SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing 8502445 DvMF_3151 ABC transporter related (RefSeq) to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
65% identity, 99% coverage: 3:242/242 of query aligns to 2:240/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
M
 
I
I
 
I
E
 
R
F
 
I
H
 
R
D
 
N
V
 
L
H
 
H
K
 
K
W
 
W
Y
x
F
G
 
G
E
 
P
F
x
L
H
 
H
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
H
Q
 
L
K
 
E
V
 
V
E
 
A
K
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
K
L
 
L
V
 
V
I
 
I
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
L
I
 
I
R
 
R
C
 
T
L
 
I
N
 
N
R
 
R
L
 
L
E
 
E
P
 
D
I
 
F
Q
 
Q
K
 
E
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
L
 
V
L
 
V
E
 
D
G
 
G
K
 
L
S
 
S
I
 
V
H
 
K
D
 
D
K
 
D
G
 
R
V
 
A
D
 
-
V
 
L
N
 
R
E
 
E
L
 
I
R
 
R
T
 
R
E
 
E
V
 
V
G
 
G
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
H
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
M
K
 
R
V
 
V
R
 
R
K
 
R
M
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
E
 
E
S
 
K
I
 
K
A
 
A
M
 
L
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
V
G
 
G
I
 
I
H
 
L
D
 
D
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
K
 
K
Y
 
Y
P
 
P
V
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
I
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
D
A
 
V
M
 
M
K
 
R
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
Q
A
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
V
F
 
F
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
Q
V
 
I
I
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
G
P
 
R
P
 
P
D
 
E
V
 
E
F
 
I
F
 
F
S
 
T
S
 
R
P
 
P
K
 
K
H
 
E
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
R
A
 
S
F
 
F
L
 
L
R
 
Q
E
 
R
I
 
V
L
 
L

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
61% identity, 100% coverage: 1:242/242 of query aligns to 1:242/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
M
 
L
A
 
Q
M
 
M
I
 
I
E
 
D
F
 
V
H
 
H
D
 
Q
V
 
L
H
 
K
K
 
K
W
 
S
Y
x
F
G
 
G
E
 
S
F
 
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
N
Q
 
V
K
 
H
V
 
I
E
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
|
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
F
I
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
D
I
 
F
Q
 
D
K
 
E
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
L
 
I
L
 
I
E
 
D
G
 
G
K
 
I
S
 
N
I
 
L
H
 
K
D
 
A
K
 
K
G
 
D
V
 
T
D
 
N
V
 
L
N
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
T
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
H
 
N
N
 
N
V
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
M
K
 
K
V
 
V
R
 
R
K
 
K
M
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
E
 
E
S
 
A
I
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
L
H
 
K
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
R
x
H
K
 
A
Y
|
Y
P
 
P
V
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
I
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
S
A
 
V
M
 
M
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
N
A
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
F
 
F
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
G
P
 
K
P
 
P
D
 
E
V
 
D
F
 
L
F
 
F
S
 
D
S
 
R
P
 
P
K
 
Q
H
 
H
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
L
 
L
R
 
S
E
 
K
I
 
V
L
 
F

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
61% identity, 100% coverage: 1:242/242 of query aligns to 1:242/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
M
 
L
A
 
Q
M
 
M
I
 
I
E
 
D
F
 
V
H
 
H
D
 
Q
V
 
L
H
 
K
K
 
K
W
 
S
Y
x
F
G
 
G
E
 
S
F
 
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
N
Q
 
V
K
 
H
V
 
I
E
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
|
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
F
I
 
L
R
|
R
C
 
C
L
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
D
I
 
F
Q
 
D
K
 
E
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
L
 
I
L
 
I
E
 
D
G
 
G
K
 
I
S
 
N
I
 
L
H
 
K
D
 
A
K
 
K
G
 
D
V
 
T
D
 
N
V
 
L
N
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
T
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
H
 
N
N
 
N
V
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
M
K
 
K
V
 
V
R
 
R
K
 
K
M
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
E
 
E
S
 
A
I
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
L
H
 
K
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
R
x
H
K
 
A
Y
|
Y
P
 
P
V
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
I
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
S
A
 
V
M
 
M
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
N
A
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
F
 
F
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
G
P
 
K
P
 
P
D
 
E
V
 
D
F
 
L
F
 
F
S
 
D
S
 
R
P
 
P
K
 
Q
H
 
H
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
L
 
L
R
 
S
E
 
K
I
 
V
L
 
F

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
61% identity, 100% coverage: 1:242/242 of query aligns to 1:242/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
M
 
L
A
 
Q
M
 
M
I
 
I
E
 
D
F
 
V
H
 
H
D
 
Q
V
 
L
H
 
K
K
 
K
W
 
S
Y
x
F
G
 
G
E
 
S
F
x
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
N
Q
 
V
K
 
H
V
 
I
E
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
F
I
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
D
I
 
F
Q
 
D
K
 
E
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
L
 
I
L
 
I
E
 
D
G
 
G
K
 
I
S
 
N
I
 
L
H
 
K
D
 
A
K
 
K
G
 
D
V
 
T
D
 
N
V
 
L
N
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
T
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
H
 
N
N
 
N
V
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
M
K
 
K
V
 
V
R
 
R
K
 
K
M
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
E
 
E
S
 
A
I
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
L
H
 
K
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
R
 
H
K
 
A
Y
 
Y
P
 
P
V
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
I
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
S
A
 
V
M
 
M
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
N
A
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
F
 
F
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
G
P
 
K
P
 
P
D
 
E
V
 
D
F
 
L
F
 
F
S
 
D
S
 
R
P
 
P
K
 
Q
H
 
H
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
L
 
L
R
 
S
E
 
K
I
 
V
L
 
F

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
61% identity, 100% coverage: 1:242/242 of query aligns to 1:242/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
M
 
L
A
 
Q
M
 
M
I
 
I
E
 
D
F
 
V
H
 
H
D
 
Q
V
 
L
H
 
K
K
 
K
W
 
S
Y
x
F
G
 
G
E
 
S
F
 
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
T
 
N
Q
 
V
K
 
H
V
 
I
E
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
F
I
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
L
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
D
I
 
F
Q
 
D
K
 
E
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
L
 
I
L
 
I
E
 
D
G
 
G
K
 
I
S
 
N
I
 
L
H
 
K
D
 
A
K
 
K
G
 
D
V
 
T
D
 
N
V
 
L
N
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
T
 
E
E
 
E
V
 
V
G
 
G
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
H
 
N
N
 
N
V
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
M
K
 
K
V
 
V
R
 
R
K
 
K
M
 
W
P
 
P
K
 
R
A
 
E
K
 
K
A
 
A
E
 
E
S
 
A
I
 
K
A
 
A
M
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
L
H
 
K
D
 
D
Q
 
K
A
 
A
R
x
H
K
 
A
Y
|
Y
P
 
P
V
 
D
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
I
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
S
A
 
V
M
 
M
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
N
A
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
L
F
 
F
M
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G
K
 
Y
V
 
I
I
 
I
E
 
E
E
 
E
A
 
G
P
 
K
P
 
P
D
 
E
V
 
D
F
 
L
F
 
F
S
 
D
S
 
R
P
 
P
K
 
Q
H
 
H
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
L
 
L
R
 
S
E
 
K
I
 
V
L
 
F

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
60% identity, 99% coverage: 3:242/242 of query aligns to 1:240/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
M
 
M
I
 
I
E
 
F
F
 
V
H
 
N
D
 
D
V
 
V
H
 
Y
K
 
K
W
 
N
Y
x
F
G
 
G
E
 
S
F
x
L
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
T
Q
 
L
K
 
K
V
 
V
E
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
V
V
 
V
I
 
I
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
L
I
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
I
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
|
E
P
 
E
I
 
P
Q
 
T
K
 
K
G
 
G
Q
 
E
I
 
V
L
 
F
L
 
I
E
 
D
G
 
G
K
 
V
S
 
K
I
 
I
H
 
N
D
 
N
K
 
G
G
 
K
V
 
V
D
 
N
V
 
I
N
 
N
E
 
K
L
 
V
R
 
R
T
 
Q
E
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
L
S
 
T
V
 
A
L
 
I
H
 
E
N
 
N
V
 
I
T
 
T
L
 
L
A
 
A
P
 
P
T
 
V
K
 
K
V
 
V
R
 
K
K
 
K
M
 
M
P
 
N
K
 
K
A
 
K
K
 
E
A
 
A
E
 
E
S
 
E
I
 
L
A
 
A
M
 
V
E
 
D
L
 
L
L
 
L
E
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
L
H
 
L
D
 
D
Q
 
K
A
 
K
R
 
D
K
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
V
 
I
E
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Q
 
Q
P
 
P
K
 
E
V
 
V
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
M
I
 
V
N
 
K
E
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
N
A
 
V
M
 
M
K
 
K
D
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
N
A
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
V
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
V
 
I
F
 
F
M
 
M
D
 
D
G
 
D
G
 
G
K
 
V
V
 
I
I
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
G
P
 
T
P
 
P
D
 
E
V
 
E
F
 
I
F
 
F
S
 
Y
S
 
R
P
 
A
K
 
K
H
 
N
E
 
E
R
 
R
T
 
T
Q
 
R
A
 
E
F
 
F
L
 
L
R
 
S
E
 
K
I
 
I
L
 
L

1b0uA Atp-binding subunit of the histidine permease from salmonella typhimurium (see paper)
51% identity, 96% coverage: 8:239/242 of query aligns to 7:250/258 of 1b0uA

query
sites
1b0uA
D
 
D
V
 
L
H
 
H
K
 
K
W
 
R
Y
|
Y
G
 
G
E
 
G
F
x
H
H
 
E
V
|
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
V
T
 
S
Q
 
L
K
 
Q
V
 
A
E
 
R
K
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
S
I
 
I
C
 
I
G
 
G
P
 
S
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
F
I
 
L
R
 
R
C
 
C
L
 
I
N
 
N
R
 
F
L
 
L
E
 
E
P
 
K
I
 
P
Q
 
S
K
 
E
G
 
G
Q
 
A
I
 
I
L
 
I
L
 
V
E
 
N
G
 
G
K
 
Q
S
 
N
I
 
I
H
 
N
-
 
L
-
 
V
-
 
R
D
 
D
K
 
K
G
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
-
 
V
V
 
A
D
 
D
V
 
K
N
 
N
E
 
Q
L
 
L
R
 
R
-
 
L
-
 
L
-
 
R
T
 
T
E
 
R
V
 
L
G
 
T
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
Y
 
W
P
 
S
H
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
L
H
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
M
L
 
E
A
 
A
P
 
P
T
 
I
K
 
Q
V
 
V
R
 
L
K
 
G
M
 
L
P
 
S
K
 
K
A
 
H
K
 
D
A
 
A
E
 
R
S
 
E
I
 
R
A
 
A
M
 
L
E
 
K
L
 
Y
L
 
L
E
 
A
R
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
I
H
 
D
D
 
E
Q
 
R
A
 
A
R
 
Q
-
 
G
K
 
K
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
E
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Q
 
E
P
 
P
K
 
D
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
M
 
L
I
 
V
N
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
R
A
 
I
M
 
M
K
 
Q
D
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
E
G
 
G
M
 
K
T
 
T
M
 
M
L
 
V
C
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
H
V
 
V
A
 
S
D
 
S
R
 
H
V
 
V
V
 
I
F
 
F
M
 
L
D
 
H
G
 
Q
G
 
G
K
 
K
V
 
I
I
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
G
P
 
D
P
 
P
D
 
E
V
 
Q
F
 
V
F
 
F
S
 
G
S
 
N
P
 
P
K
 
Q
H
 
S
E
 
P
R
 
R
T
 
L
Q
 
Q
A
 
Q
F
 
F
L
 
L
R
 
K

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
38% identity, 99% coverage: 3:242/242 of query aligns to 1:245/343 of P30750

query
sites
P30750
M
 
M
I
 
I
E
 
K
F
 
L
H
 
S
D
 
N
V
 
I
H
 
T
K
 
K
W
 
V
Y
 
F
G
 
H
E
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
F
 
I
H
 
Q
V
 
A
L
 
L
K
 
N
G
 
N
I
 
V
T
 
S
Q
 
L
K
 
H
V
 
V
E
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
L
 
Y
V
 
G
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
L
I
 
I
R
 
R
C
 
C
L
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
R
I
 
P
Q
 
T
K
 
E
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
V
E
 
D
G
 
G
K
 
Q
S
 
E
I
 
L
H
 
T
D
 
T
K
 
L
G
 
S
-
 
E
V
 
S
D
 
E
V
 
L
N
 
T
E
 
K
L
 
A
R
 
R
T
 
R
E
 
Q
V
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
Y
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
L
 
F
H
 
G
N
 
N
V
 
V
T
 
A
L
 
L
A
 
-
P
 
P
T
 
L
K
 
E
V
 
L
R
 
D
K
 
N
M
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
D
K
 
E
A
 
V
E
 
K
S
 
R
I
 
R
A
 
V
M
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
L
H
 
G
D
 
D
Q
 
K
A
 
H
R
 
D
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
V
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
Q
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
M
 
T
I
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
N
 
E
A
 
L
M
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
I
A
 
N
-
 
R
R
 
R
A
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
L
 
L
C
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
E
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
F
 
V
M
 
I
D
 
S
G
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
I
 
I
E
 
E
E
 
Q
A
 
D
P
 
T
P
 
V
D
 
S
V
 
E
F
 
V
F
 
F
S
 
S
S
 
H
P
 
P
K
 
K
H
 
T
E
 
P
R
 
L
T
 
A
Q
 
Q
A
 
K
F
 
F
L
 
I
R
 
Q
E
 
S
I
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
37% identity, 99% coverage: 3:242/242 of query aligns to 2:246/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
M
 
M
I
 
I
E
 
K
F
 
L
H
 
S
D
 
N
V
 
I
H
 
T
K
 
K
W
 
V
Y
x
F
G
 
H
E
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
F
 
I
H
 
Q
V
x
A
L
 
L
K
 
N
G
 
N
I
 
V
T
 
S
Q
 
L
K
 
H
V
 
V
E
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
L
 
Y
V
 
G
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
L
I
 
I
R
 
R
C
 
C
L
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
R
I
 
P
Q
 
T
K
 
E
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
V
E
 
D
G
 
G
K
 
Q
S
 
E
I
 
L
H
 
T
D
 
T
K
 
L
G
 
S
-
 
E
V
 
S
D
 
E
V
 
L
N
 
T
E
 
K
L
 
A
R
 
R
T
 
R
E
 
Q
V
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
Y
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
L
 
F
H
 
G
N
 
N
V
 
V
T
 
A
L
 
L
A
 
-
P
 
P
T
 
L
K
 
E
V
 
L
R
 
D
K
 
N
M
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
D
K
 
E
A
 
V
E
 
K
S
 
R
I
 
R
A
 
V
M
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
L
H
 
G
D
 
D
Q
 
K
A
 
H
R
 
D
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
V
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
Q
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
M
 
T
I
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
N
 
E
A
 
L
M
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
I
A
 
N
-
 
R
R
 
R
A
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
L
 
L
C
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
E
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
F
 
V
M
 
I
D
 
S
G
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
I
 
I
E
 
E
E
 
Q
A
 
D
P
 
T
P
 
V
D
 
S
V
 
E
F
 
V
F
 
F
S
 
S
S
 
H
P
 
P
K
 
K
H
 
T
E
 
P
R
 
L
T
 
A
Q
 
Q
A
 
K
F
 
F
L
 
I
R
 
Q
E
 
S
I
 
T
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
37% identity, 99% coverage: 3:242/242 of query aligns to 2:246/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
M
 
M
I
 
I
E
 
K
F
 
L
H
 
S
D
 
N
V
 
I
H
 
T
K
 
K
W
 
V
Y
x
F
G
 
H
E
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
F
 
I
H
 
Q
V
 
A
L
 
L
K
 
N
G
 
N
I
 
V
T
 
S
Q
 
L
K
 
H
V
 
V
E
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
L
 
Y
V
 
G
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
L
I
 
I
R
 
R
C
 
C
L
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
R
I
 
P
Q
 
T
K
 
E
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
V
E
 
D
G
 
G
K
 
Q
S
 
E
I
 
L
H
 
T
D
 
T
K
 
L
G
 
S
-
 
E
V
 
S
D
 
E
V
 
L
N
 
T
E
 
K
L
 
A
R
 
R
T
 
R
E
 
Q
V
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
Y
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
L
 
F
H
 
G
N
 
N
V
 
V
T
 
A
L
 
L
A
 
-
P
 
P
T
 
L
K
 
E
V
 
L
R
 
D
K
 
N
M
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
D
K
 
E
A
 
V
E
 
K
S
 
R
I
 
R
A
 
V
M
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
L
H
 
G
D
 
D
Q
 
K
A
 
H
R
 
D
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
V
 
S
E
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
Q
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
M
 
T
I
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
N
 
E
A
 
L
M
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
I
A
 
N
-
 
R
R
 
R
A
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
L
 
L
C
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
E
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
F
 
V
M
 
I
D
 
S
G
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
I
 
I
E
 
E
E
 
Q
A
 
D
P
 
T
P
 
V
D
 
S
V
 
E
F
 
V
F
 
F
S
 
S
S
 
H
P
 
P
K
 
K
H
 
T
E
 
P
R
 
L
T
 
A
Q
 
Q
A
 
K
F
 
F
L
 
I
R
 
Q
E
 
S
I
 
T
L
 
L

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
37% identity, 99% coverage: 3:242/242 of query aligns to 2:246/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
M
 
M
I
 
I
E
 
K
F
 
L
H
 
S
D
 
N
V
 
I
H
 
T
K
 
K
W
 
V
Y
x
F
G
 
H
E
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
T
F
x
I
H
 
Q
V
 
A
L
 
L
K
 
N
G
 
N
I
 
V
T
 
S
Q
 
L
K
 
H
V
 
V
E
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
L
 
Y
V
 
G
I
 
V
C
 
I
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
L
I
 
I
R
 
R
C
 
C
L
 
V
N
 
N
R
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
R
I
 
P
Q
 
T
K
 
E
G
 
G
Q
 
S
I
 
V
L
 
L
L
 
V
E
 
D
G
 
G
K
 
Q
S
 
E
I
 
L
H
 
T
D
 
T
K
 
L
G
 
S
-
 
E
V
 
S
D
 
E
V
 
L
N
 
T
E
 
K
L
 
A
R
 
R
T
 
R
E
 
Q
V
 
I
G
 
G
I
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
Y
 
L
P
 
S
H
 
S
L
 
R
S
 
T
V
 
V
L
 
F
H
 
G
N
 
N
V
 
V
T
 
A
L
 
L
A
 
-
P
 
P
T
 
L
K
 
E
V
 
L
R
 
D
K
 
N
M
 
T
P
 
P
K
 
K
A
 
D
K
 
E
A
 
V
E
 
K
S
 
R
I
 
R
A
 
V
M
 
T
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
S
R
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
L
H
 
G
D
 
D
Q
 
K
A
 
H
R
 
D
K
 
S
Y
 
Y
P
 
P
V
 
S
E
x
N
L
|
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
|
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
M
 
S
Q
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
M
 
T
I
 
T
N
 
R
E
 
S
V
 
I
L
 
L
N
 
E
A
 
L
M
 
L
K
 
K
D
 
D
L
 
I
A
 
N
-
 
R
R
 
R
A
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
L
 
L
C
 
L
V
 
I
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
G
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
E
 
R
V
 
I
A
 
C
D
 
D
R
 
C
V
 
V
V
 
A
F
 
V
M
 
I
D
 
S
G
 
N
G
 
G
K
 
E
V
 
L
I
 
I
E
 
E
E
 
Q
A
 
D
P
 
T
P
 
V
D
 
S
V
 
E
F
 
V
F
 
F
S
 
S
S
 
H
P
 
P
K
 
K
H
 
T
E
 
P
R
 
L
T
 
A
Q
 
Q
A
 
K
F
 
F
L
 
I
R
 
Q
E
 
S
I
 
T
L
 
L

2d62A Crystal structure of multiple sugar binding transport atp- binding protein
36% identity, 98% coverage: 1:238/242 of query aligns to 4:243/375 of 2d62A

query
sites
2d62A
M
 
M
A
 
A
M
 
E
I
 
V
E
 
K
F
 
L
H
 
I
D
 
N
V
 
I
H
 
W
K
 
K
W
 
R
Y
 
F
G
 
G
E
 
D
F
 
V
H
 
T
V
 
A
L
 
V
K
 
K
G
 
D
I
 
L
T
 
S
Q
 
L
K
 
E
V
 
I
E
 
K
K
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
F
L
 
L
V
 
V
I
 
L
C
 
L
G
 
G
P
|
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
F
 
T
I
 
L
R
 
R
C
 
M
L
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
E
 
E
P
 
E
I
 
P
Q
 
T
K
 
R
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
Y
L
 
I
E
 
E
G
 
D
K
 
N
S
 
L
I
 
V
H
 
A
D
 
D
-
 
P
-
 
E
K
 
K
G
 
G
V
 
V
D
 
F
V
 
V
N
 
P
E
 
P
L
 
K
R
 
E
T
 
R
E
 
D
V
 
V
G
 
A
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
F
 
Y
N
 
A
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
Y
H
 
D
N
 
N
V
 
I
T
 
A
L
 
F
A
 
-
P
 
P
T
 
L
K
 
K
V
 
L
R
 
R
K
 
K
M
 
V
P
 
P
K
 
K
A
 
Q
K
 
E
A
 
I
E
 
D
S
 
K
I
 
R
A
 
V
M
 
R
E
 
E
L
 
V
L
 
A
E
 
E
R
 
M
V
 
L
G
 
G
I
 
L
H
 
T
D
 
E
Q
 
L
A
 
L
R
 
N
K
 
R
Y
 
K
P
 
P
V
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
I
M
 
R
Q
 
R
P
 
P
K
 
K
V
 
V
M
 
F
L
 
L
F
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
K
M
 
L
I
 
R
N
 
V
E
 
K
V
 
M
L
 
R
N
 
A
A
 
E
M
 
L
K
 
K
D
 
K
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
A
 
Q
-
 
L
G
 
G
M
 
V
T
 
T
M
 
T
L
 
I
C
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
Q
G
 
V
F
 
E
A
 
A
R
 
M
E
 
T
V
 
M
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
V
 
A
F
 
V
M
 
M
D
 
N
G
 
K
G
 
G
K
 
E
V
 
L
I
 
Q
E
 
Q
E
 
V
A
 
G
P
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
E
F
 
V
F
 
Y
S
 
Y
S
 
K
P
 
P
K
 
V
H
 
N
E
 
T
R
 
F
T
 
V
Q
 
A
A
 
G
F
 
F
L
 
I

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
39% identity, 90% coverage: 1:219/242 of query aligns to 1:220/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
M
 
M
A
 
S
M
 
I
I
 
I
E
 
E
F
 
M
H
 
R
D
 
D
V
 
V
H
 
V
K
 
K
W
 
K
Y
|
Y
G
 
D
E
x
N
-
 
G
F
x
T
H
 
T
V
x
A
L
 
L
K
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
S
Q
 
V
K
 
S
V
 
V
E
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
F
L
 
A
V
 
Y
I
 
I
C
 
V
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
F
I
 
I
R
 
R
C
 
S
L
 
L
N
 
Y
R
 
R
L
 
E
E
 
V
P
 
K
I
 
I
Q
 
D
K
 
K
G
 
G
Q
 
S
I
 
L
L
 
S
L
 
V
E
 
A
G
 
G
K
 
F
S
 
N
-
 
L
I
 
V
H
 
K
D
 
I
K
 
K
G
 
K
V
 
K
D
 
D
V
 
V
N
 
P
E
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
R
E
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
D
F
 
Y
N
 
K
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
H
 
K
L
 
K
S
 
T
V
 
V
L
 
Y
H
 
E
N
 
N
V
 
I
T
 
A
L
 
Y
A
 
A
P
 
-
T
 
M
K
 
E
V
 
V
R
 
I
K
 
G
M
 
E
P
 
N
K
 
R
A
 
R
K
 
N
A
 
I
E
 
K
S
 
R
I
 
R
A
 
V
M
 
M
E
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
D
R
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
L
H
 
K
D
 
H
Q
 
K
A
 
V
R
 
R
K
 
S
Y
 
F
P
 
P
V
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
N
Q
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
I
F
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
D
M
 
N
I
 
S
N
 
W
E
 
E
V
 
I
L
 
M
N
 
N
A
 
L
M
 
L
K
 
E
D
 
R
L
 
I
A
 
N
R
 
L
A
 
Q
G
 
G
M
 
T
T
 
T
M
 
I
L
 
L
C
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
N
M
 
S
G
 
Q
F
 
I
A
 
V
R
 
N
E
 
T
V
 
L
A
 
R
D
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
I
F
 
A
M
 
I
D
 
E
G
 
N
G
 
G
K
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
R
E
 
D

1g291 Malk (see paper)
34% identity, 98% coverage: 1:238/242 of query aligns to 1:240/372 of 1g291

query
sites
1g291
M
 
M
A
 
A
M
 
G
I
 
V
E
 
R
F
 
L
H
 
V
D
 
D
V
 
V
H
 
W
K
 
K
W
 
V
Y
 
F
G
 
G
E
 
E
F
 
V
H
 
T
V
 
A
L
 
V
K
 
R
G
 
E
I
 
M
T
 
S
Q
 
L
K
 
E
V
 
V
E
 
K
K
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
F
L
 
M
V
 
I
I
 
L
C
 
L
G
 
G
P
|
P
S
|
S
G
|
G
S
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
S
x
T
F
 
T
I
 
L
R
 
R
C
 
M
L
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
E
 
E
P
 
E
I
 
P
Q
 
S
K
 
R
G
 
G
Q
 
Q
I
 
I
L
 
Y
L
 
I
E
 
G
G
 
D
K
 
K
S
 
L
I
 
V
H
 
A
D
|
D
-
 
P
-
x
E
K
|
K
G
 
G
V
 
I
D
 
F
V
 
V
N
 
P
E
 
P
L
x
K
R
x
D
T
 
R
E
 
D
V
 
I
G
 
A
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
F
 
Y
N
 
A
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
H
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
Y
H
 
D
N
 
N
V
 
I
T
 
A
L
 
F
A
 
-
P
 
P
T
 
L
K
 
K
V
 
L
R
 
R
K
 
K
M
 
V
P
 
P
K
 
R
A
 
Q
K
 
E
A
 
I
E
 
D
S
 
Q
I
 
R
A
 
V
M
 
R
E
 
E
L
 
V
L
 
A
E
 
E
R
 
L
V
 
L
G
 
G
I
 
L
H
 
T
D
 
E
Q
 
L
A
 
L
R
 
N
K
 
R
Y
 
K
P
 
P
V
 
R
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
L
A
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
R
Q
 
K
P
 
P
K
 
Q
V
 
V
M
 
F
L
 
L
F
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
K
M
 
L
I
 
R
N
 
V
E
 
R
V
 
M
L
 
R
N
 
A
A
 
E
M
 
L
K
 
K
D
 
K
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
A
 
Q
-
 
L
G
 
G
M
 
V
T
 
T
M
 
T
L
 
I
C
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
Q
G
 
V
F
 
E
A
 
A
R
 
M
E
 
T
V
 
M
A
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
I
V
 
A
F
 
V
M
 
M
D
 
N
G
 
R
G
 
G
K
 
V
V
 
L
I
 
Q
E
 
Q
E
 
V
A
 
G
P
 
S
P
 
P
D
 
D
V
 
E
F
 
V
F
x
Y
S
x
D
S
 
K
P
 
P
K
 
A
H
 
N
E
 
T
R
 
F
T
 
V
Q
 
A
A
 
G
F
 
F
L
 
I

Sites not aligning to the query:

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
39% identity, 90% coverage: 2:219/242 of query aligns to 2:220/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
A
 
S
M
 
I
I
 
I
E
 
E
F
 
M
H
 
R
D
 
D
V
 
V
H
 
V
K
 
K
W
 
K
Y
|
Y
G
 
D
E
 
N
-
x
G
F
x
T
H
 
T
V
x
A
L
 
L
K
 
R
G
 
G
I
 
V
T
 
S
Q
 
V
K
 
S
V
 
V
E
 
Q
K
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
F
L
 
A
V
 
Y
I
 
I
C
 
V
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
F
 
F
I
 
I
R
 
R
C
 
S
L
 
L
N
 
Y
R
 
R
L
 
E
E
 
V
P
 
K
I
 
I
Q
 
D
K
 
K
G
 
G
Q
 
S
I
 
L
L
 
S
L
 
V
E
 
A
G
 
G
K
 
F
S
 
N
-
 
L
I
 
V
H
 
K
D
 
I
K
 
K
G
 
K
V
 
K
D
 
D
V
 
V
N
 
P
E
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
R
E
 
S
V
 
V
G
 
G
I
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
D
F
 
Y
N
 
K
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
H
 
K
L
 
K
S
 
T
V
 
V
L
 
Y
H
 
E
N
 
N
V
 
I
T
 
A
L
 
Y
A
 
A
P
 
-
T
 
M
K
 
E
V
 
V
R
 
I
K
 
G
M
 
E
P
 
N
K
 
R
A
 
R
K
 
N
A
 
I
E
 
K
S
 
R
I
 
R
A
 
V
M
 
M
E
 
E
L
 
V
L
 
L
E
 
D
R
 
L
V
 
V
G
 
G
I
 
L
H
 
K
D
 
H
Q
 
K
A
 
V
R
 
R
K
 
S
Y
 
F
P
 
P
V
 
N
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
M
 
N
Q
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
I
F
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
D
M
 
N
I
 
S
N
 
W
E
 
E
V
 
I
L
 
M
N
 
N
A
 
L
M
 
L
K
 
E
D
 
R
L
 
I
A
 
N
R
 
L
A
 
Q
G
 
G
M
 
T
T
 
T
M
 
I
L
 
L
C
 
M
V
 
A
T
 
T
H
|
H
E
 
N
M
 
S
G
 
Q
F
 
I
A
 
V
R
 
N
E
 
T
V
 
L
A
 
R
D
 
H
R
 
R
V
 
V
V
 
I
F
 
A
M
 
I
D
 
E
G
 
N
G
 
G
K
 
R
V
 
V
I
 
V
E
 
R
E
 
D

P0AAH0 Phosphate import ATP-binding protein PstB; ABC phosphate transporter; Phosphate-transporting ATPase; EC 7.3.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
34% identity, 97% coverage: 4:238/242 of query aligns to 11:252/257 of P0AAH0

query
sites
P0AAH0
I
 
I
E
 
Q
F
 
V
H
 
R
D
 
N
V
 
L
H
 
N
K
 
F
W
 
Y
Y
 
Y
G
 
G
E
 
K
F
 
F
H
 
H
V
 
A
L
 
L
K
 
K
G
 
N
I
 
I
T
 
N
Q
 
L
K
 
D
V
 
I
E
 
A
K
 
K
G
 
N
E
 
Q
V
 
V
L
 
T
V
 
A
I
 
F
C
 
I
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
C
G
|
G
K
|
K
S
 
S
S
 
T
F
 
L
I
 
L
R
 
R
C
 
T
L
 
F
N
 
N
R
 
K
-
 
M
-
 
F
-
 
E
L
 
L
E
 
Y
P
 
P
I
 
E
Q
 
Q
K
 
R
-
 
A
-
 
E
G
 
G
Q
 
E
I
 
I
L
 
L
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
D
S
 
N
I
 
I
H
 
L
D
 
T
K
 
N
G
 
S
V
 
Q
D
 
D
V
 
I
N
 
A
E
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
A
E
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
K
F
 
P
N
 
T
L
 
P
Y
 
F
P
 
P
H
 
-
L
 
M
S
 
S
V
 
I
L
 
Y
H
 
D
N
 
N
V
 
I
T
 
A
L
 
F
A
 
G
P
 
V
T
 
R
K
 
L
V
 
F
R
 
E
K
 
K
M
 
L
P
 
S
K
 
R
A
 
A
K
 
D
A
 
M
E
 
D
S
 
E
I
 
R
A
 
V
M
 
Q
E
 
W
L
 
A
L
 
L
E
 
T
R
 
K
V
 
A
G
 
A
I
 
L
H
 
W
D
 
N
Q
 
E
A
 
T
R
 
K
-
 
D
-
 
K
-
 
L
-
 
H
K
 
Q
Y
 
S
P
 
G
V
 
Y
E
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
C
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
G
L
 
I
A
 
A
M
 
I
Q
 
R
P
 
P
K
 
E
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
C
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
I
M
 
S
I
 
T
N
 
G
E
 
R
V
 
I
L
 
E
N
 
E
A
 
L
M
 
I
K
 
T
D
 
E
L
 
L
A
 
-
R
 
K
A
 
Q
G
 
D
M
 
Y
T
 
T
M
 
V
L
 
V
C
 
I
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
N
M
 
M
G
 
Q
F
 
Q
A
 
A
R
 
A
E
 
R
V
 
C
A
 
S
D
 
D
R
 
H
V
 
T
V
 
A
F
 
F
M
 
M
D
 
Y
G
 
L
G
 
G
K
 
E
V
 
L
I
 
I
E
 
E
E
 
F
A
 
S
P
 
N
P
 
T
D
 
D
V
 
D
F
 
L
F
 
F
S
 
T
S
 
K
P
 
P
K
 
A
H
 
K
E
 
K
R
 
Q
T
 
T
Q
 
E
A
 
D
F
 
Y
L
 
I

Sites not aligning to the query:

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
34% identity, 99% coverage: 3:241/242 of query aligns to 17:251/378 of P69874

query
sites
P69874
M
 
L
I
 
V
E
 
Q
F
 
L
H
 
A
D
 
G
V
 
I
H
 
R
K
 
K
W
x
C
Y
x
F
G
 
D
E
 
G
F
 
K
H
 
E
V
 
V
L
 
I
K
 
P
G
 
Q
I
 
L
T
 
D
Q
 
L
K
 
T
V
 
I
E
 
N
K
 
N
G
 
G
E
 
E
V
x
F
L
 
L
V
 
T
I
 
L
C
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
x
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
S
 
T
F
 
V
I
x
L
R
 
R
C
 
L
L
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
L
E
 
E
P
 
T
I
 
V
Q
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
L
 
M
L
|
L
E
 
D
G
 
N
K
 
E
S
 
D
I
 
I
H
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
T
D
 
H
V
 
V
N
 
P
E
 
A
L
 
E
R
 
N
T
 
R
E
 
Y
V
 
V
G
 
N
I
 
T
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
F
 
Y
N
 
A
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H
L
 
M
S
 
T
V
 
V
L
 
F
H
 
E
N
 
N
V
 
V
T
 
A
L
 
F
A
 
G
P
 
-
T
 
L
K
 
R
V
 
M
R
 
Q
K
 
K
M
 
T
P
 
P
K
 
A
A
 
A
K
 
E
A
 
I
E
 
T
S
 
P
I
 
R
A
 
V
M
 
M
E
 
E
L
 
A
L
 
L
E
 
R
R
 
M
V
|
V
G
 
Q
I
 
L
H
 
E
D
 
T
Q
 
F
A
 
A
R
 
Q
K
 
R
Y
 
K
P
 
P
V
 
H
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
M
 
N
Q
 
K
P
 
P
K
 
R
V
 
L
M
 
L
L
 
L
F
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
T
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
E
 
K
M
 
L
I
 
R
N
 
K
E
 
Q
V
 
M
L
 
Q
N
 
N
A
 
E
M
 
L
K
 
K
D
 
A
L
 
L
A
 
Q
R
 
R
A
 
K
-
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
T
M
 
F
L
 
V
C
 
F
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
Q
G
 
E
F
 
E
A
 
A
R
 
L
E
 
T
V
 
M
A
 
S
D
 
D
R
 
R
V
 
I
V
 
V
F
 
V
M
 
M
D
 
R
G
 
D
G
 
G
K
 
R
V
 
I
I
 
E
E
 
Q
E
 
D
A
 
G
P
 
T
P
 
P
D
 
R
V
 
E
F
 
I
F
 
Y
S
 
E
S
 
E
P
 
P
K
 
K
H
 
N
E
 
L
R
 
F
T
 
V
Q
 
A
A
 
G
F
 
F
L
 
I
R
 
G
E
 
E
I
 
I

Sites not aligning to the query:

5xu1B Structure of a non-canonical abc transporter from streptococcus pneumoniae r6 (see paper)
38% identity, 87% coverage: 3:213/242 of query aligns to 3:218/226 of 5xu1B

query
sites
5xu1B
M
 
L
I
 
I
E
 
S
F
 
L
H
 
K
D
 
N
V
 
I
H
 
F
K
 
R
W
 
S
Y
 
Y
-
 
R
-
 
N
-
 
G
-
 
D
G
 
Q
E
 
E
F
 
L
H
 
Q
V
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
N
I
 
I
T
 
N
Q
 
L
K
 
E
V
 
V
E
 
N
K
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
F
L
 
V
V
 
A
I
 
I
C
 
M
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
 
T
F
 
L
I
 
M
R
 
N
C
 
T
L
 
I
N
 
G
R
 
M
L
 
L
E
 
D
P
 
T
I
 
P
Q
 
T
K
 
S
G
 
G
Q
 
E
I
 
Y
L
 
Y
L
 
L
E
 
E
G
 
G
K
 
Q
S
 
E
I
 
V
H
 
A
D
 
G
K
 
L
G
 
G
-
 
E
V
 
K
D
 
Q
V
 
L
N
 
A
E
 
K
L
 
V
R
 
R
T
 
N
E
 
Q
-
 
Q
V
 
I
G
 
G
I
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
N
 
F
L
 
L
Y
 
L
P
 
S
H
 
K
L
 
L
S
 
N
V
 
A
L
 
L
H
 
Q
N
 
N
V
 
V
T
 
E
L
 
L
A
 
-
P
 
P
T
 
L
K
 
I
V
 
Y
R
 
A
K
 
G
M
 
V
P
 
S
K
 
S
A
 
S
K
 
K
A
 
R
E
 
R
S
 
K
I
 
L
A
 
A
M
 
E
E
 
E
L
 
Y
L
 
L
E
 
D
R
 
K
V
 
V
G
 
E
I
 
L
H
 
T
D
 
E
Q
 
R
A
 
S
R
 
H
K
 
H
Y
 
L
P
 
P
V
 
S
E
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
M
 
N
Q
 
N
P
 
P
K
 
S
V
 
I
M
 
I
L
 
L
F
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
T
E
 
K
M
 
T
I
 
G
N
 
N
E
 
Q
V
 
I
L
 
M
N
 
Q
A
 
L
M
 
L
K
 
V
D
 
D
L
 
L
A
 
N
R
 
K
A
 
E
G
 
G
M
 
K
T
 
T
M
 
I
L
 
I
C
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
P
G
 
E
F
 
I
A
 
A
R
 
A
E
 
Y
V
 
A
A
 
K
D
 
R
R
 
Q
V
 
I
V
 
V
F
 
I
M
 
R
D
 
D
G
 
G

3d31A Modbc from methanosarcina acetivorans (see paper)
34% identity, 98% coverage: 3:238/242 of query aligns to 1:228/348 of 3d31A

query
sites
3d31A
M
 
M
I
 
I
E
 
E
F
 
I
H
 
E
D
 
S
V
 
L
H
 
S
K
 
R
W
 
K
Y
 
W
G
 
K
E
 
N
F
 
F
H
 
S
V
 
-
L
 
L
K
 
D
G
 
N
I
 
L
T
 
S
Q
 
L
K
 
K
V
 
V
E
 
E
K
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
Y
L
 
F
V
 
V
I
 
I
C
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
T
G
 
G
S
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
S
 
L
F
 
F
I
 
L
R
 
E
C
 
L
L
 
I
N
 
A
R
 
G
L
 
F
E
 
H
P
 
V
I
 
P
Q
 
D
K
 
S
G
 
G
Q
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
E
 
D
G
 
G
K
 
K
S
 
D
I
 
V
H
 
-
D
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
T
D
 
D
V
 
L
N
 
S
E
 
P
L
 
E
R
 
K
T
 
H
E
 
D
V
 
I
G
 
A
I
 
F
V
 
V
F
 
Y
Q
 
Q
Q
 
N
F
 
Y
N
 
S
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
H
 
H