SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO353_15550 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_15550 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

Q88E47 Homogentisate 1,2-dioxygenase; HGDO; Homogentisate oxygenase; Homogentisic acid oxidase; Homogentisicase; EC 1.13.11.5 from Pseudomonas putida (strain ATCC 47054 / DSM 6125 / CFBP 8728 / NCIMB 11950 / KT2440) (see paper)
83% identity, 100% coverage: 1:434/434 of query aligns to 1:433/433 of Q88E47

query
sites
Q88E47
M
 
M
N
 
N
L
 
R
D
 
D
S
 
-
T
 
T
A
 
S
P
 
P
A
 
D
L
 
L
V
 
H
Y
 
Y
Q
 
L
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
E
 
E
F
 
F
S
 
A
S
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
T
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
F
 
F
T
 
T
M
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
S
E
 
E
A
 
L
R
 
R
R
 
R
T
 
T
W
 
W
M
 
L
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
Q
 
R
P
 
P
S
 
S
A
 
A
N
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
R
F
 
F
V
 
E
K
 
R
L
 
L
E
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
P
A
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
D
 
G
V
 
I
T
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
R
L
 
L
R
 
R
W
 
W
N
 
S
P
 
P
L
 
Q
E
 
P
I
 
I
P
 
P
G
 
A
E
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
D
F
 
F
I
 
I
D
 
E
G
 
G
L
 
W
V
 
L
R
 
P
M
 
M
A
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
A
G
 
G
S
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
P
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
H
 
I
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
N
 
N
R
 
R
S
 
S
M
 
M
E
 
E
R
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
 
N
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
E
W
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
M
E
 
E
L
 
V
E
 
E
P
 
P
L
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
L
 
M
K
 
K
F
 
F
R
 
R
I
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
H
 
H
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
P
R
 
R
D
 
D
F
 
F
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
L
 
A
K
 
E
Q
 
G
P
 
P
T
 
V
T
 
Q
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
F
 
F
L
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
H
W
 
W
G
 
A
C
 
C
E
 
E
L
 
L
D
 
Q
H
 
H
S
 
S
P
 
P
L
 
L
N
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
A
W
 
W
H
 
H
G
 
G
N
 
S
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
R
F
 
F
N
 
N
T
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
V
S
 
S
F
 
F
D
 
D
H
|
H
P
 
P
D
 
D
P
 
P
S
 
S
I
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
P
 
P
T
 
T
S
 
S
V
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
M
A
 
A
N
 
N
L
 
M
D
 
D
F
 
F
V
 
V
I
 
I
F
 
F
P
 
P
P
 
P
R
 
R
W
 
W
M
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
T
 
T
F
 
F
R
 
R
P
 
P
P
 
P
W
 
W
F
 
F
H
 
H
R
 
R
N
 
N
L
 
L
M
 
M
N
 
N
E
 
E
F
 
F
M
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
Q
 
N
G
 
G
T
 
A
Y
|
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
E
G
 
G
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
G
C
 
V
M
 
M
S
 
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
A
E
 
E
T
 
T
C
 
C
T
 
E
K
 
K
A
 
A
I
 
I
N
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
H
K
 
K
I
 
I
D
 
D
N
 
N
T
 
T
M
 
M
A
 
A
F
 
F
M
 
M
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
R
 
R
P
 
P
S
 
S
R
 
L
F
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
E
C
 
C
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
A
N
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
S
C
 
C
W
 
W
A
 
A
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
S
T
 
T
F
 
F
N
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
R
R
 
R

4aq6D Substrate bound homogentisate 1,2-dioxygenase (see paper)
84% identity, 98% coverage: 8:434/434 of query aligns to 1:427/427 of 4aq6D

query
sites
4aq6D
P
 
P
A
 
D
L
 
L
V
 
H
Y
 
Y
Q
 
L
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
E
 
E
F
 
F
S
 
A
S
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
T
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
F
 
F
T
 
T
M
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
S
E
 
E
A
 
L
R
 
R
R
 
R
T
 
T
W
 
W
M
 
L
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
Q
 
R
P
 
P
S
 
S
A
 
A
N
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
R
F
 
F
V
 
E
K
 
R
L
 
L
E
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
P
A
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
D
 
G
V
 
I
T
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
R
L
 
L
R
 
R
W
 
W
N
 
S
P
 
P
L
 
Q
E
 
P
I
 
I
P
 
P
G
 
A
E
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
D
F
 
F
I
 
I
D
 
E
G
 
G
L
 
W
V
 
L
R
 
P
M
 
M
A
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
A
G
 
G
S
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
P
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
H
 
I
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
N
 
N
R
 
R
S
 
S
M
 
M
E
 
E
R
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
 
N
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
E
W
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
M
E
 
E
L
 
V
E
 
E
P
 
P
L
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
L
 
M
K
 
K
F
 
F
R
 
R
I
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
H
 
H
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
P
R
 
R
D
 
D
F
 
F
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
L
 
A
K
 
E
Q
 
G
P
 
P
T
 
V
T
 
Q
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
F
 
F
L
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
H
W
 
W
G
 
A
C
 
C
E
 
E
L
 
L
D
 
Q
H
 
H
S
 
S
P
 
P
L
 
L
N
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
A
W
 
W
H
 
H
G
 
G
N
 
S
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
R
F
 
F
N
 
N
T
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
V
S
 
S
F
 
F
D
 
D
H
|
H
P
 
P
D
 
D
P
|
P
S
 
S
I
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
P
 
P
T
 
T
S
 
S
V
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
M
A
 
A
N
 
N
L
 
M
D
 
D
F
 
F
V
 
V
I
 
I
F
 
F
P
 
P
P
 
P
R
 
R
W
 
W
M
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
T
 
T
F
 
F
R
 
R
P
 
P
P
|
P
W
|
W
F
 
F
H
|
H
R
 
R
N
 
N
L
 
L
M
 
M
N
 
N
E
|
E
F
 
F
M
|
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
Q
 
N
G
 
G
T
 
A
Y
|
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
E
G
 
G
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
H
|
H
S
 
G
C
 
V
M
 
M
S
 
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
A
E
 
E
T
 
T
C
 
C
T
 
E
K
 
K
A
 
A
I
 
I
N
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
H
K
 
K
I
 
I
D
 
D
N
 
N
T
 
T
M
 
M
A
 
A
F
 
F
M
 
M
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
R
 
R
P
 
P
S
 
S
R
 
L
F
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
E
C
 
C
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
A
N
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
S
C
 
C
W
 
W
A
 
A
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
S
T
 
T
F
 
F
N
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
R
R
 
R

3zdsA Structure of homogentisate 1,2-dioxygenase in complex with reaction intermediates of homogentisate with oxygen. (see paper)
84% identity, 98% coverage: 10:434/434 of query aligns to 1:425/425 of 3zdsA

query
sites
3zdsA
L
 
L
V
 
H
Y
 
Y
Q
 
L
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
E
 
E
F
 
F
S
 
A
S
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
T
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
F
 
F
T
 
T
M
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
S
E
 
E
A
 
L
R
 
R
R
 
R
T
 
T
W
 
W
M
 
L
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
Q
 
R
P
 
P
S
 
S
A
 
A
N
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
R
F
 
F
V
 
E
K
 
R
L
 
L
E
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
P
A
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
D
 
G
V
 
I
T
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
R
L
 
L
R
 
R
W
 
W
N
 
S
P
 
P
L
 
Q
E
 
P
I
 
I
P
 
P
G
 
A
E
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
D
F
 
F
I
 
I
D
 
E
G
 
G
L
 
W
V
 
L
R
 
P
M
 
M
A
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
A
G
 
G
S
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
P
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
H
 
I
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
N
 
N
R
 
R
S
 
S
M
 
M
E
 
E
R
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
 
N
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
E
W
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
M
E
 
E
L
 
V
E
 
E
P
 
P
L
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
L
 
M
K
 
K
F
 
F
R
 
R
I
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
H
 
H
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
P
R
 
R
D
 
D
F
 
F
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
L
 
A
K
 
E
Q
 
G
P
 
P
T
 
V
T
 
Q
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
F
 
F
L
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
H
W
 
W
G
 
A
C
 
C
E
 
E
L
 
L
D
 
Q
H
 
H
S
 
S
P
 
P
L
 
L
N
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
A
W
 
W
H
 
H
G
 
G
N
 
S
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
R
F
 
F
N
 
N
T
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
V
S
 
S
F
 
F
D
 
D
H
|
H
P
 
P
D
 
D
P
|
P
S
 
S
I
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
P
 
P
T
 
T
S
 
S
V
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
M
A
 
A
N
 
N
L
 
M
D
 
D
F
 
F
V
 
V
I
 
I
F
 
F
P
 
P
P
 
P
R
 
R
W
 
W
M
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
T
 
T
F
 
F
R
 
R
P
 
P
P
|
P
W
|
W
F
 
F
H
|
H
R
 
R
N
 
N
L
 
L
M
 
M
N
 
N
E
|
E
F
 
F
M
|
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
Q
 
N
G
 
G
T
 
A
Y
|
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
E
G
 
G
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
H
|
H
S
 
G
C
 
V
M
 
M
S
 
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
A
E
 
E
T
 
T
C
 
C
T
 
E
K
 
K
A
 
A
I
 
I
N
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
H
K
 
K
I
 
I
D
 
D
N
 
N
T
 
T
M
 
M
A
 
A
F
 
F
M
|
M
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
R
 
R
P
 
P
S
 
S
R
 
L
F
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
E
C
 
C
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
A
N
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
S
C
 
C
W
 
W
A
 
A
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
S
T
 
T
F
 
F
N
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
R
R
 
R

3zdsF Structure of homogentisate 1,2-dioxygenase in complex with reaction intermediates of homogentisate with oxygen. (see paper)
84% identity, 98% coverage: 10:434/434 of query aligns to 2:426/426 of 3zdsF

query
sites
3zdsF
L
 
L
V
 
H
Y
 
Y
Q
 
L
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
E
 
E
F
 
F
S
 
A
S
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
T
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
F
 
F
T
 
T
M
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
S
E
 
E
A
 
L
R
 
R
R
 
R
T
 
T
W
 
W
M
 
L
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
Q
 
R
P
 
P
S
 
S
A
 
A
N
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
R
F
 
F
V
 
E
K
 
R
L
 
L
E
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
P
A
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
D
 
G
V
 
I
T
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
R
L
 
L
R
 
R
W
 
W
N
 
S
P
 
P
L
 
Q
E
 
P
I
 
I
P
 
P
G
 
A
E
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
D
F
 
F
I
 
I
D
 
E
G
 
G
L
 
W
V
 
L
R
 
P
M
 
M
A
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
A
G
 
G
S
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
P
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
H
 
I
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
N
 
N
R
 
R
S
 
S
M
 
M
E
 
E
R
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
 
N
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
E
W
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
M
E
 
E
L
 
V
E
 
E
P
 
P
L
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
L
 
M
K
 
K
F
 
F
R
 
R
I
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
H
 
H
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
P
R
 
R
D
 
D
F
 
F
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
L
 
A
K
 
E
Q
 
G
P
 
P
T
 
V
T
 
Q
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
F
 
F
L
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
H
W
 
W
G
 
A
C
 
C
E
 
E
L
 
L
D
 
Q
H
 
H
S
 
S
P
 
P
L
 
L
N
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
A
W
 
W
H
 
H
G
 
G
N
 
S
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
R
F
 
F
N
 
N
T
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
V
S
 
S
F
 
F
D
 
D
H
|
H
P
 
P
D
 
D
P
|
P
S
 
S
I
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
P
 
P
T
 
T
S
 
S
V
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
M
A
 
A
N
 
N
L
 
M
D
 
D
F
 
F
V
 
V
I
 
I
F
 
F
P
 
P
P
 
P
R
 
R
W
 
W
M
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
T
 
T
F
 
F
R
 
R
P
 
P
P
|
P
W
|
W
F
 
F
H
|
H
R
 
R
N
 
N
L
 
L
M
 
M
N
 
N
E
|
E
F
 
F
M
|
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
Q
 
N
G
 
G
T
 
A
Y
|
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
E
G
 
G
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
H
|
H
S
 
G
C
 
V
M
 
M
S
 
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
A
E
 
E
T
 
T
C
 
C
T
 
E
K
 
K
A
 
A
I
 
I
N
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
H
K
 
K
I
 
I
D
 
D
N
 
N
T
 
T
M
 
M
A
 
A
F
 
F
M
|
M
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
R
 
R
P
 
P
S
 
S
R
 
L
F
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
E
C
 
C
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
A
N
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
S
C
 
C
W
 
W
A
 
A
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
S
T
 
T
F
 
F
N
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
R
R
 
R

3zdsC Structure of homogentisate 1,2-dioxygenase in complex with reaction intermediates of homogentisate with oxygen. (see paper)
84% identity, 98% coverage: 10:434/434 of query aligns to 2:426/426 of 3zdsC

query
sites
3zdsC
L
 
L
V
 
H
Y
 
Y
Q
 
L
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
E
 
E
F
 
F
S
 
A
S
 
S
E
 
E
A
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
T
 
A
E
 
E
L
 
L
F
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
F
 
F
T
 
T
M
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
S
E
 
E
A
 
L
R
 
R
R
 
R
T
 
T
W
 
W
M
 
L
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
Q
 
R
P
 
P
S
 
S
A
 
A
N
 
L
H
 
H
P
 
P
A
 
R
F
 
F
V
 
E
K
 
R
L
 
L
E
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
P
A
 
L
G
 
G
G
 
G
P
 
P
L
 
L
G
 
G
D
 
G
V
 
I
T
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
R
L
 
L
R
 
R
W
 
W
N
 
S
P
 
P
L
 
Q
E
 
P
I
 
I
P
 
P
G
 
A
E
 
E
P
 
P
T
 
T
D
 
D
F
 
F
I
 
I
D
 
E
G
 
G
L
 
W
V
 
L
R
 
P
M
 
M
A
 
A
A
 
A
N
 
N
S
 
A
G
 
G
S
 
A
E
 
E
K
 
K
P
 
P
A
 
A
G
 
G
I
 
V
S
 
S
I
 
I
Y
 
Y
H
 
I
Y
 
Y
R
 
R
A
 
A
N
 
N
R
 
R
S
 
S
M
 
M
E
 
E
R
 
R
V
 
V
F
 
F
F
 
F
N
 
N
A
 
A
D
 
D
G
 
G
E
 
E
W
 
L
L
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
R
I
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
V
L
 
M
E
 
E
L
 
V
E
 
E
P
 
P
L
 
L
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
R
 
R
G
 
G
L
 
M
K
 
K
F
 
F
R
 
R
I
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
G
Q
 
Q
A
 
A
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
A
E
 
E
N
 
N
H
 
H
G
 
G
A
 
A
P
 
P
L
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
S
 
S
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
P
R
 
R
D
 
D
F
 
F
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
V
A
 
A
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
D
 
E
L
 
A
K
 
E
Q
 
G
P
 
P
T
 
V
T
 
Q
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
K
 
K
F
 
F
L
 
L
G
 
G
E
 
E
L
 
H
W
 
W
G
 
A
C
 
C
E
 
E
L
 
L
D
 
Q
H
 
H
S
 
S
P
 
P
L
 
L
N
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
A
W
 
W
H
 
H
G
 
G
N
 
S
N
 
N
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
R
R
 
R
F
 
F
N
 
N
T
 
T
I
 
I
G
 
G
T
 
T
V
 
V
S
 
S
F
 
F
D
 
D
H
|
H
P
 
P
D
 
D
P
|
P
S
 
S
I
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
S
P
 
P
T
 
T
S
 
S
V
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
M
A
 
A
N
 
N
L
 
M
D
 
D
F
 
F
V
 
V
I
 
I
F
|
F
P
 
P
P
 
P
R
 
R
W
 
W
M
 
M
V
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
T
 
T
F
 
F
R
 
R
P
 
P
P
|
P
W
 
W
F
 
F
H
|
H
R
 
R
N
 
N
L
 
L
M
 
M
N
 
N
E
|
E
F
 
F
M
|
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
Q
 
N
G
 
G
T
 
A
Y
|
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
E
G
 
G
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
S
L
 
L
H
|
H
S
 
G
C
 
V
M
 
M
S
 
S
A
 
A
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
A
E
 
E
T
 
T
C
 
C
T
 
E
K
 
K
A
 
A
I
 
I
N
 
A
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
H
K
 
K
I
 
I
D
 
D
N
 
N
T
 
T
M
 
M
A
 
A
F
 
F
M
 
M
F
 
F
E
 
E
T
 
T
S
 
S
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L
R
 
R
P
 
P
S
 
S
R
 
L
F
 
Q
A
 
A
L
 
L
D
 
E
C
 
C
P
 
P
Q
 
Q
L
 
L
Q
 
Q
N
 
A
N
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
S
C
 
C
W
 
W
A
 
A
S
 
T
L
 
L
P
 
P
V
 
S
T
 
T
F
 
F
N
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
R
R
 
R

Q93099 Homogentisate 1,2-dioxygenase; Homogentisate oxygenase; Homogentisic acid oxidase; Homogentisicase; EC 1.13.11.5 from Homo sapiens (Human) (see 13 papers)
51% identity, 98% coverage: 10:434/434 of query aligns to 4:439/445 of Q93099

query
sites
Q93099
L
 
L
V
 
K
Y
 
Y
Q
 
I
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
E
 
E
F
 
C
S
 
S
S
 
S
E
 
E
-
 
D
-
 
P
A
 
R
L
 
C
P
 
P
G
 
G
A
 
S
L
 
L
P
 
P
V
 
E
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
S
 
N
P
 
P
Q
 
Q
K
 
V
A
 
C
P
 
P
Y
 
Y
G
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
A
E
 
E
L
 
Q
F
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
S
A
 
A
F
 
F
T
 
T
M
 
C
A
 
P
R
 
R
S
 
S
E
 
T
A
 
N
R
 
K
R
 
R
T
 
S
W
 
W
M
 
L
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
Q
 
L
P
 
P
S
 
S
A
 
V
N
 
S
H
 
H
P
 
K
A
 
P
F
 
F
V
 
E
K
 
S
L
 
I
E
 
D
R
 
E
Q
 
G
L
x
Q
A
 
V
G
 
T
G
 
H
P
 
N
L
 
W
G
 
D
D
 
E
V
 
V
T
 
D
P
 
P
-
 
D
-
 
P
N
 
N
R
 
Q
L
 
L
R
 
R
W
 
W
N
 
K
P
 
P
L
 
F
E
 
E
I
 
I
P
 
P
G
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
Q
E
 
K
P
 
K
T
 
V
D
 
D
F
 
F
I
 
V
D
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
H
R
 
T
M
 
L
A
 
C
A
 
G
N
 
A
S
 
G
G
 
D
S
 
I
E
 
K
K
 
S
P
 
N
A
 
N
G
 
G
I
 
L
S
 
A
I
 
I
Y
 
H
H
 
I
Y
 
F
R
 
L
A
 
C
N
 
N
R
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
-
 
N
R
 
R
V
 
C
F
 
F
F
 
Y
N
 
N
A
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
D
W
 
F
L
 
L
L
 
I
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
Q
 
K
G
|
G
R
 
N
L
 
L
R
 
L
I
 
I
A
 
Y
T
 
T
E
|
E
L
 
F
G
 
G
V
 
K
L
x
M
E
 
L
L
 
V
E
 
Q
P
 
P
L
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
C
V
 
V
L
 
I
P
 
Q
R
 
R
G
 
G
L
 
M
K
 
R
F
 
F
R
 
S
I
 
I
E
 
D
L
 
V
L
 
F
D
 
E
P
 
-
Q
 
E
A
 
T
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
L
E
 
E
N
 
V
H
 
Y
G
 
G
A
 
V
P
 
H
L
 
F
R
 
E
L
 
L
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
P
R
 
R
D
 
D
F
 
F
L
 
L
T
 
I
P
|
P
V
 
I
A
 
A
H
 
W
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
L
 
R
K
 
Q
Q
 
V
P
 
P
-
 
G
-
 
G
T
 
Y
T
 
T
L
 
V
V
 
I
Q
 
N
K
 
K
F
 
Y
L
 
Q
G
 
G
E
 
K
L
 
L
W
 
F
G
 
A
C
 
A
E
 
K
L
 
Q
D
 
D
H
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
V
A
 
A
W
 
W
H
 
H
G
 
G
N
 
N
N
 
Y
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
N
F
 
F
N
 
M
T
 
V
I
 
I
G
 
N
T
 
S
V
 
V
S
 
A
F
 
F
D
 
D
H
 
H
P
 
A
D
 
D
P
 
P
S
 
S
I
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
A
P
 
K
T
 
S
S
 
V
V
 
R
H
 
P
G
 
G
L
 
V
A
 
A
N
 
I
L
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
V
I
 
I
F
 
F
P
 
P
P
 
P
R
 
R
W
 
W
M
 
G
V
 
V
A
 
A
E
 
D
N
 
K
T
 
T
F
 
F
R
 
R
P
 
P
P
 
P
W
 
Y
F
 
Y
H
|
H
R
 
R
N
 
N
L
 
C
M
 
M
N
 
S
E
|
E
F
 
F
M
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
Q
 
R
G
 
G
T
 
H
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
K
 
K
A
 
Q
E
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
C
 
T
M
|
M
S
 
T
A
 
P
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
A
E
 
D
T
 
C
C
 
F
T
 
E
K
 
K
A
 
A
I
 
S
N
 
K
A
 
V
E
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
E
K
 
R
I
 
I
-
 
A
D
 
D
N
 
G
T
 
T
M
 
M
A
 
A
F
 
F
M
 
M
F
 
F
E
 
E
T
 
S
S
 
S
Q
 
L
V
 
S
L
 
L
R
 
A
P
 
V
S
 
T
R
 
K
F
 
W
A
 
G
L
 
L
D
 
K
C
 
A
P
 
S
Q
 
R
-
 
C
L
 
L
Q
 
D
N
 
E
N
 
N
Y
 
Y
D
 
H
A
 
K
C
 
C
W
 
W
A
 
E
S
 
P
L
 
L
P
 
K
V
 
S
T
 
H
F
 
F
N
 
T
P
 
P
N
 
N
R
 
S
R
 
R

Q9Y041 Homogentisate 1,2-dioxygenase; Homogentisate oxygenase; Homogentisic acid oxidase; Homogentisicase; EC 1.13.11.5 from Caenorhabditis elegans (see paper)
49% identity, 97% coverage: 10:429/434 of query aligns to 7:433/437 of Q9Y041

query
sites
Q9Y041
L
 
L
V
 
K
Y
 
Y
Q
 
L
S
 
T
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
E
 
E
F
 
H
S
 
A
S
 
T
E
 
S
-
 
D
-
 
P
A
 
R
L
 
V
P
 
P
G
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
S
 
S
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
A
 
C
P
 
S
Y
 
H
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
T
 
A
E
 
E
L
 
Q
F
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
F
 
F
T
 
T
M
 
A
A
 
P
R
 
R
S
 
S
E
 
Q
A
 
N
R
 
Q
R
 
R
T
 
S
W
 
W
M
 
L
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
Q
 
R
P
 
P
S
 
S
A
 
V
N
 
I
H
 
H
P
 
R
A
 
P
F
 
F
-
 
E
-
 
A
V
 
M
K
 
K
L
 
E
E
 
N
R
 
D
Q
 
Q
L
 
H
A
 
W
G
 
T
G
 
N
P
 
N
L
 
F
G
 
S
D
 
S
V
 
I
-
 
P
-
 
P
T
 
N
P
 
P
N
 
N
R
 
Q
L
 
Y
R
 
R
W
 
W
N
 
N
P
 
P
L
 
F
E
 
P
I
 
L
P
 
P
-
 
T
G
 
K
E
 
E
P
 
G
T
 
V
D
 
T
F
 
F
I
 
V
D
 
D
G
 
N
L
 
L
V
 
Y
R
 
T
M
 
V
A
 
C
A
 
G
N
 
G
S
 
G
G
 
D
S
 
V
E
 
I
K
 
S
P
 
R
A
 
T
G
 
G
I
 
L
S
 
A
I
 
I
Y
 
H
H
 
Q
Y
 
F
R
 
S
A
 
C
N
 
N
R
 
A
S
 
S
M
 
M
E
 
E
R
 
H
V
 
T
-
 
A
F
 
M
F
 
Y
N
 
N
A
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
D
W
 
F
L
 
L
L
 
I
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
Q
 
Q
G
 
G
R
 
A
L
 
L
R
 
E
I
 
I
A
 
T
T
 
T
E
 
E
L
 
F
G
|
G
V
 
R
L
 
L
E
 
L
L
 
V
E
 
N
P
 
P
L
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
R
 
Q
G
 
G
L
 
I
K
 
R
F
 
F
R
 
S
I
 
V
E
 
A
L
 
V
L
 
R
D
 
G
P
 
P
Q
 
-
A
 
S
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
L
E
 
E
N
 
V
H
 
Y
G
 
G
A
 
T
P
 
H
L
 
F
R
 
Q
L
 
L
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
P
R
 
R
D
 
D
F
 
F
L
 
E
T
 
A
P
 
P
V
 
V
A
 
A
H
 
W
Y
 
F
E
 
E
D
 
D
L
 
L
K
 
D
Q
 
V
P
 
E
T
 
F
T
 
T
L
 
I
V
 
I
Q
 
N
K
 
K
F
 
Y
L
 
Q
G
 
G
E
 
S
L
 
W
W
 
F
G
 
Q
C
 
A
E
 
K
L
 
Q
D
 
G
H
 
H
S
 
S
P
 
P
L
 
F
N
 
D
V
 
V
V
 
V
A
 
G
W
 
W
H
 
H
G
 
G
N
 
N
N
 
Y
V
 
V
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
K
R
 
K
F
 
F
N
 
M
T
 
V
I
 
I
G
 
N
T
 
T
V
 
V
S
 
S
F
 
F
D
 
D
H
 
H
P
 
C
D
 
D
P
 
P
S
 
S
I
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
A
P
 
P
T
 
S
S
 
V
V
 
K
H
 
H
G
 
G
L
 
T
A
 
A
N
 
I
L
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
V
I
 
I
F
 
F
P
 
P
P
 
P
R
 
R
W
 
W
M
 
G
V
 
C
A
 
A
E
 
D
N
 
N
T
 
T
F
 
F
R
 
R
P
 
P
P
 
P
W
 
Y
F
 
Y
H
 
H
R
 
R
N
 
N
L
 
C
M
 
M
N
 
S
E
 
E
F
 
Y
M
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
Q
 
T
G
 
G
T
 
C
Y
 
Y
D
 
E
A
 
A
K
 
K
A
 
E
E
 
G
G
 
G
F
 
F
L
 
K
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H
S
 
S
C
 
M
M
 
M
S
 
T
A
 
P
H
 
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
F
E
 
N
T
 
C
C
 
F
T
 
E
K
 
M
A
 
A
I
 
S
N
 
N
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
K
P
 
P
S
 
Q
K
 
R
I
 
V
-
 
A
D
 
E
N
 
G
T
 
T
M
 
M
A
 
S
F
 
F
M
 
M
F
 
F
E
 
E
T
 
S
S
 
S
Q
 
L
V
 
N
L
 
M
R
 
A
P
 
I
S
 
T
R
 
N
F
 
W
A
 
A
L
 
V
D
 
-
C
 
Y
P
 
Q
Q
 
N
L
 
V
Q
 
D
N
 
K
N
 
D
Y
 
Y
D
 
Y
A
 
K
C
 
D
W
 
W
A
 
Q
S
 
P
L
 
L
P
 
K
V
 
K
T
 
H
F
 
F

1ey2A Human homogentisate dioxygenase with fe(ii) (see paper)
50% identity, 94% coverage: 10:418/434 of query aligns to 3:413/419 of 1ey2A

query
sites
1ey2A
L
 
L
V
 
K
Y
 
Y
Q
 
I
S
 
S
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
E
 
E
F
 
C
S
 
S
S
 
S
E
 
E
-
 
D
-
 
P
A
 
R
L
 
C
P
 
P
G
 
G
A
 
S
L
 
L
P
 
P
V
 
E
G
 
G
Q
 
Q
N
 
N
S
 
N
P
 
P
Q
 
Q
K
 
V
A
 
C
P
 
P
Y
 
Y
G
 
N
L
 
L
Y
 
Y
T
 
A
E
 
E
L
 
Q
F
 
L
S
 
S
G
 
G
T
 
S
A
 
A
F
 
F
T
 
T
M
 
C
A
 
P
R
 
R
S
 
S
E
 
T
A
 
N
R
 
K
R
 
R
T
 
S
W
 
W
M
 
L
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
Q
 
L
P
 
P
S
 
S
A
 
V
N
 
S
H
 
H
P
 
K
A
 
P
F
 
F
V
 
E
K
 
S
L
 
I
E
 
D
R
 
E
Q
 
G
L
 
H
A
 
V
G
 
T
G
 
H
P
 
N
L
 
W
G
 
D
D
 
E
V
 
V
T
 
D
P
 
P
-
 
D
-
 
P
N
 
N
R
 
Q
L
 
L
R
 
R
W
 
W
N
 
K
P
 
P
L
 
F
E
 
E
I
 
I
P
 
P
G
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
Q
E
 
K
P
 
K
T
 
V
D
 
D
F
 
F
I
 
V
D
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
H
R
 
T
M
 
L
A
 
C
A
 
G
N
 
A
S
 
G
G
 
D
S
 
I
E
 
K
K
 
S
P
 
N
A
 
N
G
 
G
I
 
L
S
 
A
I
 
I
Y
 
H
H
 
I
Y
 
F
R
 
L
A
 
C
N
 
N
R
 
T
S
 
S
M
 
M
E
 
E
-
 
N
R
 
R
V
 
C
F
 
F
F
 
Y
N
 
N
A
 
S
D
 
D
G
 
G
E
 
D
W
 
F
L
 
L
L
 
I
V
 
V
P
 
P
E
 
Q
Q
 
K
G
 
G
R
 
N
L
 
L
R
 
L
I
 
I
A
 
Y
T
 
T
E
 
E
L
 
F
G
 
G
V
 
K
L
 
M
E
 
L
L
 
V
E
 
Q
P
 
P
L
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
C
V
 
V
L
 
I
P
 
Q
R
 
R
G
 
G
L
 
M
K
 
R
F
 
F
R
 
S
I
 
I
E
 
D
L
 
V
L
 
F
D
 
E
P
 
-
Q
 
E
A
 
T
R
 
R
G
 
G
Y
 
Y
L
 
I
A
 
L
E
 
E
N
 
V
H
 
Y
G
 
G
A
 
V
P
 
H
L
 
F
R
 
E
L
 
L
P
 
P
D
 
D
L
 
L
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
S
 
A
N
 
N
G
 
G
L
 
L
A
 
A
N
 
N
P
 
P
R
 
R
D
 
D
F
 
F
L
 
L
T
 
I
P
 
P
V
 
I
A
 
A
H
 
W
Y
 
Y
E
 
E
D
 
D
L
 
R
K
 
Q
Q
 
V
P
 
P
-
 
G
-
 
G
T
 
Y
T
 
T
L
 
V
V
 
I
Q
 
N
K
 
K
F
 
Y
L
 
Q
G
 
G
E
 
K
L
 
L
W
 
F
G
 
A
C
 
A
E
 
K
L
 
Q
D
 
D
H
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
V
A
 
A
W
 
W
H
 
H
G
 
G
N
 
N
N
 
Y
V
 
T
P
 
P
Y
 
Y
K
 
K
Y
 
Y
D
 
N
L
 
L
R
 
K
R
 
N
F
 
F
N
 
M
T
 
V
I
 
I
G
 
N
T
 
S
V
 
V
S
 
A
F
 
F
D
 
D
H
|
H
P
 
A
D
 
D
P
 
P
S
 
S
I
 
I
F
 
F
T
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
T
S
 
A
P
 
K
T
 
S
S
 
V
V
 
R
H
 
P
G
 
G
L
 
V
A
 
A
N
 
I
L
 
A
D
 
D
F
 
F
V
 
V
I
 
I
F
 
F
P
 
P
P
 
P
R
 
R
W
 
W
M
 
G
V
 
V
A
 
A
E
 
D
N
 
K
T
 
T
F
 
F
R
 
R
P
 
P
P
 
P
W
 
Y
F
 
Y
H
|
H
R
 
R
N
 
N
L
 
C
M
 
M
N
 
S
E
|
E
F
 
F
M
 
M
G
 
G
L
 
L
I
 
I
Q
 
R
G
 
-
T
 
-
Y
 
-
D
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
G
F
 
F
L
 
L
P
 
P
G
 
G
G
 
G
A
 
G
S
 
S
L
 
L
H
|
H
S
 
S
C
 
T
M
 
M
S
 
T
A
 
P
H
|
H
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
A
E
 
D
T
 
C
C
 
F
T
 
E
K
 
K
A
 
A
I
 
S
N
 
K
A
 
V
E
 
K
L
 
L
A
 
A
P
 
P
S
 
E
K
 
R
I
 
I
-
 
A
D
 
D
N
 
G
T
 
T
M
 
M
A
 
A
F
 
F
M
 
M
F
 
F
E
 
E
T
 
S
S
 
S
Q
 
L
V
 
S
L
 
L
R
 
A
P
 
V
S
 
T
R
 
K
F
 
W
A
 
G
L
 
L
D
 
K
C
 
A
P
 
S
Q
 
R
L
 
L
Q
 
K
N
 
S
N
 
H
Y
 
F

Query Sequence

>AO353_15550 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_15550
MNLDSTAPALVYQSGFGNEFSSEALPGALPVGQNSPQKAPYGLYTELFSGTAFTMARSEA
RRTWMYRIQPSANHPAFVKLERQLAGGPLGDVTPNRLRWNPLEIPGEPTDFIDGLVRMAA
NSGSEKPAGISIYHYRANRSMERVFFNADGEWLLVPEQGRLRIATELGVLELEPLEIAVL
PRGLKFRIELLDPQARGYLAENHGAPLRLPDLGPIGSNGLANPRDFLTPVAHYEDLKQPT
TLVQKFLGELWGCELDHSPLNVVAWHGNNVPYKYDLRRFNTIGTVSFDHPDPSIFTVLTS
PTSVHGLANLDFVIFPPRWMVAENTFRPPWFHRNLMNEFMGLIQGTYDAKAEGFLPGGAS
LHSCMSAHGPDGETCTKAINAELAPSKIDNTMAFMFETSQVLRPSRFALDCPQLQNNYDA
CWASLPVTFNPNRR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory