SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8501107 FitnessBrowser__Miya:8501107 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3nz2C Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
36% identity, 49% coverage: 55:162/222 of query aligns to 74:179/183 of 3nz2C

query
sites
3nz2C
I
 
I
G
 
G
Q
 
D
R
 
H
V
 
T
L
 
F
V
 
I
G
 
N
R
 
M
Q
 
N
S
 
V
M
 
V
I
 
M
S
 
L
A
 
D
G
 
G
G
 
A
E
 
P
L
 
I
E
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
H
C
 
V
L
 
L
F
 
I
A
 
G
P
 
P
R
 
S
V
 
T
F
 
Q
V
 
F
S
x
Y
D
 
T
A
 
A
D
 
S
H
|
H
V
 
S
V
 
L
D
 
D
N
 
Y
I
 
R
S
 
R
R
 
R
P
 
Q
Y
 
A
S
 
W
E
 
E
Q
 
T
G
 
-
F
 
-
T
 
I
R
 
C
G
 
K
K
 
P
V
 
I
V
 
V
V
 
I
E
 
E
E
 
D
N
 
D
C
 
V
W
 
W
L
 
I
G
|
G
I
 
G
N
 
N
T
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
N
G
 
Q
S
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
I
G
 
G
R
 
A
G
 
R
C
 
S
V
 
V
V
 
V
A
|
A
A
|
A
N
|
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
N
R
 
Q
D
 
D
V
 
V
P
 
P
P
 
P
F
 
D
S
 
T
V
 
L
V
 
V
A
x
G
G
 
G
V
x
T
P
|
P
A
 
A
V
 
R
I
 
I
L
|
L
K
x
R

3nz2J Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
36% identity, 49% coverage: 55:162/222 of query aligns to 77:182/185 of 3nz2J

query
sites
3nz2J
I
 
I
G
 
G
Q
 
D
R
 
H
V
 
T
L
 
F
V
 
I
G
 
N
R
 
M
Q
 
N
S
 
V
M
 
V
I
 
M
S
 
L
A
 
D
G
 
G
G
 
A
E
 
P
L
 
I
E
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
H
C
 
V
L
 
L
F
 
I
A
x
G
P
 
P
R
 
S
V
 
T
F
 
Q
V
 
F
S
x
Y
D
 
T
A
 
A
D
 
S
H
|
H
V
 
S
V
 
L
D
 
D
N
 
Y
I
 
R
S
 
R
R
 
R
P
 
Q
Y
 
A
S
 
W
E
 
E
Q
 
T
G
 
-
F
 
-
T
 
I
R
 
C
G
 
K
K
 
P
V
 
I
V
 
V
V
 
I
E
 
E
E
 
D
N
 
D
C
 
V
W
|
W
L
 
I
G
|
G
I
 
G
N
 
N
T
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
N
G
 
Q
S
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
I
G
 
G
R
 
A
G
 
R
C
 
S
V
 
V
V
 
V
A
|
A
A
|
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
N
R
 
Q
D
 
D
V
 
V
P
 
P
P
 
P
F
 
D
S
 
T
V
 
L
V
 
V
A
x
G
G
 
G
V
x
T
P
|
P
A
 
A
V
 
R
I
 
I
L
 
L
K
x
R

3ectA Crystal structure of the hexapeptide-repeat containing- acetyltransferase vca0836 from vibrio cholerae
36% identity, 49% coverage: 55:162/222 of query aligns to 67:172/176 of 3ectA

query
sites
3ectA
I
 
I
G
 
G
Q
 
D
R
 
H
V
 
T
L
 
F
V
 
I
G
 
N
R
 
M
Q
 
N
S
 
V
M
 
V
I
 
M
S
 
L
A
 
D
G
 
G
G
 
A
E
 
P
L
 
I
E
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
H
C
 
V
L
 
L
F
 
I
A
 
G
P
 
P
R
 
S
V
 
T
F
 
Q
V
 
F
S
 
Y
D
 
T
A
 
A
D
 
S
H
 
H
V
 
S
V
 
L
D
 
D
N
 
Y
I
 
R
S
 
R
R
 
R
P
 
Q
Y
 
A
S
 
W
E
 
E
Q
 
T
G
 
-
F
 
-
T
 
I
R
 
C
G
 
K
K
 
P
V
 
I
V
 
V
V
 
I
E
 
E
E
 
D
N
 
D
C
 
V
W
 
W
L
 
I
G
 
G
I
 
G
N
 
N
T
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
N
G
 
Q
S
x
G
I
 
V
T
 
T
V
 
I
G
 
G
R
 
A
G
 
R
C
 
S
V
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
N
R
 
Q
D
|
D
V
 
V
P
 
P
P
 
P
F
 
D
S
 
T
V
 
L
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
T
P
 
P
A
 
A
V
 
R
I
 
I
L
 
L
K
 
R

5u2kA Crystal structure of galactoside o-acetyltransferase complex with coa (h3 space group)
29% identity, 53% coverage: 46:162/222 of query aligns to 68:182/190 of 5u2kA

query
sites
5u2kA
D
 
D
R
 
T
D
 
D
D
 
Y
R
 
G
L
 
W
R
 
N
L
 
V
V
 
K
I
 
L
G
 
G
Q
 
K
R
 
N
V
 
V
L
 
Y
V
 
V
G
 
N
R
 
T
Q
 
N
S
 
C
M
 
Y
I
 
F
S
x
M
A
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
L
 
I
E
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
N
C
 
V
L
 
F
F
 
I
A
 
G
P
 
P
R
 
N
V
 
C
F
 
G
V
 
F
S
x
Y
D
 
T
A
|
A
D
 
T
H
|
H
V
 
P
V
 
L
D
 
N
N
 
F
I
 
H
S
 
H
R
 
R
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
E
 
N
Q
 
E
G
 
G
F
 
F
T
 
E
R
 
K
-
 
A
G
 
G
K
 
P
V
 
I
V
 
H
V
 
I
E
 
G
E
 
S
N
 
N
C
 
T
W
 
W
L
 
F
G
 
G
I
 
G
N
 
H
T
 
V
V
 
A
I
 
V
T
x
L
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
I
G
 
G
R
 
E
G
 
G
C
 
S
V
 
V
V
 
I
A
 
G
A
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
P
 
P
F
 
H
S
 
S
V
 
L
V
 
A
A
 
V
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
C
V
 
K
I
 
V
L
 
V
K
 
R

3igjC Crystal structure of maltose o-acetyltransferase complexed with acetyl coenzyme a from bacillus anthracis
39% identity, 41% coverage: 72:162/222 of query aligns to 96:184/188 of 3igjC

query
sites
3igjC
E
 
E
L
 
V
E
 
R
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
H
C
 
C
L
 
M
F
 
F
A
|
A
P
 
P
R
 
G
V
 
V
F
 
H
V
 
I
S
x
Y
D
 
T
A
|
A
D
 
T
H
|
H
V
 
P
V
 
L
D
 
H
N
 
P
I
 
V
S
 
E
R
 
R
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
E
 
N
Q
 
S
G
 
G
F
 
K
T
 
E
R
 
Y
G
 
G
K
 
K
-
 
P
V
 
V
V
 
K
V
 
I
E
 
G
E
 
N
N
 
N
C
 
V
W
 
W
L
 
V
G
|
G
I
 
G
N
 
G
T
 
A
V
 
I
I
 
I
T
x
N
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
S
V
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
N
C
 
A
V
 
V
V
 
I
A
|
A
A
x
S
N
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
|
T
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
P
 
N
F
 
N
S
 
V
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
x
N
P
 
P
A
 
A
V
 
K
I
 
V
L
 
I
K
 
K

Sites not aligning to the query:

6pubA Crystal structure of the type b chloramphenicol acetyltransferase from vibrio cholerae in the complex with crystal violet
32% identity, 53% coverage: 46:163/222 of query aligns to 52:164/210 of 6pubA

query
sites
6pubA
D
 
E
R
 
R
D
 
D
D
 
D
R
 
V
L
 
D
R
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
R
 
F
V
 
C
L
 
S
V
 
I
G
 
G
R
 
S
Q
 
G
S
 
A
-
 
V
M
 
F
I
 
M
S
 
M
A
 
A
G
 
G
G
 
N
E
 
Q
L
 
G
E
 
H
I
 
R
G
 
S
D
 
D
F
 
W
C
 
I
L
 
S
F
 
T
A
 
F
P
 
P
R
 
-
V
 
F
F
 
F
V
 
Y
S
 
Q
D
 
D
A
 
N
D
 
D
H
 
N
V
 
F
V
 
A
D
 
D
N
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
Y
 
-
S
 
A
E
 
R
Q
 
D
G
 
G
F
 
F
T
 
T
R
 
R
-
 
S
G
 
G
K
 
D
V
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
E
 
H
N
 
D
C
 
V
W
 
W
L
 
I
G
 
G
I
 
T
N
 
E
T
 
A
V
 
M
I
 
I
T
 
M
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
H
G
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
I
A
 
A
A
 
S
N
 
R
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
A
P
 
P
F
 
Y
S
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
S
V
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
K
I
 
H
L
 
I
K
 
K
M
 
F

Sites not aligning to the query:

6u9cA The 2.2 a crystal structure of the type b chloramphenicol acetyltransferase from vibrio cholerae in the complex with acetyl coa
32% identity, 53% coverage: 46:163/222 of query aligns to 49:161/206 of 6u9cA

query
sites
6u9cA
D
 
E
R
 
R
D
 
D
D
 
D
R
 
V
L
 
D
R
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
Q
 
S
R
 
F
V
 
C
L
 
S
V
 
I
G
 
G
R
 
S
Q
 
G
S
 
A
-
 
V
M
 
F
I
 
M
S
 
M
A
 
A
G
 
G
G
 
N
E
 
Q
L
 
G
E
 
H
I
 
R
G
 
S
D
 
D
F
 
W
C
 
I
L
 
S
F
 
T
A
 
F
P
 
P
R
 
-
V
 
F
F
 
F
V
 
Y
S
 
Q
D
 
D
A
 
N
D
 
D
H
 
N
V
 
F
V
 
A
D
 
D
N
 
-
I
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
Y
 
-
S
 
A
E
 
R
Q
 
D
G
 
G
F
 
F
T
 
T
R
 
R
-
 
S
G
 
G
K
 
D
V
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
E
 
H
N
 
D
C
 
V
W
|
W
L
 
I
G
 
G
I
 
T
N
 
E
T
 
A
V
 
M
I
 
I
T
 
M
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
H
G
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
I
A
|
A
A
 
S
N
 
R
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
A
P
 
P
F
 
Y
S
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
G
G
 
S
V
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
K
I
 
H
L
x
I
K
 
K
M
 
F

4isxA The crystal structure of maltose o-acetyltransferase from clostridium difficile 630 in complex with acetyl-coa
37% identity, 41% coverage: 72:162/222 of query aligns to 94:182/186 of 4isxA

query
sites
4isxA
E
 
K
L
 
I
E
 
E
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
N
C
 
V
L
 
M
F
 
L
A
|
A
P
 
P
R
 
N
V
 
V
F
 
Q
V
 
I
S
 
Y
D
 
T
A
 
A
D
 
Y
H
 
H
V
 
P
V
 
I
D
 
D
N
 
A
I
 
Q
S
 
L
R
 
R
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
E
 
N
Q
 
S
G
 
G
F
 
I
T
 
E
R
 
Y
G
 
G
K
 
S
-
 
P
V
 
V
V
 
K
V
 
I
E
 
G
E
 
D
N
 
N
C
 
V
W
|
W
L
 
I
G
|
G
I
x
G
N
 
G
T
 
V
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
 
P
S
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
N
C
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
P
 
P
F
 
N
S
 
T
V
 
V
V
 
A
A
x
V
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
C
V
 
R
I
 
V
L
 
I
K
|
K

Sites not aligning to the query:

P07464 Galactoside O-acetyltransferase; GAT; Acetyl-CoA:galactoside 6-O-acetyltransferase; Thiogalactoside acetyltransferase; Thiogalactoside transacetylase; EC 2.3.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
28% identity, 59% coverage: 34:165/222 of query aligns to 56:186/203 of P07464

query
sites
P07464
S
 
A
A
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
E
D
 
N
T
 
A
W
 
W
I
 
V
N
 
-
V
 
-
C
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
E
D
 
P
R
 
P
L
 
V
R
 
Y
L
 
F
V
x
S
I
 
Y
G
 
G
Q
 
S
R
 
N
V
 
I
L
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
R
Q
 
N
S
 
F
M
 
Y
-
 
A
-
x
N
-
 
F
-
 
N
-
 
L
-
 
T
I
 
I
S
 
V
A
 
D
G
x
D
G
 
Y
E
 
T
L
 
V
E
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
N
C
 
V
L
 
L
F
 
I
A
 
A
P
 
P
R
 
N
V
 
V
F
 
T
V
 
L
S
 
S
D
 
V
A
 
T
D
 
G
H
|
H
V
 
P
V
 
V
D
 
H
N
 
H
I
 
E
S
 
L
R
 
R
P
 
K
Y
 
N
S
 
G
E
 
E
Q
 
-
G
 
-
F
 
M
T
 
Y
R
 
S
G
 
F
K
 
P
V
 
I
V
 
T
V
 
I
E
 
G
E
 
N
N
 
N
C
 
V
W
 
W
L
 
I
G
 
G
I
x
S
N
 
H
T
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
N
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
N
C
 
S
V
 
V
V
 
I
A
 
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
T
|
T
R
x
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
P
 
P
F
 
N
S
 
V
V
 
V
V
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
C
V
x
R
I
 
V
L
 
I
K
x
R
M
 
E
F
 
I
N
 
N

Sites not aligning to the query:

1krvA Galactoside acetyltransferase in complex with coa and pnp-beta-gal (see paper)
28% identity, 59% coverage: 34:165/222 of query aligns to 55:185/201 of 1krvA

query
sites
1krvA
S
 
A
A
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
E
D
 
N
T
 
A
W
 
W
I
 
V
N
 
-
V
 
-
C
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
E
D
 
P
R
 
P
L
 
V
R
 
Y
L
 
F
V
x
S
I
 
Y
G
 
G
Q
 
S
R
 
N
V
 
I
L
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
R
Q
 
N
S
 
F
M
x
Y
-
 
A
-
x
N
-
 
F
-
 
N
-
 
L
-
 
T
I
 
I
S
x
V
A
 
D
G
x
D
G
 
Y
E
 
T
L
 
V
E
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
N
C
 
V
L
 
L
F
 
I
A
|
A
P
 
P
R
 
N
V
 
V
F
 
T
V
 
L
S
|
S
D
 
V
A
x
T
D
 
G
H
 
H
V
 
P
V
 
V
D
 
H
N
 
H
I
 
E
S
 
L
R
 
R
P
 
K
Y
 
N
S
 
G
E
 
E
Q
 
-
G
 
-
F
x
M
T
 
Y
R
 
S
G
 
F
K
 
P
V
 
I
V
 
T
V
 
I
E
 
G
E
 
N
N
 
N
C
 
V
W
|
W
L
 
I
G
|
G
I
x
S
N
 
H
T
 
V
V
 
V
I
 
I
T
x
N
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
N
C
 
S
V
 
V
V
 
I
A
 
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
P
 
P
F
 
N
S
 
V
V
 
V
V
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
|
P
A
 
C
V
x
R
I
 
V
L
 
I
K
x
R
M
 
E
F
 
I
N
 
N

Sites not aligning to the query:

1kruA Galactoside acetyltransferase in complex with iptg and coenzyme a (see paper)
28% identity, 59% coverage: 34:165/222 of query aligns to 55:185/201 of 1kruA

query
sites
1kruA
S
 
A
A
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
E
D
 
N
T
 
A
W
|
W
I
 
V
N
 
-
V
 
-
C
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
E
D
 
P
R
 
P
L
 
V
R
 
Y
L
 
F
V
x
S
I
 
Y
G
 
G
Q
 
S
R
 
N
V
 
I
L
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
R
Q
 
N
S
 
F
M
x
Y
-
 
A
-
x
N
-
 
F
-
 
N
-
 
L
-
 
T
I
 
I
S
x
V
A
 
D
G
x
D
G
 
Y
E
 
T
L
 
V
E
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
N
C
 
V
L
|
L
F
 
I
A
 
A
P
 
P
R
 
N
V
 
V
F
 
T
V
 
L
S
 
S
D
 
V
A
 
T
D
 
G
H
|
H
V
 
P
V
 
V
D
 
H
N
 
H
I
 
E
S
 
L
R
 
R
P
 
K
Y
 
N
S
 
G
E
 
E
Q
 
-
G
 
-
F
x
M
T
 
Y
R
 
S
G
 
F
K
 
P
V
 
I
V
 
T
V
 
I
E
 
G
E
 
N
N
 
N
C
 
V
W
|
W
L
 
I
G
|
G
I
x
S
N
 
H
T
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
N
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
N
C
 
S
V
 
V
V
 
I
A
x
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
P
 
P
F
 
N
S
 
V
V
 
V
V
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
|
P
A
 
C
V
 
R
I
 
V
L
 
I
K
x
R
M
 
E
F
 
I
N
 
N

Sites not aligning to the query:

1krrA Galactoside acetyltransferase in complex with acetyl-coenzyme a (see paper)
28% identity, 59% coverage: 34:165/222 of query aligns to 55:185/200 of 1krrA

query
sites
1krrA
S
 
A
A
 
T
I
 
V
G
 
G
D
 
E
D
 
N
T
 
A
W
 
W
I
 
V
N
 
-
V
 
-
C
 
-
D
 
-
R
 
-
D
 
E
D
 
P
R
 
P
L
 
V
R
 
Y
L
 
F
V
 
S
I
 
Y
G
 
G
Q
 
S
R
 
N
V
 
I
L
 
H
V
 
I
G
 
G
R
 
R
Q
 
N
S
 
F
M
 
Y
-
 
A
-
x
N
-
 
F
-
 
N
-
 
L
-
 
T
I
 
I
S
 
V
A
 
D
G
 
D
G
 
Y
E
 
T
L
 
V
E
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
D
F
 
N
C
 
V
L
 
L
F
x
I
A
|
A
P
|
P
R
 
N
V
 
V
F
 
T
V
 
L
S
 
S
D
 
V
A
x
T
D
 
G
H
|
H
V
 
P
V
 
V
D
 
H
N
 
H
I
 
E
S
 
L
R
 
R
P
 
K
Y
 
N
S
 
G
E
 
E
Q
 
-
G
 
-
F
 
M
T
 
Y
R
 
S
G
 
F
K
 
P
V
 
I
V
 
T
V
 
I
E
 
G
E
 
N
N
 
N
C
 
V
W
 
W
L
 
I
G
|
G
I
x
S
N
 
H
T
 
V
V
 
V
I
 
I
T
x
N
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
T
V
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
N
C
 
S
V
 
V
V
 
I
A
x
G
A
|
A
N
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
P
P
 
P
F
 
N
S
 
V
V
 
V
V
 
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
|
P
A
 
C
V
 
R
I
 
V
L
 
I
K
x
R
M
 
E
F
 
I
N
 
N

1mrlA Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase with dalfopristin (see paper)
28% identity, 41% coverage: 72:162/222 of query aligns to 60:165/204 of 1mrlA

query
sites
1mrlA
E
 
K
L
 
L
E
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
K
F
 
F
C
 
C
L
 
S
F
 
I
A
 
G
P
 
P
-
 
G
-
 
V
R
 
T
V
 
I
F
 
I
V
 
M
S
 
N
D
 
G
A
 
A
D
x
N
H
|
H
V
 
R
V
 
M
D
 
D
N
 
G
I
 
S
S
 
T
R
 
Y
P
 
P
Y
 
F
S
 
N
-
x
L
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
x
M
-
 
P
-
 
K
-
 
L
E
 
D
Q
 
Q
G
x
L
F
 
P
T
 
I
R
 
K
G
 
G
K
 
D
V
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
E
 
N
N
 
D
C
 
V
W
 
W
L
 
I
G
 
G
I
 
K
N
 
D
T
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
M
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
V
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
A
P
 
P
F
 
Y
S
 
M
V
 
L
V
 
A
A
 
G
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
N
I
 
E
L
 
I
K
 
K

Sites not aligning to the query:

1kk4A Crystal structure of vat(d) in complex with acetyl-coa (see paper)
28% identity, 41% coverage: 72:162/222 of query aligns to 60:165/205 of 1kk4A

query
sites
1kk4A
E
 
K
L
 
L
E
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
K
F
 
F
C
 
C
L
 
S
F
x
I
A
x
G
P
 
P
-
 
G
-
 
V
R
 
T
V
 
I
F
 
I
V
 
M
S
 
N
D
 
G
A
 
A
D
 
N
H
 
H
V
 
R
V
 
M
D
 
D
N
 
G
I
 
S
S
 
T
R
 
Y
P
 
P
Y
 
F
S
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
M
-
 
P
-
 
K
-
 
L
E
 
D
Q
 
Q
G
 
L
F
 
P
T
 
I
R
x
K
G
 
G
K
 
D
V
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
E
 
N
N
 
D
C
 
V
W
|
W
L
 
I
G
|
G
I
x
K
N
 
D
T
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
M
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
V
A
|
A
A
|
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
V
R
x
K
D
 
D
V
 
I
P
 
A
P
 
P
F
 
Y
S
 
M
V
x
L
V
 
A
A
x
G
G
|
G
V
 
N
P
|
P
A
 
A
V
 
N
I
 
E
L
x
I
K
 
K

1khrA Crystal structure of vat(d) in complex with virginiamycin and coenzyme a (see paper)
28% identity, 41% coverage: 72:162/222 of query aligns to 60:165/206 of 1khrA

query
sites
1khrA
E
 
K
L
 
L
E
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
K
F
 
F
C
 
C
L
 
S
F
 
I
A
 
G
P
 
P
-
 
G
-
 
V
R
 
T
V
 
I
F
 
I
V
 
M
S
 
N
D
 
G
A
|
A
D
x
N
H
|
H
V
 
R
V
x
M
D
 
D
N
 
G
I
 
S
S
 
T
R
 
Y
P
 
P
Y
 
F
S
 
N
-
x
L
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
M
-
 
P
-
 
K
-
 
L
E
 
D
Q
 
Q
G
 
L
F
 
P
T
 
I
R
 
K
G
 
G
K
 
D
V
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
E
 
N
N
 
D
C
 
V
W
|
W
L
 
I
G
 
G
I
 
K
N
 
D
T
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
M
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
V
A
|
A
A
|
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
V
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
A
P
 
P
F
 
Y
S
 
M
V
x
L
V
 
A
A
x
G
G
 
G
V
 
N
P
|
P
A
 
A
V
 
N
I
 
E
L
x
I
K
 
K

Sites not aligning to the query:

3dhoA Structure of streptogramin acetyltransferase in complex with an inhibitor
28% identity, 41% coverage: 72:162/222 of query aligns to 60:165/203 of 3dhoA

query
sites
3dhoA
E
 
K
L
 
L
E
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
K
F
 
F
C
 
C
L
 
S
F
 
I
A
 
G
P
 
P
-
 
G
-
 
V
R
 
T
V
 
I
F
 
I
V
 
M
S
 
N
D
 
G
A
 
A
D
 
N
H
 
H
V
 
R
V
x
M
D
 
D
N
 
G
I
 
S
S
 
T
R
 
Y
P
 
P
Y
 
F
S
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
M
-
 
P
-
 
K
-
 
L
E
 
D
Q
 
Q
G
 
L
F
 
P
T
 
I
R
 
K
G
 
G
K
 
D
V
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
E
 
N
N
 
D
C
 
V
W
 
W
L
 
I
G
 
G
I
 
K
N
 
D
T
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
M
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
C
 
A
V
x
I
V
 
V
A
|
A
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
V
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
A
P
 
P
F
 
Y
S
 
M
V
x
L
V
 
A
A
x
G
G
 
G
V
 
N
P
|
P
A
 
A
V
 
N
I
 
E
L
x
I
K
 
K

P50870 Streptogramin A acetyltransferase; Virginiamycin acetyltransferase D; Vat(D); EC 2.3.1.- from Enterococcus faecium (Streptococcus faecium) (see paper)
28% identity, 39% coverage: 72:158/222 of query aligns to 60:161/209 of P50870

query
sites
P50870
E
 
K
L
 
L
E
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
K
F
 
F
C
 
C
L
 
S
F
 
I
A
 
G
P
 
P
-
 
G
-
 
V
R
 
T
V
 
I
F
 
I
V
 
M
S
 
N
D
 
G
A
 
A
D
 
N
H
|
H
V
 
R
V
 
M
D
 
D
N
 
G
I
 
S
S
 
T
R
 
Y
P
 
P
Y
 
F
S
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
N
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
M
-
 
P
-
 
K
-
 
L
E
 
D
Q
 
Q
G
 
L
F
 
P
T
 
I
R
 
K
G
 
G
K
 
D
V
 
T
V
 
I
V
 
I
E
 
G
E
 
N
N
 
D
C
 
V
W
 
W
L
 
I
G
 
G
I
 
K
N
 
D
T
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
M
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
A
N
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
V
R
 
K
D
 
D
V
 
I
P
 
A
P
 
P
F
 
Y
S
 
M
V
 
L
V
 
A
A
 
G
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A

A1ADJ6 Polysialic acid O-acetyltransferase; Capsule O-acetyl transferase; EC 2.3.1.136 from Escherichia coli O1:K1 / APEC (see paper)
32% identity, 48% coverage: 56:162/222 of query aligns to 166:278/307 of A1ADJ6

query
sites
A1ADJ6
G
 
G
Q
 
S
R
 
K
V
 
V
L
 
I
V
 
I
G
 
G
R
 
R
Q
 
R
S
 
T
M
 
T
I
 
I
S
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
F
E
 
E
L
 
V
-
 
V
-
 
T
-
 
D
-
 
K
-
 
C
-
 
N
-
 
V
E
 
T
I
 
I
G
 
G
D
 
H
F
 
D
C
 
C
L
 
M
F
 
I
A
 
A
P
 
R
R
 
D
V
 
V
F
 
I
V
 
L
S
 
R
D
 
A
A
 
S
D
 
D
-
 
G
H
|
H
V
 
P
V
 
I
D
 
F
N
 
D
I
 
I
S
 
-
R
 
-
P
 
-
Y
 
H
S
 
S
E
 
K
Q
 
K
G
 
R
F
 
I
T
 
N
R
 
W
G
 
A
K
 
K
-
 
D
V
 
I
V
 
I
V
 
I
E
 
S
E
 
S
N
 
Y
C
 
V
W
|
W
L
 
V
G
 
G
I
 
R
N
 
N
T
 
V
V
 
S
I
 
I
T
 
M
G
 
K
S
 
G
I
 
V
T
 
S
V
 
V
G
 
G
R
 
S
G
 
G
C
 
S
V
 
V
V
 
I
A
 
G
A
 
Y
N
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
P
 
S
F
 
M
S
 
C
V
 
A
V
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
K
I
 
I
L
 
I
K
 
K

6x3cA Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with streptogramin analog f1037 (47) (see paper)
28% identity, 42% coverage: 70:162/222 of query aligns to 57:164/207 of 6x3cA

query
sites
6x3cA
G
 
G
G
 
D
E
 
K
L
 
L
E
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
R
F
 
F
C
 
C
L
 
S
F
 
I
A
x
G
P
 
P
-
 
G
-
 
T
R
 
T
V
 
F
F
 
I
V
 
M
S
 
N
D
x
G
A
 
A
D
x
N
H
|
H
V
 
R
V
 
M
D
 
D
N
 
G
I
 
S
S
 
T
R
 
Y
P
 
P
Y
 
F
S
x
H
-
x
L
-
 
F
E
 
R
Q
 
M
G
 
G
F
 
W
T
 
E
R
 
K
-
 
Y
-
x
M
-
x
P
-
 
S
-
x
L
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
K
G
 
G
K
 
D
V
 
I
V
 
E
V
 
I
E
 
G
E
 
N
N
 
D
C
 
V
W
|
W
L
 
I
G
|
G
I
x
R
N
 
D
T
 
V
V
 
T
I
 
I
T
x
M
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
I
A
|
A
A
|
A
N
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
R
 
K
D
 
N
V
 
V
P
 
A
P
 
P
F
 
Y
S
 
S
V
 
I
V
 
V
A
 
G
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
L
V
 
K
I
 
F
L
 
I
K
 
R

Sites not aligning to the query:

4hurA Crystal structure of streptogramin group a antibiotic acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with acetyl coenzyme a (see paper)
28% identity, 42% coverage: 70:162/222 of query aligns to 57:164/211 of 4hurA

query
sites
4hurA
G
 
G
G
 
D
E
 
K
L
 
L
E
 
I
I
 
I
G
 
G
D
 
R
F
 
F
C
 
C
L
x
S
F
x
I
A
x
G
P
 
P
-
 
G
-
 
T
R
 
T
V
 
F
F
 
I
V
 
M
S
 
N
D
 
G
A
|
A
D
x
N
H
 
H
V
 
R
V
 
M
D
 
D
N
 
G
I
 
S
S
 
T
R
 
Y
P
 
P
Y
 
F
S
 
H
-
 
L
-
 
F
E
 
R
Q
 
M
G
 
G
F
 
W
T
 
E
R
 
K
-
 
Y
-
 
M
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
x
K
G
 
G
K
 
D
V
 
I
V
 
E
V
 
I
E
 
G
E
 
N
N
 
D
C
 
V
W
|
W
L
x
I
G
|
G
I
x
R
N
 
D
T
 
V
V
 
T
I
 
I
T
x
M
G
 
P
S
 
G
I
 
V
T
 
K
V
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
C
 
A
V
 
I
V
 
I
A
|
A
A
|
A
N
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
|
T
R
 
K
D
 
N
V
 
V
P
 
A
P
 
P
F
 
Y
S
 
S
V
 
I
V
 
V
A
x
G
G
 
G
V
 
N
P
|
P
A
 
L
V
 
K
I
 
F
L
x
I
K
x
R

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>8501107 FitnessBrowser__Miya:8501107
MPEQNTAFRRFQGVSFGKNVQILGLANVAIGQGSAIGDDTWINVCDRDDRLRLVIGQRVL
VGRQSMISAGGELEIGDFCLFAPRVFVSDADHVVDNISRPYSEQGFTRGKVVVEENCWLG
INTVITGSITVGRGCVVAANAVVTRDVPPFSVVAGVPAVILKMFNPATNAWEHVRTSEDS
ERIAAARTVHGLPSREEYRFILHRTSKVGHLSPLLVGSGQCL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory