SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8502212 FitnessBrowser__Miya:8502212 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4zrnA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (tm0509) with udp-glucose from hyperthermophilic eubacterium thermotoga maritima (see paper)
35% identity, 90% coverage: 26:330/339 of query aligns to 1:306/309 of 4zrnA

query
sites
4zrnA
L
 
M
S
 
N
V
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
H
L
 
V
V
 
V
K
 
D
A
 
K
L
 
L
A
 
I
P
 
E
R
 
N
C
 
G
R
 
Y
R
 
G
L
 
V
I
 
I
C
 
V
Y
 
V
G
x
D
R
x
N
R
 
L
A
x
S
Q
x
S
E
x
G
I
 
K
L
 
V
S
 
E
P
 
N
L
 
L
G
 
N
L
 
R
P
 
N
G
 
A
-
 
L
-
 
F
T
 
Y
E
 
E
C
 
Q
H
x
S
T
x
I
G
 
E
E
 
D
T
 
E
G
 
E
D
 
M
I
 
M
D
 
E
R
 
R
L
 
I
G
 
F
P
 
S
L
 
-
L
 
L
H
 
H
G
 
R
V
 
P
D
 
E
R
 
Y
V
 
V
I
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
S
x
A
S
 
Q
S
 
A
T
 
S
P
 
V
V
 
A
N
 
I
A
 
S
D
 
V
W
 
R
D
 
E
L
 
P
V
 
A
T
 
R
D
 
D
A
 
A
E
 
K
Q
x
T
N
 
N
V
 
I
L
 
I
T
 
G
T
 
S
L
 
L
K
 
V
L
 
L
F
 
L
R
 
E
A
 
K
C
 
S
L
 
I
A
 
K
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
G
 
K
R
 
K
V
 
F
V
 
I
F
 
F
V
x
S
S
|
S
S
x
T
G
 
G
G
|
G
T
x
A
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
P
 
E
G
 
N
-
 
V
A
 
K
V
 
V
V
 
F
P
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
T
A
 
E
P
 
I
T
 
P
D
 
H
P
 
P
I
 
I
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
I
A
 
A
K
|
K
V
 
Y
A
 
S
I
 
T
E
 
E
K
 
M
Y
 
Y
L
 
L
H
 
E
V
 
F
F
 
F
R
 
A
H
 
R
L
 
E
H
 
Y
H
 
G
L
 
L
D
 
K
Y
 
Y
R
 
T
V
 
V
L
 
L
R
 
R
V
x
Y
A
 
A
N
|
N
P
x
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
L
 
D
A
 
P
T
x
Y
K
 
G
G
 
E
Q
 
A
G
|
G
I
x
V
I
 
V
G
 
A
A
 
I
F
 
F
I
 
T
R
 
E
K
 
R
A
 
M
L
 
L
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
P
 
E
L
 
V
E
x
H
I
 
I
W
x
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
E
T
x
Y
V
 
V
R
|
R
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
V
T
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
N
L
 
L
R
 
-
A
 
L
A
 
A
V
 
M
H
 
E
D
 
K
G
 
G
P
 
D
G
 
N
R
 
E
V
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
T
 
T
T
 
T
I
x
V
N
 
N
E
 
Q
V
 
L
A
 
F
D
 
K
T
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
E
V
 
I
L
 
T
G
 
G
R
 
Y
R
 
D
L
 
K
E
 
E
R
 
P
L
 
V
Y
 
Y
H
 
K
P
 
P
P
 
P
R
|
R
P
 
K
V
 
G
D
|
D
V
 
V
P
 
R
V
 
K
S
 
S
V
 
I
L
 
L
D
 
D
C
 
Y
A
 
T
A
 
K
A
 
A
W
 
K
R
 
E
E
 
K
M
 
L
G
 
G
W
 
W
R
 
E
A
 
P
T
 
K
T
 
V
P
 
S
L
 
L
A
 
E
D
 
E
G
 
G
M
 
L
T
 
K
D
 
L
T
 
T
L
 
V
R
 
E
W
 
Y
F
 
F
T
 
R
R
 
K

7ys9A Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) in complex with both udp-glucose and udp-galactose in chaina from mycobacterium tuberculosis
38% identity, 90% coverage: 26:331/339 of query aligns to 1:310/310 of 7ys9A

query
sites
7ys9A
L
 
M
S
 
R
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
T
L
 
L
V
 
V
K
 
D
A
 
R
L
 
L
A
 
L
P
 
A
R
 
D
C
 
G
R
 
H
R
 
S
L
 
V
I
 
V
C
 
G
Y
 
L
G
x
D
R
x
N
R
 
F
A
|
A
Q
x
T
E
x
G
I
 
R
L
 
A
S
 
T
P
 
N
L
 
L
G
 
E
-
 
H
L
 
L
P
 
A
G
 
D
T
 
N
E
 
S
C
 
A
H
 
H
T
 
V
G
 
F
E
 
V
T
 
E
G
 
A
D
|
D
I
|
I
-
 
V
-
 
T
D
 
A
R
 
D
L
 
L
G
 
H
P
 
A
L
 
I
L
 
L
-
 
E
-
 
Q
H
 
H
G
 
R
V
 
P
D
 
E
R
 
V
V
 
V
I
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
S
x
A
S
 
Q
S
x
I
T
 
D
P
 
V
V
x
R
N
 
R
A
 
S
D
 
V
W
 
A
D
 
D
L
 
P
V
 
Q
T
 
F
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
I
T
 
G
T
 
T
L
 
V
K
 
R
L
 
L
F
 
A
R
 
E
A
 
A
C
 
A
L
 
R
A
 
Q
A
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
R
R
 
K
V
 
I
V
 
V
F
 
H
V
x
T
S
 
S
S
|
S
G
 
G
G
|
G
T
 
S
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
P
 
T
G
 
P
A
 
P
V
 
E
V
 
Y
P
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
T
A
 
A
P
 
P
T
 
T
D
 
D
P
 
P
I
 
A
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
A
V
 
A
A
 
G
K
|
K
V
 
V
A
 
A
I
 
G
E
 
E
K
 
I
Y
 
Y
L
 
L
H
 
N
V
 
T
F
 
F
R
 
R
H
 
H
L
 
L
H
 
Y
H
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
C
R
 
S
V
 
H
L
 
I
R
 
A
V
x
P
A
|
A
N
|
N
P
x
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
L
 
D
A
 
P
T
 
H
K
 
G
G
 
E
Q
x
A
G
|
G
I
x
V
I
 
V
G
 
A
A
 
I
F
|
F
I
 
A
R
 
Q
K
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
L
 
T
E
x
R
I
 
V
W
x
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
T
T
x
N
V
 
T
R
|
R
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
Y
 
F
I
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
V
T
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
F
L
 
V
R
 
R
A
 
V
A
 
S
V
 
A
H
 
D
D
 
V
G
 
G
P
 
G
G
 
G
R
 
L
V
 
R
F
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
R
 
K
G
 
E
T
 
T
T
 
S
I
x
D
N
 
R
E
 
Q
V
 
L
A
 
H
D
 
S
T
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
V
G
 
G
R
 
G
R
 
P
L
 
D
E
 
D
R
 
P
L
 
E
Y
 
F
H
 
H
P
 
P
P
 
P
R
|
R
P
 
L
V
 
G
D
 
D
V
 
L
P
 
K
V
 
R
S
 
S
V
 
C
L
 
L
D
 
D
C
 
I
A
 
G
A
 
L
A
 
A
W
 
E
R
 
R
E
 
V
M
 
L
G
 
G
W
 
W
R
 
R
A
 
P
T
 
Q
T
 
I
P
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
M
 
V
T
 
R
D
 
R
T
 
T
L
 
V
R
 
E
W
 
Y
F
 
F
T
 
-
R
 
R
H
 
H

7ysmA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) co-crystallized with udp-n-acetylglucosamine from mycobacterium tuberculosis
38% identity, 90% coverage: 26:331/339 of query aligns to 1:310/311 of 7ysmA

query
sites
7ysmA
L
 
M
S
 
R
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
T
L
 
L
V
 
V
K
 
D
A
 
R
L
 
L
A
 
L
P
 
A
R
 
D
C
 
G
R
 
H
R
 
S
L
 
V
I
 
V
C
 
G
Y
 
L
G
x
D
R
x
N
R
 
F
A
 
A
Q
x
T
E
x
G
I
 
R
L
 
A
S
 
T
P
 
N
L
 
L
G
 
E
-
 
H
L
 
L
P
 
A
G
 
D
T
 
N
E
 
S
C
 
A
H
 
H
T
 
V
G
 
F
E
 
V
T
 
E
G
 
A
D
|
D
I
|
I
-
 
V
-
 
T
D
 
A
R
 
D
L
 
L
G
 
H
P
 
A
L
 
I
L
 
L
-
 
E
-
 
Q
H
 
H
G
 
R
V
 
P
D
 
E
R
 
V
V
 
V
I
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
S
x
A
S
 
Q
S
x
I
T
 
D
P
 
V
V
x
R
N
 
R
A
 
S
D
 
V
W
 
A
D
 
D
L
 
P
V
 
Q
T
 
F
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
 
V
N
 
N
V
 
V
L
 
I
T
 
G
T
 
T
L
 
V
K
 
R
L
 
L
F
 
A
R
 
E
A
 
A
C
 
A
L
 
R
A
 
Q
A
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
R
R
 
K
V
 
I
V
 
V
F
 
H
V
x
T
S
 
S
S
|
S
G
 
G
G
|
G
T
x
S
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
P
 
T
G
 
P
A
 
P
V
 
E
V
 
Y
P
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
T
A
 
A
P
 
P
T
 
T
D
 
D
P
 
P
I
 
A
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
A
V
 
A
A
 
G
K
|
K
V
 
V
A
 
A
I
 
G
E
 
E
K
 
I
Y
 
Y
L
 
L
H
 
N
V
 
T
F
 
F
R
 
R
H
 
H
L
 
L
H
 
Y
H
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
C
R
 
S
V
 
H
L
 
I
R
 
A
V
x
P
A
|
A
N
|
N
P
x
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
L
 
D
A
 
P
T
 
H
K
 
G
G
 
E
Q
 
A
G
|
G
I
x
V
I
 
V
G
 
A
A
 
I
F
|
F
I
 
A
R
 
Q
K
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
L
 
T
E
x
R
I
x
V
W
x
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
T
T
x
N
V
 
T
R
|
R
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
Y
 
F
I
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
V
T
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
F
L
 
V
R
 
R
A
 
V
A
 
S
V
 
A
H
 
D
D
 
V
G
 
G
P
 
G
G
 
G
R
 
L
V
 
R
F
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
R
 
K
G
 
E
T
 
T
T
 
S
I
x
D
N
 
R
E
 
Q
V
 
L
A
 
H
D
 
S
T
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
V
G
 
G
R
 
G
R
 
P
L
 
D
E
 
D
R
 
P
L
 
E
Y
 
F
H
 
H
P
 
P
P
 
P
R
|
R
P
 
L
V
 
G
D
 
D
V
 
L
P
 
K
V
 
R
S
 
S
V
 
C
L
 
L
D
 
D
C
 
I
A
 
G
A
 
L
A
 
A
W
 
E
R
 
R
E
 
V
M
 
L
G
 
G
W
 
W
R
 
R
A
 
P
T
 
Q
T
 
I
P
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
M
 
V
T
 
R
D
 
R
T
 
T
L
 
V
R
 
E
W
 
Y
F
 
F
T
 
-
R
 
R
H
 
H

7ystA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) in complex with both udp-glucose and udp-galactose in chain b from mycobacterium tuberculosis
38% identity, 90% coverage: 26:331/339 of query aligns to 1:310/312 of 7ystA

query
sites
7ystA
L
 
M
S
 
R
V
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
T
L
 
L
V
 
V
K
 
D
A
 
R
L
 
L
A
 
L
P
 
A
R
 
D
C
 
G
R
 
H
R
 
S
L
 
V
I
 
V
C
 
G
Y
 
L
G
x
D
R
x
N
R
 
F
A
 
A
Q
x
T
E
x
G
I
 
R
L
 
A
S
 
T
P
 
N
L
 
L
G
 
E
-
 
H
L
 
L
P
 
A
G
 
D
T
 
N
E
 
S
C
 
A
H
 
H
T
 
V
G
 
F
E
 
V
T
 
E
G
 
A
D
|
D
I
|
I
-
 
V
-
 
T
D
 
A
R
 
D
L
 
L
G
 
H
P
 
A
L
 
I
L
 
L
-
 
E
-
 
Q
H
 
H
G
 
R
V
 
P
D
 
E
R
 
V
V
 
V
I
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
S
x
A
S
 
Q
S
x
I
T
 
D
P
 
V
V
x
R
N
 
R
A
 
S
D
 
V
W
 
A
D
 
D
L
 
P
V
 
Q
T
 
F
D
 
D
A
 
A
E
 
A
Q
x
V
N
 
N
V
 
V
L
 
I
T
 
G
T
 
T
L
 
V
K
 
R
L
 
L
F
 
A
R
 
E
A
 
A
C
 
A
L
 
R
A
 
Q
A
 
T
G
 
G
V
 
V
G
 
R
R
 
K
V
 
I
V
 
V
F
 
H
V
x
T
S
 
S
S
|
S
G
 
G
G
|
G
T
 
S
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
P
 
T
G
 
P
A
 
P
V
 
E
V
 
Y
P
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
T
A
 
A
P
 
P
T
 
T
D
 
D
P
 
P
I
 
A
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
A
V
 
A
A
 
G
K
|
K
V
 
V
A
 
A
I
 
G
E
 
E
K
 
I
Y
 
Y
L
 
L
H
 
N
V
 
T
F
 
F
R
 
R
H
 
H
L
 
L
H
 
Y
H
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
C
R
 
S
V
 
H
L
 
I
R
 
A
V
x
P
A
|
A
N
|
N
P
x
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
L
 
D
A
 
P
T
 
H
K
 
G
G
 
E
Q
x
A
G
|
G
I
x
V
I
 
V
G
 
A
A
 
I
F
|
F
I
 
A
R
 
Q
K
 
A
A
 
L
L
 
L
A
 
S
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
L
 
T
E
x
R
I
x
V
W
x
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
T
T
 
N
V
 
T
R
|
R
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
Y
 
F
I
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
V
T
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
F
L
 
V
R
 
R
A
 
V
A
 
S
V
 
A
H
 
D
D
 
V
G
 
G
P
 
G
G
 
G
R
 
L
V
 
R
F
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
R
 
K
G
 
E
T
 
T
T
 
S
I
x
D
N
 
R
E
 
Q
V
 
L
A
 
H
D
 
S
T
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
A
V
 
A
L
 
V
G
 
G
R
 
G
R
 
P
L
 
D
E
 
D
R
 
P
L
 
E
Y
 
F
H
 
H
P
 
P
P
 
P
R
|
R
P
 
L
V
 
G
D
 
D
V
 
L
P
 
K
V
 
R
S
 
S
V
 
C
L
 
L
D
 
D
C
 
I
A
 
G
A
 
L
A
 
A
W
 
E
R
 
R
E
 
V
M
 
L
G
 
G
W
 
W
R
 
R
A
 
P
T
 
Q
T
 
I
P
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
M
 
V
T
 
R
D
 
R
T
 
T
L
 
V
R
 
E
W
 
Y
F
 
F
T
 
-
R
 
R
H
 
H

6wj9B Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-glcnac (see paper)
33% identity, 88% coverage: 28:326/339 of query aligns to 4:306/308 of 6wj9B

query
sites
6wj9B
V
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
H
L
 
L
V
 
V
K
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
L
P
 
A
R
 
K
C
 
G
R
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
C
 
-
Y
 
Y
G
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
V
Q
 
L
E
x
D
I
x
D
L
 
L
S
|
S
-
x
T
-
x
G
-
 
K
-
 
V
-
 
G
-
 
N
-
 
L
P
 
P
L
 
M
G
 
G
L
 
D
P
 
A
G
 
G
T
 
L
E
 
E
C
 
L
H
 
L
T
 
V
G
 
G
E
x
D
T
x
A
G
 
A
D
 
D
I
 
A
D
 
A
R
 
L
L
 
L
G
 
A
P
 
D
L
 
A
L
 
V
H
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
R
 
A
V
 
V
I
 
V
H
 
H
L
|
L
A
|
A
S
x
A
S
 
V
S
 
A
T
 
S
P
x
V
V
 
Q
N
 
A
A
 
S
D
 
V
W
 
E
D
 
D
L
 
P
V
 
V
T
 
A
D
 
T
A
 
H
E
 
Q
Q
x
S
N
 
N
V
 
F
L
 
I
T
 
A
T
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
F
 
C
R
 
E
A
 
A
C
 
M
L
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
R
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
V
x
A
S
 
S
S
x
A
G
x
A
G
x
A
T
 
V
V
 
Y
Y
 
G
G
 
N
P
 
N
G
 
G
A
 
E
V
 
G
V
 
T
P
 
P
T
 
I
P
 
A
E
 
E
S
 
D
A
 
T
P
 
P
T
 
K
D
 
S
P
 
P
I
 
L
T
 
T
A
 
P
Y
x
F
G
 
A
V
 
A
A
 
D
K
|
K
V
 
L
A
 
A
I
 
S
E
 
E
K
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
H
 
D
V
 
F
F
 
Y
R
 
R
H
 
R
L
 
Q
H
 
H
H
 
G
L
 
L
D
 
E
Y
 
P
R
 
V
V
 
I
L
 
L
R
 
R
V
x
F
A
x
F
N
|
N
P
x
I
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
L
 
D
-
 
P
A
 
S
T
 
S
K
 
P
G
 
Y
Q
 
S
G
|
G
I
x
V
I
 
I
G
 
S
A
 
I
F
|
F
I
 
S
R
 
E
K
 
R
A
 
A
L
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
R
P
 
P
L
 
I
E
x
T
I
x
L
W
x
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
G
T
 
Q
V
 
T
R
|
R
D
 
D
Y
 
F
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
D
 
A
D
 
D
L
 
L
T
 
V
D
 
K
A
 
I
L
 
L
L
 
V
R
 
Q
A
 
G
A
 
L
V
 
E
H
 
S
D
 
P
G
 
A
P
 
P
-
 
A
G
 
A
R
 
D
V
 
A
F
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
G
S
 
L
G
 
G
R
 
G
G
 
V
T
 
T
T
 
T
I
x
L
N
 
N
E
 
D
V
 
L
A
 
I
D
 
G
T
 
A
L
 
L
E
 
Q
A
 
Q
V
 
I
L
 
S
G
 
G
R
 
K
R
 
P
L
 
L
E
 
Q
R
 
V
L
 
S
Y
 
H
H
 
G
P
 
A
P
 
T
R
|
R
P
 
S
V
 
G
D
|
D
V
 
I
P
 
R
V
 
H
S
 
S
V
 
K
L
 
A
D
 
D
C
 
N
A
 
R
A
 
R
A
 
L
W
 
R
R
 
E
E
 
R
M
 
F
G
 
D
W
 
L
R
 
G
A
 
T
T
 
P
T
 
S
P
 
S
L
 
L
A
 
A
D
 
E
G
 
G
M
 
L
T
 
E
D
 
R
T
 
L
L
 
Y
R
 
R

6wjaA Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-galnac (see paper)
33% identity, 88% coverage: 28:326/339 of query aligns to 3:305/307 of 6wjaA

query
sites
6wjaA
V
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
H
L
 
L
V
 
V
K
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
L
P
 
A
R
 
K
C
 
G
R
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
C
 
-
Y
 
Y
G
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
V
Q
 
L
E
x
D
I
x
D
L
 
L
S
|
S
-
x
T
-
x
G
-
 
K
-
 
V
-
 
G
-
 
N
-
 
L
P
 
P
L
 
M
G
 
G
L
 
D
P
 
A
G
 
G
T
 
L
E
 
E
C
 
L
H
 
L
T
 
V
G
 
G
E
 
D
T
x
A
G
 
A
D
 
D
I
 
A
D
 
A
R
 
L
L
 
L
G
 
A
P
 
D
L
 
A
L
 
V
H
 
Q
G
 
G
V
 
C
D
 
D
R
 
A
V
 
V
I
 
V
H
 
H
L
|
L
A
|
A
S
x
A
S
 
V
S
 
A
T
 
S
P
x
V
V
 
Q
N
 
A
A
 
S
D
 
V
W
 
E
D
 
D
L
 
P
V
 
V
T
 
A
D
 
T
A
 
H
E
 
Q
Q
x
S
N
 
N
V
 
F
L
 
I
T
 
A
T
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
F
 
C
R
 
E
A
 
A
C
 
M
L
 
T
A
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
R
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
V
 
A
S
 
S
S
x
A
G
x
A
G
x
A
T
 
V
V
 
Y
Y
 
G
G
 
N
P
 
N
G
 
G
A
 
E
V
 
G
V
 
T
P
 
P
T
 
I
P
 
A
E
 
E
S
 
D
A
 
T
P
 
P
T
 
K
D
 
S
P
 
P
I
 
L
T
 
T
A
 
P
Y
x
F
G
 
A
V
 
A
A
 
D
K
|
K
V
 
L
A
 
A
I
 
S
E
 
E
K
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
H
 
D
V
 
F
F
 
Y
R
 
R
H
 
R
L
 
Q
H
 
H
H
 
G
L
 
L
D
 
E
Y
 
P
R
 
V
V
 
I
L
 
L
R
 
R
V
x
F
A
x
F
N
|
N
P
x
I
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
L
 
D
-
 
P
A
 
S
T
 
S
K
 
P
G
 
Y
Q
 
S
G
|
G
I
x
V
I
 
I
G
 
S
A
 
I
F
|
F
I
 
S
R
 
E
K
 
R
A
 
A
L
 
K
A
 
A
G
 
G
Q
 
R
P
 
P
L
 
I
E
x
T
I
 
L
W
x
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
G
T
 
Q
V
 
T
R
|
R
D
 
D
Y
 
F
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
D
 
A
D
 
D
L
 
L
T
 
V
D
 
K
A
 
I
L
 
L
L
 
V
R
 
Q
A
 
G
A
 
L
V
 
E
H
 
S
D
 
P
G
 
A
P
 
P
-
 
A
G
 
A
R
 
D
V
 
A
F
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
G
S
 
L
G
 
G
R
 
G
G
 
V
T
 
T
T
 
T
I
x
L
N
 
N
E
 
D
V
 
L
A
 
I
D
 
G
T
 
A
L
 
L
E
 
Q
A
 
Q
V
 
I
L
 
S
G
 
G
R
 
K
R
 
P
L
 
L
E
 
Q
R
 
V
L
 
S
Y
 
H
H
 
G
P
 
A
P
 
T
R
|
R
P
 
S
V
 
G
D
|
D
V
 
I
P
 
R
V
 
H
S
 
S
V
 
K
L
 
A
D
 
D
C
 
N
A
 
R
A
 
R
A
 
L
W
 
R
R
 
E
E
 
R
M
 
F
G
 
D
W
 
L
R
 
G
A
 
T
T
 
P
T
 
S
P
 
S
L
 
L
A
 
A
D
 
E
G
 
G
M
 
L
T
 
E
D
 
R
T
 
L
L
 
Y
R
 
R

6dntA Udp-n-acetylglucosamine 4-epimerase from methanobrevibacter ruminantium m1 in complex with udp-n-acetylmuramic acid (see paper)
29% identity, 91% coverage: 23:332/339 of query aligns to 1:310/310 of 6dntA

query
sites
6dntA
L
 
M
G
 
K
E
 
D
L
 
K
S
 
N
V
 
V
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
L
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
H
L
 
I
V
 
V
K
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
I
P
 
D
R
 
D
C
 
N
R
 
K
R
 
V
L
 
T
I
 
I
C
 
I
Y
x
D
G
x
N
R
x
L
R
x
S
A
x
S
Q
x
G
E
 
K
I
 
-
L
 
M
S
 
E
P
 
N
L
 
L
G
 
N
L
 
N
P
 
P
G
 
N
T
 
H
E
 
E
C
 
N
H
 
L
T
 
T
G
 
I
E
 
I
T
 
K
G
 
E
D
|
D
I
x
L
-
 
M
-
 
D
D
 
A
R
 
D
L
 
L
G
 
E
P
 
K
L
 
I
L
 
L
H
 
K
G
 
D
V
 
K
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
I
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
S
x
A
S
 
L
S
x
A
T
 
S
P
 
V
V
 
P
N
 
G
A
 
S
D
 
V
W
 
A
D
 
E
L
 
P
V
 
L
T
 
R
D
 
Y
A
 
N
E
 
Q
Q
 
N
N
 
N
V
 
I
L
 
D
T
 
A
T
 
S
L
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
F
R
 
I
A
 
A
C
 
C
L
 
K
A
 
N
A
 
N
G
 
N
V
 
I
G
 
K
R
 
K
V
 
V
V
 
I
F
 
F
V
 
-
S
|
S
S
|
S
G
x
S
G
x
S
T
x
A
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
E
G
 
N
A
 
P
V
 
N
V
 
M
P
 
P
T
 
L
P
 
K
E
 
E
S
 
S
A
 
E
P
 
N
T
 
F
D
 
L
P
 
P
I
 
C
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
A
V
 
A
A
 
Q
K
|
K
V
 
A
A
 
S
I
 
C
E
 
E
K
 
L
Y
 
Y
L
 
L
H
 
K
V
 
S
F
 
F
R
 
H
H
 
E
L
 
S
H
 
Y
H
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
Y
R
 
V
V
 
A
L
 
L
R
 
R
V
x
Y
A
x
F
N
|
N
P
x
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
L
 
D
A
 
E
T
 
N
K
 
S
-
 
P
G
 
Y
Q
 
A
G
x
A
I
x
V
I
 
I
G
 
P
A
x
K
F
 
F
I
 
I
R
 
S
K
 
A
A
 
I
L
 
L
A
 
N
G
 
G
Q
 
E
P
 
S
L
 
P
E
x
V
I
|
I
W
x
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
x
E
T
x
Q
V
 
S
R
|
R
D
 
D
Y
 
F
V
 
I
Y
 
Y
I
 
V
D
 
K
D
 
E
L
 
I
T
 
A
D
 
K
A
 
A
L
 
N
L
 
I
R
 
L
A
 
S
A
 
A
V
 
E
H
 
S
D
 
D
G
 
Y
P
 
N
G
 
G
R
 
-
V
 
V
F
 
I
N
 
N
V
 
V
G
 
A
S
 
L
G
 
G
R
 
K
G
 
S
T
 
M
T
 
T
I
|
I
N
 
N
E
 
R
V
 
L
A
 
F
D
 
E
T
 
I
L
 
I
E
 
S
A
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
E
R
 
S
R
 
D
L
 
I
E
 
D
R
 
V
L
 
K
Y
 
Y
H
 
L
P
 
D
P
 
E
R
|
R
P
 
P
V
 
G
D
|
D
V
 
I
P
 
K
V
x
H
S
 
S
V
 
L
L
 
A
D
 
D
C
 
I
A
 
S
A
 
N
A
 
L
W
 
D
R
 
K
E
 
I
M
 
S
G
 
F
W
 
K
R
 
P
A
 
D
T
 
E
T
 
D
P
 
K
L
 
F
A
 
E
D
 
E
G
 
Q
M
 
L
T
 
R
D
 
E
T
 
T
L
 
V
R
 
K
W
 
W
F
 
F
T
 
I
R
 
S
H
 
Q
V
 
M

6kv9A Moee5 in complex with udp-glucuronic acid and NAD (see paper)
35% identity, 90% coverage: 28:332/339 of query aligns to 3:299/299 of 6kv9A

query
sites
6kv9A
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
H
L
 
L
V
 
V
K
 
T
A
 
E
L
 
L
A
 
R
P
 
N
R
 
S
C
 
G
R
 
R
R
 
N
L
 
V
I
 
V
C
 
A
Y
 
V
G
x
D
R
|
R
R
|
R
A
 
P
Q
 
-
E
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
L
P
 
P
G
 
D
T
 
T
E
 
G
C
 
S
H
 
L
T
 
R
G
 
E
E
 
I
T
 
R
G
 
G
D
|
D
I
x
L
D
 
N
R
 
S
L
 
L
G
 
N
P
 
L
L
 
V
-
 
D
-
 
C
L
 
L
H
 
K
G
 
N
V
 
I
D
 
S
R
 
T
V
 
V
I
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
S
x
A
S
 
L
S
x
P
T
 
-
P
 
G
V
 
V
N
x
R
A
 
P
D
 
S
W
 
W
D
 
T
L
 
Q
V
 
F
T
 
P
D
 
E
A
 
Y
E
 
L
Q
 
R
-
x
C
N
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
A
T
 
T
L
 
Q
K
 
R
L
 
L
F
 
M
R
 
E
A
 
A
C
 
C
L
 
V
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
V
V
x
A
S
|
S
S
|
S
G
x
S
G
 
-
T
x
S
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
G
G
 
A
A
 
D
V
 
G
V
 
V
P
 
M
T
 
S
P
 
E
E
 
D
S
 
D
A
 
L
P
 
P
T
 
R
D
 
-
P
 
P
I
 
L
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
K
|
K
V
 
L
A
 
A
I
 
A
E
 
E
K
 
R
Y
 
L
L
 
A
H
 
L
V
 
A
F
 
F
-
 
A
-
 
A
R
 
R
H
 
G
L
 
D
H
 
A
H
 
E
L
 
L
D
 
S
Y
 
V
R
 
G
V
 
A
L
 
L
R
 
R
V
x
F
A
 
F
N
x
T
P
x
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
G
Q
 
Q
L
 
-
A
 
-
T
 
-
K
x
R
G
 
P
Q
 
D
G
x
M
I
x
F
I
 
I
G
 
S
A
x
R
F
 
L
I
 
I
R
 
R
K
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
L
 
V
E
|
E
I
|
I
W
x
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
T
T
x
Q
V
 
L
R
|
R
D
 
D
Y
 
F
V
 
T
Y
 
H
I
 
V
D
 
S
D
 
D
L
 
V
T
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
L
-
 
M
L
 
L
R
 
T
A
 
A
A
 
S
V
 
V
H
 
R
D
 
D
G
 
R
P
 
G
G
 
S
R
 
A
V
 
V
F
 
L
N
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
R
 
S
G
 
A
T
 
V
T
 
S
I
x
V
N
 
N
E
 
E
V
 
V
A
 
V
D
 
S
T
 
M
L
 
T
E
 
A
A
 
E
V
 
L
L
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
R
L
 
P
E
 
C
R
 
T
L
 
A
Y
 
Y
H
 
G
P
 
S
P
 
A
R
 
R
P
 
I
V
 
G
D
|
D
V
 
V
P
 
R
V
 
S
S
 
T
V
 
T
L
 
A
D
 
D
C
 
V
A
 
R
A
 
Q
A
 
A
W
 
Q
R
 
S
E
 
V
M
 
L
G
 
G
W
 
F
R
 
T
A
 
A
T
 
R
T
 
T
P
 
G
L
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
G
M
 
L
T
 
A
D
 
T
T
 
Q
L
 
I
R
 
E
W
 
W
F
 
T
T
 
R
R
 
R
H
 
S
V
 
L

6kvcA Moee5 in complex with udp-glucose and NAD (see paper)
34% identity, 90% coverage: 28:333/339 of query aligns to 3:299/299 of 6kvcA

query
sites
6kvcA
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
H
L
 
L
V
 
V
K
 
T
A
 
E
L
 
L
A
 
R
P
 
N
R
 
S
C
 
G
R
 
R
R
 
N
L
 
V
I
 
V
C
 
A
Y
 
V
G
x
D
R
|
R
R
|
R
A
 
-
Q
 
-
E
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
-
P
 
P
L
 
L
G
 
P
L
 
T
P
 
G
G
 
S
T
 
L
E
 
R
C
 
E
H
 
I
T
 
R
G
 
G
E
x
D
T
x
L
G
 
N
D
 
S
I
 
L
D
 
N
R
 
-
L
 
L
G
 
V
P
 
D
L
 
C
L
 
L
H
 
K
G
 
N
V
 
I
D
 
S
R
 
T
V
 
V
I
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
S
x
A
S
 
L
S
x
P
T
 
-
P
 
G
V
 
V
N
x
R
A
 
P
D
 
S
W
 
W
D
 
T
L
 
Q
V
 
F
T
 
P
D
 
E
A
 
Y
E
 
L
Q
 
R
-
 
C
N
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
A
T
 
T
L
 
Q
K
 
R
L
 
L
F
 
M
R
 
E
A
 
A
C
 
C
L
 
V
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
E
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
V
V
x
A
S
 
S
S
|
S
G
x
S
G
 
-
T
x
S
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
G
G
 
A
A
 
D
V
 
G
V
 
V
P
 
M
T
 
S
P
 
E
E
 
D
S
 
D
A
 
L
P
 
P
T
 
R
D
 
-
P
 
P
I
 
L
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
V
A
 
T
K
|
K
V
 
L
A
 
A
I
 
A
E
 
E
K
 
R
Y
 
L
L
 
A
H
 
L
V
 
A
F
 
F
-
 
A
-
 
A
R
 
R
H
 
G
L
 
D
H
 
A
H
 
E
L
 
L
D
 
S
Y
 
V
R
 
G
V
 
A
L
 
L
R
 
R
V
x
F
A
 
F
N
x
T
P
x
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
G
Q
 
Q
L
 
-
A
 
-
T
 
-
K
x
R
G
 
P
Q
 
D
G
x
M
I
x
F
I
 
I
G
 
S
A
x
R
F
 
L
I
 
I
R
 
R
K
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
R
G
 
G
Q
 
E
P
 
P
L
 
V
E
|
E
I
|
I
W
x
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
T
T
x
Q
V
 
L
R
|
R
D
 
D
Y
 
F
V
 
T
Y
 
H
I
 
V
D
 
S
D
 
D
L
 
V
T
 
V
D
 
R
A
 
A
L
 
L
-
 
M
L
 
L
R
 
T
A
 
A
A
 
S
V
 
V
H
 
R
D
 
D
G
 
R
P
 
G
G
 
S
R
 
A
V
 
V
F
 
L
N
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
T
G
 
G
R
 
S
G
 
A
T
 
V
T
 
S
I
 
V
N
 
N
E
 
E
V
 
V
A
 
V
D
 
S
T
 
M
L
 
T
E
 
A
A
 
E
V
 
L
L
 
T
G
 
G
R
 
L
R
 
R
L
 
P
E
 
C
R
 
T
L
 
A
Y
 
Y
H
 
G
P
 
S
P
 
A
R
 
R
P
 
I
V
 
G
D
|
D
V
 
V
P
 
R
V
 
S
S
 
T
V
 
T
L
 
A
D
 
D
C
 
V
A
 
R
A
 
Q
A
 
A
W
 
Q
R
 
S
E
 
V
M
 
L
G
 
G
W
 
F
R
 
T
A
 
A
T
 
R
T
 
T
P
 
G
L
 
L
A
 
R
D
 
E
G
 
G
M
 
L
T
 
A
D
 
T
T
 
Q
L
 
I
R
 
E
W
 
W
F
 
T
T
 
R
R
 
R
H
 
S
V
 
L
T
 
S

2p5uA Crystal structure of thermus thermophilus hb8 udp-glucose 4-epimerase complex with NAD
32% identity, 89% coverage: 26:328/339 of query aligns to 1:307/311 of 2p5uA

query
sites
2p5uA
L
 
M
S
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
H
L
 
I
V
 
V
K
 
E
A
 
D
L
 
L
A
 
L
P
 
A
R
 
R
C
 
G
R
 
L
R
 
E
L
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
x
D
-
x
N
I
x
L
C
x
A
Y
x
T
G
|
G
R
 
K
R
 
R
A
 
E
Q
 
N
E
 
-
I
 
-
L
 
-
S
 
V
P
 
P
L
 
K
G
 
G
L
 
V
P
 
P
G
 
F
T
 
F
E
 
R
C
 
V
H
x
D
T
x
L
G
 
R
E
 
D
T
 
K
G
 
E
D
 
G
I
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
A
G
 
F
P
 
R
L
 
E
L
 
F
H
 
R
G
 
P
V
 
T
D
 
H
R
 
V
V
 
S
I
 
H
H
x
Q
L
x
A
A
|
A
S
 
Q
S
x
A
S
 
S
T
 
V
P
 
K
V
 
V
N
 
S
A
 
V
D
 
E
W
 
-
D
 
D
L
 
P
V
 
V
T
 
L
D
 
D
A
 
F
E
 
E
Q
 
V
N
 
N
V
 
L
L
 
L
T
 
G
T
 
G
L
 
L
K
 
N
L
 
L
F
 
L
R
 
E
A
 
A
C
 
C
L
 
R
A
 
Q
A
 
Y
G
 
G
V
 
V
G
 
E
R
 
K
V
 
L
V
 
V
F
 
F
V
 
A
S
|
S
S
x
T
G
 
G
G
|
G
T
x
A
V
 
I
Y
 
Y
G
 
G
P
 
E
G
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
V
P
 
P
T
 
E
P
 
G
E
 
E
S
 
R
A
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
W
P
 
P
T
 
P
D
 
R
P
 
P
I
 
K
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
A
V
 
A
A
 
S
K
|
K
V
 
A
A
 
A
I
 
F
E
 
E
K
 
H
Y
 
Y
L
 
L
H
 
S
V
 
V
F
 
Y
R
 
G
H
 
Q
L
 
S
H
 
Y
H
 
G
L
 
L
D
 
K
Y
 
W
R
 
V
V
 
S
L
 
L
R
 
R
V
 
Y
A
 
G
N
 
N
P
x
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
L
 
D
A
 
P
T
x
H
K
 
G
G
 
E
Q
 
A
G
|
G
I
 
V
I
 
V
G
 
A
A
 
I
F
 
F
I
 
A
R
 
E
K
 
R
A
 
V
L
 
L
A
 
K
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
L
 
V
E
 
T
I
 
L
W
 
Y
-
 
A
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
E
S
 
G
T
 
C
V
 
V
R
 
R
D
 
D
Y
 
Y
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
D
 
G
D
 
D
L
 
V
T
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
H
L
 
A
R
 
L
A
 
A
A
 
L
V
 
F
H
 
S
-
 
L
D
 
E
G
 
G
P
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
I
F
 
Y
N
 
N
V
 
V
G
 
G
S
 
T
G
 
G
R
 
E
G
 
G
T
 
H
T
 
T
I
 
T
N
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
L
D
 
M
T
 
A
L
 
V
E
 
A
A
 
E
V
 
A
L
 
A
G
 
G
R
 
K
R
 
A
L
 
P
E
 
E
R
 
V
L
 
Q
Y
 
P
H
 
A
P
 
P
P
 
P
R
 
R
P
 
P
V
 
G
D
 
D
V
 
L
P
 
E
V
 
R
S
 
S
V
 
V
L
 
L
D
 
-
C
 
S
A
 
P
A
 
L
A
 
K
W
 
L
R
 
M
E
 
A
M
 
H
G
 
G
W
 
W
R
 
R
A
 
P
T
 
K
T
 
V
P
 
G
L
 
F
A
 
Q
D
 
E
G
 
G
M
 
I
T
 
R
D
 
L
T
 
T
L
 
V
R
 
D
W
 
H
F
 
F

1r6dA Crystal structure of desiv double mutant (dtdp-glucose 4,6- dehydratase) from streptomyces venezuelae with NAD and dau bound (see paper)
31% identity, 89% coverage: 26:328/339 of query aligns to 1:311/322 of 1r6dA

query
sites
1r6dA
L
 
M
S
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
H
L
 
F
V
 
V
K
 
R
A
 
Q
L
 
L
A
 
L
P
 
A
R
 
G
C
 
A
R
 
Y
-
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
I
-
 
V
-
 
L
-
x
D
R
x
S
L
|
L
I
x
T
C
 
Y
Y
x
A
G
|
G
R
 
N
R
 
R
A
 
A
Q
 
N
E
 
-
I
 
-
L
 
L
S
 
A
P
 
P
L
 
V
G
 
D
L
 
A
-
 
D
P
 
P
G
 
R
T
 
L
E
 
R
C
 
F
H
 
V
T
 
H
G
 
G
E
x
D
T
x
I
G
 
R
D
 
D
I
 
A
D
 
G
R
 
L
L
 
L
G
 
A
P
 
R
L
 
E
L
 
L
H
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
A
V
 
I
I
 
V
H
 
H
L
x
F
A
|
A
S
x
A
S
 
E
S
|
S
T
x
H
P
 
V
V
 
D
N
 
R
A
 
S
D
 
I
W
 
A
D
 
G
L
 
A
V
 
S
T
 
V
D
 
F
A
 
T
E
 
E
Q
x
T
N
 
N
V
 
V
L
 
Q
T
 
G
T
 
T
L
 
Q
K
 
T
L
 
L
F
 
L
R
 
Q
A
 
C
C
 
A
L
 
V
A
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
H
V
|
V
S
|
S
S
x
T
G
x
N
G
 
-
T
x
Q
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
S
G
 
I
A
 
D
V
 
S
V
 
G
P
 
S
T
 
W
P
 
T
E
 
E
S
 
S
A
 
S
P
 
P
T
 
L
D
 
E
P
 
P
I
 
N
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
A
V
 
A
A
 
S
K
|
K
V
 
A
A
 
G
I
 
S
E
 
D
K
 
L
Y
 
V
L
 
A
H
 
R
V
 
A
F
 
Y
R
 
H
H
 
R
L
 
T
H
 
Y
H
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
V
R
 
R
V
 
I
L
 
T
R
 
R
V
 
C
A
 
C
N
|
N
P
x
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
H
A
 
P
T
 
E
K
|
K
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
x
L
I
 
I
G
 
P
A
 
L
F
 
F
I
 
V
R
 
T
K
 
N
A
 
L
L
 
L
A
 
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
T
L
 
L
E
x
P
I
 
L
W
x
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
A
T
 
N
V
 
V
R
|
R
D
 
E
Y
 
W
V
 
V
Y
 
H
I
 
T
D
 
D
D
 
D
L
 
H
T
 
C
D
 
R
A
 
G
L
 
I
L
 
A
R
 
L
A
 
V
A
 
L
V
 
A
H
 
G
D
 
G
G
 
R
P
 
A
G
 
G
R
 
E
V
 
I
F
 
Y
N
 
H
V
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
G
R
 
L
G
 
E
T
 
L
T
 
T
I
x
N
N
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
T
D
 
G
T
 
I
L
 
L
E
 
L
A
 
D
V
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
A
R
 
D
L
 
W
E
 
S
-
 
S
-
 
V
R
 
R
L
 
K
Y
 
V
H
 
A
P
 
D
P
x
R
R
 
K
P
 
G
V
x
H
D
 
D
V
 
L
P
 
R
V
x
Y
S
 
S
V
 
-
L
 
L
D
 
D
C
 
G
A
 
G
A
 
K
A
 
I
W
 
E
R
 
R
E
 
E
M
 
L
G
 
G
W
 
Y
R
 
R
A
 
P
T
 
Q
T
 
V
P
 
S
L
 
F
A
 
A
D
 
D
G
 
G
M
 
L
T
 
A
D
 
R
T
 
T
L
 
V
R
 
R
W
 
W
F
 
Y

1r66A Crystal structure of desiv (dtdp-glucose 4,6-dehydratase) from streptomyces venezuelae with NAD and tyd bound (see paper)
31% identity, 89% coverage: 26:328/339 of query aligns to 1:311/322 of 1r66A

query
sites
1r66A
L
 
M
S
 
R
V
 
L
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
H
L
 
F
V
 
V
K
 
R
A
 
Q
L
 
L
A
 
L
P
 
A
R
 
G
C
 
A
R
 
Y
-
 
P
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
I
-
 
V
-
 
L
-
x
D
R
x
S
L
|
L
I
x
T
C
 
Y
Y
 
A
G
|
G
R
 
N
R
 
R
A
 
A
Q
 
N
E
 
-
I
 
-
L
 
L
S
 
A
P
 
P
L
 
V
G
 
D
L
 
A
-
 
D
P
 
P
G
 
R
T
 
L
E
 
R
C
 
F
H
 
V
T
 
H
G
 
G
E
x
D
T
x
I
G
 
R
D
 
D
I
 
A
D
 
G
R
 
L
L
 
L
G
 
A
P
 
R
L
 
E
L
 
L
H
 
R
G
 
G
V
 
V
D
 
D
R
 
A
V
 
I
I
 
V
H
 
H
L
x
F
A
|
A
S
x
A
S
 
E
S
|
S
T
x
H
P
 
V
V
 
D
N
 
R
A
 
S
D
 
I
W
 
A
D
 
G
L
 
A
V
 
S
T
 
V
D
 
F
A
 
T
E
 
E
Q
x
T
N
 
N
V
 
V
L
 
Q
T
 
G
T
 
T
L
 
Q
K
 
T
L
 
L
F
 
L
R
 
Q
A
 
C
C
 
A
L
 
V
A
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
H
V
|
V
S
|
S
S
x
T
G
x
D
G
 
-
T
x
E
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
S
G
 
I
A
 
D
V
 
S
V
 
G
P
 
S
T
 
W
P
 
T
E
 
E
S
 
S
A
 
S
P
 
P
T
 
L
D
 
E
P
 
P
I
 
N
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
A
V
 
A
A
 
S
K
|
K
V
 
A
A
 
G
I
 
S
E
 
D
K
 
L
Y
 
V
L
 
A
H
 
R
V
 
A
F
 
Y
R
 
H
H
 
R
L
 
T
H
 
Y
H
 
G
L
 
L
D
 
D
Y
 
V
R
 
R
V
 
I
L
 
T
R
 
R
V
 
C
A
 
C
N
|
N
P
x
N
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
Q
 
Q
L
 
H
A
 
P
T
 
E
K
|
K
G
 
-
Q
 
-
G
 
-
I
x
L
I
 
I
G
 
P
A
 
L
F
 
F
I
 
V
R
 
T
K
 
N
A
 
L
L
 
L
A
 
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
T
L
 
L
E
x
P
I
 
L
W
x
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
A
T
 
N
V
 
V
R
|
R
D
 
E
Y
 
W
V
 
V
Y
 
H
I
 
T
D
 
D
D
 
D
L
 
H
T
 
C
D
 
R
A
 
G
L
 
I
L
 
A
R
 
L
A
 
V
A
 
L
V
 
A
H
 
G
D
 
G
G
 
R
P
 
A
G
 
G
R
 
E
V
 
I
F
 
Y
N
 
H
V
 
I
G
 
G
S
 
G
G
 
G
R
 
L
G
 
E
T
 
L
T
 
T
I
x
N
N
 
R
E
 
E
V
 
L
A
 
T
D
 
G
T
 
I
L
 
L
E
 
L
A
 
D
V
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
A
R
 
D
L
 
W
E
 
S
-
 
S
-
 
V
R
 
R
L
 
K
Y
 
V
H
 
A
P
 
D
P
x
R
R
 
K
P
 
G
V
x
H
D
 
D
V
 
L
P
 
R
V
 
Y
S
 
S
V
 
-
L
 
L
D
 
D
C
 
G
A
 
G
A
 
K
A
 
I
W
 
E
R
 
R
E
 
E
M
 
L
G
 
G
W
 
Y
R
 
R
A
 
P
T
 
Q
T
 
V
P
 
S
L
 
F
A
 
A
D
 
D
G
 
G
M
 
L
T
 
A
D
 
R
T
 
T
L
 
V
R
 
R
W
 
W
F
 
Y

8vr2B Crystal structure of the pcryo_0617 oxidoreductase/decarboxylase from psychrobacter cryohalolentis k5 in the presence of NAD and udp
28% identity, 91% coverage: 27:333/339 of query aligns to 9:316/321 of 8vr2B

query
sites
8vr2B
S
 
K
V
 
I
L
 
F
V
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
T
L
 
L
V
 
I
K
 
G
A
 
R
L
 
L
A
 
I
P
 
E
R
 
N
C
 
-
R
 
N
R
 
E
L
 
M
I
 
I
C
 
V
Y
 
Y
G
x
D
R
x
N
R
 
L
A
x
E
Q
x
R
E
 
N
I
 
T
L
 
L
S
 
K
P
 
S
L
 
Q
G
 
P
L
 
F
P
 
A
G
 
N
T
 
H
E
 
K
C
 
N
H
 
L
T
 
T
-
 
L
-
 
I
-
 
Q
G
 
G
E
x
N
T
x
V
G
 
L
D
 
D
I
 
Q
D
 
E
R
 
K
L
 
I
G
 
I
P
 
E
L
 
A
L
 
A
H
 
K
G
 
G
V
 
S
D
 
E
R
 
I
V
 
F
I
 
I
H
 
H
L
x
A
A
|
A
S
x
A
S
 
I
S
 
A
T
 
G
P
 
I
V
 
D
N
 
N
A
 
T
D
 
V
W
 
K
D
 
S
L
 
P
V
 
V
T
 
R
D
 
T
A
 
M
E
 
T
Q
 
V
N
 
N
V
 
M
L
 
I
T
 
G
T
 
T
L
 
A
K
 
N
L
 
A
F
 
L
R
 
E
A
 
A
C
 
A
L
 
H
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
V
R
 
Q
V
 
R
V
 
F
F
 
L
V
 
E
S
x
F
S
 
S
G
 
T
G
 
S
T
 
E
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
S
G
 
R
A
 
A
V
 
Y
V
 
R
P
 
V
T
 
D
P
 
E
E
 
T
S
 
G
A
 
A
P
 
V
T
 
G
D
 
E
P
 
A
I
x
R
T
 
W
A
 
T
Y
 
Y
G
 
A
V
 
V
A
 
S
K
|
K
V
 
L
A
 
A
I
 
G
E
 
E
K
 
H
Y
 
L
L
 
T
H
 
H
V
 
A
F
 
Y
R
 
N
H
 
R
L
 
E
H
 
H
H
 
G
L
 
L
D
 
P
Y
 
T
R
 
V
V
 
T
L
 
F
R
 
R
V
x
P
A
 
F
N
|
N
P
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
G
Q
 
Q
L
 
I
A
 
-
T
 
-
K
 
-
G
 
G
Q
 
E
G
|
G
I
x
A
I
 
I
G
 
S
A
 
I
F
x
M
I
 
I
R
 
R
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
N
G
 
N
Q
 
E
P
 
D
L
 
I
E
x
Y
I
|
I
W
x
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
V
 
I
R
|
R
D
 
A
Y
 
W
V
 
C
Y
 
Y
I
 
V
D
 
D
D
 
D
L
 
M
T
 
I
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
M
R
 
K
A
 
A
-
 
L
A
 
S
V
 
V
H
 
P
D
 
Q
G
 
A
P
 
I
G
 
G
R
 
E
V
 
S
F
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
N
G
 
A
R
 
R
G
 
A
-
 
I
T
 
T
T
 
T
I
|
I
N
 
Y
E
 
G
V
 
L
A
 
A
D
 
Q
T
 
T
L
 
I
E
 
C
A
 
R
V
 
V
L
 
L
G
 
N
R
 
S
R
 
K
L
 
S
E
 
E
R
 
I
L
 
I
Y
 
F
H
 
R
P
 
E
P
 
A
R
 
L
P
 
S
V
 
A
D
 
D
V
 
I
P
 
E
V
 
L
S
 
R
V
 
I
L
 
P
D
 
N
C
 
V
A
 
D
A
 
K
A
 
S
W
 
E
R
 
E
E
 
L
M
 
L
G
 
G
W
 
F
R
 
K
A
 
A
T
 
Q
T
 
V
P
 
D
L
 
L
A
 
E
D
 
E
G
 
G
M
 
L
T
 
I
D
 
R
T
 
T
L
 
A
R
 
D
W
 
W
F
 
L
T
 
S
R
 
A
H
 
N
V
 
M
T
 
N

2q1sA Crystal structure of the bordetella bronchiseptica enzyme wbmf in complex with nadh (see paper)
28% identity, 91% coverage: 21:327/339 of query aligns to 3:313/336 of 2q1sA

query
sites
2q1sA
A
 
S
G
 
K
L
 
L
G
 
A
E
 
N
L
 
T
S
 
N
V
 
V
L
 
M
V
 
V
T
 
V
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
x
V
G
 
G
I
 
S
N
 
N
L
 
L
V
 
V
K
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
V
R
 
N
C
 
Q
R
 
V
R
 
H
L
 
V
I
 
V
C
x
D
Y
x
N
G
x
L
R
 
L
R
x
S
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
I
 
I
L
 
N
S
 
V
P
 
P
L
 
-
G
 
D
L
 
H
P
 
P
G
 
A
T
 
V
E
 
R
C
 
F
H
 
S
T
 
E
G
 
T
E
x
S
T
x
I
G
 
T
D
 
D
I
 
D
D
 
A
R
 
L
L
 
L
G
 
A
P
 
S
L
 
L
L
 
Q
H
 
D
G
 
E
V
 
Y
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
I
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
S
x
T
S
 
Y
S
x
H
T
 
G
P
 
N
V
 
Q
N
 
S
A
 
S
D
 
I
W
 
H
D
 
D
L
 
P
V
 
L
T
 
A
D
 
D
A
 
H
E
 
E
Q
x
N
N
 
N
V
 
T
L
 
L
T
 
T
T
 
T
L
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
Y
-
 
E
R
 
R
A
 
L
C
 
K
L
 
H
A
 
F
A
 
K
G
 
R
V
 
L
G
 
K
R
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
V
x
S
S
 
A
S
x
A
G
 
G
G
 
E
T
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
E
T
 
T
P
 
D
E
 
I
S
 
V
A
 
S
P
 
L
T
 
H
D
 
N
P
 
N
I
 
D
T
 
S
A
x
P
Y
|
Y
G
 
S
V
 
M
A
 
S
K
|
K
V
 
I
A
 
F
I
 
G
E
 
E
K
 
F
Y
 
Y
L
 
S
H
 
V
V
 
Y
F
 
Y
R
 
H
H
 
K
L
 
Q
H
 
H
H
 
Q
L
 
L
D
 
P
Y
 
T
R
 
V
V
 
R
L
 
A
R
 
R
V
x
F
A
 
Q
N
 
N
P
x
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
G
Q
 
E
L
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
W
-
x
R
-
 
G
-
 
T
-
 
P
A
 
A
T
 
T
K
 
V
G
 
W
Q
x
R
G
 
N
I
 
V
I
 
T
G
 
P
A
 
T
F
 
F
I
 
I
R
 
Y
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
K
G
 
G
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
E
 
P
I
 
L
W
 
E
G
 
N
D
 
G
G
 
G
S
 
V
T
 
A
V
 
T
R
 
R
D
 
D
Y
 
F
V
 
I
Y
 
F
I
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
D
 
N
A
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
A
A
 
C
A
 
A
V
 
A
H
 
D
D
 
G
G
 
T
P
 
P
G
 
G
R
 
G
V
 
V
F
 
Y
N
 
N
V
 
I
G
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
K
G
 
E
T
 
T
T
 
S
I
 
I
N
 
A
E
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
T
T
 
K
L
 
I
E
 
N
A
 
E
V
 
I
L
 
T
G
 
G
R
 
N
R
 
N
L
 
T
E
 
E
R
 
L
L
 
D
Y
 
R
H
 
L
P
 
P
P
 
K
R
 
R
P
 
P
V
 
W
D
 
D
V
 
N
P
 
S
V
 
K
S
 
R
V
 
F
L
 
G
D
 
S
C
 
P
A
 
E
A
 
K
A
 
A
W
 
R
R
 
R
E
 
E
M
 
L
G
 
G
W
 
F
R
 
S
A
 
A
T
 
D
T
 
V
P
 
S
L
 
I
A
 
D
D
 
D
G
 
G
M
 
L
T
 
R
D
 
K
T
 
T
L
 
I
R
 
E
W
 
W

3eheA Crystal structure of udp-glucose 4 epimerase (gale-1) from archaeoglobus fulgidus
32% identity, 75% coverage: 28:280/339 of query aligns to 2:246/290 of 3eheA

query
sites
3eheA
V
 
I
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
H
L
 
V
V
 
V
K
 
D
A
 
K
L
 
L
A
 
S
P
 
E
R
 
-
C
 
-
R
 
-
R
 
-
L
 
-
I
 
-
C
 
-
Y
 
-
G
 
-
R
 
-
R
 
-
A
 
S
Q
 
N
E
 
E
I
 
I
L
 
V
S
 
V
P
 
I
L
x
D
G
x
N
L
|
L
P
x
S
-
x
S
G
|
G
T
 
N
E
 
E
C
 
E
H
 
F
T
 
V
G
 
N
E
 
E
T
 
A
G
 
A
D
 
R
I
 
L
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
x
D
-
x
L
-
 
A
-
 
A
D
 
D
R
 
D
L
 
I
G
 
K
P
 
D
L
 
Y
L
 
L
H
 
K
G
 
G
V
 
A
D
 
E
R
 
E
V
 
V
I
 
W
H
 
H
L
x
I
A
|
A
S
x
A
S
 
N
S
 
P
T
 
D
P
 
V
V
 
R
N
 
G
A
 
A
D
 
E
W
 
N
-
 
P
D
 
D
L
 
E
V
 
I
T
 
Y
D
 
-
A
 
-
E
 
R
Q
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
L
T
 
A
T
 
T
L
 
Y
K
 
R
L
 
L
F
 
L
R
 
E
A
 
A
C
 
M
L
 
R
A
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
S
R
 
R
V
 
I
V
 
V
F
 
F
V
x
T
S
 
S
S
x
T
G
x
S
G
 
-
T
|
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
E
G
 
A
A
 
K
V
 
V
V
 
I
P
 
P
T
 
T
P
 
P
E
 
E
S
 
D
A
 
Y
P
 
P
T
 
T
D
 
H
P
 
P
I
 
I
T
 
S
A
 
L
Y
|
Y
G
 
G
V
 
A
A
 
S
K
|
K
V
 
L
A
 
A
I
 
C
E
 
E
K
 
A
Y
 
L
L
 
I
H
 
E
V
 
S
F
 
Y
R
 
C
H
 
H
L
 
T
H
 
F
H
 
D
L
 
M
D
 
Q
Y
 
A
R
 
W
V
 
I
L
 
Y
R
 
R
V
x
F
A
|
A
N
|
N
P
x
V
Y
 
I
G
 
G
P
 
R
Y
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
R
K
 
S
G
 
T
Q
 
H
G
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
Y
A
 
D
F
 
F
I
 
I
R
 
M
K
 
K
A
 
L
L
 
K
A
 
R
G
 
N
-
 
P
Q
 
E
P
 
E
L
 
L
E
 
E
I
 
I
W
 
L
G
 
G
D
 
N
G
 
G
S
 
E
T
 
Q
V
 
N
R
 
K
D
 
S
Y
 
Y
V
 
I
Y
 
Y
I
 
I
D
 
S
D
 
D
L
 
C
T
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
M
L
 
L
R
 
F
A
 
G
A
 
L
V
 
R
H
 
G
D
 
D
G
 
E
P
 
R
G
 
V
R
 
N
V
 
I
F
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
S
 
S
G
 
E
R
 
D
G
 
Q
T
 
I
T
 
K
I
 
V
N
 
K
E
 
R
V
 
I
A
 
A
D
 
E
T
 
I
L
 
V
E
 
C
A
 
E
V
 
E
L
 
L
G
 
G

1udaA Structure of udp-galactose-4-epimerase complexed with udp-4-deoxy-4- fluoro-alpha-d-galactose (see paper)
30% identity, 90% coverage: 26:331/339 of query aligns to 1:332/338 of 1udaA

query
sites
1udaA
L
 
M
S
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
S
G
|
G
F
x
Y
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
H
L
 
T
V
 
C
K
 
V
A
 
Q
L
 
L
A
 
L
P
 
Q
R
 
N
C
 
G
R
 
H
R
 
D
L
 
V
I
 
I
-
 
I
-
 
L
-
x
D
-
x
N
-
x
L
C
|
C
Y
x
N
G
x
S
R
 
K
R
 
R
A
 
S
Q
 
-
E
 
-
I
 
V
L
 
L
S
 
P
P
 
V
L
 
I
G
 
E
L
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
G
E
 
K
C
 
H
H
 
P
T
 
T
G
 
F
E
 
V
T
 
E
G
 
G
D
|
D
I
|
I
D
 
R
R
 
N
L
 
E
G
 
A
P
 
L
L
 
M
L
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
D
H
 
H
G
 
A
V
 
I
D
 
D
R
 
T
V
 
V
I
 
I
H
 
H
L
x
F
A
|
A
S
x
G
S
 
L
S
x
K
T
 
A
P
 
V
V
 
G
N
 
E
A
 
S
D
 
V
W
 
Q
D
 
K
L
 
P
V
 
L
T
 
E
D
 
Y
A
 
Y
E
 
D
Q
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
N
T
 
G
T
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
F
 
I
R
 
S
A
 
A
C
 
M
L
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
N
V
 
V
G
 
K
R
 
N
V
 
F
V
 
I
F
 
F
V
 
-
S
|
S
S
 
S
G
x
S
G
x
A
T
|
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
D
G
 
N
A
 
P
V
 
K
V
 
I
P
 
P
T
 
Y
P
 
V
E
 
E
S
 
S
A
 
F
P
 
P
T
 
T
-
 
G
D
 
T
P
 
P
I
 
Q
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
K
A
 
S
K
|
K
V
 
L
A
 
M
I
 
V
E
 
E
K
 
Q
Y
 
I
L
 
L
H
 
T
V
 
D
F
 
L
R
 
Q
H
 
K
L
 
A
H
 
Q
-
 
P
H
 
D
L
 
W
D
 
S
Y
 
I
R
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
R
V
x
Y
A
 
F
N
|
N
P
|
P
Y
 
V
G
 
G
P
 
A
Y
 
H
Q
 
P
L
 
S
A
 
G
T
 
D
K
x
M
G
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
P
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
-
 
P
-
 
N
-
x
N
I
x
L
G
 
M
A
 
P
F
 
Y
I
 
I
R
 
A
K
 
Q
A
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
Q
 
R
-
 
R
-
 
D
P
 
S
L
 
L
E
x
A
I
|
I
W
x
F
G
 
G
-
 
N
-
 
D
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
E
D
 
D
G
 
G
S
 
T
T
 
G
V
 
V
R
|
R
D
 
D
Y
|
Y
V
 
I
Y
 
H
I
 
V
D
 
M
D
 
D
L
 
L
T
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
H
L
 
V
R
 
V
A
 
A
-
 
M
-
 
E
A
 
K
V
 
L
H
 
A
D
 
N
G
 
K
P
 
P
G
 
G
-
 
V
R
 
H
V
 
I
F
 
Y
N
 
N
V
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
V
G
 
G
T
 
N
T
 
S
I
 
V
N
 
L
E
 
D
V
 
V
A
 
V
D
 
N
T
 
A
L
 
F
E
 
S
A
 
K
V
 
A
L
 
C
G
 
G
R
 
K
R
 
P
L
 
V
E
 
N
R
 
Y
L
 
H
Y
 
F
H
 
A
P
 
P
P
 
R
R
|
R
P
 
E
V
 
G
D
|
D
V
 
L
P
 
P
V
 
A
S
x
Y
V
 
W
L
 
A
D
 
D
C
 
A
A
 
S
A
 
K
A
 
A
W
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
L
G
 
N
W
 
W
R
 
R
A
 
V
T
 
T
T
 
R
P
 
T
L
 
L
A
 
D
D
 
E
G
 
M
M
 
A
T
 
Q
D
 
D
T
 
T
L
 
W
R
 
H
W
 
W
F
 
Q
T
 
S
R
 
R
H
 
H

1naiA Udp-galactose 4-epimerase from escherichia coli, oxidized (see paper)
30% identity, 90% coverage: 26:331/339 of query aligns to 1:332/338 of 1naiA

query
sites
1naiA
L
 
M
S
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
S
G
|
G
F
x
Y
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
H
L
 
T
V
 
C
K
 
V
A
 
Q
L
 
L
A
 
L
P
 
Q
R
 
N
C
 
G
R
 
H
R
 
D
L
 
V
I
 
I
-
 
I
-
 
L
-
x
D
-
x
N
-
x
L
C
|
C
Y
x
N
G
x
S
R
 
K
R
 
R
A
 
S
Q
 
-
E
 
-
I
 
V
L
 
L
S
 
P
P
 
V
L
 
I
G
 
E
L
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
G
E
 
K
C
 
H
H
 
P
T
 
T
G
 
F
E
 
V
T
 
E
G
 
G
D
|
D
I
|
I
D
 
R
R
 
N
L
 
E
G
 
A
P
 
L
L
 
M
L
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
D
H
 
H
G
 
A
V
 
I
D
 
D
R
 
T
V
 
V
I
 
I
H
 
H
L
x
F
A
|
A
S
x
G
S
 
L
S
x
K
T
 
A
P
 
V
V
 
G
N
 
E
A
 
S
D
 
V
W
 
Q
D
 
K
L
 
P
V
 
L
T
 
E
D
 
Y
A
 
Y
E
 
D
Q
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
N
T
 
G
T
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
F
 
I
R
 
S
A
 
A
C
 
M
L
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
N
V
 
V
G
 
K
R
 
N
V
 
F
V
 
I
F
 
F
V
 
-
S
 
S
S
 
S
G
x
S
G
x
A
T
|
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
D
G
 
N
A
 
P
V
 
K
V
 
I
P
 
P
T
 
Y
P
 
V
E
 
E
S
 
S
A
 
F
P
 
P
T
 
T
-
 
G
D
 
T
P
 
P
I
 
Q
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
K
A
 
S
K
|
K
V
 
L
A
 
M
I
 
V
E
 
E
K
 
Q
Y
 
I
L
 
L
H
 
T
V
 
D
F
 
L
R
 
Q
H
 
K
L
 
A
H
 
Q
-
 
P
H
 
D
L
 
W
D
 
S
Y
 
I
R
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
R
V
x
Y
A
 
F
N
|
N
P
|
P
Y
 
V
G
 
G
P
 
A
Y
 
H
Q
 
P
L
 
S
A
 
G
T
 
D
K
x
M
G
 
G
-
x
E
-
 
D
-
x
P
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
-
 
P
-
 
N
-
x
N
I
x
L
G
 
M
A
 
P
F
 
Y
I
 
I
R
 
A
K
 
Q
A
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
Q
 
R
-
 
R
-
 
D
P
 
S
L
|
L
E
x
A
I
 
I
W
 
F
G
 
G
-
 
N
-
 
D
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
E
D
 
D
G
 
G
S
 
T
T
 
G
V
 
V
R
|
R
D
 
D
Y
|
Y
V
 
I
Y
 
H
I
 
V
D
 
M
D
 
D
L
 
L
T
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
H
L
 
V
R
 
V
A
 
A
-
 
M
-
 
E
A
 
K
V
 
L
H
 
A
D
 
N
G
 
K
P
 
P
G
 
G
-
 
V
R
 
H
V
 
I
F
 
Y
N
 
N
V
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
V
G
 
G
T
 
N
T
 
S
I
 
V
N
 
L
E
 
D
V
 
V
A
 
V
D
 
N
T
 
A
L
 
F
E
 
S
A
 
K
V
 
A
L
 
C
G
 
G
R
 
K
R
 
P
L
 
V
E
 
N
R
 
Y
L
 
H
Y
 
F
H
 
A
P
 
P
P
 
R
R
|
R
P
 
E
V
 
G
D
 
D
V
 
L
P
 
P
V
 
A
S
 
Y
V
 
W
L
 
A
D
 
D
C
 
A
A
 
S
A
 
K
A
 
A
W
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
L
G
 
N
W
 
W
R
 
R
A
 
V
T
 
T
T
 
R
P
 
T
L
 
L
A
 
D
D
 
E
G
 
M
M
 
A
T
 
Q
D
 
D
T
 
T
L
 
W
R
 
H
W
 
W
F
 
Q
T
 
S
R
 
R
H
 
H

1lrjA Crystal structure of e. Coli udp-galactose 4-epimerase complexed with udp-n-acetylglucosamine (see paper)
30% identity, 90% coverage: 26:331/339 of query aligns to 1:332/338 of 1lrjA

query
sites
1lrjA
L
 
M
S
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
S
G
|
G
F
x
Y
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
H
L
 
T
V
 
C
K
 
V
A
 
Q
L
 
L
A
 
L
P
 
Q
R
 
N
C
 
G
R
 
H
R
 
D
L
 
V
I
 
I
-
 
I
-
 
L
-
x
D
-
x
N
-
x
L
C
|
C
Y
x
N
G
x
S
R
 
K
R
 
R
A
 
S
Q
 
-
E
 
-
I
 
V
L
 
L
S
 
P
P
 
V
L
 
I
G
 
E
L
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
G
E
 
K
C
 
H
H
 
P
T
 
T
G
 
F
E
 
V
T
 
E
G
 
G
D
|
D
I
|
I
D
 
R
R
 
N
L
 
E
G
 
A
P
 
L
L
 
M
L
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
D
H
 
H
G
 
A
V
 
I
D
 
D
R
 
T
V
 
V
I
 
I
H
 
H
L
x
F
A
|
A
S
x
G
S
 
L
S
x
K
T
 
A
P
x
V
V
 
G
N
 
E
A
 
S
D
 
V
W
 
Q
D
 
K
L
 
P
V
 
L
T
 
E
D
 
Y
A
 
Y
E
 
D
Q
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
N
T
 
G
T
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
F
 
I
R
 
S
A
 
A
C
 
M
L
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
N
V
 
V
G
 
K
R
 
N
V
 
F
V
 
I
F
 
F
V
 
-
S
 
S
S
 
S
G
x
S
G
x
A
T
|
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
D
G
 
N
A
 
P
V
 
K
V
 
I
P
 
P
T
 
Y
P
 
V
E
 
E
S
 
S
A
 
F
P
 
P
T
 
T
-
 
G
D
 
T
P
 
P
I
 
Q
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
K
A
 
S
K
|
K
V
 
L
A
 
M
I
 
V
E
 
E
K
 
Q
Y
 
I
L
 
L
H
 
T
V
 
D
F
 
L
R
 
Q
H
 
K
L
 
A
H
 
Q
-
 
P
H
 
D
L
 
W
D
 
S
Y
 
I
R
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
R
V
x
Y
A
x
F
N
|
N
P
|
P
Y
 
V
G
 
G
P
 
A
Y
 
H
Q
 
P
L
 
S
A
 
G
T
 
D
K
x
M
G
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
P
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
-
 
P
-
 
N
-
 
N
I
x
L
G
 
M
A
 
P
F
 
Y
I
 
I
R
 
A
K
 
Q
A
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
Q
 
R
-
 
R
-
 
D
P
 
S
L
|
L
E
x
A
I
 
I
W
x
F
G
 
G
-
 
N
-
 
D
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
E
D
 
D
G
 
G
S
 
T
T
 
G
V
 
V
R
|
R
D
 
D
Y
|
Y
V
 
I
Y
 
H
I
 
V
D
 
M
D
 
D
L
 
L
T
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
H
L
 
V
R
 
V
A
 
A
-
 
M
-
 
E
A
 
K
V
 
L
H
 
A
D
 
N
G
 
K
P
 
P
G
 
G
-
 
V
R
 
H
V
 
I
F
 
Y
N
 
N
V
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
V
G
 
G
T
 
N
T
 
S
I
x
V
N
 
L
E
 
D
V
 
V
A
 
V
D
 
N
T
 
A
L
 
F
E
 
S
A
 
K
V
 
A
L
 
C
G
 
G
R
 
K
R
 
P
L
 
V
E
 
N
R
 
Y
L
 
H
Y
 
F
H
 
A
P
 
P
P
 
R
R
|
R
P
 
E
V
 
G
D
|
D
V
 
L
P
 
P
V
 
A
S
 
Y
V
 
W
L
 
A
D
 
D
C
 
A
A
 
S
A
 
K
A
 
A
W
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
L
G
 
N
W
 
W
R
 
R
A
 
V
T
 
T
T
 
R
P
 
T
L
 
L
A
 
D
D
 
E
G
 
M
M
 
A
T
 
Q
D
 
D
T
 
T
L
 
W
R
 
H
W
 
W
F
 
Q
T
 
S
R
 
R
H
 
H

2pzjA Crystal structure of the bordetella bronchiseptica enzyme wbmf in complex with NAD+ (see paper)
29% identity, 91% coverage: 21:327/339 of query aligns to 1:308/330 of 2pzjA

query
sites
2pzjA
A
 
S
G
 
K
L
 
L
G
 
A
E
 
N
L
 
T
S
 
N
V
 
V
L
 
M
V
 
V
T
 
V
G
|
G
A
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
x
V
G
 
G
I
 
S
N
 
N
L
 
L
V
 
V
K
 
K
-
 
R
-
 
L
-
 
L
A
 
E
L
 
L
A
 
G
P
 
V
R
 
N
C
 
Q
R
 
V
R
 
H
L
 
V
I
 
V
C
x
D
Y
x
N
G
x
L
R
 
L
R
x
S
A
 
A
Q
 
E
E
 
K
I
 
I
L
 
N
S
 
V
P
 
P
L
 
-
G
 
D
L
 
H
P
 
P
G
 
A
T
 
V
E
 
R
C
 
F
H
 
S
T
 
E
G
 
T
E
x
S
T
x
I
G
 
T
D
 
D
I
 
D
D
 
A
R
 
L
L
 
L
G
 
A
P
 
S
L
 
L
L
 
Q
H
 
D
G
 
E
V
 
Y
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
I
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
S
x
T
S
 
Y
S
x
H
T
 
G
P
 
N
V
 
Q
N
 
S
A
 
S
D
 
I
W
 
H
D
 
D
L
 
P
V
 
L
T
 
A
D
 
D
A
 
H
E
 
E
Q
x
N
N
 
N
V
 
T
L
 
L
T
 
T
T
 
T
L
 
L
K
 
K
L
 
L
F
 
Y
-
 
E
R
 
R
A
 
L
C
 
K
L
 
H
A
 
F
A
 
K
G
 
R
V
 
L
G
 
K
R
 
K
V
 
V
V
 
V
F
 
Y
V
x
S
S
 
A
S
x
A
G
 
G
G
 
E
T
 
-
V
 
-
Y
 
-
G
 
-
P
 
-
G
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
P
 
E
T
 
T
P
 
D
E
 
I
S
 
V
A
 
S
P
 
L
T
 
H
D
 
N
P
 
N
I
 
D
T
 
S
A
x
P
Y
|
Y
G
 
S
V
 
M
A
 
S
K
|
K
V
 
I
A
 
F
I
 
G
E
 
E
K
 
F
Y
 
Y
L
 
S
H
 
V
V
 
Y
F
 
Y
R
 
H
H
 
K
L
 
Q
H
 
H
H
 
Q
L
 
L
D
 
P
Y
 
T
R
 
V
V
 
R
L
 
A
R
 
R
V
x
F
A
 
Q
N
|
N
P
x
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
G
Q
 
E
L
 
I
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
W
-
x
R
-
 
G
-
 
T
-
 
P
A
 
A
T
 
T
K
 
V
G
 
W
Q
x
R
G
 
N
I
 
V
I
 
T
G
 
P
A
 
T
F
 
F
I
 
I
R
 
Y
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
K
G
 
G
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
E
 
P
I
 
L
W
 
E
G
 
N
D
 
G
G
 
G
S
 
V
T
 
A
V
 
T
R
 
R
D
 
D
Y
 
F
V
 
I
Y
 
F
I
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
D
 
N
A
 
G
L
 
L
L
 
I
R
 
A
A
 
C
A
 
A
V
 
A
H
 
D
D
 
G
G
 
T
P
 
P
G
 
G
R
 
G
V
 
V
F
 
Y
N
 
N
V
 
I
G
 
A
S
 
S
G
 
G
R
 
K
G
 
E
T
 
T
T
 
S
I
 
I
N
 
A
E
 
D
V
 
L
A
 
A
D
 
T
T
 
K
L
 
I
E
 
N
A
 
E
V
 
I
L
 
T
G
 
G
R
 
N
R
 
N
L
 
T
E
 
E
R
 
L
L
 
D
Y
 
R
H
 
L
P
 
P
P
 
K
R
 
R
P
 
P
V
 
W
D
 
D
V
 
N
P
 
S
V
 
G
S
 
S
V
 
-
L
 
-
D
 
-
C
 
P
A
 
E
A
 
K
A
 
A
W
 
R
R
 
R
E
 
E
M
 
L
G
 
G
W
 
F
R
 
S
A
 
A
T
 
D
T
 
V
P
 
S
L
 
I
A
 
D
D
 
D
G
 
G
M
 
L
T
 
R
D
 
K
T
 
T
L
 
I
R
 
E
W
 
W

1kvrA Udp-galactose 4-epimerase complexed with udp-phenol (see paper)
30% identity, 90% coverage: 26:331/339 of query aligns to 1:332/338 of 1kvrA

query
sites
1kvrA
L
 
M
S
 
R
V
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
S
G
|
G
F
x
Y
I
|
I
G
 
G
I
 
S
N
 
H
L
 
T
V
 
C
K
 
V
A
 
Q
L
 
L
A
 
L
P
 
Q
R
 
N
C
 
G
R
 
H
R
 
D
L
 
V
I
 
I
-
 
I
-
 
L
-
x
D
-
x
N
-
 
L
C
|
C
Y
x
N
G
x
S
R
 
K
R
 
R
A
 
S
Q
 
-
E
 
-
I
 
V
L
 
L
S
 
P
P
 
V
L
 
I
G
 
E
L
 
R
P
 
L
G
 
G
T
 
G
E
 
K
C
 
H
H
 
P
T
 
T
G
 
F
E
 
V
T
 
E
G
 
G
D
|
D
I
|
I
D
 
R
R
 
N
L
 
E
G
 
A
P
 
L
L
 
M
L
 
T
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
H
-
 
D
H
 
H
G
 
A
V
 
I
D
 
D
R
 
T
V
 
V
I
 
I
H
 
H
L
x
F
A
|
A
S
x
G
S
 
L
S
x
K
T
 
A
P
 
V
V
 
G
N
 
E
A
 
S
D
 
V
W
 
Q
D
 
K
L
 
P
V
 
L
T
 
E
D
 
Y
A
 
Y
E
 
D
Q
 
N
N
 
N
V
 
V
L
 
N
T
 
G
T
 
T
L
 
L
K
 
R
L
 
L
F
 
I
R
 
S
A
 
A
C
 
M
L
 
R
A
 
A
A
 
A
G
 
N
V
 
V
G
 
K
R
 
N
V
 
F
V
 
I
F
 
F
V
 
-
S
|
S
S
|
S
G
x
A
G
x
A
T
|
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
D
G
 
Q
A
 
P
V
 
K
V
 
I
P
 
P
T
 
Y
P
 
V
E
 
E
S
 
S
A
 
F
P
 
P
T
 
T
-
 
G
D
 
T
P
 
P
I
 
Q
T
 
S
A
 
P
Y
|
Y
G
 
G
V
 
K
A
 
S
K
|
K
V
 
L
A
 
M
I
 
V
E
 
E
K
 
Q
Y
 
I
L
 
L
H
 
T
V
 
D
F
 
L
R
 
Q
H
 
K
L
 
A
H
 
Q
-
 
P
H
 
D
L
 
W
D
 
S
Y
 
I
R
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
R
V
x
Y
A
 
F
N
|
N
P
|
P
Y
 
V
G
 
G
P
 
A
Y
 
H
Q
 
P
L
 
S
A
 
G
T
 
D
K
x
M
G
 
G
-
 
E
-
 
D
-
 
P
Q
 
Q
G
 
G
I
 
I
-
 
P
-
x
N
-
x
N
I
x
L
G
 
M
A
 
P
F
 
Y
I
 
I
R
 
A
K
 
Q
A
 
V
L
 
A
A
 
V
G
 
G
Q
 
R
-
 
R
-
 
D
P
 
S
L
 
L
E
x
A
I
|
I
W
x
F
G
 
G
-
 
N
-
 
D
-
 
Y
-
 
P
-
 
T
-
 
E
D
 
D
G
 
G
S
 
T
T
 
G
V
 
V
R
|
R
D
 
D
Y
|
Y
V
 
I
Y
 
H
I
 
V
D
 
M
D
 
D
L
 
L
T
 
A
D
 
D
A
 
G
L
 
H
L
 
V
R
 
V
A
 
A
-
 
M
-
 
E
A
 
K
V
 
L
H
 
A
D
 
N
G
 
K
P
 
P
G
 
G
-
 
V
R
 
H
V
 
I
F
 
Y
N
 
N
V
 
L
G
 
G
S
 
A
G
 
G
R
 
V
G
 
G
T
 
N
T
 
S
I
x
V
N
 
L
E
 
D
V
 
V
A
 
V
D
 
N
T
 
A
L
 
F
E
 
S
A
 
K
V
 
A
L
 
C
G
 
G
R
 
K
R
 
P
L
 
V
E
 
N
R
 
Y
L
 
H
Y
 
F
H
 
A
P
 
P
P
 
R
R
|
R
P
 
E
V
 
G
D
|
D
V
 
L
P
 
P
V
 
A
S
 
Y
V
 
W
L
 
A
D
 
D
C
 
A
A
 
S
A
 
K
A
 
A
W
 
D
R
 
R
E
 
E
M
 
L
G
 
N
W
 
W
R
 
R
A
 
V
T
 
T
T
 
R
P
 
T
L
 
L
A
 
D
D
 
E
G
 
M
M
 
A
T
 
Q
D
 
D
T
 
T
L
 
W
R
 
H
W
 
W
F
 
Q
T
 
S
R
 
R
H
 
H

Query Sequence

>8502212 FitnessBrowser__Miya:8502212
MSIPTDPLRTCTPNSPPDAPAGLGELSVLVTGAAGFIGINLVKALAPRCRRLICYGRRAQ
EILSPLGLPGTECHTGETGDIDRLGPLLHGVDRVIHLASSSTPVNADWDLVTDAEQNVLT
TLKLFRACLAAGVGRVVFVSSGGTVYGPGAVVPTPESAPTDPITAYGVAKVAIEKYLHVF
RHLHHLDYRVLRVANPYGPYQLATKGQGIIGAFIRKALAGQPLEIWGDGSTVRDYVYIDD
LTDALLRAAVHDGPGRVFNVGSGRGTTINEVADTLEAVLGRRLERLYHPPRPVDVPVSVL
DCAAAWREMGWRATTPLADGMTDTLRWFTRHVTPPGASA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory