SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8501943 FitnessBrowser__Miya:8501943 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 13 hits to proteins with known functional sites (download)

3q1xA Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-serine (see paper)
40% identity, 80% coverage: 45:299/317 of query aligns to 30:266/267 of 3q1xA

query
sites
3q1xA
P
 
P
S
 
H
L
 
K
E
 
K
A
 
V
L
 
F
A
 
T
E
 
E
M
 
L
V
 
-
S
 
Q
R
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
K
A
 
I
L
 
F
L
 
F
P
 
P
G
 
D
F
 
F
F
 
F
G
 
M
A
 
K
A
 
-
T
 
-
V
 
-
H
 
H
M
 
Q
E
 
K
S
 
I
M
 
T
R
 
E
Y
 
S
H
 
H
L
 
I
A
 
A
A
 
S
N
 
E
L
 
L
D
 
T
S
 
K
I
 
L
Y
 
V
R
 
D
I
 
Y
L
 
I
S
 
K
E
 
D
Q
 
S
I
 
V
R
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
T
C
 
A
F
 
Y
T
 
N
C
 
D
A
 
E
D
 
L
F
 
F
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
C
 
C
G
 
-
S
 
-
C
 
-
E
 
-
L
 
-
H
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
V
I
 
M
Q
 
A
F
 
I
L
 
L
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
S
I
 
I
R
 
K
R
 
R
M
 
T
L
 
L
A
 
K
S
 
T
D
 
D
V
 
L
K
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
K
 
P
S
 
G
P
 
L
G
 
S
E
 
L
T
 
I
V
 
I
F
 
R
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
S
 
G
I
 
F
A
 
Q
A
 
A
M
 
V
I
 
I
N
 
V
H
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
V
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
M
 
C
E
 
G
V
 
E
P
 
R
L
 
Y
I
 
Y
P
 
C
R
 
R
I
 
E
I
 
M
S
 
M
E
 
E
M
 
S
A
 
V
H
 
H
S
 
S
R
 
Y
T
 
T
G
 
S
I
 
I
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
S
I
 
I
D
 
K
E
 
G
E
 
H
F
 
F
F
 
F
I
 
I
D
 
D
H
 
H
G
 
G
T
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
E
G
 
W
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
|
A
L
 
M
S
x
H
F
 
F
P
 
Q
K
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
-
G
 
G
V
 
V
L
 
I
I
 
K
K
 
R
G
 
G
N
 
T
P
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
T
L
 
V
E
 
G
D
 
D
N
 
Y
V
 
V
T
 
T
V
 
I
Y
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
H
S
 
V
M
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
N
V
 
C
W
 
W
V
 
I
T
 
D
H
 
R
D
 
D
V
 
V
P
 
D
P
 
S
G
 
N
S
 
Q
K
 
T
I
 
V

3p47A Crystal structure of entamoeba histolytica serine acetyltransferase 1 in complex with l-cysteine (see paper)
40% identity, 80% coverage: 45:299/317 of query aligns to 32:268/270 of 3p47A

query
sites
3p47A
P
 
P
S
 
H
L
 
K
E
 
K
A
 
V
L
 
F
A
 
T
E
 
E
M
 
L
V
 
-
S
 
Q
R
 
K
L
 
L
R
 
R
A
 
K
A
 
I
L
 
F
L
 
F
P
 
P
G
 
D
F
 
F
F
 
F
G
 
M
A
 
K
A
 
-
T
 
-
V
 
-
H
 
H
M
 
Q
E
 
K
S
 
I
M
 
T
R
 
E
Y
 
S
H
 
H
L
 
I
A
 
A
A
 
S
N
 
E
L
 
L
D
 
T
S
 
K
I
 
L
Y
 
V
R
 
D
I
 
Y
L
 
I
S
 
K
E
 
D
Q
 
S
I
 
V
R
 
-
R
 
-
G
 
-
A
 
T
C
 
A
F
 
Y
T
 
N
C
 
D
A
 
E
D
 
L
F
 
F
A
 
A
R
 
H
E
 
Q
C
 
C
G
 
-
S
 
-
C
 
-
E
 
-
L
 
-
H
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
-
K
 
-
A
 
V
I
 
M
Q
 
A
F
 
I
L
 
L
Q
 
E
R
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
S
I
 
I
R
 
K
R
 
R
M
 
T
L
 
L
A
 
K
S
 
T
D
 
D
V
 
L
K
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
E
 
A
G
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
A
K
 
P
S
 
G
P
 
L
G
 
S
E
 
L
T
 
I
V
 
I
F
 
R
C
 
C
Y
 
Y
P
 
P
S
 
G
I
 
F
A
 
Q
A
 
A
M
 
V
I
 
I
N
 
V
H
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
H
 
H
E
 
V
L
 
L
Y
 
Y
R
 
E
M
 
C
E
 
G
V
 
E
P
 
R
L
 
Y
I
 
Y
P
 
C
R
 
R
I
 
E
I
 
M
S
 
M
E
 
E
M
 
S
A
 
V
H
 
H
S
 
S
R
 
Y
T
 
T
G
 
S
I
 
I
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
S
I
 
I
D
 
K
E
 
G
E
 
H
F
 
F
F
 
F
I
 
I
D
 
D
H
 
H
G
 
G
T
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
I
 
I
I
 
I
G
 
G
R
 
E
G
 
W
C
 
C
R
 
R
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
|
A
L
 
M
S
x
H
F
 
F
P
 
Q
K
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
-
G
 
G
V
 
V
L
 
I
I
 
K
K
 
R
G
 
G
N
 
T
P
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
T
L
 
V
E
 
G
D
 
D
N
 
Y
V
 
V
T
 
T
V
 
I
Y
 
G
A
 
T
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
I
I
 
V
G
 
G
A
 
S
G
 
H
S
 
V
M
 
R
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
N
V
 
C
W
 
W
V
 
I
T
 
D
H
 
R
D
 
D
V
 
V
P
 
D
P
 
S
G
 
N
S
 
Q
K
 
T
I
 
V

7bw9A Crystal structure of serine acetyltransferase isoform 3 in complex with cysteine from entamoeba histolytica
48% identity, 54% coverage: 124:293/317 of query aligns to 92:252/280 of 7bw9A

query
sites
7bw9A
F
 
L
L
 
L
Q
 
S
R
 
Q
L
 
F
P
 
V
E
 
T
I
 
I
R
 
R
R
 
E
M
 
L
L
 
V
A
 
K
S
 
Q
D
 
D
V
 
I
K
 
I
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
E
 
T
G
 
G
D
|
D
P
|
P
A
|
A
A
 
A
K
 
S
S
 
S
P
 
L
G
 
A
E
 
M
T
 
I
V
 
I
F
 
R
C
 
S
Y
 
Y
P
 
P
S
 
G
I
 
I
A
 
H
A
 
V
M
 
M
I
 
M
N
 
I
H
 
Q
R
 
R
I
 
V
A
 
A
H
 
H
E
 
I
L
 
L
Y
 
Y
R
 
M
M
 
N
E
 
G
V
 
D
P
 
I
L
 
E
I
 
Y
P
 
S
R
 
R
I
 
E
I
 
L
S
 
M
E
 
E
M
 
N
A
 
I
H
 
H
S
 
S
R
 
V
T
 
T
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
T
R
 
S
I
 
I
D
 
G
E
 
N
E
 
H
F
 
F
F
 
F
I
 
I
D
|
D
H
|
H
G
 
G
T
 
V
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
N
G
 
W
C
 
C
R
 
R
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
|
A
L
 
M
S
 
S
F
 
F
P
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
K
G
 
G
N
 
N
P
 
K
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
T
L
 
I
E
 
G
D
 
D
N
 
F
V
 
V
T
 
V
V
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
T
I
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
N
S
 
V
M
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
N
V
 
C
W
 
W
V
 
I
T
 
T
H
 
Q
D
 
N
V
 
I

4n69A Soybean serine acetyltransferase complexed with serine (see paper)
40% identity, 54% coverage: 129:300/317 of query aligns to 74:236/243 of 4n69A

query
sites
4n69A
P
 
P
E
 
S
I
 
L
R
 
R
R
 
S
M
 
A
L
 
A
A
 
V
S
 
A
D
 
D
V
 
L
K
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
R
E
 
E
G
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
C
K
 
V
S
 
S
P
 
Y
G
 
S
E
 
H
T
 
C
V
 
L
F
 
L
C
 
N
Y
 
Y
P
 
K
S
 
G
I
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
C
I
 
Q
N
 
A
H
 
H
R
 
R
I
 
V
A
 
A
H
 
H
E
 
L
L
 
L
Y
 
W
R
 
R
M
 
Q
E
 
S
V
 
-
P
 
-
L
 
-
I
 
-
P
 
R
R
 
R
I
 
P
I
 
L
S
 
A
E
 
L
M
 
A
A
 
L
H
 
H
S
 
S
R
 
R
T
 
I
G
 
A
-
 
N
-
 
V
-
 
F
-
 
A
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
D
 
G
E
 
K
E
 
G
F
 
I
F
 
L
I
 
F
D
 
D
H
 
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
N
G
 
N
C
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
H
G
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
|
G
A
 
-
L
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
-
D
 
-
G
|
G
D
 
T
G
 
G
V
 
K
L
 
V
I
 
-
K
 
-
G
 
G
N
 
G
P
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
K
L
 
I
E
 
G
D
 
D
N
 
G
V
 
V
T
 
L
V
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
E
G
 
G
S
 
A
M
 
K
I
 
V
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
V
 
V
T
 
L
H
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
R
S
 
T
K
 
T
I
 
A
V
 
V

6wyeA Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) (see paper)
35% identity, 56% coverage: 123:300/317 of query aligns to 70:238/261 of 6wyeA

query
sites
6wyeA
Q
 
Q
F
 
A
L
 
L
Q
 
G
R
 
S
L
 
D
P
 
T
E
 
Q
I
 
I
R
 
S
R
 
K
M
 
C
L
 
V
A
 
E
S
 
A
D
 
D
V
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
|
A
A
 
C
K
 
D
S
 
E
P
 
Y
G
 
S
E
 
L
T
 
P
V
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
F
P
 
K
S
 
G
I
 
F
A
 
H
A
 
A
M
 
I
I
 
Q
N
 
A
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
N
H
 
H
E
 
R
L
 
L
Y
 
Y
R
 
L
M
 
D
E
 
G
V
 
R
P
 
K
L
 
T
I
 
L
P
 
A
R
 
Y
I
 
F
I
 
L
S
 
Q
E
 
N
M
 
R
A
 
M
H
 
S
S
 
E
R
 
V
T
 
F
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
L
D
 
G
E
 
Y
E
 
G
F
 
L
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
F
V
 
V
I
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
I
 
V
I
 
L
G
 
G
R
 
N
G
 
N
C
 
I
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
|
G
A
 
-
L
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
-
D
 
-
G
|
G
D
 
S
G
 
G
V
 
K
L
 
-
I
 
-
K
 
E
G
 
G
N
 
G
P
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
K
L
 
I
E
 
G
D
 
D
N
 
G
V
 
V
T
 
M
V
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
T
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
N
S
 
A
M
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
V
 
V
T
 
V
H
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
S
S
 
I
K
 
T
I
 
V
V
 
V

7ra4A Crystal structure of neisseria gonorrhoeae serine acetyltransferase (cyse) in complex with serine (see paper)
35% identity, 56% coverage: 123:300/317 of query aligns to 68:236/243 of 7ra4A

query
sites
7ra4A
Q
 
Q
F
 
A
L
 
L
Q
 
G
R
 
S
L
 
D
P
 
T
E
 
Q
I
 
I
R
 
S
R
 
K
M
 
C
L
 
V
A
 
E
S
 
A
D
 
D
V
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
I
Y
 
Y
E
 
E
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
 
A
A
 
C
K
 
D
S
 
E
P
 
Y
G
 
S
E
 
L
T
 
P
V
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
F
P
 
K
S
 
G
I
 
F
A
 
H
A
 
A
M
 
I
I
 
Q
N
 
A
H
 
H
R
 
R
I
 
I
A
 
N
H
 
H
E
 
R
L
 
L
Y
 
Y
R
 
L
M
 
D
E
 
G
V
 
R
P
 
K
L
 
T
I
 
L
P
 
A
R
 
Y
I
 
F
I
 
L
S
 
Q
E
 
N
M
 
R
A
 
M
H
 
S
S
 
E
R
 
V
T
 
F
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
L
D
 
G
E
 
Y
E
 
G
F
 
L
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
F
V
 
V
I
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
I
 
V
I
 
L
G
 
G
R
 
N
G
 
N
C
 
I
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
-
L
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
-
D
 
-
G
|
G
D
 
S
G
 
G
V
 
K
L
 
-
I
 
-
K
 
E
G
 
G
N
 
G
P
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
K
L
 
I
E
 
G
D
 
D
N
 
G
V
 
V
T
 
M
V
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
N
A
 
A
T
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
R
I
 
I
G
 
G
A
 
S
G
 
N
S
 
A
M
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
V
 
V
T
 
V
H
 
S
D
 
D
V
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
S
S
 
I
K
 
T
I
 
V
V
 
V

4n6bA Soybean serine acetyltransferase complexed with coa (see paper)
38% identity, 54% coverage: 129:300/317 of query aligns to 70:226/233 of 4n6bA

query
sites
4n6bA
P
 
P
E
 
S
I
 
L
R
 
R
R
 
S
M
 
A
L
 
A
A
 
V
S
 
A
D
 
D
V
 
L
K
 
R
A
 
A
A
 
A
Y
 
R
E
 
E
G
 
R
D
 
D
P
 
V
A
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
S
P
 
Y
G
 
S
E
 
H
T
 
C
V
 
L
F
 
L
C
 
N
Y
 
Y
P
 
K
S
 
G
I
 
F
A
 
L
A
 
A
M
 
C
I
 
Q
N
 
A
H
 
H
R
 
R
I
 
V
A
 
A
H
 
H
E
 
L
L
 
L
Y
 
W
R
 
R
M
 
Q
E
 
S
V
 
-
P
 
-
L
 
-
I
 
-
P
 
R
R
 
R
I
 
P
I
 
L
S
 
A
E
 
L
M
 
A
A
 
L
H
 
H
S
 
S
R
 
R
T
 
I
G
 
A
-
 
N
-
 
V
-
 
F
-
 
A
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
D
 
G
E
 
K
E
 
G
F
 
I
F
 
L
I
 
F
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
I
 
V
I
 
I
G
 
G
R
 
N
G
 
N
C
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
x
L
Q
 
H
G
 
H
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
|
G
A
x
G
L
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
-
K
x
T
G
 
G
N
 
G
P
 
D
R
 
R
H
 
H
P
 
P
I
 
K
L
 
I
E
 
G
D
 
D
N
 
G
V
 
V
T
 
L
V
 
I
Y
 
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
T
 
T
I
 
I
L
|
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
E
G
 
G
S
 
A
M
x
K
I
 
V
G
|
G
G
x
A
N
 
G
V
 
S
W
x
V
V
 
V
T
x
L
H
 
I
D
 
D
V
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
R
S
 
T
K
 
T
I
 
A
V
|
V

Sites not aligning to the query:

4hzdA Crystal structure of serine acetyltransferase in complex with coenzyme a from brucella abortus strain s19 (see paper)
34% identity, 54% coverage: 124:294/317 of query aligns to 70:231/250 of 4hzdA

query
sites
4hzdA
F
 
M
L
 
L
Q
 
E
R
 
A
L
 
N
P
 
P
E
 
E
I
 
W
R
 
S
R
 
H
M
 
V
L
 
L
A
 
R
S
 
V
D
 
D
V
 
I
K
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
Y
E
 
D
G
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
Y
K
 
S
S
 
R
P
 
F
G
 
M
E
 
D
T
 
P
V
 
V
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
S
 
G
I
 
F
A
 
H
A
 
A
M
 
I
I
 
Q
N
 
T
H
 
H
R
 
R
I
 
L
A
 
A
H
 
H
E
 
W
L
 
L
Y
 
Y
R
 
K
M
 
Q
E
 
G
V
 
R
P
 
K
L
 
D
I
 
F
P
 
A
R
 
Y
I
 
Y
I
 
L
S
 
Q
E
 
S
M
 
R
A
 
S
H
 
S
S
 
S
R
 
I
T
 
F
G
 
Q
I
 
T
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
L
D
 
G
E
 
S
E
 
G
F
 
L
F
 
F
I
 
L
D
 
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
L
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
E
R
 
D
G
 
N
C
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
x
L
Q
 
H
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
-
S
 
T
F
 
G
P
 
K
K
 
S
D
 
S
G
 
G
D
 
D
G
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
R
H
 
H
P
 
P
I
 
K
L
 
I
E
 
R
D
 
Q
N
 
G
V
 
V
T
 
L
V
 
I
Y
x
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
Q
I
 
V
G
 
G
A
 
Q
G
 
C
S
 
S
M
 
K
I
 
I
G
x
A
G
x
A
N
 
G
V
x
S
W
 
V
V
 
V
T
 
L
H
 
K
D
 
S
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

1ssqD Serine acetyltransferase- complex with cysteine (see paper)
32% identity, 58% coverage: 126:310/317 of query aligns to 68:251/257 of 1ssqD

query
sites
1ssqD
Q
 
Q
R
 
S
L
 
N
P
 
P
E
 
S
I
 
I
R
 
I
R
 
D
M
 
C
L
 
A
A
 
A
S
 
C
D
 
D
V
 
I
K
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
E
 
H
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
|
A
A
 
V
K
 
E
S
 
L
P
 
W
G
 
S
E
 
T
T
 
P
V
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
S
 
G
I
 
F
A
 
H
A
 
A
M
 
I
I
 
Q
N
 
S
H
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
T
H
 
H
E
 
Y
L
 
L
Y
 
W
R
 
N
M
 
Q
E
 
N
V
 
R
P
 
K
L
 
S
I
 
L
P
 
A
R
 
L
I
 
Y
I
 
L
S
 
Q
E
 
N
M
 
Q
A
 
I
H
 
S
S
 
V
R
 
A
T
 
F
G
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
R
 
K
I
 
I
D
 
G
E
 
H
E
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
F
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
S
I
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
N
G
 
D
C
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
G
 
G
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
 
G
L
 
-
S
 
T
F
 
G
P
 
K
K
 
E
D
 
S
G
 
G
D
 
D
G
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
R
 
R
H
 
H
P
 
P
I
 
K
L
 
V
E
 
R
D
 
E
N
 
G
V
 
V
T
 
M
V
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
Y
S
 
A
M
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
N
V
 
S
W
 
V
V
 
V
T
 
L
H
 
N
D
 
P
V
 
V
P
 
P
-
 
E
-
 
Y
-
 
A
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
P
 
P
G
 
A
S
 
R
K
 
I
I
 
V
V
 
S
Q
 
Q
Q
 
D
R
 
K
S
 
A
A
 
A
K
 
K
P
 
P
K
 
A
P
 
F
D
 
D

1t3dA Crystal structure of serine acetyltransferase from e.Coli at 2.2a (see paper)
32% identity, 53% coverage: 129:295/317 of query aligns to 75:232/262 of 1t3dA

query
sites
1t3dA
P
 
P
E
 
E
I
 
M
R
 
I
R
 
A
M
 
S
L
 
A
A
 
A
S
 
C
D
 
D
V
 
I
K
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
E
 
T
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
|
A
A
 
V
K
 
D
S
 
K
P
 
Y
G
 
S
E
 
T
T
 
P
V
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
S
 
G
I
 
F
A
 
H
A
 
A
M
 
L
I
 
Q
N
 
A
H
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
G
H
 
H
E
 
W
L
 
L
Y
 
W
R
 
N
M
 
Q
E
 
G
V
 
R
P
 
R
L
 
A
I
 
L
P
 
A
R
 
I
I
 
F
I
 
L
S
 
Q
E
 
N
M
 
Q
A
 
V
H
 
S
S
 
V
R
 
T
T
 
F
G
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
R
 
K
I
 
I
D
 
G
E
 
R
E
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
I
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
N
G
 
D
C
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
|
G
A
 
-
L
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
G
|
G
V
 
T
L
 
G
I
 
K
K
 
S
G
 
G
N
 
G
P
 
D
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
K
L
 
I
E
 
R
D
 
E
N
 
G
V
 
V
T
 
M
V
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
R
G
 
G
S
 
A
M
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
V
 
V
T
 
L
H
 
Q
D
 
P
V
 
V
P
 
P
P
 
P

4h7oA Crystal structure of serine acetyltransferase from vibrio cholerae o1 biovar el tor n16961
32% identity, 54% coverage: 129:299/317 of query aligns to 71:232/258 of 4h7oA

query
sites
4h7oA
P
 
P
E
 
S
I
 
I
R
 
S
R
 
E
M
 
A
L
 
A
A
 
A
S
 
C
D
 
D
V
 
I
K
 
C
A
 
A
A
 
T
Y
 
V
E
 
N
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
|
A
A
 
V
K
 
S
S
 
M
P
 
Y
G
 
S
E
 
M
T
 
P
V
 
L
F
 
L
C
x
Y
Y
 
L
P
 
K
S
 
G
I
 
Y
A
 
H
A
 
A
M
 
L
I
 
Q
N
 
G
H
 
Y
R
 
R
I
 
V
A
 
A
H
 
N
E
 
W
L
 
L
Y
 
W
R
 
R
M
 
Q
E
 
G
V
 
R
P
 
K
L
 
A
I
 
L
P
 
A
R
 
T
I
x
Y
I
 
F
S
 
Q
E
x
N
M
x
Q
A
 
I
H
 
S
S
 
V
R
 
A
T
 
C
G
 
Q
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
R
 
R
I
 
I
D
 
G
E
 
R
E
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
E
R
 
D
G
 
D
C
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
G
 
D
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
 
G
A
x
G
L
 
-
S
 
T
F
 
G
P
 
K
K
 
E
D
 
C
G
 
G
D
 
D
G
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
K
L
 
I
E
 
R
D
 
E
N
 
G
V
 
V
T
 
M
V
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
E
G
 
G
S
 
A
M
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
S
N
 
G
V
 
S
W
 
V
V
 
V
T
 
L
H
 
Q
D
 
A
V
 
V
P
 
P
P
 
P
G
 
H
S
 
T
K
 
T
I
 
V

Sites not aligning to the query:

1sstA Serine acetyltransferase- complex with coa (see paper)
31% identity, 53% coverage: 126:294/317 of query aligns to 68:220/233 of 1sstA

query
sites
1sstA
Q
 
Q
R
 
S
L
 
N
P
 
P
E
 
S
I
 
I
R
 
I
R
 
D
M
 
C
L
 
A
A
 
A
S
 
C
D
 
D
V
 
I
K
 
Q
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
E
 
H
G
 
R
D
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
V
K
 
E
S
 
L
P
 
W
G
 
S
E
 
T
T
 
P
V
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
S
 
G
I
 
F
A
 
H
A
 
A
M
 
I
I
 
Q
N
 
S
H
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
T
H
 
H
E
 
Y
L
 
L
Y
 
W
R
 
N
M
 
Q
E
 
N
V
 
R
P
 
K
L
 
S
I
 
L
P
 
A
R
 
L
I
 
Y
I
 
L
S
 
Q
E
 
N
M
 
Q
A
 
I
H
 
S
S
 
V
R
 
A
T
 
F
G
 
D
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
R
 
K
I
 
I
D
 
G
E
 
H
E
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
F
D
 
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
S
I
 
V
I
 
I
G
 
E
R
 
N
G
 
D
C
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
x
L
Q
|
Q
G
 
G
V
 
V
T
|
T
L
 
L
G
 
G
A
x
G
L
 
-
S
 
-
F
 
-
P
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
D
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
R
x
T
H
 
H
P
 
P
I
 
K
L
 
V
E
 
R
D
 
E
N
 
G
V
 
V
T
 
M
V
 
I
Y
x
G
A
|
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
|
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
K
G
 
Y
S
 
A
M
x
K
I
 
I
G
|
G
G
x
A
N
 
N
V
 
S
W
x
V
V
 
V
T
x
L
H
 
N
D
 
P
V
 
V
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3gvdI Crystal structure of serine acetyltransferase cyse from yersinia pestis
31% identity, 55% coverage: 136:310/317 of query aligns to 85:258/272 of 3gvdI

query
sites
3gvdI
A
 
A
S
 
R
D
 
D
V
 
I
K
 
L
A
 
A
A
 
V
Y
 
R
E
 
L
G
 
R
D
|
D
P
|
P
A
|
A
A
 
V
K
 
D
S
 
K
P
 
Y
G
 
S
E
 
T
T
 
P
V
 
L
F
 
L
C
 
Y
Y
 
L
P
 
K
S
 
G
I
 
F
A
 
H
A
 
A
M
 
L
I
 
Q
N
 
A
H
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
G
H
 
H
E
 
W
L
 
L
Y
 
W
R
 
A
M
 
Q
E
 
D
V
 
R
P
 
K
L
 
A
I
 
L
P
 
A
R
 
I
I
 
Y
I
 
L
S
 
Q
E
 
N
M
 
Q
A
 
V
H
 
S
S
 
V
R
 
A
T
 
F
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
H
 
H
P
 
P
G
 
A
A
 
A
R
 
T
I
 
I
D
 
G
E
 
C
E
 
G
F
 
I
F
 
M
I
 
L
D
|
D
H
|
H
G
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
I
V
 
V
I
 
I
G
 
G
E
 
E
T
 
T
C
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
E
R
 
N
G
 
D
C
 
V
R
 
S
I
 
I
Y
 
L
Q
 
Q
G
 
S
V
 
V
T
 
T
L
 
L
G
|
G
A
x
G
L
 
-
S
 
T
F
 
G
P
 
K
K
 
T
D
 
S
G
 
G
D
 
D
G
 
-
V
 
-
L
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
-
N
 
-
P
 
-
R
|
R
H
|
H
P
 
P
I
 
K
L
 
I
E
 
R
D
 
E
N
 
G
V
 
V
T
 
M
V
 
I
Y
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
A
T
 
K
I
 
I
L
 
L
G
 
G
R
 
N
V
 
I
T
 
E
I
 
V
G
 
G
A
 
R
G
 
G
S
 
A
M
 
K
I
 
I
G
 
G
G
 
A
N
 
G
V
 
S
W
 
V
V
 
V
T
 
L
H
 
Q
D
 
S
V
 
V
P
 
P
-
 
A
-
 
H
-
 
T
-
 
T
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
V
P
 
P
G
 
A
S
 
R
K
 
I
I
 
V
V
 
G
Q
 
K
Q
 
P
R
 
E
S
 
S
A
 
D
K
 
K
P
 
P
K
 
S
P
 
L
D
 
D

Query Sequence

>8501943 FitnessBrowser__Miya:8501943
MKKLDDLDARSLQGMPELERIVDEMCAPESYEAVYHRSLHDAPMPSLEALAEMVSRLRAA
LLPGFFGAATVHMESMRYHLAANLDSIYRILSEQIRRGACFTCADFARECGSCELHSRDK
AIQFLQRLPEIRRMLASDVKAAYEGDPAAKSPGETVFCYPSIAAMINHRIAHELYRMEVP
LIPRIISEMAHSRTGIDIHPGARIDEEFFIDHGTGVVIGETCIIGRGCRIYQGVTLGALS
FPKDGDGVLIKGNPRHPILEDNVTVYAGATILGRVTIGAGSMIGGNVWVTHDVPPGSKIV
QQRSAKPKPDEELVGRK

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory