SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8500413 FitnessBrowser__Miya:8500413 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
29% identity, 99% coverage: 1:252/255 of query aligns to 2:254/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
M
 
M
P
 
E
L
 
I
L
 
L
E
 
R
M
 
T
K
 
E
G
 
N
V
 
I
T
 
V
Q
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
Q
 
K
A
 
A
V
 
L
S
 
D
D
 
G
F
 
V
N
 
S
I
 
I
S
 
S
L
 
V
E
 
N
E
 
K
R
 
G
K
 
D
L
 
V
I
 
T
A
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
N
L
 
V
V
 
I
S
 
T
G
 
G
F
 
F
Y
 
L
Q
 
K
P
 
A
T
 
D
E
 
E
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
I
 
Y
F
 
F
D
 
E
G
 
N
K
 
K
P
 
D
T
 
I
A
 
T
G
 
N
L
 
K
R
 
E
P
 
P
H
 
A
Q
 
E
V
 
L
T
 
Y
A
 
H
R
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
R
 
Q
L
 
P
W
 
L
H
 
K
E
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
L
R
 
L
I
 
I
A
 
G
Q
 
E
H
 
I
H
 
C
R
 
P
L
 
-
G
 
G
Y
 
E
T
 
S
I
 
P
W
 
L
D
 
N
A
 
S
F
 
L
L
 
F
R
 
Y
T
 
K
G
 
K
R
 
W
F
 
I
T
 
P
R
 
K
S
 
E
E
 
E
G
 
E
N
 
M
I
 
V
D
 
E
T
 
K
I
 
-
A
 
A
W
 
F
E
 
K
M
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
F
M
 
L
D
 
K
L
 
L
K
 
S
D
 
H
A
 
L
A
 
Y
H
 
D
E
 
R
L
 
K
P
 
A
R
 
G
N
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
M
R
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
M
I
 
T
R
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
A
S
 
P
A
 
G
D
 
L
V
 
A
D
 
H
G
 
D
L
 
I
I
 
F
K
 
N
L
 
H
I
 
V
R
 
L
W
 
E
I
 
L
H
 
K
D
 
A
E
 
K
F
 
-
D
 
G
I
 
I
A
 
T
I
 
F
W
 
L
M
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
Q
 
R
M
 
L
K
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
S
 
N
L
 
Y
C
 
I
E
 
D
W
 
H
I
 
L
K
 
Y
V
 
V
I
 
M
D
 
F
F
 
N
G
 
G
S
 
Q
T
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
G
E
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
I
 
V
Q
 
L
S
 
S
N
 
D
P
 
P
V
 
K
V
 
V
I
 
V
K
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
D
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
29% identity, 98% coverage: 1:251/255 of query aligns to 2:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
M
 
M
P
 
E
L
 
I
L
 
L
E
 
R
M
 
T
K
 
E
G
 
N
V
 
I
T
 
V
Q
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
Q
 
K
A
 
A
V
 
L
S
 
D
D
 
G
F
 
V
N
 
S
I
 
I
S
 
S
L
 
V
E
 
C
E
 
K
R
 
G
K
 
D
L
 
V
I
 
T
A
 
L
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
N
L
 
V
V
 
I
S
 
T
G
 
G
F
 
F
Y
 
L
Q
 
K
P
 
A
T
 
D
E
 
E
G
 
G
Q
 
R
I
 
V
I
 
Y
F
 
F
D
 
E
G
 
N
K
 
K
P
 
D
T
 
I
A
 
T
G
 
N
L
 
K
R
 
E
P
 
P
H
 
A
Q
 
E
V
 
L
T
 
Y
A
 
H
R
 
Y
G
 
G
I
 
I
A
 
V
R
 
R
T
 
T
F
 
F
Q
 
Q
N
 
T
I
 
P
R
 
Q
L
 
P
W
 
L
H
 
K
E
 
E
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
E
N
 
N
I
 
L
R
 
L
I
 
I
A
 
G
Q
 
E
H
 
I
H
 
N
R
 
P
L
 
-
G
 
G
Y
 
E
T
 
S
I
 
P
W
 
L
D
 
N
A
 
S
F
 
L
L
 
F
R
 
Y
T
 
K
G
 
K
R
 
W
F
 
I
T
 
P
R
 
K
S
 
E
E
 
E
G
 
E
N
 
M
I
 
V
D
 
E
T
 
K
I
 
-
A
 
A
W
 
F
E
 
K
M
 
I
L
 
L
E
 
E
A
 
F
M
 
L
D
 
K
L
 
L
K
 
S
D
 
H
A
 
L
A
 
Y
H
 
D
E
 
R
L
 
K
P
 
A
R
 
G
N
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
M
R
 
K
R
 
L
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
M
I
 
T
R
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
A
S
 
P
A
 
G
D
 
L
V
 
A
D
 
H
G
 
D
L
 
I
I
 
F
K
 
N
L
 
H
I
 
V
R
 
L
W
 
E
I
 
L
H
 
K
D
 
A
E
 
K
F
 
-
D
 
G
I
 
I
A
 
T
I
 
F
W
 
L
M
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
Q
 
R
M
 
L
K
 
D
V
 
I
V
 
V
M
 
L
S
 
N
L
 
Y
C
 
I
E
 
D
W
 
H
I
 
L
K
 
Y
V
 
V
I
 
M
D
 
F
F
 
N
G
 
G
S
 
Q
T
 
I
I
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
T
 
R
P
 
G
E
 
E
E
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
N
I
 
V
Q
 
L
S
 
S
N
 
D
P
 
P
V
 
K
V
 
V
I
 
V
K
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
30% identity, 98% coverage: 3:252/255 of query aligns to 2:236/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
L
 
I
L
 
L
E
 
K
M
 
A
K
 
Q
G
 
H
V
 
L
T
 
A
Q
 
K
R
 
S
F
 
Y
G
 
K
G
 
K
L
 
R
Q
 
K
A
 
V
V
 
V
S
 
S
D
 
D
F
 
V
N
 
S
I
 
L
S
 
Q
L
 
V
E
 
E
E
 
S
R
 
G
K
 
Q
L
 
I
I
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
V
 
S
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
V
 
I
S
 
V
G
 
G
F
 
L
Y
 
V
Q
 
A
P
 
R
T
 
D
E
 
E
G
 
G
Q
 
T
I
 
I
I
 
T
F
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
N
P
 
D
T
 
I
A
 
S
G
 
I
L
 
L
R
 
P
P
 
M
H
 
H
Q
 
S
V
 
R
T
 
S
A
 
R
R
 
M
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
R
 
S
L
 
I
W
 
F
H
 
R
E
 
K
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
E
D
 
D
N
 
N
I
 
I
R
 
M
I
 
-
A
 
-
Q
 
-
H
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
A
F
 
V
L
 
L
R
 
Q
T
 
T
G
 
R
R
 
E
F
 
E
T
 
L
R
 
T
S
 
H
E
|
E
G
 
E
N
 
R
I
 
Q
D
|
D
T
 
K
I
 
L
A
 
-
W
 
E
E
 
D
M
 
L
L
 
L
E
 
E
A
 
E
M
 
F
D
 
H
L
 
I
K
 
Q
D
 
H
A
 
I
A
 
R
H
 
K
E
 
S
L
 
A
P
 
G
R
 
M
N
 
A
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
A
I
 
A
R
 
N
P
 
P
K
 
Q
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
S
 
P
A
 
I
D
 
S
V
 
V
D
 
I
G
 
D
L
 
I
I
 
K
K
 
K
L
 
I
I
 
I
R
 
E
W
 
H
I
 
L
H
 
R
D
 
D
E
 
R
F
 
-
D
 
G
I
 
L
A
 
G
I
 
V
W
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
Q
 
N
M
 
V
K
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
S
 
D
L
 
V
C
 
C
E
 
E
W
 
K
I
 
A
K
 
Y
V
 
I
I
 
V
D
 
S
F
 
Q
G
 
G
S
 
R
T
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
E
 
D
I
 
V
Q
 
L
S
 
N
N
 
N
P
 
E
V
 
Q
V
 
V
I
 
K
K
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
E

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
31% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:237/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
L
 
L
E
 
T
M
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
L
T
 
A
Q
 
K
R
 
A
F
 
Y
G
 
K
G
 
G
L
 
R
Q
 
R
A
 
V
V
 
V
S
 
E
D
 
D
F
 
V
N
 
S
I
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
N
E
 
S
R
 
G
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
Q
 
P
P
 
R
T
 
D
E
 
A
G
 
G
Q
 
N
I
 
I
I
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
D
P
 
D
T
 
I
A
 
S
G
 
L
L
 
L
R
 
P
P
 
L
H
 
H
Q
 
A
V
 
R
T
 
A
A
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
R
 
S
L
 
I
W
 
F
H
x
R
E
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
M
I
 
A
A
 
V
Q
 
-
H
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
L
T
 
Q
I
 
I
W
 
R
D
 
D
A
 
D
F
 
L
L
 
S
R
 
A
T
 
E
G
 
Q
R
 
R
F
 
E
T
 
D
R
 
R
S
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
A
W
 
N
E
 
E
M
 
L
L
 
M
E
 
E
A
 
E
M
 
F
D
 
H
L
 
I
K
 
E
D
 
H
A
 
L
A
 
R
H
 
D
E
 
S
L
x
M
P
x
G
R
x
Q
N
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
A
I
 
A
R
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
S
 
P
A
 
I
D
 
S
V
 
V
D
 
I
G
 
D
L
 
I
I
 
K
K
 
R
L
 
I
I
 
I
R
 
E
W
 
H
I
 
L
H
 
R
D
 
D
E
 
S
F
 
-
D
 
G
I
 
L
A
 
G
I
 
V
W
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
Q
 
N
M
 
V
K
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
S
 
A
L
 
V
C
 
C
E
 
E
W
 
R
I
 
A
K
 
Y
V
 
I
I
 
V
D
 
S
F
 
Q
G
 
G
S
 
H
T
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
S
 
Q
N
 
D
P
 
E
V
 
H
V
 
V
I
 
K
K
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
E
D
 
D

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
31% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 3:237/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
L
 
L
E
 
T
M
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
L
T
 
A
Q
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
Q
 
R
A
 
V
V
 
V
S
 
E
D
 
D
F
 
V
N
 
S
I
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
N
E
 
S
R
 
G
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
Q
 
P
P
 
R
T
 
D
E
 
A
G
 
G
Q
 
N
I
 
I
I
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
D
P
 
D
T
 
I
A
 
S
G
 
L
L
 
L
R
 
P
P
 
L
H
 
H
Q
 
A
V
 
R
T
 
A
A
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
N
 
E
I
 
A
R
 
S
L
 
I
W
 
F
H
 
R
E
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
M
I
 
A
A
 
V
Q
 
-
H
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
L
T
 
Q
I
 
I
W
 
R
D
 
D
A
 
D
F
 
L
L
 
S
R
 
A
T
 
E
G
 
Q
R
 
R
F
 
E
T
 
D
R
 
R
S
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
A
W
 
N
E
 
E
M
 
L
L
 
M
E
 
E
A
 
E
M
 
F
D
 
H
L
 
I
K
 
E
D
 
H
A
 
L
A
 
R
H
 
D
E
 
S
L
 
M
P
 
G
R
 
Q
N
x
S
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
L
x
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
A
I
 
A
R
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
S
 
P
A
 
I
D
 
S
V
 
V
D
 
I
G
 
D
L
 
I
I
 
K
K
 
R
L
 
I
I
 
I
R
 
E
W
 
H
I
 
L
H
 
R
D
 
D
E
 
S
F
 
-
D
 
G
I
 
L
A
 
G
I
 
V
W
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
Q
 
N
M
 
V
K
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
S
 
A
L
 
V
C
 
C
E
 
E
W
 
R
I
 
A
K
 
Y
V
 
I
I
 
V
D
 
S
F
 
Q
G
 
G
S
 
H
T
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
S
 
Q
N
 
D
P
 
E
V
 
H
V
 
V
I
 
K
K
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
E
D
 
D

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
30% identity, 98% coverage: 4:253/255 of query aligns to 4:238/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
L
 
L
E
 
T
M
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
L
T
 
A
Q
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
Q
 
R
A
x
V
V
 
V
S
 
E
D
 
D
F
 
V
N
 
S
I
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
N
E
 
S
R
 
G
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
Q
 
P
P
 
R
T
 
D
E
 
A
G
 
G
Q
 
N
I
 
I
I
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
D
P
 
D
T
 
I
A
 
S
G
 
L
L
 
L
R
 
P
P
 
L
H
 
H
Q
 
A
V
 
R
T
 
A
A
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
R
 
S
L
 
I
W
 
F
H
 
R
E
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
M
I
 
A
A
 
V
Q
 
-
H
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
L
T
 
Q
I
 
I
W
 
R
D
 
D
A
 
D
F
 
L
L
 
S
R
 
A
T
 
E
G
 
Q
R
 
R
F
 
E
T
 
D
R
 
R
S
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
A
W
 
N
E
 
E
M
 
L
L
 
M
E
 
E
A
 
E
M
 
F
D
 
H
L
 
I
K
 
E
D
 
H
A
 
L
A
 
R
H
 
D
E
 
S
L
 
M
P
 
G
R
 
Q
N
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
A
I
 
A
R
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
S
 
P
A
 
I
D
 
S
V
 
V
D
 
I
G
 
D
L
 
I
I
 
K
K
 
R
L
 
I
I
 
I
R
 
E
W
 
H
I
 
L
H
 
R
D
 
D
E
 
S
F
 
-
D
 
G
I
 
L
A
 
G
I
 
V
W
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
Q
 
N
M
 
V
K
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
S
 
A
L
 
V
C
 
C
E
 
E
W
 
R
I
 
A
K
 
Y
V
 
I
I
 
V
D
 
S
F
 
Q
G
 
G
S
 
H
T
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
S
 
Q
N
 
D
P
 
E
V
 
H
V
 
V
I
 
K
K
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
E
D
 
D

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
32% identity, 86% coverage: 23:241/255 of query aligns to 20:228/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
N
 
N
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
N
E
 
I
R
 
R
K
 
R
-
 
G
-
 
Q
L
 
I
I
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
L
V
 
I
S
 
G
G
 
G
F
 
Q
Y
 
L
Q
 
V
P
 
P
T
 
D
E
 
Q
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
I
 
L
F
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
D
T
 
I
A
 
A
G
 
Q
L
 
M
-
 
S
R
 
R
P
 
Q
H
 
E
Q
 
L
V
 
F
T
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
A
-
 
R
I
 
M
A
 
G
R
 
M
T
 
L
F
 
F
Q
|
Q
N
 
S
I
 
G
R
 
A
L
 
L
W
 
F
H
 
T
E
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
R
 
A
-
 
F
-
 
P
I
 
I
A
 
R
Q
 
A
H
 
H
H
 
T
R
 
K
L
 
L
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
S
E
 
E
G
 
N
N
 
L
I
 
I
D
 
A
T
 
E
I
 
L
A
 
V
W
 
A
E
 
L
M
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
S
M
 
V
D
 
G
L
 
L
K
 
R
D
 
G
A
 
T
A
 
E
H
 
Q
E
 
L
L
 
M
P
 
P
R
 
T
N
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
N
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
I
S
 
A
I
 
L
R
 
D
P
 
P
K
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
N
 
D
S
 
P
A
 
I
D
 
V
V
 
K
D
 
G
G
 
V
L
 
L
I
 
T
K
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
W
 
S
I
 
L
H
 
R
D
 
E
E
 
A
F
 
L
D
 
D
I
 
L
A
 
T
I
 
T
W
 
I
M
 
I
I
 
V
E
 
S
H
|
H
Q
 
D
M
 
V
K
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
S
 
S
L
 
I
C
 
A
E
 
D
W
 
Y
I
 
I
K
 
Y
V
 
V
I
 
V
D
 
A
F
 
E
G
 
G
S
 
K
T
 
I
I
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
L
Q
 
Q
S
 
A

Sites not aligning to the query:

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
32% identity, 86% coverage: 23:241/255 of query aligns to 22:230/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
N
 
N
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
N
E
 
I
R
 
R
K
 
R
-
 
G
-
 
Q
L
 
I
I
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
T
 
T
T
 
T
V
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
L
V
 
I
S
 
G
G
 
G
F
 
Q
Y
 
L
Q
 
V
P
 
P
T
 
D
E
 
Q
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
I
 
L
F
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
D
T
 
I
A
 
A
G
 
Q
L
 
M
-
 
S
R
 
R
P
 
Q
H
 
E
Q
 
L
V
 
F
T
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
A
-
 
R
I
 
M
A
 
G
R
 
M
T
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
G
R
 
A
L
 
L
W
 
F
H
 
T
E
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
R
 
A
-
 
F
-
 
P
I
 
I
A
 
R
Q
 
A
H
 
H
H
 
T
R
 
K
L
 
L
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
S
E
 
E
G
 
N
N
 
L
I
 
I
D
 
A
T
 
E
I
 
L
A
 
V
W
 
A
E
 
L
M
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
S
M
 
V
D
 
G
L
 
L
K
 
R
D
 
G
A
 
T
A
 
E
H
 
Q
E
 
L
L
 
M
P
 
P
R
 
T
N
x
E
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
L
x
M
Q
 
N
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
I
S
 
A
I
 
L
R
 
D
P
 
P
K
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
N
 
D
S
 
P
A
 
I
D
 
V
V
 
K
D
 
G
G
 
V
L
 
L
I
 
T
K
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
W
 
S
I
 
L
H
 
R
D
 
E
E
 
A
F
 
L
D
 
D
I
 
L
A
 
T
I
 
T
W
 
I
M
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
Q
 
D
M
 
V
K
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
S
 
S
L
 
I
C
 
A
E
 
D
W
 
Y
I
 
I
K
 
Y
V
 
V
I
 
V
D
 
A
F
 
E
G
 
G
S
 
K
T
 
I
I
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
L
Q
 
Q
S
 
A

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
32% identity, 86% coverage: 23:241/255 of query aligns to 22:230/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
N
 
N
I
 
I
S
 
S
L
 
L
E
 
N
E
 
I
R
 
R
K
 
R
-
 
G
-
 
Q
L
 
I
I
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
L
F
 
L
N
 
R
L
 
L
V
 
I
S
 
G
G
 
G
F
 
Q
Y
 
L
Q
 
V
P
 
P
T
 
D
E
 
Q
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
I
 
L
F
 
L
D
 
D
G
 
G
K
 
K
P
 
D
T
 
I
A
 
A
G
 
Q
L
 
M
-
 
S
R
 
R
P
 
Q
H
 
E
Q
 
L
V
 
F
T
 
A
A
 
A
R
 
R
G
 
A
-
 
R
I
 
M
A
 
G
R
 
M
T
 
L
F
 
F
Q
 
Q
N
 
S
I
 
G
R
 
A
L
 
L
W
 
F
H
 
T
E
 
D
M
 
M
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
V
R
 
A
-
 
F
-
 
P
I
 
I
A
 
R
Q
 
A
H
 
H
H
 
T
R
 
K
L
 
L
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
S
E
 
E
G
 
N
N
 
L
I
 
I
D
 
A
T
 
E
I
 
L
A
 
V
W
 
A
E
 
L
M
 
K
L
 
L
E
 
E
A
 
S
M
 
V
D
 
G
L
 
L
K
 
R
D
 
G
A
 
T
A
 
E
H
 
Q
E
 
L
L
 
M
P
 
P
R
 
T
N
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
M
Q
 
N
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
I
S
 
A
I
 
L
R
 
D
P
 
P
K
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
Q
N
 
D
S
 
P
A
 
I
D
 
V
V
 
K
D
 
G
G
 
V
L
 
L
I
 
T
K
 
R
L
 
L
I
 
I
R
 
R
W
 
S
I
 
L
H
 
R
D
 
E
E
 
A
F
 
L
D
 
D
I
 
L
A
 
T
I
 
T
W
 
I
M
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
Q
 
D
M
 
V
K
 
P
V
 
E
V
 
T
M
 
L
S
 
S
L
 
I
C
 
A
E
 
D
W
 
Y
I
 
I
K
 
Y
V
 
V
I
 
V
D
 
A
F
 
E
G
 
G
S
 
K
T
 
I
I
 
Q
A
 
G
E
 
E
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
L
Q
 
Q
S
 
A

Sites not aligning to the query:

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
31% identity, 97% coverage: 4:251/255 of query aligns to 3:235/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
L
 
L
E
 
T
M
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
L
T
 
A
Q
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
 
R
Q
 
R
A
 
V
V
 
V
S
 
E
D
 
D
F
 
V
N
 
S
I
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
N
E
 
S
R
 
G
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
Q
 
P
P
 
R
T
 
D
E
 
A
G
 
G
Q
 
N
I
 
I
I
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
D
P
 
D
T
 
I
A
 
S
G
 
L
L
 
L
R
 
P
P
 
L
H
 
H
Q
 
A
V
 
R
T
 
A
A
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
N
 
E
I
 
A
R
 
S
L
 
I
W
 
F
H
 
R
E
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
M
I
 
A
A
 
V
Q
 
-
H
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
L
T
 
Q
I
 
I
W
 
R
D
 
D
A
 
D
F
 
L
L
 
S
R
 
A
T
 
E
G
 
Q
R
 
R
F
 
E
T
 
D
R
 
R
S
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
A
W
 
N
E
 
E
M
 
L
L
 
M
E
 
E
A
 
E
M
 
F
D
 
H
L
 
I
K
 
E
D
 
H
A
 
L
A
 
R
H
 
D
E
 
S
L
 
M
P
 
G
R
 
Q
N
x
S
L
 
L
P
x
S
Y
x
G
G
|
G
L
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
A
I
 
A
R
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
|
G
L
 
V
N
 
D
S
 
P
A
 
I
D
 
S
V
 
V
D
 
I
G
 
D
L
 
I
I
 
K
K
 
R
L
 
I
I
 
I
R
 
E
W
 
H
I
 
L
H
 
R
D
 
D
E
 
S
F
 
-
D
 
G
I
 
L
A
 
G
I
 
V
W
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
|
H
Q
 
N
M
 
V
K
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
S
 
A
L
 
V
C
 
C
E
 
E
W
 
R
I
 
A
K
 
Y
V
 
I
I
 
V
D
 
S
F
 
Q
G
 
G
S
 
H
T
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
S
 
Q
N
 
D
P
 
E
V
 
H
V
 
V
I
 
K
K
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

6b89A E. Coli lptb in complex with adp and novobiocin (see paper)
30% identity, 97% coverage: 4:250/255 of query aligns to 3:234/234 of 6b89A

query
sites
6b89A
L
 
L
E
 
T
M
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
L
T
 
A
Q
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
Q
 
R
A
x
V
V
 
V
S
 
E
D
 
D
F
 
V
N
 
S
I
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
N
E
 
S
R
 
G
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
Q
 
P
P
 
R
T
 
D
E
 
A
G
 
G
Q
 
N
I
 
I
I
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
D
P
 
D
T
 
I
A
 
S
G
 
L
L
 
L
R
 
P
P
x
L
H
|
H
Q
 
A
V
 
R
T
 
A
A
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
x
P
Q
|
Q
N
 
E
I
x
A
R
x
S
L
 
I
W
x
F
H
x
R
E
x
R
M
x
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
M
I
 
A
A
x
V
Q
 
-
H
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
L
T
 
Q
I
 
I
W
 
R
D
 
D
A
 
D
F
 
L
L
 
S
R
 
A
T
 
E
G
 
Q
R
 
R
F
 
E
T
 
D
R
 
R
S
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
A
W
 
N
E
 
E
M
 
L
L
 
M
E
 
E
A
 
E
M
 
F
D
 
H
L
 
I
K
 
E
D
 
H
A
 
L
A
 
R
H
 
D
E
 
S
L
 
M
P
 
G
R
x
Q
N
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
|
R
A
 
A
M
 
L
S
 
A
I
 
A
R
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
S
 
P
A
 
I
D
 
S
V
 
V
D
 
I
G
 
D
L
 
I
I
 
K
K
 
R
L
 
I
I
 
I
R
 
E
W
 
H
I
 
L
H
 
R
D
 
D
E
 
S
F
 
-
D
 
G
I
 
L
A
 
G
I
 
V
W
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
Q
 
N
M
 
V
K
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
S
 
A
L
 
V
C
 
C
E
 
E
W
 
R
I
 
A
K
 
Y
V
 
I
I
 
V
D
 
S
F
 
Q
G
 
G
S
 
H
T
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
S
 
Q
N
 
D
P
 
E
V
 
H
V
 
V
I
 
K
K
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

4p31A Crystal structure of a selenomethionine derivative of e. Coli lptb in complex with adp-magensium (see paper)
30% identity, 97% coverage: 4:250/255 of query aligns to 3:234/234 of 4p31A

query
sites
4p31A
L
 
L
E
 
T
M
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
L
T
 
A
Q
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
Q
 
R
A
x
V
V
 
V
S
 
E
D
 
D
F
 
V
N
 
S
I
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
N
E
 
S
R
 
G
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
Q
 
P
P
 
R
T
 
D
E
 
A
G
 
G
Q
 
N
I
 
I
I
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
D
P
 
D
T
 
I
A
 
S
G
 
L
L
 
L
R
 
P
P
 
L
H
 
H
Q
 
A
V
 
R
T
 
A
A
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
|
Q
N
 
E
I
 
A
R
 
S
L
 
I
W
 
F
H
 
R
E
 
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
M
I
 
A
A
 
V
Q
 
-
H
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
L
T
 
Q
I
 
I
W
 
R
D
 
D
A
 
D
F
 
L
L
 
S
R
 
A
T
 
E
G
 
Q
R
 
R
F
 
E
T
 
D
R
 
R
S
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
A
W
 
N
E
 
E
M
 
L
L
 
M
E
 
E
A
 
E
M
 
F
D
 
H
L
 
I
K
 
E
D
 
H
A
 
L
A
 
R
H
 
D
E
 
S
L
 
M
P
 
G
R
 
Q
N
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
A
I
 
A
R
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
S
 
P
A
 
I
D
 
S
V
 
V
D
 
I
G
 
D
L
 
I
I
 
K
K
 
R
L
 
I
I
 
I
R
 
E
W
 
H
I
 
L
H
 
R
D
 
D
E
 
S
F
 
-
D
 
G
I
 
L
A
 
G
I
 
V
W
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
Q
 
N
M
 
V
K
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
S
 
A
L
 
V
C
 
C
E
 
E
W
 
R
I
 
A
K
 
Y
V
 
I
I
 
V
D
 
S
F
 
Q
G
 
G
S
 
H
T
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
S
 
Q
N
 
D
P
 
E
V
 
H
V
 
V
I
 
K
K
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
29% identity, 95% coverage: 3:243/255 of query aligns to 1:232/343 of P30750

query
sites
P30750
L
 
M
L
 
I
E
 
K
M
 
L
K
 
S
G
 
N
V
 
I
T
 
T
Q
 
K
R
 
V
F
 
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
S
 
N
D
 
N
F
 
V
N
 
S
I
 
L
S
 
H
L
 
V
E
 
P
E
 
A
R
 
G
K
 
Q
L
 
I
I
 
Y
A
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
C
V
 
V
S
 
N
G
 
L
F
 
L
Y
 
E
Q
 
R
P
 
P
T
 
T
E
 
E
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
I
 
L
F
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
P
 
E
T
 
L
A
 
T
G
 
T
L
 
L
R
 
S
P
 
E
H
 
S
Q
 
E
V
 
L
T
 
T
A
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
R
 
N
L
 
L
W
 
L
H
 
S
E
 
S
M
 
R
S
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
I
 
V
R
 
A
I
 
L
A
 
P
Q
 
L
H
 
-
H
 
-
R
 
E
L
 
L
G
 
D
Y
 
N
T
 
T
I
 
P
W
 
K
D
 
D
A
 
E
F
 
V
L
 
K
R
 
R
T
 
-
G
 
-
R
 
R
F
 
V
T
 
T
R
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
W
 
-
E
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
L
M
 
V
D
 
G
L
 
L
K
 
G
D
 
D
A
 
K
A
 
H
H
 
D
E
 
S
L
 
Y
P
 
P
R
 
S
N
 
N
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
A
I
 
S
R
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
S
 
P
A
 
A
D
 
T
V
 
T
D
 
R
G
 
S
L
 
I
I
 
L
K
 
E
L
 
L
I
 
L
R
 
K
W
 
D
I
 
I
H
 
N
D
 
R
E
 
R
F
 
L
D
 
G
I
 
L
A
 
T
I
 
I
W
 
L
M
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
Q
 
E
M
 
M
K
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
K
S
 
R
L
 
I
C
 
C
E
 
D
W
 
C
I
 
V
K
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
S
F
 
N
G
 
G
S
 
E
T
 
L
I
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
E
 
S
E
 
E
I
 
V
Q
 
F
S
 
S
N
 
H
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
30% identity, 96% coverage: 4:249/255 of query aligns to 3:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
L
 
L
E
 
T
M
 
A
K
 
K
G
 
N
V
 
L
T
 
A
Q
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
Q
 
R
A
x
V
V
 
V
S
 
E
D
 
D
F
 
V
N
 
S
I
 
L
S
 
T
L
 
V
E
 
N
E
 
S
R
 
G
K
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
F
N
 
Y
L
 
M
V
 
V
S
 
V
G
 
G
F
 
I
Y
 
V
Q
 
P
P
 
R
T
 
D
E
 
A
G
 
G
Q
 
N
I
 
I
I
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
D
K
 
D
P
 
D
T
 
I
A
 
S
G
 
L
L
 
L
R
 
P
P
 
L
H
 
H
Q
 
A
V
 
R
T
 
A
A
 
R
R
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
G
R
 
Y
T
 
L
F
 
P
Q
 
Q
N
 
E
I
 
A
R
 
S
L
 
I
W
x
F
H
x
R
E
x
R
M
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
L
R
 
M
I
 
A
A
 
V
Q
 
-
H
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
L
T
 
Q
I
 
I
W
 
R
D
 
D
A
 
D
F
 
L
L
 
S
R
 
A
T
 
E
G
 
Q
R
 
R
F
 
E
T
 
D
R
 
R
S
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
A
W
 
N
E
 
E
M
 
L
L
 
M
E
 
E
A
 
E
M
 
F
D
 
H
L
 
I
K
 
E
D
 
H
A
 
L
A
 
R
H
 
D
E
 
S
L
 
M
P
 
G
R
 
Q
N
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
R
R
 
R
R
 
R
V
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
A
I
 
A
R
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
V
N
 
D
S
 
P
A
 
I
D
 
S
V
 
V
D
 
I
G
 
D
L
 
I
I
 
K
K
 
R
L
 
I
I
 
I
R
 
E
W
 
H
I
 
L
H
 
R
D
 
D
E
 
S
F
 
-
D
 
G
I
 
L
A
 
G
I
 
V
W
 
L
M
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
Q
 
N
M
 
V
K
 
R
V
 
E
V
 
T
M
 
L
S
 
A
L
 
V
C
 
C
E
 
E
W
 
R
I
 
A
K
 
Y
V
 
I
I
 
V
D
 
S
F
 
Q
G
 
G
S
 
H
T
 
L
I
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
E
 
E
I
 
I
Q
 
L
S
 
Q
N
 
D
P
 
E
V
 
H
V
 
V
I
 
K
K
 
R
A
 
V
Y
 
Y

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
28% identity, 98% coverage: 3:251/255 of query aligns to 6:238/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
L
 
V
L
 
L
E
 
E
M
 
V
K
 
Q
G
 
S
V
 
L
T
 
H
Q
 
V
R
 
Y
F
x
Y
G
 
G
G
 
A
L
 
I
Q
 
H
A
 
A
V
 
I
S
 
K
D
 
G
F
 
I
N
 
D
I
 
L
S
 
K
L
 
V
E
 
P
E
 
R
R
 
G
K
 
Q
L
 
I
I
 
V
A
 
T
L
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
|
T
T
|
T
V
 
T
F
 
L
N
 
S
L
 
A
V
 
I
S
 
A
G
 
G
F
 
L
Y
 
V
Q
 
R
P
 
A
T
 
Q
E
 
K
G
 
G
Q
 
K
I
 
I
I
 
I
F
 
F
D
 
N
G
 
G
K
 
Q
P
 
D
T
 
I
A
 
T
G
 
N
L
 
K
R
 
P
P
 
A
H
 
H
Q
 
V
V
 
I
T
 
N
A
 
R
R
 
M
G
 
G
I
 
I
A
 
A
R
 
L
T
 
V
F
 
P
Q
x
E
N
 
G
I
 
R
R
 
R
L
 
I
W
 
F
H
 
P
E
 
E
M
 
L
S
 
T
V
 
V
L
 
Y
D
 
E
N
 
N
I
 
L
R
 
M
I
 
M
A
 
G
Q
 
A
H
 
Y
H
 
N
R
 
R
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
T
 
K
R
 
D
S
 
K
E
 
E
G
 
G
N
 
I
I
 
K
D
 
R
T
 
D
I
 
L
A
 
E
W
 
W
E
 
I
M
 
F
L
 
S
E
 
L
A
 
F
M
 
P
D
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
E
A
 
R
A
 
L
H
 
K
E
 
Q
L
 
L
P
 
G
R
 
G
N
 
T
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
E
Q
 
Q
R
 
Q
R
 
M
V
 
L
E
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
M
I
 
S
R
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
L
L
 
L
L
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
A
 
S
A
 
L
G
 
G
L
 
L
N
 
A
S
 
P
A
 
I
D
 
L
V
 
V
D
 
S
G
 
E
L
 
V
I
 
F
K
 
E
L
 
V
I
 
I
R
 
Q
W
 
K
I
 
I
H
 
N
D
 
Q
E
 
E
F
 
-
D
 
G
I
 
T
A
 
T
I
 
I
W
 
L
M
 
L
I
 
V
E
 
E
H
 
Q
Q
 
N
M
 
A
K
 
L
V
 
G
V
 
A
M
 
L
S
 
K
L
 
V
C
 
A
E
 
H
W
 
Y
I
 
G
K
 
Y
V
 
V
I
 
L
D
 
E
F
 
T
G
 
G
S
 
Q
T
 
I
I
 
V
A
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
A
E
 
S
E
 
E
I
 
L
Q
 
L
S
 
D
N
 
N
P
 
E
V
 
M
V
 
V
I
 
R
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
29% identity, 95% coverage: 3:243/255 of query aligns to 2:233/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
L
 
M
L
 
I
E
 
K
M
 
L
K
 
S
G
 
N
V
 
I
T
 
T
Q
 
K
R
 
V
F
|
F
G
 
H
-
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
S
 
N
D
 
N
F
 
V
N
 
S
I
 
L
S
 
H
L
 
V
E
 
P
E
 
A
R
 
G
K
 
Q
L
 
I
I
 
Y
A
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
C
V
 
V
S
 
N
G
 
L
F
 
L
Y
 
E
Q
 
R
P
 
P
T
 
T
E
 
E
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
I
 
L
F
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
P
 
E
T
 
L
A
 
T
G
 
T
L
 
L
R
 
S
P
 
E
H
 
S
Q
 
E
V
 
L
T
 
T
A
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
R
 
N
L
 
L
W
 
L
H
 
S
E
 
S
M
 
R
S
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
I
 
V
R
 
A
I
 
L
A
 
P
Q
 
L
H
 
-
H
 
-
R
 
E
L
 
L
G
 
D
Y
 
N
T
 
T
I
 
P
W
 
K
D
 
D
A
 
E
F
 
V
L
 
K
R
 
R
T
 
-
G
 
-
R
 
R
F
 
V
T
 
T
R
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
W
 
-
E
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
L
M
 
V
D
 
G
L
 
L
K
 
G
D
 
D
A
 
K
A
 
H
H
 
D
E
 
S
L
 
Y
P
 
P
R
 
S
N
 
N
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
A
I
 
S
R
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
S
 
P
A
 
A
D
 
T
V
 
T
D
 
R
G
 
S
L
 
I
I
 
L
K
 
E
L
 
L
I
 
L
R
 
K
W
 
D
I
 
I
H
 
N
D
 
R
E
 
R
F
 
L
D
 
G
I
 
L
A
 
T
I
 
I
W
 
L
M
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
Q
 
E
M
 
M
K
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
K
S
 
R
L
 
I
C
 
C
E
 
D
W
 
C
I
 
V
K
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
S
F
 
N
G
 
G
S
 
E
T
 
L
I
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
E
 
S
E
 
E
I
 
V
Q
 
F
S
 
S
N
 
H
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
29% identity, 95% coverage: 3:243/255 of query aligns to 2:233/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
L
 
M
L
 
I
E
 
K
M
 
L
K
 
S
G
 
N
V
 
I
T
 
T
Q
 
K
R
 
V
F
|
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
S
 
N
D
 
N
F
 
V
N
 
S
I
 
L
S
 
H
L
 
V
E
 
P
E
 
A
R
 
G
K
 
Q
L
 
I
I
 
Y
A
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
C
V
 
V
S
 
N
G
 
L
F
 
L
Y
 
E
Q
 
R
P
 
P
T
 
T
E
 
E
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
I
 
L
F
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
P
 
E
T
 
L
A
 
T
G
 
T
L
 
L
R
 
S
P
 
E
H
 
S
Q
 
E
V
 
L
T
 
T
A
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
R
 
N
L
 
L
W
 
L
H
 
S
E
 
S
M
 
R
S
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
I
 
V
R
 
A
I
 
L
A
 
P
Q
 
L
H
 
-
H
 
-
R
 
E
L
 
L
G
 
D
Y
 
N
T
 
T
I
 
P
W
 
K
D
 
D
A
 
E
F
 
V
L
 
K
R
 
R
T
 
-
G
 
-
R
 
R
F
 
V
T
 
T
R
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
W
 
-
E
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
L
M
 
V
D
 
G
L
 
L
K
 
G
D
 
D
A
 
K
A
 
H
H
 
D
E
 
S
L
 
Y
P
 
P
R
 
S
N
 
N
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
A
I
 
S
R
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
S
 
P
A
 
A
D
 
T
V
 
T
D
 
R
G
 
S
L
 
I
I
 
L
K
 
E
L
 
L
I
 
L
R
 
K
W
 
D
I
 
I
H
 
N
D
 
R
E
 
R
F
 
L
D
 
G
I
 
L
A
 
T
I
 
I
W
 
L
M
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
Q
 
E
M
 
M
K
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
K
S
 
R
L
 
I
C
 
C
E
 
D
W
 
C
I
 
V
K
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
S
F
 
N
G
 
G
S
 
E
T
 
L
I
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
E
 
S
E
 
E
I
 
V
Q
 
F
S
 
S
N
 
H
P
 
P

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
29% identity, 95% coverage: 3:243/255 of query aligns to 2:233/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
L
 
M
L
 
I
E
 
K
M
 
L
K
 
S
G
 
N
V
 
I
T
 
T
Q
 
K
R
 
V
F
|
F
G
 
H
-
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
L
x
I
Q
 
Q
A
 
A
V
 
L
S
 
N
D
 
N
F
 
V
N
 
S
I
 
L
S
 
H
L
 
V
E
 
P
E
 
A
R
 
G
K
 
Q
L
 
I
I
 
Y
A
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
L
F
 
I
N
 
R
L
 
C
V
 
V
S
 
N
G
 
L
F
 
L
Y
 
E
Q
 
R
P
 
P
T
 
T
E
 
E
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
I
 
L
F
 
V
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
P
 
E
T
 
L
A
 
T
G
 
T
L
 
L
R
 
S
P
 
E
H
 
S
Q
 
E
V
 
L
T
 
T
A
 
K
-
 
A
-
 
R
R
 
R
G
 
Q
I
 
I
A
 
G
R
 
M
T
 
I
F
 
F
Q
 
Q
N
 
H
I
 
F
R
 
N
L
 
L
W
 
L
H
 
S
E
 
S
M
 
R
S
 
T
V
 
V
L
 
F
D
 
G
N
 
N
I
 
V
R
 
A
I
 
L
A
 
P
Q
 
L
H
 
-
H
 
-
R
 
E
L
 
L
G
 
D
Y
 
N
T
 
T
I
 
P
W
 
K
D
 
D
A
 
E
F
 
V
L
 
K
R
 
R
T
 
-
G
 
-
R
 
R
F
 
V
T
 
T
R
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
W
 
-
E
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
L
M
 
V
D
 
G
L
 
L
K
 
G
D
 
D
A
 
K
A
 
H
H
 
D
E
 
S
L
 
Y
P
 
P
R
 
S
N
|
N
L
 
L
P
x
S
Y
 
G
G
 
G
L
x
Q
Q
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
A
I
 
S
R
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
S
 
P
A
 
A
D
 
T
V
 
T
D
 
R
G
 
S
L
 
I
I
 
L
K
 
E
L
 
L
I
 
L
R
 
K
W
 
D
I
 
I
H
 
N
D
 
R
E
 
R
F
 
L
D
 
G
I
 
L
A
 
T
I
 
I
W
 
L
M
 
L
I
 
I
E
 
T
H
|
H
Q
 
E
M
 
M
K
 
D
V
 
V
V
 
V
M
 
K
S
 
R
L
 
I
C
 
C
E
 
D
W
 
C
I
 
V
K
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
S
F
 
N
G
 
G
S
 
E
T
 
L
I
 
I
A
 
E
E
 
Q
G
 
D
T
 
T
P
 
V
E
 
S
E
 
E
I
 
V
Q
 
F
S
 
S
N
 
H
P
 
P

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
27% identity, 95% coverage: 1:243/255 of query aligns to 1:229/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
M
 
L
P
 
Q
L
 
M
L
 
I
E
 
D
M
 
V
K
 
H
G
 
Q
V
 
L
T
 
K
Q
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
x
V
V
 
L
S
 
K
D
 
G
F
 
I
N
 
N
I
 
V
S
 
H
L
 
I
E
 
R
E
 
E
R
 
G
K
 
E
L
 
V
I
 
V
A
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
F
F
 
L
N
 
R
L
 
C
V
 
L
S
 
N
G
 
L
F
 
L
Y
 
E
Q
 
D
P
 
F
T
 
D
E
 
E
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
I
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
I
P
 
N
T
 
L
A
 
K
G
 
A
L
 
K
R
 
D
P
 
T
H
 
N
Q
 
L
V
 
N
T
 
K
A
 
V
R
 
R
G
 
E
-
 
E
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
R
I
 
F
R
 
N
L
 
L
W
 
F
H
 
P
E
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
N
N
 
N
I
 
I
R
 
T
I
 
L
A
 
A
Q
 
P
H
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
M
R
 
K
T
 
V
G
 
R
R
 
K
F
 
W
T
 
P
R
 
R
S
 
E
E
 
K
G
 
A
N
 
-
I
 
-
D
 
E
T
 
A
I
 
K
A
 
A
W
 
M
E
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
D
A
 
K
M
 
V
D
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
A
L
 
Y
P
 
P
R
 
D
N
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
A
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
A
I
 
M
R
 
E
P
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
S
 
P
A
 
E
D
 
M
V
 
V
D
 
G
G
 
E
L
 
V
I
 
L
K
 
S
L
 
V
I
 
M
R
 
K
W
 
Q
I
 
L
H
 
A
D
 
N
E
 
E
F
 
-
D
 
G
I
 
M
A
 
T
I
 
M
W
 
V
M
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
Q
 
E
M
 
M
K
 
G
V
 
F
V
 
A
M
 
R
S
 
E
L
 
V
C
 
G
E
 
D
W
 
R
I
 
V
K
 
L
V
 
F
I
 
M
D
 
D
F
 
G
G
 
G
S
 
Y
T
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
L
Q
 
F
S
 
D
N
 
R
P
 
P

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
27% identity, 95% coverage: 1:243/255 of query aligns to 1:229/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
M
 
L
P
 
Q
L
 
M
L
 
I
E
 
D
M
 
V
K
 
H
G
 
Q
V
 
L
T
 
K
Q
 
K
R
 
S
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
x
V
V
 
L
S
 
K
D
 
G
F
 
I
N
 
N
I
 
V
S
 
H
L
 
I
E
 
R
E
 
E
R
 
G
K
 
E
L
 
V
I
 
V
A
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
T
x
S
T
|
T
V
 
F
F
 
L
N
 
R
L
 
C
V
 
L
S
 
N
G
 
L
F
 
L
Y
 
E
Q
 
D
P
 
F
T
 
D
E
 
E
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
I
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
G
K
 
I
P
 
N
T
 
L
A
 
K
G
 
A
L
 
K
R
 
D
P
 
T
H
 
N
Q
 
L
V
 
N
T
 
K
A
 
V
R
 
R
G
 
E
-
 
E
I
 
V
A
 
G
R
 
M
T
 
V
F
 
F
Q
 
Q
N
 
R
I
 
F
R
 
N
L
 
L
W
 
F
H
 
P
E
 
H
M
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
D
 
N
N
 
N
I
 
I
R
 
T
I
 
L
A
 
A
Q
 
P
H
 
-
H
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
Y
 
-
T
 
-
I
 
-
W
 
-
D
 
-
A
 
-
F
 
-
L
 
M
R
 
K
T
 
V
G
 
R
R
 
K
F
 
W
T
 
P
R
 
R
S
 
E
E
 
K
G
 
A
N
 
-
I
 
-
D
 
E
T
 
A
I
 
K
A
 
A
W
 
M
E
 
E
M
 
L
L
 
L
E
 
D
A
 
K
M
 
V
D
 
G
L
 
L
K
 
K
D
 
D
A
 
K
A
 
A
H
 
H
E
 
A
L
 
Y
P
 
P
R
 
D
N
 
S
L
 
L
P
 
S
Y
 
G
G
 
G
L
 
Q
Q
 
A
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
M
 
L
S
 
A
I
 
M
R
 
E
P
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
N
 
D
S
 
P
A
 
E
D
 
M
V
 
V
D
 
G
G
 
E
L
 
V
I
 
L
K
 
S
L
 
V
I
 
M
R
 
K
W
 
Q
I
 
L
H
 
A
D
 
N
E
 
E
F
 
-
D
 
G
I
 
M
A
 
T
I
 
M
W
 
V
M
 
V
I
 
V
E
 
T
H
 
H
Q
 
E
M
 
M
K
 
G
V
 
F
V
 
A
M
 
R
S
 
E
L
 
V
C
 
G
E
 
D
W
 
R
I
 
V
K
 
L
V
 
F
I
 
M
D
 
D
F
 
G
G
 
G
S
 
Y
T
 
I
I
 
I
A
 
E
E
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
L
Q
 
F
S
 
D
N
 
R
P
 
P

Query Sequence

>8500413 FitnessBrowser__Miya:8500413
MPLLEMKGVTQRFGGLQAVSDFNISLEERKLIALIGPNGAGKTTVFNLVSGFYQPTEGQI
IFDGKPTAGLRPHQVTARGIARTFQNIRLWHEMSVLDNIRIAQHHRLGYTIWDAFLRTGR
FTRSEGNIDTIAWEMLEAMDLKDAAHELPRNLPYGLQRRVEIARAMSIRPKLLLLDEPAA
GLNSADVDGLIKLIRWIHDEFDIAIWMIEHQMKVVMSLCEWIKVIDFGSTIAEGTPEEIQ
SNPVVIKAYLGDDTI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory