SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8501897 FitnessBrowser__Miya:8501897 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9FG67 Methylthioalkylmalate synthase 1, chloroplastic; 2-isopropylmalate synthase 3; EC 2.3.3.17 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
30% identity, 81% coverage: 2:370/455 of query aligns to 87:470/506 of Q9FG67

query
sites
Q9FG67
L
 
V
L
 
F
D
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
F
 
P
G
 
G
T
 
G
Y
x
S
L
 
L
S
 
T
M
 
P
A
 
P
D
 
Q
R
 
K
E
 
L
R
 
E
V
 
I
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
K
V
 
L
G
 
R
V
 
V
P
 
D
E
 
I
A
 
M
E
 
E
V
 
V
G
 
G
W
 
F
A
 
P
G
 
G
-
 
S
-
 
S
R
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
L
T
 
E
D
 
T
M
 
I
L
 
K
A
 
T
L
 
I
S
 
A
A
 
K
R
 
T
V
 
V
A
 
G
P
 
N
G
 
E
L
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
V
-
 
P
A
 
V
A
 
I
A
 
C
A
 
A
W
 
I
C
 
A
R
 
R
C
 
C
R
 
K
P
 
H
G
 
R
D
 
D
L
 
I
R
 
E
A
 
A
A
 
T
V
 
W
A
 
E
C
 
A
G
 
L
A
 
K
S
 
Y
-
 
A
-
 
K
-
 
R
-
 
P
R
 
R
V
 
I
C
 
L
V
 
V
G
 
F
V
 
T
P
 
S
V
 
T
S
 
S
D
 
D
A
 
I
H
 
H
L
 
M
A
 
K
R
 
Y
R
 
K
L
 
L
G
 
K
L
 
K
G
 
T
R
 
Q
A
 
E
A
 
E
L
 
V
L
 
I
D
 
E
L
 
M
L
 
A
A
 
V
A
 
S
T
 
S
L
 
I
A
 
R
E
 
F
A
 
A
R
 
K
M
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
N
H
 
D
V
 
I
T
 
Q
V
 
F
G
 
G
M
 
C
E
 
E
D
 
D
A
 
G
S
 
G
R
 
R
A
 
S
D
 
D
R
 
K
A
 
D
F
 
F
V
 
L
F
 
C
A
 
K
V
 
I
A
 
L
C
 
G
H
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
K
H
 
A
G
 
G
A
 
V
H
 
T
R
 
V
V
 
V
R
 
T
L
 
I
S
 
G
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
N
T
 
M
P
 
P
L
 
H
E
 
E
V
 
Y
A
 
G
D
 
E
V
 
L
V
 
V
R
 
T
A
 
Y
L
 
L
R
 
K
A
 
A
E
 
N
L
 
T
E
 
P
G
 
G
A
 
I
R
 
-
Q
 
-
D
 
D
D
 
D
T
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
V
S
 
V
I
 
V
G
x
A
T
 
V
H
 
H
F
 
C
H
 
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
G
 
G
M
 
L
A
 
A
T
 
T
A
 
A
N
 
N
A
 
S
L
 
I
T
 
A
A
 
G
L
 
I
E
 
R
C
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
R
C
 
Q
A
 
V
D
 
E
V
 
V
S
 
T
V
 
I
L
 
N
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
G
V
 
N
A
 
A
R
 
S
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
V
A
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
K
V
 
C
R
 
R
G
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
V
-
 
I
-
 
N
-
 
G
-
 
V
R
 
Y
A
 
T
R
 
K
F
 
I
E
 
D
L
 
T
A
 
R
P
 
Q
L
 
I
R
 
M
A
 
A
L
 
T
C
 
S
G
 
K
Q
 
M
V
 
V
A
 
Q
Q
 
E
A
 
Y
A
 
T
S
 
G
L
 
L
S
 
Y
V
 
V
P
 
Q
R
 
A
H
 
H
W
 
K
P
 
P
V
 
I
A
 
V
G
 
G
R
 
A
D
 
N
I
 
C
F
 
F
A
 
V
V
 
H
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
I
H
 
H
A
 
Q
H
 
D
G
 
G
V
 
I
R
 
L
R
 
K
D
 
N
P
 
R
S
 
S
L
 
T
F
 
Y
E
 
E
P
 
I
F
 
L
P
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
D
V
 
I
G
 
G
-
 
I
-
 
V
D
 
K
S
 
S
R
 
Q
R
 
N
M
 
S
G
 
G
-
 
L
-
 
V
V
 
L
G
 
G
R
 
K
K
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
R
A
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
D
A
 
R
L
 
L
A
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
G
I
 
Y
L
 
E
P
 
L
P
 
D
P
 
D
D
 
E
E
 
K
L
 
L
P
 
N
A
 
A
I
 
V
V
 
F
E
 
S
A
 
L
V
 
F
R
 
R
D
 
D
L
 
L
S
 
T
A
 
K
T
 
N
L
 
K
R
 
K
R
 
R
P
 
-
L
 
I
T
 
T
P
 
D
A
 
A
E
 
D
L
 
L

6e1jA Crystal structure of methylthioalkylmalate synthase (bjumam1.1) from brassica juncea (see paper)
31% identity, 80% coverage: 2:363/455 of query aligns to 20:397/409 of 6e1jA

query
sites
6e1jA
L
 
V
L
 
F
D
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
E
x
D
G
 
G
E
 
E
Q
|
Q
S
 
S
F
 
P
G
 
G
T
 
A
Y
 
A
L
 
L
S
 
T
M
 
P
A
 
P
D
 
Q
R
 
K
E
 
I
R
 
E
V
 
I
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
K
V
 
L
G
 
R
V
 
V
P
 
D
E
 
I
A
 
M
E
 
E
V
 
V
G
 
G
W
x
F
-
 
P
-
 
V
A
x
S
G
 
S
R
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
F
T
 
E
D
 
T
M
 
I
L
 
Q
A
 
T
L
 
I
S
 
A
A
 
K
R
 
T
V
 
V
A
 
G
P
 
N
G
 
E
L
x
V
-
 
D
-
x
E
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
I
-
 
P
A
 
V
A
 
I
A
 
C
A
 
V
W
x
I
C
 
A
R
|
R
C
 
S
R
 
K
P
 
E
G
 
R
D
 
D
L
 
I
R
 
K
A
 
A
A
 
A
V
 
W
A
 
E
C
 
S
G
 
V
A
 
K
S
 
Y
-
 
A
-
 
K
-
 
R
-
 
P
R
 
R
V
 
I
C
 
V
V
 
I
G
x
F
V
 
T
P
 
S
V
 
T
S
 
S
D
 
D
A
 
I
H
 
H
L
 
L
A
 
K
R
 
Y
R
x
K
L
|
L
G
 
K
L
 
M
G
 
T
R
 
R
A
 
E
A
 
E
L
 
V
L
 
V
D
 
D
L
 
M
L
 
V
A
 
A
A
 
S
T
 
S
L
 
I
A
 
R
E
 
F
A
 
A
R
 
K
M
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
E
H
 
D
V
 
I
T
 
E
V
 
F
G
 
G
M
 
C
E
 
E
D
 
D
A
 
G
S
 
G
R
 
R
A
 
S
D
 
D
R
 
K
A
 
D
F
 
Y
V
 
I
F
 
C
A
 
T
V
 
V
A
 
F
C
 
E
H
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
K
H
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
T
R
 
T
V
 
L
R
 
A
L
 
C
S
x
P
D
 
D
T
|
T
V
 
V
G
 
G
L
 
I
Y
 
N
T
 
M
P
 
P
L
 
H
E
 
E
V
 
Y
A
 
G
D
 
K
V
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
Y
L
 
I
R
 
K
A
 
A
E
 
N
L
 
T
E
 
P
G
 
G
A
 
I
R
 
-
Q
 
-
D
 
D
D
 
D
T
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
V
S
 
I
I
 
F
G
 
S
T
 
A
H
|
H
F
 
C
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
G
 
G
M
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
N
 
N
A
 
T
L
 
I
T
 
A
A
 
G
L
 
I
E
 
C
C
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
R
C
 
Q
A
 
V
D
 
E
V
 
V
S
 
T
V
 
I
L
 
N
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
G
V
 
N
A
 
A
R
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
V
A
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
K
V
 
C
R
 
R
G
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
V
-
 
M
-
 
G
-
 
G
-
 
V
R
 
Y
A
 
T
R
 
R
F
 
I
E
 
D
L
 
T
A
 
R
P
 
Q
L
 
I
R
 
M
A
 
A
L
 
T
C
 
S
G
 
K
Q
 
M
V
 
V
A
 
Q
Q
 
E
A
 
Y
A
 
T
S
 
G
L
 
L
S
 
Y
V
 
V
P
 
Q
R
 
P
H
 
H
W
 
K
P
 
P
V
 
I
A
 
V
G
 
G
R
 
A
D
 
N
I
 
C
F
 
F
A
 
V
V
 
H
E
 
E
S
|
S
G
|
G
L
x
I
H
 
H
A
 
Q
H
x
D
G
 
G
V
 
I
R
 
L
R
x
K
D
 
N
P
 
R
S
 
S
L
 
T
F
 
Y
E
 
E
P
 
I
F
 
I
P
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
D
V
 
V
G
 
G
-
 
V
-
 
V
D
 
K
S
 
S
R
 
Q
R
 
N
M
 
S
G
 
G
V
 
I
-
 
V
-
 
L
G
 
G
R
 
K
K
x
L
S
 
S
G
 
G
V
x
R
A
x
H
A
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
G
I
 
Y
L
 
E
P
 
I
P
 
S
P
 
D
D
 
E
E
 
K
L
 
L
P
 
N
A
 
E
I
 
V
V
 
F
E
 
S
A
 
R
V
 
F
R
 
R
D
 
D
L
 
L
S
 
T
A
 
K
T
 
Q
L
 
K
R
 
K
R
 
R

6ktqA Crystal structure of catalytic domain of homocitrate synthase from sulfolobus acidocaldarius (sahcs(dram)) in complex with alpha- ketoglutarate/zn2+/coa (see paper)
29% identity, 83% coverage: 2:380/455 of query aligns to 24:397/399 of 6ktqA

query
sites
6ktqA
L
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
S
T
 
T
L
 
L
R
|
R
E
|
E
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
S
 
T
F
 
P
G
 
G
T
 
V
Y
 
V
L
 
F
S
 
T
M
 
T
A
 
D
D
 
Q
R
 
R
E
 
V
R
 
E
V
 
I
L
 
A
R
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
D
V
 
I
G
 
G
V
 
V
P
 
Q
E
 
M
A
 
I
E
 
E
V
 
A
G
 
G
W
 
H
A
 
P
G
 
A
-
x
V
-
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
I
R
 
Y
E
 
E
D
 
G
L
 
I
T
 
R
D
 
R
M
 
I
L
 
I
A
 
K
L
 
L
S
 
K
A
 
R
R
 
E
V
 
G
A
 
V
P
 
I
G
 
K
L
 
S
A
 
E
A
 
I
A
 
V
A
 
A
W
 
H
C
 
S
R
|
R
C
x
A
R
 
V
P
 
K
G
 
R
D
 
D
L
 
I
R
 
E
A
 
V
A
 
G
V
 
A
A
 
E
C
 
I
G
 
E
A
 
A
S
 
D
R
 
R
V
 
I
C
 
A
V
 
I
G
x
F
V
 
Y
P
 
G
V
 
I
S
 
S
D
 
D
A
 
T
H
 
H
L
 
L
A
 
K
R
 
A
R
 
K
L
x
H
G
 
H
L
 
T
G
 
T
R
 
R
A
 
D
A
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
R
L
 
S
L
 
I
A
 
A
A
 
E
T
 
T
L
 
V
A
 
S
E
 
Y
A
 
A
R
 
K
M
 
S
L
 
H
G
 
G
I
 
V
E
 
K
H
 
-
V
 
V
T
x
R
V
 
F
G
x
T
M
 
A
E
|
E
D
 
D
A
 
A
S
 
T
R
 
R
A
 
A
D
 
D
R
 
Y
A
 
Q
F
 
Y
V
 
L
F
 
L
A
 
E
V
 
V
A
 
I
C
 
K
H
 
T
A
 
V
A
 
R
A
 
D
H
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
D
R
 
R
V
 
V
R
x
S
L
 
I
S
 
A
D
 
D
T
|
T
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
L
T
 
Y
P
 
P
L
 
S
E
 
R
V
 
T
A
 
R
D
 
E
V
 
L
V
 
F
R
 
K
A
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
D
T
 
L
A
 
T
P
 
S
R
 
R
A
 
F
R
 
P
R
 
D
V
 
I
S
 
E
I
 
F
G
 
D
T
 
I
H
|
H
F
 
A
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
G
 
G
M
 
M
A
 
A
T
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
V
L
 
L
T
 
A
A
 
A
L
 
A
E
 
E
C
 
G
G
 
G
A
 
A
D
 
T
C
 
I
A
 
I
D
 
H
V
 
T
S
 
T
V
 
L
L
 
N
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
V
G
 
G
V
 
I
A
 
A
R
 
P
L
 
L
E
 
Q
E
 
V
L
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
K
V
 
Y
R
 
H
-
 
F
G
 
G
R
 
I
A
 
E
R
 
V
F
 
V
E
 
D
L
 
L
A
 
K
P
 
K
L
 
L
R
 
S
A
 
E
L
 
V
C
 
A
G
 
S
Q
 
L
V
 
V
A
 
E
Q
 
K
A
 
Y
A
 
S
S
 
G
L
 
I
S
 
A
V
 
L
P
 
P
R
 
P
H
 
N
W
 
F
P
 
P
V
 
I
A
 
T
G
 
G
R
 
D
D
 
Y
I
 
A
F
 
F
A
 
V
V
 
H
E
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
V
H
 
H
A
 
V
H
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
L
R
 
N
D
 
D
P
 
P
S
 
K
L
 
T
F
 
Y
E
 
E
P
 
F
F
 
L
P
 
P
P
 
P
E
 
E
L
 
T
V
 
F
G
 
G
D
 
R
S
 
S
R
 
R
R
 
D
M
 
Y
G
 
V
V
 
I
G
 
D
R
 
K
K
 
Y
S
 
T
G
 
G
V
 
K
A
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
D
A
 
R
L
 
F
A
 
D
E
 
R
L
 
L
S
 
G
I
 
V
L
 
K
P
 
L
P
 
T
P
 
D
D
 
S
E
 
E
L
 
I
P
 
D
A
 
Q
I
 
V
V
 
L
E
 
A
A
 
K
V
 
I
R
 
K
-
 
S
D
 
N
L
 
P
S
 
N
A
 
V
T
 
R
L
 
F
R
 
Y
R
 
R
P
 
D
L
 
V
T
 
D
P
 
L
A
 
L
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
-
 
S
V
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
R
G
 
L
K
 
E
H
 
H
H
 
H

Q9FN52 Methylthioalkylmalate synthase 3, chloroplastic; 2-isopropylmalate synthase 2; Methylthioalkylmalate synthase-like; EC 2.3.3.17 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
28% identity, 81% coverage: 2:370/455 of query aligns to 87:470/503 of Q9FN52

query
sites
Q9FN52
L
 
V
L
 
L
D
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
E
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
F
 
P
G
 
G
T
 
A
Y
 
A
L
 
L
S
 
T
M
 
P
A
 
P
D
 
Q
R
 
K
E
 
L
R
 
E
V
 
I
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
K
V
 
L
G
 
R
V
 
V
P
 
D
E
 
I
A
 
M
E
 
E
V
 
V
G
 
G
W
 
F
-
 
P
-
 
V
A
 
S
G
 
S
R
 
E
E
 
E
D
 
E
L
 
F
T
 
E
D
 
A
M
 
I
L
 
K
A
 
T
L
 
I
S
 
A
A
 
K
R
 
T
V
 
V
A
 
G
P
 
N
G
 
E
L
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
G
-
 
Y
-
 
V
-
 
P
A
 
V
A
 
I
A
 
C
A
 
G
W
 
I
C
 
A
R
 
R
C
 
C
R
 
K
P
 
K
G
 
R
D
 
D
L
 
I
R
 
E
A
 
A
A
 
T
V
 
W
A
 
E
C
 
A
G
 
L
A
 
K
S
 
Y
-
 
A
-
 
K
-
 
R
-
 
P
R
 
R
V
 
V
C
 
M
V
 
L
G
 
F
V
 
T
P
 
S
V
 
T
S
 
S
D
 
E
A
 
I
H
 
H
L
 
M
A
 
K
R
 
Y
R
 
K
L
 
L
G
 
K
L
 
K
G
 
T
R
 
K
A
 
E
A
 
E
L
 
V
L
 
I
D
 
E
L
 
M
L
 
A
A
 
V
A
 
N
T
 
S
L
 
V
A
 
K
E
 
Y
A
 
A
R
 
K
M
 
S
L
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
K
H
 
D
V
 
I
T
 
Q
V
 
F
G
 
G
M
 
C
E
 
E
D
 
D
A
 
G
S
 
G
R
 
R
A
 
T
D
 
E
R
 
K
A
 
D
F
 
F
V
 
I
F
 
C
A
 
K
V
 
I
A
 
L
C
 
G
H
 
E
A
 
S
A
 
I
A
 
K
H
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
T
R
 
T
V
 
V
R
 
G
L
 
F
S
 
A
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
|
G
L
 
I
Y
 
N
T
 
M
P
 
P
L
 
Q
E
 
E
V
 
F
A
 
G
D
 
E
V
 
L
V
 
V
R
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
A
R
 
Y
Q
 
V
D
 
I
D
 
E
T
 
N
A
 
T
P
 
P
R
 
G
A
 
A
R
 
D
R
 
D
V
 
I
S
 
V
I
 
F
G
 
A
T
 
I
H
 
H
F
 
C
H
 
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
G
 
G
M
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
A
N
 
N
A
 
T
L
 
I
T
 
S
A
 
G
L
 
I
E
 
C
C
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
R
C
 
Q
A
 
V
D
 
E
V
 
V
S
 
T
V
 
I
L
 
N
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
G
V
 
N
A
 
A
R
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
E
L
 
V
A
 
V
A
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
K
V
 
C
R
 
R
G
 
G
R
 
E
A
 
S
-
 
L
-
 
M
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
Y
-
 
T
R
 
K
F
 
I
E
 
D
L
 
S
A
 
R
P
 
Q
L
 
I
R
 
M
A
 
A
L
 
T
C
 
S
G
 
K
Q
 
M
V
 
V
A
 
Q
Q
 
E
A
 
H
A
 
T
S
 
G
L
 
M
S
 
Y
V
 
V
P
 
Q
R
 
P
H
 
H
W
 
K
P
 
P
V
 
I
A
 
V
G
 
G
R
 
D
D
 
N
I
 
C
F
 
F
A
 
V
V
 
H
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
I
H
 
H
A
 
Q
H
 
D
G
 
G
V
 
I
R
 
L
R
 
K
D
 
N
P
 
R
S
 
S
L
 
T
F
 
Y
E
 
E
P
 
I
F
 
L
P
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
D
V
 
V
G
 
G
-
 
I
-
 
V
D
 
K
S
 
S
R
 
E
R
 
N
M
 
S
G
 
G
V
 
I
-
 
V
-
 
L
G
 
G
R
 
K
K
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
R
A
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
D
A
 
R
L
 
L
A
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
G
I
 
Y
L
 
E
P
 
I
P
 
S
P
 
D
D
 
E
E
 
K
L
 
F
P
 
N
A
 
D
I
 
I
V
 
F
E
 
S
A
 
R
V
 
Y
R
 
R
D
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
K
T
 
D
L
 
K
R
 
K
R
 
R
P
 
-
L
 
I
T
 
T
P
 
D
A
 
A
E
 
D
L
 
L

Q9Y823 Homocitrate synthase, mitochondrial; HCS; EC 2.3.3.14 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see 2 papers)
30% identity, 75% coverage: 2:340/455 of query aligns to 37:367/418 of Q9Y823

