SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO353_12275 AO353_12275 proline-specific permease to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P15993 Aromatic amino acid transport protein AroP; Aromatic amino acid:H(+) symporter AroP; General aromatic amino acid permease; General aromatic transport system from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
45% identity, 97% coverage: 2:457/468 of query aligns to 5:456/457 of P15993

query
sites
P15993
Q
 
Q
K
 
Q
P
 
H
A
 
G
N
 
E
G
 
Q
L
 
L
K
 
K
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
K
A
 
N
R
 
R
H
 
H
I
 
I
R
 
Q
F
 
L
M
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
L
G
 
G
S
 
S
A
 
A
S
 
S
A
 
V
I
 
I
Q
 
Q
M
 
S
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
G
V
 
I
L
 
I
L
 
L
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
I
 
I
G
 
A
G
 
G
A
 
F
A
 
I
V
 
A
F
 
F
M
 
L
V
 
I
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
M
A
 
V
V
 
V
H
 
E
N
 
E
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
S
 
S
F
 
F
G
 
S
Q
 
H
Y
 
F
A
 
A
S
 
Y
T
 
K
Y
 
Y
L
 
W
G
 
G
P
 
S
M
 
F
A
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
A
L
 
S
G
 
G
W
 
W
T
 
N
Y
 
Y
A
 
W
F
 
V
E
 
L
M
x
Y
V
 
V
I
 
L
V
 
V
G
 
A
M
 
M
A
 
A
D
 
E
V
 
L
T
 
T
A
 
A
F
 
V
G
 
G
I
 
K
Y
 
Y
M
 
I
G
 
Q
F
 
F
W
 
W
F
 
Y
P
 
P
E
 
E
V
 
I
S
 
P
R
 
T
W
 
W
I
 
V
W
 
S
V
 
A
L
 
A
G
 
V
V
 
F
V
 
F
S
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
N
G
 
A
L
 
I
N
 
N
L
 
L
C
 
T
N
 
N
V
 
V
K
 
K
V
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
E
M
 
M
E
 
E
F
 
F
W
 
W
L
 
F
S
 
A
L
 
I
L
 
I
K
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
A
I
 
V
V
 
V
A
 
A
M
 
M
I
 
I
L
 
I
G
 
F
G
 
G
F
 
-
G
 
G
I
 
W
M
 
L
L
 
L
F
 
F
G
 
S
I
 
G
S
 
N
T
 
G
A
 
G
P
 
P
G
 
-
Q
 
Q
V
 
A
T
 
T
D
 
-
I
 
V
S
 
S
N
 
N
L
 
L
W
 
W
T
 
D
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
F
 
F
M
 
L
P
 
P
N
 
H
G
 
G
M
 
F
G
 
T
G
 
G
L
 
L
I
 
V
A
 
M
S
 
M
F
 
M
A
 
A
V
 
I
V
 
I
M
 
M
F
 
F
A
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
L
E
 
E
I
 
L
I
 
V
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
D
D
 
N
P
 
P
Q
 
E
H
 
Q
V
 
S
L
 
I
P
 
P
R
 
K
A
 
A
I
 
T
N
 
N
A
 
Q
V
 
V
P
 
I
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
I
F
 
F
Y
 
Y
V
 
I
L
 
G
T
 
S
M
 
L
L
 
A
V
 
V
L
 
L
M
 
L
S
 
S
I
 
L
F
 
M
P
 
P
W
 
W
Q
 
T
Q
 
R
I
 
V
G
 
T
S
 
A
Q
 
D
G
 
T
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
Q
 
L
I
 
I
F
 
F
D
 
H
K
 
E
L
 
L
G
 
G
I
 
D
S
 
T
S
 
F
A
 
V
A
 
A
T
 
N
I
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
S
A
 
V
I
 
Y
N
 
N
S
 
S
D
 
C
I
 
V
F
 
Y
G
 
C
A
 
N
G
 
S
R
 
R
M
 
M
M
 
L
F
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
H
 
N
A
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
A
F
 
L
A
 
A
H
 
S
L
 
V
S
 
D
R
 
K
N
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
W
 
V
M
 
N
T
 
T
V
 
I
V
 
L
V
 
V
M
 
S
S
 
A
V
 
L
A
 
V
L
 
T
L
 
A
L
 
L
G
 
C
V
 
V
L
 
L
L
 
I
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
I
 
A
P
 
P
E
 
E
N
 
S
V
 
A
F
 
F
L
 
G
L
 
L
I
 
L
A
 
M
S
 
A
I
 
L
A
 
V
T
 
V
F
 
S
A
 
A
T
 
L
V
 
V
W
 
I
V
 
N
W
 
W
L
 
A
M
 
M
I
 
I
L
 
S
F
 
L
T
 
A
Q
 
H
V
 
M
A
 
K
M
 
F
R
 
R
R
 
R
S
 
A
M
 
-
T
 
K
A
 
Q
E
 
E
Q
 
Q
V
 
G
A
 
V
Q
 
V
L
 
T
K
 
R
F
 
F
P
 
P
V
 
A
P
 
L
F
 
L
W
 
Y
P
 
P
Y
 
L
A
 
G
P
 
N
M
 
W
A
 
I
A
 
C
I
 
L
A
 
L
F
 
F
M
 
M
L
 
A
F
 
A
V
 
V
F
 
L
G
 
V
V
 
I
L
 
M
G
 
L
Y
 
M
F
 
T
P
 
P
D
 
G
T
 
M
Q
 
A
A
 
I
A
 
S
L
 
V
I
 
Y
V
 
L
G
 
I
V
 
P
V
 
V
W
 
W
I
 
L
V
 
I
L
 
V
L
 
L
V
 
G
L
 
I
A
 
G
Y
 
Y
L
 
L
M
 
F
W
 
K
V
 
E
K
 
K
P
 
T
A
 
A
A
 
K
G
 
A
Q
 
V
A
 
K
A
 
A

P24207 Phenylalanine-specific permease; Phenylalanine:H(+) symporter PheP from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
45% identity, 95% coverage: 2:445/468 of query aligns to 15:452/458 of P24207

query
sites
P24207
Q
 
Q
K
 
E
P
 
P
A
 
T
N
 
-
G
 
-
L
 
L
K
 
H
R
 
R
G
 
G
L
 
L
S
 
H
A
 
N
R
|
R
H
 
H
I
 
I
R
 
Q
F
 
L
M
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
L
G
 
G
S
 
I
A
 
G
S
 
P
A
 
A
I
 
I
Q
 
Q
M
 
M
A
 
A
G
 
G
P
|
P
A
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
A
 
G
Y
 
Y
L
 
G
I
 
V
G
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
I
V
 
A
F
 
F
M
 
L
V
 
I
M
 
M
R
 
R
A
 
Q
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
M
A
 
V
V
 
V
H
 
E
N
 
E
P
 
P
V
 
V
A
 
S
G
 
G
S
 
S
F
|
F
G
 
A
Q
 
H
Y
x
F
A
 
A
S
x
Y
T
 
K
Y
|
Y
L
x
W
G
 
G
P
 
P
M
x
F
A
 
A
G
 
G
F
|
F
I
 
L
L
 
S
G
 
G
W
|
W
T
 
N
Y
|
Y
A
x
W
F
 
V
E
 
M
M
x
F
V
 
V
I
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
M
A
 
A
D
x
E
V
 
L
T
 
T
A
 
A
F
 
A
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
M
 
M
G
 
Q
F
 
Y
W
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
D
V
 
V
S
 
P
R
 
T
W
 
W
I
 
I
W
 
W
V
 
A
L
 
A
G
 
A
V
 
F
V
 
F
S
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
N
G
 
A
L
 
V
N
 
N
L
 
L
C
 
V
N
 
N
V
 
V
K
 
R
V
 
L
F
 
Y
G
 
G
E
 
E
M
 
T
E
 
E
F
 
F
W
 
W
L
 
F
S
 
A
L
 
L
L
 
I
K
|
K
V
 
V
A
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
I
A
 
G
M
 
M
I
 
I
L
 
-
G
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
G
I
 
L
M
 
W
L
 
L
F
 
L
G
 
-
I
 
F
S
 
S
T
 
G
A
 
H
P
 
G
G
 
G
Q
 
E
V
 
K
T
 
A
D
 
S
I
 
I
S
 
D
N
 
N
L
 
L
W
 
W
T
 
R
Q
 
Y
G
 
G
G
 
G
F
 
F
M
 
F
P
 
A
N
 
T
G
 
G
M
 
W
G
 
N
G
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
L
S
 
S
F
 
L
A
 
A
V
 
V
V
 
I
M
 
M
F
 
F
A
 
S
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
L
E
|
E
I
 
L
I
 
I
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
K
 
R
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
H
 
K
V
 
S
L
 
I
P
 
P
R
 
K
A
 
A
I
 
V
N
 
N
A
 
Q
V
 
V
P
 
V
L
 
Y
R
|
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
V
 
I
L
 
G
T
 
S
M
 
L
L
 
V
V
 
V
L
 
L
M
 
L
S
 
A
I
 
L
F
 
Y
P
 
P
W
 
W
Q
 
V
Q
 
E
I
 
V
G
 
K
S
 
S
Q
 
N
G
 
S
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
Q
 
M
I
 
I
F
 
F
D
 
H
K
 
N
L
 
L
G
 
D
I
 
S
S
 
N
S
 
V
A
 
V
A
 
A
T
 
S
I
 
A
L
 
L
N
 
N
I
 
F
V
 
V
V
 
I
I
 
L
T
 
V
A
 
A
A
 
S
I
 
L
S
 
S
A
 
V
I
 
Y
N
 
N
S
 
S
D
 
G
I
 
V
F
 
Y
G
 
S
A
 
N
G
 
S
R
 
R
M
 
M
M
 
L
F
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
S
Q
 
V
Q
 
Q
G
 
G
H
 
N
A
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
F
F
 
L
A
 
T
H
 
R
L
 
V
S
 
S
R
 
R
N
 
R
G
 
G
V
 
V
P
|
P
W
 
I
M
 
N
T
 
S
V
 
L
V
 
M
V
 
L
M
 
S
S
 
G
V
 
A
A
 
I
L
 
T
L
 
S
L
 
L
G
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
I
N
 
N
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
P
 
P
E
 
Q
N
 
K
V
 
A
F
 
F
L
 
G
L
 
L
I
 
L
A
 
M
S
 
A
I
 
L
A
 
V
T
 
V
F
 
A
A
 
T
T
 
L
V
 
L
W
 
L
V
 
N
W
 
W
L
 
I
M
 
M
I
 
I
L
 
C
F
 
L
T
 
A
Q
 
H
V
 
L
A
 
R
M
 
F
R
 
R
R
 
A
S
 
A
M
 
M
T
 
R
A
 
-
E
 
R
Q
 
Q
V
 
G
A
 
R
Q
 
E
L
 
T
K
 
Q
F
 
F
P
 
K
V
 
A
P
 
L
F
 
L
W
 
Y
P
 
P
Y
 
F
A
 
G
P
 
N
M
 
Y
A
 
L
A
 
C
I
 
I
A
 
A
F
 
F
M
 
L
L
 
G
F
 
M
V
 
I
F
 
L
G
 
L
V
 
L
L
 
M
G
 
C
Y
 
T
F
 
M
P
 
D
D
 
D
T
 
M
Q
 
R
A
 
L
A
 
S
L
 
A
I
 
I
V
 
L
G
 
L
V
x
P
V
 
V
W
 
W
I
 
I
V
 
V
L
 
F
L
 
L
V
 
F
L
 
M
A
 
A
Y
 
F

P46349 Gamma-aminobutyric acid permease; GABA permease; 4-aminobutyrate permease; Gamma-aminobutyrate permease; Proline transporter GabP from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 1:457/468 of query aligns to 1:455/469 of P46349

query
sites
P46349
M
 
M
Q
 
N
K
 
Q
P
 
S
A
 
Q
N
 
S
G
 
G
L
 
L
K
 
K
R
 
K
G
 
E
L
 
L
S
 
K
A
 
T
R
 
R
H
 
H
I
 
M
R
 
T
F
 
M
M
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
A
S
 
G
A
 
V
I
 
I
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
V
G
|
G
S
 
S
A
 
G
S
 
S
A
 
V
I
 
I
Q
 
H
M
 
S
A
 
T
G
|
G
P
 
P
A
 
G
V
 
A
L
 
V
L
 
V
A
 
S
Y
 
Y
L
 
A
I
 
L
G
 
A
G
 
G
A
 
L
A
 
L
V
 
V
F
 
I
M
 
F
V
 
I
M
 
M
R
 
R
A
 
M
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
M
A
 
S
V
 
A
H
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
T
A
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
F
G
 
S
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
S
 
H
T
 
D
Y
 
A
L
 
I
G
 
G
P
 
P
M
 
W
A
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
T
L
 
I
G
 
G
W
 
W
T
 
L
Y
 
Y
A
 
W
F
 
F
E
 
F
M
 
W
V
 
V
I
 
I
V
 
V
G
 
I
M
 
A
A
 
I
D
 
E
V
 
A
T
 
I
A
 
A
F
 
G
G
 
A
I
 
G
Y
 
I
M
 
I
G
 
Q
F
 
Y
W
 
W
F
 
F
P
 
H
E
 
D
V
 
I
S
 
P
R
 
L
W
 
W
I
 
L
W
 
T
V
 
S
L
 
L
G
 
I
V
 
L
V
 
T
S
 
I
I
 
V
V
 
L
G
 
T
G
 
L
L
 
T
N
 
N
L
 
V
C
 
Y
N
 
S
V
 
V
K
 
K
V
 
S
F
 
F
G
 
G
E
 
E
M
 
F
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
L
 
F
S
 
S
L
 
L
L
 
I
K
 
K
V
 
V
A
 
V
A
 
T
I
 
I
V
 
I
A
 
A
M
 
F
I
 
L
L
 
I
G
 
V
G
 
G
F
 
F
G
 
A
I
 
-
M
 
F
L
 
I
F
 
F
G
 
G
I
 
F
S
 
-
T
 
-
A
 
A
P
 
P
G
 
G
-
 
S
Q
 
E
V
 
P
T
 
V
D
 
G
I
 
F
S
 
S
N
 
N
L
 
L
W
 
T
T
 
G
Q
 
K
G
 
G
G
 
G
F
 
F
M
 
F
P
 
P
N
 
E
G
 
G
M
 
I
G
 
S
G
 
S
L
 
V
I
 
L
A
 
L
S
 
G
F
 
I
A
 
V
V
 
V
V
 
V
M
 
I
F
 
F
A
 
S
F
 
F
G
 
M
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
I
I
 
V
G
 
A
V
 
I
T
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
T
K
 
S
D
 
N
P
 
P
Q
 
I
H
 
E
V
 
S
L
 
V
P
 
T
R
 
K
A
 
A
I
 
T
N
 
R
A
 
S
V
 
V
P
 
V
L
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
I
L
 
V
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
L
 
G
T
 
S
M
 
I
L
 
A
V
 
I
L
 
V
M
 
V
S
 
A
I
 
L
F
 
L
P
 
P
W
 
W
Q
 
N
Q
 
S
I
 
A
G
 
N
S
 
I
Q
 
L
G
 
E
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
Q
 
A
I
 
V
F
 
L
D
 
E
K
 
H
L
 
I
G
 
G
I
 
V
S
 
P
S
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
Q
I
 
I
L
 
M
N
 
N
I
 
F
V
 
I
V
 
V
I
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
L
S
 
S
A
 
C
I
 
L
N
 
N
S
 
S
D
x
G
I
 
L
F
 
Y
G
 
T
A
 
T
G
 
S
R
 
R
M
 
M
M
 
L
F
 
Y
G
 
S
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
Q
 
R
G
 
N
H
 
E
A
 
A
P
 
P
K
 
R
G
 
R
F
 
F
A
 
M
H
 
K
L
 
L
S
 
S
R
 
K
N
 
K
G
 
G
V
 
V
P
 
P
W
 
V
M
 
Q
T
 
A
V
 
I
V
 
V
V
 
A
M
x
G
S
 
T
V
 
F
A
x
F
L
 
S
L
 
Y
L
 
I
G
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
M
N
 
N
Y
 
Y
L
 
F
I
 
S
P
 
P
E
 
D
N
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
F
I
 
L
A
 
V
S
 
N
I
 
S
A
 
S
T
 
G
F
 
A
A
 
I
T
 
A
V
 
L
W
 
L
V
 
V
W
 
Y
L
 
L
M
 
V
I
 
I
L
 
A
F
 
V
T
 
S
Q
 
Q
V
 
L
A
 
K
M
 
M
R
 
R
R
 
K
S
 
K
M
 
L
T
 
E
A
 
K
E
 
T
Q
 
N
V
 
P
A
 
E
Q
 
A
L
 
L
K
 
K
F
 
I
P
 
K
V
 
M
-
 
W
-
 
L
-
 
F
P
 
P
F
 
F
W
 
L
P
 
T
Y
 
Y
A
 
L
P
 
T
M
 
I
A
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
C
F
x
G
M
 
I
L
 
L
F
 
V
V
 
S
F
 
M
G
 
A
V
 
F
L
 
I
G
 
D
Y
 
S
F
 
M
P
 
R
D
 
D
T
 
-
Q
 
-
A
 
E
A
 
L
L
 
L
I
 
L
V
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
I
W
 
T
I
 
G
V
 
I
L
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
-
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
M
 
V
W
 
F
V
 
R
K
 
K
P
 
R
A
 
K
A
 
V
G
 
S
Q
 
E
A
 
K
A
 
A

P25737 Lysine-specific permease LysP; Lysine transporter LysP; Trigger transporter LysP from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
36% identity, 88% coverage: 5:417/468 of query aligns to 10:431/489 of P25737

query
sites
P25737
A
 
A
N
 
P
G
 
G
L
 
L
K
 
R
R
 
R
G
 
E
L
 
L
S
 
K
A
 
A
R
 
R
H
 
H
I
 
L
R
 
T
F
 
M
M
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
S
 
G
A
 
S
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
V
G
 
A
S
 
S
A
 
G
S
 
A
A
 
T
I
 
I
Q
 
S
M
 
Q
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
G
-
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
S
Y
 
Y
L
 
M
I
 
L
G
 
I
G
 
G
A
 
L
A
 
M
V
 
V
F
 
Y
M
 
F
V
 
L
M
 
M
R
 
T
A
 
S
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
L
A
 
A
V
 
A
H
 
Y
N
 
M
P
 
P
V
 
V
A
 
S
G
 
G
S
 
S
F
 
F
G
 
A
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
G
S
 
Q
T
 
N
Y
 
Y
L
 
V
G
 
E
P
 
E
M
 
G
A
 
F
G
 
G
F
 
F
I
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
W
T
 
N
Y
|
Y
A
 
W
F
 
Y
E
 
N
M
x
W
V
 
A
I
 
V
V
 
T
G
 
I
M
 
A
A
 
V
D
 
D
V
 
L
T
 
V
A
 
A
F
 
A
G
 
Q
I
 
L
Y
 
V
M
 
M
G
 
S
F
 
W
W
 
W
F
 
F
P
 
P
E
 
D
V
 
T
S
 
P
R
 
G
W
 
W
I
 
I
W
 
W
V
 
S
L
 
A
G
 
L
V
 
F
V
 
L
S
 
G
I
 
V
V
 
I
G
 
F
G
 
L
L
 
L
N
 
N
L
 
Y
C
 
I
N
 
S
V
 
V
K
 
R
V
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
E
M
 
A
E
 
E
F
 
Y
W
 
W
L
 
F
S
 
S
L
 
L
L
 
I
K
|
K
V
 
V
A
 
T
A
 
T
I
 
V
V
 
I
A
 
V
M
 
F
I
 
I
L
 
I
G
 
V
G
 
G
F
 
V
G
 
-
I
 
L
M
 
M
L
 
I
F
 
I
G
 
G
I
 
I
S
 
F
T
 
K
A
 
G
P
 
-
G
 
A
Q
 
Q
V
 
P
T
 
A
D
 
G
I
 
W
S
 
S
N
 
N
L
 
-
W
 
W
T
 
T
Q
 
I
G
 
G
G
 
E
F
 
A
-
 
P
M
 
F
P
 
A
N
 
G
G
 
G
M
 
F
G
 
A
G
 
A
L
 
M
I
 
I
A
 
G
S
 
V
F
 
A
A
 
M
V
 
I
V
 
V
M
 
G
F
|
F
A
 
S
F
 
F
G
 
Q
G
 
G
I
 
T
E
|
E
I
 
L
I
 
I
G
 
G
V
 
I
T
 
A
A
 
A
G
 
G
E
|
E
A
 
S
K
 
E
D
 
D
P
 
P
Q
 
A
H
 
K
V
 
N
L
 
I
P
 
P
R
 
R
A
 
A
I
 
V
N
 
R
A
 
Q
V
 
V
P
 
F
L
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
T
 
A
M
 
I
L
 
L
V
 
I
L
 
I
M
 
S
S
 
L
I
 
I
F
 
I
P
 
P
W
 
Y
Q
 
T
Q
 
D
-
 
P
-
 
S
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
N
-
x
D
-
 
V
I
 
K
G
x
D
S
 
I
Q
 
S
G
 
V
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
T
Q
 
L
I
 
V
F
 
F
D
 
Q
K
 
H
L
 
A
G
 
G
I
 
L
S
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
A
T
 
A
I
 
V
L
 
M
N
 
N
I
 
A
V
 
V
V
 
I
I
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
V
I
 
L
S
 
S
A
 
A
I
 
G
N
 
N
S
 
S
D
 
G
I
 
M
F
 
Y
G
 
A
A
 
S
G
 
T
R
 
R
M
 
M
M
 
L
F
 
Y
G
 
T
L
 
L
A
 
A
Q
 
C
Q
 
D
G
 
G
H
 
K
A
 
A
P
 
P
K
 
R
G
 
I
F
 
F
A
 
A
H
 
K
L
 
L
S
 
S
R
 
R
N
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
W
 
R
M
 
N
T
 
A
V
 
L
V
 
Y
V
 
A
M
 
T
S
 
T
V
 
V
A
 
I
L
 
A
L
 
G
L
 
L
G
 
C
V
 
F
L
 
L
L
 
T
N
 
S
Y
 
M
L
 
F
I
 
G
P
 
N
E
 
Q
N
 
T
V
 
V
F
 
Y
L
 
L
L
 
W
I
 
L
A
 
L
S
 
N
I
 
T
A
 
S
T
 
G
F
 
M
A
 
T
T
 
G
V
 
F
W
 
I
V
 
A
W
 
W
L
 
L
M
 
G
I
 
I
L
 
A
F
 
I
T
 
S
Q
 
H
V
 
Y
A
 
R
M
 
F
R
 
R
R
 
R
S
 
G
-
 
Y
-
 
V
M
 
L
T
 
Q
A
 
G
E
 
H
Q
 
D
V
 
I
A
 
N
Q
 
D
L
 
L
K
 
P
F
 
Y
P
 
R
V
 
S
P
 
G
F
 
F
W
 
F
P
 
P
Y
 
L
A
 
G
P
 
P
M
 
I
A
 
F
A
 
A
I
 
F
A
 
I
F
 
L
M
 
C
L
 
L
F
 
I
V
 
I

Sites not aligning to the query:

P04817 Arginine permease CAN1; Canavanine resistance protein 1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
31% identity, 84% coverage: 8:399/468 of query aligns to 84:489/590 of P04817

query
sites
P04817
L
 
V
K
 
K
R
 
R
G
 
E
L
 
L
S
 
K
A
 
Q
R
 
R
H
 
H
I
 
I
R
 
G
F
 
M
M
 
I
A
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
G
A
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
I
G
 
G
S
 
L
A
 
S
S
 
T
A
x
P
I
 
L
Q
 
T
M
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
P
-
 
V
A
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
I
 
F
G
 
M
G
 
G
A
 
S
A
 
L
V
 
A
F
 
Y
M
 
S
V
 
V
M
 
T
R
 
Q
A
 
S
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
M
A
 
A
V
 
T
H
 
F
N
 
I
P
|
P
V
|
V
A
 
T
G
 
S
S
|
S
F
 
F
G
 
T
Q
 
V
Y
 
F
A
 
S
S
 
Q
T
 
R
Y
 
F
L
 
L
G
 
S
P
 
P
M
 
A
A
 
F
G
 
G
F
 
A
I
 
A
L
 
N
G
 
G
W
 
Y
T
 
M
Y
|
Y
A
 
W
F
 
F
E
 
S
M
 
W
V
 
A
I
 
I
V
 
T
G
 
F
M
 
A
A
 
L
D
 
E
V
 
L
T
 
S
A
 
V
F
 
V
G
 
G
I
 
Q
Y
 
V
M
 
I
G
 
Q
F
 
F
W
 
W
F
 
T
P
 
Y
E
 
K
V
 
V
S
 
P
R
 
L
W
 
A
I
 
A
W
 
W
V
 
I
L
 
S
G
 
I
V
 
F
V
 
W
S
 
V
I
 
I
V
 
I
G
 
T
G
 
I
L
 
M
N
 
N
L
 
L
C
 
F
N
 
P
V
 
V
K
 
K
V
 
Y
F
 
Y
G
 
G
E
 
E
M
 
F
E
 
E
F
 
F
W
 
W
L
 
V
S
 
A
L
 
S
L
 
I
K
 
K
V
 
V
A
 
L
A
 
A
I
 
I
V
 
I
A
 
G
M
 
F
I
 
L
L
 
I
G
 
Y
G
 
C
F
 
F
G
 
-
I
 
C
M
 
M
L
 
V
F
 
C
G
 
G
I
 
A
S
 
G
T
 
V
A
 
T
-
 
G
-
 
P
-
 
V
-
 
G
-
 
F
-
 
R
-
 
Y
-
 
W
-
 
R
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
A
-
 
W
-
 
G
P
 
P
G
 
G
Q
 
I
V
 
I
T
 
S
D
 
K
I
 
D
S
 
K
N
 
N
L
 
-
W
 
-
T
 
-
Q
 
E
G
 
G
G
 
R
F
 
F
M
 
L
P
 
-
N
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
G
L
 
W
I
 
V
A
 
S
S
 
S
F
 
L
A
 
I
V
 
N
V
 
A
M
 
A
F
 
F
A
 
T
F
 
F
G
 
Q
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
L
I
 
V
G
 
G
V
 
I
T
 
T
A
 
A
G
|
G
E
 
E
A
 
A
K
 
A
D
 
N
P
|
P
Q
 
R
H
 
K
V
 
S
L
 
V
P
 
P
R
 
R
A
 
A
I
 
I
N
 
K
A
 
K
V
 
V
P
 
V
L
 
F
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
T
F
 
F
Y
 
Y
V
 
I
L
 
G
T
 
S
M
 
L
L
 
L
V
 
F
L
 
I
M
 
G
S
 
L
I
 
L
F
 
V
P
 
P
W
 
Y
Q
 
N
-
 
D
-
 
P
-
 
K
-
 
L
-
 
T
Q
 
Q
I
 
S
G
x
T
S
|
S
-
x
Y
-
 
V
Q
 
S
G
 
T
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
I
Q
 
I
I
 
A
F
 
I
D
 
E
K
 
N
L
 
S
G
 
G
I
 
T
S
 
K
S
 
V
A
 
L
A
 
P
T
 
H
I
 
I
L
 
F
N
 
N
I
 
A
V
 
V
V
 
I
I
 
L
T
 
T
A
 
T
A
 
I
I
 
I
S
 
S
A
 
A
I
 
A
N
 
N
S
 
S
D
 
N
I
 
I
F
 
Y
G
 
V
A
 
G
G
 
S
R
 
R
M
 
I
M
 
L
F
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
S
Q
 
K
Q
 
N
G
 
K
H
 
L
A
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
F
F
 
L
A
 
S
H
 
R
L
 
T
S
 
T
R
 
K
N
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
W
 
Y
M
 
I
T
 
A
V
 
V
V
 
F
V
 
V
M
 
T
S
 
A
V
 
A
A
 
F
L
 
G
L
 
A
L
 
L
G
 
A
V
 
Y
L
 
M
L
 
E
N
 
T
Y
 
S
L
 
T
I
 
G
P
 
G
E
 
D
N
 
K
V
 
V
F
 
F
L
 
E
L
x
W
I
 
L
A
 
L
S
 
N
I
 
I
A
 
T
T
 
G
F
 
V
A
 
A
T
 
G
V
x
F
W
 
F
V
 
A
W
 
W
L
 
L
M
 
F
I
 
I
L
 
S
F
 
I
T
 
S
Q
 
H
V
 
I
A
 
R
M
 
F
R
 
M
R
 
Q
S
 
A
M
 
L
T
 
K
A
 
Y
E
 
R
Q
 
G
V
 
I
A
 
S
Q
 
R
L
 
D
K
 
E
F
 
L
P
 
P

Q9URZ4 Cationic amino acid transporter 1 from Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast) (see paper)
30% identity, 85% coverage: 3:401/468 of query aligns to 75:484/587 of Q9URZ4

query
sites
Q9URZ4
K
 
E
P
 
D
A
 
G
N
 
T
G
 
A
L
 
L
K
 
K
R
 
R
G
 
S
L
 
L
S
 
K
A
 
S
R
 
R
H
 
H
I
 
M
R
 
Q
F
 
M
M
 
I
A
 
S
L
 
I
G
 
G
S
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
Y
Y
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
G
S
 
S
A
 
S
I
 
L
Q
 
A
M
 
D
A
 
G
G
 
G
P
 
P
A
 
A
-
 
S
V
 
V
L
 
I
L
 
I
A
 
N
Y
 
Y
L
 
S
I
 
L
G
 
I
G
 
G
A
 
I
A
 
M
V
 
M
F
 
F
M
 
F
V
 
I
M
 
V
R
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
M
A
 
A
V
 
V
H
 
A
N
 
Y
P
 
P
V
 
V
A
 
A
G
 
G
S
 
G
F
 
F
G
 
N
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
S
 
T
T
 
R
Y
 
F
L
 
I
G
 
D
P
 
P
M
 
A
A
 
W
G
 
G
F
 
F
I
 
A
L
 
V
G
 
S
W
 
W
T
 
N
Y
 
Y
A
 
F
F
 
I
E
 
N
M
 
Y
V
 
F
I
 
V
V
 
T
G
 
F
M
 
P
A
 
L
D
 
E
V
 
L
T
 
T
A
 
T
F
 
C
G
 
A
I
 
I
Y
 
T
M
 
F
G
 
R
F
 
Y
W
 
W
F
 
T
P
 
D
-
 
I
E
 
N
V
 
S
S
 
A
R
 
A
W
 
W
I
 
I
W
 
S
V
 
I
L
 
F
G
 
L
V
 
V
V
 
V
S
 
I
I
 
I
V
 
I
G
 
-
G
 
-
L
 
V
N
 
N
L
 
L
C
 
F
N
 
G
V
 
V
K
 
R
V
 
A
F
 
Y
G
 
G
E
 
E
M
 
V
E
 
E
F
 
F
W
 
I
L
 
L
S
 
S
L
 
T
L
 
V
K
 
K
V
 
V
A
 
V
A
 
A
I
 
T
V
 
-
A
 
-
M
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
F
G
 
G
I
 
F
M
 
I
L
 
I
F
 
L
G
 
A
I
 
I
S
 
I
T
 
I
A
 
N
P
 
C
G
 
G
Q
 
G
V
 
V
T
 
P
D
 
T
I
 
D
S
 
H
N
 
R
L
 
G
W
 
Y
T
 
I
Q
 
G
G
 
G
G
 
S
F
 
I
M
 
I
P
 
K
-
 
H
-
 
K
-
 
P
-
 
F
-
 
R
N
 
H
G
 
G
M
 
F
G
 
K
G
 
G
L
 
F
I
 
C
A
 
S
S
 
V
F
 
F
A
 
T
V
 
T
V
 
A
M
 
A
F
 
F
A
 
S
F
 
F
G
 
S
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
V
I
 
I
G
 
G
V
 
L
T
 
A
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
V
K
 
D
D
 
N
P
 
P
Q
 
Q
H
 
K
V
 
A
L
 
L
P
 
P
R
 
H
A
 
A
I
 
V
N
 
K
A
 
Q
V
 
V
P
 
F
L
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
A
L
 
I
F
 
F
Y
 
Y
V
 
V
L
 
V
T
 
S
M
 
L
L
 
I
-
 
L
-
 
I
-
 
G
V
 
L
L
 
L
M
 
I
S
 
S
I
 
P
F
 
D
P
 
D
W
 
P
Q
 
N
Q
 
L
I
 
M
G
 
G
S
 
N
Q
 
G
G
 
S
-
 
T
-
 
S
-
 
V
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
Q
 
L
I
 
A
F
 
I
D
 
K
K
 
E
L
 
A
G
 
N
I
 
I
S
 
K
S
 
G
A
 
L
A
 
P
T
 
S
I
 
V
L
 
F
N
 
N
I
 
A
V
 
V
V
 
I
I
 
I
T
 
I
A
 
S
A
 
V
I
 
V
S
 
S
A
 
V
I
 
T
N
 
N
S
 
S
D
 
S
I
 
T
F
 
Y
G
 
T
A
 
A
G
 
G
R
 
R
M
 
T
M
 
L
F
 
H
G
 
G
L
 
M
A
 
A
Q
 
N
Q
 
L
G
 
K
H
 
Q
A
 
A
P
 
P
K
 
S
G
 
F
F
 
F
A
 
K
H
 
Y
L
 
T
S
 
D
R
 
R
N
 
L
G
 
G
V
 
R
P
 
P
W
 
L
M
 
L
T
 
A
V
 
M
V
 
I
V
 
V
M
 
V
S
 
-
V
 
-
A
 
-
L
 
L
L
 
L
L
 
F
G
 
G
V
 
-
L
 
F
L
 
F
N
 
A
Y
 
Y
L
 
I
-
 
N
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
K
-
 
N
-
 
G
-
 
N
-
 
D
I
 
V
P
 
S
E
 
D
N
 
T
V
 
V
F
 
F
L
 
N
L
 
W
I
 
L
A
 
L
S
 
A
I
 
L
A
 
S
T
 
G
F
 
L
A
 
S
T
 
N
V
 
F
W
 
F
V
 
T
W
 
W
L
 
G
M
 
S
I
 
I
L
 
C
F
 
L
T
 
C
Q
 
H
V
 
I
A
 
I
M
 
F
R
 
R
R
 
L
S
 
A
M
 
F
T
 
K
A
 
K
E
 
Q
-
 
G
-
 
H
Q
 
S
V
 
L
A
 
K
Q
 
E
L
 
L
K
 
G
F
 
F
P
 
V
V
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P19145 General amino-acid permease GAP1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see 3 papers)
29% identity, 84% coverage: 8:401/468 of query aligns to 86:493/602 of P19145

query
sites
P19145
L
 
L
K
 
K
R
 
H
G
 
H
L
 
L
S
 
K
A
 
N
R
 
R
H
 
H
I
 
L
R
 
Q
F
 
M
M
 
I
A
 
A
L
 
I
G
 
G
S
 
G
A
 
A
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
L
Y
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
G
S
 
T
A
 
A
I
 
L
Q
 
R
M
 
T
A
 
G
G
 
G
P
 
P
A
 
A
V
 
S
L
 
L
L
 
L
-
 
I
A
 
G
Y
 
W
L
 
G
I
 
S
G
 
T
G
 
G
A
 
T
A
 
M
V
 
I
F
 
Y
M
 
A
V
 
M
M
 
V
R
 
M
A
 
A
L
 
L
G
 
G
E
 
E
M
 
L
A
 
A
V
 
V
H
 
I
N
 
F
P
 
P
V
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
G
F
 
F
G
 
T
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
S
 
T
T
 
R
Y
 
F
L
 
I
G
 
D
P
 
E
M
 
S
A
 
F
G
 
G
F
 
Y
I
 
A
L
 
N
G
 
N
W
 
F
T
 
N
Y
 
Y
A
 
M
F
 
L
E
 
Q
M
 
W
V
 
L
I
 
V
V
 
V
G
 
L
M
 
P
A
 
L
D
 
E
V
 
I
T
 
V
A
 
S
F
 
A
G
 
S
I
 
I
Y
 
T
M
 
V
G
 
N
F
 
F
W
 
W
-
 
G
-
 
T
F
 
D
P
 
P
E
 
K
V
 
Y
S
 
R
R
 
D
W
 
G
I
 
F
W
 
V
V
 
A
L
 
L
G
 
F
V
 
W
V
 
L
S
 
A
I
 
I
V
 
V
G
 
I
G
 
-
L
 
I
N
 
N
L
 
M
C
 
F
N
 
G
V
 
V
K
 
K
V
 
G
F
 
Y
G
 
G
E
 
E
M
 
A
E
 
E
F
 
F
W
 
V
L
 
F
S
 
S
L
 
F
L
 
I
K
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
T
I
 
V
V
 
V
A
 
G
M
 
F
I
 
I
L
 
I
G
 
-
G
 
-
F
 
L
G
 
G
I
 
I
M
 
I
L
 
L
F
 
N
G
 
C
I
 
G
S
 
G
T
 
G
A
 
P
P
 
T
G
 
G
Q
 
G
V
 
Y
T
 
I
D
 
G
I
 
G
S
 
K
N
 
Y
L
 
W
W
 
H
T
 
D
Q
 
P
G
 
G
G
 
A
F
 
F
M
 
A
P
 
G
N
 
D
G
 
T
M
 
P
G
 
G
-
 
A
-
 
K
-
 
F
-
 
K
G
 
G
L
 
V
I
 
C
A
 
S
S
 
V
F
 
F
A
 
V
V
 
T
V
 
A
M
 
A
F
 
F
A
 
S
F
 
F
G
x
A
G
 
G
I
 
S
E
 
E
I
 
L
I
 
V
G
 
G
V
 
L
T
 
A
A
 
A
G
 
S
E
 
E
A
 
S
K
 
V
D
 
E
P
 
P
Q
 
R
H
 
K
V
 
S
L
 
V
P
 
P
R
 
K
A
 
A
I
 
A
N
 
K
A
 
Q
V
 
V
P
 
F
L
 
W
R
 
R
I
 
I
L
 
T
L
 
L
F
 
F
Y
 
Y
V
 
I
L
 
L
T
 
S
M
 
L
L
 
L
V
 
M
L
 
I
M
 
G
S
 
L
I
 
L
F
 
V
P
 
P
W
 
Y
Q
 
N
Q
 
D
-
 
K
-
 
S
-
 
L
-
 
I
-
 
G
-
 
A
-
 
S
-
 
S
I
 
V
G
 
D
S
 
A
Q
 
A
G
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
V
Q
 
I
I
 
A
F
 
I
D
 
K
K
 
T
L
 
H
G
 
G
I
 
I
S
 
K
S
 
G
A
 
L
A
 
P
T
 
S
I
 
V
L
 
V
N
 
N
I
 
V
V
 
V
V
 
I
I
 
L
T
 
I
A
 
A
A
 
V
I
 
L
S
 
S
A
 
V
I
 
G
N
 
N
S
 
S
D
 
A
I
 
I
F
 
Y
G
 
A
A
 
C
G
 
S
R
 
R
M
 
T
M
 
M
F
 
V
G
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
Q
 
Q
G
 
R
H
 
F
A
 
L
P
 
P
K
 
E
G
 
I
F
 
F
A
 
S
H
 
Y
L
 
V
S
 
D
R
 
R
N
 
K
G
 
G
V
 
R
P
 
P
W
 
L
M
 
V
T
 
G
V
 
I
V
 
A
V
 
V
M
 
T
S
 
S
V
 
A
A
 
F
L
 
G
L
 
L
L
 
I
G
 
A
V
 
F
L
 
V
L
 
A
N
 
A
Y
 
S
L
 
K
I
 
K
P
 
E
E
 
G
N
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
N
L
 
W
I
 
L
A
 
L
S
 
A
I
 
L
A
 
S
T
 
G
F
 
L
A
 
S
T
 
S
V
 
L
W
 
F
V
 
T
W
 
W
L
 
G
M
 
G
I
 
I
L
 
C
F
 
I
T
 
C
Q
 
H
V
 
I
A
 
R
M
 
F
R
 
R
R
 
K
S
 
A
M
 
L
T
 
A
A
 
A
E
 
Q
-
 
G
-
 
R
Q
 
G
V
 
L
A
 
D
Q
 
E
L
 
L
K
 
S
F
 
F
P
 
K
V
 
S
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P48813 High-affinity glutamine permease from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
26% identity, 83% coverage: 2:391/468 of query aligns to 140:540/663 of P48813

query
sites
P48813
Q
 
Q
K
 
K
P
 
Q
A
 
E
N
 
N
G
 
-
L
 
L
K
 
K
R
 
K
G
 
S
L
 
I
S
 
K
A
 
P
R
 
R
H
 
H
I
 
T
R
 
V
F
 
M
M
 
M
A
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
T
A
 
G
I
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
L
 
L
F
 
L
Y
 
V
G
 
G
S
 
N
A
 
S
S
 
K
A
 
V
I
 
L
Q
 
N
M
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
G
-
 
G
V
 
L
L
 
I
L
 
I
A
 
G
Y
 
Y
L
 
A
I
 
I
G
 
M
G
 
G
A
 
S
A
 
C
V
 
V
F
 
Y
M
 
C
V
 
I
M
 
I
R
 
Q
A
 
A
L
 
C
G
 
G
E
 
E
M
 
L
A
 
A
V
 
V
-
 
I
H
 
Y
N
 
S
P
 
D
V
 
L
A
 
I
G
 
G
S
 
G
F
 
F
G
 
N
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
P
S
 
L
T
 
F
Y
 
L
L
 
V
G
 
D
P
 
P
M
 
A
A
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
S
L
 
V
G
 
A
W
 
W
T
 
L
Y
 
F
A
 
C
F
 
L
E
 
Q
M
 
W
V
 
L
I
 
C
V
 
V
G
 
C
M
 
P
A
 
L
D
 
E
V
 
L
T
 
V
A
 
T
F
 
A
G
 
S
I
 
M
Y
 
T
M
 
I
G
 
K
F
 
Y
W
 
W
F
 
T
P
 
T
E
 
S
V
 
V
S
 
N
R
 
P
W
 
D
I
 
V
W
 
F
V
 
V
L
 
V
G
 
I
V
 
F
V
 
Y
S
 
V
I
 
L
V
 
I
G
 
V
G
 
V
L
 
I
N
 
N
L
 
V
C
 
F
N
 
G
V
 
A
K
 
K
V
 
G
F
 
Y
G
 
A
E
 
E
M
 
A
E
 
D
F
 
F
W
 
F
L
 
F
S
 
N
L
 
C
L
 
C
K
 
K
V
 
I
A
 
L
A
 
M
I
 
I
V
 
V
A
 
-
M
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
G
F
 
F
G
 
F
I
 
I
M
 
L
L
 
A
F
 
I
G
 
I
I
 
I
S
 
D
T
 
C
A
 
G
P
 
-
G
 
G
Q
 
A
V
 
G
T
 
T
D
 
D
I
 
G
-
 
Y
-
 
I
-
 
G
S
 
S
N
 
K
L
 
Y
W
 
W
T
 
R
Q
 
D
-
 
P
G
 
G
G
 
A
F
 
F
M
 
R
P
 
G
N
 
D
G
 
T
-
 
P
-
 
I
-
 
Q
-
 
R
M
 
F
G
 
K
G
 
G
L
 
V
I
 
V
A
 
A
S
 
T
F
 
F
A
 
V
V
 
T
V
 
A
M
 
A
F
 
F
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
M
I
 
S
E
 
E
I
 
Q
I
 
L
G
 
A
V
 
M
T
 
T
A
 
A
G
 
S
E
 
E
A
 
Q
K
 
S
D
 
N
P
 
P
Q
 
R
H
 
K
V
 
A
L
 
I
P
 
P
R
 
S
A
 
A
I
 
A
N
 
K
A
 
K
V
 
M
P
 
I
L
 
Y
R
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
F
F
 
V
Y
 
F
V
 
L
L
 
A
T
 
S
M
 
L
L
 
T
V
 
L
L
 
V
M
 
G
S
 
F
I
 
L
F
 
V
P
 
P
W
 
Y
-
 
T
-
 
S
-
 
D
Q
 
Q
Q
 
L
I
 
L
G
 
G
S
 
A
Q
 
A
G
 
G
S
 
S
-
 
A
-
 
T
-
 
K
-
 
A
-
 
S
P
 
P
F
 
Y
V
 
V
Q
 
I
I
 
A
F
 
V
D
 
S
K
 
S
L
 
H
G
 
G
I
 
V
S
 
R
S
 
V
A
 
V
A
 
P
T
 
H
I
 
F
L
 
I
N
 
N
I
 
A
V
 
V
V
 
I
I
 
L
T
 
L
A
 
S
A
 
V
I
 
L
S
 
S
A
 
V
I
 
A
N
 
N
S
 
G
D
 
A
I
 
F
F
 
Y
G
 
T
A
 
S
G
 
S
R
 
R
M
 
I
M
 
L
F
 
M
G
 
S
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
H
 
N
A
 
A
P
 
P
K
 
K
G
 
C
F
 
F
A
 
D
H
 
Y
L
 
I
S
 
D
R
 
R
N
 
E
G
 
G
V
 
R
P
 
P
W
 
A
M
 
A
T
 
A
V
 
M
V
 
L
V
 
V
M
 
S
S
 
A
V
 
L
A
 
F
L
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
A
V
 
F
L
 
C
L
 
A
N
 
S
Y
 
S
L
 
K
I
 
K
P
 
E
E
 
E
N
 
D
V
 
V
F
 
F
L
 
T
L
 
W
I
 
L
A
 
L
S
 
A
I
 
I
A
 
S
T
 
G
F
 
L
A
 
S
T
 
Q
V
 
L
W
 
F
V
 
T
W
 
W
L
 
I
M
 
T
I
 
I
L
 
C
F
 
L
T
 
S
Q
 
H
V
 
I
A
 
R
M
 
F
R
 
R
R
 
R
S
 
A
M
 
M
T
 
K
A
 
V
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

Q03770 SPS-sensor component SSY1; Amino-acid permease homolog SSY1 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
23% identity, 85% coverage: 8:405/468 of query aligns to 277:754/852 of Q03770

query
sites
Q03770
L
 
I
K
 
Q
R
 
R
G
 
K
L
 
L
S
 
K
A
 
V
R
 
R
H
 
H
I
 
I
R
 
Q
F
 
M
M
 
L
A
 
S
L
 
I
G
 
G
S
 
A
A
 
C
I
 
F
G
 
S
T
 
V
G
 
G
L
 
L
F
 
F
Y
 
L
G
 
T
S
 
S
A
 
G
S
 
K
A
 
A
I
 
F
Q
 
S
M
 
I
A
 
A
G
 
G
P
 
P
-
 
F
A
 
G
V
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
G
Y
 
F
L
 
G
I
 
L
G
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
I
V
 
I
F
 
L
M
 
A
V
 
T
M
 
M
R
 
L
A
 
S
L
 
F
G
 
T
E
 
E
M
 
L
A
 
S
V
 
T
H
 
L
N
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
S
G
 
S
S
 
G
F
 
F
G
 
S
Q
 
G
Y
 
L
A
 
A
S
 
S
T
 
R
Y
 
F
L
 
V
G
 
E
P
 
D
M
 
A
A
 
F
G
 
G
F
 
F
I
 
A
L
 
L
G
 
G
W
 
W
T
 
T
Y
 
Y
A
 
W
F
 
I
E
 
S
M
 
C
V
 
M
I
 
L
V
 
A
G
 
L
M
 
P
A
 
A
D
 
Q
V
 
V
T
 
S
A
 
S
F
 
S
G
x
T
I
 
F
Y
 
Y
M
 
L
G
 
S
F
 
Y
W
 
Y
F
 
N
P
 
N
-
 
V
E
 
N
V
 
I
S
 
S
R
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
T
-
 
A
-
 
G
W
 
F
I
 
I
W
 
T
V
 
L
L
 
F
G
 
S
V
 
A
V
 
F
S
 
S
I
 
I
V
 
V
G
 
-
G
 
-
L
 
V
N
 
N
L
 
L
C
 
L
N
 
D
V
 
V
K
 
S
V
 
I
F
 
M
G
 
G
E
 
E
M
 
I
E
 
V
F
 
Y
W
 
V
L
 
A
S
 
G
L
 
I
L
 
S
K
 
K
V
 
V
A
 
I
A
 
I
I
 
A
V
 
I
A
 
L
M
 
M
I
 
V
L
 
F
-
 
T
-
 
M
-
 
I
-
 
I
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
G
-
 
H
-
 
G
-
 
N
-
 
D
-
 
I
-
 
H
G
 
E
G
 
G
F
 
V
G
 
G
I
 
F
M
 
R
L
 
Y
F
 
W
G
 
D
I
 
S
S
 
S
T
 
K
A
 
S
P
 
V
G
 
R
Q
 
N
V
 
L
T
 
T
-
 
Y
-
 
G
-
 
L
-
 
Y
-
 
R
D
 
P
I
 
T
S
 
F
N
 
D
L
 
L
W
 
A
T
 
D
Q
 
A
G
 
G
G
 
E
F
 
G
M
 
S
P
 
K
N
 
K
G
 
G
M
 
I
G
 
S
G
 
G
L
 
P
I
 
K
A
 
G
S
 
R
F
 
F
-
 
L
-
 
A
-
 
T
A
 
A
V
 
S
V
 
V
M
 
M
-
 
L
-
 
I
-
 
S
-
 
T
F
 
F
A
 
A
F
 
F
G
 
S
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
M
I
 
T
G
 
F
V
 
L
T
 
A
A
 
S
G
 
G
E
 
E
A
 
A
K
 
I
D
 
N
P
 
P
Q
 
R
H
 
K
V
 
T
L
 
I
P
 
P
R
 
S
A
 
A
I
 
T
N
 
K
A
 
R
V
 
T
P
 
F
L
 
S
R
 
I
I
 
V
L
 
L
L
 
I
F
 
S
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
T
 
L
M
 
I
L
 
F
V
 
S
-
 
V
-
 
G
-
 
I
-
 
N
-
 
I
-
 
Y
-
 
S
-
 
G
-
 
D
-
 
P
-
 
R
L
 
L
M
 
L
S
 
S
I
 
Y
F
 
F
P
 
P
-
 
G
-
 
I
-
 
S
-
 
E
-
 
K
-
 
R
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
-
 
I
-
 
I
-
 
K
-
 
G
-
 
T
-
 
G
-
 
M
-
 
D
-
 
W
-
 
R
-
 
L
-
 
R
-
 
T
-
 
N
-
 
C
-
 
R
-
 
G
-
 
G
-
 
I
-
 
D
W
 
Y
Q
 
R
Q
 
Q
I
 
I
G
 
S
-
 
V
-
 
G
-
 
T
S
 
G
Q
 
Y
G
 
S
S
 
S
P
 
P
F
 
W
V
 
V
Q
 
V
I
 
A
F
 
L
D
 
Q
K
 
N
L
 
F
G
 
G
I
 
L
S
 
C
S
 
T
A
 
F
A
 
A
T
 
S
I
 
A
L
 
F
N
 
N
I
 
A
V
 
I
V
 
L
I
 
I
T
 
F
A
 
F
A
 
T
I
 
A
S
 
T
A
 
A
I
 
G
N
 
I
S
 
S
D
 
S
I
 
L
F
 
F
G
 
S
A
 
C
G
 
S
R
 
R
M
 
T
M
 
L
F
 
Y
G
 
A
L
 
M
A
 
S
Q
 
V
Q
 
Q
G
 
R
H
 
K
A
 
A
P
 
P
K
 
P
G
 
V
F
 
F
A
 
E
H
 
I
L
 
C
S
 
S
R
 
K
N
 
R
G
 
G
V
 
V
P
 
P
W
 
Y
M
 
V
T
 
S
V
 
V
V
 
I
V
 
F
M
 
S
S
 
S
V
 
L
-
 
F
A
 
S
L
 
V
L
 
I
L
 
A
G
 
Y
V
 
I
L
 
A
L
 
V
N
 
D
Y
 
Q
L
 
T
I
 
A
P
 
I
E
 
E
N
 
N
V
 
-
F
 
F
L
 
D
L
 
V
I
 
L
A
 
A
S
 
N
I
 
V
A
 
S
T
 
S
F
 
A
A
 
S
T
 
T
V
 
S
W
 
I
V
 
I
W
 
W
L
 
M
-
 
G
-
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
S
-
 
F
M
 
L
I
 
R
L
 
F
F
 
Y
T
 
Y
Q
 
A
V
 
L
A
 
K
M
 
Q
R
 
R
R
 
K
S
 
D
M
 
I
T
 
I
A
 
S
E
 
R
Q
 
N
V
 
D
A
 
S
Q
 
S
L
 
Y
K
 
P
F
 
Y
P
 
K
V
 
S
P
 
P
F
 
F
W
 
Q
P
 
P
Y
 
Y

O34739 Serine/threonine exchanger SteT from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
23% identity, 90% coverage: 1:419/468 of query aligns to 1:405/438 of O34739

query
sites
O34739
M
 
M
Q
 
H
K
 
T
P
 
E
A
 
D
N
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
R
 
K
G
 
E
L
 
I
S
 
G
A
 
L
R
 
L
H
 
F
I
 
A
R
 
L
F
 
T
M
 
L
A
 
V
L
 
I
G
 
G
S
 
T
A
 
I
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
L
 
V
F
 
F
Y
 
M
G
 
K
S
 
P
A
 
G
S
 
A
A
 
V
I
 
L
Q
 
A
M
 
Y
A
 
S
G
 
G
P
 
D
A
 
S
-
 
K
-
 
M
V
 
A
L
 
L
L
 
F
A
 
A
Y
 
W
L
 
L
I
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
I
A
 
L
V
 
T
F
 
L
M
 
A
V
 
G
M
 
G
R
 
L
A
 
T
L
 
I
G
 
A
E
 
E
M
 
I
A
 
G
V
 
T
H
 
Q
N
 
I
P
 
P
V
 
K
A
 
T
G
 
G
S
 
G
F
 
L
G
 
Y
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
L
S
 
E
T
 
E
Y
 
V
L
 
Y
G
 
G
P
 
E
M
 
F
A
 
W
G
 
G
F
 
F
I
 
L
L
x
C
G
 
G
W
 
W
T
 
V
Y
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
Q
M
 
I
V
 
I
I
 
I
V
 
Y
G
 
G
M
 
P
A
 
A
D
 
I
V
 
I
T
 
G
A
 
A
F
 
L
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
M
 
F
G
 
G
F
 
S
W
 
L
F
 
M
P
 
A
E
 
N
V
 
L
S
 
F
R
 
G
W
 
W
I
 
G
W
 
S
V
 
G
L
 
L
G
 
S
-
 
K
V
 
V
V
 
I
S
 
G
I
 
I
V
 
I
G
 
A
G
 
V
L
 
L
N
 
F
L
 
L
C
|
C
N
 
V
V
 
I
K
 
N
V
 
I
F
 
I
G
 
G
E
 
T
M
 
K
E
 
Y
-
 
G
-
 
G
F
 
F
W
 
V
L
 
Q
S
 
T
L
 
L
L
 
T
K
 
T
V
 
I
A
 
G
A
 
K
I
 
L
V
 
I
A
 
P
M
 
I
I
 
A
L
x
C
G
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
I
 
I
M
 
I
L
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
L
S
 
W
T
 
K
A
 
G
P
 
D
G
 
Q
Q
 
H
V
 
I
-
 
F
T
 
T
D
 
A
I
 
V
S
 
N
N
 
E
L
 
S
W
 
I
T
 
S
Q
 
D
G
 
M
G
 
N
F
 
F
M
 
G
P
 
-
N
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
I
 
-
A
 
A
S
 
A
F
 
I
A
 
L
V
 
A
V
 
T
M
 
L
F
 
F
A
 
A
F
 
Y
G
 
D
G
 
G
I
 
W
E
 
I
I
 
L
I
 
L
G
 
A
V
 
A
T
 
L
A
 
G
G
 
G
E
 
E
A
 
M
K
 
K
D
 
N
P
 
P
Q
 
E
H
 
K
V
 
L
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
A
I
 
M
N
 
T
A
 
G
V
 
G
P
 
L
L
 
L
R
 
I
I
 
V
L
 
T
L
 
A
F
 
I
Y
 
Y
V
 
I
L
 
F
T
 
I
M
 
N
L
 
F
V
 
A
L
 
L
M
 
L
S
 
H
I
 
I
F
 
L
P
 
S
W
 
A
Q
 
N
Q
 
E
I
 
I
G
 
V
S
 
T
Q
 
L
G
 
G
S
 
E
P
 
N
F
 
-
V
 
-
Q
 
-
I
 
-
F
 
-
D
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
A
I
 
T
S
 
S
S
 
T
A
 
A
A
 
A
T
 
T
I
 
M
L
 
L
-
 
F
-
 
G
-
 
S
-
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
N
 
S
I
 
V
V
 
G
V
 
I
I
 
I
T
 
V
A
 
S
A
 
I
I
 
F
S
 
G
A
x
C
I
 
L
N
 
N
S
 
G
D
 
K
I
 
V
F
 
L
G
 
S
A
 
F
G
 
P
R
 
R
M
 
V
M
 
S
F
 
F
G
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
E
Q
 
R
G
 
K
H
 
Q
A
 
L
P
 
P
-
 
F
-
 
A
K
 
E
G
 
K
F
 
L
A
 
S
H
 
H
L
 
V
S
 
H
R
 
P
N
 
S
-
 
F
G
 
R
V
 
T
P
 
P
W
 
W
M
 
I
T
 
A
V
 
I
V
 
S
V
 
F
-
 
Q
M
 
I
S
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
M
G
 
M
V
 
L
L
 
I
L
 
S
N
 
N
Y
 
-
L
 
-
I
 
-
P
 
P
E
 
D
N
 
K
V
 
-
F
 
-
L
 
-
L
 
-
I
 
L
A
 
S
S
 
E
I
 
I
A
 
S
T
 
I
F
 
F
A
 
M
T
 
I
V
 
Y
W
 
I
V
 
F
W
 
Y
L
 
V
M
 
M
I
 
A
L
 
F
F
 
F
T
 
A
Q
 
V
V
 
F
A
 
I
M
 
L
R
 
R
R
 
K
S
 
R
M
 
A
T
 
K
A
 
G
E
 
E
Q
 
K
V
 
R
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
F
 
Y
P
 
S
V
 
V
P
 
P
F
 
L
W
 
Y
P
 
P
Y
 
F
A
 
M
P
 
P
M
 
I
A
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
F
 
G
M
 
S
L
 
F
F
 
F
V
 
V
F
 
L
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P76037 Putrescine importer PuuP from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
26% identity, 41% coverage: 48:238/468 of query aligns to 58:242/461 of P76037

query
sites
P76037
A
 
S
Y
 
Y
L
 
L
I
 
L
G
 
A
G
 
L
A
 
A
A
 
G
V
 
V
F
 
L
M
 
F
V
 
T
M
 
A
R
 
I
A
 
S
L
 
Y
G
 
G
E
 
K
M
 
L
A
 
V
V
 
R
H
 
Q
N
 
F
P
 
P
V
 
E
A
 
A
G
 
G
S
 
S
F
 
A
G
 
Y
Q
 
T
Y
 
Y
A
 
A
S
 
Q
T
 
K
Y
 
S
L
 
I
G
 
N
P
 
P
M
 
H
A
 
V
G
 
G
F
 
F
I
 
M
L
 
V
G
 
G
W
 
W
T
 
S
Y
 
S
A
 
L
F
 
L
E
 
D
M
x
Y
V
 
L
I
 
F
V
 
L
G
 
P
M
 
M
A
 
I
D
 
N
V
 
V
T
 
L
A
 
L
F
 
A
G
 
K
I
 
I
Y
 
Y
M
 
L
G
 
S
F
 
A
W
 
L
F
 
F
P
 
P
E
 
E
V
 
V
S
 
P
R
 
P
W
 
W
I
 
V
W
 
W
V
 
V
L
 
V
G
 
T
V
 
F
V
 
V
S
 
A
I
 
I
V
 
L
G
 
T
G
 
A
L
 
A
N
 
N
L
 
L
C
 
K
N
 
S
V
 
V
K
 
N
V
 
L
F
 
V
G
 
A
E
 
N
M
 
F
E
 
N
F
 
T
W
 
L
L
 
F
S
 
V
L
 
L
L
 
V
K
 
Q
V
 
I
A
 
S
A
 
I
I
 
M
V
 
V
A
 
V
M
 
F
I
 
I
L
 
F
G
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
-
I
 
L
M
 
V
L
 
V
F
 
Q
G
 
G
I
 
L
S
 
H
T
 
K
A
 
G
P
 
E
G
 
G
Q
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
I
 
V
S
 
G
N
 
T
L
 
V
W
 
W
T
 
S
Q
 
L
G
 
Q
G
 
P
F
 
F
M
 
I
P
 
S
N
 
E
G
 
N
-
 
A
-
 
H
M
 
L
G
 
I
G
 
P
L
 
I
I
 
I
A
 
T
S
 
G
F
 
A
A
 
T
V
 
I
V
 
V
M
 
C
F
 
F
A
 
S
F
 
F
G
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
D
I
 
A
I
 
V
G
 
T
V
 
T
T
 
L
A
 
S
G
 
E
E
 
E
A
 
T
K
 
P
D
 
D
P
 
A
Q
 
A
H
 
R
V
 
V
L
 
I
P
 
P
R
 
K
A
 
A
I
 
I

P30825 High affinity cationic amino acid transporter 1; CAT-1; CAT1; Ecotropic retroviral leukemia receptor homolog; Ecotropic retrovirus receptor homolog; Solute carrier family 7 member 1; System Y+ basic amino acid transporter from Homo sapiens (Human) (see paper)
23% identity, 71% coverage: 2:333/468 of query aligns to 22:385/629 of P30825

query
sites
P30825
Q
 
S
K
 
R
P
 
E
A
 
E
N
 
T
G
 
R
L
 
L
K
 
S
R
 
R
G
 
C
L
 
L
S
 
N
A
 
T
R
 
F
H
 
D
I
 
L
R
 
V
F
 
A
M
 
L
A
 
G
L
 
V
G
 
G
S
 
S
A
 
T
I
 
L
G
 
G
T
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
Y
-
 
V
Y
 
L
G
 
A
S
 
G
A
 
A
S
 
V
A
 
A
I
 
R
Q
 
E
M
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
I
A
 
S
Y
 
F
L
 
L
I
 
I
G
 
A
G
 
A
A
 
L
A
 
A
V
 
S
F
 
V
M
 
L
V
 
A
M
 
G
R
 
L
A
 
C
L
 
Y
G
 
G
E
 
E
M
 
F
A
 
G
V
 
A
H
 
R
N
 
V
P
 
P
V
 
K
A
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
A
G
 
Y
Q
 
L
Y
 
Y
A
 
S
S
 
Y
T
 
V
Y
 
T
L
 
V
G
 
G
P
 
E
M
 
L
A
 
W
G
 
A
F
 
F
I
 
I
L
 
T
G
 
G
W
 
W
T
 
N
Y
 
L
A
 
I
F
 
L
E
 
S
M
 
Y
V
 
I
I
 
I
-
 
G
-
 
T
-
 
S
-
 
S
V
 
V
G
 
A
M
 
R
A
 
A
D
 
W
V
 
S
T
 
A
A
 
T
F
 
F
G
 
D
I
 
E
Y
 
L
M
 
I
G
 
G
F
 
R
W
 
P
F
 
I
P
 
G
E
 
E
V
 
F
S
 
S
R
 
R
W
 
T
I
 
H
W
 
M
V
 
T
L
 
L
G
 
N
V
 
A
V
 
P
S
 
G
I
 
V
V
 
L
G
 
A
G
 
E
L
 
-
N
 
-
L
 
-
C
 
-
N
 
N
V
 
P
K
 
D
V
 
I
F
 
F
G
 
A
-
 
V
-
 
I
-
 
I
-
 
I
-
 
L
-
 
I
E
 
L
M
 
T
E
 
G
F
 
L
W
 
L
L
 
T
S
 
L
L
 
G
L
 
V
K
 
K
V
 
E
A
 
S
A
 
A
I
 
M
V
 
V
A
 
N
M
 
K
I
 
I
L
 
F
G
 
T
G
 
C
F
 
I
G
 
N
I
 
V
M
 
L
L
 
V
F
 
L
G
 
G
I
 
F
S
 
I
T
 
M
A
 
V
P
 
S
G
 
G
-
 
F
-
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
K
-
 
N
-
 
W
Q
 
Q
V
 
L
T
 
T
D
 
E
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
G
-
x
N
-
 
T
-
 
S
-
 
G
-
 
R
-
 
L
-
 
C
I
 
L
S
 
N
N
 
N
L
 
D
W
 
T
T
 
K
Q
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
F
M
 
M
P
 
P
N
 
F
G
 
G
M
 
F
G
 
S
G
 
G
L
 
V
I
 
L
A
 
S
S
 
G
F
 
A
A
 
A
V
 
T
V
 
C
M
 
F
F
 
Y
A
 
A
F
 
F
G
 
V
G
 
G
I
 
F
E
 
D
I
 
C
I
 
I
G
 
A
V
 
T
T
 
T
A
 
G
G
 
E
E
 
E
A
 
V
K
 
K
D
 
N
P
 
P
Q
 
Q
H
 
K
V
 
A
L
 
I
P
 
P
R
 
V
A
 
G
I
 
I
N
 
V
A
 
A
V
 
S
P
 
L
L
 
L
R
 
I
I
 
C
L
 
F
L
 
I
F
 
A
Y
 
Y
V
 
F
L
 
G
T
 
V
M
 
S
L
 
A
V
 
A
L
 
L
M
 
T
S
 
L
I
 
M
F
 
M
P
 
P
W
 
Y
Q
 
F
Q
 
C
I
 
L
G
 
-
S
 
D
Q
 
N
G
 
N
S
 
S
P
 
P
F
 
L
V
 
P
Q
 
D
I
 
A
F
 
F
D
 
K
K
 
H
L
 
V
G
 
G
I
 
W
S
 
E
S
 
G
A
 
A
A
 
K
T
 
Y
I
 
A
L
 
V
N
 
A
I
 
V
V
 
G
V
 
S
I
 
L
T
 
C
A
 
A
A
 
L
I
 
S
S
 
A
A
 
S
I
 
L
N
 
L
S
 
G
D
 
S
I
 
M
F
 
F
G
 
P
A
 
M
G
 
P
R
 
R
M
 
V
M
 
I
F
 
Y
G
 
A
L
 
M
A
 
A
Q
 
E
Q
 
D
G
 
G
H
 
L
A
 
L
P
 
F
K
 
K
G
 
F
F
 
L
A
 
A
H
 
N
L
 
V
S
 
N
-
 
D
R
 
R
N
 
T
G
 
K
V
 
T
P
 
P

6f34A Crystal structure of a bacterial cationic amino acid transporter (cat) homologue bound to arginine. (see paper)
27% identity, 48% coverage: 190:413/468 of query aligns to 208:420/458 of 6f34A

query
sites
6f34A
W
 
W
T
 
T
Q
 
P
G
 
-
G
 
-
F
 
F
M
 
M
P
 
P
N
 
Y
G
 
G
M
 
F
G
 
S
G
 
G
L
 
V
I
 
A
A
 
T
S
 
G
F
 
A
A
 
A
V
 
T
V
 
V
M
 
F
F
|
F
A
|
A
F
 
Y
G
x
I
G
 
G
I
 
F
E
 
D
I
 
A
I
 
V
G
 
S
V
 
T
T
 
A
A
 
A
G
 
E
E
 
E
A
 
V
K
 
R
D
 
N
P
 
P
Q
 
Q
H
 
R
V
 
D
L
 
M
P
 
P
R
 
I
A
 
G
I
 
I
N
 
I
A
 
V
V
 
S
P
 
L
L
 
L
R
 
V
I
 
C
L
 
T
L
 
L
F
 
L
Y
 
Y
V
 
I
L
 
A
T
 
V
M
 
S
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
T
S
 
G
I
 
I
F
 
V
P
 
P
W
 
Y
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
L
G
 
N
S
 
V
Q
 
K
G
 
-
S
 
N
P
 
P
F
 
V
V
 
A
Q
 
F
I
 
A
F
 
L
D
 
N
K
 
Y
L
 
I
G
 
H
I
x
Q
S
 
D
S
 
W
A
x
V
A
 
A
T
 
G
I
 
F
L
 
I
N
 
S
I
 
L
V
 
G
V
 
A
I
 
I
T
 
A
A
 
G
A
 
I
I
 
T
S
 
T
A
x
V
I
 
L
N
 
L
S
 
V
D
 
S
I
 
M
F
 
Y
G
 
G
A
 
Q
G
 
T
R
 
R
M
 
L
M
 
F
F
 
Y
G
 
A
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
Q
 
D
G
 
G
H
 
L
A
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
R
L
 
I
S
 
S
-
 
P
R
 
T
N
 
R
G
 
Q
V
 
V
P
 
P
W
 
Y
M
 
V
T
 
N
V
 
T
V
 
W
V
 
L
M
 
T
-
 
G
-
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
V
L
 
F
L
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
-
L
 
-
N
 
-
Y
 
-
L
 
-
I
 
I
P
 
P
E
 
L
N
 
N
V
 
K
F
 
L
L
 
A
L
 
E
I
 
L
A
 
T
S
 
N
I
 
I
A
 
G
T
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
A
F
 
F
A
 
I
T
 
T
V
 
V
W
 
S
V
 
I
W
 
G
L
 
V
M
 
L
I
 
V
L
 
L
F
 
R
-
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
P
A
 
D
M
 
L
R
 
K
R
 
R
S
 
A
M
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
F
 
F
P
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
F
W
 
V
P
 
P
Y
 
V
A
 
V
P
 
P
M
 
I
A
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
L
F
 
F

Sites not aligning to the query:

5oqtA Crystal structure of a bacterial cationic amino acid transporter (cat) homologue (see paper)
27% identity, 48% coverage: 190:413/468 of query aligns to 206:418/456 of 5oqtA

query
sites
5oqtA
W
 
W
T
 
T
Q
 
P
G
 
-
G
 
-
F
 
F
M
 
M
P
 
P
N
 
Y
G
 
G
M
 
F
G
 
S
G
 
G
L
 
V
I
 
A
A
 
T
S
 
G
F
 
A
A
 
A
V
 
T
V
 
V
M
 
F
F
|
F
A
|
A
F
 
Y
G
x
I
G
 
G
I
 
F
E
 
D
I
 
A
I
 
V
G
 
S
V
 
T
T
 
A
A
 
A
G
 
E
E
 
E
A
 
V
K
 
R
D
 
N
P
 
P
Q
 
Q
H
 
R
V
 
D
L
 
M
P
 
P
R
 
I
A
 
G
I
 
I
N
 
I
A
 
V
V
 
S
P
 
L
L
 
L
R
 
V
I
 
C
L
 
T
L
 
L
F
 
L
Y
 
Y
V
 
I
L
 
A
T
 
V
M
 
S
L
 
L
V
 
V
L
 
L
M
 
T
S
 
G
I
 
I
F
 
V
P
 
P
W
 
Y
Q
 
E
Q
 
Q
I
 
L
G
 
N
S
 
V
Q
 
K
G
 
-
S
 
N
P
 
P
F
 
V
V
 
A
Q
 
F
I
 
A
F
 
L
D
 
N
K
 
Y
L
 
I
G
 
H
I
x
Q
S
 
D
S
 
W
A
x
V
A
 
A
T
 
G
I
 
F
L
 
I
N
 
S
I
 
L
V
 
G
V
 
A
I
 
I
T
 
A
A
 
G
A
 
I
I
 
T
S
 
T
A
 
V
I
 
L
N
 
L
S
 
V
D
 
M
I
 
M
F
 
Y
G
 
G
A
 
Q
G
 
T
R
 
R
M
 
L
M
 
F
F
 
Y
G
 
A
L
 
I
A
 
S
Q
 
R
Q
 
D
G
 
G
H
 
L
A
 
L
P
 
P
K
 
K
G
 
V
F
 
F
A
 
A
H
 
R
L
 
I
S
 
S
-
 
P
R
 
T
N
 
R
G
 
Q
V
 
V
P
 
P
W
 
Y
M
 
V
T
 
N
V
 
T
V
 
W
V
 
L
M
 
T
-
 
G
-
 
A
S
 
A
V
 
V
A
 
A
L
 
V
L
 
F
L
 
A
G
 
G
V
 
I
L
 
-
L
 
-
N
 
-
Y
 
-
L
 
-
I
 
I
P
 
P
E
 
L
N
 
N
V
 
K
F
 
L
L
 
A
L
 
E
I
 
L
A
 
T
S
 
N
I
 
I
A
 
G
T
 
T
-
 
L
-
 
F
-
 
A
F
 
F
A
 
I
T
 
T
V
 
V
W
 
S
V
 
I
W
 
G
L
 
V
M
 
L
I
 
V
L
 
L
F
 
R
-
 
K
T
 
T
Q
 
Q
V
 
P
A
 
D
M
 
L
R
 
K
R
 
R
S
 
A
M
 
-
T
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
L
 
-
K
 
-
F
 
F
P
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
F
W
 
V
P
 
P
Y
 
V
A
 
V
P
 
P
M
 
I
A
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
L
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6f2wA Bacterial asc transporter crystal structure in open to in conformation (see paper)
24% identity, 83% coverage: 22:411/468 of query aligns to 14:392/433 of 6f2wA

query
sites
6f2wA
L
 
V
G
 
G
S
 
T
A
x
V
I
 
I
G
|
G
T
x
A
G
|
G
L
 
I
F
 
F
Y
 
F
G
 
K
S
 
P
A
 
T
S
 
A
A
 
V
I
 
Y
Q
 
G
M
 
A
A
 
A
G
 
G
-
 
A
P
 
P
A
 
G
V
 
L
-
 
G
L
 
L
L
 
L
A
 
A
Y
 
W
L
 
F
I
 
V
G
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
I
V
 
T
F
 
I
M
 
A
V
 
G
M
 
G
R
 
L
A
 
T
L
 
V
G
 
A
E
 
E
M
 
I
A
 
G
V
 
T
H
 
I
N
 
Y
P
 
P
V
 
Q
A
 
T
G
 
G
S
 
G
F
 
M
G
 
M
Q
 
I
Y
 
Y
A
 
L
S
 
E
T
 
K
Y
 
V
L
 
Y
G
 
G
P
 
R
M
 
W
A
 
L
G
 
G
F
 
F
I
 
L
L
 
V
G
 
G
W
 
W
T
 
A
Y
 
-
A
 
-
F
 
-
E
 
Q
M
 
M
V
 
V
I
 
I
V
 
Y
G
 
Y
M
 
P
A
 
A
D
 
N
V
 
I
T
 
A
A
 
A
F
 
L
G
 
A
I
 
I
Y
 
I
M
 
F
G
 
A
F
 
T
W
 
Q
F
 
F
P
 
V
E
 
N
V
 
L
-
 
F
-
 
A
-
 
L
-
 
S
-
 
D
S
 
S
R
 
T
W
 
I
I
 
V
W
 
P
V
 
T
L
 
A
G
 
I
V
 
L
V
 
T
S
 
S
I
 
I
-
 
F
V
 
L
G
 
M
G
 
G
L
 
V
N
 
N
L
 
F
C
 
L
N
 
G
V
 
T
K
 
K
V
 
Y
F
 
S
G
 
G
E
 
W
M
 
I
E
 
Q
F
 
T
W
 
L
L
 
A
S
 
T
L
 
I
L
 
L
K
 
K
V
 
L
A
 
I
A
 
P
I
 
L
V
 
V
A
 
V
M
 
I
I
 
I
L
 
V
G
 
A
G
 
G
F
 
-
G
 
-
I
 
-
M
 
L
L
 
L
F
 
Y
G
 
P
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
V
I
 
I
S
 
R
T
 
L
A
 
V
P
 
P
G
 
F
Q
 
S
V
 
V
T
 
E
D
 
T
I
 
H
S
 
P
N
 
V
L
 
L
W
 
T
T
 
S
Q
 
F
G
 
G
G
 
S
F
 
-
M
 
-
P
 
-
N
 
-
G
 
-
M
 
-
G
 
-
G
 
A
L
 
L
I
 
I
A
 
A
S
 
T
F
 
-
A
 
-
V
 
-
V
 
-
M
 
L
F
|
F
A
|
A
F
 
Y
G
x
D
G
 
G
I
 
W
E
 
I
I
 
N
I
 
V
G
 
G
V
 
T
T
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
M
K
 
K
D
 
N
P
 
P
Q
 
G
H
 
K
V
 
M
L
 
L
P
 
P
R
 
K
A
 
V
I
 
I
N
 
I
A
 
G
V
 
G
P
 
L
L
 
S
R
 
I
I
 
V
L
 
M
L
 
A
F
 
V
Y
 
Y
V
 
L
L
 
L
T
 
T
M
 
N
L
 
I
V
 
A
L
 
Y
M
 
L
S
 
F
I
 
V
F
 
L
P
 
D
W
 
S
Q
 
S
Q
 
Q
I
 
L
G
 
A
S
 
G
Q
 
T
G
 
D
S
 
T
P
 
P
F
 
A
V
 
A
Q
 
L
I
 
V
F
 
A
D
 
S
K
 
H
L
 
L
G
 
F
I
 
E
S
 
G
S
 
I
A
 
G
A
 
S
T
 
K
I
 
L
L
 
V
N
 
T
I
 
I
V
 
G
V
 
I
I
 
L
T
 
I
A
 
S
A
 
V
I
 
F
S
 
G
A
 
G
I
 
I
N
 
N
S
 
G
D
 
Y
I
 
I
F
 
I
G
 
S
A
 
G
G
 
L
R
 
R
M
 
V
M
 
P
F
 
Y
G
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
T
Q
 
Q
G
 
K
H
 
M
A
 
L
P
 
P
-
 
F
-
 
S
K
 
D
G
 
W
F
 
F
A
 
A
H
 
R
L
 
I
S
 
N
-
 
P
R
 
K
N
 
T
G
 
N
V
 
L
P
 
P
W
 
I
M
 
N
T
 
G
V
 
G
V
 
L
V
 
V
M
 
M
-
 
L
-
 
G
-
 
I
S
 
A
V
 
I
A
 
V
L
 
M
L
 
I
L
 
L
G
 
T
V
 
G
L
 
Q
L
 
F
N
 
N
Y
 
Q
L
 
L
I
 
T
P
 
D
E
 
L
N
 
I
V
 
V
F
 
F
L
 
V
L
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
T
 
-
F
 
-
A
 
-
T
 
-
V
 
I
W
 
W
V
 
F
W
 
F
L
 
I
M
 
T
I
 
L
L
 
T
F
 
F
T
 
I
Q
 
A
V
 
V
A
 
I
M
 
I
R
 
L
R
 
R
S
 
K
M
 
T
T
 
Q
A
 
P
E
 
D
Q
 
-
V
 
-
A
 
I
Q
 
E
L
 
R
K
 
P
F
 
Y
P
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
F
W
 
Y
P
 
P
Y
 
V
A
 
I
P
 
P
M
 
L
A
 
I
A
 
A
I
 
I

P60061 Arginine/agmatine antiporter from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
23% identity, 71% coverage: 1:333/468 of query aligns to 1:323/445 of P60061

query
sites
P60061
M
 
M
Q
 
S
K
 
S
P
 
D
A
 
A
N
 
D
G
 
A
L
 
H
K
 
K
R
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
-
A
 
-
R
 
I
H
 
P
I
 
V
R
 
T
F
 
L
M
 
M
A
 
V
L
 
S
G
 
G
S
 
N
A
x
I
I
 
M
G
 
G
T
x
S
G
 
G
L
 
V
F
 
F
Y
 
L
G
 
L
S
 
P
A
 
A
S
 
N
A
 
L
I
 
A
Q
 
S
M
 
T
A
 
G
G
 
G
P
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
Y
-
 
G
-
 
W
L
 
L
A
 
V
Y
 
T
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
L
A
 
G
V
 
L
F
 
S
M
 
M
V
 
V
M
 
Y
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
A
E
 
K
M
 
M
A
 
S
V
 
F
H
 
L
N
 
D
P
 
P
V
 
S
A
 
P
G
 
G
S
 
G
F
 
S
G
 
Y
Q
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
 
R
T
 
R
Y
 
C
L
 
F
G
 
G
P
 
P
M
 
F
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
-
 
Q
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
x
Y
-
 
W
I
 
L
L
x
A
G
x
C
W
 
W
T
 
I
Y
 
G
A
x
N
F
 
I
E
 
A
M
|
M
V
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
M
 
V
A
 
G
D
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
Y
M
 
L
G
 
S
F
 
Y
W
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
I
V
 
L
S
 
K
R
 
D
-
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
T
-
 
I
-
 
T
-
 
C
-
 
V
-
 
V
-
 
V
-
 
L
W
 
W
I
 
I
W
 
F
V
 
V
L
 
L
G
 
-
V
 
-
V
 
-
S
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
N
 
N
L
 
I
C
 
V
N
 
G
V
 
P
K
 
K
V
 
M
F
 
I
G
 
T
E
 
R
M
 
V
E
 
Q
F
 
A
W
 
V
L
 
A
S
 
T
L
 
V
L
 
L
K
 
A
V
 
L
A
 
I
A
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
-
M
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
G
I
 
I
M
 
A
L
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
W
S
 
F
T
 
W
A
 
F
P
 
R
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
T
 
Y
D
 
M
I
 
A
S
 
A
N
 
-
L
 
-
W
 
W
T
 
N
Q
 
V
G
 
S
G
 
G
F
 
L
M
 
-
P
 
-
N
 
G
G
 
T
M
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
I
I
 
Q
A
 
S
S
 
T
F
 
L
A
 
N
V
 
V
V
 
T
M
 
L
F
x
W
A
x
S
F
 
F
G
x
I
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
S
I
 
A
G
 
S
V
 
V
T
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
V
A
 
V
K
 
K
D
 
N
P
 
P
Q
 
K
H
 
R
V
 
N
L
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
A
I
 
T
N
 
I
A
 
G
V
 
G
P
 
V
L
 
L
R
 
I
I
 
A
L
 
A
L
 
V
F
 
C
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
T
 
S
M
 
T
L
 
T
V
 
A
L
 
I
M
 
M
S
 
G
I
 
M
F
 
I
P
 
P
W
 
N
Q
 
A
Q
 
A
I
 
L
G
 
R
S
 
V
Q
 
S
G
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
G
Q
 
D
I
 
A
F
 
A
D
 
R
K
 
M
L
 
A
G
 
L
I
 
G
S
 
D
S
 
T
A
 
A
A
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
S
I
 
F
V
 
C
V
 
A
I
 
A
T
 
A
A
 
G
A
 
C
I
 
L
S
 
G
A
 
S
I
 
L
N
 
G
S
 
G
D
x
W
I
 
T
F
 
L
G
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
M
 
T
M
 
A
F
 
K
G
 
A
L
 
A
A
 
A
Q
 
D
Q
 
D
G
 
G
H
 
L
A
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
I
F
 
F
A
 
A
H
 
R
L
 
V
S
 
N
R
 
K
N
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

P60063 Arginine/agmatine antiporter from Escherichia coli O157:H7 (see 3 papers)
23% identity, 71% coverage: 1:333/468 of query aligns to 1:323/445 of P60063

query
sites
P60063
M
 
M
Q
 
S
K
 
S
P
 
D
A
 
A
N
 
D
G
 
A
L
 
H
K
 
K
R
 
V
G
 
G
L
 
L
S
 
-
A
 
-
R
 
I
H
 
P
I
 
V
R
 
T
F
 
L
M
 
M
A
 
V
L
 
S
G
 
G
S
x
N
A
x
I
I
 
M
G
|
G
T
x
S
G
|
G
L
 
V
F
 
F
Y
 
L
G
 
L
S
 
P
A
 
A
S
 
N
A
 
L
I
 
A
Q
 
S
M
 
T
A
 
G
G
 
G
P
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
Y
-
 
G
-
 
W
L
 
L
A
 
V
Y
 
T
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
L
A
 
G
V
 
L
F
 
S
M
 
M
V
 
V
M
 
Y
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
A
E
 
K
M
 
M
A
 
S
V
 
F
H
 
L
N
 
D
P
 
P
V
 
S
A
 
P
G
 
G
S
 
G
F
 
S
G
x
Y
Q
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
 
R
T
 
R
Y
 
C
L
 
F
G
 
G
P
 
P
M
 
F
A
 
L
G
 
G
F
x
Y
-
 
Q
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
x
Y
-
 
W
I
 
L
L
x
A
G
x
C
W
 
W
T
 
I
Y
 
G
A
x
N
F
 
I
E
 
A
M
 
M
V
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
M
 
V
A
 
G
D
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
Y
M
 
L
G
 
S
F
 
Y
W
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
I
V
 
L
S
 
K
R
 
D
-
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
T
-
 
I
-
 
T
-
 
C
-
 
V
-
 
V
-
 
V
-
 
L
W
 
W
I
 
I
W
 
F
V
 
V
L
 
L
G
 
-
V
 
-
V
 
-
S
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
N
 
N
L
 
I
C
 
V
N
 
G
V
 
P
K
 
K
V
 
M
F
 
I
G
 
T
E
 
R
M
 
V
E
 
Q
F
 
A
W
 
V
L
 
A
S
 
T
L
 
V
L
 
L
K
 
A
V
 
L
A
 
I
A
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
-
M
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
G
I
 
I
M
 
A
L
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
W
S
 
F
T
 
W
A
 
F
P
 
R
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
T
 
Y
D
 
M
I
 
A
S
 
A
N
 
-
L
 
-
W
 
W
T
 
N
Q
 
V
G
 
S
G
 
G
F
 
L
M
 
-
P
 
-
N
 
G
G
 
T
M
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
I
I
 
Q
A
 
S
S
 
T
F
 
L
A
 
N
V
 
V
V
 
T
M
 
L
F
x
W
A
 
S
F
 
F
G
x
I
G
|
G
I
x
V
E
|
E
I
x
S
I
x
A
G
 
S
V
 
V
T
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
V
A
 
V
K
 
K
D
 
N
P
 
P
Q
 
K
H
 
R
V
 
N
L
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
A
I
 
T
N
 
I
A
 
G
V
 
G
P
 
V
L
 
L
R
 
I
I
 
A
L
 
A
L
 
V
F
 
C
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
T
 
S
M
 
T
L
 
T
V
 
A
L
 
I
M
 
M
S
 
G
I
 
M
F
 
I
P
 
P
W
 
N
Q
 
A
Q
 
A
I
 
L
G
 
R
S
 
V
Q
 
S
G
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
G
Q
 
D
I
 
A
F
 
A
D
 
R
K
 
M
L
 
A
G
 
L
I
 
G
S
 
D
S
 
T
A
 
A
A
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
S
I
 
F
V
 
C
V
 
A
I
 
A
T
 
A
A
 
G
A
 
C
I
 
L
S
 
G
A
 
S
I
 
L
N
 
G
S
 
G
D
x
W
I
 
T
F
 
L
G
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
M
 
T
M
 
A
F
 
K
G
 
A
L
 
A
A
 
A
Q
 
D
Q
 
D
G
 
G
H
 
L
A
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
I
F
 
F
A
 
A
H
 
R
L
 
V
S
 
N
R
 
K
N
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3l1lA Structure of arg-bound escherichia coli adic (see paper)
23% identity, 68% coverage: 17:333/468 of query aligns to 9:306/423 of 3l1lA

query
sites
3l1lA
I
 
V
R
 
T
F
 
L
M
 
M
A
 
V
L
 
S
G
 
G
S
 
A
A
x
I
I
 
M
G
 
G
T
x
S
G
|
G
L
 
V
F
 
F
Y
 
L
G
 
L
S
 
P
A
 
A
S
 
N
A
 
L
I
 
A
Q
 
S
M
 
T
A
 
G
G
 
G
P
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
Y
-
 
G
-
 
W
L
 
L
A
 
V
Y
 
T
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
L
A
 
G
V
 
L
F
 
S
M
 
M
V
 
V
M
 
Y
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
A
E
 
K
M
 
M
A
 
S
V
 
F
H
 
L
N
 
D
P
 
P
V
 
S
A
 
P
G
 
G
S
 
G
F
 
S
G
 
Y
Q
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
 
R
T
 
R
Y
 
C
L
 
F
G
 
G
P
 
P
M
 
F
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
-
 
Q
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
Y
-
 
W
I
 
L
L
 
A
G
 
C
W
 
W
T
 
I
Y
x
G
A
x
N
F
 
I
E
 
A
M
 
M
V
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
M
 
V
A
 
G
D
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
Y
M
 
L
G
 
S
F
 
Y
W
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
-
V
 
I
S
 
L
R
 
K
W
 
D
I
 
P
W
 
W
V
 
V
L
 
L
G
 
T
V
 
I
V
 
T
S
 
C
I
 
V
V
 
V
G
 
V
G
 
L
-
 
W
-
 
I
-
 
F
-
 
V
-
 
L
L
 
L
N
 
N
L
 
I
C
 
V
N
 
G
V
 
P
K
 
K
V
 
M
F
 
I
G
 
T
E
 
R
M
 
V
E
 
Q
F
 
A
W
 
V
L
 
A
S
 
T
L
 
V
L
 
L
K
 
A
V
 
L
A
 
I
A
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
-
M
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
G
I
 
I
M
 
A
L
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
W
S
 
-
T
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
-
D
 
-
I
 
-
S
 
-
N
 
-
L
 
F
W
 
W
T
 
F
Q
 
R
G
 
G
G
 
-
F
 
-
M
 
-
P
 
E
N
 
T
G
 
Y
M
 
M
G
 
A
G
 
A
L
 
I
I
 
Q
A
 
S
S
 
T
F
 
L
A
 
N
V
 
V
V
 
T
M
 
L
F
x
W
A
x
S
F
 
F
G
x
I
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
S
I
 
A
G
 
S
V
 
V
T
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
V
A
 
V
K
 
K
D
 
N
P
 
P
Q
 
K
H
 
R
V
 
N
L
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
A
I
 
T
N
 
I
A
 
G
V
 
G
P
 
V
L
 
L
R
 
I
I
 
A
L
 
A
L
 
V
F
 
C
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
T
 
S
M
 
T
L
 
T
V
 
A
L
 
I
M
 
M
S
 
G
I
 
M
F
 
I
P
 
P
W
 
N
Q
 
A
Q
 
A
I
 
L
G
 
R
S
 
V
Q
 
S
G
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
G
Q
 
D
I
 
A
F
 
A
D
 
R
K
 
M
L
 
A
G
 
L
I
 
G
S
 
D
S
 
T
A
 
A
A
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
S
I
 
F
V
 
C
V
 
A
I
 
A
T
 
A
A
 
G
A
 
C
I
 
L
S
 
G
A
 
S
I
 
L
N
 
G
S
 
G
D
x
W
I
 
T
F
 
L
G
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
M
 
T
M
 
A
F
 
K
G
 
A
L
 
A
A
 
A
Q
 
D
Q
 
D
G
 
G
H
 
L
A
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
I
F
 
F
A
 
A
H
 
R
L
 
V
S
 
N
R
 
K
N
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
P

5j4nA Crystal structure of the l-arginine/agmatine antiporter adic in complex with agmatine at 2.6 angstroem resolution (see paper)
23% identity, 68% coverage: 17:333/468 of query aligns to 11:319/437 of 5j4nA

query
sites
5j4nA
I
 
V
R
 
T
F
 
L
M
 
M
A
 
V
L
 
S
G
 
G
S
 
N
A
x
I
I
 
M
G
 
G
T
 
S
G
 
G
L
 
V
F
 
F
Y
 
L
G
 
L
S
 
P
A
 
A
S
 
N
A
 
L
I
 
A
Q
 
S
M
 
T
A
 
G
G
 
G
P
 
I
A
 
A
V
 
I
L
 
Y
-
 
G
-
 
W
L
 
L
A
 
V
Y
 
T
L
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
A
A
 
L
A
 
G
V
 
L
F
 
S
M
 
M
V
 
V
M
 
Y
R
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
A
E
 
K
M
 
M
A
 
S
V
 
F
H
 
L
N
 
D
P
 
P
V
 
S
A
 
P
G
 
G
S
 
G
F
 
S
G
 
Y
Q
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
 
R
T
 
R
Y
 
C
L
 
F
G
 
G
P
 
P
M
 
F
A
 
L
G
 
G
F
 
Y
-
 
Q
-
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
L
-
 
Y
-
 
W
I
 
L
L
x
A
G
x
C
W
 
W
T
 
I
Y
x
G
A
x
N
F
 
I
E
 
A
M
|
M
V
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
M
 
V
A
 
G
D
 
-
V
 
-
T
 
-
A
 
-
F
 
-
G
 
-
I
 
-
Y
 
Y
M
 
L
G
 
S
F
 
Y
W
 
F
F
 
F
P
 
P
E
 
I
V
 
L
S
 
K
R
 
D
-
 
P
-
 
L
-
 
V
-
 
L
-
 
T
-
 
I
-
 
T
-
 
C
-
 
V
-
 
V
-
 
V
-
 
L
W
 
W
I
 
I
W
 
F
V
 
V
L
 
L
G
 
-
V
 
-
V
 
-
S
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
L
N
 
N
L
 
I
C
 
V
N
 
G
V
 
P
K
 
K
V
 
M
F
 
I
G
 
T
E
 
R
M
 
V
E
 
Q
F
 
A
W
 
V
L
 
A
S
 
T
L
 
V
L
 
L
K
 
A
V
 
L
A
 
I
A
 
P
I
 
I
V
 
V
A
 
-
M
 
-
I
 
-
L
 
-
G
 
-
G
 
-
F
 
-
G
 
G
I
 
I
M
 
A
L
 
V
F
 
F
G
 
G
I
 
W
S
 
F
T
 
W
A
 
F
P
 
R
G
 
G
Q
 
E
V
 
T
T
 
Y
D
 
M
I
 
A
S
 
A
N
 
-
L
 
-
W
 
W
T
 
N
Q
 
V
G
 
S
G
 
G
F
 
L
M
 
-
P
 
-
N
 
G
G
 
T
M
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
I
I
 
Q
A
 
S
S
 
T
F
 
L
A
 
N
V
 
V
V
 
T
M
 
L
F
 
W
A
 
S
F
 
F
G
 
I
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
S
I
 
A
G
 
S
V
 
V
T
 
A
A
 
A
G
 
G
E
 
V
A
 
V
K
 
K
D
 
N
P
 
P
Q
 
K
H
 
R
V
 
N
L
 
V
P
 
P
R
 
I
A
 
A
I
 
T
N
 
I
A
 
G
V
 
G
P
 
V
L
 
L
R
 
I
I
 
A
L
 
A
L
 
V
F
 
C
Y
 
Y
V
 
V
L
 
L
T
 
S
M
 
T
L
 
T
V
 
A
L
 
I
M
 
M
S
 
G
I
 
M
F
 
I
P
 
P
W
 
N
Q
 
A
Q
 
A
I
 
L
G
 
R
S
 
V
Q
 
S
G
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
F
V
 
G
Q
 
D
I
 
A
F
 
A
D
 
R
K
 
M
L
 
A
G
 
L
I
 
G
S
 
D
S
 
T
A
 
A
A
 
G
T
 
A
I
 
I
L
 
V
N
 
S
I
 
F
V
 
C
V
 
A
I
 
A
T
 
A
A
 
G
A
 
C
I
 
L
S
 
G
A
 
S
I
 
L
N
 
G
S
 
G
D
x
W
I
 
T
F
 
L
G
 
L
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
M
 
T
M
 
A
F
 
K
G
 
A
L
 
A
A
 
A
Q
 
D
Q
 
D
G
 
G
H
 
L
A
 
F
P
 
P
K
 
P
G
 
I
F
 
F
A
 
A
H
 
R
L
 
V
S
 
N
R
 
K
N
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
P

Q9UHI5 Large neutral amino acids transporter small subunit 2; L-type amino acid transporter 2; hLAT2; Solute carrier family 7 member 8 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
21% identity, 71% coverage: 22:353/468 of query aligns to 50:391/535 of Q9UHI5

query
sites
Q9UHI5
L
 
V
G
 
G
S
 
N
A
x
I
I
 
I
G
 
G
T
 
S
G
 
G
L
 
I
F
 
F
Y
 
V
G
 
S
S
 
P
A
 
K
S
 
G
A
 
V
I
 
L
Q
 
E
M
 
N
A
 
A
G
 
G
P
 
S
A
 
V
-
 
G
-
 
L
V
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
V
Y
 
W
L
 
I
I
 
V
G
 
T
G
 
G
A
 
F
A
 
I
V
 
T
F
 
V
M
 
V
V
 
G
M
 
A
R
 
L
A
 
C
L
x
Y
G
 
A
E
 
E
M
 
L
A
 
G
V
 
V
H
 
T
N
 
I
P
 
P
V
 
K
A
 
S
G
 
G
S
 
G
F
 
D
G
 
Y
Q
 
S
Y
 
Y
A
 
V
S
 
K
T
 
D
Y
 
I
L
 
F
G
 
G
P
 
G
M
 
L
A
 
A
G
 
G
F
 
F
I
 
L
L
 
R
G
 
L
W
 
W
-
 
I
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
V
T
 
I
Y
 
Y
A
 
P
F
 
T
E
x
N
M
 
Q
V
 
A
I
 
V
V
 
I
G
 
A
M
 
L
-
 
T
-
 
F
A
 
S
D
 
N
V
 
Y
T
 
V
A
 
L
F
 
Q
G
 
P
I
 
L
Y
 
F
M
 
P
G
 
T
F
x
C
W
 
F
F
 
P
P
 
P
E
 
E
V
 
S
S
 
G
R
 
L
W
 
R
I
 
L
W
 
L
V
 
A
L
 
A
G
 
I
V
 
C
V
 
L
S
 
L
I
 
L
V
 
L
G
 
T
G
x
W
L
 
V
N
 
N
L
 
C
C
 
S
N
 
S
V
 
V
K
 
R
V
 
-
F
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
E
 
-
F
 
-
W
 
W
L
 
A
S
 
T
L
 
R
L
 
V
K
 
Q
V
 
D
A
 
I
A
 
F
I
 
T
V
 
A
A
 
G
M
 
K
I
 
L
L
 
L
G
 
A
G
 
L
F
 
A
G
 
L
I
 
I
M
 
I
L
 
I
F
 
M
G
 
G
I
 
I
S
 
V
T
 
-
A
 
-
P
 
-
G
 
-
Q
 
Q
V
 
I
T
 
C
D
 
K
I
 
G
S
 
E
N
 
Y
L
 
F
W
 
W
T
 
L
Q
 
E
-
 
P
-
 
K
-
 
N
-
 
A
-
 
F
G
 
E
G
 
N
F
 
F
M
 
Q
P
 
E
N
 
P
G
 
D
M
 
I
G
 
G
G
 
L
L
 
V
I
 
A
A
 
L
S
 
A
F
 
F
A
 
L
V
 
Q
V
 
G
M
 
S
F
|
F
A
 
A
F
 
Y
G
|
G
G
 
G
I
 
W
E
 
N
I
 
F
I
 
L
G
 
N
V
 
Y
T
 
V
A
 
T
G
 
E
E
 
E
A
 
L
K
 
V
D
 
D
P
 
P
Q
 
Y
H
 
K
V
 
N
L
 
L
P
 
P
R
 
R
A
 
A
I
 
I
N
 
F
-
 
I
A
 
S
V
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
-
I
 
V
L
 
T
L
 
F
F
 
V
Y
 
Y
V
 
V
L
 
F
T
 
A
M
 
N
L
 
V
V
 
A
L
 
Y
M
 
V
S
 
T
I
 
A
F
 
M
P
 
S
W
 
P
Q
 
Q
Q
 
E
I
 
L
G
 
L
S
 
A
Q
 
S
G
 
N
S
 
A
P
x
V
F
 
A
V
 
V
Q
 
T
I
 
F
F
 
G
D
 
E
K
 
K
L
 
L
G
 
-
I
 
L
S
 
G
S
 
V
A
 
M
A
 
A
T
 
W
I
 
I
L
 
M
N
 
P
I
 
I
V
 
S
V
 
V
I
 
A
T
 
L
A
 
S
A
 
T
I
 
F
S
 
G
A
 
G
I
 
V
N
 
N
S
 
G
D
 
S
I
 
L
F
 
F
G
 
T
A
 
S
G
 
S
R
 
R
M
 
L
M
 
F
F
 
F
G
 
A
L
 
G
A
 
A
Q
 
R
Q
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
L
P
 
P
K
 
S
G
 
V
F
 
L
A
 
A
-
 
M
-
 
I
H
 
H
L
 
V
S
 
K
R
 
R
-
 
C
N
 
T
G
 
P
V
 
I
P
 
P
W
 
A
M
 
L
T
 
L
V
 
F
V
 
T
V
 
C
M
 
I
S
 
S
V
 
T
A
 
L
L
 
L
L
 
M
L
 
L
-
 
V
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
M
G
 
Y
V
 
T
L
 
L
L
 
I
N
 
N
Y
 
Y
L
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AO353_12275 AO353_12275 proline-specific permease
MQKPANGLKRGLSARHIRFMALGSAIGTGLFYGSASAIQMAGPAVLLAYLIGGAAVFMVM
RALGEMAVHNPVAGSFGQYASTYLGPMAGFILGWTYAFEMVIVGMADVTAFGIYMGFWFP
EVSRWIWVLGVVSIVGGLNLCNVKVFGEMEFWLSLLKVAAIVAMILGGFGIMLFGISTAP
GQVTDISNLWTQGGFMPNGMGGLIASFAVVMFAFGGIEIIGVTAGEAKDPQHVLPRAINA
VPLRILLFYVLTMLVLMSIFPWQQIGSQGSPFVQIFDKLGISSAATILNIVVITAAISAI
NSDIFGAGRMMFGLAQQGHAPKGFAHLSRNGVPWMTVVVMSVALLLGVLLNYLIPENVFL
LIASIATFATVWVWLMILFTQVAMRRSMTAEQVAQLKFPVPFWPYAPMAAIAFMLFVFGV
LGYFPDTQAALIVGVVWIVLLVLAYLMWVKPAAGQAALVARDPSFSNR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory