SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO353_04425 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_04425 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4n27A X-ray structure of brucella abortus rica (see paper)
57% identity, 89% coverage: 15:169/174 of query aligns to 18:172/175 of 4n27A

query
sites
4n27A
Q
 
S
S
 
N
W
 
W
V
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
D
A
 
A
V
 
T
L
 
L
V
 
I
G
 
G
K
 
K
V
 
V
K
 
V
L
 
V
E
 
G
E
 
E
G
 
N
A
 
A
N
 
G
V
 
F
W
 
W
F
 
F
N
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
D
|
D
N
 
N
E
 
E
L
 
P
I
 
I
L
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
A
N
 
D
S
 
T
N
 
N
V
 
V
Q
|
Q
D
 
E
G
 
Q
T
 
T
V
x
I
M
 
M
H
|
H
T
 
T
D
 
D
M
 
I
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
V
 
C
T
 
T
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
R
A
 
A
M
 
I
L
 
L
H
|
H
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
E
Y
 
N
S
 
T
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
M
N
 
G
A
 
A
V
 
I
I
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
V
G
 
G
K
 
K
N
 
N
C
 
C
I
 
L
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
S
 
T
L
 
L
I
 
V
G
 
K
E
 
E
G
 
G
K
 
M
E
 
E
I
 
I
P
 
P
D
 
D
G
 
N
S
 
S
L
 
L
V
 
V
M
 
V
G
 
G
S
 
S
P
 
P
G
 
A
K
 
R
V
 
V
V
 
L
R
 
R
E
 
Q
L
 
L
T
 
D
E
 
D
P
 
A
Q
 
A
K
 
V
K
 
E
M
 
K
L
 
L
E
 
R
A
 
A
S
 
S
A
 
A
A
 
K
H
 
H
Y
 
Y
V
 
V
H
 
E
N
 
R
S
 
G
Q
 
H
R
 
S
Y
 
F
A
 
M
R
 
R
D
 
G
L
 
M

7zw9A Crystal structure of a gamma-carbonic anhydrase from the pathogenic bacterium burkholderia pseudomallei (see paper)
51% identity, 97% coverage: 3:171/174 of query aligns to 4:172/173 of 7zw9A

query
sites
7zw9A
Y
 
Y
R
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
E
A
 
N
R
 
A
V
 
P
E
 
S
T
 
I
H
 
H
P
 
E
Q
 
S
S
 
V
W
 
F
V
 
V
A
 
A
P
 
D
N
 
S
A
 
A
V
 
T
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
K
V
 
V
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
N
A
 
A
N
 
S
V
 
V
W
 
W
F
 
F
N
 
G
A
 
A
V
 
T
L
 
I
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
 
N
E
 
E
L
 
P
I
 
I
L
 
T
I
 
V
G
 
G
K
 
A
N
 
G
S
 
S
N
 
N
V
 
V
Q
 
Q
D
 
E
G
 
G
T
 
A
V
 
V
M
 
L
H
|
H
T
 
T
D
 
D
M
 
P
G
 
G
Y
 
C
P
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
I
G
 
A
T
 
P
G
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
V
G
 
G
H
 
H
N
 
Q
A
 
A
M
 
M
L
 
L
H
|
H
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
E
Y
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
Q
A
 
A
V
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
N
G
 
R
A
 
A
K
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
R
N
 
N
C
 
C
I
 
L
I
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
G
S
 
A
L
 
V
I
 
I
G
 
T
E
 
E
G
 
G
K
 
K
E
 
A
I
 
F
P
 
P
D
 
D
G
 
N
S
 
S
L
 
L
V
 
I
M
 
L
G
 
G
S
 
A
P
 
P
G
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
R
E
 
T
L
 
L
T
 
S
E
 
D
P
 
E
Q
 
D
K
 
I
K
 
A
M
 
R
L
 
M
E
 
H
A
 
M
S
 
N
A
 
T
A
 
K
H
 
S
Y
 
Y
V
 
A
H
 
M
N
 
R
S
 
R
Q
 
A
R
 
Y
Y
 
F
A
 
K
R
 
E
D
 
Q
L
 
L
V
 
V
E
 
R

2fkoA Structure of ph1591 from pyrococcus horikoshii ot3 (see paper)
52% identity, 95% coverage: 3:167/174 of query aligns to 4:168/173 of 2fkoA

query
sites
2fkoA
Y
 
Y
R
 
E
L
 
I
G
 
N
D
 
G
A
 
K
R
 
K
V
 
P
E
 
R
T
 
I
H
 
H
P
 
P
Q
 
S
S
 
A
W
 
F
V
 
V
A
 
D
P
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
K
A
 
T
N
 
S
V
 
V
W
 
W
F
 
P
N
 
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
x
I
E
 
E
L
 
Q
I
 
I
L
 
Y
I
 
V
G
 
G
K
 
K
N
 
Y
S
 
S
N
 
N
V
 
V
Q
|
Q
D
 
D
G
 
N
T
 
V
V
 
S
M
 
I
H
|
H
T
 
T
D
 
S
M
x
H
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
L
 
T
T
 
E
I
 
I
G
 
G
T
 
E
G
 
Y
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
H
|
H
N
 
N
A
 
A
M
 
M
L
 
V
H
|
H
G
 
G
C
 
A
T
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
N
Y
 
Y
S
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
S
A
 
S
V
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
D
N
 
H
C
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
S
 
A
L
 
V
I
 
V
G
 
P
E
 
P
G
 
N
K
 
K
E
 
E
I
 
I
P
 
P
D
 
D
G
 
Y
S
 
S
L
 
L
V
 
V
M
 
L
G
 
G
S
 
V
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
R
E
 
Q
L
 
L
T
 
T
E
 
E
P
 
E
Q
 
E
K
 
I
K
 
E
M
 
W
L
 
T
E
 
K
A
 
K
S
 
N
A
 
A
A
 
E
H
 
I
Y
 
Y
V
 
V
H
x
E
N
 
L
S
 
A
Q
 
E
R
 
K
Y
 
H
A
 
I
R
 
K

1v3wA Structure of ferripyochelin binding protein from pyrococcus horikoshii ot3 (see paper)
52% identity, 95% coverage: 3:167/174 of query aligns to 4:168/173 of 1v3wA

query
sites
1v3wA
Y
 
Y
R
 
E
L
 
I
G
 
N
D
 
G
A
 
K
R
 
K
V
 
P
E
 
R
T
 
I
H
 
H
P
 
P
Q
 
S
S
 
A
W
 
F
V
 
V
A
 
D
P
 
E
N
 
N
A
 
A
V
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
V
L
 
L
E
 
E
E
 
E
G
 
K
A
 
T
N
 
S
V
 
V
W
 
W
F
 
P
N
x
S
A
 
A
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
x
I
E
 
E
L
 
Q
I
 
I
L
 
Y
I
 
V
G
 
G
K
 
K
N
 
Y
S
 
S
N
 
N
V
 
V
Q
|
Q
D
 
D
G
x
N
T
 
V
V
 
S
M
 
I
H
|
H
T
 
T
D
 
S
M
x
H
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
L
 
T
T
 
E
I
 
I
G
 
G
T
 
E
G
 
Y
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
H
|
H
N
 
N
A
 
A
M
 
M
L
 
V
H
|
H
G
 
G
C
 
A
T
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
N
Y
 
Y
S
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
I
 
I
N
 
S
A
 
S
V
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
G
A
 
A
K
 
K
I
 
I
G
 
G
K
 
D
N
 
H
C
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
S
 
A
L
 
V
I
 
V
G
 
P
E
 
P
G
 
N
K
 
K
E
 
E
I
 
I
P
 
P
D
 
D
G
 
Y
S
 
S
L
 
L
V
 
V
M
 
L
G
 
G
S
 
V
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
R
E
 
Q
L
 
L
T
 
T
E
 
E
P
 
E
Q
 
E
K
 
I
K
 
E
M
 
W
L
 
T
E
 
K
A
 
K
S
 
N
A
 
A
A
 
E
H
 
I
Y
 
Y
V
 
V
H
x
E
N
 
L
S
 
A
Q
 
E
R
 
K
Y
 
H
A
 
I
R
 
K

6iveA Molecular structure of a thermostable and a zinc ion binding gamma- class carbonic anhydrase (see paper)
43% identity, 96% coverage: 3:169/174 of query aligns to 3:163/168 of 6iveA

query
sites
6iveA
Y
 
Y
R
 
R
L
 
F
G
 
E
D
 
D
A
 
K
R
 
T
V
 
P
E
 
A
T
 
V
H
 
H
P
 
P
Q
 
T
S
 
A
W
 
F
V
 
I
A
 
A
P
 
P
N
 
G
A
 
A
V
 
Y
L
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
A
V
 
V
K
 
E
L
 
V
E
 
G
E
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
S
V
 
I
W
 
W
F
 
F
N
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
V
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
 
L
E
 
E
L
 
R
I
 
V
L
 
V
I
 
V
G
 
G
K
 
P
N
 
G
S
 
T
N
 
N
V
 
V
Q
|
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
A
V
 
V
M
 
L
H
|
H
T
 
A
D
|
D
M
 
P
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
L
 
C
T
 
L
I
 
L
G
 
G
T
 
P
G
 
E
V
 
V
T
 
T
I
 
V
G
 
G
H
 
H
N
 
R
A
 
A
M
 
V
L
 
V
H
|
H
G
 
G
C
 
A
T
 
V
V
 
V
G
 
E
D
 
E
Y
 
G
S
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
I
 
M
N
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
V
L
 
L
N
 
N
G
 
G
A
 
A
K
 
R
I
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
C
 
A
I
 
V
I
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
G
S
 
A
L
 
V
I
 
V
G
 
P
E
 
P
G
 
G
K
 
M
E
 
E
I
 
V
P
 
P
D
 
E
G
 
G
S
 
R
L
 
L
V
 
A
M
 
L
G
 
G
S
 
V
P
 
P
G
 
A
K
 
R
V
 
V
V
 
V
R
 
R
E
 
P
L
 
I
T
 
D
E
 
P
P
 
P
Q
 
-
K
 
-
K
 
-
M
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
G
S
x
N
A
 
A
A
 
P
H
 
R
Y
|
Y
V
 
R
H
 
A
N
 
L
S
 
A
Q
 
E
R
 
R
Y
 
Y
A
 
R
R
 
K
D
 
A
L
 
L

Q5KW03 Carbonic anhydrase; Gamma-carbonic anhydrase; Cag; EC 4.2.1.1 from Geobacillus kaustophilus (strain HTA426) (see paper)
41% identity, 86% coverage: 16:165/174 of query aligns to 16:165/182 of Q5KW03

query
sites
Q5KW03
S
 
A
W
 
F
V
 
I
A
 
A
P
 
D
N
 
Y
A
 
V
V
 
T
L
 
I
V
 
T
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
V
L
 
I
E
 
G
E
 
E
G
 
E
A
 
T
N
 
S
V
 
I
W
 
W
F
 
F
N
 
N
A
 
T
V
 
V
L
 
I
R
|
R
G
 
G
D
 
D
N
 
V
E
 
A
L
 
P
I
 
T
L
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
N
N
 
R
S
 
V
N
|
N
V
 
I
Q
|
Q
D
 
D
G
 
N
T
 
S
V
 
I
M
 
L
H
|
H
T
 
Q
D
 
S
M
 
P
G
 
N
Y
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
I
I
 
I
G
 
E
T
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
V
G
 
G
H
|
H
N
 
Q
A
 
V
M
 
I
L
 
L
H
|
H
G
 
S
C
 
A
T
 
I
V
 
V
G
 
R
D
 
K
Y
 
N
S
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
M
N
 
G
A
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
R
A
 
A
K
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
E
N
 
G
C
 
A
I
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
V
G
 
P
E
 
P
G
 
G
K
 
K
E
 
K
I
 
I
P
 
P
D
 
P
G
 
N
S
 
T
L
 
L
V
 
A
M
 
L
G
 
G
S
 
R
P
 
P
G
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
E
 
E
P
 
D
Q
 
D
K
 
I
K
 
R
M
 
E
L
 
M
E
 
E
A
 
R
S
 
I
A
 
R
A
 
R
H
 
E
Y
|
Y
V
 
V
H
 
E
N
 
K
S
 
G
Q
 
Q
R
 
Y
Y
 
Y

3vnpA Crystal structure of hypothetical protein (gk2848) from geobacillus kaustophilus
41% identity, 86% coverage: 16:165/174 of query aligns to 17:166/171 of 3vnpA

query
sites
3vnpA
S
 
A
W
 
F
V
 
I
A
 
A
P
 
D
N
 
Y
A
 
V
V
 
T
L
 
I
V
 
T
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
V
L
 
I
E
 
G
E
 
E
G
 
E
A
 
T
N
 
S
V
 
I
W
 
W
F
 
F
N
 
N
A
 
T
V
 
V
L
 
I
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
 
V
E
 
A
L
 
P
I
 
T
L
 
V
I
 
I
G
 
G
K
 
N
N
 
R
S
 
V
N
 
N
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
G
 
N
T
 
S
V
 
I
M
 
L
H
|
H
T
 
Q
D
 
S
M
 
P
G
 
N
Y
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
I
I
 
I
G
 
E
T
 
D
G
 
G
V
 
V
T
 
T
I
 
V
G
 
G
H
 
H
N
 
Q
A
 
V
M
 
I
L
 
L
H
|
H
G
 
S
C
 
A
T
 
I
V
 
V
G
 
R
D
 
K
Y
 
N
S
 
A
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
M
N
 
G
A
 
S
V
 
I
I
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
R
A
 
A
K
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
E
N
 
G
C
 
A
I
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
V
G
 
P
E
 
P
G
 
G
K
 
K
E
 
K
I
 
I
P
 
P
D
 
P
G
 
N
S
 
T
L
 
L
V
 
A
M
 
L
G
 
G
S
 
R
P
 
P
G
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
V
R
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
T
E
 
E
P
 
D
Q
 
D
K
 
I
K
 
R
M
 
E
L
 
M
E
 
E
A
 
R
S
 
I
A
 
R
A
 
R
H
 
E
Y
 
Y
V
 
V
H
 
E
N
 
K
S
 
G
Q
 
Q
R
 
Y
Y
 
Y

8e73G2 qcr9 (see paper)
37% identity, 86% coverage: 17:166/174 of query aligns to 59:209/258 of 8e73G2

query
sites
8e73G2
W
 
F
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
S
A
 
A
V
 
S
L
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
Q
L
 
V
E
 
G
E
 
R
G
 
G
A
 
S
N
 
S
V
 
I
W
 
W
F
 
Y
N
 
G
A
 
C
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
 
V
E
 
N
L
 
S
I
 
I
L
 
R
I
 
V
G
 
G
K
 
S
N
 
G
S
 
T
N
 
N
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
G
 
N
T
 
S
V
 
L
M
 
V
H
|
H
T
 
V
D
 
A
M
 
K
G
 
S
-
 
V
Y
 
L
P
 
P
L
 
T
T
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
D
G
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
V
G
 
G
H
 
H
N
 
S
A
 
A
M
 
V
L
 
L
H
|
H
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
V
G
 
E
D
 
D
Y
 
E
S
 
A
L
 
F
I
 
V
G
 
G
I
 
M
N
 
G
A
 
A
V
 
V
I
 
L
L
 
L
N
 
D
G
 
G
A
 
V
K
 
V
I
 
V
G
 
E
K
 
K
N
 
N
C
 
A
I
 
M
I
 
V
G
 
A
A
 
A
N
 
G
S
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
R
E
 
Q
G
 
N
K
 
T
E
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
S
G
 
G
S
 
E
L
 
V
V
 
W
M
 
A
G
 
G
S
 
N
P
 
P
G
 
A
K
 
K
V
 
F
V
 
L
R
 
R
E
 
K
L
 
L
T
 
S
E
 
N
P
 
E
Q
 
E
K
 
I
K
 
T
M
 
F
L
 
I
E
 
S
A
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
I
H
 
N
Y
 
Y
V
 
T
H
 
N
N
 
L
S
 
A
Q
 
Q
R
 
V
Y
 
H
A
 
A

3tioF Crystal structures of yrda from escherichia coli, a homologous protein of gamma-class carbonic anhydrase, show possible allosteric conformations (see paper)
39% identity, 83% coverage: 21:165/174 of query aligns to 22:173/177 of 3tioF

query
sites
3tioF
N
 
S
A
 
S
V
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
R
L
 
L
E
 
A
E
 
D
G
 
D
A
 
V
N
 
G
V
 
I
W
 
W
F
 
P
N
 
L
A
 
V
V
 
V
L
 
I
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
x
V
E
 
H
L
 
Y
I
 
V
L
 
Q
I
 
I
G
 
G
K
 
A
N
 
R
S
 
T
N
 
N
V
 
I
Q
|
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
M
M
 
L
H
|
H
T
 
V
D
 
T
M
x
H
-
 
K
-
 
S
-
 
S
-
 
Y
-
 
N
-
 
P
-
 
D
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
E
G
 
D
V
 
V
T
 
T
I
 
V
G
 
G
H
 
H
N
 
K
A
 
V
M
 
M
L
 
L
H
|
H
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
N
Y
 
R
S
 
V
L
 
L
I
 
V
G
 
G
I
 
M
N
 
G
A
 
S
V
 
I
I
 
L
L
 
L
N
 
D
G
 
G
A
 
A
K
 
I
I
 
V
G
 
E
K
 
D
N
 
D
C
 
V
I
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
V
G
 
P
E
 
Q
G
 
N
K
 
K
E
 
R
I
 
L
P
 
E
D
 
S
G
 
G
S
 
Y
L
 
L
V
 
Y
M
 
L
G
 
G
S
 
S
P
 
P
G
 
V
K
 
K
V
 
Q
V
 
I
R
 
R
E
 
P
L
 
L
T
 
S
E
 
D
P
 
E
Q
 
E
K
 
K
K
 
A
M
 
G
L
 
L
E
 
R
A
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
N
H
 
N
Y
 
Y
V
 
V
H
 
K
N
 
W
S
 
K
Q
 
D
R
 
E
Y
 
Y

3r3rA Structure of the yrda ferripyochelin binding protein from salmonella enterica
38% identity, 88% coverage: 21:173/174 of query aligns to 27:182/184 of 3r3rA

query
sites
3r3rA
N
 
S
A
 
S
V
 
V
L
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
R
L
 
L
E
 
A
E
 
D
G
 
D
A
 
V
N
 
G
V
 
I
W
 
W
F
 
P
N
 
L
A
 
V
V
 
V
L
 
I
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
x
V
E
 
N
L
 
Y
I
 
V
L
 
A
I
 
I
G
 
G
K
 
A
N
 
R
S
 
T
N
 
N
V
 
I
Q
|
Q
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
V
M
 
L
H
|
H
T
 
V
D
 
T
M
x
H
-
 
K
-
 
S
-
 
S
-
 
S
-
 
N
-
 
P
-
 
H
G
 
G
Y
 
N
P
 
P
L
 
L
T
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
E
G
 
D
V
 
V
T
 
T
I
 
V
G
 
G
H
 
H
N
 
K
A
 
V
M
 
M
L
 
L
H
|
H
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
I
G
 
G
D
 
N
Y
 
R
S
 
V
L
 
L
I
 
V
G
 
G
I
 
M
N
 
G
A
 
S
V
 
I
I
 
V
L
 
L
N
 
D
G
 
G
A
 
A
K
 
I
I
 
I
G
 
E
K
 
D
N
 
D
C
 
V
I
 
M
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
V
G
 
P
E
 
Q
G
 
H
K
 
K
E
 
R
I
 
L
P
 
E
D
 
S
G
 
G
S
 
Y
L
 
L
V
 
Y
M
 
L
G
 
G
S
 
S
P
 
P
G
 
V
K
 
K
V
 
Q
V
 
I
R
 
R
E
 
P
L
 
L
T
 
S
E
 
D
P
 
A
Q
 
E
K
 
R
K
 
S
M
 
G
L
 
L
E
 
Q
A
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
N
H
 
N
Y
 
Y
V
 
V
H
 
-
N
 
-
S
 
-
Q
 
-
R
 
K
Y
 
W
A
 
K
R
 
D
D
 
D
L
 
Y
V
 
L
E
 
S
Q
 
Q
E
 
D

8gpmA Acinetobacter baumannii carbonic anhydrase
43% identity, 91% coverage: 14:171/174 of query aligns to 15:172/193 of 8gpmA

query
sites
8gpmA
P
 
P
Q
 
D
S
 
A
W
 
F
V
 
V
A
 
H
P
 
P
N
 
T
A
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
I
L
 
I
E
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
V
N
 
Y
V
 
V
W
 
G
F
 
P
N
 
F
A
 
A
V
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
A
D
 
D
N
 
F
E
 
G
L
 
R
I
 
I
L
 
H
I
 
I
G
 
N
K
 
Q
N
 
N
S
 
A
N
 
N
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
G
 
S
T
 
C
V
 
T
M
 
V
H
|
H
T
 
-
D
 
-
M
 
-
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
L
 
Q
T
 
S
I
 
V
G
 
-
T
 
T
G
 
L
V
 
V
T
 
E
-
 
E
-
 
M
-
 
G
-
 
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
G
A
 
A
M
 
I
L
 
L
H
|
H
G
 
G
C
 
C
T
 
R
V
 
I
G
 
G
D
 
K
Y
 
N
S
 
V
L
 
L
I
 
V
G
 
G
I
 
M
N
 
N
A
 
S
V
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
Y
A
 
A
K
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
E
N
 
N
C
 
T
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
L
 
L
I
 
V
G
 
K
E
 
T
G
 
K
K
 
D
E
 
I
I
 
I
P
 
P
D
 
A
G
 
N
S
 
V
L
 
L
V
 
A
M
 
M
G
 
G
S
 
S
P
 
P
G
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
A
R
 
R
E
 
D
L
 
L
T
 
S
E
 
E
P
 
Q
Q
 
E
K
 
K
K
 
K
M
 
W
L
 
K
E
 
T
A
 
R
S
 
G
A
 
T
A
 
Q
H
 
E
Y
 
Y
V
 
M
H
 
E
N
 
L
S
 
A
Q
 
Q
R
 
R
Y
 
C
A
 
L
R
 
N
D
 
S
L
 
M
V
 
Q
E
 
E

8gppA Acinetobacter baumannii carbonic anhydrase paay
43% identity, 91% coverage: 14:171/174 of query aligns to 14:171/189 of 8gppA

query
sites
8gppA
P
 
P
Q
 
D
S
 
A
W
 
F
V
 
V
A
 
H
P
 
P
N
 
T
A
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
I
L
 
I
E
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
V
N
 
Y
V
 
V
W
 
G
F
 
P
N
 
F
A
 
A
V
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
A
D
 
D
N
 
F
E
 
G
L
 
R
I
 
I
L
 
H
I
 
I
G
 
N
K
 
Q
N
 
N
S
 
A
N
 
N
V
 
I
Q
|
Q
D
 
D
G
 
S
T
 
C
V
 
T
M
 
V
H
|
H
T
 
-
D
 
-
M
 
-
G
 
G
Y
 
F
P
 
P
L
 
Q
T
 
S
I
 
V
G
 
-
T
 
T
G
 
L
V
 
V
T
 
E
-
 
E
-
 
M
-
 
G
-
x
H
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
G
A
 
A
M
 
I
L
 
L
H
|
H
G
 
G
C
 
C
T
 
R
V
 
I
G
 
G
D
 
K
Y
 
N
S
 
V
L
 
L
I
 
V
G
 
G
I
 
M
N
 
N
A
 
S
V
 
V
I
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
Y
A
 
A
K
 
E
I
 
I
G
 
G
K
 
E
N
 
N
C
 
T
I
 
I
I
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
N
S
 
S
L
 
L
I
 
V
G
 
K
E
 
T
G
 
K
K
 
D
E
 
I
I
 
I
P
 
P
D
 
A
G
 
N
S
 
V
L
 
L
V
 
A
M
 
M
G
 
G
S
 
S
P
 
P
G
 
A
K
 
K
V
 
V
V
 
A
R
 
R
E
 
D
L
 
L
T
 
S
E
 
E
P
 
Q
Q
 
E
K
 
K
K
 
K
M
 
W
L
 
K
E
 
T
A
 
R
S
 
G
A
 
T
A
 
Q
H
 
E
Y
|
Y
V
 
M
H
 
E
N
 
L
S
 
A
Q
 
Q
R
 
R
Y
 
C
A
 
L
R
 
N
D
 
S
L
 
M
V
 
Q
E
 
E

7a23p Plant mitochondrial respiratory complex i (see paper)
35% identity, 87% coverage: 15:166/174 of query aligns to 53:210/224 of 7a23p

query
sites
7a23p
Q
 
E
S
 
A
W
 
F
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
S
A
 
A
V
 
S
L
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
H
L
 
I
E
 
G
E
 
R
G
 
G
A
 
S
N
 
S
V
 
I
W
 
W
F
 
Y
N
 
G
A
 
C
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
 
V
E
 
N
L
 
T
I
 
V
L
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
S
N
 
G
S
 
T
N
 
N
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
G
 
N
T
 
S
V
 
L
M
 
V
H
 
H
T
 
V
D
 
A
M
 
K
G
 
S
-
 
N
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
V
Y
 
H
P
 
P
L
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
D
G
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
S
A
 
A
M
 
V
L
 
L
H
 
H
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
V
G
 
E
D
 
D
Y
 
E
S
 
T
L
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
M
N
 
G
A
 
A
V
 
T
I
 
L
L
 
L
N
 
D
G
 
G
A
 
V
K
 
V
I
 
V
G
 
E
K
 
K
N
 
H
C
 
G
I
 
M
I
 
V
G
 
A
A
 
A
N
 
G
S
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
R
E
 
Q
G
 
N
K
 
T
E
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
S
G
 
G
S
 
E
L
 
V
V
 
W
M
 
G
G
 
G
S
 
N
P
 
P
G
 
A
K
 
R
V
 
F
V
 
L
R
 
R
E
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
D
P
 
E
Q
 
E
K
 
I
K
 
A
M
 
F
L
 
I
E
 
S
A
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
T
H
 
N
Y
 
Y
V
 
S
H
 
N
N
 
L
S
 
A
Q
 
Q
R
 
A
Y
 
H
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7aqqz Cryo-em structure of arabidopsis thaliana complex-i (membrane core) (see paper)
35% identity, 87% coverage: 15:166/174 of query aligns to 57:214/233 of 7aqqz

query
sites
7aqqz
Q
 
E
S
 
A
W
 
F
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
S
A
 
A
V
 
S
L
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
H
L
 
I
E
 
G
E
 
R
G
 
G
A
 
S
N
 
S
V
 
I
W
 
W
F
 
Y
N
 
G
A
 
C
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
 
V
E
 
N
L
 
T
I
 
V
L
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
S
N
 
G
S
 
T
N
 
N
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
G
 
N
T
 
S
V
 
L
M
 
V
H
 
H
T
 
V
D
 
A
M
 
K
G
 
S
-
 
N
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
V
Y
 
H
P
 
P
L
 
T
T
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
D
G
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
S
A
 
A
M
 
V
L
 
L
H
 
H
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
V
G
 
E
D
 
D
Y
 
E
S
 
T
L
 
F
I
 
I
G
 
G
I
 
M
N
 
G
A
 
A
V
 
T
I
 
L
L
 
L
N
 
D
G
 
G
A
 
V
K
 
V
I
 
V
G
 
E
K
 
K
N
 
H
C
 
G
I
 
M
I
 
V
G
 
A
A
 
A
N
 
G
S
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
R
E
 
Q
G
 
N
K
 
T
E
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
S
G
 
G
S
 
E
L
 
V
V
 
W
M
 
G
G
 
G
S
 
N
P
 
P
G
 
A
K
 
R
V
 
F
V
 
L
R
 
R
E
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
D
P
 
E
Q
 
E
K
 
I
K
 
A
M
 
F
L
 
I
E
 
S
A
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
T
H
 
N
Y
 
Y
V
 
S
H
 
N
N
 
L
S
 
A
Q
 
Q
R
 
A
Y
 
H
A
 
A

Sites not aligning to the query:

7ar7y Cryo-em structure of arabidopsis thaliana complex-i (open conformation) (see paper)
36% identity, 87% coverage: 17:168/174 of query aligns to 59:216/268 of 7ar7y

query
sites
7ar7y
W
 
F
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
S
A
 
A
V
 
S
L
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
Q
L
 
I
E
 
G
E
 
K
G
 
G
A
 
S
N
 
S
V
 
I
W
 
W
F
 
Y
N
 
G
A
 
C
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
 
V
E
 
N
L
 
N
I
 
I
L
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
S
N
 
G
S
 
T
N
 
N
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
G
 
N
T
 
T
V
 
L
M
 
V
H
|
H
-
 
V
-
 
A
-
 
K
T
 
T
D
 
N
M
 
I
G
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
V
Y
 
L
P
 
P
L
 
T
T
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
D
G
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
V
G
 
G
H
 
H
N
 
S
A
 
A
M
 
V
L
 
I
H
|
H
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
V
G
 
E
D
 
D
Y
 
D
S
 
A
L
 
F
I
 
V
G
 
G
I
 
M
N
 
G
A
 
A
V
 
T
I
 
L
L
 
L
N
 
D
G
 
G
A
 
V
K
 
V
I
 
V
G
 
E
K
 
K
N
 
H
C
 
A
I
 
M
I
 
V
G
 
A
A
 
A
N
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
V
G
 
K
E
 
Q
G
 
N
K
 
T
E
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
S
G
 
G
S
 
E
L
 
V
V
 
W
M
 
G
G
 
G
S
 
N
P
 
P
G
 
A
K
 
K
V
 
F
V
 
M
R
 
R
E
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
D
P
 
E
Q
 
E
K
 
I
K
 
V
M
 
Y
L
 
I
E
 
S
A
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
K
H
 
N
Y
 
Y
V
 
I
H
 
N
N
 
L
S
 
A
Q
 
Q
R
 
I
Y
 
H
A
 
A
R
 
S
D
 
E

Sites not aligning to the query:

7aqqy Cryo-em structure of arabidopsis thaliana complex-i (membrane core) (see paper)
36% identity, 87% coverage: 17:168/174 of query aligns to 59:216/268 of 7aqqy

query
sites
7aqqy
W
 
F
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
S
A
 
A
V
 
S
L
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
Q
L
 
I
E
 
G
E
 
K
G
 
G
A
 
S
N
 
S
V
 
I
W
 
W
F
 
Y
N
 
G
A
 
C
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
 
V
E
 
N
L
 
N
I
 
I
L
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
S
N
 
G
S
 
T
N
 
N
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
G
 
N
T
 
T
V
 
L
M
 
V
H
|
H
-
 
V
-
 
A
-
 
K
T
 
T
D
 
N
M
 
I
G
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
V
Y
 
L
P
 
P
L
 
T
T
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
D
G
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
V
G
 
G
H
 
H
N
 
S
A
 
A
M
 
V
L
 
I
H
|
H
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
V
G
 
E
D
 
D
Y
 
D
S
 
A
L
 
F
I
 
V
G
 
G
I
 
M
N
 
G
A
 
A
V
 
T
I
 
L
L
 
L
N
 
D
G
 
G
A
 
V
K
 
V
I
 
V
G
 
E
K
 
K
N
 
H
C
 
A
I
 
M
I
 
V
G
 
A
A
 
A
N
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
V
G
 
K
E
 
Q
G
 
N
K
 
T
E
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
S
G
 
G
S
 
E
L
 
V
V
 
W
M
 
G
G
 
G
S
 
N
P
 
P
G
 
A
K
 
K
V
 
F
V
 
M
R
 
R
E
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
D
P
 
E
Q
 
E
K
 
I
K
 
V
M
 
Y
L
 
I
E
 
S
A
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
K
H
 
N
Y
 
Y
V
 
I
H
 
N
N
 
L
S
 
A
Q
 
Q
R
 
I
Y
 
H
A
 
A
R
 
S
D
 
E

8bpxy Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-1, mitochondrial (see paper)
36% identity, 87% coverage: 17:168/174 of query aligns to 60:217/265 of 8bpxy

query
sites
8bpxy
W
 
F
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
S
A
 
A
V
 
S
L
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
Q
L
 
I
E
 
G
E
 
K
G
 
G
A
 
S
N
 
S
V
 
I
W
 
W
F
 
Y
N
 
G
A
 
C
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
 
V
E
 
N
L
 
N
I
 
I
L
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
S
N
 
G
S
 
T
N
 
N
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
G
 
N
T
 
T
V
 
L
M
 
V
H
|
H
-
 
V
-
 
A
-
 
K
T
 
T
D
 
N
M
 
I
G
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
V
Y
 
L
P
 
P
L
 
T
T
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
D
G
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
V
G
 
G
H
 
H
N
 
S
A
 
A
M
 
V
L
 
I
H
|
H
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
V
G
 
E
D
 
D
Y
 
D
S
 
A
L
x
F
I
 
V
G
|
G
I
x
M
N
 
G
A
 
A
V
 
T
I
 
L
L
 
L
N
 
D
G
 
G
A
 
V
K
 
V
I
 
V
G
 
E
K
 
K
N
 
H
C
 
A
I
 
M
I
 
V
G
x
A
A
|
A
N
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
V
G
 
K
E
 
Q
G
 
N
K
 
T
E
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
S
G
 
G
S
 
E
L
 
V
V
 
W
M
 
G
G
 
G
S
 
N
P
 
P
G
 
A
K
 
K
V
 
F
V
x
M
R
|
R
E
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
D
P
 
E
Q
 
E
K
 
I
K
 
V
M
 
Y
L
 
I
E
 
S
A
 
Q
S
|
S
A
 
A
A
 
K
H
 
N
Y
 
Y
V
 
I
H
 
N
N
 
L
S
 
A
Q
 
Q
R
 
I
Y
 
H
A
 
A
R
 
S
D
 
E

Sites not aligning to the query:

8befy Cryo-em structure of the arabidopsis thaliana i+iii2 supercomplex (ci membrane core) (see paper)
36% identity, 87% coverage: 17:168/174 of query aligns to 60:217/265 of 8befy

query
sites
8befy
W
 
F
V
 
V
A
 
A
P
 
P
N
 
S
A
 
A
V
 
S
L
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
Q
L
 
I
E
 
G
E
 
K
G
 
G
A
 
S
N
 
S
V
 
I
W
 
W
F
 
Y
N
 
G
A
 
C
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
 
V
E
 
N
L
 
N
I
 
I
L
 
S
I
 
V
G
 
G
K
 
S
N
 
G
S
 
T
N
 
N
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
G
 
N
T
 
T
V
 
L
M
 
V
H
|
H
-
 
V
-
 
A
-
 
K
T
 
T
D
 
N
M
 
I
G
 
S
-
 
G
-
 
K
-
 
V
Y
 
L
P
 
P
L
 
T
T
 
L
I
 
I
G
 
G
T
 
D
G
 
N
V
 
V
T
 
T
I
 
V
G
 
G
H
 
H
N
 
S
A
 
A
M
 
V
L
 
I
H
|
H
G
 
G
C
 
C
T
 
T
V
 
V
G
 
E
D
 
D
Y
 
D
S
 
A
L
x
F
I
 
V
G
|
G
I
x
M
N
 
G
A
 
A
V
 
T
I
 
L
L
 
L
N
 
D
G
 
G
A
 
V
K
 
V
I
 
V
G
 
E
K
 
K
N
 
H
C
 
A
I
 
M
I
 
V
G
x
A
A
|
A
N
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
V
G
 
K
E
 
Q
G
 
N
K
 
T
E
 
R
I
 
I
P
 
P
D
 
S
G
 
G
S
 
E
L
 
V
V
 
W
M
 
G
G
 
G
S
 
N
P
 
P
G
 
A
K
 
K
V
 
F
V
 
M
R
|
R
E
 
K
L
 
L
T
 
T
E
 
D
P
 
E
Q
 
E
K
 
I
K
 
V
M
 
Y
L
 
I
E
 
S
A
 
Q
S
|
S
A
 
A
A
 
K
H
 
N
Y
 
Y
V
 
I
H
 
N
N
 
L
S
 
A
Q
 
Q
R
 
I
Y
 
H
A
 
A
R
 
S
D
 
E

Sites not aligning to the query:

6sc4B Gamma-carbonic anhydrase from the haloarchaeon halobacterium sp. (see paper)
32% identity, 97% coverage: 1:169/174 of query aligns to 2:178/178 of 6sc4B

query
sites
6sc4B
M
 
M
K
 
I
Y
 
Q
R
 
K
L
 
F
G
 
E
D
 
G
A
 
K
R
 
K
V
 
P
E
 
E
T
 
I
H
 
H
P
 
E
Q
 
T
S
 
A
W
 
F
V
 
V
A
 
H
P
 
P
N
 
R
A
 
A
V
 
T
L
 
I
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
E
L
 
I
E
 
G
E
 
P
G
 
K
A
 
T
N
 
S
V
 
V
W
 
W
F
 
P
N
 
G
A
 
A
V
 
V
L
 
I
R
 
R
G
 
A
D
 
D
N
 
I
E
 
E
L
 
K
I
 
I
L
 
T
I
 
I
G
 
G
K
 
K
N
 
N
S
 
T
N
 
C
V
 
I
Q
x
K
D
 
D
G
 
N
T
 
A
V
 
V
M
 
I
H
|
H
T
 
P
D
 
A
M
 
D
G
 
V
Y
 
Y
-
 
H
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
E
-
 
Y
-
 
V
P
 
P
L
 
V
T
 
K
I
 
I
G
 
G
T
 
D
G
 
N
V
 
N
T
 
I
I
 
I
G
 
G
H
|
H
N
 
R
A
 
A
M
 
L
L
 
I
H
|
H
G
 
G
C
 
A
T
 
K
V
 
I
G
 
N
D
 
D
Y
 
E
S
 
S
L
 
I
I
 
V
G
 
G
I
 
A
N
 
G
A
 
S
V
 
I
I
 
V
L
 
F
N
 
N
G
 
K
A
 
A
K
 
E
I
 
V
G
 
K
K
 
T
N
 
N
C
 
S
I
 
M
I
 
V
G
 
G
A
 
M
N
 
G
S
 
A
L
 
V
I
 
V
G
 
L
E
 
E
G
 
K
K
 
Q
E
 
E
I
 
V
P
 
P
D
 
N
G
 
G
S
 
K
L
 
I
V
 
V
M
 
V
G
 
G
S
 
I
P
 
P
G
 
A
K
 
R
V
 
V
V
 
L
R
 
R
E
 
E
L
 
L
T
 
E
E
 
E
P
 
R
Q
 
E
K
 
I
K
 
K
M
 
Q
L
 
I
E
 
K
A
 
K
S
 
Q
A
 
A
A
 
D
H
 
T
Y
 
H
V
 
A
H
 
E
N
 
L
S
 
A
Q
 
E
R
 
H
Y
 
Y
A
 
S
R
 
R
D
 
E
L
 
I

3ixcA Crystal structure of hexapeptide transferase family protein from anaplasma phagocytophilum
36% identity, 86% coverage: 16:165/174 of query aligns to 19:165/166 of 3ixcA

query
sites
3ixcA
S
 
A
W
 
F
V
 
I
A
 
A
P
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
R
L
 
I
V
 
I
G
 
G
K
 
D
V
 
V
K
 
C
L
 
I
E
 
G
E
 
K
G
 
N
A
 
A
N
 
S
V
 
I
W
 
W
F
 
Y
N
 
G
A
 
T
V
 
V
L
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
D
N
 
V
E
 
D
L
 
K
I
 
I
L
 
E
I
 
V
G
 
G
K
 
E
N
 
G
S
 
T
N
 
N
V
 
I
Q
 
Q
D
 
D
G
 
N
T
 
T
V
 
V
M
 
V
H
|
H
T
 
T
D
 
G
M
 
-
G
 
-
Y
 
-
P
 
D
L
 
T
T
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
K
G
 
F
V
 
V
T
 
T
I
 
I
G
 
G
H
 
H
N
 
S
A
 
C
M
 
I
L
 
L
H
|
H
G
 
A
C
 
C
T
 
T
V
 
L
G
 
G
D
 
N
Y
 
N
S
 
A
L
 
F
I
 
V
G
 
G
I
 
M
N
 
G
A
 
S
V
 
I
I
 
V
L
 
M
N
 
D
G
 
R
A
 
A
K
 
V
I
 
M
G
 
E
K
 
E
N
 
G
C
 
S
I
 
M
I
 
L
G
 
A
A
 
A
N
 
G
S
 
S
L
 
L
I
 
L
G
 
T
E
 
R
G
 
G
K
 
K
E
 
I
I
 
V
P
 
K
D
 
S
G
 
G
S
 
E
L
 
L
V
 
W
M
 
A
G
 
G
S
 
R
P
 
P
G
 
A
K
 
K
V
 
F
V
 
L
R
 
R
E
 
M
L
 
M
T
 
T
E
 
E
P
 
E
Q
 
E
K
 
I
K
 
L
M
 
Y
L
 
L
E
 
Q
A
 
K
S
 
S
A
 
A
A
 
E
H
 
N
Y
 
Y
V
 
I
H
 
A
N
 
L
S
 
S
Q
 
R
R
 
G
Y
 
Y

Query Sequence

>AO353_04425 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_04425
MKYRLGDARVETHPQSWVAPNAVLVGKVKLEEGANVWFNAVLRGDNELILIGKNSNVQDG
TVMHTDMGYPLTIGTGVTIGHNAMLHGCTVGDYSLIGINAVILNGAKIGKNCIIGANSLI
GEGKEIPDGSLVMGSPGKVVRELTEPQKKMLEASAAHYVHNSQRYARDLVEQEQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory