
D
 
N
G
 
E
R
 
R
M
 
F
R
 
S
T
 
T
S
 
N
Q
 
V
P
 
S
H
 
G
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
I
G
 
P
D
 
G
W
 
P
Q
x
M
F
x
L
T
x
A
H
|
H
A
 
K
A
 
A
G
 
-
H
 
E
E
 
E
A
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
A
V
 
C
A
 
V
N
 
E
A
 
Y
V
 
L
L
 
A
R
 
G
L
 
K
P
 
V
R
 
G
R
 
H
A
 
V
D
 
D
H
 
Y
A
 
D
R
 
K
M
 
V
P
 
P
W
 
G
C
 
V
T
 
V
F
 
Y
T
 
T
D
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
G
C
 
K
N
 
T
E
 
E
R
 
E
M
 
Q
A
 
V
A
 
K
E
 
E
R
 
T
G
 
G
L
 
V
P
 
E
V
 
Y
D
 
R
V
 
V
H
 
G
V
 
K
E
 
F
P
 
P
F
 
F
A
 
M
A
 
A
N
 
N
D
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
K
A
 
A
E
 
I
G
 
D
T
 
N
P
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
L
L
 
V
K
 
K
L
 
I
V
 
I
L
 
A
R
 
E
K
 
K
G
 
E
G
 
T
N
 
D
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
H
A
 
I
V
 
M
G
 
A
P
 
P
H
 
N
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
H
E
 
E
W
 
A
V
 
A
A
 
I
V
 
A
L
 
L
G
 
Q
G
 
Y
G
 
D
V
 
A
R
 
S
L
 
S
S
 
E
A
 
D
L
 
I
A
 
A
G
 
R
A
 
V
V
 
C
H
|
H
P
 
A
Y
x
H
P
 
P
T
 
T
L
 
M
G
 
S
E
|
E
I
 
A
S
 
I
A
 
K
R
 
E
A
 
A
A
 
A

4jdrA Dihydrolipoamide dehydrogenase of pyruvate dehydrogenase from escherichia coli (see paper)
31% identity, 92% coverage: 11:477/508 of query aligns to 8:449/471 of 4jdrA

query
sites
4jdrA
L
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
L
G
|
G
G
 
A
G
|
G
A
x
P
A
|
A
G
 
G
L
 
Y
T
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
F
G
 
R
A
 
C
A
 
A
R
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
L
R
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
I
A
 
V
E
|
E
R
|
R
E
x
Y
P
 
N
A
 
T
L
|
L
G
 
G
G
 
G
D
x
V
C
|
C
L
 
L
H
 
N
H
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
T
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
H
T
 
V
A
 
A
R
 
K
-
 
V
-
 
I
-
 
E
-
 
E
A
 
A
R
 
K
H
 
A
V
 
L
M
 
A
R
 
E
R
 
H
A
 
G
A
 
I
L
 
V
F
 
F
G
 
G
L
x
E
P
|
P
A
 
K
P
 
T
E
 
D
L
 
I
E
 
D
P
 
K
V
 
I
D
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
R
R
 
T
I
 
W
R
 
K
E
 
E
V
 
-
Q
 
-
A
 
K
V
 
V
I
 
I
Q
 
N
R
 
Q
H
 
L
D
 
T
S
 
G
-
 
G
-
 
L
P
 
A
Q
 
G
R
 
M
F
 
A
T
 
K
G
 
G
L
 
R
G
 
K
V
 
V
D
 
K
V
 
V
R
 
V
F
 
N
G
 
G
P
x
L
A
x
G
R
 
K
F
 
F
C
 
T
D
 
G
E
 
A
H
 
N
T
 
T
V
 
L
E
 
E
I
 
V
G
 
E
G
 
G
R
 
E
R
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
V
V
 
I
S
 
N
A
 
F
A
 
D
R
 
N
I
 
A
L
 
I
I
 
I
A
 
A
T
x
A
G
|
G
S
 
S
S
 
R
P
 
P
-
 
I
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
P
 
F
L
 
I
P
 
P
G
 
H
L
 
E
D
 
D
T
 
P
V
 
-
P
 
R
F
 
I
L
 
W
T
 
D
N
 
S
R
 
T
D
 
D
I
 
A
F
 
L
S
 
E
L
 
L
D
 
K
A
 
E
L
 
V
P
 
P
A
 
E
S
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
x
I
M
x
I
A
 
G
C
 
L
E
|
E
M
 
M
A
 
G
Q
 
T
A
 
V
F
 
Y
A
 
H
R
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
R
 
Q
V
 
I
T
 
D
M
 
V
V
 
V
L
 
E
R
 
M
G
 
F
P
 
D
R
 
Q
I
 
V
L
 
I
P
 
P
R
 
A
D
 
A
D
 
D
A
 
K
D
 
D
M
 
I
A
 
V
G
 
K
V
 
V
V
 
F
H
 
T
A
 
K
S
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
R
V
 
I
L
 
S
A
 
K
G
 
K
A
 
F
T
 
N
V
 
L
K
 
M
M
 
L
L
 
E
R
 
T
A
 
K
V
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
E
G
 
A
R
 
K
F
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
E
D
 
D
G
 
G
N
 
I
D
 
Y
A
 
V
A
 
T
G
 
M
T
 
E
G
 
G
V
 
K
E
 
K
A
 
A
E
 
P
L
 
A
E
 
E
V
 
-
P
 
P
Q
 
Q
G
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
R
A
 
Y
D
 
D
R
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
V
P
 
P
E
 
N
T
 
G
A
 
K
G
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
A
A
 
G
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
E
T
 
V
G
 
D
R
 
D
H
 
R
G
 
G
G
 
F
I
 
I
T
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
K
R
 
Q
M
 
L
R
 
R
T
 
T
S
 
N
Q
 
V
P
 
P
H
 
H
V
 
I
F
 
F
A
 
A
A
 
I
G
|
G
D
|
D
V
 
I
T
 
V
G
 
G
D
 
Q
W
 
P
Q
x
M
F
x
L
T
x
A
H
|
H
A
 
K
A
 
G
G
x
V
H
 
H
E
 
E
A
 
-
G
 
G
V
 
H
V
 
V
V
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
V
V
 
I
L
 
A
R
 
G
L
 
K
P
 
K
R
 
H
R
 
Y
A
 
F
D
 
D
H
 
P
A
 
K
R
 
V
M
 
I
P
 
P
W
 
S
C
 
I
T
 
A
F
 
Y
T
 
T
D
 
E
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
W
V
 
V
G
 
G
C
 
L
N
 
T
E
 
E
R
 
K
M
 
E
A
 
A
A
 
K
E
 
E
R
 
K
G
 
G
L
 
I
P
 
S
V
 
Y
D
 
E
V
 
T
H
 
A
V
 
T
E
 
F
P
 
P
F
 
W
A
 
A
A
 
A
N
 
S
D
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
S
G
 
D
T
 
C
P
 
A
E
 
D
G
 
G
R
 
M
L
 
T
K
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
F
R
 
D
K
 
K
G
 
E
G
 
S
N
 
H
R
 
R
V
 
V
L
 
I
G
 
G
V
 
G
Q
 
A
A
 
I
V
 
V
G
 
G
P
 
T
H
 
N
A
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
L
N
 
G
E
 
E
W
 
I
V
 
G
A
 
L
V
 
A
L
 
I
G
 
E
G
 
M
G
 
G
V
 
C
R
 
D
L
 
A
S
 
E
A
 
D
L
 
I
A
 
A
G
 
L
A
 
T
V
 
I
H
|
H
P
 
A
Y
x
H
P
 
P
T
 
T
L
 
L
G
 
H
E
|
E

Sites not aligning to the query:

P31023 Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial; Dihydrolipoamide dehydrogenase; Glycine cleavage system L protein; Pyruvate dehydrogenase complex E3 subunit; E3; PDC-E3; EC 1.8.1.4 from Pisum sativum (Garden pea) (Lathyrus oleraceus) (see 2 papers)
31% identity, 94% coverage: 8:483/508 of query aligns to 37:491/501 of P31023

query
sites
P31023
D
 
E
A
 
N
D
 
D
L
 
V
L
 
V
V
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
P
A
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
I
G
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
A
 
F
R
 
K
V
 
T
V
 
T
L
 
C
A
 
I
E
|
E
R
x
K
E
x
R
P
x
G
A
|
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
D
x
T
C
|
C
L
 
L
H
 
N
H
 
V
G
 
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
 
S
K
 
K
T
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
H
T
 
S
A
 
S
R
 
H
A
 
M
R
 
Y
H
 
H
V
 
E
M
 
A
R
 
K
R
 
H
A
 
S
-
 
F
A
 
A
L
 
N
F
 
H
G
 
G
L
 
V
P
 
K
A
 
V
P
 
S
E
 
N
L
 
V
E
 
E
P
 
-
V
 
I
D
 
D
F
 
L
A
 
A
A
 
A
-
 
M
-
 
M
-
 
G
-
 
Q
-
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
A
V
 
V
A
 
S
R
 
N
R
 
L
I
 
T
R
 
R
E
 
G
V
 
I
Q
 
E
A
 
G
V
 
L
I
 
F
Q
 
K
R
 
K
H
 
-
D
 
N
S
 
K
P
 
V
Q
 
T
R
 
Y
F
 
V
T
 
K
G
 
G
L
 
Y
G
|
G
V
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
K
F
 
F
G
 
V
P
 
S
A
 
P
R
 
S
F
 
E
C
 
I
D
 
S
E
 
V
H
 
D
T
 
T
V
 
I
E
 
E
I
 
G
G
 
E
G
 
N
R
 
T
R
 
V
V
 
V
S
 
K
A
 
G
A
 
K
R
 
H
I
 
I
L
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
D
P
 
V
Q
 
K
L
 
S
P
 
L
P
 
P
L
 
G
P
 
V
G
 
T
L
 
I
D
 
D
T
 
E
V
 
K
P
 
K
F
 
I
L
 
V
T
 
S
N
 
S
R
 
T
D
 
G
I
 
A
F
 
L
S
 
A
L
 
L
D
 
S
A
 
E
L
 
I
P
 
P
A
 
K
S
 
K
L
 
L
L
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
G
 
A
G
 
G
P
 
Y
M
 
I
A
 
G
C
 
L
E
 
E
M
 
M
A
 
G
Q
 
S
A
 
V
F
 
W
A
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
G
S
 
S
R
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
V
V
 
V
L
 
E
R
 
F
G
 
A
P
 
S
R
 
E
I
 
I
L
 
V
P
 
P
R
 
T
D
 
M
D
 
D
A
 
A
D
 
E
M
 
I
A
 
R
G
 
K
V
 
Q
V
 
F
H
 
Q
A
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
E
A
 
K
D
 
Q
G
 
G
V
 
M
R
 
K
V
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
-
K
 
-
M
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
-
S
 
-
A
 
-
I
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
F
G
 
K
K
 
L
P
 
K
G
 
T
E
 
K
P
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
V
D
 
D
G
 
-
N
 
-
D
 
-
A
 
T
A
 
S
G
 
G
T
 
D
G
 
G
V
 
V
E
 
K
A
 
-
E
 
-
L
 
L
E
 
T
V
 
V
P
 
E
Q
 
P
G
 
S
E
 
A
G
 
G
R
 
G
G
 
E
P
 
Q
L
 
T
V
 
I
V
 
I
R
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
V
L
 
V
L
 
L
A
 
V
A
 
S
L
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
T
P
 
P
E
 
F
T
 
T
A
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
N
L
 
L
A
 
D
A
 
K
A
 
I
G
 
G
V
 
V
A
 
E
T
 
T
G
 
D
R
 
K
H
 
L
G
 
G
G
 
R
I
 
I
T
 
L
V
 
V
D
 
N
G
 
E
R
 
R
M
 
F
R
 
S
T
 
T
S
 
N
Q
 
V
P
 
S
H
 
G
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
I
G
 
P
D
 
G
W
 
P
Q
x
M
F
x
L
T
x
A
H
|
H
A
 
K
A
 
A
G
 
-
H
 
E
E
 
E
A
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
A
V
 
C
A
 
V
N
 
E
A
 
Y
V
 
L
L
 
A
R
 
G
L
 
K
P
 
V
R
 
G
R
 
H
A
 
V
D
 
D
H
 
Y
A
 
D
R
 
K
M
 
V
P
 
P
W
 
G
C
 
V
T
 
V
F
 
Y
T
 
T
D
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
G
C
 
K
N
 
T
E
 
E
R
 
E
M
 
Q
A
 
V
A
 
K
E
 
E
R
 
T
G
 
G
L
 
V
P
 
E
V
 
Y
D
 
R
V
 
V
H
 
G
V
 
K
E
 
F
P
 
P
F
 
F
A
 
M
A
 
A
N
 
N
D
 
S
R
 
R
A
 
A
L
 
K
A
 
A
E
 
I
G
 
D
T
 
N
P
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
L
L
 
V
K
 
K
L
 
I
V
 
I
L
 
A
R
 
E
K
 
K
G
 
E
G
 
T
N
 
D
R
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
H
A
 
I
V
 
M
G
 
A
P
 
P
H
 
N
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
I
N
 
H
E
 
E
W
 
A
V
 
A
A
 
I
V
 
A
L
 
L
G
 
Q
G
 
Y
G
 
D
V
 
A
R
 
S
L
 
S
S
 
E
A
 
D
L
 
I
A
 
A
G
 
R
A
 
V
V
 
C
H
 
H
P
 
A
Y
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
M
G
 
S
E
 
E
I
 
A
S
 
I
A
 
K
R
 
E
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P0A9P0 Dihydrolipoyl dehydrogenase; Dihydrolipoamide dehydrogenase; E3 component of pyruvate and 2-oxoglutarate dehydrogenases complexes; Glycine cleavage system L protein; EC 1.8.1.4 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
31% identity, 92% coverage: 11:477/508 of query aligns to 9:450/474 of P0A9P0

query
sites
P0A9P0
L
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
G
A
 
P
A
 
A
G
 
G
L
 
Y
T
 
S
A
 
A
A
 
A
A
 
F
G
 
R
A
 
C
A
 
A
R
 
D
F
 
L
G
 
G
A
 
L
R
 
E
V
 
T
V
 
V
L
 
I
A
 
V
E
 
E
R
 
R
E
 
Y
P
 
N
A
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
D
 
V
C
 
C
L
 
L
H
 
N
H
 
V
G
 
G
C
 
C
V
 
I
P
 
P
S
 
S
K
 
K
T
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
H
T
 
V
A
 
A
R
 
K
-
 
V
-
 
I
-
 
E
-
 
E
A
 
A
R
 
K
H
 
A
V
 
L
M
 
A
R
 
E
R
 
H
A
 
G
A
 
I
L
 
V
F
 
F
G
 
G
L
 
E
P
 
P
A
 
K
P
 
T
E
 
D
L
 
I
E
 
D
P
 
K
V
 
I
D
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
R
R
 
T
I
 
W
R
 
K
E
 
E
V
 
-
Q
 
-
A
 
K
V
 
V
I
 
I
Q
 
N
R
 
Q
H
 
L
D
 
T
S
 
G
-
 
G
-
 
L
P
 
A
Q
 
G
R
 
M
F
 
A
T
 
K
G
 
G
L
 
R
G
 
K
V
 
V
D
 
K
V
 
V
R
 
V
F
 
N
G
 
G
P
 
L
A
 
G
R
 
K
F
 
F
C
 
T
D
 
G
E
 
A
H
 
N
T
 
T
V
 
L
E
 
E
I
 
V
G
 
E
G
 
G
R
 
E
R
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
T
-
 
V
V
 
I
S
 
N
A
 
F
A
 
D
R
 
N
I
 
A
L
 
I
I
 
I
A
 
A
T
 
A
G
 
G
S
 
S
S
 
R
P
 
P
-
 
I
Q
 
Q
L
 
L
P
 
P
P
 
F
L
 
I
P
 
P
G
 
H
L
 
E
D
 
D
T
 
P
V
 
-
P
 
R
F
 
I
L
 
W
T
 
D
N
 
S
R
 
T
D
 
D
I
 
A
F
 
L
S
 
E
L
 
L
D
 
K
A
 
E
L
 
V
P
 
P
A
 
E
S
 
R
L
 
L
L
 
L
V
 
V
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
 
I
M
 
I
A
 
G
C
 
L
E
 
E
M
 
M
A
 
G
Q
 
T
A
 
V
F
 
Y
A
 
H
R
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
S
R
 
Q
V
 
I
T
 
D
M
 
V
V
 
V
L
 
E
R
 
M
G
 
F
P
 
D
R
 
Q
I
 
V
L
 
I
P
 
P
R
 
A
D
 
A
D
 
D
A
 
K
D
 
D
M
 
I
A
 
V
G
x
K
V
 
V
V
 
F
H
 
T
A
 
K
S
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
R
 
R
V
 
I
L
 
S
A
 
K
G
 
K
A
 
F
T
 
N
V
 
L
K
 
M
M
 
L
L
 
E
R
 
T
A
 
K
V
 
V
S
 
T
A
 
A
I
 
V
S
 
E
G
 
A
R
 
K
F
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
E
D
 
D
G
 
G
N
 
I
D
 
Y
A
 
V
A
 
T
G
 
M
T
 
E
G
 
G
V
 
K
E
 
K
A
 
A
E
 
P
L
 
A
E
 
E
V
 
-
P
 
P
Q
 
Q
G
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
R
A
 
Y
D
 
D
R
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
V
P
 
P
E
 
N
T
 
G
A
 
K
G
 
N
L
 
L
D
 
D
L
 
A
A
 
G
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
E
T
 
V
G
 
D
R
 
D
H
 
R
G
 
G
G
 
F
I
 
I
T
 
R
V
 
V
D
 
D
G
 
K
R
 
Q
M
 
L
R
 
R
T
 
T
S
 
N
Q
 
V
P
 
P
H
 
H
V
 
I
F
 
F
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
 
D
V
 
I
T
 
V
G
 
G
D
 
Q
W
 
P
Q
 
M
F
 
L
T
 
A
H
 
H
A
 
K
A
 
G
G
 
V
H
 
H
E
 
E
A
 
-
G
 
G
V
 
H
V
 
V
V
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
V
V
 
I
L
 
A
R
 
G
L
 
K
P
 
K
R
 
H
R
 
Y
A
 
F
D
 
D
H
 
P
A
 
K
R
 
V
M
 
I
P
 
P
W
 
S
C
 
I
T
 
A
F
 
Y
T
 
T
D
 
E
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
A
S
 
W
V
 
V
G
 
G
C
 
L
N
 
T
E
 
E
R
 
K
M
 
E
A
 
A
A
 
K
E
 
E
R
 
K
G
 
G
L
 
I
P
 
S
V
 
Y
D
 
E
V
 
T
H
 
A
V
 
T
E
 
F
P
 
P
F
 
W
A
 
A
A
 
A
N
 
S
D
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
S
G
 
D
T
 
C
P
 
A
E
 
D
G
 
G
R
 
M
L
 
T
K
 
K
L
 
L
V
 
I
L
 
F
R
 
D
K
 
K
G
 
E
G
 
S
N
 
H
R
 
R
V
 
V
L
 
I
G
 
G
V
 
G
Q
 
A
A
 
I
V
 
V
G
 
G
P
 
T
H
 
N
A
 
G
G
 
G
E
 
E
V
 
L
L
 
L
N
 
G
E
 
E
W
 
I
V
 
G
A
 
L
V
 
A
L
 
I
G
 
E
G
 
M
G
 
G
V
 
C
R
 
D
L
 
A
S
 
E
A
 
D
L
 
I
A
 
A
G
 
L
A
 
T
V
 
I
H
 
H
P
 
A
Y
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
L
G
 
H
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P09063 Dihydrolipoyl dehydrogenase; Dihydrolipoamide dehydrogenase; E3 component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex; LPD-Val; EC 1.8.1.4 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see paper)
33% identity, 93% coverage: 11:483/508 of query aligns to 9:449/459 of P09063

query
sites
P09063
L
 
L
L
 
L
V
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
P
A
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
G
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
A
 
I
R
 
P
V
 
T
V
 
V
L
 
L
A
 
V
E
|
E
R
x
G
E
x
Q
P
 
-
A
|
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
D
x
T
C
|
C
L
 
L
H
 
N
H
 
I
G
 
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
 
S
K
|
K
T
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
H
T
 
V
A
 
A
R
 
E
A
 
Q
R
 
F
H
 
H
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
Q
A
 
A
A
 
S
L
 
R
F
 
F
G
 
T
L
 
E
P
 
P
A
 
S
P
 
P
E
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
L
D
 
G
F
 
I
A
 
S
A
 
V
V
 
A
A
 
S
R
 
P
R
 
R
I
 
L
R
 
D
E
 
I
V
 
G
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
I
 
A
Q
 
W
R
 
K
H
 
D
D
 
G
S
 
I
P
 
V
Q
 
D
R
 
R
F
 
L
T
 
T
-
 
T
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
K
G
 
K
L
 
H
G
 
G
V
 
V
D
 
K
V
 
V
R
 
V
F
 
H
G
 
G
P
 
W
A
|
A
R
 
K
F
 
V
C
 
L
D
 
D
E
 
G
H
 
K
T
 
Q
V
 
V
E
 
E
I
 
V
G
 
D
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
V
 
I
S
 
Q
A
 
C
A
 
E
R
 
H
I
 
L
L
 
L
I
 
L
A
|
A
T
 
T
G
 
G
S
 
S
S
 
S
P
 
S
-
 
V
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
P
 
M
L
 
L
P
 
P
-
 
L
-
 
G
G
 
G
L
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
P
F
 
V
L
 
I
T
 
S
N
 
S
R
 
T
D
 
E
I
 
A
F
 
L
S
 
A
L
 
P
D
 
K
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
Q
S
 
H
L
 
L
L
 
V
V
 
V
L
 
V
G
|
G
G
|
G
G
|
G
P
x
Y
M
x
I
A
 
G
C
 
L
E
 
E
M
 
L
A
 
G
Q
 
I
A
 
A
F
 
Y
A
 
R
R
 
K
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
Q
V
 
V
T
 
S
M
 
V
V
 
V
L
x
E
R
 
A
G
 
R
P
 
E
R
 
R
I
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
T
D
 
Y
D
 
D
A
 
S
D
 
E
M
 
L
A
 
T
G
 
A
V
 
P
V
 
V
H
 
A
A
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
K
A
 
K
D
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
A
V
 
L
L
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
H
T
 
S
V
|
V
K
 
E
M
 
G
L
 
Y
R
 
E
A
 
N
V
 
G
S
 
C
A
 
L
I
 
L
S
 
A
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
N
D
 
D
A
 
G
A
 
K
G
 
G
T
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
P
 
Q
L
 
L
V
 
R
V
 
L
R
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
L
 
L
A
 
V
A
|
A
L
x
V
G
|
G
R
|
R
T
 
R
P
 
P
E
 
R
T
 
T
A
 
K
G
 
G
L
 
F
D
 
N
L
 
L
A
 
E
A
 
C
A
 
L
G
 
D
V
 
L
A
 
K
T
 
M
G
 
-
R
 
N
H
 
G
G
 
A
G
 
A
I
 
I
T
 
A
V
 
I
D
 
D
G
 
E
R
 
R
M
 
C
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
Q
 
M
P
 
H
H
 
N
V
 
V
F
 
W
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
A
G
 
G
D
 
E
W
 
P
Q
x
M
F
 
L
T
x
A
H
 
H
A
 
R
A
 
A
G
 
M
H
 
A
E
 
Q
A
 
-
G
 
G
V
 
E
V
 
M
V
 
V
A
 
A
N
 
E
A
 
I
V
 
I
L
 
A
R
 
G
L
 
K
P
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
F
D
 
E
H
 
P
A
 
A
R
 
A
M
 
I
P
 
A
W
 
A
C
 
V
T
 
C
F
 
F
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
V
S
 
V
V
 
V
G
 
G
C
 
K
N
 
T
E
 
P
R
 
E
M
 
Q
A
 
A
A
 
S
E
 
Q
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
P
 
D
V
 
C
D
 
I
V
 
V
H
 
A
V
 
Q
E
 
F
P
 
P
F
 
F
A
 
A
A
 
A
N
 
N
D
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
M
A
 
S
E
 
L
G
 
E
T
 
S
P
 
K
E
 
S
G
 
G
R
 
F
L
 
V
K
 
R
L
 
V
V
 
V
L
 
A
R
 
R
K
 
R
G
 
D
G
 
N
N
 
H
R
 
L
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
W
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
G
P
 
V
H
 
A
A
 
V
G
 
S
E
 
E
V
 
L
L
 
S
N
 
T
E
 
A
W
 
F
V
 
A
A
 
Q
V
 
S
L
 
L
G
 
E
G
 
M
G
 
G
V
 
A
R
 
C
L
 
L
S
 
E
A
 
D
L
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
T
V
 
I
H
 
H
P
 
A
Y
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
L
G
 
G
E
 
E
I
 
A
S
 
V
A
 
Q
R
 
E
A
 
A
A
 
A

1lvlA The refined structure of pseudomonas putida lipoamide dehydrogenase complexed with NAD+ at 2.45 angstroms resolution (see paper)
33% identity, 93% coverage: 11:483/508 of query aligns to 8:448/458 of 1lvlA

query
sites
1lvlA
L
 
L
L
 
L
V
 
I
I
|
I
G
|
G
G
 
G
G
 
G
A
x
P
A
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
I
G
 
R
A
 
A
A
 
G
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
A
 
I
R
 
P
V
 
T
V
 
V
L
 
L
A
 
V
E
|
E
R
x
G
E
 
Q
P
 
-
A
 
A
L
|
L
G
 
G
G
|
G
D
x
T
C
|
C
L
 
L
H
 
N
H
 
I
G
|
G
C
|
C
V
 
I
P
 
P
S
|
S
K
|
K
T
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
H
T
 
V
A
 
A
R
 
E
A
 
Q
R
 
F
H
 
H
V
 
-
M
 
-
R
 
-
R
 
Q
A
 
A
A
 
S
L
 
R
F
 
F
G
 
T
L
 
E
P
 
P
A
 
S
P
 
P
E
 
-
L
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
L
D
 
G
F
 
I
A
 
S
A
 
V
V
 
A
A
x
S
R
x
P
R
 
R
I
 
L
R
 
D
E
 
I
V
 
G
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
I
 
A
Q
 
W
R
 
K
H
 
D
D
 
G
S
 
I
P
 
V
Q
 
D
R
 
R
F
 
L
T
 
T
-
 
T
-
 
G
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
L
-
 
L
-
 
K
G
 
K
L
 
H
G
 
G
V
 
V
D
 
K
V
 
V
R
 
V
F
 
H
G
 
G
P
x
W
A
|
A
R
 
K
F
 
V
C
 
L
D
 
D
E
 
G
H
 
K
T
 
Q
V
 
V
E
 
E
I
 
V
G
 
D
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
V
 
I
S
 
Q
A
 
C
A
 
E
R
 
H
I
 
L
L
 
L
I
 
L
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
 
S
S
 
S
P
 
S
-
 
V
Q
 
E
L
 
L
P
 
P
P
 
M
L
 
L
P
 
P
-
 
L
-
 
G
G
 
G
L
 
-
D
 
-
T
 
-
V
 
-
P
 
P
F
 
V
L
 
I
T
 
S
N
 
S
R
 
T
D
 
E
I
 
A
F
 
L
S
 
A
L
 
P
D
 
K
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
Q
S
 
H
L
 
L
L
 
V
V
 
V
L
x
V
G
|
G
G
 
G
G
 
G
P
x
Y
M
x
I
A
 
G
C
 
L
E
|
E
M
 
L
A
 
G
Q
 
I
A
 
A
F
 
Y
A
 
R
R
 
K
L
 
L
G
 
G
S
 
A
R
 
Q
V
 
V
T
 
S
M
 
V
V
 
V
L
x
E
R
 
A
G
 
R
P
 
E
R
 
R
I
 
I
L
 
L
P
 
P
R
 
T
D
 
Y
D
 
D
A
 
S
D
 
E
M
 
L
A
 
T
G
 
A
V
 
P
V
 
V
H
 
A
A
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
K
A
 
K
D
 
L
G
 
G
V
 
I
R
 
A
V
 
L
L
 
H
A
 
L
G
 
G
A
 
H
T
 
S
V
 
V
K
 
E
M
 
G
L
 
Y
R
 
E
A
 
N
V
 
G
S
 
C
A
 
L
I
 
L
S
 
A
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
N
D
 
D
A
 
G
A
 
K
G
 
G
T
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
G
P
 
Q
L
 
L
V
 
R
V
 
L
R
 
E
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
L
 
L
A
 
V
A
|
A
L
x
V
G
|
G
R
|
R
T
 
R
P
 
P
E
x
R
T
 
T
A
 
K
G
 
G
L
 
F
D
 
N
L
 
L
A
 
E
A
 
C
A
 
L
G
 
D
V
 
L
A
 
K
T
 
M
G
 
-
R
 
N
H
 
G
G
 
A
G
 
A
I
 
I
T
 
A
V
 
I
D
 
D
G
 
E
R
 
R
M
 
C
R
 
Q
T
 
T
S
 
S
Q
 
M
P
 
H
H
 
N
V
 
V
F
 
W
A
 
A
A
 
I
G
 
G
D
|
D
V
 
V
T
 
A
G
 
G
D
x
E
W
 
P
Q
x
M
F
x
L
T
x
A
H
|
H
A
 
R
A
 
A
G
x
M
H
 
A
E
 
Q
A
 
-
G
 
G
V
 
E
V
 
M
V
 
V
A
 
A
N
 
E
A
 
I
V
 
I
L
 
A
R
 
G
L
 
K
P
 
A
R
 
R
R
 
R
A
 
F
D
 
E
H
 
P
A
 
A
R
 
A
M
 
I
P
 
A
W
 
A
C
 
V
T
 
C
F
 
F
T
 
T
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
V
A
 
V
S
 
V
V
 
V
G
 
G
C
 
K
N
 
T
E
 
P
R
 
E
M
 
Q
A
 
A
A
 
S
E
 
Q
R
 
Q
G
 
G
L
 
L
P
 
D
V
 
C
D
 
I
V
 
V
H
 
A
V
 
Q
E
 
F
P
 
P
F
 
F
A
 
A
A
 
A
N
 
N
D
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
M
A
 
S
E
 
L
G
 
E
T
 
S
P
 
K
E
 
S
G
 
G
R
 
F
L
 
V
K
 
R
L
 
V
V
 
V
L
 
A
R
 
R
K
 
R
G
 
D
G
 
N
N
 
H
R
 
L
V
 
I
L
 
L
G
 
G
V
 
W
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
G
 
G
P
 
V
H
 
A
A
 
V
G
 
S
E
 
E
V
 
L
L
 
S
N
 
T
E
 
A
W
 
F
V
 
A
A
 
Q
V
 
S
L
 
L
G
 
E
G
 
M
G
 
G
V
 
A
R
 
C
L
 
L
S
 
E
A
 
D
L
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
T
V
 
I
H
|
H
P
 
A
Y
x
H
P
 
P
T
 
T
L
 
L
G
 
G
E
|
E
I
 
A
S
 
V
A
 
Q
R
 
E
A
 
A
A
 
A

4dnaA Crystal structure of putative glutathione reductase from sinorhizobium meliloti 1021
33% identity, 87% coverage: 8:448/508 of query aligns to 3:413/461 of 4dnaA

query
sites
4dnaA
D
 
D
A
 
Y
D
 
D
L
 
L
L
 
F
V
 
V
I
|
I
G
|
G
G
|
G
G
|
G
A
 
S
A
x
G
G
 
G
L
 
V
T
 
R
A
 
S
A
 
G
A
 
R
G
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
A
F
 
L
G
 
G
A
 
K
R
 
K
V
 
V
V
 
A
L
 
I
A
 
A
E
|
E
R
 
-
E
|
E
P
 
F
A
 
R
L
x
Y
G
 
G
G
|
G
D
x
T
C
|
C
L
 
V
H
 
I
H
 
R
G
|
G
C
|
C
V
 
V
P
 
P
S
x
K
K
 
K
T
 
L
L
 
Y
L
 
V
A
 
Y
T
 
A
A
 
S
R
 
Q
A
 
F
R
 
A
H
 
E
V
 
H
M
 
F
R
 
E
R
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
G
F
 
F
G
 
G
L
 
W
P
 
T
A
 
V
P
 
G
E
 
E
L
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
D
 
-
F
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
S
R
 
R
I
 
F
R
 
D
E
 
W
V
 
A
Q
 
K
A
 
L
V
 
V
I
 
A
Q
 
A
R
 
K
H
 
E
D
 
Q
S
 
E
P
 
I
Q
 
A
R
 
R
F
 
L
T
 
E
G
 
G
L
 
L
-
 
Y
-
 
R
-
 
K
-
 
G
-
 
L
-
 
A
-
 
N
-
 
A
G
 
G
V
 
A
D
 
E
V
 
I
R
 
L
F
 
D
G
 
T
P
x
R
A
|
A
R
 
E
F
 
L
C
 
A
D
 
G
E
 
P
H
 
N
T
 
T
V
 
V
E
 
K
I
 
L
-
 
L
-
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
K
R
 
T
V
 
V
S
 
T
A
 
A
A
 
E
R
 
R
I
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
x
V
G
|
G
S
 
G
S
 
H
P
 
P
Q
 
S
-
 
P
L
 
H
P
 
D
P
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
H
D
 
E
T
 
L
V
 
C
P
 
-
F
 
-
L
 
I
T
 
T
N
 
S
R
 
N
D
 
E
I
 
A
F
 
F
S
 
D
L
 
L
D
 
P
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
E
S
 
S
L
 
I
L
 
L
V
 
I
L
 
A
G
 
G
G
 
G
G
 
G
P
x
Y
M
 
I
A
 
A
C
 
V
E
|
E
M
 
F
A
 
A
Q
 
N
A
 
I
F
 
F
A
 
H
R
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
V
R
 
K
V
 
T
T
 
T
M
 
L
V
 
I
L
 
Y
R
 
R
G
 
G
P
 
K
R
 
E
I
 
I
L
 
L
P
 
S
R
 
R
D
 
F
D
 
D
A
 
Q
D
 
D
M
 
M
A
 
R
G
 
R
V
 
G
V
 
L
H
 
H
A
 
A
S
 
A
L
 
M
A
 
E
A
 
E
D
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
L
 
L
A
 
C
G
 
E
A
 
-
T
 
-
V
 
-
K
 
D
M
 
I
L
 
I
R
 
Q
A
 
S
V
 
V
S
 
S
A
 
A
I
 
-
S
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
G
N
 
R
D
 
R
A
 
V
A
 
A
G
 
T
T
 
T
G
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
M
P
 
K
Q
 
H
G
 
G
E
 
E
G
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
I
R
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
Q
L
 
V
L
 
M
A
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
R
|
R
T
 
M
P
 
P
E
 
N
T
 
T
A
 
N
G
 
G
L
 
L
D
 
G
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
R
T
 
T
G
 
N
R
 
E
H
 
L
G
 
G
G
 
A
I
 
I
T
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
A
R
 
F
M
 
S
R
 
R
T
 
T
S
 
S
Q
 
T
P
 
P
H
 
G
V
 
I
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
V
T
 
T
G
 
D
D
 
R
W
 
V
Q
|
Q
F
x
L
T
|
T
H
 
P
A
 
V
A
 
A
G
 
I
H
 
H
E
 
E
A
 
A
G
 
M
V
 
C
V
 
F
V
 
I
A
 
E
N
 
T
A
 
E
V
 
Y
L
 
K
R
 
N
L
 
N
P
 
P
R
 
T
R
 
S
A
 
P
D
 
D
H
 
H
A
 
D
R
 
L
M
 
I
P
 
A
W
 
T
C
 
A
T
 
V
F
 
F
T
 
S
D
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
I
A
 
G
S
 
T
V
 
V
G
 
G
C
 
I
N
 
T
E
 
E
R
 
E
M
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
K
G
 
F
L
 
Q
P
 
E
V
 
I
D
 
E
V
 
V
H
 
Y
V
 
R
E
 
A
P
 
E
F
 
F
A
 
R
A
 
P
N
 
M
D
 
K
R
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
S
E
 
G
G
 
R
T
 
K
P
 
E
E
 
K
G
 
T
R
 
I
L
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
V
R
 
N
K
 
A
G
 
A
G
 
D
N
 
R
R
 
K
V
 
V
L
 
V
G
 
G
V
 
A
Q
 
H
A
 
I
V
 
L
G
 
G
P
 
H
H
 
D
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
M

Sites not aligning to the query:

2rabA Structure of glutathione amide reductase from chromatium gracile in complex with NAD (see paper)
32% identity, 91% coverage: 10:471/508 of query aligns to 5:434/451 of 2rabA

query
sites
2rabA
D
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
A
I
 
I
G
|
G
G
 
G
G
|
G
A
x
S
A
x
G
G
 
G
L
 
L
T
 
A
A
 
V
A
 
A
A
 
E
G
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
K
R
 
R
V
 
V
V
 
A
L
 
L
A
x
I
E
|
E
R
x
S
E
 
K
P
 
-
A
 
A
L
|
L
G
 
G
G
 
G
D
x
T
C
|
C
L
 
V
H
 
N
H
 
V
G
|
G
C
|
C
V
 
V
P
 
P
S
x
K
K
 
K
T
 
V
L
 
M
L
 
W
A
 
Y
T
 
A
A
 
S
R
 
H
A
 
L
R
 
A
H
 
E
V
 
A
M
 
V
R
 
R
R
 
D
A
 
A
A
 
P
L
 
G
F
 
F
G
 
G
L
 
V
P
 
Q
A
 
A
P
 
S
E
 
T
L
 
L
E
 
D
P
 
W
V
 
P
D
 
R
F
 
L
A
 
-
A
 
-
V
 
V
A
 
A
R
 
G
R
 
R
I
 
D
R
 
R
E
 
Y
V
 
I
Q
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
N
Q
 
S
R
 
F
H
 
W
D
 
D
S
 
G
P
 
-
Q
 
-
R
 
Y
F
 
V
T
 
E
G
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
I
D
 
T
V
 
R
R
 
V
F
 
D
G
 
G
P
x
H
A
|
A
R
 
R
F
 
F
C
 
V
D
 
D
E
 
A
H
 
H
T
 
T
V
 
I
E
 
E
I
 
V
G
 
E
G
 
G
R
 
Q
R
 
R
V
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
D
R
 
H
I
 
I
L
 
V
I
 
I
A
 
A
T
|
T
G
|
G
S
 
G
S
 
R
P
 
P
Q
 
I
L
 
V
P
 
P
P
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
A
D
 
E
T
 
L
V
 
-
P
 
-
F
 
G
L
 
I
T
 
T
N
 
S
R
 
D
D
 
G
I
 
F
F
 
F
S
 
A
L
 
L
D
 
Q
A
 
Q
L
 
Q
P
 
P
A
 
K
S
 
R
L
 
V
L
 
A
V
 
I
L
x
I
G
 
G
G
 
A
G
|
G
P
x
Y
M
x
I
A
 
G
C
 
I
E
|
E
M
 
L
A
 
A
Q
 
G
A
 
L
F
 
L
A
 
R
R
 
S
L
 
F
G
 
G
S
 
S
R
 
E
V
 
V
T
 
T
M
 
V
V
 
V
L
x
A
R
x
L
G
x
E
P
 
D
R
 
R
I
 
L
L
 
L
P
 
F
R
 
Q
D
 
F
D
 
D
A
 
P
D
 
L
M
 
L
A
 
S
G
 
A
V
 
T
V
 
L
H
 
A
A
 
E
S
 
N
L
 
M
A
 
H
A
 
A
D
 
Q
G
 
G
V
 
I
R
 
E
V
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
T
K
 
H
M
 
L
L
 
E
R
 
F
A
 
A
V
|
V
S
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
E
G
 
-
R
 
-
F
 
-
G
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
P
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
R
D
 
D
A
 
A
A
 
Q
G
 
G
T
 
T
G
 
T
V
 
L
E
 
V
A
 
A
E
 
Q
L
 
D
E
 
G
V
 
T
P
 
R
Q
 
L
G
 
G
E
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
L
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
F
D
 
D
R
 
S
L
 
V
L
 
I
A
 
W
A
 
A
L
x
V
G
|
G
R
|
R
T
 
A
P
 
P
E
 
N
T
 
T
A
 
R
G
 
D
L
 
L
D
 
G
L
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
E
T
 
V
G
 
Q
R
 
S
H
 
N
G
 
G
G
 
M
I
 
V
T
 
P
V
 
T
D
 
D
G
 
A
R
 
Y
M
 
Q
R
 
N
T
 
T
S
 
N
Q
 
V
P
 
P
H
 
G
V
 
V
F
 
Y
A
 
A
A
 
L
G
|
G
D
|
D
V
 
I
T
 
T
G
 
G
D
 
R
W
 
D
Q
|
Q
F
x
L
T
|
T
H
 
P
A
 
V
A
 
A
G
 
-
H
x
I
E
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
R
V
 
R
V
 
L
A
 
A
N
 
E
A
 
R
V
 
L
L
 
F
-
 
D
-
 
G
R
 
Q
L
 
S
P
 
E
R
 
R
R
 
K
A
 
L
D
 
D
H
 
Y
A
 
D
R
 
N
M
 
I
P
 
P
W
 
T
C
x
V
T
 
V
F
 
F
T
 
A
D
 
H
P
 
P
E
 
P
L
 
L
A
 
S
S
 
K
V
 
V
G
 
G
C
 
L
N
 
S
E
 
E
R
 
P
M
 
E
A
 
A
A
 
R
E
 
E
R
 
R
-
 
L
G
 
G
L
 
D
P
 
V
V
 
L
D
 
T
V
 
V
H
 
Y
V
 
E
E
 
T
P
 
S
F
 
F
A
 
T
A
 
P
N
 
M
D
 
R
R
 
Y
A
 
A
L
 
L
A
 
N
E
 
E
G
 
H
T
 
G
P
 
P
E
 
K
G
 
T
R
 
A
L
 
M
K
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
C
R
 
A
K
 
G
G
 
P
G
 
E
N
 
Q
R
 
R
V
 
V
L
 
V
G
 
G
V
 
V
Q
 
H
A
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
D
H
 
G
A
 
A
G
 
D
E
 
E
V
 
M
L
 
L
N
 
Q
E
 
G
W
 
F
V
 
A
A
 
V
V
 
A
L
 
V
G
 
K
G
 
M
G
 
G
V
 
A
R
 
T
L
 
K
S
 
A
A
 
D
L
 
F
A
 
D
G
 
N
-
 
T
-
 
V
A
|
A
V
 
I
H
|
H
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>8500135 FitnessBrowser__Miya:8500135
MARTPRHDADLLVIGGGAAGLTAAAGAARFGARVVLAEREPALGGDCLHHGCVPSKTLLA
TARARHVMRRAALFGLPAPELEPVDFAAVARRIREVQAVIQRHDSPQRFTGLGVDVRFGP
ARFCDEHTVEIGGRRVSAARILIATGSSPQLPPLPGLDTVPFLTNRDIFSLDALPASLLV
LGGGPMACEMAQAFARLGSRVTMVLRGPRILPRDDADMAGVVHASLAADGVRVLAGATVK
MLRAVSAISGRFGKPGEPVGADGNDAAGTGVEAELEVPQGEGRGPLVVRADRLLAALGRT
PETAGLDLAAAGVATGRHGGITVDGRMRTSQPHVFAAGDVTGDWQFTHAAGHEAGVVVAN
AVLRLPRRADHARMPWCTFTDPELASVGCNERMAAERGLPVDVHVEPFAANDRALAEGTP
EGRLKLVLRKGGNRVLGVQAVGPHAGEVLNEWVAVLGGGVRLSALAGAVHPYPTLGEISA
RAAGNVVSRVLFSVGARRLLRLLFGYRG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory