SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO353_05975 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_05975 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

Q9I234 Kynurenine formamidase; KFA; KFase; Arylformamidase; N-formylkynurenine formamidase; FKF; EC 3.5.1.9 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see paper)
66% identity, 94% coverage: 4:211/221 of query aligns to 3:209/213 of Q9I234

query
sites
Q9I234
T
 
S
M
 
L
S
 
R
W
 
Y
W
 
W
D
 
D
I
 
I
S
 
S
P
 
P
P
 
A
L
 
L
S
 
D
T
 
P
A
 
N
T
 
T
P
 
P
T
 
T
W
 
W
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
P
 
P
F
 
F
Q
 
Q
E
 
Q
E
 
E
R
 
W
V
 
A
W
 
A
T
 
R
F
 
L
G
 
D
P
 
E
E
 
Q
C
 
C
P
 
P
V
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
L
 
L
S
 
S
P
 
P
H
|
H
T
 
T
G
 
G
A
 
A
H
|
H
V
 
V
D
|
D
A
 
G
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
S
 
R
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
L
A
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
Q
V
 
V
S
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
I
Y
 
Y
I
 
M
G
 
G
P
 
P
C
 
C
R
 
R
V
 
V
L
 
I
H
 
H
C
 
C
L
 
I
D
 
G
S
 
A
G
 
N
R
 
P
L
 
L
V
 
V
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
H
L
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
A
 
D
D
 
D
L
 
L
P
 
P
E
 
S
R
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
T
Y
 
F
Q
 
E
Q
 
R
A
 
V
P
 
P
L
 
A
T
 
N
A
 
-
W
 
W
D
 
P
P
 
E
D
 
G
F
 
F
T
 
C
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
P
E
 
A
T
 
T
V
 
I
D
 
E
L
 
C
L
 
L
S
 
A
S
 
E
L
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
V
G
 
G
I
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
H
S
 
S
K
 
K
T
 
T
M
 
L
D
 
D
S
 
A
H
|
H
N
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
M
 
M
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
|
E
G
 
G
I
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
A
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
I
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
K
F
 
F
A
 
T
N
 
H
L
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
S
P
 
P
V
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
V
L
 
L
R
 
R
P
 
A
L
 
L

4cobA Crystal structure kynurenine formamidase from pseudomonas aeruginosa (see paper)
67% identity, 93% coverage: 7:211/221 of query aligns to 2:205/206 of 4cobA

query
sites
4cobA
W
 
Y
W
 
W
D
 
D
I
 
I
S
 
S
P
 
P
P
 
A
L
 
L
S
 
D
T
 
P
A
 
N
T
 
T
P
 
P
T
 
T
W
 
W
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
P
 
P
F
 
F
Q
 
Q
E
 
Q
E
 
E
R
 
W
V
 
A
W
 
A
T
 
R
F
 
L
G
 
D
P
 
E
E
 
Q
C
 
C
P
 
P
V
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
G
R
 
R
I
 
I
T
 
T
L
 
L
S
 
S
P
 
P
H
|
H
T
 
T
G
 
G
A
 
A
H
|
H
V
 
V
D
|
D
A
 
G
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
S
 
R
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
L
A
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
Q
V
 
V
S
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
V
Y
 
Y
I
 
M
G
 
G
P
 
P
C
 
C
R
 
R
V
 
V
L
 
I
H
 
H
C
 
C
L
 
I
D
 
G
S
 
A
G
 
N
R
 
P
L
 
L
V
 
V
Q
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
H
L
 
L
E
 
A
G
 
G
R
 
Q
L
 
L
A
 
D
D
 
D
L
 
L
P
 
P
E
 
S
R
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
T
Y
 
F
Q
 
E
Q
 
R
A
 
V
P
 
P
L
 
A
T
 
N
A
 
-
W
 
W
D
 
P
P
 
E
D
 
G
F
 
F
T
 
C
A
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
P
E
 
A
T
 
T
V
 
I
D
 
E
L
 
C
L
 
L
S
 
A
S
 
E
L
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
L
I
 
V
G
 
G
I
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
H
S
 
S
K
 
K
T
 
T
M
 
L
D
 
D
S
 
A
H
|
H
N
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
G
R
 
R
H
 
H
G
 
G
M
 
M
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
|
E
G
 
G
I
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
A
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
I
 
L
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
K
F
 
F
A
 
T
N
 
H
L
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
S
P
 
P
V
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
V
L
 
L
R
 
R
P
 
A
L
 
L

B4E9I9 Kynurenine formamidase; KFA; KFase; Arylformamidase; N-formylkynurenine formamidase; FKF; EC 3.5.1.9 from Burkholderia cenocepacia (strain ATCC BAA-245 / DSM 16553 / LMG 16656 / NCTC 13227 / J2315 / CF5610) (Burkholderia cepacia (strain J2315)) (see paper)
68% identity, 92% coverage: 8:211/221 of query aligns to 5:208/213 of B4E9I9

query
sites
B4E9I9
W
 
W
D
 
D
I
 
I
S
 
S
P
 
P
P
 
P
L
 
V
S
 
S
T
 
P
A
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
V
W
 
W
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
P
 
P
F
 
V
Q
 
A
E
 
V
E
 
E
R
 
R
V
 
V
W
 
W
T
 
R
F
 
M
G
 
E
P
 
A
E
 
G
C
 
S
P
 
P
V
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
A
R
 
R
I
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
P
 
P
H
|
H
T
 
T
G
 
G
A
 
A
H
|
H
V
 
C
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
S
 
D
A
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
A
V
 
V
S
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
T
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
P
 
P
C
 
C
R
 
R
V
 
V
L
 
I
H
 
H
C
 
C
L
 
I
D
 
G
S
 
A
G
 
A
R
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
R
P
 
P
E
 
A
Q
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
D
D
 
G
L
 
V
P
 
P
E
 
P
R
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
A
Q
 
R
A
 
A
P
 
A
L
 
V
T
 
E
A
 
Q
W
 
W
D
 
D
P
 
S
D
 
N
F
 
F
T
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
P
E
 
D
T
 
T
V
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
S
 
A
S
 
A
L
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
E
S
 
S
K
 
K
T
 
T
M
 
M
D
 
D
S
 
A
H
|
H
N
 
R
A
 
R
V
 
V
A
 
R
R
 
A
H
 
H
G
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
|
E
G
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
K
F
 
F
A
 
A
N
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
S
P
 
P
V
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
V
L
 
L
R
 
R
P
 
A
L
 
L

4cogA Crystal structure of kynurenine formamidase from burkholderia cenocepacia (see paper)
68% identity, 92% coverage: 8:211/221 of query aligns to 3:206/207 of 4cogA

query
sites
4cogA
W
 
W
D
 
D
I
 
I
S
 
S
P
 
P
P
 
P
L
 
V
S
 
S
T
 
P
A
 
A
T
 
T
P
 
P
T
 
V
W
 
W
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
P
 
P
F
 
V
Q
 
A
E
 
V
E
 
E
R
 
R
V
 
V
W
 
W
T
 
R
F
 
M
G
 
E
P
 
A
E
 
G
C
 
S
P
 
P
V
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
A
R
 
R
I
 
L
T
 
T
L
 
L
S
 
S
P
 
P
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
A
H
 
H
V
 
C
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Y
 
Y
S
x
D
A
 
A
D
|
D
G
 
G
A
 
A
A
 
P
I
 
I
G
 
G
D
 
A
V
 
V
S
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
T
Y
 
Y
I
 
L
G
 
G
P
 
P
C
 
C
R
 
R
V
 
V
L
 
I
H
 
H
C
 
C
L
 
I
D
 
G
S
 
A
G
 
A
R
 
P
L
 
V
V
 
V
Q
 
R
P
 
P
E
 
A
Q
 
D
L
 
V
E
 
E
G
 
A
R
 
A
L
 
L
A
 
D
D
 
G
L
 
V
P
 
P
E
 
P
R
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
A
Q
 
R
A
 
A
P
 
A
L
 
V
T
 
E
A
 
Q
W
 
W
D
 
D
P
 
S
D
 
N
F
 
F
T
 
C
A
 
A
V
 
V
A
 
A
K
 
P
E
 
D
T
 
T
V
 
V
D
 
D
L
 
L
L
 
L
S
 
A
S
 
A
L
 
H
G
 
G
V
 
V
R
 
K
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
I
D
 
D
T
 
T
P
 
P
S
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
E
S
 
S
K
 
K
T
 
T
M
 
M
D
 
D
S
 
A
H
|
H
N
 
R
A
 
R
V
 
V
A
 
R
R
 
A
H
 
H
G
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
I
L
 
L
E
|
E
G
 
G
I
 
I
V
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
P
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
K
F
 
F
A
 
A
N
 
T
L
 
L
D
 
D
A
 
A
S
 
S
P
 
P
V
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
V
L
 
L
R
 
R
P
 
A
L
 
L

Q81PP9 Kynurenine formamidase; KFA; KFase; Arylformamidase; N-formylkynurenine formamidase; FKF; EC 3.5.1.9 from Bacillus anthracis (see paper)
43% identity, 95% coverage: 3:211/221 of query aligns to 2:209/209 of Q81PP9

query
sites
Q81PP9
K
 
K
T
 
T
M
 
S
S
 
K
W
 
W
W
 
I
D
 
D
I
 
I
S
 
S
P
 
Q
P
 
P
L
 
L
S
 
N
T
 
N
A
 
D
T
 
I
P
 
A
T
 
T
W
|
W
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
P
 
P
F
 
F
Q
 
S
E
 
Y
E
 
E
R
 
V
V
 
L
W
 
W
T
 
S
F
 
K
G
 
E
P
 
E
E
 
S
C
 
G
P
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
G
R
 
K
I
 
L
T
 
T
L
 
M
S
 
S
P
 
I
H
|
H
T
 
T
G
 
G
A
 
T
H
|
H
V
 
I
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
F
H
 
H
Y
 
F
S
 
D
A
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
K
A
 
K
I
 
V
G
 
L
D
 
D
V
 
L
S
 
D
L
 
I
D
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
P
 
P
C
 
T
R
 
R
V
 
I
L
 
I
H
 
D
C
 
V
L
 
S
D
 
N
S
 
L
G
 
E
R
 
S
L
 
I
V
 
G
Q
 
K
P
 
K
E
 
E
Q
 
-
L
 
L
E
 
E
G
 
K
R
 
F
L
 
H
A
 
L
D
 
E
L
 
G
P
 
V
E
 
E
R
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
T
Y
 
S
Q
 
S
Q
 
H
A
 
G
P
 
K
L
 
A
T
 
N
A
 
E
W
 
F
D
 
P
P
 
D
D
 
I
F
 
I
T
 
P
A
 
H
V
 
L
A
 
R
K
 
A
E
 
D
T
 
I
V
 
A
D
 
P
L
 
F
L
 
L
S
 
S
S
 
E
L
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
V
D
 
D
T
 
V
P
 
P
S
 
S
L
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
L
Q
 
D
S
 
D
K
 
K
T
 
E
M
 
L
D
 
A
S
 
A
H
|
H
N
 
H
A
 
Q
V
 
L
A
 
F
R
 
K
H
 
H
G
 
S
M
 
I
A
 
H
I
 
I
L
 
L
E
|
E
G
 
N
I
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
H
V
 
V
P
 
A
E
 
D
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
A
F
 
L
A
 
S
N
 
D
L
 
A
D
 
D
A
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
V
L
 
I
R
 
R
P
 
P
L
 
I

4cz1A Crystal structure of kynurenine formamidase from bacillus anthracis complexed with 2-aminoacetophenone. (see paper)
42% identity, 94% coverage: 4:211/221 of query aligns to 1:207/207 of 4cz1A

query
sites
4cz1A
T
 
T
M
 
S
S
 
K
W
 
W
W
 
I
D
 
D
I
 
I
S
 
S
P
 
Q
P
 
P
L
 
L
S
 
N
T
 
N
A
 
D
T
 
I
P
 
A
T
 
T
W
|
W
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
P
 
P
F
 
F
Q
 
S
E
 
Y
E
 
E
R
 
V
V
 
L
W
 
W
T
 
S
F
 
K
G
 
E
P
 
E
E
 
S
C
 
G
P
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
G
R
 
K
I
 
L
T
 
T
L
 
M
S
 
S
P
 
I
H
|
H
T
 
T
G
 
G
A
 
T
H
|
H
V
 
I
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
F
H
|
H
Y
 
F
S
 
D
A
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
K
A
 
K
I
 
V
G
 
L
D
 
D
V
 
L
S
 
D
L
 
I
D
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
P
 
P
C
 
T
R
 
R
V
 
I
L
 
I
H
 
D
C
 
V
L
 
S
D
 
N
S
 
L
G
 
E
R
 
S
L
 
I
V
 
G
Q
 
K
P
 
K
E
 
E
Q
 
-
L
 
L
E
 
E
G
 
K
R
 
F
L
 
H
A
 
L
D
 
E
L
 
G
P
 
V
E
 
E
R
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
T
Y
 
S
Q
 
S
Q
 
H
A
 
G
P
 
K
L
 
A
T
 
N
A
 
E
W
 
F
D
 
P
P
 
D
D
 
I
F
 
I
T
 
P
A
 
H
V
 
L
A
 
R
K
 
A
E
 
D
T
 
I
V
 
A
D
 
P
L
 
F
L
 
L
S
 
S
S
 
E
L
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
V
D
 
D
T
 
V
P
 
P
S
 
S
L
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
L
Q
 
D
S
 
D
K
 
K
T
 
E
M
 
L
D
 
A
S
 
A
H
|
H
N
 
H
A
 
Q
V
 
L
A
 
F
R
 
K
H
 
H
G
 
S
M
 
I
A
 
H
I
 
I
L
 
L
E
|
E
G
 
N
I
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
H
V
 
V
P
 
A
E
 
D
G
 
G
D
 
D
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
A
F
 
L
A
 
S
N
 
D
L
 
A
D
 
D
A
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
V
L
 
I
R
 
R
P
 
P
L
 
I

4co9A Crystal structure of kynurenine formamidase from bacillus anthracis (see paper)
42% identity, 94% coverage: 4:211/221 of query aligns to 1:207/207 of 4co9A

query
sites
4co9A
T
 
T
M
 
S
S
 
K
W
 
W
W
 
I
D
 
D
I
 
I
S
 
S
P
 
Q
P
 
P
L
 
L
S
 
N
T
 
N
A
 
D
T
 
I
P
 
A
T
 
T
W
 
W
P
 
P
G
 
G
D
 
D
T
 
T
P
 
P
F
 
F
Q
 
S
E
 
Y
E
 
E
R
 
V
V
 
L
W
 
W
T
 
S
F
 
K
G
 
E
P
 
E
E
 
S
C
 
G
P
 
S
V
 
V
N
 
N
V
 
V
G
 
G
R
 
K
I
 
L
T
 
T
L
 
M
S
 
S
P
 
I
H
|
H
T
 
T
G
 
G
A
 
T
H
|
H
V
 
I
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
F
H
 
H
Y
 
F
S
 
D
A
 
N
D
 
D
G
 
G
A
 
K
A
 
K
I
 
V
G
 
L
D
 
D
V
 
L
S
 
D
L
 
I
D
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
I
 
V
G
 
G
P
 
P
C
 
T
R
 
R
V
 
I
L
 
I
H
 
D
C
 
V
L
 
S
D
 
N
S
 
L
G
 
E
R
 
S
L
 
I
V
 
G
Q
 
K
P
 
K
E
 
E
Q
 
-
L
 
L
E
 
E
G
 
K
R
 
F
L
 
H
A
 
L
D
 
E
L
 
G
P
 
V
E
 
E
R
 
R
V
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
R
T
 
T
Y
 
S
Q
 
S
Q
 
H
A
 
G
P
 
K
L
 
A
T
 
N
A
 
E
W
 
F
D
 
P
P
 
D
D
 
I
F
 
I
T
 
P
A
 
H
V
 
L
A
 
R
K
 
A
E
 
D
T
 
I
V
 
A
D
 
P
L
 
F
L
 
L
S
 
S
S
 
E
L
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
I
 
I
G
 
G
I
 
V
D
 
D
T
 
V
P
 
P
S
 
S
L
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
L
Q
 
D
S
 
D
K
 
K
T
 
E
M
 
L
D
 
A
S
 
A
H
|
H
N
 
H
A
 
Q
V
 
L
A
 
F
R
 
K
H
 
H
G
 
S
M
 
I
A
 
H
I
 
I
L
 
L
E
|
E
G
 
N
I
 
V
V
 
V
L
 
L
D
 
D
D
 
H
V
 
V
P
 
A
E
 
D
G
|
G
D
|
D
Y
 
Y
E
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
P
L
 
L
R
 
A
F
 
L
A
 
S
N
 
D
L
 
A
D
 
D
A
 
G
S
 
S
P
 
P
V
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
V
L
 
I
R
 
R
P
 
P
L
 
I

1r61A The structure of predicted metal-dependent hydrolase from bacillus stearothermophilus
28% identity, 92% coverage: 5:208/221 of query aligns to 3:202/205 of 1r61A

query
sites
1r61A
M
 
M
S
 
K
W
 
V
W
 
Y
D
 
D
I
 
V
S
 
T
P
 
A
P
 
P
L
 
I
S
 
Y
T
 
E
A
 
G
T
 
M
P
 
P
T
 
V
W
 
Y
P
 
K
G
 
N
D
 
K
T
 
P
P
 
E
F
 
K
Q
 
Q
E
 
P
E
 
K
R
 
R
V
 
T
W
 
T
T
 
I
F
 
-
G
 
-
P
 
T
E
 
N
C
 
G
P
 
Y
V
 
V
N
 
T
V
 
E
G
 
S
R
 
R
I
 
I
T
 
D
L
 
M
S
 
D
P
 
V
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
T
H
 
H
V
 
I
D
|
D
A
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
H
Y
 
M
S
 
V
A
 
E
D
 
G
G
 
G
A
 
A
A
 
T
I
 
F
G
 
E
D
 
T
V
 
I
S
 
P
L
 
L
D
 
N
V
 
D
Y
 
L
I
 
V
G
 
G
P
 
P
C
 
C
R
 
K
V
 
L
L
 
F
H
 
D
C
 
L
L
 
T
D
 
H
S
 
V
G
 
N
R
 
D
L
 
R
V
 
I
Q
 
T
P
 
K
E
 
D
Q
 
D
L
 
I
E
 
A
G
 
H
R
 
L
L
 
D
A
 
I
D
 
Q
L
 
E
P
 
G
E
 
D
R
 
F
V
 
V
L
 
L
L
 
F
R
 
K
T
 
T
Y
 
-
Q
 
K
Q
 
N
A
 
S
P
 
F
L
 
E
T
 
D
A
 
A
W
 
F
D
 
H
P
 
F
D
 
E
F
 
F
T
 
I
A
 
F
V
 
V
A
 
A
K
 
E
E
 
D
T
 
A
V
 
A
D
 
R
L
 
Y
L
 
L
S
 
A
S
 
D
L
 
K
G
 
Q
V
 
I
R
 
R
L
 
G
I
 
V
G
 
G
I
 
I
D
 
D
T
 
A
P
 
L
S
 
G
L
 
I
D
 
E
P
 
R
Q
 
A
Q
 
Q
S
 
-
K
 
E
T
 
G
M
 
H
D
 
P
S
 
T
H
|
H
N
 
K
A
 
T
V
 
L
A
 
F
R
 
S
H
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
I
I
 
I
L
 
I
E
|
E
G
 
G
I
 
L
V
 
R
L
 
L
D
 
K
D
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
E
G
 
G
D
 
R
Y
 
Y
E
 
F
L
 
M
I
 
V
A
 
A
L
 
A
P
 
P
L
 
L
R
 
K
F
 
L
A
 
V
N
 
G
L
 
T
D
 
D
A
 
A
S
 
A
P
 
P
V
 
A
R
 
R
A
 
V
I
 
L
L
 
L

Query Sequence

>AO353_05975 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_05975
MKKTMSWWDISPPLSTATPTWPGDTPFQEERVWTFGPECPVNVGRITLSPHTGAHVDAPL
HYSADGAAIGDVSLDVYIGPCRVLHCLDSGRLVQPEQLEGRLADLPERVLLRTYQQAPLT
AWDPDFTAVAKETVDLLSSLGVRLIGIDTPSLDPQQSKTMDSHNAVARHGMAILEGIVLD
DVPEGDYELIALPLRFANLDASPVRAILRPLNKPPLEEPAQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory