SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO353_04045 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_04045 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
47% identity, 99% coverage: 2:250/252 of query aligns to 4:242/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
K
 
R
L
 
L
T
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
 
A
Q
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
S
 
E
M
 
A
A
 
A
E
 
R
Y
 
V
F
 
F
A
 
M
A
 
K
K
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
A
D
|
D
L
x
F
N
 
N
Q
 
E
E
 
A
K
 
A
L
 
G
D
 
K
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
C
 
N
K
 
P
A
 
G
A
 
V
G
 
-
V
 
V
E
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
C
x
V
N
x
D
V
|
V
A
 
S
N
 
D
E
 
R
E
 
E
Q
 
S
V
 
V
T
 
H
H
 
R
M
 
L
V
 
V
A
 
E
Q
 
N
V
 
V
A
 
A
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
K
I
 
I
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
|
D
G
 
S
L
 
M
L
 
L
I
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
T
 
S
K
|
K
M
 
M
S
 
T
L
 
V
A
 
D
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
A
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
H
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
P
K
 
Y
M
 
M
I
 
A
E
 
E
L
 
-
K
 
Q
T
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
T
-
 
G
R
 
T
A
 
Y
G
 
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
Q
|
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
M
T
 
T
V
 
K
T
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
|
F
I
x
T
E
 
E
T
|
T
E
 
A
M
|
M
T
 
V
L
 
A
S
 
E
M
 
V
K
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
V
L
 
I
E
 
E
K
|
K
M
 
M
T
 
K
S
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
-
A
 
-
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
F
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
H
E
 
E
N
 
S
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
V
T
 
N
G
 
G
R
 
H
I
 
V
L
 
L
E
 
H
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I

P73826 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
40% identity, 98% coverage: 1:248/252 of query aligns to 4:236/240 of P73826

query
sites
P73826
M
 
L
K
 
G
L
 
L
T
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
N
Q
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
A
S
 
A
M
 
I
A
 
V
E
 
K
Y
 
L
F
 
L
A
 
Q
A
 
E
K
 
M
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
T
D
 
D
L
 
L
N
 
-
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
A
C
 
T
K
 
D
A
 
G
A
 
G
G
 
N
V
 
T
E
 
E
A
 
A
R
 
L
A
 
G
Y
 
V
L
 
V
C
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
T
N
 
D
E
 
L
E
 
E
Q
 
S
V
 
M
T
 
T
H
 
A
M
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
A
 
T
E
 
D
D
 
K
F
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
H
 
Y
G
 
G
L
 
V
I
 
V
N
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
N
L
 
F
L
 
F
I
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
T
 
P
K
 
K
M
 
L
S
 
T
L
 
P
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
L
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
A
L
 
Y
C
 
S
T
 
I
R
 
K
E
 
P
V
 
F
A
 
I
A
 
E
K
 
G
M
 
M
I
 
Y
E
 
E
L
 
R
K
 
K
T
 
A
G
 
G
G
 
-
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
A
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
S
-
 
G
R
 
E
A
 
R
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
M
T
 
M
V
 
K
T
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
A
A
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
E
 
E
M
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
A
M
 
I
K
 
R
P
 
E
E
 
D
A
 
I
L
 
R
E
 
E
K
 
K
M
 
I
T
 
T
S
 
K
G
 
E
I
 
I
P
 
P
L
 
F
K
 
R
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
W
S
 
A
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
L
E
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
N
 
S
D
 
S
Y
 
Y
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
V
L
 
L
E
 
R
M
 
V
D
 
N
G
 
G

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
43% identity, 98% coverage: 3:250/252 of query aligns to 4:244/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
T
 
T
D
 
A
K
 
Q
V
 
V
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
x
A
C
 
S
Q
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
K
S
 
A
M
 
T
A
 
A
E
 
L
Y
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
T
G
 
G
A
 
M
K
 
K
L
 
V
A
 
-
L
 
V
V
 
V
D
 
N
L
 
Y
N
 
A
Q
 
Q
E
 
S
K
 
S
L
 
T
-
 
A
-
 
A
D
 
D
Q
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
E
C
 
I
K
 
I
A
 
A
A
 
N
G
 
G
V
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
I
A
 
A
Y
 
V
L
 
Q
C
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
N
 
N
E
 
A
E
 
D
Q
 
E
V
 
V
T
 
D
H
 
Q
M
 
L
V
 
I
A
 
K
Q
 
T
V
 
T
A
 
L
E
 
D
D
 
K
F
 
F
G
 
S
A
 
R
I
 
I
H
 
D
G
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
L
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
L
A
 
E
Q
 
D
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
K
K
 
L
M
 
M
I
 
L
E
 
K
L
 
Q
K
 
K
T
 
S
G
 
-
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
T
S
 
S
I
 
V
S
 
A
-
 
G
R
 
M
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
x
P
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
F
T
 
T
V
 
K
T
 
T
W
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
|
F
I
 
I
E
 
A
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
E
S
 
N
M
 
L
K
x
N
P
 
A
E
 
E
A
 
P
L
 
I
E
 
L
K
 
Q
M
 
F
T
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
A
R
 
R
M
 
Y
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
G
S
 
T
A
 
I
A
 
R
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
T
N
 
D
D
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
F
E
 
N
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
40% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:244/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
M
 
M
K
 
K
L
 
M
T
 
T
D
 
-
K
 
K
V
 
S
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
C
 
S
Q
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
S
 
S
M
 
I
A
 
A
E
 
L
Y
 
Q
F
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
E
G
 
G
A
 
Y
K
 
N
L
 
V
A
 
A
L
 
V
-
 
N
V
 
Y
D
 
A
L
 
G
N
 
S
Q
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
A
D
 
E
Q
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
E
C
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
D
A
 
S
R
 
F
A
 
A
Y
 
I
L
 
Q
C
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
N
 
D
E
 
A
E
 
D
Q
 
E
V
 
V
T
 
K
H
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
K
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
S
D
 
Q
F
 
F
G
 
G
A
 
S
I
 
L
H
 
D
G
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
Q
E
 
E
M
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
T
 
I
R
 
Q
E
 
K
V
 
A
A
 
T
A
 
P
K
 
Q
M
 
M
I
 
L
E
 
R
L
 
Q
K
 
R
T
 
S
G
 
-
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
R
 
G
A
 
A
-
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
K
T
 
S
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
D
S
 
A
M
 
L
K
 
S
P
 
D
E
 
E
A
 
L
L
 
K
E
 
E
K
 
Q
M
 
M
T
 
L
S
 
T
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
T
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
K
-
 
A
D
 
K
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
H
M
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
45% identity, 98% coverage: 6:252/252 of query aligns to 2:251/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
K
 
R
V
 
V
I
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
 
A
Q
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
S
 
A
M
 
T
A
 
A
E
 
L
Y
 
E
F
 
F
A
 
A
A
 
Q
K
 
A
G
 
G
A
 
Y
K
 
H
L
 
V
A
 
V
L
 
A
V
 
W
D
|
D
L
|
L
N
 
A
Q
 
E
E
 
E
K
 
A
L
 
G
D
 
A
Q
 
A
A
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
E
C
 
I
K
 
A
A
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
G
E
 
S
A
 
A
R
 
D
A
 
F
Y
 
A
L
 
R
C
x
V
N
x
D
V
|
V
A
 
S
N
 
A
E
 
A
E
 
E
Q
 
S
V
 
V
T
 
E
H
 
A
M
 
A
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
A
 
I
E
 
A
D
 
E
F
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
V
H
 
D
G
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
L
R
 
H
D
 
D
G
 
G
L
 
Q
L
 
L
I
 
V
K
 
K
V
 
V
K
 
K
D
 
G
G
 
G
E
 
E
M
 
V
T
 
V
K
 
K
-
 
K
M
 
M
S
 
A
L
 
E
A
 
A
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
P
K
 
H
M
 
M
I
 
I
E
 
A
L
 
A
K
 
K
T
 
Y
G
 
-
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
L
N
 
N
I
 
A
S
 
S
S
|
S
-
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
Y
G
 
G
N
 
N
V
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
M
T
 
T
V
 
K
T
 
V
W
 
W
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
E
 
E
M
 
M
T
 
V
L
 
Q
S
 
Q
M
 
M
K
 
P
P
 
E
E
 
R
A
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
A
M
 
M
T
 
V
S
 
A
G
 
R
I
 
T
P
 
P
L
 
V
K
 
G
R
 
R
M
 
I
G
 
G
K
 
D
P
 
P
E
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
R
S
 
-
A
 
-
A
 
A
Y
 
Y
I
 
L
F
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
S
-
 
E
E
 
E
N
 
S
D
 
G
Y
 
F
Y
 
I
T
 
S
G
 
G
R
 
T
I
 
T
L
 
L
E
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
V
I
 
V

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
38% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 4:245/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
M
 
M
K
 
K
L
 
L
T
 
A
D
 
S
K
 
K
V
 
T
I
 
A
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
 
A
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
F
S
 
G
M
 
I
A
 
A
E
 
Q
Y
 
V
F
 
L
A
 
A
A
 
R
K
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
L
 
V
A
 
I
L
 
I
V
 
A
D
|
D
L
x
R
N
 
D
Q
 
A
E
 
H
K
 
G
L
 
-
D
 
E
Q
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
S
C
 
L
K
 
R
A
 
E
A
 
S
G
 
G
V
 
A
E
 
Q
A
 
A
R
 
L
A
 
F
Y
 
I
L
 
S
C
|
C
N
 
N
V
x
I
A
 
A
N
 
E
E
 
K
E
 
T
Q
 
Q
V
 
V
T
 
E
H
 
A
M
 
L
V
 
F
A
 
S
Q
 
Q
V
 
A
A
 
E
E
 
E
D
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
P
I
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
A
L
 
M
L
 
L
I
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
T
 
H
K
 
K
M
 
L
S
 
T
L
 
E
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
T
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
M
R
 
Q
E
 
Q
V
 
A
A
 
A
A
 
I
K
 
R
M
 
M
I
 
R
E
 
E
L
 
-
K
 
R
T
 
G
G
 
A
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
A
S
 
S
R
 
W
A
 
L
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
A
 
M
T
 
T
V
 
K
T
 
T
W
 
A
A
 
C
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
H
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
D
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
|
T
L
 
R
S
 
G
M
 
V
K
 
P
P
 
E
E
 
N
A
 
V
L
 
W
E
 
Q
K
 
I
M
 
M
T
 
V
S
 
S
G
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
Y
M
 
A
G
 
G
K
 
E
P
 
A
E
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
H
 
E
S
 
C
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
G
-
 
A
-
 
R
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
V
L
 
I
E
 
N
M
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
40% identity, 97% coverage: 6:250/252 of query aligns to 2:237/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
V
 
S
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
S
 
S
M
 
I
A
 
A
E
 
L
Y
 
Q
F
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
E
G
 
G
A
 
Y
K
 
N
L
 
V
A
 
A
L
 
V
-
x
N
V
x
Y
D
x
A
L
x
G
N
x
S
Q
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
A
D
 
E
Q
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
E
C
 
I
K
 
K
A
 
A
A
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
D
A
 
S
R
 
F
A
 
A
Y
 
I
L
 
Q
C
x
A
N
|
N
V
|
V
A
 
A
N
 
D
E
 
A
E
 
D
Q
 
E
V
 
V
T
 
K
H
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
K
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
S
D
 
Q
F
 
F
G
 
G
A
 
S
I
 
L
H
 
D
G
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
Q
E
 
E
M
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
x
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
T
 
I
R
 
Q
E
 
K
V
 
A
A
 
T
A
 
P
K
 
Q
M
 
M
I
 
L
E
 
R
L
 
Q
K
 
R
T
 
S
G
 
-
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
R
 
G
A
 
A
-
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
K
T
 
S
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
E
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
D
S
 
E
M
 
L
K
 
K
P
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
K
 
Q
M
 
M
T
 
L
S
 
T
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
T
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
K
-
 
A
D
 
K
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
H
M
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
39% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
K
 
T
L
 
L
T
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
C
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
S
 
D
M
 
I
A
 
A
E
 
I
Y
 
N
F
 
L
A
 
A
A
 
K
K
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
L
 
I
A
 
F
L
 
F
-
x
N
V
x
Y
D
x
N
L
x
G
N
x
S
Q
 
P
E
 
E
K
 
A
L
 
A
D
 
E
Q
 
E
A
 
T
V
 
A
A
 
K
A
 
L
C
 
V
K
 
A
A
 
E
A
 
H
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
V
R
 
E
A
 
A
Y
 
M
L
 
K
C
 
A
N
|
N
V
|
V
A
 
A
N
 
I
E
 
A
E
 
E
Q
 
D
V
 
V
T
 
D
H
 
A
M
 
F
V
 
F
A
 
K
Q
 
Q
V
 
A
A
 
I
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
D
E
 
E
M
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
D
A
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
R
K
 
T
M
 
M
I
 
M
E
 
K
L
 
Q
K
 
R
T
 
A
G
 
G
G
 
K
A
 
I
I
 
I
V
 
N
N
 
M
I
 
A
S
|
S
S
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
I
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
K
T
 
T
W
 
T
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
P
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
T
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
D
S
 
K
M
 
L
K
 
D
P
 
E
E
 
K
A
 
T
L
 
K
E
 
E
K
 
A
M
 
M
T
 
L
S
 
A
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
A
M
 
Y
G
 
G
K
 
T
P
 
T
E
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
A
A
 
V
A
 
L
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
A
-
 
S
D
 
K
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
E
 
S
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
41% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 2:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
K
 
K
L
 
L
T
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
C
 
A
Q
x
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
Q
S
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
L
Y
 
A
F
 
Y
A
 
A
A
 
E
K
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
A
V
 
G
D
|
D
L
|
L
N
 
G
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
D
Q
 
L
A
 
T
V
 
Y
A
 
S
A
 
H
C
 
P
K
 
N
A
 
V
A
 
E
G
 
G
V
 
M
E
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
Y
L
|
L
C
 
-
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
D
E
 
V
E
 
T
Q
 
G
V
 
V
T
 
E
H
 
K
M
 
F
V
 
Y
A
 
Q
Q
 
S
V
 
V
A
 
I
E
 
D
D
 
K
F
 
Y
G
 
G
A
 
K
I
 
I
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
A
L
 
M
L
 
-
I
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
T
T
 
R
K
 
K
M
 
M
S
 
T
L
 
E
A
 
A
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
D
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
P
K
 
Q
M
 
M
I
 
-
E
 
Q
L
 
T
K
 
N
T
 
G
G
 
Y
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
R
 
G
A
 
V
-
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
I
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
M
T
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
L
H
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
I
|
I
E
 
M
T
|
T
E
 
D
M
 
I
T
 
L
L
 
K
S
 
T
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
D
A
 
L
L
 
L
E
 
D
K
 
K
M
 
F
T
 
A
S
 
A
G
 
L
I
 
T
P
 
M
L
 
L
K
 
N
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
K
S
 
V
A
 
A
A
 
L
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
S
Y
 
Y
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
N
M
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
R
I
 
L

4cqmF Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
39% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 6:239/241 of 4cqmF

query
sites
4cqmF
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
C
I
 
A
I
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
C
 
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
S
 
A
M
 
V
A
 
A
E
 
Q
Y
 
L
F
 
M
A
 
A
A
 
R
K
 
K
G
 
G
A
 
Y
K
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
I
D
x
A
L
x
R
N
|
N
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
L
D
 
E
Q
 
G
A
 
A
V
 
K
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
G
A
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
G
E
 
D
A
 
H
R
 
L
A
 
A
Y
 
F
L
 
S
C
 
C
N
x
D
V
|
V
A
 
A
N
 
K
E
 
E
E
 
H
Q
 
D
V
 
V
T
 
Q
H
 
N
M
 
T
V
 
F
A
 
E
Q
 
E
V
 
L
A
 
E
E
 
K
D
 
H
F
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
V
H
 
N
G
 
F
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
L
I
 
V
K
 
R
V
 
T
K
 
K
D
 
T
G
 
E
E
 
D
M
 
M
T
 
V
K
 
S
M
 
Q
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
L
D
 
H
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
L
G
 
G
V
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
T
 
C
R
 
K
E
 
A
V
 
A
A
 
M
A
 
R
K
 
T
M
 
M
I
 
I
E
 
Q
L
 
-
K
 
Q
T
 
Q
G
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
I
 
I
-
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
S
G
 
G
Q
|
Q
T
 
S
N
 
V
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
V
A
 
G
A
 
F
T
 
S
V
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R
H
 
K
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
N
G
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
x
V
E
 
H
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
L
 
K
S
 
D
M
 
L
K
 
K
P
 
E
E
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
K
K
 
K
M
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
E
P
 
T
E
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
H
S
 
A
A
 
V
A
 
V
Y
 
F
I
 
L
F
 
L
E
 
E
N
 
S
D
 
P
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
H
I
 
V
L
 
L
E
 
V
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
Q
I
 
L

Q8N4T8 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase beta subunit; KAR beta subunit; Carbonyl reductase family member 4; CBR4; Quinone reductase CBR4; Short chain dehydrogenase/reductase family 45C member 1; EC 1.1.1.100; EC 1.6.5.10 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
39% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 2:235/237 of Q8N4T8

query
sites
Q8N4T8
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
C
I
 
A
I
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
C
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
S
 
A
M
 
V
A
 
A
E
 
Q
Y
 
L
F
 
M
A
 
A
A
 
R
K
 
K
G
 
G
A
 
Y
K
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
I
D
 
A
L
x
R
N
|
N
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
L
D
 
E
Q
 
G
A
 
A
V
 
K
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
G
A
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
G
E
 
D
A
 
H
R
 
L
A
 
A
Y
 
F
L
 
S
C
 
C
N
x
D
V
 
V
A
 
A
N
 
K
E
 
E
E
 
H
Q
 
D
V
 
V
T
 
Q
H
 
N
M
 
T
V
 
F
A
 
E
Q
 
E
V
x
L
A
 
E
E
 
K
D
 
H
F
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
V
H
 
N
G
 
F
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
L
I
 
V
K
 
R
V
 
T
K
 
K
D
 
T
G
 
E
E
 
D
M
 
M
T
 
V
K
 
S
M
 
Q
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
-
A
 
-
V
 
-
I
 
L
D
 
H
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
L
G
 
G
V
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
T
 
C
R
 
K
E
 
A
V
 
A
A
 
M
A
 
R
K
 
T
M
 
M
I
 
I
E
 
Q
L
 
-
K
 
Q
T
 
Q
G
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
V
S
 
G
S
|
S
I
 
I
-
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
K
G
 
G
N
 
N
V
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
S
N
 
V
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
V
A
 
G
A
 
F
T
 
S
V
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
|
R
H
x
K
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
N
G
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
x
V
E
x
H
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
K
S
 
D
M
 
L
K
 
K
P
 
E
E
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
K
K
 
K
M
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
E
P
 
T
E
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
H
S
 
A
A
 
V
A
 
V
Y
 
F
I
 
L
F
 
L
E
 
E
N
 
S
D
 
P
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
H
I
 
V
L
 
L
E
 
V
M
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
Q
I
 
L

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
35% identity, 97% coverage: 6:250/252 of query aligns to 5:240/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
K
 
K
V
 
I
I
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
x
S
Q
x
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
S
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
E
Y
 
T
F
 
F
A
 
V
A
 
A
K
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
-
L
 
I
V
 
G
D
 
T
L
 
A
N
x
T
Q
 
S
E
 
E
K
 
S
L
 
G
D
 
A
Q
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
G
C
 
Y
K
 
-
A
 
-
A
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
N
A
 
G
R
 
K
A
 
G
Y
 
F
L
 
M
C
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
K
N
 
D
E
 
A
E
 
Q
Q
 
S
V
 
I
T
 
D
H
 
S
M
 
V
V
 
L
A
 
A
Q
 
S
V
 
I
A
 
R
E
 
A
D
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
E
I
 
I
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
D
E
 
E
M
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
E
A
 
D
V
 
I
I
 
L
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
V
F
 
F
L
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
M
A
 
C
K
 
A
M
 
M
I
 
M
E
 
K
L
 
K
K
 
R
T
 
F
G
 
G
G
 
R
A
 
I
I
 
I
V
 
T
N
 
I
I
 
G
S
 
S
S
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
I
A
 
G
A
 
F
T
 
S
V
 
K
T
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
R
S
 
A
M
 
L
K
 
T
P
 
D
E
 
D
A
 
Q
L
 
R
E
 
A
K
 
G
M
 
I
T
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
A
K
 
N
R
 
R
M
 
P
G
 
G
K
 
D
P
 
A
E
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
S
S
 
A
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
E
-
 
A
-
 
G
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
T
L
 
L
E
 
H
M
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
40% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:237/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
M
 
L
K
 
P
L
 
L
T
 
T
D
 
D
K
 
R
V
 
I
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
S
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
L
Y
 
E
F
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
N
D
 
Y
L
x
A
N
x
S
Q
x
S
E
 
A
K
 
G
L
 
A
D
 
A
Q
 
D
A
 
E
V
 
V
A
 
V
A
 
A
C
 
A
K
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
A
V
 
G
E
 
G
A
 
E
R
 
A
A
 
F
Y
 
A
L
 
V
-
 
K
C
x
A
N
x
D
V
|
V
A
 
S
N
 
Q
E
 
E
E
 
S
Q
 
E
V
 
V
T
 
E
H
 
A
M
 
L
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
A
 
I
E
 
E
D
 
R
F
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
L
H
 
D
G
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
T
L
 
L
L
 
L
I
 
L
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
R
G
 
D
E
 
D
M
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
Q
A
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
V
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
S
R
 
R
E
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
K
K
 
I
M
 
M
I
 
L
E
 
K
L
 
Q
K
 
R
T
 
S
G
 
G
G
 
-
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
E
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
P
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
K
T
 
T
W
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
L
 
-
S
 
-
M
 
-
K
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
S
M
 
L
T
 
L
S
 
E
G
 
V
I
 
I
P
 
P
L
 
L
K
 
G
R
 
R
M
 
Y
G
 
G
K
 
E
P
 
A
E
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
G
S
 
V
A
 
V
A
 
R
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
A
N
 
D
D
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
V
L
 
I
E
 
N
M
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
36% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 4:244/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
K
 
N
L
 
L
T
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
x
S
Q
x
R
G
 
G
L
x
I
G
 
G
R
 
K
S
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
-
L
 
I
V
 
G
D
 
T
L
 
A
N
x
T
Q
 
S
E
 
E
K
 
S
L
 
G
D
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
-
C
 
-
K
 
D
A
 
Y
A
 
L
G
 
G
V
 
D
E
 
N
A
 
G
R
 
K
A
 
G
Y
 
M
L
 
A
C
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
N
E
 
P
E
 
E
Q
 
S
V
 
I
T
 
E
H
 
A
M
 
V
V
 
L
A
 
K
Q
 
A
V
 
I
A
 
T
E
 
D
D
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
G
I
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
E
E
 
E
M
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
S
A
 
D
V
 
I
I
 
M
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
L
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
R
K
 
G
M
 
M
I
 
M
E
 
K
L
 
-
K
 
K
T
 
R
G
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
F
T
 
T
V
 
K
T
 
S
W
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
L
 
K
S
 
A
M
 
L
K
 
N
P
 
D
E
 
E
A
 
Q
L
 
R
E
 
T
K
 
A
M
 
T
T
 
L
S
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
S
S
 
A
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
-
 
S
-
 
P
E
 
E
N
 
A
D
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
T
L
 
L
E
 
H
M
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
37% identity, 99% coverage: 1:249/252 of query aligns to 1:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
M
|
M
K
 
G
L
 
I
T
 
Q
D
 
N
K
 
R
V
 
V
I
 
A
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
S
C
 
A
Q
x
S
G
 
G
L
 
M
G
 
G
R
 
K
S
 
Q
M
 
T
A
 
A
E
 
L
Y
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
E
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
A
L
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
N
D
|
D
L
 
I
N
 
D
Q
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
V
D
 
R
Q
 
A
A
 
T
V
 
V
A
 
D
A
 
E
C
 
F
K
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
H
E
 
R
A
 
V
R
 
L
A
 
G
Y
 
A
L
 
V
C
 
A
N
x
D
V
x
I
A
 
G
N
 
N
E
 
K
E
 
A
Q
 
A
V
 
V
T
 
D
H
 
G
M
 
M
V
 
V
A
 
K
Q
 
Q
V
 
T
A
 
I
E
 
D
D
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
I
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
M
L
 
E
R
 
R
D
 
A
G
 
G
L
 
A
L
 
L
I
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
T
 
R
K
 
K
M
 
L
S
 
S
L
 
E
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
H
A
 
G
K
 
H
M
 
M
I
 
V
E
 
E
L
 
N
K
 
K
T
 
H
G
 
G
G
 
-
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
R
S
 
A
R
 
W
A
 
L
G
 
G
N
 
G
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
A
 
M
T
 
T
V
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
I
 
I
E
 
H
T
 
T
E
 
P
M
 
M
T
 
W
L
 
D
S
 
E
M
 
L
K
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
D
L
 
Q
E
 
Q
K
 
F
M
 
L
T
 
L
S
 
S
G
 
R
I
 
Q
P
 
P
L
 
T
K
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
T
A
 
L
A
 
L
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
D
N
 
D
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
F
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
V
L
 
L
E
 
Y
M
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
35% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:241/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
M
 
M
K
 
S
L
 
F
T
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
I
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
S
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
E
Y
 
T
F
 
L
A
 
V
A
 
A
K
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
-
L
 
I
V
 
G
D
 
T
L
 
A
N
x
T
Q
 
S
E
 
E
K
 
S
L
 
G
D
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
-
C
 
-
K
 
D
A
 
Y
A
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
N
A
 
G
R
 
K
A
 
G
Y
 
L
L
 
M
C
x
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
D
E
 
P
E
 
A
Q
 
S
V
 
I
T
 
E
H
 
S
M
 
V
V
 
L
A
 
E
Q
 
N
V
 
V
A
 
R
E
 
A
D
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
E
I
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
D
E
 
E
M
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
N
A
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
L
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
M
A
 
R
K
 
A
M
 
M
I
 
M
E
 
K
L
 
K
K
 
R
T
 
H
G
 
G
G
 
R
A
 
I
I
 
I
V
 
T
N
 
I
I
 
G
S
|
S
S
 
V
I
 
V
S
 
G
R
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
I
A
 
G
A
 
F
T
 
S
V
 
K
T
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
V
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
R
S
 
A
M
 
L
K
 
T
P
 
D
E
 
E
A
 
Q
L
 
R
E
 
A
K
 
G
M
 
T
T
 
L
S
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
T
P
 
P
E
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
S
S
 
A
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
E
-
 
A
-
 
S
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
T
L
 
L
E
 
H
M
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
37% identity, 98% coverage: 3:249/252 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
L
 
I
T
 
Q
D
 
N
K
 
R
V
 
V
I
 
A
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
C
 
A
Q
 
S
G
 
G
L
x
M
G
 
G
R
 
K
S
 
Q
M
 
T
A
 
A
E
 
L
Y
 
R
F
 
F
A
 
A
A
 
E
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
A
L
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
N
D
|
D
L
x
I
N
 
D
Q
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
V
D
 
R
Q
 
A
A
 
T
V
 
V
A
 
D
A
 
E
C
 
F
K
 
S
A
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
H
E
 
R
A
 
V
R
 
L
A
 
G
Y
 
A
L
 
V
C
 
A
N
 
D
V
x
I
A
 
G
N
 
N
E
 
K
E
 
A
Q
 
A
V
 
V
T
 
D
H
 
G
M
 
M
V
 
V
A
 
K
Q
 
Q
V
 
T
A
 
I
E
 
D
D
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
I
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
M
L
 
E
R
 
R
D
 
A
G
 
G
L
 
A
L
 
L
I
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
T
 
R
K
 
K
M
 
L
S
 
S
L
 
E
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
V
V
 
T
I
 
I
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
H
A
 
G
K
 
H
M
 
M
I
 
V
E
 
E
L
 
N
K
 
K
T
 
H
G
 
G
G
 
-
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
I
 
R
S
 
A
R
 
W
A
 
L
G
 
G
N
 
G
V
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
P
Y
|
Y
S
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
A
 
M
T
 
T
V
 
R
T
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
H
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
C
I
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
L
I
|
I
E
 
H
T
 
T
E
 
P
M
 
M
T
 
W
L
 
D
S
 
E
M
 
L
K
 
P
P
 
E
E
 
K
A
 
D
L
 
Q
E
 
Q
K
 
F
M
 
L
T
 
L
S
 
S
G
 
R
I
 
Q
P
 
P
L
 
T
K
 
G
R
 
K
M
 
L
G
 
G
K
 
E
P
 
P
E
 
D
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
T
A
 
L
A
 
L
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
D
N
 
D
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
F
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
V
L
 
L
E
 
Y
M
 
V
D
 
C
G
 
G
G
 
G

4cqlI Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:250/252 of query aligns to 5:249/251 of 4cqlI

query
sites
4cqlI
K
 
R
L
 
L
T
 
R
D
 
S
K
 
A
V
 
L
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
C
 
G
Q
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
S
 
A
M
 
V
A
 
S
E
 
V
Y
 
R
F
 
L
A
 
A
A
 
G
K
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
L
 
V
A
 
A
L
 
A
V
 
C
D
|
D
L
|
L
N
 
D
Q
 
R
E
 
A
K
 
A
L
 
A
D
 
Q
Q
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
R
A
 
L
C
 
L
K
 
G
A
 
G
A
 
P
G
 
G
V
 
S
E
 
N
A
 
H
R
 
A
A
 
A
Y
 
F
L
 
Q
C
x
A
N
x
D
V
|
V
A
 
S
N
 
E
E
 
A
E
 
R
Q
 
A
V
 
A
T
 
R
H
 
C
M
 
L
V
 
L
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
A
 
Q
E
 
A
D
 
C
F
 
F
G
 
S
A
 
R
I
 
P
H
 
P
G
 
S
L
 
V
I
 
V
-
 
V
N
 
S
N
x
C
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
Q
D
 
D
G
 
E
L
 
F
L
 
L
I
 
L
K
 
H
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
M
S
 
S
L
 
E
A
 
D
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
A
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
A
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
V
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
A
M
 
L
I
 
V
E
 
S
L
 
N
K
 
G
T
 
C
G
 
R
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
-
 
V
S
 
G
R
 
K
A
 
V
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
L
T
 
T
V
 
Q
T
 
T
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
C
A
 
N
G
 
S
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
E
 
P
M
|
M
T
 
T
L
 
Q
S
 
K
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
L
 
V
E
 
D
K
 
K
M
 
I
T
 
T
S
 
E
G
 
M
I
 
I
P
 
P
L
 
M
K
 
G
R
 
H
M
 
L
G
 
G
K
 
D
P
 
P
E
 
E
E
 
D
I
 
V
A
 
A
H
 
D
S
 
V
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
E
 
S
N
 
E
D
 
D
-
 
S
-
 
G
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
T
I
 
S
L
 
V
E
 
E
M
 
V
D
 
T
G
 
G
G
 
G
L
 
L

5vmlA Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b with bound NADP
35% identity, 99% coverage: 4:252/252 of query aligns to 1:244/245 of 5vmlA

query
sites
5vmlA
T
 
S
D
 
Q
K
 
R
V
 
I
I
 
A
I
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
C
 
M
Q
x
G
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
T
S
 
S
M
 
I
A
 
C
E
 
Q
Y
 
R
F
 
L
A
 
H
A
 
K
K
 
D
G
 
G
A
 
F
K
 
R
L
 
V
-
 
V
A
 
A
L
 
G
V
x
C
D
x
G
L
 
P
N
 
N
Q
 
S
E
 
P
K
x
R
L
 
R
D
 
V
Q
 
K
A
 
W
V
 
L
A
 
E
A
 
D
C
 
Q
K
 
K
A
 
A
A
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
D
A
 
F
R
 
Y
A
 
A
Y
 
S
L
 
E
C
x
G
N
|
N
V
|
V
A
 
G
N
 
D
E
 
W
E
 
D
Q
 
S
V
 
T
T
 
K
H
 
Q
M
 
A
V
 
F
A
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
K
E
 
A
D
 
E
F
 
V
G
 
G
A
 
E
I
 
I
H
 
D
G
 
V
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
V
L
 
V
L
 
F
I
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
T
 
R
K
 
K
M
 
M
S
 
T
L
 
R
A
 
E
Q
 
D
W
 
W
Q
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
L
F
 
F
L
 
N
C
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
Q
V
 
V
A
 
I
A
 
D
K
 
G
M
 
M
I
 
V
E
 
E
L
 
-
K
 
R
T
 
G
G
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
N
-
 
G
R
 
Q
A
 
K
G
 
G
N
 
Q
V
 
F
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
H
A
 
G
A
 
F
T
 
T
V
 
M
T
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
H
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
I
|
I
E
 
G
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
V
L
 
K
S
 
A
M
 
I
K
 
R
P
 
P
E
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
M
 
I
T
 
V
S
 
A
G
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
R
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
S
P
 
P
E
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
H
 
S
S
 
I
A
 
V
A
 
A
Y
 
W
I
 
L
F
 
A
-
 
S
-
 
E
E
 
E
N
 
S
D
 
G
Y
 
F
Y
 
S
T
 
T
G
 
G
R
 
A
I
 
D
L
 
F
E
 
S
M
 
L
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
H
I
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
36% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 4:240/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
M
 
M
K
 
N
L
 
L
T
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
K
S
 
A
M
 
I
A
 
A
E
 
E
Y
 
L
F
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
-
L
 
I
V
 
G
D
 
T
L
 
A
N
x
T
Q
 
S
E
 
E
K
 
S
L
 
G
D
 
A
Q
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
-
C
 
-
K
 
D
A
 
Y
A
 
L
G
 
G
V
 
D
E
 
N
A
 
G
R
 
K
A
 
G
Y
 
M
L
 
A
C
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
N
E
 
P
E
 
E
Q
 
S
V
 
I
T
 
E
H
 
A
M
 
V
V
 
L
A
 
K
Q
 
A
V
 
I
A
 
T
E
 
D
D
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
G
I
 
V
H
 
D
G
 
I
L
 
L
I
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
L
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
E
E
 
E
M
 
-
T
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
S
A
 
D
V
 
I
I
 
M
D
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
L
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
R
K
 
G
M
 
M
I
 
M
E
 
K
L
 
-
K
 
K
T
 
R
G
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
V
S
x
G
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
Q
|
Q
T
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
A
 
F
T
 
T
V
 
K
T
 
S
W
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
H
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
N
L
 
D
S
 
E
M
 
Q
K
 
R
P
 
T
E
 
A
A
 
T
L
 
L
E
 
A
K
 
Q
M
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
V
P
 
P
L
 
A
K
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
D
P
 
P
E
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
S
S
 
A
A
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
F
 
A
-
 
S
-
 
P
E
 
E
N
 
A
D
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
T
L
 
L
E
 
H
M
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M

Query Sequence

>AO353_04045 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_04045
MKLTDKVIIITGGCQGLGRSMAEYFAAKGAKLALVDLNQEKLDQAVAACKAAGVEARAYL
CNVANEEQVTHMVAQVAEDFGAIHGLINNAGILRDGLLIKVKDGEMTKMSLAQWQAVIDV
NLTGVFLCTREVAAKMIELKTGGAIVNISSISRAGNVGQTNYSAAKAGVAAATVTWAKEL
ARHGIRVAGIAPGFIETEMTLSMKPEALEKMTSGIPLKRMGKPEEIAHSAAYIFENDYYT
GRILEMDGGLRI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory