SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8500677 FitnessBrowser__Miya:8500677 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6pnzA The structure of the aspartate transcarbamoylase trimer from staphylococcus aureus complexed with pala at 2.27 resolution.
40% identity, 90% coverage: 14:306/325 of query aligns to 4:288/293 of 6pnzA

query
sites
6pnzA
L
 
L
L
 
L
D
 
S
V
 
M
T
 
E
Q
 
H
L
 
L
T
 
S
R
 
T
A
 
D
E
 
Q
L
 
I
F
 
Y
H
 
K
L
 
L
L
 
I
D
 
Q
T
 
K
A
 
A
A
 
S
Q
 
Q
F
 
F
H
 
-
D
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
K
R
 
S
P
 
G
V
 
E
K
 
R
K
 
Q
V
 
L
P
 
P
T
 
N
L
 
F
K
 
E
G
 
G
K
 
K
S
 
Y
V
 
V
V
 
A
L
 
N
F
 
L
F
 
F
A
 
F
E
 
E
P
 
N
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
K
 
K
T
 
C
S
 
S
F
 
F
D
 
E
V
 
M
A
 
A
G
 
E
K
 
L
R
 
K
L
 
L
S
 
G
A
 
L
D
 
K
T
 
T
F
 
I
S
 
S
L
 
F
A
 
E
K
 
T
S
 
S
G
 
T
S
 
S
S
|
S
L
 
V
S
 
S
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
C
L
 
K
T
 
T
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
M
 
I
T
 
G
P
 
C
D
 
D
I
 
L
I
 
L
V
 
V
I
 
I
R
|
R
H
 
H
S
 
P
S
 
F
S
 
N
G
 
N
A
 
Y
A
 
Y
Q
 
E
F
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
-
R
 
N
L
 
I
D
 
N
C
 
I
S
 
P
V
 
I
V
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
S
H
 
G
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
L
Y
 
M
S
 
T
L
 
I
R
 
Y
Q
 
E
V
 
E
W
 
Y
G
 
G
D
 
-
T
 
Y
F
 
F
E
 
E
G
 
G
R
 
L
T
 
N
L
 
V
L
 
L
I
 
I
L
 
C
G
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
K
H
 
N
S
 
S
R
|
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
N
 
N
V
 
Y
H
 
H
L
 
S
L
 
L
S
 
K
S
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
A
K
 
N
V
 
V
R
 
M
L
 
F
C
 
N
A
 
S
P
 
P
R
 
N
T
 
A
L
 
W
L
 
I
P
 
D
A
 
D
G
 
S
V
 
L
H
 
E
N
 
A
W
 
P
P
 
Y
V
 
V
T
 
N
I
 
I
F
 
-
N
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
D
D
 
D
A
 
V
V
 
I
Q
 
E
G
 
T
V
 
V
D
 
D
A
 
I
V
 
V
M
 
M
C
 
L
L
 
L
R
|
R
L
 
I
Q
|
Q
L
 
H
E
 
E
R
 
R
Q
 
H
Q
 
-
A
 
-
G
 
G
L
 
L
L
 
A
P
 
E
D
 
E
L
 
T
R
 
R
-
 
F
-
 
A
-
 
A
-
 
D
E
 
D
Y
 
Y
A
 
H
Q
 
Q
R
 
K
F
 
H
C
 
G
L
 
L
S
 
N
P
 
E
R
 
V
H
 
R
L
 
Y
T
 
N
M
 
K
A
 
L
A
 
Q
P
 
E
S
 
H
A
 
A
R
 
I
V
 
V
L
 
M
H
 
H
P
 
P
G
x
A
P
 
P
M
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
Q
S
 
S
V
 
D
L
 
L
A
 
V
D
 
E
A
 
A
P
 
S
E
 
K
S
 
S
L
 
R
I
 
I
L
 
F
D
 
K
Q
 
Q
V
 
M
A
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
Y
T
 
L
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
V
L
 
I

4bjhB Crystal structure of the aquifex reactor complex formed by dihydroorotase (h180a, h232a) with dihydroorotate and aspartate transcarbamoylase with n-(phosphonacetyl)-l-aspartate (pala) (see paper)
36% identity, 92% coverage: 12:311/325 of query aligns to 2:291/291 of 4bjhB

query
sites
4bjhB
K
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
I
D
 
S
V
 
S
T
 
L
Q
 
D
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
E
H
 
E
L
 
I
L
 
L
D
 
K
T
 
Y
A
 
A
A
 
K
Q
 
E
F
 
F
H
 
K
D
 
E
I
 
G
N
 
K
R
 
E
R
 
E
P
 
T
V
 
I
K
 
K
K
 
A
V
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
K
 
-
S
 
S
V
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
F
 
F
A
 
S
E
 
E
P
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
K
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
D
 
E
V
 
K
A
 
A
G
 
A
K
 
R
R
 
E
L
 
L
S
 
G
A
 
I
D
 
E
T
 
T
F
 
Y
S
 
L
L
 
V
A
 
S
K
 
G
S
 
S
G
 
E
S
 
S
S
 
S
L
 
T
S
 
V
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
F
K
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
L
L
 
K
T
 
T
L
 
F
Q
 
E
A
 
G
M
 
L
T
 
G
P
 
F
D
 
D
I
 
Y
I
 
V
V
 
V
I
 
F
R
|
R
H
 
V
S
 
P
S
 
F
S
 
V
G
 
F
A
 
F
A
 
P
-
 
Y
Q
 
K
F
 
E
L
 
I
A
 
V
E
 
K
R
 
S
L
 
L
D
 
N
C
 
L
S
 
R
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
T
H
 
H
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
S
Q
|
Q
A
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
C
 
F
Y
 
F
S
 
T
L
 
I
R
 
K
Q
 
E
V
 
H
W
 
F
G
 
G
D
 
E
T
 
V
F
 
K
E
 
D
G
 
L
R
 
R
T
 
V
L
 
L
L
 
Y
I
 
V
L
 
-
G
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
K
H
 
H
S
 
S
R
|
R
V
|
V
A
 
F
R
 
R
S
 
S
N
 
G
V
 
A
H
 
P
L
 
L
L
 
L
S
 
N
S
 
M
L
 
F
G
 
G
V
 
A
K
 
K
V
 
I
R
 
G
L
 
V
C
 
C
A
 
G
P
 
P
R
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
I
P
 
P
A
 
R
G
 
D
V
 
V
H
 
E
N
 
V
W
 
F
P
 
K
V
 
V
T
 
D
I
 
V
F
 
F
N
 
D
R
 
D
L
 
V
D
 
D
D
 
K
A
 
G
V
 
I
Q
 
D
G
 
W
V
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
V
M
 
I
C
 
W
L
 
L
R
|
R
L
 
L
Q
|
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
A
 
E
G
 
N
L
 
Y
L
 
I
P
 
P
D
 
S
L
 
E
R
 
S
E
 
S
Y
 
Y
A
 
F
Q
 
K
R
 
Q
F
 
F
C
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
K
R
 
E
H
 
R
L
 
F
T
 
E
M
 
K
A
 
V
A
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
K
R
 
L
V
 
Y
L
 
M
H
 
H
P
 
P
G
|
G
P
 
P
M
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
N
L
 
V
E
 
D
I
 
I
S
 
D
S
 
H
V
 
E
L
 
L
A
 
V
D
 
Y
A
 
T
P
 
E
E
 
K
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
Q
D
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
K
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
P
T
 
V
R
 
R
M
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
Y
F
 
K
L
 
F
L
 
L
A
 
W
T
 
T

3d6nB Crystal structure of aquifex dihydroorotase activated by aspartate transcarbamoylase (see paper)
36% identity, 92% coverage: 12:311/325 of query aligns to 2:291/291 of 3d6nB

query
sites
3d6nB
K
 
R
D
 
S
L
 
L
L
 
I
D
 
S
V
 
S
T
 
L
Q
 
D
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
E
E
 
E
L
 
V
F
 
E
H
 
E
L
 
I
L
 
L
D
 
K
T
 
Y
A
 
A
A
 
K
Q
 
E
F
 
F
H
 
K
D
 
E
I
 
G
N
 
K
R
 
E
R
 
E
P
 
T
V
 
I
K
 
K
K
 
A
V
 
-
P
 
-
T
 
-
L
 
-
K
 
-
G
 
-
K
 
-
S
 
S
V
 
A
V
 
V
L
 
L
F
 
F
F
 
F
A
 
S
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
K
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
D
 
E
V
 
K
A
 
A
G
 
A
K
 
R
R
 
E
L
 
L
S
 
G
A
 
I
D
 
E
T
 
T
F
 
Y
S
 
L
L
 
V
A
 
S
K
 
G
S
 
S
G
 
E
S
 
S
S
 
S
L
 
T
S
 
V
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
F
K
 
F
D
 
D
T
 
T
A
 
L
L
 
K
T
 
T
L
 
F
Q
 
E
A
 
G
M
 
L
T
 
G
P
 
F
D
 
D
I
 
Y
I
 
V
V
 
V
I
 
F
R
|
R
H
 
V
S
 
P
S
 
F
S
 
V
G
 
F
A
 
F
A
 
P
-
 
Y
Q
 
K
F
 
E
L
 
I
A
 
V
E
 
K
R
 
S
L
 
L
D
 
N
C
 
L
S
 
R
V
 
L
V
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
T
H
 
H
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
S
Q
|
Q
A
 
G
L
 
L
L
 
I
D
 
D
C
 
F
Y
 
F
S
 
T
L
 
I
R
 
K
Q
 
E
V
 
H
W
 
F
G
 
G
D
 
E
T
 
V
F
 
K
E
 
D
G
 
L
R
 
R
T
 
V
L
 
L
L
 
Y
I
 
V
L
 
-
G
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
K
H
 
H
S
 
S
R
|
R
V
|
V
A
 
F
R
 
R
S
 
S
N
 
G
V
 
A
H
 
P
L
 
L
L
 
L
S
 
N
S
 
M
L
 
F
G
 
G
V
 
A
K
 
K
V
 
I
R
 
G
L
 
V
C
 
C
A
 
G
P
 
P
R
 
K
T
 
T
L
 
L
L
 
I
P
 
P
A
 
R
G
 
D
V
 
V
H
 
E
N
 
V
W
 
F
P
 
K
V
 
V
T
 
D
I
 
V
F
 
F
N
 
D
R
 
D
L
 
V
D
 
D
D
 
K
A
 
G
V
 
I
Q
 
D
G
 
W
V
 
A
D
 
D
A
 
V
V
 
V
M
 
I
C
 
W
L
 
L
R
|
R
L
 
L
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
K
A
 
E
G
 
N
L
 
Y
L
 
I
P
 
P
D
 
S
L
 
E
R
 
S
E
 
S
Y
 
Y
A
 
F
Q
 
K
R
 
Q
F
 
F
C
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
K
R
 
E
H
 
R
L
 
F
T
 
E
M
 
K
A
 
V
A
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
K
R
 
L
V
 
Y
L
 
M
H
 
H
P
 
P
G
|
G
P
 
P
M
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
N
L
 
V
E
 
D
I
 
I
S
 
D
S
 
H
V
 
E
L
 
L
A
 
V
D
 
Y
A
 
T
P
 
E
E
 
K
S
 
S
L
 
L
I
 
I
L
 
Q
D
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
K
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
P
T
 
V
R
 
R
M
 
K
A
 
A
I
 
I
L
 
Y
F
 
K
L
 
F
L
 
L
A
 
W
T
 
T

P05654 Aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
36% identity, 91% coverage: 12:306/325 of query aligns to 2:285/304 of P05654

query
sites
P05654
K
 
K
D
 
H
L
 
L
L
 
T
D
 
T
V
 
M
T
 
S
Q
 
E
L
 
L
T
 
S
R
 
T
A
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
K
H
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
Q
Q
 
E
F
 
L
H
 
-
D
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
R
 
K
P
 
S
V
 
G
K
 
K
K
 
T
V
 
D
P
 
N
T
 
Q
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
F
V
 
A
V
 
A
L
 
N
F
 
L
F
 
F
A
 
F
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
K
 
R
T
 
F
S
 
S
F
 
F
D
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
E
K
 
K
R
 
K
L
 
L
S
 
G
A
 
M
D
 
N
T
 
V
F
 
L
S
 
N
L
 
L
A
 
D
K
 
G
S
 
T
G
 
S
S
 
T
S
 
S
L
 
V
S
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
K
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
I
L
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
M
 
I
T
 
G
P
 
V
D
 
D
I
 
V
I
 
C
V
 
V
I
 
I
R
 
R
H
 
H
S
 
S
S
 
E
S
 
D
G
 
E
A
 
Y
A
 
Y
Q
 
E
F
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
S
R
 
Q
L
 
V
D
 
N
C
 
I
S
 
P
V
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
C
H
 
G
A
 
Q
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
L
Y
 
M
S
 
T
L
 
I
R
 
Y
Q
 
E
V
 
E
W
 
F
G
 
-
D
 
N
T
 
T
F
 
F
E
 
K
G
 
G
R
 
L
T
 
T
L
 
V
L
 
S
I
 
I
L
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
K
H
 
H
S
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
N
 
N
V
 
A
H
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
T
S
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
A
K
 
R
V
 
V
R
 
L
L
 
F
C
 
S
A
 
G
P
 
P
R
 
S
T
 
E
L
 
W
L
 
Q
P
 
D
A
 
-
G
 
-
V
 
-
H
 
E
N
 
E
W
 
N
P
 
T
V
 
F
T
 
G
I
 
T
F
 
Y
N
 
V
R
 
S
L
 
M
D
 
D
D
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
E
G
 
S
V
 
S
D
 
D
A
 
V
V
 
V
M
 
M
C
 
L
L
 
L
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
L
 
N
E
 
E
R
 
R
Q
 
H
Q
 
Q
A
 
S
G
 
A
L
 
V
L
 
S
P
 
Q
D
 
E
L
 
-
R
 
-
E
 
G
Y
 
Y
A
 
L
Q
 
N
R
 
K
F
 
Y
C
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
V
R
 
E
H
 
R
L
 
A
T
 
E
M
 
R
A
 
M
A
 
K
P
 
R
S
 
H
A
 
A
R
 
I
V
 
I
L
 
M
H
 
H
P
 
P
G
 
A
P
 
P
M
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
D
S
 
D
V
 
S
L
 
L
A
 
V
D
 
E
A
 
S
P
 
E
E
 
K
S
 
S
L
 
R
I
 
I
L
 
F
D
 
K
Q
 
Q
V
 
M
A
 
K
A
 
N
G
 
G
V
 
V
A
 
F
T
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
V
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3r7lA Crystal structure of pala-bound aspartate transcarbamoylase from bacillus subtilis (see paper)
36% identity, 91% coverage: 12:306/325 of query aligns to 2:285/290 of 3r7lA

query
sites
3r7lA
K
 
K
D
 
H
L
 
L
L
 
T
D
 
T
V
 
M
T
 
S
Q
 
E
L
 
L
T
 
S
R
 
T
A
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
K
H
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
Q
Q
 
E
F
 
L
H
 
-
D
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
R
 
K
P
 
S
V
 
G
K
 
K
K
 
T
V
 
D
P
 
N
T
 
Q
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
F
V
 
A
V
 
A
L
 
N
F
 
L
F
 
F
A
 
F
E
 
E
P
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
K
 
R
T
 
F
S
 
S
F
 
F
D
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
E
K
 
K
R
 
K
L
 
L
S
 
G
A
 
M
D
 
N
T
 
V
F
 
L
S
 
N
L
 
L
A
 
D
K
 
G
S
 
T
G
 
S
S
 
T
S
|
S
L
 
V
S
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
K
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
I
L
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
M
 
I
T
 
G
P
 
V
D
 
D
I
 
V
I
 
C
V
 
V
I
 
I
R
|
R
H
 
H
S
 
S
S
 
E
S
 
D
G
 
E
A
 
Y
A
 
Y
Q
 
E
F
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
S
R
 
Q
L
 
V
D
 
N
C
 
I
S
 
P
V
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
C
H
 
G
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
L
Y
 
M
S
 
T
L
 
I
R
 
Y
Q
 
E
V
 
E
W
 
F
G
 
-
D
 
N
T
 
T
F
 
F
E
 
K
G
 
G
R
 
L
T
 
T
L
 
V
L
 
S
I
 
I
L
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
K
H
 
H
S
 
S
R
|
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
N
 
N
V
 
A
H
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
T
S
 
R
L
 
L
G
 
G
V
 
A
K
 
R
V
 
V
R
 
L
L
 
F
C
 
S
A
 
G
P
 
P
R
 
S
T
 
E
L
 
W
L
 
Q
P
 
D
A
 
-
G
 
-
V
 
-
H
 
E
N
 
E
W
 
N
P
 
T
V
 
F
T
 
G
I
 
T
F
 
Y
N
 
V
R
 
S
L
 
M
D
 
D
D
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
E
G
 
S
V
 
S
D
 
D
A
 
V
V
 
V
M
 
M
C
 
L
L
|
L
R
|
R
L
 
I
Q
|
Q
L
 
N
E
 
E
R
 
R
Q
 
H
Q
 
Q
A
 
S
G
 
A
L
 
V
L
 
S
P
 
Q
D
 
E
L
 
-
R
 
-
E
 
G
Y
 
Y
A
 
L
Q
 
N
R
 
K
F
 
Y
C
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
V
R
 
E
H
 
R
L
 
A
T
 
E
M
 
R
A
 
M
A
 
K
P
 
R
S
 
H
A
 
A
R
 
I
V
 
I
L
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
A
P
 
P
M
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
D
S
 
D
V
 
S
L
 
L
A
 
V
D
 
E
A
 
S
P
 
E
E
 
K
S
 
S
L
 
R
I
 
I
L
 
F
D
 
K
Q
 
Q
V
 
M
A
 
K
A
 
N
G
|
G
V
 
V
A
 
F
T
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
V
L
 
I

3r7fA Crystal structure of cp-bound aspartate transcarbamoylase from bacillus subtilis (see paper)
36% identity, 91% coverage: 12:306/325 of query aligns to 2:285/291 of 3r7fA

query
sites
3r7fA
K
 
K
D
 
H
L
 
L
L
 
T
D
 
T
V
 
M
T
 
S
Q
 
E
L
 
L
T
x
S
R
x
T
A
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
K
H
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
x
Q
Q
 
E
F
 
L
H
 
-
D
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
R
x
K
P
 
S
V
 
G
K
 
K
K
 
T
V
 
D
P
 
N
T
 
Q
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
F
V
 
A
V
 
A
L
 
N
F
 
L
F
 
F
A
 
F
E
 
E
P
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
K
 
R
T
 
F
S
 
S
F
 
F
D
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
E
K
 
K
R
 
K
L
 
L
S
 
G
A
 
M
D
 
N
T
 
V
F
 
L
S
 
N
L
 
L
A
 
D
K
 
G
S
 
T
G
 
S
S
 
T
S
 
S
L
 
V
S
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
K
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
I
L
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
M
 
I
T
 
G
P
 
V
D
 
D
I
 
V
I
 
C
V
 
V
I
 
I
R
|
R
H
 
H
S
 
S
S
 
E
S
 
D
G
 
E
A
 
Y
A
 
Y
Q
 
E
F
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
S
R
 
Q
L
 
V
D
 
N
C
 
I
S
 
P
V
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
C
H
 
G
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
L
Y
 
M
S
 
T
L
 
I
R
 
Y
Q
x
E
V
 
E
W
 
F
G
 
-
D
 
N
T
 
T
F
 
F
E
 
K
G
 
G
R
 
L
T
 
T
L
 
V
L
 
S
I
 
I
L
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
K
H
 
H
S
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
N
 
N
V
 
A
H
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
T
S
x
R
L
 
L
G
 
G
V
 
A
K
 
R
V
 
V
R
 
L
L
 
F
C
 
S
A
 
G
P
 
P
R
 
S
T
 
E
L
 
W
L
 
Q
P
 
D
A
 
-
G
 
-
V
 
-
H
 
E
N
 
E
W
 
N
P
 
T
V
 
F
T
 
G
I
 
T
F
 
Y
N
 
V
R
 
S
L
 
M
D
 
D
D
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
E
G
 
S
V
 
S
D
 
D
A
 
V
V
 
V
M
 
M
C
 
L
L
|
L
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
L
 
N
E
 
E
R
 
R
Q
 
H
Q
 
Q
A
 
S
G
 
A
L
 
V
L
 
S
P
 
Q
D
 
E
L
 
-
R
 
-
E
 
G
Y
 
Y
A
 
L
Q
 
N
R
 
K
F
 
Y
C
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
V
R
 
E
H
 
R
L
 
A
T
 
E
M
 
R
A
 
M
A
x
K
P
 
R
S
x
H
A
 
A
R
 
I
V
 
I
L
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
A
P
 
P
M
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
D
S
 
D
V
 
S
L
 
L
A
 
V
D
 
E
A
 
S
P
 
E
E
 
K
S
 
S
L
 
R
I
 
I
L
 
F
D
x
K
Q
 
Q
V
 
M
A
x
K
A
 
N
G
|
G
V
 
V
A
 
F
T
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
V
L
 
I

3r7dA Crystal structure of unliganded aspartate transcarbamoylase from bacillus subtilis (see paper)
36% identity, 91% coverage: 12:306/325 of query aligns to 2:285/291 of 3r7dA

query
sites
3r7dA
K
 
K
D
 
H
L
 
L
L
 
T
D
 
T
V
 
M
T
 
S
Q
 
E
L
 
L
T
x
S
R
x
T
A
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
K
H
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
Q
T
 
T
A
 
A
A
 
Q
Q
 
E
F
 
L
H
 
-
D
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
R
 
K
P
 
S
V
 
G
K
 
K
K
 
T
V
 
D
P
 
N
T
 
Q
L
 
L
K
 
T
G
 
G
K
 
K
S
 
F
V
 
A
V
 
A
L
 
N
F
 
L
F
 
F
A
 
F
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
K
 
R
T
 
F
S
 
S
F
 
F
D
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
E
K
 
K
R
 
K
L
 
L
S
 
G
A
 
M
D
 
N
T
 
V
F
 
L
S
 
N
L
 
L
A
 
D
K
 
G
S
 
T
G
 
S
S
x
T
S
|
S
L
 
V
S
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
K
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
I
L
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
M
 
I
T
 
G
P
 
V
D
 
D
I
 
V
I
 
C
V
 
V
I
 
I
R
|
R
H
 
H
S
 
S
S
 
E
S
 
D
G
 
E
A
 
Y
A
 
Y
Q
 
E
F
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
S
R
 
Q
L
 
V
D
 
N
C
 
I
S
 
P
V
 
I
V
 
L
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
C
H
 
G
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
S
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
L
Y
 
M
S
 
T
L
 
I
R
 
Y
Q
 
E
V
 
E
W
 
F
G
 
-
D
 
N
T
 
T
F
 
F
E
 
K
G
 
G
R
 
L
T
 
T
L
 
V
L
 
S
I
 
I
L
 
H
G
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
K
H
 
H
S
 
S
R
 
R
V
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
S
N
 
N
V
 
A
H
 
E
L
 
V
L
 
L
S
 
T
S
x
R
L
 
L
G
 
G
V
 
A
K
 
R
V
 
V
R
 
L
L
 
F
C
 
S
A
 
G
P
 
P
R
 
S
T
 
E
L
 
W
L
 
Q
P
 
D
A
 
-
G
 
-
V
 
-
H
 
E
N
 
E
W
 
N
P
 
T
V
 
F
T
 
G
I
 
T
F
 
Y
N
 
V
R
 
S
L
 
M
D
 
D
D
 
E
A
 
A
V
 
V
Q
 
E
G
 
S
V
 
S
D
 
D
A
 
V
V
 
V
M
 
M
C
 
L
L
|
L
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
L
 
N
E
 
E
R
 
R
Q
 
H
Q
 
Q
A
 
S
G
 
A
L
 
V
L
 
S
P
 
Q
D
 
E
L
 
-
R
 
-
E
 
G
Y
 
Y
A
 
L
Q
 
N
R
 
K
F
 
Y
C
 
G
L
 
L
S
 
T
P
 
V
R
 
E
H
 
R
L
 
A
T
 
E
M
 
R
A
 
M
A
 
K
P
 
R
S
 
H
A
 
A
R
 
I
V
 
I
L
 
M
H
 
H
P
|
P
G
 
A
P
 
P
M
 
V
N
 
N
R
 
R
G
 
G
L
 
V
E
 
E
I
 
I
S
 
D
S
 
D
V
 
S
L
 
L
A
 
V
D
 
E
A
 
S
P
 
E
E
 
K
S
 
S
L
 
R
I
 
I
L
 
F
D
 
K
Q
 
Q
V
 
M
A
 
K
A
 
N
G
|
G
V
 
V
A
 
F
T
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
V
L
 
I

5g1pA Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to carbamoyl phosphate (see paper)
33% identity, 91% coverage: 12:306/325 of query aligns to 3:285/292 of 5g1pA

query
sites
5g1pA
K
 
Q
D
 
H
L
 
I
L
 
L
D
 
S
V
 
V
T
 
Q
Q
 
Q
L
 
F
T
 
T
R
 
K
A
 
D
E
 
Q
L
 
M
F
 
S
H
 
H
L
 
L
L
 
F
D
 
N
T
 
V
A
 
A
A
 
H
Q
 
T
F
 
L
H
 
R
D
 
M
I
 
M
N
 
V
R
 
Q
R
 
K
P
 
E
V
 
-
K
 
R
K
 
S
V
 
L
P
 
D
T
 
I
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
M
V
 
A
L
 
S
F
 
M
F
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
K
 
S
T
 
S
S
 
S
F
 
F
D
 
A
V
 
A
A
 
A
G
 
M
K
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
A
T
 
V
F
 
L
S
 
S
L
 
F
A
 
S
K
 
E
S
 
A
G
 
T
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
A
D
 
D
T
 
S
A
 
V
L
 
Q
T
 
T
L
 
M
Q
 
S
A
 
C
M
 
Y
T
 
A
P
 
-
D
 
D
I
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
L
R
|
R
H
 
H
S
 
P
S
 
Q
S
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
V
Q
 
E
F
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
K
R
 
H
L
 
C
D
 
R
C
 
R
S
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
V
H
 
G
A
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
I
Y
 
F
S
 
T
L
 
I
R
 
R
Q
 
E
V
 
E
W
 
L
G
 
G
D
 
-
T
 
T
F
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
M
T
 
T
L
 
I
L
 
T
I
 
M
L
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
K
H
 
H
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
N
 
L
V
 
A
H
 
C
L
 
L
L
 
L
S
 
T
S
 
Q
L
 
Y
G
 
R
V
 
V
K
 
S
V
 
L
R
 
R
L
 
Y
C
 
V
A
 
A
P
 
P
R
 
P
T
 
S
L
 
L
-
 
R
L
 
M
P
 
P
A
 
P
G
 
T
V
 
V
H
 
R
N
 
A
W
 
F
P
 
V
V
 
A
T
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
E
I
 
E
F
 
F
N
 
E
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
L
Q
 
P
G
 
D
V
 
T
D
 
D
A
 
V
V
 
L
M
 
Y
C
 
M
L
x
T
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
F
Q
 
Q
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
E
 
-
Y
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
F
 
F
C
 
I
L
 
L
S
 
T
P
 
P
R
 
H
H
 
I
L
 
M
T
 
T
M
 
R
A
 
A
A
 
K
P
 
K
S
 
K
A
 
M
R
 
V
V
 
V
L
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
M
P
 
P
M
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
V
L
 
N
E
 
E
I
 
I
S
 
S
S
 
V
V
 
E
L
 
V
A
 
D
D
 
S
A
 
D
P
 
P
E
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
D
 
R
Q
 
Q
V
 
A
A
 
E
A
 
N
G
|
G
V
 
M
A
 
Y
T
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
L

5g1nE Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to pala (see paper)
33% identity, 91% coverage: 12:306/325 of query aligns to 6:300/307 of 5g1nE

query
sites
5g1nE
K
 
Q
D
 
H
L
 
I
L
 
L
D
 
S
V
 
V
T
 
Q
Q
 
Q
L
 
F
T
 
T
R
 
K
A
 
D
E
 
Q
L
 
M
F
 
S
H
 
H
L
 
L
L
 
F
D
 
N
T
 
V
A
 
A
A
 
H
Q
 
T
F
 
L
H
 
R
D
 
M
I
 
M
N
 
V
R
 
Q
R
 
K
P
 
E
V
 
-
K
 
R
K
 
S
V
 
L
P
 
D
T
 
I
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
M
V
 
A
L
 
S
F
 
M
F
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
K
 
S
T
 
S
S
 
S
F
 
F
D
 
A
V
 
A
A
 
A
G
 
M
K
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
A
T
 
V
F
 
L
S
 
S
L
 
F
A
 
S
K
 
E
S
 
A
G
 
T
S
 
S
S
|
S
L
 
V
S
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
A
D
 
D
T
 
S
A
 
V
L
 
Q
T
 
T
L
 
M
Q
 
S
A
 
C
M
 
Y
T
 
A
P
 
-
D
 
D
I
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
L
R
|
R
H
 
H
S
 
P
S
 
Q
S
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
V
Q
 
E
F
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
K
R
 
H
L
 
C
D
 
R
C
 
R
S
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
V
H
 
G
A
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
I
Y
 
F
S
 
T
L
 
I
R
 
R
Q
 
E
V
 
E
W
 
L
G
 
G
D
 
-
T
 
T
F
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
M
T
 
T
L
 
I
L
 
T
I
 
M
L
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
K
H
 
H
S
 
G
R
|
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
N
 
L
V
 
A
H
 
C
L
 
L
L
 
L
S
 
T
S
 
Q
L
 
Y
G
 
R
V
 
V
K
 
S
V
 
L
R
 
R
L
 
Y
C
 
V
A
 
A
P
 
P
R
 
P
T
 
S
L
 
L
-
 
R
L
 
M
P
 
P
A
 
P
G
 
T
V
 
V
H
 
R
N
 
A
W
 
F
P
 
V
V
 
A
T
 
S
-
 
R
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
E
I
 
E
F
 
F
N
 
E
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
L
Q
 
P
G
 
D
V
 
T
D
 
D
A
 
V
V
 
L
M
 
Y
C
 
M
L
x
T
R
|
R
L
 
I
Q
|
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
Q
 
-
A
 
F
G
 
G
L
 
S
L
 
T
P
 
Q
D
 
E
L
 
Y
R
 
E
E
 
A
Y
 
C
A
 
F
Q
 
G
R
 
Q
F
 
F
C
 
I
L
 
L
S
 
T
P
 
P
R
 
H
H
 
I
L
 
M
T
 
T
M
 
R
A
 
A
A
 
K
P
 
K
S
 
K
A
 
M
R
 
V
V
 
V
L
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
M
P
 
P
M
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
V
L
 
N
E
 
E
I
 
I
S
 
S
S
 
V
V
 
E
L
 
V
A
 
D
D
 
S
A
 
D
P
 
P
E
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
D
 
R
Q
 
Q
V
 
A
A
 
E
A
 
N
G
|
G
V
 
M
A
 
Y
T
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
L

P08955 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Mesocricetus auratus (Golden hamster) (see paper)
33% identity, 91% coverage: 12:306/325 of query aligns to 1924:2218/2225 of P08955

query
sites
P08955
K
 
Q
D
 
H
L
 
I
L
 
L
D
 
S
V
 
V
T
 
K
Q
 
Q
L
 
F
T
 
T
R
 
K
A
 
D
E
 
Q
L
 
M
F
 
S
H
 
H
L
 
L
L
 
F
D
 
N
T
 
V
A
 
A
A
 
H
Q
 
T
F
 
L
H
 
R
D
 
M
I
 
M
N
 
V
R
 
Q
R
 
K
P
 
E
V
 
-
K
 
R
K
 
S
V
 
L
P
 
D
T
 
I
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
M
V
 
A
L
 
S
F
 
M
F
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
K
 
S
T
 
S
S
 
S
F
 
F
D
 
A
V
 
A
A
 
A
G
 
M
K
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
A
T
 
V
F
 
L
S
 
S
L
 
F
A
 
S
K
 
E
S
 
A
G
 
T
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
A
D
 
D
T
 
S
A
 
V
L
 
Q
T
 
T
L
 
M
Q
 
S
A
 
C
M
 
Y
T
 
A
P
 
-
D
 
D
I
 
V
I
 
V
V
 
V
I
 
L
R
 
R
H
 
H
S
 
P
S
 
Q
S
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
V
Q
 
E
F
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
K
R
 
H
L
 
C
D
 
R
C
 
R
S
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
V
H
 
G
A
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
I
Y
 
F
S
 
T
L
 
I
R
 
R
Q
 
E
V
 
E
W
 
L
G
 
G
D
 
-
T
 
T
F
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
M
T
 
T
L
 
I
L
 
T
I
 
M
L
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
K
H
 
H
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
N
 
L
V
 
A
H
 
C
L
 
L
L
 
L
S
 
T
S
 
Q
L
 
Y
G
 
R
V
 
V
K
 
S
V
 
L
R
 
R
L
 
Y
C
 
V
A
 
A
P
 
P
R
 
P
T
 
S
L
 
L
-
 
R
L
 
M
P
 
P
A
 
P
G
 
S
V
 
V
H
 
W
N
 
D
W
 
F
P
 
V
V
 
A
T
 
S
-
 
R
-
 
G
-
 
T
-
 
K
-
 
Q
-
 
E
I
 
E
F
 
F
N
 
E
R
 
S
L
 
I
D
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
L
Q
 
P
G
 
D
V
 
T
D
 
D
A
 
V
V
 
L
M
 
Y
C
 
M
L
 
T
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
Q
 
-
A
 
F
G
 
G
L
 
S
L
 
T
P
 
Q
D
 
E
L
 
Y
R
 
E
E
 
A
Y
 
C
A
 
F
Q
 
G
R
 
Q
F
 
F
C
 
I
L
 
L
S
 
T
P
 
P
R
 
H
H
 
I
L
 
M
T
 
T
M
 
R
A
 
A
A
 
K
P
 
K
S
 
K
A
 
M
R
 
V
V
 
V
L
 
M
H
 
H
P
 
-
G
 
-
P
 
P
M
 
M
N
 
P
R
 
R
G
 
V
L
 
N
E
 
E
I
 
I
S
 
S
S
 
V
V
 
E
L
 
V
A
 
D
D
 
S
A
 
D
P
 
P
E
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
D
 
R
Q
 
Q
V
 
A
A
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
M
A
 
Y
T
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

1ml4A The pala-liganded aspartate transcarbamoylase catalytic subunit from pyrococcus abyssi (see paper)
33% identity, 93% coverage: 9:309/325 of query aligns to 2:303/307 of 1ml4A

query
sites
1ml4A
W
 
W
P
 
K
H
 
G
K
 
R
D
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
S
V
 
I
T
 
R
Q
 
D
L
 
F
T
 
S
R
 
K
A
 
E
E
 
D
L
 
I
F
 
E
H
 
T
L
 
V
L
 
L
D
 
A
T
 
T
A
 
A
A
 
E
Q
 
R
F
 
L
H
 
E
D
 
-
I
 
-
N
 
-
R
 
-
R
 
R
P
 
E
V
 
L
K
 
K
K
 
E
V
 
K
P
 
G
T
 
Q
L
 
L
-
 
E
-
 
Y
-
 
A
K
 
K
G
 
G
K
 
K
S
 
I
V
 
L
V
 
A
L
 
T
F
 
L
F
 
F
A
 
F
E
 
E
P
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
K
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
D
 
E
V
 
S
A
 
A
G
 
M
K
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
A
T
 
V
F
 
I
S
 
G
L
 
F
A
 
A
K
 
E
-
 
A
S
 
S
G
 
T
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
R
D
 
D
T
 
T
A
 
I
L
 
K
T
 
T
L
 
V
Q
 
E
A
 
Q
M
 
Y
T
 
C
P
 
-
D
 
D
I
 
V
I
 
I
V
 
V
I
 
I
R
|
R
H
 
H
S
 
P
S
 
K
S
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
F
 
L
L
 
A
A
 
A
E
 
E
R
 
V
L
 
A
D
 
E
C
 
V
S
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
S
H
 
N
A
 
Q
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
L
Y
 
Y
S
 
T
L
 
I
R
 
K
Q
 
K
V
 
E
W
 
F
G
 
G
D
 
-
T
 
R
F
 
I
E
 
D
G
 
G
R
 
L
T
 
K
L
 
I
L
 
G
I
 
L
L
 
L
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
K
H
 
Y
S
 
G
R
|
R
V
x
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
N
 
L
V
 
A
H
 
E
L
 
A
L
 
L
S
 
T
S
 
F
L
 
Y
G
 
D
V
 
V
K
 
E
V
 
L
R
 
Y
L
 
L
C
 
I
A
 
S
P
 
P
R
 
E
T
 
L
L
 
L
-
 
R
L
 
M
P
 
P
A
 
R
G
 
H
V
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
L
-
 
R
-
 
E
H
 
K
N
 
G
W
 
M
P
 
K
V
 
V
T
 
V
I
 
E
F
 
T
N
 
T
R
 
T
L
 
L
D
 
E
D
 
D
A
 
V
V
 
I
Q
 
G
G
 
K
V
 
L
D
 
D
A
 
V
V
 
L
M
 
Y
C
 
V
L
x
T
R
|
R
L
 
I
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
E
R
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
A
 
L
Q
 
K
-
 
V
-
 
K
-
 
G
R
 
S
F
 
Y
C
 
Q
L
 
V
S
 
N
P
 
L
R
 
K
H
 
V
L
 
L
T
 
E
M
 
K
A
 
A
A
 
K
P
 
D
S
 
E
A
 
L
R
 
R
V
 
I
L
 
M
H
 
H
P
|
P
G
x
L
P
 
P
M
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
V
L
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
H
S
 
P
V
 
E
L
 
V
A
 
D
D
 
N
A
 
T
P
 
K
E
 
H
S
 
A
L
 
I
I
 
Y
L
 
F
D
 
R
Q
 
Q
V
 
V
A
 
F
A
 
N
G
|
G
V
 
V
A
 
P
T
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
L
F
 
A
L
 
L
L
 
V

P27708 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
33% identity, 91% coverage: 12:306/325 of query aligns to 1924:2218/2225 of P27708

query
sites
P27708
K
x
Q
D
x
H
L
x
I
L
|
L
D
x
S
V
|
V
T
x
Q
Q
|
Q
L
x
F
T
|
T
R
x
K
A
x
D
E
x
Q
L
x
M
F
x
S
H
|
H
L
|
L
L
x
F
D
x
N
T
x
V
A
|
A
A
x
H
Q
x
T
F
x
L
H
x
R
D
x
M
I
x
M
N
x
V
R
x
Q
R
x
K
P
x
E
V
 
-
K
x
R
K
x
S
V
x
L
P
x
D
T
x
I
L
|
L
K
|
K
G
|
G
K
|
K
S
x
V
V
x
M
V
x
A
L
x
S
F
x
M
F
|
F
A
x
Y
E
|
E
P
x
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
K
x
S
T
x
S
S
|
S
F
|
F
D
x
A
V
x
A
A
|
A
G
x
M
K
x
A
R
|
R
L
|
L
S
x
G
A
x
G
D
x
A
T
x
V
F
x
L
S
|
S
L
x
F
A
x
S
K
x
E
S
x
A
G
x
T
S
|
S
S
|
S
L
x
V
S
x
Q
K
|
K
G
|
G
E
|
E
S
|
S
L
|
L
K
x
A
D
|
D
T
x
S
A
x
V
L
x
Q
T
|
T
L
x
M
Q
x
S
A
x
C
M
x
Y
T
x
A
P
 
-
D
|
D
I
x
V
I
x
V
V
|
V
I
x
L
R
|
R
H
|
H
S
x
P
S
x
Q
S
x
P
G
|
G
A
|
A
A
x
V
Q
x
E
F
x
L
L
x
A
A
|
A
E
x
K
R
x
H
L
x
C
D
x
R
C
x
R
S
x
P
V
|
V
V
x
I
N
|
N
A
|
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
W
x
V
H
x
G
A
x
E
H
|
H
P
|
P
T
|
T
Q
|
Q
A
|
A
L
|
L
L
|
L
D
|
D
C
x
I
Y
x
F
S
x
T
L
x
I
R
|
R
Q
x
E
V
x
E
W
x
L
G
|
G
D
 
-
T
|
T
F
x
V
E
x
N
G
|
G
R
x
M
T
|
T
L
x
I
L
x
T
I
x
M
L
x
V
G
|
G
D
|
D
I
x
L
A
x
K
H
|
H
S
x
G
R
|
R
V
x
T
A
x
V
R
x
H
S
|
S
N
x
L
V
x
A
H
x
C
L
|
L
L
|
L
S
x
T
S
x
Q
L
x
Y
G
x
R
V
|
V
K
x
S
V
x
L
R
|
R
L
x
Y
C
x
V
A
|
A
P
|
P
R
x
P
T
x
S
L
|
L
-
x
R
L
x
M
P
|
P
A
x
P
G
x
T
V
|
V
H
x
R
N
x
A
W
x
F
P
x
V
V
x
A
T
x
S
-
x
R
-
x
G
-
x
T
-
x
K
-
x
Q
-
x
E
I
x
E
F
|
F
N
x
E
R
x
S
L
x
I
D
x
E
D
x
E
A
|
A
V
x
L
Q
x
P
G
x
D
V
x
T
D
|
D
A
x
V
V
x
L
M
x
Y
C
x
M
L
x
T
R
|
R
L
x
I
Q
|
Q
L
x
K
E
|
E
R
|
R
Q
 
-
Q
 
-
A
x
F
G
|
G
L
x
S
L
x
T
P
x
Q
D
x
E
L
x
Y
R
x
E
E
x
A
Y
x
C
A
x
F
Q
x
G
R
x
Q
F
|
F
C
x
I
L
|
L
S
x
T
P
|
P
R
x
H
H
x
I
L
x
M
T
|
T
M
x
R
A
|
A
A
x
K
P
x
K
S
x
K
A
x
M
R
x
V
V
|
V
L
x
M
H
|
H
P
 
-
G
 
-
P
|
P
M
|
M
N
x
P
R
|
R
G
x
V
L
x
N
E
|
E
I
|
I
S
|
S
S
x
V
V
x
E
L
x
V
A
x
D
D
x
S
A
x
D
P
|
P
E
x
R
S
x
A
L
x
A
I
x
Y
L
x
F
D
x
R
Q
|
Q
V
x
A
A
x
E
A
x
N
G
|
G
V
x
M
A
x
Y
T
x
I
R
|
R
M
|
M
A
|
A
I
x
L
L
|
L

Sites not aligning to the query:

8bplA Aspartate transcarbamoylase mutant (n2045c, r2238c) from chaetomium thermophilum cad-like bound to carbamoyl phosphate (see paper)
34% identity, 94% coverage: 8:311/325 of query aligns to 12:316/316 of 8bplA

query
sites
8bplA
T
 
S
W
 
F
P
 
K
H
 
K
K
 
S
D
 
H
L
 
V
L
 
L
D
 
S
V
 
V
T
 
T
Q
 
Q
L
 
F
T
 
T
R
 
R
A
 
A
E
 
D
L
 
L
F
 
-
H
 
H
L
 
L
L
 
L
D
 
F
T
 
Q
A
 
I
A
 
A
Q
 
Q
F
 
E
H
 
M
D
 
R
I
 
L
N
 
G
R
 
V
R
 
Q
P
 
R
V
 
E
K
 
G
K
 
V
V
 
L
P
 
D
T
 
I
L
 
L
K
 
R
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
L
V
 
C
L
 
T
F
 
L
F
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
K
 
S
T
 
A
S
 
S
F
 
F
D
 
D
V
 
A
A
 
A
G
 
M
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
R
T
 
T
F
 
I
S
 
P
L
 
I
A
 
Q
K
 
T
S
 
S
G
 
T
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
T
 
T
A
 
L
L
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
-
A
 
A
M
 
C
T
 
Y
P
 
S
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
L
R
|
R
H
 
H
S
 
P
S
 
D
S
 
E
G
 
K
A
 
C
A
 
V
Q
 
D
F
 
V
L
 
A
A
 
K
E
 
K
R
 
Y
L
 
C
D
 
P
C
 
V
S
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
W
 
S
H
 
K
A
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
C
 
L
Y
 
F
S
 
T
L
 
I
R
 
R
Q
 
E
V
 
E
W
 
L
G
 
G
D
 
-
T
 
T
F
 
M
E
 
Q
G
 
G
R
 
L
T
 
T
L
 
I
L
 
T
I
 
F
L
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
L
H
 
Y
S
 
G
R
 
R
V
 
P
A
 
V
R
 
H
S
 
S
N
 
L
V
 
V
H
 
Y
L
 
L
L
 
L
S
 
R
S
 
H
L
 
Y
G
 
Q
V
 
V
K
 
K
V
 
V
R
 
Q
L
 
L
C
 
V
A
 
S
P
 
P
R
 
K
T
 
A
L
 
L
-
 
R
L
 
L
P
 
P
A
 
P
G
 
A
V
 
V
H
 
R
N
 
Q
W
 
Q
P
 
L
V
 
V
T
 
D
I
 
A
F
 
G
N
 
Q
R
 
L
L
 
L
D
 
C
D
 
E
A
 
S
-
 
E
-
 
A
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
E
-
 
I
V
 
L
Q
 
G
G
 
R
V
 
T
D
 
D
A
 
V
V
 
L
M
 
Y
C
 
C
L
 
T
R
 
R
L
 
V
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
F
P
 
P
D
 
S
L
 
L
R
 
A
E
 
E
Y
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
V
A
 
K
Q
 
D
R
 
S
F
 
Y
C
 
R
L
 
I
S
 
D
P
 
Y
R
 
S
H
 
T
L
 
L
T
 
K
M
 
Y
A
 
A
A
 
K
P
 
P
S
 
T
A
 
T
R
 
V
V
 
V
L
 
M
H
 
H
P
 
P
G
x
L
P
 
P
M
 
R
N
 
N
R
 
E
G
 
-
L
 
-
E
 
E
I
 
V
S
 
A
S
 
E
V
 
E
L
 
V
A
 
D
D
 
F
A
 
D
P
 
Q
E
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
D
 
R
Q
 
Q
V
 
M
A
 
C
A
 
Y
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
T
 
C
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
L
F
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
M
T
 
S

P20054 Multifunctional protein pyr1-3; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Dictyostelium discoideum (Social amoeba)
31% identity, 92% coverage: 12:309/325 of query aligns to 1923:2220/2225 of P20054

query
sites
P20054
K
 
K
D
 
H
L
 
I
L
 
F
D
 
S
V
 
V
T
 
K
Q
 
Q
L
 
F
T
 
N
R
 
R
A
 
K
E
 
Q
L
 
L
F
 
H
H
 
A
L
 
L
L
 
F
D
 
G
T
 
I
A
 
A
A
 
H
Q
 
E
F
 
M
H
 
R
D
 
I
I
 
L
N
 
V
R
 
K
R
 
R
P
 
S
V
 
-
K
 
G
K
 
G
V
 
S
P
 
D
T
 
L
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
K
S
 
V
V
 
L
V
 
A
L
 
T
F
 
L
F
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
K
 
Q
T
 
C
S
 
S
F
 
F
D
 
T
V
 
A
A
 
A
G
 
M
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
S
T
 
V
F
 
V
S
 
T
L
 
V
A
 
D
K
 
N
S
 
V
G
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
I
K
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
L
 
Q
T
 
T
L
 
L
Q
 
E
A
 
S
M
 
Y
T
 
C
P
 
-
D
 
D
I
 
A
I
 
V
V
 
C
I
 
M
R
 
R
H
 
H
S
 
P
S
 
A
S
 
V
G
 
G
A
 
S
A
 
V
Q
 
E
F
 
S
L
 
A
A
 
I
E
 
Q
R
 
V
L
 
A
D
 
K
C
 
K
S
 
P
V
 
I
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
V
H
 
G
A
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
V
Y
 
F
S
 
T
L
 
I
R
 
R
Q
 
E
V
 
E
W
 
L
G
 
G
D
 
-
T
 
T
F
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
L
T
 
T
L
 
I
L
 
T
I
 
V
L
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
K
H
 
H
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
N
 
L
V
 
V
H
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
A
S
 
N
L
 
Y
G
 
Q
V
 
V
K
 
K
V
 
I
R
 
N
L
 
Y
C
 
V
A
 
S
P
 
P
R
 
S
T
 
S
L
 
L
L
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
H
 
-
N
 
S
W
 
M
P
 
P
V
 
T
T
 
E
I
 
I
F
 
I
N
 
K
R
 
E
L
 
L
D
 
N
D
 
E
A
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
E
-
 
Q
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
T
-
 
N
-
 
I
-
 
E
-
 
S
-
 
I
V
 
L
Q
 
P
G
 
T
V
 
T
D
 
N
A
 
V
V
 
L
M
 
Y
C
 
V
L
 
T
R
 
R
L
 
V
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
F
Q
 
Q
A
 
S
G
 
-
L
 
-
L
 
I
P
 
E
D
 
E
L
 
Y
R
 
E
E
 
K
Y
 
V
A
 
K
Q
 
D
R
 
S
F
 
F
C
 
I
L
 
I
S
 
T
P
 
P
R
 
H
H
 
T
L
 
L
T
 
T
M
 
K
A
 
A
A
 
S
P
 
D
S
 
N
A
 
M
R
 
I
V
 
V
L
 
M
H
 
H
P
 
P
G
 
L
P
 
P
M
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
I
L
 
N
E
 
E
I
 
I
S
 
S
S
 
P
V
 
E
L
 
V
A
 
D
D
 
S
A
 
D
P
 
P
E
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
D
 
R
Q
 
Q
V
 
M
A
 
E
A
 
N
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
T
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
S
I
 
L
L
 
L
F
 
A
L
 
L
L
 
V

Sites not aligning to the query:

6ys6B Arabidopsis aspartate transcarbamoylase complex with pala (see paper)
34% identity, 92% coverage: 10:309/325 of query aligns to 1:308/312 of 6ys6B

query
sites
6ys6B
P
 
P
H
 
H
-
 
M
-
 
F
-
 
E
-
 
L
K
 
S
D
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
E
V
 
G
T
 
K
Q
 
Q
L
 
F
T
 
D
R
 
R
A
 
E
E
 
M
L
 
L
F
 
S
H
 
A
L
 
I
L
 
F
D
 
D
T
 
V
A
 
A
A
 
R
Q
 
E
F
 
M
H
 
E
D
 
K
I
 
I
N
 
E
R
 
K
R
 
S
P
 
S
V
 
S
K
 
Q
K
 
S
V
 
-
P
 
E
T
 
I
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
Y
S
 
L
V
 
M
V
 
A
L
 
T
F
 
L
F
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
K
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
D
 
E
V
 
S
A
 
A
G
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
E
T
 
V
F
 
L
S
 
T
L
 
T
-
 
E
-
 
N
A
 
A
K
 
R
S
 
E
G
 
F
S
 
S
S
|
S
L
 
A
S
 
A
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
K
 
E
D
 
D
T
 
T
A
 
I
L
 
R
T
 
T
L
 
V
Q
 
E
A
 
G
M
 
Y
T
 
S
P
 
-
D
 
D
I
 
I
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
S
 
F
S
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
F
 
K
L
 
A
A
 
A
E
 
A
R
 
T
L
 
A
D
 
N
C
 
I
S
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
P
H
 
G
A
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
V
Y
 
Y
S
 
T
L
 
I
R
 
Q
Q
 
S
V
 
E
W
 
I
G
 
G
D
 
-
T
 
K
F
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
I
T
 
S
L
 
V
L
 
A
I
 
L
L
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
A
H
 
N
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
R
S
 
S
N
 
L
V
 
A
H
 
Y
L
 
L
L
 
L
S
 
A
S
 
K
L
 
F
-
 
K
G
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
I
R
 
Y
L
 
F
C
 
V
A
 
S
P
 
P
R
 
E
T
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
Y
L
 
L
L
 
T
P
 
S
A
 
S
G
 
G
V
 
V
H
 
E
N
 
-
W
 
W
P
 
E
V
 
E
T
 
S
I
 
-
F
 
-
N
 
S
R
 
D
L
 
L
D
 
M
D
 
E
A
 
V
V
 
A
Q
 
S
G
 
K
V
 
C
D
 
D
A
 
V
V
 
V
M
 
Y
C
 
Q
L
x
T
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
L
 
-
E
 
-
R
 
R
Q
 
E
Q
 
R
A
 
F
G
 
G
L
 
E
L
 
R
P
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
Y
E
 
E
Y
 
A
A
 
A
Q
 
R
-
 
G
R
 
K
F
 
F
C
 
I
L
 
V
S
 
D
P
 
K
R
 
D
H
 
L
L
 
L
T
 
G
M
 
V
A
 
M
A
 
Q
P
 
K
S
 
K
A
 
A
R
 
I
V
 
I
L
 
M
H
 
H
P
|
P
G
 
L
P
 
P
M
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
L
L
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
T
S
 
A
V
 
D
L
 
V
A
 
D
D
 
A
A
 
D
P
 
P
E
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
D
 
R
Q
 
Q
V
 
A
A
 
K
A
 
N
G
|
G
V
 
L
A
 
F
T
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
L
F
 
K
L
 
L
L
 
L

6ypoA Arabidopsis aspartate transcarbamoylase bound to ump (see paper)
34% identity, 92% coverage: 10:309/325 of query aligns to 1:308/312 of 6ypoA

query
sites
6ypoA
P
 
P
H
 
H
-
 
M
-
 
F
-
 
E
-
 
L
K
 
S
D
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
E
V
 
G
T
 
K
Q
 
Q
L
 
F
T
 
D
R
 
R
A
 
E
E
 
M
L
 
L
F
 
S
H
 
A
L
 
I
L
 
F
D
 
D
T
 
V
A
 
A
A
 
R
Q
 
E
F
 
M
H
 
E
D
 
K
I
 
I
N
 
E
R
 
K
R
 
S
P
 
S
V
 
S
K
 
Q
K
 
S
V
 
-
P
 
E
T
 
I
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
Y
S
 
L
V
 
M
V
 
A
L
 
T
F
 
L
F
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
K
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
D
 
E
V
 
S
A
 
A
G
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
E
T
 
V
F
 
L
S
 
T
L
 
T
-
 
E
-
 
N
A
 
A
K
 
R
S
 
E
G
 
F
S
 
S
S
 
S
L
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
K
 
E
D
 
D
T
 
T
A
 
I
L
 
R
T
 
T
L
 
V
Q
 
E
A
 
G
M
 
Y
T
 
S
P
 
-
D
 
D
I
 
I
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
S
 
F
S
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
F
 
K
L
 
A
A
 
A
E
 
A
R
 
T
L
 
A
D
 
N
C
 
I
S
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
P
H
 
G
A
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
V
Y
 
Y
S
 
T
L
 
I
R
 
Q
Q
 
S
V
 
E
W
 
I
G
 
G
D
 
-
T
 
K
F
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
I
T
 
S
L
 
V
L
 
A
I
 
L
L
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
A
H
 
N
S
 
G
R
|
R
V
x
T
A
 
V
R
 
R
S
 
S
N
 
L
V
 
A
H
 
Y
L
 
L
L
 
L
S
 
A
S
 
K
L
 
F
-
 
K
G
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
I
R
 
Y
L
 
F
C
 
V
A
 
S
P
 
P
R
 
E
T
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
Y
L
 
L
L
 
T
P
 
S
A
 
S
G
 
G
V
 
V
H
 
E
N
 
-
W
 
W
P
 
E
V
 
E
T
 
S
I
 
-
F
 
-
N
 
S
R
 
D
L
 
L
D
 
M
D
 
E
A
 
V
V
 
A
Q
 
S
G
 
K
V
 
C
D
 
D
A
 
V
V
 
V
M
 
Y
C
 
Q
L
x
T
R
|
R
L
 
I
Q
 
Q
L
 
-
E
 
-
R
 
R
Q
 
E
Q
 
R
A
 
F
G
 
G
L
 
E
L
 
R
P
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
Y
E
 
E
Y
 
A
A
 
A
Q
 
R
-
 
G
R
 
K
F
 
F
C
 
I
L
 
V
S
 
D
P
 
K
R
 
D
H
 
L
L
 
L
T
 
G
M
 
V
A
 
M
A
 
Q
P
 
K
S
 
K
A
 
A
R
 
I
V
 
I
L
 
M
H
|
H
P
|
P
G
x
L
P
 
P
M
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
L
L
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
T
S
 
A
V
 
D
L
 
V
A
 
D
D
 
A
A
 
D
P
 
P
E
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
D
 
R
Q
 
Q
V
 
A
A
 
K
A
 
N
G
|
G
V
 
L
A
 
F
T
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
L
F
 
K
L
 
L
L
 
L

6yvbC Arabidopsis aspartate transcarbamoylase complex with carbamoyl phosphate (see paper)
34% identity, 92% coverage: 10:309/325 of query aligns to 13:320/324 of 6yvbC

query
sites
6yvbC
P
 
P
H
 
H
-
 
M
-
 
F
-
 
E
-
 
L
K
 
S
D
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
E
V
 
G
T
 
K
Q
 
Q
L
 
F
T
 
D
R
 
R
A
 
E
E
 
M
L
 
L
F
 
S
H
 
A
L
 
I
L
 
F
D
 
D
T
 
V
A
 
A
A
 
R
Q
 
E
F
 
M
H
 
E
D
 
K
I
 
I
N
 
E
R
 
K
R
 
S
P
 
S
V
 
S
K
 
Q
K
 
S
V
 
-
P
 
E
T
 
I
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
Y
S
 
L
V
 
M
V
 
A
L
 
T
F
 
L
F
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
K
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
D
 
E
V
 
S
A
 
A
G
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
E
T
 
V
F
 
L
S
 
T
L
 
T
-
 
E
-
 
N
A
 
A
K
 
R
S
 
E
G
 
F
S
 
S
S
 
S
L
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
K
 
E
D
 
D
T
 
T
A
 
I
L
 
R
T
 
T
L
 
V
Q
 
E
A
 
G
M
 
Y
T
 
S
P
 
-
D
 
D
I
 
I
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
S
 
F
S
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
F
 
K
L
 
A
A
 
A
E
 
A
R
 
T
L
 
A
D
 
N
C
 
I
S
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
P
H
 
G
A
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
V
Y
 
Y
S
 
T
L
 
I
R
 
Q
Q
 
S
V
 
E
W
 
I
G
 
G
D
 
-
T
 
K
F
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
I
T
 
S
L
 
V
L
 
A
I
 
L
L
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
A
H
 
N
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
R
S
 
S
N
 
L
V
 
A
H
 
Y
L
 
L
L
 
L
S
 
A
S
 
K
L
 
F
-
 
K
G
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
I
R
 
Y
L
 
F
C
 
V
A
 
S
P
 
P
R
 
E
T
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
Y
L
 
L
L
 
T
P
 
S
A
 
S
G
 
G
V
 
V
H
 
E
N
 
-
W
 
W
P
 
E
V
 
E
T
 
S
I
 
-
F
 
-
N
 
S
R
 
D
L
 
L
D
 
M
D
 
E
A
 
V
V
 
A
Q
 
S
G
 
K
V
 
C
D
 
D
A
 
V
V
 
V
M
 
Y
C
 
Q
L
x
T
R
 
R
L
 
I
Q
 
Q
L
 
-
E
 
-
R
 
R
Q
 
E
Q
 
R
A
 
F
G
 
G
L
 
E
L
 
R
P
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
Y
E
 
E
Y
 
A
A
 
A
Q
 
R
-
 
G
R
 
K
F
 
F
C
 
I
L
 
V
S
 
D
P
 
K
R
 
D
H
 
L
L
 
L
T
 
G
M
 
V
A
 
M
A
 
Q
P
 
K
S
 
K
A
 
A
R
 
I
V
 
I
L
 
M
H
 
H
P
|
P
G
 
L
P
 
P
M
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
L
L
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
T
S
 
A
V
 
D
L
 
V
A
 
D
D
 
A
A
 
D
P
 
P
E
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
D
 
R
Q
 
Q
V
 
A
A
 
K
A
 
N
G
|
G
V
 
L
A
 
F
T
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
L
F
 
K
L
 
L
L
 
L

4eknB Structure of the catalytic chain of methanococcus jannaschii aspartate transcarbamoylase in a hexagonal crystal form (see paper)
33% identity, 91% coverage: 12:306/325 of query aligns to 2:296/304 of 4eknB

query
sites
4eknB
K
 
K
D
 
H
L
 
L
L
 
I
D
 
S
V
 
M
T
 
K
Q
 
D
L
 
I
T
 
G
R
 
K
A
 
E
E
 
E
L
 
I
F
 
L
H
 
E
L
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
E
A
 
A
A
 
R
Q
 
K
F
 
M
H
 
E
D
 
E
I
 
L
-
 
L
-
 
N
N
 
T
R
 
K
R
 
R
P
 
P
V
 
L
K
 
K
K
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
L
L
 
L
K
 
E
G
 
G
K
 
K
S
 
I
V
 
L
V
 
A
L
 
T
F
 
V
F
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
K
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
D
 
E
V
 
T
A
 
A
G
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
E
T
 
V
F
 
I
S
 
T
L
 
M
A
 
T
K
 
D
-
 
L
S
 
K
G
 
S
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
I
D
 
D
T
 
T
A
 
I
L
 
R
T
 
V
L
 
I
Q
 
S
A
 
G
M
 
Y
T
 
A
P
 
-
D
 
D
I
 
I
I
 
I
V
 
V
I
 
L
R
 
R
H
 
H
S
 
P
S
 
S
S
 
E
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
F
 
L
L
 
A
A
 
S
E
 
E
R
 
Y
L
 
S
D
 
Q
C
 
V
S
 
P
V
 
I
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
S
H
 
N
A
 
Q
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
L
Y
 
Y
S
 
T
L
 
I
R
 
M
Q
 
R
V
 
E
W
 
I
G
 
G
D
 
-
T
 
R
F
 
I
E
 
D
G
 
G
R
 
I
T
 
K
L
 
I
L
 
A
I
 
F
L
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
K
H
 
Y
S
x
G
R
|
R
V
x
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
N
 
L
V
 
V
H
 
Y
L
 
A
L
 
L
S
 
S
S
 
L
L
 
F
-
 
E
G
 
N
V
 
V
K
 
E
V
 
M
R
 
Y
L
 
F
C
 
V
A
 
S
P
 
P
R
 
K
T
 
E
L
 
L
-
 
R
L
 
L
P
 
P
A
 
K
G
 
D
V
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
K
-
 
A
H
 
K
N
 
N
W
 
I
P
 
K
V
 
F
T
 
Y
I
 
E
F
 
K
N
 
E
R
 
S
L
 
L
D
 
D
D
 
D
A
 
L
V
 
D
Q
 
D
G
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
V
V
 
L
M
 
Y
C
 
V
L
x
T
R
|
R
L
 
I
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
L
 
-
L
 
F
P
 
P
D
 
D
L
 
P
R
 
N
E
 
E
Y
 
Y
A
 
E
Q
 
K
-
 
V
R
 
K
F
 
G
C
 
S
L
 
Y
S
 
K
P
 
I
R
 
K
H
 
R
L
 
E
T
 
Y
M
 
V
A
 
E
A
 
G
P
 
K
S
 
K
A
 
F
R
 
I
V
 
I
L
 
M
H
 
H
P
|
P
G
 
L
P
 
P
M
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
V
L
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
D
S
 
Y
V
 
D
L
 
V
A
 
D
D
 
D
A
 
L
P
 
P
E
 
Q
S
 
A
L
 
K
I
 
Y
L
 
F
D
 
K
Q
 
Q
V
 
S
A
 
F
A
 
Y
G
|
G
V
 
I
A
 
P
T
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
I
L
 
L

P49077 Aspartate carbamoyltransferase, chloroplastic; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
33% identity, 91% coverage: 13:309/325 of query aligns to 86:386/390 of P49077

query
sites
P49077
D
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
E
V
 
G
T
 
K
Q
 
Q
L
 
F
T
 
D
R
 
R
A
 
E
E
 
M
L
 
L
F
 
S
H
 
A
L
 
I
L
 
F
D
 
D
T
 
V
A
 
A
A
 
R
Q
 
E
F
 
M
H
 
E
D
 
K
I
 
I
N
 
E
R
 
K
R
 
S
P
 
S
V
 
S
K
 
Q
K
 
S
V
 
-
P
 
E
T
 
I
L
 
L
K
 
K
G
 
G
K
 
Y
S
 
L
V
 
M
V
 
A
L
 
T
F
 
L
F
 
F
A
 
Y
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
K
 
R
T
 
L
S
 
S
F
 
F
D
 
E
V
 
S
A
 
A
G
 
M
K
 
K
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
E
T
 
V
F
 
L
S
 
T
L
 
T
-
 
E
-
 
N
A
 
A
K
 
R
S
 
E
G
 
F
S
 
S
S
 
S
L
 
A
S
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
K
 
E
D
 
D
T
 
T
A
 
I
L
 
R
T
 
T
L
 
V
Q
 
E
A
 
G
M
 
Y
T
 
S
P
 
-
D
 
D
I
 
I
I
 
I
V
 
V
I
 
M
R
|
R
H
 
H
S
 
F
S
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
A
A
 
A
Q
 
R
F
 
K
L
 
A
A
 
A
E
 
A
R
 
T
L
 
A
D
 
N
C
 
I
S
 
P
V
 
V
V
 
I
N
 
N
A
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
W
 
P
H
 
G
A
 
E
H
|
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
C
 
V
Y
 
Y
S
 
T
L
 
I
R
 
Q
Q
 
S
V
 
E
W
 
I
G
 
G
D
 
-
T
 
K
F
 
L
E
 
D
G
 
G
R
 
I
T
 
S
L
 
V
L
 
A
I
 
L
L
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
A
H
 
N
S
 
G
R
|
R
V
 
T
A
 
V
R
 
R
S
 
S
N
 
L
V
 
A
H
 
Y
L
 
L
L
 
L
S
 
A
S
 
K
L
 
F
-
 
K
G
 
D
V
 
V
K
 
K
V
 
I
R
 
Y
L
 
F
C
 
V
A
 
S
P
 
P
R
 
E
T
 
I
-
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
K
-
 
D
-
 
Y
L
 
L
L
 
T
P
 
S
A
 
S
G
 
G
V
 
V
H
 
E
N
 
-
W
 
W
P
 
E
V
 
E
T
 
S
I
 
-
F
 
-
N
 
S
R
 
D
L
 
L
D
 
M
D
 
E
A
 
V
V
 
A
Q
 
S
G
 
K
V
 
C
D
 
D
A
 
V
V
 
V
M
 
Y
C
 
Q
L
 
T
R
|
R
L
 
I
Q
 
Q
L
 
-
E
 
-
R
 
R
Q
 
E
Q
 
R
A
 
F
G
 
G
L
 
E
L
 
R
P
 
L
D
 
D
L
 
L
R
 
Y
E
 
E
Y
 
A
A
 
A
Q
 
R
-
 
G
R
 
K
F
 
Y
C
 
I
L
 
V
S
 
D
P
 
K
R
 
D
H
 
L
L
 
L
T
 
G
M
 
V
A
 
M
A
 
Q
P
 
K
S
 
K
A
 
A
R
 
I
V
 
I
L
 
M
H
 
H
P
 
P
G
 
L
P
 
P
M
 
-
N
 
-
R
 
R
G
 
L
L
 
D
E
 
E
I
 
I
S
 
T
S
 
A
V
 
D
L
 
V
A
 
D
D
 
A
A
 
D
P
 
P
E
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
D
 
R
Q
 
Q
V
 
A
A
 
K
A
 
N
G
 
G
V
 
L
A
 
F
T
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
L
F
 
K
L
 
L
L
 
L

Q09794 Multifunctional protein ura1; Pyrimidine-specific carbamoyl phosphate synthase-aspartate carbamoyl transferase; CPSase-ATCase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
34% identity, 91% coverage: 12:306/325 of query aligns to 1937:2233/2244 of Q09794

query
sites
Q09794
K
 
K
D
 
H
L
 
I
L
 
I
D
 
S
V
 
V
T
 
H
Q
 
Q
L
 
V
T
 
T
R
 
R
A
 
S
E
 
D
L
 
L
F
 
H
H
 
V
L
 
L
L
 
F
D
 
A
T
 
I
A
 
A
A
 
H
Q
 
Q
F
 
M
H
 
R
D
 
I
I
 
I
N
 
V
R
 
E
R
 
R
P
 
Q
V
 
-
K
 
G
K
 
V
V
 
I
P
 
D
T
 
L
L
 
C
K
 
Y
G
 
G
K
 
K
S
 
L
V
 
L
V
 
C
L
 
T
F
 
M
F
 
F
A
 
F
E
 
E
P
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
K
 
S
T
 
S
S
 
S
F
 
F
D
 
D
V
 
A
A
 
A
G
 
M
K
 
Q
R
 
R
L
 
L
S
 
G
A
 
G
D
 
K
T
 
V
F
 
V
S
 
A
L
 
V
A
 
T
K
 
A
S
 
S
G
 
A
S
 
S
S
 
S
L
 
V
S
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
K
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
I
L
 
R
T
 
T
L
 
L
Q
 
G
A
 
C
M
 
Y
T
 
G
P
 
-
D
 
D
I
 
A
I
 
I
V
 
V
I
 
L
R
 
R
H
 
H
S
 
P
S
 
S
S
 
I
G
 
E
A
 
S
A
 
A
Q
 
R
F
 
I
L
 
A
A
 
A
E
 
N
R
 
F
L
 
S
D
 
P
C
 
V
S
 
P
V
 
I
V
 
I
N
 
N
A
 
G
G
 
G
D
 
N
G
 
G
W
 
S
H
 
K
A
 
E
H
 
H
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
F
L
 
L
D
 
D
C
 
L
Y
 
Y
S
 
T
L
 
I
R
 
R
Q
 
E
V
 
E
W
 
L
G
 
G
D
 
-
T
 
S
F
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
L
T
 
T
L
 
I
L
 
T
I
 
F
L
 
I
G
 
G
D
 
D
I
 
L
A
 
K
H
 
Y
S
 
G
R
 
R
V
 
T
A
 
V
R
 
H
S
 
S
N
 
L
V
 
A
H
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
A
S
 
F
L
 
W
G
 
H
V
 
V
K
 
E
V
 
L
R
 
H
L
 
L
C
 
V
A
 
S
P
 
P
R
 
E
T
 
Q
L
 
L
-
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
D
G
 
D
V
 
V
H
 
K
-
 
D
-
 
D
-
 
I
-
 
R
-
 
A
N
 
N
W
 
G
P
 
L
V
 
N
T
 
F
I
 
I
F
 
E
N
 
H
R
 
R
-
 
E
-
 
L
L
 
T
D
 
K
D
 
E
A
 
V
V
 
V
Q
 
A
G
 
Q
V
 
S
D
 
D
A
 
V
V
 
L
M
 
Y
C
 
C
L
 
T
R
 
R
L
 
V
Q
 
Q
L
 
K
E
 
E
R
 
R
Q
 
F
Q
 
A
A
 
S
G
 
-
L
 
-
L
 
V
P
 
D
D
 
E
L
 
Y
R
 
E
E
 
K
Y
 
L
A
 
K
Q
 
D
R
 
S
F
 
F
C
 
I
L
 
V
S
 
D
P
 
N
R
 
S
H
 
V
L
 
L
T
 
A
M
 
S
A
 
A
A
 
K
P
 
S
S
 
H
A
 
C
R
 
I
V
 
V
L
 
M
H
 
H
P
 
P
G
 
L
P
 
P
M
 
R
N
 
N
R
 
R
G
 
-
L
 
-
E
 
E
I
 
I
S
 
S
-
 
E
S
 
E
V
 
V
L
 
D
A
 
F
D
 
D
A
 
Q
P
 
R
E
 
R
S
 
A
L
 
A
I
 
Y
L
 
F
D
 
R
Q
 
Q
V
 
M
A
 
R
A
 
Y
G
 
G
V
 
L
A
 
Y
T
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
L
 
L

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>8500677 FitnessBrowser__Miya:8500677
MQHAQRPTWPHKDLLDVTQLTRAELFHLLDTAAQFHDINRRPVKKVPTLKGKSVVLFFAE
PSTRTKTSFDVAGKRLSADTFSLAKSGSSLSKGESLKDTALTLQAMTPDIIVIRHSSSGA
AQFLAERLDCSVVNAGDGWHAHPTQALLDCYSLRQVWGDTFEGRTLLILGDIAHSRVARS
NVHLLSSLGVKVRLCAPRTLLPAGVHNWPVTIFNRLDDAVQGVDAVMCLRLQLERQQAGL
LPDLREYAQRFCLSPRHLTMAAPSARVLHPGPMNRGLEISSVLADAPESLILDQVAAGVA
TRMAILFLLATRTGIEQTADNGGRA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory