SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO353_14450 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_14450 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07821 Iron(3+)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; Ferric hydroxamate uptake protein C; Ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC; Iron(III)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; EC 7.2.2.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
36% identity, 97% coverage: 4:251/255 of query aligns to 14:261/265 of P07821

query
sites
P07821
V
 
L
E
 
R
N
 
N
L
 
I
Q
 
S
I
 
F
C
 
R
R
 
V
G
 
P
K
 
G
K
 
R
I
 
T
V
 
L
L
 
L
A
 
H
D
 
P
I
 
L
D
 
S
L
 
L
E
 
T
L
 
F
K
 
P
P
 
A
G
 
G
E
 
K
V
 
V
L
 
T
G
 
G
V
 
L
L
 
I
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
K
A
 
M
L
 
L
C
 
G
G
 
R
E
 
H
L
 
Q
R
 
P
P
 
P
D
 
S
H
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
I
W
 
L
L
 
L
D
 
D
Q
 
A
R
 
Q
E
 
P
L
 
L
S
 
E
Q
 
S
W
 
W
D
 
S
G
 
S
A
 
K
Q
 
A
R
 
F
A
 
A
Q
 
R
R
 
K
L
 
V
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
Q
S
 
L
T
 
P
L
 
P
D
 
A
F
 
E
A
 
G
F
 
M
R
 
T
V
 
V
E
 
R
E
 
E
V
 
L
V
 
V
G
 
A
M
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
Y
P
 
P
H
 
W
Q
 
H
T
 
G
G
 
A
R
 
L
V
 
G
R
 
R
-
 
F
-
 
G
-
 
A
-
 
A
D
 
D
D
 
R
E
 
E
I
 
K
V
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
I
Q
 
S
A
 
L
A
 
V
D
 
G
V
 
L
G
 
K
H
 
P
L
 
L
S
 
A
G
 
H
R
 
R
S
 
L
Y
 
V
L
 
D
A
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
A
H
 
W
L
 
I
A
 
A
R
 
M
V
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
L
 
-
W
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
D
G
 
S
Q
 
R
T
 
C
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
M
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
I
L
 
A
H
 
H
Q
 
Q
H
 
V
T
 
D
T
 
V
L
 
L
Q
 
S
A
 
L
I
 
V
R
 
H
E
 
R
F
 
L
A
 
S
-
 
Q
D
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
L
A
 
T
V
 
V
L
 
I
V
 
A
I
 
V
L
 
L
H
 
H
D
 
D
L
 
I
N
 
N
L
 
M
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
C
 
C
D
 
D
R
 
Y
I
 
L
L
 
V
L
 
A
L
 
L
E
 
R
S
 
G
G
 
G
R
 
E
P
 
M
H
 
I
A
 
A
L
 
Q
D
 
G
T
 
T
P
 
P
Q
 
A
Q
 
E
V
 
I
L
 
M
R
 
R
P
 
G
E
 
E
P
 
T
L
 
L
K
 
E
A
 
M
V
 
I
F
 
Y
G
 
G
L
 
I
D
 
P
V
 
M
L
 
G
V
 
I
Q
 
L
P
 
P
H
 
H
P
 
P
E
 
A
R
 
G
G
 
A
H
 
A
P
 
P
L
 
V

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
31% identity, 92% coverage: 1:235/255 of query aligns to 2:233/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
M
 
I
L
 
L
R
 
K
V
 
A
E
 
Q
N
 
H
L
 
L
Q
 
A
I
 
K
C
 
S
R
 
Y
G
 
K
K
 
K
K
 
R
I
 
K
V
 
V
L
 
V
A
 
S
D
 
D
I
 
V
D
 
S
L
 
L
E
 
Q
L
 
V
K
 
E
P
 
S
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
S
L
 
F
G
 
Y
A
 
M
L
 
I
C
 
V
G
 
G
E
 
L
L
 
V
R
 
A
P
 
R
D
 
D
H
 
E
G
 
G
R
 
T
V
 
I
W
 
T
L
 
I
D
 
D
Q
 
D
R
 
N
E
 
D
L
 
I
S
 
S
Q
 
I
W
 
L
D
 
P
G
 
M
A
 
H
Q
 
S
R
 
R
A
 
S
Q
 
R
R
 
M
-
 
G
L
 
I
A
 
G
V
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
E
S
 
A
T
 
S
L
 
I
D
 
F
F
 
R
A
 
K
F
 
L
R
 
S
V
 
V
E
 
E
E
 
D
V
 
N
V
 
I
G
 
-
M
 
M
G
 
A
R
 
V
L
 
L
P
 
Q
H
 
T
Q
 
R
-
 
E
-
 
E
-
 
L
T
 
T
G
 
H
R
x
E
V
 
E
R
 
R
D
 
Q
D
|
D
E
 
K
I
 
L
V
 
-
A
 
E
A
 
D
A
 
L
L
 
L
Q
 
E
A
 
E
A
 
F
D
 
H
V
 
I
G
 
Q
H
 
H
L
 
I
S
 
R
G
 
K
R
 
S
S
 
A
Y
 
G
L
 
M
A
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
H
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
-
W
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
N
G
 
P
Q
 
Q
T
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
S
 
A
M
 
G
L
 
V
D
 
D
P
 
P
L
 
I
H
 
S
Q
 
V
H
 
I
T
 
D
T
 
I
L
 
K
Q
 
K
A
 
I
I
 
I
R
 
E
E
 
H
F
 
L
A
 
R
D
 
D
R
 
R
G
 
G
A
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
I
I
 
T
L
 
D
H
 
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
L
 
E
A
 
T
A
 
L
R
 
D
Y
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
K
I
 
A
L
 
Y
L
 
I
L
 
V
E
 
S
S
 
Q
G
 
G
R
 
R
P
 
L
H
 
I
A
 
A
L
 
E
D
 
G
T
 
T
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
D
V
 
V
L
 
L
R
 
N
P
 
N
E
 
E
P
 
Q
L
 
V
K
 
K
A
 
Q
V
 
V
F
 
Y

1l7vC Bacterial abc transporter involved in b12 uptake (see paper)
37% identity, 84% coverage: 23:237/255 of query aligns to 21:231/231 of 1l7vC

query
sites
1l7vC
E
 
E
L
 
V
K
 
R
P
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
I
L
 
L
G
 
H
V
 
L
L
 
V
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
R
L
 
M
C
 
A
G
 
G
E
 
-
L
 
M
R
 
T
P
 
S
D
 
G
H
 
K
G
 
G
R
 
S
V
 
I
W
 
Q
L
 
F
D
 
A
Q
 
G
R
 
Q
E
 
P
L
 
L
S
 
E
Q
 
A
W
 
W
D
 
S
G
 
A
A
 
T
Q
 
K
R
 
L
A
 
A
Q
 
L
R
 
H
L
 
R
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
P
 
S
Q
 
Q
T
 
Q
S
 
Q
T
 
T
L
 
P
D
 
P
F
 
F
A
 
A
F
 
T
R
 
P
V
 
V
E
 
W
E
 
H
V
 
Y
V
 
L
G
 
T
M
 
L
G
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
H
 
H
Q
 
Q
T
 
H
G
 
D
R
 
K
V
 
T
R
 
R
D
 
T
D
 
E
E
 
L
I
 
L
-
 
N
-
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
A
 
L
A
 
D
D
 
D
V
 
K
G
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
L
G
 
G
R
 
R
S
 
S
Y
 
T
L
 
N
A
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
W
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
H
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
I
W
 
T
P
 
P
-
 
Q
-
 
A
G
 
N
E
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
M
S
 
N
M
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
V
L
 
A
H
 
Q
Q
 
Q
H
 
S
T
 
A
T
 
L
L
 
D
Q
 
K
A
 
I
I
 
L
R
 
S
E
 
A
F
 
L
A
 
C
D
 
Q
R
 
Q
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
V
V
 
M
I
 
S
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
N
 
N
L
 
H
A
 
T
A
 
L
R
 
R
Y
 
H
C
 
A
D
 
H
R
 
R
I
 
A
L
 
W
L
 
L
L
 
L
E
 
K
S
 
G
G
 
G
R
 
K
P
 
M
H
 
L
A
 
A
L
 
S
D
 
G
T
 
R
P
 
R
Q
 
E
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
T
P
 
P
E
 
P
P
 
N
L
 
L
K
 
A
A
 
Q
V
 
A
F
 
Y
G
 
G
L
 
M

4fi3C Structure of vitamin b12 transporter btucd-f in a nucleotide-bound state (see paper)
36% identity, 85% coverage: 23:239/255 of query aligns to 21:233/248 of 4fi3C

query
sites
4fi3C
E
 
E
L
 
V
K
 
R
P
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
I
L
 
L
G
 
H
V
 
L
L
 
V
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
G
 
A
A
 
R
L
 
M
C
 
A
G
 
G
E
 
-
L
 
M
R
 
T
P
 
S
D
 
G
H
 
K
G
 
G
R
 
S
V
 
I
W
 
Q
L
 
F
D
 
A
Q
 
G
R
 
Q
E
 
P
L
 
L
S
 
E
Q
 
A
W
 
W
D
 
S
G
 
A
A
 
T
Q
 
K
R
 
L
A
 
A
Q
 
L
R
 
H
L
 
R
A
 
A
V
 
Y
L
 
L
P
 
S
Q
|
Q
T
 
Q
S
 
Q
T
 
T
L
 
P
D
 
P
F
 
F
A
 
A
F
 
T
R
 
P
V
 
V
E
 
W
E
 
H
V
 
Y
V
 
L
G
 
T
M
 
L
G
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
-
H
 
H
Q
 
Q
T
 
H
G
 
D
R
 
K
V
 
T
R
 
R
D
 
T
D
 
E
E
 
L
I
 
L
-
 
N
-
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
G
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
A
 
L
A
 
D
D
 
D
V
 
K
G
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
L
G
 
G
R
|
R
S
 
S
Y
 
T
L
 
N
A
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
|
E
R
 
W
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
H
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
A
V
 
V
L
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
I
W
 
T
P
 
P
-
 
Q
-
 
A
G
 
N
E
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
M
S
 
C
M
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
V
L
 
A
H
 
Q
Q
 
Q
H
 
S
T
 
A
T
 
L
L
 
D
Q
 
K
A
 
I
I
 
L
R
 
S
E
 
A
F
 
L
A
 
S
D
 
Q
R
 
Q
G
 
G
A
 
L
A
 
A
V
 
I
L
 
V
V
 
M
I
 
S
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
N
 
N
L
 
H
A
 
T
A
 
L
R
 
R
Y
 
H
C
 
A
D
 
H
R
 
R
I
 
A
L
 
W
L
 
L
L
 
L
E
 
K
S
 
G
G
 
G
R
 
K
P
 
M
H
 
L
A
 
A
L
 
S
D
 
G
T
 
R
P
 
R
Q
 
E
Q
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
T
P
 
P
E
 
P
P
 
N
L
 
L
K
 
A
A
 
Q
V
 
A
F
 
Y
G
 
G
L
 
M
D
 
N
V
 
F

Sites not aligning to the query:

3d31A Modbc from methanosarcina acetivorans (see paper)
30% identity, 89% coverage: 1:226/255 of query aligns to 1:216/348 of 3d31A

query
sites
3d31A
M
 
M
L
 
I
R
 
E
V
 
I
E
 
E
N
 
S
L
 
L
Q
 
S
I
 
-
C
 
R
R
 
K
G
 
W
K
 
K
K
 
N
I
 
F
V
 
S
L
 
L
A
 
D
D
 
N
I
 
L
D
 
S
L
 
L
E
 
K
L
 
V
K
 
E
P
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
Y
L
 
F
G
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
L
L
 
F
L
 
L
G
 
E
A
 
L
L
 
I
C
 
A
G
 
G
E
 
F
L
 
H
R
 
V
P
 
P
D
 
D
H
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
I
W
 
L
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
R
 
K
E
 
D
L
 
V
S
 
T
Q
 
-
W
 
-
D
 
D
G
 
L
A
 
S
Q
 
P
R
 
E
A
 
K
Q
 
H
R
 
D
L
 
I
A
 
A
V
 
F
L
 
V
P
 
Y
Q
 
Q
T
 
N
S
 
Y
T
 
S
L
 
L
D
 
F
F
 
P
A
 
H
F
 
M
R
 
N
V
 
V
E
 
K
E
 
K
V
 
N
V
 
L
G
 
E
M
 
F
G
 
G
R
 
-
L
 
-
P
 
-
H
 
M
Q
 
R
T
 
M
G
 
K
R
 
K
V
 
I
R
 
K
D
 
D
D
 
P
E
 
K
I
 
R
V
 
V
A
 
L
A
 
D
A
 
T
L
 
A
Q
 
R
A
 
D
A
 
L
D
 
K
V
 
I
G
 
E
H
 
H
L
 
L
S
 
L
G
 
D
R
 
R
S
 
N
Y
 
P
L
 
L
A
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
H
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
V
Q
 
T
L
 
-
W
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
N
G
 
P
Q
 
K
T
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
S
 
S
M
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
R
H
 
T
Q
 
Q
H
 
E
T
 
N
T
 
A
L
 
R
Q
 
E
A
 
M
I
 
L
R
 
S
E
 
V
F
 
L
A
 
H
D
 
K
R
 
K
G
 
N
A
 
K
-
 
L
A
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
H
I
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
N
 
T
L
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
I
Y
 
M
C
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
L
 
A
L
 
V
L
 
V
E
 
M
S
 
D
G
 
G
R
 
K
P
 
L
H
 
I
A
 
Q
L
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
Q
 
E
Q
 
E
V
 
I
L
 
F

Sites not aligning to the query:

7chaI Cryo-em structure of p.Aeruginosa mlafebd with amppnp (see paper)
33% identity, 87% coverage: 2:222/255 of query aligns to 4:224/262 of 7chaI

query
sites
7chaI
L
 
V
R
 
E
V
 
L
E
 
K
N
 
G
L
 
L
Q
 
T
I
 
F
C
 
K
R
|
R
G
 
G
K
 
S
K
 
R
I
 
A
V
 
I
L
 
F
A
 
D
D
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
V
E
 
R
L
 
I
K
 
P
P
 
R
G
 
G
E
 
K
V
 
V
L
 
T
G
 
G
V
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
G
 
R
A
 
L
L
 
I
C
 
A
G
 
S
E
 
Q
L
 
L
R
 
R
P
 
P
D
 
S
H
 
K
G
 
G
R
 
E
V
 
V
W
 
W
L
 
V
D
 
N
Q
 
G
R
 
Q
-
 
N
-
 
L
-
 
P
E
 
Q
L
 
L
S
 
S
Q
 
R
W
 
G
D
 
D
G
 
L
A
 
F
Q
 
D
R
 
M
A
 
R
Q
 
K
R
 
Q
L
 
F
A
 
G
V
 
V
L
 
L
P
 
F
Q
 
Q
T
 
S
S
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
F
F
 
T
A
 
D
F
 
L
R
 
D
V
 
V
E
 
F
E
 
E
V
 
N
V
 
V
G
 
A
M
 
F
-
 
P
-
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
H
G
 
T
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
H
 
E
Q
 
E
T
 
M
G
 
I
R
 
R
V
 
-
R
 
-
D
 
-
D
 
-
E
 
D
I
 
I
V
 
V
A
 
L
A
 
M
A
 
K
L
 
L
Q
 
Q
A
 
A
A
 
V
D
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
G
L
 
L
S
 
R
G
 
G
R
 
A
S
 
V
Y
 
E
L
 
L
A
 
M
-
 
P
-
 
D
-
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
H
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
-
L
 
L
W
 
D
P
 
P
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
Q
T
 
I
L
 
L
L
 
L
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
S
 
V
M
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
I
H
 
A
Q
 
M
H
 
G
T
 
V
T
 
L
L
 
V
Q
 
R
A
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
L
F
 
L
A
 
N
D
 
D
R
 
A
-
 
L
G
 
G
A
 
I
A
 
T
V
 
S
L
 
I
V
 
V
I
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
N
 
A
L
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
S
Y
 
I
C
 
A
D
 
D
R
 
Y
I
 
I
L
 
Y
L
 
I
L
 
V
E
 
G
S
 
D
G
 
G
R
 
R
P
 
V
H
 
L
A
 
G
L
 
H
D
 
G
T
 
T
P
 
P

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
28% identity, 89% coverage: 1:226/255 of query aligns to 1:224/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
M
 
M
L
 
I
R
 
F
V
 
V
E
 
N
N
 
D
L
 
V
Q
 
Y
I
 
K
C
 
N
R
x
F
G
 
G
K
 
S
K
 
L
I
 
E
V
|
V
L
 
L
A
 
K
D
 
G
I
 
V
D
 
T
L
 
L
E
 
K
L
 
V
K
 
N
P
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
V
G
 
V
V
 
I
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
G
 
R
A
 
C
L
 
I
C
 
N
G
 
L
E
 
L
L
 
E
R
 
E
P
 
P
D
 
T
H
 
K
G
 
G
R
 
E
V
 
V
W
 
F
L
 
I
D
 
D
Q
 
G
R
 
V
E
 
K
L
 
I
S
 
N
-
 
N
-
 
G
Q
 
K
W
 
V
D
 
N
G
 
I
A
 
N
Q
 
K
R
 
V
A
 
R
Q
 
Q
R
 
K
L
 
V
A
 
G
V
 
M
L
 
V
P
 
F
Q
 
Q
T
 
H
S
 
F
T
 
N
L
 
L
D
 
F
F
 
P
A
 
H
F
 
L
R
 
T
V
 
A
E
 
I
E
 
E
V
 
N
V
 
I
G
 
T
M
 
L
G
 
A
R
 
P
L
 
V
P
 
K
H
 
V
Q
 
K
T
 
K
G
 
M
R
 
N
V
 
K
R
 
K
D
 
E
D
 
A
E
 
E
I
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
D
L
 
L
Q
 
-
A
 
L
A
 
A
D
 
K
V
 
V
G
 
G
H
 
L
L
 
L
S
 
D
G
 
K
R
 
K
S
 
D
Y
 
Q
-
 
Y
-
 
P
L
 
I
A
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
M
W
 
Q
P
 
P
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
E
T
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
M
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
E
H
 
M
Q
 
V
H
 
K
T
 
E
T
 
V
L
 
L
Q
 
N
A
 
V
I
 
M
R
 
K
E
 
Q
F
 
L
A
 
A
D
 
N
R
 
E
G
 
G
A
 
M
A
 
T
V
 
M
L
 
V
V
 
V
I
 
V
L
 
T
H
|
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
R
R
 
E
Y
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
I
L
 
F
L
 
M
E
 
D
S
 
D
G
 
G
R
 
V
P
 
I
H
 
V
A
 
E
L
 
E
D
 
G
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
Q
 
E
V
 
I
L
 
F

5x40A Structure of a cbio dimer bound with amppcp (see paper)
36% identity, 82% coverage: 17:226/255 of query aligns to 21:228/280 of 5x40A

query
sites
5x40A
L
 
L
A
 
D
D
 
D
I
 
L
D
 
S
L
 
L
E
 
A
L
 
V
K
 
P
P
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
S
L
 
L
G
 
A
V
 
I
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
G
 
L
A
 
H
L
 
L
C
 
N
G
 
G
E
 
T
L
 
L
R
 
R
P
 
P
D
 
Q
H
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
V
W
 
L
L
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
A
-
 
T
-
 
G
-
 
H
D
 
S
Q
 
R
R
 
K
E
 
D
L
 
L
S
 
T
Q
 
G
W
 
W
D
 
-
G
 
-
A
 
-
Q
 
-
R
 
R
A
 
R
Q
 
R
R
 
V
L
 
G
A
 
L
V
 
V
L
 
L
P
x
Q
Q
 
D
T
 
A
S
 
D
T
 
D
L
 
Q
D
 
L
F
 
F
A
 
A
F
 
T
R
 
T
V
 
V
E
 
F
E
 
E
V
 
D
V
 
V
G
 
S
M
 
F
G
 
G
R
 
P
L
 
L
P
 
N
H
 
L
Q
 
G
T
 
L
G
 
S
R
 
E
V
 
A
R
 
E
D
 
A
D
 
R
E
 
A
I
 
R
V
 
V
A
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
A
A
 
A
A
 
L
D
 
S
V
 
I
G
 
S
H
 
D
L
 
L
S
 
R
G
 
D
R
 
R
S
 
P
Y
 
T
L
x
H
A
x
M
L
|
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
R
 
K
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
G
V
 
A
L
 
V
A
 
A
Q
 
-
L
 
M
W
 
R
P
 
P
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
E
T
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
A
M
 
G
L
 
L
D
 
D
P
 
L
L
 
A
H
 
G
Q
 
T
H
 
E
T
 
Q
T
 
L
L
 
L
Q
 
T
A
 
L
I
 
L
R
 
R
E
 
G
F
 
L
A
 
R
D
 
A
R
 
A
G
 
G
A
 
M
A
 
T
V
 
L
L
 
V
V
 
F
I
 
S
L
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
V
N
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
R
 
A
Y
 
L
C
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
A
L
 
L
L
 
F
E
 
R
S
 
T
G
 
G
R
 
R
P
 
V
H
 
L
A
 
A
L
 
E
D
 
G
T
 
A
P
 
A
Q
 
E
Q
 
A
V
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

O65934 ABC transporter ATP-binding/permease protein Rv1747; EC 7.-.-.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 3 papers)
32% identity, 85% coverage: 12:228/255 of query aligns to 330:542/865 of O65934

query
sites
O65934
G
 
G
K
 
D
K
 
K
I
 
T
V
 
L
L
 
L
A
 
D
D
 
G
I
 
I
D
 
S
L
 
L
E
 
T
L
 
A
K
 
R
P
 
P
G
 
G
E
 
M
V
 
L
L
 
T
G
 
A
V
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
A
G
 
R
A
 
L
L
 
V
C
 
A
G
 
G
E
 
Y
L
 
T
R
 
H
P
 
P
D
 
T
H
 
D
G
 
G
R
 
T
V
 
V
W
 
T
L
 
F
D
 
E
Q
 
G
R
 
H
E
 
N
L
 
V
S
 
H
Q
 
A
W
 
E
D
 
Y
G
 
A
A
 
S
Q
 
L
R
 
R
A
 
S
Q
 
-
R
 
R
L
 
I
A
 
G
V
 
M
L
 
V
P
 
P
Q
 
Q
T
 
D
S
 
D
T
 
V
L
 
V
D
 
H
F
 
G
A
 
Q
F
 
L
R
 
T
V
 
V
E
 
K
E
 
H
V
 
A
V
 
L
G
 
M
M
 
Y
G
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
H
 
P
Q
 
D
T
 
T
G
 
T
R
 
K
V
 
D
R
 
D
D
 
R
D
 
T
E
 
Q
I
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
R
A
 
V
L
 
L
Q
 
E
A
 
E
A
 
L
D
 
E
V
 
M
G
 
S
H
 
K
L
 
H
S
 
I
G
 
D
R
 
T
S
 
R
Y
 
V
L
 
D
A
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
Q
 
K
R
 
R
V
 
-
H
 
-
L
 
-
A
 
A
R
 
S
V
 
V
L
 
A
A
 
L
Q
 
E
L
 
L
W
 
L
P
 
T
G
 
G
E
 
P
A
 
S
G
 
-
Q
 
-
T
 
L
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
M
 
G
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
A
H
 
L
Q
 
D
H
 
R
T
 
Q
T
 
V
L
 
M
Q
 
T
A
 
M
I
 
L
R
 
R
E
 
Q
F
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
A
G
 
G
A
 
R
A
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
V
I
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
S
L
 
L
N
 
T
L
 
Y
A
 
-
A
 
L
R
 
D
Y
 
V
C
 
C
D
 
D
R
 
Q
I
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
L
E
 
A
S
 
P
G
 
G
R
 
G
P
 
K
H
 
T
A
 
A
L
 
F
D
 
C
T
 
G
P
 
P
Q
 
P
Q
 
T
V
 
Q
L
 
I
R
 
G
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Q5M243 Energy-coupling factor transporter ATP-binding protein EcfA1; ECF transporter A component EcfA1; EC 7.-.-.- from Streptococcus thermophilus (strain ATCC BAA-250 / LMG 18311) (see paper)
30% identity, 94% coverage: 1:239/255 of query aligns to 1:238/276 of Q5M243

query
sites
Q5M243
M
 
M
L
 
I
R
 
E
V
 
I
E
 
K
N
 
N
L
 
L
Q
 
K
I
 
F
C
 
K
R
 
Y
G
 
N
K
 
Q
-
 
D
-
 
Q
-
 
T
K
 
S
I
 
Y
V
 
T
L
 
L
A
 
N
D
 
D
I
 
V
D
 
S
L
 
F
E
 
H
L
 
V
K
 
K
P
 
H
G
 
G
E
 
E
V
 
W
L
 
L
G
 
S
V
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
T
L
 
A
G
 
R
A
 
L
L
 
I
C
 
G
G
 
G
E
 
L
L
 
L
R
 
V
P
 
A
D
 
D
H
 
S
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
W
 
I
L
 
V
D
 
D
Q
 
G
R
 
Q
E
 
E
L
 
L
S
 
T
Q
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
V
W
 
W
D
 
D
G
 
I
A
 
R
Q
 
D
R
 
K
A
 
I
Q
 
G
R
 
M
L
 
V
A
 
F
V
 
Q
L
 
N
P
 
P
Q
 
D
T
 
N
S
x
Q
T
 
F
L
 
V
D
 
-
F
 
-
A
 
G
F
 
A
R
 
T
V
 
V
E
 
E
E
 
D
V
 
D
V
 
V
G
 
A
M
 
F
G
 
G
R
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
K
-
 
G
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
Q
 
K
T
 
E
G
 
M
R
 
V
V
 
S
R
 
R
D
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
V
 
V
A
 
Q
A
 
E
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
A
 
F
A
 
V
D
 
G
V
 
M
G
 
M
H
 
D
L
 
F
S
 
K
G
 
D
R
 
R
S
 
E
Y
 
P
L
 
A
A
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
G
V
 
I
L
 
I
A
 
A
Q
 
-
L
 
M
W
 
R
P
 
P
G
 
S
E
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
M
 
M
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
E
H
 
G
Q
 
R
H
 
Q
T
 
E
T
 
L
L
 
I
Q
 
Q
A
 
Y
I
 
I
R
 
E
E
 
D
F
 
I
A
 
R
D
 
Q
R
 
Q
-
 
Y
G
 
G
A
 
M
A
 
T
V
 
V
L
 
L
V
 
S
I
 
I
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
L
N
 
D
L
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
-
Y
 
M
C
 
S
D
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
L
L
 
V
L
 
L
E
 
K
S
 
Q
G
 
G
R
 
K
P
 
V
H
 
E
A
 
S
L
 
I
D
 
S
T
 
S
P
 
P
Q
 
R
Q
 
E
V
 
L
L
 
F
R
 
S
P
 
R
E
 
G
P
 
S
L
 
E
K
 
L
A
 
V
V
 
D
F
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
I

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
29% identity, 92% coverage: 1:235/255 of query aligns to 3:242/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
M
 
M
L
 
I
R
 
D
V
 
V
E
 
H
N
 
Q
L
 
L
Q
 
K
I
 
K
C
 
S
R
x
F
G
 
G
K
 
S
K
 
L
I
 
E
V
|
V
L
 
L
A
 
K
D
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
E
 
H
L
 
I
K
 
R
P
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
V
G
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
G
 
R
A
 
C
L
 
L
C
 
N
G
 
L
E
 
L
L
 
E
R
 
D
P
 
F
D
 
D
H
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
I
W
 
I
L
 
I
D
 
D
Q
 
G
R
 
I
E
 
N
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
W
 
K
D
 
D
G
 
T
A
 
N
Q
 
L
R
 
N
A
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
 
V
-
 
F
Q
 
Q
R
 
R
L
 
F
A
 
N
V
 
L
L
 
F
P
 
P
Q
 
H
T
 
M
S
 
T
T
 
V
L
 
L
D
 
N
F
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
N
M
 
I
G
 
T
R
 
L
L
 
A
P
 
P
H
 
M
Q
 
K
T
 
V
G
 
R
R
 
K
V
 
W
R
 
P
D
 
R
D
 
E
E
 
K
I
 
A
V
 
E
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
M
Q
 
E
A
 
L
A
 
L
D
 
D
V
 
K
G
 
V
H
 
G
L
 
L
S
 
K
G
 
D
R
 
K
S
 
A
Y
 
H
L
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
A
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
M
W
 
E
P
 
P
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
K
T
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
M
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
E
H
 
M
Q
 
V
H
 
G
T
 
E
T
 
V
L
 
L
Q
 
S
A
 
V
I
 
M
R
 
K
E
 
Q
F
 
L
A
 
A
D
 
N
R
 
E
G
 
G
A
 
M
A
 
T
V
 
M
L
 
V
V
 
V
I
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
R
R
 
E
Y
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
-
 
F
-
 
M
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
L
 
I
L
 
I
E
 
E
S
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
P
H
 
E
A
 
D
L
 
L
-
 
F
D
 
D
T
 
R
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
H
V
 
E
L
 
R
R
 
T
P
 
K
E
 
A
P
 
F
L
 
L
K
 
S
A
 
K
V
 
V
F
 
F

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
29% identity, 92% coverage: 1:235/255 of query aligns to 3:242/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
M
 
M
L
 
I
R
 
D
V
 
V
E
 
H
N
 
Q
L
 
L
Q
 
K
I
 
K
C
 
S
R
x
F
G
 
G
K
 
S
K
 
L
I
 
E
V
|
V
L
 
L
A
 
K
D
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
E
 
H
L
 
I
K
 
R
P
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
V
G
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
G
 
R
A
 
C
L
 
L
C
 
N
G
 
L
E
 
L
L
 
E
R
 
D
P
 
F
D
 
D
H
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
I
W
 
I
L
 
I
D
 
D
Q
 
G
R
 
I
E
 
N
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
W
 
K
D
 
D
G
 
T
A
 
N
Q
 
L
R
 
N
A
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
 
V
-
 
F
Q
 
Q
R
 
R
L
 
F
A
 
N
V
 
L
L
 
F
P
 
P
Q
 
H
T
 
M
S
 
T
T
 
V
L
 
L
D
 
N
F
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
N
M
 
I
G
 
T
R
 
L
L
 
A
P
 
P
H
 
M
Q
 
K
T
 
V
G
 
R
R
 
K
V
 
W
R
 
P
D
 
R
D
 
E
E
 
K
I
 
A
V
 
E
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
M
Q
 
E
A
 
L
A
 
L
D
 
D
V
 
K
G
 
V
H
 
G
L
 
L
S
 
K
G
 
D
R
 
K
S
 
A
Y
 
H
L
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
A
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
M
W
 
E
P
 
P
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
K
T
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
M
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
E
H
 
M
Q
 
V
H
 
G
T
 
E
T
 
V
L
 
L
Q
 
S
A
 
V
I
 
M
R
 
K
E
 
Q
F
 
L
A
 
A
D
 
N
R
 
E
G
 
G
A
 
M
A
 
T
V
 
M
L
 
V
V
 
V
I
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
R
R
 
E
Y
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
-
 
F
-
 
M
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
L
 
I
L
 
I
E
 
E
S
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
P
H
 
E
A
 
D
L
 
L
-
 
F
D
 
D
T
 
R
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
H
V
 
E
L
 
R
R
 
T
P
 
K
E
 
A
P
 
F
L
 
L
K
 
S
A
 
K
V
 
V
F
 
F

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
29% identity, 92% coverage: 1:235/255 of query aligns to 3:242/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
M
 
M
L
 
I
R
 
D
V
 
V
E
 
H
N
 
Q
L
 
L
Q
 
K
I
 
K
C
 
S
R
x
F
G
 
G
K
 
S
K
 
L
I
 
E
V
|
V
L
 
L
A
 
K
D
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
E
 
H
L
 
I
K
 
R
P
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
V
G
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
G
 
R
A
 
C
L
 
L
C
 
N
G
 
L
E
 
L
L
 
E
R
 
D
P
 
F
D
 
D
H
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
I
W
 
I
L
 
I
D
 
D
Q
 
G
R
 
I
E
 
N
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
W
 
K
D
 
D
G
 
T
A
 
N
Q
 
L
R
 
N
A
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
 
V
-
 
F
Q
 
Q
R
 
R
L
 
F
A
 
N
V
 
L
L
 
F
P
 
P
Q
 
H
T
 
M
S
 
T
T
 
V
L
 
L
D
 
N
F
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
N
M
 
I
G
 
T
R
 
L
L
 
A
P
 
P
H
 
M
Q
 
K
T
 
V
G
 
R
R
 
K
V
 
W
R
 
P
D
 
R
D
 
E
E
 
K
I
 
A
V
 
E
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
M
Q
 
E
A
 
L
A
 
L
D
 
D
V
 
K
G
 
V
H
 
G
L
 
L
S
 
K
G
 
D
R
 
K
S
 
A
Y
 
H
L
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
A
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
M
W
 
E
P
 
P
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
K
T
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
M
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
E
H
 
M
Q
 
V
H
 
G
T
 
E
T
 
V
L
 
L
Q
 
S
A
 
V
I
 
M
R
 
K
E
 
Q
F
 
L
A
 
A
D
 
N
R
 
E
G
 
G
A
 
M
A
 
T
V
 
M
L
 
V
V
 
V
I
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
R
R
 
E
Y
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
-
 
F
-
 
M
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
L
 
I
L
 
I
E
 
E
S
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
P
H
 
E
A
 
D
L
 
L
-
 
F
D
 
D
T
 
R
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
H
V
 
E
L
 
R
R
 
T
P
 
K
E
 
A
P
 
F
L
 
L
K
 
S
A
 
K
V
 
V
F
 
F

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
29% identity, 92% coverage: 1:235/255 of query aligns to 3:242/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
M
 
M
L
 
I
R
 
D
V
 
V
E
 
H
N
 
Q
L
 
L
Q
 
K
I
 
K
C
 
S
R
x
F
G
 
G
K
 
S
K
 
L
I
 
E
V
|
V
L
 
L
A
 
K
D
 
G
I
 
I
D
 
N
L
 
V
E
 
H
L
 
I
K
 
R
P
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
L
 
V
G
 
V
V
 
V
L
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
G
 
R
A
 
C
L
 
L
C
 
N
G
 
L
E
 
L
L
 
E
R
 
D
P
 
F
D
 
D
H
 
E
G
 
G
R
 
E
V
 
I
W
 
I
L
 
I
D
 
D
Q
 
G
R
 
I
E
 
N
L
 
L
S
 
K
Q
 
A
W
 
K
D
 
D
G
 
T
A
 
N
Q
 
L
R
 
N
A
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
E
-
 
V
-
 
G
-
 
M
-
 
V
-
 
F
Q
 
Q
R
 
R
L
 
F
A
 
N
V
 
L
L
 
F
P
 
P
Q
 
H
T
 
M
S
 
T
T
 
V
L
 
L
D
 
N
F
 
-
A
 
-
F
 
-
R
 
-
V
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
N
M
 
I
G
 
T
R
 
L
L
 
A
P
 
P
H
 
M
Q
 
K
T
 
V
G
 
R
R
 
K
V
 
W
R
 
P
D
 
R
D
 
E
E
 
K
I
 
A
V
 
E
A
 
A
A
 
K
A
 
A
L
 
M
Q
 
E
A
 
L
A
 
L
D
 
D
V
 
K
G
 
V
H
 
G
L
 
L
S
 
K
G
 
D
R
 
K
S
 
A
Y
 
H
L
 
A
-
 
Y
-
 
P
-
 
D
A
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
R
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
M
W
 
E
P
 
P
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
K
T
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
M
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
L
 
E
H
 
M
Q
 
V
H
 
G
T
 
E
T
 
V
L
 
L
Q
 
S
A
 
V
I
 
M
R
 
K
E
 
Q
F
 
L
A
 
A
D
 
N
R
 
E
G
 
G
A
 
M
A
 
T
V
 
M
L
 
V
V
 
V
I
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
L
 
F
A
 
A
A
 
R
R
 
E
Y
 
V
C
 
G
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
-
 
F
-
 
M
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
L
 
I
L
 
I
E
 
E
S
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
P
H
 
E
A
 
D
L
 
L
-
 
F
D
 
D
T
 
R
P
 
P
Q
 
Q
Q
 
H
V
 
E
L
 
R
R
 
T
P
 
K
E
 
A
P
 
F
L
 
L
K
 
S
A
 
K
V
 
V
F
 
F

6tejB Structure of apo irtab devoid sid in complex with sybody syb_nl5 (see paper)
32% identity, 84% coverage: 2:215/255 of query aligns to 331:541/585 of 6tejB

query
sites
6tejB
L
 
I
R
 
E
V
 
F
E
 
D
N
 
D
L
 
V
Q
 
R
I
 
F
C
 
S
R
x
Y
G
 
G
K
 
D
K
x
E
I
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
D
D
 
G
I
 
V
D
 
S
L
 
F
E
 
T
L
 
L
K
 
R
P
 
P
G
 
G
E
 
N
V
 
T
L
 
T
G
 
A
V
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
x
T
T
 
T
L
 
I
L
|
L
G
 
S
A
 
L
L
 
I
C
 
A
G
 
G
E
 
L
L
x
Q
R
 
Q
P
 
P
D
 
A
H
 
S
G
 
G
R
 
R
V
 
V
W
 
L
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
R
 
V
E
 
D
L
 
V
S
 
T
Q
 
T
W
 
L
D
 
D
-
 
P
G
 
E
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
Q
 
A
R
 
V
L
 
S
A
 
V
V
 
V
L
x
F
P
 
Q
Q
 
H
T
 
P
S
 
Y
T
 
L
L
 
F
D
 
D
F
 
G
A
 
T
F
 
L
R
 
R
V
 
D
E
 
N
E
 
V
V
 
L
V
 
V
G
 
G
M
 
D
G
 
-
R
 
-
L
 
-
P
 
P
H
 
E
Q
 
A
T
 
-
G
 
-
R
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
D
D
 
P
E
 
D
I
 
D
V
 
V
A
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
M
Q
 
R
A
 
L
A
 
A
D
 
R
V
 
V
G
 
D
H
 
E
L
 
L
-
 
L
-
 
D
-
 
R
-
 
L
-
 
P
-
 
D
-
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
V
S
 
V
G
 
G
R
 
E
S
 
G
Y
 
G
L
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
H
 
S
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
L
Q
 
K
L
 
P
W
 
A
P
 
P
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
-
T
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
M
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
N
L
 
A
H
 
N
Q
 
E
H
 
A
T
 
A
T
 
V
L
 
V
Q
 
D
A
 
A
I
 
L
R
 
T
E
 
-
F
 
-
A
 
A
D
 
D
-
 
P
R
 
R
G
 
P
A
 
R
A
 
T
V
 
R
L
 
V
V
 
I
I
 
V
L
 
A
H
 
H
D
 
R
L
 
L
N
 
A
L
 
-
A
 
S
A
 
I
R
 
R
Y
 
H
C
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
V
L
 
L
L
 
F
L
 
V
E
 
E
S
 
A
G
 
G
R
 
R

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
30% identity, 92% coverage: 2:235/255 of query aligns to 3:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
L
 
L
R
 
T
V
 
A
E
 
K
N
 
N
L
 
L
Q
 
A
I
 
K
C
 
A
R
x
Y
G
 
K
K
 
G
K
x
R
I
 
R
V
|
V
L
 
V
A
 
E
D
 
D
I
 
V
D
 
S
L
 
L
E
 
T
L
 
V
K
 
N
P
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
G
 
Y
A
 
M
L
 
V
C
 
V
G
 
G
E
 
I
L
 
V
R
 
P
P
 
R
D
 
D
H
 
A
G
 
G
R
 
N
V
 
I
W
 
I
L
 
I
D
 
D
Q
 
D
R
 
D
E
 
D
L
 
I
S
 
S
Q
 
L
W
 
L
D
 
P
G
 
L
A
 
H
Q
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
-
 
G
L
 
I
A
 
G
V
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
T
 
E
S
 
A
T
 
S
L
 
I
D
x
F
F
x
R
A
x
R
F
 
L
R
 
S
V
 
V
E
 
Y
E
 
D
V
 
N
V
 
L
G
 
-
M
 
M
G
 
A
R
 
V
L
 
L
P
 
-
H
 
-
Q
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
D
 
D
D
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
R
-
 
E
E
 
D
I
 
R
V
 
A
A
 
N
A
 
E
A
 
L
L
 
M
Q
 
E
A
 
E
A
 
F
D
 
H
V
 
I
G
 
E
H
 
H
L
 
L
S
 
R
G
 
D
R
 
S
S
 
M
Y
 
G
L
 
Q
A
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
H
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
-
W
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
N
G
 
P
Q
 
K
T
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
S
 
A
M
 
G
L
 
V
D
 
D
P
 
P
L
 
I
H
 
S
Q
 
V
H
 
I
T
 
D
T
 
I
L
 
K
Q
 
R
A
 
I
I
 
I
R
 
E
E
 
H
F
 
L
A
 
R
D
 
D
R
 
S
G
 
G
A
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
I
I
 
T
L
 
D
H
 
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
L
 
E
A
 
T
A
 
L
R
 
A
Y
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
L
 
Y
L
 
I
L
 
V
E
 
S
S
 
Q
G
 
G
R
 
H
P
 
L
H
 
I
A
 
A
L
 
H
D
 
G
T
 
T
P
 
P
Q
 
T
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
R
 
Q
P
 
D
E
 
E
P
 
H
L
 
V
K
 
K
A
 
R
V
 
V
F
 
Y

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
30% identity, 88% coverage: 1:225/255 of query aligns to 2:226/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
M
 
L
L
 
I
R
 
E
V
 
V
E
 
K
N
 
N
L
 
L
Q
 
S
I
 
F
C
 
N
R
|
R
G
 
G
K
 
E
K
 
R
I
 
V
V
 
I
L
 
Y
A
 
D
D
 
N
I
 
I
D
 
S
L
 
L
E
 
N
L
 
I
K
 
R
P
 
R
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
L
 
T
G
 
A
V
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
G
 
R
A
 
L
L
 
I
C
 
G
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
V
P
 
P
D
 
D
H
 
Q
G
 
G
R
 
E
V
 
V
W
 
L
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
R
 
K
E
 
D
L
 
I
S
 
A
Q
 
Q
W
 
M
D
 
S
-
 
R
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
G
 
F
A
 
A
Q
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
-
R
 
R
L
 
M
A
 
G
V
 
M
L
 
L
P
 
F
Q
|
Q
T
 
S
S
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
F
F
 
T
A
 
D
F
 
M
R
 
S
V
 
V
E
 
Y
E
 
E
V
 
N
V
 
V
G
 
A
M
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
F
P
 
P
H
 
I
Q
 
R
T
 
A
G
 
H
R
 
T
V
 
K
R
 
L
D
 
S
D
 
E
E
 
N
I
 
L
V
 
I
A
 
A
-
 
E
-
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
L
A
 
E
D
 
S
V
 
V
G
 
G
H
 
-
L
 
L
S
 
R
G
 
G
R
 
T
S
 
E
Y
 
Q
L
 
L
A
 
M
-
 
P
-
 
T
-
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
N
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
H
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
-
L
 
L
W
 
D
P
 
P
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
D
T
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
S
 
A
M
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
I
H
 
V
Q
 
K
H
 
G
T
 
V
T
 
L
L
 
T
Q
 
R
A
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
S
F
 
L
A
 
R
D
 
E
R
 
A
-
 
L
G
 
D
A
 
L
A
 
T
V
 
T
L
 
I
V
 
I
I
 
V
L
 
S
H
|
H
D
 
D
L
 
V
N
 
P
L
 
E
A
 
T
A
 
L
R
 
S
Y
 
I
C
 
A
D
 
D
R
 
Y
I
 
I
L
 
Y
L
 
V
L
 
V
E
 
A
S
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
I
H
 
Q
A
 
G
L
 
E
D
 
G
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
Q
 
E
V
 
L

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
30% identity, 92% coverage: 2:235/255 of query aligns to 3:233/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
L
 
L
R
 
T
V
 
A
E
 
K
N
 
N
L
 
L
Q
 
A
I
 
K
C
 
A
R
x
Y
G
 
K
K
 
G
K
 
R
I
 
R
V
 
V
L
 
V
A
 
E
D
 
D
I
 
V
D
 
S
L
 
L
E
 
T
L
 
V
K
 
N
P
 
S
G
 
G
E
 
E
V
 
I
L
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
G
 
Y
A
 
M
L
 
V
C
 
V
G
 
G
E
 
I
L
 
V
R
 
P
P
 
R
D
 
D
H
 
A
G
 
G
R
 
N
V
 
I
W
 
I
L
 
I
D
 
D
Q
 
D
R
 
D
E
 
D
L
 
I
S
 
S
Q
 
L
W
 
L
D
 
P
G
 
L
A
 
H
Q
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
R
R
 
R
-
 
G
L
 
I
A
 
G
V
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
|
Q
T
 
E
S
 
A
T
 
S
L
 
I
D
 
F
F
 
R
A
 
R
F
 
L
R
 
S
V
 
V
E
 
Y
E
 
D
V
 
N
V
 
L
G
 
-
M
 
M
G
 
A
R
 
V
L
 
L
P
 
-
H
 
-
Q
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
Q
V
 
I
R
 
R
D
 
D
D
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
A
-
 
E
-
 
Q
-
 
R
-
 
E
E
 
D
I
 
R
V
 
A
A
 
N
A
 
E
A
 
L
L
 
M
Q
 
E
A
 
E
A
 
F
D
 
H
V
 
I
G
 
E
H
 
H
L
 
L
S
 
R
G
 
D
R
 
S
S
 
M
Y
 
G
L
 
Q
A
x
S
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
E
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
H
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
L
 
-
W
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
A
 
N
G
 
P
Q
 
K
T
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
S
 
A
M
x
G
L
 
V
D
 
D
P
 
P
L
 
I
H
 
S
Q
 
V
H
 
I
T
 
D
T
 
I
L
 
K
Q
 
R
A
 
I
I
 
I
R
 
E
E
 
H
F
 
L
A
 
R
D
 
D
R
 
S
G
 
G
A
 
L
A
 
G
V
 
V
L
 
L
V
 
I
I
 
T
L
 
D
H
|
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
L
 
E
A
 
T
A
 
L
R
 
A
Y
 
V
C
 
C
D
 
E
R
 
R
I
 
A
L
 
Y
L
 
I
L
 
V
E
 
S
S
 
Q
G
 
G
R
 
H
P
 
L
H
 
I
A
 
A
L
 
H
D
 
G
T
 
T
P
 
P
Q
 
T
Q
 
E
V
 
I
L
 
L
R
 
Q
P
 
D
E
 
E
P
 
H
L
 
V
K
 
K
A
 
R
V
 
V
F
 
Y

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
30% identity, 88% coverage: 1:225/255 of query aligns to 4:228/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
M
 
L
L
 
I
R
 
E
V
 
V
E
 
K
N
 
N
L
 
L
Q
 
S
I
 
F
C
 
N
R
 
R
G
 
G
K
 
E
K
 
R
I
 
V
V
 
I
L
 
Y
A
 
D
D
 
N
I
 
I
D
 
S
L
 
L
E
 
N
L
 
I
K
 
R
P
 
R
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
L
 
T
G
 
A
V
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
S
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
R
A
 
L
L
 
I
C
 
G
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
V
P
 
P
D
 
D
H
 
Q
G
 
G
R
 
E
V
 
V
W
 
L
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
R
 
K
E
 
D
L
 
I
S
 
A
Q
 
Q
W
 
M
D
 
S
-
 
R
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
G
 
F
A
 
A
Q
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
-
R
 
R
L
 
M
A
 
G
V
 
M
L
 
L
P
 
F
Q
 
Q
T
 
S
S
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
F
F
 
T
A
 
D
F
 
M
R
 
S
V
 
V
E
 
Y
E
 
E
V
 
N
V
 
V
G
 
A
M
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
F
P
 
P
H
 
I
Q
 
R
T
 
A
G
 
H
R
 
T
V
 
K
R
 
L
D
 
S
D
 
E
E
 
N
I
 
L
V
 
I
A
 
A
-
 
E
-
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
L
A
 
E
D
 
S
V
 
V
G
 
G
H
 
-
L
 
L
S
 
R
G
 
G
R
 
T
S
 
E
Y
 
Q
L
 
L
A
 
M
-
 
P
-
 
T
-
x
E
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
x
M
R
 
N
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
H
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
-
L
 
L
W
 
D
P
 
P
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
D
T
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
S
 
A
M
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
I
H
 
V
Q
 
K
H
 
G
T
 
V
T
 
L
L
 
T
Q
 
R
A
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
S
F
 
L
A
 
R
D
 
E
R
 
A
-
 
L
G
 
D
A
 
L
A
 
T
V
 
T
L
 
I
V
 
I
I
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
V
N
 
P
L
 
E
A
 
T
A
 
L
R
 
S
Y
 
I
C
 
A
D
 
D
R
 
Y
I
 
I
L
 
Y
L
 
V
L
 
V
E
 
A
S
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
I
H
 
Q
A
 
G
L
 
E
D
 
G
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
Q
 
E
V
 
L

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
30% identity, 88% coverage: 1:225/255 of query aligns to 4:228/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
M
 
L
L
 
I
R
 
E
V
 
V
E
 
K
N
 
N
L
 
L
Q
 
S
I
 
F
C
 
N
R
|
R
G
 
G
K
 
E
K
x
R
I
 
V
V
 
I
L
 
Y
A
 
D
D
 
N
I
 
I
D
 
S
L
 
L
E
 
N
L
 
I
K
 
R
P
 
R
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
L
 
T
G
 
A
V
 
I
L
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
G
 
R
A
 
L
L
 
I
C
 
G
G
 
G
E
 
Q
L
 
L
R
 
V
P
 
P
D
 
D
H
 
Q
G
 
G
R
 
E
V
 
V
W
 
L
L
 
L
D
 
D
Q
 
G
R
 
K
E
 
D
L
 
I
S
 
A
Q
 
Q
W
 
M
D
 
S
-
 
R
-
 
Q
-
 
E
-
 
L
G
 
F
A
 
A
Q
 
A
R
 
R
A
 
A
Q
 
-
R
 
R
L
 
M
A
 
G
V
 
M
L
 
L
P
 
F
Q
 
Q
T
 
S
S
 
G
T
 
A
L
 
L
D
 
F
F
 
T
A
 
D
F
 
M
R
 
S
V
 
V
E
 
Y
E
 
E
V
 
N
V
 
V
G
 
A
M
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
F
P
 
P
H
 
I
Q
 
R
T
 
A
G
 
H
R
 
T
V
 
K
R
 
L
D
 
S
D
 
E
E
 
N
I
 
L
V
 
I
A
 
A
-
 
E
-
 
L
A
 
V
A
 
A
L
 
L
Q
 
K
A
 
L
A
 
E
D
 
S
V
 
V
G
 
G
H
 
-
L
 
L
S
 
R
G
 
G
R
 
T
S
 
E
Y
 
Q
L
 
L
A
 
M
-
 
P
-
 
T
-
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
M
R
 
N
Q
 
R
R
 
R
V
 
V
H
 
A
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
Q
 
-
L
 
L
W
 
D
P
 
P
G
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
Q
 
D
T
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
S
 
A
M
 
G
L
 
Q
D
 
D
P
 
P
L
 
I
H
 
V
Q
 
K
H
 
G
T
 
V
T
 
L
L
 
T
Q
 
R
A
 
L
I
 
I
R
 
R
E
 
S
F
 
L
A
 
R
D
 
E
R
 
A
-
 
L
G
 
D
A
 
L
A
 
T
V
 
T
L
 
I
V
 
I
I
 
V
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
V
N
 
P
L
 
E
A
 
T
A
 
L
R
 
S
Y
 
I
C
 
A
D
 
D
R
 
Y
I
 
I
L
 
Y
L
 
V
L
 
V
E
 
A
S
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
I
H
 
Q
A
 
G
L
 
E
D
 
G
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
Q
 
E
V
 
L

Query Sequence

>AO353_14450 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_14450
MLRVENLQICRGKKIVLADIDLELKPGEVLGVLGPNGAGKSTLLGALCGELRPDHGRVWL
DQRELSQWDGAQRAQRLAVLPQTSTLDFAFRVEEVVGMGRLPHQTGRVRDDEIVAAALQA
ADVGHLSGRSYLALSGGERQRVHLARVLAQLWPGEAGQTLLLDEPTSMLDPLHQHTTLQA
IREFADRGAAVLVILHDLNLAARYCDRILLLESGRPHALDTPQQVLRPEPLKAVFGLDVL
VQPHPERGHPLIIAR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory