SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO353_07425 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_07425 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4iztA The e41q mutant of the amidase from nesterenkonia sp. An1 showing covalent addition of the acetamide moiety of fluoroacetamide at the active site cysteine
34% identity, 98% coverage: 1:258/264 of query aligns to 10:259/263 of 4iztA

query
sites
4iztA
M
 
M
R
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
L
Y
 
M
Q
 
Q
C
 
H
P
 
T
P
 
A
L
 
R
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
P
A
 
Q
G
 
H
N
 
N
L
 
L
Q
 
D
R
 
L
L
 
I
Q
 
D
K
 
D
L
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
R
A
 
A
-
 
S
-
 
E
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
L
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
 
Q
M
 
L
F
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
Y
|
Y
N
 
-
I
 
V
G
 
P
A
 
S
E
 
Q
A
 
I
V
 
C
G
 
A
A
 
Q
L
 
V
A
 
S
E
 
A
A
 
E
Q
 
Q
D
 
V
G
 
D
T
 
A
C
 
A
A
 
R
Q
 
S
Y
 
R
I
 
L
A
 
R
S
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
D
S
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
Y
 
W
G
 
S
Y
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
P
A
 
E
E
 
G
D
 
P
G
 
E
Q
 
Q
I
 
R
Y
 
G
N
 
I
A
 
T
V
 
A
Q
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
D
S
 
E
R
 
H
G
 
G
Q
 
E
R
 
V
L
 
L
A
 
A
N
 
S
Y
 
Y
R
 
Q
K
 
K
T
 
V
H
 
Q
L
 
L
F
x
Y
G
 
G
E
 
P
L
 
E
D
 
E
H
 
K
S
 
A
M
 
A
F
 
F
S
 
V
V
 
P
G
 
G
P
 
E
D
 
Q
E
 
P
F
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
L
E
 
S
L
 
W
N
 
G
G
 
G
W
 
R
K
 
Q
L
 
L
G
 
S
F
 
L
L
 
L
I
 
V
C
 
C
Y
 
Y
D
 
D
L
 
V
E
|
E
F
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
A
|
A
N
x
L
M
x
A
I
 
G
P
 
D
Y
x
E
D
 
T
F
 
S
I
 
V
A
 
P
D
 
G
V
 
I
T
 
L
V
 
L
R
 
P
S
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
G
C
 
I
Y
 
T
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
Y
 
H
C
 
C
G
 
G
H
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
G
I
 
L
H
 
V
Y
 
F
C
 
D
G
 
G
Q
 
G
S
 
S
S
 
V
I
 
V
A
 
V
A
 
G
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Q
R
 
P
I
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
V
D
 
E
E
 
P
A
 
G
L
 
L
I
 
L
V
 
V
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
-
M
 
-
V
 
V
D
 
D
S
 
L
R
 
P
A
 
D
A
 
A
N
 
D
R
 
-
Y
 
Y
F
 
L
L
 
Q
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
A
E
 
E
L
 
L
Y
 
H

4izuA The e41q mutant of the amidase from nesterenkonia sp. An1 showing the result of michael addition of acrylamide at the active site cysteine
34% identity, 93% coverage: 1:245/264 of query aligns to 2:247/254 of 4izuA

query
sites
4izuA
M
 
M
R
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
L
Y
 
M
Q
 
Q
C
 
H
P
 
T
P
 
A
L
 
R
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
x
P
A
x
Q
G
 
H
N
 
N
L
 
L
Q
 
D
R
 
L
L
 
I
Q
 
D
K
 
D
L
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
R
A
 
A
-
 
S
-
 
E
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
L
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
x
Q
M
 
L
F
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
Y
|
Y
N
 
-
I
 
V
G
 
P
A
 
S
E
 
Q
A
 
I
V
x
C
G
 
A
A
 
Q
L
 
V
A
 
S
E
 
A
A
 
E
Q
 
Q
D
 
V
G
 
D
T
x
A
C
x
A
A
 
R
Q
 
S
Y
x
R
I
 
L
A
 
R
S
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
D
S
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
Y
 
W
G
 
S
Y
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
P
A
 
E
E
 
G
D
x
P
G
x
E
Q
 
Q
I
 
R
Y
 
G
N
 
I
A
 
T
V
 
A
Q
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
D
S
 
E
R
 
H
G
 
G
Q
 
E
R
 
V
L
 
L
A
 
A
N
 
S
Y
 
Y
R
 
Q
K
|
K
T
 
V
H
 
Q
L
 
L
F
x
Y
G
 
G
E
 
P
L
 
E
D
x
E
H
 
K
S
 
A
M
x
A
F
 
F
S
 
V
V
 
P
G
 
G
P
 
E
D
 
Q
E
 
P
F
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
L
E
 
S
L
 
W
N
 
G
G
 
G
W
 
R
K
 
Q
L
 
L
G
 
S
F
 
L
L
 
L
I
 
V
C
|
C
Y
|
Y
D
 
D
L
 
V
E
 
E
F
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
A
|
A
N
 
L
M
 
A
I
 
G
P
 
D
Y
 
E
D
 
T
F
 
S
I
 
V
A
 
P
D
 
G
V
 
I
T
 
L
V
 
L
R
 
P
S
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
G
C
 
I
Y
 
T
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
Y
 
H
C
 
C
G
 
G
H
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
G
I
 
L
H
 
V
Y
 
F
C
 
D
G
 
G
Q
 
G
S
 
S
S
 
V
I
 
V
A
 
V
A
 
G
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Q
R
 
P
I
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
V
D
 
E
E
 
P
A
 
G
L
 
L
I
 
L
V
 
V
G
 
V
T
 
D
L
 
L
D
 
P
R
 
A
Q
 
D
L
 
Y
M
 
L
V
 
Q
D
 
D
S
 
R
R
 
R
A
 
A

5nybA A c145a mutant of nesterenkonia an1 amidase bound to adipamide
34% identity, 98% coverage: 1:258/264 of query aligns to 9:258/262 of 5nybA

query
sites
5nybA
M
 
M
R
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
L
Y
 
M
Q
 
Q
C
 
H
P
 
T
P
 
A
L
 
R
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
P
A
 
Q
G
 
H
N
 
N
L
 
L
Q
 
D
R
 
L
L
 
I
Q
 
D
K
 
D
L
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
R
A
 
A
-
 
S
-
 
E
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
L
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
|
E
M
 
L
F
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
Y
|
Y
N
 
-
I
 
V
G
 
P
A
 
S
E
 
Q
A
 
I
V
 
C
G
 
A
A
 
Q
L
 
V
A
 
S
E
 
A
A
 
E
Q
 
Q
D
 
V
G
 
D
T
 
A
C
 
A
A
 
R
Q
 
S
Y
 
R
I
 
L
A
 
R
S
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
D
S
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
Y
 
W
G
 
S
Y
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
P
A
 
E
E
 
G
D
 
P
G
 
E
Q
 
Q
I
 
R
Y
 
G
N
 
I
A
 
T
V
 
A
Q
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
D
S
 
E
R
 
H
G
 
G
Q
 
E
R
 
V
L
 
L
A
 
A
N
 
S
Y
 
Y
R
 
Q
K
|
K
T
 
V
H
 
Q
L
 
L
F
x
Y
G
 
G
E
 
P
L
 
E
D
x
E
H
 
K
S
 
A
M
 
A
F
 
F
S
 
V
V
 
P
G
 
G
P
 
E
D
 
Q
E
 
P
F
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
L
E
 
S
L
 
W
N
 
G
G
 
G
W
 
R
K
 
Q
L
 
L
G
 
S
F
 
L
L
 
L
I
 
V
C
x
A
Y
|
Y
D
 
D
L
 
V
E
|
E
F
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
A
|
A
N
x
L
M
 
A
I
 
G
P
 
D
Y
x
E
D
 
T
F
 
S
I
 
V
A
 
P
D
 
G
V
 
I
T
 
L
V
 
L
R
 
P
S
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
G
C
 
I
Y
 
T
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
Y
 
H
C
 
C
G
 
G
H
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
G
I
 
L
H
 
V
Y
 
F
C
 
D
G
 
G
Q
 
G
S
 
S
S
 
V
I
 
V
A
 
V
A
 
G
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Q
R
 
P
I
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
V
D
 
E
E
 
P
A
 
G
L
 
L
I
 
L
V
 
V
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
-
M
 
-
V
 
V
D
 
D
S
 
L
R
 
P
A
 
D
A
 
A
N
 
D
R
 
-
Y
 
Y
F
 
L
L
 
Q
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
A
E
 
E
L
 
L
Y
 
H

5ny7A A c145a mutant of nesterenkonia an1 amidase bound to nicotinamide
34% identity, 98% coverage: 1:258/264 of query aligns to 9:258/262 of 5ny7A

query
sites
5ny7A
M
 
M
R
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
L
Y
 
M
Q
 
Q
C
 
H
P
 
T
P
 
A
L
 
R
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
P
A
 
Q
G
 
H
N
 
N
L
 
L
Q
 
D
R
 
L
L
 
I
Q
 
D
K
 
D
L
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
R
A
 
A
-
 
S
-
 
E
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
L
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
|
E
M
 
L
F
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
Y
|
Y
N
 
-
I
 
V
G
 
P
A
 
S
E
 
Q
A
 
I
V
 
C
G
 
A
A
 
Q
L
 
V
A
 
S
E
 
A
A
 
E
Q
 
Q
D
 
V
G
 
D
T
 
A
C
 
A
A
x
R
Q
 
S
Y
 
R
I
 
L
A
 
R
S
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
D
S
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
Y
 
W
G
 
S
Y
 
L
P
 
P
E
 
G
R
x
P
A
 
E
E
 
G
D
 
P
G
 
E
Q
 
Q
I
 
R
Y
 
G
N
 
I
A
x
T
V
 
A
Q
x
E
L
 
L
I
 
A
D
 
D
S
 
E
R
 
H
G
 
G
Q
 
E
R
 
V
L
 
L
A
 
A
N
x
S
Y
 
Y
R
 
Q
K
|
K
T
 
V
H
 
Q
L
 
L
F
x
Y
G
 
G
E
 
P
L
 
E
D
x
E
H
 
K
S
 
A
M
 
A
F
 
F
S
 
V
V
 
P
G
 
G
P
 
E
D
 
Q
E
 
P
F
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
L
E
 
S
L
 
W
N
 
G
G
 
G
W
 
R
K
 
Q
L
 
L
G
 
S
F
 
L
L
 
L
I
 
V
C
x
A
Y
|
Y
D
 
D
L
 
V
E
|
E
F
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
A
|
A
N
x
L
M
 
A
I
 
G
P
 
D
Y
 
E
D
 
T
F
 
S
I
 
V
A
 
P
D
 
G
V
 
I
T
 
L
V
 
L
R
 
P
S
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
G
C
 
I
Y
 
T
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
Y
 
H
C
 
C
G
 
G
H
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
G
I
 
L
H
 
V
Y
 
F
C
 
D
G
 
G
Q
 
G
S
 
S
S
 
V
I
 
V
A
 
V
A
 
G
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Q
R
 
P
I
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
V
D
 
E
E
 
P
A
 
G
L
 
L
I
 
L
V
 
V
G
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
R
 
-
Q
 
-
L
 
-
M
 
-
V
 
V
D
 
D
S
 
L
R
 
P
A
 
D
A
 
A
N
 
D
R
 
-
Y
 
Y
F
 
L
L
 
Q
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
A
E
 
E
L
 
L
Y
 
H

Sites not aligning to the query:

5nycA A c145a mutant of nesterenkonia an1 amidase bound to propionitrile
34% identity, 93% coverage: 1:245/264 of query aligns to 9:254/261 of 5nycA

query
sites
5nycA
M
 
M
R
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
L
Y
 
M
Q
 
Q
C
 
H
P
 
T
P
 
A
L
 
R
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
x
P
A
x
Q
G
 
H
N
 
N
L
 
L
Q
 
D
R
 
L
L
 
I
Q
 
D
K
 
D
L
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
R
A
 
A
-
 
S
-
 
E
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
L
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
 
E
M
 
L
F
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
Y
 
Y
N
 
-
I
 
V
G
 
P
A
 
S
E
 
Q
A
 
I
V
 
C
G
 
A
A
 
Q
L
 
V
A
 
S
E
 
A
A
 
E
Q
 
Q
D
 
V
G
 
D
T
x
A
C
x
A
A
 
R
Q
 
S
Y
x
R
I
 
L
A
 
R
S
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
D
S
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
Y
 
W
G
 
S
Y
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
P
A
 
E
E
 
G
D
 
P
G
 
E
Q
 
Q
I
 
R
Y
 
G
N
 
I
A
 
T
V
 
A
Q
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
D
S
 
E
R
 
H
G
 
G
Q
 
E
R
 
V
L
 
L
A
 
A
N
 
S
Y
 
Y
R
 
Q
K
|
K
T
 
V
H
 
Q
L
 
L
F
x
Y
G
 
G
E
 
P
L
 
E
D
 
E
H
 
K
S
 
A
M
 
A
F
 
F
S
 
V
V
 
P
G
 
G
P
 
E
D
 
Q
E
 
P
F
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
L
E
 
S
L
 
W
N
 
G
G
 
G
W
 
R
K
 
Q
L
 
L
G
 
S
F
 
L
L
 
L
I
 
V
C
x
A
Y
|
Y
D
 
D
L
 
V
E
|
E
F
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
A
|
A
N
x
L
M
 
A
I
 
G
P
 
D
Y
 
E
D
 
T
F
 
S
I
 
V
A
 
P
D
 
G
V
 
I
T
 
L
V
 
L
R
 
P
S
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
G
C
 
I
Y
 
T
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
Y
 
H
C
 
C
G
 
G
H
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
G
I
 
L
H
 
V
Y
 
F
C
 
D
G
 
G
Q
 
G
S
 
S
S
 
V
I
 
V
A
 
V
A
 
G
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Q
R
 
P
I
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
V
D
 
E
E
 
P
A
 
G
L
 
L
I
 
L
V
 
V
G
 
V
T
 
D
L
 
L
D
 
P
R
 
A
Q
 
D
L
 
Y
M
 
L
V
 
Q
D
 
D
S
 
R
R
 
R
A
 
A

4izsA The c145a mutant of the amidase from nesterenkonia sp. An1 in complex with butyramide
34% identity, 93% coverage: 1:245/264 of query aligns to 9:254/261 of 4izsA

query
sites
4izsA
M
 
M
R
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
L
Y
 
M
Q
 
Q
C
 
H
P
 
T
P
 
A
L
 
R
P
 
P
L
 
L
D
 
D
V
 
P
A
 
Q
G
 
H
N
 
N
L
 
L
Q
 
D
R
 
L
L
 
I
Q
 
D
K
 
D
L
 
A
A
 
A
T
 
A
E
 
R
A
 
A
-
 
S
-
 
E
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
L
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
|
E
M
 
L
F
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
Y
|
Y
N
 
-
I
 
V
G
 
P
A
 
S
E
 
Q
A
 
I
V
 
C
G
 
A
A
 
Q
L
 
V
A
 
S
E
 
A
A
 
E
Q
 
Q
D
 
V
G
 
D
T
 
A
C
 
A
A
 
R
Q
 
S
Y
 
R
I
 
L
A
 
R
S
 
G
I
 
I
A
 
A
K
 
R
A
 
D
S
 
R
G
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
V
Y
 
W
G
 
S
Y
 
L
P
 
P
E
 
G
R
 
P
A
 
E
E
 
G
D
 
P
G
 
E
Q
 
Q
I
 
R
Y
 
G
N
 
I
A
 
T
V
 
A
Q
 
E
L
 
L
I
 
A
D
 
D
S
 
E
R
 
H
G
 
G
Q
 
E
R
 
V
L
 
L
A
 
A
N
 
S
Y
 
Y
R
 
Q
K
|
K
T
 
V
H
 
Q
L
 
L
F
x
Y
G
 
G
E
 
P
L
 
E
D
x
E
H
 
K
S
 
A
M
 
A
F
 
F
S
 
V
V
 
P
G
 
G
P
 
E
D
 
Q
E
 
P
F
 
P
P
 
P
L
 
V
V
 
L
E
 
S
L
 
W
N
 
G
G
 
G
W
 
R
K
 
Q
L
 
L
G
 
S
F
 
L
L
 
L
I
 
V
C
x
A
Y
|
Y
D
 
D
L
 
V
E
|
E
F
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
M
A
 
V
R
 
R
R
 
A
L
 
A
A
 
A
L
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
I
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
T
A
|
A
N
x
L
M
 
A
I
 
G
P
 
D
Y
 
E
D
 
T
F
 
S
I
 
V
A
 
P
D
 
G
V
 
I
T
 
L
V
 
L
R
 
P
S
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
V
E
 
E
N
 
N
Q
 
G
C
 
I
Y
 
T
V
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
N
 
N
Y
 
H
C
 
C
G
 
G
H
 
P
E
 
E
G
 
G
E
 
G
I
 
L
H
 
V
Y
 
F
C
 
D
G
 
G
Q
 
G
S
 
S
S
 
V
I
 
V
A
 
V
A
 
G
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Q
R
 
P
I
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
L
G
 
G
L
 
V
D
 
E
E
 
P
A
 
G
L
 
L
I
 
L
V
 
V
G
 
V
T
 
D
L
 
L
D
 
P
R
 
A
Q
 
D
L
 
Y
M
 
L
V
 
Q
D
 
D
S
 
R
R
 
R
A
 
A

3klcB Crystal structure of hyperthermophilic nitrilase (see paper)
35% identity, 98% coverage: 1:258/264 of query aligns to 1:259/261 of 3klcB

query
sites
3klcB
M
 
V
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
Y
Y
 
V
Q
 
Q
C
 
M
P
 
N
P
 
P
L
 
Q
P
 
I
L
 
L
D
 
E
V
 
P
A
 
D
G
 
K
N
 
N
L
 
Y
Q
 
S
R
 
K
L
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
I
T
 
K
E
 
E
A
 
A
-
 
S
-
 
K
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
M
 
L
F
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
I
 
F
G
 
E
A
 
T
-
 
R
E
 
E
A
 
E
V
 
V
G
 
F
A
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
-
 
I
Q
 
P
D
 
E
G
 
G
T
 
E
C
 
T
A
 
T
Q
 
T
Y
 
F
I
 
L
A
 
M
S
 
D
I
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
D
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
Y
I
 
I
V
 
V
Y
 
A
G
 
G
Y
 
T
P
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
G
Q
 
D
I
 
V
-
 
L
Y
 
Y
N
|
N
A
 
S
V
 
A
Q
 
V
L
 
V
I
 
V
D
 
G
S
 
P
R
 
R
G
 
G
Q
 
-
R
x
F
L
 
I
A
 
G
N
x
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
F
G
 
Y
E
 
R
L
 
-
D
x
E
H
 
K
S
 
F
M
 
F
F
 
F
S
 
E
V
 
P
G
 
G
P
 
D
D
 
L
E
 
G
F
 
F
P
 
R
L
 
V
V
 
F
E
 
D
L
 
L
N
 
G
G
 
F
W
 
M
K
 
K
L
 
V
G
 
G
F
 
V
L
 
M
I
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
L
 
W
E
 
F
F
 
F
P
 
P
E
|
E
N
 
S
A
 
A
R
 
R
R
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
V
I
 
I
L
 
A
V
 
H
P
 
P
T
 
A
A
x
N
N
x
L
M
 
V
I
x
M
P
 
P
Y
 
Y
D
 
-
F
 
-
I
 
-
A
 
A
D
 
P
V
 
R
T
 
A
V
 
M
R
 
P
S
 
I
R
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
E
N
 
N
Q
 
K
C
 
V
Y
 
Y
V
 
T
A
 
V
Y
 
T
A
 
A
N
 
D
Y
 
R
C
 
V
G
 
G
H
 
E
E
 
E
G
 
R
E
 
G
I
 
L
H
 
K
Y
 
F
C
 
I
G
 
G
Q
 
K
S
 
S
S
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
S
P
 
P
D
 
K
G
 
A
S
 
E
R
 
V
I
 
L
A
 
S
Q
 
M
A
 
A
G
 
S
-
 
E
L
 
T
D
 
E
E
 
E
A
 
E
L
 
V
I
 
G
V
 
V
G
 
A
T
 
E
L
 
I
D
 
D
R
 
L
Q
 
S
L
 
L
M
 
V
V
 
R
D
 
N
S
 
K
R
 
R
A
 
I
A
 
N
-
 
D
-
 
L
N
 
N
R
 
D
Y
 
I
F
 
F
L
 
K
D
 
D
R
|
R
R
 
R
P
x
E
E
 
E
L
 
Y
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

3klcA Crystal structure of hyperthermophilic nitrilase (see paper)
35% identity, 98% coverage: 1:258/264 of query aligns to 1:259/261 of 3klcA

query
sites
3klcA
M
 
V
R
x
K
V
 
V
A
 
A
L
 
Y
Y
 
V
Q
 
Q
C
 
M
P
 
N
P
 
P
L
 
Q
P
 
I
L
 
L
D
x
E
V
 
P
A
x
D
G
x
K
N
 
N
L
 
Y
Q
 
S
R
 
K
L
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
I
T
 
K
E
 
E
A
 
A
-
 
S
-
 
K
K
 
Q
G
|
G
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
M
 
L
F
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
I
 
F
G
 
E
A
 
T
-
 
R
E
 
E
A
 
E
V
 
V
G
 
F
A
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
-
 
I
Q
 
P
D
 
E
G
 
G
T
 
E
C
 
T
A
 
T
Q
 
T
Y
 
F
I
 
L
A
 
M
S
 
D
I
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
D
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
Y
I
 
I
V
 
V
Y
 
A
G
 
G
Y
 
T
P
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
G
Q
 
D
I
 
V
-
 
L
Y
 
Y
N
|
N
A
 
S
V
 
A
Q
 
V
L
 
V
I
 
V
D
x
G
S
x
P
R
|
R
G
 
G
Q
 
-
R
x
F
L
x
I
A
x
G
N
x
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
F
G
 
Y
E
 
R
L
 
-
D
x
E
H
 
K
S
 
F
M
 
F
F
 
F
S
 
E
V
 
P
G
 
G
P
 
D
D
 
L
E
 
G
F
 
F
P
x
R
L
x
V
V
 
F
E
 
D
L
 
L
N
 
G
G
 
F
W
 
M
K
 
K
L
 
V
G
 
G
F
 
V
L
 
M
I
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
L
 
W
E
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
S
A
 
A
R
 
R
R
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
x
K
G
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
V
I
 
I
L
 
A
V
 
H
P
 
P
T
 
A
A
x
N
N
x
L
M
 
V
I
x
M
P
 
P
Y
 
Y
D
 
-
F
 
-
I
 
-
A
 
A
D
 
P
V
 
R
T
 
A
V
 
M
R
 
P
S
 
I
R
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
E
N
 
N
Q
 
K
C
 
V
Y
 
Y
V
 
T
A
 
V
Y
 
T
A
 
A
N
 
D
Y
 
R
C
 
V
G
 
G
H
 
E
E
 
E
G
 
R
E
 
G
I
 
L
H
 
K
Y
 
F
C
 
I
G
 
G
Q
 
K
S
 
S
S
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
S
P
 
P
D
 
K
G
 
A
S
 
E
R
 
V
I
 
L
A
 
S
Q
 
M
A
 
A
G
 
S
-
 
E
L
 
T
D
 
E
E
 
E
A
 
E
L
 
V
I
 
G
V
 
V
G
 
A
T
 
E
L
 
I
D
 
D
R
 
L
Q
 
S
L
 
L
M
 
V
V
 
R
D
 
N
S
 
K
R
 
R
A
 
I
A
 
N
-
 
D
-
 
L
N
 
N
R
 
D
Y
 
I
F
 
F
L
 
K
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
E
E
 
E
L
 
Y
Y
 
Y

Q9UYV8 Nitrilase; PaNit; EC 3.5.5.1 from Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) (see paper)
35% identity, 98% coverage: 1:258/264 of query aligns to 2:260/262 of Q9UYV8

query
sites
Q9UYV8
M
 
V
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
Y
Y
 
V
Q
 
Q
C
 
M
P
 
N
P
 
P
L
 
Q
P
 
I
L
 
L
D
 
E
V
 
P
A
 
D
G
 
K
N
 
N
L
 
Y
Q
 
S
R
 
K
L
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
I
T
 
K
E
 
E
A
 
A
-
 
S
-
 
K
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
 
E
M
 
L
F
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
N
 
N
I
 
F
G
 
E
A
 
T
-
 
R
E
 
E
A
 
E
V
 
V
G
 
F
A
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
Q
A
 
K
-
 
I
Q
 
P
D
 
E
G
 
G
T
 
E
C
 
T
A
 
T
Q
 
T
Y
 
F
I
 
L
A
 
M
S
 
D
I
 
V
A
 
A
K
 
R
A
 
D
S
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
Y
I
 
I
V
 
V
Y
 
A
G
 
G
Y
 
T
P
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
-
E
 
-
D
 
D
G
 
G
Q
 
D
I
 
V
-
 
L
Y
 
Y
N
 
N
A
 
S
V
 
A
Q
 
V
L
 
V
I
 
V
D
 
G
S
 
P
R
 
R
G
 
G
Q
 
-
R
 
F
L
 
I
A
 
G
N
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
 
K
T
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
F
G
 
Y
E
 
R
L
 
-
D
 
E
H
 
K
S
 
F
M
 
F
F
 
F
S
 
E
V
 
P
G
 
G
P
 
D
D
 
L
E
 
G
F
 
F
P
 
R
L
 
V
V
 
F
E
 
D
L
 
L
N
 
G
G
 
F
W
 
M
K
 
K
L
 
V
G
 
G
F
 
V
L
 
M
I
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
L
 
W
E
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
S
A
 
A
R
 
R
R
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
D
L
 
V
I
 
I
L
 
A
V
 
H
P
 
P
T
 
A
A
 
N
N
 
L
M
 
V
I
 
M
P
 
P
Y
 
Y
D
 
-
F
 
-
I
 
-
A
 
A
D
 
P
V
 
R
T
 
A
V
 
M
R
 
P
S
 
I
R
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
E
N
 
N
Q
 
K
C
 
V
Y
 
Y
V
 
T
A
 
V
Y
 
T
A
 
A
N
 
D
Y
 
R
C
 
V
G
 
G
H
 
E
E
 
E
G
 
R
E
 
G
I
 
L
H
 
K
Y
 
F
C
 
I
G
 
G
Q
 
K
S
 
S
S
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
S
P
 
P
D
 
K
G
 
A
S
 
E
R
 
V
I
 
L
A
 
S
Q
 
M
A
 
A
G
 
S
-
 
E
L
 
T
D
 
E
E
 
E
A
 
E
L
 
V
I
 
G
V
 
V
G
 
A
T
 
E
L
 
I
D
 
D
R
 
L
Q
 
Y
L
 
L
M
 
V
V
 
R
D
 
N
S
 
K
R
 
R
A
 
I
A
 
N
-
 
D
-
 
L
N
 
N
R
 
D
Y
 
I
F
 
F
L
 
K
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
E
E
 
E
L
 
Y
Y
 
Y

6ypaB The c146a variant of an amidase from pyrococcus horikoshii with bound glutaramide
33% identity, 98% coverage: 1:258/264 of query aligns to 9:267/269 of 6ypaB

query
sites
6ypaB
M
 
V
R
 
K
V
 
V
A
 
G
L
 
Y
Y
 
I
Q
 
Q
C
 
M
P
 
E
P
 
P
L
 
K
P
 
I
L
 
L
D
 
E
V
 
L
A
 
D
G
 
K
N
 
N
L
 
Y
Q
 
S
R
 
K
L
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
I
T
 
K
E
 
E
A
 
A
-
 
S
-
 
K
K
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
L
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
M
 
L
F
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
Y
|
Y
N
 
N
I
 
F
G
 
E
A
 
S
-
 
R
-
 
E
E
 
E
A
 
V
V
 
F
G
 
D
A
 
V
L
 
A
A
 
Q
E
 
Q
A
 
I
Q
 
P
D
 
E
G
 
G
T
 
E
C
 
T
A
 
T
Q
 
T
Y
 
F
I
 
L
A
 
M
S
 
E
I
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
E
S
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
I
 
I
V
 
V
Y
 
A
G
 
G
Y
 
T
P
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
S
E
 
G
D
 
N
G
 
-
Q
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
N
 
N
A
 
S
V
 
A
Q
 
V
L
 
V
I
 
V
D
 
G
S
 
P
R
 
R
G
 
G
Q
 
Y
R
 
-
L
 
I
A
 
G
N
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
I
H
 
H
L
 
L
F
|
F
G
 
Y
E
 
R
L
 
-
D
x
E
H
 
K
S
 
V
M
 
F
F
 
F
S
 
E
V
 
P
G
 
G
P
 
D
D
 
L
E
 
G
F
 
F
P
 
K
L
 
V
V
 
F
E
 
D
L
 
I
N
 
G
G
 
F
W
 
A
K
 
K
L
 
V
G
 
G
F
 
V
L
 
M
I
 
I
C
x
A
Y
x
F
D
 
D
L
x
W
E
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
S
A
 
A
R
 
R
R
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
I
L
 
A
V
 
H
P
 
P
T
 
A
A
x
N
N
x
L
M
x
V
I
x
M
P
 
P
Y
 
Y
D
 
-
F
 
-
I
 
-
A
 
A
D
 
P
V
 
R
T
 
A
V
 
M
R
 
P
S
 
I
R
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
E
N
 
N
Q
 
R
C
 
V
Y
 
Y
V
 
T
A
 
I
Y
 
T
A
 
A
N
 
D
Y
 
R
C
 
V
G
 
G
H
 
E
E
 
E
G
 
R
E
 
G
I
 
L
H
 
K
Y
 
F
C
 
I
G
 
G
Q
 
K
S
 
S
S
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
S
P
 
P
D
 
K
G
 
A
S
 
E
R
 
V
I
 
L
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
S
-
 
E
L
 
T
D
 
E
E
 
E
A
 
E
L
 
I
I
 
G
V
 
V
G
 
V
T
 
E
L
 
I
D
 
D
R
 
L
Q
 
N
L
 
L
M
 
A
V
 
R
D
 
N
S
 
K
R
 
R
A
 
L
-
 
N
-
 
D
A
 
M
N
 
N
R
 
D
Y
 
I
F
 
F
L
 
K
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
E
E
 
E
L
 
Y
Y
 
Y

7ovgA The c146a variant of an amidase from pyrococcus horikoshii with bound acetamide (see paper)
33% identity, 98% coverage: 1:258/264 of query aligns to 3:261/263 of 7ovgA

query
sites
7ovgA
M
 
V
R
 
K
V
 
V
A
 
G
L
 
Y
Y
 
I
Q
 
Q
C
 
M
P
 
E
P
 
P
L
 
K
P
 
I
L
 
L
D
 
E
V
 
L
A
 
D
G
 
K
N
 
N
L
 
Y
Q
 
S
R
 
K
L
 
A
Q
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
I
T
 
K
E
 
E
A
 
A
-
 
S
-
 
K
K
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
L
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
M
 
L
F
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
Y
|
Y
N
 
N
I
 
F
G
 
E
A
 
S
-
 
R
-
 
E
E
 
E
A
 
V
V
 
F
G
 
D
A
 
V
L
 
A
A
 
Q
E
 
Q
A
 
I
Q
 
P
D
 
E
G
 
G
T
 
E
C
 
T
A
 
T
Q
 
T
Y
 
F
I
 
L
A
 
M
S
 
E
I
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
E
S
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
Y
I
 
I
V
 
V
Y
 
A
G
 
G
Y
 
T
P
 
A
E
 
E
R
 
K
A
 
S
E
 
G
D
 
N
G
 
-
Q
 
Y
I
 
L
Y
 
Y
N
 
N
A
 
S
V
 
A
Q
 
V
L
 
V
I
 
V
D
 
G
S
 
P
R
 
R
G
 
G
Q
 
Y
R
 
-
L
 
I
A
 
G
N
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
I
H
 
H
L
 
L
F
|
F
G
 
Y
E
 
R
L
 
-
D
x
E
H
 
K
S
 
V
M
 
F
F
 
F
S
 
E
V
 
P
G
 
G
P
 
D
D
 
L
E
 
G
F
 
F
P
 
K
L
 
V
V
 
F
E
 
D
L
 
I
N
 
G
G
 
F
W
 
A
K
 
K
L
 
V
G
 
G
F
 
V
L
 
M
I
 
I
C
x
A
Y
x
F
D
 
D
L
 
W
E
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
S
A
 
A
R
 
R
R
 
T
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
K
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
I
L
 
A
V
 
H
P
 
P
T
 
A
A
x
N
N
 
L
M
 
V
I
 
M
P
 
P
Y
 
Y
D
 
-
F
 
-
I
 
-
A
 
A
D
 
P
V
 
R
T
 
A
V
 
M
R
 
P
S
 
I
R
 
R
A
 
A
F
 
L
E
 
E
N
 
N
Q
 
R
C
 
V
Y
 
Y
V
 
T
A
 
I
Y
 
T
A
 
A
N
 
D
Y
 
R
C
 
V
G
 
G
H
 
E
E
 
E
G
 
R
E
 
G
I
 
L
H
 
K
Y
 
F
C
 
I
G
 
G
Q
 
K
S
 
S
S
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
S
P
 
P
D
 
K
G
 
A
S
 
E
R
 
V
I
 
L
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
S
-
 
E
L
 
T
D
 
E
E
 
E
A
 
E
L
 
I
I
 
G
V
 
V
G
 
V
T
 
E
L
 
I
D
 
D
R
 
L
Q
 
N
L
 
L
M
 
A
V
 
R
D
 
N
S
 
K
R
 
R
A
 
L
-
 
N
-
 
D
A
 
M
N
 
N
R
 
D
Y
 
I
F
 
F
L
 
K
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
E
E
 
E
L
 
Y
Y
 
Y

Q9NQR4 Omega-amidase NIT2; Nitrilase homolog 2; EC 3.5.1.3 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
30% identity, 93% coverage: 18:263/264 of query aligns to 20:275/276 of Q9NQR4

query
sites
Q9NQR4
N
 
N
L
 
V
Q
 
T
R
 
R
L
 
A
Q
 
C
K
 
S
L
 
F
A
 
I
T
 
R
E
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
T
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
K
L
 
I
L
 
V
V
 
S
F
 
L
P
 
P
E
|
E
M
 
C
F
 
F
L
 
N
T
 
S
G
 
P
Y
 
Y
N
 
-
I
 
-
G
 
G
A
 
A
E
 
K
A
 
Y
V
 
F
G
 
P
A
 
E
L
 
Y
A
 
A
E
 
E
A
 
K
Q
 
I
D
 
P
G
 
G
T
 
E
C
 
S
A
 
T
Q
 
Q
Y
 
K
I
 
L
A
 
S
S
 
E
I
 
V
A
 
A
K
 
K
A
 
E
S
 
C
G
 
S
I
 
I
A
 
Y
I
 
L
V
 
I
Y
 
G
G
 
G
Y
 
S
P
 
I
E
 
P
R
 
E
A
 
E
E
 
D
D
 
A
G
 
G
Q
 
K
I
 
L
Y
 
Y
N
 
N
A
 
T
V
 
C
Q
 
A
L
 
V
I
 
F
D
 
G
S
 
P
R
 
D
G
 
G
Q
 
T
R
 
L
L
 
L
A
 
A
N
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
I
H
 
H
L
 
L
F
|
F
-
x
D
-
x
I
-
x
D
-
x
V
-
x
P
G
|
G
E
x
K
L
x
I
-
x
T
-
x
F
-
x
Q
D
x
E
H
 
S
S
 
K
M
 
T
F
 
L
S
 
S
V
 
P
G
 
G
P
 
-
D
 
D
E
 
S
F
 
F
P
 
S
L
 
T
V
 
F
E
 
D
L
 
T
N
 
P
G
 
Y
W
 
C
K
 
R
L
 
V
G
 
G
F
 
L
L
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
 
Y
D
 
D
L
 
M
E
 
R
F
 
F
P
 
A
E
 
E
N
 
L
A
 
A
R
 
Q
R
 
I
L
 
Y
A
 
A
L
 
Q
A
 
R
G
 
G
A
 
C
E
 
Q
L
 
L
I
 
L
L
 
V
V
 
Y
P
 
P
T
 
G
A
 
A
-
 
F
N
 
N
M
 
L
I
 
T
P
 
T
Y
 
G
D
 
P
F
 
A
I
 
H
A
 
W
D
 
E
V
 
L
T
 
L
V
 
Q
R
 
R
S
 
S
R
 
R
A
 
A
F
 
V
E
 
D
N
 
N
Q
 
Q
C
 
V
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
Y
 
T
A
 
A
N
 
S
Y
 
P
C
 
A
G
 
R
H
 
D
E
 
D
G
 
K
E
 
A
I
 
S
H
 
Y
Y
 
V
C
 
A
-
 
W
G
 
G
Q
 
H
S
 
S
S
 
T
I
 
V
A
 
V
A
 
N
P
 
P
D
 
W
G
 
G
S
 
E
R
x
V
I
 
L
A
 
A
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
T
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
I
I
 
V
V
 
Y
G
 
S
T
 
D
L
 
I
D
 
D
R
 
L
Q
 
K
L
 
K
M
 
L
V
 
A
D
 
E
S
 
I
R
 
R
A
 
Q
A
 
Q
N
 
I
R
 
P
Y
 
V
F
 
F
L
 
R
D
 
Q
R
 
K
R
 
R
P
 
S
E
 
D
L
 
L
Y
 
Y
G
 
A
-
 
V
E
 
E
L
 
M
N
 
K
K
 
K

5h8jB Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) in complex with cadaverine (see paper)
29% identity, 94% coverage: 14:261/264 of query aligns to 17:287/297 of 5h8jB

query
sites
5h8jB
D
 
D
V
 
V
A
 
S
G
 
T
N
 
N
L
 
V
Q
 
T
R
 
T
L
 
A
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
-
 
V
-
 
R
A
 
A
T
 
A
E
 
H
A
 
K
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
N
L
 
I
L
 
V
V
 
L
F
 
I
P
 
Q
E
|
E
M
 
L
F
 
F
L
 
E
T
 
G
G
 
Y
Y
 
Y
N
 
F
I
 
C
G
 
Q
A
 
A
E
 
Q
A
 
R
V
 
E
G
 
D
A
 
F
L
 
I
A
 
Q
E
 
R
A
 
A
Q
 
K
-
 
P
-
 
Y
-
 
K
D
 
D
G
 
H
T
 
P
C
 
T
A
 
I
Q
 
M
Y
 
R
I
 
L
A
 
Q
S
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
S
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
V
I
 
I
V
 
P
Y
 
V
G
 
S
Y
 
F
P
 
F
E
 
E
R
 
E
A
 
A
E
 
N
D
 
N
G
 
A
Q
 
H
I
 
-
Y
 
Y
N
|
N
A
 
S
V
 
I
Q
 
A
L
 
I
I
 
I
D
 
D
S
 
A
R
 
D
G
 
G
Q
 
T
R
 
D
L
 
L
A
 
G
N
 
I
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
S
H
 
H
L
 
I
F
x
P
-
 
D
-
 
G
-
 
P
G
 
G
E
x
Y
L
 
E
D
x
E
H
 
K
S
 
F
M
 
Y
F
 
F
S
 
N
V
 
P
G
 
G
P
 
D
D
 
T
E
 
G
F
 
F
P
 
K
L
 
V
V
 
F
E
 
Q
L
 
T
N
 
K
G
 
Y
W
 
A
K
 
K
L
 
I
G
 
G
F
 
V
L
 
A
I
 
I
C
|
C
Y
x
W
D
 
D
L
 
Q
E
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
A
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
L
L
 
F
V
 
Y
P
 
P
T
 
T
A
|
A
-
x
I
N
 
G
M
 
S
I
x
E
P
 
P
Y
 
H
D
 
D
F
 
Q
I
 
S
A
 
I
D
 
D
V
 
S
-
 
R
-
 
D
-
 
H
-
 
W
-
 
K
-
 
R
T
 
V
V
 
M
R
 
Q
S
 
G
R
 
H
A
 
A
F
 
G
E
 
A
N
 
N
Q
 
L
C
 
V
Y
 
P
V
 
L
A
 
V
Y
 
A
A
 
S
N
 
N
Y
 
R
C
 
I
G
 
G
H
 
N
E
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
K
G
 
S
E
 
E
I
 
I
H
 
K
Y
 
F
C
 
Y
G
 
G
Q
 
N
S
 
S
S
 
F
I
 
I
A
 
A
A
 
G
P
 
P
D
 
T
G
 
G
S
 
E
R
 
I
I
 
V
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
-
 
D
G
 
D
L
 
K
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
V
I
 
L
V
 
I
G
 
A
T
 
E
L
 
F
D
 
N
R
 
L
Q
 
D
L
 
K
M
 
I
V
 
K
D
 
S
S
 
M
R
 
R
A
 
H
A
 
C
N
 
W
R
 
G
Y
 
V
F
 
F
L
 
R
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
D
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
E
 
V
L
 
L

5h8iC Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) in complex with n-(dihydroxymethyl)putrescine (see paper)
29% identity, 94% coverage: 14:261/264 of query aligns to 21:291/301 of 5h8iC

query
sites
5h8iC
D
 
D
V
 
V
A
 
S
G
 
T
N
 
N
L
 
V
Q
 
T
R
 
T
L
 
A
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
-
 
V
-
 
R
A
 
A
T
 
A
E
 
H
A
 
K
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
N
L
 
I
L
 
V
V
 
L
F
 
I
P
 
Q
E
|
E
M
 
L
F
 
F
L
 
E
T
 
G
G
 
Y
Y
|
Y
N
 
F
I
 
C
G
 
Q
A
 
A
E
 
Q
A
 
R
V
 
E
G
 
D
A
 
F
L
 
I
A
 
Q
E
 
R
A
 
A
Q
 
K
-
 
P
-
 
Y
-
 
K
D
 
D
G
 
H
T
 
P
C
 
T
A
 
I
Q
 
M
Y
 
R
I
 
L
A
 
Q
S
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
S
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
V
I
 
I
V
 
P
Y
 
V
G
 
S
Y
 
F
P
 
F
E
 
E
R
 
E
A
 
A
E
 
N
D
 
N
G
 
A
Q
 
H
I
 
-
Y
 
Y
N
|
N
A
 
S
V
 
I
Q
 
A
L
 
I
I
 
I
D
 
D
S
 
A
R
 
D
G
 
G
Q
 
T
R
 
D
L
 
L
A
 
G
N
 
I
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
S
H
 
H
L
 
I
F
x
P
-
 
D
-
 
G
-
 
P
G
 
G
E
x
Y
L
 
E
D
x
E
H
 
K
S
 
F
M
 
Y
F
 
F
S
 
N
V
 
P
G
 
G
P
 
D
D
 
T
E
 
G
F
 
F
P
 
K
L
 
V
V
 
F
E
 
Q
L
 
T
N
 
K
G
 
Y
W
 
A
K
 
K
L
 
I
G
 
G
F
 
V
L
 
A
I
 
I
C
|
C
Y
x
W
D
 
D
L
 
Q
E
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
A
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
L
L
 
F
V
 
Y
P
 
P
T
 
T
A
|
A
-
x
I
N
 
G
M
 
S
I
x
E
P
 
P
Y
 
H
D
 
D
F
 
Q
I
 
S
A
 
I
D
 
D
V
 
S
-
 
R
-
 
D
-
 
H
-
 
W
-
 
K
-
 
R
T
 
V
V
 
M
R
 
Q
S
 
G
R
 
H
A
 
A
F
 
G
E
 
A
N
 
N
Q
 
L
C
 
V
Y
 
P
V
 
L
A
 
V
Y
 
A
A
 
S
N
 
N
Y
 
R
C
 
I
G
 
G
H
 
N
E
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
K
G
 
S
E
 
E
I
 
I
H
 
K
Y
 
F
C
 
Y
G
 
G
Q
 
N
S
 
S
S
 
F
I
 
I
A
 
A
A
 
G
P
 
P
D
 
T
G
 
G
S
 
E
R
 
I
I
 
V
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
-
 
D
G
 
D
L
 
K
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
V
I
 
L
V
 
I
G
 
A
T
 
E
L
 
F
D
 
N
R
 
L
Q
 
D
L
 
K
M
 
I
V
 
K
D
 
S
S
 
M
R
 
R
A
 
H
A
 
C
N
 
W
R
 
G
Y
 
V
F
 
F
L
 
R
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
D
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
E
 
V
L
 
L

5h8lB Crystal structure of medicago truncatula n-carbamoylputrescine amidohydrolase (mtcpa) c158s mutant in complex with putrescine (see paper)
29% identity, 94% coverage: 14:261/264 of query aligns to 18:288/298 of 5h8lB

query
sites
5h8lB
D
 
D
V
 
V
A
 
S
G
 
T
N
 
N
L
 
V
Q
 
T
R
 
T
L
 
A
Q
 
E
K
 
R
L
 
L
-
 
V
-
 
R
A
 
A
T
 
A
E
 
H
A
 
K
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
N
L
 
I
L
 
V
V
 
L
F
 
I
P
 
Q
E
|
E
M
 
L
F
 
F
L
 
E
T
 
G
G
 
Y
Y
 
Y
N
 
F
I
 
C
G
 
Q
A
 
A
E
 
Q
A
 
R
V
 
E
G
 
D
A
 
F
L
 
I
A
 
Q
E
 
R
A
 
A
Q
 
K
-
 
P
-
 
Y
-
 
K
D
 
D
G
 
H
T
 
P
C
 
T
A
 
I
Q
 
M
Y
 
R
I
 
L
A
 
Q
S
 
K
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
E
S
 
L
G
 
G
I
 
V
A
 
V
I
 
I
V
 
P
Y
 
V
G
 
S
Y
 
F
P
 
F
E
 
E
R
 
E
A
 
A
E
 
N
D
 
N
G
 
A
Q
 
H
I
 
-
Y
 
Y
N
|
N
A
 
S
V
 
I
Q
 
A
L
 
I
I
 
I
D
 
D
S
 
A
R
 
D
G
 
G
Q
 
T
R
 
D
L
 
L
A
 
G
N
 
I
Y
 
Y
R
 
R
K
|
K
T
 
S
H
 
H
L
 
I
F
x
P
-
 
D
-
 
G
-
 
P
G
 
G
E
x
Y
L
 
E
D
x
E
H
 
K
S
 
F
M
 
Y
F
 
F
S
 
N
V
 
P
G
 
G
P
 
D
D
 
T
E
 
G
F
 
F
P
 
K
L
 
V
V
 
F
E
 
Q
L
 
T
N
 
K
G
 
Y
W
 
A
K
 
K
L
 
I
G
 
G
F
 
V
L
 
A
I
 
I
C
x
S
Y
x
W
D
 
D
L
 
Q
E
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
E
N
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
A
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
I
I
 
L
L
 
F
V
 
Y
P
 
P
T
 
T
A
|
A
-
x
I
N
 
G
M
 
S
I
x
E
P
 
P
Y
 
H
D
 
D
F
 
Q
I
 
S
A
 
I
D
 
D
V
 
S
-
 
R
-
 
D
-
 
H
-
 
W
-
 
K
-
 
R
T
 
V
V
 
M
R
 
Q
S
 
G
R
 
H
A
 
A
F
 
G
E
 
A
N
 
N
Q
 
L
C
 
V
Y
 
P
V
 
L
A
 
V
Y
 
A
A
 
S
N
 
N
Y
 
R
C
 
I
G
 
G
H
 
N
E
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
T
-
 
E
-
 
H
-
 
G
-
 
K
G
 
S
E
 
E
I
 
I
H
 
K
Y
 
F
C
 
Y
G
 
G
Q
 
N
S
 
S
S
 
F
I
 
I
A
 
A
A
 
G
P
 
P
D
 
T
G
 
G
S
 
E
R
 
I
I
 
V
A
 
S
Q
 
I
A
 
A
-
 
D
G
 
D
L
 
K
D
 
E
E
 
E
A
 
A
L
 
V
I
 
L
V
 
I
G
 
A
T
 
E
L
 
F
D
 
N
R
 
L
Q
 
D
L
 
K
M
 
I
V
 
K
D
 
S
S
 
M
R
 
R
A
 
H
A
 
C
N
 
W
R
 
G
Y
 
V
F
 
F
L
 
R
D
 
D
R
 
R
R
 
R
P
 
P
E
 
D
L
 
L
Y
 
Y
G
 
K
E
 
V
L
 
L

Q94JV5 Deaminated glutathione amidase, chloroplastic/cytosolic; dGSH amidase; Nitrilase-like protein 2; Protein nitrilase 1 homolog; AtNit1; Protein Nit1 homolog; EC 3.5.1.128 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
29% identity, 93% coverage: 1:245/264 of query aligns to 37:294/307 of Q94JV5

query
sites
Q94JV5
M
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
A
Y
 
A
Q
 
Q
C
 
M
P
 
T
P
 
S
L
 
V
P
 
N
L
 
-
D
 
D
V
 
L
A
 
M
G
 
T
N
 
N
L
 
F
Q
 
A
R
 
T
L
 
C
Q
 
S
K
 
R
L
 
L
A
 
V
T
 
Q
E
 
E
A
 
A
K
 
A
-
 
L
-
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
K
L
 
L
L
 
I
V
 
C
F
 
F
P
 
P
E
 
E
M
 
N
F
 
F
L
 
S
T
 
F
G
 
V
Y
 
G
N
 
D
I
 
K
G
 
E
A
 
G
E
 
E
A
 
S
V
 
V
G
 
-
A
 
K
L
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
P
Q
 
L
D
 
D
G
 
G
T
 
P
C
 
V
A
 
M
Q
 
E
Y
 
R
I
 
Y
A
 
C
S
 
S
I
 
L
A
 
A
K
 
R
A
 
D
S
 
S
G
 
N
I
 
I
A
 
W
I
 
L
V
 
S
Y
 
L
G
 
G
-
 
G
Y
 
F
P
 
Q
E
 
E
R
 
R
A
 
F
E
 
D
D
 
D
G
 
T
Q
 
H
I
 
L
Y
 
C
N
 
N
A
 
T
V
 
H
Q
 
V
L
 
V
I
 
I
D
 
D
S
 
D
R
 
A
G
 
G
Q
 
M
R
 
I
L
 
R
A
 
D
N
 
T
Y
 
Y
R
 
Q
K
 
K
T
 
M
H
 
H
L
 
L
F
 
F
-
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
G
G
 
S
E
 
S
L
 
Y
D
 
K
H
 
E
S
 
S
M
 
S
F
 
F
S
 
T
V
 
V
G
 
P
P
 
G
D
 
T
E
 
K
F
 
I
P
 
V
L
 
S
V
 
V
E
 
D
L
 
S
N
 
P
G
 
V
W
 
G
K
 
R
L
 
L
G
 
G
F
 
L
L
 
T
I
 
V
C
 
C
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
E
 
R
F
 
F
P
 
P
E
 
K
N
 
I
A
 
Y
R
 
Q
R
 
Q
L
 
L
A
 
R
L
 
F
-
 
E
A
 
Q
G
 
K
A
 
A
E
 
Q
L
 
V
I
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
T
 
S
A
 
A
-
 
F
N
 
T
M
 
K
I
 
V
P
 
T
Y
 
G
D
 
E
F
 
A
I
 
H
A
 
W
D
 
E
V
 
I
T
 
L
V
 
L
R
 
R
S
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
I
E
 
E
N
 
T
Q
 
Q
C
 
C
Y
 
Y
V
 
V
A
 
I
Y
 
A
A
 
A
N
 
A
Y
 
Q
C
 
A
G
 
G
-
 
K
H
 
H
E
 
N
G
 
E
E
 
K
I
 
R
H
 
E
Y
 
S
C
 
Y
G
 
G
Q
 
D
S
 
T
S
 
L
I
 
I
A
 
I
A
 
D
P
 
P
D
 
W
G
 
G
S
 
T
R
 
V
I
 
V
A
 
G
Q
 
R
A
 
L
G
 
P
-
 
D
-
 
R
L
 
V
D
 
S
E
 
T
A
 
G
L
 
I
I
 
V
V
 
V
G
 
A
T
 
D
L
 
I
D
 
D
R
 
F
Q
 
S
L
 
L
M
 
I
V
 
D
D
 
S
S
 
V
R
 
R
A
 
T

Sites not aligning to the query:

O25067 Aliphatic amidase; Acylamide amidohydrolase; EC 3.5.1.4 from Helicobacter pylori (strain ATCC 700392 / 26695) (Campylobacter pylori) (see paper)
30% identity, 81% coverage: 31:244/264 of query aligns to 51:266/339 of O25067

query
sites
O25067
G
 
G
A
 
L
D
 
D
L
 
L
L
 
I
V
 
I
F
 
F
P
 
P
E
 
E
-
 
Y
-
 
S
-
 
T
-
 
H
-
 
G
-
 
I
-
 
M
-
 
Y
-
 
D
-
 
R
-
 
Q
-
 
E
M
 
M
F
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
A
Y
 
A
N
 
S
I
 
V
G
 
P
A
 
G
E
 
E
A
 
E
V
 
T
G
 
A
A
 
I
L
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
-
D
 
-
G
 
-
T
 
-
C
 
C
A
 
K
Q
 
K
Y
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
N
K
 
K
A
 
V
S
 
W
G
 
G
I
 
V
A
 
F
I
 
S
V
 
L
Y
 
T
G
 
G
Y
 
E
P
 
K
E
 
H
R
 
E
A
 
Q
E
 
A
D
 
K
G
 
K
Q
 
N
I
 
P
Y
 
Y
N
 
N
A
 
T
V
 
L
Q
 
I
L
 
L
I
 
V
D
 
N
S
 
D
R
 
K
G
 
G
Q
 
E
R
 
I
L
 
V
A
 
Q
N
 
K
Y
 
Y
R
 
R
K
 
K
T
 
I
H
 
L
L
 
P
F
 
W
G
 
C
E
 
P
L
 
I
D
 
E
H
 
-
S
 
-
M
 
C
F
 
W
S
 
Y
V
 
P
G
 
G
P
 
D
D
 
K
E
 
T
F
 
Y
P
 
V
L
 
V
V
 
D
E
 
G
L
 
P
N
 
K
G
 
G
W
 
L
K
 
K
L
 
V
G
 
S
F
 
L
L
 
I
I
 
I
C
|
C
Y
 
D
D
|
D
L
 
G
E
 
N
F
 
Y
P
 
P
E
 
E
N
 
I
A
 
W
R
 
R
R
 
D
L
 
C
A
 
A
L
 
M
A
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
I
L
 
V
V
 
R
P
 
C
T
 
Q
A
 
G
N
 
Y
M
 
M
I
 
Y
P
 
P
Y
 
A
D
 
K
F
 
E
I
 
Q
A
 
Q
D
 
I
V
 
A
T
 
I
V
 
V
R
 
K
S
 
A
R
 
M
A
 
A
F
 
W
E
 
A
N
 
N
Q
 
Q
C
 
C
Y
 
Y
V
 
V
A
 
A
Y
 
V
A
 
A
N
 
N
Y
 
A
C
 
T
G
 
G
H
 
F
E
 
D
G
 
G
E
 
V
I
 
Y
H
 
S
Y
 
Y
C
 
F
G
 
G
Q
 
H
S
 
S
S
 
S
I
 
I
A
 
I
A
 
G
P
 
F
D
 
D
G
 
G
S
 
H
R
 
T
I
 
L
A
 
G
Q
 
E
A
 
C
G
 
G
L
 
E
D
 
E
E
 
E
-
 
N
A
 
G
L
 
L
I
 
Q
V
 
Y
G
 
A
T
 
Q
L
 
L
D
 
S
R
 
V
Q
 
Q
L
 
Q
M
 
I
V
 
R
D
 
D
S
 
A
R
 
R

Q44185 N-carbamoyl-D-amino acid hydrolase; D-N-alpha-carbamilase; EC 3.5.1.77 from Rhizobium radiobacter (Agrobacterium tumefaciens) (Agrobacterium radiobacter) (see paper)
27% identity, 91% coverage: 21:259/264 of query aligns to 27:299/304 of Q44185

query
sites
Q44185
R
 
R
L
 
L
Q
 
L
K
 
D
L
 
M
A
 
L
T
 
T
E
 
N
A
 
A
-
 
A
-
 
S
K
 
R
G
 
G
A
 
V
D
 
N
L
 
F
L
 
I
V
 
V
F
 
F
P
 
P