query
sites
Q9Y823
L
 
I
L
 
I
D
 
E
T
 
S
T
 
T
L
 
L
R
|
R
E
|
E
G
 
G
E
 
E
Q
|
Q
S
 
F
F
 
A
G
 
N
T
 
A
Y
 
F
L
 
F
S
 
D
M
 
T
A
 
E
D
 
K
R
 
K
E
 
I
R
 
Q
V
 
I
L
 
A
R
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
N
V
 
F
G
 
G
V
 
V
P
 
D
E
 
Y
A
 
I
E
|
E
V
 
L
-
 
T
-
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
G
 
S
W
 
E
A
 
Q
G
 
S
R
 
R
E
 
Q
D
 
D
L
 
C
T
 
E
D
 
A
M
 
I
-
 
C
-
 
K
L
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
C
R
 
K
V
 
I
A
 
L
P
 
T
G
x
H
L
 
I
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
W
 
-
C
 
-
R
 
R
C
 
C
R
 
H
P
 
M
G
 
D
D
 
D
L
 
A
R
 
R
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
E
C
 
T
G
 
G
A
 
V
S
 
D
R
 
G
V
 
V
C
x
D
V
 
V
G
 
V
V
 
I
P
 
G
V
 
T
S
 
S
D
 
Q
A
 
Y
H
 
L
L
 
R
A
 
K
R
 
Y
R
 
S
L
 
H
G
 
G
L
 
K
G
 
D
R
 
M
A
 
T
A
 
Y
L
 
I
L
 
I
D
 
D
L
 
S
L
 
A
A
 
T
A
 
E
T
 
V
L
 
I
A
 
N
E
 
F
A
 
V
R
 
K
M
 
S
L
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
-
V
 
V
T
x
R
V
 
F
G
x
S
M
 
S
E
|
E
D
 
D
A
 
S
S
 
F
R
 
R
A
 
S
D
 
D
R
 
L
A
 
V
F
 
D
V
 
L
F
 
L
A
 
S
V
 
L
A
 
Y
C
 
K
H
 
A
A
 
V
A
 
D
A
 
K
H
 
I
G
 
G
A
 
V
H
 
N
R
 
R
V
 
V
R
 
G
L
 
I
S
 
A
D
 
D
T
|
T
V
 
V
G
 
G
L
 
C
Y
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
R
E
 
Q
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
V
 
L
V
 
I
R
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
G
E
 
V
L
 
V
E
 
S
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
C
S
 
D
I
 
I
G
x
E
T
 
C
H
|
H
F
 
F
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
Y
T
 
C
A
 
A
L
 
L
E
 
E
C
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
C
 
H
A
 
I
D
 
D
V
 
T
S
 
S
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
T
R
 
P
L
 
L
E
 
G
E
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
M
V
 
Y
V
 
V
R
 
T
G
 
D
R
 
R
A
 
E
-
 
Y
-
 
I
-
 
T
-
 
H
R
 
K
F
 
Y
E
 
K
L
 
L
A
 
N
P
 
Q
L
 
L
R
|
R
A
 
E
L
 
L
C
 
E
G
 
N
Q
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
A
 
V
S
 
E
L
 
V
S
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
F
H
 
N
W
 
N
P
 
Y
V
 
I
A
 
T
G
 
G
R
 
M
D
 
C
I
 
A
F
 
F
A
 
T
V
 
H
E
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
H
A
 
A
H
 
K
G
 
A
V
 
I
R
 
L
R
 
A
D
 
N
P
 
P
S
 
S
L
 
T
F
x
Y
E
 
E
P
 
I
F
 
L
P
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
D
V
 
F
G
 
G
D
 
M
S
 
S
R
 
R
R
 
Y
M
 
V
G
 
H
V
 
V
G
 
G
-
 
S
R
 
R
K
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
W
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
S
A
 
R
L
 
A
A
 
E
E
x
Q
L
 
L
S
 
N
I
 
L

3ivtB Homocitrate synthase lys4 bound to 2-og (see paper)
30% identity, 75% coverage: 2:340/455 of query aligns to 32:362/400 of 3ivtB

query
sites
3ivtB
L
 
I
L
 
I
D
 
E
T
 
S
T
 
T
L
 
L
R
|
R
E
|
E
G
 
G
E
 
E
Q
|
Q
S
 
F
F
 
A
G
 
N
T
 
A
Y
 
F
L
 
F
S
 
D
M
 
T
A
 
E
D
 
K
R
 
K
E
 
I
R
 
Q
V
 
I
L
 
A
R
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
N
V
 
F
G
 
G
V
 
V
P
 
D
E
 
Y
A
 
I
E
 
E
V
 
L
-
 
T
-
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
G
 
S
W
 
E
A
 
Q
G
 
S
R
 
R
E
 
Q
D
 
D
L
 
C
T
 
E
D
 
A
M
 
I
-
 
C
-
 
K
L
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
C
R
 
K
V
 
I
A
 
L
P
 
T
G
x
H
L
 
I
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
W
 
-
C
 
-
R
 
R
C
 
C
R
 
H
P
 
M
G
 
D
D
 
D
L
 
A
R
 
R
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
E
C
 
T
G
 
G
A
 
V
S
 
D
R
 
G
V
 
V
C
 
D
V
 
V
G
 
V
V
 
I
P
 
G
V
 
T
S
 
S
D
 
Q
A
 
Y
H
 
L
L
 
R
A
 
K
R
 
Y
R
 
S
L
 
H
G
 
G
L
 
K
G
 
D
R
 
M
A
 
T
A
 
Y
L
 
I
L
 
I
D
 
D
L
 
S
L
 
A
A
 
T
A
 
E
T
 
V
L
 
I
A
 
N
E
 
F
A
 
V
R
 
K
M
 
S
L
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
-
V
 
V
T
x
R
V
 
F
G
x
S
M
 
S
E
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
F
R
 
R
A
 
S
D
 
D
R
 
L
A
 
V
F
 
D
V
 
L
F
 
L
A
 
S
V
 
L
A
 
Y
C
 
K
H
 
A
A
 
V
A
 
D
A
 
K
H
 
I
G
 
G
A
 
V
H
 
N
R
 
R
V
 
V
R
 
G
L
 
I
S
 
A
D
 
D
T
|
T
V
 
V
G
 
G
L
 
C
Y
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
R
E
 
Q
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
V
 
L
V
 
I
R
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
G
E
 
V
L
 
V
E
 
S
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
C
S
 
D
I
 
I
G
 
E
T
 
C
H
|
H
F
 
F
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
Y
T
 
C
A
 
A
L
 
L
E
 
E
C
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
C
 
H
A
 
I
D
 
D
V
 
T
S
 
S
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
T
R
 
P
L
 
L
E
 
G
E
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
M
V
 
Y
V
 
V
R
 
T
G
 
D
R
 
R
A
 
E
-
 
Y
-
 
I
-
 
T
-
 
H
R
 
K
F
 
Y
E
 
K
L
 
L
A
 
N
P
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
L
C
 
E
G
 
N
Q
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
A
 
V
S
 
E
L
 
V
S
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
F
H
 
N
W
 
N
P
 
Y
V
 
I
A
 
T
G
 
G
R
 
M
D
 
C
I
 
A
F
 
F
A
 
T
V
 
H
E
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
H
A
 
A
H
 
K
G
 
A
V
 
I
R
 
L
R
 
A
D
 
N
P
 
P
S
 
S
L
 
T
F
 
Y
E
 
E
P
 
I
F
 
L
P
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
D
V
 
F
G
 
G
D
 
M
S
 
S
R
 
R
R
 
Y
M
 
V
G
 
H
V
 
V
G
 
G
-
 
S
R
 
R
K
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
W
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
S
A
 
R
L
 
A
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
S
 
N
I
 
L

3ivsA Homocitrate synthase lys4 (see paper)
30% identity, 78% coverage: 2:358/455 of query aligns to 14:351/364 of 3ivsA

query
sites
3ivsA
L
 
I
L
 
I
D
 
E
T
 
S
T
 
T
L
 
L
R
 
R
E
|
E
G
 
G
E
 
E
Q
|
Q
S
 
F
F
 
A
G
 
N
T
 
A
Y
 
F
L
 
F
S
 
D
M
 
T
A
 
E
D
 
K
R
 
K
E
 
I
R
 
Q
V
 
I
L
 
A
R
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
N
V
 
F
G
 
G
V
 
V
P
 
D
E
 
Y
A
 
I
E
 
E
V
 
L
-
 
T
-
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
G
 
S
W
 
E
A
 
Q
G
 
S
R
 
R
E
 
Q
D
 
D
L
 
C
T
 
E
D
 
A
M
 
I
-
 
C
-
 
K
L
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
C
R
 
K
V
 
I
A
 
L
P
 
T
G
 
H
L
 
I
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
W
 
-
C
 
-
R
 
R
C
 
C
R
 
H
P
 
M
G
 
D
D
 
D
L
 
A
R
 
R
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
E
C
 
T
G
 
G
A
 
V
S
 
D
R
 
-
V
 
-
C
 
-
V
 
-
G
 
G
V
 
V
P
 
D
V
 
V
S
 
V
D
 
-
A
 
-
H
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
I
G
 
G
R
 
T
A
 
T
A
 
Y
L
 
I
L
 
I
D
 
D
L
 
S
L
 
A
A
 
T
A
 
E
T
 
V
L
 
I
A
 
N
E
 
F
A
 
V
R
 
K
M
 
S
L
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
-
V
 
V
T
 
R
V
 
F
G
 
S
M
 
S
E
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
F
R
 
R
A
 
S
D
 
D
R
 
L
A
 
V
F
 
D
V
 
L
F
 
L
A
 
S
V
 
L
A
 
Y
C
 
K
H
 
A
A
 
V
A
 
D
A
 
K
H
 
I
G
 
G
A
 
V
H
 
N
R
 
R
V
 
V
R
 
G
L
 
I
S
 
A
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
C
Y
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
R
E
 
Q
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
V
 
L
V
 
I
R
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
G
E
 
V
L
 
V
E
 
S
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
C
S
 
D
I
 
I
G
 
E
T
 
C
H
|
H
F
 
F
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
Y
T
 
C
A
 
A
L
 
L
E
 
E
C
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
C
 
H
A
 
I
D
 
D
V
 
T
S
 
S
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
T
R
 
P
L
 
L
E
 
G
E
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
M
V
 
Y
V
 
V
R
 
T
G
 
D
R
 
R
A
 
E
-
 
Y
-
 
I
-
 
T
-
 
H
R
 
K
F
 
Y
E
 
K
L
 
L
A
 
N
P
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
L
C
 
E
G
 
N
Q
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
A
 
V
S
 
E
L
 
V
S
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
F
H
 
N
W
 
N
P
 
Y
V
 
I
A
 
T
G
 
G
R
 
M
D
 
C
I
 
A
F
 
F
A
 
T
V
 
H
E
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
H
A
 
A
H
 
K
G
 
A
V
 
I
R
 
L
R
 
A
D
 
N
P
 
P
S
 
S
L
 
T
F
 
Y
E
 
E
P
 
I
F
 
L
P
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
D
V
 
F
G
 
G
D
 
M
S
 
S
R
 
R
R
 
Y
M
 
V
G
 
H
V
 
V
G
 
G
-
 
S
R
 
R
K
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
W
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
S
A
 
R
L
 
A
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
S
 
N
I
 
L
L
 
H
P
 
L
P
 
Q
P
 
A
D
 
K
E
 
E
L
 
L
P
 
T
A
 
V
I
 
R
V
 
I
E
 
K
-
 
K
-
 
L
A
 
A
V
 
V
R
 
R
D
 
T
L
 
L
S
 
A

3mi3A Homocitrate synthase lys4 bound to lysine (see paper)
30% identity, 75% coverage: 2:340/455 of query aligns to 14:333/370 of 3mi3A

query
sites
3mi3A
L
 
I
L
 
I
D
 
E
T
 
S
T
 
T
L
 
L
R
|
R
E
|
E
G
 
G
E
 
E
Q
|
Q
S
 
F
F
 
A
G
 
N
T
 
A
Y
 
F
L
 
F
S
 
D
M
 
T
A
 
E
D
 
K
R
 
K
E
 
I
R
 
Q
V
 
I
L
 
A
R
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
N
V
 
F
G
 
G
V
 
V
P
 
D
E
 
Y
A
 
I
E
 
E
V
 
L
-
 
T
-
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
G
 
S
W
 
E
A
 
Q
G
 
S
R
 
R
E
 
Q
D
 
D
L
 
C
T
 
E
D
 
A
M
 
I
-
 
C
-
 
K
L
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
C
R
 
K
V
 
I
A
 
L
P
 
T
G
 
H
L
 
I
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
W
 
-
C
 
-
R
 
R
C
 
C
R
 
H
P
 
M
G
 
D
D
 
D
L
 
A
R
 
R
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
E
C
 
T
G
 
G
A
 
V
S
 
D
R
 
-
V
 
-
C
 
-
V
 
-
G
 
G
V
 
V
P
x
D
V
 
V
S
 
V
D
 
-
A
 
-
H
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
I
G
 
G
L
 
T
G
 
S
R
 
M
A
 
T
A
 
Y
L
 
I
L
 
I
D
 
D
L
 
S
L
 
A
A
 
T
A
 
E
T
 
V
L
 
I
A
 
N
E
 
F
A
 
V
R
 
K
M
 
S
L
 
K
G
 
G
I
 
I
E
 
E
H
 
-
V
 
V
T
 
R
V
 
F
G
 
S
M
 
S
E
 
E
D
 
D
A
 
S
S
 
F
R
 
R
A
 
S
D
 
D
R
 
L
A
 
V
F
 
D
V
 
L
F
 
L
A
 
S
V
 
L
A
 
Y
C
 
K
H
 
A
A
 
V
A
 
D
A
 
K
H
 
I
G
 
G
A
 
V
H
 
N
R
 
R
V
 
V
R
 
G
L
 
I
S
 
A
D
 
D
T
|
T
V
 
V
G
 
G
L
 
C
Y
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
R
E
 
Q
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
V
 
L
V
 
I
R
 
R
A
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
G
E
 
V
L
 
V
E
 
S
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
C
S
 
D
I
 
I
G
 
E
T
 
C
H
|
H
F
 
F
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
Y
T
 
C
A
 
A
L
 
L
E
 
E
C
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
C
 
H
A
 
I
D
 
D
V
 
T
S
 
S
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
N
G
 
G
V
 
I
A
 
T
R
 
P
L
 
L
E
 
G
E
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
M
V
 
Y
V
 
V
R
 
T
G
 
D
R
 
R
A
 
E
-
 
Y
-
 
I
-
 
T
-
 
H
R
 
K
F
 
Y
E
 
K
L
 
L
A
 
N
P
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
E
L
 
L
C
 
E
G
 
N
Q
 
L
V
 
V
A
 
A
Q
 
D
A
 
A
A
 
V
S
 
E
L
 
V
S
 
Q
V
 
I
P
 
P
R
 
F
H
 
N
W
 
N
P
 
Y
V
 
I
A
 
T
G
 
G
R
 
M
D
 
C
I
 
A
F
 
F
A
 
T
V
 
H
E
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
H
A
 
A
H
 
K
G
 
A
V
 
I
R
 
L
R
 
A
D
 
N
P
 
P
S
 
S
L
 
T
F
 
Y
E
 
E
P
 
I
F
 
L
P
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
D
V
 
F
G
 
G
D
 
M
S
 
S
R
 
R
R
 
Y
M
 
V
G
 
H
V
 
V
G
 
G
-
 
S
R
 
R
K
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
W
A
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
S
A
 
R
L
 
A
A
 
E
E
 
Q
L
 
L
S
 
N
I
 
L

Q9JZG1 2-isopropylmalate synthase; Alpha-IPM synthase; Alpha-isopropylmalate synthase; EC 2.3.3.13 from Neisseria meningitidis serogroup B (strain MC58) (see 2 papers)
29% identity, 81% coverage: 1:370/455 of query aligns to 8:378/517 of Q9JZG1

query
sites
Q9JZG1
M
 
I
L
 
I
L
 
F
D
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
E
x
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
S
 
S
F
 
P
G
 
G
T
 
A
Y
 
A
L
 
M
S
 
T
M
 
K
A
 
E
D
 
E
R
 
K
E
 
I
R
 
R
V
 
V
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
L
 
L
A
 
E
A
 
K
V
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
D
E
 
I
A
 
I
E
 
E
V
 
A
G
 
G
W
 
F
A
 
A
G
 
A
R
 
A
E
 
S
D
 
P
L
 
-
T
 
G
D
 
D
M
 
F
L
 
E
A
 
A
L
 
V
S
 
N
A
 
A
R
 
-
V
 
I
A
 
A
P
 
K
G
 
T
L
 
I
A
 
T
A
 
K
A
 
S
A
 
T
W
 
V
C
 
C
-
 
S
-
 
L
-
 
S
R
 
R
C
 
A
R
 
I
P
 
E
G
 
R
D
 
D
L
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
A
V
 
G
A
 
E
C
 
A
G
 
V
A
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
K
S
 
K
R
 
R
V
 
I
C
 
H
V
 
T
G
 
F
V
 
I
P
 
A
V
 
T
S
 
S
D
 
P
A
 
I
H
 
H
L
 
M
A
 
E
R
 
Y
R
 
K
L
 
L
G
 
K
L
 
M
G
 
K
R
 
P
A
 
K
A
 
Q
L
 
V
L
 
I
D
 
E
L
 
A
L
 
A
A
 
V
A
 
K
T
 
A
L
 
V
A
 
K
E
 
I
A
 
A
R
 
R
M
 
E
L
 
Y
G
 
-
I
 
T
E
 
D
H
 
D
V
 
V
T
 
E
V
 
F
G
 
S
M
 
C
E
 
E
D
 
D
A
 
A
S
 
L
R
 
R
A
 
S
D
 
E
R
 
I
A
 
D
F
 
F
V
 
L
F
 
A
A
 
E
V
 
I
A
 
C
C
 
G
H
 
A
A
 
V
A
 
I
A
 
E
H
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
T
R
 
T
V
 
I
R
 
N
L
 
I
S
 
P
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
Y
Y
 
S
T
 
I
P
 
P
L
 
Y
E
 
K
V
 
T
A
 
E
D
 
E
V
 
F
V
 
F
R
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
I
A
 
A
E
 
K
L
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
T
P
 
P
R
 
N
A
 
G
R
 
G
R
 
K
V
 
V
S
 
V
I
 
W
G
 
S
T
 
A
H
|
H
F
 
C
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
G
 
G
M
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
S
L
 
L
T
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
K
C
 
G
G
 
G
A
 
A
D
 
R
C
 
Q
A
 
V
D
 
E
V
 
C
S
 
T
V
 
V
L
 
N
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
G
V
x
N
A
 
A
R
 
S
L
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
V
A
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
K
V
 
V
R
 
R
-
 
H
-
 
D
-
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
T
G
 
G
R
 
I
A
 
D
R
 
T
F
 
T
E
 
Q
L
 
I
A
 
V
P
 
P
L
 
S
R
 
S
A
 
K
L
 
L
C
 
-
G
 
-
Q
 
-
V
 
V
A
 
S
Q
 
T
A
 
I
A
 
T
S
 
G
L
 
Y
S
 
P
V
 
V
P
 
Q
R
 
P
H
 
N
W
 
K
P
 
A
V
 
I
A
 
V
G
 
G
R
 
A
D
 
N
I
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
H
E
 
E
S
 
S
G
 
G
L
 
I
H
 
H
A
 
Q
H
 
D
G
 
G
V
 
V
R
 
L
R
 
K
D
 
H
P
 
R
S
 
E
L
 
T
F
 
Y
E
 
E
P
 
I
F
 
M
P
 
S
P
 
A
E
 
E
L
 
S
V
 
V
G
 
G
-
 
W
D
 
A
S
 
T
R
 
N
R
 
R
M
 
L
G
 
S
V
 
L
G
 
G
R
 
K
K
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
R
A
 
N
A
 
A
V
 
F
A
 
K
A
 
T
A
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
L
S
 
G
I
 
I
-
 
E
L
 
L
P
 
E
P
 
S
P
 
E
D
 
E
E
 
A
L
 
L
P
 
N
A
 
A
I
 
A
V
 
F
E
 
A
A
 
R
V
 
F
R
 
K
D
 
E
L
|
L
S
 
-
A
|
A
T
x
D
L
x
K
R
x
K
R
|
R
P
x
E
L
x
I
T
x
F
P
x
D
A
x
E
E
x
D
L
|
L

Sites not aligning to the query:

O87198 Homocitrate synthase; HCS; EC 2.3.3.14 from Thermus thermophilus (strain ATCC BAA-163 / DSM 7039 / HB27) (see paper)
30% identity, 81% coverage: 2:370/455 of query aligns to 6:366/376 of O87198

query
sites
O87198
L
 
I
L
 
I
D
 
D
T
 
S
T
 
T
L
 
L
R
|
R
E
|
E
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
S
 
F
F
 
E
G
 
K
T
 
A
Y
 
N
L
 
F
S
 
S
M
 
T
A
 
Q
D
 
D
R
 
K
E
 
V
R
 
E
V
 
I
L
 
A
R
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
E
V
 
F
G
 
G
V
 
I
P
 
E
E
 
Y
A
 
I
E
 
E
V
 
V
G
 
T
W
 
T
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
P
A
 
Q
G
 
S
R
 
R
E
 
K
D
 
D
L
 
A
T
 
E
D
 
V
M
 
L
-
 
A
-
 
S
L
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
P
 
T
G
x
H
L
 
I
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
W
 
-
C
 
-
R
 
Q
C
 
C
R
 
R
P
 
L
G
 
D
D
 
A
L
 
A
R
 
K
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
E
C
 
T
G
 
G
A
 
V
S
 
Q
R
 
G
V
 
I
C
x
D
V
 
L
G
 
L
V
 
F
P
 
G
V
 
T
S
 
S
D
 
K
A
 
-
H
 
Y
L
 
L
A
 
R
R
 
A
R
 
A
L
 
H
G
 
G
L
 
R
G
 
D
R
 
I
A
 
P
A
 
R
L
 
I
L
 
I
D
 
E
L
 
E
L
 
A
A
 
K
A
 
E
T
 
V
L
 
I
A
 
A
E
 
Y
A
 
I
R
 
R
M
 
E
L
 
A
G
 
A
I
 
-
E
 
P
H
 
H
V
 
V
T
 
E
V
 
V
G
x
R
M
 
F
-
x
S
-
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
T
S
 
F
R
 
R
A
 
S
D
 
E
R
 
E
A
 
Q
F
 
D
V
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
-
C
 
Y
H
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
H
 
P
G
 
Y
A
 
V
H
 
D
R
 
R
V
 
V
R
 
G
L
 
L
S
 
A
D
 
D
T
|
T
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
R
E
 
Q
V
 
V
A
 
Y
D
 
A
V
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
E
L
 
V
R
 
R
A
 
R
E
 
V
L
 
V
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
G
P
 
P
R
 
R
A
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
V
S
 
D
I
 
I
G
 
E
T
 
F
H
|
H
F
 
G
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
T
G
 
G
M
 
C
A
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
Y
T
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
E
C
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
C
 
H
A
 
V
D
 
D
V
 
T
S
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
N
G
 
G
V
 
I
-
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
M
E
 
Y
E
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
P
A
 
E
L
 
Y
V
 
V
V
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
R
A
 
R
R
 
K
F
 
Y
E
 
K
L
 
L
A
 
E
P
 
M
L
 
L
R
 
P
A
 
E
L
 
L
C
 
D
G
 
R
Q
 
M
V
 
V
A
 
A
Q
 
R
A
 
M
A
 
V
S
 
G
L
 
V
S
 
E
V
 
I
P
 
P
R
 
F
H
 
N
W
 
N
P
 
Y
V
 
I
A
 
T
G
 
G
R
 
E
D
 
T
I
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
H
E
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
M
H
 
H
A
 
L
H
 
K
G
 
A
V
 
I
R
 
Y
R
 
I
D
 
N
P
 
P
S
 
E
L
 
A
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
E
 
E
L
 
V
V
 
F
G
 
G
D
 
V
S
 
K
R
 
R
R
 
K
M
 
L
G
 
I
V
 
I
-
 
A
G
 
S
R
 
R
K
 
L
S
 
T
G
 
G
V
 
R
A
 
H
A
 
A
V
 
I
A
 
K
A
 
A
A
 
R
L
 
A
A
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
G
I
 
L
L
 
H
P
 
Y
P
 
G
P
 
E
D
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
H
A
 
R
I
 
V
V
 
T
E
 
Q
A
 
H
V
 
I
R
 
K
D
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
D
T
 
-
L
 
-
R
 
R
R
 
G
P
 
Q
L
 
L
T
 
T
P
 
L
A
 
E
E
 
E
L
 
L

4ov4A Isopropylmalate synthase binding with ketoisovalerate (see paper)
26% identity, 81% coverage: 2:370/455 of query aligns to 6:374/379 of 4ov4A

query
sites
4ov4A
L
 
I
L
 
Q
D
 
D
T
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
E
x
D
G
 
G
E
 
N
Q
|
Q
S
 
A
F
 
L
G
 
K
T
 
R
Y
 
P
L
 
W
S
 
T
M
 
I
A
 
D
D
 
E
R
 
K
E
 
I
R
 
E
V
 
V
L
 
F
R
 
D
G
 
L
L
 
L
A
 
V
A
 
E
V
 
L
G
 
N
V
 
V
P
 
D
E
 
G
A
 
I
E
 
E
V
 
V
G
 
G
W
 
F
-
 
P
-
 
S
A
 
S
G
 
N
R
 
E
E
 
T
D
 
E
L
 
F
T
 
H
D
 
T
M
 
C
L
 
Q
A
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
P
P
 
K
G
 
G
L
 
K
A
 
P
A
 
I
A
 
A
A
 
A
W
 
L
C
 
S
R
 
R
C
 
A
R
 
N
P
 
Q
G
 
N
D
 
E
L
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
T
-
 
W
R
 
E
A
 
A
A
 
I
V
 
Q
A
 
K
C
 
A
G
 
D
A
 
C
S
 
P
R
 
R
V
 
M
C
 
H
V
 
I
G
 
V
V
 
Y
P
 
P
V
 
V
S
 
S
D
 
D
A
 
F
H
 
S
L
 
I
A
 
K
R
 
H
R
 
V
L
 
L
G
 
K
L
 
I
G
 
S
R
 
E
A
 
K
A
 
E
L
 
V
L
 
L
D
 
Q
L
 
K
L
 
I
A
 
R
A
 
N
T
 
S
L
 
I
A
 
S
E
 
F
A
 
A
R
 
R
M
 
S
L
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
P
G
 
G
I
 
I
E
 
E
-
 
I
-
 
Q
-
 
F
-
 
S
-
 
G
-
 
E
H
 
H
V
 
F
T
 
G
V
 
D
G
 
A
M
 
I
E
 
E
D
 
N
A
 
F
S
 
A
R
 
F
A
 
T
D
 
K
R
 
E
A
 
A
F
 
F
V
 
L
F
 
T
A
 
A
V
 
I
A
 
E
C
 
A
H
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
N
R
 
I
V
 
I
R
 
N
L
 
L
S
x
P
D
 
N
T
|
T
V
 
V
G
 
E
L
 
R
Y
 
Y
T
 
R
P
 
P
L
 
M
E
 
V
V
 
F
A
 
V
D
 
N
V
 
M
V
 
V
R
 
K
A
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
E
L
 
I
E
 
K
G
 
D
A
 
V
R
 
V
Q
 
K
D
 
D
D
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
K
V
 
A
S
 
I
I
 
I
G
 
S
T
 
I
H
|
H
F
 
T
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
G
 
G
M
 
M
A
 
A
T
 
T
A
 
A
N
 
T
A
 
S
L
 
V
T
 
E
A
 
S
L
 
V
E
 
Y
C
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
E
C
 
Q
A
 
I
D
 
E
V
 
V
S
 
A
V
 
L
L
 
N
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
N
A
 
T
R
 
N
L
 
L
E
 
Y
E
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
H
V
 
Q
R
 
N
G
 
G
R
 
E
A
 
N
-
 
L
R
 
N
F
 
I
E
 
N
L
 
F
A
 
Q
P
 
R
L
 
I
R
 
Y
A
 
P
L
 
T
C
 
A
G
 
K
Q
 
R
V
 
I
A
 
S
Q
 
E
A
 
L
A
 
T
S
 
G
L
 
I
S
 
P
V
 
I
P
 
G
R
 
E
H
 
K
W
 
T
P
 
P
V
 
I
A
 
I
G
 
G
R
 
E
D
 
D
I
 
I
F
 
F
A
 
S
V
 
H
E
 
R
S
 
S
G
 
G
L
 
I
H
 
H
A
 
Q
H
 
H
G
 
-
V
 
-
R
 
-
R
 
Q
D
 
S
P
 
K
S
 
G
L
 
A
F
 
Y
E
 
R
P
 
T
F
 
F
P
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
F
V
 
V
G
 
G
-
 
R
-
 
M
D
 
D
S
 
K
R
 
E
R
 
T
M
 
I
G
 
S
V
 
F
G
 
T
R
 
N
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
V
 
H
A
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
E
A
 
F
A
 
L
L
 
L
A
 
H
E
 
Q
L
 
R
S
 
G
I
 
I
L
 
Q
P
 
V
P
 
S
P
 
K
D
 
E
E
 
G
L
 
I
P
 
H
A
 
H
I
 
L
V
 
F
E
 
S
A
 
L
V
 
A
R
 
K
D
 
S
L
 
I
S
 
S
A
 
S
-
 
R
T
 
E
L
 
N
R
 
N
R
 
R
P
 
E
L
 
I
T
 
T
P
 
E
A
 
A
E
 
E
L
 
L

4ov9A Structure of isopropylmalate synthase binding with alpha- isopropylmalate (see paper)
25% identity, 81% coverage: 2:370/455 of query aligns to 6:376/380 of 4ov9A

query
sites
4ov9A
L
 
I
L
 
Q
D
 
D
T
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
E
x
D
G
 
G
E
 
N
Q
|
Q
S
 
A
F
 
L
G
 
K
T
 
R
Y
 
P
L
 
W
S
 
T
M
 
I
A
 
D
D
 
E
R
 
K
E
 
I
R
 
E
V
 
V
L
 
F
R
 
D
G
 
L
L
 
L
A
 
V
A
 
E
V
 
L
G
 
N
V
 
V
P
 
D
E
 
G
A
 
I
E
 
E
V
 
V
G
 
G
W
 
F
-
 
P
-
 
S
A
 
S
G
 
N
R
 
E
E
 
T
D
 
E
L
 
F
T
 
H
D
 
T
M
 
C
L
 
Q
A
 
V
L
 
L
S
 
S
A
 
K
R
 
R
V
 
A
A
 
P
P
 
K
G
 
G
L
 
K
A
 
P
A
 
I
A
 
A
A
 
A
W
x
L
C
 
S
R
 
R
C
 
A
R
 
N
P
 
Q
G
 
N
D
 
E
L
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
T
-
 
W
R
 
E
A
 
A
A
 
I
V
 
Q
A
 
K
C
 
A
G
 
D
A
 
C
S
 
P
R
 
R
V
 
M
C
 
H
V
 
I
G
 
V
V
 
Y
P
 
P
V
 
V
S
 
S
D
 
D
A
 
F
H
 
S
L
 
I
A
 
K
R
 
H
R
 
V
L
 
L
G
 
K
L
 
I
G
 
S
R
 
E
A
 
K
A
 
E
L
 
V
L
 
L
D
 
Q
L
 
K
L
 
I
A
 
R
A
 
N
T
 
S
L
 
I
A
 
S
E
 
F
A
 
A
R
 
R
M
 
S
L
 
I
-
 
V
-
 
G
-
 
P
G
 
G
I
 
I
E
 
E
-
 
I
-
 
Q
-
 
F
-
 
S
-
 
G
-
 
E
H
 
H
V
 
F
T
 
G
V
 
D
G
 
A
M
 
I
E
 
E
D
 
N
A
 
F
S
 
A
R
 
F
A
 
T
D
 
K
R
 
E
A
 
A
F
 
F
V
 
L
F
 
T
A
 
A
V
 
I
A
 
E
C
 
A
H
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
H
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
N
R
 
I
V
 
I
R
 
N
L
 
L
S
 
P
D
 
N
T
|
T
V
 
V
G
 
E
L
 
R
Y
 
Y
T
 
R
P
 
P
L
 
M
E
 
V
V
 
F
A
 
V
D
 
N
V
 
M
V
 
V
R
 
K
A
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
E
L
 
I
E
 
K
G
 
D
A
 
V
R
 
V
Q
 
K
D
 
D
D
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
K
V
 
A
S
 
I
I
 
I
G
 
S
T
 
I
H
|
H
F
 
T
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
G
 
G
M
 
M
A
 
A
T
 
T
A
 
A
N
 
T
A
 
S
L
 
V
T
 
E
A
 
S
L
 
V
E
 
Y
C
 
V
G
 
G
A
 
A
D
 
E
C
 
Q
A
 
I
D
 
E
V
 
V
S
 
A
V
 
L
L
 
N
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
N
A
 
T
R
 
N
L
 
L
E
 
Y
E
 
E
L
 
T
A
 
A
A
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
H
V
 
Q
R
 
N
G
 
G
R
 
E
A
 
N
-
 
L
R
 
N
F
 
I
E
 
N
L
 
F
A
 
Q
P
 
R
L
 
I
R
 
Y
A
 
P
L
 
T
C
 
A
G
 
K
Q
 
R
V
 
I
A
 
S
Q
 
E
A
 
L
A
 
T
S
 
G
L
 
I
S
 
P
V
 
I
P
 
G
R
 
E
H
 
K
W
 
T
P
 
P
V
 
I
A
 
I
G
 
G
R
 
E
D
 
D
I
 
I
F
 
F
A
 
S
V
 
H
E
 
R
S
 
S
G
 
G
L
 
I
H
 
H
A
 
-
H
 
Q
G
 
T
V
 
L
R
 
H
R
 
Q
D
 
S
P
 
K
S
 
G
L
 
A
F
 
Y
E
 
R
P
 
T
F
 
F
P
 
S
P
 
P
E
 
E
L
 
F
V
 
V
G
 
G
-
 
R
-
 
M
D
 
D
S
 
K
R
 
E
R
 
T
M
 
I
G
 
S
V
 
F
G
 
T
R
 
N
K
 
Q
S
 
S
G
 
G
V
 
H
A
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
E
A
 
F
A
 
L
L
 
L
A
 
H
E
 
Q
L
 
R
S
 
G
I
 
I
L
 
Q
P
 
V
P
 
S
P
 
K
D
 
E
E
 
G
L
 
I
P
 
H
A
 
H
I
 
L
V
 
F
E
 
S
A
 
L
V
 
A
R
 
K
D
 
S
L
 
I
S
 
S
A
 
S
-
 
R
T
 
E
L
 
N
R
 
N
R
 
R
P
 
E
L
 
I
T
 
T
P
 
E
A
 
A
E
 
E
L
 
L

2zyfA Crystal structure of homocitrate synthase from thermus thermophilus complexed with magnesuim ion and alpha-ketoglutarate (see paper)
29% identity, 70% coverage: 2:320/455 of query aligns to 6:311/314 of 2zyfA

query
sites
2zyfA
L
 
I
L
 
I
D
 
D
T
 
S
T
 
T
L
 
L
R
|
R
E
|
E
G
 
G
E
 
E
Q
|
Q
S
 
F
F
 
E
G
 
K
T
 
A
Y
 
N
L
 
F
S
 
S
M
 
T
A
 
Q
D
 
D
R
 
K
E
 
V
R
 
E
V
 
I
L
 
A
R
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
E
V
 
F
G
 
G
V
 
I
P
 
E
E
 
Y
A
 
I
E
 
E
V
 
V
G
 
T
W
 
T
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
P
A
 
Q
G
 
S
R
 
R
E
 
K
D
 
D
L
 
A
T
 
E
D
 
V
M
 
L
-
 
A
-
 
S
L
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
P
 
T
G
x
H
L
 
I
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
W
 
-
C
 
-
R
 
Q
C
 
C
R
 
R
P
 
L
G
 
D
D
 
A
L
 
A
R
 
K
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
E
C
 
T
G
 
G
A
 
V
S
 
Q
R
 
G
V
 
I
C
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
D
A
 
L
H
x
L
L
 
F
A
 
G
R
 
T
R
 
S
L
 
K
G
 
G
L
 
R
G
 
D
R
 
I
A
 
P
A
 
R
L
 
I
L
 
I
D
 
E
L
 
E
L
 
A
A
 
K
A
 
E
T
 
V
L
 
I
A
 
A
E
 
Y
A
 
I
R
 
R
M
 
E
L
 
A
G
 
A
I
 
-
E
 
P
H
 
H
V
 
V
T
 
E
V
 
V
G
x
R
M
 
F
-
 
S
-
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
T
S
 
F
R
 
R
A
 
S
D
 
E
R
 
E
A
 
Q
F
 
D
V
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
-
C
 
Y
H
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
H
 
P
G
 
Y
A
 
V
H
 
D
R
 
R
V
 
V
R
 
G
L
 
L
S
 
A
D
 
D
T
|
T
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
R
E
 
Q
V
 
V
A
 
Y
D
 
A
V
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
E
L
 
V
R
 
R
A
 
R
E
 
V
L
 
V
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
G
R
 
P
R
 
R
V
 
V
S
 
D
I
 
I
G
 
E
T
 
F
H
|
H
F
 
G
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
T
G
 
G
M
 
C
A
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
Y
T
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
E
C
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
C
 
H
A
 
V
D
 
D
V
 
T
S
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
N
G
 
G
V
 
I
-
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
M
E
 
Y
E
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
P
A
 
E
L
 
Y
V
 
V
V
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
R
A
 
R
R
 
K
F
 
Y
E
 
K
L
 
L
A
 
E
P
 
M
L
 
L
R
 
P
A
 
E
L
 
L
C
 
D
G
 
R
Q
 
M
V
 
V
A
 
A
Q
 
R
A
 
M
A
 
V
S
 
G
L
 
V
S
 
E
V
 
I
P
 
P
R
 
F
H
 
N
W
 
N
P
 
Y
V
 
I
A
 
T
G
 
G
R
 
E
D
 
T
I
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
H
E
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
M
H
 
H
A
 
L
H
 
K
G
 
A
V
 
I
R
 
Y
R
 
I
D
 
N
P
 
P
S
 
E
L
 
A
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
E
 
E
L
 
V
V
 
F
G
 
G
D
 
V
S
 
K
R
 
R
R
 
K
M
 
L

2ztjA Crystal structure of homocitrate synthase from thermus thermophilus complexed with alpha-ketoglutarate (see paper)
29% identity, 70% coverage: 2:320/455 of query aligns to 6:309/312 of 2ztjA

query
sites
2ztjA
L
 
I
L
 
I
D
 
D
T
 
S
T
 
T
L
 
L
R
|
R
E
|
E
G
 
G
E
 
E
Q
|
Q
S
 
F
F
 
E
G
 
K
T
 
A
Y
 
N
L
 
F
S
 
S
M
 
T
A
 
Q
D
 
D
R
 
K
E
 
V
R
 
E
V
 
I
L
 
A
R
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
E
V
 
F
G
 
G
V
 
I
P
 
E
E
 
Y
A
 
I
E
 
E
V
 
V
G
 
T
W
 
T
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
P
A
 
Q
G
 
S
R
 
R
E
 
K
D
 
D
L
 
A
T
 
E
D
 
V
M
 
L
-
 
A
-
 
S
L
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
P
 
T
G
x
H
L
 
I
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
W
 
-
C
 
-
R
 
Q
C
 
C
R
 
R
P
 
L
G
 
D
D
 
A
L
 
A
R
 
K
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
E
C
 
T
G
 
G
A
 
V
S
 
Q
R
 
G
V
 
I
C
 
D
V
 
L
G
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
x
L
L
 
F
G
 
G
L
 
T
G
 
G
R
 
R
A
 
D
A
 
I
-
 
P
-
 
R
L
 
I
L
 
I
D
 
E
L
 
E
L
 
A
A
 
K
A
 
E
T
 
V
L
 
I
A
 
A
E
 
Y
A
 
I
R
 
R
M
 
E
L
 
A
G
 
A
I
 
-
E
 
P
H
 
H
V
 
V
T
 
E
V
 
V
G
x
R
M
 
F
-
 
S
-
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
T
S
 
F
R
 
R
A
 
S
D
 
E
R
 
E
A
 
Q
F
 
D
V
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
-
C
 
Y
H
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
H
 
P
G
 
Y
A
 
V
H
 
D
R
 
R
V
 
V
R
 
G
L
 
L
S
x
A
D
 
D
T
|
T
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
R
E
 
Q
V
 
V
A
 
Y
D
 
A
V
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
E
L
 
V
R
 
R
A
 
R
E
 
V
L
 
V
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
G
R
 
P
R
 
R
V
 
V
S
 
D
I
 
I
G
 
E
T
 
F
H
|
H
F
 
G
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
T
G
 
G
M
 
C
A
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
Y
T
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
E
C
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
C
 
H
A
 
V
D
 
D
V
 
T
S
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
N
G
 
G
V
 
I
-
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
M
E
 
Y
E
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
P
A
 
E
L
 
Y
V
 
V
V
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
R
A
 
R
R
 
K
F
 
Y
E
 
K
L
 
L
A
 
E
P
 
M
L
 
L
R
 
P
A
 
E
L
 
L
C
 
D
G
 
R
Q
 
M
V
 
V
A
 
A
Q
 
R
A
 
M
A
 
V
S
 
G
L
 
V
S
 
E
V
 
I
P
 
P
R
 
F
H
 
N
W
 
N
P
 
Y
V
 
I
A
 
T
G
 
G
R
 
E
D
 
T
I
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
H
E
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
M
H
 
H
A
 
L
H
 
K
G
 
A
V
 
I
R
 
Y
R
 
I
D
 
N
P
 
P
S
 
E
L
 
A
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
E
 
E
L
 
V
V
 
F
G
 
G
D
 
V
S
 
K
R
 
R
R
 
K
M
 
L

3a9iA Crystal structure of homocitrate synthase from thermus thermophilus complexed with lys (see paper)
30% identity, 69% coverage: 2:315/455 of query aligns to 5:305/347 of 3a9iA

query
sites
3a9iA
L
 
I
L
 
I
D
 
D
T
 
S
T
 
T
L
 
L
R
|
R
E
|
E
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
S
 
F
F
 
E
G
 
K
T
 
A
Y
 
N
L
 
F
S
 
S
M
 
T
A
 
Q
D
 
D
R
 
K
E
 
V
R
 
E
V
 
I
L
 
A
R
 
K
G
 
A
L
 
L
A
 
D
A
 
E
V
 
F
G
 
G
V
 
I
P
 
E
E
 
Y
A
 
I
E
 
E
V
 
V
G
 
T
W
 
T
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
S
-
 
P
A
 
Q
G
 
S
R
 
R
E
 
K
D
 
D
L
 
A
T
 
E
D
 
V
M
 
L
-
 
A
-
 
S
L
 
L
A
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
V
P
 
T
G
 
H
L
 
I
A
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
W
 
-
C
 
-
R
 
Q
C
 
C
R
 
R
P
 
L
G
 
D
D
 
A
L
 
A
R
 
K
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
E
C
 
T
G
 
G
A
 
V
S
 
Q
R
 
G
V
 
I
C
 
-
V
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
V
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
H
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
R
x
D
L
 
L
G
 
L
L
 
F
G
 
G
R
 
T
A
 
S
A
 
K
L
 
Y
L
 
L
D
 
D
L
 
I
L
 
-
A
 
P
A
 
R
T
 
I
L
 
I
A
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
K
M
 
E
L
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
Y
-
 
I
-
 
R
-
 
E
G
 
A
I
 
A
E
 
P
H
 
H
V
 
V
T
 
E
V
 
V
G
 
R
M
 
F
-
x
S
-
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
T
S
 
F
R
 
R
A
 
S
D
 
E
R
 
E
A
 
Q
F
 
D
V
 
L
F
 
L
A
 
A
V
 
V
A
 
-
C
 
Y
H
 
E
A
 
A
A
 
V
A
 
A
H
 
P
G
 
Y
A
 
V
H
 
D
R
 
R
V
 
V
R
 
G
L
 
L
S
 
A
D
 
D
T
|
T
V
 
V
G
 
G
L
 
V
Y
 
A
T
 
T
P
 
P
L
 
R
E
 
Q
V
 
V
A
 
Y
D
 
A
V
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
E
L
 
V
R
 
R
A
 
R
E
 
V
L
 
V
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
G
P
 
P
R
 
R
A
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
V
S
 
D
I
 
I
G
 
E
T
 
F
H
|
H
F
 
G
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
T
G
 
G
M
 
C
A
 
A
T
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
Y
T
 
E
A
 
A
L
 
I
E
 
E
C
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
C
 
H
A
 
V
D
 
D
V
 
T
S
 
T
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
N
G
 
G
V
 
I
-
 
T
-
 
P
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
F
-
 
L
A
 
A
R
 
R
L
 
M
E
 
Y
E
 
T
L
 
L
A
 
Q
A
 
P
A
 
E
L
 
Y
V
 
V
V
 
-
R
 
-
G
 
-
R
 
R
A
 
R
R
 
K
F
 
Y
E
 
K
L
 
L
A
 
E
P
 
M
L
 
L
R
 
P
A
 
E
L
 
L
C
 
D
G
 
R
Q
 
M
V
 
V
A
 
A
Q
 
R
A
 
M
A
 
V
S
 
G
L
 
V
S
 
E
V
 
I
P
 
P
R
 
F
H
 
N
W
 
N
P
 
Y
V
 
I
A
 
T
G
 
G
R
 
E
D
 
T
I
 
A
F
 
F
A
 
S
V
 
H
E
 
K
S
 
A
G
 
G
L
 
M
H
 
H
A
 
L
H
 
K
G
 
A
V
 
I
R
 
Y
R
 
I
D
 
N
P
 
P
S
 
E
L
 
A
F
 
Y
E
 
E
P
 
P
F
 
Y
P
 
P
P
 
P
E
 
E
L
 
V
V
 
F
G
 
G

Q8F3Q1 (R)-citramalate synthase CimA; LiCMS; EC 2.3.3.21 from Leptospira interrogans serogroup Icterohaemorrhagiae serovar Lai (strain 56601) (see 2 papers)
24% identity, 82% coverage: 2:375/455 of query aligns to 10:385/516 of Q8F3Q1

query
sites
Q8F3Q1
L
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
E
x
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
Q
S
 
T
F
 
R
G
 
G
T
 
V
Y
 
S
L
 
F
S
 
S
M
 
T
A
 
S
D
 
E
R
 
K
E
 
L
R
 
N
V
 
I
L
 
A
R
 
K
G
 
F
L
 
L
-
 
L
A
 
Q
A
 
K
V
 
L
G
 
N
V
 
V
P
 
D
E
 
R
A
 
V
E
 
E
V
 
I
G
 
A
-
 
S
-
 
A
-
 
R
-
 
V
-
 
S
-
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
T
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
E
W
 
W
A
 
A
G
 
A
R
 
T
E
 
E
D
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
E
M
 
R
L
 
I
A
 
E
L
 
I
S
x
L
A
 
G
R
x
F
V
 
V
A
 
-
P
 
D
G
 
G
L
 
N
A
 
K
A
 
T
A
 
V
A
 
D
W
 
W
C
 
I
R
 
K
C
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
D
C
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
K
R
 
V
V
 
L
C
 
N
V
 
L
G
x
L
V
 
T
P
 
K
V
 
G
S
 
S
D
 
L
A
 
H
H
 
H
L
 
L
A
 
E
R
 
K
R
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
K
G
 
T
R
 
P
A
 
K
A
 
E
L
 
F
L
 
F
D
 
T
L
 
D
L
 
V
A
 
S
A
 
F
T
 
V
L
 
I
A
 
E
E
 
Y
A
 
A
R
 
I
M
 
K
L
 
S
G
 
G
I
 
L
E
 
K
H
 
-
V
 
I
T
 
N
V
 
V
G
x
Y
M
 
L
E
|
E
D
 
D
A
 
W
S
 
S
R
 
N
A
 
G
D
 
F
R
 
R
A
 
N
-
 
S
-
 
P
-
 
D
F
 
Y
V
 
V
F
 
K
A
 
S
V
 
L
A
 
V
C
 
E
H
 
H
A
 
L
A
 
S
A
 
K
H
 
E
G
 
H
A
 
I
H
 
E
R
 
R
V
 
I
R
 
F
L
 
L
S
 
P
D
 
D
T
|
T
V
 
L
G
 
G
L
 
V
Y
 
L
T
 
S
P
 
P
L
 
E
E
 
E
V
 
T
A
 
F
D
 
Q
V
 
G
V
 
V
R
 
D
A
 
S
L
 
L
R
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
I
P
 
Q
R
 
K
A
 
Y
R
 
P
R
 
D
V
 
I
S
 
H
I
 
F
G
 
E
T
 
F
H
 
H
F
 
G
H
 
H
N
 
N
D
 
D
C
 
Y
G
 
D
M
 
L
A
 
S
T
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
S
L
 
L
T
 
Q
A
 
A
L
 
I
E
 
R
C
 
A
G
 
G
A
 
V
D
 
K
C
 
G
A
 
L
D
 
H
V
 
A
S
 
S
V
 
I
L
 
N
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
N
A
 
T
R
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
T
A
 
T
L
 
I
V
 
H
V
 
D
R
 
K
G
 
S
R
 
N
A
 
S
R
 
K
F
 
T
E
 
N
L
 
I
A
 
N
P
 
E
L
 
I
R
 
A
-
 
I
-
 
T
-
 
E
-
 
A
A
 
S
L
 
R
C
 
L
G
 
V
Q
 
E
V
 
V
A
 
F
Q
 
S
A
 
G
A
 
K
S
 
R
L
 
I
S
 
S
V
 
A
P
 
N
R
 
R
H
 
-
W
 
-
P
 
P
V
 
I
A
 
V
G
 
G
R
 
E
D
 
D
I
 
V
F
 
F
A
 
T
V
 
Q
E
 
T
S
 
A
G
 
G
L
 
V
H
|
H
A
 
A
H
x
D
G
 
G
V
 
D
R
 
K
R
 
K
D
 
G
P
x
N
S
x
L
L
x
Y
F
 
A
E
 
N
P
 
P
F
 
I
P
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
R
V
 
F
G
 
G
D
 
R
S
 
K
R
 
R
R
 
S
M
 
Y
G
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
K
K
 
L
S
 
A
G
 
G
V
 
K
A
 
A
A
 
S
V
 
I
A
 
S
A
 
E
A
 
N
L
 
V
A
 
K
E
 
Q
L
 
L
S
 
G
I
 
M
L
 
V
P
 
L
P
 
S
P
 
E
D
 
V
E
 
V
L
 
L
P
 
Q
A
 
K
I
 
V
V
 
L
E
 
E
A
 
R
V
 
V
R
 
I
D
 
E
L
 
L
S
 
G
A
 
D
T
 
Q
L
 
-
R
 
N
R
 
K
P
 
L
L
 
V
T
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
D
L
 
L
-
 
P
-
 
F
-
 
I
-
 
I
A
 
A
E
 
D
V
 
V
A
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3rmjB Crystal structure of truncated alpha-isopropylmalate synthase from neisseria meningitidis (see paper)
31% identity, 55% coverage: 1:251/455 of query aligns to 5:250/308 of 3rmjB

query
sites
3rmjB
M
 
I
L
 
I
L
 
F
D
 
D
T
 
T
T
 
T
L
 
L
R
 
R
E
x
D
G
 
G
E
 
E
Q
|
Q
S
 
S
F
 
P
G
 
G
T
 
A
Y
 
A
L
 
M
S
 
T
M
 
K
A
 
E
D
 
E
R
 
K
E
 
I
R
 
R
V
 
V
L
 
A
R
 
R
G
 
Q
L
 
L
A
 
E
A
 
K
V
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
D
E
 
I
A
 
I
E
 
E
V
 
A
G
 
G
W
 
F
A
 
A
G
 
A
R
 
A
E
 
S
D
 
P
L
 
-
T
 
G
D
 
D
M
 
F
L
 
E
A
 
A
L
 
V
S
 
N
A
 
A
R
 
-
V
 
I
A
 
A
P
 
K
G
 
T
L
 
I
A
 
T
A
 
K
A
 
S
A
 
T
W
 
V
C
 
C
-
 
S
-
 
L
-
 
S
R
 
R
C
 
A
R
 
I
P
 
E
G
 
R
D
 
D
L
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
A
V
 
G
A
 
E
C
 
A
G
 
V
A
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
K
S
 
K
R
 
R
V
 
I
C
 
H
V
 
T
G
 
F
V
 
I
P
 
A
V
 
T
S
 
S
D
 
P
A
 
I
H
 
H
L
 
M
A
 
E
R
 
Y
R
 
K
L
 
L
G
 
K
L
 
M
G
 
K
R
 
P
A
 
K
A
 
Q
L
 
V
L
 
I
D
 
E
L
 
A
L
 
A
A
 
V
A
 
K
T
 
A
L
 
V
A
 
K
E
 
I
A
 
A
R
 
R
M
 
E
L
 
Y
G
 
-
I
 
T
E
 
D
H
 
D
V
 
V
T
 
E
V
 
F
G
 
S
M
 
C
E
 
E
D
 
D
A
 
A
S
 
L
R
 
R
A
 
S
D
 
E
R
 
I
A
 
D
F
 
F
V
 
L
F
 
A
A
 
E
V
 
I
A
 
C
C
 
G
H
 
A
A
 
V
A
 
I
A
 
E
H
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
T
R
 
T
V
 
I
R
 
N
L
 
I
S
 
P
D
 
D
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
Y
Y
 
S
T
 
I
P
 
P
L
 
Y
E
 
K
V
 
T
A
 
E
D
 
E
V
 
F
V
 
F
R
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
I
A
 
A
E
 
K
L
 
-
E
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
T
P
 
P
R
 
N
A
 
G
R
 
G
R
 
K
V
 
V
S
 
V
I
 
W
G
 
S
T
 
A
H
|
H
F
 
C
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
L
G
 
G
M
 
L
A
 
A
T
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
S
L
 
L
T
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
K
C
 
G
G
 
G
A
 
A
D
 
R
C
 
Q
A
 
V
D
 
E
V
 
C
S
 
T
V
 
V
L
 
N
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
G
V
x
N
A
 
A
R
 
S
L
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
I
A
 
V
A
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
K
V
 
V
R
 
R

3bliA Crystal structure of the catalytic domain of licms in complexed with pyruvate and acetyl-coa (see paper)
23% identity, 70% coverage: 2:318/455 of query aligns to 4:311/311 of 3bliA

query
sites
3bliA
L
 
I
L
 
L
D
 
D
T
 
V
T
 
T
L
 
L
R
|
R
E
x
D
G
 
G
E
 
E
Q
|
Q
S
 
T
F
 
R
G
 
G
T
 
V
Y
 
S
L
 
F
S
 
S
M
 
T
A
 
S
D
 
E
R
 
K
E
 
L
R
 
N
V
 
I
L
 
A
R
 
K
G
 
F
L
 
L
-
 
L
A
 
Q
A
 
K
V
 
L
G
 
N
V
 
V
P
 
D
E
 
R
A
 
V
E
 
E
V
 
I
G
 
A
-
 
S
-
 
A
-
x
R
-
x
V
-
 
S
-
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
T
-
 
V
-
 
Q
-
 
K
-
 
I
-
 
M
-
 
E
W
 
W
A
 
A
G
 
A
R
 
T
E
 
E
D
 
Q
L
 
L
T
 
T
D
 
E
M
 
R
L
 
I
A
 
E
L
 
I
S
 
L
A
 
G
R
 
F
V
 
V
A
 
-
P
 
D
G
 
G
L
 
N
A
 
K
A
 
T
A
 
V
A
 
D
W
 
W
C
 
I
R
 
K
C
 
-
R
 
-
P
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
D
C
 
S
G
 
G
A
 
A
S
 
K
R
 
V
V
 
L
C
 
N
V
 
L
G
 
L
V
 
T
P
 
K
V
 
G
S
 
S
D
 
L
A
 
H
H
 
H
L
 
L
A
 
E
R
 
K
R
 
Q
L
 
L
G
 
G
L
 
K
G
 
T
R
 
P
A
 
K
A
 
E
L
 
F
L
 
F
D
 
T
L
 
D
L
 
V
A
 
S
A
 
F
T
 
V
L
 
I
A
 
E
E
 
Y
A
 
A
R
 
I
M
 
K
L
 
S
G
 
G
I
 
L
E
 
K
H
 
-
V
 
I
T
 
N
V
 
V
G
x
Y
M
 
L
E
|
E
D
 
D
A
 
W
S
 
S
R
 
N
A
 
G
D
 
F
R
 
R
A
 
N
-
 
S
-
 
P
-
 
D
F
 
Y
V
 
V
F
 
K
A
 
S
V
 
L
A
 
V
C
 
E
H
 
H
A
 
L
A
 
S
A
 
K
H
 
E
G
 
H
A
 
I
H
 
E
R
 
R
V
 
I
R
 
F
L
 
L
S
x
P
D
 
D
T
|
T
V
 
L
G
 
G
L
 
V
Y
 
L
T
 
S
P
 
P
L
 
E
E
 
E
V
 
T
A
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
-
R
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
-
A
 
-
E
 
-
L
 
F
E
 
Q
G
 
G
A
 
V
R
 
-
Q
 
-
D
 
D
D
 
S
T
 
L
A
 
I
P
 
Q
R
 
K
A
 
Y
R
 
P
R
 
D
V
 
I
S
 
H
I
 
F
G
 
E
T
 
F
H
|
H
F
 
G
H
|
H
N
 
N
D
 
D
C
 
Y
G
 
D
M
 
L
A
 
S
T
 
V
A
 
A
N
 
N
A
 
S
L
 
L
T
 
Q
A
 
A
L
 
I
E
 
R
C
 
A
G
 
G
A
 
V
D
 
K
C
 
G
A
 
L
D
 
H
V
 
A
S
 
S
V
 
I
L
 
N
G
 
G
L
 
L
G
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
N
A
 
T
R
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
T
A
 
T
L
 
I
V
 
H
V
 
D
R
 
K
G
 
S
R
 
N
A
 
S
R
 
K
F
 
T
E
 
N
L
 
I
A
 
N
P
 
E
L
 
I
-
 
A
-
 
I
-
 
T
-
 
E
R
 
A
A
 
S
L
 
R
C
 
L
G
 
V
Q
 
E
V
 
V
A
 
F
Q
 
S
A
 
G
A
 
K
S
 
R
L
 
I
S
 
S
V
 
A
P
 
N
R
 
R
H
 
-
W
 
-
P
 
P
V
 
I
A
 
V
G
 
G
R
 
E
D
 
D
I
 
V
F
 
F
A
 
T
V
 
Q
E
 
T
S
 
A
G
 
G
L
 
V
H
 
N
A
 
L
H
 
Y
G
 
A
V
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
-
L
 
-
F
 
-
E
 
N
P
 
P
F
 
I
P
 
L
P
 
P
E
 
E
L
 
R
V
 
F
G
 
G
D
 
R
S
 
K
R
 
R

Q53WI0 4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase; HOA; 4-hydroxy-2-keto-pentanoic acid aldolase; 4-hydroxy-2-oxohexanoate aldolase; 4-hydroxy-2-oxopentanoate aldolase; EC 4.1.3.39; EC 4.1.3.43 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8) (see paper)
37% identity, 21% coverage: 152:248/455 of query aligns to 163:247/347 of Q53WI0

query
sites
Q53WI0
H
 
Y
G
 
G
A
 
A
H
 
D
R
 
V
V
 
V
R
 
Y
L
 
I
S
 
V
D
 
D
T
 
S
V
 
A
G
 
G
L
 
A
Y
 
M
T
 
L
P
 
P
L
 
E
E
 
D
V
 
A
A
 
Y
D
 
A
V
 
R
V
 
V
R
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
K
A
 
E
E
 
A
L
 
L
E
 
S
G
 
-
A
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
R
 
R
V
 
A
S
 
K
I
 
V
G
 
G
T
 
F
H
 
H
F
 
A
H
 
H
N
 
N
D
 
N
C
 
L
G
 
G
M
 
L
A
 
A
T
 
I
A
 
G
N
 
N
A
 
T
L
 
L
T
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
A
C
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
C
 
W
A
 
V
D
 
D
V
 
A
S
 
T
V
 
L
L
 
R
G
 
G
L
 
Y
G
 
G
E
 
A
R
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
N
A
 
A
R
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

P9WQB3 2-isopropylmalate synthase; Alpha-IPM synthase; Alpha-isopropylmalate synthase; EC 2.3.3.13 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
23% identity, 65% coverage: 7:301/455 of query aligns to 79:385/644 of P9WQB3

query
sites
P9WQB3
L
|
L
R
|
R
E
x
D
G
|
G
E
x
N
Q
|
Q
S
x
A
F
x
L
G
x
I
T
x
D
Y
x
P
L
x
M
S
|
S
M
x
P
A
|
A
D
x
R
R
x
K
E
x
R
R
|
R
V
x
M
L
x
F
R
x
D
G
x
L
L
|
L
A
x
V
A
x
R
V
x
M
G
|
G
V
x
Y
P
x
K
E
|
E
A
x
I
E
|
E
V
|
V
G
|
G
W
x
F
A
x
P
G
x
S
R
x
A
E
x
S
-
x
Q
-
x
T
-
x
D
-
x
F
D
|
D
L
x
F
T
x
V
D
x
R
M
x
E
L
x
I
A
x
I
L
x
E
S
x
Q
A
x
G
R
x
A
V
x
I
A
x
P
P
x
D
G
x
D
L
x
V
A
x
T
A
x
I
A
x
Q
A
x
V
W
x
L
C
x
T
R
x
Q
C
|
C
R
|
R
P
|
P
G
x
E
D
x
L
L
x
I
-
x
E
R
|
R
A
x
T
A
x
F
V
x
Q
A
|
A
C
|
C
-
x
S
G
|
G
A
|
A
S
x
P
R
|
R
V
x
A
C
x
I
V
|
V
G
x
H
V
x
F
P
x
Y
V
x
N
S
|
S
D
x
T
A
x
S
H
x
I
L
|
L
A
x
Q
R
|
R
R
|
R
L
x
V
G
 
-
L
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
L
 
-
L
 
-
D
 
-
L
x
V
L
x
F
A
x
R
A
|
A
T
x
N
L
x
R
A
|
A
E
|
E
A
x
V
R
x
Q
M
x
A
L
x
I
G
x
A
I
x
T
E
x
D
H
x
G
V
x
A
T
x
R
V
x
K
G
x
C
M
x
V
E
|
E
D
x
Q
A
|
A
S
x
A
R
x
K
-
x
Y
-
x
P
-
x
G
A
x
T
D
x
Q
R
x
W
A
x
R
F
|
F
V
x
E
F
x
Y
A
x
S
V
x
P
A
x
E
C
x
S
H
x
Y
A
x
T
A
x
G
A
x
T
H
x
E
G
x
L
A
x
E
H
x
Y
R
x
A
V
x
K
R
x
Q
L
x
V
S
x
C
D
|
D
T
x
A
V
|
V
G
|
G
-
x
E
L
x
V
Y
x
I
T
x
A
P
|
P
L
x
T
E
x
P
V
x
E
A
x
R
D
x
P
V
x
I
V
x
I
R
x
F
A
x
N
L
|
L
R
x
P
A
|
A
E
x
T
L
x
V
E
|
E
-
x
M
-
x
T
-
x
T
-
x
P
G
x
N
A
x
V
R
x
Y
Q
x
A
D
|
D
D
x
S
T
x
I
A
x
E
P
x
W
R
x
M
A
x
S
R
|
R
R
x
N
-
x
L
-
x
A
-
x
N
-
x
R
-
x
E
-
x
S
V
|
V
S
x
I
I
x
L
G
x
S
T
x
L
H
|
H
F
x
P
H
|
H
N
|
N
D
|
D
C
x
R
G
|
G
M
x
T
A
|
A
T
x
V
A
|
A
N
x
A
A
|
A
L
x
E
T
x
L
A
x
G
L
x
F
E
x
A
C
x
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
C
x
R
A
x
I
D
x
E
V
x
G
S
x
C
V
x
L
L
x
F
G
|
G
L
x
N
G
|
G
E
|
E
R
|
R
A
x
T
G
|
G
V
x
N
A
x
V
R
x
C
L
|
L
E
x
V
E
x
T
L
|
L
A
x
G
A
x
L
A
x
N
L
|
L
V
x
F
V
x
S
R
|
R
G
|
G
-
x
V
R
x
D
A
x
P
R
x
Q
F
x
I
E
x
D
L
x
F
A
x
S
P
x
N
L
x
I
R
x
D
A
x
E
L
x
I
C
x
R
G
x
R
Q
x
T
V
|
V
A
x
E
Q
x
Y
A
x
C
A
x
N
S
x
Q
L
|
L
S
x
P
V
|
V
P
x
H
R
x
E
H
x
R
W
x
H
P
|
P
V
x
Y
A
x
G
G
|
G
R
x
D
D
x
L
I
x
V
F
x
Y
A
x
T
V
x
A
E
x
F
S
|
S
G
|
G
L
x
S
H
|
H
A
x
Q
H
x
D
G
x
A
V
x
I
R
x
N
R
x
K

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>8501897 FitnessBrowser__Miya:8501897
MLLDTTLREGEQSFGTYLSMADRERVLRGLAAVGVPEAEVGWAGREDLTDMLALSARVAP
GLAAAAWCRCRPGDLRAAVACGASRVCVGVPVSDAHLARRLGLGRAALLDLLAATLAEAR
MLGIEHVTVGMEDASRADRAFVFAVACHAAAHGAHRVRLSDTVGLYTPLEVADVVRALRA
ELEGARQDDTAPRARRVSIGTHFHNDCGMATANALTALECGADCADVSVLGLGERAGVAR
LEELAAALVVRGRARFELAPLRALCGQVAQAASLSVPRHWPVAGRDIFAVESGLHAHGVR
RDPSLFEPFPPELVGDSRRMGVGRKSGVAAVAAALAELSILPPPDELPAIVEAVRDLSAT
LRRPLTPAELAEVAGLGKHHAPPMQTDIPGHAPTARPTARPVPANGIPPQSGPESAPVVS
GMPATDRAATGPHRHPDHTGAHRRGPVPTASGREA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory