SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO353_14870 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_14870 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1eyyA Crystal structure of the NADP+ dependent aldehyde dehydrogenase from vibrio harveyi. (see paper)
46% identity, 95% coverage: 19:519/529 of query aligns to 2:501/504 of 1eyyA

query
sites
1eyyA
D
 
D
H
 
N
V
 
V
L
 
F
H
 
Y
S
 
A
V
 
T
D
 
N
A
 
A
H
 
F
S
 
T
G
 
G
E
 
E
P
 
A
L
 
L
P
 
P
Y
 
L
D
 
A
F
 
F
S
 
P
Q
 
V
A
 
H
S
 
T
A
 
E
E
 
V
E
 
E
I
 
V
D
 
N
N
 
Q
A
 
A
A
 
A
H
 
T
F
 
A
A
 
A
A
 
A
T
 
K
A
 
V
Y
 
A
P
 
R
I
 
D
Y
 
F
R
 
R
N
 
R
L
 
L
P
 
N
A
 
N
T
 
S
V
 
K
R
 
R
A
 
A
G
 
S
F
 
L
L
 
L
E
 
R
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
S
E
 
E
I
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
R
G
 
S
D
 
D
D
 
D
F
 
I
I
 
I
A
 
A
I
 
R
V
 
A
C
 
H
R
 
L
E
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
E
A
 
V
R
 
R
I
 
L
Q
 
T
G
 
G
E
 
E
R
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
T
S
 
A
G
 
N
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
L
 
L
F
 
F
A
 
A
R
 
D
V
 
V
L
 
V
R
 
N
Q
 
S
G
 
G
D
 
S
F
 
Y
L
 
H
G
 
Q
A
 
A
R
 
I
I
 
L
D
 
D
R
 
T
A
 
P
L
 
N
P
 
P
E
 
T
R
 
R
Q
 
A
P
 
P
F
 
L
P
 
P
R
 
K
P
 
P
D
 
D
V
 
I
R
 
R
Q
 
R
W
 
Q
R
 
Q
I
 
I
G
 
A
L
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
A
S
|
S
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
A
F
 
F
S
 
S
T
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
D
T
 
T
A
 
A
A
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
P
V
 
V
V
 
I
F
 
V
K
|
K
A
 
G
H
|
H
S
x
T
G
 
A
H
 
H
M
 
P
A
 
G
T
 
T
A
 
S
E
 
Q
L
 
I
V
 
V
A
 
A
A
 
E
A
 
C
I
 
I
I
 
E
R
 
Q
A
 
A
A
 
L
Q
 
K
R
 
Q
S
 
E
G
 
Q
M
 
L
P
 
P
E
 
Q
G
 
A
V
 
I
F
 
F
N
 
T
M
 
L
I
 
L
Y
 
Q
G
 
G
A
 
N
-
 
Q
-
x
R
G
 
A
V
 
L
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
S
H
 
H
P
 
P
A
 
E
I
 
I
Q
 
K
A
 
A
V
 
V
G
 
G
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
L
 
V
K
 
G
G
 
G
G
 
G
R
 
R
A
 
A
L
 
L
C
 
F
D
 
N
M
 
L
A
 
A
A
 
H
A
 
E
R
 
R
P
 
P
Q
 
E
P
 
P
I
 
I
P
 
P
V
 
F
F
 
Y
A
 
G
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
A
I
 
I
N
 
N
P
 
P
V
 
T
L
 
F
L
 
I
L
 
F
P
 
P
A
 
S
A
 
A
L
 
M
A
 
R
A
 
A
R
 
K
S
 
-
A
 
A
S
 
D
I
 
L
A
 
A
S
 
D
E
 
Q
L
 
F
S
 
V
A
 
A
S
 
S
I
 
M
V
 
T
L
 
M
G
 
G
G
 
C
G
 
G
Q
 
Q
F
 
F
C
|
C
T
 
T
N
 
K
P
 
P
G
 
G
L
 
V
I
 
V
I
 
F
G
 
A
L
 
L
R
 
N
S
 
T
A
 
P
A
 
E
F
 
T
S
 
Q
A
 
A
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Q
 
T
L
 
A
T
 
Q
A
 
S
Q
 
L
I
 
I
N
 
R
E
 
Q
K
 
Q
P
 
S
P
 
P
Q
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
T
S
 
P
G
 
G
T
 
I
R
 
R
R
 
D
S
 
S
Y
 
Y
E
 
Q
S
 
S
G
 
Q
V
 
V
Q
 
-
R
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
H
 
-
P
 
-
R
 
-
V
 
V
T
 
S
R
 
R
L
 
G
S
 
S
G
 
D
N
 
D
L
 
G
V
 
I
P
 
D
G
 
V
N
 
T
Q
 
F
V
 
S
Q
 
Q
P
 
A
Q
 
E
L
 
S
F
 
P
K
 
C
A
 
V
D
 
A
V
 
S
S
 
A
L
 
L
L
 
F
L
 
V
E
 
T
G
 
S
D
 
S
E
 
E
-
 
N
-
 
W
-
 
R
-
 
K
-
 
H
-
 
P
V
 
A
L
 
W
Q
 
E
E
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
Q
S
 
S
I
 
L
V
 
I
L
 
V
E
 
V
V
 
C
A
 
E
D
 
N
E
 
V
R
 
A
E
 
D
L
 
M
R
 
L
L
 
S
A
 
L
L
 
S
C
 
E
A
 
M
L
 
L
H
 
A
G
 
G
Q
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
T
 
T
L
 
I
I
 
H
A
 
A
E
 
T
P
 
E
Q
 
E
D
 
D
L
 
Y
V
 
P
L
 
Q
C
 
V
A
 
S
Q
 
Q
L
 
L
I
 
I
P
 
P
I
 
R
L
 
L
E
 
E
Q
 
E
K
 
I
A
 
A
G
 
G
R
 
R
L
 
L
L
 
V
L
 
F
N
 
N
G
 
G
Y
 
W
P
 
P
T
 
T
G
 
G
V
 
V
E
 
E
V
 
V
C
 
G
D
 
Y
A
 
A
M
 
M
V
 
V
H
 
H
G
 
G
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
P
 
P
A
 
A
T
 
S
S
 
T
D
 
H
A
 
S
R
 
A
G
 
S
T
 
T
S
 
S
V
 
V
G
 
G
S
 
A
L
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
H
R
 
R
F
 
W
L
 
L
R
 
R
P
 
P
V
 
V
C
 
A
Y
 
Y
Q
 
Q
N
 
A
C
 
L
P
 
P
D
 
E
R
 
S
L
 
L
L
 
L
P
 
P
D
 
D
A
 
S
L
 
L
K
 
K
N
 
A
A
 
E
N
 
N
P
 
P
L
 
L
G
 
E
I
 
I
L
 
A
R
 
R
L
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G

Q8NMB0 Vanillin dehydrogenase; Aromatic aldehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.67; EC 1.2.1.64; EC 1.2.1.96 from Corynebacterium glutamicum (strain ATCC 13032 / DSM 20300 / JCM 1318 / BCRC 11384 / CCUG 27702 / LMG 3730 / NBRC 12168 / NCIMB 10025 / NRRL B-2784 / 534) (see paper)
24% identity, 86% coverage: 34:487/529 of query aligns to 33:473/484 of Q8NMB0

query
sites
Q8NMB0
P
 
P
Y
 
Y
D
 
D
F
 
D
S
 
S
-
 
V
-
 
I
-
 
A
-
 
E
-
 
S
-
 
K
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
A
 
I
E
 
A
E
 
D
I
 
V
D
 
D
N
 
A
A
 
A
A
 
Y
H
 
E
F
 
A
A
 
A
A
 
K
T
 
K
A
 
A
Y
 
Q
P
 
A
I
 
E
Y
 
W
R
 
A
N
 
A
L
 
T
P
 
P
A
 
A
T
 
A
V
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
A
F
 
I
L
 
I
E
 
Y
T
 
R
I
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
L
I
 
L
D
 
E
A
 
E
L
 
H
G
 
R
D
 
E
D
 
E
F
 
I
I
 
V
A
 
E
I
 
W
V
 
L
C
 
I
R
 
K
E
 
E
T
 
S
A
 
G
L
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
Q
 
-
G
 
S
E
 
T
R
 
R
A
 
S
R
 
K
T
 
A
S
 
N
G
 
L
Q
 
E
L
 
I
R
 
T
L
 
L
F
 
A
A
 
G
R
 
N
V
 
I
L
 
T
R
 
K
Q
 
E
G
 
S
D
 
A
F
 
S
L
 
F
G
 
P
A
 
G
R
 
R
I
 
V
D
 
H
-
 
G
R
 
R
A
 
I
L
 
S
P
 
P
E
 
S
R
 
N
Q
 
T
P
 
P
F
 
-
P
 
-
R
 
G
P
 
K
D
 
E
V
 
N
R
 
R
Q
 
V
W
 
Y
R
 
R
I
 
V
G
 
A
L
 
K
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
V
F
 
I
G
 
S
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
N
F
 
L
S
 
S
T
 
I
A
 
R
G
 
-
G
 
-
D
 
S
T
 
V
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
G
 
G
C
 
N
P
 
A
V
 
V
V
 
V
F
 
I
K
|
K
A
 
P
H
 
A
S
 
S
G
 
D
H
 
T
M
 
P
A
 
V
T
 
T
A
 
G
E
 
G
L
 
V
V
 
I
A
 
P
A
 
A
A
 
R
I
 
I
I
 
F
R
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
E
R
x
E
S
 
A
G
 
G
M
 
V
P
 
P
E
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
I
N
 
S
M
 
T
I
 
V
Y
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
-
 
S
-
 
E
V
 
I
G
 
G
E
 
D
A
 
H
L
 
F
V
 
V
K
 
T
H
 
H
P
 
A
A
 
V
I
 
P
Q
 
K
A
 
L
V
 
I
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
T
K
 
P
G
 
V
G
 
G
R
 
R
A
 
R
L
 
V
C
 
G
D
 
E
M
 
L
A
 
A
A
 
I
A
 
N
R
 
G
P
 
G
Q
 
P
P
 
M
I
 
K
P
 
T
V
 
V
F
 
A
A
 
L
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
N
N
 
A
P
 
P
V
 
F
L
 
V
L
 
V
L
 
L
P
 
A
A
 
D
A
 
A
L
 
D
A
 
I
A
 
D
R
 
A
S
 
A
A
 
A
S
 
Q
I
 
A
A
 
A
S
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
A
A
 
V
S
 
G
I
 
A
V
 
F
L
 
L
G
 
H
G
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
F
 
I
C
|
C
T
 
M
N
 
S
P
 
I
G
 
N
L
 
R
I
 
V
I
 
I
G
 
-
L
 
V
R
 
D
S
 
A
A
 
A
A
 
V
F
 
H
S
 
D
A
 
E
F
 
F
I
 
L
E
 
E
Q
 
K
L
 
F
T
 
V
A
 
E
Q
 
A
I
 
V
N
 
K
E
 
N
K
 
I
P
 
P
P
 
T
-
 
G
-
 
D
-
 
P
-
 
S
-
 
A
-
 
E
Q
 
G
T
 
T
L
 
L
L
 
V
N
 
G
S
 
P
G
 
V
T
 
I
R
 
N
R
 
D
S
 
S
Y
 
Q
E
 
L
S
 
S
G
 
G
V
 
L
Q
 
K
R
 
E
L
 
K
L
 
I
E
 
E
H
 
L
P
 
A
R
 
K
V
 
K
T
 
E
R
 
G
L
 
A
S
 
T
G
 
V
N
 
Q
L
 
V
-
 
E
-
 
G
-
 
P
V
 
I
P
 
E
G
 
G
N
 
R
Q
 
L
V
 
V
Q
 
H
P
 
P
Q
 
H
L
 
V
F
 
F
K
 
-
A
 
S
D
 
D
V
 
V
S
 
T
L
 
S
L
 
D
L
 
M
E
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
E
V
 
I
L
 
A
Q
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
L
S
 
I
I
 
S
V
 
V
L
 
L
E
 
K
V
 
A
A
 
D
D
 
D
E
 
E
R
 
A
E
 
H
L
 
-
R
 
-
L
 
-
A
 
-
L
 
-
C
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
T
 
-
A
 
A
T
 
A
L
 
E
I
 
L
A
 
A
E
 
N
P
 
A
Q
 
S
D
 
D
L
 
F
V
 
G
L
 
L
C
 
S
A
 
A
Q
 
A
L
 
V
I
 
W
P
 
S
I
 
K
L
 
D
E
 
I
Q
 
D
K
 
R
A
 
A
G
 
A
R
 
Q
L
 
F
L
 
A
L
 
L
N
 
Q
G
 
I
Y
 
D
P
 
S
T
 
G
G
 
M
V
 
V
E
 
H
V
 
I
C
 
N
D
 
D
A
 
L
M
 
T
V
 
V
H
 
N
G
 
D
G
 
E
P
 
P
Y
 
H
P
 
V
A
 
M
T
 
F
S
 
G
D
 
G
A
 
S
R
 
K
G
 
N
T
 
S
S
 
G
V
 
L
-
 
G
-
 
R
-
 
F
-
 
N
G
 
G
S
 
D
L
 
W
A
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
E
F
 
F

3rhdA Crystal structure of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase gapn from methanocaldococcus jannaschii dsm 2661 complexed with NADP
25% identity, 72% coverage: 41:423/529 of query aligns to 24:392/456 of 3rhdA

query
sites
3rhdA
S
 
S
A
 
R
E
 
E
E
 
E
I
 
A
D
 
K
N
 
E
A
 
A
A
 
I
H
 
D
F
 
T
A
 
A
A
 
E
T
 
K
A
 
Y
Y
 
K
P
 
E
I
 
V
Y
 
M
R
 
K
N
 
N
L
 
L
P
 
P
A
 
I
T
 
T
V
 
K
R
 
R
A
 
Y
G
 
N
F
 
I
L
 
L
E
 
M
T
 
N
I
 
I
A
 
A
E
 
K
E
 
Q
I
 
I
D
 
K
A
 
E
L
 
K
G
 
K
D
 
E
D
 
E
F
 
L
I
 
A
A
 
K
I
 
I
V
 
L
C
 
A
R
 
I
E
 
D
T
 
A
A
 
G
L
 
K
P
 
P
A
 
I
A
 
K
R
 
Q
I
 
A
Q
 
R
G
 
V
E
 
E
R
 
V
A
 
E
R
 
R
T
 
S
S
 
I
G
 
G
Q
 
T
L
 
F
R
 
K
L
 
L
F
 
A
A
 
A
R
 
F
V
 
Y
L
 
V
R
 
K
Q
 
E
G
 
H
D
 
R
F
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
D
 
D
R
 
E
A
 
V
L
 
I
P
 
P
-
 
S
-
 
D
E
 
D
R
 
R
Q
 
L
P
 
I
F
 
F
P
 
T
R
 
R
P
 
R
D
 
E
V
 
-
R
 
-
Q
 
-
W
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
P
V
 
V
A
 
G
V
 
I
F
 
V
G
 
G
A
 
A
S
x
I
-
x
T
-
 
P
-
x
F
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
L
A
 
N
F
 
L
S
 
S
T
 
-
A
 
-
G
 
A
G
 
H
D
 
K
T
 
I
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
N
P
 
V
V
 
I
V
 
V
F
 
H
K
x
H
A
 
P
H
x
S
S
|
S
G
x
K
H
 
A
M
 
P
A
 
L
T
 
V
A
 
C
E
 
I
L
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
K
A
 
I
I
 
I
I
 
E
R
 
N
A
 
A
A
 
L
Q
 
K
R
 
K
S
 
Y
G
 
N
M
 
V
P
 
P
E
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
N
 
N
M
 
L
I
 
L
Y
 
T
G
 
G
A
 
A
G
|
G
-
x
E
-
 
V
V
 
V
G
|
G
E
x
D
A
 
E
L
 
I
V
 
V
K
 
V
H
 
N
P
 
E
A
 
K
I
 
V
Q
 
N
A
 
M
V
 
I
G
 
S
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
L
 
S
K
 
K
G
x
V
G
 
G
R
 
E
A
 
L
L
 
I
C
 
T
D
 
K
M
 
K
A
 
A
A
 
G
A
 
F
R
 
K
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
K
V
 
I
F
 
A
A
 
L
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
V
N
 
N
P
 
P
V
 
N
L
 
I
L
 
V
L
 
L
P
 
K
A
 
D
A
 
-
L
 
-
A
 
A
A
 
D
R
 
L
S
 
N
A
 
K
S
 
A
I
 
V
A
 
N
S
 
A
E
 
L
L
 
I
S
 
K
A
 
G
S
 
S
I
 
F
V
 
I
L
 
Y
G
 
-
G
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
I
N
 
S
P
 
V
G
 
G
L
 
M
I
 
I
I
 
L
G
 
V
L
 
D
R
 
E
S
 
S
A
 
I
A
 
A
F
 
-
S
 
D
A
 
K
F
 
F
I
 
I
E
 
E
Q
 
M
L
 
F
T
 
V
A
 
N
Q
 
K
I
 
-
N
 
-
E
 
-
K
 
-
P
 
-
P
 
-
Q
 
A
T
 
K
L
 
V
L
 
L
N
 
N
S
 
V
G
 
G
T
 
N
R
 
P
R
 
L
S
 
D
Y
 
E
E
 
K
S
 
T
G
 
D
V
 
V
Q
 
G
R
 
P
L
 
L
L
 
I
-
 
S
-
 
V
E
 
E
H
 
H
-
 
A
-
 
E
-
 
W
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
V
P
 
E
R
 
K
V
 
A
T
 
I
R
 
D
L
 
E
S
 
G
G
 
G
N
 
K
L
 
L
V
 
L
P
 
L
G
 
G
N
 
G
Q
 
K
V
 
R
Q
 
D
P
 
K
Q
 
A
L
 
L
F
 
F
K
 
Y
A
 
P
D
 
T
V
 
I
S
 
-
L
 
L
L
 
E
L
 
V
E
 
D
G
 
R
D
 
D
E
 
N
V
 
I
L
 
L
-
 
C
Q
 
K
E
 
T
E
|
E
V
 
T
F
 
F
G
 
A
P
 
P
A
 
V
S
 
I
I
 
P
V
 
I
L
 
I
E
 
R
V
 
T
A
 
N
D
 
E
E
 
E
R
 
E
E
 
M
L
 
I
R
 
D
L
 
I
A
 
A
L
 
N
C
 
S
A
 
T
L
 
E
H
 
Y
G
 
G
Q
 
L
L
 
H
T
 
S
A
 
A
T
 
I
L
 
F

Sites not aligning to the query:

3rhhD Crystal structure of NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase from bacillus halodurans c-125 complexed with NADP
28% identity, 69% coverage: 41:407/529 of query aligns to 39:394/480 of 3rhhD

query
sites
3rhhD
S
 
S
A
 
Q
E
 
E
E
 
E
I
 
V
D
 
N
N
 
D
A
 
A
A
 
I
H
 
Q
F
 
G
A
 
A
A
 
K
T
 
D
A
 
A
Y
 
Q
P
 
K
I
 
I
Y
 
W
R
 
K
N
 
I
L
 
R
P
 
P
A
 
I
T
 
H
V
 
E
R
 
R
A
 
V
G
 
D
F
 
L
L
 
L
E
 
Y
T
 
A
I
 
W
A
 
A
E
 
D
E
 
L
I
 
L
D
 
E
A
 
E
L
 
R
G
 
K
D
 
E
D
 
I
F
 
I
I
 
G
A
 
E
I
 
L
V
 
I
C
 
M
R
 
H
E
 
E
T
 
V
A
 
A
L
 
K
P
 
P
A
 
K
A
 
K
R
 
S
I
 
A
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
V
A
 
S
R
 
R
T
 
T
S
 
A
G
 
D
-
 
I
-
 
I
-
 
R
-
 
H
-
 
T
-
 
A
-
 
D
-
 
E
Q
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
L
F
 
N
A
 
G
R
 
E
V
 
T
L
 
L
R
 
K
Q
 
G
G
 
D
D
 
Q
F
 
F
L
 
K
G
 
G
A
 
G
R
 
S
I
 
S
D
 
K
R
 
K
-
 
I
A
 
A
L
 
L
P
 
V
E
 
E
R
 
R
Q
 
E
P
 
P
F
 
-
P
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
Q
 
-
W
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
L
V
 
A
F
x
I
G
 
S
A
x
P
S
x
F
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
V
A
 
N
F
 
L
S
 
A
T
 
A
A
 
A
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
I
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
V
A
 
T
G
 
G
C
 
N
P
 
T
V
 
V
V
 
V
F
 
F
K
|
K
-
x
P
A
|
A
H
x
T
S
 
Q
G
 
G
H
 
S
M
 
L
A
 
S
T
 
G
A
 
I
E
 
K
L
 
M
V
 
V
A
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
I
 
-
R
 
E
A
 
A
A
 
L
Q
 
A
R
 
D
S
 
A
G
 
G
M
 
A
P
 
P
E
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
I
N
 
Q
M
 
V
I
 
V
Y
 
T
G
 
G
A
 
R
G
|
G
-
 
S
-
 
V
V
 
I
G
|
G
E
x
D
A
 
H
L
 
L
V
 
V
K
 
E
H
 
H
P
 
P
A
 
G
I
 
I
Q
 
D
A
 
M
V
 
I
G
 
T
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
x
G
L
 
T
K
 
T
G
x
T
G
 
G
R
 
E
A
 
R
L
 
I
C
 
S
D
 
E
M
 
K
A
 
A
A
 
-
A
 
-
R
 
-
P
 
-
Q
 
K
P
 
M
I
 
I
P
 
P
V
 
V
F
 
V
A
 
L
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
D
P
 
P
V
 
A
L
 
I
L
 
V
L
 
L
P
 
D
A
 
D
A
 
A
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
D
S
 
L
E
 
K
L
 
L
S
 
T
A
 
A
S
 
S
I
 
Q
V
 
I
L
 
V
G
 
S
G
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
S
-
 
Y
-
 
S
G
 
G
Q
 
Q
F
 
R
C
|
C
T
 
T
N
 
A
P
 
I
G
 
K
L
 
R
I
 
V
I
 
F
G
 
V
L
 
Q
R
 
D
S
 
S
A
 
V
A
 
A
-
 
D
-
 
Q
F
 
L
S
 
V
A
 
A
F
 
N
I
 
I
E
 
K
Q
 
E
L
 
L
T
 
V
A
 
E
Q
 
Q
I
 
L
N
 
T
E
 
V
K
 
G
P
 
S
P
 
P
Q
 
E
T
 
D
-
 
D
-
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
T
-
 
P
L
 
V
L
 
I
N
 
D
S
 
E
G
 
K
T
 
S
R
 
A
R
 
A
S
 
F
Y
 
I
E
 
Q
S
 
G
G
 
L
V
 
I
Q
 
D
R
 
D
L
 
A
L
 
L
E
 
E
H
 
N
P
 
G
R
 
-
V
 
A
T
 
T
R
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
N
L
 
K
V
 
R
P
 
Q
G
 
G
N
 
N
Q
 
L
V
 
L
Q
 
S
P
 
P
Q
 
T
L
 
L
F
 
L
K
 
D
A
 
-
D
 
D
V
 
V
S
 
T
L
 
P
L
 
A
L
 
M
E
 
-
G
 
-
D
 
-
E
 
R
V
 
V
L
 
A
Q
 
W
E
 
E
E
|
E
V
 
P
F
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
V
S
 
L
I
 
P
V
 
I
L
 
I
E
 
R
V
 
V
A
 
K
D
 
D
E
 
A
R
 
N
E
 
E

Sites not aligning to the query:

Q59931 NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase [NADP(+)]; Non-phosphorylating glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase; Triosephosphate dehydrogenase; EC 1.2.1.9 from Streptococcus mutans serotype c (strain ATCC 700610 / UA159) (see 3 papers)
28% identity, 55% coverage: 41:329/529 of query aligns to 38:307/475 of Q59931

query
sites
Q59931
S
 
S
A
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
D
 
D
N
 
Y
A
 
V
A
 
Y
H
 
A
F
 
S
A
 
A
A
 
K
T
 
K
A
 
A
Y
 
Q
P
 
P
I
 
A
Y
 
W
R
 
R
N
 
S
L
 
L
P
 
S
A
 
Y
T
 
I
V
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
L
 
L
E
 
H
T
 
K
I
 
V
A
 
A
E
 
D
E
 
I
I
 
L
D
 
M
A
 
R
L
 
D
G
 
K
D
 
E
D
 
K
F
 
I
I
 
G
A
 
A
I
 
V
V
 
L
C
 
S
R
 
K
E
 
E
T
 
V
A
 
A
L
 
K
P
 
G
A
 
Y
A
 
K
R
 
S
I
 
A
Q
 
V
G
 
S
E
 
E
R
 
V
A
 
V
R
|
R
T
 
T
S
 
A
G
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
N
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
E
Q
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
M
F
 
E
A
 
G
R
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
E
Q
 
G
G
 
G
D
 
S
F
 
F
L
 
E
G
 
A
A
 
A
R
 
S
I
 
K
D
 
K
R
 
K
-
 
I
A
 
A
L
 
V
P
 
V
E
 
R
R
 
R
Q
 
E
P
 
P
F
 
-
P
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
Q
 
-
W
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
V
G
 
G
P
 
L
V
 
V
A
 
L
V
 
A
F
 
I
G
x
S
A
 
P
S
 
F
N
 
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
V
A
 
-
F
 
-
S
 
N
T
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
S
D
 
K
T
 
I
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
V
V
 
I
V
 
A
F
 
F
K
|
K
A
 
P
H
 
P
S
x
T
G
 
Q
H
 
G
M
 
S
A
 
I
T
 
S
A
 
G
E
 
L
L
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
F
I
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
G
M
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
T
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
A
 
R
G
 
G
-
 
S
-
 
E
V
 
I
G
 
G
E
x
D
A
 
Y
L
 
I
V
 
V
K
 
E
H
 
H
P
 
Q
A
 
A
I
 
V
Q
 
N
A
 
F
V
 
I
G
 
N
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
L
x
T
K
x
G
G
x
I
G
|
G
R
x
E
A
x
R
L
x
I
C
x
G
D
x
K
M
|
M
A
|
A
A
x
G
A
x
M
R
|
R
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
I
 
-
P
|
P
V
x
I
F
x
M
A
x
L
E
|
E
M
x
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
D
P
 
S
V
 
A
L
 
I
L
 
V
L
 
L
P
 
E
A
 
D
A
 
A
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
D
S
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
A
S
 
K
I
 
N
V
 
I
L
 
I
G
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
Y
-
 
S
G
 
G
Q
 
Q
F
 
R
C
 
C
T
 
T
N
 
A
P
 
V
G
 
K
L
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
V
L
 
M
R
 
E
S
 
S
A
 
V
A
 
A
F
 
-
S
 
-
A
 
-
F
 
-
I
 
-
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
T
 
V
A
 
E
Q
 
K
I
 
I
N
 
R
E
 
E
K
 
K

Sites not aligning to the query:

2esdA Crystal structure of thioacylenzyme intermediate of an NADP dependent aldehyde dehydrogenase (see paper)
29% identity, 55% coverage: 41:329/529 of query aligns to 37:306/474 of 2esdA

query
sites
2esdA
S
 
S
A
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
D
 
D
N
 
Y
A
 
V
A
 
Y
H
 
A
F
 
S
A
 
A
A
 
K
T
 
K
A
 
A
Y
 
Q
P
 
P
I
 
A
Y
 
W
R
 
R
N
 
A
L
 
L
P
 
S
A
 
Y
T
 
I
V
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
L
 
L
E
 
H
T
 
K
I
 
V
A
 
A
E
 
D
E
 
I
I
 
L
D
 
M
A
 
R
L
 
D
G
 
K
D
 
E
D
 
K
F
 
I
I
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
L
C
 
S
R
 
K
E
 
E
T
 
V
A
 
A
L
 
K
P
 
G
A
 
Y
A
 
K
R
 
S
I
 
A
Q
 
V
G
 
S
E
 
E
R
 
V
A
 
V
R
|
R
T
 
T
S
 
A
G
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
N
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
E
Q
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
M
F
 
E
A
 
G
R
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
E
Q
 
G
G
 
G
D
 
S
F
 
F
L
 
E
G
 
A
A
 
A
R
 
S
I
 
K
D
 
K
R
 
K
-
 
I
A
 
A
L
 
V
P
 
V
E
 
R
R
 
R
Q
 
E
P
 
P
F
 
-
P
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
Q
 
-
W
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
V
G
 
G
P
 
L
V
 
V
A
 
L
V
 
A
F
 
I
G
 
S
A
 
P
S
x
F
N
|
N
F
x
Y
P
 
P
L
 
V
A
 
-
F
 
-
S
 
N
T
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
S
D
 
K
T
 
I
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
V
V
 
I
V
 
A
F
 
F
K
|
K
A
 
P
H
x
P
S
x
T
G
 
Q
H
 
G
M
 
S
A
 
I
T
 
S
A
 
G
E
 
L
L
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
F
I
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
G
M
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
T
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
A
 
R
G
|
G
-
 
S
-
 
E
V
 
I
G
|
G
E
x
D
A
 
Y
L
 
I
V
 
V
K
 
E
H
 
H
P
 
Q
A
 
A
I
 
V
Q
 
N
A
 
F
V
 
I
G
 
N
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
L
 
T
K
 
G
G
x
I
G
 
G
R
 
E
A
 
R
L
 
I
C
 
G
D
 
K
M
 
M
A
 
A
A
 
G
A
 
M
R
 
R
P
 
P
Q
 
I
P
 
M
I
 
L
P
x
A
V
 
L
F
 
G
A
 
G
E
 
K
M
 
D
S
 
S
S
 
A
I
 
I
N
 
-
P
 
-
V
 
-
L
 
V
L
 
L
L
 
E
P
 
D
A
 
A
A
 
D
L
 
L
A
 
-
A
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
-
S
 
-
E
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
A
S
 
K
I
 
N
V
 
I
L
 
I
G
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
Y
-
 
S
G
 
G
Q
 
Q
F
x
R
C
|
C
T
|
T
N
 
A
P
 
V
G
 
K
L
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
V
L
 
M
R
 
E
S
 
S
A
 
V
A
 
A
F
 
-
S
 
-
A
 
-
F
 
-
I
 
-
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
T
 
V
A
 
E
Q
 
K
I
 
I
N
 
R
E
 
E
K
 
K

Sites not aligning to the query:

Q84LK3 Betaine aldehyde dehydrogenase 2; OsBADH2; EC 1.2.1.8 from Oryza sativa subsp. japonica (Rice) (see paper)
23% identity, 66% coverage: 59:407/529 of query aligns to 66:409/503 of Q84LK3

query
sites
Q84LK3
Y
 
W
R
 
A
N
 
R
L
 
A
P
 
P
A
 
G
T
 
A
V
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
K
F
 
Y
L
 
L
E
 
R
T
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
A
E
 
K
I
 
I
D
 
I
A
 
E
L
 
R
G
 
K
D
 
S
D
 
E
F
 
L
I
 
A
A
 
R
I
 
L
V
 
E
C
 
T
R
 
L
E
 
D
T
 
C
A
 
G
L
 
K
P
 
P
A
 
L
A
 
D
R
 
E
I
 
A
Q
 
A
G
 
W
E
 
D
R
 
M
A
 
D
R
 
D
T
 
V
S
 
A
G
 
G
Q
 
C
L
 
F
R
 
E
L
 
Y
F
 
F
A
 
A
R
 
D
V
 
-
L
 
-
R
 
-
Q
 
-
G
 
-
D
 
-
F
 
-
L
 
L
G
 
A
A
 
E
R
 
S
I
 
L
D
 
D
R
 
K
A
 
R
L
 
Q
P
 
N
E
 
A
R
 
P
Q
 
V
P
 
S
F
 
L
P
 
P
R
 
M
P
 
E
D
 
N
V
 
F
R
 
K
Q
 
C
W
 
Y
-
 
L
-
 
R
R
 
K
I
 
E
G
 
P
L
 
I
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
L
F
 
I
G
 
T
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
 
M
S
 
A
T
 
T
A
 
-
G
 
-
G
x
W
D
 
K
T
 
V
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
P
 
T
V
 
A
V
 
V
F
 
L
K
 
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
G
 
-
H
 
-
M
 
-
A
 
-
T
 
L
A
 
A
E
 
S
L
 
V
V
 
T
A
 
C
A
 
L
A
 
E
I
 
L
I
 
A
R
 
D
A
 
V
A
 
C
Q
 
K
R
 
E
S
 
V
G
 
G
M
 
L
P
 
P
E
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
L
N
 
N
M
 
I
I
 
V
Y
 
T
G
 
G
A
 
L
G
 
G
-
 
S
-
 
E
V
 
A
G
 
G
E
 
A
A
 
P
L
 
L
V
 
S
K
 
S
H
 
H
P
 
P
A
 
G
I
 
V
Q
 
D
A
 
K
V
 
V
G
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
Y
K
 
E
G
 
T
G
 
G
R
 
K
A
 
K
L
 
I
C
 
-
D
 
-
M
 
M
A
 
A
A
 
S
A
 
A
R
 
A
P
 
P
Q
 
M
P
 
V
I
 
K
P
 
P
V
 
V
F
 
S
A
 
L
E
 
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
I
L
 
V
L
 
V
L
 
F
P
 
D
A
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
S
 
D
I
 
V
A
 
D
S
 
V
E
 
E
L
 
K
S
 
A
A
 
V
S
 
E
I
 
W
V
 
T
L
 
L
G
 
F
G
 
G
-
 
C
-
 
F
-
 
W
-
 
T
-
 
N
G
 
G
Q
 
Q
F
 
I
C
 
C
T
 
S
N
 
A
P
 
T
G
 
S
L
 
R
I
 
L
I
 
I
G
 
-
L
 
L
R
 
H
S
 
K
A
 
K
A
 
I
F
 
A
S
 
K
A
 
E
F
 
F
I
 
Q
E
 
E
Q
 
R
L
 
M
T
 
V
A
 
A
Q
 
W
I
 
A
N
 
K
E
 
N
K
 
I
P
 
K
P
 
V
Q
 
S
T
 
D
L
 
P
L
 
L
N
 
E
S
 
E
G
 
G
T
 
C
R
 
R
R
 
L
S
 
G
-
 
P
-
 
V
-
 
V
Y
 
S
E
 
E
S
 
G
G
 
Q
V
 
Y
Q
 
E
R
 
K
L
 
I
L
 
K
E
 
Q
H
 
F
P
 
V
R
 
S
V
 
T
T
 
A
R
 
K
L
 
S
S
 
Q
G
 
G
N
 
A
L
 
T
V
 
I
P
 
L
G
 
T
N
 
G
Q
 
G
V
 
V
Q
 
R
P
 
P
Q
 
K
L
 
H
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
G
F
 
F
K
 
Y
A
 
I
D
 
E
V
 
P
S
 
T
L
 
I
L
 
I
L
 
T
E
 
D
G
 
V
D
 
D
-
 
T
-
 
S
-
 
M
E
 
Q
V
 
I
L
 
W
Q
 
R
E
 
E
E
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
V
S
 
L
I
 
C
V
 
V
L
 
K
E
 
E
V
 
F
A
 
S
D
 
T
E
 
E
R
 
E
E
 
E

3ty7B Crystal structure of aldehyde dehydrogenase family protein from staphylococcus aureus
24% identity, 69% coverage: 38:404/529 of query aligns to 38:393/454 of 3ty7B

query
sites
3ty7B
S
 
A
Q
 
K
A
 
G
S
 
N
A
 
K
E
 
A
E
 
D
I
 
V
D
 
D
N
 
K
A
 
A
A
 
V
H
 
E
F
 
A
A
 
A
A
 
D
T
 
D
A
 
V
Y
 
Y
P
 
L
I
 
E
Y
 
F
R
 
R
N
 
H
L
 
T
P
 
S
A
 
V
T
 
K
V
 
E
R
 
R
A
 
Q
G
 
A
F
 
L
L
 
L
E
 
D
T
 
K
I
 
I
A
 
V
E
 
K
E
 
E
I
 
Y
D
 
E
A
 
N
L
 
R
G
 
K
D
 
D
D
 
D
F
 
I
I
 
V
A
 
Q
I
 
A
V
 
I
C
 
T
R
 
D
E
 
E
T
 
L
A
 
G
L
 
A
P
 
P
A
 
-
A
 
-
R
 
-
I
 
-
Q
 
-
G
 
-
E
 
-
R
 
-
A
 
-
R
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
Q
 
-
L
 
L
R
 
S
L
 
L
F
 
S
A
 
E
R
 
R
V
 
V
L
 
H
R
 
Y
Q
 
Q
-
 
M
-
 
G
-
 
L
G
 
N
D
 
H
F
 
F
L
 
V
G
 
A
A
 
A
R
 
R
-
 
D
-
 
A
I
 
L
D
 
D
R
 
N
A
 
Y
L
 
E
P
 
F
E
 
E
R
 
E
Q
 
R
P
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
R
P
 
G
D
 
D
V
 
D
R
 
L
Q
 
V
W
 
V
R
 
K
I
 
E
G
 
A
L
 
I
G
 
G
P
 
V
V
 
S
A
 
G
V
 
L
F
 
I
G
 
T
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
T
A
 
N
F
 
Q
S
 
T
T
 
S
A
 
L
G
 
-
G
 
-
D
 
K
T
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
S
P
 
P
V
 
V
V
 
V
F
 
L
K
|
K
A
 
P
H
 
-
S
 
-
G
 
-
H
 
-
M
 
-
A
 
-
T
 
S
A
 
E
E
|
E
L
 
T
V
 
P
A
 
F
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
I
R
 
L
A
 
A
A
 
E
-
 
I
-
 
F
Q
 
D
R
 
K
S
 
V
G
 
G
M
 
V
P
 
P
E
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
L
I
 
V
Y
 
N
G
 
G
-
 
D
-
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
E
 
N
A
 
P
L
 
L
V
 
S
K
 
E
H
 
H
P
 
P
A
 
K
I
 
V
Q
 
R
A
 
M
V
 
M
G
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
L
 
G
K
 
P
G
 
T
G
 
G
R
 
S
A
 
K
L
 
I
C
 
M
D
 
E
M
 
K
A
 
A
A
 
A
A
 
K
R
 
D
P
 
F
Q
 
K
P
 
K
I
 
V
P
 
S
V
 
L
F
 
-
A
 
-
E
|
E
M
 
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
Y
L
 
I
L
 
V
L
 
L
P
 
D
A
 
D
A
 
V
L
 
D
A
 
I
A
 
K
R
 
E
S
 
A
A
 
A
S
 
K
I
 
A
A
 
T
S
 
-
E
 
-
L
 
-
S
 
T
A
 
G
S
 
K
I
 
V
V
 
V
L
 
N
G
 
N
G
 
T
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
-
P
 
A
G
 
G
L
 
T
I
 
R
I
 
V
G
 
L
L
 
V
R
 
P
S
 
N
A
 
K
A
 
I
F
 
K
S
 
D
A
 
A
F
 
F
I
 
L
E
 
A
Q
 
E
L
 
L
T
 
K
A
 
E
Q
 
Q
I
 
F
N
 
S
E
 
Q
K
 
-
P
 
-
P
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
V
N
 
R
S
 
V
G
 
G
T
 
N
R
 
P
R
 
R
S
 
E
Y
 
D
E
 
G
S
 
T
G
 
Q
V
 
V
Q
 
G
R
 
P
L
 
I
L
 
I
E
 
S
H
 
K
P
 
K
R
 
Q
V
 
F
T
 
D
R
 
Q
L
 
V
S
 
Q
G
 
N
N
 
Y
L
 
I
V
 
N
P
 
K
G
 
G
N
 
I
Q
 
E
V
 
E
Q
 
G
P
 
A
Q
 
E
L
 
L
F
 
F
K
 
Y
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
E
-
 
G
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
G
-
 
Y
-
 
F
A
 
A
D
 
R
V
 
P
S
 
T
L
 
I
L
 
F
L
 
I
E
 
N
G
 
V
D
 
D
E
 
N
-
 
Q
-
 
M
-
 
T
V
 
I
L
 
A
Q
 
Q
E
 
E
E
|
E
V
 
I
F
 
F
G
 
G
P
 
P
A
 
V
S
 
M
I
 
S
V
 
V
L
 
I
E
 
T
V
 
Y
A
 
N
D
 
D

Sites not aligning to the query:

1qi1B Ternary complex of an NADP dependent aldehyde dehydrogenase (see paper)
28% identity, 55% coverage: 41:329/529 of query aligns to 37:306/474 of 1qi1B

query
sites
1qi1B
S
 
S
A
 
T
E
 
E
E
 
E
I
 
V
D
 
D
N
 
Y
A
 
V
A
 
Y
H
 
A
F
 
S
A
 
A
A
 
K
T
 
K
A
 
A
Y
 
Q
P
 
P
I
 
A
Y
 
W
R
 
R
N
 
A
L
 
L
P
 
S
A
 
Y
T
 
I
V
 
E
R
 
R
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
L
 
L
E
 
H
T
 
K
I
 
V
A
 
A
E
 
D
E
 
I
I
 
L
D
 
M
A
 
R
L
 
D
G
 
K
D
 
E
D
 
K
F
 
I
I
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
L
C
 
S
R
 
K
E
 
E
T
 
V
A
 
A
L
 
K
P
 
G
A
 
Y
A
 
K
R
 
S
I
 
A
Q
 
V
G
 
S
E
 
E
R
 
V
A
 
V
R
 
R
T
 
T
S
 
A
G
 
E
-
 
I
-
 
I
-
 
N
-
 
Y
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
E
Q
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
M
F
 
E
A
 
G
R
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
E
Q
 
G
G
 
G
D
 
S
F
 
F
L
 
E
G
 
A
A
 
A
R
 
S
I
 
K
D
 
K
R
 
K
-
 
I
A
 
A
L
 
V
P
 
V
E
 
R
R
 
R
Q
 
E
P
 
P
F
 
-
P
 
-
R
 
-
P
 
-
D
 
-
V
 
-
R
 
-
Q
 
-
W
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
V
G
 
G
P
 
L
V
 
V
A
 
L
V
 
A
F
 
I
G
 
S
A
x
P
S
x
F
N
|
N
F
x
Y
P
 
P
L
 
V
A
 
-
F
 
-
S
 
N
T
x
L
A
 
A
G
 
G
G
 
S
D
 
K
T
 
I
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
I
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
V
V
 
I
V
 
A
F
 
F
K
|
K
A
 
P
H
x
P
S
x
T
G
 
Q
H
 
G
M
 
S
A
 
I
T
 
S
A
 
G
E
 
L
L
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
A
I
 
F
I
 
A
R
 
E
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
G
M
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
T
I
 
I
Y
 
T
G
 
G
A
 
R
G
|
G
-
 
S
-
 
E
V
 
I
G
|
G
E
 
D
A
 
Y
L
 
I
V
 
V
K
 
E
H
 
H
P
 
Q
A
 
A
I
 
V
Q
 
N
A
 
F
V
 
I
G
 
N
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
L
 
T
K
 
G
G
x
I
G
 
G
R
 
E
A
 
R
L
 
I
C
 
G
D
 
K
M
 
M
A
 
A
A
 
G
A
 
M
R
 
R
P
 
-
Q
 
-
P
 
-
I
 
-
P
 
P
V
 
I
F
 
M
A
 
L
E
|
E
M
x
L
S
 
G
S
 
G
I
 
K
N
 
D
P
 
S
V
 
A
L
 
I
L
 
V
L
 
L
P
 
E
A
 
D
A
 
A
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
S
 
-
I
 
-
A
 
D
S
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
A
S
 
K
I
 
N
V
 
I
L
 
I
G
 
A
G
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
G
-
 
Y
-
 
S
G
 
G
Q
 
Q
F
x
R
C
x
S
T
|
T
N
 
A
P
 
V
G
 
K
L
 
R
I
 
V
I
 
L
G
 
V
L
 
M
R
 
E
S
 
S
A
 
V
A
 
A
F
 
-
S
 
-
A
 
-
F
 
-
I
 
-
E
 
D
Q
 
E
L
 
L
T
 
V
A
 
E
Q
 
K
I
 
I
N
 
R
E
 
E
K
 
K

Sites not aligning to the query:

6wsbA Crystal structure of a betaine aldehyde dehydrogenase from burkholderia pseudomallei bound to cofactor NAD (see paper)
26% identity, 74% coverage: 16:407/529 of query aligns to 17:401/489 of 6wsbA

query
sites
6wsbA
A
 
A
A
 
T
G
 
S
D
 
G
H
 
K
V
 
T
L
 
F
H
 
D
S
 
T
V
 
F
D
 
D
A
 
P
H
 
A
S
 
T
G
 
G
E
 
E
P
 
L
L
 
L
P
 
A
Y
 
-
D
 
R
F
 
V
S
 
Q
Q
 
Q
A
 
A
S
 
S
A
 
A
E
 
D
E
 
D
I
 
V
D
 
D
N
 
R
A
 
A
A
 
V
H
 
A
F
 
S
A
 
A
A
 
R
T
 
E
A
 
G
Y
 
Q
P
 
R
I
 
E
Y
 
W
R
 
A
N
 
A
L
 
M
P
 
T
A
 
A
T
 
M
V
 
Q
R
 
R
A
 
S
G
 
R
F
 
I
L
 
L
E
 
R
T
 
R
I
 
A
A
 
V
E
 
E
E
 
L
I
 
L
D
 
R
A
 
E
L
 
R
G
 
N
D
 
D
D
 
A
F
 
L
I
 
A
A
 
E
I
 
L
V
 
E
C
 
M
R
 
R
E
 
D
T
 
T
A
 
G
L
 
K
P
 
P
A
 
I
A
 
A
R
 
E
I
 
T
Q
 
R
G
 
A
E
 
V
R
 
D
A
 
I
R
 
V
T
 
T
S
 
G
G
 
-
Q
 
-
L
 
-
R
 
-
L
 
-
F
 
-
A
 
A
R
 
D
V
 
V
L
 
I
R
 
E
Q
 
Y
G
 
Y
D
 
A
F
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
T
R
 
A
I
 
I
D
 
E
-
 
G
R
 
L
A
 
Q
L
 
V
P
 
P
E
 
L
R
 
R
Q
 
-
P
 
-
F
 
-
P
 
P
R
 
E
P
 
S
D
 
F
V
 
V
R
 
Y
Q
 
T
W
 
R
R
 
R
I
 
E
G
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
C
A
 
A
V
 
G
F
x
I
G
|
G
A
|
A
S
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
L
 
I
A
 
-
F
 
-
S
 
Q
T
 
I
A
 
A
G
 
C
G
 
W
D
 
K
T
 
S
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
A
V
 
M
V
 
I
F
 
F
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
x
E
G
 
-
H
 
-
M
 
-
A
 
-
T
 
V
A
 
T
E
 
P
L
 
L
V
 
S
A
 
A
A
 
L
A
 
K
I
 
L
I
 
A
R
 
E
A
 
I
A
 
Y
Q
 
T
R
 
E
S
 
A
G
 
G
M
 
V
P
 
P
E
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
V
I
 
V
Y
 
Q
G
 
G
A
 
D
G
|
G
-
 
S
V
 
V
G
|
G
E
x
A
A
 
L
L
 
L
V
 
S
K
 
A
H
 
H
P
 
P
A
 
G
I
 
I
Q
 
A
A
 
K
V
 
V
G
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
x
G
L
 
V
K
 
E
G
x
T
G
 
G
R
 
K
A
 
K
L
x
V
C
 
M
D
 
S
M
 
L
A
 
A
A
 
G
A
 
A
R
 
S
P
 
S
Q
 
L
P
 
K
I
 
-
P
 
E
V
 
V
F
 
T
A
 
M
E
|
E
M
x
L
S
x
G
S
 
G
I
 
K
N
 
S
P
 
P
V
 
L
L
 
I
L
 
V
L
 
F
P
 
D
A
 
D
A
 
A
L
 
D
A
 
L
A
 
-
R
 
-
S
 
D
A
 
R
S
 
A
I
 
A
A
 
D
S
 
I
E
 
A
L
 
V
S
 
T
A
 
A
S
 
N
I
 
F
V
 
-
L
 
F
G
 
S
G
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
V
C
|
C
T
 
T
N
 
N
P
 
-
G
 
G
L
 
T
I
 
R
I
 
V
G
 
F
L
 
V
R
 
Q
S
 
Q
A
 
A
A
 
V
F
 
K
S
 
D
A
 
A
F
 
F
I
 
V
E
 
E
Q
 
R
L
 
V
T
 
L
A
 
A
Q
 
R
I
 
V
N
 
A
E
 
R
-
 
I
-
 
R
-
 
V
-
 
G
K
 
K
P
 
P
P
 
S
Q
 
D
T
 
S
L
 
D
L
 
T
N
 
N
S
 
F
G
 
G
T
 
P
R
 
L
R
 
A
S
 
S
Y
 
-
E
 
A
S
 
A
G
 
Q
V
 
L
Q
 
D
R
 
K
L
 
V
L
 
L
E
 
G
H
 
Y
P
 
I
R
 
D
V
 
S
T
 
G
R
 
K
L
 
A
S
 
E
G
 
G
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
N
-
 
D
N
 
H
L
 
F
V
 
A
P
 
S
G
 
G
N
 
Q
Q
 
Y
V
 
V
Q
 
A
P
 
P
Q
 
T
L
 
V
F
 
F
K
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
L
 
-
E
 
-
G
 
G
D
 
D
-
 
C
-
 
R
-
 
D
-
 
D
-
 
M
E
 
R
V
 
I
L
 
V
Q
 
R
E
 
E
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
A
 
V
S
 
M
I
 
S
V
 
I
L
 
L
E
 
S
V
 
F
A
 
E
D
 
T
E
 
E
R
 
D
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3ju8A Crystal structure of succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa.
27% identity, 57% coverage: 4:302/529 of query aligns to 1:280/486 of 3ju8A

query
sites
3ju8A
I
 
M
I
 
M
G
 
S
H
 
T
N
 
H
F
 
Y
I
 
I
G
 
A
F
 
G
G
 
Q
R
 
W
S
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
Q
D
 
G
H
 
E
V
 
T
L
 
L
H
 
E
S
 
S
V
 
L
D
 
D
A
 
P
H
 
-
S
 
V
G
 
G
E
 
Q
P
 
G
L
 
V
P
 
V
Y
 
W
D
 
S
F
 
G
S
 
R
Q
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
E
 
T
E
 
Q
I
 
V
D
 
D
N
 
A
A
 
A
A
 
V
H
 
C
F
 
A
A
 
A
A
 
R
T
 
E
A
 
A
Y
 
F
P
 
P
I
 
A
Y
 
W
R
 
A
N
 
R
L
 
R
P
 
P
A
 
L
T
 
E
V
 
Q
R
 
R
A
 
I
G
 
E
F
 
L
L
 
L
E
 
E
T
 
R
I
 
F
A
 
A
E
 
A
E
 
T
I
 
L
D
 
K
A
 
S
L
 
R
G
 
A
D
 
D
D
 
E
F
 
L
I
 
A
A
 
R
I
 
V
V
 
I
C
 
G
R
 
E
E
 
E
T
 
T
A
 
G
L
 
K
P
 
P
A
 
L
A
 
W
R
 
E
I
 
S
Q
 
A
G
 
T
E
 
E
R
 
V
A
 
T
R
 
S
T
 
M
S
 
V
G
 
N
Q
 
K
L
 
V
R
 
A
L
 
I
F
 
S
A
 
V
R
 
Q
V
 
A
L
 
F
R
 
R
Q
 
E
-
 
R
-
 
T
G
 
G
D
 
E
F
 
K
L
 
S
G
 
G
A
 
P
R
 
L
I
 
A
D
 
D
R
 
A
A
 
T
L
 
A
P
 
V
E
 
L
R
 
R
Q
 
H
P
 
-
F
 
-
P
 
-
R
 
K
P
 
P
D
 
H
V
 
-
R
 
-
Q
 
-
W
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
G
P
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
F
 
F
G
|
G
A
 
P
S
x
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
L
 
G
A
 
H
F
x
L
S
 
P
T
 
N
A
 
-
G
 
-
G
 
G
D
 
H
T
 
I
A
 
V
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
L
A
 
A
G
 
G
C
 
N
P
 
C
V
 
V
V
 
V
F
 
F
K
|
K
A
 
P
H
x
S
S
 
E
G
 
L
H
 
T
M
 
P
A
 
K
T
 
V
A
 
A
E
 
E
L
 
L
V
 
T
A
 
L
A
 
K
A
 
A
I
 
W
I
 
I
R
 
Q
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
R
 
-
S
 
-
G
 
G
M
 
L
P
 
P
E
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
L
N
 
N
M
 
L
I
 
V
Y
 
Q
G
 
G
A
 
G
-
 
R
G
 
E
V
 
T
G
 
G
E
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
A
K
 
A
H
 
H
P
 
R
A
 
G
I
 
L
Q
 
D
A
 
G
V
 
L
G
 
F
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
L
 
S
K
 
R
G
x
T
G
 
G
R
 
N
A
 
L
L
 
L
C
 
H
D
 
S
M
 
Q
A
 
F
A
 
G
A
 
G
R
 
Q
P
 
P
Q
 
Q
P
 
K
I
 
I
P
 
L
V
 
A
F
 
L
A
 
-
E
|
E
M
|
M
S
x
G
S
 
G
I
 
N
N
 
N
P
 
P
V
 
L
L
 
V
L
 
V
L
 
-
P
 
-
A
 
E
A
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
D
R
 
L
S
 
D
A
 
A
S
 
A
I
 
V
A
 
Y
S
 
T
E
 
I
L
 
I
S
 
Q
A
 
S
S
 
A
I
 
F
V
 
I
L
 
-
G
 
S
G
 
A
G
 
G
Q
 
Q
F
 
R
C
|
C
T
 
T

Sites not aligning to the query:

4u3wA X-ray crystal structure of 2-aminomuconate 6-semialdehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
30% identity, 41% coverage: 36:253/529 of query aligns to 32:243/485 of 4u3wA

query
sites
4u3wA
D
 
D
F
 
V
S
 
C
Q
 
E
A
 
A
S
 
D
A
 
A
E
 
A
E
 
L
I
 
V
D
 
D
N
 
S
A
 
A
A
 
V
H
 
Q
F
 
A
A
 
A
A
 
H
T
 
A
A
 
A
Y
 
Q
P
 
K
I
 
A
-
 
G
Y
 
W
R
 
R
N
 
D
L
 
T
P
 
T
A
 
P
T
 
A
V
 
Q
R
 
R
A
 
A
G
 
A
F
 
W
L
 
L
E
 
H
T
 
K
I
 
I
A
 
A
E
 
D
E
 
G
I
 
I
D
 
E
A
 
A
L
 
R
G
 
F
D
 
D
D
 
E
F
 
F
I
 
V
A
 
A
I
 
A
V
 
E
C
 
V
R
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
G
L
 
R
P
 
P
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
I
 
A
Q
 
R
G
 
T
-
 
L
E
 
D
R
 
I
A
 
A
R
 
R
T
 
G
S
 
I
G
 
A
Q
 
N
L
 
F
R
 
R
L
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
D
V
 
L
L
 
V
R
 
R
Q
 
T
G
 
A
D
 
S
F
 
-
L
 
-
G
 
G
A
 
E
R
 
Y
I
 
F
D
 
E
R
 
T
A
 
H
L
 
A
P
 
A
E
 
D
R
 
G
Q
 
S
P
 
E
F
 
L
P
 
I
R
 
N
P
 
Y
D
 
V
V
 
T
R
 
R
Q
 
K
W
 
-
R
 
-
I
 
-
G
 
P
L
 
L
G
 
G
P
 
V
V
 
I
A
 
G
V
 
I
F
 
I
G
 
S
A
 
P
S
 
W
N
|
N
F
 
L
P
 
P
L
 
L
A
 
L
F
 
L
S
 
F
T
 
T
A
 
-
G
 
-
G
 
W
D
 
K
T
 
V
A
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
M
G
 
G
C
 
N
P
 
C
V
 
V
V
 
V
F
 
A
K
|
K
A
 
P
H
 
S
S
 
E
G
 
E
H
 
T
M
 
P
A
 
S
T
 
S
A
 
A
E
 
T
L
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
E
A
 
V
I
 
M
I
 
-
R
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
H
R
 
D
S
 
V
G
 
G
M
 
L
P
 
P
E
 
P
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
L
I
 
I
Y
 
H
G
 
G
A
 
H
G
 
G
-
 
Q
-
 
N
-
 
A
V
 
A
G
 
G
E
 
E
A
 
F
L
 
L
V
 
T
K
 
R
H
 
H
P
 
P
A
 
D
I
 
I
Q
 
S
A
 
A
V
 
I
G
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
E
L
 
S
K
 
R
G
 
T
G
 
G
R
 
S
A
 
T
L
 
I
C
 
M
D
 
K
M
 
A
A
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3hazA Crystal structure of bifunctional proline utilization a (puta) protein (see paper)
27% identity, 73% coverage: 10:395/529 of query aligns to 511:882/983 of 3hazA

query
sites
3hazA
I
 
V
G
 
E
F
 
F
G
 
G
R
 
A
S
 
R
A
 
T
A
 
A
G
 
L
D
 
D
H
 
Q
V
 
L
L
 
L
H
 
T
S
 
D
V
 
V
D
 
K
A
 
A
H
 
E
S
 
T
G
 
G
E
 
D
P
 
L
L
 
K
P
 
P
Y
 
-
D
 
-
F
 
I
S
 
A
Q
 
D
A
 
A
S
 
T
A
 
P
E
 
D
E
 
Q
I
 
A
D
 
H
N
 
A
A
 
A
A
 
V
H
 
A
F
 
A
A
 
A
A
 
R
T
 
A
A
 
G
Y
 
F
P
 
A
I
 
G
Y
 
W
R
 
S
N
 
R
L
 
T
P
 
P
A
 
A
T
 
G
V
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
A
F
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
Q
I
 
A
A
 
A
E
 
H
E
 
L
I
 
L
D
 
E
A
 
S
L
 
R
G
 
S
D
 
A
D
 
H
F
 
F
I
 
I
A
 
A
I
 
L
V
 
L
C
 
Q
R
 
R
E
 
E
T
 
G
A
 
G
L
 
K
P
 
T
A
 
L
A
 
D
R
 
D
I
 
A
Q
 
L
G
 
S
E
 
E
R
 
L
A
 
R
R
 
E
T
 
A
S
 
A
G
 
D
Q
 
F
L
 
C
R
 
R
L
 
Y
F
 
Y
A
 
A
R
 
A
V
 
Q
L
 
G
R
 
R
Q
 
K
G
 
-
D
 
-
F
 
L
L
 
F
G
 
G
A
 
S
R
 
-
I
 
-
D
 
E
R
 
T
A
 
A
L
 
M
P
 
P
E
 
-
R
 
-
Q
 
G
P
 
P
F
 
T
P
 
G
R
 
E
P
 
S
D
 
N
V
 
A
R
 
L
Q
 
T
W