SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8501167 FitnessBrowser__Miya:8501167 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4hurA Crystal structure of streptogramin group a antibiotic acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with acetyl coenzyme a (see paper)
34% identity, 66% coverage: 61:200/212 of query aligns to 11:166/211 of 4hurA

query
sites
4hurA
V
 
I
Q
 
K
G
 
G
C
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
L
A
 
Q
L
 
F
-
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
I
-
 
T
A
 
N
D
 
E
G
 
N
V
 
I
R
 
L
I
 
V
G
 
G
K
 
E
G
 
Y
C
 
S
H
 
Y
L
 
Y
Y
 
D
A
 
S
R
 
K
T
 
R
G
 
G
A
 
-
L
 
-
E
 
E
M
 
S
A
 
F
E
 
E
N
 
D
A
 
Q
A
 
V
L
 
L
N
x
Y
V
 
H
N
 
Y
V
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
G
G
 
D
H
 
K
I
 
L
R
 
I
M
 
I
G
 
G
A
 
R
H
 
F
V
 
C
T
x
S
V
x
I
G
|
G
P
 
P
G
 
G
T
 
T
-
 
T
-
 
F
V
 
I
I
 
M
R
 
N
A
 
G
A
|
A
N
|
N
H
 
H
N
 
R
F
 
M
D
 
D
R
 
G
T
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
-
 
H
M
 
L
F
 
F
Q
 
R
-
 
M
G
 
G
H
 
W
E
 
E
Y
 
K
-
 
Y
-
 
M
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
x
K
G
 
G
E
 
D
V
 
I
T
 
E
I
 
I
E
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
|
I
A
x
G
A
x
R
N
 
D
C
 
V
T
 
T
I
 
I
T
x
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
G
x
A
A
|
A
G
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
|
T
K
 
K
D
 
N
V
 
V
E
 
A
P
 
P
Y
 
Y
T
 
S
V
 
I
V
 
V
G
|
G
G
 
G
V
 
N
P
|
P
A
 
L
R
 
K
P
 
F
L
x
I
R
|
R
K
 
K
R
 
R

6x3jA Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with streptogramin analog f0224 (46) (see paper)
34% identity, 66% coverage: 61:200/212 of query aligns to 11:166/206 of 6x3jA

query
sites
6x3jA
V
 
I
Q
 
K
G
 
G
C
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
L
A
 
Q
L
 
F
-
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
I
-
 
T
A
 
N
D
 
E
G
 
N
V
 
I
R
 
L
I
 
V
G
 
G
K
 
E
G
 
Y
C
 
S
H
 
Y
L
 
Y
Y
 
D
A
 
S
R
 
K
T
 
R
G
 
G
A
 
-
L
 
-
E
 
E
M
 
S
A
 
F
E
 
E
N
 
D
A
 
Q
A
 
V
L
 
L
N
x
Y
V
 
H
N
x
Y
V
 
E
V
|
V
V
 
I
D
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
G
G
 
D
H
 
K
I
 
L
R
 
I
M
 
I
G
 
G
A
 
R
H
 
F
V
 
C
T
 
S
V
 
I
G
|
G
P
 
P
G
 
G
T
 
T
-
 
T
-
 
F
V
 
I
I
 
M
R
 
N
A
 
G
A
|
A
N
 
N
H
|
H
N
 
R
F
 
M
D
 
D
R
 
G
T
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
-
x
H
M
x
L
F
 
F
Q
 
R
-
 
M
G
 
G
H
 
W
E
 
E
Y
 
K
-
 
Y
-
x
M
-
x
P
-
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
x
L
-
 
P
-
 
L
-
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
I
T
 
E
I
 
I
E
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
A
x
G
A
 
R
N
 
D
C
 
V
T
 
T
I
 
I
T
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
G
 
A
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
N
V
 
V
E
 
A
P
 
P
Y
 
Y
T
 
S
V
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
L
R
 
K
P
 
F
L
 
I
R
 
R
K
 
K
R
 
R

4husA Crystal structure of streptogramin group a antibiotic acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with virginiamycin m1 (see paper)
34% identity, 66% coverage: 61:200/212 of query aligns to 11:166/212 of 4husA

query
sites
4husA
V
 
I
Q
 
K
G
 
G
C
 
N
R
 
R
N
 
N
I
x
L
A
 
Q
L
 
F
-
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
I
-
 
T
A
 
N
D
 
E
G
 
N
V
 
I
R
 
L
I
 
V
G
 
G
K
 
E
G
 
Y
C
 
S
H
x
Y
L
 
Y
Y
x
D
A
 
S
R
 
K
T
 
R
G
 
G
A
 
-
L
 
-
E
 
E
M
 
S
A
 
F
E
 
E
N
 
D
A
 
Q
A
 
V
L
 
L
N
 
Y
V
 
H
N
 
Y
V
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
G
G
 
D
H
 
K
I
 
L
R
 
I
M
 
I
G
 
G
A
 
R
H
 
F
V
 
C
T
 
S
V
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
T
 
T
-
 
T
-
 
F
V
 
I
I
 
M
R
 
N
A
 
G
A
 
A
N
 
N
H
 
H
N
 
R
F
 
M
D
 
D
R
 
G
T
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
-
 
H
M
 
L
F
 
F
Q
 
R
-
 
M
G
 
G
H
 
W
E
 
E
Y
 
K
-
 
Y
-
 
M
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
I
T
 
E
I
 
I
E
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
A
 
G
A
 
R
N
 
D
C
 
V
T
 
T
I
 
I
T
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
G
 
A
A
 
A
G
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
N
V
 
V
E
 
A
P
 
P
Y
 
Y
T
 
S
V
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
L
R
 
K
P
 
F
L
 
I
R
 
R
K
 
K
R
 
R

6x3cA Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with streptogramin analog f1037 (47) (see paper)
34% identity, 66% coverage: 61:200/212 of query aligns to 11:166/207 of 6x3cA

query
sites
6x3cA
V
 
I
Q
 
K
G
 
G
C
 
N
R
 
R
N
 
N
I
x
L
A
 
Q
L
 
F
-
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
I
-
 
T
A
 
N
D
 
E
G
 
N
V
 
I
R
 
L
I
 
V
G
 
G
K
 
E
G
 
Y
C
 
S
H
x
Y
L
 
Y
Y
 
D
A
 
S
R
 
K
T
 
R
G
 
G
A
 
-
L
 
-
E
 
E
M
 
S
A
 
F
E
 
E
N
 
D
A
 
Q
A
 
V
L
 
L
N
x
Y
V
 
H
N
x
Y
V
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
G
G
 
D
H
 
K
I
 
L
R
 
I
M
 
I
G
 
G
A
 
R
H
 
F
V
 
C
T
 
S
V
 
I
G
|
G
P
 
P
G
 
G
T
 
T
-
 
T
-
 
F
V
 
I
I
 
M
R
 
N
A
x
G
A
 
A
N
|
N
H
|
H
N
 
R
F
 
M
D
 
D
R
 
G
T
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
-
x
H
M
x
L
F
 
F
Q
 
R
-
 
M
G
 
G
H
 
W
E
 
E
Y
 
K
-
 
Y
-
x
M
-
x
P
-
 
S
-
x
L
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
I
T
 
E
I
 
I
E
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
A
x
G
A
x
R
N
 
D
C
 
V
T
 
T
I
 
I
T
x
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
G
x
A
A
|
A
G
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
N
V
 
V
E
 
A
P
 
P
Y
 
Y
T
 
S
V
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
L
R
 
K
P
 
F
L
 
I
R
 
R
K
 
K
R
 
R

6x3cE Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase vata from staphylococcus aureus in complex with streptogramin analog f1037 (47) (see paper)
34% identity, 66% coverage: 61:200/212 of query aligns to 11:166/203 of 6x3cE

query
sites
6x3cE
V
 
I
Q
 
K
G
 
G
C
 
N
R
 
R
N
 
N
I
 
L
A
 
Q
L
 
F
-
 
I
-
 
K
-
 
P
-
 
T
-
 
I
-
 
T
A
 
N
D
 
E
G
 
N
V
 
I
R
 
L
I
 
V
G
 
G
K
 
E
G
 
Y
C
 
S
H
 
Y
L
 
Y
Y
 
D
A
 
S
R
 
K
T
 
R
G
 
G
A
 
-
L
 
-
E
 
E
M
 
S
A
 
F
E
 
E
N
 
D
A
 
Q
A
 
V
L
 
L
N
x
Y
V
 
H
N
x
Y
V
 
E
V
 
V
V
 
I
D
 
-
A
 
-
D
 
-
G
 
G
G
 
D
H
 
K
I
 
L
R
 
I
M
 
I
G
 
G
A
 
R
H
 
F
V
 
C
T
 
S
V
 
I
G
|
G
P
 
P
G
 
G
T
 
T
-
 
T
-
 
F
V
 
I
I
 
M
R
 
N
A
x
G
A
 
A
N
|
N
H
|
H
N
 
R
F
x
M
D
 
D
R
 
G
T
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
-
x
H
M
x
L
F
 
F
Q
 
R
-
 
M
G
 
G
H
 
W
E
 
E
Y
 
K
-
 
Y
-
x
M
-
x
P
-
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
L
-
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
I
T
 
E
I
 
I
E
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
A
x
G
A
 
R
N
 
D
C
 
V
T
 
T
I
 
I
T
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
G
x
A
A
|
A
G
 
E
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
N
V
 
V
E
 
A
P
 
P
Y
 
Y
T
 
S
V
 
I
V
 
V
G
 
G
G
 
G
V
x
N
P
|
P
A
 
L
R
 
K
P
 
F
L
 
I
R
 
R
K
 
K
R
 
R

3nz2J Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
41% identity, 52% coverage: 88:198/212 of query aligns to 75:182/185 of 3nz2J

query
sites
3nz2J
L
 
I
E
 
R
M
 
I
A
 
G
E
 
D
N
 
H
A
 
T
A
 
F
L
 
I
N
 
N
V
 
M
N
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
M
D
 
-
A
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
H
 
P
I
 
I
R
 
T
M
 
I
G
 
G
A
 
D
H
 
H
V
 
V
T
 
L
V
 
I
G
|
G
P
 
P
G
 
S
T
 
T
V
 
Q
I
 
F
R
x
Y
A
 
T
A
 
A
N
 
S
H
|
H
N
 
S
F
 
L
D
 
D
R
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
I
 
-
M
 
-
F
 
Y
Q
 
R
G
 
R
H
 
R
E
 
Q
Y
 
A
G
 
W
E
 
E
-
 
T
-
 
I
-
 
C
-
 
K
-
 
P
V
 
I
T
 
V
I
 
I
E
 
E
D
 
D
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
A
x
G
A
 
G
N
 
N
C
 
V
T
 
V
I
 
I
T
 
N
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
H
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
A
G
 
R
A
 
S
V
 
V
V
 
V
G
x
A
A
|
A
G
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
N
K
 
Q
D
 
D
V
 
V
E
 
P
P
 
P
Y
 
D
T
 
T
V
 
L
V
 
V
G
|
G
G
 
G
V
x
T
P
|
P
A
 
A
R
 
R
P
 
I
L
 
L
R
|
R

3ectA Crystal structure of the hexapeptide-repeat containing- acetyltransferase vca0836 from vibrio cholerae
40% identity, 53% coverage: 88:199/212 of query aligns to 65:173/176 of 3ectA

query
sites
3ectA
L
 
I
E
 
R
M
 
I
A
 
G
E
 
D
N
 
H
A
 
T
A
 
F
L
 
I
N
 
N
V
 
M
N
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
M
D
 
-
A
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
H
 
P
I
 
I
R
 
T
M
 
I
G
 
G
A
 
D
H
 
H
V
 
V
T
 
L
V
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
S
T
 
T
V
 
Q
I
 
F
R
 
Y
A
 
T
A
 
A
N
 
S
H
 
H
N
 
S
F
 
L
D
 
D
R
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
I
 
-
M
 
-
F
 
Y
Q
 
R
G
 
R
H
 
R
E
 
Q
Y
 
A
G
 
W
E
 
E
-
 
T
-
 
I
-
 
C
-
 
K
-
 
P
V
 
I
T
 
V
I
 
I
E
 
E
D
 
D
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
A
 
G
A
 
G
N
 
N
C
 
V
T
 
V
I
 
I
T
 
N
P
 
Q
G
|
G
V
 
V
H
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
A
G
 
R
A
 
S
V
 
V
V
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
N
K
 
Q
D
|
D
V
 
V
E
 
P
P
 
P
Y
 
D
T
 
T
V
 
L
V
 
V
G
 
G
G
 
G
V
 
T
P
 
P
A
 
A
R
 
R
P
 
I
L
 
L
R
 
R
K
 
S

3nz2C Crystal structure of hexapeptide-repeat containing-acetyltransferase vca0836 complexed with acetyl co enzyme a from vibrio cholerae o1 biovar eltor
40% identity, 53% coverage: 88:199/212 of query aligns to 72:180/183 of 3nz2C

query
sites
3nz2C
L
 
I
E
 
R
M
 
I
A
 
G
E
 
D
N
 
H
A
 
T
A
 
F
L
 
I
N
 
N
V
 
M
N
 
N
V
 
V
V
 
V
V
 
M
D
 
-
A
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
A
H
 
P
I
 
I
R
 
T
M
 
I
G
 
G
A
 
D
H
 
H
V
 
V
T
 
L
V
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
S
T
 
T
V
 
Q
I
 
F
R
x
Y
A
 
T
A
 
A
N
 
S
H
|
H
N
 
S
F
 
L
D
 
D
R
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
-
I
 
-
M
 
-
F
 
Y
Q
 
R
G
 
R
H
 
R
E
 
Q
Y
 
A
G
 
W
E
 
E
-
 
T
-
 
I
-
 
C
-
 
K
-
 
P
V
 
I
T
 
V
I
 
I
E
 
E
D
 
D
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
A
x
G
A
 
G
N
 
N
C
 
V
T
 
V
I
 
I
T
 
N
P
 
Q
G
 
G
V
 
V
H
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
A
G
 
R
A
 
S
V
 
V
V
 
V
G
x
A
A
|
A
G
x
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
N
K
 
Q
D
 
D
V
 
V
E
 
P
P
 
P
Y
 
D
T
 
T
V
 
L
V
 
V
G
|
G
G
 
G
V
x
T
P
|
P
A
 
A
R
 
R
P
 
I
L
|
L
R
|
R
K
 
S

3dhoA Structure of streptogramin acetyltransferase in complex with an inhibitor
35% identity, 44% coverage: 108:200/212 of query aligns to 60:167/203 of 3dhoA

query
sites
3dhoA
H
 
K
I
 
L
R
 
K
M
 
I
G
 
G
A
 
K
H
 
F
V
 
C
T
 
S
V
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
T
 
V
V
 
T
I
 
I
-
 
I
-
 
M
R
 
N
A
 
G
A
 
A
N
 
N
H
 
H
N
 
R
F
x
M
D
 
D
R
 
G
T
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
M
 
N
F
 
L
Q
 
F
G
 
G
H
 
N
E
 
G
Y
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
M
-
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
T
T
 
I
I
 
I
E
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
A
 
G
A
 
K
N
 
D
C
 
V
T
 
V
I
 
I
T
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
A
 
A
V
x
I
V
 
V
G
x
A
A
 
A
G
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
V
K
 
K
D
 
D
V
 
I
E
 
A
P
 
P
Y
 
Y
T
 
M
V
x
L
V
 
A
G
|
G
G
 
G
V
 
N
P
|
P
A
 
A
R
 
N
P
 
E
L
x
I
R
 
K
K
 
Q
R
 
R

P50870 Streptogramin A acetyltransferase; Virginiamycin acetyltransferase D; Vat(D); EC 2.3.1.- from Enterococcus faecium (Streptococcus faecium) (see paper)
35% identity, 44% coverage: 108:200/212 of query aligns to 60:167/209 of P50870

query
sites
P50870
H
 
K
I
 
L
R
 
K
M
 
I
G
 
G
A
 
K
H
 
F
V
 
C
T
 
S
V
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
T
 
V
V
 
T
I
 
I
-
 
I
-
 
M
R
 
N
A
 
G
A
 
A
N
 
N
H
|
H
N
 
R
F
 
M
D
 
D
R
 
G
T
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
M
 
N
F
 
L
Q
 
F
G
 
G
H
 
N
E
 
G
Y
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
M
-
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
T
T
 
I
I
 
I
E
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
A
 
G
A
 
K
N
 
D
C
 
V
T
 
V
I
 
I
T
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
I
E
 
A
P
 
P
Y
 
Y
T
 
M
V
 
L
V
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
N
P
 
E
L
 
I
R
 
K
K
 
Q
R
 
R

1khrA Crystal structure of vat(d) in complex with virginiamycin and coenzyme a (see paper)
35% identity, 44% coverage: 108:200/212 of query aligns to 60:167/206 of 1khrA

query
sites
1khrA
H
 
K
I
 
L
R
 
K
M
 
I
G
 
G
A
 
K
H
 
F
V
 
C
T
 
S
V
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
T
 
V
V
 
T
I
 
I
-
 
I
-
 
M
R
 
N
A
 
G
A
|
A
N
|
N
H
|
H
N
 
R
F
x
M
D
 
D
R
 
G
T
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
M
 
N
F
x
L
Q
 
F
G
 
G
H
 
N
E
 
G
Y
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
M
-
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
T
T
 
I
I
 
I
E
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
A
 
G
A
 
K
N
 
D
C
 
V
T
 
V
I
 
I
T
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
G
x
A
A
|
A
G
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
V
K
 
K
D
 
D
V
 
I
E
 
A
P
 
P
Y
 
Y
T
 
M
V
x
L
V
 
A
G
|
G
G
 
G
V
 
N
P
|
P
A
 
A
R
 
N
P
 
E
L
x
I
R
 
K
K
 
Q
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1mrlA Crystal structure of streptogramin a acetyltransferase with dalfopristin (see paper)
35% identity, 44% coverage: 108:200/212 of query aligns to 60:167/204 of 1mrlA

query
sites
1mrlA
H
 
K
I
 
L
R
 
K
M
 
I
G
 
G
A
 
K
H
 
F
V
 
C
T
 
S
V
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
G
T
 
V
V
 
T
I
 
I
-
 
I
-
 
M
R
 
N
A
 
G
A
 
A
N
|
N
H
|
H
N
 
R
F
 
M
D
 
D
R
 
G
T
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
M
 
N
F
x
L
Q
 
F
G
 
G
H
 
N
E
 
G
Y
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
x
M
-
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
x
L
-
 
P
-
 
I
-
 
K
G
 
G
E
 
D
V
 
T
T
 
I
I
 
I
E
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
A
 
G
A
 
K
N
 
D
C
 
V
T
 
V
I
 
I
T
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
G
 
A
A
 
A
G
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
V
K
 
K
D
 
D
V
 
I
E
 
A
P
 
P
Y
 
Y
T
 
M
V
 
L
V
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
N
P
 
E
L
 
I
R
 
K
K
 
Q
R
 
R

Sites not aligning to the query:

1kk4A Crystal structure of vat(d) in complex with acetyl-coa (see paper)
35% identity, 44% coverage: 108:200/212 of query aligns to 60:167/205 of 1kk4A

query
sites
1kk4A
H
 
K
I
 
L
R
 
K
M
 
I
G
 
G
A
 
K
H
 
F
V
 
C
T
 
S
V
x
I
G
|
G
P
 
P
G
 
G
T
 
V
V
 
T
I
 
I
-
 
I
-
 
M
R
 
N
A
 
G
A
 
A
N
 
N
H
 
H
N
 
R
F
 
M
D
 
D
R
 
G
T
 
S
D
 
T
V
 
Y
P
 
P
I
 
F
M
 
N
F
 
L
Q
 
F
G
 
G
H
 
N
E
 
G
Y
 
W
-
 
E
-
 
K
-
 
H
-
 
M
-
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
D
-
 
Q
-
 
L
-
 
P
-
 
I
-
x
K
G
 
G
E
 
D
V
 
T
T
 
I
I
 
I
E
 
G
D
 
N
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
A
x
G
A
x
K
N
 
D
C
 
V
T
 
V
I
 
I
T
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
V
G
x
A
A
|
A
G
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
x
V
K
|
K
D
 
D
V
 
I
E
 
A
P
 
P
Y
 
Y
T
 
M
V
x
L
V
 
A
G
|
G
G
|
G
V
 
N
P
|
P
A
 
A
R
 
N
P
 
E
L
x
I
R
 
K
K
 
Q
R
 
R

4isxA The crystal structure of maltose o-acetyltransferase from clostridium difficile 630 in complex with acetyl-coa
39% identity, 53% coverage: 88:199/212 of query aligns to 75:183/186 of 4isxA

query
sites
4isxA
L
 
I
E
 
H
M
 
V
A
 
G
E
 
E
N
 
N
A
 
F
A
 
F
L
 
A
N
|
N
V
 
Y
N
 
D
V
 
C
V
 
I
V
 
F
D
 
-
A
 
L
D
 
D
G
 
V
G
 
C
H
 
K
I
 
I
R
 
E
M
 
I
G
 
G
A
 
D
H
 
N
V
 
V
T
 
M
V
 
L
G
x
A
P
 
P
G
 
N
T
 
V
V
 
Q
I
 
I
R
 
Y
A
 
T
A
 
A
N
 
Y
H
 
H
N
 
-
F
 
-
D
 
-
R
 
P
T
 
I
D
 
D
V
 
A
P
 
Q
I
 
L
M
 
R
F
 
N
Q
 
S
G
 
G
H
 
I
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
E
 
S
-
 
P
V
 
V
T
 
K
I
 
I
E
 
G
D
 
D
D
 
N
V
 
V
W
|
W
I
 
I
A
x
G
A
x
G
N
 
G
C
 
V
T
 
I
I
 
I
T
 
T
P
 
P
G
 
G
V
 
I
H
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
N
A
 
V
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
V
 
I
E
 
P
P
 
P
Y
 
N
T
 
T
V
 
V
V
 
A
G
x
V
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
C
R
 
R
P
 
V
L
 
I
R
x
K
K
 
K

5u2kA Crystal structure of galactoside o-acetyltransferase complex with coa (h3 space group)
34% identity, 53% coverage: 88:199/212 of query aligns to 75:183/190 of 5u2kA

query
sites
5u2kA
L
 
V
E
 
K
M
 
L
A
 
G
E
 
K
N
 
N
A
 
V
A
 
Y
L
 
V
N
 
N
V
 
T
N
 
N
V
 
C
V
 
Y
V
 
F
D
 
-
A
x
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
H
 
Q
I
 
I
R
 
T
M
 
I
G
 
G
A
 
D
H
 
N
V
 
V
T
 
F
V
 
I
G
 
G
P
 
P
G
 
N
T
 
C
V
 
G
I
 
F
R
x
Y
A
 
T
A
|
A
N
 
T
H
|
H
N
 
-
F
 
-
D
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
P
I
 
L
M
 
N
F
 
F
-
 
H
-
 
H
-
 
R
-
 
N
Q
 
E
G
 
G
H
 
F
E
 
E
Y
 
K
-
 
A
G
 
G
E
 
P
V
 
I
T
 
H
I
 
I
E
 
G
D
 
S
D
 
N
V
 
T
W
 
W
I
 
F
A
 
G
A
 
G
N
 
H
C
 
V
T
 
A
I
 
V
T
x
L
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
E
G
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
|
T
K
|
K
D
 
D
V
 
I
E
 
P
P
 
P
Y
 
H
T
 
S
V
 
L
V
 
A
G
 
V
G
 
G
V
 
N
P
 
P
A
 
C
R
 
K
P
 
V
L
 
V
R
 
R
K
 
K

6pubA Crystal structure of the type b chloramphenicol acetyltransferase from vibrio cholerae in the complex with crystal violet
34% identity, 45% coverage: 105:200/212 of query aligns to 55:165/210 of 6pubA

query
sites
6pubA
D
 
D
G
 
V
G
 
D
H
 
K
I
 
L
R
 
V
M
 
I
G
 
G
A
 
S
H
 
F
V
 
C
T
 
S
V
 
I
G
 
G
P
 
S
G
 
G
T
 
A
V
 
V
I
 
F
R
 
M
A
 
M
A
 
A
N
 
G
H
 
N
N
 
Q
F
 
G
D
 
H
R
 
R
T
 
S
D
 
D
-
 
W
-
 
I
-
 
S
-
 
T
V
 
F
P
 
P
I
 
F
M
 
F
F
 
Y
Q
 
Q
G
 
D
H
 
N
E
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
F
-
 
T
-
 
R
Y
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
T
T
 
I
I
 
I
E
 
G
D
 
H
D
 
D
V
 
V
W
 
W
I
 
I
A
 
G
A
 
T
N
 
E
C
 
A
T
 
M
I
 
I
T
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
H
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
G
 
A
A
 
S
G
 
R
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
V
 
V
E
 
A
P
 
P
Y
 
Y
T
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
S
V
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
K
P
 
H
L
 
I
R
 
K
K
 
F
R
 
R

Sites not aligning to the query:

6u9cA The 2.2 a crystal structure of the type b chloramphenicol acetyltransferase from vibrio cholerae in the complex with acetyl coa
34% identity, 45% coverage: 105:200/212 of query aligns to 52:162/206 of 6u9cA

query
sites
6u9cA
D
 
D
G
 
V
G
 
D
H
 
K
I
 
L
R
 
V
M
 
I
G
 
G
A
 
S
H
 
F
V
 
C
T
 
S
V
 
I
G
 
G
P
 
S
G
 
G
T
 
A
V
 
V
I
 
F
R
 
M
A
 
M
A
 
A
N
 
G
H
 
N
N
 
Q
F
 
G
D
 
H
R
 
R
T
 
S
D
 
D
-
 
W
-
 
I
-
 
S
-
 
T
V
 
F
P
 
P
I
 
F
M
 
F
F
 
Y
Q
 
Q
G
 
D
H
 
N
E
 
D
-
 
N
-
 
F
-
 
A
-
 
D
-
 
A
-
 
R
-
 
D
-
 
G
-
 
F
-
 
T
-
 
R
Y
 
S
G
 
G
E
 
D
V
 
T
T
 
I
I
 
I
E
 
G
D
 
H
D
 
D
V
 
V
W
|
W
I
 
I
A
 
G
A
 
T
N
 
E
C
 
A
T
 
M
I
 
I
T
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
H
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
G
x
A
A
 
S
G
 
R
A
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
K
 
K
D
 
D
V
 
V
E
 
A
P
 
P
Y
 
Y
T
 
E
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
S
V
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
K
P
 
H
L
x
I
R
 
K
K
 
F
R
 
R

2xatA Complex of the hexapeptide xenobiotic acetyltransferase with chloramphenicol and desulfo-coenzyme a (see paper)
52% identity, 26% coverage: 145:200/212 of query aligns to 107:162/208 of 2xatA

query
sites
2xatA
G
 
G
E
 
D
V
 
T
T
 
L
I
 
I
E
 
G
D
 
H
D
 
E
V
 
V
W
 
W
I
 
I
A
x
G
A
x
T
N
 
E
C
 
A
T
 
M
I
 
F
T
 
M
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
R
I
 
V
G
 
G
R
 
H
G
 
G
A
 
A
V
 
I
V
 
I
G
|
G
A
x
S
G
 
R
A
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
T
K
 
G
D
 
D
V
 
V
E
 
E
P
 
P
Y
 
Y
T
 
A
V
 
I
V
 
V
G
|
G
G
|
G
V
 
N
P
 
P
A
 
A
R
 
R
P
 
T
L
x
I
R
 
R
K
 
K
R
 
R

Sites not aligning to the query:

3igjC Crystal structure of maltose o-acetyltransferase complexed with acetyl coenzyme a from bacillus anthracis
41% identity, 48% coverage: 97:198/212 of query aligns to 86:184/188 of 3igjC

query
sites
3igjC
N
 
N
V
 
F
N
 
N
V
 
C
V
 
V
V
 
I
D
 
-
A
 
L
D
 
D
G
 
V
G
 
C
H
 
E
I
 
V
R
 
R
M
 
I
G
 
G
A
 
D
H
 
H
V
 
C
T
 
M
V
 
F
G
x
A
P
 
P
G
 
G
T
 
V
V
 
H
I
 
I
R
x
Y
A
 
T
A
|
A
N
 
T
H
|
H
N
 
P
F
 
L
D
 
H
R
 
P
T
 
V
D
 
E
V
 
-
P
 
-
I
 
-
M
 
R
F
 
N
Q
 
S
G
 
G
H
 
K
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
E
 
K
-
 
P
V
 
V
T
 
K
I
 
I
E
 
G
D
 
N
D
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
V
A
x
G
A
 
G
N
 
G
C
 
A
T
 
I
I
 
I
T
x
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
S
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
N
A
 
A
V
 
V
V
 
I
G
x
A
A
x
S
G
 
G
A
 
A
V
 
V
V
 
V
T
|
T
K
 
K
D
 
D
V
 
V
E
 
P
P
 
N
Y
 
N
T
 
V
V
 
V
V
 
V
G
 
G
G
 
G
V
x
N
P
 
P
A
 
A
R
 
K
P
 
V
L
 
I
R
 
K

Sites not aligning to the query:

P07464 Galactoside O-acetyltransferase; GAT; Acetyl-CoA:galactoside 6-O-acetyltransferase; Thiogalactoside acetyltransferase; Thiogalactoside transacetylase; EC 2.3.1.18 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
30% identity, 56% coverage: 82:199/212 of query aligns to 70:184/203 of P07464

query
sites
P07464
Y
 
F
A
x
S
R
 
Y
T
 
G
G
 
S
A
 
N
L
 
I
E
 
H
M
 
I
A
 
G
E
 
R
N
 
N
A
 
F
A
 
Y
L
 
A
N
|
N
V
 
F
N
 
N
V
 
L
V
 
T
V
 
I
D
 
-
A
 
V
D
 
D
G
x
D
G
 
Y
H
 
T
I
 
V
R
 
T
M
 
I
G
 
G
A
 
D
H
 
N
V
 
V
T
 
L
V
 
I
G
 
A
P
 
P
G
 
N
T
 
V
V
 
T
I
 
L
R
 
S
A
 
V
A
 
T
N
 
G
H
|
H
N
 
-
F
 
-
D
 
-
R
 
-
T
 
-
D
 
-
V
 
-
P
 
P
I
 
V
M
 
H
F
 
H
Q
 
E
G
 
L
H
 
R
E
 
K
Y
 
N
G
 
G
E
 
E
-
 
M
-
 
Y
-
 
S
-
 
F
-
 
P
V
 
I
T
 
T
I
 
I
E
 
G
D
 
N
D
 
N
V
 
V
W
 
W
I
 
I
A
 
G
A
x
S
N
 
H
C
 
V
T
 
V
I
 
I
T
 
N
P
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
T
I
 
I
G
 
G
R
 
D
G
 
N
A
 
S
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
S
V
 
I
V
 
V
T
|
T
K
|
K
D
 
D
V
 
I
E
 
P
P
 
P
Y
 
N
T
 
V
V
 
V
V
 
A
G
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
C
R
|
R
P
 
V
L
 
I
R
|
R
K
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>8501167 FitnessBrowser__Miya:8501167
MPTPHMPRMPDMSRLAAIAEELWLSLFAWIPTVIGVGARLVAWQPLFCHCGRVRFGQSVT
VQGCRNIALADGVRIGKGCHLYARTGALEMAENAALNVNVVVDADGGHIRMGAHVTVGPG
TVIRAANHNFDRTDVPIMFQGHEYGEVTIEDDVWIAANCTITPGVHIGRGAVVGAGAVVT
KDVEPYTVVGGVPARPLRKRGVHERAATPPEA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory