SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing AO353_17555 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_17555 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3bptA Crystal structure of human beta-hydroxyisobutyryl-coa hydrolase in complex with quercetin
35% identity, 94% coverage: 6:354/370 of query aligns to 6:345/362 of 3bptA

query
sites
3bptA
E
 
E
E
 
V
L
 
L
T
 
L
G
 
G
T
 
K
D
 
K
G
 
G
A
 
C
R
 
-
I
 
T
G
 
G
I
 
V
A
 
I
S
 
T
L
 
L
D
 
N
A
 
R
E
 
P
K
 
K
S
x
F
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
S
 
T
L
 
L
P
 
N
M
 
M
I
 
I
R
 
R
A
 
Q
L
 
I
S
 
Y
D
 
P
Q
 
Q
L
 
L
E
 
K
A
 
K
W
 
W
A
 
E
K
 
Q
E
 
D
P
 
P
Q
 
E
I
 
T
V
 
F
C
 
L
V
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
K
G
 
G
N
 
A
G
 
G
A
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
|
G
G
|
G
E
 
D
V
x
I
R
 
R
N
 
V
L
 
I
V
 
S
E
 
E
A
 
A
C
 
E
R
 
K
A
 
A
H
 
K
P
 
Q
G
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
K
L
 
I
A
 
A
A
x
P
Q
 
V
F
 
F
F
 
F
S
x
R
A
 
E
E
|
E
Y
 
Y
R
 
M
L
 
L
D
 
N
F
 
N
R
 
A
L
 
V
H
 
G
T
 
S
Y
 
C
P
 
Q
K
 
K
P
 
P
L
 
Y
I
 
V
C
 
A
W
 
L
G
 
I
H
 
H
G
 
G
Y
 
I
V
 
T
L
 
M
G
|
G
G
|
G
G
 
G
L
 
V
G
|
G
L
 
L
L
 
S
Q
 
V
G
 
H
A
 
G
S
 
Q
I
 
F
R
 
R
I
 
V
V
 
A
T
 
T
P
 
E
S
 
K
S
 
C
R
 
L
L
 
F
A
 
A
M
 
M
P
|
P
E
|
E
I
 
T
S
 
A
I
|
I
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
D
|
D
V
|
V
G
 
G
A
 
G
S
 
G
W
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
P
R
 
R
L
 
L
P
 
Q
G
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
Y
F
 
F
L
 
L
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
F
Q
 
R
M
 
L
N
 
K
A
 
G
R
 
R
D
 
D
A
 
V
I
 
Y
D
 
R
L
 
A
D
 
G
L
 
I
A
 
A
D
 
T
R
 
H
F
 
F
L
 
V
L
 
D
D
 
S
E
 
E
Q
 
K
Q
 
L
E
 
A
E
 
M
L
 
L
I
 
E
E
 
E
G
 
D
L
 
L
L
 
L
Q
 
A
L
 
L
N
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
Q
 
K
T
 
S
P
 
P
M
 
S
Q
 
K
L
 
E
N
 
N
-
 
I
-
 
A
S
 
S
L
 
V
L
 
L
K
 
E
A
 
N
L
 
Y
Q
 
H
Q
 
T
E
 
E
A
 
S
V
 
-
G
 
-
K
 
K
M
 
I
P
 
D
E
 
R
A
 
D
Q
 
K
W
 
S
L
 
F
P
 
I
R
 
L
R
 
E
Q
 
E
Q
 
H
I
 
M
D
 
D
E
 
K
L
 
I
L
 
N
D
 
S
V
 
C
S
 
F
D
 
S
V
 
A
R
 
N
C
 
T
A
 
V
W
 
E
R
 
E
A
 
I
I
 
I
S
 
E
L
 
N
L
 
L
R
 
Q
D
 
Q
H
 
D
R
 
G
D
 
S
L
 
S
L
 
F
L
 
A
A
 
L
R
 
E
A
 
Q
A
 
L
K
 
K
N
 
V
L
 
I
H
 
N
E
 
K
G
 
M
C
 
S
P
 
P
L
 
T
T
 
S
A
 
L
H
 
K
L
 
I
V
 
T
W
 
L
E
 
R
Q
 
Q
I
 
L
Q
 
M
R
 
E
A
 
G
R
 
S
H
 
S
L
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
Q
E
 
E
V
 
V
F
 
L
Q
 
T
M
 
M
E
 
E
Y
 
Y
T
 
R
M
 
L
S
 
S
L
 
Q
N
 
A
C
 
C
C
 
M
R
 
R
H
 
G
P
 
H
E
 
D
F
 
F
S
 
H
E
 
E
G
 
G
V
 
V
R
 
R
A
 
A
R
 
V
L
|
L
I
 
I
D
 
D
K
 
K
D
 
D
Q
 
Q
K
 
S
P
 
P
H
 
K
W
 
W
H
 
K
W
 
P
P
 
A
D
 
D
I
 
L
N
 
K
A
 
E
I
 
V
P
 
T
E
 
E
A
 
E
V
 
D
V
 
L
Q
 
N
A
 
N
H
 
H
F
 
F

Q9LKJ1 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase 1; CoA-thioester hydrolase CHY1; EC 3.1.2.-; EC 3.1.2.4 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
30% identity, 94% coverage: 12:357/370 of query aligns to 15:356/378 of Q9LKJ1

query
sites
Q9LKJ1
D
 
E
G
 
K
A
 
S
R
 
S
I
 
V
G
 
R
I
 
I
A
 
L
S
 
T
L
 
L
D
 
N
A
 
R
E
 
P
K
 
K
S
 
Q
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
F
P
 
H
M
 
M
I
 
I
R
 
S
A
 
R
L
 
L
S
 
L
D
 
Q
Q
 
L
L
 
F
E
 
L
A
 
A
W
 
F
A
 
E
K
 
E
E
 
D
P
 
P
Q
 
S
I
 
V
V
 
K
C
 
L
V
 
V
L
 
I
L
 
L
R
 
K
G
 
G
N
 
H
G
 
G
A
 
-
K
 
R
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
 
G
G
|
G
E
 
D
V
 
V
R
 
A
N
 
A
L
 
V
V
 
V
E
 
R
A
 
D
C
 
I
R
 
N
A
 
Q
H
 
G
P
 
N
G
 
W
E
 
R
V
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
L
A
 
G
A
 
A
Q
 
N
F
 
Y
F
 
F
S
 
S
A
 
S
E
 
E
Y
 
Y
R
 
M
L
 
L
D
 
N
F
 
Y
R
 
V
L
 
M
H
 
A
T
 
T
Y
 
Y
P
 
S
K
 
K
P
 
A
L
 
Q
I
 
V
C
 
S
W
 
I
G
 
L
H
 
N
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
S
Q
 
V
G
 
H
A
 
G
S
 
R
I
 
F
R
 
R
I
 
I
V
 
A
T
 
T
P
 
E
S
 
N
S
 
T
R
 
V
L
 
F
A
 
A
M
 
M
P
 
P
E
|
E
I
 
T
S
 
A
I
 
L
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
P
 
P
D
|
D
V
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
S
W
 
Y
F
 
F
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
P
G
 
G
K
 
F
L
 
F
G
 
G
L
 
E
F
 
Y
L
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
R
M
 
L
N
 
D
A
 
G
R
 
A
D
 
E
A
 
M
I
 
L
D
 
A
L
 
C
D
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
T
R
 
H
F
 
F
L
 
V
L
 
P
D
 
S
E
 
T
Q
 
R
Q
 
L
E
 
T
E
 
A
L
 
L
I
 
E
E
 
A
G
 
D
L
 
L
L
 
C
Q
 
R
L
 
I
N
 
N
W
 
S
Q
 
N
E
 
D
Q
 
-
T
 
-
P
 
P
M
 
T
Q
 
F
L
 
A
N
 
S
S
 
T
L
 
I
L
 
L
K
 
D
A
 
A
L
 
Y
-
 
T
-
 
Q
-
 
H
-
 
P
-
 
R
-
 
L
-
 
K
Q
 
Q
Q
 
Q
E
 
S
A
 
A
V
 
Y
G
 
R
K
 
R
M
 
L
P
 
D
E
 
V
A
 
I
Q
 
D
W
 
R
L
 
C
P
 
F
R
 
S
R
 
R
Q
 
R
Q
 
T
I
 
V
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
 
I
D
 
S
V
 
A
S
 
L
D
 
E
V
 
R
R
 
E
C
 
A
A
 
T
W
 
Q
R
 
E
A
 
A
I
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
R
 
-
D
 
-
H
 
-
R
 
-
D
 
D
L
 
G
L
 
W
L
 
I
A
 
S
R
 
A
A
 
T
A
 
I
K
 
Q
N
 
A
L
 
L
H
 
K
E
 
K
G
 
G
C
 
S
P
 
P
L
 
A
T
 
S
A
 
L
H
 
K
L
 
I
V
 
S
W
 
L
E
 
R
Q
 
S
I
 
I
Q
 
R
R
 
E
A
 
G
R
 
R
H
 
L
L
 
Q
S
 
G
L
 
V
A
 
G
E
 
Q
V
 
C
F
 
L
Q
 
I
M
 
R
E
 
E
Y
 
Y
T
 
R
M
 
M
S
 
V
L
 
C
N
 
H
C
 
V
C
 
M
R
 
K
-
 
G
-
 
E
-
 
I
H
 
S
P
 
K
E
 
D
F
 
F
S
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
C
R
 
R
A
 
A
R
 
I
L
 
L
I
 
V
D
 
D
K
 
K
D
 
D
Q
 
K
K
 
N
P
 
P
H
 
K
W
 
W
H
 
E
W
 
P
P
 
R
D
 
R
I
 
L
N
 
E
A
 
D
I
 
M
P
 
K
E
 
D
A
 
S
V
 
M
V
 
V
Q
 
E
A
 
Q
H
 
Y
F
 
F
H
 
E
K
 
R
V
 
V

4hdtA Crystal structure of a carnitinyl-coa dehydratase from mycobacterium thermoresistibile (see paper)
32% identity, 92% coverage: 16:357/370 of query aligns to 12:331/340 of 4hdtA

query
sites
4hdtA
I
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
L
S
 
T
L
 
L
D
 
N
A
 
R
E
 
P
K
 
K
S
 
A
L
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
L
S
 
T
L
x
H
P
 
G
M
 
M
I
 
V
R
 
T
A
 
T
L
 
M
S
 
A
D
 
E
Q
 
R
L
 
L
E
 
A
A
 
A
W
 
W
A
x
E
K
 
N
E
 
D
P
 
D
Q
 
S
I
 
V
V
 
R
C
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
R
 
T
G
 
G
N
 
A
G
 
G
A
x
E
K
 
R
A
 
G
F
 
L
C
 
C
A
 
A
G
 
G
G
|
G
E
 
D
V
 
V
R
 
V
N
 
A
L
x
I
V
 
Y
E
 
H
A
 
S
C
 
A
R
 
K
A
 
A
H
 
D
P
 
G
G
 
A
E
|
E
V
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
A
A
 
R
Q
 
R
F
 
F
F
x
W
S
 
F
A
 
D
E
 
E
Y
|
Y
R
 
R
L
 
L
D
 
N
F
 
A
R
x
H
L
 
I
H
 
G
T
 
R
Y
 
Y
P
 
P
K
 
K
P
 
P
L
 
Y
I
 
V
C
 
S
W
 
I
G
 
M
H
 
D
G
 
G
Y
 
I
V
 
V
L
 
M
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
V
G
|
G
L
 
V
L
 
G
Q
 
A
G
 
H
A
 
G
S
 
N
I
 
V
R
 
R
I
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
D
S
 
T
S
 
T
R
 
K
L
 
M
A
 
A
M
 
M
P
 
P
E
|
E
I
 
V
S
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
F
Y
 
I
P
|
P
D
|
D
V
 
V
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Y
F
 
L
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
F
 
H
L
 
A
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
A
Q
 
P
M
 
F
N
 
S
A
 
G
R
 
A
D
 
D
A
 
A
I
 
I
D
 
V
L
 
M
D
 
G
L
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
H
F
 
Y
L
 
V
L
 
P
D
x
H
E
 
D
Q
 
K
Q
 
I
E
 
D
E
 
E
L
 
F
I
 
T
E
 
R
G
 
A
L
 
V
L
 
I
Q
 
A
L
 
D
N
 
G
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
Q
 
-
T
 
-
P
 
-
M
 
-
Q
 
-
L
 
V
N
 
D
S
 
A
L
 
A
L
 
L
K
 
A
A
 
A
L
 
H
Q
 
A
Q
 
Q
E
 
E
A
 
P
V
 
-
G
 
-
K
 
-
M
 
-
P
 
P
E
 
A
A
 
S
Q
 
P
W
 
L
L
 
A
P
 
E
R
 
Q
R
 
R
Q
 
S
Q
 
W
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
C
L
 
Y
-
 
T
-
 
G
-
 
D
D
 
T
V
 
V
S
 
A
D
 
D
V
 
I
R
 
-
C
 
-
A
 
-
W
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
I
S
 
A
L
 
A
L
 
L
R
 
R
D
 
A
H
 
H
R
 
D
D
 
A
L
 
P
L
 
A
L
 
A
A
 
G
R
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
D
N
 
L
L
 
I
H
 
A
E
 
T
G
 
R
C
 
S
P
 
P
L
 
I
T
 
A
A
 
L
H
 
S
L
 
V
V
 
T
W
 
L
E
 
E
Q
 
S
I
 
V
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
R
 
A
H
 
K
L
 
L
-
 
Q
S
 
S
L
 
L
A
 
E
E
 
D
V
 
T
F
 
L
Q
x
R
M
 
Q
E
 
E
Y
 
Y
T
 
R
M
 
V
S
 
S
L
 
C
N
 
A
C
 
S
C
 
L
R
 
K
H
 
S
P
 
H
E
 
D
F
 
L
S
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
R
A
 
A
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
D
 
N
K
 
-
D
 
-
Q
 
-
K
 
-
P
 
P
H
 
K
W
 
W
H
 
R
W
 
P
P
 
A
D
 
T
I
 
L
N
 
A
A
 
E
I
 
V
P
 
T
E
 
E
A
 
A
V
 
D
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
H
 
Y
F
 
F
H
 
A
K
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
28% identity, 62% coverage: 3:230/370 of query aligns to 1:215/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
L
 
M
H
 
E
F
 
F
E
 
E
E
 
T
L
 
I
T
 
E
G
 
T
T
 
K
D
 
K
G
 
E
A
 
G
R
 
N
I
 
L
G
 
F
I
 
W
A
 
I
S
 
T
L
 
L
D
 
N
A
 
R
E
 
P
K
 
D
S
x
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
N
L
 
A
P
 
K
M
 
L
I
 
L
R
 
E
A
 
E
L
 
L
S
 
D
D
 
R
Q
 
A
L
 
V
E
 
S
A
 
Q
W
 
A
A
 
E
K
 
S
E
 
D
P
 
P
Q
 
E
I
 
I
V
 
R
C
 
V
V
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
N
 
K
G
 
G
A
 
-
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
|
A
G
|
G
G
x
A
E
x
D
V
x
I
R
 
T
N
 
Q
L
x
F
V
 
-
E
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
N
E
 
Q
V
 
L
P
 
T
P
 
P
L
 
A
A
 
E
A
 
A
Q
 
W
F
 
K
F
 
F
S
|
S
A
 
K
E
 
K
Y
 
G
R
|
R
-
 
E
-
 
I
L
 
M
D
 
D
F
 
-
R
 
K
L
 
I
H
 
E
T
 
A
Y
 
L
P
 
S
K
 
K
P
 
P
L
 
T
I
 
I
C
 
A
W
 
M
G
 
I
H
 
N
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
L
G
x
E
L
 
L
L
 
A
Q
 
L
G
 
A
A
 
C
S
 
D
I
 
I
R
 
R
I
 
I
V
 
A
T
 
A
P
 
E
S
 
E
S
 
A
R
 
Q
L
 
L
A
 
G
M
 
L
P
|
P
E
|
E
I
 
I
S
 
N
I
 
L
G
 
G
L
x
I
Y
 
Y
P
|
P
D
x
G
V
 
Y
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
F
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
V
P
 
I
G
 
G
K
 
K
-
 
G
L
 
R
G
 
A
L
 
L
F
 
E
L
 
M
G
 
M
L
 
M
T
 
T
G
 
G
A
 
D
Q
x
R
M
 
I
N
 
P
A
 
G
R
 
K
D
 
D
A
 
A
I
 
E
D
 
K
L
 
Y
D
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
N
R
 
R
F
 
V
L
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
N
L
 
L
D
 
E
E
 
Q
Q
 
E
Q
 
T
E
 
R
E
 
K
L
 
L
I
 
A
E
 
E
G
 
K
L
 
I
L
 
A
Q
 
K
L
 
-
N
 
-
W
 
-
Q
 
-
E
 
-
Q
 
K
T
 
S
P
 
P
M
 
I
Q
 
S
L
 
L
N
 
-
S
 
-
L
 
-
L
 
-
K
 
-
A
 
A
L
 
L
Q
 
I
Q
 
K
E
 
E
A
 
V
V
 
V
G
 
N
K
 
R

Sites not aligning to the query:

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
28% identity, 51% coverage: 14:201/370 of query aligns to 14:188/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
A
 
S
R
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
I
S
 
Q
L
 
L
D
 
N
A
 
R
E
 
P
K
|
K
S
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
S
 
C
L
 
N
P
 
G
M
 
L
I
 
I
R
 
E
A
 
E
L
 
L
S
 
N
D
 
Q
Q
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
T
W
 
F
A
 
E
K
 
E
E
 
D
P
 
P
Q
 
A
I
 
V
V
 
G
C
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
N
 
-
G
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
 
G
G
x
A
E
x
D
V
x
I
R
x
K
N
 
E
L
x
M
-
 
Q
-
 
N
-
 
R
-
 
T
V
 
F
E
 
Q
A
 
D
C
 
C
R
 
Y
A
x
S
H
 
H
P
 
W
G
 
D
E
 
H
V
 
I
P
 
T
P
 
R
L
 
I
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
F
 
-
S
 
-
A
 
-
E
 
-
Y
 
-
R
 
-
L
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
-
L
 
-
H
 
-
T
 
-
Y
 
-
P
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
V
H
 
N
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
G
x
E
L
 
L
L
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
S
 
D
I
 
I
R
 
I
I
 
Y
V
 
A
T
 
G
P
 
E
S
 
K
S
 
A
R
 
Q
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
S
 
L
I
 
L
G
 
G
L
x
T
Y
 
I
P
|
P
D
x
G
V
x
A
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
F
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
P
 
V
G
 
G
K
 
K
-
 
S
L
 
L
G
 
A
L
 
M
F
 
E
L
 
M
G
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
D
Q
 
R
M
 
I
N
 
S
A
 
A
R
 
Q
D
 
D
A
 
A
I
 
K
D
 
Q
L
 
A
D
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
S
R
 
K
-
 
I
F
 
F
L
 
P
L
 
V
D
 
E
E
 
T
Q
 
L
Q
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
A
I
 
I
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
28% identity, 45% coverage: 15:181/370 of query aligns to 12:169/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
R
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
I
S
 
T
L
 
L
D
 
N
A
 
R
E
 
P
K
 
Q
S
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
N
L
 
S
P
 
Q
M
 
V
I
 
M
R
 
N
A
 
E
L
 
V
S
 
T
D
 
S
Q
 
A
L
 
A
E
 
T
A
 
E
W
 
L
A
 
D
K
 
D
E
 
D
P
 
P
Q
 
D
I
 
I
V
 
G
C
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
N
 
S
G
 
-
A
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
E
 
D
V
 
I
R
 
K
N
 
E
L
x
M
V
 
A
E
 
D
A
 
L
C
 
T
R
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
F
 
F
S
 
A
A
 
D
E
 
A
Y
 
F
R
x
T
L
 
A
D
 
D
F
 
F
-
x
F
-
 
A
-
 
T
-
 
W
-
 
G
R
 
K
L
 
L
H
 
A
T
 
A
Y
 
V
P
 
R
K
 
T
P
 
P
L
 
T
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
V
H
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
G
x
E
L
 
L
L
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
S
 
D
I
 
V
R
 
L
I
 
I
V
 
A
T
 
A
P
 
D
S
 
T
S
 
A
R
 
K
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
S
 
K
I
 
L
G
 
G
L
x
V
Y
 
L
P
|
P
D
x
G
V
 
M
G
 
G
A
 
G
S
 
S
W
 
Q
F
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
P
 
I
G
 
G
K
 
K
L
 
A
-
 
K
G
 
A
L
 
M
F
 
D
L
 
L
G
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
R
Q
 
T
M
 
M
N
 
D
A
 
A
R
 
A
D
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P14604 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial; mECH; mECH1; Enoyl-CoA hydratase 1; ECHS1; Short-chain enoyl-CoA hydratase; SCEH; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8 from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
29% identity, 51% coverage: 14:201/370 of query aligns to 45:224/290 of P14604

query
sites
P14604
A
 
S
R
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
I
S
 
Q
L
 
L
D
 
N
A
 
R
E
 
P
K
 
K
S
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
C
L
 
N
P
 
G
M
 
L
I
 
I
R
 
E
A
 
E
L
 
L
S
 
N
D
 
Q
Q
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
T
W
 
F
A
 
E
K
 
E
E
 
D
P
 
P
Q
 
A
I
 
V
V
 
G
C
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
N
 
-
G
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
A
E
 
D
V
 
I
R
 
K
N
 
E
L
 
M
V
 
Q
E
 
N
A
 
-
C
 
-
R
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
R
F
 
T
F
 
F
S
 
Q
A
 
D
E
 
C
Y
 
Y
R
 
S
L
 
G
D
 
K
F
 
F
R
 
L
L
 
S
H
 
H
-
 
W
-
 
D
-
 
H
-
 
I
-
 
T
T
 
R
Y
 
I
P
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
V
H
 
N
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
C
G
x
E
L
 
L
L
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
S
 
D
I
 
I
R
 
I
I
 
Y
V
 
A
T
 
G
P
 
E
S
 
K
S
 
A
R
 
Q
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
 
P
E
|
E
I
 
I
S
 
L
I
 
L
G
 
G
L
 
T
Y
 
I
P
 
P
D
 
G
V
 
A
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
F
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
P
 
V
G
 
G
K
 
K
-
 
S
L
 
L
G
 
A
L
 
M
F
 
E
L
 
M
G
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
D
Q
 
R
M
 
I
N
 
S
A
 
A
R
 
Q
D
 
D
A
 
A
I
 
K
D
 
Q
L
 
A
D
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
S
R
 
K
-
 
I
F
 
F
L
 
P
L
 
V
D
 
E
E
 
T
Q
 
L
Q
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
A
I
 
I
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
30% identity, 45% coverage: 15:181/370 of query aligns to 13:170/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
R
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
I
S
 
T
L
 
L
D
 
N
A
 
R
E
 
P
K
x
Q
S
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
S
 
N
L
 
S
P
 
Q
M
 
V
I
 
M
R
 
N
A
 
E
L
 
V
S
 
T
D
 
S
Q
 
A
L
 
A
E
 
T
A
 
E
W
 
L
A
 
D
K
 
D
E
 
D
P
 
P
Q
 
D
I
 
I
V
 
G
C
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
N
 
S
G
 
-
A
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
E
x
D
V
x
I
R
x
K
N
 
E
L
x
M
V
 
A
E
 
D
A
 
L
C
 
T
R
 
F
A
 
A
H
 
D
P
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
A
L
 
F
A
x
T
A
 
A
Q
 
D
F
 
F
F
|
F
S
 
A
A
 
T
E
 
W
Y
 
G
R
 
-
L
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
K
L
 
L
H
 
A
T
 
A
Y
 
V
P
 
R
K
 
T
P
 
P
L
 
T
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
V
H
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
G
x
E
L
 
L
L
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
S
 
D
I
 
V
R
 
L
I
 
I
V
 
A
T
 
A
P
 
D
S
 
T
S
 
A
R
 
K
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
S
 
K
I
 
L
G
 
G
L
x
V
Y
 
L
P
|
P
D
x
G
V
x
M
G
 
G
A
 
G
S
 
S
W
 
Q
F
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
P
 
I
G
 
G
K
 
K
L
 
A
-
 
K
G
 
A
L
 
M
F
 
D
L
 
L
G
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
R
Q
 
T
M
 
M
N
 
D
A
 
A
R
 
A
D
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
30% identity, 45% coverage: 15:181/370 of query aligns to 13:170/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
R
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
I
S
 
T
L
 
L
D
 
N
A
 
R
E
 
P
K
 
Q
S
 
A
L
|
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
N
L
 
S
P
 
Q
M
 
V
I
 
M
R
 
N
A
 
E
L
 
V
S
 
T
D
 
S
Q
 
A
L
 
A
E
 
T
A
 
E
W
 
L
A
 
D
K
 
D
E
 
D
P
 
P
Q
 
D
I
 
I
V
 
G
C
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
N
 
S
G
 
-
A
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
 
G
G
x
A
E
 
D
V
x
I
R
x
K
N
 
E
L
x
M
V
 
A
E
 
D
A
 
L
C
 
T
R
 
F
A
 
A
H
 
D
P
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
A
L
 
F
A
x
T
A
 
A
Q
 
D
F
 
F
F
|
F
S
 
A
A
 
T
E
 
W
Y
 
G
R
 
-
L
 
-
D
 
-
F
 
-
R
 
K
L
 
L
H
 
A
T
 
A
Y
 
V
P
 
R
K
 
T
P
 
P
L
 
T
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
V
H
 
A
G
 
G
Y
|
Y
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
G
x
E
L
 
L
L
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
S
 
D
I
 
V
R
 
L
I
 
I
V
 
A
T
 
A
P
 
D
S
 
T
S
 
A
R
 
K
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
S
 
K
I
x
L
G
 
G
L
x
V
Y
 
L
P
|
P
D
x
G
V
 
M
G
 
G
A
 
G
S
 
S
W
 
Q
F
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
P
 
I
G
 
G
K
 
K
L
 
A
-
 
K
G
 
A
L
 
M
F
 
D
L
 
L
G
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
R
Q
 
T
M
 
M
N
 
D
A
 
A
R
 
A
D
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
29% identity, 51% coverage: 14:201/370 of query aligns to 13:192/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
A
 
S
R
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
I
S
 
Q
L
 
L
D
 
N
A
 
R
E
 
P
K
|
K
S
 
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
S
 
C
L
 
N
P
 
G
M
 
L
I
 
I
R
 
E
A
 
E
L
 
L
S
 
N
D
 
Q
Q
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
T
W
 
F
A
 
E
K
 
E
E
 
D
P
 
P
Q
 
A
I
 
V
V
 
G
C
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
N
 
-
G
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
|
G
G
x
A
E
x
D
V
x
I
R
 
K
N
 
E
L
x
M
V
 
Q
E
 
N
A
 
-
C
 
-
R
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
R
F
 
T
F
 
F
S
 
Q
A
 
D
E
 
C
Y
 
Y
R
x
S
L
 
G
D
 
K
F
 
F
R
x
L
L
 
S
H
 
H
-
x
W
-
 
D
-
 
H
-
 
I
-
 
T
T
 
R
Y
 
I
P
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
V
H
 
N
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
G
x
E
L
 
L
L
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
S
 
D
I
 
I
R
 
I
I
 
Y
V
 
A
T
 
G
P
 
E
S
 
K
S
 
A
R
 
Q
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
S
 
L
I
x
L
G
 
G
L
x
T
Y
 
I
P
|
P
D
x
G
V
 
A
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
F
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
P
 
V
G
 
G
K
 
K
-
 
S
L
 
L
G
 
A
L
 
M
F
 
E
L
 
M
G
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
D
Q
 
R
M
 
I
N
 
S
A
 
A
R
 
Q
D
 
D
A
 
A
I
 
K
D
 
Q
L
 
A
D
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
S
R
 
K
-
 
I
F
 
F
L
 
P
L
 
V
D
 
E
E
 
T
Q
 
L
Q
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
A
I
 
I
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
29% identity, 51% coverage: 14:201/370 of query aligns to 15:194/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
A
 
S
R
 
S
I
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
I
S
 
Q
L
 
L
D
 
N
A
 
R
E
 
P
K
|
K
S
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
S
 
C
L
 
N
P
 
G
M
 
L
I
 
I
R
 
E
A
 
E
L
 
L
S
 
N
D
 
Q
Q
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
T
W
 
F
A
 
E
K
 
E
E
 
D
P
 
P
Q
 
A
I
 
V
V
 
G
C
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
N
 
-
G
 
G
A
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
|
A
G
 
G
G
x
A
E
x
D
V
x
I
R
 
K
N
 
E
L
x
M
V
 
Q
E
 
N
A
 
-
C
 
-
R
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
R
F
 
T
F
 
F
S
 
Q
A
 
D
E
 
C
Y
 
Y
R
x
S
L
 
G
D
 
K
F
 
F
R
x
L
L
 
S
H
 
H
-
 
W
-
 
D
-
 
H
-
 
I
-
 
T
T
 
R
Y
 
I
P
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
V
H
 
N
G
 
G
Y
|
Y
V
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
G
x
E
L
 
L
L
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
S
 
D
I
 
I
R
 
I
I
 
Y
V
 
A
T
 
G
P
 
E
S
 
K
S
 
A
R
 
Q
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
S
 
L
I
x
L
G
 
G
L
x
T
Y
 
I
P
|
P
D
x
G
V
 
A
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
F
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
P
 
V
G
 
G
K
 
K
-
 
S
L
 
L
G
 
A
L
 
M
F
 
E
L
 
M
G
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
D
Q
 
R
M
 
I
N
 
S
A
 
A
R
 
Q
D
 
D
A
 
A
I
 
K
D
 
Q
L
 
A
D
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
S
R
 
K
-
 
I
F
 
F
L
 
P
L
 
V
D
 
E
E
 
T
Q
 
L
Q
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
A
I
 
I
E
 
Q

Sites not aligning to the query:

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
28% identity, 45% coverage: 15:181/370 of query aligns to 12:165/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
R
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
I
S
 
T
L
 
L
D
 
N
A
 
R
E
 
P
K
 
Q
S
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
N
L
 
S
P
 
Q
M
 
V
I
 
M
R
 
N
A
 
E
L
 
V
S
 
T
D
 
S
Q
 
A
L
 
A
E
 
T
A
 
E
W
 
L
A
 
D
K
 
D
E
 
D
P
 
P
Q
 
D
I
 
I
V
 
G
C
 
A
V
 
I
L
 
I
L
 
I
R
 
T
G
 
G
N
 
S
G
 
-
A
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
E
 
D
V
 
I
R
 
K
N
 
E
L
x
M
V
 
-
E
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
F
 
F
S
 
A
A
 
D
E
 
A
Y
 
F
R
x
T
L
 
A
D
 
D
F
 
F
-
x
F
-
 
A
-
 
T
-
 
W
-
 
G
R
 
K
L
 
L
H
 
A
T
 
A
Y
 
V
P
 
R
K
 
T
P
 
P
L
 
T
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
V
H
 
A
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
G
x
E
L
 
L
L
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
S
 
D
I
 
V
R
 
L
I
 
I
V
 
A
T
 
A
P
 
D
S
 
T
S
 
A
R
 
K
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
S
 
K
I
 
L
G
 
G
L
x
V
Y
 
L
P
|
P
D
x
G
V
 
M
G
 
G
A
 
G
S
 
S
W
 
Q
F
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
P
 
I
G
 
G
K
 
K
L
 
A
-
 
K
G
 
A
L
 
M
F
 
D
L
 
L
G
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
R
Q
 
T
M
 
M
N
 
D
A
 
A
R
 
A
D
 
E
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
31% identity, 45% coverage: 16:181/370 of query aligns to 17:173/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
I
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
I
S
 
Q
L
 
L
D
 
N
A
 
R
E
 
P
K
|
K
S
x
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
S
 
C
L
 
D
P
 
G
M
 
L
I
 
I
R
 
D
A
 
E
L
 
L
S
 
N
D
 
Q
Q
 
A
L
 
L
E
 
K
A
 
I
W
 
F
A
 
E
K
 
E
E
 
D
P
 
P
Q
 
A
I
 
V
V
 
G
C
 
A
V
 
I
L
 
V
L
 
L
R
 
T
G
 
G
N
 
-
G
 
G
A
 
D
K
|
K
A
 
A
F
 
F
C
 
A
A
 
A
G
 
G
G
x
A
E
 
D
V
x
I
R
 
K
N
 
-
L
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
C
 
-
R
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
E
V
x
M
P
 
Q
P
 
N
L
 
L
A
 
S
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
F
 
F
S
 
Q
A
 
D
E
 
C
Y
 
Y
R
x
S
L
 
S
D
 
K
F
 
F
R
x
L
L
 
K
H
 
H
-
 
W
-
 
D
-
 
H
-
 
L
-
 
T
T
 
Q
Y
 
V
P
 
K
K
 
K
P
 
P
L
 
V
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
V
H
 
N
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
L
x
F
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
G
x
E
L
 
L
L
 
A
Q
 
M
G
 
M
A
 
C
S
 
D
I
 
I
R
 
I
I
 
Y
V
 
A
T
 
G
P
 
E
S
 
K
S
 
A
R
 
Q
L
 
F
A
 
A
M
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
S
 
L
I
 
I
G
 
G
L
x
T
Y
 
I
P
|
P
D
x
G
V
 
A
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
F
 
R
L
 
L
S
 
T
R
 
R
L
 
A
P
 
V
G
 
G
K
 
K
-
 
S
L
 
L
G
 
A
L
 
M
F
 
E
L
 
M
G
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
D
Q
 
R
M
 
I
N
 
S
A
 
A
R
 
Q
D
 
D
A
 
A

Sites not aligning to the query:

O53561 Enoyl-CoA hydratase EchA19; EC 4.2.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
28% identity, 63% coverage: 18:251/370 of query aligns to 20:246/266 of O53561

query
sites
O53561
I
 
I
A
 
V
S
 
T
L
 
M
D
 
N
A
 
R
E
 
P
K
 
A
S
 
A
L
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
T
P
 
E
M
 
M
I
 
M
R
 
R
A
 
I
L
 
M
S
 
V
D
 
Q
Q
 
A
L
 
W
E
 
D
A
 
R
W
 
V
A
 
D
K
 
N
E
 
D
P
 
P
Q
 
D
I
 
I
V
 
R
C
 
C
V
 
C
L
 
I
L
 
L
R
 
T
G
 
G
N
 
A
G
 
G
A
 
G
K
 
Y
A
 
-
F
 
F
C
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
M
N
 
D
L
 
L
V
 
K
E
 
A
A
 
A
C
 
T
R
 
Q
A
 
K
H
 
P
P
 
P
G
 
G
E
 
D
V
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
Q
 
S
F
 
F
F
 
K
S
 
D
A
 
G
E
 
S
Y
 
Y
-
 
G
-
 
P
-
 
S
R
 
R
L
 
I
D
 
D
-
 
A
-
 
L
F
 
L
R
 
K
L
 
G
H
 
R
T
 
R
Y
 
L
P
 
T
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
V
H
 
E
G
 
G
Y
 
P
V
 
A
L
 
I
G
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
T
G
 
E
L
 
I
L
 
L
Q
 
Q
G
 
G
A
 
T
S
 
D
I
 
I
R
 
R
I
 
V
V
 
A
T
 
G
P
 
E
S
 
S
S
 
A
R
x
K
L
x
F
A
x
G
M
x
I
P
x
S
E
|
E
I
x
A
S
x
K
I
 
W
G
 
S
L
 
L
Y
 
Y
P
 
P
D
 
M
V
 
G
G
 
G
A
 
S
S
 
A
W
 
V
F
 
R
L
 
L
S
 
V
R
 
R
-
 
Q
L
 
I
P
 
P
G
 
Y
K
 
T
L
 
L
G
 
A
L
 
C
F
 
D
L
 
L
G
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
R
Q
 
H
M
 
I
N
 
T
A
 
A
R
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
K
D
 
E
L
 
M
D
 
G
L
 
L
A
 
I
D
 
G
R
 
H
F
 
V
L
 
V
L
 
P
D
 
D
E
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
E
 
-
E
 
-
L
 
L
I
 
T
E
 
K
G
 
A
L
 
L
-
 
E
L
 
L
Q
 
A
L
 
D
N
 
A
W
 
I
Q
 
S
E
 
A
Q
 
N
T
 
G
P
 
P
M
 
L
Q
 
A
L
 
V
N
 
Q
S
 
A
L
 
I
L
 
L
K
 
R
A
 
S
L
 
I
Q
 
R
Q
 
E
E
 
T
A
 
E
V
 
C
G
 
-
K
 
-
M
 
M
P
 
P
E
 
E
A
 
N
Q
 
E
W
 
A
L
 
F
P
 
K
R
 
I
R
 
D
Q
 
T
Q
 
Q
I
 
I
D
 
G
E
 
I
L
 
K
L
 
V
D
 
F
V
 
L
S
 
S
D
 
D

5jbxB Crystal structure of liuc in complex with coenzyme a and malonic acid (see paper)
26% identity, 65% coverage: 20:260/370 of query aligns to 19:251/261 of 5jbxB

query
sites
5jbxB
S
 
T
L
 
I
D
 
D
A
 
G
E
 
E
K
x
S
S
x
R
L
x
R
N
 
N
A
|
A
L
 
I
S
 
S
L
 
R
P
 
A
M
 
M
I
 
L
R
 
K
A
 
E
L
 
L
S
 
G
D
 
E
Q
 
L
L
 
V
E
 
T
A
 
R
W
 
V
A
 
S
K
 
S
E
 
S
P
 
R
Q
 
D
I
 
V
V
 
R
C
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
I
R
 
T
G
 
G
N
 
A
G
 
G
A
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
A
|
A
G
 
G
G
x
A
E
x
D
V
x
L
R
x
K
N
 
E
L
 
-
V
 
-
E
 
-
A
 
-
C
 
-
R
|
R
A
 
A
H
 
T
P
 
M
G
 
A
E
 
E
V
 
D
P
 
E
P
 
V
L
 
R
A
 
A
A
 
-
Q
 
-
F
 
-
F
 
F
S
x
L
A
 
D
E
 
G
Y
 
L
R
|
R
L
 
R
D
 
T
F
 
F
R
 
R
-
 
A
L
 
I
H
 
E
T
 
K
Y
 
S
P
 
D
K
 
C
P
 
V
L
 
F
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
I
H
 
N
G
 
G
Y
 
A
V
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
L
 
T
G
x
E
L
 
L
L
 
A
Q
 
L
G
 
A
A
 
C
S
 
D
I
 
L
R
 
R
I
 
V
V
 
A
T
 
A
P
 
P
S
 
A
S
 
A
R
 
E
L
 
L
A
 
G
M
 
L
P
x
T
E
|
E
I
 
V
S
 
K
I
x
L
G
 
G
L
x
I
Y
 
I
P
|
P
D
x
G
V
 
G
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
F
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
R
L
 
L
-
 
V
-
 
G
P
 
P
G
 
G
K
 
R
L
 
A
G
 
K
L
 
D
F
 
L
L
 
I
G
 
-
L
 
L
T
 
T
G
 
A
A
 
R
Q
x
R
M
 
I
N
 
N
A
 
A
R
 
A
D
 
E
A
 
A
I
 
F
D
 
S
L
 
V
D
 
G
L
 
L
A
 
A
D
 
N
R
 
R
F
 
L
L
 
A
L
 
P
D
 
E
E
 
G
Q
 
H
Q
 
L
E
 
L
E
 
A
L
 
V
I
 
A
E
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
A
Q
 
E
L
 
-
N
 
S
W
 
V
Q
 
V
E
 
E
Q
 
N
T
 
A
P
 
P
M
 
I
Q
 
A
L
 
V
N
 
A
S
 
T
L
 
A
L
 
K
K
 
H
A
 
A
L
 
I
Q
 
D
Q
 
E
E
 
G
A
 
T
V
 
G
G
 
L
K
 
E
M
 
L
P
 
D
E
 
D
A
 
A
Q
 
L
W
x
A
L
 
L
P
 
E
R
 
L
R
 
R
Q
 
K
Q
 
Y
I
 
-
D
 
E
E
 
E
L
 
I
L
|
L
D
 
K
V
 
T
S
 
E
D
 
D
V
 
R
R
 
L
C
 
E
A
 
G
W
 
L
R
 
R
A
 
A
I
 
F
S
 
A

6z1pBI mS93 (see paper)
28% identity, 45% coverage: 16:180/370 of query aligns to 32:194/1413 of 6z1pBI

query
sites
6z1pBI
I
 
V
G
 
A
I
 
F
A
 
S
S
 
Y
L
 
L
D
 
N
A
 
G
E
 
E
K
x
Y
S
x
K
L
x
Q
N
 
N
A
x
T
L
 
L
S
x
D
L
 
T
P
x
H
M
 
M
I
 
I
R
 
K
A
 
E
L
 
I
S
 
T
D
 
R
Q
 
F
L
 
L
E
 
E
A
 
S
W
 
Y
A
 
E
K
 
I
E
 
D
P
 
S
Q
 
S
I
 
I
V
 
R
C
 
A
V
 
V
L
 
F
L
 
L
R
 
E
G
 
N
N
 
S
G
 
K
-
 
E
A
 
A
K
 
G
A
 
V
F
 
F
C
 
S
A
x
K
G
 
G
G
x
T
E
x
D
V
x
F
R
x
K
N
 
F
L
 
L
V
 
M
E
x
K
A
 
K
C
 
I
R
 
A
A
 
E
H
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
K
V
 
E
P
 
P
P
 
H
L
 
K
A
 
A
A
 
F
Q
 
D
F
 
Y
F
 
L
S
 
R
A
 
E
E
 
L
Y
 
Y
R
 
D
L
 
F
D
 
A
F
 
I
R
 
F
L
 
I
H
 
G
T
 
K
Y
 
Y
P
 
N
K
 
K
P
 
P
L
 
L
I
 
L
C
 
I
W
 
N
G
 
I
H
 
N
G
 
G
Y
x
L
V
 
I
L
 
T
G
 
G
G
x
S
G
 
A
L
 
A
G
 
S
L
 
I
L
 
F
Q
 
T
G
 
R
A
 
A
S
 
P
I
 
F
R
 
A
I
 
L
V
 
G
T
 
S
P
 
K
S
 
N
S
 
T
R
x
K
L
 
W
A
 
R
M
 
L
P
 
N
E
|
E
I
 
T
S
 
S
I
 
L
G
 
G
L
 
Y
Y
 
I
P
 
P
D
|
D
V
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
S
W
 
Y
F
 
Y
L
 
L
S
 
S
R
 
R
L
 
L
P
 
N
G
 
M
K
 
E
L
 
L
G
 
G
L
 
T
F
 
F
L
 
L
G
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
W
Q
 
Q
M
 
I
N
 
D
A
 
G
R
 
Y
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Q9P4U9 Enoyl-CoA hydratase AKT3-1; AF-toxin biosynthesis protein 3-1; EC 4.2.1.17 from Alternaria alternata (Alternaria rot fungus) (Torula alternata) (see paper)
29% identity, 46% coverage: 4:174/370 of query aligns to 13:176/296 of Q9P4U9

query
sites
Q9P4U9
H
 
H
F
 
N
E
 
L
E
 
R
L
 
V
T
 
D
G
 
G
T
 
P
D
 
D
G
 
A
A
 
D
R
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
V
A
 
I
S
 
V
L
 
L
D
 
A
A
 
R
E
 
S
K
 
Q
S
 
S
L
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
T
L
 
L
P
 
P
M
 
M
I
 
L
R
 
T
A
 
D
L
 
M
S
 
V
D
 
Q
Q
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
A
W
 
M
A
 
D
K
 
A
E
 
D
P
 
D
Q
 
S
I
 
V
V
 
K
C
 
C
V
 
I
L
 
V
L
 
F
R
 
T
G
 
G
N
 
E
G
 
G
A
 
-
K
 
P
A
 
F
F
 
F
C
 
C
A
 
S
G
 
G
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
V
N
 
D
L
 
L
V
 
T
E
 
E
A
 
G
C
 
F
R
 
-
A
 
-
H
 
-
P
 
-
G
 
G
E
 
E
V
 
I
P
 
G
P
 
K
L
 
T
A
 
R
A
 
D
Q
 
T
F
 
H
F
 
R
S
 
D
A
 
A
E
 
G
Y
 
G
R
 
K
L
 
L
D
 
A
F
 
L
R
 
A
L
 
I
H
 
H
T
 
N
Y
 
C
P
 
R
K
 
K
P
 
P
L
 
T
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
I
H
 
N
G
 
G
Y
 
T
V
 
A
L
 
V
G
 
G
G
 
V
G
 
G
L
 
I
G
 
T
L
 
M
L
 
T
Q
 
L
G
 
P
A
 
M
S
 
S
I
 
I
R
 
R
I
 
I
V
 
A
T
 
A
P
 
K
S
 
T
S
 
A
R
 
K
L
 
I
A
 
S
M
 
F
P
 
P
E
 
F
I
 
V
S
 
R
I
 
R
G
 
G
L
 
I
Y
 
V
P
 
A
D
 
D
V
 
A
G
 
A
A
 
S
S
 
S
W
 
F
F
 
Y
L
 
L
S
 
P
R
 
R
L
 
L
P
 
V
G
 
G
-
 
Y
K
 
G
L
 
R
G
 
A
L
 
L
F
 
H
L
 
L
G
 
F
L
 
T
T
 
T
G
 
G
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P21177 Fatty acid oxidation complex subunit alpha; EC 4.2.1.17; EC 5.1.2.3; EC 5.3.3.8; EC 1.1.1.35 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
28% identity, 50% coverage: 17:202/370 of query aligns to 16:196/729 of P21177

query
sites
P21177
G
 
G
I
 
I
A
 
A
S
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
F
D
 
D
A
 
A
E
 
P
K
 
G
S
 
S
L
 
V
N
 
N
A
 
K
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
A
M
 
T
I
 
V
R
 
A
A
 
S
L
 
L
S
 
G
D
 
E
Q
 
A
L
 
I
E
 
G
A
 
V
W
 
L
A
 
E
K
 
Q
E
 
Q
P
 
S
Q
 
D
I
 
L
V
 
K
C
 
G
V
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
R
G
 
S
N
 
N
G
 
K
A
 
A
K
 
-
A
 
A
F
 
F
C
 
I
A
 
V
G
 
G
G
 
A
E
 
D
V
 
I
R
 
T
N
 
E
L
 
F
V
 
L
E
 
S
A
 
L
C
 
F
R
 
L
A
 
V
H
 
P
P
 
E
G
 
E
E
 
Q
V
 
L
P
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
S
Q
 
Q
F
 
W
F
 
L
S
 
H
A
 
F
E
 
A
Y
 
N
R
 
S
L
 
V
D
 
F
F
 
N
R
 
R
L
 
L
H
 
E
T
 
D
Y
 
L
P
 
P
K
 
V
P
 
P
L
 
T
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
V
H
 
N
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
G
 
E
L
 
C
L
 
V
Q
 
L
G
 
A
A
 
T
S
 
D
I
 
Y
R
 
R
I
 
L
V
 
A
T
 
T
P
 
P
S
 
D
S
 
L
R
 
R
L
 
I
A
 
G
M
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
T
S
 
K
I
 
L
G
 
G
L
 
I
Y
 
M
P
 
P
D
 
G
V
 
F
G
 
G
A
 
G
S
 
S
W
 
V
F
 
R
L
 
M
S
 
P
R
 
R
L
 
M
P
 
L
G
 
G
-
 
A
K
 
D
L
 
S
G
 
A
L
 
L
F
 
E
L
 
I
G
 
I
L
 
A
T
 
A
G
 
G
A
 
K
Q
 
D
M
 
V
N
 
G
A
 
A
R
 
D
D
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
K
L
 
I
D
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
D
R
 
G
F
 
V
L
 
V
L
 
-
D
 
-
E
 
-
Q
 
K
Q
 
A
E
 
E
E
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6tnmA E. Coli aerobic trifunctional enzyme subunit-alpha (see paper)
28% identity, 50% coverage: 17:202/370 of query aligns to 16:196/719 of 6tnmA

query
sites
6tnmA
G
 
G
I
 
I
A
 
A
S
 
E
L
 
L
-
 
V
-
 
F
D
 
D
A
 
A
E
 
P
K
 
G
S
 
S
L
 
V
N
 
N
A
 
K
L
 
L
S
 
D
L
 
T
P
 
A
M
 
T
I
 
V
R
 
A
A
 
S
L
 
L
S
 
G
D
 
E
Q
 
A
L
 
I
E
 
G
A
 
V
W
 
L
A
 
E
K
 
Q
E
 
Q
P
 
S
Q
 
D
I
 
L
V
 
K
C
 
G
V
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
R
G
 
S
N
 
N
G
 
K
A
 
A
K
 
-
A
 
A
F
 
F
C
 
I
A
 
V
G
 
G
G
x
A
E
 
D
V
 
I
R
 
T
N
 
E
L
x
F
V
 
L
E
 
S
A
 
L
C
 
F
R
 
L
A
 
V
H
 
P
P
 
E
G
 
E
E
 
Q
V
 
L
P
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
S
Q
 
Q
F
 
W
F
 
L
S
 
H
A
 
F
E
 
A
Y
 
N
R
 
S
L
 
V
D
 
F
F
 
N
R
 
R
L
 
L
H
 
E
T
 
D
Y
 
L
P
 
P
K
 
V
P
 
P
L
 
T
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
V
H
 
N
G
 
G
Y
 
Y
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
C
G
x
E
L
 
C
L
 
V
Q
 
L
G
 
A
A
 
T
S
 
D
I
 
Y
R
 
R
I
 
L
V
 
A
T
 
T
P
 
P
S
 
D
S
 
L
R
 
R
L
 
I
A
 
G
M
 
L
P
|
P
E
|
E
I
 
T
S
 
K
I
 
L
G
 
G
L
 
I
Y
 
M
P
 
P
D
x
G
V
 
F
G
 
G
A
 
G
S
 
S
W
 
V
F
 
R
L
 
M
S
 
P
R
 
R
L
 
M
P
 
L
G
 
G
-
 
A
K
 
D
L
 
S
G
 
A
L
 
L
F
 
E
L
 
I
G
 
I
L
 
A
T
 
A
G
 
G
A
 
K
Q
 
D
M
 
V
N
 
G
A
 
A
R
 
D
D
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
K
L
 
I
D
 
G
L
 
L
A
 
V
D
 
D
R
 
G
F
 
V
L
 
V
L
 
-
D
 
-
E
 
-
Q
 
K
Q
 
A
E
 
E
E
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
E
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6eqoA Tri-functional propionyl-coa synthase of erythrobacter sp. Nap1 with bound NADP+ and phosphomethylphosphonic acid adenylate ester (see paper)
27% identity, 48% coverage: 13:191/370 of query aligns to 864:1029/1804 of 6eqoA

query
sites
6eqoA
G
 
G
A
 
K
R
 
R
I
 
V
G
 
A
I
 
T
A
 
V
S
 
T
L
 
V
D
 
K
A
 
-
E
 
N
K
 
P
S
 
P
L
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
N
L
 
E
P
 
R
M
 
A
I
 
L
R
 
D
A
 
E
L
 
L
S
 
V
D
 
I
Q
 
I
L
 
A
E
 
E
A
 
H
W
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
K
P
 
D
Q
 
D
I
 
V
V
 
A
C
 
A
V
 
V
L
 
V
L
 
F
R
 
T
G
 
G
N
 
S
G
 
G
A
 
T
K
 
A
A
 
S
F
 
F
C
 
V
A
 
A
G
 
G
G
x
A
E
 
D
V
 
I
R
 
R
N
 
Q
L
 
M
V
 
L
E
 
E
A
 
E
C
 
V
R
 
N
A
 
S
H
 
V
P
 
E
G
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
P
 
-
L
 
-
A
 
E
A
 
A
Q
 
K
F
 
A
F
 
L
S
 
P
A
 
D
E
 
N
Y
 
A
R
 
Q
L
 
L
D
 
A
F
 
F
R
 
R
-
 
T
L
 
I
H
 
E
T
 
E
Y
 
M
P
 
D
K
 
K
P
 
P
L
 
C
I
 
I
C
 
A
W
 
A
G
 
I
H
 
Q
G
 
G
Y
 
V
V
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
L
 
M
G
x
E
L
 
F
L
 
A
Q
 
L
G
 
A
A
 
C
S
 
H
I
 
Y
R
 
R
I
 
V
V
 
A
T
 
E
P
 
P
S
 
K
S
 
A
R
 
R
L
 
F
A
 
G
M
 
Q
P
 
P
E
|
E
I
 
I
S
 
N
I
 
L
G
 
R
L
 
L
Y
 
L
P
 
P
D
x
G
V
 
Y
G
 
G
A
 
G
S
 
T
W
 
Q
F
 
R
L
 
L
S
 
P
R
 
R
L
 
L
P
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
-
L
 
-
F
 
-
L
 
L
G
 
A
L
 
D
T
 
G
G
 
G
A
 
G
Q
 
E
M
 
T
N
 
G
A
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
A
I
 
L
D
 
D
L
 
L
D
 
I
L
 
L
A
 
G
D
 
G
R
 
R
F
 
A
L
 
I

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>AO353_17555 FitnessBrowser__pseudo3_N2E3:AO353_17555
MNLHFEELTGTDGARIGIASLDAEKSLNALSLPMIRALSDQLEAWAKEPQIVCVLLRGNG
AKAFCAGGEVRNLVEACRAHPGEVPPLAAQFFSAEYRLDFRLHTYPKPLICWGHGYVLGG
GLGLLQGASIRIVTPSSRLAMPEISIGLYPDVGASWFLSRLPGKLGLFLGLTGAQMNARD
AIDLDLADRFLLDEQQEELIEGLLQLNWQEQTPMQLNSLLKALQQEAVGKMPEAQWLPRR
QQIDELLDVSDVRCAWRAISLLRDHRDLLLARAAKNLHEGCPLTAHLVWEQIQRARHLSL
AEVFQMEYTMSLNCCRHPEFSEGVRARLIDKDQKPHWHWPDINAIPEAVVQAHFHKVWEG
RHPLADLSGY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory